MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas syringae

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 333042 333043 PSPTO0001 PSPTO0002 dnaA dnaN TRUE 0.939 39.000 0.328 1.000 Y NA
 333043 333044 PSPTO0002 PSPTO0003 dnaN recF TRUE 0.965 23.000 0.318 1.000 Y NA
 333044 333045 PSPTO0003 PSPTO0004 recF gyrB TRUE 0.997 5.000 0.249 0.004 Y NA
 333045 333046 PSPTO0004 PSPTO0005 gyrB   FALSE 0.002 528.000 0.000 1.000 N NA
 333046 333047 PSPTO0005 PSPTO0006     TRUE 0.784 63.000 0.032 0.086 Y NA
 333047 333048 PSPTO0006 PSPTO0007     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 333048 333049 PSPTO0007 PSPTO0008     TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 10692007 333051 PSPTO_5633 PSPTO0011     FALSE 0.006 322.000 0.000 NA   NA
 333051 333052 PSPTO0011 PSPTO0012     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 333052 333053 PSPTO0012 PSPTO0013     TRUE 0.516 -25.000 0.000 NA   NA
 333055 333056 PSPTO0015 PSPTO0016     FALSE 0.219 36.000 0.000 NA   NA
 333057 333058 PSPTO0017 PSPTO0018     FALSE 0.354 147.000 0.000 1.000 Y NA
 333058 333059 PSPTO0018 PSPTO0019     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 333059 333060 PSPTO0019 PSPTO0020     FALSE 0.140 69.000 0.000 NA   NA
 333060 333061 PSPTO0020 PSPTO0021     FALSE 0.367 19.000 0.000 NA   NA
 333062 333063 PSPTO0022 PSPTO0023     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 333063 333064 PSPTO0023 PSPTO0024     FALSE 0.001 931.000 0.000 NA   NA
 333064 333065 PSPTO0024 PSPTO0025     FALSE 0.005 351.000 0.000 NA   NA
 333067 333068 PSPTO0027 PSPTO0028     TRUE 0.847 2.000 0.000 NA   NA
 333068 333069 PSPTO0028 PSPTO0029     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 333069 333070 PSPTO0029 PSPTO0030     TRUE 0.558 13.000 0.000 NA   NA
 333070 333071 PSPTO0030 PSPTO0031     FALSE 0.002 578.000 0.000 NA   NA
 333072 333073 PSPTO0032 PSPTO0033     TRUE 0.999 0.000 0.857 0.086   NA
 333073 333074 PSPTO0033 PSPTO0034     TRUE 0.999 -3.000 0.743 0.086   NA
 333074 333075 PSPTO0034 PSPTO0035     FALSE 0.006 873.000 0.000 NA Y NA
 333075 333076 PSPTO0035 PSPTO0036     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 333077 333078 PSPTO0037 PSPTO0038     FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 333079 333080 PSPTO0039 PSPTO0040     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 333081 10692008 PSPTO0041 PSPTO_0042     TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 10692008 333082 PSPTO_0042 PSPTO0043     FALSE 0.086 130.000 0.000 NA   NA
 333084 333085 PSPTO0045 PSPTO0046     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 333085 333086 PSPTO0046 PSPTO0047     TRUE 0.997 3.000 0.415 NA Y NA
 333086 333087 PSPTO0047 PSPTO0048     FALSE 0.001 1475.000 0.000 NA   NA
 333087 333088 PSPTO0048 PSPTO0049     FALSE 0.231 252.000 0.300 NA   NA
 333088 333089 PSPTO0049 PSPTO0050     TRUE 0.941 17.000 0.300 NA   NA
 333089 333090 PSPTO0050 PSPTO0051     FALSE 0.116 87.000 0.000 NA   NA
 333090 333091 PSPTO0051 PSPTO0052     FALSE 0.020 227.000 0.000 NA   NA
 333092 333093 PSPTO0053 PSPTO0054     TRUE 0.996 -13.000 1.000 NA   NA
 333094 333095 PSPTO0055 PSPTO0056     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 333096 333097 PSPTO0057 PSPTO0058     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333097 333098 PSPTO0058 PSPTO0059     FALSE 0.087 128.000 0.000 NA   NA
 10692009 333099 PSPTO_0060 PSPTO0061     FALSE 0.090 118.000 0.000 NA   NA
 333102 333103 PSPTO0064 PSPTO0065   recG FALSE 0.327 87.000 0.038 1.000 N NA
 333103 333104 PSPTO0065 PSPTO0066 recG   TRUE 0.972 12.000 0.117 1.000 Y NA
 333104 333105 PSPTO0066 PSPTO0067   tonB-1 FALSE 0.242 93.000 0.023 1.000 N NA
 333105 333106 PSPTO0067 PSPTO0068 tonB-1 exbD-1 TRUE 0.987 -3.000 0.143 1.000 N NA
 333106 333107 PSPTO0068 PSPTO0069 exbD-1 exbB-1 TRUE 0.999 4.000 0.810 1.000 Y NA
 333109 333110 PSPTO0071 PSPTO0072     TRUE 0.483 55.000 0.056 NA   NA
 333110 333111 PSPTO0072 PSPTO0073   spoT TRUE 0.853 26.000 0.215 NA N NA
 333111 333112 PSPTO0073 PSPTO0074 spoT rpoZ TRUE 0.906 61.000 0.291 1.000 Y NA
 333112 333113 PSPTO0074 PSPTO0075 rpoZ gmk TRUE 0.742 148.000 0.471 1.000 N NA
 333113 333114 PSPTO0075 PSPTO0076 gmk   TRUE 0.955 14.000 0.276 NA   NA
 333115 333116 PSPTO0077 PSPTO0078 rph   TRUE 0.627 17.000 0.018 NA   NA
 333118 333119 PSPTO0080 PSPTO0081 pyrE   TRUE 0.850 11.000 0.034 NA   NA
 333120 333121 PSPTO0082 PSPTO0083 argB algC TRUE 0.596 29.000 0.044 1.000 N NA
 333121 333122 PSPTO0083 PSPTO0084 algC dut FALSE 0.003 1243.000 0.039 1.000 N NA
 333122 333123 PSPTO0084 PSPTO0085 dut coaBC TRUE 0.974 7.000 0.201 1.000 N NA
 333125 333126 PSPTO0087 PSPTO0088     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 333127 333128 PSPTO0089 PSPTO0090 rpmB rpmG TRUE 0.994 12.000 0.332 0.013 Y NA
 333133 333134 PSPTO0095 PSPTO0096     TRUE 0.856 25.000 0.200 1.000 N NA
 333139 333140 PSPTO0101 PSPTO0102 dadA   TRUE 0.864 -28.000 0.088 NA N NA
 333140 333141 PSPTO0102 PSPTO0103   dadX FALSE 0.437 80.000 0.070 NA N NA
 333143 333144 PSPTO0105 PSPTO0106   cycB TRUE 0.688 25.000 0.057 1.000 N NA
 333144 333145 PSPTO0106 PSPTO0107 cycB   TRUE 0.741 97.000 0.123 1.000 Y NA
 333146 333147 PSPTO0108 PSPTO0109     TRUE 0.958 -7.000 0.122 NA   NA
 333147 333148 PSPTO0109 PSPTO0110     TRUE 0.856 28.000 0.230 NA   NA
 333150 333151 PSPTO0112 PSPTO0113 xpt rep FALSE 0.324 55.000 0.020 1.000 N NA
 333154 333155 PSPTO0116 PSPTO0117     TRUE 0.648 184.000 0.500 1.000 N NA
 333155 333156 PSPTO0117 PSPTO0118     FALSE 0.007 320.000 0.000 1.000 N NA
 333156 333157 PSPTO0118 PSPTO0119     TRUE 0.922 58.000 0.600 1.000   NA
 333157 333158 PSPTO0119 PSPTO0120     FALSE 0.474 97.000 0.109 NA   NA
 333161 333162 PSPTO0123 PSPTO0124     TRUE 0.584 57.000 0.000 1.000 Y NA
 333164 333165 PSPTO0126 PSPTO0127   algR TRUE 1.000 -3.000 0.775 0.031 Y NA
 333165 333166 PSPTO0127 PSPTO0128 algR hemC FALSE 0.068 223.000 0.032 1.000 N NA
 333166 333167 PSPTO0128 PSPTO0129 hemC hemD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 333167 333168 PSPTO0129 PSPTO0130 hemD   TRUE 0.972 42.000 0.600 1.000 Y NA
 333168 333169 PSPTO0130 PSPTO0131     TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 333169 333170 PSPTO0131 PSPTO0132     FALSE 0.092 215.000 0.042 1.000 N NA
 333170 333171 PSPTO0132 PSPTO0133     TRUE 0.772 5.000 0.000 NA   NA
 333171 333172 PSPTO0133 PSPTO0134   algQ FALSE 0.392 18.000 0.000 NA   NA
 333176 333177 PSPTO0138 PSPTO0139     TRUE 0.852 17.000 0.108 NA   NA
 333177 333178 PSPTO0139 PSPTO0140     TRUE 0.508 67.000 0.075 NA   NA
 333178 333179 PSPTO0140 PSPTO0141     FALSE 0.105 181.000 0.024 1.000 N NA
 333179 333180 PSPTO0141 PSPTO0142     FALSE 0.025 215.000 0.000 NA   NA
 333181 333182 PSPTO0143 PSPTO0144   prlC TRUE 0.989 -3.000 0.173 NA   NA
 333185 333186 PSPTO0147 PSPTO0148     FALSE 0.026 209.000 0.000 NA   NA
 333186 333187 PSPTO0148 PSPTO0149     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA   NA
 333187 333188 PSPTO0149 PSPTO0150     FALSE 0.367 19.000 0.000 NA   NA
 333189 333190 PSPTO0151 PSPTO0152   osmC FALSE 0.213 118.000 0.026 NA   NA
 333192 333193 PSPTO0154 PSPTO0155     FALSE 0.233 150.000 0.049 NA   NA
 333196 333197 PSPTO0158 PSPTO0159 trpB trpA TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.001 Y NA
 333197 333199 PSPTO0159 PSPTO0161 trpA   FALSE 0.087 127.000 0.000 NA   NA
 333200 333201 PSPTO0162 PSPTO0163     FALSE 0.025 213.000 0.000 NA   NA
 333201 333202 PSPTO0163 PSPTO0164     FALSE 0.006 774.000 0.079 NA N NA
 333203 333204 PSPTO0165 PSPTO0166     TRUE 0.803 37.000 0.218 1.000 N NA
 333204 333205 PSPTO0166 PSPTO0167     FALSE 0.153 62.000 0.000 NA   NA
 333205 333206 PSPTO0167 PSPTO0168     FALSE 0.135 72.000 0.000 NA   NA
 333207 333208 PSPTO0169 PSPTO0170 aroE hemF TRUE 0.981 0.000 0.093 1.000 N NA
 3829845 333209 PSPTO_5630 PSPTO0171     FALSE 0.200 41.000 0.000 NA   NA
 333209 333210 PSPTO0171 PSPTO0172     FALSE 0.002 588.000 0.000 NA   NA
 333210 333211 PSPTO0172 PSPTO0173   qor FALSE 0.106 96.000 0.000 NA   NA
 333212 333213 PSPTO0174 PSPTO0175     FALSE 0.372 39.000 0.023 NA N NA
 333213 333214 PSPTO0175 PSPTO0176     FALSE 0.414 55.000 0.033 1.000   NA
 333215 333216 PSPTO0177 PSPTO0178 def-1 fmt TRUE 0.882 61.000 0.105 0.019 Y NA
 333216 333217 PSPTO0178 PSPTO0179 fmt sun TRUE 0.998 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 333217 333218 PSPTO0179 PSPTO0180 sun trkA TRUE 0.985 -3.000 0.122 1.000 N NA
 333218 333219 PSPTO0180 PSPTO0181 trkA   FALSE 0.128 83.000 0.000 1.000 N NA
 333220 333221 PSPTO0182 PSPTO0183   tag FALSE 0.378 38.000 0.017 1.000 N NA
 333222 333223 PSPTO0184 PSPTO0185 glyQ glyS TRUE 1.000 -3.000 0.651 0.001 Y NA
 333223 333224 PSPTO0185 PSPTO0186 glyS   TRUE 0.904 14.000 0.123 1.000 N NA
 333224 333225 PSPTO0186 PSPTO0187     TRUE 0.808 58.000 0.310 1.000 N NA
 333226 10692011 PSPTO0189 PSPTO_0190     TRUE 0.847 2.000 0.000 NA   NA
 10692011 333227 PSPTO_0190 PSPTO0192     FALSE 0.001 1374.000 0.000 NA   NA
 333228 333229 PSPTO0193 PSPTO0194     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 333229 333230 PSPTO0194 PSPTO0196     FALSE 0.066 276.000 0.000 NA Y NA
 333230 333231 PSPTO0196 PSPTO0197     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 333231 333232 PSPTO0197 PSPTO0200     FALSE 0.001 1044.000 0.000 NA   NA
 333232 333233 PSPTO0200 PSPTO0201     FALSE 0.017 739.000 0.000 0.037 Y NA
 333233 333234 PSPTO0201 PSPTO0202     TRUE 0.828 3.000 0.000 NA   NA
 333234 333235 PSPTO0202 PSPTO0203     TRUE 0.772 5.000 0.000 NA   NA
 333235 333236 PSPTO0203 PSPTO0205     FALSE 0.001 3408.000 0.000 NA   NA
 333236 333237 PSPTO0205 PSPTO0206     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 333237 10692012 PSPTO0206 PSPTO_0207     FALSE 0.044 179.000 0.000 NA   NA
 10692012 333238 PSPTO_0207 PSPTO0208     FALSE 0.175 49.000 0.000 NA   NA
 333238 333239 PSPTO0208 PSPTO0209   lsyA-1 FALSE 0.037 188.000 0.000 NA   NA
 333239 333240 PSPTO0209 PSPTO0210 lsyA-1   TRUE 0.847 2.000 0.000 NA   NA
 333240 333241 PSPTO0210 PSPTO0211   iucD TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 333242 333243 PSPTO0212 PSPTO0213 lysR   FALSE 0.014 251.000 0.000 NA   NA
 333243 333244 PSPTO0213 PSPTO0214     TRUE 0.949 10.000 0.136 NA   NA
 333246 333247 PSPTO0216 PSPTO0217   glnK FALSE 0.032 199.000 0.000 NA   NA
 333247 333248 PSPTO0217 PSPTO0218 glnK amt-1 TRUE 0.720 36.000 0.135 1.000 N NA
 333248 333249 PSPTO0218 PSPTO0219 amt-1   FALSE 0.017 242.000 0.000 NA   NA
 333249 333250 PSPTO0219 PSPTO0220     FALSE 0.207 99.000 0.018 NA   NA
 333251 333252 PSPTO0221 PSPTO0222   xerC TRUE 0.988 -7.000 0.367 1.000   NA
 333252 333253 PSPTO0222 PSPTO0223 xerC   TRUE 0.997 3.000 0.714 NA   NA
 333253 333254 PSPTO0223 PSPTO0224   dapF TRUE 0.926 14.000 0.175 NA   NA
 333254 333255 PSPTO0224 PSPTO0225 dapF lsyA-2 TRUE 0.994 5.000 0.104 0.002 Y NA
 333255 333256 PSPTO0225 PSPTO0226 lsyA-2 lppL TRUE 0.736 10.000 0.006 NA N NA
 333257 333258 PSPTO0227 PSPTO0228 cyaY   TRUE 0.929 3.000 0.025 NA   NA
 333258 333259 PSPTO0228 PSPTO0229   rnk FALSE 0.279 138.000 0.054 NA   NA
 333260 333261 PSPTO0230 PSPTO0231 cyaA   FALSE 0.328 183.000 0.164 1.000   NA
 333261 333262 PSPTO0231 PSPTO0232     FALSE 0.241 217.000 0.200 NA   NA
 333262 333263 PSPTO0232 PSPTO0233   gltP FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 333263 333264 PSPTO0233 PSPTO0234 gltP rimK FALSE 0.003 453.000 0.000 1.000 N NA
 333264 333265 PSPTO0234 PSPTO0235 rimK   TRUE 0.984 -3.000 0.102 1.000 N NA
 333265 333266 PSPTO0235 PSPTO0236     TRUE 0.715 17.000 0.039 NA N NA
 333267 333268 PSPTO0237 PSPTO0238 hslR hslO FALSE 0.368 161.000 0.140 1.000 N NA
 333268 333269 PSPTO0238 PSPTO0239 hslO pckA FALSE 0.162 180.000 0.048 1.000 N NA
 333269 333270 PSPTO0239 PSPTO0240 pckA   FALSE 0.008 297.000 0.000 NA   NA
 333270 333271 PSPTO0240 PSPTO0241     TRUE 0.968 13.000 0.333 NA   NA
 333272 333273 PSPTO0242 PSPTO0243     FALSE 0.076 139.000 0.000 NA   NA
 333273 333274 PSPTO0243 PSPTO0244     FALSE 0.001 913.000 0.000 NA   NA
 333274 333275 PSPTO0244 PSPTO0245     TRUE 0.817 161.000 0.667 NA   NA
 333275 333276 PSPTO0245 PSPTO0246     FALSE 0.070 146.000 0.000 NA   NA
 333277 333278 PSPTO0247 PSPTO0248 dehII   TRUE 0.684 67.000 0.182 1.000   NA
 333278 333279 PSPTO0248 PSPTO0249     TRUE 0.833 92.000 0.225 1.000 Y NA
 333279 333280 PSPTO0249 PSPTO0250     TRUE 0.887 32.000 0.050 0.082 Y NA
 333280 333281 PSPTO0250 PSPTO0251     TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.082 Y NA
 333281 333282 PSPTO0251 PSPTO0252     TRUE 0.990 2.000 0.250 1.000   NA
 333282 333283 PSPTO0252 PSPTO0253     TRUE 0.993 -3.000 0.250 1.000   NA
 333283 333284 PSPTO0253 PSPTO0254     TRUE 0.975 -21.000 0.250 0.049   NA
 333284 333285 PSPTO0254 PSPTO0255     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.049   NA
 333285 333286 PSPTO0255 PSPTO0256   argE-1 TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 333286 333287 PSPTO0256 PSPTO0257 argE-1 gabD-1 FALSE 0.380 115.000 0.074 1.000 N NA
 333289 333290 PSPTO0259 PSPTO0260 gabT-1   TRUE 0.722 76.000 0.250 NA   NA
 333290 333291 PSPTO0260 PSPTO0261     TRUE 0.605 48.000 0.095 NA   NA
 333294 333295 PSPTO0264 PSPTO0265     TRUE 0.998 2.000 0.667 1.000   NA
 333295 333296 PSPTO0265 PSPTO0266     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.082   NA
 333296 333297 PSPTO0266 PSPTO0267     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.082   NA
 333297 333298 PSPTO0267 PSPTO0268     TRUE 0.918 112.000 0.667 0.082 N NA
 333298 333299 PSPTO0268 PSPTO0269     FALSE 0.030 292.000 0.000 0.082 N NA
 333299 333300 PSPTO0269 PSPTO0270     TRUE 1.000 0.000 1.000 0.098 Y NA
 333300 333301 PSPTO0270 PSPTO0271     TRUE 0.982 51.000 1.000 0.014 N NA
 333301 333302 PSPTO0271 PSPTO0272   iscS-1 FALSE 0.001 1180.000 0.000 1.000 N NA
 333303 333304 PSPTO0273 PSPTO0274     FALSE 0.120 84.000 0.000 NA   NA
 333305 333306 PSPTO0275 PSPTO0276     FALSE 0.023 236.000 0.000 1.000   NA
 333308 333309 PSPTO0278 PSPTO0279     FALSE 0.429 17.000 0.000 NA   NA
 333309 333310 PSPTO0279 PSPTO0280     FALSE 0.022 221.000 0.000 NA   NA
 333310 333311 PSPTO0280 PSPTO0281     FALSE 0.003 445.000 0.000 NA   NA
 333311 333312 PSPTO0281 PSPTO0282     FALSE 0.040 184.000 0.000 NA   NA
 333312 333313 PSPTO0282 PSPTO0283     FALSE 0.017 241.000 0.000 NA   NA
 333315 10692013 PSPTO0285 PSPTO_0286     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333316 333317 PSPTO0287 PSPTO0288     FALSE 0.005 676.000 0.000 0.084   NA
 333317 333318 PSPTO0288 PSPTO0289     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333318 333319 PSPTO0289 PSPTO0290     FALSE 0.089 123.000 0.000 NA   NA
 333320 333321 PSPTO0291 PSPTO0292     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 333322 333323 PSPTO0293 PSPTO0294     TRUE 0.523 14.000 0.000 NA   NA
 333325 333326 PSPTO0296 PSPTO0297     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333326 333327 PSPTO0297 PSPTO0298     FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 333328 333329 PSPTO0299 PSPTO0300   gabD-2 FALSE 0.073 271.000 0.000 1.000 Y NA
 333329 333330 PSPTO0300 PSPTO0301 gabD-2 gabT-2 FALSE 0.475 184.000 0.303 1.000 N NA
 333330 333331 PSPTO0301 PSPTO0302 gabT-2   FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 333331 333332 PSPTO0302 PSPTO0303     FALSE 0.461 -46.000 0.000 NA   NA
 333333 333334 PSPTO0304 PSPTO0305     TRUE 0.656 134.000 0.294 1.000 N NA
 333335 333336 PSPTO0306 PSPTO0307     FALSE 0.165 191.000 0.062 NA   NA
 333336 333337 PSPTO0307 PSPTO0308   sbp TRUE 0.478 147.000 0.188 NA   NA
 333337 333338 PSPTO0308 PSPTO0309 sbp cysT TRUE 0.642 95.000 0.066 0.002 N NA
 333338 333339 PSPTO0309 PSPTO0310 cysT   TRUE 0.997 14.000 0.935 0.001 N NA
 333339 333340 PSPTO0310 PSPTO0311   cysA TRUE 0.998 3.000 0.587 1.000 Y NA
 333342 333343 PSPTO0313 PSPTO0314     FALSE 0.072 119.000 0.000 NA N NA
 333343 333344 PSPTO0314 PSPTO0315     TRUE 0.915 208.000 0.844 0.082 Y NA
 333344 333345 PSPTO0315 PSPTO0316   gcvT-1 FALSE 0.272 154.000 0.017 0.082 N NA
 333345 333346 PSPTO0316 PSPTO0317 gcvT-1 gcvH-1 TRUE 0.965 44.000 0.317 0.002 Y NA
 333347 333348 PSPTO0318 PSPTO0319     FALSE 0.237 140.000 0.041 NA   NA
 333348 333349 PSPTO0319 PSPTO0320     FALSE 0.392 111.000 0.082 NA   NA
 333352 333353 PSPTO0323 PSPTO0324 argE-2 argA TRUE 0.830 76.000 0.051 0.003 Y NA
 333354 333355 PSPTO0325 PSPTO0326 gshA   FALSE 0.048 244.000 0.036 NA N NA
 333355 333356 PSPTO0326 PSPTO0327     TRUE 0.960 0.000 0.036 NA N NA
 333357 333358 PSPTO0328 PSPTO0329 ompR envZ TRUE 0.941 152.000 0.584 0.031 Y NA
 333361 333362 PSPTO0332 PSPTO0333     FALSE 0.019 230.000 0.000 NA   NA
 333363 333364 PSPTO0334 PSPTO0335 algB   TRUE 0.996 11.000 0.455 0.031 Y NA
 333365 333366 PSPTO0336 PSPTO0337     TRUE 0.797 26.000 0.141 NA   NA
 333366 333367 PSPTO0337 PSPTO0338     FALSE 0.010 260.000 0.000 NA N NA
 333367 333368 PSPTO0338 PSPTO0339     TRUE 0.758 96.000 0.350 1.000 N NA
 333368 333369 PSPTO0339 PSPTO0340     TRUE 0.987 -3.000 0.147 NA   NA
 333369 333370 PSPTO0340 PSPTO0341   dsbA TRUE 0.955 10.000 0.162 NA   NA
 333370 333371 PSPTO0341 PSPTO0342 dsbA   TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 10692014 333373 PSPTO_5670 PSPTO0344   polI FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 333374 333375 PSPTO0345 PSPTO0346   thrB TRUE 0.786 37.000 0.204 NA   NA
 10692015 333377 PSPTO_0348 PSPTO0349     FALSE 0.219 36.000 0.000 NA   NA
 333377 333378 PSPTO0349 PSPTO0350     FALSE 0.296 131.000 0.059 NA N NA
 333378 333379 PSPTO0350 PSPTO0351     FALSE 0.291 83.000 0.029 1.000 N NA
 333380 333381 PSPTO0352 PSPTO0353 ntrC ntrB TRUE 0.999 -3.000 0.587 1.000 Y NA
 333381 333382 PSPTO0353 PSPTO0354 ntrB   FALSE 0.467 -40.000 0.000 NA   NA
 333382 333383 PSPTO0354 PSPTO0355     FALSE 0.056 166.000 0.000 NA   NA
 333383 333384 PSPTO0355 PSPTO0356     TRUE 0.999 -3.000 0.889 NA   NA
 333384 333385 PSPTO0356 PSPTO0357   aroH FALSE 0.247 79.000 0.018 NA   NA
 333385 333386 PSPTO0357 PSPTO0358 aroH   FALSE 0.024 221.000 0.000 1.000 N NA
 333386 333387 PSPTO0358 PSPTO0359   glnA-1 FALSE 0.119 89.000 0.000 1.000 N NA
 333388 333389 PSPTO0360 PSPTO0361 thiI typA FALSE 0.133 143.000 0.011 1.000 N NA
 333390 333391 PSPTO0362 PSPTO0363   polS FALSE 0.059 166.000 0.000 1.000 N NA
 333391 333392 PSPTO0363 PSPTO0364 polS   FALSE 0.438 40.000 0.029 1.000 N NA
 333394 333395 PSPTO0366 PSPTO0367     FALSE 0.010 277.000 0.000 NA   NA
 333395 333396 PSPTO0367 PSPTO0368     FALSE 0.078 138.000 0.000 NA   NA
 333397 333398 PSPTO0369 PSPTO0370     FALSE 0.039 202.000 0.000 1.000   NA
 333398 333399 PSPTO0370 PSPTO0371   iaaL FALSE 0.129 82.000 0.000 1.000 N NA
 333400 333401 PSPTO0372 PSPTO0373     FALSE 0.127 79.000 0.000 NA   NA
 333401 333402 PSPTO0373 PSPTO0374     FALSE 0.091 113.000 0.000 NA   NA
 333402 333403 PSPTO0374 PSPTO0375     FALSE 0.007 304.000 0.000 NA   NA
 333403 333404 PSPTO0375 PSPTO0376     TRUE 0.937 25.000 0.421 1.000 N NA
 333404 333405 PSPTO0376 PSPTO0377     TRUE 0.919 68.000 0.368 1.000 Y NA
 333406 333407 PSPTO0378 PSPTO0379     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 333407 333408 PSPTO0379 PSPTO0380     FALSE 0.090 115.000 0.000 NA   NA
 333409 333410 PSPTO0381 PSPTO0382     TRUE 0.610 41.000 0.079 NA   NA
 333410 333411 PSPTO0382 PSPTO0383   metK FALSE 0.035 223.000 0.004 1.000 N NA
 333411 333412 PSPTO0383 PSPTO0384 metK   TRUE 0.655 21.000 0.036 1.000 N NA
 333413 333414 PSPTO0385 PSPTO0386 tkt epd TRUE 0.797 144.000 0.285 1.000 Y NA
 333414 333415 PSPTO0386 PSPTO0387 epd pgk TRUE 0.949 23.000 0.070 0.003 Y NA
 333415 333416 PSPTO0387 PSPTO0388 pgk   FALSE 0.374 28.000 0.004 NA   NA
 333416 333417 PSPTO0388 PSPTO0389     TRUE 0.829 87.000 0.455 NA   NA
 333417 333418 PSPTO0389 PSPTO0390   fba FALSE 0.394 114.000 0.084 NA   NA
 333422 333423 PSPTO0394 PSPTO0395     TRUE 0.945 84.000 0.868 1.000   NA
 333423 333424 PSPTO0395 PSPTO0396     TRUE 0.991 16.000 0.912 1.000   NA
 333424 333425 PSPTO0396 PSPTO0397     TRUE 0.971 75.000 0.574 0.048 Y NA
 333425 333426 PSPTO0397 PSPTO0398   etfA-1 TRUE 0.848 234.000 0.667 0.012 Y NA
 333426 333427 PSPTO0398 PSPTO0399 etfA-1 etfB-1 TRUE 0.999 -10.000 0.776 0.012 Y NA
 333428 333429 PSPTO0400 PSPTO0401     FALSE 0.031 203.000 0.000 1.000 N NA
 333433 333434 PSPTO0405 PSPTO0406 msrA   FALSE 0.184 151.000 0.032 1.000 N NA
 333434 333435 PSPTO0406 PSPTO0407     FALSE 0.019 249.000 0.000 1.000   NA
 333435 333436 PSPTO0407 PSPTO0408     TRUE 0.825 34.000 0.235 NA   NA
 333436 333437 PSPTO0408 PSPTO0409     TRUE 0.992 0.000 0.233 NA   NA
 333437 333438 PSPTO0409 PSPTO0410     FALSE 0.112 124.000 0.000 1.000   NA
 333441 333442 PSPTO0413 PSPTO0414   mutM FALSE 0.289 46.000 0.015 NA N NA
 333442 333443 PSPTO0414 PSPTO0415 mutM   FALSE 0.193 90.000 0.012 NA   NA
 333444 333445 PSPTO0416 PSPTO0417     TRUE 0.479 91.000 0.088 1.000   NA
 333445 333446 PSPTO0417 PSPTO0418     FALSE 0.085 168.000 0.005 1.000 N NA
 333447 333448 PSPTO0419 PSPTO0420     FALSE 0.262 54.000 0.008 1.000 N NA
 333449 333450 PSPTO0421 PSPTO0422     FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 333450 333451 PSPTO0422 PSPTO0423     TRUE 0.962 13.000 0.286 NA   NA
 333451 333452 PSPTO0423 PSPTO0424     FALSE 0.012 263.000 0.000 NA   NA
 333452 333453 PSPTO0424 PSPTO0425     TRUE 0.979 0.000 0.070 1.000   NA
 333453 333454 PSPTO0425 PSPTO0426     TRUE 0.999 -3.000 0.598 0.005   NA
 333455 333456 PSPTO0427 PSPTO0428 ftsY ftsE TRUE 0.985 -3.000 0.117 1.000 N NA
 333456 333457 PSPTO0428 PSPTO0429 ftsE ftsX TRUE 0.990 -3.000 0.035 NA Y NA
 333457 333458 PSPTO0429 PSPTO0430 ftsX rpoH FALSE 0.294 119.000 0.054 NA N NA
 333460 333461 PSPTO0432 PSPTO0433   thiS FALSE 0.334 109.000 0.058 NA   NA
 333461 333462 PSPTO0433 PSPTO0434 thiS thiG TRUE 0.837 52.000 0.130 1.000 Y NA
 333462 333463 PSPTO0434 PSPTO0435 thiG   TRUE 0.904 11.000 0.060 1.000   NA
 333464 333465 PSPTO0436 PSPTO0437   folA FALSE 0.035 191.000 0.000 NA   NA
 333466 333467 PSPTO0438 PSPTO0439     TRUE 0.997 -7.000 0.904 NA   NA
 333467 333468 PSPTO0439 PSPTO0440   betI FALSE 0.007 343.000 0.000 1.000   NA
 333468 333469 PSPTO0440 PSPTO0441 betI badH TRUE 0.804 105.000 0.459 1.000 N NA
 333469 333470 PSPTO0441 PSPTO0442 badH   TRUE 0.591 12.000 0.000 NA   NA
 333470 333471 PSPTO0442 PSPTO0443   betA FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 333471 333472 PSPTO0443 PSPTO0444 betA   FALSE 0.061 164.000 0.000 1.000 N NA
 333472 333473 PSPTO0444 PSPTO0445     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA N NA
 333473 333474 PSPTO0445 PSPTO0446     FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 333474 333475 PSPTO0446 PSPTO0447     TRUE 0.988 -3.000 0.167 NA   NA
 333475 333476 PSPTO0447 PSPTO0448     FALSE 0.118 85.000 0.000 NA   NA
 333476 333477 PSPTO0448 PSPTO0449     FALSE 0.016 225.000 0.000 NA N NA
 333477 333478 PSPTO0449 PSPTO0450     TRUE 0.584 57.000 0.000 1.000 Y NA
 333483 333484 PSPTO0455 PSPTO0456 fdhA-1 purU-1 TRUE 0.590 57.000 0.103 1.000 N NA
 333484 333485 PSPTO0456 PSPTO0457 purU-1 soxG-1 TRUE 0.536 171.000 0.303 1.000 N NA
 333485 333486 PSPTO0457 PSPTO0458 soxG-1 soxA-1 TRUE 0.982 37.000 0.778 0.002   NA
 333486 333487 PSPTO0458 PSPTO0459 soxA-1 soxD-1 TRUE 0.999 -3.000 0.824 0.001   NA
 333487 333488 PSPTO0459 PSPTO0460 soxD-1 soxB-1 TRUE 0.998 16.000 0.824 0.001 Y NA
 333488 333489 PSPTO0460 PSPTO0461 soxB-1 glyA-1 TRUE 0.977 18.000 0.357 1.000 Y NA
 333489 333490 PSPTO0461 PSPTO0462 glyA-1   FALSE 0.089 257.000 0.000 1.000 Y NA
 333490 333491 PSPTO0462 PSPTO0463     TRUE 1.000 -3.000 0.844 1.000 Y NA
 333491 333492 PSPTO0463 PSPTO0464     TRUE 0.938 68.000 0.328 0.081 Y NA
 333494 333495 PSPTO0466 PSPTO0467     FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 333496 333497 PSPTO0468 PSPTO0469     TRUE 0.945 -3.000 0.017 NA   NA
 333498 333499 PSPTO0470 PSPTO0471     TRUE 0.996 -3.000 0.392 1.000 N NA
 2209161 333502 PSPTO_0473 PSPTO0474 hopAS1   TRUE 0.858 1.000 0.000 NA   NA
 333502 2209162 PSPTO0474 PSPTO_5616     FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 2209162 333503 PSPTO_5616 PSPTO0475     FALSE 0.033 196.000 0.000 NA   NA
 333503 333504 PSPTO0475 PSPTO0476     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333504 333505 PSPTO0476 PSPTO0477     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333505 333506 PSPTO0477 PSPTO0478     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333506 333507 PSPTO0478 PSPTO0479     TRUE 0.732 7.000 0.000 NA   NA
 333507 333508 PSPTO0479 PSPTO0480   glcB-1 FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 333510 333511 PSPTO0482 PSPTO0483   rarD-1 FALSE 0.007 312.000 0.000 NA   NA
 333511 333512 PSPTO0483 PSPTO0484 rarD-1   FALSE 0.185 126.000 0.020 NA   NA
 333513 333514 PSPTO0485 PSPTO0486     TRUE 0.992 -16.000 0.761 1.000 N NA
 333514 333515 PSPTO0486 PSPTO0487     TRUE 0.999 0.000 0.870 0.080 N NA
 333515 333516 PSPTO0487 PSPTO0488     TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.080 N NA
 333516 333517 PSPTO0488 PSPTO0489     TRUE 0.999 -3.000 0.632 0.080 Y NA
 333517 333518 PSPTO0489 PSPTO0490     TRUE 0.932 25.000 0.382 1.000   NA
 333519 333520 PSPTO0491 PSPTO0492     TRUE 0.506 82.000 0.100 NA   NA
 333520 333521 PSPTO0492 PSPTO0493     FALSE 0.070 192.000 0.009 1.000   NA
 333522 333523 PSPTO0494 PSPTO0495 bioB bioF TRUE 0.921 64.000 0.168 0.001 Y NA
 333523 333524 PSPTO0495 PSPTO0496 bioF bioH TRUE 0.950 -7.000 0.092 NA   NA
 333524 333525 PSPTO0496 PSPTO0497 bioH bioC TRUE 0.967 -7.000 0.163 NA   NA
 333525 333526 PSPTO0497 PSPTO0498 bioC bioD TRUE 0.830 32.000 0.063 0.001 N NA
 333526 333527 PSPTO0498 PSPTO0499 bioD   TRUE 0.528 155.000 0.244 NA   NA
 333527 333528 PSPTO0499 PSPTO0500     FALSE 0.005 349.000 0.000 NA   NA
 333529 333530 PSPTO0501 PSPTO0502 hopPtoS2 hopPtoF FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 333530 333531 PSPTO0502 PSPTO0503 hopPtoF schF FALSE 0.079 137.000 0.000 NA   NA
 333532 333533 PSPTO0505 PSPTO0506     TRUE 0.487 170.000 0.250 1.000 N NA
 333533 10692016 PSPTO0506 PSPTO_5647     FALSE 0.113 89.000 0.000 NA   NA
 10692016 333534 PSPTO_5647 PSPTO0507     FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 333535 333536 PSPTO0508 PSPTO0509   pqqE TRUE 0.871 -37.000 0.088 1.000   NA
 333536 333537 PSPTO0509 PSPTO0510 pqqE pqqD TRUE 0.989 -7.000 0.211 0.002   NA
 333537 333538 PSPTO0510 PSPTO0511 pqqD pqqC TRUE 0.997 -3.000 0.246 0.002   NA
 333538 333539 PSPTO0511 PSPTO0512 pqqC pqqB TRUE 0.998 9.000 0.825 0.002   NA
 333539 333540 PSPTO0512 PSPTO0513 pqqB pqqA TRUE 0.643 98.000 0.064 0.002   NA
 333540 333541 PSPTO0513 PSPTO0514 pqqA pqqF TRUE 0.826 136.000 0.333 0.002   NA
 333542 333543 PSPTO0515 PSPTO0516     TRUE 0.584 57.000 0.000 1.000 Y NA
 333544 333545 PSPTO0517 PSPTO0518     TRUE 0.925 18.000 0.258 1.000   NA
 333545 333546 PSPTO0518 PSPTO0519     FALSE 0.262 197.000 0.161 1.000 N NA
 333546 333547 PSPTO0519 PSPTO0520     FALSE 0.233 33.000 0.000 NA   NA
 333548 333549 PSPTO0521 PSPTO0522     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 333552 333553 PSPTO0525 PSPTO0526     FALSE 0.184 46.000 0.000 NA   NA
 333553 333554 PSPTO0526 PSPTO0527     FALSE 0.002 482.000 0.000 NA   NA
 333554 333555 PSPTO0527 PSPTO0528     TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 333555 333556 PSPTO0528 PSPTO0529     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333556 333557 PSPTO0529 PSPTO0530     FALSE 0.002 590.000 0.000 NA   NA
 333558 333559 PSPTO0531 PSPTO0532     FALSE 0.002 484.000 0.000 NA   NA
 333559 10692017 PSPTO0532 PSPTO_0533     TRUE 0.828 3.000 0.000 NA   NA
 10692017 333560 PSPTO_0533 PSPTO0534     FALSE 0.200 41.000 0.000 NA   NA
 333561 401681 PSPTO0535 PSPTO_t02   tRNA-Met-1 TRUE 0.604 -13.000 0.000 NA   NA
 401681 333562 PSPTO_t02 PSPTO0536 tRNA-Met-1   FALSE 0.457 16.000 0.000 NA   NA
 333562 333563 PSPTO0536 PSPTO0537   rpoD FALSE 0.026 257.000 0.013 1.000 N NA
 333563 333564 PSPTO0537 PSPTO0538 rpoD dnaG TRUE 0.781 68.000 0.299 1.000 N NA
 333564 333565 PSPTO0538 PSPTO0539 dnaG rpsU FALSE 0.014 470.000 0.067 1.000 N NA
 333568 333569 PSPTO0542 PSPTO0543 folB-1 folK-1 TRUE 0.996 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 333570 333571 PSPTO0544 PSPTO0545 cca   FALSE 0.267 98.000 0.032 NA   NA
 333571 333572 PSPTO0545 PSPTO0546     TRUE 0.999 -3.000 0.761 NA   NA
 333572 333573 PSPTO0546 PSPTO0547     TRUE 0.881 122.000 0.683 NA   NA
 333573 333574 PSPTO0547 PSPTO0548     FALSE 0.007 286.000 0.000 NA N NA
 333574 333575 PSPTO0548 PSPTO0549   apaH TRUE 0.973 -3.000 0.045 1.000   NA
 333575 333576 PSPTO0549 PSPTO0550 apaH apaG TRUE 0.993 0.000 0.267 NA   NA
 333576 333577 PSPTO0550 PSPTO0551 apaG ksgA FALSE 0.365 114.000 0.078 NA N NA
 333577 333578 PSPTO0551 PSPTO0552 ksgA pdxA TRUE 0.990 -3.000 0.197 1.000 N NA
 333578 333579 PSPTO0552 PSPTO0553 pdxA surA TRUE 0.998 -3.000 0.561 1.000 N NA
 333579 333580 PSPTO0553 PSPTO0554 surA   TRUE 0.816 17.000 0.070 1.000 N NA
 333581 333582 PSPTO0555 PSPTO0556     TRUE 0.868 119.000 0.642 NA   NA
 333582 333583 PSPTO0556 PSPTO0557     TRUE 0.977 1.000 0.091 1.000 N NA
 333585 333586 PSPTO0559 PSPTO0560     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.030 Y NA
 333586 333587 PSPTO0560 PSPTO0561     FALSE 0.015 248.000 0.000 NA   NA
 333587 333588 PSPTO0561 PSPTO0562     FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 333588 333589 PSPTO0562 PSPTO0563     TRUE 0.945 83.000 0.556 1.000 Y NA
 333589 333590 PSPTO0563 PSPTO0564     TRUE 0.843 78.000 0.108 0.080 Y NA
 333590 333591 PSPTO0564 PSPTO0565     TRUE 0.984 12.000 0.145 0.080 Y NA
 333591 333592 PSPTO0565 PSPTO0566   rpe FALSE 0.102 156.000 0.007 1.000 N NA
 333592 333593 PSPTO0566 PSPTO0567 rpe gph-1 TRUE 0.895 15.000 0.120 1.000   NA
 333593 333594 PSPTO0567 PSPTO0568 gph-1 trpE TRUE 0.731 70.000 0.233 1.000   NA
 333595 333596 PSPTO0569 PSPTO0570     FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 333596 333597 PSPTO0570 PSPTO0571     FALSE 0.002 499.000 0.000 NA   NA
 333598 333599 PSPTO0572 PSPTO0573     FALSE 0.002 580.000 0.000 NA   NA
 333599 333600 PSPTO0573 PSPTO0574     TRUE 0.990 -22.000 0.750 NA   NA
 333600 333601 PSPTO0574 PSPTO0575     FALSE 0.184 46.000 0.000 NA   NA
 333601 333602 PSPTO0575 PSPTO0576     TRUE 0.996 -3.000 0.417 NA   NA
 333602 333603 PSPTO0576 PSPTO0577     TRUE 0.983 19.000 0.800 NA   NA
 333603 333604 PSPTO0577 PSPTO0578     TRUE 0.964 61.000 1.000 NA   NA
 333604 333605 PSPTO0578 PSPTO0579     TRUE 0.999 -3.000 0.900 NA   NA
 333605 333606 PSPTO0579 PSPTO0580     TRUE 0.802 131.000 0.500 NA   NA
 333606 333607 PSPTO0580 PSPTO0581     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333607 333608 PSPTO0581 PSPTO0582     FALSE 0.022 223.000 0.000 NA   NA
 333609 333610 PSPTO0583 PSPTO0584     FALSE 0.005 349.000 0.000 NA   NA
 333610 333611 PSPTO0584 PSPTO0585     FALSE 0.248 142.000 0.048 NA   NA
 333612 333613 PSPTO0586 PSPTO0587     TRUE 0.849 24.000 0.059 0.017   NA
 333614 333615 PSPTO0588 PSPTO0589 hopPtoH hopPtoC FALSE 0.008 652.000 0.000 0.003   NA
 333617 333618 PSPTO0591 PSPTO0592   trpG FALSE 0.003 403.000 0.000 1.000 N NA
 333618 333619 PSPTO0592 PSPTO0593 trpG trpD TRUE 0.919 22.000 0.105 1.000 Y NA
 333619 333620 PSPTO0593 PSPTO0594 trpD trpC TRUE 0.998 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 333620 333621 PSPTO0594 PSPTO0595 trpC   FALSE 0.361 35.000 0.013 NA   NA
 333623 333624 PSPTO0597 PSPTO0598   speD FALSE 0.042 243.000 0.025 1.000 N NA
 333625 333626 PSPTO0599 PSPTO0600     FALSE 0.185 122.000 0.018 1.000 N NA
 333626 333627 PSPTO0600 PSPTO0601     FALSE 0.185 103.000 0.008 1.000   NA
 333627 333628 PSPTO0601 PSPTO0602     FALSE 0.204 54.000 0.000 1.000   NA
 333628 333629 PSPTO0602 PSPTO0603     FALSE 0.103 99.000 0.000 NA   NA
 333630 333631 PSPTO0604 PSPTO0605 argC   FALSE 0.085 203.000 0.031 NA   NA
 333632 333633 PSPTO0606 PSPTO0607     TRUE 0.814 28.000 0.184 NA N NA
 333633 333634 PSPTO0607 PSPTO0608     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333635 2209163 PSPTO0609 PSPTO_r01 tyrS Ps16SA FALSE 0.002 520.000 0.000 NA   NA
 2209163 401620 PSPTO_r01 PSPTO_t03 Ps16SA tRNA-Ile-1 FALSE 0.099 104.000 0.000 NA   NA
 401620 401621 PSPTO_t03 PSPTO_t04 tRNA-Ile-1 tRNA-Ala-1 FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 401621 2209164 PSPTO_t04 PSPTO_r02 tRNA-Ala-1 Ps23SA FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 2209164 406456 PSPTO_r02 PSPTO_r03 Ps23SA Ps5SA FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 406456 333636 PSPTO_r03 PSPTO0610 Ps5SA birA FALSE 0.073 142.000 0.000 NA   NA
 333636 333637 PSPTO0610 PSPTO0611 birA   TRUE 0.950 -10.000 0.147 1.000 N NA
 333637 333638 PSPTO0611 PSPTO0612     TRUE 0.831 8.000 0.012 NA   NA
 333638 401622 PSPTO0612 PSPTO_t05   tRNA-Tyr-1 FALSE 0.072 144.000 0.000 NA   NA
 401622 401623 PSPTO_t05 PSPTO_t06 tRNA-Tyr-1 tRNA-Gly-1 FALSE 0.308 25.000 0.000 NA   NA
 401623 401624 PSPTO_t06 PSPTO_t07 tRNA-Gly-1 tRNA-Thr-1 FALSE 0.289 27.000 0.000 NA   NA
 401624 401625 PSPTO_t07 PSPTO_t08 tRNA-Thr-1 tRNA-Trp-1 FALSE 0.056 166.000 0.000 NA   NA
 401625 333639 PSPTO_t08 PSPTO0613 tRNA-Trp-1 secE FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 333639 333640 PSPTO0613 PSPTO0614 secE nusG TRUE 0.996 10.000 0.843 1.000 N NA
 333640 333641 PSPTO0614 PSPTO0615 nusG rplK TRUE 0.882 119.000 0.681 1.000 N NA
 333641 333642 PSPTO0615 PSPTO0616 rplK rplA TRUE 1.000 0.000 0.838 0.016 Y NA
 333642 333643 PSPTO0616 PSPTO0617 rplA rplJ TRUE 0.745 203.000 0.302 0.016 Y NA
 333643 333644 PSPTO0617 PSPTO0618 rplJ rplL TRUE 0.986 80.000 0.884 0.012 Y NA
 333644 10692018 PSPTO0618 PSPTO_5648 rplL   TRUE 0.750 6.000 0.000 NA   NA
 10692018 333645 PSPTO_5648 PSPTO0619   rpoB FALSE 0.066 151.000 0.000 NA   NA
 333645 333646 PSPTO0619 PSPTO0620 rpoB rpoC TRUE 0.990 65.000 0.851 0.001 Y NA
 333646 333647 PSPTO0620 PSPTO0621 rpoC rpsL FALSE 0.220 198.000 0.122 1.000 N NA
 333647 333648 PSPTO0621 PSPTO0622 rpsL rpsG TRUE 0.966 123.000 0.620 0.002 Y NA
 333648 333649 PSPTO0622 PSPTO0623 rpsG fusA TRUE 0.978 31.000 0.579 1.000 Y NA
 333649 333650 PSPTO0623 PSPTO0624 fusA tuf TRUE 0.981 32.000 0.400 0.001 Y NA
 333650 333651 PSPTO0624 PSPTO0625 tuf rpsJ TRUE 0.820 142.000 0.318 1.000 Y NA
 333651 333652 PSPTO0625 PSPTO0626 rpsJ rplC TRUE 0.932 82.000 0.307 0.016 Y NA
 333652 333653 PSPTO0626 PSPTO0627 rplC rplD TRUE 0.996 13.000 0.486 0.012 Y NA
 333653 333654 PSPTO0627 PSPTO0628 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.012 Y NA
 333654 333655 PSPTO0628 PSPTO0629 rplW rplB TRUE 0.998 15.000 0.849 0.014 Y NA
 333655 333656 PSPTO0629 PSPTO0630 rplB rpsS TRUE 0.997 17.000 0.820 0.016 Y NA
 333656 333657 PSPTO0630 PSPTO0631 rpsS rplV TRUE 0.998 14.000 0.769 0.016 Y NA
 333657 333658 PSPTO0631 PSPTO0632 rplV rpsC TRUE 0.997 14.000 0.719 0.016 Y NA
 333658 333659 PSPTO0632 PSPTO0633 rpsC rplP TRUE 0.998 13.000 0.828 0.016 Y NA
 333659 333660 PSPTO0633 PSPTO0634 rplP rpmC TRUE 1.000 0.000 0.802 0.012 Y NA
 333660 333661 PSPTO0634 PSPTO0635 rpmC rpsQ TRUE 1.000 3.000 0.828 0.012 Y NA
 333661 333662 PSPTO0635 PSPTO0636 rpsQ rplN TRUE 0.995 24.000 0.791 0.016 Y NA
 333662 333663 PSPTO0636 PSPTO0637 rplN rplX TRUE 0.998 12.000 0.810 0.016 Y NA
 333663 333664 PSPTO0637 PSPTO0638 rplX rplE TRUE 0.995 21.000 0.758 0.012 Y NA
 333664 333665 PSPTO0638 PSPTO0639 rplE rpsN TRUE 0.991 14.000 0.309 0.012 Y NA
 333665 333666 PSPTO0639 PSPTO0640 rpsN rpsH TRUE 0.710 215.000 0.295 0.012 Y NA
 333666 333667 PSPTO0640 PSPTO0641 rpsH rplF TRUE 0.998 13.000 0.808 0.012 Y NA
 333667 333668 PSPTO0641 PSPTO0642 rplF rplR TRUE 0.999 11.000 0.815 0.012 Y NA
 333668 333669 PSPTO0642 PSPTO0643 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.016 Y NA
 333669 333670 PSPTO0643 PSPTO0644 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.016 Y NA
 333670 333671 PSPTO0644 PSPTO0645 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 333671 333672 PSPTO0645 PSPTO0646 rplO secY TRUE 0.998 1.000 0.730 1.000 N NA
 333672 333673 PSPTO0646 PSPTO0647 secY rpmJ TRUE 0.563 29.000 0.036 1.000 N NA
 333673 333674 PSPTO0647 PSPTO0648 rpmJ rpsM TRUE 0.784 131.000 0.086 0.012 Y NA
 333674 333675 PSPTO0648 PSPTO0649 rpsM rpsK TRUE 0.993 31.000 0.810 0.012 Y NA
 333675 333676 PSPTO0649 PSPTO0650 rpsK rpsD TRUE 0.991 19.000 0.509 0.016 Y NA
 333676 333677 PSPTO0650 PSPTO0651 rpsD rpoA TRUE 0.961 23.000 0.549 1.000 N NA
 333677 333678 PSPTO0651 PSPTO0652 rpoA rplQ TRUE 0.967 42.000 0.873 1.000 N NA
 333678 333679 PSPTO0652 PSPTO0653 rplQ   FALSE 0.013 263.000 0.000 1.000 N NA
 333681 333682 PSPTO0655 PSPTO0656   ssB TRUE 0.814 10.000 0.015 1.000 N NA
 333685 333686 PSPTO0659 PSPTO0660     TRUE 0.996 -3.000 0.375 1.000 N NA
 333686 333687 PSPTO0660 PSPTO0661   ugpC TRUE 0.743 7.000 0.000 1.000 N NA
 333687 333688 PSPTO0661 PSPTO0662 ugpC ugpE TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.079 Y NA
 333688 333689 PSPTO0662 PSPTO0663 ugpE ugpA TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.079 Y NA
 333689 333690 PSPTO0663 PSPTO0664 ugpA ugpB TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.079 Y NA
 333692 333693 PSPTO0666 PSPTO0667     FALSE 0.001 606.000 0.000 NA   NA
 333693 333694 PSPTO0667 PSPTO0668     FALSE 0.061 175.000 0.000 1.000   NA
 333695 333696 PSPTO0669 PSPTO0670     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 333697 333698 PSPTO0671 PSPTO0672   exbD-2 FALSE 0.368 71.000 0.000 0.079 N NA
 333698 333699 PSPTO0672 PSPTO0673 exbD-2 exbB-2 TRUE 0.986 2.000 0.000 0.095 Y NA
 333699 333700 PSPTO0673 PSPTO0674 exbB-2   TRUE 0.892 11.000 0.000 0.014 N NA
 333700 333701 PSPTO0674 PSPTO0675     FALSE 0.066 169.000 0.000 1.000   NA
 333702 333703 PSPTO0676 PSPTO0677     FALSE 0.277 168.000 0.000 NA Y NA
 333703 333704 PSPTO0677 PSPTO0678     TRUE 0.953 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 333705 333706 PSPTO0679 PSPTO0680     FALSE 0.355 104.000 0.060 NA   NA
 333706 333707 PSPTO0680 PSPTO0681     TRUE 0.948 9.000 0.114 NA   NA
 333707 333708 PSPTO0681 PSPTO0682     TRUE 0.999 2.000 0.605 NA Y NA
 333708 333709 PSPTO0682 PSPTO0683     TRUE 0.800 70.000 0.336 NA   NA
 333710 333711 PSPTO0684 PSPTO0685     FALSE 0.131 76.000 0.000 NA   NA
 333712 333713 PSPTO0686 PSPTO0687 trx-1   FALSE 0.126 173.000 0.022 1.000   NA
 333713 333714 PSPTO0687 PSPTO0688     TRUE 0.997 -3.000 0.462 NA   NA
 333715 333716 PSPTO0689 PSPTO0690   ribD TRUE 0.993 -3.000 0.277 NA N NA
 333716 333717 PSPTO0690 PSPTO0691 ribD ribE TRUE 0.951 48.000 0.456 1.000 Y NA
 333717 333718 PSPTO0691 PSPTO0692 ribE ribBA-1 TRUE 0.920 18.000 0.065 1.000 Y NA
 333718 333719 PSPTO0692 PSPTO0693 ribBA-1 ribH-1 TRUE 0.757 129.000 0.049 0.002 Y NA
 333719 333720 PSPTO0693 PSPTO0694 ribH-1 nusB TRUE 0.995 -3.000 0.347 1.000 N NA
 333720 333721 PSPTO0694 PSPTO0695 nusB thiL TRUE 0.921 17.000 0.225 1.000 N NA
 333721 333722 PSPTO0695 PSPTO0696 thiL ribA TRUE 0.492 87.000 0.000 1.000 Y NA
 333722 333723 PSPTO0696 PSPTO0697 ribA   TRUE 0.972 -3.000 0.050 NA   NA
 333724 333725 PSPTO0698 PSPTO0699 dxs ispA TRUE 0.726 164.000 0.246 1.000 Y NA
 333725 333726 PSPTO0699 PSPTO0700 ispA xseB TRUE 0.989 -3.000 0.177 1.000 N NA
 333726 333727 PSPTO0700 PSPTO0701 xseB metC-1 FALSE 0.104 104.000 0.000 1.000 N NA
 333727 333728 PSPTO0701 PSPTO0702 metC-1   FALSE 0.139 70.000 0.000 NA   NA
 333728 333729 PSPTO0702 PSPTO0703     FALSE 0.030 202.000 0.000 NA   NA
 333730 333731 PSPTO0704 PSPTO0705     TRUE 0.996 -3.000 0.161 1.000 Y NA
 333731 333732 PSPTO0705 PSPTO0706     TRUE 0.509 82.000 0.000 1.000 Y NA
 333732 333733 PSPTO0706 PSPTO0707     TRUE 0.847 2.000 0.000 NA   NA
 333733 333734 PSPTO0707 PSPTO0708     TRUE 0.883 8.000 0.029 NA   NA
 333734 333735 PSPTO0708 PSPTO0709     TRUE 0.948 6.000 0.065 1.000   NA
