MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus cereus Q1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5520651 5520652 BCQ_0001 BCQ_0002 dnaA dnaN TRUE 0.721 179.000 0.097 1.000 Y NA
 5520652 5520653 BCQ_0002 BCQ_0003 dnaN yaaA TRUE 0.515 116.000 0.260 NA   NA
 5520653 5520654 BCQ_0003 BCQ_0004 yaaA recF TRUE 0.801 13.000 0.247 NA   NA
 5520654 5520655 BCQ_0004 BCQ_0005 recF gyrB TRUE 0.970 39.000 0.257 0.005 Y NA
 5520655 5520656 BCQ_0005 BCQ_0006 gyrB gyrA TRUE 0.965 89.000 0.299 0.002 Y NA
 5520656 5520657 BCQ_0006 BCQ_0007 gyrA   FALSE 0.030 271.000 0.000 NA   NA
 5520657 5520658 BCQ_0007 BCQ_0008     FALSE 0.060 151.000 0.000 NA   NA
 5520658 5520659 BCQ_0008 BCQ_0009     FALSE 0.309 9.000 0.000 NA   NA
 5520659 5520660 BCQ_0009 BCQ_0010     FALSE 0.089 95.000 0.000 NA   NA
 5520660 5520661 BCQ_0010 BCQ_0012     FALSE 0.115 51.000 0.000 NA   NA
 5520663 5520664 BCQ_0014 BCQ_0015 guaB dacA FALSE 0.428 114.000 0.000 1.000 N NA
 5520664 5520665 BCQ_0015 BCQ_0016 dacA pdx1 FALSE 0.339 162.000 0.000 1.000 N NA
 5520665 5520666 BCQ_0016 BCQ_0017 pdx1 guaA TRUE 0.948 19.000 0.640 NA Y NA
 5520666 5520667 BCQ_0017 BCQ_0018 guaA serS FALSE 0.121 328.000 0.008 NA N NA
 5520667 5520668 BCQ_0018 BCQ_0019 serS   FALSE 0.058 157.000 0.000 NA   NA
 5520668 5520669 BCQ_0019 BCQ_0020     FALSE 0.313 8.000 0.000 NA   NA
 5520670 5520671 BCQ_0021 BCQ_0022 dck dgk TRUE 0.995 3.000 0.333 0.001 Y NA
 5520671 5520672 BCQ_0022 BCQ_0023 dgk   TRUE 0.501 126.000 0.030 1.000 N NA
 5520673 5520674 BCQ_0024 BCQ_0025   dnaX FALSE 0.089 477.000 0.007 1.000 N NA
 5520674 5520675 BCQ_0025 BCQ_0026 dnaX dnaX TRUE 0.456 -27.000 0.000 NA   NA
 5520675 5520676 BCQ_0026 BCQ_0027 dnaX yaaK FALSE 0.156 23.000 0.000 NA   NA
 5520676 5520677 BCQ_0027 BCQ_0028 yaaK recR TRUE 0.862 15.000 0.615 NA   NA
 5520677 5520678 BCQ_0028 BCQ_0029 recR yaaL TRUE 0.547 15.000 0.057 NA   NA
 5520678 5520679 BCQ_0029 BCQ_0030 yaaL bofA FALSE 0.434 193.000 0.333 NA   NA
 5520679 5520680 BCQ_0030 BCQ_0031 bofA   FALSE 0.037 246.000 0.000 NA   NA
 5520680 5520681 BCQ_0031 BCQ_0032     FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5520681 5520682 BCQ_0032 BCQ_0034     FALSE 0.117 50.000 0.000 NA   NA
 5520682 5520683 BCQ_0034 BCQ_0035     FALSE 0.049 192.000 0.000 NA   NA
 5520683 5520684 BCQ_0035 BCQ_0036   cad TRUE 0.551 73.000 0.232 NA   NA
 5520684 5520685 BCQ_0036 BCQ_0037 cad tmk TRUE 0.904 2.000 0.067 1.000 N NA
 5520685 5520686 BCQ_0037 BCQ_0038 tmk holB TRUE 0.775 87.000 0.353 1.000 N NA
