For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.
Also see:
| Column | Description |
| Gene1 | VIMSS id of 1st gene in pair |
| SysName1 | Systematic name of 1st gene in pair |
| Name1 | Ordinary name of 1st gene in pair |
| Gene2 | VIMSS id of 2nd gene in pair |
| SysName2 | Systematic name of 2nd gene in pair |
| Name2 | Ordinary name of 2nd gene in pair |
| bOp | Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not |
| pOp | Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions. |
| Sep | Distance between the two genes, in base pairs |
| MOGScore | Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved) |
| GOScore | Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized |
| COGSim | Whether the genes share a COG category or not |
| ExprSim | Correlation of expression patterns (not available for most genomes) |
| Gene1 | Gene2 | SysName1 | SysName2 | Name1 | Name2 | bOp | pOp | Sep | MOGScore | GOScore | COGSim | ExprSim |
| 5499447 | 5499448 | AMF_001 | AMF_002 | purE | TRUE | 0.952 | -7.000 | 0.008 | NA | NA | ||
| 5499449 | 5499450 | AMF_005 | AMF_006 | rodA | ihfA | FALSE | 0.248 | 75.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499450 | 5499451 | AMF_006 | AMF_007 | ihfA | TRUE | 0.994 | -3.000 | 0.562 | 1.000 | NA | ||
| 5499451 | 5499452 | AMF_007 | AMF_1060 | TRUE | 0.801 | -9.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499453 | 5499454 | AMF_008 | AMF_009 | FALSE | 0.233 | 90.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499455 | 5499456 | AMF_1061 | AMF_010 | murC | FALSE | 0.566 | 13.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499457 | 5499458 | AMF_011 | AMF_012 | trpS | grpE | TRUE | 0.979 | -3.000 | 0.013 | 1.000 | N | NA |
| 5499460 | 5499461 | AMF_015 | AMF_016 | pyrG | secG | TRUE | 0.972 | 13.000 | 0.118 | 1.000 | N | NA |
| 5499462 | 5499463 | AMF_017 | AMF_018 | xerD | TRUE | 0.808 | -7.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499465 | 5499466 | AMF_020 | AMF_021 | maeB | FALSE | 0.322 | 174.000 | 0.020 | NA | NA | ||
| 5499466 | 5499467 | AMF_021 | AMF_022 | nuoN | FALSE | 0.013 | 220.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499468 | 5499469 | AMF_1032 | AMF_023 | FALSE | 0.100 | 135.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499469 | 5499470 | AMF_023 | AMF_024 | FALSE | 0.274 | 67.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499473 | 5499474 | AMF_027 | AMF_028 | thiS | thiG | TRUE | 0.661 | 63.000 | 0.000 | 1.000 | Y | NA |
| 5499476 | 5499477 | AMF_030 | AMF_1062 | gltX | FALSE | 0.012 | 225.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499477 | 5499478 | AMF_1062 | AMF_031 | FALSE | 0.100 | 135.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499478 | 5499479 | AMF_031 | AMF_032 | TRUE | 0.787 | 20.000 | 0.008 | NA | NA | |||
| 5499484 | 5499485 | AMF_038 | AMF_041 | glmU | ptr1 | FALSE | 0.031 | 181.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499485 | 5499486 | AMF_041 | AMF_042 | ptr1 | pheS | FALSE | 0.431 | 91.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 5499486 | 5499487 | AMF_042 | AMF_043 | pheS | rplT | TRUE | 0.990 | -37.000 | 0.239 | 1.000 | Y | NA |
| 5499487 | 5499488 | AMF_043 | AMF_1033 | rplT | rpmI | TRUE | 0.982 | 27.000 | 0.963 | 0.060 | Y | NA |
| 5499489 | 5499490 | AMF_044 | AMF_045 | rho | FALSE | 0.352 | 109.000 | 0.005 | NA | NA | ||
| 5499490 | 5499491 | AMF_045 | AMF_047 | rho | FALSE | 0.005 | 392.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499491 | 5499492 | AMF_047 | AMF_048 | FALSE | 0.006 | 1884.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499492 | 5499493 | AMF_048 | AMF_049 | FALSE | 0.274 | 67.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499493 | 5499494 | AMF_049 | AMF_050 | fpbA | FALSE | 0.005 | 542.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499494 | 5499495 | AMF_050 | AMF_1034 | fpbA | FALSE | 0.598 | 28.000 | 0.006 | 1.000 | NA | ||
| 5499498 | 5499499 | AMF_1063 | AMF_053 | FALSE | 0.262 | 70.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499500 | 5499501 | AMF_054 | AMF_055 | TRUE | 0.865 | 99.000 | 0.081 | NA | NA | |||
| 5499501 | 5499502 | AMF_055 | AMF_056 | omp14 | FALSE | 0.023 | 187.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499503 | 5499504 | AMF_057 | AMF_058 | FALSE | 0.193 | 104.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499505 | 5499506 | AMF_059 | AMF_061 | recA | FALSE | 0.005 | 403.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499506 | 5499507 | AMF_061 | AMF_062 | recA | pyrE | FALSE | 0.358 | 95.000 | 0.004 | 1.000 | N | NA |
| 5499507 | 5499508 | AMF_062 | AMF_063 | pyrE | thiF | TRUE | 0.907 | 34.000 | 0.033 | 1.000 | N | NA |
| 5499511 | 5499512 | AMF_066 | AMF_067 | TRUE | 0.793 | 85.000 | 0.020 | 1.000 | NA | |||
| 5499514 | 5499515 | AMF_069 | AMF_070 | trxA | trbG | TRUE | 0.988 | 9.000 | 0.333 | NA | NA | |
| 5499515 | 5499516 | AMF_070 | AMF_071 | trbG | pdhA | FALSE | 0.011 | 251.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 5499516 | 5499517 | AMF_071 | AMF_072 | pdhA | TRUE | 0.921 | -28.000 | 0.008 | NA | NA | ||
| 5499518 | 5499519 | AMF_1055 | AMF_1058 | rrl | rrf | FALSE | 0.249 | 77.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499520 | 5499521 | AMF_073 | AMF_074 | guaB | FALSE | 0.596 | 58.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA | |
| 5499521 | 5499522 | AMF_074 | AMF_076 | rpmE | TRUE | 0.991 | -3.000 | 0.059 | 1.000 | N | NA | |
| 5499523 | 5499524 | AMF_077 | AMF_078 | fabD | tmk | TRUE | 0.877 | 2.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 5499524 | 5499525 | AMF_078 | AMF_079 | tmk | TRUE | 0.647 | 55.000 | 0.007 | NA | N | NA | |
| 5499527 | 5499528 | AMF_081 | AMF_083 | secB | TRUE | 0.951 | -46.000 | 0.018 | NA | N | NA | |
| 5499530 | 5499531 | AMF_085 | AMF_086 | FALSE | 0.005 | 306.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499532 | 5499533 | AMF_087 | AMF_089 | ribE | msp1B-2 | FALSE | 0.006 | 282.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499533 | 5499534 | AMF_089 | AMF_090 | msp1B-2 | FALSE | 0.010 | 231.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499534 | 5499535 | AMF_090 | AMF_091 | mfd | TRUE | 0.731 | -22.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499536 | 5499537 | AMF_092 | AMF_093 | rnhA | TRUE | 0.967 | 10.000 | 0.020 | NA | NA | ||
| 5499537 | 5499538 | AMF_093 | AMF_094 | pyrH | FALSE | 0.314 | 43.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499538 | 5499539 | AMF_094 | AMF_095 | pyrH | rrf | TRUE | 0.991 | 9.000 | 0.736 | 1.000 | N | NA |
| 5499539 | 5499540 | AMF_095 | AMF_096 | rrf | uppS | TRUE | 0.994 | 1.000 | 0.300 | 1.000 | N | NA |
| 5499540 | 5499541 | AMF_096 | AMF_097 | uppS | cdsA | TRUE | 0.989 | -46.000 | 0.344 | 1.000 | Y | NA |
| 5499542 | 5499543 | AMF_098 | AMF_099 | FALSE | 0.077 | 144.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499543 | 5499544 | AMF_099 | AMF_100 | purC | FALSE | 0.077 | 144.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499547 | 5499548 | AMF_103 | AMF_104 | coxW | panB | FALSE | 0.329 | 35.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499549 | 5499550 | AMF_105 | AMF_106 | ccmA | murA | FALSE | 0.513 | 15.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499550 | 5499551 | AMF_106 | AMF_107 | murA | dcd | TRUE | 0.836 | 2.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499551 | 5499552 | AMF_107 | AMF_108 | dcd | FALSE | 0.203 | 99.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 5499553 | 5499554 | AMF_109 | AMF_110 | cspA | ntrY | TRUE | 0.907 | 42.000 | 0.046 | 1.000 | N | NA |
| 5499554 | 5499555 | AMF_110 | AMF_111 | ntrY | rnd | TRUE | 0.972 | -31.000 | 0.028 | 1.000 | N | NA |
| 5499556 | 5499557 | AMF_112 | AMF_113 | ligA | grxC2 | TRUE | 0.915 | 9.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA |
| 5499557 | 5499558 | AMF_113 | AMF_114 | grxC2 | TRUE | 0.994 | -10.000 | 0.442 | NA | N | NA | |
| 5499558 | 5499559 | AMF_114 | AMF_115 | dsbE | FALSE | 0.077 | 144.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499559 | 5499560 | AMF_115 | AMF_116 | dsbE | radA | TRUE | 0.933 | 9.000 | 0.009 | 1.000 | NA | |
| 5499561 | 5499562 | AMF_117 | AMF_118 | TRUE | 0.971 | 7.000 | 0.014 | NA | NA | |||
| 5499562 | 5499563 | AMF_118 | AMF_119 | rpsF | TRUE | 0.878 | 11.000 | 0.008 | 1.000 | NA | ||
| 5499563 | 5499564 | AMF_119 | AMF_120 | rpsF | rpsR | TRUE | 0.997 | 1.000 | 0.358 | 0.057 | Y | NA |
| 5499564 | 5499565 | AMF_120 | AMF_121 | rpsR | rplI | TRUE | 0.979 | 20.000 | 0.497 | 0.057 | Y | NA |
| 5499565 | 5499566 | AMF_121 | AMF_122 | rplI | glyA | TRUE | 0.722 | 27.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 5499566 | 5499567 | AMF_122 | AMF_123 | glyA | cyaY | TRUE | 0.734 | 131.000 | 0.032 | NA | N | NA |
| 5499567 | 5499568 | AMF_123 | AMF_124 | cyaY | msbA2 | TRUE | 0.981 | -19.000 | 0.026 | NA | N | NA |
| 5499568 | 5499569 | AMF_124 | AMF_125 | msbA2 | sdhA | FALSE | 0.007 | 271.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499569 | 5499570 | AMF_125 | AMF_126 | sdhA | sdhB | TRUE | 0.978 | 25.000 | 0.714 | 0.006 | Y | NA |
| 5499570 | 5499571 | AMF_126 | AMF_127 | sdhB | thy1 | TRUE | 0.946 | 1.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA |
| 5499571 | 5499572 | AMF_127 | AMF_128 | thy1 | bcr2 | FALSE | 0.120 | 136.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 5499573 | 5499574 | AMF_129 | AMF_130 | ruvB | ruvA | TRUE | 0.995 | -3.000 | 0.115 | 0.003 | Y | NA |
| 5499574 | 5499575 | AMF_130 | AMF_131 | ruvA | ccmC | TRUE | 0.957 | -3.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 5499576 | 5499577 | AMF_132 | AMF_133 | gmk | FALSE | 0.135 | 126.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 5499577 | 5499578 | AMF_133 | AMF_134 | folD | FALSE | 0.067 | 150.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 5499578 | 5499579 | AMF_134 | AMF_1064 | folD | FALSE | 0.368 | 28.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499579 | 5499580 | AMF_1064 | AMF_135 | msp1B-1 | FALSE | 0.005 | 368.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499580 | 5499581 | AMF_135 | AMF_136 | msp1B-1 | FALSE | 0.005 | 484.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499582 | 5499583 | AMF_139 | AMF_141 | FALSE | 0.006 | 283.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499583 | 5499584 | AMF_141 | AMF_142 | cycM | TRUE | 0.860 | 83.000 | 0.035 | NA | NA | ||
| 5499584 | 5499585 | AMF_142 | AMF_144 | cycM | nuoL2 | FALSE | 0.023 | 400.000 | 0.000 | 1.000 | Y | NA |
| 5499585 | 5499586 | AMF_144 | AMF_145 | nuoL2 | ppdK | FALSE | 0.005 | 367.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499586 | 5499587 | AMF_145 | AMF_146 | ppdK | FALSE | 0.006 | 296.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499587 | 5499588 | AMF_146 | AMF_147 | TRUE | 0.983 | 3.000 | 0.016 | NA | NA | |||
| 5499588 | 5499589 | AMF_147 | AMF_148 | aspS | FALSE | 0.016 | 186.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 5499590 | 5499591 | AMF_149 | AMF_150 | gshB | TRUE | 0.941 | 15.000 | 0.023 | NA | NA | ||
| 5499591 | 5499592 | AMF_150 | AMF_151 | gshB | ddlB | FALSE | 0.091 | 136.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499592 | 5499593 | AMF_151 | AMF_152 | ddlB | ftsQ | TRUE | 0.996 | -19.000 | 0.410 | NA | Y | NA |
| 5499593 | 5499594 | AMF_152 | AMF_153 | ftsQ | ntrX | FALSE | 0.013 | 241.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 5499594 | 5499595 | AMF_153 | AMF_154 | ntrX | FALSE | 0.005 | 381.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499596 | 5499597 | AMF_155 | AMF_156 | pdhD | FALSE | 0.314 | 43.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499598 | 5499599 | AMF_157 | AMF_158 | TRUE | 0.937 | 69.000 | 0.600 | NA | NA | |||
| 5499599 | 5499600 | AMF_158 | AMF_159 | TRUE | 0.995 | 0.000 | 0.500 | NA | NA | |||
| 5499600 | 5499601 | AMF_159 | AMF_160 | TRUE | 0.995 | -3.000 | 0.625 | NA | NA | |||
| 5499601 | 5499602 | AMF_160 | AMF_161 | phnP | FALSE | 0.226 | 93.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499603 | 5499604 | AMF_162 | AMF_163 | glnA | pstC | TRUE | 0.975 | -22.000 | 0.021 | 1.000 | N | NA |
| 5499606 | 5499607 | AMF_167 | AMF_168 | sucD | sucC | TRUE | 0.993 | 9.000 | 0.407 | 0.003 | Y | NA |
| 5499607 | 5499608 | AMF_168 | AMF_169 | sucC | rpsU | TRUE | 0.837 | 70.000 | 0.026 | 1.000 | NA | |
| 5499608 | 5499609 | AMF_169 | AMF_170 | rpsU | pstS | TRUE | 0.903 | 93.000 | 0.385 | 1.000 | NA | |
| 5499609 | 5499610 | AMF_170 | AMF_171 | pstS | msp5 | TRUE | 0.935 | 60.000 | 0.556 | 1.000 | NA | |
| 5499610 | 5499611 | AMF_171 | AMF_172 | msp5 | fabK | FALSE | 0.346 | 183.000 | 0.083 | 0.049 | NA | |
| 5499611 | 5499612 | AMF_172 | AMF_173 | fabK | cybB | TRUE | 0.992 | 3.000 | 0.292 | 0.049 | NA | |
| 5499614 | 5499615 | AMF_175 | AMF_176 | aprE | TRUE | 0.831 | 88.000 | 0.029 | 1.000 | NA | ||
| 5499617 | 5499618 | AMF_178 | AMF_179 | tolB | TRUE | 0.979 | 7.000 | 0.025 | 1.000 | NA | ||
| 5499619 | 5499620 | AMF_180 | AMF_181 | FALSE | 0.343 | 33.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499620 | 5499621 | AMF_181 | AMF_182 | rpsL | FALSE | 0.016 | 185.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 5499621 | 5499622 | AMF_182 | AMF_183 | rpsL | rpsG | TRUE | 0.987 | 18.000 | 0.935 | 0.012 | Y | NA |
| 5499622 | 5499623 | AMF_183 | AMF_185 | rpsG | fusA | TRUE | 0.966 | 34.000 | 0.222 | 1.000 | Y | NA |
| 5499623 | 5499624 | AMF_185 | AMF_186 | fusA | tuf | TRUE | 0.987 | 12.000 | 0.187 | 0.004 | Y | NA |
| 5499624 | 5499625 | AMF_186 | AMF_1065 | tuf | FALSE | 0.517 | 15.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499625 | 5499626 | AMF_1065 | AMF_187 | FALSE | 0.616 | 12.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499626 | 5499627 | AMF_187 | AMF_188 | nusG | TRUE | 0.993 | -16.000 | 0.829 | 1.000 | NA | ||
| 5499627 | 5499628 | AMF_188 | AMF_190 | nusG | rplK | TRUE | 0.995 | 4.000 | 0.762 | 1.000 | N | NA |
| 5499628 | 5499629 | AMF_190 | AMF_191 | rplK | rplA | TRUE | 0.985 | 19.000 | 0.831 | 0.075 | Y | NA |
| 5499629 | 5499630 | AMF_191 | AMF_192 | rplA | rplJ | TRUE | 0.978 | 24.000 | 0.377 | 1.000 | Y | NA |
| 5499630 | 5499631 | AMF_192 | AMF_193 | rplJ | rplL | TRUE | 0.939 | 125.000 | 0.888 | 1.000 | Y | NA |
| 5499631 | 5499632 | AMF_193 | AMF_194 | rplL | rpoB | TRUE | 0.944 | 25.000 | 0.219 | 1.000 | NA | |
| 5499632 | 5499633 | AMF_194 | AMF_195 | rpoB | rpoC | TRUE | 0.984 | 12.000 | 0.875 | 0.003 | NA | |
| 5499636 | 5499637 | AMF_1035 | AMF_1066 | FALSE | 0.329 | 36.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499637 | 5499638 | AMF_1066 | AMF_199 | bioF | FALSE | 0.017 | 198.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499640 | 5499641 | AMF_201 | AMF_203 | pyrD | TRUE | 0.963 | 7.000 | 0.010 | 1.000 | N | NA | |
| 5499642 | 5499643 | AMF_204 | AMF_205 | def | FALSE | 0.111 | 132.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499643 | 5499644 | AMF_205 | AMF_206 | FALSE | 0.005 | 304.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499644 | 5499645 | AMF_206 | AMF_207 | pdxH | FALSE | 0.453 | 81.000 | 0.006 | 1.000 | NA | ||
| 5499648 | 5499649 | AMF_210 | AMF_211 | metC | bolA | TRUE | 0.888 | -46.000 | 0.008 | NA | N | NA |
| 5499650 | 5499651 | AMF_212 | AMF_213 | dnaE | FALSE | 0.005 | 411.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499651 | 5499652 | AMF_213 | AMF_214 | dnaE | aroA | FALSE | 0.009 | 240.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499652 | 5499653 | AMF_214 | AMF_1059 | aroA | rrs | FALSE | 0.021 | 188.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499653 | 5499654 | AMF_1059 | AMF_215 | rrs | sdhC | FALSE | 0.237 | 88.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499654 | 5499655 | AMF_215 | AMF_217 | sdhC | sdhD | TRUE | 0.994 | -9.000 | 0.958 | 0.003 | NA | |
| 5499655 | 5499656 | AMF_217 | AMF_218 | sdhD | FALSE | 0.278 | 151.000 | 0.008 | NA | NA | ||
| 5499657 | 5499658 | AMF_219 | AMF_220 | thiD | TRUE | 0.746 | 8.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499658 | 5499659 | AMF_220 | AMF_221 | perM | TRUE | 0.837 | 1.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499659 | 5499660 | AMF_221 | AMF_222 | perM | FALSE | 0.007 | 273.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499661 | 5499662 | AMF_223 | AMF_1067 | rpsD | FALSE | 0.517 | 15.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499663 | 5499664 | AMF_224 | AMF_225 | TRUE | 0.944 | 60.000 | 0.700 | NA | NA | |||
| 5499664 | 5499665 | AMF_225 | AMF_227 | pgpA | TRUE | 0.968 | -33.000 | 0.027 | 1.000 | NA | ||
| 5499666 | 5499667 | AMF_228 | AMF_1094 | FALSE | 0.251 | 75.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499667 | 5499668 | AMF_1094 | AMF_1068 | FALSE | 0.111 | 132.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499668 | 5499669 | AMF_1068 | AMF_229 | tig | FALSE | 0.623 | -39.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499669 | 5499670 | AMF_229 | AMF_230 | tig | clpP | TRUE | 0.991 | 5.000 | 0.018 | 1.000 | Y | NA |
| 5499670 | 5499671 | AMF_230 | AMF_231 | clpP | clpX | TRUE | 0.981 | 10.000 | 0.016 | 1.000 | Y | NA |
| 5499671 | 5499672 | AMF_231 | AMF_232 | clpX | lon | TRUE | 0.979 | 19.000 | 0.223 | 1.000 | Y | NA |
| 5499672 | 5499673 | AMF_232 | AMF_1069 | lon | FALSE | 0.005 | 354.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499673 | 5499674 | AMF_1069 | AMF_233 | fmt | FALSE | 0.368 | 28.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499674 | 5499675 | AMF_233 | AMF_234 | fmt | FALSE | 0.056 | 159.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499675 | 5499676 | AMF_234 | AMF_235 | FALSE | 0.049 | 204.000 | 0.007 | NA | NA | |||
| 5499676 | 5499677 | AMF_235 | AMF_236 | thiE | FALSE | 0.005 | 415.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499679 | 5499680 | AMF_238 | AMF_240 | ftsK | TRUE | 0.982 | -25.000 | 0.076 | 1.000 | NA | ||
| 5499681 | 5499682 | AMF_241 | AMF_243 | argD | FALSE | 0.185 | 228.000 | 0.043 | NA | NA | ||
| 5499684 | 5499685 | AMF_245 | AMF_246 | tolR | TRUE | 0.654 | -34.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499685 | 5499686 | AMF_246 | AMF_247 | tolR | tolQ | TRUE | 0.919 | -19.000 | 0.000 | 0.021 | Y | NA |
| 5499688 | 5499689 | AMF_249 | AMF_250 | smf | trmU | FALSE | 0.005 | 535.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499689 | 5499690 | AMF_250 | AMF_251 | trmU | pilT | FALSE | 0.028 | 188.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 5499690 | 5499691 | AMF_251 | AMF_252 | pilT | fabB | FALSE | 0.007 | 301.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 5499691 | 5499692 | AMF_252 | AMF_253 | fabB | acpP | TRUE | 0.905 | 105.000 | 0.045 | 1.000 | Y | NA |