 333735 333736 PSPTO0709 PSPTO0710     TRUE 0.920 21.000 0.308 NA   NA
 333736 333737 PSPTO0710 PSPTO0711     TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 333737 333738 PSPTO0711 PSPTO0712     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333738 333739 PSPTO0712 PSPTO0713     FALSE 0.165 54.000 0.000 NA   NA
 333739 333740 PSPTO0713 PSPTO0714     FALSE 0.044 179.000 0.000 NA   NA
 333740 333741 PSPTO0714 PSPTO0715     FALSE 0.165 54.000 0.000 NA   NA
 333742 333743 PSPTO0716 PSPTO0717     TRUE 0.690 24.000 0.000 0.036   NA
 333744 333745 PSPTO0718 PSPTO0719     TRUE 0.551 -19.000 0.000 NA   NA
 333745 333746 PSPTO0719 PSPTO0720     TRUE 0.847 2.000 0.000 NA   NA
 333747 333748 PSPTO0721 PSPTO0722   ppa-1 FALSE 0.005 359.000 0.000 1.000 N NA
 333748 333749 PSPTO0722 PSPTO0723 ppa-1   FALSE 0.199 111.000 0.022 NA   NA
 333749 333750 PSPTO0723 PSPTO0724     TRUE 0.924 4.000 0.030 NA   NA
 333750 333751 PSPTO0724 PSPTO0725     FALSE 0.203 193.000 0.100 NA   NA
 333751 333752 PSPTO0725 PSPTO0726   eutC FALSE 0.418 72.000 0.047 1.000   NA
 333752 333753 PSPTO0726 PSPTO0727 eutC eutB TRUE 1.000 -3.000 0.859 0.001 Y NA
 333753 333754 PSPTO0727 PSPTO0728 eutB   FALSE 0.009 296.000 0.000 1.000 N NA
 333755 333756 PSPTO0729 PSPTO0730 mpl   TRUE 0.992 -3.000 0.235 1.000 N NA
 333756 333757 PSPTO0730 PSPTO0731     TRUE 0.876 -19.000 0.070 NA   NA
 333758 333759 PSPTO0732 PSPTO0733     TRUE 0.670 28.000 0.056 1.000   NA
 333759 333760 PSPTO0733 PSPTO0734     TRUE 0.588 141.000 0.243 1.000   NA
 333761 333762 PSPTO0735 PSPTO0736     TRUE 0.999 -3.000 0.818 NA   NA
 333762 333763 PSPTO0736 PSPTO0737     TRUE 0.754 14.000 0.027 NA   NA
 333764 333765 PSPTO0738 PSPTO0739     FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 333765 333766 PSPTO0739 PSPTO0740   smtA TRUE 0.788 20.000 0.087 NA   NA
 333766 333767 PSPTO0740 PSPTO0741 smtA   TRUE 0.488 81.000 0.088 NA   NA
 333767 333768 PSPTO0741 PSPTO0742     FALSE 0.260 115.000 0.036 NA   NA
 333768 333769 PSPTO0742 PSPTO0743     TRUE 0.709 31.000 0.000 1.000 Y NA
 333770 333771 PSPTO0744 PSPTO0745     FALSE 0.042 181.000 0.000 NA   NA
 333771 333772 PSPTO0745 PSPTO0746     FALSE 0.233 33.000 0.000 NA   NA
 333775 333776 PSPTO0749 PSPTO0750     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 N NA
 333776 333777 PSPTO0750 PSPTO0751     TRUE 0.875 70.000 0.500 NA   NA
 333778 333779 PSPTO0752 PSPTO0753     FALSE 0.438 147.000 0.161 1.000 N NA
 333781 333782 PSPTO0755 PSPTO0756     FALSE 0.036 437.000 0.000 0.078 Y NA
 333783 333784 PSPTO0757 PSPTO0758 add   FALSE 0.309 79.000 0.025 1.000   NA
 333784 333785 PSPTO0758 PSPTO0759     TRUE 0.549 78.000 0.106 1.000   NA
 333785 333786 PSPTO0759 PSPTO0760     FALSE 0.025 230.000 0.000 1.000   NA
 333786 333787 PSPTO0760 PSPTO0761   fecD TRUE 0.997 4.000 0.380 1.000 Y NA
 333787 333788 PSPTO0761 PSPTO0762 fecD fecC TRUE 0.999 -3.000 0.340 0.079 Y NA
 333788 333789 PSPTO0762 PSPTO0763 fecC fecB TRUE 0.996 16.000 0.864 1.000 Y NA
 333791 333792 PSPTO0765 PSPTO0766 atzB   TRUE 0.487 124.000 0.135 1.000   NA
 333792 333793 PSPTO0766 PSPTO0767     FALSE 0.018 251.000 0.000 1.000   NA
 333793 333794 PSPTO0767 PSPTO0768     TRUE 0.993 0.000 0.154 0.079   NA
 333794 333795 PSPTO0768 PSPTO0769     TRUE 0.989 12.000 0.590 1.000   NA
 333795 333796 PSPTO0769 PSPTO0770     FALSE 0.003 524.000 0.000 1.000   NA
 333796 333797 PSPTO0770 PSPTO0771     FALSE 0.451 33.000 0.019 1.000   NA
 333797 333798 PSPTO0771 PSPTO0772     TRUE 0.654 99.000 0.240 1.000 N NA
 333798 333799 PSPTO0772 PSPTO0773     FALSE 0.188 186.000 0.068 1.000 N NA
 333800 333801 PSPTO0774 PSPTO0775   mmsA-1 TRUE 0.820 94.000 0.455 1.000 N NA
 333801 2209165 PSPTO0775 PSPTO_r04 mmsA-1 Ps16SB FALSE 0.001 606.000 0.000 NA   NA
 2209165 401626 PSPTO_r04 PSPTO_t09 Ps16SB tRNA-Ile-2 FALSE 0.099 104.000 0.000 NA   NA
 401626 401627 PSPTO_t09 PSPTO_t10 tRNA-Ile-2 tRNA-Ala-2 FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 401627 2209166 PSPTO_t10 PSPTO_r05 tRNA-Ala-2 Ps23SB FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 2209166 406457 PSPTO_r05 PSPTO_r06 Ps23SB Ps5SB FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 406457 333802 PSPTO_r06 PSPTO0776 Ps5SB recC FALSE 0.035 192.000 0.000 NA   NA
 333802 333803 PSPTO0776 PSPTO0777 recC recB TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 333803 333804 PSPTO0777 PSPTO0778 recB recD TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 333808 333809 PSPTO0782 PSPTO0783 mmsA-2 mmsB TRUE 0.989 35.000 1.000 0.001 N NA
 333809 333810 PSPTO0783 PSPTO0784 mmsB   FALSE 0.095 115.000 0.000 1.000 N NA
 333811 333812 PSPTO0785 PSPTO0786     TRUE 0.917 30.000 0.182 1.000 Y NA
 333814 333815 PSPTO0788 PSPTO0789     TRUE 0.997 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 333815 333816 PSPTO0789 PSPTO0790     TRUE 0.998 -6.000 0.696 1.000 Y NA
 333816 333817 PSPTO0790 PSPTO0791     TRUE 1.000 -3.000 0.690 0.002 Y NA
 333818 333819 PSPTO0792 PSPTO0793   selD FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 333819 333820 PSPTO0793 PSPTO0794 selD   TRUE 0.991 0.000 0.214 NA   NA
 333820 333821 PSPTO0794 PSPTO0795     FALSE 0.223 35.000 0.000 NA   NA
 333823 333824 PSPTO0797 PSPTO0798 rplU rpmA TRUE 0.990 33.000 0.667 0.012 Y NA
 333824 333825 PSPTO0798 PSPTO0799 rpmA   FALSE 0.390 217.000 0.335 1.000   NA
 333825 333826 PSPTO0799 PSPTO0800   proB TRUE 0.647 91.000 0.206 1.000   NA
 333826 333827 PSPTO0800 PSPTO0801 proB creA TRUE 0.481 26.000 0.017 NA   NA
 333829 333830 PSPTO0803 PSPTO0804     FALSE 0.175 49.000 0.000 NA   NA
 333830 333831 PSPTO0804 PSPTO0805   ribF TRUE 0.520 133.000 0.169 1.000   NA
 333831 333832 PSPTO0805 PSPTO0806 ribF ileS TRUE 0.905 21.000 0.254 1.000 N NA
 333832 333833 PSPTO0806 PSPTO0807 ileS lspA TRUE 0.964 -7.000 0.147 1.000 N NA
 333833 333834 PSPTO0807 PSPTO0808 lspA   TRUE 0.989 -7.000 0.417 1.000 N NA
 333834 333835 PSPTO0808 PSPTO0809   ispH TRUE 0.898 84.000 0.626 1.000 N NA
 333837 333838 PSPTO0811 PSPTO0812     TRUE 0.998 0.000 0.333 NA Y NA
 333838 333839 PSPTO0812 PSPTO0813     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 333839 333840 PSPTO0813 PSPTO0814     TRUE 0.989 12.000 0.615 NA   NA
 333840 333841 PSPTO0814 PSPTO0815     TRUE 0.989 -13.000 0.346 NA Y NA
 333841 333842 PSPTO0815 PSPTO0816     TRUE 0.989 12.000 0.346 1.000 Y NA
 333842 333843 PSPTO0816 PSPTO0817     TRUE 0.655 29.000 0.061 1.000 N NA
 333843 333844 PSPTO0817 PSPTO0818     FALSE 0.089 131.000 0.000 1.000 N NA
 333844 333845 PSPTO0818 PSPTO0819     TRUE 0.872 39.000 0.333 1.000   NA
 333846 333847 PSPTO0820 PSPTO0821     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA N NA
 333847 333848 PSPTO0821 PSPTO0822     TRUE 0.861 82.000 0.500 1.000 N NA
 333848 333849 PSPTO0822 PSPTO0823   pilR FALSE 0.009 474.000 0.000 0.077 N NA
 333849 333850 PSPTO0823 PSPTO0824 pilR pilS TRUE 0.998 3.000 0.556 1.000 Y NA
 333850 333851 PSPTO0824 PSPTO0825 pilS   TRUE 0.964 -10.000 0.206 NA   NA
 333851 333852 PSPTO0825 PSPTO0826     FALSE 0.312 47.000 0.015 NA   NA
 3829846 333853 PSPTO_0827 PSPTO0828 rluD   TRUE 0.989 -3.000 0.168 NA   NA
 333853 333854 PSPTO0828 PSPTO0829   clpB FALSE 0.286 172.000 0.108 NA   NA
 333854 401628 PSPTO0829 PSPTO_t11 clpB tRNA-Asn-1 FALSE 0.008 302.000 0.000 NA   NA
 401628 401629 PSPTO_t11 PSPTO_t12 tRNA-Asn-1 tRNA-Pro-1 FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 401629 401630 PSPTO_t12 PSPTO_t13 tRNA-Pro-1 tRNA-Lys-1 TRUE 0.750 6.000 0.000 NA   NA
 401630 401631 PSPTO_t13 PSPTO_t14 tRNA-Lys-1 tRNA-Pro-2 FALSE 0.106 96.000 0.000 NA   NA
 10692019 333855 PSPTO_0830 PSPTO0831     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333855 333856 PSPTO0831 PSPTO0832     FALSE 0.118 109.000 0.000 1.000   NA
 333856 333857 PSPTO0832 PSPTO0833     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 333858 333859 PSPTO0834 PSPTO0835     FALSE 0.146 70.000 0.000 1.000 N NA
 333859 333860 PSPTO0835 PSPTO0836     FALSE 0.182 66.000 0.000 1.000   NA
 333860 333861 PSPTO0836 PSPTO0837     TRUE 0.847 2.000 0.000 NA   NA
 333861 333862 PSPTO0837 PSPTO0838     FALSE 0.346 21.000 0.000 NA   NA
 333862 333863 PSPTO0838 PSPTO0840     FALSE 0.001 1046.000 0.000 NA   NA
 333865 10692021 PSPTO0844 PSPTO_0846     FALSE 0.001 1567.000 0.000 NA   NA
 10692021 333866 PSPTO_0846 PSPTO0847     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333866 333867 PSPTO0847 PSPTO0848     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 333867 333868 PSPTO0848 PSPTO0849     TRUE 0.987 21.000 1.000 NA   NA
 333868 333869 PSPTO0849 PSPTO0850     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 333869 333870 PSPTO0850 PSPTO0851     FALSE 0.002 541.000 0.000 NA   NA
 333870 333871 PSPTO0851 PSPTO0852   hopPmaG(Pto) FALSE 0.012 262.000 0.000 NA   NA
 333871 2209167 PSPTO0852 PSPTO_5618 hopPmaG(Pto) hopAT1 FALSE 0.001 817.000 0.000 NA   NA
 2209168 333872 PSPTO_5621 PSPTO0853     FALSE 0.266 36.000 0.000 1.000   NA
 333872 333873 PSPTO0853 PSPTO0854     FALSE 0.211 38.000 0.000 NA   NA
 333873 333874 PSPTO0854 PSPTO0855     FALSE 0.001 1690.000 0.000 NA   NA
 333874 333875 PSPTO0855 PSPTO0856     TRUE 0.983 3.000 0.167 1.000   NA
 333876 333877 PSPTO0857 PSPTO0858     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 333877 333878 PSPTO0858 PSPTO0859     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 333878 333879 PSPTO0859 PSPTO0860     FALSE 0.342 288.000 0.600 NA   NA
 333879 333880 PSPTO0860 PSPTO0861     TRUE 0.985 -22.000 0.600 NA   NA
 333880 333881 PSPTO0861 PSPTO0862     TRUE 0.997 -10.000 1.000 NA   NA
 333881 333882 PSPTO0862 PSPTO0863     TRUE 0.998 -3.000 0.571 NA   NA
 333882 333883 PSPTO0863 PSPTO0864     FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 333883 333884 PSPTO0864 PSPTO0865     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 333884 333885 PSPTO0865 PSPTO0866     FALSE 0.191 44.000 0.000 NA   NA
 333885 333886 PSPTO0866 PSPTO0867     TRUE 0.987 16.000 0.750 NA   NA
 333886 333887 PSPTO0867 PSPTO0868     TRUE 0.988 20.000 1.000 NA   NA
 333887 333888 PSPTO0868 PSPTO0869     TRUE 0.878 87.000 0.571 NA   NA
 333888 2209169 PSPTO0869 PSPTO_5617     FALSE 0.121 83.000 0.000 NA   NA
 333890 333891 PSPTO0871 PSPTO0873     FALSE 0.001 951.000 0.000 1.000   NA
 333891 333892 PSPTO0873 PSPTO0874     FALSE 0.145 87.000 0.000 1.000   NA
 333892 333893 PSPTO0874 PSPTO0875     TRUE 0.491 53.000 0.000 0.035   NA
 333893 333894 PSPTO0875 PSPTO0876   hopPtoD1 FALSE 0.002 466.000 0.000 NA   NA
 333897 333898 PSPTO0879 PSPTO0880     TRUE 0.911 10.000 0.060 NA   NA
 333898 333899 PSPTO0880 PSPTO0881     TRUE 0.974 40.000 1.000 NA   NA
 333899 333900 PSPTO0881 PSPTO0882     FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 333902 333903 PSPTO0884 PSPTO0885     TRUE 0.679 81.000 0.219 1.000 N NA
 333903 333904 PSPTO0885 PSPTO0886   malK TRUE 0.827 18.000 0.000 1.000 Y NA
 333904 333905 PSPTO0886 PSPTO0887 malK   TRUE 0.876 28.000 0.021 0.078 Y NA
 333905 333906 PSPTO0887 PSPTO0888     TRUE 1.000 -3.000 0.723 0.078 Y NA
 333906 333907 PSPTO0888 PSPTO0889     TRUE 0.909 22.000 0.028 0.078 Y NA
 333908 333909 PSPTO0890 PSPTO0891 scrY   FALSE 0.106 96.000 0.000 NA   NA
 333911 333912 PSPTO0893 PSPTO0894     FALSE 0.043 180.000 0.000 NA   NA
 333913 333914 PSPTO0895 PSPTO0896     FALSE 0.017 242.000 0.000 NA   NA
 333914 333915 PSPTO0896 PSPTO0897     FALSE 0.054 377.000 0.000 0.023 Y NA
 333918 2209170 PSPTO0900 PSPTO_5619     FALSE 0.005 344.000 0.000 NA   NA
 2209170 333919 PSPTO_5619 PSPTO0901     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 333920 333921 PSPTO0902 PSPTO0903     FALSE 0.277 215.000 0.000 0.021 Y NA
 2209171 333923 PSPTO_0904 PSPTO0905     FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 333923 333924 PSPTO0905 PSPTO0906     FALSE 0.037 188.000 0.000 NA   NA
 333924 333925 PSPTO0906 PSPTO0907     FALSE 0.052 169.000 0.000 NA   NA
 333926 333927 PSPTO0908 PSPTO0909 cheB-1   TRUE 0.987 -10.000 0.211 1.000 Y NA
 333927 333928 PSPTO0909 PSPTO0910   cheR-1 TRUE 0.998 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 333928 333929 PSPTO0910 PSPTO0911 cheR-1 cheW-1 TRUE 0.985 10.000 0.182 1.000 Y NA
 333929 333930 PSPTO0911 PSPTO0912 cheW-1   TRUE 0.985 37.000 0.600 0.016 Y NA
 333930 333931 PSPTO0912 PSPTO0913   cheA-1 TRUE 0.945 29.000 0.136 0.016 Y NA
 333931 333932 PSPTO0913 PSPTO0914 cheA-1   FALSE 0.428 47.000 0.035 NA   NA
 333932 333933 PSPTO0914 PSPTO0915   cheY-1 FALSE 0.289 27.000 0.000 NA   NA
 333933 333934 PSPTO0915 PSPTO0916 cheY-1   TRUE 0.966 10.000 0.041 1.000 Y NA
 333934 333935 PSPTO0916 PSPTO0917   ndH FALSE 0.003 429.000 0.000 1.000 N NA
 333935 333936 PSPTO0917 PSPTO0918 ndH   TRUE 0.894 96.000 0.667 NA   NA
 333936 333937 PSPTO0918 PSPTO0919     TRUE 0.800 14.000 0.039 NA   NA
 333937 333938 PSPTO0919 PSPTO0920     TRUE 0.925 6.000 0.039 1.000   NA
 333938 333939 PSPTO0920 PSPTO0921     TRUE 0.591 12.000 0.000 NA   NA
 333939 333940 PSPTO0921 PSPTO0922     FALSE 0.001 647.000 0.000 NA   NA
 333940 333941 PSPTO0922 PSPTO0923   coaE TRUE 0.966 -3.000 0.033 1.000   NA
 333941 333942 PSPTO0923 PSPTO0924 coaE pilD TRUE 0.985 -3.000 0.122 1.000 N NA
 333942 333943 PSPTO0924 PSPTO0925 pilD pilC TRUE 0.998 2.000 0.454 1.000 Y NA
 333943 333944 PSPTO0925 PSPTO0926 pilC pilB TRUE 0.998 3.000 0.362 0.013 Y NA
 333947 333948 PSPTO0929 PSPTO0930 gsT   FALSE 0.022 241.000 0.000 1.000   NA
 333948 333949 PSPTO0930 PSPTO0931     TRUE 0.997 -3.000 0.522 NA   NA
 333951 333952 PSPTO0933 PSPTO0934     FALSE 0.201 55.000 0.000 1.000   NA
 333952 333953 PSPTO0934 PSPTO0935     FALSE 0.144 67.000 0.000 NA   NA
 333953 333954 PSPTO0935 PSPTO0936     TRUE 0.960 -7.000 0.126 NA   NA
 333954 333955 PSPTO0936 PSPTO0937     TRUE 0.983 -7.000 0.296 NA   NA
 333955 333956 PSPTO0937 PSPTO0938     TRUE 0.996 0.000 0.420 NA   NA
 333956 333957 PSPTO0938 PSPTO0939     FALSE 0.146 70.000 0.000 1.000 N NA
 333957 333958 PSPTO0939 PSPTO0940   terZ FALSE 0.186 48.000 0.000 1.000 N NA
 333958 333959 PSPTO0940 PSPTO0941 terZ terA TRUE 0.997 -3.000 0.270 0.004   NA
 333959 333960 PSPTO0941 PSPTO0942 terA terB TRUE 0.626 52.000 0.120 NA   NA
 333960 333961 PSPTO0942 PSPTO0943 terB terC TRUE 0.919 27.000 0.167 NA Y NA
 333961 333962 PSPTO0943 PSPTO0944 terC terD TRUE 0.855 28.000 0.222 1.000 N NA
 333962 333963 PSPTO0944 PSPTO0945 terD terE TRUE 0.923 38.000 0.103 0.004 Y NA
 333964 333965 PSPTO0946 PSPTO0947     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 333965 333966 PSPTO0947 PSPTO0948   nadC FALSE 0.004 382.000 0.000 NA   NA
 333967 333968 PSPTO0949 PSPTO0950   ampD FALSE 0.028 311.000 0.048 NA   NA
 333968 333969 PSPTO0950 PSPTO0951 ampD   TRUE 0.974 16.000 0.249 1.000 Y NA
 333970 333971 PSPTO0952 PSPTO0953     FALSE 0.175 102.000 0.017 NA N NA
 333972 333973 PSPTO0954 PSPTO0955   fruK TRUE 0.994 0.000 0.101 1.000 Y NA
 333973 333974 PSPTO0955 PSPTO0956 fruK   TRUE 0.994 13.000 0.562 1.000 Y NA
 333975 333976 PSPTO0957 PSPTO0958 phbA-1   FALSE 0.196 139.000 0.029 NA   NA
 333976 333977 PSPTO0958 PSPTO0959   pgi FALSE 0.043 247.000 0.029 NA   NA
 333977 333978 PSPTO0959 PSPTO0960 pgi panC FALSE 0.030 243.000 0.010 1.000 N NA
 333978 333979 PSPTO0960 PSPTO0961 panC panB TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.000 Y NA
 333979 333980 PSPTO0961 PSPTO0962 panB folK-2 FALSE 0.320 229.000 0.117 1.000 Y NA
 333980 333981 PSPTO0962 PSPTO0963 folK-2 pcnB TRUE 0.978 -7.000 0.234 1.000 N NA
 333981 10692022 PSPTO0963 PSPTO_5668 pcnB   FALSE 0.072 144.000 0.000 NA   NA
 10692022 333982 PSPTO_5668 PSPTO0964     FALSE 0.032 199.000 0.000 NA   NA
 333982 333983 PSPTO0964 PSPTO0965     TRUE 0.947 23.000 0.453 1.000 N NA
 333983 333984 PSPTO0965 PSPTO0966     TRUE 0.979 -10.000 0.312 1.000   NA
 333984 333985 PSPTO0966 PSPTO0967     FALSE 0.332 99.000 0.042 1.000   NA
 333985 333986 PSPTO0967 PSPTO0968     FALSE 0.002 587.000 0.000 1.000 N NA
 333986 333987 PSPTO0968 PSPTO0969   dksA FALSE 0.132 80.000 0.000 1.000 N NA
 333988 333989 PSPTO0970 PSPTO0971   sfsA TRUE 0.964 0.000 0.038 NA   NA
 333991 10692023 PSPTO0973 PSPTO_5649 deoC   FALSE 0.308 25.000 0.000 NA   NA
 10692023 333992 PSPTO_5649 PSPTO0974     FALSE 0.090 118.000 0.000 NA   NA
 333993 333994 PSPTO0975 PSPTO0976     FALSE 0.101 102.000 0.000 NA   NA
 333995 333996 PSPTO0977 PSPTO0978     TRUE 0.802 -12.000 0.014 1.000   NA
 333996 333997 PSPTO0978 PSPTO0979     TRUE 0.944 0.000 0.018 NA   NA
 333999 334000 PSPTO0981 PSPTO0982 ilvB ilvN TRUE 0.999 3.000 0.371 0.000 Y NA
 334000 334001 PSPTO0982 PSPTO0983 ilvN ilvC TRUE 0.910 48.000 0.092 0.001 Y NA
 334001 334002 PSPTO0983 PSPTO0984 ilvC pssA-1 FALSE 0.231 145.000 0.041 1.000 N NA
 334002 334003 PSPTO0984 PSPTO0985 pssA-1   FALSE 0.365 65.000 0.029 1.000   NA
 334003 334004 PSPTO0985 PSPTO0986     TRUE 0.999 0.000 0.790 0.046   NA
 334004 2209172 PSPTO0986 PSPTO_r07   Ps16SC FALSE 0.002 513.000 0.000 NA   NA
 2209172 401632 PSPTO_r07 PSPTO_t15 Ps16SC tRNA-Ile-3 FALSE 0.099 104.000 0.000 NA   NA
 401632 401633 PSPTO_t15 PSPTO_t16 tRNA-Ile-3 tRNA-Ala-3 FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 401633 2209173 PSPTO_t16 PSPTO_r08 tRNA-Ala-3 Ps23SC FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 2209173 406458 PSPTO_r08 PSPTO_r09 Ps23SC Ps5SC FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 406458 334005 PSPTO_r09 PSPTO0987 Ps5SC   FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 334006 334007 PSPTO0988 PSPTO0989     TRUE 0.999 -3.000 0.950 NA   NA
 334007 334008 PSPTO0989 PSPTO0990     TRUE 0.996 -10.000 0.947 NA   NA
 334009 334010 PSPTO0991 PSPTO0992   rimI TRUE 0.885 -7.000 0.027 NA   NA
 334013 334014 PSPTO0995 PSPTO0996     FALSE 0.119 108.000 0.000 1.000   NA
 334014 334015 PSPTO0996 PSPTO0997     FALSE 0.163 76.000 0.000 1.000   NA
 334016 334017 PSPTO0998 PSPTO0999     FALSE 0.005 346.000 0.000 1.000 N NA
 334018 334019 PSPTO1000 PSPTO1001     FALSE 0.116 87.000 0.000 NA   NA
 334020 334021 PSPTO1003 PSPTO1004     FALSE 0.163 76.000 0.000 1.000   NA
 334022 334023 PSPTO1005 PSPTO1006 gmd   TRUE 0.858 1.000 0.000 NA   NA
 334026 334027 PSPTO1009 PSPTO1010   phoD FALSE 0.067 155.000 0.000 1.000 N NA
 334027 334028 PSPTO1010 PSPTO1011 phoD   TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000 N NA
 334029 334030 PSPTO1012 PSPTO1013     TRUE 0.997 0.000 0.500 1.000 N NA
 334030 334031 PSPTO1013 PSPTO1014     TRUE 0.974 21.000 0.667 1.000 N NA
 334031 334032 PSPTO1014 PSPTO1015     FALSE 0.088 132.000 0.000 1.000 N NA
 334032 334033 PSPTO1015 PSPTO1016     TRUE 0.696 24.000 0.059 NA   NA
 334033 334034 PSPTO1016 PSPTO1017     FALSE 0.448 -106.000 0.000 NA   NA
 334034 10692025 PSPTO1017 PSPTO_1018     FALSE 0.392 18.000 0.000 NA   NA
 10692025 334035 PSPTO_1018 PSPTO1019     FALSE 0.193 43.000 0.000 NA   NA
 334035 334036 PSPTO1019 PSPTO1020     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 334036 10692026 PSPTO1020 PSPTO_1021     FALSE 0.184 46.000 0.000 NA   NA
 334038 334039 PSPTO1023 PSPTO1024     FALSE 0.439 64.000 0.044 1.000   NA
 334039 334040 PSPTO1024 PSPTO1025     FALSE 0.144 71.000 0.000 1.000 N NA
 334040 334041 PSPTO1025 PSPTO1026   wssA FALSE 0.007 283.000 0.000 NA N NA
 334041 334042 PSPTO1026 PSPTO1027 wssA wssB TRUE 0.995 -3.000 0.375 NA N NA
 334042 334043 PSPTO1027 PSPTO1028 wssB   TRUE 0.967 15.000 0.182 0.001   NA
 334043 334044 PSPTO1028 PSPTO1029   wssD TRUE 0.992 4.000 0.375 1.000   NA
 334044 334045 PSPTO1029 PSPTO1030 wssD wssE FALSE 0.376 180.000 0.200 1.000 N NA
 334045 334046 PSPTO1030 PSPTO1031 wssE wssF TRUE 0.853 16.000 0.080 1.000   NA
 334046 334047 PSPTO1031 PSPTO1032 wssF wssG TRUE 0.996 -3.000 0.429 NA   NA
 334047 334048 PSPTO1032 PSPTO1033 wssG wssH TRUE 0.979 19.000 0.714 NA   NA
 334048 334049 PSPTO1033 PSPTO1034 wssH wssI TRUE 0.992 12.000 0.714 NA   NA
 334050 334051 PSPTO1035 PSPTO1036     FALSE 0.027 207.000 0.000 NA   NA
 334051 334052 PSPTO1036 PSPTO1037     FALSE 0.018 233.000 0.000 NA   NA
 334052 334053 PSPTO1037 PSPTO1038     TRUE 0.996 -3.000 0.412 NA   NA
 334054 334055 PSPTO1039 PSPTO1040     TRUE 0.998 4.000 0.902 1.000   NA
 334055 334056 PSPTO1040 PSPTO1041   aroA FALSE 0.133 96.000 0.000 1.000   NA
 334057 334058 PSPTO1042 PSPTO1043     TRUE 0.999 0.000 0.898 NA N NA
 334058 334059 PSPTO1043 PSPTO1044     FALSE 0.003 414.000 0.000 NA   NA
 334059 334060 PSPTO1044 PSPTO1045     FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 334060 334061 PSPTO1045 PSPTO1046     TRUE 0.998 0.000 0.727 NA   NA
 334061 334062 PSPTO1046 PSPTO1047     FALSE 0.090 115.000 0.000 NA   NA
 334062 334063 PSPTO1047 PSPTO1048     TRUE 0.857 -25.000 0.067 NA   NA
 334063 334064 PSPTO1048 PSPTO1049   dctM TRUE 0.548 84.000 0.133 NA   NA
 334064 334065 PSPTO1049 PSPTO1050 dctM   TRUE 0.999 1.000 0.905 NA Y NA
 334065 334066 PSPTO1050 PSPTO1051   dctP TRUE 0.981 64.000 0.947 NA Y NA
 334066 334067 PSPTO1051 PSPTO1052 dctP   TRUE 0.921 57.000 0.350 NA Y NA
 334067 334068 PSPTO1052 PSPTO1053     TRUE 0.940 57.000 0.450 NA Y NA
 334068 334069 PSPTO1053 PSPTO1054     FALSE 0.394 179.000 0.200 1.000   NA
 334070 334071 PSPTO1055 PSPTO1056     FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 334072 334073 PSPTO1057 PSPTO1058     TRUE 0.998 0.000 0.615 NA   NA
 334073 334074 PSPTO1058 PSPTO1059     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 334075 334076 PSPTO1060 PSPTO1061     FALSE 0.015 246.000 0.000 NA   NA
 334077 10692027 PSPTO1062 PSPTO_1064     FALSE 0.001 2503.000 0.000 NA   NA
 10692027 401680 PSPTO_1064 PSPTO_t17   tRNA-Met-2 FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 401680 334078 PSPTO_t17 PSPTO1065 tRNA-Met-2   FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 334079 334080 PSPTO1066 PSPTO1067     FALSE 0.046 177.000 0.000 NA   NA
 334081 334082 PSPTO1068 PSPTO1069     FALSE 0.072 144.000 0.000 NA   NA
 334082 334083 PSPTO1069 PSPTO1070     TRUE 0.689 11.000 0.000 1.000   NA
 334083 334084 PSPTO1070 PSPTO1071     TRUE 0.604 -13.000 0.000 NA   NA
 334084 334085 PSPTO1071 PSPTO1072     TRUE 0.990 -3.000 0.035 NA Y NA
 334085 334086 PSPTO1072 PSPTO1073     TRUE 0.828 3.000 0.000 NA   NA
 334086 334087 PSPTO1073 PSPTO1074     FALSE 0.184 46.000 0.000 NA   NA
 334087 334088 PSPTO1074 PSPTO1075     TRUE 0.781 -7.000 0.000 1.000   NA
 334088 334089 PSPTO1075 PSPTO1076     TRUE 0.982 -10.000 0.155 1.000 Y NA
 334089 334090 PSPTO1076 PSPTO1077   rfbC-1 TRUE 0.989 0.000 0.028 1.000 Y NA
 334090 334091 PSPTO1077 PSPTO1078 rfbC-1   FALSE 0.008 671.000 0.000 NA Y NA
 334091 334092 PSPTO1078 PSPTO1079   rfbA TRUE 0.862 42.000 0.150 NA Y NA
 334092 334093 PSPTO1079 PSPTO1080 rfbA rfbD TRUE 0.997 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 334093 334094 PSPTO1080 PSPTO1081 rfbD rfbB-1 TRUE 0.997 0.000 0.084 0.002 Y NA
 334096 334097 PSPTO1083 PSPTO1084     FALSE 0.001 1003.000 0.000 NA N NA
 334097 334098 PSPTO1084 PSPTO1085     FALSE 0.366 75.000 0.041 NA   NA
 334099 334100 PSPTO1086 PSPTO1087 hsdM   TRUE 0.988 -10.000 0.150 0.078 Y NA
 334100 334101 PSPTO1087 PSPTO1088     TRUE 0.975 -3.000 0.057 NA   NA
 334101 334102 PSPTO1088 PSPTO1089     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 334103 334104 PSPTO1090 PSPTO1091     TRUE 0.993 0.000 0.286 NA   NA
 334105 334106 PSPTO1092 PSPTO1093 mobB-1   TRUE 0.828 3.000 0.000 NA   NA
 334106 334107 PSPTO1093 PSPTO1094     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 334107 334108 PSPTO1094 PSPTO1095     FALSE 0.001 743.000 0.000 NA   NA
 334108 334109 PSPTO1095 PSPTO1096     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 334109 334110 PSPTO1096 PSPTO1097     FALSE 0.020 244.000 0.000 1.000   NA
 334111 334112 PSPTO1098 PSPTO1099     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 334112 334113 PSPTO1099 PSPTO1100     FALSE 0.001 1307.000 0.000 NA   NA
 334113 334114 PSPTO1100 PSPTO1101   ychF FALSE 0.025 216.000 0.000 1.000 N NA
 334114 334115 PSPTO1101 PSPTO1102 ychF pth TRUE 0.943 22.000 0.184 1.000 Y NA
 334115 334116 PSPTO1102 PSPTO1103 pth   TRUE 0.913 165.000 0.496 0.017 Y NA
 334116 334117 PSPTO1103 PSPTO1104   prsA FALSE 0.419 138.000 0.122 1.000 N NA
 334117 401679 PSPTO1104 PSPTO_t18 prsA tRNA-Gln-1 FALSE 0.184 46.000 0.000 NA   NA
 401679 334118 PSPTO_t18 PSPTO1105 tRNA-Gln-1 ispE FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 334118 334119 PSPTO1105 PSPTO1106 ispE lolB TRUE 0.967 3.000 0.072 1.000 N NA
 334119 334120 PSPTO1106 PSPTO1107 lolB   TRUE 0.954 5.000 0.072 1.000 N NA
 334121 334122 PSPTO1108 PSPTO1109 hemA prfA TRUE 0.994 -3.000 0.171 0.037 N NA
 334122 334123 PSPTO1109 PSPTO1110 prfA hemK TRUE 0.996 1.000 0.229 1.000 Y NA
 334123 334124 PSPTO1110 PSPTO1111 hemK moeB TRUE 0.889 -15.000 0.068 1.000 N NA
 334124 334125 PSPTO1111 PSPTO1112 moeB murI TRUE 0.850 -7.000 0.013 1.000 N NA
 334127 334128 PSPTO1114 PSPTO1115     FALSE 0.097 105.000 0.000 NA   NA
 334128 334129 PSPTO1115 PSPTO1116   cfa TRUE 0.994 -7.000 0.588 1.000   NA
 334129 334130 PSPTO1116 PSPTO1117 cfa   TRUE 0.971 -13.000 0.311 NA   NA
 334130 334131 PSPTO1117 PSPTO1118     TRUE 0.892 114.000 0.722 NA   NA
 334131 334132 PSPTO1118 PSPTO1119     TRUE 0.996 -3.000 0.217 0.047   NA
 334132 334133 PSPTO1119 PSPTO1120     TRUE 0.997 -3.000 0.533 NA   NA
 334133 334134 PSPTO1120 PSPTO1121   phrB TRUE 0.921 -7.000 0.048 NA   NA
 334134 334135 PSPTO1121 PSPTO1122 phrB   TRUE 0.824 10.000 0.017 1.000 N NA
 334135 334136 PSPTO1122 PSPTO1123     TRUE 0.951 6.000 0.083 NA   NA
 334136 334137 PSPTO1123 PSPTO1124     FALSE 0.032 199.000 0.000 NA   NA
 334137 334138 PSPTO1124 PSPTO1125     TRUE 0.516 -25.000 0.000 NA   NA
 334138 334139 PSPTO1125 PSPTO1126     TRUE 0.976 -3.000 0.060 NA   NA
 334140 334141 PSPTO1127 PSPTO1128   hemH TRUE 0.560 24.000 0.020 1.000   NA
 334142 334143 PSPTO1129 PSPTO1130 uraA upp TRUE 0.799 62.000 0.101 1.000 Y NA
 334144 334145 PSPTO1131 PSPTO1132 hpt   FALSE 0.279 66.000 0.018 NA   NA
 334145 10692029 PSPTO1132 PSPTO_5634     TRUE 0.753 67.000 0.261 NA   NA
 334146 334147 PSPTO1133 PSPTO1134     TRUE 0.929 99.000 0.394 0.076 Y NA
 334150 334151 PSPTO1137 PSPTO1138     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 334152 334153 PSPTO1139 PSPTO1140     FALSE 0.025 213.000 0.000 NA   NA
 334154 334155 PSPTO1141 PSPTO1142     TRUE 0.995 0.000 0.364 NA   NA
 334155 334156 PSPTO1142 PSPTO1143     TRUE 0.893 29.000 0.320 NA   NA
 334156 334157 PSPTO1143 PSPTO1144     FALSE 0.082 184.000 0.017 NA   NA
 334158 10692030 PSPTO1145 PSPTO_5650     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 10692030 334159 PSPTO_5650 PSPTO1146   rsmC FALSE 0.204 40.000 0.000 NA   NA
 334160 334161 PSPTO1147 PSPTO1148   alkK FALSE 0.228 191.000 0.114 1.000 N NA
 334161 334162 PSPTO1148 PSPTO1149 alkK   FALSE 0.007 310.000 0.000 NA   NA
 334162 334163 PSPTO1149 PSPTO1150     TRUE 0.998 5.000 0.889 NA   NA
 334163 334164 PSPTO1150 PSPTO1151     FALSE 0.286 252.000 0.375 NA   NA
 334165 334166 PSPTO1152 PSPTO1153     FALSE 0.010 300.000 0.000 1.000   NA
 334166 334167 PSPTO1153 PSPTO1154     TRUE 0.895 13.000 0.077 1.000   NA
 334167 334168 PSPTO1154 PSPTO1155     TRUE 0.837 58.000 0.365 NA   NA
 334168 334169 PSPTO1155 PSPTO1156     TRUE 0.983 11.000 0.442 NA N NA
 334169 334170 PSPTO1156 PSPTO1157     TRUE 0.998 0.000 0.621 NA N NA
 334171 334172 PSPTO1158 PSPTO1159     FALSE 0.023 234.000 0.000 1.000   NA
 334172 334173 PSPTO1159 PSPTO1160     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000   NA
 334173 334174 PSPTO1160 PSPTO1161     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 334174 10692031 PSPTO1161 PSPTO_1162     FALSE 0.457 16.000 0.000 NA   NA
 10692031 334175 PSPTO_1162 PSPTO1164     FALSE 0.001 1040.000 0.000 NA   NA
 334175 334176 PSPTO1164 PSPTO1165     FALSE 0.006 329.000 0.000 NA   NA
 334176 334177 PSPTO1165 PSPTO1166     FALSE 0.200 41.000 0.000 NA   NA
 334177 334178 PSPTO1166 PSPTO1167     FALSE 0.001 1354.000 0.000 NA   NA
 334179 334180 PSPTO1168 PSPTO1169   pta TRUE 0.782 65.000 0.170 0.070   NA
 334180 334181 PSPTO1169 PSPTO1170 pta   TRUE 0.508 78.000 0.094 NA   NA
 334182 334183 PSPTO1171 PSPTO1172     TRUE 0.552 130.000 0.036 1.000 Y NA
 334183 334184 PSPTO1172 PSPTO1173     FALSE 0.102 183.000 0.024 1.000 N NA
 334187 334188 PSPTO1176 PSPTO1177   cysZ FALSE 0.038 186.000 0.000 NA   NA
 334190 334191 PSPTO1179 PSPTO1180 hopPmaJ(Pto)   TRUE 0.952 -7.000 0.097 NA   NA
 334191 334192 PSPTO1180 PSPTO1181   folB-2 TRUE 0.555 44.000 0.061 NA   NA
 334192 334193 PSPTO1181 PSPTO1182 folB-2 folE-1 TRUE 0.989 0.000 0.030 1.000 Y NA
 334193 334194 PSPTO1182 PSPTO1183 folE-1   TRUE 0.789 22.000 0.100 1.000 N NA
 334194 334195 PSPTO1183 PSPTO1184     FALSE 0.131 235.000 0.120 NA   NA
 334195 334196 PSPTO1184 PSPTO1185     FALSE 0.247 152.000 0.056 NA   NA
 334197 334198 PSPTO1186 PSPTO1187     FALSE 0.299 113.000 0.000 0.047 N NA
 334198 334199 PSPTO1187 PSPTO1188     FALSE 0.067 155.000 0.000 1.000 N NA
 334200 334201 PSPTO1189 PSPTO1190     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 334201 334202 PSPTO1190 PSPTO1191     FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 334202 334203 PSPTO1191 PSPTO1192     FALSE 0.121 83.000 0.000 NA   NA
 334203 334204 PSPTO1192 PSPTO1193     FALSE 0.369 161.000 0.143 NA   NA
 334204 334205 PSPTO1193 PSPTO1194   nfrB TRUE 0.992 -3.000 0.227 1.000 N NA
 334205 334206 PSPTO1194 PSPTO1195 nfrB   TRUE 0.928 13.000 0.159 NA   NA
 334206 334207 PSPTO1195 PSPTO1196     FALSE 0.374 240.000 0.429 NA   NA
 334207 334208 PSPTO1196 PSPTO1197     FALSE 0.001 704.000 0.000 NA   NA
 334208 334209 PSPTO1197 PSPTO1198     FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 334209 334210 PSPTO1198 PSPTO1199     TRUE 0.628 -12.000 0.000 NA   NA
 334212 334213 PSPTO1201 PSPTO1202     FALSE 0.015 245.000 0.000 NA   NA
 334214 334215 PSPTO1203 PSPTO1204     TRUE 0.996 -3.000 0.375 1.000 N NA
 334218 334219 PSPTO1207 PSPTO1208     FALSE 0.121 528.000 0.400 NA Y NA
 334219 334220 PSPTO1208 PSPTO1209     TRUE 0.998 -3.000 0.714 NA N NA
 334221 334222 PSPTO1210 PSPTO1211     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 334222 334223 PSPTO1211 PSPTO1212     TRUE 0.993 0.000 0.278 NA   NA
 334226 334227 PSPTO1215 PSPTO1216     TRUE 0.816 88.000 0.429 1.000 N NA
 334228 334229 PSPTO1217 PSPTO1218     TRUE 0.998 -3.000 0.714 NA   NA
 334229 334230 PSPTO1218 PSPTO1219     TRUE 0.943 -15.000 0.182 NA   NA
 334230 334231 PSPTO1219 PSPTO1220     TRUE 0.907 26.000 0.318 NA   NA
 334231 334232 PSPTO1220 PSPTO1221     FALSE 0.001 978.000 0.000 1.000 N NA
 334232 334233 PSPTO1221 PSPTO1222     FALSE 0.001 1367.000 0.000 NA   NA
 334234 334235 PSPTO1223 PSPTO1224     TRUE 0.980 17.000 0.636 NA   NA
 10692032 334236 PSPTO_1225 PSPTO1226     FALSE 0.448 -106.000 0.000 NA   NA
 334236 334237 PSPTO1226 PSPTO1227     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 334237 10692033 PSPTO1227 PSPTO_1228     FALSE 0.011 265.000 0.000 NA   NA
 10692033 334238 PSPTO_1228 PSPTO1229     FALSE 0.163 55.000 0.000 NA   NA
 334241 334242 PSPTO1232 PSPTO1233 algA algF TRUE 0.723 137.000 0.400 NA   NA
 334242 334243 PSPTO1233 PSPTO1234 algF algJ TRUE 0.994 13.000 0.889 NA   NA
 334243 334244 PSPTO1234 PSPTO1235 algJ algI TRUE 0.995 11.000 0.889 NA   NA
 334244 334245 PSPTO1235 PSPTO1236 algI algL TRUE 0.578 187.000 0.438 NA   NA
 334245 334246 PSPTO1236 PSPTO1237 algL algX TRUE 0.992 9.000 0.562 NA   NA
 334246 334247 PSPTO1237 PSPTO1238 algX algG TRUE 0.977 15.000 0.500 NA   NA
 334247 334248 PSPTO1238 PSPTO1239 algG algE TRUE 0.963 27.000 0.625 NA   NA
 334248 334249 PSPTO1239 PSPTO1240 algE algK TRUE 0.987 -3.000 0.143 NA   NA
 334249 334250 PSPTO1240 PSPTO1241 algK   TRUE 0.978 3.000 0.143 NA   NA
 334250 334251 PSPTO1241 PSPTO1242     TRUE 0.916 41.000 0.500 NA   NA
 334251 334252 PSPTO1242 PSPTO1243   algD TRUE 0.875 103.000 0.625 NA   NA
 334252 334253 PSPTO1243 PSPTO1244 algD   FALSE 0.001 811.000 0.000 NA   NA
 334254 334255 PSPTO1245 PSPTO1246     FALSE 0.009 295.000 0.000 1.000 N NA
 334255 334256 PSPTO1246 PSPTO1247   moaC FALSE 0.140 142.000 0.013 1.000 N NA
 334256 334257 PSPTO1247 PSPTO1248 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 334257 334258 PSPTO1248 PSPTO1249 moaD moaE TRUE 0.999 3.000 0.501 0.002 Y NA
 334258 334259 PSPTO1249 PSPTO1250 moaE   FALSE 0.023 223.000 0.000 1.000 N NA
 334259 334260 PSPTO1250 PSPTO1251     TRUE 0.970 22.000 0.625 NA   NA
 334260 334261 PSPTO1251 PSPTO1252     TRUE 0.999 -3.000 0.740 NA   NA
 334262 334263 PSPTO1253 PSPTO1254 rhlB estA FALSE 0.012 383.000 0.031 1.000   NA
 334264 334265 PSPTO1255 PSPTO1256     TRUE 0.967 71.000 0.548 0.075 Y NA
 334265 334266 PSPTO1256 PSPTO1257     TRUE 0.999 11.000 0.815 0.012 Y NA
 334266 334267 PSPTO1257 PSPTO1258     TRUE 0.997 11.000 0.734 1.000 Y NA
 334269 334270 PSPTO1260 PSPTO1261     TRUE 0.510 41.000 0.048 NA   NA
 334270 334271 PSPTO1261 PSPTO1262     TRUE 0.882 -7.000 0.026 NA   NA
 334271 334272 PSPTO1262 PSPTO1263     FALSE 0.378 65.000 0.041 NA N NA
 334273 334274 PSPTO1264 PSPTO1265 nrdH   FALSE 0.071 145.000 0.000 NA   NA
 334276 334277 PSPTO1267 PSPTO1268   valS FALSE 0.246 64.000 0.003 1.000   NA
 334277 334278 PSPTO1268 PSPTO1269 valS   FALSE 0.008 360.000 0.009 NA   NA
 334278 334279 PSPTO1269 PSPTO1270   holC TRUE 0.895 8.000 0.034 NA   NA
 334279 334280 PSPTO1270 PSPTO1271 holC pepA TRUE 0.886 59.000 0.494 1.000 N NA
 334281 334282 PSPTO1272 PSPTO1273     TRUE 0.994 -13.000 0.631 0.067   NA
 334283 334284 PSPTO1274 PSPTO1275   gcvT-2 FALSE 0.003 404.000 0.000 1.000 N NA
 334284 334285 PSPTO1275 PSPTO1276 gcvT-2 gcvP TRUE 0.964 -37.000 0.032 0.001 Y NA
 334285 334286 PSPTO1276 PSPTO1277 gcvP gcvH-2 TRUE 0.987 11.000 0.249 1.000 Y NA
 334286 334287 PSPTO1277 PSPTO1278 gcvH-2   FALSE 0.008 305.000 0.000 1.000 N NA
 334287 10692034 PSPTO1278 PSPTO_1279     TRUE 0.671 10.000 0.000 NA   NA
 10692034 334288 PSPTO_1279 PSPTO1280     FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 334288 334289 PSPTO1280 PSPTO1281     FALSE 0.072 325.000 0.200 NA   NA
 334289 334290 PSPTO1281 PSPTO1282     FALSE 0.097 105.000 0.000 NA   NA
 334290 334291 PSPTO1282 PSPTO1283     TRUE 0.986 -3.000 0.132 NA   NA
 334291 334292 PSPTO1283 PSPTO1284     TRUE 0.956 -19.000 0.074 NA Y NA
 334292 334293 PSPTO1284 PSPTO1285     TRUE 0.692 121.000 0.122 NA Y NA
 334293 334294 PSPTO1285 PSPTO1286     TRUE 0.930 128.000 1.000 NA N NA
 334294 334295 PSPTO1286 PSPTO1287   gap-1 FALSE 0.273 100.000 0.033 1.000 N NA
 334296 334297 PSPTO1288 PSPTO1289 edd glk TRUE 0.990 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 334297 334298 PSPTO1289 PSPTO1290 glk   TRUE 0.851 51.000 0.364 1.000 N NA
 334298 334299 PSPTO1290 PSPTO1291     TRUE 0.982 62.000 0.909 1.000 Y NA
 334299 334300 PSPTO1291 PSPTO1292     TRUE 0.593 172.000 0.367 1.000 N NA
 334300 334301 PSPTO1292 PSPTO1293     TRUE 0.921 105.000 0.367 0.075 Y NA
 334301 334302 PSPTO1293 PSPTO1294     TRUE 0.999 -7.000 0.816 0.075 Y NA
 334302 334303 PSPTO1294 PSPTO1295   gltK TRUE 0.999 3.000 0.723 0.075 Y NA
 334303 334304 PSPTO1295 PSPTO1296 gltK oprB TRUE 0.593 134.000 0.135 0.075 N NA
 334304 334305 PSPTO1296 PSPTO1297 oprB   TRUE 0.718 8.000 0.000 NA   NA
 334305 334306 PSPTO1297 PSPTO1298     TRUE 0.504 -28.000 0.000 NA   NA
 334308 334309 PSPTO1300 PSPTO1301 zwf-1 pgl TRUE 0.978 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 334309 334310 PSPTO1301 PSPTO1302 pgl eda-1 TRUE 0.864 29.000 0.064 1.000 Y NA
 334313 334314 PSPTO1305 PSPTO1306     FALSE 0.181 204.000 0.000 1.000 Y NA
 334314 334315 PSPTO1306 PSPTO1307     TRUE 0.999 -10.000 0.793 0.002 Y NA
 334315 334316 PSPTO1307 PSPTO1308     TRUE 0.966 11.000 0.240 1.000 N NA
 334316 334317 PSPTO1308 PSPTO1309     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.013 N NA
 334318 334319 PSPTO1310 PSPTO1311     FALSE 0.017 240.000 0.000 NA   NA
 334319 334320 PSPTO1311 PSPTO1312     FALSE 0.007 313.000 0.000 NA   NA
 334320 334321 PSPTO1312 PSPTO1313     TRUE 0.984 64.000 1.000 1.000 Y NA
 334321 10692035 PSPTO1313 PSPTO_1314     FALSE 0.046 177.000 0.000 NA   NA
 10692036 334323 PSPTO_1316 PSPTO1317     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 334323 334324 PSPTO1317 PSPTO1318     TRUE 0.979 2.000 0.105 1.000   NA
 334324 334325 PSPTO1318 PSPTO1319     FALSE 0.177 48.000 0.000 NA   NA
 334328 334329 PSPTO1322 PSPTO1323     TRUE 0.893 63.000 0.500 1.000   NA
 334330 334331 PSPTO1324 PSPTO1325 dsbB cyoA FALSE 0.010 466.000 0.000 0.044 N NA
 334331 334332 PSPTO1325 PSPTO1326 cyoA cyoB TRUE 0.996 4.000 0.200 0.006 Y NA
 334332 334333 PSPTO1326 PSPTO1327 cyoB cyoC TRUE 0.997 4.000 0.258 0.044 Y NA
 334333 334334 PSPTO1327 PSPTO1328 cyoC cyoD TRUE 0.998 0.000 0.273 0.044 Y NA
 334334 334335 PSPTO1328 PSPTO1329 cyoD cyoE TRUE 0.949 11.000 0.064 0.067 N NA
 334335 334336 PSPTO1329 PSPTO1330 cyoE   FALSE 0.013 258.000 0.000 NA   NA
 334336 334337 PSPTO1330 PSPTO1331     FALSE 0.431 98.000 0.085 NA   NA
 334337 334338 PSPTO1331 PSPTO1332   ilvE FALSE 0.095 140.000 0.000 1.000   NA
 334339 334340 PSPTO1333 PSPTO1334     FALSE 0.066 150.000 0.000 NA   NA
 334340 334341 PSPTO1334 PSPTO1335     FALSE 0.422 120.000 0.000 1.000 Y NA
 334342 334343 PSPTO1336 PSPTO1337     FALSE 0.429 57.000 0.042 1.000 N NA
 334343 334344 PSPTO1337 PSPTO1338   sodC FALSE 0.018 242.000 0.000 1.000 N NA
 334345 334346 PSPTO1339 PSPTO1340     FALSE 0.032 198.000 0.000 NA   NA
 334346 334347 PSPTO1340 PSPTO1341     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 334347 334348 PSPTO1341 PSPTO1342     FALSE 0.142 68.000 0.000 NA   NA
 334349 334350 PSPTO1343 PSPTO1344     FALSE 0.096 106.000 0.000 NA   NA
 334350 334351 PSPTO1344 PSPTO1345   gnl TRUE 0.628 18.000 0.025 NA   NA
 334354 334355 PSPTO1348 PSPTO1349     FALSE 0.029 220.000 0.000 1.000   NA
 334355 334356 PSPTO1349 PSPTO1350     TRUE 0.924 -12.000 0.085 1.000   NA
 334356 334357 PSPTO1350 PSPTO1351     FALSE 0.298 26.000 0.000 NA   NA
 334357 334358 PSPTO1351 PSPTO1352     FALSE 0.012 262.000 0.000 NA   NA
 334358 334359 PSPTO1352 PSPTO1353     TRUE 0.987 -3.000 0.150 NA   NA
 334359 334360 PSPTO1353 PSPTO1354     TRUE 0.981 0.000 0.095 NA   NA
 334360 334361 PSPTO1354 PSPTO1355     TRUE 0.997 -3.000 0.429 1.000   NA
 334361 334362 PSPTO1355 PSPTO1356     TRUE 0.997 3.000 0.632 1.000   NA
 334362 334363 PSPTO1356 PSPTO1357   amiE TRUE 0.975 6.000 0.184 1.000   NA
 334363 334364 PSPTO1357 PSPTO1358 amiE   TRUE 0.857 25.000 0.189 1.000   NA
 334364 334365 PSPTO1358 PSPTO1359     TRUE 0.998 -7.000 0.966 0.074   NA
 334365 334366 PSPTO1359 PSPTO1360     TRUE 0.996 10.000 0.929 1.000   NA
 334366 334367 PSPTO1360 PSPTO1361     TRUE 0.889 15.000 0.107 1.000   NA
 334367 334368 PSPTO1361 PSPTO1362     FALSE 0.021 225.000 0.000 NA   NA
 334368 334369 PSPTO1362 PSPTO1363     FALSE 0.196 42.000 0.000 NA   NA
 334370 334371 PSPTO1364 PSPTO1365   gstA FALSE 0.112 90.000 0.000 NA   NA
 334375 334376 PSPTO1369 PSPTO1370   hopPtoN TRUE 0.868 14.000 0.000 0.003   NA
 334380 334381 PSPTO1374 PSPTO1375   hopPtoM TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 334381 334382 PSPTO1375 PSPTO1376 hopPtoM avrF FALSE 0.134 73.000 0.000 NA   NA
 334384 334385 PSPTO1378 PSPTO1379   hrpR FALSE 0.001 1078.000 0.000 NA   NA
 334385 334386 PSPTO1379 PSPTO1380 hrpR hrpS TRUE 0.792 46.000 0.000 0.006 Y NA
 334386 334387 PSPTO1380 PSPTO1381 hrpS hrpA(Pto) FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 334387 334388 PSPTO1381 PSPTO1382 hrpA(Pto) hrpZ(Pto) TRUE 0.854 56.000 0.400 NA   NA
 334388 334389 PSPTO1382 PSPTO1383 hrpZ(Pto) hrpB(Pto) TRUE 0.699 28.000 0.074 NA   NA
 334389 334390 PSPTO1383 PSPTO1384 hrpB(Pto) hrcJ TRUE 0.987 9.000 0.222 0.010   NA
 334390 334391 PSPTO1384 PSPTO1385 hrcJ hrpD TRUE 0.998 -3.000 0.600 NA   NA