 5520686 5520687 BCQ_0038 BCQ_0039 holB   TRUE 0.905 -3.000 0.276 NA   NA
 5520687 5520688 BCQ_0039 BCQ_0040   yabA TRUE 0.875 0.000 0.204 NA   NA
 5520688 5520689 BCQ_0040 BCQ_0041 yabA   FALSE 0.373 121.000 0.116 NA   NA
 5520689 5520690 BCQ_0041 BCQ_0042   uvrC TRUE 0.885 -13.000 0.167 NA   NA
 5520690 5520691 BCQ_0042 BCQ_0043 uvrC   TRUE 0.857 -31.000 0.039 1.000   NA
 5520693 5520694 BCQ_0045 BCQ_0046 metS tatD TRUE 0.518 167.000 0.208 NA N NA
 5520694 5520695 BCQ_0046 BCQ_0047 tatD rnmV TRUE 0.580 218.000 0.060 NA Y NA
 5520695 5520696 BCQ_0047 BCQ_0048 rnmV ksgA TRUE 0.933 -3.000 0.104 1.000 N NA
 5520696 5520697 BCQ_0048 BCQ_0049 ksgA yabG FALSE 0.209 111.000 0.023 NA   NA
 5520697 5520698 BCQ_0049 BCQ_0050 yabG veg FALSE 0.266 239.000 0.156 NA   NA
 5520698 5520699 BCQ_0050 BCQ_0051 veg sspF TRUE 0.458 92.000 0.146 NA   NA
 5520699 5520700 BCQ_0051 BCQ_0052 sspF ispE FALSE 0.127 188.000 0.019 NA   NA
 5520700 5520701 BCQ_0052 BCQ_0053 ispE purR TRUE 0.642 55.000 0.051 1.000 N NA
 5520701 5520702 BCQ_0053 BCQ_0054 purR purR TRUE 0.642 123.000 0.295 NA N NA
 5520702 5520703 BCQ_0054 BCQ_0055 purR spoVG TRUE 0.653 99.000 0.232 NA N NA
 5520703 5520704 BCQ_0055 BCQ_0056 spoVG gcaD FALSE 0.418 323.000 0.018 1.000 Y NA
 5520704 5520705 BCQ_0056 BCQ_0057 gcaD prs TRUE 0.772 19.000 0.069 1.000 N NA
 5520705 5520706 BCQ_0057 BCQ_0058 prs spoVC TRUE 0.537 73.000 0.006 1.000 N NA
 5520706 5520707 BCQ_0058 BCQ_0059 spoVC yabK FALSE 0.223 71.000 0.015 NA   NA
 5520707 5520708 BCQ_0059 BCQ_0060 yabK mfd FALSE 0.208 107.000 0.020 NA   NA
 5520708 5520709 BCQ_0060 BCQ_0061 mfd spoVT TRUE 0.658 137.000 0.038 NA Y NA
 5520709 5520710 BCQ_0061 BCQ_0062 spoVT   FALSE 0.291 231.000 0.173 NA   NA
 5520710 5520711 BCQ_0062 BCQ_0063   mazG FALSE 0.438 106.000 0.061 1.000   NA
 5520711 5520712 BCQ_0063 BCQ_0064 mazG hslR TRUE 0.686 15.000 0.055 1.000   NA
 5520712 5520713 BCQ_0064 BCQ_0065 hslR yabP TRUE 0.481 59.000 0.126 NA   NA
 5520713 5520714 BCQ_0065 BCQ_0066 yabP   TRUE 0.950 -3.000 0.709 NA   NA
 5520714 5520715 BCQ_0066 BCQ_0067   divIC TRUE 0.811 -3.000 0.086 NA   NA
 5520715 5520716 BCQ_0067 BCQ_0068 divIC   TRUE 0.665 88.000 0.123 1.000 N NA
 5520716 5520717 BCQ_0068 BCQ_0069     FALSE 0.057 161.000 0.000 NA   NA
 5520717 5520718 BCQ_0069 BCQ_0070     FALSE 0.230 14.000 0.000 NA   NA
 5520718 5520719 BCQ_0070 BCQ_0071   spoIIE FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 5520719 5520720 BCQ_0071 BCQ_0072 spoIIE mesJ FALSE 0.387 226.000 0.049 1.000 N NA