| 5499692 | 5499693 | AMF_253 | AMF_1036 | acpP | rpmG | FALSE | 0.005 | 587.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499694 | 5499695 | AMF_255 | AMF_256 | TRUE | 0.987 | -12.000 | 0.045 | NA | NA | |||
| 5499695 | 5499696 | AMF_256 | AMF_1037 | FALSE | 0.036 | 173.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499696 | 5499697 | AMF_1037 | AMF_257 | FALSE | 0.005 | 552.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499699 | 5499700 | AMF_259 | AMF_261 | coq7 | FALSE | 0.171 | 115.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499700 | 5499701 | AMF_261 | AMF_262 | coq7 | FALSE | 0.305 | 46.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499702 | 5499703 | AMF_264 | AMF_265 | FALSE | 0.148 | 123.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499703 | 5499704 | AMF_265 | AMF_266 | TRUE | 0.746 | 8.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499704 | 5499705 | AMF_266 | AMF_267 | FALSE | 0.006 | 280.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499705 | 5499706 | AMF_267 | AMF_1038 | FALSE | 0.006 | 296.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499706 | 5499707 | AMF_1038 | AMF_268 | FALSE | 0.005 | 335.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499707 | 5499708 | AMF_268 | AMF_269 | FALSE | 0.006 | 287.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499708 | 5499709 | AMF_269 | AMF_271 | uvrD | FALSE | 0.006 | 670.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499710 | 5499711 | AMF_272 | AMF_273 | gyrA | FALSE | 0.006 | 1149.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499711 | 5499712 | AMF_273 | AMF_274 | gyrA | nth | TRUE | 0.977 | 0.000 | 0.006 | 1.000 | Y | NA |
| 5499712 | 5499713 | AMF_274 | AMF_275 | nth | FALSE | 0.005 | 353.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499713 | 5499714 | AMF_275 | AMF_276 | htpG | TRUE | 0.818 | 65.000 | 0.017 | NA | NA | ||
| 5499714 | 5499715 | AMF_276 | AMF_1039 | htpG | FALSE | 0.009 | 246.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499716 | 5499717 | AMF_1040 | AMF_279 | purB | FALSE | 0.006 | 918.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499718 | 5499719 | AMF_1095 | AMF_1070 | FALSE | 0.283 | 56.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499719 | 5499720 | AMF_1070 | AMF_280 | uvrC | FALSE | 0.008 | 250.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499721 | 5499722 | AMF_281 | AMF_282 | birA | FALSE | 0.005 | 462.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499722 | 5499723 | AMF_282 | AMF_283 | birA | gst | TRUE | 0.796 | 9.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 5499723 | 5499724 | AMF_283 | AMF_284 | gst | FALSE | 0.240 | 83.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499725 | 5499726 | AMF_285 | AMF_286 | potA | recR | FALSE | 0.005 | 340.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499728 | 5499729 | AMF_288 | AMF_289 | znuC | ubiB | TRUE | 0.986 | -7.000 | 0.032 | 1.000 | NA | |
| 5499729 | 5499730 | AMF_289 | AMF_290 | ubiB | FALSE | 0.325 | 38.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499731 | 5499732 | AMF_291 | AMF_293 | miaB | FALSE | 0.087 | 137.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499732 | 5499733 | AMF_293 | AMF_294 | FALSE | 0.006 | 296.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499735 | 5499736 | AMF_296 | AMF_297 | dapA | FALSE | 0.013 | 217.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499736 | 5499737 | AMF_297 | AMF_299 | dapA | pkcI | FALSE | 0.013 | 217.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499737 | 5499738 | AMF_299 | AMF_300 | pkcI | TRUE | 0.974 | -3.000 | 0.010 | NA | NA | ||
| 5499739 | 5499740 | AMF_301 | AMF_302 | mutS | TRUE | 0.750 | -19.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499740 | 5499741 | AMF_302 | AMF_303 | proP | FALSE | 0.071 | 148.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499741 | 5499742 | AMF_303 | AMF_304 | proP | proP | FALSE | 0.010 | 129.000 | 0.000 | 0.014 | NA | |
| 5499743 | 5499744 | AMF_305 | AMF_306 | nadE | hemB | TRUE | 0.967 | 7.000 | 0.006 | 1.000 | Y | NA |
| 5499745 | 5499746 | AMF_307 | AMF_308 | pbpA2 | FALSE | 0.388 | 40.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 5499746 | 5499747 | AMF_308 | AMF_309 | proP | FALSE | 0.638 | 162.000 | 0.333 | NA | NA | ||
| 5499749 | 5499750 | AMF_311 | AMF_312 | mcd | gatB | TRUE | 0.868 | 13.000 | 0.009 | 1.000 | NA | |
| 5499750 | 5499751 | AMF_312 | AMF_1071 | gatB | FALSE | 0.005 | 419.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499751 | 5499752 | AMF_1071 | AMF_313 | fab1 | TRUE | 0.746 | 8.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499752 | 5499753 | AMF_313 | AMF_314 | fab1 | dnaA | FALSE | 0.009 | 242.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499755 | 5499756 | AMF_316 | AMF_318 | nadD | pdxJ | FALSE | 0.205 | 174.000 | 0.005 | 1.000 | Y | NA |
| 5499757 | 5499758 | AMF_1041 | AMF_319 | hupB | dnaX | FALSE | 0.009 | 210.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 5499758 | 5499759 | AMF_319 | AMF_320 | dnaX | TRUE | 0.959 | -18.000 | 0.010 | NA | NA | ||
| 5499761 | 5499762 | AMF_322 | AMF_323 | thiC | FALSE | 0.619 | 45.000 | 0.007 | NA | NA | ||
| 5499762 | 5499763 | AMF_323 | AMF_324 | rpoZ | TRUE | 0.743 | 65.000 | 0.010 | NA | NA | ||
| 5499763 | 5499764 | AMF_324 | AMF_325 | rpoZ | FALSE | 0.004 | 335.000 | 0.004 | 0.045 | NA | ||
| 5499765 | 5499766 | AMF_327 | AMF_328 | leuS | FALSE | 0.007 | 318.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 5499766 | 5499767 | AMF_328 | AMF_329 | pyrF | TRUE | 0.742 | -43.000 | 0.003 | NA | N | NA | |
| 5499768 | 5499769 | AMF_330 | AMF_331 | ccmE | surE | FALSE | 0.636 | 122.000 | 0.015 | 1.000 | NA | |
| 5499769 | 5499770 | AMF_331 | AMF_332 | surE | nuoC1 | FALSE | 0.004 | 959.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 5499770 | 5499771 | AMF_332 | AMF_333 | nuoC1 | nuoB | TRUE | 0.993 | 6.000 | 0.045 | 0.010 | Y | NA |
| 5499771 | 5499772 | AMF_333 | AMF_334 | nuoB | nuoA | TRUE | 0.990 | -40.000 | 0.551 | 0.010 | Y | NA |
| 5499772 | 5499773 | AMF_334 | AMF_335 | nuoA | uvrA | FALSE | 0.005 | 317.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499773 | 5499774 | AMF_335 | AMF_336 | uvrA | nusB | FALSE | 0.443 | 34.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 5499774 | 5499775 | AMF_336 | AMF_337 | nusB | ribH | TRUE | 0.994 | -7.000 | 0.467 | 1.000 | N | NA |
| 5499775 | 5499776 | AMF_337 | AMF_339 | ribH | yidC | TRUE | 0.932 | -52.000 | 0.015 | 1.000 | N | NA |
| 5499776 | 5499777 | AMF_339 | AMF_340 | yidC | pssA | FALSE | 0.228 | 91.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499777 | 5499778 | AMF_340 | AMF_341 | pssA | psd | TRUE | 0.962 | 61.000 | 0.371 | 1.000 | Y | NA |
| 5499778 | 5499779 | AMF_341 | AMF_342 | psd | FALSE | 0.007 | 259.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 5499779 | 5499780 | AMF_342 | AMF_343 | FALSE | 0.005 | 418.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499781 | 5499782 | AMF_344 | AMF_345 | murG | efp | FALSE | 0.072 | 147.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499782 | 5499783 | AMF_345 | AMF_346 | efp | suhB | TRUE | 0.992 | 3.000 | 0.067 | 1.000 | N | NA |
| 5499783 | 5499784 | AMF_346 | AMF_347 | suhB | rluC | TRUE | 0.921 | -3.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 5499785 | 5499786 | AMF_349 | AMF_350 | FALSE | 0.183 | 197.000 | 0.017 | 1.000 | N | NA | ||
| 5499786 | 5499787 | AMF_350 | AMF_351 | TRUE | 0.654 | -34.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499787 | 5499788 | AMF_351 | AMF_352 | gdh | FALSE | 0.509 | -145.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499789 | 5499790 | AMF_353 | AMF_354 | cysS | TRUE | 0.952 | 2.000 | 0.007 | NA | NA | ||
| 5499790 | 5499791 | AMF_354 | AMF_355 | cysS | nrdB | FALSE | 0.019 | 191.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499791 | 5499792 | AMF_355 | AMF_357 | nrdB | TRUE | 0.940 | -22.000 | 0.009 | 1.000 | NA | ||
| 5499794 | 5499795 | AMF_360 | AMF_361 | dnaG | FALSE | 0.127 | 128.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499795 | 5499796 | AMF_361 | AMF_1042 | dnaG | TRUE | 0.672 | -31.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499797 | 5499798 | AMF_363 | AMF_365 | rpoD | nifR3 | FALSE | 0.053 | 161.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499800 | 5499801 | AMF_367 | AMF_368 | cutA | FALSE | 0.005 | 532.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499801 | 5499802 | AMF_368 | AMF_369 | cutA | dhkA | TRUE | 0.845 | 44.000 | 0.017 | 1.000 | N | NA |
| 5499802 | 5499803 | AMF_369 | AMF_370 | dhkA | FALSE | 0.071 | 499.000 | 0.029 | 1.000 | NA | ||
| 5499804 | 5499805 | AMF_371 | AMF_372 | FALSE | 0.035 | 203.000 | 0.005 | NA | NA | |||
| 5499805 | 5499806 | AMF_372 | AMF_373 | topA | FALSE | 0.184 | 125.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 5499807 | 5499808 | AMF_374 | AMF_1072 | FALSE | 0.005 | 489.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499808 | 5499809 | AMF_1072 | AMF_375 | acpS | FALSE | 0.005 | 435.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499809 | 5499810 | AMF_375 | AMF_377 | acpS | proS | TRUE | 0.982 | -3.000 | 0.015 | 1.000 | N | NA |