 334391 334392 PSPTO1385 PSPTO1386 hrpD hrpE TRUE 0.914 36.000 0.462 NA   NA
 334392 334393 PSPTO1386 PSPTO1387 hrpE hrpF TRUE 0.778 95.000 0.385 NA   NA
 334393 334394 PSPTO1387 PSPTO1388 hrpF hrpG TRUE 0.974 -13.000 0.333 NA   NA
 334394 334395 PSPTO1388 PSPTO_1389 hrpG hrcC TRUE 0.990 2.000 0.250 NA   NA
 334395 334396 PSPTO_1389 PSPTO1390 hrcC hrpT TRUE 0.996 -3.000 0.375 NA   NA
 334396 334397 PSPTO1390 PSPTO1391 hrpT hrpV TRUE 0.999 3.000 1.000 NA   NA
 334398 334399 PSPTO1392 PSPTO1393 hrcU hrcT TRUE 1.000 -3.000 0.875 0.066 Y NA
 334399 334400 PSPTO1393 PSPTO1394 hrcT hrcS TRUE 0.998 1.000 0.273 0.066 Y NA
 334400 334401 PSPTO1394 PSPTO1395 hrcS hrcR TRUE 0.996 8.000 0.318 0.010 Y NA
 334401 334402 PSPTO1395 PSPTO1396 hrcR hrcQb TRUE 0.898 48.000 0.231 1.000 Y NA
 334402 334403 PSPTO1396 PSPTO1397 hrcQb hrcQa TRUE 0.951 -10.000 0.154 NA   NA
 334403 334404 PSPTO1397 PSPTO1398 hrcQa hrpP TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA   NA
 334404 334405 PSPTO1398 PSPTO1399 hrpP hrpO TRUE 0.998 7.000 1.000 NA   NA
 334405 334406 PSPTO1399 PSPTO1400 hrpO hrcN TRUE 0.988 3.000 0.250 NA   NA
 334406 334407 PSPTO1400 PSPTO1401 hrcN hrpQ TRUE 0.979 -3.000 0.073 NA   NA
 334407 334408 PSPTO1401 PSPTO1402 hrpQ hrcV TRUE 0.639 34.000 0.073 NA   NA
 334408 334409 PSPTO1402 PSPTO1403 hrcV hrpJ TRUE 0.989 0.000 0.167 1.000   NA
 334410 334411 PSPTO1404 PSPTO1405 hrpL hrpK(Pto) FALSE 0.116 87.000 0.000 NA   NA
 334411 334412 PSPTO1405 PSPTO1406 hrpK(Pto) hopPtoB1 FALSE 0.132 75.000 0.000 NA   NA
 2209174 334413 PSPTO_5622 PSPTO1408     FALSE 0.031 201.000 0.000 NA   NA
 334413 334414 PSPTO1408 PSPTO1409     FALSE 0.040 184.000 0.000 NA   NA
 334414 334415 PSPTO1409 PSPTO1410     FALSE 0.002 494.000 0.000 NA   NA
 334416 401678 PSPTO1411 PSPTO_t19   tRNA-Leu-1 TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 334417 334418 PSPTO1412 PSPTO1413 queA tgt TRUE 0.993 15.000 0.360 0.000 Y NA
 334418 334419 PSPTO1413 PSPTO1414 tgt yajC TRUE 0.815 54.000 0.325 NA N NA
 334419 334420 PSPTO1414 PSPTO1415 yajC secD TRUE 0.668 63.000 0.031 NA Y NA
 334420 334421 PSPTO1415 PSPTO1416 secD secF TRUE 0.993 10.000 0.171 0.001 Y NA
 334421 334422 PSPTO1416 PSPTO1417 secF   FALSE 0.336 109.000 0.050 1.000   NA
 334423 334424 PSPTO1418 PSPTO1419   suhB FALSE 0.142 72.000 0.000 1.000 N NA
 334425 334426 PSPTO1420 PSPTO1421   cysE TRUE 0.991 0.000 0.208 1.000 N NA
 334426 334427 PSPTO1421 PSPTO1422 cysE   TRUE 0.550 160.000 0.271 1.000 N NA
 334427 334428 PSPTO1422 PSPTO1423   iscS-2 TRUE 0.886 45.000 0.424 1.000 N NA
 334428 334429 PSPTO1423 PSPTO1424 iscS-2 iscU TRUE 0.834 83.000 0.448 1.000 N NA
 334429 334430 PSPTO1424 PSPTO1425 iscU iscA TRUE 0.938 43.000 0.359 0.001   NA
 334430 334431 PSPTO1425 PSPTO1426 iscA hscB TRUE 0.985 12.000 0.500 1.000   NA
 334431 334432 PSPTO1426 PSPTO1427 hscB hscA TRUE 0.973 45.000 0.634 1.000 Y NA
 334432 334433 PSPTO1427 PSPTO1428 hscA   TRUE 0.997 4.000 0.794 1.000 N NA
 334433 334434 PSPTO1428 PSPTO1429     TRUE 0.994 9.000 0.625 1.000   NA
 334434 334435 PSPTO1429 PSPTO1430   ndk FALSE 0.230 97.000 0.017 1.000   NA
 334435 334436 PSPTO1430 PSPTO1431 ndk   TRUE 0.762 34.000 0.156 1.000   NA
 334436 334437 PSPTO1431 PSPTO1432   pilF TRUE 0.746 27.000 0.086 1.000   NA
 334437 334438 PSPTO1432 PSPTO1433 pilF   TRUE 0.991 0.000 0.204 1.000   NA
 334438 334439 PSPTO1433 PSPTO1434   ispG TRUE 0.985 4.000 0.233 1.000   NA
 334439 334440 PSPTO1434 PSPTO1435 ispG hisS TRUE 0.871 23.000 0.207 1.000 N NA
 334440 334441 PSPTO1435 PSPTO1436 hisS   TRUE 0.835 39.000 0.259 1.000   NA
 334441 334442 PSPTO1436 PSPTO1437     TRUE 0.992 -7.000 0.492 1.000   NA
 334442 334443 PSPTO1437 PSPTO1438   engA TRUE 0.547 138.000 0.203 1.000   NA
 334445 334446 PSPTO1440 PSPTO1441     TRUE 0.930 -12.000 0.099 1.000   NA
 334448 334449 PSPTO1443 PSPTO1444 bcpA leuA FALSE 0.004 372.000 0.000 1.000 N NA
 334449 334450 PSPTO1444 PSPTO1445 leuA   FALSE 0.009 294.000 0.000 1.000 N NA
 334450 334451 PSPTO1445 PSPTO1446   xseA TRUE 0.898 7.000 0.032 1.000 N NA
 334452 334453 PSPTO1447 PSPTO1448     FALSE 0.131 76.000 0.000 NA   NA
 334453 334454 PSPTO1448 PSPTO1449   guaB FALSE 0.168 95.000 0.008 NA   NA
 334454 334455 PSPTO1449 PSPTO1450 guaB guaA TRUE 0.753 124.000 0.190 0.000 N NA
 334456 334457 PSPTO1451 PSPTO1452     FALSE 0.113 89.000 0.000 NA   NA
 334457 334458 PSPTO1452 PSPTO1453   lsc-1 TRUE 0.489 15.000 0.000 NA   NA
 334458 334459 PSPTO1453 PSPTO1454 lsc-1   FALSE 0.002 621.000 0.000 1.000   NA
 334460 334461 PSPTO1455 PSPTO1456   cumA FALSE 0.006 330.000 0.000 1.000 N NA
 334461 334462 PSPTO1456 PSPTO1457 cumA   TRUE 0.969 0.000 0.045 1.000 N NA
 334464 334465 PSPTO1459 PSPTO1460 purL   TRUE 0.865 6.000 0.016 NA   NA
 334466 334467 PSPTO1461 PSPTO1462     TRUE 0.977 -3.000 0.065 NA   NA
 334468 334469 PSPTO1463 PSPTO1464     TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 334469 334470 PSPTO1464 PSPTO1465     TRUE 0.559 59.000 0.078 1.000   NA
 334470 334471 PSPTO1465 PSPTO1466     TRUE 0.976 0.000 0.062 NA   NA
 334471 334472 PSPTO1466 PSPTO1467     FALSE 0.003 632.000 0.016 NA   NA
 334472 334473 PSPTO1467 PSPTO1468   purT FALSE 0.204 104.000 0.019 NA   NA
 334474 334475 PSPTO1469 PSPTO1470     FALSE 0.136 131.000 0.008 NA   NA
 334475 334476 PSPTO1470 PSPTO1471     TRUE 0.970 13.000 0.349 NA   NA
 334477 334478 PSPTO1472 PSPTO1473 ffh rpsP FALSE 0.288 249.000 0.361 1.000 N NA
 334478 334479 PSPTO1473 PSPTO1474 rpsP rimM TRUE 0.997 6.000 0.342 0.011 Y NA
 334479 334480 PSPTO1474 PSPTO1475 rimM trmD TRUE 0.998 6.000 0.672 1.000 Y NA
 334480 334481 PSPTO1475 PSPTO1476 trmD rplS TRUE 0.967 45.000 0.567 1.000 Y NA
 334483 334484 PSPTO1478 PSPTO1479 xerD dsbC FALSE 0.176 146.000 0.026 1.000 N NA
 334484 334485 PSPTO1479 PSPTO1480 dsbC hom FALSE 0.183 147.000 0.029 1.000 N NA
 334485 334486 PSPTO1480 PSPTO1481 hom thrC TRUE 0.727 105.000 0.125 1.000 Y NA
 334486 334487 PSPTO1481 PSPTO1482 thrC   FALSE 0.094 121.000 0.000 1.000 N NA
 334487 334488 PSPTO1482 PSPTO1483     TRUE 0.597 124.000 0.000 0.022 Y NA
 334492 334493 PSPTO1487 PSPTO1488   recJ FALSE 0.254 74.000 0.011 1.000   NA
 334493 334494 PSPTO1488 PSPTO1489 recJ   FALSE 0.136 115.000 0.002 1.000 N NA
 334498 334499 PSPTO1493 PSPTO1494     TRUE 0.998 8.000 0.600 0.015 Y NA
 334499 334500 PSPTO1494 PSPTO1495     TRUE 0.999 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 334500 334501 PSPTO1495 PSPTO1496     TRUE 0.999 0.000 0.558 1.000 Y NA
 334501 334502 PSPTO1496 PSPTO1497     TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.018 Y NA
 334502 334503 PSPTO1497 PSPTO1498     TRUE 0.999 -3.000 0.324 0.018 Y NA
 334503 334504 PSPTO1498 PSPTO1499     TRUE 0.974 46.000 0.480 0.022 Y NA
 334504 10692038 PSPTO1499 PSPTO_1500   prfB FALSE 0.010 322.000 0.002 1.000 N NA
 10692038 334505 PSPTO_1500 PSPTO1501 prfB lysS TRUE 0.891 70.000 0.162 0.036 Y NA
 334505 334506 PSPTO1501 PSPTO1502 lysS   FALSE 0.249 79.000 0.012 1.000   NA
 334506 334507 PSPTO1502 PSPTO1503     FALSE 0.073 142.000 0.000 NA   NA
 334507 334508 PSPTO1503 PSPTO1504     FALSE 0.074 251.000 0.065 NA   NA
 334508 334509 PSPTO1504 PSPTO1505     TRUE 0.989 -3.000 0.174 NA   NA
 334510 334511 PSPTO1506 PSPTO1507     TRUE 0.667 59.000 0.167 NA   NA
 334512 334513 PSPTO1508 PSPTO1509 ppc adk FALSE 0.010 280.000 0.000 1.000 N NA
 334513 334514 PSPTO1509 PSPTO1510 adk   FALSE 0.236 88.000 0.019 1.000 N NA
 334514 334515 PSPTO1510 PSPTO1511     FALSE 0.036 224.000 0.008 NA   NA
 334515 334516 PSPTO1511 PSPTO1512     TRUE 0.980 -3.000 0.074 NA   NA
 334516 334517 PSPTO1512 PSPTO1513     FALSE 0.220 142.000 0.037 NA   NA
 334522 334523 PSPTO1518 PSPTO1519     FALSE 0.096 208.000 0.042 NA   NA
 334523 334524 PSPTO1519 PSPTO1520   plsB FALSE 0.311 112.000 0.052 NA   NA
 334524 334525 PSPTO1520 PSPTO1521 plsB   FALSE 0.035 192.000 0.000 NA   NA
 334525 334526 PSPTO1521 PSPTO1522     TRUE 0.782 20.000 0.083 NA   NA
 334526 334527 PSPTO1522 PSPTO1523   dapE TRUE 0.961 0.000 0.033 1.000 N NA
 334527 334528 PSPTO1523 PSPTO1524 dapE   FALSE 0.207 100.000 0.018 1.000 N NA
 334530 334531 PSPTO1526 PSPTO1527 sufE csdA TRUE 0.985 -3.000 0.116 NA   NA
 334531 334532 PSPTO1527 PSPTO1528 csdA   TRUE 0.888 61.000 0.244 1.000 Y NA
 334532 334533 PSPTO1528 PSPTO1529     TRUE 0.558 48.000 0.069 1.000 N NA
 334533 334534 PSPTO1529 PSPTO1530     FALSE 0.002 560.000 0.000 1.000   NA
 334534 334535 PSPTO1530 PSPTO1531     FALSE 0.215 137.000 0.028 1.000   NA
 334535 334536 PSPTO1531 PSPTO1532   glnD TRUE 0.667 103.000 0.257 1.000 N NA
 334536 334537 PSPTO1532 PSPTO1533 glnD map-1 TRUE 0.920 67.000 0.651 1.000 N NA
 10692039 334538 PSPTO_5651 PSPTO1534   rpsB FALSE 0.346 21.000 0.000 NA   NA
 334538 334539 PSPTO1534 PSPTO1535 rpsB tsf TRUE 0.883 191.000 0.748 1.000 Y NA
 334539 334540 PSPTO1535 PSPTO1536 tsf pyrH FALSE 0.062 206.000 0.017 1.000 N NA
 334540 334541 PSPTO1536 PSPTO1537 pyrH frr TRUE 0.960 -3.000 0.030 1.000 N NA
 334541 334542 PSPTO1537 PSPTO1538 frr uppS TRUE 0.960 17.000 0.409 1.000 N NA
 334542 334543 PSPTO1538 PSPTO1539 uppS cdsA-1 TRUE 0.998 0.000 0.400 1.000 Y NA
 334543 334544 PSPTO1539 PSPTO1540 cdsA-1 dxr TRUE 0.998 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 334544 334545 PSPTO1540 PSPTO1541 dxr   TRUE 0.844 118.000 0.568 1.000 N NA
 334545 334546 PSPTO1541 PSPTO1542     TRUE 0.557 88.000 0.014 1.000 Y NA
 334546 334547 PSPTO1542 PSPTO1543     TRUE 0.773 46.000 0.050 1.000 Y NA
 334547 334548 PSPTO1543 PSPTO1544   lpxD TRUE 0.999 3.000 0.814 1.000 Y NA
 334548 334549 PSPTO1544 PSPTO1545 lpxD fabZ TRUE 0.910 110.000 0.796 1.000 N NA
 334549 334550 PSPTO1545 PSPTO1546 fabZ lpxA TRUE 0.999 -3.000 0.850 1.000 N NA
 334550 334551 PSPTO1546 PSPTO1547 lpxA lpxB TRUE 0.996 3.000 0.289 1.000 Y NA
 334551 334552 PSPTO1547 PSPTO1548 lpxB rnhB TRUE 0.947 12.000 0.186 1.000 N NA
 334552 334553 PSPTO1548 PSPTO1549 rnhB dnaE TRUE 0.787 68.000 0.104 1.000 Y NA
 334553 334554 PSPTO1549 PSPTO1550 dnaE accA FALSE 0.446 129.000 0.122 1.000 N NA
 334554 334555 PSPTO1550 PSPTO1551 accA   FALSE 0.458 122.000 0.123 1.000 N NA
 334555 334556 PSPTO1551 PSPTO1552   pyrG FALSE 0.025 264.000 0.016 1.000 N NA
 334556 334557 PSPTO1552 PSPTO1553 pyrG kdsA TRUE 0.898 15.000 0.138 1.000 N NA
 334557 334558 PSPTO1553 PSPTO1554 kdsA eno-1 FALSE 0.420 139.000 0.125 1.000 N NA
 334558 334559 PSPTO1554 PSPTO1555 eno-1   FALSE 0.383 190.000 0.241 1.000 N NA
 334559 334560 PSPTO1555 PSPTO1556   ispD TRUE 0.931 14.000 0.185 1.000 N NA
 334562 334563 PSPTO1558 PSPTO1559 adhC   TRUE 0.866 100.000 0.567 1.000   NA
 334563 334564 PSPTO1559 PSPTO1560   ispF FALSE 0.312 54.000 0.012 1.000   NA
 334564 334565 PSPTO1560 PSPTO1561 ispF   TRUE 0.990 -3.000 0.173 1.000   NA
 334565 334566 PSPTO1561 PSPTO1562   surE TRUE 0.967 -12.000 0.235 1.000   NA
 334566 334567 PSPTO1562 PSPTO1563 surE pcm TRUE 0.874 42.000 0.353 1.000   NA
 334567 334568 PSPTO1563 PSPTO1564 pcm   FALSE 0.048 206.000 0.007 1.000 N NA
 334568 334569 PSPTO1564 PSPTO1565   rpoS FALSE 0.411 105.000 0.081 1.000 N NA
 10692040 334571 PSPTO_5652 PSPTO1567     FALSE 0.120 84.000 0.000 NA   NA
 334572 2209175 PSPTO1568 PSPTO_5620 hopPtoJ   FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 334574 334575 PSPTO1570 PSPTO1571     FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 334575 334576 PSPTO1571 PSPTO1572     FALSE 0.007 304.000 0.000 NA   NA
 334577 334578 PSPTO1573 PSPTO1574     FALSE 0.151 63.000 0.000 NA   NA
 334579 334580 PSPTO1575 PSPTO1576     FALSE 0.326 23.000 0.000 NA   NA
 334580 334581 PSPTO1576 PSPTO1577     FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 334583 334584 PSPTO1579 PSPTO1580     FALSE 0.215 49.000 0.000 1.000   NA
 334587 334588 PSPTO1583 PSPTO1584     TRUE 0.991 3.000 0.333 NA N NA
 334588 334589 PSPTO1584 PSPTO1585     FALSE 0.093 125.000 0.000 1.000 N NA
 334589 334590 PSPTO1585 PSPTO1586     FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 334591 334592 PSPTO1587 PSPTO1588 srmB   FALSE 0.075 140.000 0.000 NA   NA
 334593 334594 PSPTO1589 PSPTO1590     FALSE 0.416 70.000 0.051 NA   NA
 334597 334598 PSPTO1593 PSPTO1594     FALSE 0.001 633.000 0.000 NA   NA
 334598 334599 PSPTO1594 PSPTO1595     FALSE 0.367 19.000 0.000 NA   NA
 334599 334600 PSPTO1595 PSPTO1596     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 334600 334601 PSPTO1596 PSPTO1597     FALSE 0.020 227.000 0.000 NA   NA
 334601 334602 PSPTO1597 PSPTO1598   def-2 FALSE 0.434 47.000 0.031 1.000   NA
 334604 334605 PSPTO1600 PSPTO1601     FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 334605 334606 PSPTO1601 PSPTO1602   cdd FALSE 0.228 34.000 0.000 NA   NA
 334606 334607 PSPTO1602 PSPTO1603 cdd   FALSE 0.215 37.000 0.000 NA   NA
 334607 334608 PSPTO1603 PSPTO1604     FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 334608 334609 PSPTO1604 PSPTO1605     TRUE 0.905 -10.000 0.050 1.000   NA
 334609 334610 PSPTO1605 PSPTO1606     TRUE 0.584 134.000 0.000 0.016 Y NA
 334610 334611 PSPTO1606 PSPTO1607     FALSE 0.025 215.000 0.000 NA   NA
 334611 334612 PSPTO1607 PSPTO1608     FALSE 0.366 72.000 0.039 NA   NA
 334616 334617 PSPTO1612 PSPTO1613     FALSE 0.004 383.000 0.000 1.000 N NA
 334617 334618 PSPTO1613 PSPTO1614     FALSE 0.004 369.000 0.000 NA   NA
 334618 334619 PSPTO1614 PSPTO1615     FALSE 0.001 832.000 0.000 NA   NA
 334620 334621 PSPTO1616 PSPTO1617     FALSE 0.008 297.000 0.000 1.000 N NA
 334623 334624 PSPTO1619 PSPTO1620     FALSE 0.167 53.000 0.000 NA   NA
 334624 334625 PSPTO1620 PSPTO1621     TRUE 0.974 -7.000 0.204 NA   NA
 334625 10692041 PSPTO1621 PSPTO_5669     FALSE 0.009 284.000 0.000 NA   NA
 334626 334627 PSPTO1622 PSPTO1623     FALSE 0.015 248.000 0.000 NA   NA
 334627 334628 PSPTO1623 PSPTO1624     TRUE 0.999 -3.000 0.733 NA   NA
 334630 334631 PSPTO1626 PSPTO1627     FALSE 0.097 105.000 0.000 NA   NA
 334631 334632 PSPTO1627 PSPTO1628     FALSE 0.098 234.000 0.071 NA   NA
 334632 334633 PSPTO1628 PSPTO1629   csrA-1 FALSE 0.325 170.000 0.133 NA   NA
 334634 334635 PSPTO1630 PSPTO1631     FALSE 0.384 73.000 0.045 NA   NA
 334635 334636 PSPTO1631 PSPTO1632     TRUE 0.837 83.000 0.471 NA N NA
 334636 334637 PSPTO1632 PSPTO1633   asnB TRUE 0.995 4.000 0.514 1.000 N NA
 334638 334639 PSPTO1634 PSPTO1635     TRUE 0.764 36.000 0.176 NA   NA
 334640 334641 PSPTO1636 PSPTO1637     TRUE 0.994 8.000 0.627 NA   NA
 334641 334642 PSPTO1637 PSPTO1638     TRUE 0.998 0.000 0.680 NA N NA
 334642 334643 PSPTO1638 PSPTO1639     FALSE 0.022 225.000 0.000 1.000 N NA
 334645 334646 PSPTO1641 PSPTO1642     FALSE 0.087 127.000 0.000 NA   NA
 334646 334647 PSPTO1642 PSPTO1643     TRUE 0.914 11.000 0.077 NA   NA
 334648 334649 PSPTO1644 PSPTO1645 recQ   FALSE 0.455 94.000 0.024 0.054 N NA
 334649 334650 PSPTO1645 PSPTO1646     FALSE 0.346 139.000 0.080 1.000 N NA
 334650 334651 PSPTO1646 PSPTO1647     FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 334651 334652 PSPTO1647 PSPTO1648   aer-1 FALSE 0.005 349.000 0.000 NA   NA
 334652 334653 PSPTO1648 PSPTO1649 aer-1   FALSE 0.001 1005.000 0.000 1.000   NA
 334653 334654 PSPTO1649 PSPTO1650     TRUE 0.978 54.000 0.800 0.001   NA
 334654 334655 PSPTO1650 PSPTO1651     FALSE 0.004 360.000 0.000 NA   NA
 334657 334658 PSPTO1653 PSPTO1654     TRUE 0.999 -3.000 0.759 NA   NA
 334659 334660 PSPTO1655 PSPTO1656     FALSE 0.173 50.000 0.000 NA   NA
 334662 334663 PSPTO1658 PSPTO1659     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 334667 334668 PSPTO1663 PSPTO1664     FALSE 0.096 106.000 0.000 NA   NA
 334668 334669 PSPTO1664 PSPTO1665     FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 334669 334670 PSPTO1665 PSPTO1666     FALSE 0.223 35.000 0.000 NA   NA
 334673 334674 PSPTO1669 PSPTO1670 tdcD xfp FALSE 0.141 73.000 0.000 1.000 N NA
 334676 334677 PSPTO1672 PSPTO1673     TRUE 0.482 221.000 0.229 1.000 Y NA
 334677 334678 PSPTO1673 PSPTO1674   fhuF FALSE 0.464 -42.000 0.000 NA   NA
 334682 334683 PSPTO1678 PSPTO1679     FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 334683 334684 PSPTO1679 PSPTO1680   phoQ TRUE 1.000 -3.000 0.940 1.000 Y NA
 334689 334690 PSPTO1685 PSPTO1686   wrbA FALSE 0.133 96.000 0.000 1.000   NA
 334690 334691 PSPTO1686 PSPTO1687 wrbA arsC TRUE 0.992 -3.000 0.112 0.043   NA
 334693 334694 PSPTO1689 PSPTO1690     TRUE 0.986 -3.000 0.135 NA   NA
 334694 334695 PSPTO1690 PSPTO1691   gacS FALSE 0.120 84.000 0.000 NA   NA
 334696 334697 PSPTO1692 PSPTO1693 cysM   TRUE 0.966 0.000 0.039 1.000 N NA
 334697 334698 PSPTO1693 PSPTO1694   relA FALSE 0.199 166.000 0.047 1.000 N NA
 334698 334699 PSPTO1694 PSPTO1695 relA   FALSE 0.275 114.000 0.035 1.000   NA
 334699 334700 PSPTO1695 PSPTO1696     FALSE 0.390 31.000 0.013 NA   NA
 334701 334702 PSPTO1697 PSPTO1698     FALSE 0.002 500.000 0.000 NA   NA
 334702 334703 PSPTO1698 PSPTO1699   purN TRUE 0.927 9.000 0.065 NA   NA
 334703 334704 PSPTO1699 PSPTO1700 purN purM TRUE 0.998 0.000 0.230 0.002 Y NA
 334705 334706 PSPTO1701 PSPTO1702     TRUE 0.631 40.000 0.087 NA   NA
 334706 334707 PSPTO1702 PSPTO1703     FALSE 0.223 230.000 0.217 NA   NA
 334707 334708 PSPTO1703 PSPTO1704     TRUE 0.591 12.000 0.000 NA   NA
 334708 334709 PSPTO1704 PSPTO1705     TRUE 0.739 70.000 0.267 NA N NA
 334709 334710 PSPTO1705 PSPTO1706     TRUE 0.971 95.000 0.909 NA Y NA
 10692042 334712 PSPTO_5653 PSPTO1708   cobO FALSE 0.111 91.000 0.000 NA   NA
 334712 334713 PSPTO1708 PSPTO1709 cobO   TRUE 0.903 40.000 0.069 0.007 Y NA
 334713 334714 PSPTO1709 PSPTO1710     TRUE 0.957 -3.000 0.027 1.000 N NA
 334714 334715 PSPTO1710 PSPTO1711   cobD TRUE 0.974 -3.000 0.053 1.000 N NA
 334715 334716 PSPTO1711 PSPTO1712 cobD cobC TRUE 0.995 -7.000 0.463 0.007 N NA
 334716 334717 PSPTO1712 PSPTO1713 cobC cobQ TRUE 0.987 -3.000 0.033 0.007 N NA
 334717 334718 PSPTO1713 PSPTO1714 cobQ cobP TRUE 0.992 1.000 0.079 1.000 Y NA
 334718 334719 PSPTO1714 PSPTO1715 cobP cobT TRUE 0.995 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 334719 334720 PSPTO1715 PSPTO1716 cobT   TRUE 0.982 -3.000 0.090 1.000 N NA
 334720 334721 PSPTO1716 PSPTO1717   cobS TRUE 0.883 6.000 0.021 1.000 N NA
 334721 334722 PSPTO1717 PSPTO1718 cobS   FALSE 0.109 98.000 0.000 1.000 N NA
 334722 334723 PSPTO1718 PSPTO1719     FALSE 0.149 181.000 0.042 1.000 N NA
 334724 334725 PSPTO1720 PSPTO1721     FALSE 0.017 242.000 0.000 NA   NA
 334725 334726 PSPTO1721 PSPTO1722     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 334727 334728 PSPTO1723 PSPTO1724     FALSE 0.002 518.000 0.000 NA   NA
 334728 334729 PSPTO1724 PSPTO1725     FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 334731 334732 PSPTO1727 PSPTO1728     FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 334732 334733 PSPTO1728 PSPTO1729     FALSE 0.101 101.000 0.000 NA   NA
 334734 334735 PSPTO1730 PSPTO1731   fumC-1 TRUE 0.846 -7.000 0.007 1.000   NA
 334736 334737 PSPTO1732 PSPTO1733   bolA TRUE 0.704 22.000 0.056 NA   NA
 334737 334738 PSPTO1733 PSPTO1734 bolA   FALSE 0.183 172.000 0.049 NA   NA
 334738 334739 PSPTO1734 PSPTO1735     TRUE 0.935 4.000 0.038 NA   NA
 334739 334740 PSPTO1735 PSPTO1736     TRUE 0.989 -7.000 0.407 1.000 N NA
 334740 334741 PSPTO1736 PSPTO1737     TRUE 0.501 124.000 0.158 1.000 N NA
 334741 334742 PSPTO1737 PSPTO1738     TRUE 0.824 31.000 0.222 NA N NA
 334743 334744 PSPTO1739 PSPTO1740     FALSE 0.016 247.000 0.000 1.000 N NA
 334744 334745 PSPTO1740 PSPTO1741   gph-2 TRUE 0.848 28.000 0.098 0.067   NA
 334745 334746 PSPTO1741 PSPTO1742 gph-2 ubiG TRUE 0.987 4.000 0.259 1.000   NA
 334746 334747 PSPTO1742 PSPTO1743 ubiG   TRUE 0.571 65.000 0.104 1.000 N NA
 334748 334749 PSPTO1744 PSPTO1745   gyrA FALSE 0.013 303.000 0.007 1.000 N NA
 334749 334750 PSPTO1745 PSPTO1746 gyrA serC FALSE 0.185 186.000 0.067 1.000 N NA
 334750 334751 PSPTO1746 PSPTO1747 serC pheA TRUE 0.994 0.000 0.121 1.000 Y NA
 334751 334752 PSPTO1747 PSPTO1748 pheA   TRUE 0.684 67.000 0.035 1.000 Y NA
 334752 334753 PSPTO1748 PSPTO1749   cmk TRUE 0.991 -3.000 0.209 1.000 N NA
 334753 334754 PSPTO1749 PSPTO1750 cmk rpsA TRUE 0.663 122.000 0.281 1.000 N NA
 334754 334755 PSPTO1750 PSPTO1751 rpsA ihfB FALSE 0.121 316.000 0.292 1.000 N NA
 334755 334756 PSPTO1751 PSPTO1752 ihfB   TRUE 0.720 25.000 0.069 NA   NA
 334756 334757 PSPTO1752 PSPTO1753     FALSE 0.003 413.000 0.000 NA   NA
 334757 334758 PSPTO1753 PSPTO1754     FALSE 0.087 173.000 0.009 1.000 N NA
 334758 334759 PSPTO1754 PSPTO1755     TRUE 0.992 -7.000 0.250 1.000 Y NA
 334759 334760 PSPTO1755 PSPTO1756   wbpM TRUE 0.608 101.000 0.041 1.000 Y NA
 334760 334761 PSPTO1756 PSPTO1757 wbpM   FALSE 0.124 160.000 0.012 1.000   NA
 334762 334763 PSPTO1758 PSPTO1759     FALSE 0.140 74.000 0.000 1.000 N NA
 334765 334766 PSPTO1761 PSPTO1762     FALSE 0.089 124.000 0.000 NA   NA
 334766 334767 PSPTO1762 PSPTO1763     TRUE 0.966 4.000 0.096 NA   NA
 334768 334769 PSPTO1764 PSPTO1765   efp FALSE 0.408 100.000 0.074 NA   NA
 334770 334771 PSPTO1766 PSPTO1767   ohr TRUE 0.656 41.000 0.103 1.000 N NA
 334771 334772 PSPTO1767 PSPTO1768 ohr   FALSE 0.355 217.000 0.314 1.000 N NA
 334777 334778 PSPTO1773 PSPTO1774     FALSE 0.079 137.000 0.000 NA   NA
 334778 334779 PSPTO1774 PSPTO1775     FALSE 0.076 139.000 0.000 NA   NA
 334782 334783 PSPTO1778 PSPTO1779 htpX   FALSE 0.019 269.000 0.008 1.000 N NA
 334784 334785 PSPTO1780 PSPTO1781     TRUE 0.498 145.000 0.036 1.000 Y NA
 334787 334788 PSPTO1783 PSPTO1784     TRUE 0.948 -3.000 0.019 NA   NA
 401634 401635 PSPTO_t20 PSPTO_t21 tRNA-Glu-1 tRNA-Gly-2 TRUE 0.828 3.000 0.000 NA   NA
 401635 401636 PSPTO_t21 PSPTO_t22 tRNA-Gly-2 tRNA-Glu-2 FALSE 0.102 100.000 0.000 NA   NA
 401636 401637 PSPTO_t22 PSPTO_t23 tRNA-Glu-2 tRNA-Gly-3 TRUE 0.772 5.000 0.000 NA   NA
 334791 334792 PSPTO1787 PSPTO1788     FALSE 0.075 145.000 0.000 1.000 N NA
 334792 334793 PSPTO1788 PSPTO1789     FALSE 0.277 29.000 0.000 1.000 N NA
 334794 334795 PSPTO1790 PSPTO1791     TRUE 0.731 33.000 0.130 1.000 N NA
 334795 334796 PSPTO1791 PSPTO1792     FALSE 0.383 189.000 0.062 NA Y NA
 334796 334797 PSPTO1792 PSPTO1793     TRUE 0.997 -3.000 0.511 NA   NA
 334800 334801 PSPTO1796 PSPTO1797     TRUE 0.998 3.000 0.429 1.000 Y NA
 334801 334802 PSPTO1797 PSPTO1798     FALSE 0.177 52.000 0.000 1.000 N NA
 334802 334803 PSPTO1798 PSPTO1799     FALSE 0.202 93.000 0.008 1.000   NA
 334804 334805 PSPTO1800 PSPTO1801   trkH FALSE 0.001 628.000 0.000 NA   NA
 334809 334810 PSPTO1805 PSPTO1806     TRUE 0.683 186.000 0.318 NA Y NA
 334810 334811 PSPTO1806 PSPTO1807     TRUE 0.988 8.000 0.409 NA   NA
 334811 334812 PSPTO1807 PSPTO1808     FALSE 0.186 167.000 0.043 NA   NA
 334812 334813 PSPTO1808 PSPTO1809   ispZ TRUE 0.988 2.000 0.224 NA   NA
 334814 334815 PSPTO1810 PSPTO1811     TRUE 0.956 14.000 0.281 NA   NA
 334815 334816 PSPTO1811 PSPTO1812     TRUE 0.965 0.000 0.040 NA   NA
 334816 334817 PSPTO1812 PSPTO1813     TRUE 0.844 16.000 0.083 NA   NA
 334817 334818 PSPTO1813 PSPTO1814     TRUE 0.546 62.000 0.087 NA   NA
 334818 5937145 PSPTO1814 PSPTO_1815   rluB FALSE 0.099 185.000 0.026 NA   NA
 5937145 334819 PSPTO_1815 PSPTO1816 rluB   FALSE 0.151 63.000 0.000 NA   NA
 334819 334820 PSPTO1816 PSPTO1817     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 334820 334821 PSPTO1817 PSPTO1818     FALSE 0.385 32.000 0.007 1.000   NA
 334822 334823 PSPTO1819 PSPTO1820     TRUE 0.857 138.000 0.667 NA   NA
 334823 334824 PSPTO1820 PSPTO1821   phhB FALSE 0.003 452.000 0.000 NA   NA
 334824 334825 PSPTO1821 PSPTO1822 phhB phhA TRUE 0.796 35.000 0.203 1.000 N NA
 334828 334829 PSPTO1825 PSPTO1826 acs   FALSE 0.002 534.000 0.000 1.000 N NA
 334829 334830 PSPTO1826 PSPTO1827     TRUE 0.976 85.000 0.714 0.072 Y NA
 334830 334831 PSPTO1827 PSPTO1828     TRUE 1.000 -3.000 0.875 0.012 Y NA
 334831 334832 PSPTO1828 PSPTO1829     TRUE 0.996 2.000 0.500 1.000   NA
 334832 334833 PSPTO1829 PSPTO1830   hisP TRUE 0.966 23.000 0.571 1.000   NA
 334833 334834 PSPTO1830 PSPTO1831 hisP argR TRUE 0.873 73.000 0.500 1.000 N NA
 334834 334835 PSPTO1831 PSPTO1832 argR argD-1 FALSE 0.019 237.000 0.000 1.000 N NA
 334835 334836 PSPTO1832 PSPTO1833 argD-1 aruF TRUE 0.914 134.000 0.533 1.000 Y NA
 334836 334837 PSPTO1833 PSPTO1834 aruF aruG TRUE 0.992 64.000 1.000 0.000 Y NA
 334837 334838 PSPTO1834 PSPTO1835 aruG astD TRUE 0.990 0.000 0.205 1.000 N NA
 334838 334839 PSPTO1835 PSPTO1836 astD astB TRUE 0.757 81.000 0.306 1.000 N NA
 10692043 334841 PSPTO_5637 PSPTO1838   astE TRUE 0.995 12.000 0.909 NA   NA
 334842 334843 PSPTO1839 PSPTO1840 ribH-2   FALSE 0.335 22.000 0.000 NA   NA
 334843 10692044 PSPTO1840 PSPTO_5654     FALSE 0.461 -46.000 0.000 NA   NA
 334844 334845 PSPTO1841 PSPTO1842   alaS FALSE 0.123 145.000 0.009 1.000 N NA
 334845 334846 PSPTO1842 PSPTO1843 alaS   FALSE 0.413 91.000 0.065 1.000 N NA
 334846 334847 PSPTO1843 PSPTO1844   csrA-2 FALSE 0.249 172.000 0.079 1.000 N NA
 334847 401638 PSPTO1844 PSPTO_t24 csrA-2 tRNA-Ser-1 FALSE 0.151 63.000 0.000 NA   NA
 401638 401639 PSPTO_t24 PSPTO_t25 tRNA-Ser-1 tRNA-Arg-2 FALSE 0.092 110.000 0.000 NA   NA
 401639 401640 PSPTO_t25 PSPTO_t26 tRNA-Arg-2 tRNA-Arg-3 FALSE 0.115 88.000 0.000 NA   NA
 334850 334851 PSPTO1847 PSPTO1848     FALSE 0.003 445.000 0.000 NA   NA
 334851 334852 PSPTO1848 PSPTO1849     TRUE 0.628 -12.000 0.000 NA   NA
 334853 334854 PSPTO1850 PSPTO1851     TRUE 0.491 -33.000 0.000 NA   NA
 334854 334855 PSPTO1851 PSPTO1852     FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 334855 334856 PSPTO1852 PSPTO1853     FALSE 0.006 319.000 0.000 NA   NA
 334857 334858 PSPTO1854 PSPTO1855     TRUE 0.938 109.000 1.000 NA   NA
 334858 334859 PSPTO1855 PSPTO1856     FALSE 0.002 579.000 0.000 1.000 N NA
 334861 334862 PSPTO1858 PSPTO1859     FALSE 0.381 95.000 0.054 1.000   NA
 334863 334864 PSPTO1860 PSPTO1861     FALSE 0.133 74.000 0.000 NA   NA
 334864 334865 PSPTO1861 PSPTO1862     FALSE 0.407 78.000 0.000 0.044   NA
 334865 334866 PSPTO1862 PSPTO1863     TRUE 0.592 80.000 0.143 1.000   NA
 334866 334867 PSPTO1863 PSPTO1864     TRUE 0.886 17.000 0.148 1.000   NA
 334867 334868 PSPTO1864 PSPTO1865     TRUE 0.928 42.000 0.378 0.044   NA
 334868 334869 PSPTO1865 PSPTO1866     FALSE 0.012 264.000 0.000 1.000 N NA
 334870 334871 PSPTO1868 PSPTO1869 hss   FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 334871 334872 PSPTO1869 PSPTO1870     FALSE 0.223 35.000 0.000 NA   NA
 334872 334873 PSPTO1870 PSPTO1871     FALSE 0.005 348.000 0.000 1.000 N NA
 334873 334874 PSPTO1871 PSPTO1872     FALSE 0.106 96.000 0.000 NA   NA
 334875 334876 PSPTO1873 PSPTO1874   hyuE TRUE 0.963 11.000 0.220 1.000 N NA
 334878 334879 PSPTO1876 PSPTO1877     FALSE 0.200 41.000 0.000 NA   NA
 334879 334880 PSPTO1877 PSPTO1878     TRUE 0.979 14.000 0.476 1.000   NA
 334882 334883 PSPTO1880 PSPTO1881     TRUE 0.997 4.000 0.750 1.000 N NA
 334883 334884 PSPTO1881 PSPTO1882     TRUE 0.814 5.000 0.000 1.000   NA
 334886 334887 PSPTO1884 PSPTO1885     TRUE 0.940 7.000 0.069 NA   NA
 334890 334891 PSPTO1888 PSPTO1889     FALSE 0.001 758.000 0.000 NA   NA
 334891 334892 PSPTO1889 PSPTO1890   gabT-3 TRUE 0.889 24.000 0.250 NA   NA
 334893 334894 PSPTO1891 PSPTO1892 pcD   TRUE 0.731 44.000 0.173 1.000 N NA
 334895 334896 PSPTO1893 PSPTO1894     TRUE 1.000 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 334897 334898 PSPTO1895 PSPTO1896     TRUE 0.997 0.000 0.562 NA   NA
 334898 334899 PSPTO1896 PSPTO1897     TRUE 0.566 39.000 0.062 NA N NA
 334899 334900 PSPTO1897 PSPTO1898     TRUE 0.994 -3.000 0.297 NA   NA
 334900 334901 PSPTO1898 PSPTO1899     TRUE 0.967 11.000 0.250 NA   NA
 334901 334902 PSPTO1899 PSPTO1900     FALSE 0.036 190.000 0.000 NA   NA
 334902 334903 PSPTO1900 PSPTO1901   bphO FALSE 0.135 72.000 0.000 NA   NA
 334903 334904 PSPTO1901 PSPTO1902 bphO bphP TRUE 0.994 -3.000 0.300 NA N NA
 334905 334906 PSPTO1903 PSPTO1904     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 334908 334909 PSPTO1906 PSPTO1907   pobA FALSE 0.007 317.000 0.000 1.000 N NA
 334912 334913 PSPTO1910 PSPTO1911     FALSE 0.022 399.000 0.000 NA Y NA
 334913 334914 PSPTO1911 PSPTO1912     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 334914 334915 PSPTO1912 PSPTO1913     FALSE 0.047 176.000 0.000 NA   NA
 334915 334916 PSPTO1913 PSPTO1914     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 334916 334917 PSPTO1914 PSPTO1915     TRUE 0.962 -3.000 0.027 1.000   NA
 334917 334918 PSPTO1915 PSPTO1916     TRUE 0.966 6.000 0.027 0.004   NA
 334919 334920 PSPTO1917 PSPTO1918     FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 334920 334921 PSPTO1918 PSPTO1919     FALSE 0.132 75.000 0.000 NA   NA
 334921 334922 PSPTO1919 PSPTO1920     TRUE 0.906 0.000 0.000 1.000   NA
 334923 334924 PSPTO1921 PSPTO1922     TRUE 0.888 55.000 0.462 1.000   NA
 334925 334926 PSPTO1923 PSPTO1924     TRUE 0.539 83.000 0.121 1.000 N NA
 334926 334927 PSPTO1924 PSPTO1925     TRUE 0.967 50.000 0.361 0.001 Y NA
 334927 334928 PSPTO1925 PSPTO1926     TRUE 0.802 161.000 0.371 NA Y NA
 334929 334930 PSPTO1927 PSPTO1928   cheR-2 TRUE 0.986 37.000 0.838 1.000 Y NA
 334930 334931 PSPTO1928 PSPTO1929 cheR-2   FALSE 0.131 81.000 0.000 1.000 N NA
 334931 334932 PSPTO1929 PSPTO1930   cynS FALSE 0.154 177.000 0.000 0.073 N NA
 334932 334933 PSPTO1930 PSPTO1931 cynS   TRUE 0.761 11.000 0.011 NA   NA
 334933 334934 PSPTO1931 PSPTO1932     FALSE 0.173 50.000 0.000 NA   NA
 334934 334935 PSPTO1932 PSPTO1933   flgB FALSE 0.144 67.000 0.000 NA   NA
 334935 334936 PSPTO1933 PSPTO1934 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.800 0.003 Y NA
 334936 334937 PSPTO1934 PSPTO1935 flgC flgD TRUE 0.966 16.000 0.207 NA Y NA
 334937 334938 PSPTO1935 PSPTO1936 flgD flgE-1 TRUE 0.991 26.000 0.875 NA Y NA
 334938 334939 PSPTO1936 PSPTO1937 flgE-1 flgE-2 FALSE 0.428 190.000 0.000 0.000 Y NA
 334939 334940 PSPTO1937 PSPTO1938 flgE-2   FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 334940 334941 PSPTO1938 PSPTO1939   flgF FALSE 0.021 224.000 0.000 NA   NA
 334941 334942 PSPTO1939 PSPTO1940 flgF flgG TRUE 0.946 47.000 0.207 0.001 Y NA
 334942 334943 PSPTO1940 PSPTO1941 flgG flgH TRUE 0.975 85.000 0.632 0.005 Y NA
 334943 334944 PSPTO1941 PSPTO1942 flgH flgI TRUE 0.982 14.000 0.128 0.006 Y NA
 334944 334945 PSPTO1942 PSPTO1943 flgI flgJ TRUE 0.996 11.000 0.405 0.006 Y NA
 334945 334946 PSPTO1943 PSPTO1944 flgJ flgK TRUE 0.998 12.000 0.705 0.002 Y NA
 334946 334947 PSPTO1944 PSPTO1945 flgK flgL TRUE 0.976 14.000 0.057 0.001 Y NA
 334947 334948 PSPTO1945 PSPTO1946 flgL   FALSE 0.091 89.000 0.000 NA N NA
 334948 334949 PSPTO1946 PSPTO1947     FALSE 0.084 132.000 0.000 NA   NA
 334949 334950 PSPTO1947 PSPTO1948     FALSE 0.009 286.000 0.000 NA   NA
 334950 334951 PSPTO1948 PSPTO1949     FALSE 0.004 329.000 0.000 NA N NA
 334951 334952 PSPTO1949 PSPTO1950     TRUE 0.634 67.000 0.025 NA Y NA
 334952 334953 PSPTO1950 PSPTO1951   fliD TRUE 0.750 84.000 0.117 NA Y NA
 334953 334954 PSPTO1951 PSPTO1952 fliD fliS TRUE 0.872 126.000 0.194 0.002 Y NA
 334954 334955 PSPTO1952 PSPTO1953 fliS   TRUE 0.944 26.000 0.478 NA   NA
 334955 334956 PSPTO1953 PSPTO1954   fleQ FALSE 0.186 177.000 0.056 NA   NA
 334956 334957 PSPTO1954 PSPTO1955 fleQ fleS TRUE 0.578 231.000 0.377 1.000 Y NA
 334957 334958 PSPTO1955 PSPTO1956 fleS fleR TRUE 0.999 0.000 0.679 1.000 Y NA
 334958 334959 PSPTO1956 PSPTO1957 fleR fliE TRUE 0.477 215.000 0.446 1.000 N NA
 334959 334960 PSPTO1957 PSPTO1958 fliE fliF TRUE 0.998 16.000 0.910 0.005 Y NA
 334960 334961 PSPTO1958 PSPTO1959 fliF fliG TRUE 0.994 8.000 0.189 0.005 Y NA
 334961 334962 PSPTO1959 PSPTO1960 fliG   TRUE 0.990 16.000 0.320 0.003 Y NA
 334962 334963 PSPTO1960 PSPTO1961   fliI TRUE 0.989 -10.000 0.115 0.003 Y NA
 334963 334964 PSPTO1961 PSPTO1962 fliI   TRUE 0.980 7.000 0.070 1.000 Y NA
 334964 334965 PSPTO1962 PSPTO1963     FALSE 0.235 83.000 0.022 NA N NA
 334965 334966 PSPTO1963 PSPTO1964     TRUE 0.994 5.000 0.308 NA Y NA
 334966 334967 PSPTO1964 PSPTO1965     TRUE 0.952 34.000 0.381 NA Y NA
 334967 334968 PSPTO1965 PSPTO1966   fliK FALSE 0.379 99.000 0.069 NA N NA
 334970 334971 PSPTO1968 PSPTO1969   fliM TRUE 0.993 10.000 0.171 0.001 Y NA
 334971 334972 PSPTO1969 PSPTO1970 fliM fliN TRUE 0.987 62.000 0.741 0.001 Y NA
 334972 334973 PSPTO1970 PSPTO1971 fliN fliO TRUE 0.998 1.000 0.443 1.000 Y NA
 334973 334974 PSPTO1971 PSPTO1972 fliO fliP TRUE 0.992 0.000 0.061 1.000 Y NA
 334974 334975 PSPTO1972 PSPTO1973 fliP fliQ TRUE 0.996 26.000 1.000 0.009 Y NA
 334975 334976 PSPTO1973 PSPTO1974 fliQ fliR TRUE 0.998 16.000 1.000 0.001 Y NA
 334976 334977 PSPTO1974 PSPTO1975 fliR flhB TRUE 0.993 2.000 0.129 1.000 Y NA
 334977 334978 PSPTO1975 PSPTO1976 flhB flhA FALSE 0.194 387.000 0.205 0.009 Y NA
 334978 334979 PSPTO1976 PSPTO1977 flhA flhF TRUE 0.979 12.000 0.178 1.000 Y NA
 334979 334980 PSPTO1977 PSPTO1978 flhF fleN TRUE 0.616 125.000 0.241 1.000 N NA
 334980 334981 PSPTO1978 PSPTO1979 fleN fliA TRUE 0.997 -3.000 0.482 1.000 N NA
 334981 334982 PSPTO1979 PSPTO1980 fliA cheY-2 FALSE 0.217 253.000 0.283 1.000 N NA
 334982 334983 PSPTO1980 PSPTO1981 cheY-2 cheZ TRUE 0.919 119.000 0.516 1.000 Y NA
 334983 334984 PSPTO1981 PSPTO1982 cheZ cheA-2 TRUE 0.949 34.000 0.341 1.000 Y NA
 334984 334985 PSPTO1982 PSPTO1983 cheA-2 cheB-2 TRUE 0.955 51.000 0.327 0.018 Y NA
 334985 334986 PSPTO1983 PSPTO1984 cheB-2 motA-1 TRUE 0.995 0.000 0.153 1.000 Y NA
 334986 334987 PSPTO1984 PSPTO1985 motA-1   TRUE 0.992 7.000 0.248 1.000 Y NA
 334987 334988 PSPTO1985 PSPTO1986     TRUE 0.748 46.000 0.199 1.000 N NA
 334988 334989 PSPTO1986 PSPTO1987     TRUE 0.854 76.000 0.454 1.000   NA
 334989 334990 PSPTO1987 PSPTO1988   cheW-2 TRUE 0.977 58.000 0.886 0.015   NA
 334990 334991 PSPTO1988 PSPTO1989 cheW-2   TRUE 0.954 43.000 0.743 NA   NA
 334992 334993 PSPTO1990 PSPTO1991 apt anr FALSE 0.283 62.000 0.016 1.000 N NA
 334995 334996 PSPTO1993 PSPTO1994 hemN   FALSE 0.368 96.000 0.051 1.000   NA
 334996 334997 PSPTO1994 PSPTO1995   ccoS TRUE 0.981 -7.000 0.266 NA   NA
 334997 334998 PSPTO1995 PSPTO1996 ccoS   TRUE 0.995 -21.000 0.713 NA Y NA
 334998 334999 PSPTO1996 PSPTO1997     TRUE 0.984 3.000 0.197 NA   NA
 334999 335000 PSPTO1997 PSPTO1998     TRUE 0.930 11.000 0.111 NA   NA
 335000 335001 PSPTO1998 PSPTO1999     FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 335001 335002 PSPTO1999 PSPTO2000     TRUE 0.994 0.000 0.323 NA   NA
 335002 335003 PSPTO2000 PSPTO2001   ccoP FALSE 0.078 138.000 0.000 NA   NA
 335003 335004 PSPTO2001 PSPTO2002 ccoP ccoQ TRUE 0.988 -3.000 0.030 0.001 N NA
 335004 335005 PSPTO2002 PSPTO2003 ccoQ ccoO TRUE 0.974 6.000 0.045 0.001 N NA
 335005 335006 PSPTO2003 PSPTO2004 ccoO ccoN TRUE 0.999 0.000 0.833 0.001 N NA
 335008 335009 PSPTO2006 PSPTO2007     FALSE 0.129 77.000 0.000 NA   NA
 335011 335012 PSPTO2009 PSPTO2010     FALSE 0.088 126.000 0.000 NA   NA
 335014 335015 PSPTO2012 PSPTO2013     FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 335015 335016 PSPTO2013 PSPTO2014   aer-2 FALSE 0.006 318.000 0.000 NA   NA
 335016 335017 PSPTO2014 PSPTO2015 aer-2   FALSE 0.327 97.000 0.048 NA   NA
 335017 335018 PSPTO2015 PSPTO2016   acnA FALSE 0.137 121.000 0.006 NA   NA
 335019 335020 PSPTO2017 PSPTO2018     FALSE 0.409 67.000 0.047 NA   NA
 335020 335021 PSPTO2018 PSPTO2019   pdxB FALSE 0.188 89.000 0.009 1.000 N NA
 335024 335025 PSPTO2022 PSPTO2023     FALSE 0.297 114.000 0.049 NA   NA
 335027 335028 PSPTO2025 PSPTO2026     FALSE 0.236 113.000 0.031 NA   NA
 335028 335029 PSPTO2026 PSPTO2027     FALSE 0.105 97.000 0.000 NA   NA
 335034 335035 PSPTO2032 PSPTO2033     FALSE 0.240 32.000 0.000 NA   NA
 335036 335037 PSPTO2034 PSPTO2035   folE-2 TRUE 0.515 75.000 0.090 1.000 N NA
 335039 335040 PSPTO2037 PSPTO2038     FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 335040 335041 PSPTO2038 PSPTO2039     FALSE 0.046 177.000 0.000 NA   NA
 335043 335044 PSPTO2041 PSPTO2042     TRUE 0.632 97.000 0.219 NA   NA
 335045 335046 PSPTO2043 PSPTO2044 aroC   TRUE 0.620 32.000 0.055 1.000   NA
 335046 335047 PSPTO2044 PSPTO2045     TRUE 0.954 -3.000 0.018 1.000   NA
 335047 335048 PSPTO2045 PSPTO2046     TRUE 0.592 82.000 0.148 1.000   NA
 335048 335049 PSPTO2046 PSPTO2047     TRUE 0.927 17.000 0.231 1.000   NA
 335049 335050 PSPTO2047 PSPTO2048     FALSE 0.011 275.000 0.000 1.000 N NA
 335052 335053 PSPTO2050 PSPTO2051     TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 335053 335054 PSPTO2051 PSPTO2052     TRUE 0.618 99.000 0.211 NA   NA
 335056 335057 PSPTO2054 PSPTO2055   speE FALSE 0.032 199.000 0.000 NA   NA
 335057 335058 PSPTO2055 PSPTO2056 speE   FALSE 0.012 265.000 0.000 1.000 N NA
 335058 335059 PSPTO2056 PSPTO2057     FALSE 0.001 674.000 0.000 NA   NA
 335059 335060 PSPTO2057 PSPTO2058     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 335060 335061 PSPTO2058 PSPTO2059     FALSE 0.006 321.000 0.000 NA   NA
 335061 335062 PSPTO2059 PSPTO2060     TRUE 0.992 13.000 0.805 NA   NA
 335062 335063 PSPTO2060 PSPTO2061     TRUE 0.995 -3.000 0.365 NA   NA
 335066 335067 PSPTO2064 PSPTO2065     FALSE 0.244 126.000 0.033 1.000 N NA
 335067 335068 PSPTO2065 PSPTO2066     FALSE 0.088 126.000 0.000 NA   NA
 335069 335070 PSPTO2067 PSPTO2068     FALSE 0.161 56.000 0.000 NA   NA
 335070 335071 PSPTO2068 PSPTO2069     FALSE 0.002 572.000 0.000 NA   NA
 335072 335073 PSPTO2070 PSPTO2071     FALSE 0.142 68.000 0.000 NA   NA
 335073 335074 PSPTO2071 PSPTO2072     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 335074 335075 PSPTO2072 PSPTO2073     FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 335075 335076 PSPTO2073 PSPTO2074     FALSE 0.107 95.000 0.000 NA   NA
 335079 335080 PSPTO2077 PSPTO2078     TRUE 0.967 11.000 0.250 NA   NA
 335080 335081 PSPTO2078 PSPTO2079     TRUE 0.993 3.000 0.375 NA   NA
 335081 335082 PSPTO2079 PSPTO2080     TRUE 0.994 0.000 0.294 NA   NA
 335082 335083 PSPTO2080 PSPTO2081     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335084 335085 PSPTO2082 PSPTO2083     FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 335085 335086 PSPTO2083 PSPTO2084     FALSE 0.024 216.000 0.000 NA   NA
 335086 335087 PSPTO2084 PSPTO2085     TRUE 0.956 18.000 0.429 NA   NA
 335087 335088 PSPTO2085 PSPTO2086     TRUE 0.891 149.000 0.857 NA   NA
 335089 335090 PSPTO2087 PSPTO2088     TRUE 0.988 3.000 0.250 NA   NA
 335090 335091 PSPTO2088 PSPTO2089     TRUE 0.994 0.000 0.333 NA   NA
 335091 335092 PSPTO2089 PSPTO2090     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335092 335093 PSPTO2090 PSPTO2091     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335093 335094 PSPTO2091 PSPTO2092     FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 335094 335095 PSPTO2092 PSPTO2093     FALSE 0.125 80.000 0.000 NA   NA
 335095 335096 PSPTO2093 PSPTO2094     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335096 335097 PSPTO2094 PSPTO2095     TRUE 0.558 13.000 0.000 NA   NA
 335097 335098 PSPTO2095 PSPTO2096     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 401677 335099 PSPTO_t28 PSPTO2097 tRNA-Ser-2   FALSE 0.045 178.000 0.000 NA   NA
 335101 335102 PSPTO2099 PSPTO2100     TRUE 0.512 75.000 0.091 NA   NA
 335102 335103 PSPTO2100 PSPTO2101   mfd TRUE 0.895 12.000 0.071 NA   NA
 335104 335105 PSPTO2102 PSPTO2103 gap-2   FALSE 0.316 161.000 0.000 1.000 Y NA
 335107 335108 PSPTO2105 PSPTO2106   sthA FALSE 0.164 143.000 0.021 1.000 N NA
 335109 10692046 PSPTO2107 PSPTO_2108     TRUE 0.701 60.000 0.192 NA   NA
 335110 335111 PSPTO2109 PSPTO2110 lolC lolD TRUE 0.939 8.000 0.025 0.084 N NA
 335111 335112 PSPTO2110 PSPTO2111 lolD lolE TRUE 0.964 36.000 0.620 0.084 N NA
 335112 335113 PSPTO2111 PSPTO2112 lolE   FALSE 0.116 110.000 0.000 1.000   NA
 335114 335115 PSPTO2113 PSPTO2114     FALSE 0.225 102.000 0.024 NA   NA
 335118 335119 PSPTO2117 PSPTO2118     TRUE 0.998 -3.000 0.408 NA Y NA
 335121 335122 PSPTO2120 PSPTO2121     FALSE 0.074 110.000 0.000 NA N NA