 5520720 5520721 BCQ_0072 BCQ_0073 mesJ hprT TRUE 0.955 -3.000 0.082 0.046 N NA
 5520721 5520722 BCQ_0073 BCQ_0074 hprT ftsH TRUE 0.731 86.000 0.237 1.000 N NA
 5520722 5520723 BCQ_0074 BCQ_0075 ftsH   FALSE 0.219 309.000 0.023 1.000 N NA
 5520723 5520724 BCQ_0075 BCQ_0076   hslO TRUE 0.870 7.000 0.050 1.000 N NA
 5520724 5520725 BCQ_0076 BCQ_0077 hslO cysK TRUE 0.550 105.000 0.035 1.000 N NA
 5520725 5520726 BCQ_0077 BCQ_0078 cysK pabB TRUE 0.729 221.000 0.174 1.000 Y NA
 5520726 5520727 BCQ_0078 BCQ_0079 pabB pabA TRUE 0.982 6.000 0.090 0.014 Y NA
 5520727 5520728 BCQ_0079 BCQ_0080 pabA pabC TRUE 0.973 -6.000 0.090 1.000 Y NA
 5520728 5520729 BCQ_0080 BCQ_0081 pabC sul TRUE 0.980 -7.000 0.186 1.000 Y NA
 5520729 5520730 BCQ_0081 BCQ_0082 sul folB TRUE 0.926 25.000 0.273 1.000 Y NA
 5520730 5520731 BCQ_0082 BCQ_0083 folB folK TRUE 0.980 -3.000 0.240 1.000 Y NA
 5520731 5520732 BCQ_0083 BCQ_0084 folK   TRUE 0.909 -48.000 0.022 1.000 N NA
 5520732 5520733 BCQ_0084 BCQ_0085     TRUE 0.611 48.000 0.016 1.000 N NA
 5520733 5520734 BCQ_0085 BCQ_0086   lysS TRUE 0.712 160.000 0.062 1.000 Y NA
 5520734 5520735 BCQ_0086 BCQ_0087 lysS   FALSE 0.032 262.000 0.000 NA   NA
 5520735 5520736 BCQ_0087 BCQ_0088     FALSE 0.425 -3.000 0.000 NA   NA
 5520736 5520737 BCQ_0088 BCQ_0089     FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5520737 5520738 BCQ_0089 BCQ_0091     FALSE 0.115 51.000 0.000 NA   NA
 5520738 5520739 BCQ_0091 BCQ_0092   ctsR FALSE 0.046 208.000 0.000 NA   NA
 5520739 5520740 BCQ_0092 BCQ_0093 ctsR   TRUE 0.594 174.000 0.714 NA   NA
 5520740 5520741 BCQ_0093 BCQ_0094   karG TRUE 0.951 5.000 0.837 1.000   NA
 5520741 5520742 BCQ_0094 BCQ_0095 karG clpC TRUE 0.864 23.000 0.344 1.000 N NA
 5520742 5520743 BCQ_0095 BCQ_0096 clpC radA TRUE 0.923 97.000 0.083 0.010 Y NA
 5520743 5520744 BCQ_0096 BCQ_0097 radA   TRUE 0.876 4.000 0.139 1.000   NA
 5520744 5520745 BCQ_0097 BCQ_0098     FALSE 0.265 161.000 0.088 NA   NA
 5520745 5520746 BCQ_0098 BCQ_0099   ispD TRUE 0.733 17.000 0.238 NA   NA
 5520746 5520747 BCQ_0099 BCQ_0100 ispD ispF TRUE 0.822 116.000 0.136 1.000 Y NA
 5520747 5520748 BCQ_0100 BCQ_0101 ispF gltX TRUE 0.559 90.000 0.032 1.000 N NA
 5520748 5520749 BCQ_0101 BCQ_0102 gltX cysE FALSE 0.106 432.000 0.008 1.000 N NA
 5520749 5520750 BCQ_0102 BCQ_0103 cysE cysS TRUE 0.958 -19.000 0.071 0.046 N NA
 5520750 5520751 BCQ_0103 BCQ_0104 cysS yazC TRUE 0.885 3.000 0.151 1.000   NA
 5520751 5520752 BCQ_0104 BCQ_0105 yazC   TRUE 0.980 -3.000 0.177 0.003   NA