| 5499810 | 5499811 | AMF_377 | AMF_378 | proS | FALSE | 0.007 | 264.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499811 | 5499812 | AMF_378 | AMF_1073 | FALSE | 0.283 | 56.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499814 | 5499815 | AMF_380 | AMF_381 | trxB | tdpX1 | TRUE | 0.995 | -3.000 | 0.032 | 1.000 | Y | NA |
| 5499817 | 5499818 | AMF_383 | AMF_384 | ppiD | FALSE | 0.213 | 52.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 5499818 | 5499819 | AMF_384 | AMF_385 | FALSE | 0.629 | 19.000 | 0.003 | NA | N | NA | ||
| 5499819 | 5499820 | AMF_385 | AMF_1074 | FALSE | 0.006 | 1363.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499823 | 5499824 | AMF_389 | AMF_390 | truB | rpsO | TRUE | 0.964 | 39.000 | 0.223 | 1.000 | Y | NA |
| 5499824 | 5499825 | AMF_390 | AMF_391 | rpsO | pnp | TRUE | 0.960 | 52.000 | 0.306 | 1.000 | Y | NA |
| 5499825 | 5499826 | AMF_391 | AMF_392 | pnp | TRUE | 0.951 | 6.000 | 0.008 | 1.000 | NA | ||
| 5499826 | 5499827 | AMF_392 | AMF_393 | lepA | FALSE | 0.213 | 135.000 | 0.006 | 1.000 | NA | ||
| 5499829 | 5499830 | AMF_395 | AMF_396 | msp1a | mlp2 | FALSE | 0.005 | 555.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499830 | 5499831 | AMF_396 | AMF_398 | mlp2 | mlp3 | FALSE | 0.005 | 474.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499831 | 5499832 | AMF_398 | AMF_399 | mlp3 | mlp4 | FALSE | 0.005 | 423.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499832 | 5499833 | AMF_399 | AMF_400 | mlp4 | FALSE | 0.408 | 22.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499833 | 5499834 | AMF_400 | AMF_401 | FALSE | 0.006 | 824.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499834 | 5499835 | AMF_401 | AMF_402 | FALSE | 0.279 | 62.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499835 | 5499836 | AMF_402 | AMF_403 | FALSE | 0.005 | 400.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499836 | 5499837 | AMF_403 | AMF_405 | FALSE | 0.005 | 577.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499837 | 5499838 | AMF_405 | AMF_1043 | FALSE | 0.408 | 22.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499838 | 5499839 | AMF_1043 | AMF_406 | FALSE | 0.026 | 183.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499839 | 5499840 | AMF_406 | AMF_407 | FALSE | 0.006 | 800.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499840 | 5499841 | AMF_407 | AMF_408 | FALSE | 0.028 | 182.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499843 | 5499844 | AMF_412 | AMF_413 | bioA | FALSE | 0.059 | 182.000 | 0.006 | 1.000 | NA | ||
| 5499844 | 5499845 | AMF_413 | AMF_1075 | bioA | FALSE | 0.007 | 274.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499845 | 5499846 | AMF_1075 | AMF_414 | FALSE | 0.255 | 73.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499848 | 5499849 | AMF_1076 | AMF_416 | tpiA | FALSE | 0.561 | -57.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499849 | 5499850 | AMF_416 | AMF_417 | tpiA | TRUE | 0.985 | -16.000 | 0.042 | NA | NA | ||
| 5499850 | 5499851 | AMF_417 | AMF_418 | gcp | TRUE | 0.936 | 10.000 | 0.009 | NA | NA | ||
| 5499853 | 5499854 | AMF_420 | AMF_421 | folB | mdh | TRUE | 0.825 | 52.000 | 0.017 | 1.000 | N | NA |
| 5499858 | 5499859 | AMF_425 | AMF_426 | rpiB | ubiG | TRUE | 0.752 | 93.000 | 0.015 | 1.000 | N | NA |
| 5499860 | 5499861 | AMF_427 | AMF_428 | gcp | TRUE | 0.936 | 10.000 | 0.009 | NA | NA | ||
| 5499861 | 5499862 | AMF_428 | AMF_429 | FALSE | 0.009 | 242.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499862 | 5499863 | AMF_429 | AMF_430 | TRUE | 0.742 | -21.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499863 | 5499864 | AMF_430 | AMF_431 | FALSE | 0.293 | 51.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499864 | 5499865 | AMF_431 | AMF_432 | TRUE | 0.709 | -25.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499865 | 5499866 | AMF_432 | AMF_433 | TRUE | 0.994 | -3.000 | 0.357 | NA | NA | |||
| 5499866 | 5499867 | AMF_433 | AMF_434 | TRUE | 0.723 | 9.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499867 | 5499868 | AMF_434 | AMF_435 | putA | FALSE | 0.005 | 502.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499870 | 5499871 | AMF_438 | AMF_1077 | putA | FALSE | 0.005 | 626.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499873 | 5499874 | AMF_440 | AMF_441 | rlpA | xthA2 | FALSE | 0.017 | 199.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499874 | 5499875 | AMF_441 | AMF_442 | xthA2 | TRUE | 0.799 | 6.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499876 | 5499877 | AMF_443 | AMF_444 | rpmJ | FALSE | 0.271 | 29.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 5499878 | 5499879 | AMF_445 | AMF_1078 | FALSE | 0.561 | -57.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499879 | 5499880 | AMF_1078 | AMF_446 | rpmA | TRUE | 0.773 | 7.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499880 | 5499881 | AMF_446 | AMF_447 | rpmA | rplU | TRUE | 0.997 | 4.000 | 0.710 | 0.048 | Y | NA |
| 5499882 | 5499883 | AMF_448 | AMF_449 | eno | hflX | TRUE | 0.981 | 2.000 | 0.015 | 1.000 | NA | |
| 5499884 | 5499885 | AMF_450 | AMF_451 | purA | TRUE | 0.796 | -10.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499885 | 5499886 | AMF_451 | AMF_452 | mraW | TRUE | 0.836 | 3.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499886 | 5499887 | AMF_452 | AMF_453 | mraW | ygfA | FALSE | 0.037 | 172.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499888 | 5499889 | AMF_457 | AMF_458 | FALSE | 0.012 | 223.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499890 | 5499891 | AMF_459 | AMF_460 | FALSE | 0.106 | 133.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499891 | 5499892 | AMF_460 | AMF_461 | trxB2 | FALSE | 0.015 | 205.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499892 | 5499893 | AMF_461 | AMF_462 | trxB2 | pmbA | FALSE | 0.246 | 79.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499893 | 5499894 | AMF_462 | AMF_463 | pmbA | folE | TRUE | 0.960 | 10.000 | 0.015 | NA | NA | |
| 5499894 | 5499895 | AMF_463 | AMF_464 | folE | atpG | TRUE | 0.943 | 7.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 5499896 | 5499897 | AMF_465 | AMF_466 | nuoD | nuoE | TRUE | 0.997 | 5.000 | 0.632 | 0.009 | Y | NA |
| 5499897 | 5499898 | AMF_466 | AMF_467 | nuoE | dnaQ | TRUE | 0.931 | -10.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA |
| 5499900 | 5499901 | AMF_470 | AMF_471 | FALSE | 0.005 | 436.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499902 | 5499903 | AMF_472 | AMF_473 | rpoH | TRUE | 0.814 | -6.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499904 | 5499905 | AMF_474 | AMF_475 | TRUE | 0.829 | -3.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499905 | 5499906 | AMF_475 | AMF_476 | FALSE | 0.005 | 440.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499907 | 5499908 | AMF_477 | AMF_478 | nuoH | nuoG | TRUE | 0.997 | 2.000 | 0.488 | 0.025 | Y | NA |
| 5499908 | 5499909 | AMF_478 | AMF_479 | nuoG | TRUE | 0.982 | 8.000 | 0.032 | NA | NA | ||
| 5499909 | 5499910 | AMF_479 | AMF_480 | gyrB2 | FALSE | 0.059 | 181.000 | 0.004 | NA | NA | ||
| 5499912 | 5499913 | AMF_482 | AMF_483 | FALSE | 0.005 | 494.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499913 | 5499914 | AMF_483 | AMF_484 | adx1 | TRUE | 0.978 | -28.000 | 0.038 | NA | NA | ||
| 5499914 | 5499915 | AMF_484 | AMF_485 | adx1 | hscA | TRUE | 0.946 | 26.000 | 0.109 | NA | N | NA |
| 5499915 | 5499916 | AMF_485 | AMF_486 | hscA | hscB | TRUE | 0.997 | -12.000 | 0.878 | NA | Y | NA |
| 5499916 | 5499917 | AMF_486 | AMF_487 | hscB | TRUE | 0.985 | -22.000 | 0.081 | NA | NA | ||
| 5499917 | 5499918 | AMF_487 | AMF_488 | nifU | TRUE | 0.986 | -22.000 | 0.137 | NA | NA | ||
| 5499918 | 5499919 | AMF_488 | AMF_489 | nifU | nifS | TRUE | 0.995 | -12.000 | 0.884 | 1.000 | N | NA |
| 5499919 | 5499920 | AMF_489 | AMF_490 | nifS | nifS | TRUE | 0.666 | 33.000 | 0.000 | 0.002 | Y | NA |
| 5499921 | 5499922 | AMF_491 | AMF_492 | lysS | FALSE | 0.005 | 303.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499922 | 5499923 | AMF_492 | AMF_493 | lysS | TRUE | 0.919 | 50.000 | 0.017 | NA | Y | NA | |
| 5499924 | 5499925 | AMF_494 | AMF_495 | truA | pyrB | TRUE | 0.964 | -3.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 5499925 | 5499926 | AMF_495 | AMF_498 | pyrB | FALSE | 0.050 | 163.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 5499926 | 5499927 | AMF_498 | AMF_499 | atpC | TRUE | 0.964 | -3.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA | |
| 5499927 | 5499928 | AMF_499 | AMF_500 | atpC | atpD | TRUE | 0.927 | 70.000 | 0.046 | 0.010 | Y | NA |
| 5499928 | 5499929 | AMF_500 | AMF_1079 | atpD | FALSE | 0.262 | 70.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499932 | 5499933 | AMF_502 | AMF_503 | ftsJ | FALSE | 0.005 | 492.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499933 | 5499934 | AMF_503 | AMF_504 | FALSE | 0.298 | 50.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499934 | 5499935 | AMF_504 | AMF_505 | FALSE | 0.005 | 654.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499936 | 5499937 | AMF_507 | AMF_509 | FALSE | 0.005 | 605.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499937 | 5499938 | AMF_509 | AMF_510 | argS | FALSE | 0.196 | 102.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499939 | 5499940 | AMF_511 | AMF_512 | recO | FALSE | 0.361 | 79.000 | 0.003 | NA | NA | ||