 335122 335123 PSPTO2121 PSPTO2122     FALSE 0.228 34.000 0.000 NA   NA
 335123 335124 PSPTO2122 PSPTO2123     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   NA
 335124 335125 PSPTO2123 PSPTO2124     FALSE 0.001 633.000 0.000 NA   NA
 335127 335128 PSPTO2126 PSPTO2127     FALSE 0.095 115.000 0.000 1.000 N NA
 335129 335130 PSPTO2128 PSPTO2129     TRUE 0.996 -3.000 0.065 0.021 Y NA
 335130 335131 PSPTO2129 PSPTO2130     TRUE 0.835 84.000 0.087 0.021 Y NA
 335131 335132 PSPTO2130 PSPTO2131     TRUE 0.998 -3.000 0.261 0.026 Y NA
 335135 335136 PSPTO2134 PSPTO2135   pvsA TRUE 0.868 105.000 0.333 1.000 Y NA
 335136 335137 PSPTO2135 PSPTO2136 pvsA daT FALSE 0.321 110.000 0.053 1.000 N NA
 335137 335138 PSPTO2136 PSPTO2137 daT   TRUE 0.629 82.000 0.184 NA   NA
 335139 335140 PSPTO2138 PSPTO2139     TRUE 0.999 1.000 0.512 1.000 Y NA
 335140 335141 PSPTO2139 PSPTO2140     TRUE 0.999 0.000 0.814 1.000 Y NA
 335141 335142 PSPTO2140 PSPTO2141     TRUE 0.999 -3.000 0.484 1.000 Y NA
 335142 335143 PSPTO2141 PSPTO2142     TRUE 0.966 15.000 0.387 NA   NA
 335143 335144 PSPTO2142 PSPTO2143     TRUE 0.995 -3.000 0.360 NA   NA
 335144 335145 PSPTO2143 PSPTO2144     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335145 335146 PSPTO2144 PSPTO2145     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335147 335148 PSPTO2146 PSPTO2147     FALSE 0.063 286.000 0.000 1.000 Y NA
 335148 335149 PSPTO2147 PSPTO2148     TRUE 0.999 -3.000 0.286 0.004 Y NA
 335149 335150 PSPTO2148 PSPTO2149     TRUE 0.990 15.000 0.286 0.004 Y NA
 335150 335151 PSPTO2149 PSPTO2150     TRUE 0.998 2.000 0.286 0.004 Y NA
 335152 335153 PSPTO2151 PSPTO2152     FALSE 0.179 260.000 0.000 0.003 Y NA
 335153 335154 PSPTO2152 PSPTO2153   pvdE FALSE 0.050 308.000 0.000 1.000 Y NA
 335154 335155 PSPTO2153 PSPTO2154 pvdE   TRUE 0.624 66.000 0.150 NA   NA
 335155 335156 PSPTO2154 PSPTO2155     TRUE 0.831 79.000 0.429 NA   NA
 335156 335157 PSPTO2155 PSPTO2156     TRUE 0.889 43.000 0.188 1.000 Y NA
 335159 335160 PSPTO2158 PSPTO2159     TRUE 0.984 -7.000 0.314 1.000 N NA
 335160 335161 PSPTO2159 PSPTO2160     TRUE 0.999 1.000 0.943 1.000 N NA
 335163 335164 PSPTO2162 PSPTO2163   aspC TRUE 0.489 -34.000 0.000 NA   NA
 335167 401642 PSPTO2166 PSPTO_t29 gltX tRNA-Ala-4 FALSE 0.066 150.000 0.000 NA   NA
 401642 401643 PSPTO_t29 PSPTO_t30 tRNA-Ala-4 tRNA-Glu-3 FALSE 0.112 90.000 0.000 NA   NA
 401643 401644 PSPTO_t30 PSPTO_t31 tRNA-Glu-3 tRNA-Ala-5 FALSE 0.167 53.000 0.000 NA   NA
 401644 401645 PSPTO_t31 PSPTO_t32 tRNA-Ala-5 tRNA-Glu-4 FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 401645 335168 PSPTO_t32 PSPTO2167 tRNA-Glu-4   FALSE 0.002 511.000 0.000 NA   NA
 335168 335169 PSPTO2167 PSPTO2168     FALSE 0.002 606.000 0.000 1.000   NA
 335169 335170 PSPTO2168 PSPTO2169     TRUE 0.546 29.000 0.029 1.000   NA
 335170 335171 PSPTO2169 PSPTO2170     FALSE 0.165 131.000 0.021 NA N NA
 335172 335173 PSPTO2171 PSPTO2172     TRUE 0.741 69.000 0.163 0.099 N NA
 335174 335175 PSPTO2173 PSPTO2174 leuC leuD TRUE 0.999 -3.000 0.463 0.000 Y NA
 335175 335176 PSPTO2174 PSPTO2175 leuD leuB TRUE 0.823 147.000 0.159 0.001 Y NA
 335176 335177 PSPTO2175 PSPTO2176 leuB asd-1 TRUE 0.905 71.000 0.196 0.034 Y NA
 335177 335178 PSPTO2176 PSPTO2177 asd-1 dgoK FALSE 0.059 166.000 0.000 1.000 N NA
 335178 335179 PSPTO2177 PSPTO2178 dgoK eda-2 TRUE 0.989 2.000 0.060 1.000 Y NA
 335179 335180 PSPTO2178 PSPTO2179 eda-2   TRUE 0.701 61.000 0.084 0.065 N NA
 335180 335181 PSPTO2179 PSPTO2180     FALSE 0.474 96.000 0.103 1.000 N NA
 335181 335182 PSPTO2180 PSPTO2181     FALSE 0.450 82.000 0.069 1.000 N NA
 335185 335186 PSPTO2185 PSPTO2186 etfB-2 etfA-2 TRUE 0.996 1.000 0.100 0.010 Y NA
 335186 335187 PSPTO2186 PSPTO2187 etfA-2   TRUE 0.543 121.000 0.182 1.000 N NA
 335187 335188 PSPTO2187 PSPTO2188     TRUE 0.970 11.000 0.273 NA   NA
 335188 335189 PSPTO2188 PSPTO2189     TRUE 0.992 -3.000 0.231 NA   NA
 335189 335190 PSPTO2189 PSPTO2190     FALSE 0.346 218.000 0.308 1.000 N NA
 335190 335191 PSPTO2190 PSPTO2191     TRUE 0.874 35.000 0.333 NA   NA
 335191 335192 PSPTO2191 PSPTO2192     FALSE 0.242 95.000 0.025 NA   NA
 335192 335193 PSPTO2192 PSPTO2193     FALSE 0.402 58.000 0.037 NA   NA
 335195 335196 PSPTO2195 PSPTO2196 sdhC   TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 335196 335197 PSPTO2196 PSPTO2197   sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 335197 335198 PSPTO2197 PSPTO2198 sdhA sdhB TRUE 0.997 13.000 0.604 0.001 Y NA
 335198 335199 PSPTO2198 PSPTO2199 sdhB sucA FALSE 0.183 260.000 0.067 1.000 Y NA
 335199 335200 PSPTO2199 PSPTO2200 sucA sucB TRUE 0.976 42.000 0.667 1.000 Y NA
 335200 335201 PSPTO2200 PSPTO2201 sucB lpdA TRUE 0.699 173.000 0.253 1.000 Y NA
 335201 335202 PSPTO2201 PSPTO2202 lpdA sucC FALSE 0.330 209.000 0.069 1.000 Y NA
 335202 335203 PSPTO2202 PSPTO2203 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.000 Y NA
 335204 335205 PSPTO2204 PSPTO2205     FALSE 0.084 97.000 0.000 NA N NA
 335208 335209 PSPTO2208 PSPTO2209 htpG   FALSE 0.184 91.000 0.008 1.000 N NA
 335210 335211 PSPTO2210 PSPTO2211 fabB fabA TRUE 0.993 11.000 0.451 1.000 Y NA
 335211 335212 PSPTO2211 PSPTO2212 fabA   FALSE 0.024 221.000 0.000 1.000 N NA
 335213 335214 PSPTO2213 PSPTO2214 gpsA   TRUE 0.830 40.000 0.273 NA   NA
 335214 335215 PSPTO2214 PSPTO2215   sixA TRUE 0.984 -3.000 0.114 NA   NA
 335215 335216 PSPTO2215 PSPTO2216 sixA   FALSE 0.380 68.000 0.045 NA N NA
 335216 335217 PSPTO2216 PSPTO2217     FALSE 0.421 120.000 0.101 NA   NA
 335217 335218 PSPTO2217 PSPTO2218     TRUE 0.983 -3.000 0.096 NA   NA
 335218 335219 PSPTO2218 PSPTO2219     FALSE 0.131 76.000 0.000 NA   NA
 335219 335220 PSPTO2219 PSPTO2220     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 335220 335221 PSPTO2220 PSPTO2221     TRUE 0.817 101.000 0.478 NA   NA
 335222 335223 PSPTO2222 PSPTO2223     TRUE 0.999 -3.000 0.533 1.000 Y NA
 335224 335225 PSPTO2224 PSPTO2225     FALSE 0.008 297.000 0.000 NA   NA
 335225 335226 PSPTO2225 PSPTO2226     FALSE 0.080 136.000 0.000 NA   NA
 335227 335228 PSPTO2227 PSPTO2228   fimD TRUE 0.835 47.000 0.111 1.000 Y NA
 335228 335229 PSPTO2228 PSPTO2229 fimD papD TRUE 0.989 40.000 1.000 1.000 Y NA
 335229 335230 PSPTO2229 PSPTO2230 papD fimA TRUE 0.972 109.000 1.000 1.000 Y NA
 335230 335231 PSPTO2230 PSPTO2231 fimA   FALSE 0.003 429.000 0.000 NA   NA
 335232 335233 PSPTO2232 PSPTO2233     FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 335235 335236 PSPTO2235 PSPTO2236     FALSE 0.163 55.000 0.000 NA   NA
 335236 335237 PSPTO2236 PSPTO2237     FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 335237 335238 PSPTO2237 PSPTO2238     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335238 335239 PSPTO2238 PSPTO2239     FALSE 0.111 91.000 0.000 NA   NA
 335241 335242 PSPTO2241 PSPTO2242   kdpA TRUE 0.988 3.000 0.071 0.001   NA
 335242 335243 PSPTO2242 PSPTO2243 kdpA kdpB TRUE 0.985 11.000 0.059 0.001 Y NA
 335243 335244 PSPTO2243 PSPTO2244 kdpB kdpC TRUE 0.991 55.000 0.877 0.001 Y NA
 335244 335245 PSPTO2244 PSPTO2245 kdpC kdpD FALSE 0.292 67.000 0.020 1.000 N NA
 335245 335246 PSPTO2245 PSPTO2246 kdpD kdpE TRUE 0.999 -3.000 0.621 1.000 Y NA
 335246 335247 PSPTO2246 PSPTO2247 kdpE   FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 335247 335248 PSPTO2247 PSPTO2248     FALSE 0.005 338.000 0.000 NA   NA
 335248 335249 PSPTO2248 PSPTO2249     TRUE 0.988 -30.000 0.739 NA   NA
 335249 335250 PSPTO2249 PSPTO2250     TRUE 0.909 96.000 0.727 NA   NA
 335250 335251 PSPTO2250 PSPTO2251     TRUE 0.539 25.000 0.025 NA   NA
 335251 10692048 PSPTO2251 PSPTO_2252     FALSE 0.061 158.000 0.000 NA   NA
 335252 335253 PSPTO2253 PSPTO2254     FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 335253 335254 PSPTO2254 PSPTO2255     FALSE 0.460 85.000 0.089 NA N NA
 335255 335256 PSPTO2256 PSPTO2257     TRUE 0.789 107.000 0.444 NA   NA
 335256 10692049 PSPTO2257 PSPTO_2258     FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 10692049 335257 PSPTO_2258 PSPTO2259     FALSE 0.007 305.000 0.000 NA   NA
 335257 335258 PSPTO2259 PSPTO2260     TRUE 0.786 22.000 0.100 NA   NA
 335258 335259 PSPTO2260 PSPTO2261     TRUE 0.988 -3.000 0.167 NA   NA
 335261 335262 PSPTO2263 PSPTO2264     FALSE 0.003 435.000 0.000 NA   NA
 335262 335263 PSPTO2264 PSPTO2265   greB-1 FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 335264 335265 PSPTO2266 PSPTO2267     TRUE 0.999 0.000 0.535 NA Y NA
 335266 335267 PSPTO2268 PSPTO2269     FALSE 0.369 57.000 0.031 NA   NA
 335267 335268 PSPTO2269 PSPTO2270     TRUE 0.880 109.000 0.667 NA   NA
 335269 335270 PSPTO2271 PSPTO2272   oprI FALSE 0.005 335.000 0.000 NA   NA
 335271 335272 PSPTO2273 PSPTO2274     FALSE 0.144 67.000 0.000 NA   NA
 335274 335275 PSPTO2276 PSPTO2277 panE-1   TRUE 0.959 4.000 0.061 1.000   NA
 335275 335276 PSPTO2277 PSPTO2278     FALSE 0.459 79.000 0.061 1.000   NA
 335276 335277 PSPTO2278 PSPTO2279   cysB FALSE 0.283 166.000 0.085 1.000 N NA
 335280 335281 PSPTO2282 PSPTO2283 pabB   TRUE 0.639 90.000 0.042 1.000 Y NA
 335281 335282 PSPTO2283 PSPTO2284     TRUE 0.999 -3.000 0.923 NA   NA
 335282 335283 PSPTO2284 PSPTO2285     TRUE 0.969 5.000 0.141 NA   NA
 335284 335285 PSPTO2286 PSPTO2287   prpB TRUE 0.981 -3.000 0.080 1.000 N NA
 335285 335286 PSPTO2287 PSPTO2288 prpB prpC FALSE 0.152 375.000 0.502 1.000 N NA
 335286 335287 PSPTO2288 PSPTO2289 prpC   TRUE 0.865 93.000 0.289 1.000 Y NA
 335287 335288 PSPTO2289 PSPTO2290     TRUE 0.894 121.000 0.733 NA   NA
 335290 335291 PSPTO2292 PSPTO2293 ppsA   FALSE 0.085 193.000 0.029 NA N NA
 335291 335292 PSPTO2293 PSPTO2294     TRUE 0.484 89.000 0.113 NA N NA
 335292 335293 PSPTO2294 PSPTO2295   cmaX TRUE 0.904 12.000 0.093 NA N NA
 335293 335294 PSPTO2295 PSPTO2296 cmaX crfX TRUE 0.482 86.000 0.093 NA   NA
 335294 335295 PSPTO2296 PSPTO2297 crfX   TRUE 0.988 3.000 0.256 NA   NA
 335295 335296 PSPTO2297 PSPTO2298     TRUE 0.493 176.000 0.279 NA   NA
 335296 335297 PSPTO2298 PSPTO2299   oprF TRUE 0.677 107.000 0.280 1.000 N NA
 335298 335299 PSPTO2300 PSPTO2301 cobA nasA TRUE 0.879 11.000 0.048 1.000 N NA
 335299 335300 PSPTO2301 PSPTO2302 nasA   TRUE 0.967 -9.000 0.069 0.041   NA
 335300 335301 PSPTO2302 PSPTO2303     FALSE 0.034 283.000 0.033 1.000   NA
 335301 335302 PSPTO2303 PSPTO2304     TRUE 0.784 80.000 0.337 1.000 N NA
 335304 335305 PSPTO2306 PSPTO2307 nasT   TRUE 0.930 15.000 0.218 NA N NA
 335305 335306 PSPTO2307 PSPTO2308     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335309 335310 PSPTO2311 PSPTO2312     FALSE 0.332 39.000 0.010 1.000 N NA
 335310 335311 PSPTO2312 PSPTO2313     TRUE 0.936 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 335315 335316 PSPTO2317 PSPTO2318     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 335317 335318 PSPTO2319 PSPTO2320     FALSE 0.001 1721.000 0.000 NA   NA
 335319 335320 PSPTO2321 PSPTO2322     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 335321 335322 PSPTO2323 PSPTO2324     FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 335322 335323 PSPTO2324 PSPTO2325     FALSE 0.001 1287.000 0.000 NA   NA
 335323 335324 PSPTO2325 PSPTO2326     FALSE 0.001 763.000 0.000 NA   NA
 335324 10692050 PSPTO2326 PSPTO_2327     TRUE 0.699 9.000 0.000 NA   NA
 10692050 335325 PSPTO_2327 PSPTO2328     FALSE 0.064 154.000 0.000 NA   NA
 335325 10692051 PSPTO2328 PSPTO_2329     FALSE 0.200 41.000 0.000 NA   NA
 10692051 335326 PSPTO_2329 PSPTO2330     FALSE 0.003 404.000 0.000 NA   NA
 335326 335327 PSPTO2330 PSPTO2331     FALSE 0.015 252.000 0.000 1.000 N NA
 335329 335330 PSPTO2333 PSPTO2334     TRUE 0.927 5.000 0.040 NA   NA
 335331 335332 PSPTO2335 PSPTO2336     FALSE 0.247 31.000 0.000 NA   NA
 335332 335333 PSPTO2336 PSPTO2337   pcaQ FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 335333 335334 PSPTO2337 PSPTO2338 pcaQ pcaH TRUE 0.701 128.000 0.153 0.001 N NA
 335334 335335 PSPTO2338 PSPTO2339 pcaH pcaG TRUE 0.999 12.000 0.782 0.000 Y NA
 335335 335336 PSPTO2339 PSPTO2340 pcaG pcaK FALSE 0.149 68.000 0.000 1.000 N NA
 335336 335337 PSPTO2340 PSPTO2341 pcaK pcaB FALSE 0.321 25.000 0.000 1.000 N NA
 335337 335338 PSPTO2341 PSPTO2342 pcaB pcaC-1 TRUE 0.974 -3.000 0.049 1.000   NA
 335342 335343 PSPTO2346 PSPTO2347     TRUE 0.478 105.000 0.122 1.000 N NA
 335345 335346 PSPTO2350 PSPTO2351   mobA FALSE 0.165 96.000 0.007 NA   NA
 335347 335348 PSPTO2352 PSPTO2353 moaB moeA TRUE 0.991 7.000 0.073 0.002 Y NA
 335348 335349 PSPTO2353 PSPTO2354 moeA   FALSE 0.112 90.000 0.000 NA   NA
 335350 335351 PSPTO2355 PSPTO2356     FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 335351 10692052 PSPTO2356 PSPTO_5638     TRUE 0.489 15.000 0.000 NA   NA
 335354 335355 PSPTO2359 PSPTO2360 allD   FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 335355 335356 PSPTO2360 PSPTO2361     FALSE 0.091 113.000 0.000 NA   NA
 335356 335357 PSPTO2361 PSPTO2362   map-2 TRUE 0.996 -3.000 0.410 NA   NA
 335358 335359 PSPTO2363 PSPTO2364   endA FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 335359 335360 PSPTO2364 PSPTO2365 endA   TRUE 0.992 5.000 0.455 NA   NA
 335361 335362 PSPTO2366 PSPTO2367   rbsB-1 FALSE 0.040 184.000 0.000 NA   NA
 335362 335363 PSPTO2367 PSPTO2368 rbsB-1 rbsA-1 TRUE 0.825 54.000 0.132 NA Y NA
 335363 335364 PSPTO2368 PSPTO2369 rbsA-1 rbsC-1 TRUE 0.999 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 335364 335365 PSPTO2369 PSPTO2370 rbsC-1 rbsR TRUE 0.989 2.000 0.226 1.000 N NA
 335365 335366 PSPTO2370 PSPTO2371 rbsR rbsK TRUE 0.931 31.000 0.484 1.000 N NA
 335366 335367 PSPTO2371 PSPTO2372 rbsK   TRUE 0.990 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 335367 335368 PSPTO2372 PSPTO2373     FALSE 0.409 40.000 0.025 1.000 N NA
 335371 335372 PSPTO2376 PSPTO2377     FALSE 0.007 306.000 0.000 NA   NA
 335373 335374 PSPTO2378 PSPTO2379 thrS infC TRUE 0.955 18.000 0.186 1.000 Y NA
 335374 335375 PSPTO2379 PSPTO2380 infC rpmI TRUE 0.967 61.000 0.652 1.000 Y NA
 335375 335376 PSPTO2380 PSPTO2381 rpmI rplT TRUE 0.995 30.000 0.928 0.010 Y NA
 335376 335377 PSPTO2381 PSPTO2382 rplT pheS TRUE 0.796 104.000 0.202 1.000 Y NA
 335377 335378 PSPTO2382 PSPTO2383 pheS pheT TRUE 0.990 29.000 0.574 0.000 Y NA
 335378 335379 PSPTO2383 PSPTO2384 pheT ihfA TRUE 0.983 4.000 0.208 1.000 N NA
 335379 335380 PSPTO2384 PSPTO2385 ihfA   TRUE 0.984 -19.000 0.535 1.000 N NA
 335380 401646 PSPTO2385 PSPTO_t33   tRNA-Pro-3 FALSE 0.118 85.000 0.000 NA   NA
 335382 335383 PSPTO2387 PSPTO2388     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 335388 335389 PSPTO2394 PSPTO2395     FALSE 0.011 293.000 0.000 1.000   NA
 335389 335390 PSPTO2395 PSPTO2396     TRUE 0.537 82.000 0.118 1.000 N NA
 335390 335391 PSPTO2396 PSPTO2397     TRUE 0.960 31.000 0.240 0.042 Y NA
 335391 335392 PSPTO2397 PSPTO2398   rbsA-2 TRUE 0.933 32.000 0.500 1.000 N NA
 335392 335393 PSPTO2398 PSPTO2399 rbsA-2 rbsB-2 TRUE 0.991 16.000 0.600 NA Y NA
 335393 335394 PSPTO2399 PSPTO2400 rbsB-2 rbsC-2 TRUE 0.552 67.000 0.100 NA   NA
 335395 335396 PSPTO2401 PSPTO2402     TRUE 0.999 -10.000 0.860 0.001 Y NA
 335396 335397 PSPTO2402 PSPTO2403     TRUE 0.951 31.000 0.596 1.000 N NA
 335399 335400 PSPTO2405 PSPTO2406 xenA   FALSE 0.045 165.000 0.000 NA N NA
 335400 335401 PSPTO2406 PSPTO2407     TRUE 0.634 137.000 0.286 NA   NA
 335402 335403 PSPTO2408 PSPTO2409 ureD-1 ureG-1 TRUE 0.705 84.000 0.000 0.003 Y NA
 335403 10692053 PSPTO2409 PSPTO_2410 ureG-1   FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 10692053 335404 PSPTO_2410 PSPTO2411     TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 335404 335405 PSPTO2411 PSPTO2412   ureF-1 TRUE 0.824 16.000 0.000 0.003 N NA
 335405 335406 PSPTO2412 PSPTO2413 ureF-1   TRUE 0.999 -3.000 0.460 0.003 Y NA
 335406 335407 PSPTO2413 PSPTO2414     FALSE 0.339 23.000 0.000 1.000 N NA
 335407 335408 PSPTO2414 PSPTO2415     TRUE 0.998 3.000 0.600 0.018   NA
 335408 335409 PSPTO2415 PSPTO2416     TRUE 0.998 -3.000 0.639 1.000   NA
 335409 335410 PSPTO2416 PSPTO2417     TRUE 1.000 2.000 0.888 0.068 Y NA
 335410 335411 PSPTO2417 PSPTO2418     TRUE 0.915 88.000 0.429 1.000 Y NA
 335412 335413 PSPTO2419 PSPTO2420     TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA N NA
 335413 335414 PSPTO2420 PSPTO2421   amdA FALSE 0.017 222.000 0.000 NA N NA
 335415 335416 PSPTO2422 PSPTO2423     FALSE 0.085 131.000 0.000 NA   NA
 335416 335417 PSPTO2423 PSPTO2424     FALSE 0.136 77.000 0.000 1.000 N NA
 335417 335418 PSPTO2424 PSPTO2425     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA N NA
 335419 335420 PSPTO2426 PSPTO2427     FALSE 0.048 178.000 0.000 1.000 N NA
 335420 335421 PSPTO2427 PSPTO2428     FALSE 0.134 79.000 0.000 1.000 N NA
 335421 335422 PSPTO2428 PSPTO2429     FALSE 0.311 26.000 0.000 1.000 N NA
 335422 335423 PSPTO2429 PSPTO2430     TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000 N NA
 335423 335424 PSPTO2430 PSPTO2431     TRUE 0.493 59.000 0.000 0.014   NA
 335425 335426 PSPTO2432 PSPTO2433     FALSE 0.025 214.000 0.000 NA   NA
 335427 335428 PSPTO2434 PSPTO2435     TRUE 0.520 16.000 0.000 1.000   NA
 335428 335429 PSPTO2435 PSPTO2436     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 335429 335430 PSPTO2436 PSPTO2437     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 335430 335431 PSPTO2437 PSPTO2438     FALSE 0.128 58.000 0.000 NA N NA
 335431 335432 PSPTO2438 PSPTO2439     FALSE 0.455 56.000 0.000 0.041 N NA
 335432 335433 PSPTO2439 PSPTO2440     TRUE 0.987 28.000 0.500 0.003 Y NA
 335433 335434 PSPTO2440 PSPTO2441     FALSE 0.001 794.000 0.000 1.000 N NA
 335434 335435 PSPTO2441 PSPTO2442     TRUE 0.878 24.000 0.000 0.017 Y NA
 335435 335436 PSPTO2442 PSPTO2443     FALSE 0.163 55.000 0.000 NA   NA
 335437 335438 PSPTO2444 PSPTO2445     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 335438 335439 PSPTO2445 PSPTO2446     TRUE 0.489 15.000 0.000 NA   NA
 335441 335442 PSPTO2448 PSPTO2449   soxG-2 FALSE 0.014 267.000 0.000 1.000   NA
 335442 335443 PSPTO2449 PSPTO2450 soxG-2 soxA-2 TRUE 0.997 4.000 0.500 0.002   NA
 335443 335444 PSPTO2450 PSPTO2451 soxA-2 soxD-2 TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.002   NA
 335444 335445 PSPTO2451 PSPTO2452 soxD-2 soxB-2 TRUE 0.998 14.000 0.750 0.002 Y NA
 335445 335446 PSPTO2452 PSPTO2453 soxB-2 folD-1 TRUE 0.966 -18.000 0.308 1.000 N NA
 335446 335447 PSPTO2453 PSPTO2454 folD-1 purU-2 TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 N NA
 335450 335451 PSPTO2457 PSPTO2458     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 10692054 335452 PSPTO_2459 PSPTO2460     FALSE 0.175 49.000 0.000 NA   NA
 335452 335453 PSPTO2460 PSPTO2461     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 335453 10692055 PSPTO2461 PSPTO_2462     FALSE 0.448 -106.000 0.000 NA   NA
 10692055 335454 PSPTO_2462 PSPTO2463     FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 335454 335455 PSPTO2463 PSPTO2464     FALSE 0.160 214.000 0.000 1.000 Y NA
 335456 335457 PSPTO2465 PSPTO2466     FALSE 0.002 673.000 0.000 1.000   NA
 335458 335459 PSPTO2467 PSPTO2468     FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 335459 335460 PSPTO2468 PSPTO2469     TRUE 0.847 2.000 0.000 NA   NA
 335461 335462 PSPTO2470 PSPTO2471     FALSE 0.092 110.000 0.000 NA   NA
 335462 335463 PSPTO2471 PSPTO2472     FALSE 0.027 207.000 0.000 NA   NA
 335463 335464 PSPTO2472 PSPTO2473     TRUE 0.945 17.000 0.333 NA N NA
 335466 335467 PSPTO2475 PSPTO2476     FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 335468 335469 PSPTO2477 PSPTO2478   topB FALSE 0.118 66.000 0.000 NA N NA
 335469 335470 PSPTO2478 PSPTO2479 topB   FALSE 0.036 177.000 0.000 NA N NA
 335471 335472 PSPTO2480 PSPTO2481   tonB-2 FALSE 0.011 278.000 0.000 1.000 N NA
 335472 335473 PSPTO2481 PSPTO2482 tonB-2 exbB-3 TRUE 0.939 135.000 0.778 0.012 N NA
 335473 335474 PSPTO2482 PSPTO2483 exbB-3 exbD-3 TRUE 0.991 32.000 0.778 0.082 Y NA
 335474 335475 PSPTO2483 PSPTO2484 exbD-3   FALSE 0.035 283.000 0.000 0.068 N NA
 335475 335476 PSPTO2484 PSPTO2485     FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000 N NA
 335478 335479 PSPTO2487 PSPTO2488     FALSE 0.144 71.000 0.000 1.000 N NA
 335479 335480 PSPTO2488 PSPTO2489     FALSE 0.099 104.000 0.000 NA   NA
 335480 335481 PSPTO2489 PSPTO2490     FALSE 0.073 142.000 0.000 NA   NA
 335481 335482 PSPTO2490 PSPTO2491     FALSE 0.121 88.000 0.000 1.000 N NA
 335482 335483 PSPTO2491 PSPTO2492     FALSE 0.370 84.000 0.000 0.042 N NA
 335483 335484 PSPTO2492 PSPTO2493     TRUE 0.961 -7.000 0.132 1.000 N NA
 335487 335488 PSPTO2496 PSPTO2497     FALSE 0.037 189.000 0.000 NA   NA
 335488 335489 PSPTO2497 PSPTO2498     FALSE 0.165 54.000 0.000 NA   NA
 335490 335491 PSPTO2499 PSPTO2500 mntH   FALSE 0.408 62.000 0.000 0.068 N NA
 335492 335493 PSPTO2501 PSPTO2502     FALSE 0.142 68.000 0.000 NA   NA
 335493 335494 PSPTO2502 PSPTO2503     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 335496 335497 PSPTO2505 PSPTO2506     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 335497 335498 PSPTO2506 PSPTO2507     FALSE 0.109 93.000 0.000 NA   NA
 335499 335500 PSPTO2508 PSPTO2509     FALSE 0.061 139.000 0.000 NA N NA
 335500 335501 PSPTO2509 PSPTO2510   poxB FALSE 0.060 165.000 0.000 1.000 N NA
 335501 335502 PSPTO2510 PSPTO2511 poxB   FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000 N NA
 10692056 335504 PSPTO_5639 PSPTO2513     FALSE 0.097 105.000 0.000 NA   NA
 335504 335505 PSPTO2513 PSPTO2514     TRUE 0.671 10.000 0.000 NA   NA
 335505 335506 PSPTO2514 PSPTO2515     TRUE 0.951 18.000 0.395 NA   NA
 335507 335508 PSPTO2516 PSPTO2517 moaA   FALSE 0.012 264.000 0.000 1.000 N NA
 335508 335509 PSPTO2517 PSPTO2518     FALSE 0.096 113.000 0.000 1.000 N NA
 335509 335510 PSPTO2518 PSPTO2519     TRUE 1.000 -3.000 0.895 1.000 Y NA
 335510 335511 PSPTO2519 PSPTO2520     TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000   NA
 335511 335512 PSPTO2520 PSPTO2521     TRUE 0.998 -3.000 0.444 0.040   NA
 335512 335513 PSPTO2521 PSPTO2522     TRUE 0.975 15.000 0.471 1.000   NA
 335513 335514 PSPTO2522 PSPTO2523     TRUE 1.000 4.000 1.000 0.068 Y NA
 335514 335515 PSPTO2523 PSPTO2524     TRUE 1.000 -3.000 0.889 0.068 Y NA
 335516 335517 PSPTO2525 PSPTO2526     FALSE 0.076 144.000 0.000 1.000 N NA
 335518 335519 PSPTO2527 PSPTO2528     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 335519 335520 PSPTO2528 PSPTO2529     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 335520 335521 PSPTO2529 PSPTO2530     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335521 335522 PSPTO2530 PSPTO2531     TRUE 0.558 13.000 0.000 NA   NA
 335524 335525 PSPTO2533 PSPTO2534     FALSE 0.153 62.000 0.000 NA   NA
 335525 335526 PSPTO2534 PSPTO2535     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335526 335527 PSPTO2535 PSPTO2536     TRUE 0.888 -52.000 0.143 NA   NA
 335527 335528 PSPTO2536 PSPTO2537     TRUE 0.504 -28.000 0.000 NA   NA
 335528 335529 PSPTO2537 PSPTO2538     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 335529 335530 PSPTO2538 PSPTO2539   hcp-1 FALSE 0.131 76.000 0.000 NA   NA
 10692058 335532 PSPTO_2542 PSPTO2543     FALSE 0.219 36.000 0.000 NA   NA
 335532 335533 PSPTO2543 PSPTO2544     TRUE 0.506 30.000 0.030 NA   NA
 335533 335534 PSPTO2544 PSPTO2545     TRUE 0.982 16.000 0.627 NA   NA
 335534 335535 PSPTO2545 PSPTO2546     FALSE 0.104 98.000 0.000 NA   NA
 335535 335536 PSPTO2546 PSPTO2547     TRUE 0.485 -36.000 0.000 NA   NA
 335536 335537 PSPTO2547 PSPTO2548     TRUE 0.963 10.000 0.196 NA   NA
 335537 335538 PSPTO2548 PSPTO2549     TRUE 0.962 2.000 0.000 0.020 N NA
 335538 335539 PSPTO2549 PSPTO2550     FALSE 0.173 50.000 0.000 NA   NA
 335539 335540 PSPTO2550 PSPTO2551     FALSE 0.165 54.000 0.000 NA   NA
 335540 335541 PSPTO2551 PSPTO2552     FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 335541 335542 PSPTO2552 PSPTO2553     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 335542 335543 PSPTO2553 PSPTO2554     TRUE 0.987 14.000 0.667 NA   NA
 335543 335544 PSPTO2554 PSPTO2555   phnC FALSE 0.010 278.000 0.000 NA   NA
 335544 335545 PSPTO2555 PSPTO2556 phnC phnD TRUE 0.971 38.000 0.337 0.002 Y NA
 335545 335546 PSPTO2556 PSPTO2557 phnD phnE TRUE 0.980 28.000 0.330 0.001 Y NA
 335546 335547 PSPTO2557 PSPTO2558 phnE phnF TRUE 0.731 39.000 0.158 1.000 N NA
 335547 335548 PSPTO2558 PSPTO2559 phnF phnG TRUE 0.987 15.000 0.691 1.000 N NA
 335548 335549 PSPTO2559 PSPTO2560 phnG phnH TRUE 1.000 0.000 0.967 0.002 Y NA
 335549 335550 PSPTO2560 PSPTO2561 phnH phnI TRUE 1.000 0.000 0.960 0.002 Y NA
 335550 335551 PSPTO2561 PSPTO2562 phnI phnJ TRUE 1.000 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 335551 335552 PSPTO2562 PSPTO2563 phnJ   TRUE 1.000 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 335552 335553 PSPTO2563 PSPTO2564     TRUE 0.993 33.000 0.859 0.018 Y NA
 335553 335554 PSPTO2564 PSPTO2565     TRUE 0.995 -6.000 0.320 1.000 Y NA
 335554 335555 PSPTO2565 PSPTO2566   phnN TRUE 0.997 0.000 0.235 NA Y NA
 335555 335556 PSPTO2566 PSPTO2567 phnN   TRUE 0.970 -9.000 0.214 NA   NA
 335556 335557 PSPTO2567 PSPTO2568   gcd-1 FALSE 0.080 155.000 0.000 1.000   NA
 335558 335559 PSPTO2569 PSPTO2570     FALSE 0.053 171.000 0.000 1.000 N NA
 335559 335560 PSPTO2570 PSPTO2571     TRUE 0.996 -3.000 0.048 0.005 Y NA
 335560 335561 PSPTO2571 PSPTO2572     TRUE 0.997 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 335561 335562 PSPTO2572 PSPTO2573     TRUE 0.999 -3.000 0.450 0.002 Y NA
 335562 335563 PSPTO2573 PSPTO2574     TRUE 0.989 17.000 0.528 1.000 Y NA
 335563 335564 PSPTO2574 PSPTO2575     TRUE 0.998 9.000 0.694 0.067 Y NA
 335564 335565 PSPTO2575 PSPTO2576     TRUE 0.970 103.000 0.697 0.067 Y NA
 335566 335567 PSPTO2577 PSPTO2578     FALSE 0.050 185.000 0.000 1.000   NA
 335567 335568 PSPTO2578 PSPTO2579     TRUE 0.819 12.000 0.026 1.000   NA
 335568 335569 PSPTO2579 PSPTO2580     FALSE 0.169 52.000 0.000 NA   NA
 10692059 335571 PSPTO_2582 PSPTO2583     FALSE 0.059 161.000 0.000 NA   NA
 335571 335572 PSPTO2583 PSPTO2584     TRUE 0.999 -3.000 0.786 1.000 Y NA
 335572 335573 PSPTO2584 PSPTO2585     TRUE 0.996 16.000 0.901 1.000 Y NA
 335573 335574 PSPTO2585 PSPTO2586   amt-2 FALSE 0.004 534.000 0.014 1.000 N NA
 335574 335575 PSPTO2586 PSPTO2587 amt-2   FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 335576 335577 PSPTO2588 PSPTO2589     FALSE 0.026 209.000 0.000 NA   NA
 335578 335579 PSPTO2590 PSPTO2591     FALSE 0.006 323.000 0.000 1.000 N NA
 335580 335581 PSPTO2592 PSPTO2593     TRUE 0.959 34.000 0.706 1.000 N NA
 335583 335584 PSPTO2595 PSPTO2596 pchA pchB TRUE 0.961 -3.000 0.030 1.000 N NA
 335584 335585 PSPTO2596 PSPTO2597 pchB irp5 FALSE 0.471 16.000 0.000 1.000 N NA
 335585 335586 PSPTO2597 PSPTO2598 irp5 irp4 TRUE 0.903 13.000 0.000 1.000 Y NA
 335586 335587 PSPTO2598 PSPTO2599 irp4 irp3 TRUE 0.987 -28.000 0.406 1.000 Y NA
 335587 335588 PSPTO2599 PSPTO2600 irp3 irp1 TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 335588 335589 PSPTO2600 PSPTO2601 irp1   TRUE 0.544 -13.000 0.000 NA N NA
 335589 335590 PSPTO2601 PSPTO2602     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA N NA
 335590 335591 PSPTO2602 PSPTO2603     FALSE 0.163 61.000 0.000 1.000 N NA
 335591 335592 PSPTO2603 PSPTO2604     TRUE 1.000 -3.000 0.750 0.004 Y NA
 335592 335593 PSPTO2604 PSPTO2605     FALSE 0.197 155.000 0.000 0.081 N NA
 335596 335597 PSPTO2608 PSPTO2609     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 335598 335599 PSPTO2610 PSPTO2611     FALSE 0.163 76.000 0.000 1.000   NA
 335599 335600 PSPTO2611 PSPTO2612     FALSE 0.007 328.000 0.000 1.000   NA
 335600 335601 PSPTO2612 PSPTO2613     FALSE 0.121 83.000 0.000 NA   NA
 335612 10692061 PSPTO2624 PSPTO_2625     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 10692061 335613 PSPTO_2625 PSPTO2626     FALSE 0.135 72.000 0.000 NA   NA
 335614 335615 PSPTO2627 PSPTO2628     TRUE 0.961 44.000 0.350 0.067 Y NA
 335615 335616 PSPTO2628 PSPTO2629     TRUE 0.999 -10.000 0.800 0.011 Y NA
 335616 335617 PSPTO2629 PSPTO2630     TRUE 0.997 -13.000 0.789 1.000 Y NA
 335617 335618 PSPTO2630 PSPTO2631     TRUE 0.938 28.000 0.474 NA   NA
 335618 335619 PSPTO2631 PSPTO2632     FALSE 0.264 198.000 0.167 NA   NA
 335619 335620 PSPTO2632 PSPTO2633     FALSE 0.027 212.000 0.000 1.000 N NA
 335620 335621 PSPTO2633 PSPTO2634     TRUE 0.999 -3.000 0.465 0.100 Y NA
 335621 335622 PSPTO2634 PSPTO2635     TRUE 0.991 12.000 0.400 1.000 Y NA
 335624 335625 PSPTO2637 PSPTO2638   abP TRUE 0.534 162.000 0.083 NA Y NA
 335625 335626 PSPTO2638 PSPTO2639 abP   TRUE 0.982 56.000 0.917 NA Y NA
 335626 335627 PSPTO2639 PSPTO2640   araH TRUE 0.990 17.000 0.451 0.081 Y NA
 335627 335628 PSPTO2640 PSPTO2641 araH   TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 335629 335630 PSPTO2642 PSPTO2643     TRUE 0.982 72.000 1.000 1.000 Y NA
 335630 335631 PSPTO2643 PSPTO2644     FALSE 0.139 51.000 0.000 NA N NA
 335631 335632 PSPTO2644 PSPTO2645     FALSE 0.126 60.000 0.000 NA N NA
 335633 335634 PSPTO2646 PSPTO2647     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 335634 335635 PSPTO2647 PSPTO2648     TRUE 0.998 0.000 0.714 NA   NA
 335635 335636 PSPTO2648 PSPTO2649     TRUE 0.699 9.000 0.000 NA   NA
 335636 335637 PSPTO2649 PSPTO2650     FALSE 0.134 73.000 0.000 NA   NA
 335638 335639 PSPTO2651 PSPTO2652     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.095 Y NA
 335639 10692062 PSPTO2652 PSPTO_2653     FALSE 0.004 362.000 0.000 NA   NA
 335640 335641 PSPTO2654 PSPTO2655     TRUE 0.998 0.000 0.222 0.040 Y NA
 335641 335642 PSPTO2655 PSPTO2656     TRUE 0.678 187.000 0.133 0.002 Y NA
 335642 335643 PSPTO2656 PSPTO2657     TRUE 0.791 3.000 0.000 NA N NA
 335650 335651 PSPTO2664 PSPTO2665     TRUE 1.000 -3.000 0.815 0.067 Y NA
 335651 335652 PSPTO2665 PSPTO2666     TRUE 0.999 7.000 0.852 0.067 Y NA
 335652 335653 PSPTO2666 PSPTO2667     TRUE 0.920 87.000 0.304 0.067 Y NA
 335653 335654 PSPTO2667 PSPTO2668   ribBA-2 FALSE 0.009 290.000 0.000 1.000 N NA
 335656 335657 PSPTO2670 PSPTO2671     TRUE 0.954 2.000 0.039 1.000 N NA
 335657 335658 PSPTO2671 PSPTO2672     FALSE 0.443 191.000 0.286 1.000   NA
 335658 335659 PSPTO2672 PSPTO2673     TRUE 0.955 14.000 0.143 0.041   NA
 335659 335660 PSPTO2673 PSPTO2674     TRUE 0.989 -3.000 0.164 1.000   NA
 335660 335661 PSPTO2674 PSPTO2675     TRUE 0.942 35.000 0.582 NA   NA
 335662 335663 PSPTO2676 PSPTO2677 fdhA-2   FALSE 0.342 95.000 0.000 0.041 N NA
 335663 335664 PSPTO2677 PSPTO2678   hopPtoP FALSE 0.030 202.000 0.000 NA   NA
 335664 335665 PSPTO2678 PSPTO2679 hopPtoP   TRUE 0.516 -25.000 0.000 NA   NA
 335665 335666 PSPTO2679 PSPTO2680   gabD-3 FALSE 0.005 340.000 0.000 NA   NA
 335669 335670 PSPTO2683 PSPTO2684     TRUE 0.608 173.000 0.400 NA   NA
 335673 335674 PSPTO2687 PSPTO2688     FALSE 0.012 264.000 0.000 NA   NA
 335676 335677 PSPTO2690 PSPTO2691     TRUE 0.650 35.000 0.083 NA   NA
 401647 401648 PSPTO_t34 PSPTO_t35 tRNA-Val-1 tRNA-Val-2 FALSE 0.056 166.000 0.000 NA   NA
 335681 335682 PSPTO2695 PSPTO2696     FALSE 0.096 112.000 0.000 1.000 N NA
 335682 335683 PSPTO2696 PSPTO2697     FALSE 0.008 324.000 0.000 1.000   NA
 335684 335685 PSPTO2698 PSPTO2699     FALSE 0.071 145.000 0.000 NA   NA
 335685 335686 PSPTO2699 PSPTO2700     FALSE 0.043 180.000 0.000 NA   NA
 335687 335688 PSPTO2701 PSPTO2702   xylB TRUE 0.913 25.000 0.118 1.000 Y NA
 335688 335689 PSPTO2702 PSPTO2703 xylB uxuB TRUE 0.976 11.000 0.118 1.000 Y NA
 335689 10692063 PSPTO2703 PSPTO_2704 uxuB   FALSE 0.367 19.000 0.000 NA   NA
 10692063 335690 PSPTO_2704 PSPTO2705     FALSE 0.240 32.000 0.000 NA   NA
 335690 335691 PSPTO2705 PSPTO2706     TRUE 0.999 11.000 0.918 0.067 Y NA
 335691 335692 PSPTO2706 PSPTO2707     TRUE 0.778 88.000 0.056 0.067 Y NA
 335692 335693 PSPTO2707 PSPTO2708   mltR FALSE 0.018 241.000 0.000 1.000 N NA
 335695 335696 PSPTO2710 PSPTO2711     FALSE 0.186 107.000 0.022 NA N NA
 335697 335698 PSPTO2712 PSPTO2713     TRUE 0.930 29.000 0.208 1.000 Y NA
 335698 335699 PSPTO2713 PSPTO2714     TRUE 0.996 -3.000 0.416 1.000   NA
 335699 335700 PSPTO2714 PSPTO2715     TRUE 0.990 -6.000 0.353 1.000   NA
 335700 335701 PSPTO2715 PSPTO2716     TRUE 0.952 92.000 0.462 0.020 Y NA
 335702 335703 PSPTO2717 PSPTO2718     TRUE 0.997 -3.000 0.174 0.099 Y NA
 335704 335705 PSPTO2719 PSPTO2720     FALSE 0.353 53.000 0.025 1.000 N NA
 335706 335707 PSPTO2721 PSPTO2722     FALSE 0.121 106.000 0.000 1.000   NA
 335707 335708 PSPTO2722 PSPTO2723     FALSE 0.347 101.000 0.000 0.041   NA
 335708 335709 PSPTO2723 PSPTO2724     TRUE 0.769 28.000 0.115 1.000   NA
 335709 335710 PSPTO2724 PSPTO2725     FALSE 0.038 203.000 0.000 1.000   NA
 335710 335711 PSPTO2725 PSPTO2726     TRUE 0.823 56.000 0.344 NA N NA
 335711 335712 PSPTO2726 PSPTO2727     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 335714 335715 PSPTO2729 PSPTO2730   cysI TRUE 0.933 -16.000 0.165 NA   NA
 335718 335719 PSPTO2733 PSPTO2734 cti   FALSE 0.212 176.000 0.059 1.000   NA
 335719 335720 PSPTO2734 PSPTO2735   yhgI FALSE 0.303 71.000 0.020 1.000   NA
 335721 335722 PSPTO2736 PSPTO2737     TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.062 Y NA
 335722 335723 PSPTO2737 PSPTO2738     TRUE 0.970 15.000 0.189 1.000 Y NA
 335723 335724 PSPTO2738 PSPTO2739     TRUE 0.984 14.000 0.316 1.000 Y NA
 335725 335726 PSPTO2740 PSPTO2741     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 335727 335728 PSPTO2742 PSPTO2743 mvaB   TRUE 0.535 31.000 0.035 1.000 N NA
 335728 335729 PSPTO2743 PSPTO2744     TRUE 0.552 168.000 0.033 0.066 Y NA
 335731 335732 PSPTO2746 PSPTO2747   xthA FALSE 0.325 120.000 0.056 1.000 N NA
 335733 335734 PSPTO2748 PSPTO2749     FALSE 0.401 60.000 0.033 1.000   NA
 335734 335735 PSPTO2749 PSPTO2750     TRUE 0.998 -3.000 0.575 NA   NA
 335735 335736 PSPTO2750 PSPTO2751     FALSE 0.096 106.000 0.000 NA   NA
 335736 335737 PSPTO2751 PSPTO2752   tpx FALSE 0.117 91.000 0.000 1.000 N NA
 335737 335738 PSPTO2752 PSPTO2753 tpx   FALSE 0.145 119.000 0.007 1.000 N NA
 335738 10692064 PSPTO2753 PSPTO_2754     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 10692064 335739 PSPTO_2754 PSPTO2755     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335739 335740 PSPTO2755 PSPTO2756     TRUE 0.997 -3.000 0.556 NA N NA
 335740 335741 PSPTO2756 PSPTO2757     TRUE 0.517 168.000 0.267 1.000 N NA
 335741 335742 PSPTO2757 PSPTO2758     TRUE 0.637 113.000 0.250 1.000 N NA
 335744 335745 PSPTO2760 PSPTO2761     TRUE 0.983 20.000 0.544 0.004   NA
 335745 335746 PSPTO2761 PSPTO2762   glgB TRUE 0.997 -3.000 0.115 0.004 Y NA
 335747 335748 PSPTO2763 PSPTO2764     FALSE 0.057 168.000 0.000 1.000 N NA
 335750 335751 PSPTO2766 PSPTO2767     FALSE 0.003 396.000 0.000 NA   NA
 335751 335752 PSPTO2767 PSPTO2768     FALSE 0.003 446.000 0.000 NA   NA
 335755 335756 PSPTO2771 PSPTO2772     FALSE 0.114 113.000 0.000 1.000   NA
 335756 335757 PSPTO2772 PSPTO2773     FALSE 0.090 116.000 0.000 NA   NA
 335757 335758 PSPTO2773 PSPTO2774     TRUE 0.558 13.000 0.000 NA   NA
 335758 335759 PSPTO2774 PSPTO2775     FALSE 0.006 327.000 0.000 NA   NA
 335759 335760 PSPTO2775 PSPTO2776     TRUE 0.981 64.000 0.706 0.067 Y NA
 335760 335761 PSPTO2776 PSPTO2777     TRUE 0.991 10.000 0.148 0.011 Y NA
 335761 335762 PSPTO2777 PSPTO2778     TRUE 0.995 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 335762 335763 PSPTO2778 PSPTO2779     TRUE 0.817 37.000 0.250 NA N NA
 335763 335764 PSPTO2779 PSPTO2780     FALSE 0.380 155.000 0.150 NA N NA
 335764 335765 PSPTO2780 PSPTO2781     TRUE 0.707 18.000 0.047 NA N NA
 335765 335766 PSPTO2781 PSPTO2782   kdgK TRUE 0.574 29.000 0.047 NA N NA
 335766 335767 PSPTO2782 PSPTO2783 kdgK   FALSE 0.005 376.000 0.000 1.000   NA
 335770 335771 PSPTO2786 PSPTO2787     TRUE 0.966 19.000 0.273 1.000 Y NA
 335771 335772 PSPTO2787 PSPTO2788     TRUE 1.000 -3.000 0.795 0.067 Y NA
 335773 335774 PSPTO2789 PSPTO2790     FALSE 0.240 32.000 0.000 NA   NA
 335776 335777 PSPTO2792 PSPTO2793 lexA-1   TRUE 0.995 0.000 0.381 NA   NA
 335777 335778 PSPTO2793 PSPTO2794     TRUE 0.984 -40.000 0.667 NA   NA
 335778 335779 PSPTO2794 PSPTO2795     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 335779 335780 PSPTO2795 PSPTO2796     FALSE 0.137 71.000 0.000 NA   NA
 335780 335781 PSPTO2796 PSPTO2797     FALSE 0.001 2596.000 0.000 NA   NA
 335783 335784 PSPTO2799 PSPTO2800     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335785 335786 PSPTO2801 PSPTO2802   proP TRUE 0.837 3.000 0.000 1.000 N NA
 335786 335787 PSPTO2802 PSPTO2803 proP   FALSE 0.037 191.000 0.000 1.000 N NA
 335787 335788 PSPTO2803 PSPTO2804     TRUE 0.861 25.000 0.000 0.065 Y NA
 335791 335792 PSPTO2807 PSPTO2808     FALSE 0.100 108.000 0.000 1.000 N NA
 335792 335793 PSPTO2808 PSPTO2809     FALSE 0.161 347.000 0.471 1.000 N NA
 335793 335794 PSPTO2809 PSPTO2810     TRUE 0.996 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 335794 335795 PSPTO2810 PSPTO2811     TRUE 1.000 -3.000 0.818 0.067 Y NA
 335795 335796 PSPTO2811 PSPTO2812     TRUE 0.999 -3.000 0.636 1.000 Y NA
 335796 10692065 PSPTO2812 PSPTO_2813     TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 10692065 335797 PSPTO_2813 PSPTO2814     FALSE 0.167 53.000 0.000 NA   NA
 335797 335798 PSPTO2814 PSPTO2815     FALSE 0.135 72.000 0.000 NA   NA
 335798 335799 PSPTO2815 PSPTO2816     TRUE 0.994 0.000 0.333 NA   NA
 335799 335800 PSPTO2816 PSPTO2817     FALSE 0.151 63.000 0.000 NA   NA
 335802 335803 PSPTO2819 PSPTO2820     TRUE 0.963 -6.000 0.111 NA   NA
 335804 335805 PSPTO2821 PSPTO2822     FALSE 0.308 25.000 0.000 NA   NA
 335806 335807 PSPTO2823 PSPTO2824     FALSE 0.277 129.000 0.045 NA   NA
 335807 335808 PSPTO2824 PSPTO2825     TRUE 0.905 -15.000 0.091 NA   NA
 335812 335813 PSPTO2829 PSPTO2830     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 335813 335814 PSPTO2830 PSPTO2831   macA TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000 N NA
 335814 335815 PSPTO2831 PSPTO2832 macA macB TRUE 0.998 3.000 0.789 1.000 N NA
 335819 10692066 PSPTO2836 PSPTO_2837     FALSE 0.033 196.000 0.000 NA   NA
 335821 335822 PSPTO2839 PSPTO2840     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 335822 335823 PSPTO2840 PSPTO2841     FALSE 0.007 747.000 0.000 NA Y NA
 335823 335824 PSPTO2841 PSPTO2842     TRUE 0.982 21.000 0.500 1.000 Y NA
 335824 335825 PSPTO2842 PSPTO2843     FALSE 0.015 246.000 0.000 NA   NA
 335825 335826 PSPTO2843 PSPTO2844     FALSE 0.183 315.000 0.429 NA   NA
 335826 335827 PSPTO2844 PSPTO2845     FALSE 0.455 -63.000 0.000 NA   NA
 335827 335828 PSPTO2845 PSPTO2846     FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 335828 335829 PSPTO2846 PSPTO2847     TRUE 0.949 11.000 0.167 NA   NA
 10692067 335830 PSPTO_2848 PSPTO2849     FALSE 0.004 371.000 0.000 NA   NA
 335830 335831 PSPTO2849 PSPTO2850     FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 335831 335832 PSPTO2850 PSPTO2851     TRUE 0.997 0.000 0.500 NA   NA
 335833 335834 PSPTO2852 PSPTO2853     FALSE 0.001 746.000 0.000 NA   NA
 335834 335835 PSPTO2853 PSPTO2855     FALSE 0.001 1310.000 0.000 1.000   NA
 335837 335838 PSPTO2857 PSPTO2858     FALSE 0.002 482.000 0.000 NA   NA
 335838 335839 PSPTO2858 PSPTO2859     FALSE 0.015 247.000 0.000 NA   NA
 335839 335840 PSPTO2859 PSPTO2860     FALSE 0.451 -76.000 0.000 NA   NA
 335840 335841 PSPTO2860 PSPTO2861     TRUE 0.686 -12.000 0.000 1.000   NA
 335841 335842 PSPTO2861 PSPTO2862     TRUE 1.000 -3.000 0.705 0.039 Y NA
 335842 335843 PSPTO2862 PSPTO2863     TRUE 0.999 6.000 0.917 0.002 Y NA
 335843 335844 PSPTO2863 PSPTO2864     FALSE 0.214 40.000 0.000 1.000 N NA
 335845 335846 PSPTO2865 PSPTO2866     TRUE 0.988 -3.000 0.167 NA   NA
 335849 335850 PSPTO2869 PSPTO2870     FALSE 0.128 78.000 0.000 NA   NA
 335850 335851 PSPTO2870 PSPTO2871     TRUE 0.591 12.000 0.000 NA   NA