 5520752 5520753 BCQ_0105 BCQ_0106   yacP TRUE 0.795 4.000 0.113 NA   NA
 5520753 5520754 BCQ_0106 BCQ_0107 yacP spo0H TRUE 0.611 68.000 0.315 NA   NA
 5520754 5520755 BCQ_0107 BCQ_0108 spo0H secE FALSE 0.163 311.000 0.000 1.000 N NA
 5520755 5520756 BCQ_0108 BCQ_0109 secE nusG TRUE 0.807 132.000 0.829 1.000 N NA
 5520756 5520757 BCQ_0109 BCQ_0110 nusG rplK TRUE 0.738 189.000 0.762 1.000 N NA
 5520757 5520758 BCQ_0110 BCQ_0111 rplK rplA TRUE 0.939 178.000 0.831 0.017 Y NA
 5520758 5520759 BCQ_0111 BCQ_0112 rplA rplJ TRUE 0.890 233.000 0.377 0.017 Y NA
 5520759 5520760 BCQ_0112 BCQ_0113 rplJ rplL TRUE 0.972 68.000 0.888 0.013 Y NA
 5520760 5520761 BCQ_0113 BCQ_0114 rplL   TRUE 0.804 77.000 0.053 1.000 Y NA
 5520761 5520762 BCQ_0114 BCQ_0115   rpoB FALSE 0.233 293.000 0.012 1.000 N NA
 5520762 5520763 BCQ_0115 BCQ_0116 rpoB rpoC TRUE 0.985 65.000 0.875 0.001 Y NA
 5520763 5520764 BCQ_0116 BCQ_0117 rpoC   TRUE 0.459 81.000 0.037 NA N NA
 5520764 5520765 BCQ_0117 BCQ_0118   rpsl TRUE 0.707 115.000 0.043 NA Y NA
 5520765 5520766 BCQ_0118 BCQ_0119 rpsl rpsG TRUE 0.987 30.000 0.935 0.003 Y NA
 5520766 5520767 BCQ_0119 BCQ_0120 rpsG fusA TRUE 0.773 209.000 0.272 1.000 Y NA
 5520767 5520768 BCQ_0120 BCQ_0121 fusA tuf TRUE 0.961 118.000 0.221 0.001 Y NA
 5520768 5520769 BCQ_0121 BCQ_0122 tuf rpsJ TRUE 0.499 401.000 0.340 1.000 Y NA
 5520769 5520770 BCQ_0122 BCQ_0123 rpsJ rplC TRUE 0.977 35.000 0.749 0.017 Y NA
 5520770 5520771 BCQ_0123 BCQ_0124 rplC rplD TRUE 0.983 26.000 0.958 0.013 Y NA
 5520771 5520772 BCQ_0124 BCQ_0125 rplD rplW TRUE 0.995 0.000 0.904 0.013 Y NA
 5520772 5520773 BCQ_0125 BCQ_0126 rplW rplB TRUE 0.980 29.000 0.915 0.017 Y NA
 5520773 5520774 BCQ_0126 BCQ_0127 rplB rpsS TRUE 0.971 61.000 0.894 0.017 Y NA
 5520774 5520775 BCQ_0127 BCQ_0128 rpsS rplV TRUE 0.985 18.000 0.968 0.017 Y NA
 5520775 5520776 BCQ_0128 BCQ_0129 rplV rpsC TRUE 0.994 4.000 0.905 0.017 Y NA
 5520776 5520777 BCQ_0129 BCQ_0130 rpsC rplP TRUE 0.994 2.000 0.894 0.017 Y NA
 5520777 5520778 BCQ_0130 BCQ_0131 rplP rpmC TRUE 0.996 -25.000 0.868 0.013 Y NA
 5520778 5520779 BCQ_0131 BCQ_0132 rpmC rpsQ TRUE 0.984 21.000 0.911 0.013 Y NA
 5520779 5520780 BCQ_0132 BCQ_0133 rpsQ rplN TRUE 0.976 44.000 0.850 0.017 Y NA
 5520780 5520781 BCQ_0133 BCQ_0134 rplN rplX TRUE 0.978 39.000 0.958 0.017 Y NA
 5520781 5520782 BCQ_0134 BCQ_0135 rplX rplE TRUE 0.982 27.000 0.894 0.013 Y NA
 5520782 5520783 BCQ_0135 BCQ_0136 rplE rpsN TRUE 0.966 49.000 0.376 0.013 Y NA
 5520783 5520784 BCQ_0136 BCQ_0137 rpsN rpsH TRUE 0.971 30.000 0.359 0.013 Y NA