| 5499940 | 5499941 | AMF_512 | AMF_1044 | FALSE | 0.616 | 12.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499942 | 5499943 | AMF_513 | AMF_514 | ileS | FALSE | 0.007 | 268.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499944 | 5499945 | AMF_515 | AMF_516 | bcp | TRUE | 0.941 | -34.000 | 0.011 | NA | NA | ||
| 5499948 | 5499949 | AMF_519 | AMF_520 | prfB | FALSE | 0.005 | 300.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499949 | 5499950 | AMF_520 | AMF_521 | gatA | FALSE | 0.012 | 329.000 | 0.005 | NA | NA | ||
| 5499951 | 5499952 | AMF_522 | AMF_523 | folC | hemC | FALSE | 0.237 | 158.000 | 0.000 | 1.000 | Y | NA |
| 5499952 | 5499953 | AMF_523 | AMF_524 | hemC | murB | TRUE | 0.928 | -25.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 5499953 | 5499954 | AMF_524 | AMF_526 | murB | ankA | FALSE | 0.006 | 282.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5499955 | 5499956 | AMF_527 | AMF_528 | nuoI | lepB | TRUE | 0.945 | 16.000 | 0.029 | 1.000 | N | NA |
| 5499956 | 5499957 | AMF_528 | AMF_529 | lepB | TRUE | 0.959 | 11.000 | 0.018 | NA | NA | ||
| 5499959 | 5499960 | AMF_531 | AMF_532 | FALSE | 0.005 | 582.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499963 | 5499964 | AMF_535 | AMF_536 | FALSE | 0.274 | 67.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499965 | 5499966 | AMF_537 | AMF_538 | typA | clpA | FALSE | 0.400 | 55.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 5499968 | 5499969 | AMF_541 | AMF_542 | rbfA | infB | TRUE | 0.997 | -3.000 | 0.609 | 1.000 | Y | NA |
| 5499969 | 5499970 | AMF_542 | AMF_543 | infB | nusA | TRUE | 0.968 | 16.000 | 0.332 | 1.000 | N | NA |
| 5499970 | 5499971 | AMF_543 | AMF_544 | nusA | acrD | FALSE | 0.020 | 512.000 | 0.007 | NA | N | NA |
| 5499971 | 5499972 | AMF_544 | AMF_545 | acrD | tatC | FALSE | 0.038 | 230.000 | 0.006 | NA | N | NA |
| 5499972 | 5499973 | AMF_545 | AMF_546 | tatC | gcpE | TRUE | 0.641 | 98.000 | 0.009 | NA | N | NA |
| 5499973 | 5499974 | AMF_546 | AMF_547 | gcpE | TRUE | 0.978 | 4.000 | 0.012 | NA | NA | ||
| 5499974 | 5499975 | AMF_547 | AMF_548 | dxr | FALSE | 0.328 | 98.000 | 0.004 | NA | NA | ||
| 5499975 | 5499976 | AMF_548 | AMF_549 | dxr | nuoN1 | TRUE | 0.878 | 14.000 | 0.009 | 1.000 | N | NA |
| 5499976 | 5499977 | AMF_549 | AMF_550 | nuoN1 | nuoM | TRUE | 0.995 | 3.000 | 0.079 | 0.008 | Y | NA |
| 5499977 | 5499978 | AMF_550 | AMF_551 | nuoM | nuoL | TRUE | 0.995 | -3.000 | 0.143 | 0.008 | Y | NA |
| 5499978 | 5499979 | AMF_551 | AMF_552 | nuoL | nuoK | TRUE | 0.962 | 68.000 | 0.671 | 0.024 | Y | NA |
| 5499979 | 5499980 | AMF_552 | AMF_553 | nuoK | nuoJ | TRUE | 0.967 | 49.000 | 0.631 | 0.008 | Y | NA |
| 5499980 | 5499981 | AMF_553 | AMF_555 | nuoJ | nuoF | FALSE | 0.334 | 189.000 | 0.023 | 0.008 | Y | NA |
| 5499981 | 5499982 | AMF_555 | AMF_556 | nuoF | fadB | FALSE | 0.243 | 79.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499982 | 5499983 | AMF_556 | AMF_557 | fadB | TRUE | 0.985 | 6.000 | 0.027 | NA | NA | ||
| 5499985 | 5499986 | AMF_560 | AMF_561 | FALSE | 0.048 | 164.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5499988 | 5499989 | AMF_563 | AMF_564 | hemF | FALSE | 0.006 | 280.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499989 | 5499990 | AMF_564 | AMF_565 | hemF | agk | FALSE | 0.073 | 170.000 | 0.004 | 1.000 | N | NA |
| 5499990 | 5499991 | AMF_565 | AMF_566 | agk | engB | TRUE | 0.965 | -55.000 | 0.057 | 1.000 | NA | |
| 5499993 | 5499994 | AMF_569 | AMF_570 | pccB | fpg | FALSE | 0.009 | 246.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5499997 | 5499998 | AMF_572 | AMF_573 | gltX2 | TRUE | 0.816 | 5.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5499999 | 5500000 | AMF_574 | AMF_575 | FALSE | 0.005 | 435.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500000 | 5500001 | AMF_575 | AMF_576 | FALSE | 0.368 | 28.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500001 | 5500002 | AMF_576 | AMF_577 | TRUE | 0.643 | -36.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500002 | 5500003 | AMF_577 | AMF_578 | petC | FALSE | 0.006 | 286.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500003 | 5500004 | AMF_578 | AMF_580 | petC | petB | TRUE | 0.997 | 1.000 | 0.361 | 0.004 | Y | NA |
| 5500004 | 5500005 | AMF_580 | AMF_581 | petB | petA | TRUE | 0.968 | 12.000 | 0.074 | 0.004 | NA | |
| 5500005 | 5500006 | AMF_581 | AMF_582 | petA | petA | FALSE | 0.201 | -16.000 | 0.000 | 0.039 | NA | |
| 5500006 | 5500007 | AMF_582 | AMF_583 | petA | FALSE | 0.023 | 186.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500007 | 5500008 | AMF_583 | AMF_584 | znuB | FALSE | 0.007 | 263.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500008 | 5500009 | AMF_584 | AMF_585 | znuB | TRUE | 0.988 | 6.000 | 0.046 | NA | NA | ||
| 5500009 | 5500010 | AMF_585 | AMF_586 | tsf | FALSE | 0.408 | 22.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500010 | 5500011 | AMF_586 | AMF_587 | tsf | rpsB | TRUE | 0.977 | 36.000 | 0.815 | 1.000 | Y | NA |
| 5500011 | 5500012 | AMF_587 | AMF_588 | rpsB | maf | FALSE | 0.453 | 35.000 | 0.003 | NA | N | NA |
| 5500012 | 5500013 | AMF_588 | AMF_589 | maf | infA | TRUE | 0.988 | -6.000 | 0.030 | NA | N | NA |
| 5500013 | 5500014 | AMF_589 | AMF_590 | infA | hlyD | TRUE | 0.995 | -3.000 | 0.500 | 1.000 | N | NA |
| 5500014 | 5500015 | AMF_590 | AMF_591 | hlyD | lpdA | TRUE | 0.965 | -34.000 | 0.023 | 1.000 | N | NA |
| 5500015 | 5500016 | AMF_591 | AMF_592 | lpdA | TRUE | 0.981 | 8.000 | 0.029 | NA | NA | ||
| 5500019 | 5500020 | AMF_595 | AMF_597 | carA | lytB | FALSE | 0.025 | 184.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500020 | 5500021 | AMF_597 | AMF_598 | lytB | dut | FALSE | 0.047 | 202.000 | 0.006 | 1.000 | N | NA |
| 5500024 | 5500025 | AMF_602 | AMF_603 | TRUE | 0.991 | -37.000 | 0.500 | 0.005 | Y | NA | ||
| 5500025 | 5500026 | AMF_603 | AMF_604 | TRUE | 0.988 | 12.000 | 0.333 | 0.005 | Y | NA | ||
| 5500026 | 5500027 | AMF_604 | AMF_605 | virB6 | TRUE | 0.955 | 53.000 | 0.333 | 0.005 | Y | NA | |
| 5500027 | 5500028 | AMF_605 | AMF_606 | virB6 | virB4 | TRUE | 0.986 | -58.000 | 0.250 | 1.000 | Y | NA |
| 5500028 | 5500029 | AMF_606 | AMF_607 | virB4 | virB3 | TRUE | 0.998 | 4.000 | 0.652 | NA | Y | NA |
| 5500029 | 5500030 | AMF_607 | AMF_608 | virB3 | sodB | FALSE | 0.564 | 73.000 | 0.006 | NA | N | NA |
| 5500032 | 5500033 | AMF_1082 | AMF_610 | lipA | TRUE | 0.690 | 10.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500033 | 5500034 | AMF_610 | AMF_612 | lipA | FALSE | 0.006 | 683.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500034 | 5500035 | AMF_612 | AMF_613 | TRUE | 0.900 | 107.000 | 0.600 | NA | NA | |||
| 5500035 | 5500036 | AMF_613 | AMF_614 | pycA | TRUE | 0.864 | 93.000 | 0.048 | NA | NA | ||
| 5500038 | 5500039 | AMF_617 | AMF_618 | rpmB | priA | FALSE | 0.005 | 504.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500039 | 5500040 | AMF_618 | AMF_619 | priA | FALSE | 0.013 | 218.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500040 | 5500041 | AMF_619 | AMF_620 | hemD | FALSE | 0.177 | 126.000 | 0.003 | NA | NA | ||
| 5500041 | 5500042 | AMF_620 | AMF_622 | hemD | FALSE | 0.021 | 188.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 5500042 | 5500043 | AMF_622 | AMF_623 | FALSE | 0.011 | 127.000 | 0.000 | 0.033 | NA | |||
| 5500043 | 5500044 | AMF_623 | AMF_624 | FALSE | 0.073 | 387.000 | 0.030 | 1.000 | NA | |||
| 5500044 | 5500045 | AMF_624 | AMF_625 | era | TRUE | 0.983 | -24.000 | 0.071 | 1.000 | NA | ||
| 5500045 | 5500046 | AMF_625 | AMF_626 | era | ffh | FALSE | 0.579 | 95.000 | 0.010 | 0.022 | NA | |
| 5500046 | 5500047 | AMF_626 | AMF_628 | ffh | nuoL3 | TRUE | 0.988 | -7.000 | 0.039 | 1.000 | N | NA |
| 5500047 | 5500048 | AMF_628 | AMF_629 | nuoL3 | FALSE | 0.342 | 63.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 5500048 | 5500049 | AMF_629 | AMF_630 | dnaK | FALSE | 0.015 | 227.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 5500049 | 5500050 | AMF_630 | AMF_631 | dnaK | rne | FALSE | 0.159 | 200.000 | 0.016 | 1.000 | N | NA |
| 5500050 | 5500051 | AMF_631 | AMF_633 | rne | TRUE | 0.808 | 95.000 | 0.025 | 1.000 | N | NA | |
| 5500051 | 5500052 | AMF_633 | AMF_634 | TRUE | 0.903 | 88.000 | 0.283 | NA | NA | |||
| 5500052 | 5500053 | AMF_634 | AMF_635 | FALSE | 0.603 | -43.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500053 | 5500054 | AMF_635 | AMF_636 | TRUE | 0.837 | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500054 | 5500055 | AMF_636 | AMF_637 | TRUE | 0.773 | 7.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500055 | 5500056 | AMF_637 | AMF_638 | tktA | TRUE | 0.960 | 18.000 | 0.125 | NA | NA | ||
| 5500056 | 5500057 | AMF_638 | AMF_639 | tktA | TRUE | 0.939 | 16.000 | 0.025 | 1.000 | N | NA | |
| 5500058 | 5500059 | AMF_640 | AMF_641 | pal | purA | FALSE | 0.004 | 294.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 5500060 | 5500061 | AMF_642 | AMF_643 | hflX | yqgF | FALSE | 0.243 | 38.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 5500061 | 5500062 | AMF_643 | AMF_644 | yqgF | nrdA | FALSE | 0.305 | 45.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500062 | 5500063 | AMF_644 | AMF_1083 | nrdA | FALSE | 0.021 | 188.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500064 | 5500065 | AMF_645 | AMF_646 | ispA | TRUE | 0.986 | -3.000 | 0.026 | 1.000 | NA | ||