 335851 335852 PSPTO2871 PSPTO2872   hopPtoL TRUE 0.984 -3.000 0.111 NA   NA
 335852 335853 PSPTO2872 PSPTO2873 hopPtoL   TRUE 0.969 4.000 0.111 NA   NA
 335853 335854 PSPTO2873 PSPTO2874     TRUE 0.860 27.000 0.222 NA   NA
 335854 335855 PSPTO2874 PSPTO2875     TRUE 0.997 2.000 0.560 1.000   NA
 335855 335856 PSPTO2875 PSPTO2876     TRUE 0.996 -16.000 0.710 NA Y NA
 335856 335857 PSPTO2876 PSPTO2877     TRUE 0.866 29.000 0.258 NA   NA
 335857 335858 PSPTO2877 PSPTO2878     TRUE 0.940 33.000 0.556 NA   NA
 335858 335859 PSPTO2878 PSPTO2879     TRUE 0.995 8.000 0.714 NA   NA
 335859 335860 PSPTO2879 PSPTO2880     TRUE 0.867 56.000 0.429 NA   NA
 335861 10692068 PSPTO2881 PSPTO_2882     FALSE 0.191 44.000 0.000 NA   NA
 10692068 335862 PSPTO_2882 PSPTO2883     FALSE 0.007 311.000 0.000 NA   NA
 335862 335863 PSPTO2883 PSPTO2885     FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 335863 10692069 PSPTO2885 PSPTO_2886     FALSE 0.001 863.000 0.000 NA   NA
 335864 335865 PSPTO2887 PSPTO2888     FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 335865 335866 PSPTO2888 PSPTO2889     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 335866 335867 PSPTO2889 PSPTO2890     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335867 335868 PSPTO2890 PSPTO2891     TRUE 0.921 -22.000 0.161 NA   NA
 335868 335869 PSPTO2891 PSPTO2892     FALSE 0.111 91.000 0.000 NA   NA
 335869 335870 PSPTO2892 PSPTO2893     FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 335870 335871 PSPTO2893 PSPTO2894     FALSE 0.014 251.000 0.000 NA   NA
 335872 335873 PSPTO2895 PSPTO2896     FALSE 0.006 321.000 0.000 NA   NA
 335873 335874 PSPTO2896 PSPTO2897     FALSE 0.093 142.000 0.000 1.000   NA
 335874 335875 PSPTO2897 PSPTO2898   glf TRUE 0.950 3.000 0.036 1.000   NA
 335875 335876 PSPTO2898 PSPTO2899 glf   TRUE 0.911 -12.000 0.065 1.000   NA
 335878 335879 PSPTO2901 PSPTO2902     FALSE 0.114 113.000 0.000 1.000   NA
 335880 335881 PSPTO2903 PSPTO2904   vanA FALSE 0.071 148.000 0.000 1.000 N NA
 335881 335882 PSPTO2904 PSPTO2905 vanA vanB TRUE 0.735 70.000 0.128 0.039 N NA
 335883 335884 PSPTO2906 PSPTO2907 vanR   FALSE 0.138 76.000 0.000 1.000 N NA
 335884 335885 PSPTO2907 PSPTO2908     FALSE 0.007 304.000 0.000 NA   NA
 335885 335886 PSPTO2908 PSPTO2909     FALSE 0.075 140.000 0.000 NA   NA
 335887 335888 PSPTO2910 PSPTO2911     TRUE 0.925 20.000 0.308 1.000 N NA
 335889 335890 PSPTO2912 PSPTO2913     TRUE 0.964 64.000 0.632 1.000 Y NA
 335890 335891 PSPTO2913 PSPTO2914     TRUE 0.997 11.000 0.714 1.000 Y NA
 335891 335892 PSPTO2914 PSPTO2915     TRUE 0.999 7.000 0.810 0.011 Y NA
 335892 335893 PSPTO2915 PSPTO2916     TRUE 0.873 122.000 0.640 1.000   NA
 335893 335894 PSPTO2916 PSPTO2917     TRUE 0.507 131.000 0.160 1.000   NA
 335894 335895 PSPTO2917 PSPTO2918     TRUE 0.983 5.000 0.250 NA   NA
 335895 335896 PSPTO2918 PSPTO2919     TRUE 0.988 0.000 0.179 NA N NA
 335896 335897 PSPTO2919 PSPTO2920     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA Y NA
 335897 335898 PSPTO2920 PSPTO2921   accC-1 TRUE 0.963 -3.000 0.033 1.000 N NA
 335898 335899 PSPTO2921 PSPTO2922 accC-1   TRUE 0.911 41.000 0.066 0.001 Y NA
 335899 335900 PSPTO2922 PSPTO2923     FALSE 0.095 120.000 0.000 1.000 N NA
 335901 335902 PSPTO2924 PSPTO2925   aspB FALSE 0.029 204.000 0.000 NA   NA
 335902 335903 PSPTO2925 PSPTO2926 aspB   TRUE 0.919 11.000 0.083 1.000 N NA
 335903 335904 PSPTO2926 PSPTO2927   oprE TRUE 0.681 73.000 0.083 0.059   NA
 335904 335905 PSPTO2927 PSPTO2928 oprE   FALSE 0.066 169.000 0.000 1.000   NA
 335905 335906 PSPTO2928 PSPTO2929     TRUE 0.994 -10.000 0.750 NA   NA
 335907 335908 PSPTO2930 PSPTO2931     FALSE 0.289 27.000 0.000 NA   NA
 335908 335909 PSPTO2931 PSPTO2932     FALSE 0.013 241.000 0.000 NA N NA
 335911 335912 PSPTO2934 PSPTO2935     TRUE 1.000 -3.000 0.886 0.004 Y NA
 335912 335913 PSPTO2935 PSPTO2936     FALSE 0.313 89.000 0.032 1.000   NA
 335915 335916 PSPTO2938 PSPTO2939     FALSE 0.457 16.000 0.000 NA   NA
 335916 335917 PSPTO2939 PSPTO2940     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 335917 335918 PSPTO2940 PSPTO2941   fcs TRUE 0.997 -3.000 0.231 NA Y NA
 335918 335919 PSPTO2941 PSPTO2942 fcs   FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 335919 335920 PSPTO2942 PSPTO2943   vdh FALSE 0.074 141.000 0.000 NA   NA
 335920 335921 PSPTO2943 PSPTO2944 vdh   TRUE 0.688 106.000 0.172 0.061 N NA
 10692070 335925 PSPTO_2948 PSPTO2949     FALSE 0.115 88.000 0.000 NA   NA
 335925 335926 PSPTO2949 PSPTO2950   xylcC TRUE 0.829 86.000 0.286 0.041 N NA
 335928 335929 PSPTO2952 PSPTO2953     FALSE 0.001 751.000 0.000 1.000   NA
 335929 335930 PSPTO2953 PSPTO2954     FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 335932 335933 PSPTO2956 PSPTO2957 estB medH FALSE 0.290 28.000 0.000 1.000 N NA
 335933 335934 PSPTO2957 PSPTO2958 medH rhtC FALSE 0.225 37.000 0.000 1.000 N NA
 335934 335935 PSPTO2958 PSPTO2959 rhtC   FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 335935 335936 PSPTO2959 PSPTO2960     TRUE 0.993 0.000 0.286 NA   NA
 335936 335937 PSPTO2960 PSPTO2961     TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000 N NA
 335937 335938 PSPTO2961 PSPTO2962     TRUE 0.558 55.000 0.083 NA   NA
 335938 335939 PSPTO2962 PSPTO2963     TRUE 0.874 18.000 0.167 NA   NA
 335939 335940 PSPTO2963 PSPTO2964     FALSE 0.296 39.000 0.003 1.000 N NA
 335940 335941 PSPTO2964 PSPTO2965     TRUE 0.805 8.000 0.006 NA   NA
 335941 335942 PSPTO2965 PSPTO2966     FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 335944 335945 PSPTO2968 PSPTO2969     TRUE 0.865 63.000 0.444 1.000 N NA
 335946 335947 PSPTO2970 PSPTO2971     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 335947 335948 PSPTO2971 PSPTO2972     FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 335948 335949 PSPTO2972 PSPTO2973   modA FALSE 0.171 156.000 0.026 1.000   NA
 335949 335950 PSPTO2973 PSPTO2974 modA modB TRUE 1.000 1.000 0.660 0.001 Y NA
 335950 335951 PSPTO2974 PSPTO2975 modB modC TRUE 0.998 4.000 0.308 0.001 Y NA
 335951 335952 PSPTO2975 PSPTO2976 modC   FALSE 0.241 89.000 0.021 1.000 N NA
 335952 401649 PSPTO2976 PSPTO_t36   tRNA-Leu-2 FALSE 0.054 168.000 0.000 NA   NA
 335953 335954 PSPTO2977 PSPTO2978     FALSE 0.001 948.000 0.000 NA   NA
 335954 335955 PSPTO2978 PSPTO2979     FALSE 0.055 167.000 0.000 NA   NA
 335955 335956 PSPTO2979 PSPTO2980     TRUE 0.996 2.000 0.500 NA   NA
 335956 335957 PSPTO2980 PSPTO2981     FALSE 0.026 226.000 0.000 1.000   NA
 335957 401676 PSPTO2981 PSPTO_t37   tRNA-Cys-1 FALSE 0.062 156.000 0.000 NA   NA
 401676 335958 PSPTO_t37 PSPTO2982 tRNA-Cys-1   FALSE 0.029 203.000 0.000 NA   NA
 335960 335961 PSPTO2984 PSPTO2985     FALSE 0.003 461.000 0.000 1.000 N NA
 335961 335962 PSPTO2985 PSPTO2986     FALSE 0.095 120.000 0.000 1.000 N NA
 335962 335963 PSPTO2986 PSPTO2987     TRUE 0.990 5.000 0.167 1.000 Y NA
 335963 335964 PSPTO2987 PSPTO2988     TRUE 0.926 51.000 0.333 1.000 Y NA
 335964 335965 PSPTO2988 PSPTO2989     TRUE 0.995 24.000 0.857 0.066 Y NA
 335965 335966 PSPTO2989 PSPTO2990     TRUE 0.999 4.000 0.750 1.000 Y NA
 335966 335967 PSPTO2990 PSPTO2991     TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 N NA
 335969 335970 PSPTO2993 PSPTO2994     TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.066 Y NA
 335970 335971 PSPTO2994 PSPTO2995     TRUE 0.997 -13.000 0.778 1.000 Y NA
 335971 335972 PSPTO2995 PSPTO2996     TRUE 0.836 17.000 0.000 NA Y NA
 335972 335973 PSPTO2996 PSPTO2997     FALSE 0.016 225.000 0.000 NA N NA
 335974 335975 PSPTO2998 PSPTO2999     FALSE 0.470 -39.000 0.000 NA   NA
 335975 335976 PSPTO2999 PSPTO3000     FALSE 0.006 328.000 0.000 NA   NA
 335978 335979 PSPTO3002 PSPTO3003 xylA xylF FALSE 0.439 141.000 0.020 NA Y NA
 335979 335980 PSPTO3003 PSPTO3004 xylF xylG TRUE 0.918 109.000 0.518 NA Y NA
 335980 335981 PSPTO3004 PSPTO3005 xylG xylH TRUE 0.998 1.000 0.469 1.000 Y NA
 335982 335983 PSPTO3006 PSPTO3007     TRUE 0.495 42.000 0.050 NA N NA
 335983 335984 PSPTO3007 PSPTO3008     TRUE 0.994 23.000 1.000 1.000 Y NA
 335984 335985 PSPTO3008 PSPTO3009     TRUE 0.974 29.000 0.500 1.000 Y NA
 335985 335986 PSPTO3009 PSPTO3010     TRUE 0.981 -7.000 0.073 1.000 Y NA
 335986 335987 PSPTO3010 PSPTO3011     TRUE 0.480 44.000 0.000 0.066 N NA
 335987 10692071 PSPTO3011 PSPTO_3012     FALSE 0.002 519.000 0.000 NA   NA
 335988 335989 PSPTO3013 PSPTO3014     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 335992 335993 PSPTO3018 PSPTO3019     TRUE 0.950 20.000 0.412 1.000   NA
 401675 335996 PSPTO_t38 PSPTO3022 tRNA-Gly-4 pgsA FALSE 0.144 67.000 0.000 NA   NA
 335996 335997 PSPTO3022 PSPTO3023 pgsA uvrC TRUE 0.864 27.000 0.227 1.000 N NA
 335997 335998 PSPTO3023 PSPTO3024 uvrC gacA TRUE 0.985 3.000 0.086 0.029 N NA
 335998 335999 PSPTO3024 PSPTO3025 gacA   FALSE 0.344 168.000 0.036 0.029   NA
 336000 336001 PSPTO3026 PSPTO3027   aroF-2 FALSE 0.002 702.000 0.000 1.000   NA
 336001 336002 PSPTO3027 PSPTO3028 aroF-2 ppiC-1 FALSE 0.316 81.000 0.028 1.000   NA
 336002 336003 PSPTO3028 PSPTO3029 ppiC-1   FALSE 0.097 228.000 0.056 1.000   NA
 336003 336004 PSPTO3029 PSPTO3030     TRUE 0.999 1.000 0.800 0.066   NA
 336004 336005 PSPTO3030 PSPTO3031     TRUE 0.999 0.000 0.800 0.066   NA
 336005 336006 PSPTO3031 PSPTO3032     TRUE 0.998 2.000 0.800 1.000   NA
 336009 336010 PSPTO3035 PSPTO3036 pgm   FALSE 0.156 101.000 0.005 1.000 N NA
 336010 336011 PSPTO3036 PSPTO3037     FALSE 0.348 148.000 0.000 1.000 Y NA
 336011 336012 PSPTO3037 PSPTO3038     TRUE 0.997 3.000 0.600 NA   NA
 336012 336013 PSPTO3038 PSPTO3039     FALSE 0.002 578.000 0.000 NA   NA
 336015 10692073 PSPTO3041 PSPTO_3042     FALSE 0.019 231.000 0.000 NA   NA
 10692073 336016 PSPTO_3042 PSPTO3043     FALSE 0.127 79.000 0.000 NA   NA
 336016 336017 PSPTO3043 PSPTO3044     TRUE 0.620 13.000 0.000 1.000   NA
 336017 336018 PSPTO3044 PSPTO3045     TRUE 0.907 9.000 0.000 0.067   NA
 336018 336019 PSPTO3045 PSPTO3046     FALSE 0.157 183.000 0.000 0.064   NA
 336020 336021 PSPTO3047 PSPTO3048     TRUE 0.996 -3.000 0.406 1.000   NA
 336021 336022 PSPTO3048 PSPTO3049     TRUE 0.650 99.000 0.062 NA Y NA
 336024 336025 PSPTO3051 PSPTO3052     TRUE 0.923 24.000 0.333 1.000   NA
 336025 336026 PSPTO3052 PSPTO3053     FALSE 0.447 62.000 0.000 0.059   NA
 336026 336027 PSPTO3053 PSPTO3054     FALSE 0.318 29.000 0.000 1.000   NA
 336028 336029 PSPTO3055 PSPTO3056     TRUE 0.569 -16.000 0.000 NA   NA
 336029 336030 PSPTO3056 PSPTO3057     FALSE 0.307 30.000 0.000 1.000   NA
 336030 336031 PSPTO3057 PSPTO3058     FALSE 0.161 77.000 0.000 1.000   NA
 336031 336032 PSPTO3058 PSPTO3059     TRUE 0.967 110.000 0.695 0.065 Y NA
 336032 336033 PSPTO3059 PSPTO3060     TRUE 0.970 50.000 0.630 1.000 Y NA
 336034 336035 PSPTO3061 PSPTO3062     FALSE 0.003 403.000 0.000 1.000 N NA
 336035 336036 PSPTO3062 PSPTO3063     FALSE 0.025 219.000 0.000 1.000 N NA
 336036 336037 PSPTO3063 PSPTO3064     TRUE 0.997 -7.000 0.690 0.061 N NA
 336037 336038 PSPTO3064 PSPTO3065     TRUE 0.995 -3.000 0.345 1.000 N NA
 336038 336039 PSPTO3065 PSPTO3066     TRUE 0.551 -19.000 0.000 NA   NA
 336039 336040 PSPTO3066 PSPTO3067     FALSE 0.023 219.000 0.000 NA   NA
 336042 336043 PSPTO3069 PSPTO3070     FALSE 0.174 69.000 0.000 1.000   NA
 336043 336044 PSPTO3070 PSPTO3071     FALSE 0.165 75.000 0.000 1.000   NA
 336048 336049 PSPTO3075 PSPTO3076     FALSE 0.087 134.000 0.000 1.000 N NA
 336049 336050 PSPTO3076 PSPTO3077     TRUE 0.508 59.000 0.064 1.000 N NA
 336050 336051 PSPTO3077 PSPTO3078     TRUE 0.546 55.000 0.077 NA   NA
 336051 336052 PSPTO3078 PSPTO3079     TRUE 0.533 60.000 0.077 NA   NA
 336055 336056 PSPTO3082 PSPTO3083     TRUE 0.991 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 336056 336057 PSPTO3083 PSPTO3084     TRUE 0.990 -3.000 0.034 1.000 Y NA
 336057 336058 PSPTO3084 PSPTO3085     TRUE 0.998 -19.000 0.841 0.011 Y NA
 336061 336062 PSPTO3088 PSPTO3089   nikB TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.065 Y NA
 336062 336063 PSPTO3089 PSPTO3090 nikB   TRUE 0.999 5.000 0.857 0.065 Y NA
 336063 336064 PSPTO3090 PSPTO3091     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000   NA
 336064 336065 PSPTO3091 PSPTO3092     FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 336068 10692077 PSPTO3096 PSPTO_3097     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 336070 336071 PSPTO3099 PSPTO3100 mexE mexF TRUE 0.994 13.000 0.923 1.000 N NA
 336071 336072 PSPTO3100 PSPTO3101 mexF   TRUE 0.999 0.000 0.600 0.065 N NA
 336072 336073 PSPTO3101 PSPTO3102     TRUE 0.730 83.000 0.080 1.000 Y NA
 336073 336074 PSPTO3102 PSPTO3103     FALSE 0.003 488.000 0.000 1.000   NA
 336074 336075 PSPTO3103 PSPTO3104     TRUE 0.582 -15.000 0.000 NA   NA
 336078 336079 PSPTO3107 PSPTO3108 ahpF ahpC TRUE 0.922 125.000 0.551 1.000 Y NA
 336079 336080 PSPTO3108 PSPTO3109 ahpC   FALSE 0.169 111.000 0.012 1.000 N NA
 336082 336083 PSPTO3111 PSPTO3112   gor-1 FALSE 0.139 91.000 0.000 1.000   NA
 336083 336084 PSPTO3112 PSPTO3113 gor-1 galU FALSE 0.104 104.000 0.000 1.000 N NA
 336087 336088 PSPTO3116 PSPTO3117     TRUE 0.906 15.000 0.156 NA   NA
 336088 336089 PSPTO3117 PSPTO3118   alkB FALSE 0.281 58.000 0.015 NA   NA
 336090 336091 PSPTO3119 PSPTO3120     FALSE 0.206 53.000 0.000 1.000   NA
 336091 336092 PSPTO3120 PSPTO3121   zwf-2 TRUE 0.973 -7.000 0.182 1.000   NA
 336092 336093 PSPTO3121 PSPTO3122 zwf-2 gnd TRUE 0.993 0.000 0.073 1.000 Y NA
 336096 336097 PSPTO3125 PSPTO3126 glgA   TRUE 0.994 20.000 0.917 1.000 Y NA
 336097 336098 PSPTO3126 PSPTO3127   malQ TRUE 0.993 -10.000 0.204 0.004 Y NA
 336098 336099 PSPTO3127 PSPTO3128 malQ   TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.004 Y NA
 336099 336100 PSPTO3128 PSPTO3129     FALSE 0.392 18.000 0.000 NA   NA
 336100 336101 PSPTO3129 PSPTO3130   glgX FALSE 0.060 160.000 0.000 NA   NA
 336101 336102 PSPTO3130 PSPTO3131 glgX   TRUE 0.983 -3.000 0.085 1.000   NA
 336102 336103 PSPTO3131 PSPTO3132     FALSE 0.289 27.000 0.000 NA   NA
 336103 336104 PSPTO3132 PSPTO3133     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336104 336105 PSPTO3133 PSPTO3134     TRUE 0.969 -31.000 0.409 NA   NA
 336106 336107 PSPTO3135 PSPTO3136     FALSE 0.004 369.000 0.000 NA   NA
 336107 336108 PSPTO3136 PSPTO3137     FALSE 0.139 75.000 0.000 1.000 N NA
 336108 336109 PSPTO3137 PSPTO3138     FALSE 0.156 80.000 0.000 1.000   NA
 336111 336112 PSPTO3140 PSPTO3141     TRUE 0.958 -3.000 0.029 NA   NA
 336113 336114 PSPTO3142 PSPTO3143     TRUE 0.997 -3.000 0.242 NA Y NA
 336117 336118 PSPTO3146 PSPTO3147     FALSE 0.003 417.000 0.000 1.000 N NA
 336118 336119 PSPTO3147 PSPTO3148     TRUE 0.982 54.000 0.568 0.000 Y NA
 336119 336120 PSPTO3148 PSPTO3149     TRUE 0.993 0.000 0.070 1.000 Y NA
 336120 336121 PSPTO3149 PSPTO3150     TRUE 0.988 4.000 0.274 1.000   NA
 336121 10692078 PSPTO3150 PSPTO_5655     FALSE 0.090 116.000 0.000 NA   NA
 336122 336123 PSPTO3151 PSPTO3152     TRUE 0.976 21.000 0.684 NA   NA
 336123 10692079 PSPTO3152 PSPTO_3153     TRUE 0.477 -37.000 0.000 NA   NA
 10692079 336124 PSPTO_3153 PSPTO3154   cobM FALSE 0.233 33.000 0.000 NA   NA
 336126 10692080 PSPTO3156 PSPTO_5657     FALSE 0.106 96.000 0.000 NA   NA
 10692080 336127 PSPTO_5657 PSPTO3157     FALSE 0.050 171.000 0.000 NA   NA
 336127 10692081 PSPTO3157 PSPTO_3158     FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 336129 336130 PSPTO3160 PSPTO3161     FALSE 0.244 41.000 0.000 1.000   NA
 336131 336132 PSPTO3162 PSPTO3163     FALSE 0.030 202.000 0.000 NA   NA
 336132 336133 PSPTO3163 PSPTO3164   phbA-2 TRUE 0.505 83.000 0.000 1.000 Y NA
 336134 336135 PSPTO3165 PSPTO3166     FALSE 0.146 86.000 0.000 1.000   NA
 336137 336138 PSPTO3168 PSPTO3169     FALSE 0.007 308.000 0.000 NA   NA
 336138 336139 PSPTO3169 PSPTO3170     FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 336140 336141 PSPTO3171 PSPTO3172     TRUE 0.986 23.000 1.000 1.000 N NA
 336141 336142 PSPTO3172 PSPTO3173     FALSE 0.099 104.000 0.000 NA   NA
 336145 336146 PSPTO3176 PSPTO3177     TRUE 0.556 32.000 0.043 NA   NA
 336146 10692082 PSPTO3177 PSPTO_3178     FALSE 0.013 254.000 0.000 NA   NA
 10692082 336147 PSPTO_3178 PSPTO3179     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 336147 336148 PSPTO3179 PSPTO3180     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336148 336149 PSPTO3180 PSPTO3181     FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 336153 336154 PSPTO3186 PSPTO3187     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 336154 336155 PSPTO3187 PSPTO3188     FALSE 0.441 124.000 0.118 NA   NA
 336155 336156 PSPTO3188 PSPTO3189     TRUE 0.998 -3.000 0.647 NA   NA
 336156 336157 PSPTO3189 PSPTO3190     TRUE 0.994 10.000 0.714 NA   NA
 336157 336158 PSPTO3190 PSPTO3191     TRUE 0.920 -22.000 0.154 1.000 N NA
 336158 336159 PSPTO3191 PSPTO3192     TRUE 0.685 69.000 0.200 1.000 N NA
 336159 336160 PSPTO3192 PSPTO3193     FALSE 0.011 295.000 0.000 1.000   NA
 336161 336162 PSPTO3194 PSPTO3195     FALSE 0.002 486.000 0.000 1.000 N NA
 336164 336165 PSPTO3197 PSPTO3198     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336165 336166 PSPTO3198 PSPTO3199     FALSE 0.451 94.000 0.000 NA Y NA
 336167 336168 PSPTO3200 PSPTO3201     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336168 336169 PSPTO3201 PSPTO3202     FALSE 0.116 87.000 0.000 NA   NA
 336169 336170 PSPTO3202 PSPTO3203     FALSE 0.402 81.000 0.000 0.040   NA
 336170 336171 PSPTO3203 PSPTO3204     TRUE 0.531 -22.000 0.000 NA   NA
 336171 336172 PSPTO3204 PSPTO3205     TRUE 0.911 -16.000 0.120 NA N NA
 336172 10692084 PSPTO3205 PSPTO_3206     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 10692084 336173 PSPTO_3206 PSPTO3207     FALSE 0.023 218.000 0.000 NA   NA
 336175 336176 PSPTO3210 PSPTO3211     FALSE 0.001 1151.000 0.000 NA   NA
 336177 336178 PSPTO3212 PSPTO3213     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 336179 336180 PSPTO3215 PSPTO3216     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 336181 336182 PSPTO3217 PSPTO3218     FALSE 0.001 619.000 0.000 NA   NA
 336182 336183 PSPTO3218 PSPTO3219     FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 336183 336184 PSPTO3219 PSPTO3220     FALSE 0.107 95.000 0.000 NA   NA
 336184 336185 PSPTO3220 PSPTO3221     TRUE 0.749 19.000 0.061 NA   NA
 336185 336186 PSPTO3221 PSPTO3222     FALSE 0.139 70.000 0.000 NA   NA
 336187 336188 PSPTO3223 PSPTO3224     TRUE 0.614 99.000 0.000 0.066 Y NA
 336188 336189 PSPTO3224 PSPTO3225     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 336190 336191 PSPTO3226 PSPTO3227     FALSE 0.054 168.000 0.000 NA   NA
 336191 336192 PSPTO3227 PSPTO3228     FALSE 0.003 450.000 0.000 NA   NA
 336192 336193 PSPTO3228 PSPTO3229     FALSE 0.001 627.000 0.000 NA   NA
 336193 336194 PSPTO3229 PSPTO3230     FALSE 0.204 40.000 0.000 NA   NA
 336196 336197 PSPTO3232 PSPTO3233     FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 336197 336198 PSPTO3233 PSPTO3234     FALSE 0.125 85.000 0.000 1.000 N NA
 10692086 336199 PSPTO_3235 PSPTO3236     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336201 336202 PSPTO3238 PSPTO3239   tolR-1 TRUE 0.920 6.000 0.040 1.000 N NA
 336202 336203 PSPTO3239 PSPTO3240 tolR-1 tolQ-1 TRUE 0.997 10.000 0.556 0.077 Y NA
 336203 336204 PSPTO3240 PSPTO3241 tolQ-1   FALSE 0.337 55.000 0.023 1.000 N NA
 336204 336205 PSPTO3241 PSPTO3242     TRUE 0.804 37.000 0.220 1.000 N NA
 336206 336207 PSPTO3243 PSPTO3244     TRUE 0.987 10.000 0.450 1.000 N NA
 336208 336209 PSPTO3245 PSPTO3246     FALSE 0.405 112.000 0.000 NA Y NA
 336210 336211 PSPTO3247 PSPTO3248     TRUE 0.517 86.000 0.114 1.000 N NA
 336211 336212 PSPTO3248 PSPTO3249     TRUE 0.923 41.000 0.160 0.064 Y NA
 336212 336213 PSPTO3249 PSPTO3250     TRUE 0.999 0.000 0.640 0.064 Y NA
 336213 336214 PSPTO3250 PSPTO3251     TRUE 0.970 63.000 0.692 1.000 Y NA
 336214 336215 PSPTO3251 PSPTO3252     TRUE 0.998 11.000 0.733 0.017 Y NA
 336215 336216 PSPTO3252 PSPTO3253     FALSE 0.101 136.000 0.000 1.000   NA
 10692087 336218 PSPTO_3255 PSPTO3256     FALSE 0.043 180.000 0.000 NA   NA
 336218 336219 PSPTO3256 PSPTO3257     TRUE 0.999 9.000 0.958 1.000 Y NA
 336219 336220 PSPTO3257 PSPTO3258     TRUE 0.998 -3.000 0.391 1.000 Y NA
 336220 336221 PSPTO3258 PSPTO3259     FALSE 0.100 107.000 0.000 1.000 N NA
 336222 336223 PSPTO3260 PSPTO3261     FALSE 0.088 126.000 0.000 NA   NA
 336224 336225 PSPTO3262 PSPTO3263 nirB nirD TRUE 0.999 0.000 0.656 0.001 N NA
 336228 336229 PSPTO3266 PSPTO3267 pstB-1 pstA TRUE 0.999 0.000 0.526 0.002 Y NA
 336229 336230 PSPTO3267 PSPTO3268 pstA pstC TRUE 0.998 9.000 0.537 0.002 Y NA
 336230 336231 PSPTO3268 PSPTO3269 pstC pstS TRUE 0.719 82.000 0.000 0.002 Y NA
 336232 336233 PSPTO3270 PSPTO3271     FALSE 0.117 86.000 0.000 NA   NA
 336236 336237 PSPTO3274 PSPTO3275     FALSE 0.003 431.000 0.000 1.000 N NA
 336237 336238 PSPTO3275 PSPTO3276     FALSE 0.367 19.000 0.000 NA   NA
 336240 336241 PSPTO3278 PSPTO3279     FALSE 0.094 124.000 0.000 1.000 N NA
 336241 336242 PSPTO3279 PSPTO3280   glxK FALSE 0.045 181.000 0.000 1.000 N NA
 336242 336243 PSPTO3280 PSPTO3281 glxK   FALSE 0.312 111.000 0.050 1.000 N NA
 336246 336247 PSPTO3284 PSPTO3285   gudD FALSE 0.474 52.000 0.049 1.000 N NA
 336247 336248 PSPTO3285 PSPTO3286 gudD   FALSE 0.071 145.000 0.000 NA   NA
 336248 336249 PSPTO3286 PSPTO3287     FALSE 0.215 37.000 0.000 NA   NA
 336251 336252 PSPTO3289 PSPTO3290     FALSE 0.005 331.000 0.000 NA   NA
 336254 336255 PSPTO3292 PSPTO3293     FALSE 0.015 451.000 0.000 0.004   NA
 336257 336258 PSPTO3295 PSPTO3296 pncA   FALSE 0.086 135.000 0.000 1.000 N NA
 336258 336259 PSPTO3296 PSPTO3297     FALSE 0.122 87.000 0.000 1.000 N NA
 336259 336260 PSPTO3297 PSPTO3298     TRUE 0.997 -22.000 0.857 1.000 Y NA
 336260 336261 PSPTO3298 PSPTO3299   phaG-1 FALSE 0.001 571.000 0.000 NA N NA
 336261 336262 PSPTO3299 PSPTO3300 phaG-1   FALSE 0.082 99.000 0.000 NA N NA
 336262 336263 PSPTO3300 PSPTO3301     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 336263 336264 PSPTO3301 PSPTO3302     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA N NA
 336264 336265 PSPTO3302 PSPTO3303     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336265 336266 PSPTO3303 PSPTO3304     FALSE 0.058 162.000 0.000 NA   NA
 336266 336267 PSPTO3304 PSPTO3305     FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 336268 336269 PSPTO3306 PSPTO3307   gspD FALSE 0.131 76.000 0.000 NA   NA
 336269 336270 PSPTO3307 PSPTO3308 gspD   TRUE 0.840 48.000 0.333 NA   NA
 336270 336271 PSPTO3308 PSPTO3309     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336271 336272 PSPTO3309 PSPTO3310     TRUE 0.993 -19.000 0.811 1.000   NA
 336272 336273 PSPTO3310 PSPTO3311     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.057   NA
 336273 336274 PSPTO3311 PSPTO3312     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336274 336275 PSPTO3312 PSPTO3313     TRUE 0.938 -3.000 0.012 NA   NA
 336275 336276 PSPTO3313 PSPTO3314   gspH TRUE 0.993 0.000 0.087 0.002   NA
 336276 336277 PSPTO3314 PSPTO3315 gspH gspG TRUE 0.997 9.000 0.348 0.002 Y NA
 336277 336278 PSPTO3315 PSPTO3316 gspG gspF TRUE 0.908 26.000 0.015 0.002 Y NA
 336278 336279 PSPTO3316 PSPTO3317 gspF gspE TRUE 0.998 -3.000 0.119 0.002 Y NA
 336281 336282 PSPTO3319 PSPTO3320     FALSE 0.157 59.000 0.000 NA   NA
 336282 336283 PSPTO3320 PSPTO3321   bar TRUE 0.658 41.000 0.109 NA   NA
 336284 336285 PSPTO3322 PSPTO3323     FALSE 0.010 279.000 0.000 1.000 N NA
 336285 336286 PSPTO3323 PSPTO3324     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 336286 336287 PSPTO3324 PSPTO3325     FALSE 0.011 267.000 0.000 NA   NA
 336290 336291 PSPTO3328 PSPTO3329 tliF tliE TRUE 0.997 2.000 0.375 0.007   NA
 336291 336292 PSPTO3329 PSPTO3330 tliE tliD TRUE 0.869 81.000 0.312 0.007   NA
 336292 336293 PSPTO3330 PSPTO3331 tliD   TRUE 0.478 81.000 0.071 1.000   NA
 336293 336294 PSPTO3331 PSPTO3332     TRUE 0.589 60.000 0.095 1.000   NA
 336294 336295 PSPTO3332 PSPTO3333     FALSE 0.003 477.000 0.000 1.000   NA
 401650 336296 PSPTO_t40 PSPTO3334 tRNA-Ser-3   FALSE 0.062 157.000 0.000 NA   NA
 336297 336298 PSPTO3335 PSPTO3336     TRUE 0.922 16.000 0.000 0.064 Y NA
 336299 336300 PSPTO3337 PSPTO3338     FALSE 0.089 123.000 0.000 NA   NA
 336300 336301 PSPTO3338 PSPTO3339     TRUE 0.999 2.000 0.790 NA Y NA
 336301 336302 PSPTO3339 PSPTO3340     TRUE 0.999 0.000 0.804 NA Y NA
 336302 336303 PSPTO3340 PSPTO3341     TRUE 0.998 -3.000 0.317 NA Y NA
 336303 336304 PSPTO3341 PSPTO3342     TRUE 0.980 -3.000 0.072 1.000 N NA
 336304 336305 PSPTO3342 PSPTO3343     FALSE 0.297 109.000 0.051 NA N NA
 336306 336307 PSPTO3344 PSPTO3345 cysG serS TRUE 0.951 1.000 0.031 1.000 N NA
 336307 336308 PSPTO3345 PSPTO3346 serS   TRUE 0.686 17.000 0.028 1.000 N NA
 336308 336309 PSPTO3346 PSPTO3347     TRUE 0.955 0.000 0.027 1.000 N NA
 336309 336310 PSPTO3347 PSPTO3348   lolA TRUE 0.878 18.000 0.167 1.000 N NA
 336310 336311 PSPTO3348 PSPTO3349 lolA ftsK TRUE 0.774 77.000 0.305 1.000   NA
 336312 336313 PSPTO3350 PSPTO3351 aat   TRUE 0.903 61.000 0.285 1.000 Y NA
 336313 336314 PSPTO3351 PSPTO3352   infA FALSE 0.415 102.000 0.078 1.000 N NA
 336315 336316 PSPTO3353 PSPTO3354 clpA   TRUE 0.950 31.000 0.596 NA   NA
 336317 336318 PSPTO3355 PSPTO3356     FALSE 0.009 634.000 0.093 1.000 N NA
 336318 336319 PSPTO3356 PSPTO3357     FALSE 0.256 126.000 0.032 1.000   NA
 336319 336320 PSPTO3357 PSPTO3358   trmU TRUE 0.668 61.000 0.158 1.000   NA
 336320 336321 PSPTO3358 PSPTO3359 trmU   TRUE 0.989 0.000 0.180 NA   NA
 336321 336322 PSPTO3359 PSPTO3360   purB FALSE 0.390 132.000 0.093 NA   NA
 336322 336323 PSPTO3360 PSPTO3361 purB   FALSE 0.345 61.000 0.029 NA   NA
 336323 336324 PSPTO3361 PSPTO3362     TRUE 0.968 -7.000 0.167 NA   NA
 336324 336325 PSPTO3362 PSPTO3363     FALSE 0.253 178.000 0.085 1.000   NA
 336325 336326 PSPTO3363 PSPTO3364   aceA FALSE 0.013 277.000 0.000 1.000   NA
 336326 336327 PSPTO3364 PSPTO3365 aceA nuoA FALSE 0.017 475.000 0.000 1.000 Y NA
 336327 336328 PSPTO3365 PSPTO3366 nuoA nuoB TRUE 0.996 11.000 0.377 0.001 Y NA
 336328 336329 PSPTO3366 PSPTO3367 nuoB nuoCD TRUE 0.983 75.000 0.691 0.001 Y NA
 336329 336330 PSPTO3367 PSPTO3368 nuoCD nuoE TRUE 0.999 3.000 0.407 0.003 Y NA
 336330 336331 PSPTO3368 PSPTO3369 nuoE nuoF TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.003 Y NA
 336331 336332 PSPTO3369 PSPTO3370 nuoF nuoG TRUE 0.844 138.000 0.180 0.003 Y NA
 336332 336333 PSPTO3370 PSPTO3371 nuoG nuoH TRUE 1.000 -3.000 0.664 0.003 Y NA
 336333 336334 PSPTO3371 PSPTO3372 nuoH nuoI TRUE 0.996 12.000 0.423 0.003 Y NA
 336334 336335 PSPTO3372 PSPTO3373 nuoI nuoJ TRUE 0.996 11.000 0.428 0.003 Y NA
 336335 336336 PSPTO3373 PSPTO3374 nuoJ nouK TRUE 0.999 -3.000 0.269 0.001 Y NA
 336336 336337 PSPTO3374 PSPTO3375 nouK nuoL TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.003 Y NA
 336337 336338 PSPTO3375 PSPTO3376 nuoL nuoM TRUE 0.990 40.000 0.713 0.001 Y NA
 336338 336339 PSPTO3376 PSPTO3377 nuoM nuoN TRUE 0.998 8.000 0.437 0.001 Y NA
 336340 336341 PSPTO3378 PSPTO3379     FALSE 0.147 146.000 0.019 NA   NA
 336341 336342 PSPTO3379 PSPTO3380     TRUE 0.604 127.000 0.000 0.013 Y NA
 336342 336343 PSPTO3380 PSPTO3381     TRUE 1.000 -3.000 0.882 1.000 Y NA
 336343 336344 PSPTO3381 PSPTO3382     TRUE 0.999 0.000 0.762 1.000   NA
 336344 336345 PSPTO3382 PSPTO3383     TRUE 0.999 0.000 0.619 0.002   NA
 336345 336346 PSPTO3383 PSPTO3384     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 336348 336349 PSPTO3386 PSPTO3387     FALSE 0.001 993.000 0.000 NA   NA
 336349 336350 PSPTO3387 PSPTO3388     FALSE 0.015 262.000 0.000 1.000   NA
 336350 336351 PSPTO3388 PSPTO3389     FALSE 0.039 202.000 0.000 1.000   NA
 336351 336352 PSPTO3389 PSPTO3390     FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 336352 336353 PSPTO3390 PSPTO3391     FALSE 0.110 92.000 0.000 NA   NA
 336353 336354 PSPTO3391 PSPTO3392     TRUE 0.938 -25.000 0.211 NA   NA
 336354 336355 PSPTO3392 PSPTO3393     TRUE 0.559 91.000 0.158 NA   NA
 336355 336356 PSPTO3393 PSPTO3394     TRUE 0.588 139.000 0.250 NA   NA
 336356 336357 PSPTO3394 PSPTO3395     TRUE 0.914 16.000 0.192 NA   NA
 336357 336358 PSPTO3395 PSPTO3396     TRUE 0.977 13.000 0.423 NA   NA
 336358 336359 PSPTO3396 PSPTO3397     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 336359 336360 PSPTO3397 PSPTO3398     TRUE 0.699 9.000 0.000 NA   NA
 336360 336361 PSPTO3398 PSPTO3399     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336361 336362 PSPTO3399 PSPTO3400     TRUE 0.995 2.000 0.429 NA   NA
 336362 336363 PSPTO3400 PSPTO3401     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA   NA
 336363 336364 PSPTO3401 PSPTO3402     TRUE 0.997 4.000 0.750 NA   NA
 336364 336365 PSPTO3402 PSPTO3403     TRUE 0.955 43.000 0.750 NA   NA
 336365 336366 PSPTO3403 PSPTO3404     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 336366 336367 PSPTO3404 PSPTO3405     TRUE 0.992 -7.000 0.500 NA   NA
 336367 336368 PSPTO3405 PSPTO3406     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 336368 336369 PSPTO3406 PSPTO3407     TRUE 0.978 3.000 0.136 NA   NA
 336369 336370 PSPTO3407 PSPTO3408     TRUE 0.870 86.000 0.545 NA   NA
 336370 336371 PSPTO3408 PSPTO3409   clpP-1 TRUE 0.998 -3.000 0.588 NA   NA
 336371 336372 PSPTO3409 PSPTO3410 clpP-1   TRUE 0.998 -3.000 0.706 1.000   NA
 336372 336373 PSPTO3410 PSPTO3411     TRUE 0.992 -3.000 0.235 NA   NA
 336373 336374 PSPTO3411 PSPTO3412     TRUE 0.991 2.000 0.273 NA   NA
 336374 336375 PSPTO3412 PSPTO3413     TRUE 0.992 5.000 0.455 NA   NA
 336375 336376 PSPTO3413 PSPTO3414     FALSE 0.021 225.000 0.000 NA   NA
 336376 336377 PSPTO3414 PSPTO3415     TRUE 0.847 2.000 0.000 NA   NA
 336377 336378 PSPTO3415 PSPTO3416     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336378 336379 PSPTO3416 PSPTO3417     FALSE 0.002 528.000 0.000 NA   NA
 336379 336380 PSPTO3417 PSPTO3418     TRUE 0.995 -7.000 0.667 NA   NA
 336380 336381 PSPTO3418 PSPTO3419     TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 336381 336382 PSPTO3419 PSPTO3420     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 336383 336384 PSPTO3421 PSPTO3422     FALSE 0.001 1208.000 0.000 NA   NA
 336384 336385 PSPTO3422 PSPTO3423     TRUE 0.995 9.000 0.750 NA   NA
 336385 336386 PSPTO3423 PSPTO3424     FALSE 0.074 141.000 0.000 NA   NA
 336386 336387 PSPTO3424 PSPTO3425     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336387 336388 PSPTO3425 PSPTO3426     TRUE 0.807 51.000 0.286 NA   NA
 336388 336389 PSPTO3426 PSPTO3427     FALSE 0.001 695.000 0.000 NA   NA
 336389 336390 PSPTO3427 PSPTO3428     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336390 336391 PSPTO3428 PSPTO3429     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336391 336392 PSPTO3429 PSPTO3430     FALSE 0.241 76.000 0.014 1.000 N NA
 336393 336394 PSPTO3432 PSPTO3433     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 336394 406459 PSPTO3433 PSPTO_r10   Ps5SD FALSE 0.001 726.000 0.000 NA   NA
 406459 2209176 PSPTO_r10 PSPTO_r11 Ps5SD Ps23SD FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 2209176 401673 PSPTO_r11 PSPTO_t41 Ps23SD tRNA-Ala-6 FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 401673 401672 PSPTO_t41 PSPTO_t42 tRNA-Ala-6 tRNA-Ile-4 FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 401672 2209177 PSPTO_t42 PSPTO_r12 tRNA-Ile-4 Ps16SD FALSE 0.099 104.000 0.000 NA   NA
 10692088 336395 PSPTO_3435 PSPTO3436     FALSE 0.056 166.000 0.000 NA   NA
 336396 336397 PSPTO3437 PSPTO3438   iscS-3 TRUE 0.689 58.000 0.029 1.000 Y NA
 336398 336399 PSPTO3439 PSPTO3440     TRUE 0.906 6.000 0.027 1.000   NA
 336399 336400 PSPTO3440 PSPTO3441     TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 336400 336401 PSPTO3441 PSPTO3442     TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 336401 336402 PSPTO3442 PSPTO3443     TRUE 0.865 1.000 0.000 1.000 N NA
 336402 336403 PSPTO3443 PSPTO3444     FALSE 0.177 52.000 0.000 1.000 N NA
 336403 336404 PSPTO3444 PSPTO3445     FALSE 0.113 89.000 0.000 NA   NA
 336404 336405 PSPTO3445 PSPTO3446     TRUE 0.984 -3.000 0.105 NA   NA
 336405 336406 PSPTO3446 PSPTO3447     TRUE 0.707 76.000 0.000 0.013 Y NA
 336406 336407 PSPTO3447 PSPTO3448     TRUE 0.717 71.000 0.000 0.013 Y NA
 336407 336408 PSPTO3448 PSPTO3449     TRUE 0.895 13.000 0.000 NA Y NA
 336408 336409 PSPTO3449 PSPTO3450     FALSE 0.419 106.000 0.000 NA Y NA
 336409 336410 PSPTO3450 PSPTO3451   ssuE FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000   NA
 336411 336412 PSPTO3452 PSPTO3453     FALSE 0.173 124.000 0.016 NA   NA
 336412 336413 PSPTO3453 PSPTO3454     FALSE 0.113 89.000 0.000 NA   NA
 336414 336415 PSPTO3455 PSPTO3456     TRUE 0.970 46.000 0.352 0.000 Y NA
 336415 336416 PSPTO3456 PSPTO3457     FALSE 0.020 444.000 0.000 1.000 Y NA
 336417 336418 PSPTO3458 PSPTO3459     TRUE 0.937 -3.000 0.004 1.000   NA
 336418 336419 PSPTO3459 PSPTO3460     FALSE 0.118 109.000 0.000 1.000   NA
 336423 336424 PSPTO3464 PSPTO3465     TRUE 0.891 37.000 0.371 1.000   NA
 336425 336426 PSPTO3466 PSPTO3467 ssuD   TRUE 0.888 0.000 0.000 1.000 N NA
 336427 336428 PSPTO3468 PSPTO3469     TRUE 0.502 49.000 0.049 1.000   NA
 336429 336430 PSPTO3470 PSPTO3471     FALSE 0.076 160.000 0.000 1.000   NA
 336430 336431 PSPTO3471 PSPTO3472     TRUE 1.000 0.000 0.881 0.003 Y NA
 336431 336432 PSPTO3472 PSPTO3473     TRUE 0.999 6.000 0.976 0.003 Y NA
 336432 336433 PSPTO3473 PSPTO3474     TRUE 1.000 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 336433 336434 PSPTO3474 PSPTO3475     TRUE 1.000 -3.000 0.937 0.057 Y NA
 336434 336435 PSPTO3475 PSPTO3476     TRUE 1.000 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 336438 336439 PSPTO3479 PSPTO3480     FALSE 0.033 210.000 0.000 1.000   NA
 336440 336441 PSPTO3481 PSPTO3482     FALSE 0.191 44.000 0.000 NA   NA
 336441 336442 PSPTO3482 PSPTO3483     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 336442 336443 PSPTO3483 PSPTO3484     TRUE 0.984 26.000 1.000 NA   NA
 336443 336444 PSPTO3484 PSPTO3485     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 336444 336445 PSPTO3485 PSPTO3486     FALSE 0.021 225.000 0.000 NA   NA
 336446 336447 PSPTO3487 PSPTO3488     FALSE 0.010 304.000 0.000 1.000   NA
 336447 336448 PSPTO3488 PSPTO3489     TRUE 0.915 45.000 0.500 1.000   NA
 336448 336449 PSPTO3489 PSPTO3490     TRUE 0.969 70.000 0.750 NA Y NA
 336451 336452 PSPTO3492 PSPTO3493     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 336452 336453 PSPTO3493 PSPTO3494   iolG FALSE 0.410 53.000 0.036 NA   NA
 336453 336454 PSPTO3494 PSPTO3495 iolG   TRUE 0.574 84.000 0.140 1.000   NA
 336454 336455 PSPTO3495 PSPTO3496   iolI FALSE 0.397 64.000 0.047 NA N NA
 336455 336456 PSPTO3496 PSPTO3497 iolI mmsA-3 TRUE 0.510 37.000 0.048 NA N NA
 336456 336457 PSPTO3497 PSPTO3498 mmsA-3   FALSE 0.290 28.000 0.000 1.000 N NA
 336457 336458 PSPTO3498 PSPTO3499     TRUE 0.923 30.000 0.199 1.000 Y NA
 336458 336459 PSPTO3499 PSPTO3500     TRUE 0.765 70.000 0.086 1.000 Y NA
 336461 336462 PSPTO3502 PSPTO3503     TRUE 0.995 -3.000 0.357 NA   NA
 336462 336463 PSPTO3503 PSPTO3504     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336465 336466 PSPTO3506 PSPTO3507   nagZ TRUE 0.827 10.000 0.018 1.000 N NA
 336466 336467 PSPTO3507 PSPTO3508 nagZ psrA FALSE 0.222 124.000 0.028 1.000 N NA
 336467 336468 PSPTO3508 PSPTO3509 psrA   FALSE 0.083 133.000 0.000 NA   NA
 336469 336470 PSPTO3510 PSPTO3511 lexA-2   TRUE 0.946 10.000 0.122 1.000 N NA
 336471 336472 PSPTO3512 PSPTO3513     TRUE 0.882 35.000 0.348 NA   NA
 336472 336473 PSPTO3513 PSPTO3514   topA FALSE 0.154 123.000 0.011 NA   NA
 336473 336474 PSPTO3514 PSPTO3515 topA   FALSE 0.140 114.000 0.007 NA   NA
 336474 336475 PSPTO3515 PSPTO3516   fadA FALSE 0.462 78.000 0.070 NA   NA
 336475 336476 PSPTO3516 PSPTO3517 fadA fadB TRUE 0.998 5.000 0.607 1.000 Y NA
 336482 336483 PSPTO3523 PSPTO3524     TRUE 0.517 93.000 0.116 1.000   NA
 336484 336485 PSPTO3525 PSPTO3526     FALSE 0.070 146.000 0.000 NA   NA
 336486 336487 PSPTO3527 PSPTO3528     FALSE 0.003 472.000 0.000 1.000 N NA
 336488 336489 PSPTO3529 PSPTO3530     TRUE 0.989 0.000 0.034 NA Y NA
 336489 336490 PSPTO3530 PSPTO3531     FALSE 0.422 146.000 0.014 1.000 Y NA
 336490 336491 PSPTO3531 PSPTO3532     TRUE 0.965 18.000 0.152 0.098 Y NA
 336491 336492 PSPTO3532 PSPTO3533     TRUE 0.992 0.000 0.054 1.000 Y NA
 336492 336493 PSPTO3533 PSPTO3534     TRUE 0.963 2.000 0.054 1.000 N NA
 336493 336494 PSPTO3534 PSPTO3535     TRUE 0.997 4.000 0.714 1.000 N NA
 336494 336495 PSPTO3535 PSPTO3536     TRUE 0.999 -9.000 0.714 0.013 Y NA
 336495 336496 PSPTO3536 PSPTO3537     TRUE 0.998 0.000 0.625 NA   NA
 336496 336497 PSPTO3537 PSPTO3538     TRUE 0.983 -3.000 0.103 NA   NA
 336497 336498 PSPTO3538 PSPTO3539     TRUE 0.873 16.000 0.103 1.000   NA
 336500 336501 PSPTO3541 PSPTO3542     FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 336501 336502 PSPTO3542 PSPTO3543     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 336502 336503 PSPTO3543 PSPTO3544     FALSE 0.010 278.000 0.000 NA   NA
 336503 336504 PSPTO3544 PSPTO3545     FALSE 0.056 166.000 0.000 NA   NA
 336504 336505 PSPTO3545 PSPTO3546     FALSE 0.090 119.000 0.000 NA   NA
 336506 336507 PSPTO3547 PSPTO3548     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 336509 336510 PSPTO3550 PSPTO3551 fahA hmgA TRUE 0.996 0.000 0.188 1.000 Y NA
 336512 336513 PSPTO3553 PSPTO3554 hppD maiA FALSE 0.331 143.000 0.000 0.001 N NA
 336514 336515 PSPTO3555 PSPTO3556 glcD glcE TRUE 0.991 0.000 0.070 0.010   NA
 336515 10692089 PSPTO3556 PSPTO_3557 glcE   TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 10692089 336516 PSPTO_3557 PSPTO3558   glcG FALSE 0.219 36.000 0.000 NA   NA
 336516 336517 PSPTO3558 PSPTO3559 glcG glcB-2 TRUE 0.598 65.000 0.125 NA   NA
 336518 336519 PSPTO3560 PSPTO3561     FALSE 0.061 158.000 0.000 NA   NA
 336519 336520 PSPTO3561 PSPTO3562     FALSE 0.035 192.000 0.000 NA   NA
 336520 336521 PSPTO3562 PSPTO3563   gntR FALSE 0.211 38.000 0.000 NA   NA
 336522 336523 PSPTO3564 PSPTO3565 gntV   TRUE 0.887 98.000 0.364 1.000 Y NA
 336523 336524 PSPTO3565 PSPTO3566   csrA-3 FALSE 0.002 557.000 0.000 1.000 N NA
 336525 336526 PSPTO3567 PSPTO3568     FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 336526 336527 PSPTO3568 PSPTO3569     FALSE 0.113 89.000 0.000 NA   NA
 336527 336528 PSPTO3569 PSPTO3570     FALSE 0.003 407.000 0.000 NA   NA
 336528 336529 PSPTO3570 PSPTO3571     FALSE 0.191 44.000 0.000 NA   NA
 336530 336531 PSPTO3572 PSPTO3573     FALSE 0.201 55.000 0.000 1.000   NA
 336531 336532 PSPTO3573 PSPTO3574     FALSE 0.113 120.000 0.000 1.000   NA
 336534 336535 PSPTO3576 PSPTO3577     FALSE 0.045 181.000 0.000 1.000 N NA
 336535 336536 PSPTO3577 PSPTO3578     FALSE 0.123 82.000 0.000 NA   NA
 336537 336538 PSPTO3579 PSPTO3580     FALSE 0.074 141.000 0.000 NA   NA
 336538 336539 PSPTO3580 PSPTO3581     FALSE 0.042 195.000 0.000 1.000   NA
 336540 336541 PSPTO3582 PSPTO3583 katB   FALSE 0.151 63.000 0.000 NA   NA
 336542 336543 PSPTO3584 PSPTO3585     FALSE 0.006 327.000 0.000 NA   NA
 336543 336544 PSPTO3585 PSPTO3586     FALSE 0.007 307.000 0.000 NA   NA
 336545 336546 PSPTO3587 PSPTO3588     FALSE 0.088 125.000 0.000 NA   NA
 336548 336549 PSPTO3590 PSPTO3591   rarD-2 FALSE 0.130 98.000 0.000 1.000   NA
 336550 336551 PSPTO3592 PSPTO3593     FALSE 0.144 67.000 0.000 NA   NA
 336554 336555 PSPTO3596 PSPTO3597     TRUE 0.989 9.000 0.222 NA Y NA
 336555 336556 PSPTO3597 PSPTO3598     TRUE 0.948 25.000 0.244 NA Y NA
 336556 336557 PSPTO3598 PSPTO3599     TRUE 0.933 30.000 0.244 NA Y NA
 336558 336559 PSPTO3600 PSPTO3601     TRUE 0.861 120.000 0.429 0.037   NA