 5520784 5520785 BCQ_0137 BCQ_0138 rpsH rplF TRUE 0.981 33.000 0.956 0.013 Y NA
 5520785 5520786 BCQ_0138 BCQ_0139 rplF rplR TRUE 0.981 32.000 0.886 0.013 Y NA
 5520786 5520787 BCQ_0139 BCQ_0140 rplR rplR TRUE 0.983 22.000 0.973 0.017 Y NA
 5520787 5520788 BCQ_0140 BCQ_0141 rplR rpmD TRUE 0.988 14.000 0.782 0.017 Y NA
 5520788 5520789 BCQ_0141 BCQ_0142 rpmD rplO TRUE 0.986 34.000 0.677 0.002 Y NA
 5520789 5520790 BCQ_0142 BCQ_0143 rplO secY TRUE 0.974 0.000 0.873 1.000 N NA
 5520790 5520791 BCQ_0143 BCQ_0144 secY adk TRUE 0.755 57.000 0.198 1.000 N NA
 5520791 5520792 BCQ_0144 BCQ_0145 adk map TRUE 0.954 0.000 0.313 1.000 N NA
 5520792 5520793 BCQ_0145 BCQ_0146 map infA TRUE 0.815 69.000 0.058 1.000 Y NA
 5520793 5520794 BCQ_0146 BCQ_0147 infA rpmJ TRUE 0.767 36.000 0.323 1.000   NA
 5520794 5520795 BCQ_0147 BCQ_0148 rpmJ rpsM TRUE 0.933 22.000 0.436 0.013   NA
 5520795 5520796 BCQ_0148 BCQ_0149 rpsM rpsK TRUE 0.978 25.000 0.530 0.013 Y NA
 5520796 5520797 BCQ_0149 BCQ_0150 rpsK rpoA TRUE 0.681 181.000 0.440 1.000 N NA
 5520797 5520798 BCQ_0150 BCQ_0151 rpoA rplQ TRUE 0.901 36.000 0.883 1.000 N NA
 5520798 5520799 BCQ_0151 BCQ_0152 rplQ   TRUE 0.693 44.000 0.069 1.000 N NA
 5520799 5520800 BCQ_0152 BCQ_0153     TRUE 0.993 -24.000 0.475 0.031 Y NA
 5520800 5520801 BCQ_0153 BCQ_0154     TRUE 0.981 -12.000 0.196 1.000 Y NA
 5520801 5520802 BCQ_0154 BCQ_0155   truA TRUE 0.900 15.000 0.333 1.000 N NA
 5520802 5520803 BCQ_0155 BCQ_0156 truA rplM TRUE 0.708 153.000 0.047 1.000 Y NA
 5520803 5520804 BCQ_0156 BCQ_0157 rplM rpsI TRUE 0.984 22.000 0.979 0.013 Y NA
 5520804 5520805 BCQ_0157 BCQ_0158 rpsI ybaK FALSE 0.130 162.000 0.011 NA   NA
 5520805 5520806 BCQ_0158 BCQ_0159 ybaK cwlD TRUE 0.535 67.000 0.190 NA   NA
 5520806 5520807 BCQ_0159 BCQ_0160 cwlD mrp TRUE 0.561 145.000 0.228 NA N NA
 5520811 5520812 BCQ_0164 BCQ_0165     FALSE 0.034 254.000 0.000 NA   NA
 5520812 5520813 BCQ_0165 BCQ_0166     FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5520813 5520814 BCQ_0166 BCQ_0168     FALSE 0.090 89.000 0.000 NA   NA
 5520814 5520815 BCQ_0168 BCQ_0169     FALSE 0.254 13.000 0.000 NA   NA
 5520815 5520816 BCQ_0169 BCQ_0170     FALSE 0.337 5.000 0.000 NA   NA
 5520816 5520817 BCQ_0170 BCQ_0171     FALSE 0.151 25.000 0.000 NA   NA
 5520817 5520818 BCQ_0171 BCQ_0172     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 5520818 5520819 BCQ_0172 BCQ_0173     FALSE 0.183 18.000 0.000 NA   NA
 5520819 5520820 BCQ_0173 BCQ_0174     FALSE 0.101 66.000 0.000 NA   NA