| 5500066 | 5500067 | AMF_647 | AMF_648 | thiO | dnaB | FALSE | 0.091 | 136.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500067 | 5500068 | AMF_648 | AMF_649 | dnaB | TRUE | 0.832 | 51.000 | 0.017 | NA | NA | ||
| 5500070 | 5500071 | AMF_651 | AMF_652 | fabH | plsX | TRUE | 0.996 | -3.000 | 0.362 | 0.007 | Y | NA |
| 5500071 | 5500072 | AMF_652 | AMF_1047 | plsX | rpmF | TRUE | 0.995 | 0.000 | 0.455 | 1.000 | N | NA |
| 5500074 | 5500075 | AMF_655 | AMF_656 | pstB | dapB | TRUE | 0.911 | -60.000 | 0.011 | 1.000 | N | NA |
| 5500075 | 5500076 | AMF_656 | AMF_657 | dapB | TRUE | 0.844 | 11.000 | 0.006 | 1.000 | NA | ||
| 5500076 | 5500077 | AMF_657 | AMF_658 | ubiA | TRUE | 0.938 | 13.000 | 0.019 | 1.000 | NA | ||
| 5500077 | 5500078 | AMF_658 | AMF_659 | ubiA | aaap | FALSE | 0.060 | 152.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 6685524 | 6685525 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685525 | 6685526 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685526 | 6685527 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685527 | 6685528 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685528 | 6685529 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685529 | 6685530 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685530 | 6685531 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685531 | 6685532 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685533 | 6685534 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685534 | 6685535 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685535 | 6685536 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685536 | 6685537 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685538 | 6685539 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685539 | 6685540 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685540 | 6685541 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685541 | 6685542 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685542 | 6685543 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685543 | 6685544 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685545 | 6685546 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685546 | 6685547 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685547 | 6685548 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685548 | 6685549 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685549 | 6685550 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685550 | 6685551 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685551 | 6685552 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6685552 | 6685553 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 5500083 | 5500084 | AMF_1048 | AMF_665 | rpmH | TRUE | 0.981 | -60.000 | 0.825 | 1.000 | NA | ||
| 5500084 | 5500085 | AMF_665 | AMF_667 | TRUE | 0.846 | 13.000 | 0.008 | 1.000 | NA | |||
| 5500086 | 5500087 | AMF_669 | AMF_670 | pheT | FALSE | 0.006 | 282.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500087 | 5500088 | AMF_670 | AMF_671 | pheT | rplQ | TRUE | 0.979 | 4.000 | 0.007 | 1.000 | Y | NA |
| 5500088 | 5500089 | AMF_671 | AMF_672 | rplQ | rpoA | TRUE | 0.958 | 41.000 | 0.883 | 1.000 | N | NA |
| 5500089 | 5500090 | AMF_672 | AMF_673 | rpoA | rpsK | TRUE | 0.963 | 21.000 | 0.440 | 1.000 | N | NA |
| 5500090 | 5500091 | AMF_673 | AMF_675 | rpsK | rpsM | TRUE | 0.884 | 43.000 | 0.012 | 0.043 | Y | NA |
| 5500091 | 5500092 | AMF_675 | AMF_676 | rpsM | adk | FALSE | 0.275 | 64.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500092 | 5500093 | AMF_676 | AMF_677 | adk | secY | TRUE | 0.758 | -18.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500093 | 5500094 | AMF_677 | AMF_678 | secY | rplO | TRUE | 0.984 | 13.000 | 0.873 | 1.000 | N | NA |
| 5500094 | 5500095 | AMF_678 | AMF_679 | rplO | rpsE | TRUE | 0.982 | 14.000 | 0.180 | 0.057 | Y | NA |
| 5500095 | 5500096 | AMF_679 | AMF_680 | rpsE | rplR | TRUE | 0.994 | 11.000 | 0.973 | 0.057 | Y | NA |
| 5500096 | 5500097 | AMF_680 | AMF_681 | rplR | rplF | TRUE | 0.998 | 2.000 | 0.886 | 0.043 | Y | NA |
| 5500097 | 5500098 | AMF_681 | AMF_682 | rplF | rpsH | TRUE | 0.997 | -15.000 | 0.956 | 0.043 | Y | NA |
| 5500098 | 5500099 | AMF_682 | AMF_683 | rpsH | rpsN | TRUE | 0.982 | 18.000 | 0.425 | 0.043 | Y | NA |
| 5500099 | 5500100 | AMF_683 | AMF_684 | rpsN | rplE | TRUE | 0.956 | 69.000 | 0.435 | 0.043 | Y | NA |
| 5500100 | 5500101 | AMF_684 | AMF_685 | rplE | rplX | TRUE | 0.995 | 1.000 | 0.894 | 0.043 | NA | |
| 5500101 | 5500102 | AMF_685 | AMF_686 | rplX | rplN | TRUE | 0.936 | 71.000 | 0.958 | 0.057 | NA | |
| 5500102 | 5500103 | AMF_686 | AMF_687 | rplN | rpsQ | TRUE | 0.990 | 13.000 | 0.850 | 0.057 | Y | NA |
| 5500103 | 5500104 | AMF_687 | AMF_688 | rpsQ | rpmC | TRUE | 0.994 | -10.000 | 0.911 | 0.043 | NA | |
| 5500104 | 5500105 | AMF_688 | AMF_689 | rpmC | rplP | TRUE | 0.991 | 8.000 | 0.868 | 0.043 | NA | |
| 5500105 | 5500106 | AMF_689 | AMF_690 | rplP | rpsC | TRUE | 0.997 | -3.000 | 0.894 | 0.057 | Y | NA |
| 5500106 | 5500107 | AMF_690 | AMF_691 | rpsC | rplV | TRUE | 0.998 | 4.000 | 0.905 | 0.057 | Y | NA |
| 5500107 | 5500108 | AMF_691 | AMF_692 | rplV | rpsS | TRUE | 0.998 | 4.000 | 0.968 | 0.057 | Y | NA |
| 5500108 | 5500109 | AMF_692 | AMF_693 | rpsS | rplB | TRUE | 0.997 | 6.000 | 0.894 | 0.057 | Y | NA |
| 5500109 | 5500110 | AMF_693 | AMF_694 | rplB | rplW | TRUE | 0.998 | -3.000 | 0.915 | 1.000 | Y | NA |
| 5500110 | 5500111 | AMF_694 | AMF_695 | rplW | rplD | TRUE | 0.996 | -25.000 | 0.904 | 1.000 | Y | NA |
| 5500111 | 5500112 | AMF_695 | AMF_696 | rplD | rplC | TRUE | 0.987 | 18.000 | 0.958 | 0.043 | Y | NA |
| 5500112 | 5500113 | AMF_696 | AMF_697 | rplC | rpsJ | TRUE | 0.997 | 2.000 | 0.749 | 0.057 | Y | NA |
| 5500113 | 5500114 | AMF_697 | AMF_698 | rpsJ | tuf | TRUE | 0.995 | 7.000 | 0.340 | 1.000 | Y | NA |
| 5500114 | 5500115 | AMF_698 | AMF_1096 | tuf | FALSE | 0.368 | 28.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500115 | 5500116 | AMF_1096 | AMF_1084 | TRUE | 0.723 | 9.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500117 | 5500118 | AMF_699 | AMF_700 | trmH | cmk | TRUE | 0.917 | -13.000 | 0.006 | 1.000 | N | NA |
| 5500118 | 5500119 | AMF_700 | AMF_701 | cmk | rpsA | TRUE | 0.691 | 65.000 | 0.009 | 1.000 | N | NA |
| 5500119 | 5500120 | AMF_701 | AMF_702 | rpsA | sppA | TRUE | 0.991 | 4.000 | 0.051 | 1.000 | N | NA |
| 5500120 | 5500121 | AMF_702 | AMF_703 | sppA | FALSE | 0.008 | 249.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500121 | 5500122 | AMF_703 | AMF_704 | TRUE | 0.980 | 1.000 | 0.013 | NA | NA | |||
| 5500122 | 5500123 | AMF_704 | AMF_705 | FALSE | 0.005 | 319.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500123 | 5500124 | AMF_705 | AMF_706 | hemH | FALSE | 0.005 | 304.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500125 | 5500126 | AMF_707 | AMF_708 | FALSE | 0.008 | 256.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500126 | 5500127 | AMF_708 | AMF_709 | hflK | FALSE | 0.005 | 538.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500127 | 5500128 | AMF_709 | AMF_710 | hflK | FALSE | 0.279 | 62.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500130 | 5500131 | AMF_712 | AMF_713 | qor | aprD | TRUE | 0.824 | 106.000 | 0.056 | 1.000 | NA | |
| 5500132 | 5500133 | AMF_714 | AMF_716 | folP | carB | FALSE | 0.005 | 459.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500134 | 5500135 | AMF_717 | AMF_718 | fumC | FALSE | 0.324 | 165.000 | 0.015 | NA | NA | ||
| 5500136 | 5500137 | AMF_719 | AMF_720 | dfp | pyrC | TRUE | 0.855 | 1.000 | 0.003 | 1.000 | NA | |
| 5500138 | 5500139 | AMF_721 | AMF_722 | glmM | lipB | FALSE | 0.324 | 37.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500139 | 5500140 | AMF_722 | AMF_723 | lipB | radC | FALSE | 0.370 | 91.000 | 0.004 | 1.000 | N | NA |
| 5500141 | 5500142 | AMF_724 | AMF_725 | groES | groEL | TRUE | 0.970 | 48.000 | 0.526 | 1.000 | Y | NA |
| 5500145 | 5500146 | AMF_729 | AMF_730 | FALSE | 0.010 | 231.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500146 | 5500147 | AMF_730 | AMF_731 | pcxB | TRUE | 0.857 | 105.000 | 0.105 | NA | NA | ||
| 5500148 | 5500149 | AMF_1056 | AMF_1057 | pepA | TRUE | 0.692 | -28.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500149 | 5500150 | AMF_1057 | AMF_733 | pepA | purN | TRUE | 0.896 | 16.000 | 0.012 | 1.000 | N | NA |
| 5500151 | 5500152 | AMF_735 | AMF_736 | purQ | FALSE | 0.007 | 273.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500155 | 5500156 | AMF_739 | AMF_740 | FALSE | 0.048 | 164.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500156 | 5500157 | AMF_740 | AMF_741 | TRUE | 0.851 | 101.000 | 0.059 | NA | NA | |||
| 5500157 | 5500158 | AMF_741 | AMF_742 | bioB | TRUE | 0.899 | -13.000 | 0.005 | NA | NA | ||
| 5500158 | 5500159 | AMF_742 | AMF_743 | bioB | purL | FALSE | 0.006 | 728.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500159 | 5500160 | AMF_743 | AMF_744 | purL | folP | FALSE | 0.005 | 373.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500161 | 5500162 | AMF_745 | AMF_747 | TRUE | 0.861 | 99.000 | 0.074 | NA | NA | |||