 336559 336560 PSPTO3601 PSPTO3602     TRUE 0.897 73.000 0.583 NA   NA
 336561 336562 PSPTO3603 PSPTO3604     TRUE 0.999 -21.000 0.889 0.002 Y NA
 336565 336566 PSPTO3607 PSPTO3608     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 336567 336568 PSPTO3609 PSPTO3610     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336568 10692090 PSPTO3610 PSPTO_3611     FALSE 0.005 338.000 0.000 NA   NA
 10692090 336569 PSPTO_3611 PSPTO3612     FALSE 0.121 83.000 0.000 NA   NA
 336569 336570 PSPTO3612 PSPTO3613     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 336570 10692091 PSPTO3613 PSPTO_3614     FALSE 0.177 48.000 0.000 NA   NA
 10692091 336571 PSPTO_3614 PSPTO3615     FALSE 0.042 181.000 0.000 NA   NA
 336573 336574 PSPTO3617 PSPTO3618     TRUE 0.958 18.000 0.444 NA   NA
 336574 336575 PSPTO3618 PSPTO3619     TRUE 0.995 -3.000 0.353 NA   NA
 336575 336576 PSPTO3619 PSPTO3620     TRUE 0.997 -3.000 0.529 NA   NA
 336576 336577 PSPTO3620 PSPTO3621     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.098 N NA
 336577 336580 PSPTO3621 PSPTO3624     FALSE 0.001 978.000 0.000 1.000 N NA
 336580 336581 PSPTO3624 PSPTO3625     TRUE 0.578 99.000 0.030 1.000 Y NA
 336582 10692092 PSPTO3626 PSPTO_3627     TRUE 0.591 12.000 0.000 NA   NA
 10692092 336583 PSPTO_3627 PSPTO3628   cycL TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336583 336584 PSPTO3628 PSPTO3629 cycL dsbE TRUE 0.996 -3.000 0.196 NA Y NA
 336584 336585 PSPTO3629 PSPTO3630 dsbE ccmF TRUE 1.000 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 336585 336586 PSPTO3630 PSPTO3631 ccmF ccmE TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 336586 336587 PSPTO3631 PSPTO3632 ccmE ccmD TRUE 0.995 -3.000 0.344 1.000 N NA
 336587 336588 PSPTO3632 PSPTO3633 ccmD ccmC TRUE 0.997 -3.000 0.501 1.000 N NA
 336588 336589 PSPTO3633 PSPTO3634 ccmC ccmB TRUE 0.873 56.000 0.051 0.001 Y NA
 336589 336590 PSPTO3634 PSPTO3635 ccmB ccmA TRUE 0.997 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 336591 336592 PSPTO3636 PSPTO3637     TRUE 0.994 0.000 0.286 1.000   NA
 336593 336594 PSPTO3638 PSPTO3639 recR   FALSE 0.097 111.000 0.000 1.000 N NA
 336595 336596 PSPTO3640 PSPTO3641     TRUE 0.930 -10.000 0.098 NA N NA
 336596 10692093 PSPTO3641 PSPTO_3642     FALSE 0.356 20.000 0.000 NA   NA
 10692093 336597 PSPTO_3642 PSPTO3643     FALSE 0.255 30.000 0.000 NA   NA
 336597 336598 PSPTO3643 PSPTO3644     FALSE 0.231 156.000 0.000 0.058   NA
 336599 336600 PSPTO3645 PSPTO3646   dnaZX TRUE 0.852 62.000 0.411 NA   NA
 336601 336602 PSPTO3647 PSPTO3648     FALSE 0.116 92.000 0.000 1.000 N NA
 336605 336606 PSPTO3651 PSPTO3652     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 10692094 336607 PSPTO_3653 PSPTO3654     FALSE 0.001 1540.000 0.000 NA   NA
 336608 336609 PSPTO3655 PSPTO3656   ligA FALSE 0.004 442.000 0.002 NA   NA
 336609 336610 PSPTO3656 PSPTO3657 ligA   FALSE 0.424 128.000 0.106 1.000 N NA
 336610 336611 PSPTO3657 PSPTO3658     FALSE 0.393 252.000 0.115 0.007 Y NA
 336611 336612 PSPTO3658 PSPTO3659     TRUE 0.884 4.000 0.010 1.000 N NA
 336613 336614 PSPTO3660 PSPTO3661     TRUE 0.997 -7.000 0.269 0.000 Y NA
 336614 336615 PSPTO3661 PSPTO3662     TRUE 0.982 -13.000 0.463 NA N NA
 336615 336616 PSPTO3662 PSPTO3663   guaD TRUE 0.990 -3.000 0.203 NA N NA
 336617 336618 PSPTO3664 PSPTO3665     FALSE 0.112 122.000 0.000 1.000   NA
 336619 336620 PSPTO3666 PSPTO3667     TRUE 0.983 -3.000 0.097 NA   NA
 336620 336621 PSPTO3667 PSPTO3668     TRUE 0.965 27.000 0.647 NA   NA
 336621 336622 PSPTO3668 PSPTO3669   allA TRUE 0.929 139.000 0.647 1.000 Y NA
 336622 336623 PSPTO3669 PSPTO3670 allA   TRUE 0.972 18.000 0.538 1.000   NA
 336623 336624 PSPTO3670 PSPTO3671     FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 336628 336629 PSPTO3675 PSPTO3676     FALSE 0.055 169.000 0.000 1.000 N NA
 336629 336630 PSPTO3676 PSPTO3677     TRUE 0.978 -10.000 0.316 NA   NA
 336633 336634 PSPTO3680 PSPTO3681     FALSE 0.066 150.000 0.000 NA   NA
 336634 336635 PSPTO3681 PSPTO3682     TRUE 0.971 3.000 0.091 NA   NA
 336636 336637 PSPTO3683 PSPTO3684     FALSE 0.032 198.000 0.000 NA   NA
 336637 336638 PSPTO3684 PSPTO3685     FALSE 0.095 107.000 0.000 NA   NA
 336639 336640 PSPTO3686 PSPTO3687     FALSE 0.078 265.000 0.000 1.000 Y NA
 336640 336641 PSPTO3687 PSPTO3688     TRUE 0.997 -3.000 0.488 NA   NA
 336641 336642 PSPTO3688 PSPTO3689     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 336642 336643 PSPTO3689 PSPTO3690     FALSE 0.096 106.000 0.000 NA   NA
 336643 336644 PSPTO3690 PSPTO3691     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336645 336646 PSPTO3692 PSPTO3693     FALSE 0.003 431.000 0.000 NA   NA
 336646 336647 PSPTO3693 PSPTO3694     FALSE 0.003 432.000 0.000 NA   NA
 336649 336650 PSPTO3696 PSPTO3697     FALSE 0.211 38.000 0.000 NA   NA
 336650 336651 PSPTO3697 PSPTO3698     TRUE 0.718 8.000 0.000 NA   NA
 336652 336653 PSPTO3699 PSPTO3700     FALSE 0.124 104.000 0.000 1.000   NA
 336653 336654 PSPTO3700 PSPTO3701     FALSE 0.064 171.000 0.000 1.000   NA
 336654 336655 PSPTO3701 PSPTO3702     FALSE 0.248 279.000 0.094 0.097 Y NA
 336656 336657 PSPTO3703 PSPTO3704     TRUE 0.998 -3.000 0.578 1.000   NA
 336658 336659 PSPTO3705 PSPTO3706   acdA TRUE 0.998 4.000 0.500 1.000 Y NA
 336660 336661 PSPTO3707 PSPTO3708     FALSE 0.079 137.000 0.000 NA   NA
 336663 336664 PSPTO3710 PSPTO3711   dnaQ FALSE 0.394 22.000 0.000 1.000   NA
 336664 336665 PSPTO3711 PSPTO3712 dnaQ rnhA TRUE 0.872 72.000 0.248 1.000 Y NA
 336665 336666 PSPTO3712 PSPTO3713 rnhA   FALSE 0.295 47.000 0.005 1.000   NA
 336667 336668 PSPTO3714 PSPTO3715   mltD TRUE 0.658 100.000 0.233 1.000   NA
 336668 336669 PSPTO3715 PSPTO3716 mltD   FALSE 0.270 138.000 0.049 1.000 N NA
 336669 336670 PSPTO3716 PSPTO3717     TRUE 0.997 -3.000 0.159 0.062 Y NA
 336670 336671 PSPTO3717 PSPTO3718     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.062   NA
 336671 336672 PSPTO3718 PSPTO3719     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.062   NA
 336672 336673 PSPTO3719 PSPTO3720     TRUE 0.999 2.000 1.000 1.000   NA
 336673 336674 PSPTO3720 PSPTO3721   fabI TRUE 0.703 25.000 0.057 1.000   NA
 336675 336676 PSPTO3722 PSPTO3723   hupB FALSE 0.062 206.000 0.017 1.000 N NA
 336676 336677 PSPTO3723 PSPTO3724 hupB lon-1 FALSE 0.222 147.000 0.040 1.000 N NA
 336677 336678 PSPTO3724 PSPTO3725 lon-1 clpX TRUE 0.590 211.000 0.201 0.092 Y NA
 336678 336679 PSPTO3725 PSPTO3726 clpX clpP-2 TRUE 0.873 107.000 0.352 1.000 Y NA
 336679 336680 PSPTO3726 PSPTO3727 clpP-2 tig TRUE 0.900 83.000 0.351 1.000 Y NA
 336680 336681 PSPTO3727 PSPTO3728 tig   FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 336685 401671 PSPTO3732 PSPTO_t43   tRNA-Leu-3 FALSE 0.002 572.000 0.000 NA   NA
 401671 401670 PSPTO_t43 PSPTO_t44 tRNA-Leu-3 tRNA-His-1 FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 401670 401669 PSPTO_t44 PSPTO_t45 tRNA-His-1 tRNA-Arg-5 FALSE 0.169 52.000 0.000 NA   NA
 336687 336688 PSPTO3734 PSPTO3735     FALSE 0.102 79.000 0.000 NA N NA
 336688 336689 PSPTO3735 PSPTO3736     FALSE 0.388 86.000 0.056 NA   NA
 336689 336690 PSPTO3736 PSPTO3737     TRUE 0.993 13.000 0.854 NA   NA
 336690 336691 PSPTO3737 PSPTO3738     TRUE 0.999 11.000 0.922 0.062 Y NA
 336691 336692 PSPTO3738 PSPTO3739     TRUE 0.999 -7.000 0.847 0.062 Y NA
 336692 336693 PSPTO3739 PSPTO3740     TRUE 1.000 0.000 0.865 0.002 Y NA
 336695 336696 PSPTO3742 PSPTO3743 cysS glnS TRUE 0.928 20.000 0.032 0.030 Y NA
 336697 336698 PSPTO3744 PSPTO3745 ppiB lpxH TRUE 0.993 -3.000 0.237 1.000   NA
 336699 336700 PSPTO3746 PSPTO3747     FALSE 0.007 340.000 0.000 1.000   NA
 336700 336701 PSPTO3747 PSPTO3748     TRUE 0.982 27.000 0.900 1.000   NA
 336701 336702 PSPTO3748 PSPTO3749     TRUE 0.498 91.000 0.111 1.000 N NA
 336702 336703 PSPTO3749 PSPTO3750     FALSE 0.073 147.000 0.000 1.000 N NA
 336703 336704 PSPTO3750 PSPTO3751     FALSE 0.120 84.000 0.000 NA   NA
 336706 336707 PSPTO3753 PSPTO3754     FALSE 0.096 106.000 0.000 NA   NA
 336708 336709 PSPTO3755 PSPTO3756     FALSE 0.007 304.000 0.000 NA   NA
 336711 336712 PSPTO3758 PSPTO3759     FALSE 0.036 206.000 0.000 1.000   NA
 336712 336713 PSPTO3759 PSPTO3760     TRUE 0.975 5.000 0.179 NA   NA
 336713 336714 PSPTO3760 PSPTO3761     TRUE 0.997 -3.000 0.484 NA   NA
 336714 336715 PSPTO3761 PSPTO3762     TRUE 0.978 -7.000 0.233 NA   NA
 336715 336716 PSPTO3762 PSPTO3763     TRUE 0.992 -3.000 0.233 NA   NA
 336716 336717 PSPTO3763 PSPTO3764     TRUE 0.993 -3.000 0.258 NA   NA
 336717 336718 PSPTO3764 PSPTO3765   sbcD FALSE 0.193 43.000 0.000 NA   NA
 336718 336719 PSPTO3765 PSPTO3766 sbcD sbcC TRUE 0.999 -3.000 0.669 0.001 N NA
 336719 336720 PSPTO3766 PSPTO3767 sbcC   FALSE 0.020 226.000 0.000 NA   NA
 336721 336722 PSPTO3768 PSPTO3769     TRUE 0.551 80.000 0.125 NA   NA
 336722 336723 PSPTO3769 PSPTO3770     FALSE 0.109 93.000 0.000 NA   NA
 336723 336724 PSPTO3770 PSPTO3771     TRUE 0.592 80.000 0.143 1.000   NA
 336725 336726 PSPTO3772 PSPTO3773     FALSE 0.367 115.000 0.069 1.000 N NA
 336726 336727 PSPTO3773 PSPTO3774     FALSE 0.005 337.000 0.000 NA   NA
 336727 336728 PSPTO3774 PSPTO3775     TRUE 0.732 7.000 0.000 NA   NA
 336728 336729 PSPTO3775 PSPTO3776     FALSE 0.001 633.000 0.000 NA   NA
 336730 336731 PSPTO3777 PSPTO3778     TRUE 0.957 28.000 0.409 0.056   NA
 336731 336732 PSPTO3778 PSPTO3779     FALSE 0.116 232.000 0.091 NA   NA
 336732 336733 PSPTO3779 PSPTO3780     FALSE 0.002 521.000 0.000 NA   NA
 336733 336734 PSPTO3780 PSPTO3781     TRUE 0.960 12.000 0.244 NA   NA
 336734 336735 PSPTO3781 PSPTO3782     TRUE 0.888 52.000 0.470 NA   NA
 336735 336736 PSPTO3782 PSPTO3783     TRUE 0.901 32.000 0.379 NA   NA
 336736 336737 PSPTO3783 PSPTO3784     TRUE 0.997 -3.000 0.455 NA   NA
 336737 336738 PSPTO3784 PSPTO3785     FALSE 0.143 88.000 0.000 1.000   NA
 336738 336739 PSPTO3785 PSPTO3786     FALSE 0.391 31.000 0.013 NA   NA
 336739 336740 PSPTO3786 PSPTO3787     TRUE 0.981 27.000 0.911 NA   NA
 336740 336741 PSPTO3787 PSPTO3788   pepN FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 336741 336742 PSPTO3788 PSPTO3789 pepN   TRUE 0.861 13.000 0.059 NA   NA
 336742 336743 PSPTO3789 PSPTO3790     TRUE 0.791 30.000 0.168 NA   NA
 336743 336744 PSPTO3790 PSPTO3791     TRUE 0.754 29.000 0.124 NA   NA
 336744 336745 PSPTO3791 PSPTO3792     TRUE 0.902 15.000 0.131 1.000   NA
 336745 336746 PSPTO3792 PSPTO3793   ppnK TRUE 0.971 0.000 0.045 1.000   NA
 336747 336748 PSPTO3794 PSPTO3795     FALSE 0.038 186.000 0.000 NA   NA
 336751 336752 PSPTO3798 PSPTO3799 arsB fsr TRUE 0.969 0.000 0.000 0.055 N NA
 336752 336753 PSPTO3799 PSPTO3800 fsr   FALSE 0.001 632.000 0.000 1.000 N NA
 336753 336754 PSPTO3800 PSPTO3801     FALSE 0.016 259.000 0.000 1.000   NA
 336754 336755 PSPTO3801 PSPTO3802     FALSE 0.241 148.000 0.000 0.062   NA
 336755 336756 PSPTO3802 PSPTO3803   fadH TRUE 0.785 26.000 0.040 0.058 N NA
 336757 336758 PSPTO3804 PSPTO3805     TRUE 0.981 3.000 0.154 1.000   NA
 336758 336759 PSPTO3805 PSPTO3806   ilvA-1 FALSE 0.002 558.000 0.000 1.000 N NA
 336760 336761 PSPTO3807 PSPTO3808     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 336761 401668 PSPTO3808 PSPTO_t46   tRNA-Asp-1 FALSE 0.103 99.000 0.000 NA   NA
 401668 401667 PSPTO_t46 PSPTO_t47 tRNA-Asp-1 tRNA-Asp-2 FALSE 0.090 115.000 0.000 NA   NA
 401667 401666 PSPTO_t47 PSPTO_t48 tRNA-Asp-2 tRNA-Val-3 FALSE 0.140 69.000 0.000 NA   NA
 401666 336762 PSPTO_t48 PSPTO3809 tRNA-Val-3   FALSE 0.058 162.000 0.000 NA   NA
 336762 336763 PSPTO3809 PSPTO3810   metZ FALSE 0.297 90.000 0.033 1.000 N NA
 336763 336764 PSPTO3810 PSPTO3811 metZ purF TRUE 0.841 21.000 0.153 1.000 N NA
 336764 336765 PSPTO3811 PSPTO3812 purF   TRUE 0.961 13.000 0.262 1.000   NA
 336765 336766 PSPTO3812 PSPTO3813     FALSE 0.442 119.000 0.116 NA   NA
 336766 336767 PSPTO3813 PSPTO3814   folC TRUE 0.950 -16.000 0.216 NA   NA
 336767 336768 PSPTO3814 PSPTO3815 folC accD TRUE 0.996 -3.000 0.383 1.000 N NA
 336768 336769 PSPTO3815 PSPTO3816 accD trpF FALSE 0.023 253.000 0.007 1.000 N NA
 336769 3829848 PSPTO3816 PSPTO_3817 trpF truA TRUE 0.630 61.000 0.139 1.000 N NA
 3829848 336770 PSPTO_3817 PSPTO3818 truA   FALSE 0.179 161.000 0.035 1.000 N NA
 336770 336771 PSPTO3818 PSPTO3819   asd-2 FALSE 0.187 110.000 0.017 1.000 N NA
 336771 336772 PSPTO3819 PSPTO3820 asd-2   FALSE 0.117 86.000 0.000 NA   NA
 336772 336773 PSPTO3820 PSPTO3821     TRUE 0.747 20.000 0.062 NA   NA
 336773 336774 PSPTO3821 PSPTO3822     TRUE 0.507 127.000 0.167 NA   NA
 336774 336775 PSPTO3822 PSPTO3823     FALSE 0.095 120.000 0.000 1.000 N NA
 336776 336777 PSPTO3824 PSPTO3825   pilZ TRUE 0.858 15.000 0.089 NA N NA
 336777 336778 PSPTO3825 PSPTO3826 pilZ holB TRUE 0.888 35.000 0.382 NA N NA
 336778 336779 PSPTO3826 PSPTO3827 holB tmk TRUE 0.985 -7.000 0.211 0.092 N NA
 336779 336780 PSPTO3827 PSPTO3828 tmk   TRUE 0.886 20.000 0.209 NA   NA
 336780 336781 PSPTO3828 PSPTO3829   pabC TRUE 0.982 4.000 0.204 NA   NA
 336781 336782 PSPTO3829 PSPTO3830 pabC fabF TRUE 0.989 0.000 0.187 1.000 N NA
 336782 336783 PSPTO3830 PSPTO3831 fabF acpP TRUE 0.864 114.000 0.346 1.000 Y NA
 336783 336784 PSPTO3831 PSPTO3832 acpP fabG TRUE 0.800 193.000 0.321 0.003 Y NA
 336784 336785 PSPTO3832 PSPTO3833 fabG fabD TRUE 0.993 16.000 0.432 0.003 Y NA
 336785 336786 PSPTO3833 PSPTO3834 fabD plsX TRUE 0.821 117.000 0.106 0.003 Y NA
 336786 336787 PSPTO3834 PSPTO3835 plsX rpmF TRUE 0.905 35.000 0.418 1.000 N NA
 336787 336788 PSPTO3835 PSPTO3836 rpmF   TRUE 0.985 14.000 0.599 NA   NA
 336790 336791 PSPTO3838 PSPTO3839 sppA   TRUE 0.819 24.000 0.134 1.000   NA
 336791 5937147 PSPTO3839 PSPTO_3840   rluC TRUE 0.984 -10.000 0.389 1.000   NA
 336793 336794 PSPTO3842 PSPTO3843 murB kdsB TRUE 0.714 35.000 0.005 1.000 Y NA
 336794 336795 PSPTO3843 PSPTO3844 kdsB   TRUE 0.993 -3.000 0.265 NA   NA
 336795 336796 PSPTO3844 PSPTO3845   lpxK TRUE 0.922 18.000 0.263 NA   NA
 336796 336797 PSPTO3845 PSPTO3846 lpxK   TRUE 0.982 0.000 0.096 1.000 N NA
 336797 336798 PSPTO3846 PSPTO3847     TRUE 1.000 -3.000 0.746 0.074 Y NA
 336798 336799 PSPTO3847 PSPTO3848     FALSE 0.308 116.000 0.045 1.000   NA
 336800 336801 PSPTO3849 PSPTO3850     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336801 336802 PSPTO3850 PSPTO3851     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336802 336803 PSPTO3851 PSPTO3852     TRUE 0.485 -36.000 0.000 NA   NA
 336803 336804 PSPTO3852 PSPTO3853     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336805 336806 PSPTO3854 PSPTO3855     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.091 N NA
 336806 336807 PSPTO3855 PSPTO3856     FALSE 0.159 168.000 0.039 NA N NA
 336808 336809 PSPTO3857 PSPTO3858     TRUE 0.503 77.000 0.090 NA   NA
 336809 336810 PSPTO3858 PSPTO3859     FALSE 0.033 194.000 0.000 NA   NA
 336816 336817 PSPTO3865 PSPTO3866     TRUE 0.842 -7.000 0.012 NA   NA
 336817 336818 PSPTO3866 PSPTO3867     TRUE 0.993 -10.000 0.667 NA   NA
 336818 336819 PSPTO3867 PSPTO3868     TRUE 0.971 0.000 0.051 NA   NA
 336819 336820 PSPTO3868 PSPTO3869     TRUE 0.717 -16.000 0.012 NA   NA
 336821 336822 PSPTO3870 PSPTO3871   htrB TRUE 0.657 33.000 0.069 1.000   NA
 336823 336824 PSPTO3872 PSPTO3873 minC minD TRUE 0.648 230.000 0.466 1.000 Y NA
 336824 336825 PSPTO3873 PSPTO3874 minD minE TRUE 0.999 0.000 0.618 NA Y NA
 336825 3829849 PSPTO3874 PSPTO_3875 minE rluA FALSE 0.197 91.000 0.018 NA N NA
 3829849 336826 PSPTO_3875 PSPTO3876 rluA   FALSE 0.010 372.000 0.022 1.000 N NA
 336828 336829 PSPTO3878 PSPTO3879     TRUE 0.961 21.000 0.500 1.000   NA
 336829 336830 PSPTO3879 PSPTO3880     TRUE 0.994 -3.000 0.290 1.000   NA
 336830 336831 PSPTO3880 PSPTO3881     TRUE 0.996 -13.000 0.774 0.062   NA
 336831 336832 PSPTO3881 PSPTO3882     TRUE 0.998 2.000 0.360 0.062 Y NA
 336832 336833 PSPTO3882 PSPTO3883     TRUE 0.730 154.000 0.222 1.000 Y NA
 336835 336836 PSPTO3885 PSPTO3886 prc   FALSE 0.213 134.000 0.029 1.000 N NA
 336837 336838 PSPTO3887 PSPTO3888     TRUE 0.996 3.000 0.562 NA   NA
 336838 336839 PSPTO3888 PSPTO3889     TRUE 0.831 101.000 0.500 NA   NA
 336839 336840 PSPTO3889 PSPTO3890     FALSE 0.003 440.000 0.000 NA   NA
 336840 336841 PSPTO3890 PSPTO3891     FALSE 0.027 207.000 0.000 NA   NA
 336843 336844 PSPTO3893 PSPTO3894     FALSE 0.129 57.000 0.000 NA N NA
 336844 336845 PSPTO3894 PSPTO3895     FALSE 0.089 123.000 0.000 NA   NA
 401665 401664 PSPTO_t49 PSPTO_t50 tRNA-Asp-3 tRNA-Val-4 FALSE 0.346 21.000 0.000 NA   NA
 336847 336848 PSPTO3897 PSPTO3898     FALSE 0.459 89.000 0.074 1.000   NA
 336851 336852 PSPTO3901 PSPTO3902   cysK FALSE 0.115 178.000 0.025 1.000 N NA
 336855 336856 PSPTO3905 PSPTO3906     TRUE 0.898 40.000 0.431 NA   NA
 336856 336857 PSPTO3906 PSPTO3907     FALSE 0.056 166.000 0.000 NA   NA
 336858 336859 PSPTO3908 PSPTO3909     TRUE 0.502 47.000 0.053 NA   NA
 336859 336860 PSPTO3909 PSPTO3910     FALSE 0.384 77.000 0.048 NA   NA
 336861 336862 PSPTO3911 PSPTO3912     FALSE 0.246 127.000 0.040 NA N NA
 336862 336863 PSPTO3912 PSPTO3913     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 336863 336864 PSPTO3913 PSPTO3914     FALSE 0.010 296.000 0.000 1.000   NA
 336864 336865 PSPTO3914 PSPTO3915     FALSE 0.405 105.000 0.000 0.001 N NA
 336865 336866 PSPTO3915 PSPTO3916     FALSE 0.141 73.000 0.000 1.000 N NA
 336866 336867 PSPTO3916 PSPTO3917     FALSE 0.257 109.000 0.034 NA   NA
 336870 336871 PSPTO3920 PSPTO3921     FALSE 0.137 71.000 0.000 NA   NA
 336871 336872 PSPTO3921 PSPTO3922   rnd TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336872 336873 PSPTO3922 PSPTO3923 rnd   FALSE 0.052 207.000 0.006 1.000   NA
 336873 336874 PSPTO3923 PSPTO3924   sfcA FALSE 0.024 233.000 0.000 1.000   NA
 336874 336875 PSPTO3924 PSPTO3925 sfcA   FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 336875 10692097 PSPTO3925 PSPTO_3926     FALSE 0.017 241.000 0.000 NA   NA
 10692097 336876 PSPTO_3926 PSPTO3927     FALSE 0.097 105.000 0.000 NA   NA
 336876 336877 PSPTO3927 PSPTO3929     FALSE 0.004 833.000 0.000 0.063   NA
 336877 336878 PSPTO3929 PSPTO3930     TRUE 0.862 3.000 0.000 1.000   NA
 336880 336881 PSPTO3932 PSPTO3933     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 336881 336882 PSPTO3933 PSPTO3934     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 336882 336883 PSPTO3934 PSPTO3935     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 336883 336884 PSPTO3935 PSPTO3936     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 336884 336885 PSPTO3936 PSPTO3937     FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 336885 336886 PSPTO3937 PSPTO3938     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336886 10692098 PSPTO3938 PSPTO_3939     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 10692098 10692099 PSPTO_3939 PSPTO_3941     FALSE 0.001 626.000 0.000 NA   NA
 336887 336888 PSPTO3942 PSPTO3943     FALSE 0.191 44.000 0.000 NA   NA
 336888 336889 PSPTO3943 PSPTO3944     TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 336889 336890 PSPTO3944 PSPTO3945     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336890 336891 PSPTO3945 PSPTO3946     FALSE 0.113 89.000 0.000 NA   NA
 336891 336892 PSPTO3946 PSPTO3947     TRUE 0.944 -10.000 0.125 NA   NA
 336892 336893 PSPTO3947 PSPTO3948     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 336894 401663 PSPTO3949 PSPTO_t51   tRNA-Ser-4 FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 401663 336895 PSPTO_t51 PSPTO3950 tRNA-Ser-4 purC FALSE 0.110 92.000 0.000 NA   NA
 336895 336896 PSPTO3950 PSPTO3951 purC   TRUE 0.501 29.000 0.021 1.000   NA
 336896 336897 PSPTO3951 PSPTO3952     TRUE 0.938 1.000 0.022 NA   NA
 336897 336898 PSPTO3952 PSPTO3953   dapA TRUE 0.917 19.000 0.088 NA Y NA
 336899 336900 PSPTO3954 PSPTO3955     TRUE 0.934 10.000 0.102 NA N NA
 336901 336902 PSPTO3956 PSPTO3957     TRUE 0.716 33.000 0.121 NA   NA
 336905 336906 PSPTO3960 PSPTO3961 pglA   FALSE 0.008 295.000 0.000 NA   NA
 336906 336907 PSPTO3961 PSPTO3962     FALSE 0.027 207.000 0.000 NA   NA
 336909 336910 PSPTO3965 PSPTO3966     FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 401662 336911 PSPTO_t52 PSPTO3968 tRNA-Lys-2 exsB FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 336911 336912 PSPTO3968 PSPTO3969 exsB   TRUE 0.972 11.000 0.270 1.000   NA
 336912 336913 PSPTO3969 PSPTO3970     FALSE 0.223 172.000 0.059 1.000   NA
 336913 336914 PSPTO3970 PSPTO3971   pal TRUE 0.983 7.000 0.278 1.000   NA
 336914 336915 PSPTO3971 PSPTO3972 pal tolB TRUE 0.921 53.000 0.592 1.000 N NA
 336915 336916 PSPTO3972 PSPTO3973 tolB tolA TRUE 0.996 -3.000 0.215 0.006   NA
 336916 336917 PSPTO3973 PSPTO3974 tolA tolR-2 TRUE 0.998 0.000 0.460 0.095   NA
 336917 336918 PSPTO3974 PSPTO3975 tolR-2 tolQ-2 TRUE 0.995 15.000 0.556 0.073 Y NA
 336918 336919 PSPTO3975 PSPTO3976 tolQ-2   TRUE 0.992 -10.000 0.593 1.000   NA
 336919 336920 PSPTO3976 PSPTO3977   ruvB FALSE 0.382 135.000 0.082 1.000   NA
 336920 336921 PSPTO3977 PSPTO3978 ruvB ruvA TRUE 0.961 124.000 0.549 0.001 Y NA
 336921 336922 PSPTO3978 PSPTO3979 ruvA ruvC TRUE 0.944 109.000 0.451 0.009 Y NA
 336922 336923 PSPTO3979 PSPTO3980 ruvC   TRUE 0.643 131.000 0.277 NA   NA
 336923 336924 PSPTO3980 PSPTO3981   aspS FALSE 0.267 115.000 0.039 NA   NA
 336924 336925 PSPTO3981 PSPTO3982 aspS   FALSE 0.009 285.000 0.000 NA   NA
 336925 336926 PSPTO3982 PSPTO3983     FALSE 0.005 447.000 0.014 NA   NA
 336928 336929 PSPTO3985 PSPTO3986     TRUE 0.964 -3.000 0.035 NA   NA
 336930 336931 PSPTO3987 PSPTO3988 oprD proS FALSE 0.059 177.000 0.000 1.000   NA
 336931 336932 PSPTO3988 PSPTO3989 proS   FALSE 0.251 67.000 0.013 NA   NA
 401651 401652 PSPTO_t53 PSPTO_t54 tRNA-Met-3 tRNA-Met-4 FALSE 0.035 192.000 0.000 NA   NA
 401652 336934 PSPTO_t54 PSPTO3991 tRNA-Met-4   FALSE 0.005 351.000 0.000 NA   NA
 336934 336935 PSPTO3991 PSPTO3992     TRUE 0.988 0.000 0.176 NA   NA
 336937 336938 PSPTO3994 PSPTO3995     FALSE 0.002 569.000 0.000 NA   NA
 336939 336940 PSPTO3996 PSPTO3997     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 336941 336942 PSPTO3998 PSPTO3999     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 336943 10692100 PSPTO4001 PSPTO_4002 avrPto(DC3000)   FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 10692100 336944 PSPTO_4002 PSPTO4003     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336944 336945 PSPTO4003 PSPTO4004     TRUE 0.997 -3.000 0.529 NA   NA
 336947 336948 PSPTO4006 PSPTO4007     TRUE 0.699 9.000 0.000 NA   NA
 336948 336949 PSPTO4007 PSPTO4008     FALSE 0.158 58.000 0.000 NA   NA
 336949 336950 PSPTO4008 PSPTO4009   cro TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336952 336953 PSPTO4011 PSPTO4012     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 336954 336955 PSPTO4013 PSPTO4014     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 336956 336957 PSPTO4015 PSPTO4016     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 336957 336958 PSPTO4016 PSPTO4017     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336958 336959 PSPTO4017 PSPTO4018     FALSE 0.003 454.000 0.000 NA   NA
 336960 336961 PSPTO4019 PSPTO4020     FALSE 0.395 103.000 0.009 0.057   NA
 336961 336962 PSPTO4020 PSPTO4021     TRUE 0.546 94.000 0.139 1.000   NA
 336962 336963 PSPTO4021 PSPTO4022     FALSE 0.357 82.000 0.043 NA   NA
 336963 336964 PSPTO4022 PSPTO4023     TRUE 0.803 -13.000 0.025 NA   NA
 336967 336968 PSPTO4026 PSPTO4027 dgkA   TRUE 0.757 84.000 0.316 1.000 N NA
 336968 336969 PSPTO4027 PSPTO4028     FALSE 0.125 80.000 0.000 NA   NA
 336969 336970 PSPTO4028 PSPTO4029     FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 336971 336972 PSPTO4030 PSPTO4031     FALSE 0.110 192.000 0.036 NA   NA
 336973 336974 PSPTO4032 PSPTO4033 recX recA TRUE 0.956 15.000 0.296 1.000   NA
 336974 336975 PSPTO4033 PSPTO4034 recA   FALSE 0.436 94.000 0.082 NA   NA
 336977 336978 PSPTO4036 PSPTO4037     FALSE 0.289 27.000 0.000 NA   NA
 336978 336979 PSPTO4037 PSPTO4038     FALSE 0.125 80.000 0.000 NA   NA
 336979 336980 PSPTO4038 PSPTO4039     FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 336980 336981 PSPTO4039 PSPTO4040     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336981 336982 PSPTO4040 PSPTO4041     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336982 336983 PSPTO4041 PSPTO4042     TRUE 0.996 0.000 0.417 NA   NA
 336983 336984 PSPTO4042 PSPTO4043     TRUE 0.988 3.000 0.250 NA   NA
 336984 336985 PSPTO4043 PSPTO4044     TRUE 0.996 0.000 0.400 NA   NA
 336985 336986 PSPTO4044 PSPTO4045     FALSE 0.265 29.000 0.000 NA   NA
 336986 336987 PSPTO4045 PSPTO4046     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336987 336988 PSPTO4046 PSPTO4047     FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 336988 336989 PSPTO4047 PSPTO4048     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 336989 336990 PSPTO4048 PSPTO4049     FALSE 0.392 18.000 0.000 NA   NA
 336990 336991 PSPTO4049 PSPTO4050     FALSE 0.069 147.000 0.000 NA   NA
 336992 336993 PSPTO4051 PSPTO4052     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 336995 336996 PSPTO4054 PSPTO4055     FALSE 0.026 209.000 0.000 NA   NA
 336996 336997 PSPTO4055 PSPTO4056     FALSE 0.175 49.000 0.000 NA   NA
 336997 336998 PSPTO4056 PSPTO4057     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 336998 336999 PSPTO4057 PSPTO4058   mutS TRUE 0.639 51.000 0.003 1.000 Y NA
 336999 337000 PSPTO4058 PSPTO4059 mutS fdxA FALSE 0.036 247.000 0.020 1.000 N NA
 337001 337002 PSPTO4060 PSPTO4061     FALSE 0.139 75.000 0.000 1.000 N NA
 337003 337004 PSPTO4062 PSPTO4063   dctA-2 TRUE 0.492 103.000 0.125 1.000 N NA
 337007 337008 PSPTO4066 PSPTO4067     FALSE 0.163 55.000 0.000 NA   NA
 337009 337010 PSPTO4068 PSPTO4069     FALSE 0.228 34.000 0.000 NA   NA
 337010 337011 PSPTO4069 PSPTO4070     FALSE 0.117 86.000 0.000 NA   NA
 337012 337013 PSPTO4071 PSPTO4072     FALSE 0.104 98.000 0.000 NA   NA
 337013 337014 PSPTO4072 PSPTO4073   fmdA TRUE 0.809 106.000 0.478 NA   NA
 337014 337015 PSPTO4073 PSPTO4074 fmdA   TRUE 0.685 125.000 0.312 1.000 N NA
 337015 337016 PSPTO4074 PSPTO4075     TRUE 0.995 11.000 0.600 0.016   NA
 337016 337017 PSPTO4075 PSPTO4076     TRUE 0.998 -3.000 0.639 1.000   NA
 337017 337018 PSPTO4076 PSPTO4077     TRUE 0.999 11.000 0.888 0.060 Y NA
 337018 337019 PSPTO4077 PSPTO4078     TRUE 0.871 118.000 0.367 1.000 Y NA
 337020 337021 PSPTO4079 PSPTO4080     TRUE 0.963 -13.000 0.119 0.018 N NA
 10692101 337029 PSPTO_4088 PSPTO4089     TRUE 0.523 14.000 0.000 NA   NA
 337029 337030 PSPTO4089 PSPTO4090   ppiA TRUE 0.606 150.000 0.286 1.000   NA
 337030 337031 PSPTO4090 PSPTO4091 ppiA   TRUE 0.560 102.000 0.171 1.000 N NA
 337032 337033 PSPTO4092 PSPTO4093     FALSE 0.204 40.000 0.000 NA   NA
 337033 337034 PSPTO4093 PSPTO4094     FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 337034 337035 PSPTO4094 PSPTO4095   hrpA FALSE 0.058 241.000 0.036 1.000 N NA
 337037 337038 PSPTO4097 PSPTO4098 fadD-1 fadD-2 FALSE 0.083 356.000 0.000 0.000 Y NA
 337038 337039 PSPTO4098 PSPTO4099 fadD-2   FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 337040 337041 PSPTO4100 PSPTO4101   hopPmaH(Pto) FALSE 0.038 173.000 0.000 NA N NA
 337041 337042 PSPTO4101 PSPTO4102 hopPmaH(Pto)   FALSE 0.010 275.000 0.000 NA   NA
 337048 337049 PSPTO4108 PSPTO4109     FALSE 0.132 226.000 0.000 1.000 Y NA
 337049 337050 PSPTO4109 PSPTO4110     TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.060 Y NA
 337050 337051 PSPTO4110 PSPTO4111     TRUE 0.999 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 337051 337052 PSPTO4111 PSPTO4112     TRUE 1.000 1.000 0.967 0.016 Y NA
 337052 337053 PSPTO4112 PSPTO4113     FALSE 0.030 285.000 0.034 NA   NA
 337053 337054 PSPTO4113 PSPTO4114     FALSE 0.202 97.000 0.017 NA   NA
 337055 337056 PSPTO4115 PSPTO4116   pdxH FALSE 0.071 148.000 0.000 1.000 N NA
 337056 337057 PSPTO4116 PSPTO4117 pdxH   FALSE 0.027 274.000 0.023 1.000 N NA
 337059 337060 PSPTO4119 PSPTO4120 estC   FALSE 0.187 111.000 0.017 1.000 N NA
 337061 337062 PSPTO4121 PSPTO4122   tsk FALSE 0.014 268.000 0.000 1.000   NA
 337062 337063 PSPTO4122 PSPTO4123 tsk   TRUE 0.805 27.000 0.167 NA N NA
 337064 337065 PSPTO4124 PSPTO4125     TRUE 0.955 -7.000 0.106 NA   NA
 337066 337067 PSPTO4126 PSPTO4127     TRUE 0.992 4.000 0.407 NA   NA
 337068 337069 PSPTO4128 PSPTO4129     FALSE 0.091 113.000 0.000 NA   NA
 337071 337072 PSPTO4131 PSPTO4132     FALSE 0.087 128.000 0.000 NA   NA
 337073 337074 PSPTO4133 PSPTO4134     FALSE 0.003 405.000 0.000 NA   NA
 337074 337075 PSPTO4134 PSPTO4135     TRUE 0.999 -3.000 0.751 NA N NA
 337075 337076 PSPTO4135 PSPTO4136     FALSE 0.005 344.000 0.000 1.000 N NA
 337076 337077 PSPTO4136 PSPTO4137     TRUE 0.873 97.000 0.200 0.060 Y NA
 337077 337078 PSPTO4137 PSPTO4138     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.010 Y NA
 337078 337079 PSPTO4138 PSPTO4139     TRUE 0.947 13.000 0.200 1.000   NA
 337079 337080 PSPTO4139 PSPTO4140     TRUE 0.992 10.000 0.571 1.000   NA
 337080 337081 PSPTO4140 PSPTO4141     FALSE 0.018 378.000 0.008 0.089   NA
 337081 337082 PSPTO4141 PSPTO4142     TRUE 0.997 -3.000 0.460 1.000   NA
 337083 337084 PSPTO4143 PSPTO4144     FALSE 0.169 113.000 0.014 NA   NA
 337087 337088 PSPTO4147 PSPTO4148 metG   FALSE 0.163 131.000 0.014 1.000 N NA
 337088 337089 PSPTO4148 PSPTO4149   nth TRUE 0.972 -3.000 0.048 1.000 N NA
 337090 337091 PSPTO4150 PSPTO4151     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 337092 337093 PSPTO4152 PSPTO4153     FALSE 0.001 869.000 0.000 1.000   NA
 337093 337094 PSPTO4153 PSPTO4154     FALSE 0.005 342.000 0.000 NA   NA
 337095 337096 PSPTO4155 PSPTO4156 argG   FALSE 0.167 121.000 0.013 1.000 N NA
 337097 337098 PSPTO4157 PSPTO4158   rnt TRUE 0.979 -3.000 0.068 1.000 N NA
 337098 337099 PSPTO4158 PSPTO4159 rnt   FALSE 0.060 184.000 0.009 NA N NA
 337099 337100 PSPTO4159 PSPTO4160   bfr TRUE 0.607 201.000 0.286 NA Y NA
 337101 337102 PSPTO4161 PSPTO4162     FALSE 0.323 89.000 0.039 1.000 N NA
 337102 337103 PSPTO4162 PSPTO4163     FALSE 0.447 55.000 0.048 NA   NA
 337104 337105 PSPTO4164 PSPTO4165 argF   TRUE 0.971 6.000 0.025 1.000 Y NA
 337107 337108 PSPTO4167 PSPTO4168 glpF glpK FALSE 0.473 30.000 0.023 1.000 N NA
 337108 337109 PSPTO4168 PSPTO4169 glpK glpR FALSE 0.327 111.000 0.055 1.000 N NA
 337109 337110 PSPTO4169 PSPTO4170 glpR glpD FALSE 0.003 592.000 0.016 1.000 N NA
 337110 337111 PSPTO4170 PSPTO4171 glpD   FALSE 0.005 356.000 0.000 1.000 N NA
 337111 337112 PSPTO4171 PSPTO4172     TRUE 0.760 131.000 0.083 0.060 Y NA
 337112 337113 PSPTO4172 PSPTO4173     TRUE 1.000 0.000 0.933 0.010 Y NA
 337113 337114 PSPTO4173 PSPTO4174     TRUE 0.995 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 337114 337115 PSPTO4174 PSPTO4175     TRUE 0.738 59.000 0.129 0.089 N NA
 337115 337116 PSPTO4175 PSPTO4176     TRUE 0.997 11.000 0.613 0.089 Y NA
 337117 337118 PSPTO4177 PSPTO4178     FALSE 0.359 54.000 0.028 NA   NA
 337118 337119 PSPTO4178 PSPTO4179   metE FALSE 0.063 186.000 0.007 NA   NA
 337121 337122 PSPTO4181 PSPTO4182     TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000 N NA
 337122 337123 PSPTO4182 PSPTO4183   rpmE-1 FALSE 0.069 152.000 0.000 1.000 N NA
 337124 337125 PSPTO4184 PSPTO4185     FALSE 0.335 22.000 0.000 NA   NA
 337125 337126 PSPTO4185 PSPTO4186     FALSE 0.106 96.000 0.000 NA   NA
 337128 337129 PSPTO4188 PSPTO4189     FALSE 0.044 179.000 0.000 NA   NA
 337131 337132 PSPTO4191 PSPTO4192     FALSE 0.236 79.000 0.014 1.000 N NA
 337132 337133 PSPTO4192 PSPTO4193     TRUE 0.991 -3.000 0.223 NA N NA
 337134 337135 PSPTO4194 PSPTO4195     FALSE 0.240 71.000 0.013 NA   NA
 337137 337138 PSPTO4197 PSPTO4198     TRUE 0.994 -3.000 0.303 NA   NA
 337138 337139 PSPTO4198 PSPTO4199     TRUE 0.999 -3.000 0.788 NA   NA
 337139 337140 PSPTO4199 PSPTO4200     TRUE 0.740 23.000 0.071 NA   NA
 337140 337141 PSPTO4200 PSPTO4201     TRUE 0.995 32.000 1.000 0.037 Y NA
 337141 337142 PSPTO4201 PSPTO4202     TRUE 0.944 11.000 0.150 1.000 N NA
 337142 337143 PSPTO4202 PSPTO4203     TRUE 0.781 28.000 0.138 1.000 N NA
 337143 337144 PSPTO4203 PSPTO4204     FALSE 0.360 125.000 0.069 1.000 N NA
 337146 337147 PSPTO4206 PSPTO4207     TRUE 0.998 0.000 0.619 NA   NA
 337147 337148 PSPTO4207 PSPTO4208     TRUE 0.800 4.000 0.000 NA   NA
 337148 337149 PSPTO4208 PSPTO4209     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 337150 337151 PSPTO4210 PSPTO4211 lon-2   FALSE 0.095 208.000 0.041 NA   NA
 337151 337152 PSPTO4211 PSPTO4212     FALSE 0.214 101.000 0.021 NA   NA
 337152 337153 PSPTO4212 PSPTO4213     TRUE 0.994 -3.000 0.315 NA   NA
 337154 337155 PSPTO4214 PSPTO4215 pdxJ recO TRUE 0.658 63.000 0.166 1.000 N NA
 337155 337156 PSPTO4215 PSPTO4216 recO era TRUE 0.606 61.000 0.109 1.000   NA
 337156 337157 PSPTO4216 PSPTO4217 era rnc TRUE 0.980 -7.000 0.127 0.045   NA
 337157 337158 PSPTO4217 PSPTO4218 rnc   TRUE 0.962 -3.000 0.033 NA   NA
 337158 337159 PSPTO4218 PSPTO4219   lepB FALSE 0.468 117.000 0.133 NA   NA
 337159 337160 PSPTO4219 PSPTO4220 lepB lepA TRUE 0.964 10.000 0.187 1.000   NA
 337160 337161 PSPTO4220 PSPTO4221 lepA   FALSE 0.097 181.000 0.020 1.000 N NA
 337161 337162 PSPTO4221 PSPTO4222   mucB FALSE 0.017 286.000 0.017 NA N NA
 337162 337163 PSPTO4222 PSPTO4223 mucB mucA TRUE 0.998 9.000 0.856 NA Y NA
 337163 337164 PSPTO4223 PSPTO4224 mucA rpoE TRUE 0.957 34.000 0.705 NA N NA
 337166 337167 PSPTO4226 PSPTO4227     TRUE 0.785 -16.000 0.027 NA   NA
 337168 337169 PSPTO4228 PSPTO4229     FALSE 0.247 114.000 0.034 NA   NA
 337170 337171 PSPTO4230 PSPTO4231   tctD TRUE 0.988 -7.000 0.163 1.000 Y NA
 337172 337173 PSPTO4232 PSPTO4233     TRUE 0.776 63.000 0.277 NA   NA
 337173 337174 PSPTO4233 PSPTO4234     TRUE 0.998 2.000 0.857 NA   NA
 337174 337175 PSPTO4234 PSPTO4235     TRUE 0.989 -7.000 0.429 NA   NA
 337176 337177 PSPTO4236 PSPTO4237 ung   FALSE 0.042 181.000 0.000 NA   NA
 337178 337179 PSPTO4238 PSPTO4239     TRUE 0.986 28.000 0.719 NA Y NA
 337179 337180 PSPTO4239 PSPTO4240     TRUE 0.997 -3.000 0.220 1.000 Y NA
 337180 337181 PSPTO4240 PSPTO4241     TRUE 0.985 -3.000 0.118 NA   NA
 337181 337182 PSPTO4241 PSPTO4242     TRUE 0.995 12.000 0.931 NA   NA
 337182 337183 PSPTO4242 PSPTO4243     TRUE 0.918 110.000 0.835 NA   NA
 337183 337184 PSPTO4243 PSPTO4244     TRUE 0.908 36.000 0.437 1.000 N NA
 337184 337185 PSPTO4244 PSPTO4245     FALSE 0.092 111.000 0.000 NA   NA
 337185 337186 PSPTO4245 PSPTO4246     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 337186 3829850 PSPTO4246 PSPTO_4247   rsuA TRUE 0.699 60.000 0.189 NA   NA
 3829850 337187 PSPTO_4247 PSPTO4248 rsuA phaG-2 FALSE 0.008 297.000 0.000 NA   NA
 337187 401653 PSPTO4248 PSPTO_t55 phaG-2 tRNA-Gly-5 FALSE 0.002 576.000 0.000 NA   NA
 337189 337190 PSPTO4251 PSPTO4252     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 337190 337191 PSPTO4252 PSPTO4253     FALSE 0.001 834.000 0.000 NA   NA
 337192 337193 PSPTO4254 PSPTO4255 gor-2   FALSE 0.003 453.000 0.000 NA   NA
 337193 337194 PSPTO4255 PSPTO4256     FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 337194 337195 PSPTO4256 PSPTO4257     FALSE 0.318 29.000 0.000 1.000   NA
 337195 337196 PSPTO4257 PSPTO4258     FALSE 0.115 111.000 0.000 1.000   NA
 337196 337197 PSPTO4258 PSPTO4259   kefC TRUE 0.997 1.000 0.560 1.000   NA
 337198 337199 PSPTO4260 PSPTO4261 trxA   TRUE 0.485 65.000 0.000 0.004 N NA
 337199 337200 PSPTO4261 PSPTO4262     TRUE 0.953 4.000 0.059 1.000 N NA
 337200 337201 PSPTO4262 PSPTO4263     FALSE 0.114 94.000 0.000 1.000 N NA
 337201 337202 PSPTO4263 PSPTO4264     TRUE 0.796 90.000 0.400 1.000 N NA
 337203 337204 PSPTO4265 PSPTO4266 metC-2   FALSE 0.159 78.000 0.000 1.000   NA
 10692103 337206 PSPTO_4268 PSPTO4269     FALSE 0.140 69.000 0.000 NA   NA
 337206 337207 PSPTO4269 PSPTO4270     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 337207 10692104 PSPTO4270 PSPTO_4271     FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 337212 337213 PSPTO4277 PSPTO4278     FALSE 0.048 178.000 0.000 1.000 N NA
 337213 337214 PSPTO4278 PSPTO4279     FALSE 0.034 193.000 0.000 NA   NA
 337214 337215 PSPTO4279 PSPTO4280     TRUE 0.718 8.000 0.000 NA   NA
 337215 337216 PSPTO4280 PSPTO4281     TRUE 0.671 10.000 0.000 NA   NA
 337216 337217 PSPTO4281 PSPTO4282     FALSE 0.169 52.000 0.000 NA   NA
 337218 337219 PSPTO4283 PSPTO4284 pnlA   FALSE 0.062 157.000 0.000 NA   NA
 337219 337220 PSPTO4284 PSPTO4285   adhB TRUE 0.671 25.000 0.000 0.055   NA
 337220 337221 PSPTO4285 PSPTO4286 adhB   FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 3829851 337222 PSPTO_5625 PSPTO4287     TRUE 0.828 3.000 0.000 NA   NA
 337223 337224 PSPTO4288 PSPTO4289     TRUE 0.878 35.000 0.338 NA   NA
 337225 337226 PSPTO4290 PSPTO4291 bglX   TRUE 0.494 71.000 0.074 1.000 N NA
 337226 337227 PSPTO4291 PSPTO4292     TRUE 0.997 7.000 0.419 0.088 Y NA
 337227 337228 PSPTO4292 PSPTO4293     FALSE 0.241 226.000 0.000 0.018 Y NA
 337228 337229 PSPTO4293 PSPTO4294   hscC FALSE 0.166 168.000 0.000 0.088 N NA
 337229 337230 PSPTO4294 PSPTO4295 hscC   TRUE 0.996 6.000 0.750 1.000   NA
 337230 337231 PSPTO4295 PSPTO4296     FALSE 0.052 183.000 0.000 1.000   NA
 337231 337232 PSPTO4296 PSPTO4297     FALSE 0.002 503.000 0.000 NA   NA
 337232 337233 PSPTO4297 PSPTO4298     FALSE 0.266 139.000 0.050 NA   NA
 337236 337237 PSPTO4301 PSPTO4302     FALSE 0.002 463.000 0.000 NA   NA
 337238 337239 PSPTO4303 PSPTO4304     TRUE 0.995 4.000 0.565 1.000 N NA
 337239 337240 PSPTO4304 PSPTO4305     TRUE 0.997 -3.000 0.385 0.059 N NA
 337241 337242 PSPTO4306 PSPTO4307 pcaT catF FALSE 0.252 147.000 0.051 1.000 N NA
 337242 337243 PSPTO4307 PSPTO4308 catF catJ TRUE 0.998 0.000 0.351 1.000 Y NA
 337243 337244 PSPTO4308 PSPTO4309 catJ catI TRUE 1.000 0.000 0.739 0.000 Y NA
 337244 337245 PSPTO4309 PSPTO4310 catI pcaR FALSE 0.306 158.000 0.087 1.000 N NA
 337245 337246 PSPTO4310 PSPTO4311 pcaR   FALSE 0.001 845.000 0.000 NA   NA
 10692106 337247 PSPTO_5644 PSPTO4312     FALSE 0.028 206.000 0.000 NA   NA
 337248 337249 PSPTO4313 PSPTO4314   purU-3 TRUE 0.595 79.000 0.157 NA   NA
 337252 337253 PSPTO4317 PSPTO4318     TRUE 0.998 -3.000 0.708 NA   NA
 337253 337254 PSPTO4318 PSPTO4319     TRUE 0.930 -13.000 0.129 NA   NA
 337254 337255 PSPTO4319 PSPTO4320     TRUE 0.999 -3.000 0.955 NA   NA
 337255 337256 PSPTO4320 PSPTO4321     FALSE 0.008 298.000 0.000 NA   NA
 337256 337257 PSPTO4321 PSPTO4322     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 337257 337258 PSPTO4322 PSPTO4323     TRUE 0.968 5.000 0.118 1.000   NA
 337258 337259 PSPTO4323 PSPTO4324     FALSE 0.009 580.000 0.000 0.007   NA
 337259 337260 PSPTO4324 PSPTO4325     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 337260 337261 PSPTO4325 PSPTO4326     FALSE 0.040 184.000 0.000 NA   NA
 337261 337262 PSPTO4326 PSPTO4327     TRUE 0.971 3.000 0.091 NA   NA
 337263 337264 PSPTO4328 PSPTO4329     TRUE 0.901 48.000 0.250 NA Y NA
 337265 337266 PSPTO4330 PSPTO4331   hopPtoE FALSE 0.107 95.000 0.000 NA   NA
 337266 337267 PSPTO4331 PSPTO4332 hopPtoE   FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 337267 337268 PSPTO4332 PSPTO4333     FALSE 0.023 238.000 0.000 1.000   NA
 337268 337269 PSPTO4333 PSPTO4334     TRUE 0.990 -3.000 0.182 NA   NA
 337270 337271 PSPTO4335 PSPTO4336     FALSE 0.037 189.000 0.000 NA   NA
 10692107 337276 PSPTO_4341 PSPTO4342     FALSE 0.196 42.000 0.000 NA   NA
 337276 337277 PSPTO4342 PSPTO4343     FALSE 0.356 20.000 0.000 NA   NA
 337277 337278 PSPTO4343 PSPTO4344     TRUE 0.781 -7.000 0.000 1.000   NA
 337278 337279 PSPTO4344 PSPTO4345     FALSE 0.011 266.000 0.000 NA   NA
 337279 337280 PSPTO4345 PSPTO4346     FALSE 0.002 553.000 0.000 NA   NA
 337280 337281 PSPTO4346 PSPTO4347     FALSE 0.044 179.000 0.000 NA   NA