 5520820 5520821 BCQ_0174 BCQ_0175     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 5520821 5520822 BCQ_0175 BCQ_0176     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 5520822 5520823 BCQ_0176 BCQ_0177     FALSE 0.295 11.000 0.000 NA   NA
 5520823 5520824 BCQ_0177 BCQ_0178   garK FALSE 0.078 117.000 0.000 NA   NA
 5520824 5520825 BCQ_0178 BCQ_0179 garK rocF FALSE 0.293 210.000 0.000 1.000 N NA
 5520825 5520826 BCQ_0179 BCQ_0180 rocF ybbP FALSE 0.035 250.000 0.000 NA   NA
 5520826 5520827 BCQ_0180 BCQ_0181 ybbP ybbR TRUE 0.945 -7.000 0.554 NA   NA
 5520827 5520828 BCQ_0181 BCQ_0182 ybbR glmM TRUE 0.882 -7.000 0.167 NA   NA
 5520828 5520829 BCQ_0182 BCQ_0183 glmM glmS FALSE 0.099 485.000 0.033 1.000 N NA
 5520829 5520830 BCQ_0183 BCQ_0184 glmS   FALSE 0.019 337.000 0.000 NA   NA
 5520830 5520831 BCQ_0184 BCQ_0185   gntR FALSE 0.012 408.000 0.000 NA   NA
 5520831 5520832 BCQ_0185 BCQ_0186 gntR gntK TRUE 0.874 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5520832 5520833 BCQ_0186 BCQ_0187 gntK gntP TRUE 0.881 120.000 0.417 1.000 Y NA
 5520833 5520834 BCQ_0187 BCQ_0188 gntP gntZ TRUE 0.471 265.000 0.000 1.000 Y NA
 5520834 5520835 BCQ_0188 BCQ_0189 gntZ   FALSE 0.160 314.000 0.000 1.000 N NA
 5520835 5520836 BCQ_0189 BCQ_0190     FALSE 0.062 146.000 0.000 NA   NA
 5520837 5520838 BCQ_0191 BCQ_0192     FALSE 0.038 241.000 0.000 NA   NA
 5520838 5520839 BCQ_0192 BCQ_0193     TRUE 0.880 0.000 0.222 NA   NA
 5520839 5520840 BCQ_0193 BCQ_0194     FALSE 0.065 141.000 0.000 NA   NA
 5520842 5520843 BCQ_0196 BCQ_0197     TRUE 0.981 -25.000 0.190 1.000 Y NA
 5520843 5520844 BCQ_0197 BCQ_0198     TRUE 0.962 13.000 0.500 NA Y NA
 5520844 5520845 BCQ_0198 BCQ_0199     FALSE 0.121 283.000 0.000 NA N NA
 5520846 5520847 BCQ_0200 BCQ_0201     FALSE 0.069 133.000 0.000 NA   NA
 5520847 5520848 BCQ_0201 BCQ_0202     TRUE 0.720 -3.000 0.034 NA   NA
 5520848 5520849 BCQ_0202 BCQ_0203     FALSE 0.093 79.000 0.000 NA   NA
 5520849 5520850 BCQ_0203 BCQ_0204     FALSE 0.072 128.000 0.000 NA   NA
 5520854 5520855 BCQ_0208 BCQ_0209   oppC TRUE 0.958 18.000 0.222 0.041 Y NA
 5520855 5520856 BCQ_0209 BCQ_0210 oppC oppD TRUE 0.981 -43.000 0.200 1.000 Y NA
 5520856 5520857 BCQ_0210 BCQ_0211 oppD oppF TRUE 0.974 -3.000 0.087 0.003   NA
 5520857 5520858 BCQ_0211 BCQ_0212 oppF oppA TRUE 0.748 14.000 0.087 1.000   NA
 5520860 5520861 BCQ_0214 BCQ_0215     TRUE 0.520 274.000 0.000 0.067 Y NA
 5520861 5520862 BCQ_0215 BCQ_0216     FALSE 0.327 59.000 0.045 NA   NA