| 5500163 | 5500164 | AMF_748 | AMF_749 | FALSE | 0.009 | 245.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500168 | 5500169 | AMF_753 | AMF_1049 | gpsA | omp15 | TRUE | 0.829 | -3.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500170 | 5500171 | AMF_755 | AMF_756 | FALSE | 0.274 | 67.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500173 | 5500174 | AMF_758 | AMF_1050 | rho | FALSE | 0.007 | 270.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500175 | 5500176 | AMF_759 | AMF_760 | hslV | hslU | TRUE | 0.998 | -3.000 | 0.740 | 1.000 | Y | NA |
| 5500176 | 5500177 | AMF_760 | AMF_761 | hslU | ubiE | TRUE | 0.975 | 4.000 | 0.011 | 1.000 | N | NA |
| 5500181 | 5500182 | AMF_766 | AMF_767 | coxB | coxA | TRUE | 0.952 | 98.000 | 0.786 | 0.003 | Y | NA |
| 5500182 | 5500183 | AMF_767 | AMF_768 | coxA | ctaB | TRUE | 0.982 | 10.000 | 0.256 | 0.039 | N | NA |
| 5500185 | 5500186 | AMF_770 | AMF_771 | purD | yajC | FALSE | 0.421 | 31.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 5500186 | 5500187 | AMF_771 | AMF_772 | yajC | glmS | FALSE | 0.557 | 69.000 | 0.006 | NA | N | NA |
| 5500188 | 5500189 | AMF_773 | AMF_774 | dnaN | rnd | FALSE | 0.029 | 221.000 | 0.007 | 0.004 | NA | |
| 5500189 | 5500190 | AMF_774 | AMF_775 | rnd | czcR | TRUE | 0.833 | 65.000 | 0.022 | 1.000 | NA | |
| 5500190 | 5500191 | AMF_775 | AMF_776 | czcR | FALSE | 0.028 | 295.000 | 0.000 | 1.000 | Y | NA | |
| 5500191 | 5500192 | AMF_776 | AMF_777 | ppa | FALSE | 0.006 | 844.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 5500192 | 5500193 | AMF_777 | AMF_1051 | ppa | FALSE | 0.006 | 1650.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500193 | 5500194 | AMF_1051 | AMF_778 | rpsI | FALSE | 0.528 | -64.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500194 | 5500195 | AMF_778 | AMF_779 | rpsI | rplM | TRUE | 0.995 | -28.000 | 0.979 | 0.041 | Y | NA |
| 5500196 | 5500197 | AMF_780 | AMF_781 | tolC | TRUE | 0.957 | 19.000 | 0.159 | NA | NA | ||
| 5500199 | 5500200 | AMF_784 | AMF_785 | prsA | gatC | TRUE | 0.978 | -3.000 | 0.012 | 1.000 | N | NA |
| 5500201 | 5500202 | AMF_786 | AMF_787 | acnA | apaG | FALSE | 0.007 | 319.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 5500205 | 5500206 | AMF_790 | AMF_792 | FALSE | 0.005 | 312.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500207 | 5500208 | AMF_793 | AMF_794 | FALSE | 0.016 | 201.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500208 | 5500209 | AMF_794 | AMF_795 | FALSE | 0.005 | 335.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500209 | 5500210 | AMF_795 | AMF_796 | virB4 | FALSE | 0.005 | 554.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500210 | 5500211 | AMF_796 | AMF_797 | virB4 | FALSE | 0.106 | 133.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500211 | 5500212 | AMF_797 | AMF_798 | FALSE | 0.007 | 273.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500212 | 5500213 | AMF_798 | AMF_799 | FALSE | 0.006 | 787.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500213 | 5500214 | AMF_799 | AMF_1052 | TRUE | 0.690 | 10.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500215 | 5500216 | AMF_800 | AMF_801 | FALSE | 0.274 | 67.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500216 | 5500217 | AMF_801 | AMF_802 | msp3 | FALSE | 0.118 | 131.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500217 | 5500218 | AMF_802 | AMF_803 | msp3 | hflK | FALSE | 0.008 | 247.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500218 | 5500219 | AMF_803 | AMF_804 | hflK | hflC | TRUE | 0.990 | -82.000 | 0.983 | 0.015 | Y | NA |
| 5500219 | 5500220 | AMF_804 | AMF_805 | hflC | TRUE | 0.995 | 3.000 | 0.090 | 0.015 | Y | NA | |
| 5500220 | 5500221 | AMF_805 | AMF_806 | TRUE | 0.986 | -7.000 | 0.027 | 1.000 | N | NA | ||
| 5500221 | 5500222 | AMF_806 | AMF_807 | rnc | TRUE | 0.910 | -13.000 | 0.006 | 1.000 | N | NA | |
| 5500222 | 5500223 | AMF_807 | AMF_808 | rnc | cox11 | TRUE | 0.680 | 31.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA |
| 5500224 | 5500225 | AMF_809 | AMF_811 | ana29 | FALSE | 0.005 | 339.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500227 | 5500228 | AMF_813 | AMF_814 | FALSE | 0.133 | 197.000 | 0.011 | NA | NA | |||
| 5500228 | 5500229 | AMF_814 | AMF_815 | TRUE | 0.978 | 13.000 | 0.725 | 0.007 | NA | |||
| 5500229 | 5500230 | AMF_815 | AMF_816 | lspA | TRUE | 0.959 | -37.000 | 0.030 | 0.030 | NA | ||
| 5500230 | 5500231 | AMF_816 | AMF_817 | lspA | ribF | TRUE | 0.740 | 79.000 | 0.011 | 1.000 | N | NA |
| 5500233 | 5500234 | AMF_819 | AMF_820 | hemK | map | FALSE | 0.385 | 181.000 | 0.012 | 1.000 | Y | NA |
| 5500234 | 5500235 | AMF_820 | AMF_821 | map | sucB | TRUE | 0.927 | 4.000 | 0.006 | 1.000 | N | NA |
| 5500235 | 5500236 | AMF_821 | AMF_822 | sucB | TRUE | 0.735 | 31.000 | 0.009 | 1.000 | NA | ||
| 5500236 | 5500237 | AMF_822 | AMF_823 | panC | FALSE | 0.226 | 46.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 5500239 | 5500240 | AMF_825 | AMF_826 | dsbD | TRUE | 0.697 | 44.000 | 0.008 | NA | NA | ||
| 5500241 | 5500242 | AMF_827 | AMF_828 | oma87 | TRUE | 0.996 | -3.000 | 0.224 | 1.000 | Y | NA | |
| 5500242 | 5500243 | AMF_828 | AMF_829 | oma87 | TRUE | 0.992 | -13.000 | 0.031 | 1.000 | Y | NA | |
| 5500243 | 5500244 | AMF_829 | AMF_830 | fabZ | TRUE | 0.967 | 6.000 | 0.010 | 1.000 | N | NA | |
| 5500244 | 5500245 | AMF_830 | AMF_831 | fabZ | purH | TRUE | 0.849 | 15.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 5500247 | 5500248 | AMF_834 | AMF_835 | slt | FALSE | 0.368 | 28.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500254 | 5500255 | AMF_841 | AMF_842 | atpE | TRUE | 0.978 | 7.000 | 0.030 | 0.009 | NA | ||
| 5500255 | 5500256 | AMF_842 | AMF_843 | TRUE | 0.994 | -3.000 | 0.800 | 0.009 | NA | |||
| 5500257 | 5500258 | AMF_844 | AMF_845 | ftsA | trkH | TRUE | 0.870 | 32.000 | 0.019 | 1.000 | N | NA |
| 5500259 | 5500260 | AMF_846 | AMF_1085 | mesJ | FALSE | 0.516 | -134.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500260 | 5500261 | AMF_1085 | AMF_847 | ftsH | FALSE | 0.006 | 1384.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500261 | 5500262 | AMF_847 | AMF_848 | ftsH | secA | FALSE | 0.251 | 121.000 | 0.004 | 1.000 | N | NA |
| 5500263 | 5500264 | AMF_1053 | AMF_849 | FALSE | 0.453 | 19.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500264 | 5500265 | AMF_849 | AMF_850 | czcD | TRUE | 0.988 | 4.000 | 0.025 | NA | N | NA | |
| 5500265 | 5500266 | AMF_850 | AMF_1086 | czcD | FALSE | 0.613 | -41.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500266 | 5500267 | AMF_1086 | AMF_851 | ccmB | FALSE | 0.092 | 136.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500270 | 5500271 | AMF_854 | AMF_855 | ftsY | icd | FALSE | 0.006 | 275.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500271 | 5500272 | AMF_855 | AMF_856 | icd | recJ | FALSE | 0.206 | 141.000 | 0.006 | 1.000 | N | NA |
| 5500276 | 5500277 | AMF_860 | AMF_861 | omp1 | FALSE | 0.005 | 415.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500277 | 5500278 | AMF_861 | AMF_862 | omp1 | opag3 | FALSE | 0.044 | 165.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500278 | 5500279 | AMF_862 | AMF_864 | opag3 | opag2 | FALSE | 0.517 | 15.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500279 | 5500280 | AMF_864 | AMF_865 | opag2 | opag1 | FALSE | 0.616 | 12.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500280 | 5500281 | AMF_865 | AMF_866 | opag1 | msp2 | FALSE | 0.566 | 13.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500284 | 5500285 | AMF_869 | AMF_870 | FALSE | 0.010 | 232.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500289 | 5500290 | AMF_875 | AMF_876 | omp2 | omp3 | FALSE | 0.243 | 81.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500291 | 5500292 | AMF_877 | AMF_878 | omp4 | FALSE | 0.007 | 270.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500292 | 5500293 | AMF_878 | AMF_879 | omp4 | TRUE | 0.731 | -22.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500293 | 5500294 | AMF_879 | AMF_880 | omp5 | FALSE | 0.159 | 119.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500295 | 5500296 | AMF_881 | AMF_882 | ccmF | TRUE | 0.688 | 51.000 | 0.009 | 1.000 | NA | ||
| 5500298 | 5500299 | AMF_884 | AMF_885 | smpB | ribB | TRUE | 0.954 | 3.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA |
| 5500299 | 5500300 | AMF_885 | AMF_886 | ribB | greA | TRUE | 0.912 | 19.000 | 0.018 | 1.000 | N | NA |
| 5500300 | 5500301 | AMF_886 | AMF_887 | greA | atpA | TRUE | 0.978 | -3.000 | 0.013 | 1.000 | N | NA |
| 5500301 | 5500302 | AMF_887 | AMF_888 | atpA | atpH | TRUE | 0.984 | 20.000 | 0.953 | 0.008 | Y | NA |
| 5500302 | 5500303 | AMF_888 | AMF_889 | atpH | FALSE | 0.005 | 576.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500303 | 5500304 | AMF_889 | AMF_890 | TRUE | 0.988 | 4.000 | 0.027 | NA | NA | |||
| 5500304 | 5500305 | AMF_890 | AMF_891 | TRUE | 0.990 | -3.000 | 0.045 | NA | NA | |||
| 5500305 | 5500306 | AMF_891 | AMF_893 | lolE | TRUE | 0.988 | 5.000 | 0.034 | NA | NA | ||