 337282 337283 PSPTO4348 PSPTO4349     FALSE 0.097 105.000 0.000 NA   NA
 337283 337284 PSPTO4349 PSPTO4350     TRUE 0.994 2.000 0.412 NA   NA
 337284 337285 PSPTO4350 PSPTO4351     TRUE 0.730 81.000 0.273 NA   NA
 337285 337286 PSPTO4351 PSPTO4352     TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA   NA
 337287 337288 PSPTO4353 PSPTO4354     TRUE 0.994 0.000 0.286 NA   NA
 337290 337291 PSPTO4356 PSPTO4357     TRUE 0.806 33.000 0.204 1.000 N NA
 337291 337292 PSPTO4357 PSPTO4358     TRUE 0.764 22.000 0.080 1.000 N NA
 337293 337294 PSPTO4359 PSPTO4360     FALSE 0.120 84.000 0.000 NA   NA
 337294 337295 PSPTO4360 PSPTO4361   iciA FALSE 0.306 144.000 0.066 1.000 N NA
 337296 337297 PSPTO4362 PSPTO4363   sodB FALSE 0.068 193.000 0.009 1.000   NA
 337299 337300 PSPTO4365 PSPTO4366     FALSE 0.181 176.000 0.057 NA N NA
 337300 337301 PSPTO4366 PSPTO4367     FALSE 0.209 297.000 0.436 NA N NA
 337301 337302 PSPTO4367 PSPTO4368     TRUE 0.936 61.000 0.713 NA   NA
 337302 337303 PSPTO4368 PSPTO4369     TRUE 0.979 17.000 0.620 NA   NA
 337304 337305 PSPTO4370 PSPTO4371   inaA TRUE 0.997 -3.000 0.455 NA   NA
 337305 337306 PSPTO4371 PSPTO4372 inaA   TRUE 0.997 5.000 0.833 1.000   NA
 337306 337307 PSPTO4372 PSPTO4373   colS TRUE 0.707 201.000 0.667 1.000   NA
 337307 337308 PSPTO4373 PSPTO4374 colS colR TRUE 0.989 -10.000 0.267 1.000 Y NA
 337310 337311 PSPTO4376 PSPTO4377 groEL groES TRUE 0.928 50.000 0.177 0.006 Y NA
 337311 337312 PSPTO4377 PSPTO4378 groES   FALSE 0.091 114.000 0.000 NA   NA
 337312 337313 PSPTO4378 PSPTO4379     FALSE 0.240 32.000 0.000 NA   NA
 337316 337317 PSPTO4382 PSPTO4383     TRUE 0.617 55.000 0.120 NA   NA
 337317 337318 PSPTO4383 PSPTO4384     FALSE 0.233 33.000 0.000 NA   NA
 337318 337319 PSPTO4384 PSPTO4385     FALSE 0.001 648.000 0.000 NA   NA
 337319 337320 PSPTO4385 PSPTO4386     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 337320 337321 PSPTO4386 PSPTO4387     FALSE 0.001 1037.000 0.000 NA   NA
 337321 337322 PSPTO4387 PSPTO4388     FALSE 0.001 992.000 0.000 NA   NA
 337323 337324 PSPTO4389 PSPTO4390     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 337324 337325 PSPTO4390 PSPTO4392     FALSE 0.002 576.000 0.000 NA   NA
 337325 337326 PSPTO4392 PSPTO4393     FALSE 0.193 123.000 0.021 NA   NA
 337327 337328 PSPTO4394 PSPTO4395 panE-2   TRUE 0.504 45.000 0.049 1.000 N NA
 337328 337329 PSPTO4395 PSPTO4396     TRUE 0.855 16.000 0.030 0.087   NA
 337330 337331 PSPTO4397 PSPTO4398     TRUE 0.760 -157.000 0.042 1.000 N NA
 337331 337332 PSPTO4398 PSPTO4399   argJ FALSE 0.265 58.000 0.011 1.000 N NA
 337332 337333 PSPTO4399 PSPTO4400 argJ secA FALSE 0.431 112.000 0.102 1.000 N NA
 337335 337336 PSPTO4402 PSPTO4403 lpxC ftsZ TRUE 0.477 113.000 0.134 1.000 N NA
 337336 337337 PSPTO4403 PSPTO4404 ftsZ ftsA TRUE 0.922 88.000 0.460 1.000 Y NA
 337337 337338 PSPTO4404 PSPTO4405 ftsA   TRUE 0.964 15.000 0.389 NA N NA
 337338 337339 PSPTO4405 PSPTO4406     TRUE 0.996 4.000 0.372 NA Y NA
 337339 337340 PSPTO4406 PSPTO4407   murC TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 337340 337341 PSPTO4407 PSPTO4408 murC murG TRUE 0.993 -7.000 0.283 1.000 Y NA
 337341 337342 PSPTO4408 PSPTO4409 murG ftsW TRUE 0.993 -10.000 0.647 1.000 N NA
 337342 337343 PSPTO4409 PSPTO4410 ftsW murD TRUE 0.997 -3.000 0.297 0.002 N NA
 337343 337344 PSPTO4410 PSPTO4411 murD mraY TRUE 0.999 6.000 0.647 0.003 Y NA
 337344 337345 PSPTO4411 PSPTO4412 mraY murF TRUE 0.999 0.000 0.309 0.003 Y NA
 337345 337346 PSPTO4412 PSPTO4413 murF murE TRUE 0.999 -7.000 0.569 0.001 Y NA
 337346 337347 PSPTO4413 PSPTO4414 murE   TRUE 0.993 0.000 0.073 1.000 Y NA
 337347 337348 PSPTO4414 PSPTO4415     TRUE 0.987 0.000 0.153 1.000 N NA
 337348 337349 PSPTO4415 PSPTO4416     TRUE 0.992 -3.000 0.227 1.000 N NA
 337349 337350 PSPTO4416 PSPTO4417     TRUE 0.997 3.000 0.635 NA   NA
 337350 10692108 PSPTO4417 PSPTO_5661     FALSE 0.006 323.000 0.000 NA   NA
 10692108 337351 PSPTO_5661 PSPTO4418     FALSE 0.080 136.000 0.000 NA   NA
 337352 337353 PSPTO4419 PSPTO4420     TRUE 0.989 -3.000 0.172 NA   NA
 337353 337354 PSPTO4420 PSPTO4421   gmhA FALSE 0.382 176.000 0.187 1.000 N NA
 337354 337355 PSPTO4421 PSPTO4422 gmhA   TRUE 0.998 -3.000 0.613 NA   NA
 337356 337357 PSPTO4423 PSPTO4424 sspB sspA TRUE 0.986 18.000 0.831 NA   NA
 337357 337358 PSPTO4424 PSPTO4425 sspA rpsI FALSE 0.017 281.000 0.014 NA N NA
 337358 337359 PSPTO4425 PSPTO4426 rpsI rplM TRUE 0.996 15.000 0.601 0.009 Y NA
 337361 337362 PSPTO4428 PSPTO4429   trpS TRUE 0.487 63.000 0.061 NA   NA
 337362 337363 PSPTO4429 PSPTO4430 trpS   TRUE 0.546 40.000 0.048 1.000   NA
 337365 337366 PSPTO4432 PSPTO4433 cysN/C cysD TRUE 0.971 11.000 0.096 0.000 N NA
 337366 337367 PSPTO4433 PSPTO4434 cysD   FALSE 0.170 154.000 0.030 NA   NA
 337369 337370 PSPTO4436 PSPTO4437   hisC FALSE 0.001 757.000 0.000 NA   NA
 337370 337371 PSPTO4437 PSPTO4438 hisC hisD TRUE 0.997 0.000 0.087 0.002 Y NA
 337371 337372 PSPTO4438 PSPTO4439 hisD hisG TRUE 0.900 125.000 0.254 0.002 Y NA
 337374 337375 PSPTO4441 PSPTO4442 murA   TRUE 0.891 23.000 0.258 NA N NA
 337375 337376 PSPTO4442 PSPTO4443     FALSE 0.340 115.000 0.067 NA N NA
 337376 337377 PSPTO4443 PSPTO4444     TRUE 0.995 -3.000 0.353 NA N NA
 337377 337378 PSPTO4444 PSPTO4445     TRUE 0.701 30.000 0.091 NA   NA
 337378 337379 PSPTO4445 PSPTO4446     TRUE 0.997 0.000 0.562 NA   NA
 337379 337380 PSPTO4446 PSPTO4447     TRUE 0.999 0.000 0.530 NA Y NA
 337381 337382 PSPTO4448 PSPTO4449     TRUE 0.998 0.000 0.598 1.000   NA
 337382 337383 PSPTO4449 PSPTO4450     TRUE 0.993 9.000 0.617 NA   NA
 337383 337384 PSPTO4450 PSPTO4451     TRUE 0.983 -13.000 0.459 NA   NA
 337384 337385 PSPTO4451 PSPTO4452     TRUE 0.997 1.000 0.543 NA   NA
 337385 337386 PSPTO4452 PSPTO4453   rpoN FALSE 0.327 183.000 0.163 1.000   NA
 337386 337387 PSPTO4453 PSPTO4454 rpoN yfiA TRUE 0.939 75.000 0.820 NA N NA
 337387 337388 PSPTO4454 PSPTO4455 yfiA ptsN TRUE 0.991 12.000 0.728 NA N NA
 337388 337389 PSPTO4455 PSPTO4456 ptsN   TRUE 0.983 3.000 0.186 NA   NA
 337389 337390 PSPTO4456 PSPTO4457   ptsH TRUE 0.900 17.000 0.182 NA   NA
 337391 337392 PSPTO4458 PSPTO4459   sodA FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 337392 337393 PSPTO4459 PSPTO4460 sodA   TRUE 0.987 1.000 0.179 1.000   NA
 337393 337394 PSPTO4460 PSPTO4461   fumC-2 FALSE 0.475 33.000 0.024 1.000   NA
 337394 337395 PSPTO4461 PSPTO4462 fumC-2   TRUE 0.931 -7.000 0.058 NA   NA
 337395 337396 PSPTO4462 PSPTO4463   pmbA FALSE 0.013 305.000 0.010 NA   NA
 337398 337399 PSPTO4465 PSPTO4466 tldD   TRUE 0.989 3.000 0.259 NA   NA
 337399 337400 PSPTO4466 PSPTO4467     TRUE 0.850 49.000 0.358 NA   NA
 337400 337401 PSPTO4467 PSPTO4468   cafA TRUE 0.478 182.000 0.296 NA   NA
 337401 337402 PSPTO4468 PSPTO4469 cafA maf-2 TRUE 0.996 -3.000 0.417 NA N NA
 337402 337403 PSPTO4469 PSPTO4470 maf-2   TRUE 0.680 68.000 0.206 NA N NA
 337403 337404 PSPTO4470 PSPTO4471   mreC TRUE 0.999 -7.000 0.550 0.001 Y NA
 337404 337405 PSPTO4471 PSPTO4472 mreC mreB TRUE 0.598 231.000 0.689 1.000 N NA
 337406 337407 PSPTO4473 PSPTO4474 gatC gatA TRUE 0.997 15.000 0.643 0.001 Y NA
 337407 337408 PSPTO4474 PSPTO4475 gatA gatB TRUE 0.997 11.000 0.492 0.001 Y NA
 337408 337409 PSPTO4475 PSPTO4476 gatB   FALSE 0.171 99.000 0.010 NA   NA
 337409 337410 PSPTO4476 PSPTO4477     TRUE 0.846 67.000 0.417 NA   NA
 337410 337411 PSPTO4477 PSPTO4478   pcaC-2 TRUE 0.742 32.000 0.122 1.000   NA
 337412 337413 PSPTO4479 PSPTO4480     FALSE 0.122 105.000 0.000 1.000   NA
 337414 337415 PSPTO4481 PSPTO4482     TRUE 0.531 80.000 0.114 NA   NA
 337415 337416 PSPTO4482 PSPTO4483     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 337417 337418 PSPTO4484 PSPTO4485     FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 337418 337419 PSPTO4485 PSPTO4486   pnp FALSE 0.134 79.000 0.000 1.000 N NA
 337419 337420 PSPTO4486 PSPTO4487 pnp rpsO TRUE 0.754 176.000 0.335 1.000 Y NA
 337420 10692109 PSPTO4487 PSPTO_5662 rpsO   FALSE 0.457 -56.000 0.000 NA   NA
 10692109 3829852 PSPTO_5662 PSPTO_4488   truB FALSE 0.099 104.000 0.000 NA   NA
 3829852 337421 PSPTO_4488 PSPTO4489 truB rbfA TRUE 0.996 4.000 0.318 1.000 Y NA
 337421 337422 PSPTO4489 PSPTO4490 rbfA infB TRUE 0.881 160.000 0.530 1.000 Y NA
 337422 337423 PSPTO4490 PSPTO4491 infB nusA TRUE 0.908 28.000 0.342 1.000 N NA
 337423 337424 PSPTO4491 PSPTO4492 nusA   TRUE 0.944 60.000 0.759 NA   NA
 337424 401661 PSPTO4492 PSPTO_t56   tRNA-Met-5 FALSE 0.091 113.000 0.000 NA   NA
 401661 401660 PSPTO_t56 PSPTO_t57 tRNA-Met-5 tRNA-Leu-4 FALSE 0.106 96.000 0.000 NA   NA
 401660 337425 PSPTO_t57 PSPTO4493 tRNA-Leu-4 secG FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 337425 337426 PSPTO4493 PSPTO4494 secG tpiA TRUE 0.977 5.000 0.184 1.000 N NA
 337426 337427 PSPTO4494 PSPTO4495 tpiA glmM TRUE 0.769 67.000 0.082 1.000 Y NA
 337427 337428 PSPTO4495 PSPTO4496 glmM folP TRUE 0.932 17.000 0.260 1.000 N NA
 337428 337429 PSPTO4496 PSPTO4497 folP ftsH TRUE 0.982 9.000 0.325 1.000 N NA
 337429 337430 PSPTO4497 PSPTO4498 ftsH   FALSE 0.150 194.000 0.066 NA N NA
 337432 337433 PSPTO4500 PSPTO4501 greA carB TRUE 0.992 -3.000 0.241 1.000 N NA
 337433 337434 PSPTO4501 PSPTO4502 carB carA TRUE 0.924 136.000 0.345 0.000 Y NA
 337434 337435 PSPTO4502 PSPTO4503 carA dapB FALSE 0.239 216.000 0.034 1.000 Y NA
 337435 337436 PSPTO4503 PSPTO4504 dapB dnaJ TRUE 0.651 23.000 0.041 1.000 N NA
 337436 337437 PSPTO4504 PSPTO4505 dnaJ dnaK FALSE 0.335 326.000 0.236 0.002 Y NA
 337437 337438 PSPTO4505 PSPTO4506 dnaK grpE TRUE 0.756 111.000 0.049 0.006 Y NA
 337441 337442 PSPTO4509 PSPTO4510 omlA   FALSE 0.122 105.000 0.000 1.000   NA
 337442 337443 PSPTO4510 PSPTO4511     TRUE 0.951 24.000 0.476 1.000   NA
 337444 337445 PSPTO4512 PSPTO4513     TRUE 0.948 -7.000 0.086 NA   NA
 337445 337446 PSPTO4513 PSPTO4514     TRUE 0.718 -31.000 0.024 NA   NA
 337447 337448 PSPTO4515 PSPTO4516 smpB   FALSE 0.008 292.000 0.000 NA   NA
 337448 10692110 PSPTO4516 PSPTO_5663     FALSE 0.092 111.000 0.000 NA   NA
 10692110 337449 PSPTO_5663 PSPTO4517     FALSE 0.001 863.000 0.000 NA   NA
 337449 337450 PSPTO4517 PSPTO4518     FALSE 0.159 63.000 0.000 1.000 N NA
 337450 337451 PSPTO4518 PSPTO4519     TRUE 0.645 109.000 0.000 0.003 Y NA
 337451 337452 PSPTO4519 PSPTO4520     TRUE 0.669 37.000 0.000 1.000 Y NA
 337452 337453 PSPTO4520 PSPTO4521     FALSE 0.240 32.000 0.000 NA   NA
 337453 337454 PSPTO4521 PSPTO4522     FALSE 0.069 147.000 0.000 NA   NA
 337454 337455 PSPTO4522 PSPTO4523     FALSE 0.005 336.000 0.000 NA   NA
 337455 337456 PSPTO4523 PSPTO4524     FALSE 0.140 74.000 0.000 1.000 N NA
 337456 337457 PSPTO4524 PSPTO4525     FALSE 0.001 721.000 0.000 NA   NA
 337458 337459 PSPTO4526 PSPTO4527     FALSE 0.147 47.000 0.000 NA N NA
 337459 337460 PSPTO4527 PSPTO4528     TRUE 0.897 69.000 0.583 NA N NA
 337461 337462 PSPTO4529 PSPTO4530   katG FALSE 0.002 571.000 0.000 NA   NA
 337463 337464 PSPTO4531 PSPTO4532     FALSE 0.107 95.000 0.000 NA   NA
 337464 337465 PSPTO4532 PSPTO4533   nhaA-1 FALSE 0.175 49.000 0.000 NA   NA
 337465 337466 PSPTO4533 PSPTO4534 nhaA-1   FALSE 0.064 158.000 0.000 1.000 N NA
 337466 337467 PSPTO4534 PSPTO4535     TRUE 0.933 50.000 0.357 1.000 Y NA
 337467 337468 PSPTO4535 PSPTO4536     TRUE 0.997 -3.000 0.097 0.002 Y NA
 337468 337469 PSPTO4536 PSPTO4537     TRUE 0.993 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 337469 337470 PSPTO4537 PSPTO4538     TRUE 0.997 -3.000 0.105 0.058 Y NA
 337471 337472 PSPTO4539 PSPTO4540     TRUE 0.854 95.000 0.520 1.000 N NA
 337472 337473 PSPTO4540 PSPTO4541     FALSE 0.014 257.000 0.000 1.000 N NA
 337473 337474 PSPTO4541 PSPTO4542     FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 337474 337475 PSPTO4542 PSPTO4543     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 337475 337476 PSPTO4543 PSPTO4544     FALSE 0.161 77.000 0.000 1.000   NA
 337476 337477 PSPTO4544 PSPTO4545     FALSE 0.021 225.000 0.000 NA   NA
 337478 337479 PSPTO4546 PSPTO4547   garD FALSE 0.055 167.000 0.000 NA   NA
 337479 337480 PSPTO4547 PSPTO4548 garD   TRUE 0.977 11.000 0.130 1.000 Y NA
 337480 337481 PSPTO4548 PSPTO4549     FALSE 0.250 166.000 0.065 1.000 N NA
 337481 337482 PSPTO4549 PSPTO4550     FALSE 0.009 291.000 0.000 1.000 N NA
 337482 337483 PSPTO4550 PSPTO4551     FALSE 0.349 98.000 0.048 1.000   NA
 337485 337486 PSPTO4553 PSPTO4554     TRUE 0.999 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 337487 337488 PSPTO4555 PSPTO4556     FALSE 0.118 85.000 0.000 NA   NA
 337488 337489 PSPTO4556 PSPTO4557     FALSE 0.105 97.000 0.000 NA   NA
 337489 337490 PSPTO4557 PSPTO4558     FALSE 0.157 258.000 0.000 0.058 Y NA
 337490 337491 PSPTO4558 PSPTO4559     FALSE 0.074 330.000 0.000 0.058 Y NA
 337491 337492 PSPTO4559 PSPTO4560     TRUE 0.900 156.000 0.714 0.070   NA
 337492 337493 PSPTO4560 PSPTO4561   dppA TRUE 0.959 66.000 0.714 0.070   NA
 337493 337494 PSPTO4561 PSPTO4562 dppA   TRUE 0.783 75.000 0.036 0.058 Y NA
 337494 337495 PSPTO4562 PSPTO4563   dppC TRUE 0.998 11.000 0.779 0.058 Y NA
 337495 337496 PSPTO4563 PSPTO4564 dppC   TRUE 0.995 11.000 0.560 1.000 Y NA
 337496 10692111 PSPTO4564 PSPTO_4565     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 10692111 337497 PSPTO_4565 PSPTO4566     FALSE 0.193 43.000 0.000 NA   NA
 337497 337498 PSPTO4566 PSPTO4567     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 337498 10692112 PSPTO4567 PSPTO_4568     FALSE 0.429 17.000 0.000 NA   NA
 337499 337500 PSPTO4569 PSPTO4570     FALSE 0.030 202.000 0.000 NA   NA
 337500 337501 PSPTO4570 PSPTO4571     FALSE 0.219 36.000 0.000 NA   NA
 337501 337502 PSPTO4571 PSPTO4572     FALSE 0.010 276.000 0.000 NA   NA
 337502 337503 PSPTO4572 PSPTO4573     FALSE 0.356 20.000 0.000 NA   NA
 337505 337506 PSPTO4575 PSPTO4576     TRUE 1.000 -3.000 0.903 0.091 Y NA
 337506 337507 PSPTO4576 PSPTO4577     TRUE 0.977 14.000 0.313 0.058 N NA
 337507 337508 PSPTO4577 PSPTO4578     TRUE 0.981 15.000 0.403 0.058 N NA
 337509 337510 PSPTO4579 PSPTO4580 prfC   FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 337511 337512 PSPTO4581 PSPTO4582     FALSE 0.104 98.000 0.000 NA   NA
 337512 337513 PSPTO4582 PSPTO4583     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 337513 337514 PSPTO4583 PSPTO4584     FALSE 0.381 126.000 0.082 NA   NA
 337514 337515 PSPTO4584 PSPTO4585     FALSE 0.308 175.000 0.132 NA   NA
 337516 337517 PSPTO4586 PSPTO4587     TRUE 0.631 63.000 0.149 NA   NA
 337518 337519 PSPTO4588 PSPTO4589     TRUE 0.489 15.000 0.000 NA   NA
 337519 337520 PSPTO4589 PSPTO4590     FALSE 0.052 169.000 0.000 NA   NA
 337520 5937148 PSPTO4590 PSPTO_4591   hopO1-3 FALSE 0.335 22.000 0.000 NA   NA
 5937148 337522 PSPTO_4591 PSPTO4592 hopO1-3   FALSE 0.093 109.000 0.000 NA   NA
 337522 337523 PSPTO4592 PSPTO4593   holPtoU2 FALSE 0.005 347.000 0.000 NA   NA
 337523 337524 PSPTO4593 PSPTO4594 holPtoU2 hopPtoS3 TRUE 0.750 6.000 0.000 NA   NA
 337524 337525 PSPTO4594 PSPTO4595 hopPtoS3   FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 337527 337529 PSPTO4597 PSPTO4599     TRUE 0.558 13.000 0.000 NA   NA
 337530 337531 PSPTO4600 PSPTO4601   greB-2 FALSE 0.294 77.000 0.027 NA   NA
 337533 337534 PSPTO4603 PSPTO4604     TRUE 0.995 -3.000 0.179 0.012   NA
 337534 337535 PSPTO4604 PSPTO4605     TRUE 0.996 -3.000 0.231 0.012   NA
 337535 337536 PSPTO4605 PSPTO4606     TRUE 0.989 3.000 0.273 NA   NA
 337536 337537 PSPTO4606 PSPTO4607     FALSE 0.003 430.000 0.000 NA   NA
 337537 337538 PSPTO4607 PSPTO4608     FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 337539 337540 PSPTO4609 PSPTO4610     FALSE 0.002 496.000 0.000 NA   NA
 337540 337541 PSPTO4610 PSPTO4611     FALSE 0.005 331.000 0.000 NA   NA
 337541 337542 PSPTO4611 PSPTO4612     FALSE 0.390 110.000 0.080 NA   NA
 337544 337545 PSPTO4614 PSPTO4615   ppa-2 TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 337545 337546 PSPTO4615 PSPTO4616 ppa-2 eno-2 FALSE 0.138 116.000 0.004 1.000 N NA
 337548 337549 PSPTO4618 PSPTO4619     FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 337549 337550 PSPTO4619 PSPTO4620     FALSE 0.018 237.000 0.000 NA   NA
 337550 337551 PSPTO4620 PSPTO4621     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 337552 337553 PSPTO4622 PSPTO4623     FALSE 0.001 839.000 0.000 NA   NA
 337555 337556 PSPTO4625 PSPTO4626     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 337556 337557 PSPTO4626 PSPTO4627     FALSE 0.001 1614.000 0.000 1.000   NA
 337557 337558 PSPTO4627 PSPTO4628     FALSE 0.006 323.000 0.000 NA   NA
 337558 337559 PSPTO4628 PSPTO4629     FALSE 0.001 1302.000 0.000 NA   NA
 337561 337562 PSPTO4631 PSPTO4632   glyA-2 TRUE 0.597 165.000 0.333 1.000 N NA
 337562 337563 PSPTO4632 PSPTO4633 glyA-2   FALSE 0.001 671.000 0.000 NA   NA
 337563 337564 PSPTO4633 PSPTO4634     TRUE 0.982 7.000 0.286 NA   NA
 337564 337565 PSPTO4634 PSPTO4635     FALSE 0.001 739.000 0.000 NA   NA
 337566 337567 PSPTO4636 PSPTO4637     FALSE 0.389 96.000 0.062 NA   NA
 337567 337568 PSPTO4637 PSPTO4638   cstA TRUE 0.795 28.000 0.156 NA   NA
 337572 337573 PSPTO4642 PSPTO4643 fnr-2   FALSE 0.003 434.000 0.000 1.000 N NA
 337574 337575 PSPTO4644 PSPTO4645     FALSE 0.090 130.000 0.000 1.000 N NA
 337576 337577 PSPTO4646 PSPTO4647   cioB FALSE 0.335 22.000 0.000 NA   NA
 337577 337578 PSPTO4647 PSPTO4648 cioB cioA TRUE 0.984 4.000 0.000 0.034 Y NA
 337580 337581 PSPTO4650 PSPTO4651     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 337581 337582 PSPTO4651 PSPTO4652     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.034 Y NA
 337583 337584 PSPTO4653 PSPTO4654   trmA TRUE 0.979 -3.000 0.062 1.000   NA
 337584 337586 PSPTO4654 PSPTO4656 trmA   FALSE 0.001 949.000 0.000 NA   NA
 337586 337587 PSPTO4656 PSPTO4657     FALSE 0.079 137.000 0.000 NA   NA
 337587 337588 PSPTO4657 PSPTO4658     TRUE 0.933 5.000 0.046 NA   NA
 337589 337590 PSPTO4659 PSPTO4660   tesB TRUE 0.604 33.000 0.052 1.000   NA
 337590 337591 PSPTO4660 PSPTO4661 tesB   FALSE 0.250 138.000 0.042 1.000 N NA
 337592 337593 PSPTO4662 PSPTO4663     FALSE 0.331 90.000 0.043 NA   NA
 337594 337595 PSPTO4664 PSPTO4665     FALSE 0.467 115.000 0.007 1.000 Y NA
 337595 337596 PSPTO4665 PSPTO4666     TRUE 0.511 19.000 0.010 NA   NA
 337596 337597 PSPTO4666 PSPTO4667     FALSE 0.041 271.000 0.043 NA   NA
 337598 337599 PSPTO4668 PSPTO4669     FALSE 0.352 87.000 0.048 NA   NA
 337600 337601 PSPTO4670 PSPTO4671     FALSE 0.075 140.000 0.000 NA   NA
 337602 337603 PSPTO4672 PSPTO4673     FALSE 0.144 67.000 0.000 NA   NA
 337604 337605 PSPTO4674 PSPTO4675     FALSE 0.001 1240.000 0.000 NA   NA
 337606 337607 PSPTO4676 PSPTO4677     FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   NA
 337608 337609 PSPTO4680 PSPTO4681 cfl cfa1 TRUE 0.708 87.000 0.250 1.000   NA
 337609 337610 PSPTO4681 PSPTO4682 cfa1 cfa2 TRUE 0.716 12.000 0.009 NA   NA
 337610 337611 PSPTO4682 PSPTO4683 cfa2 cfa3 TRUE 0.967 -6.000 0.013 NA Y NA
 337611 337612 PSPTO4683 PSPTO4684 cfa3 cfa4 TRUE 0.998 -3.000 0.571 NA   NA
 337612 337613 PSPTO4684 PSPTO4685 cfa4 cfa5 TRUE 0.944 -3.000 0.016 NA   NA
 337613 337614 PSPTO4685 PSPTO4686 cfa5 cfa6 TRUE 0.896 -112.000 0.022 1.000 Y NA
 337614 337615 PSPTO4686 PSPTO4687 cfa6 cfa7 TRUE 0.999 6.000 0.571 0.005 Y NA
 337615 337616 PSPTO4687 PSPTO4688 cfa7   TRUE 0.987 -3.000 0.154 NA   NA
 337616 337617 PSPTO4688 PSPTO4689   cfa8 FALSE 0.415 50.000 0.035 NA   NA
 337617 337618 PSPTO4689 PSPTO4690 cfa8 cfa9 FALSE 0.199 56.000 0.000 1.000   NA
 337618 337619 PSPTO4690 PSPTO4691 cfa9 hopPtoI FALSE 0.001 999.000 0.000 NA   NA
 10692114 337620 PSPTO_4692 PSPTO4693     FALSE 0.013 255.000 0.000 NA   NA
 337620 337621 PSPTO4693 PSPTO4694     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 337622 337623 PSPTO4695 PSPTO4696     TRUE 0.621 32.000 0.000 0.015   NA
 337624 337625 PSPTO4697 PSPTO4699     FALSE 0.002 588.000 0.000 1.000   NA
 337625 3829853 PSPTO4699 PSPTO_5629     FALSE 0.001 1069.000 0.000 1.000 N NA
 337626 337627 PSPTO4702 PSPTO4703   holPtoAA FALSE 0.006 330.000 0.000 NA   NA
 337627 337628 PSPTO4703 PSPTO4704 holPtoAA corR FALSE 0.066 151.000 0.000 NA   NA
 337628 10692115 PSPTO4704 PSPTO_4705 corR corS TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 337630 337631 PSPTO4707 PSPTO4708     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 337631 337632 PSPTO4708 PSPTO4709   cmaA TRUE 0.966 -3.000 0.038 NA   NA
 337632 337633 PSPTO4709 PSPTO4710 cmaA   TRUE 0.979 -13.000 0.400 NA   NA
 337633 337634 PSPTO4710 PSPTO4711     TRUE 0.763 10.000 0.005 NA   NA
 337634 337635 PSPTO4711 PSPTO4712   cmaT TRUE 0.763 10.000 0.005 NA   NA
 337635 337636 PSPTO4712 PSPTO4713 cmaT   TRUE 0.750 6.000 0.000 NA   NA
 337636 337637 PSPTO4713 PSPTO4714   cmaU FALSE 0.367 19.000 0.000 NA   NA
 337637 337638 PSPTO4714 PSPTO4716 cmaU   FALSE 0.001 1183.000 0.000 NA   NA
 337638 337639 PSPTO4716 PSPTO4717     TRUE 0.718 8.000 0.000 NA   NA
 337642 337643 PSPTO4720 PSPTO4721     FALSE 0.118 85.000 0.000 NA   NA
 337643 337644 PSPTO4721 PSPTO4722   hopPtoD2 FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 337644 337645 PSPTO4722 PSPTO4723 hopPtoD2   FALSE 0.002 504.000 0.000 NA   NA
 2209178 337646 PSPTO_4724 PSPTO4725 hopD   FALSE 0.200 41.000 0.000 NA   NA
 337646 2209179 PSPTO4725 PSPTO_4726     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 10692116 3829855 PSPTO_5623 PSPTO_5626     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 337648 337649 PSPTO4729 PSPTO4730     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3829856 10692117 PSPTO_5627 PSPTO_5628     FALSE 0.088 126.000 0.000 NA   NA
 10692117 337650 PSPTO_5628 PSPTO4732     FALSE 0.135 72.000 0.000 NA   NA
 337651 337652 PSPTO4733 PSPTO4734     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 337652 337653 PSPTO4734 PSPTO4735   hrpB FALSE 0.002 482.000 0.000 NA   NA
 337653 337654 PSPTO4735 PSPTO4737 hrpB   FALSE 0.014 511.000 0.000 NA Y NA
 337654 337655 PSPTO4737 PSPTO4738     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 337655 337656 PSPTO4738 PSPTO4741     FALSE 0.001 822.000 0.000 NA   NA
 337656 337657 PSPTO4741 PSPTO4742     TRUE 0.980 4.000 0.188 NA   NA
 337657 337658 PSPTO4742 PSPTO4743     TRUE 0.996 0.000 0.375 1.000   NA
 337658 337659 PSPTO4743 PSPTO4744     TRUE 0.984 -13.000 0.462 1.000   NA
 337659 337660 PSPTO4744 PSPTO4745     FALSE 0.156 80.000 0.000 1.000   NA
 3829858 337661 PSPTO_5632 PSPTO4746     TRUE 0.986 -16.000 0.571 NA   NA
 337661 337662 PSPTO4746 PSPTO4747     TRUE 0.998 -3.000 0.571 NA   NA
 337662 337663 PSPTO4747 PSPTO4748     TRUE 0.982 3.000 0.174 NA   NA
 10692118 337664 PSPTO_4749 PSPTO4750     FALSE 0.092 110.000 0.000 NA   NA
 337664 337665 PSPTO4750 PSPTO4751     FALSE 0.090 115.000 0.000 NA   NA
 337665 337666 PSPTO4751 PSPTO4752     FALSE 0.002 585.000 0.000 NA   NA
 337671 337672 PSPTO4757 PSPTO4758     FALSE 0.001 1066.000 0.000 NA   NA
 337674 337675 PSPTO4760 PSPTO4761     FALSE 0.006 345.000 0.000 1.000   NA
 337675 337676 PSPTO4761 PSPTO4762     TRUE 0.902 33.000 0.400 NA   NA
 337676 337677 PSPTO4762 PSPTO4763     TRUE 0.992 4.000 0.400 NA   NA
 337678 337679 PSPTO4764 PSPTO4765     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 337679 337680 PSPTO4765 PSPTO4766     FALSE 0.193 43.000 0.000 NA   NA
 337680 337681 PSPTO4766 PSPTO4767     FALSE 0.001 610.000 0.000 NA   NA
 337681 337682 PSPTO4767 PSPTO4768     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 337682 337683 PSPTO4768 PSPTO4769     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 337683 337684 PSPTO4769 PSPTO4770     FALSE 0.001 1209.000 0.000 NA   NA
 337685 337686 PSPTO4771 PSPTO4772     FALSE 0.017 240.000 0.000 NA   NA
 337687 337688 PSPTO4773 PSPTO4774     FALSE 0.210 51.000 0.000 1.000   NA
 337690 337691 PSPTO4776 PSPTO4777 hopPmaI(Pto)   FALSE 0.005 380.000 0.000 1.000   NA
 337691 337692 PSPTO4777 PSPTO4778     FALSE 0.140 50.000 0.000 NA N NA
 337693 337694 PSPTO4779 PSPTO4780     FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 337695 337696 PSPTO4781 PSPTO4782   gal FALSE 0.282 33.000 0.000 1.000   NA
 3829859 337698 PSPTO_5631 PSPTO4784     TRUE 0.973 42.000 1.000 NA   NA
 337698 337699 PSPTO4784 PSPTO4785     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 337699 337700 PSPTO4785 PSPTO4786     TRUE 0.523 14.000 0.000 NA   NA
 337700 337701 PSPTO4786 PSPTO4787     TRUE 0.865 27.000 0.000 0.015 Y NA
 337701 337702 PSPTO4787 PSPTO4788   kptA FALSE 0.095 115.000 0.000 1.000 N NA
 337702 337703 PSPTO4788 PSPTO4789 kptA   FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 337703 337704 PSPTO4789 PSPTO4790     TRUE 0.721 16.000 0.031 NA   NA
 337705 337706 PSPTO4791 PSPTO4792     FALSE 0.124 81.000 0.000 NA   NA
 337706 10692119 PSPTO4792 PSPTO_5664     FALSE 0.184 46.000 0.000 NA   NA
 5937149 337708 PSPTO_4794 PSPTO4795 rluE   FALSE 0.257 80.000 0.019 1.000 N NA
 337708 337709 PSPTO4795 PSPTO4796     FALSE 0.064 159.000 0.000 1.000 N NA
 337709 337710 PSPTO4796 PSPTO4797     FALSE 0.453 -64.000 0.000 NA   NA
 337711 337712 PSPTO4798 PSPTO4799   thiE TRUE 0.775 24.000 0.000 1.000 Y NA
 337712 337713 PSPTO4799 PSPTO4800 thiE hemL FALSE 0.177 206.000 0.000 1.000 Y NA
 337713 337714 PSPTO4800 PSPTO4801 hemL   FALSE 0.132 75.000 0.000 NA   NA
 337714 337715 PSPTO4801 PSPTO4802     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 337717 337718 PSPTO4804 PSPTO4805 miaB   FALSE 0.413 178.000 0.220 1.000 N NA
 337718 337719 PSPTO4805 PSPTO4806     TRUE 0.990 -7.000 0.457 NA   NA
 337719 337720 PSPTO4806 PSPTO4807     TRUE 0.967 6.000 0.150 NA   NA
 337720 337721 PSPTO4807 PSPTO4808   cutE TRUE 0.924 42.000 0.557 NA N NA
 337722 337723 PSPTO4809 PSPTO4810     TRUE 0.846 71.000 0.435 NA   NA
 337723 337724 PSPTO4810 PSPTO4811     TRUE 0.671 10.000 0.000 NA   NA
 337725 337726 PSPTO4812 PSPTO4813 leuS   TRUE 0.588 90.000 0.182 NA N NA
 337726 337727 PSPTO4813 PSPTO4814   holA TRUE 0.749 42.000 0.199 NA N NA
 337727 337728 PSPTO4814 PSPTO4815 holA   TRUE 0.772 5.000 0.000 NA   NA
 337728 337729 PSPTO4815 PSPTO4816     FALSE 0.089 124.000 0.000 NA   NA
 337729 337730 PSPTO4816 PSPTO4817     TRUE 0.536 84.000 0.123 NA   NA
 337731 337732 PSPTO4818 PSPTO4819 lipA lipB TRUE 0.968 44.000 0.319 0.000 Y NA
 337732 337733 PSPTO4819 PSPTO4820 lipB   TRUE 0.991 0.000 0.219 NA   NA
 337733 337734 PSPTO4820 PSPTO4821     FALSE 0.432 91.000 0.074 NA   NA
 337734 337735 PSPTO4821 PSPTO4822     FALSE 0.403 242.000 0.241 NA Y NA
 337735 337736 PSPTO4822 PSPTO4823   mltB TRUE 0.997 0.000 0.298 NA Y NA
 337736 337737 PSPTO4823 PSPTO4824 mltB rodA TRUE 0.811 18.000 0.096 NA N NA
 337737 337738 PSPTO4824 PSPTO4825 rodA   TRUE 0.777 -10.000 0.008 1.000 N NA
 337738 337739 PSPTO4825 PSPTO4826     FALSE 0.360 30.000 0.007 NA   NA
 337739 337740 PSPTO4826 PSPTO4827     TRUE 0.978 10.000 0.307 NA   NA
 337740 337741 PSPTO4827 PSPTO4828   nadD TRUE 0.691 76.000 0.221 NA   NA
 337741 337742 PSPTO4828 PSPTO4829 nadD proA TRUE 0.925 14.000 0.170 1.000 N NA
 337743 337744 PSPTO4830 PSPTO4831     TRUE 0.915 4.000 0.019 1.000   NA
 337744 337745 PSPTO4831 PSPTO4832     FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 337746 337747 PSPTO4833 PSPTO4834     FALSE 0.157 59.000 0.000 NA   NA
 337748 337749 PSPTO4835 PSPTO4836     FALSE 0.328 158.000 0.091 1.000   NA
 337751 337752 PSPTO4838 PSPTO4839     TRUE 0.477 -37.000 0.000 NA   NA
 337752 337753 PSPTO4839 PSPTO4840     TRUE 0.982 0.000 0.101 NA   NA
 337753 337754 PSPTO4840 PSPTO4841     FALSE 0.058 210.000 0.017 1.000 N NA
 337754 337755 PSPTO4841 PSPTO4842   speA FALSE 0.252 89.000 0.023 1.000 N NA
 337755 337756 PSPTO4842 PSPTO4843 speA   FALSE 0.011 269.000 0.000 1.000 N NA
 337761 337762 PSPTO4848 PSPTO4849     TRUE 0.944 41.000 0.667 NA N NA
 337763 337764 PSPTO4850 PSPTO4851     TRUE 0.954 21.000 0.234 NA Y NA
 337764 337765 PSPTO4851 PSPTO4852     TRUE 0.999 -3.000 0.696 NA Y NA
 337765 337766 PSPTO4852 PSPTO4853     TRUE 0.999 0.000 0.732 NA Y NA
 337766 337767 PSPTO4853 PSPTO4854     TRUE 0.993 19.000 0.822 1.000 Y NA
 337767 337768 PSPTO4854 PSPTO4855     TRUE 1.000 2.000 0.844 0.007 Y NA
 337768 337769 PSPTO4855 PSPTO4856     TRUE 0.973 42.000 0.620 1.000 Y NA
 337769 337770 PSPTO4856 PSPTO4857     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 337770 337771 PSPTO4857 PSPTO4858   dsbD FALSE 0.124 81.000 0.000 NA   NA
 337771 337772 PSPTO4858 PSPTO4859 dsbD aroQ FALSE 0.149 130.000 0.010 1.000 N NA
 337772 337773 PSPTO4859 PSPTO4860 aroQ accB TRUE 0.727 77.000 0.254 1.000 N NA
 337773 337774 PSPTO4860 PSPTO4861 accB accC-2 TRUE 0.986 18.000 0.275 0.001 Y NA
 337774 337775 PSPTO4861 PSPTO4862 accC-2 prmA FALSE 0.464 136.000 0.152 1.000 N NA
 337775 337776 PSPTO4862 PSPTO4863 prmA   FALSE 0.438 25.000 0.009 NA   NA
 337776 337777 PSPTO4863 PSPTO4864     FALSE 0.010 317.000 0.005 NA   NA
 337777 337778 PSPTO4864 PSPTO4865   fis TRUE 0.981 3.000 0.161 1.000 N NA
 337778 337779 PSPTO4865 PSPTO4866 fis purH TRUE 0.509 83.000 0.101 1.000 N NA
 337779 337780 PSPTO4866 PSPTO4867 purH purD TRUE 0.578 199.000 0.238 1.000 Y NA
 337780 337781 PSPTO4867 PSPTO4868 purD   FALSE 0.384 88.000 0.010 0.084 N NA
 337781 337782 PSPTO4868 PSPTO4869     FALSE 0.249 70.000 0.020 NA N NA
 337783 337784 PSPTO4870 PSPTO4871     FALSE 0.215 37.000 0.000 NA   NA
 337784 337785 PSPTO4871 PSPTO4872     TRUE 0.734 -7.000 0.000 NA   NA
 337785 337786 PSPTO4872 PSPTO4873     FALSE 0.157 59.000 0.000 NA   NA
 337786 337787 PSPTO4873 PSPTO4874     FALSE 0.016 366.000 0.042 NA   NA
 337787 337788 PSPTO4874 PSPTO4875   cobI TRUE 0.997 0.000 0.097 0.005 Y NA
 337788 337789 PSPTO4875 PSPTO4876 cobI cobH TRUE 0.998 0.000 0.191 0.005 Y NA
 337789 337790 PSPTO4876 PSPTO4877 cobH   TRUE 0.987 -3.000 0.149 1.000 N NA
 337791 337792 PSPTO4878 PSPTO4879 cobL cbiD TRUE 0.995 0.000 0.043 0.005 Y NA
 337792 337793 PSPTO4879 PSPTO4880 cbiD   TRUE 0.997 -3.000 0.123 0.005 Y NA
 337793 337794 PSPTO4880 PSPTO4881     FALSE 0.005 338.000 0.000 NA   NA
 337794 337795 PSPTO4881 PSPTO4882     TRUE 0.946 14.000 0.238 NA   NA
 337795 337796 PSPTO4882 PSPTO4883     FALSE 0.120 84.000 0.000 NA   NA
 337796 337797 PSPTO4883 PSPTO4884     FALSE 0.001 1416.000 0.000 NA   NA
 337797 337798 PSPTO4884 PSPTO4885     FALSE 0.013 255.000 0.000 NA   NA
 337798 337799 PSPTO4885 PSPTO4886     TRUE 0.805 214.000 0.654 1.000 Y NA
 337799 337800 PSPTO4886 PSPTO4887     TRUE 1.000 0.000 0.758 0.057 Y NA
 337800 337801 PSPTO4887 PSPTO4888     TRUE 0.999 -3.000 0.823 1.000   NA
 337801 337802 PSPTO4888 PSPTO4889     TRUE 0.940 118.000 0.731 0.015   NA
 337802 337803 PSPTO4889 PSPTO4890   ureD-2 TRUE 0.762 49.000 0.221 1.000 N NA
 337803 337804 PSPTO4890 PSPTO4891 ureD-2 ureA TRUE 0.949 86.000 0.664 0.002 N NA
 337804 337805 PSPTO4891 PSPTO4892 ureA   TRUE 0.838 11.000 0.029 1.000 N NA
 337805 337806 PSPTO4892 PSPTO4893   ttr TRUE 0.950 11.000 0.041 0.006   NA
 337806 337807 PSPTO4893 PSPTO4894 ttr ureB TRUE 0.955 -3.000 0.019 1.000   NA
 337807 337808 PSPTO4894 PSPTO4895 ureB ureC TRUE 0.809 226.000 0.486 0.001 Y NA
 337808 337809 PSPTO4895 PSPTO4896 ureC   FALSE 0.061 193.000 0.010 1.000 N NA
 337812 337813 PSPTO4899 PSPTO4900     FALSE 0.106 189.000 0.031 NA   NA
 337820 337821 PSPTO4908 PSPTO4909   ureE FALSE 0.081 185.000 0.010 1.000   NA
 337821 337822 PSPTO4909 PSPTO4910 ureE ureF-2 TRUE 0.999 -3.000 0.560 0.002 Y NA
 337822 337823 PSPTO4910 PSPTO4911 ureF-2 ureG-2 TRUE 0.992 21.000 0.550 0.002 Y NA
 337823 337824 PSPTO4911 PSPTO4912 ureG-2   TRUE 0.882 25.000 0.068 NA Y NA
 337824 337825 PSPTO4912 PSPTO4913     FALSE 0.184 204.000 0.118 NA N NA
 337826 337827 PSPTO4914 PSPTO4915     FALSE 0.002 720.000 0.000 1.000   NA
 337827 337828 PSPTO4915 PSPTO4916     TRUE 1.000 -3.000 0.881 0.015 Y NA
 337828 337829 PSPTO4916 PSPTO4917   braE TRUE 0.997 -3.000 0.268 1.000 Y NA
 337829 337830 PSPTO4917 PSPTO4918 braE braD TRUE 0.997 3.000 0.263 0.057 Y NA
 337830 337831 PSPTO4918 PSPTO4919 braD   TRUE 0.658 163.000 0.175 1.000 Y NA
 337832 337833 PSPTO4920 PSPTO4921   pncB FALSE 0.164 100.000 0.007 1.000 N NA
 337833 337834 PSPTO4921 PSPTO4922 pncB nadE TRUE 0.837 27.000 0.033 1.000 Y NA
 337835 337836 PSPTO4923 PSPTO4924 azu   FALSE 0.054 193.000 0.012 NA N NA
 337836 337837 PSPTO4924 PSPTO4925     TRUE 0.998 0.000 0.734 NA   NA
 337837 337838 PSPTO4925 PSPTO4926     TRUE 0.902 88.000 0.667 NA   NA
 337840 337841 PSPTO4928 PSPTO4929   dnaB FALSE 0.154 121.000 0.009 1.000 N NA
 337841 337842 PSPTO4929 PSPTO4930 dnaB rplI FALSE 0.377 124.000 0.074 1.000 N NA
 337842 337843 PSPTO4930 PSPTO4931 rplI   TRUE 0.646 20.000 0.034 NA   NA
 337843 337844 PSPTO4931 PSPTO4932   rpsR FALSE 0.460 40.000 0.034 NA   NA
 337844 337845 PSPTO4932 PSPTO4933 rpsR rpsF TRUE 0.975 29.000 0.319 0.009 Y NA
 337845 337846 PSPTO4933 PSPTO4934 rpsF   FALSE 0.204 215.000 0.017 1.000 Y NA
 337846 337847 PSPTO4934 PSPTO4935   vacB TRUE 0.994 -3.000 0.147 0.010 N NA
 401654 401655 PSPTO_t58 PSPTO_t59 tRNA-Leu-5 tRNA-Leu-6 FALSE 0.059 161.000 0.000 NA   NA
 337848 337849 PSPTO4936 PSPTO4937   purA FALSE 0.080 173.000 0.007 1.000 N NA
 337849 337850 PSPTO4937 PSPTO4938 purA   TRUE 0.671 55.000 0.161 1.000 N NA
 337850 337851 PSPTO4938 PSPTO4939   hflC FALSE 0.043 269.000 0.045 1.000 N NA
 337851 337852 PSPTO4939 PSPTO4940 hflC hflK TRUE 1.000 0.000 0.947 0.006 Y NA
 337852 337853 PSPTO4940 PSPTO4941 hflK hflX TRUE 0.603 97.000 0.184 1.000   NA
 337853 337854 PSPTO4941 PSPTO4942 hflX hfq TRUE 0.926 13.000 0.141 1.000   NA
 337854 337855 PSPTO4942 PSPTO4943 hfq miaA TRUE 0.864 93.000 0.531 1.000   NA
 337855 337856 PSPTO4943 PSPTO4944 miaA mutL TRUE 0.992 1.000 0.188 0.084 N NA
 337856 337857 PSPTO4944 PSPTO4945 mutL   TRUE 0.958 0.000 0.030 1.000 N NA
 337857 337858 PSPTO4945 PSPTO4946     TRUE 0.756 15.000 0.033 NA   NA
 337858 337859 PSPTO4946 PSPTO4947     TRUE 0.737 30.000 0.118 NA   NA
 337861 337862 PSPTO4949 PSPTO4950   orn FALSE 0.188 97.000 0.013 NA   NA
 337864 337865 PSPTO4952 PSPTO4953 motB motA-2 TRUE 0.999 4.000 0.722 1.000 Y NA
 337866 337867 PSPTO4954 PSPTO4955     TRUE 0.695 46.000 0.156 NA   NA
 337867 337868 PSPTO4955 PSPTO4956     FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 337871 337872 PSPTO4959 PSPTO4960   parC FALSE 0.074 184.000 0.012 NA   NA
 337872 337873 PSPTO4960 PSPTO4961 parC   TRUE 0.808 11.000 0.016 1.000   NA
 337873 337874 PSPTO4961 PSPTO4962     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 337874 337875 PSPTO4962 PSPTO4963   parE TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 337875 337876 PSPTO4963 PSPTO4964 parE   FALSE 0.112 90.000 0.000 NA   NA
 337876 337877 PSPTO4964 PSPTO4965     FALSE 0.115 88.000 0.000 NA   NA
 337877 337878 PSPTO4965 PSPTO4966     FALSE 0.089 124.000 0.000 NA   NA
 337878 337879 PSPTO4966 PSPTO4967     FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 337879 337880 PSPTO4967 PSPTO4968     FALSE 0.001 733.000 0.000 NA   NA
 337881 337882 PSPTO4969 PSPTO4970     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 337883 337884 PSPTO4971 PSPTO4972     FALSE 0.008 303.000 0.000 NA   NA
 337884 337885 PSPTO4972 PSPTO4973     TRUE 0.988 -9.000 0.443 NA   NA
 337887 337888 PSPTO4975 PSPTO4976   thiC FALSE 0.143 127.000 0.007 1.000 N NA
 337888 10692120 PSPTO4976 PSPTO_5665 thiC   FALSE 0.062 157.000 0.000 NA   NA
 337891 337892 PSPTO4979 PSPTO4980     TRUE 0.867 49.000 0.400 1.000 N NA
 337892 337893 PSPTO4980 PSPTO4981     TRUE 0.999 -3.000 0.441 0.035 Y NA
 337893 337894 PSPTO4981 PSPTO4982     TRUE 0.872 37.000 0.324 1.000   NA
 337895 337896 PSPTO4983 PSPTO4984   msbA FALSE 0.202 125.000 0.023 1.000 N NA
 337898 337899 PSPTO4986 PSPTO4987     TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 337899 337900 PSPTO4987 PSPTO4988     FALSE 0.142 68.000 0.000 NA   NA
 337900 337901 PSPTO4988 PSPTO4989     TRUE 0.766 31.000 0.154 NA   NA
 337901 337902 PSPTO4989 PSPTO4990     TRUE 0.984 -30.000 0.625 NA   NA
 337902 337903 PSPTO4990 PSPTO4991     TRUE 0.994 0.000 0.312 NA   NA
 337903 337904 PSPTO4991 PSPTO4992     TRUE 0.988 -16.000 0.409 0.012 N NA
 337906 337907 PSPTO4994 PSPTO4995     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 337909 337910 PSPTO4997 PSPTO4998     TRUE 0.868 31.000 0.095 0.001   NA
 337910 337911 PSPTO4998 PSPTO4999     TRUE 0.995 -3.000 0.133 0.001   NA
 337911 337912 PSPTO4999 PSPTO5000   waaP TRUE 0.994 0.000 0.133 0.001   NA
 337912 337913 PSPTO5000 PSPTO5001 waaP waaG TRUE 0.992 0.000 0.241 1.000   NA
 337913 337914 PSPTO5001 PSPTO5002 waaG waaC TRUE 0.997 0.000 0.217 1.000 Y NA
 337914 337915 PSPTO5002 PSPTO5003 waaC rfaF TRUE 0.997 3.000 0.205 0.001 Y NA
 337915 337916 PSPTO5003 PSPTO5004 rfaF glnE FALSE 0.165 130.000 0.014 1.000 N NA
 337917 337918 PSPTO5005 PSPTO5006 aceE-2 aceF TRUE 0.703 143.000 0.167 1.000 Y NA
 337918 337919 PSPTO5006 PSPTO5007 aceF dbpA FALSE 0.005 363.000 0.000 1.000 N NA
 337919 337920 PSPTO5007 PSPTO5008 dbpA   FALSE 0.096 177.000 0.011 1.000   NA
 337920 337921 PSPTO5008 PSPTO5009     FALSE 0.132 136.000 0.009 NA   NA
 337924 337925 PSPTO5012 PSPTO5013     TRUE 0.967 -3.000 0.040 NA   NA
 337925 337926 PSPTO5013 PSPTO5014     TRUE 0.532 33.000 0.040 NA   NA
 337930 337931 PSPTO5018 PSPTO5019     TRUE 0.992 0.000 0.111 0.058   NA
 337933 337934 PSPTO5021 PSPTO5022     FALSE 0.079 137.000 0.000 NA   NA
 337935 337936 PSPTO5023 PSPTO5024     TRUE 0.931 24.000 0.379 1.000 N NA
 337937 337938 PSPTO5025 PSPTO5026     FALSE 0.021 224.000 0.000 NA   NA
 337939 337940 PSPTO5027 PSPTO5028     FALSE 0.086 130.000 0.000 NA   NA
 337941 337942 PSPTO5029 PSPTO5030     TRUE 0.935 -7.000 0.000 0.014   NA
 337942 337943 PSPTO5030 PSPTO5031   pilJ TRUE 0.979 48.000 0.554 0.014 Y NA
 337943 337944 PSPTO5031 PSPTO5032 pilJ pilI TRUE 0.992 33.000 0.795 0.012 Y NA
 337944 337945 PSPTO5032 PSPTO5033 pilI pilH TRUE 0.978 15.000 0.266 1.000 Y NA
 337945 337946 PSPTO5033 PSPTO5034 pilH pilG TRUE 0.954 47.000 0.296 0.017 Y NA
 337947 337948 PSPTO5035 PSPTO5036 gshB   FALSE 0.081 259.000 0.089 1.000 N NA
 337948 337949 PSPTO5036 PSPTO5037     FALSE 0.431 76.000 0.064 NA N NA
 337949 337950 PSPTO5037 PSPTO5038     TRUE 0.992 0.000 0.263 NA N NA
 337950 337951 PSPTO5038 PSPTO5039   pyrR FALSE 0.114 243.000 0.109 1.000 N NA
 337951 337952 PSPTO5039 PSPTO5040 pyrR pyrB TRUE 0.982 13.000 0.247 1.000 Y NA
 337952 337953 PSPTO5040 PSPTO5041 pyrB   TRUE 0.999 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 337958 337959 PSPTO5046 PSPTO5047   proC TRUE 0.672 53.000 0.158 NA   NA
 337959 337960 PSPTO5047 PSPTO5048 proC   TRUE 0.819 26.000 0.152 1.000   NA
 337960 337961 PSPTO5048 PSPTO5049     FALSE 0.022 290.000 0.018 1.000   NA
 337961 337962 PSPTO5049 PSPTO5050   metW TRUE 0.991 8.000 0.509 NA N NA
 337962 337963 PSPTO5050 PSPTO5051 metW   FALSE 0.277 34.000 0.004 NA N NA
 337963 337964 PSPTO5051 PSPTO5052     TRUE 0.992 -3.000 0.218 1.000 N NA
 337964 337965 PSPTO5052 PSPTO5053     TRUE 0.791 10.000 0.011 NA   NA
 337966 337967 PSPTO5054 PSPTO5055     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 337967 10692121 PSPTO5055 PSPTO_5056     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 10692121 337968 PSPTO_5056 PSPTO5057   ilvD FALSE 0.005 343.000 0.000 NA   NA
 337971 337972 PSPTO5060 PSPTO5061     TRUE 0.717 86.000 0.273 NA   NA
 337972 337973 PSPTO5061 PSPTO5062     TRUE 0.949 0.000 0.022 NA   NA
 337973 337974 PSPTO5062 PSPTO5063     TRUE 0.485 136.000 0.022 1.000 Y NA
 337974 337975 PSPTO5063 PSPTO5064     TRUE 0.928 23.000 0.143 1.000 Y NA
 337975 337976 PSPTO5064 PSPTO5065     FALSE 0.100 107.000 0.000 1.000 N NA
 337976 337977 PSPTO5065 PSPTO5066     TRUE 0.584 57.000 0.000 1.000 Y NA
 337979 337980 PSPTO5068 PSPTO5069 ahcY metF FALSE 0.169 190.000 0.061 1.000 N NA
 337980 337981 PSPTO5069 PSPTO5070 metF   FALSE 0.007 311.000 0.000 1.000 N NA