 5520863 5520864 BCQ_0217 BCQ_0218 oppA oppA FALSE 0.380 388.000 0.000 0.041 Y NA
 5520864 5520865 BCQ_0218 BCQ_0219 oppA   FALSE 0.047 391.000 0.000 1.000   NA
 5520865 5520866 BCQ_0219 BCQ_0220   proC TRUE 0.690 2.000 0.000 1.000   NA
 5520868 5520869 BCQ_0222 BCQ_0223 glcU modB FALSE 0.243 302.000 0.000 0.066 N NA
 5520869 5520870 BCQ_0223 BCQ_0224 modB modA TRUE 0.966 165.000 0.634 0.001 Y NA
 5520872 5520873 BCQ_0226 BCQ_0227     FALSE 0.254 13.000 0.000 NA   NA
 5520873 5520874 BCQ_0227 BCQ_0228   gltR FALSE 0.064 142.000 0.000 NA   NA
 5520875 5520876 BCQ_0229 BCQ_0230     TRUE 0.824 22.000 0.667 NA   NA
 5520877 5520878 BCQ_0231 BCQ_0232     FALSE 0.254 13.000 0.000 NA   NA
 5520881 5520882 BCQ_0235 BCQ_0236     FALSE 0.006 597.000 0.000 NA   NA
 5520882 5520883 BCQ_0236 BCQ_0237     FALSE 0.065 140.000 0.000 NA   NA
 5520883 5520884 BCQ_0237 BCQ_0238     FALSE 0.005 746.000 0.000 NA   NA
 5520887 5520888 BCQ_0241 BCQ_0242     FALSE 0.067 135.000 0.000 NA   NA
 5520889 5520890 BCQ_0243 BCQ_0244     FALSE 0.074 125.000 0.000 NA   NA
 5520892 5520893 BCQ_0246 BCQ_0247   oppA TRUE 0.638 243.000 0.000 0.041 Y NA
 5520893 5520894 BCQ_0247 BCQ_0248 oppA oppB TRUE 0.879 137.000 0.222 0.041 Y NA
 5520894 5520895 BCQ_0248 BCQ_0249 oppB oppC TRUE 0.984 13.000 0.667 0.041 Y NA
 5520895 5520896 BCQ_0249 BCQ_0250 oppC oppD TRUE 0.971 11.000 0.333 1.000 Y NA
 5520896 5520897 BCQ_0250 BCQ_0251 oppD oppF TRUE 0.996 -3.000 0.444 0.002 Y NA
 5520898 5520899 BCQ_0252 BCQ_0253     FALSE 0.013 396.000 0.000 NA   NA
 5520900 5520901 BCQ_0254 BCQ_0255     FALSE 0.126 43.000 0.000 NA   NA
 5520901 5520902 BCQ_0255 BCQ_0256   hppD FALSE 0.023 310.000 0.000 NA   NA
 5520902 5520903 BCQ_0256 BCQ_0257 hppD   TRUE 0.683 67.000 0.111 1.000 N NA
 5520903 5520904 BCQ_0257 BCQ_0258     TRUE 0.969 -34.000 0.042 1.000 Y NA
 5520904 5520905 BCQ_0258 BCQ_0259     FALSE 0.265 233.000 0.000 1.000 N NA
 5520905 5520906 BCQ_0259 BCQ_0260     TRUE 0.712 109.000 0.000 1.000 Y NA
 5520906 5520907 BCQ_0260 BCQ_0261   ddlA FALSE 0.107 383.000 0.000 1.000 N NA
 5520907 5520908 BCQ_0261 BCQ_0262 ddlA murF TRUE 0.952 62.000 0.156 0.006 Y NA
 5520908 5520909 BCQ_0262 BCQ_0263 murF deaD FALSE 0.284 306.000 0.079 1.000 N NA
 5520909 5520910 BCQ_0263 BCQ_0264 deaD   TRUE 0.726 97.000 0.000 1.000 Y NA
 5520912 5520913 BCQ_0266 BCQ_0267 acpS   FALSE 0.434 94.000 0.027 NA N NA
 5520913 5520914 BCQ_0267 BCQ_0268   alr TRUE 0.804 119.000 0.231 NA Y NA
 5520914 5520915 BCQ_0268 BCQ_0269 alr   FALSE 0.309 300.000 0.189 NA N NA