| 5500308 | 5500309 | AMF_895 | AMF_896 | gshA | gltA | FALSE | 0.003 | 363.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 5500309 | 5500310 | AMF_896 | AMF_897 | gltA | guaA | TRUE | 0.844 | 7.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 5500310 | 5500311 | AMF_897 | AMF_898 | guaA | FALSE | 0.168 | 117.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500312 | 5500313 | AMF_899 | AMF_900 | pdhC | FALSE | 0.005 | 611.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500313 | 5500314 | AMF_900 | AMF_901 | pdhC | fbaB | FALSE | 0.005 | 298.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500314 | 5500315 | AMF_901 | AMF_1087 | fbaB | TRUE | 0.836 | 3.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500316 | 5500317 | AMF_902 | AMF_903 | pbpA1 | secF | TRUE | 0.748 | -19.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500319 | 5500320 | AMF_905 | AMF_906 | hemA | tyrS | FALSE | 0.381 | 170.000 | 0.023 | 1.000 | N | NA |
| 5500320 | 5500321 | AMF_906 | AMF_1088 | tyrS | TRUE | 0.680 | -29.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500322 | 5500323 | AMF_907 | AMF_908 | glnA | mraY1 | TRUE | 0.650 | 11.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500323 | 5500324 | AMF_908 | AMF_909 | mraY1 | ispB | TRUE | 0.687 | 10.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500325 | 5500326 | AMF_910 | AMF_911 | mkl | TRUE | 0.765 | 127.000 | 0.047 | NA | NA | ||
| 5500326 | 5500327 | AMF_911 | AMF_912 | mkl | TRUE | 0.996 | 5.000 | 0.206 | NA | Y | NA | |
| 5500327 | 5500328 | AMF_912 | AMF_913 | rpe | TRUE | 0.787 | 19.000 | 0.007 | NA | N | NA | |
| 5500328 | 5500329 | AMF_913 | AMF_914 | rpe | polA | FALSE | 0.352 | 77.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 5500330 | 5500331 | AMF_915 | AMF_916 | argF | FALSE | 0.400 | 23.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500331 | 5500332 | AMF_916 | AMF_917 | argF | recF | TRUE | 0.687 | 10.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500333 | 5500334 | AMF_918 | AMF_919 | omp6 | omp7 | FALSE | 0.321 | 40.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500334 | 5500335 | AMF_919 | AMF_920 | omp7 | omp8 | FALSE | 0.278 | 65.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500335 | 5500336 | AMF_920 | AMF_921 | omp8 | omp9 | FALSE | 0.279 | 62.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500336 | 5500337 | AMF_921 | AMF_922 | omp9 | omp10 | FALSE | 0.279 | 62.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500337 | 5500338 | AMF_922 | AMF_923 | omp10 | FALSE | 0.005 | 429.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500340 | 5500341 | AMF_926 | AMF_929 | mviN | FALSE | 0.161 | 151.000 | 0.006 | NA | NA | ||
| 5500342 | 5500343 | AMF_930 | AMF_1054 | lgt | FALSE | 0.010 | 240.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500344 | 5500345 | AMF_931 | AMF_932 | rpsT | plsC | TRUE | 0.659 | 89.000 | 0.009 | 1.000 | N | NA |
| 5500346 | 5500347 | AMF_933 | AMF_934 | def | FALSE | 0.158 | 247.000 | 0.052 | 1.000 | N | NA | |
| 5500347 | 5500348 | AMF_934 | AMF_936 | FALSE | 0.082 | 142.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500349 | 5500350 | AMF_937 | AMF_938 | FALSE | 0.281 | 59.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500350 | 5500351 | AMF_938 | AMF_939 | FALSE | 0.010 | 236.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500351 | 5500352 | AMF_939 | AMF_940 | FALSE | 0.308 | 45.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500352 | 5500353 | AMF_940 | AMF_941 | uvrB | FALSE | 0.005 | 413.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500354 | 5500355 | AMF_942 | AMF_944 | secD | FALSE | 0.003 | 490.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 5500357 | 5500358 | AMF_946 | AMF_947 | FALSE | 0.274 | 67.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500359 | 5500360 | AMF_948 | AMF_949 | ubiD | omp11 | TRUE | 0.920 | 110.000 | 1.000 | NA | NA | |
| 5500360 | 5500361 | AMF_949 | AMF_950 | omp11 | omp12 | FALSE | 0.512 | 194.000 | 1.000 | NA | NA | |
| 5500361 | 5500362 | AMF_950 | AMF_951 | omp12 | omp13 | FALSE | 0.014 | 208.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 5500363 | 5500364 | AMF_952 | AMF_953 | ftsZ | FALSE | 0.005 | 377.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500364 | 5500365 | AMF_953 | AMF_954 | parA | FALSE | 0.323 | 74.000 | 0.003 | NA | NA | ||
| 5500365 | 5500366 | AMF_954 | AMF_955 | parA | parB | TRUE | 0.995 | -3.000 | 0.790 | 1.000 | N | NA |
| 5500366 | 5500367 | AMF_955 | AMF_957 | parB | rimM | TRUE | 0.786 | 12.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 5500367 | 5500368 | AMF_957 | AMF_958 | rimM | trmD | TRUE | 0.997 | -3.000 | 0.687 | 1.000 | Y | NA |
| 5500368 | 5500369 | AMF_958 | AMF_959 | trmD | rplS | TRUE | 0.997 | -7.000 | 0.597 | 1.000 | Y | NA |
| 5500371 | 5500372 | AMF_961 | AMF_962 | thrS | infC | TRUE | 0.964 | 30.000 | 0.083 | 1.000 | Y | NA |
| 5500373 | 5500374 | AMF_963 | AMF_964 | TRUE | 0.958 | 4.000 | 0.008 | NA | NA | |||
| 5500374 | 5500375 | AMF_964 | AMF_965 | asd | FALSE | 0.164 | 118.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500375 | 5500376 | AMF_965 | AMF_966 | asd | TRUE | 0.964 | 2.000 | 0.008 | NA | NA | ||
| 5500376 | 5500377 | AMF_966 | AMF_967 | dnaZ | TRUE | 0.993 | 6.000 | 0.388 | NA | NA | ||
| 5500377 | 5500378 | AMF_967 | AMF_968 | dnaZ | gapA | FALSE | 0.583 | 66.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA |
| 5500379 | 5500380 | AMF_970 | AMF_971 | elbB | TRUE | 0.932 | 16.000 | 0.021 | NA | NA | ||
| 5500381 | 5500382 | AMF_972 | AMF_973 | ftsW | metK | TRUE | 0.758 | -18.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500383 | 5500384 | AMF_1089 | AMF_974 | ubiH | FALSE | 0.427 | 20.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500385 | 5500386 | AMF_975 | AMF_1090 | FALSE | 0.337 | 34.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500387 | 5500388 | AMF_976 | AMF_977 | glyQ | glyS | TRUE | 0.997 | 2.000 | 0.616 | 0.002 | Y | NA |
| 5500388 | 5500389 | AMF_977 | AMF_978 | glyS | dnaJ | FALSE | 0.600 | 82.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 5500392 | 5500393 | AMF_981 | AMF_982 | ruvC | coxC | TRUE | 0.897 | 19.000 | 0.015 | 1.000 | N | NA |
| 5500393 | 5500394 | AMF_982 | AMF_983 | coxC | hemE | TRUE | 0.777 | 70.000 | 0.014 | 1.000 | N | NA |
| 5500396 | 5500397 | AMF_985 | AMF_986 | TRUE | 0.987 | -16.000 | 0.049 | NA | NA | |||
| 5500398 | 5500399 | AMF_987 | AMF_988 | nadA | TRUE | 0.855 | 20.000 | 0.006 | 1.000 | Y | NA | |
| 5500402 | 5500403 | AMF_991 | AMF_992 | infC | virD4 | TRUE | 0.773 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 5500403 | 5500404 | AMF_992 | AMF_993 | virD4 | virB11 | TRUE | 0.968 | 48.000 | 0.455 | 1.000 | Y | NA |
| 5500404 | 5500405 | AMF_993 | AMF_994 | virB11 | virB10 | TRUE | 0.972 | 42.000 | 0.515 | 1.000 | Y | NA |
| 5500405 | 5500406 | AMF_994 | AMF_995 | virB10 | virB9 | TRUE | 0.994 | 8.000 | 0.212 | NA | Y | NA |
| 5500406 | 5500407 | AMF_995 | AMF_996 | virB9 | virB8 | TRUE | 0.996 | -13.000 | 0.333 | NA | Y | NA |
| 5500407 | 5500408 | AMF_996 | AMF_997 | virB8 | ribA | TRUE | 0.872 | 119.000 | 0.350 | NA | N | NA |
| 5500408 | 5500409 | AMF_997 | AMF_1091 | ribA | TRUE | 0.680 | -29.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500409 | 5500410 | AMF_1091 | AMF_998 | FALSE | 0.282 | 58.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500410 | 5500411 | AMF_998 | AMF_999 | FALSE | 0.603 | -43.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500411 | 5500412 | AMF_999 | AMF_1002 | dapF | FALSE | 0.280 | 61.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500412 | 5500413 | AMF_1002 | AMF_1003 | dapF | FALSE | 0.616 | 12.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500413 | 5500414 | AMF_1003 | AMF_1004 | FALSE | 0.082 | 142.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500416 | 5500417 | AMF_1006 | AMF_1007 | xseA | TRUE | 0.910 | -25.000 | 0.007 | NA | NA | ||
| 5500418 | 5500419 | AMF_1009 | AMF_1010 | dapD | thdF | TRUE | 0.774 | 1.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 5500421 | 5500422 | AMF_1012 | AMF_1013 | recG | FALSE | 0.185 | 182.000 | 0.011 | 1.000 | N | NA | |
| 5500423 | 5500424 | AMF_1014 | AMF_1015 | purF | pth | FALSE | 0.063 | 151.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500424 | 5500425 | AMF_1015 | AMF_1016 | pth | rplY | TRUE | 0.997 | 5.000 | 0.522 | 0.059 | Y | NA |
| 5500429 | 5500430 | AMF_1020 | AMF_1021 | comF | dapE | TRUE | 0.912 | -61.000 | 0.014 | 1.000 | NA | |
| 5500430 | 5500431 | AMF_1021 | AMF_1022 | dapE | kefB | FALSE | 0.040 | 170.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500431 | 5500432 | AMF_1022 | AMF_1023 | kefB | TRUE | 0.964 | 14.000 | 0.061 | 1.000 | N | NA | |
| 5500432 | 5500433 | AMF_1023 | AMF_1024 | FALSE | 0.088 | 228.000 | 0.011 | NA | NA | |||
| 5500433 | 5500434 | AMF_1024 | AMF_1025 | pdhB | FALSE | 0.118 | 131.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500434 | 5500435 | AMF_1025 | AMF_1026 | pdhB | FALSE | 0.278 | 65.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 5500435 | 5500436 | AMF_1026 | AMF_1093 | FALSE | 0.005 | 346.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 5500438 | 5500439 | AMF_1028 | AMF_1029 | ychF | ispF | FALSE | 0.031 | 181.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 5500439 | 5500440 | AMF_1029 | AMF_1030 | ispF | ispD | FALSE | 0.203 | 250.000 | 0.025 | 1.000 | Y | NA |