 337982 337983 PSPTO5071 PSPTO5072     TRUE 0.966 28.000 0.676 NA   NA
 337983 337984 PSPTO5072 PSPTO5073     FALSE 0.215 37.000 0.000 NA   NA
 337984 337985 PSPTO5073 PSPTO5074     FALSE 0.165 54.000 0.000 NA   NA
 337986 337987 PSPTO5075 PSPTO5076 bioA   FALSE 0.274 117.000 0.041 NA   NA
 337990 337991 PSPTO5079 PSPTO5080 madM madL TRUE 0.999 2.000 0.945 NA   NA
 337991 337992 PSPTO5080 PSPTO5081 madL   TRUE 0.678 70.000 0.200 NA   NA
 337992 337993 PSPTO5081 PSPTO5082     TRUE 0.998 -3.000 0.651 1.000   NA
 337993 337994 PSPTO5082 PSPTO5083   mdcE TRUE 0.995 -3.000 0.339 NA   NA
 337994 337995 PSPTO5083 PSPTO5084 mdcE mdcD TRUE 0.998 -3.000 0.700 NA   NA
 337995 337996 PSPTO5084 PSPTO5085 mdcD mdcC TRUE 0.988 -7.000 0.400 NA   NA
 337996 337997 PSPTO5085 PSPTO5086 mdcC mdcB TRUE 0.995 2.000 0.475 NA   NA
 337997 337998 PSPTO5086 PSPTO5087 mdcB mdcA TRUE 0.997 0.000 0.508 1.000   NA
 337998 337999 PSPTO5087 PSPTO5088 mdcA   FALSE 0.228 34.000 0.000 NA   NA
 338002 338003 PSPTO5091 PSPTO5092     TRUE 0.986 -24.000 0.636 NA   NA
 338003 338004 PSPTO5092 PSPTO5093     TRUE 0.878 -25.000 0.075 1.000   NA
 338004 338005 PSPTO5093 PSPTO5094     TRUE 0.981 4.000 0.052 0.005   NA
 338005 338006 PSPTO5094 PSPTO5095     TRUE 0.996 -3.000 0.422 NA   NA
 338006 338007 PSPTO5095 PSPTO5096     TRUE 0.900 119.000 0.758 NA   NA
 338007 338008 PSPTO5096 PSPTO5097     TRUE 0.951 -7.000 0.103 NA N NA
 338008 338009 PSPTO5097 PSPTO5098     TRUE 0.980 -3.000 0.080 NA   NA
 338009 338010 PSPTO5098 PSPTO5099   hutH-1 TRUE 0.969 -19.000 0.333 1.000   NA
 338010 338011 PSPTO5099 PSPTO5100 hutH-1   TRUE 0.984 -10.000 0.413 NA   NA
 338011 338012 PSPTO5100 PSPTO5101     TRUE 0.997 -3.000 0.532 NA   NA
 338012 338013 PSPTO5101 PSPTO5102     TRUE 0.989 -28.000 0.732 NA   NA
 338013 338014 PSPTO5102 PSPTO5103     TRUE 0.977 -3.000 0.061 NA   NA
 338014 338015 PSPTO5103 PSPTO5104     TRUE 0.896 -13.000 0.068 NA   NA
 338015 338016 PSPTO5104 PSPTO5105     TRUE 0.939 12.000 0.162 1.000 N NA
 338016 338017 PSPTO5105 PSPTO5106     TRUE 0.984 -3.000 0.106 NA   NA
 338017 338018 PSPTO5106 PSPTO5107     TRUE 0.984 -3.000 0.110 NA   NA
 338018 338019 PSPTO5107 PSPTO5108     TRUE 0.999 -3.000 0.514 NA Y NA
 338019 338020 PSPTO5108 PSPTO5109     TRUE 0.998 -3.000 0.397 NA Y NA
 338020 338021 PSPTO5109 PSPTO5110     TRUE 0.999 0.000 0.486 1.000 Y NA
 338023 338024 PSPTO5112 PSPTO5113     FALSE 0.159 78.000 0.000 1.000   NA
 338024 338025 PSPTO5113 PSPTO5114     TRUE 0.911 -3.000 0.000 1.000   NA
 338025 338026 PSPTO5114 PSPTO5115     FALSE 0.010 299.000 0.000 1.000   NA
 338026 338027 PSPTO5115 PSPTO5116     TRUE 0.977 1.000 0.093 1.000 N NA
 338027 338028 PSPTO5116 PSPTO5117     TRUE 0.995 4.000 0.558 1.000 N NA
 338029 338030 PSPTO5118 PSPTO5119 hemE   FALSE 0.085 131.000 0.000 NA   NA
 338030 338031 PSPTO5119 PSPTO5120     FALSE 0.057 164.000 0.000 NA   NA
 338031 338032 PSPTO5120 PSPTO5121   gltD FALSE 0.064 158.000 0.000 1.000 N NA
 338034 338035 PSPTO5123 PSPTO5124 gltB   FALSE 0.027 207.000 0.000 NA   NA
 338035 338036 PSPTO5124 PSPTO5125     FALSE 0.163 55.000 0.000 NA   NA
 338036 338037 PSPTO5125 PSPTO5126   aroB TRUE 0.823 11.000 0.020 1.000   NA
 338037 338038 PSPTO5126 PSPTO5127 aroB aroK TRUE 0.785 119.000 0.208 1.000 Y NA
 338038 338039 PSPTO5127 PSPTO5128 aroK pilQ TRUE 0.988 5.000 0.319 1.000 N NA
 338039 338040 PSPTO5128 PSPTO5129 pilQ pilP TRUE 0.999 -3.000 0.668 NA Y NA
 338040 338041 PSPTO5129 PSPTO5130 pilP pilO TRUE 0.999 -3.000 0.680 NA Y NA
 338041 338042 PSPTO5130 PSPTO5131 pilO pilN TRUE 0.999 -3.000 0.770 NA Y NA
 338042 338043 PSPTO5131 PSPTO5132 pilN pilM TRUE 0.999 0.000 0.616 NA Y NA
 338045 338046 PSPTO5134 PSPTO5135     FALSE 0.311 170.000 0.119 1.000 N NA
 338046 338047 PSPTO5135 PSPTO5136   rpmE-2 FALSE 0.293 71.000 0.023 1.000 N NA
 338048 338049 PSPTO5137 PSPTO5138 priA argS FALSE 0.462 98.000 0.036 0.083 N NA
 338049 338050 PSPTO5138 PSPTO5139 argS   TRUE 0.958 2.000 0.052 NA N NA
 338050 338051 PSPTO5139 PSPTO5140   hslV FALSE 0.344 155.000 0.122 NA N NA
 338051 338052 PSPTO5140 PSPTO5141 hslV hslU TRUE 0.973 66.000 0.752 1.000 Y NA
 338052 338053 PSPTO5141 PSPTO5142 hslU   TRUE 0.488 77.000 0.070 1.000   NA
 338053 10692122 PSPTO5142 PSPTO_5143     FALSE 0.007 309.000 0.000 NA   NA
 10692122 338054 PSPTO_5143 PSPTO5144   phaB FALSE 0.165 54.000 0.000 NA   NA
 338054 338055 PSPTO5144 PSPTO5145 phaB phaC FALSE 0.385 151.000 0.119 1.000   NA
 338055 338056 PSPTO5145 PSPTO5146 phaC phaD TRUE 0.650 48.000 0.123 1.000 N NA
 338057 338058 PSPTO5147 PSPTO5148     TRUE 0.950 38.000 0.667 NA   NA
 338058 338059 PSPTO5148 PSPTO5149     TRUE 0.542 104.000 0.167 NA   NA
 338060 338061 PSPTO5150 PSPTO5151 ubiE   TRUE 0.987 0.000 0.145 1.000   NA
 338061 338062 PSPTO5151 PSPTO5152   ubiB TRUE 0.997 -3.000 0.432 1.000   NA
 338062 338063 PSPTO5152 PSPTO5153 ubiB hisI FALSE 0.305 68.000 0.018 1.000   NA
 338063 338064 PSPTO5153 PSPTO5154 hisI hisE TRUE 0.996 3.000 0.152 0.002 Y NA
 338064 338065 PSPTO5154 PSPTO5155 hisE tatA FALSE 0.365 45.000 0.021 1.000 N NA
 338065 338066 PSPTO5155 PSPTO5156 tatA tatB TRUE 0.995 5.000 0.157 0.006 Y NA
 338066 338067 PSPTO5156 PSPTO5157 tatB tatC TRUE 0.998 -3.000 0.314 NA Y NA
 338067 338068 PSPTO5157 PSPTO5158 tatC   TRUE 0.980 -3.000 0.076 NA   NA
 338068 338069 PSPTO5158 PSPTO5159     FALSE 0.264 90.000 0.028 NA   NA
 338069 338070 PSPTO5159 PSPTO5160     FALSE 0.330 203.000 0.000 0.012 Y NA
 338071 338072 PSPTO5161 PSPTO5162 mdoH mgoG TRUE 0.920 -7.000 0.052 NA N NA
 338072 338073 PSPTO5162 PSPTO5163 mgoG dtd FALSE 0.012 266.000 0.000 1.000 N NA
 338073 338074 PSPTO5163 PSPTO5164 dtd pip TRUE 0.660 42.000 0.026 0.027   NA
 338075 338076 PSPTO5165 PSPTO5166 glgP   FALSE 0.038 233.000 0.016 NA   NA
 338076 338077 PSPTO5166 PSPTO5167     TRUE 0.971 11.000 0.283 NA   NA
 338077 338078 PSPTO5167 PSPTO5168   fbp FALSE 0.287 134.000 0.051 NA   NA
 338078 338079 PSPTO5168 PSPTO5169 fbp   FALSE 0.040 256.000 0.026 1.000   NA
 338079 338080 PSPTO5169 PSPTO5170   blc TRUE 0.984 4.000 0.208 1.000   NA
 338082 338083 PSPTO5172 PSPTO5173 hutC   TRUE 0.990 -3.000 0.189 NA   NA
 338083 338084 PSPTO5173 PSPTO5174   nhaA-2 FALSE 0.289 27.000 0.000 NA   NA
 338084 338085 PSPTO5174 PSPTO5175 nhaA-2   FALSE 0.097 105.000 0.000 NA   NA
 338085 338086 PSPTO5175 PSPTO5176     TRUE 0.583 106.000 0.200 NA   NA
 338086 338087 PSPTO5176 PSPTO5177     TRUE 0.997 -3.000 0.511 NA   NA
 338089 338090 PSPTO5179 PSPTO5180     TRUE 0.684 221.000 0.469 1.000 Y NA
 338090 338091 PSPTO5180 PSPTO5181     TRUE 0.997 -3.000 0.100 0.067 Y NA
 338091 338092 PSPTO5181 PSPTO5182     TRUE 0.991 4.000 0.150 1.000 Y NA
 338092 338093 PSPTO5182 PSPTO5183     FALSE 0.002 574.000 0.000 NA   NA
 338093 338094 PSPTO5183 PSPTO5184     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 338094 338095 PSPTO5184 PSPTO5185     TRUE 0.989 26.000 0.500 0.003 Y NA
 338095 338096 PSPTO5185 PSPTO5186     TRUE 0.996 0.000 0.452 NA N NA
 338096 338097 PSPTO5186 PSPTO5187   metQ-1 TRUE 0.711 112.000 0.346 NA N NA
 338097 338098 PSPTO5187 PSPTO5188 metQ-1 metN-1 TRUE 0.963 96.000 0.800 NA Y NA
 338098 338099 PSPTO5188 PSPTO5189 metN-1 metI-1 TRUE 0.987 -10.000 0.222 1.000 Y NA
 338099 338100 PSPTO5189 PSPTO5190 metI-1   TRUE 0.573 52.000 0.083 1.000 N NA
 338101 338102 PSPTO5191 PSPTO5192     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA N NA
 338102 338103 PSPTO5192 PSPTO5193     TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.007 Y NA
 338103 338104 PSPTO5193 PSPTO5194     FALSE 0.033 197.000 0.000 NA   NA
 338104 338105 PSPTO5194 PSPTO5195     FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 338105 338106 PSPTO5195 PSPTO5196     TRUE 0.778 39.000 0.045 NA Y NA
 338106 338107 PSPTO5196 PSPTO5197     TRUE 0.966 92.000 0.795 1.000 Y NA
 338107 338108 PSPTO5197 PSPTO5198     TRUE 0.827 17.000 0.079 1.000 N NA
 338108 338109 PSPTO5198 PSPTO5199     FALSE 0.036 190.000 0.000 NA   NA
 338110 338111 PSPTO5200 PSPTO5201     FALSE 0.054 168.000 0.000 NA   NA
 338111 338112 PSPTO5201 PSPTO5202     FALSE 0.037 189.000 0.000 NA   NA
 338112 338113 PSPTO5202 PSPTO5203     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 338113 338114 PSPTO5203 PSPTO5204     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 338114 338115 PSPTO5204 PSPTO5205     FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 338115 338116 PSPTO5205 PSPTO5206     FALSE 0.139 70.000 0.000 NA   NA
 338116 338117 PSPTO5206 PSPTO5207     TRUE 0.671 10.000 0.000 NA   NA
 338117 338118 PSPTO5207 PSPTO5208     FALSE 0.054 168.000 0.000 NA   NA
 338118 338119 PSPTO5208 PSPTO5209     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 338119 338120 PSPTO5209 PSPTO5210     FALSE 0.001 1111.000 0.000 NA   NA
 338120 338121 PSPTO5210 PSPTO5211     TRUE 0.671 10.000 0.000 NA   NA
 338122 338123 PSPTO5212 PSPTO5213     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 338124 338125 PSPTO5214 PSPTO5215     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 338126 338127 PSPTO5216 PSPTO5217     TRUE 0.512 171.000 0.294 NA N NA
 338127 338128 PSPTO5217 PSPTO5218     TRUE 0.831 83.000 0.444 NA   NA
 338128 338129 PSPTO5218 PSPTO5219     FALSE 0.024 216.000 0.000 NA   NA
 338131 338132 PSPTO5221 PSPTO5222 ubiF ubiH TRUE 0.904 52.000 0.083 0.000 Y NA
 338132 338133 PSPTO5222 PSPTO5223 ubiH pepP TRUE 0.996 -3.000 0.396 1.000 N NA
 338133 338134 PSPTO5223 PSPTO5224 pepP   TRUE 0.780 76.000 0.329 NA   NA
 338135 338136 PSPTO5225 PSPTO5226     TRUE 0.973 -3.000 0.053 NA   NA
 338136 10692123 PSPTO5226 PSPTO_5666     FALSE 0.247 31.000 0.000 NA   NA
 10692123 338137 PSPTO_5666 PSPTO5227     FALSE 0.107 95.000 0.000 NA   NA
 338141 338142 PSPTO5231 PSPTO5232     FALSE 0.129 99.000 0.000 1.000   NA
 338142 338143 PSPTO5232 PSPTO5233     TRUE 0.717 -10.000 0.000 1.000   NA
 338143 338144 PSPTO5233 PSPTO5234     FALSE 0.177 48.000 0.000 NA   NA
 338145 338146 PSPTO5235 PSPTO5236     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 338146 338147 PSPTO5236 PSPTO5237     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 338149 338150 PSPTO5239 PSPTO5240     FALSE 0.021 208.000 0.000 NA N NA
 338150 338151 PSPTO5240 PSPTO5241   ubiD TRUE 0.963 0.000 0.042 NA N NA
 338151 338152 PSPTO5241 PSPTO5242 ubiD rho FALSE 0.185 129.000 0.025 NA N NA
 338152 338153 PSPTO5242 PSPTO5243 rho trx-2 FALSE 0.121 232.000 0.087 1.000   NA
 338153 338154 PSPTO5243 PSPTO5244 trx-2   FALSE 0.166 122.000 0.008 1.000   NA
 338155 338156 PSPTO5245 PSPTO5246     TRUE 0.949 30.000 0.179 0.056 Y NA
 338156 338157 PSPTO5246 PSPTO5247     TRUE 0.999 0.000 0.513 0.009 Y NA
 338157 338158 PSPTO5247 PSPTO5248     TRUE 0.990 -13.000 0.340 1.000 Y NA
 338158 338159 PSPTO5248 PSPTO5249   ppx FALSE 0.004 384.000 0.000 1.000 N NA
 338160 338161 PSPTO5250 PSPTO5251 ppk hemB TRUE 0.717 17.000 0.033 1.000 N NA
 338162 338163 PSPTO5252 PSPTO5253   elbB FALSE 0.064 207.000 0.021 NA   NA
 338163 338164 PSPTO5253 PSPTO5254 elbB   FALSE 0.073 113.000 0.000 NA N NA
 338164 338165 PSPTO5254 PSPTO5255   cynT FALSE 0.010 282.000 0.000 1.000 N NA
 338165 338166 PSPTO5255 PSPTO5256 cynT   TRUE 0.824 104.000 0.241 1.000 Y NA
 338168 338169 PSPTO5258 PSPTO5259 ctaG   FALSE 0.185 64.000 0.000 1.000   NA
 338170 338171 PSPTO5260 PSPTO5261 metQ-2 metI-2 TRUE 0.981 53.000 0.867 NA Y NA
 338171 338172 PSPTO5261 PSPTO5262 metI-2 metN-2 TRUE 0.999 0.000 0.469 1.000 Y NA
 338174 338175 PSPTO5264 PSPTO5265   znuB TRUE 0.514 39.000 0.037 1.000   NA
 338175 338176 PSPTO5265 PSPTO5266 znuB znuC TRUE 0.999 -7.000 0.755 0.082 Y NA
 338176 338177 PSPTO5266 PSPTO5267 znuC   TRUE 0.998 0.000 0.309 1.000 Y NA
 338180 338181 PSPTO5270 PSPTO5271 hutU   FALSE 0.425 113.000 0.000 1.000 Y NA
 338181 338182 PSPTO5271 PSPTO5272     TRUE 0.830 74.000 0.067 0.056 Y NA
 338182 338183 PSPTO5272 PSPTO5273     TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.086 Y NA
 338183 338184 PSPTO5273 PSPTO5274   hutH-2 TRUE 0.980 13.000 0.212 1.000 Y NA
 338184 338185 PSPTO5274 PSPTO5275 hutH-2 hutH-3 TRUE 0.812 55.000 0.006 0.001 Y NA
 338185 338186 PSPTO5275 PSPTO5276 hutH-3   TRUE 0.546 103.000 0.022 1.000 Y NA
 338186 338187 PSPTO5276 PSPTO5277   hutI TRUE 0.611 16.000 0.010 1.000 N NA
 338187 338188 PSPTO5277 PSPTO5278 hutI   TRUE 0.725 14.000 0.019 1.000 N NA
 338191 338192 PSPTO5281 PSPTO5282   thyA FALSE 0.004 384.000 0.000 NA   NA
 338192 338193 PSPTO5282 PSPTO5283 thyA lgt TRUE 0.683 53.000 0.164 1.000 N NA
 338193 338194 PSPTO5283 PSPTO5284 lgt ptsP FALSE 0.008 364.000 0.011 1.000 N NA
 338194 338195 PSPTO5284 PSPTO5285 ptsP   TRUE 0.787 22.000 0.097 1.000 N NA
 338197 338198 PSPTO5287 PSPTO5288   ilvA-2 FALSE 0.172 161.000 0.034 NA   NA
 338200 338201 PSPTO5290 PSPTO5291     TRUE 0.827 78.000 0.417 NA   NA
 338201 338202 PSPTO5291 PSPTO5292     FALSE 0.136 184.000 0.041 NA   NA
 338202 338203 PSPTO5292 PSPTO5293     TRUE 0.499 68.000 0.071 1.000 N NA
 338205 338206 PSPTO5295 PSPTO5296     FALSE 0.078 138.000 0.000 NA   NA
 338207 338208 PSPTO5297 PSPTO5298     FALSE 0.171 51.000 0.000 NA   NA
 338211 338212 PSPTO5301 PSPTO5302 potI potH TRUE 0.997 -3.000 0.094 0.055 Y NA
 338212 338213 PSPTO5302 PSPTO5303 potH potG TRUE 0.997 -36.000 1.000 1.000 Y NA
 338213 338214 PSPTO5303 PSPTO5304 potG   FALSE 0.069 127.000 0.000 NA N NA
 338214 338215 PSPTO5304 PSPTO5305     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 338215 338216 PSPTO5305 PSPTO5306     FALSE 0.219 36.000 0.000 NA   NA
 338216 338217 PSPTO5306 PSPTO5307     TRUE 0.907 172.000 0.500 0.014 Y NA
 338217 338218 PSPTO5307 PSPTO5308     FALSE 0.453 131.000 0.130 1.000 N NA
 338218 338219 PSPTO5308 PSPTO5309     TRUE 0.725 70.000 0.239 1.000 N NA
 10692124 338220 PSPTO_5667 PSPTO5310     FALSE 0.109 93.000 0.000 NA   NA
 338220 338221 PSPTO5310 PSPTO5311     FALSE 0.011 630.000 0.105 1.000 N NA
 338222 338223 PSPTO5312 PSPTO5313     FALSE 0.081 135.000 0.000 NA   NA
 338223 338224 PSPTO5313 PSPTO5314     TRUE 0.883 26.000 0.161 0.082 N NA
 338224 338225 PSPTO5314 PSPTO5315   ssuC TRUE 0.999 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 338225 338226 PSPTO5315 PSPTO5316 ssuC   TRUE 0.898 29.000 0.038 0.055 Y NA
 338226 338227 PSPTO5316 PSPTO5317     FALSE 0.007 313.000 0.000 1.000 N NA
 338227 338228 PSPTO5317 PSPTO5318     FALSE 0.065 170.000 0.000 1.000   NA
 338229 338230 PSPTO5319 PSPTO5320 tauA tauB TRUE 0.913 18.000 0.058 1.000 Y NA
 338230 338231 PSPTO5320 PSPTO5321 tauB tauC TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 338234 338235 PSPTO5324 PSPTO5325 secB   TRUE 0.791 41.000 0.221 1.000 N NA
 338235 338236 PSPTO5325 PSPTO5326     TRUE 0.980 3.000 0.166 NA N NA
 338237 338238 PSPTO5327 PSPTO5328 gpmA   FALSE 0.437 153.000 0.170 1.000 N NA
 338238 338239 PSPTO5328 PSPTO5329     TRUE 0.944 34.000 0.408 0.020 N NA
 338239 338240 PSPTO5329 PSPTO5330     TRUE 0.984 4.000 0.210 1.000   NA
 338240 338241 PSPTO5330 PSPTO5331     FALSE 0.048 187.000 0.000 1.000   NA
 338241 338242 PSPTO5331 PSPTO5332     FALSE 0.175 183.000 0.000 0.020   NA
 338243 338244 PSPTO5333 PSPTO5334   hisF FALSE 0.445 133.000 0.006 1.000 Y NA
 338244 338245 PSPTO5334 PSPTO5335 hisF hisA TRUE 0.989 20.000 0.433 0.002 Y NA
 338245 338246 PSPTO5335 PSPTO5336 hisA   FALSE 0.183 106.000 0.016 NA   NA
 338246 338247 PSPTO5336 PSPTO5337   hisH TRUE 0.951 5.000 0.069 NA   NA
 338247 338248 PSPTO5337 PSPTO5338 hisH hisB TRUE 0.997 0.000 0.111 0.002 Y NA
 338248 338249 PSPTO5338 PSPTO5339 hisB tyrB TRUE 0.476 93.000 0.000 1.000 Y NA
 338249 338250 PSPTO5339 PSPTO5340 tyrB   FALSE 0.023 238.000 0.000 1.000   NA
 338251 338252 PSPTO5341 PSPTO5342   mutY FALSE 0.283 85.000 0.033 NA N NA
 338252 338253 PSPTO5342 PSPTO5343 mutY   TRUE 0.986 -3.000 0.150 NA N NA
 338253 401656 PSPTO5343 PSPTO_t60   tRNA-Phe-1 FALSE 0.101 101.000 0.000 NA   NA
 401656 338254 PSPTO_t60 PSPTO5344 tRNA-Phe-1   FALSE 0.027 208.000 0.000 NA   NA
 338254 338255 PSPTO5344 PSPTO5345     FALSE 0.061 158.000 0.000 NA   NA
 338255 338256 PSPTO5345 PSPTO5346     FALSE 0.001 1165.000 0.000 NA   NA
 338256 338257 PSPTO5346 PSPTO5347     FALSE 0.089 121.000 0.000 NA   NA
 338259 10692125 PSPTO5349 PSPTO_5350     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 10692125 338260 PSPTO_5350 PSPTO5351     FALSE 0.062 156.000 0.000 NA   NA
 338260 338261 PSPTO5351 PSPTO5352     FALSE 0.007 313.000 0.000 NA   NA
 338261 338262 PSPTO5352 PSPTO5353   schA(Pto) FALSE 0.066 169.000 0.000 1.000   NA
 338262 338263 PSPTO5353 PSPTO5354 schA(Pto) hopPsyA(Pto) FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 338263 338264 PSPTO5354 PSPTO5355 hopPsyA(Pto)   FALSE 0.089 124.000 0.000 NA   NA
 338266 338267 PSPTO5357 PSPTO5358     TRUE 0.996 15.000 0.824 1.000 Y NA
 338267 338268 PSPTO5358 PSPTO5359     TRUE 0.898 67.000 0.169 0.055 Y NA
 338268 338269 PSPTO5359 PSPTO5360     TRUE 0.998 -3.000 0.195 0.009 Y NA
 338269 338270 PSPTO5360 PSPTO5361     TRUE 0.969 2.000 0.069 NA   NA
 338271 338272 PSPTO5362 PSPTO5363     FALSE 0.002 528.000 0.000 NA   NA
 338273 401657 PSPTO5364 PSPTO_t61   tRNA-Thr-2 FALSE 0.160 57.000 0.000 NA   NA
 401657 338274 PSPTO_t61 PSPTO5365 tRNA-Thr-2   FALSE 0.001 1541.000 0.000 NA   NA
 338274 338275 PSPTO5365 PSPTO5367     FALSE 0.001 1718.000 0.000 NA   NA
 338275 338276 PSPTO5367 PSPTO5368     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 338276 338277 PSPTO5368 PSPTO5370     FALSE 0.010 608.000 0.000 NA Y NA
 338277 338278 PSPTO5370 PSPTO5371     FALSE 0.012 264.000 0.000 NA   NA
 338278 338279 PSPTO5371 PSPTO5373     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 338279 338280 PSPTO5373 PSPTO5374     FALSE 0.001 702.000 0.000 NA   NA
 338280 338281 PSPTO5374 PSPTO5375     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 338283 338284 PSPTO5377 PSPTO5378     TRUE 0.796 35.000 0.189 1.000   NA
 338284 338285 PSPTO5378 PSPTO5379     TRUE 0.984 -3.000 0.108 NA   NA
 338285 338286 PSPTO5379 PSPTO5380     TRUE 0.929 10.000 0.082 NA   NA
 338286 338287 PSPTO5380 PSPTO5381     TRUE 0.991 -3.000 0.203 1.000 N NA
 338287 338288 PSPTO5381 PSPTO5382     FALSE 0.022 419.000 0.000 1.000 Y NA
 338289 338290 PSPTO5383 PSPTO5384     FALSE 0.128 78.000 0.000 NA   NA
 338292 338293 PSPTO5386 PSPTO5387     FALSE 0.104 98.000 0.000 NA   NA
 338293 338294 PSPTO5387 PSPTO5388     TRUE 0.991 -10.000 0.600 NA N NA
 338294 338295 PSPTO5388 PSPTO5389     FALSE 0.061 175.000 0.000 1.000   NA
 338297 338298 PSPTO5391 PSPTO5392     FALSE 0.019 230.000 0.000 NA   NA
 338298 338299 PSPTO5392 PSPTO5393     FALSE 0.319 199.000 0.214 NA   NA
 338299 338300 PSPTO5393 PSPTO5394     TRUE 0.956 6.000 0.084 1.000   NA
 338300 338301 PSPTO5394 PSPTO5395     FALSE 0.009 308.000 0.000 1.000   NA
 338302 338303 PSPTO5396 PSPTO5397 rfbB-2 rfbC-2 TRUE 0.512 81.000 0.000 1.000 Y NA
 338303 338304 PSPTO5397 PSPTO5398 rfbC-2   FALSE 0.297 171.000 0.111 1.000 N NA
 338304 338305 PSPTO5398 PSPTO5399     TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.082 Y NA
 338305 338306 PSPTO5399 PSPTO5400     TRUE 0.839 -13.000 0.035 NA   NA
 338307 338308 PSPTO5401 PSPTO5402 cysQ   TRUE 0.911 30.000 0.373 1.000   NA
 338311 338312 PSPTO5405 PSPTO5406   fdhD TRUE 0.732 103.000 0.333 1.000 N NA
 338312 338313 PSPTO5406 PSPTO5407 fdhD   TRUE 1.000 -3.000 0.571 0.001 Y NA
 338313 338314 PSPTO5407 PSPTO5408     FALSE 0.068 168.000 0.000 1.000   NA
 338317 338318 PSPTO5411 PSPTO5412     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 338318 338319 PSPTO5412 PSPTO5413     FALSE 0.001 1891.000 0.000 NA   NA
 338319 338320 PSPTO5413 PSPTO5414     FALSE 0.001 911.000 0.000 1.000   NA
 338320 338321 PSPTO5414 PSPTO5415     TRUE 0.750 6.000 0.000 NA   NA
 338321 338322 PSPTO5415 PSPTO5416     TRUE 0.932 22.000 0.364 NA   NA
 338322 338323 PSPTO5416 PSPTO5417     TRUE 0.997 9.000 0.625 1.000 Y NA
 338323 338324 PSPTO5417 PSPTO5418     TRUE 0.989 0.000 0.188 NA   NA
 338324 338325 PSPTO5418 PSPTO5419     TRUE 0.982 -37.000 0.600 NA   NA
 338325 338326 PSPTO5419 PSPTO5420     TRUE 0.997 6.000 0.833 NA   NA
 338326 338327 PSPTO5420 PSPTO5421     TRUE 0.999 3.000 1.000 NA   NA
 338327 338328 PSPTO5421 PSPTO5422     TRUE 0.986 6.000 0.333 NA   NA
 338328 338329 PSPTO5422 PSPTO5423     TRUE 0.927 18.000 0.278 NA   NA
 338329 338330 PSPTO5423 PSPTO5424     TRUE 0.926 64.000 0.667 NA   NA
 338330 338331 PSPTO5424 PSPTO5425     TRUE 0.969 11.000 0.118 0.016   NA
 338331 338332 PSPTO5425 PSPTO5426     TRUE 0.934 14.000 0.196 NA   NA
 338332 338333 PSPTO5426 PSPTO5427     TRUE 0.991 -36.000 0.863 NA   NA
 338333 338334 PSPTO5427 PSPTO5428     FALSE 0.001 1471.000 0.000 NA   NA
 338334 10692126 PSPTO5428 PSPTO_5646     FALSE 0.049 173.000 0.000 NA   NA
 10692126 10692127 PSPTO_5646 PSPTO_5645     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 338336 338337 PSPTO5430 PSPTO5431     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 338337 338338 PSPTO5431 PSPTO5432     TRUE 0.986 14.000 0.627 NA   NA
 338338 338339 PSPTO5432 PSPTO5433     TRUE 0.643 29.000 0.060 NA   NA
 338339 338340 PSPTO5433 PSPTO5434     TRUE 0.657 33.000 0.080 NA   NA
 338341 338342 PSPTO5435 PSPTO5436 hcp-2   TRUE 0.867 132.000 0.667 NA   NA
 338342 338343 PSPTO5436 PSPTO5437     FALSE 0.191 44.000 0.000 NA   NA
 338343 338344 PSPTO5437 PSPTO5438     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 338344 10692128 PSPTO5438 PSPTO_5439     FALSE 0.002 553.000 0.000 NA   NA
 338346 338347 PSPTO5442 PSPTO5443     FALSE 0.102 100.000 0.000 NA   NA
 338348 338349 PSPTO5444 PSPTO5445     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 338349 338350 PSPTO5445 PSPTO5446     FALSE 0.169 52.000 0.000 NA   NA
 338350 338351 PSPTO5446 PSPTO5447     FALSE 0.004 378.000 0.000 NA   NA
 338352 338353 PSPTO5448 PSPTO5449     TRUE 0.551 -19.000 0.000 NA   NA
 338353 338354 PSPTO5449 PSPTO5450     FALSE 0.041 183.000 0.000 NA   NA
 338354 338355 PSPTO5450 PSPTO5451     FALSE 0.009 286.000 0.000 NA   NA
 338356 338357 PSPTO5452 PSPTO5453     FALSE 0.406 21.000 0.000 1.000   NA
 338357 338358 PSPTO5453 PSPTO5454     FALSE 0.007 320.000 0.000 1.000 N NA
 338358 338359 PSPTO5454 PSPTO5455     FALSE 0.001 806.000 0.000 NA   NA
 338359 338360 PSPTO5455 PSPTO5456     TRUE 0.498 61.000 0.063 NA   NA
 338360 338361 PSPTO5456 PSPTO5457     TRUE 0.996 -3.000 0.400 1.000   NA
 338361 338362 PSPTO5457 PSPTO5458     TRUE 0.955 34.000 0.667 NA   NA
 406461 2209180 PSPTO_r13 PSPTO_r14 Ps5SE Ps23SE FALSE 0.067 148.000 0.000 NA   NA
 2209180 401659 PSPTO_r14 PSPTO_t62 Ps23SE tRNA-Ala-7 FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 401659 401658 PSPTO_t62 PSPTO_t63 tRNA-Ala-7 tRNA-Ile-5 FALSE 0.187 45.000 0.000 NA   NA
 401658 2209181 PSPTO_t63 PSPTO_r15 tRNA-Ile-5 Ps16SE FALSE 0.099 104.000 0.000 NA   NA
 338364 338365 PSPTO5460 PSPTO5461     TRUE 0.923 13.000 0.143 1.000 N NA
 338366 10692130 PSPTO5462 PSPTO_5463     FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 10692130 338367 PSPTO_5463 PSPTO5464   pntB TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 338367 338368 PSPTO5464 PSPTO5465 pntB   FALSE 0.466 180.000 0.077 1.000 Y NA
 338368 338369 PSPTO5465 PSPTO5466     FALSE 0.006 321.000 0.000 NA   NA
 338369 338370 PSPTO5466 PSPTO5467     FALSE 0.006 316.000 0.000 NA   NA
 338370 338371 PSPTO5467 PSPTO5468     TRUE 0.928 88.000 0.800 NA   NA
 338371 338372 PSPTO5468 PSPTO5469     FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 338373 338374 PSPTO5470 PSPTO5471     TRUE 0.772 5.000 0.000 NA   NA
 338374 338375 PSPTO5471 PSPTO5472     FALSE 0.011 265.000 0.000 NA   NA
 338375 338376 PSPTO5472 PSPTO5473   rubB TRUE 0.611 129.000 0.229 1.000   NA
 338376 338377 PSPTO5473 PSPTO5474 rubB rubA TRUE 0.855 49.000 0.208 0.032   NA
 338378 338379 PSPTO5475 PSPTO5476   ubiA TRUE 0.997 0.000 0.248 NA Y NA
 338379 338380 PSPTO5476 PSPTO5477 ubiA phoB FALSE 0.181 169.000 0.043 1.000 N NA
 338380 338381 PSPTO5477 PSPTO5478 phoB phoR TRUE 0.962 61.000 0.453 0.077 Y NA
 338381 338382 PSPTO5478 PSPTO5479 phoR   FALSE 0.288 100.000 0.037 NA   NA
 338383 338384 PSPTO5480 PSPTO5481     FALSE 0.013 257.000 0.000 NA   NA
 338384 338385 PSPTO5481 PSPTO5482     FALSE 0.021 224.000 0.000 NA   NA
 338385 338386 PSPTO5482 PSPTO5483   phoU FALSE 0.070 203.000 0.027 NA N NA
 338386 338387 PSPTO5483 PSPTO5484 phoU pstB-2 TRUE 0.898 71.000 0.330 NA Y NA
 338387 338388 PSPTO5484 PSPTO5485 pstB-2   TRUE 0.974 67.000 0.511 0.002 Y NA
 338388 338389 PSPTO5485 PSPTO5486     TRUE 0.990 12.000 0.489 0.085   NA
 338389 338390 PSPTO5486 PSPTO5487     FALSE 0.087 381.000 0.211 0.065   NA
 338390 338391 PSPTO5487 PSPTO5488     FALSE 0.249 170.000 0.020 0.065 N NA
 338392 338393 PSPTO5489 PSPTO5490     FALSE 0.228 91.000 0.025 NA N NA
 338394 338395 PSPTO5491 PSPTO5492     TRUE 0.798 69.000 0.333 NA   NA
 338395 338396 PSPTO5492 PSPTO5493   purK FALSE 0.041 288.000 0.050 1.000   NA
 338396 338397 PSPTO5493 PSPTO5494 purK purE TRUE 0.992 10.000 0.136 0.000 Y NA
 338398 338399 PSPTO5495 PSPTO5496     FALSE 0.196 42.000 0.000 NA   NA
 338399 338400 PSPTO5496 PSPTO5497     FALSE 0.157 59.000 0.000 NA   NA
 338402 338403 PSPTO5499 PSPTO5500 aspA   FALSE 0.065 283.000 0.000 1.000 Y NA
 338403 338404 PSPTO5500 PSPTO5501   ansA TRUE 0.880 30.000 0.095 1.000 Y NA
 338405 338406 PSPTO5502 PSPTO5503     FALSE 0.083 133.000 0.000 NA   NA
 338406 338407 PSPTO5503 PSPTO5504     FALSE 0.431 55.000 0.042 NA   NA
 338408 338409 PSPTO5505 PSPTO5506     TRUE 0.973 -3.000 0.047 1.000   NA
 338409 338410 PSPTO5506 PSPTO5507     TRUE 0.989 16.000 0.556 0.006   NA
 338410 338411 PSPTO5507 PSPTO5508     FALSE 0.006 331.000 0.000 1.000 N NA
 338411 338412 PSPTO5508 PSPTO5509     TRUE 0.584 57.000 0.000 1.000 Y NA
 338413 338414 PSPTO5510 PSPTO5511 oadA   TRUE 0.838 103.000 0.354 0.051 N NA
 338419 338420 PSPTO5516 PSPTO5517 uvrD   FALSE 0.027 225.000 0.000 1.000   NA
 338420 338421 PSPTO5517 PSPTO5518     FALSE 0.172 131.000 0.018 NA   NA
 338428 338429 PSPTO5525 PSPTO5526     TRUE 0.994 0.000 0.333 NA   NA
 338431 338432 PSPTO5528 PSPTO5529     FALSE 0.032 199.000 0.000 NA   NA
 338433 338434 PSPTO5530 PSPTO5531 cls   FALSE 0.134 73.000 0.000 NA   NA
 338435 338436 PSPTO5532 PSPTO5533 cadA-2   TRUE 0.998 -3.000 0.700 1.000 N NA
 338436 338437 PSPTO5533 PSPTO5534     TRUE 0.993 -3.000 0.022 0.085 Y NA
 338437 338438 PSPTO5534 PSPTO5535     TRUE 0.962 12.000 0.019 0.085 Y NA
 338439 338440 PSPTO5536 PSPTO5537     TRUE 0.916 33.000 0.215 NA Y NA
 338440 338441 PSPTO5537 PSPTO5538     TRUE 0.994 -3.000 0.285 NA   NA
 338441 338442 PSPTO5538 PSPTO5539     TRUE 0.760 24.000 0.090 NA   NA
 338442 338443 PSPTO5539 PSPTO5540     TRUE 0.955 9.000 0.140 NA   NA
 338443 338444 PSPTO5540 PSPTO5541   cdsA-2 TRUE 0.998 0.000 0.595 1.000   NA
 338444 338445 PSPTO5541 PSPTO5542 cdsA-2   FALSE 0.004 402.000 0.000 1.000   NA
 338446 338447 PSPTO5543 PSPTO5544     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 338448 338449 PSPTO5545 PSPTO5546     TRUE 0.986 2.000 0.188 NA   NA
 338449 338450 PSPTO5546 PSPTO5547     FALSE 0.406 21.000 0.000 1.000   NA
 338451 338452 PSPTO5548 PSPTO5549     TRUE 0.999 0.000 0.800 1.000 Y NA
 338452 338453 PSPTO5549 PSPTO5550     TRUE 0.731 50.000 0.095 0.081 N NA
 338453 338454 PSPTO5550 PSPTO5551     TRUE 0.982 32.000 0.667 1.000 Y NA
 338456 338457 PSPTO5553 PSPTO5554     FALSE 0.442 177.000 0.000 0.011 Y NA
 338458 338459 PSPTO5555 PSPTO5556     FALSE 0.002 550.000 0.000 NA   NA
 338461 338462 PSPTO5558 PSPTO5559     TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 338462 338463 PSPTO5559 PSPTO5560     FALSE 0.221 38.000 0.000 1.000 N NA
 338463 338464 PSPTO5560 PSPTO5561     TRUE 0.996 0.000 0.211 1.000 Y NA
 338464 338465 PSPTO5561 PSPTO5562     TRUE 0.978 1.000 0.000 1.000 Y NA
 338465 338466 PSPTO5562 PSPTO5563     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 338466 338467 PSPTO5563 PSPTO5564     FALSE 0.129 82.000 0.000 1.000 N NA
 338468 338469 PSPTO5565 PSPTO5566     FALSE 0.001 853.000 0.000 NA   NA
 338474 10692133 PSPTO5573 PSPTO_5574     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 10692133 338475 PSPTO_5574 PSPTO5575     FALSE 0.163 55.000 0.000 NA   NA
 338475 338476 PSPTO5575 PSPTO5576     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 338476 10692134 PSPTO5576 PSPTO_5577     FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 10692134 338477 PSPTO_5577 PSPTO5578     FALSE 0.109 93.000 0.000 NA   NA
 338483 338484 PSPTO5584 PSPTO5585     FALSE 0.039 202.000 0.000 1.000   NA
 338484 338485 PSPTO5585 PSPTO5586     TRUE 0.995 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 338485 338486 PSPTO5586 PSPTO5587     TRUE 0.981 9.000 0.100 1.000 Y NA
 338486 338487 PSPTO5587 PSPTO5588     TRUE 0.523 77.000 0.000 1.000 Y NA
 338487 338488 PSPTO5588 PSPTO5589     FALSE 0.191 44.000 0.000 NA   NA
 338488 338489 PSPTO5589 PSPTO5590     FALSE 0.004 357.000 0.000 NA   NA
 338489 338490 PSPTO5590 PSPTO5591     TRUE 0.769 18.000 0.061 NA   NA
 338491 10692135 PSPTO5592 PSPTO_5593     FALSE 0.117 86.000 0.000 NA   NA
 10692135 338492 PSPTO_5593 PSPTO5595   glmS FALSE 0.001 1886.000 0.000 NA   NA
 338492 338493 PSPTO5595 PSPTO5596 glmS   TRUE 0.985 10.000 0.412 1.000 N NA
 338493 338494 PSPTO5596 PSPTO5597   glmU FALSE 0.007 370.000 0.010 1.000 N NA
 338494 338495 PSPTO5597 PSPTO5598 glmU atpC FALSE 0.356 126.000 0.067 1.000 N NA
 338495 338496 PSPTO5598 PSPTO5599 atpC atpD TRUE 0.991 51.000 0.837 0.002 Y NA
 338496 338497 PSPTO5599 PSPTO5600 atpD atpG TRUE 0.993 28.000 0.724 0.002 Y NA
 338497 338498 PSPTO5600 PSPTO5601 atpG atpA TRUE 0.991 51.000 0.846 0.002 Y NA
 338498 338499 PSPTO5601 PSPTO5602 atpA atpH TRUE 0.996 22.000 0.864 0.002 Y NA
 338499 338500 PSPTO5602 PSPTO5603 atpH atpF TRUE 0.991 13.000 0.242 0.002 Y NA
 338500 338501 PSPTO5603 PSPTO5604 atpF atpE TRUE 0.965 58.000 0.666 0.002   NA
 338501 338502 PSPTO5604 PSPTO5605 atpE atpB TRUE 0.903 139.000 0.557 0.002   NA
 338502 338503 PSPTO5605 PSPTO5606 atpB atpI TRUE 0.988 17.000 0.291 0.002 Y NA
 338503 338504 PSPTO5606 PSPTO5607 atpI   FALSE 0.265 147.000 0.056 1.000 N NA
 338504 338505 PSPTO5607 PSPTO5608     TRUE 0.996 10.000 0.827 1.000 N NA
 338505 338506 PSPTO5608 PSPTO5609   gidB TRUE 0.936 19.000 0.339 1.000 N NA
 338506 338507 PSPTO5609 PSPTO5610 gidB gidA TRUE 0.992 6.000 0.466 1.000 N NA
 338507 338508 PSPTO5610 PSPTO5611 gidA trmE FALSE 0.030 580.000 0.266 1.000   NA
 338508 338509 PSPTO5611 PSPTO5612 trmE   TRUE 0.806 79.000 0.221 0.048   NA
 338509 338510 PSPTO5612 PSPTO5613     TRUE 0.995 3.000 0.461 NA   NA
 338510 338511 PSPTO5613 PSPTO5614   rnpA TRUE 0.993 -7.000 0.540 NA   NA
 338511 338512 PSPTO5614 PSPTO5615 rnpA rpmH TRUE 0.987 17.000 0.787 1.000   NA
 2209182 2209183 PSPTOA0001 PSPTOA0002 repA rulA FALSE 0.076 139.000 0.000 NA   NA
 2209183 10692003 PSPTOA0002 PSPTOA0003 rulA   TRUE 0.531 -22.000 0.000 NA   NA
 10692003 2209184 PSPTOA0003 PSPTOA0004     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 2209184 2209185 PSPTOA0004 PSPTO_A0072     TRUE 0.857 24.000 0.059 0.011   NA
 2209187 2209188 PSPTOA0007 PSPTOA0008     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 2209188 2209189 PSPTOA0008 PSPTOA0009     FALSE 0.189 221.000 0.154 1.000 N NA
 2209189 2209190 PSPTOA0009 PSPTOA0010     FALSE 0.001 740.000 0.000 1.000 N NA
 2209192 2209193 PSPTOA0012 PSPTOA0013 HopX1   FALSE 0.012 264.000 0.000 NA   NA
 2209194 2209195 PSPTOA0014 PSPTOA0015     TRUE 0.868 21.000 0.176 1.000   NA
 2209195 10692005 PSPTOA0015 PSPTOA0016     FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 10692005 2209196 PSPTOA0016 PSPTOA0017   shc01 FALSE 0.002 476.000 0.000 NA   NA
 2209196 2209197 PSPTOA0017 PSPTOA0018 shc01 hopO1-1 FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 2209197 2209198 PSPTOA0018 PSPTOA0019 hopO1-1 hopT1-1 TRUE 0.699 9.000 0.000 NA   NA
 10692006 2209199 PSPTOA0020 PSPTOA0021     FALSE 0.002 538.000 0.000 NA   NA
 2209202 2209203 PSPTOA0024 PSPTOA0025     FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 2209203 2209204 PSPTOA0025 PSPTOA0026     FALSE 0.158 58.000 0.000 NA   NA
 2209206 2209207 PSPTOA0028 PSPTOA0029     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 2209208 2209209 PSPTOA0030 PSPTOA0031     FALSE 0.006 806.000 0.000 0.003   NA
 2209209 2209210 PSPTOA0031 PSPTOA0032   lsc-3 FALSE 0.439 80.000 0.000 0.011   NA
 2209213 2209214 PSPTOA0035 PSPTOA0036     FALSE 0.174 69.000 0.000 1.000   NA
 2209214 2209215 PSPTOA0036 PSPTOA0037     FALSE 0.244 41.000 0.000 1.000   NA
 2209215 2209216 PSPTOA0037 PSPTOA0038     FALSE 0.200 41.000 0.000 NA   NA
 2209218 2209219 PSPTOA0040 PSPTOA0041     FALSE 0.006 316.000 0.000 NA   NA
 2209219 2209220 PSPTOA0041 PSPTOA0042   pilT TRUE 0.828 3.000 0.000 NA   NA
 2209220 2209221 PSPTOA0042 PSPTOA0043 pilT   FALSE 0.215 37.000 0.000 NA   NA
 2209221 2209222 PSPTOA0043 PSPTOA0044   traI TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 2209222 2209223 PSPTOA0044 PSPTOA0045 traI   TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 2209223 2209224 PSPTOA0045 PSPTOA0046     FALSE 0.002 573.000 0.000 NA   NA
 2209224 2209225 PSPTOA0046 PSPTOA0047     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 2209225 2209226 PSPTOA0047 PSPTOA0048   traK-2 FALSE 0.007 311.000 0.000 NA   NA
 2209226 2209227 PSPTOA0048 PSPTOA0049 traK-2   FALSE 0.247 152.000 0.056 NA   NA
 2209227 2209228 PSPTOA0049 PSPTOA0050   traL-2 TRUE 0.668 26.000 0.056 NA   NA
 2209228 2209229 PSPTOA0050 PSPTOA0051 traL-2 traM-2 TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 2209229 2209230 PSPTOA0051 PSPTOA0052 traM-2 traN-2 TRUE 0.931 57.000 0.667 NA   NA
 2209230 2209231 PSPTOA0052 PSPTOA0053 traN-2 traO-2 TRUE 0.998 6.000 1.000 NA   NA
 2209231 2209232 PSPTOA0053 PSPTOA0054 traO-2 traP-2 TRUE 0.973 42.000 1.000 NA   NA
 2209232 2209233 PSPTOA0054 PSPTOA0055 traP-2 traQ-2 TRUE 0.997 9.000 1.000 NA   NA
 2209233 2209234 PSPTOA0055 PSPTOA0056 traQ-2 traR-2 FALSE 0.131 76.000 0.000 NA   NA
 2209235 2209236 PSPTOA0057 PSPTOA0058     TRUE 0.892 -22.000 0.100 NA   NA
 2209237 2209238 PSPTOA0059 PSPTOA0060 traT traU-2 TRUE 0.995 -16.000 1.000 NA   NA
 2209238 2209239 PSPTOA0060 PSPTOA0061 traU-2   FALSE 0.317 24.000 0.000 NA   NA
 2209239 2209240 PSPTOA0061 PSPTOA0062   traW-2 FALSE 0.193 43.000 0.000 NA   NA
 2209240 2209241 PSPTOA0062 PSPTOA0063 traW-2 traX-2 TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 2209241 2209242 PSPTOA0063 PSPTOA0064 traX-2 traY-2 FALSE 0.265 29.000 0.000 NA   NA
 2209242 2209243 PSPTOA0064 PSPTOA0065 traY-2   FALSE 0.132 344.000 0.400 NA   NA
 2209243 2209244 PSPTOA0065 PSPTOA0066   trbA TRUE 0.789 93.000 0.400 NA   NA
 2209244 2209245 PSPTOA0066 PSPTOA0067 trbA trbB FALSE 0.117 86.000 0.000 NA   NA
 2209245 2209246 PSPTOA0067 PSPTOA0068 trbB   TRUE 0.604 -13.000 0.000 NA   NA
 2209246 2209247 PSPTOA0068 PSPTOA0069     FALSE 0.278 28.000 0.000 NA   NA
 2209247 2209248 PSPTOA0069 PSPTOA0070     FALSE 0.470 -39.000 0.000 NA   NA
 2209248 2209249 PSPTOA0070 PSPTOA0071     FALSE 0.037 188.000 0.000 NA   NA
 2209249 2209182 PSPTOA0071 PSPTOA0001   repA FALSE 0.002 705.000 0.000 1.000   NA
 10691996 2209253 PSPTO_B0004 PSPTO_B0005   plcA2 FALSE 0.002 477.000 0.000 NA   NA
 2209253 2209254 PSPTO_B0005 PSPTO_B0006 plcA2   FALSE 0.001 1144.000 0.000 NA   NA
 2209256 2209257 PSPTO_B0008 PSPTO_B0009     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 2209258 10691997 PSPTO_B0010 PSPTO_B0011     FALSE 0.071 145.000 0.000 NA   NA
 2209259 2209260 PSPTO_B0012 PSPTO_B0013     FALSE 0.001 1009.000 0.000 NA   NA
 10691998 2209261 PSPTO_B0014 PSPTO_B0015     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 2209261 2209262 PSPTO_B0015 PSPTO_B0016     FALSE 0.335 22.000 0.000 NA   NA
 2209262 10691999 PSPTO_B0016 PSPTO_B0017     FALSE 0.002 548.000 0.000 NA   NA
 2209263 2209264 PSPTO_B0018 PSPTO_B0019 stbB stbC TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 2209264 2209265 PSPTO_B0019 PSPTO_B0020 stbC   FALSE 0.005 337.000 0.000 NA   NA
 2209265 2209266 PSPTO_B0020 PSPTO_B0021     FALSE 0.001 643.000 0.000 NA   NA
 2209267 2209268 PSPTO_B0022 PSPTO_B0023     FALSE 0.211 38.000 0.000 NA   NA
 2209270 2209271 PSPTO_B0025 PSPTO_B0026     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA   NA
 2209271 2209272 PSPTO_B0026 PSPTO_B0027     FALSE 0.189 62.000 0.000 1.000   NA
 2209274 2209275 PSPTO_B0029 PSPTO_B0030     FALSE 0.181 47.000 0.000 NA   NA
 2209275 2209276 PSPTO_B0030 PSPTO_B0031     FALSE 0.142 68.000 0.000 NA   NA
 2209277 2209278 PSPTO_B0032 PSPTO_B0033     FALSE 0.191 44.000 0.000 NA   NA
 2209278 2209279 PSPTO_B0033 PSPTO_B0034     TRUE 0.509 -27.000 0.000 NA   NA
 2209280 2209281 PSPTO_B0035 PSPTO_B0036     TRUE 0.972 11.000 0.286 NA   NA
 2209281 2209282 PSPTO_B0036 PSPTO_B0037     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 2209282 10692000 PSPTO_B0037 PSPTO_B0038     FALSE 0.240 32.000 0.000 NA   NA
 2209283 2209284 PSPTO_B0039 PSPTO_B0040     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 10692001 2209285 PSPTO_B0041 PSPTO_B0042     FALSE 0.142 68.000 0.000 NA   NA
 2209285 2209286 PSPTO_B0042 PSPTO_B0043     FALSE 0.240 42.000 0.000 1.000   NA
 2209286 2209287 PSPTO_B0043 PSPTO_B0044     FALSE 0.161 56.000 0.000 NA   NA
 2209289 2209290 PSPTO_B0046 PSPTO_B0047     TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 2209290 2209291 PSPTO_B0047 PSPTO_B0048     FALSE 0.392 18.000 0.000 NA   NA
 2209291 2209292 PSPTO_B0048 PSPTO_B0049     FALSE 0.196 42.000 0.000 NA   NA
 2209292 2209293 PSPTO_B0049 PSPTO_B0050     FALSE 0.215 37.000 0.000 NA   NA
 2209293 2209294 PSPTO_B0050 PSPTO_B0051     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 2209294 2209295 PSPTO_B0051 PSPTO_B0052     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 2209295 2209296 PSPTO_B0052 PSPTO_B0053     TRUE 0.858 1.000 0.000 NA   NA
 2209296 2209297 PSPTO_B0053 PSPTO_B0054   nuc FALSE 0.208 39.000 0.000 NA   NA
 2209297 2209298 PSPTO_B0054 PSPTO_B0055 nuc   FALSE 0.215 37.000 0.000 NA   NA
 2209298 2209299 PSPTO_B0055 PSPTO_B0056   traK-1 FALSE 0.265 29.000 0.000 NA   NA
 2209299 2209300 PSPTO_B0056 PSPTO_B0057 traK-1   TRUE 0.531 43.000 0.056 NA   NA
 2209300 2209301 PSPTO_B0057 PSPTO_B0058   traL-1 TRUE 0.668 26.000 0.056 NA   NA
 2209301 2209302 PSPTO_B0058 PSPTO_B0059 traL-1 traM-1 TRUE 0.967 27.000 0.667 NA   NA
 2209302 2209303 PSPTO_B0059 PSPTO_B0060 traM-1 traN-1 TRUE 0.931 57.000 0.667 NA   NA
 2209303 2209304 PSPTO_B0060 PSPTO_B0061 traN-1 traO-1 TRUE 0.998 6.000 1.000 NA   NA
 2209304 2209305 PSPTO_B0061 PSPTO_B0062 traO-1 traP-1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 2209305 2209306 PSPTO_B0062 PSPTO_B0063 traP-1 traQ-1 TRUE 0.997 9.000 1.000 NA   NA
 2209306 2209307 PSPTO_B0063 PSPTO_B0064 traQ-1 traR-1 FALSE 0.139 70.000 0.000 NA   NA
 2209307 10692002 PSPTO_B0064 PSPTO_B0065 traR-1   FALSE 0.062 157.000 0.000 NA   NA
 10692002 2209308 PSPTO_B0065 PSPTO_B0066   traU-1 TRUE 0.516 -25.000 0.000 NA   NA
 2209308 2209309 PSPTO_B0066 PSPTO_B0067 traU-1 traW-1 TRUE 0.987 11.000 0.500 NA   NA
 2209309 2209310 PSPTO_B0067 PSPTO_B0068 traW-1 traX-1 TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 2209310 2209311 PSPTO_B0068 PSPTO_B0069 traX-1 traY-1 FALSE 0.247 31.000 0.000 NA   NA
 2209311 2209312 PSPTO_B0069 PSPTO_B0070 traY-1   FALSE 0.131 76.000 0.000 NA   NA
 2209312 2209313 PSPTO_B0070 PSPTO_B0071     TRUE 0.888 -3.000 0.000 NA   NA
 2209313 2209314 PSPTO_B0071 PSPTO_B0072     TRUE 0.789 93.000 0.400 NA   NA
 2209315 2209316 PSPTO_B0073 PSPTO_B0074     TRUE 0.998 -3.000 0.689 NA   NA
 2209317 2209318 PSPTO_B0075 PSPTO_B0076   trbC TRUE 0.604 -13.000 0.000 NA   NA
 2209318 2209319 PSPTO_B0076 PSPTO_B0077 trbC   FALSE 0.128 78.000 0.000 NA   NA
 2209319 2209250 PSPTO_B0077 PSPTO_B0001     FALSE 0.004 411.000 0.000 1.000   NA