 5520915 5520916 BCQ_0269 BCQ_0270     TRUE 0.822 26.000 0.376 NA N NA
 5520916 5520917 BCQ_0270 BCQ_0271     TRUE 0.573 68.000 0.025 1.000 N NA
 5520917 5520918 BCQ_0271 BCQ_0272     FALSE 0.140 370.000 0.210 NA   NA
 5520918 5520919 BCQ_0272 BCQ_0273     FALSE 0.080 115.000 0.000 NA   NA
 5520919 5520920 BCQ_0273 BCQ_0274     FALSE 0.350 4.000 0.000 NA   NA
 5520920 5520921 BCQ_0274 BCQ_0275     FALSE 0.309 9.000 0.000 NA   NA
 5520921 5520922 BCQ_0275 BCQ_0276     FALSE 0.337 5.000 0.000 NA   NA
 5520922 5520923 BCQ_0276 BCQ_0277     FALSE 0.121 47.000 0.000 NA   NA
 5520923 5520924 BCQ_0277 BCQ_0278     FALSE 0.090 88.000 0.000 NA   NA
 5520924 5520925 BCQ_0278 BCQ_0279     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 5520925 5520926 BCQ_0279 BCQ_0280     FALSE 0.183 18.000 0.000 NA   NA
 5520926 5520927 BCQ_0280 BCQ_0281     FALSE 0.089 95.000 0.000 NA   NA
 5520927 5520928 BCQ_0281 BCQ_0282     FALSE 0.337 5.000 0.000 NA   NA
 5520928 5520929 BCQ_0282 BCQ_0283     FALSE 0.374 2.000 0.000 NA   NA
 5520929 5520930 BCQ_0283 BCQ_0284     FALSE 0.086 105.000 0.000 NA   NA
 5520930 5520931 BCQ_0284 BCQ_0285     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 5520931 5520932 BCQ_0285 BCQ_0287     FALSE 0.117 50.000 0.000 NA   NA
 5520932 5520933 BCQ_0287 BCQ_0288     FALSE 0.230 14.000 0.000 NA   NA
 5520933 5520934 BCQ_0288 BCQ_0289     FALSE 0.350 4.000 0.000 NA   NA
 5520934 5520935 BCQ_0289 BCQ_0290     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 5520935 5520936 BCQ_0290 BCQ_0291     TRUE 0.878 -19.000 0.147 NA   NA
 5520936 5520937 BCQ_0291 BCQ_0292   rimI TRUE 0.883 14.000 0.415 1.000   NA
 5520937 5520938 BCQ_0292 BCQ_0293 rimI gcP TRUE 0.905 0.000 0.170 1.000   NA
 5520942 5520943 BCQ_0297 BCQ_0298 groES groEL TRUE 0.934 39.000 0.463 1.000 Y NA
 5520943 5520944 BCQ_0298 BCQ_0299 groEL guaA FALSE 0.097 399.000 0.000 1.000 N NA
 5520944 5520945 BCQ_0299 BCQ_0300 guaA   FALSE 0.049 385.000 0.000 1.000   NA
 5520945 5520946 BCQ_0300 BCQ_0301     FALSE 0.198 145.000 0.000 1.000   NA
 5520946 5520947 BCQ_0301 BCQ_0302     TRUE 0.933 -16.000 0.000 0.020   NA
 5520947 5520948 BCQ_0302 BCQ_0303     FALSE 0.021 324.000 0.000 NA   NA
 5520948 5520949 BCQ_0303 BCQ_0304     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 5520949 5520950 BCQ_0304 BCQ_0306     FALSE 0.117 50.000 0.000 NA   NA
 5520950 5520951 BCQ_0306 BCQ_0307     FALSE 0.005 745.000 0.000 NA   NA
 5520951 5520952 BCQ_0307 BCQ_0308   frnE FALSE 0.040 233.000 0.000 NA   NA
 5520952 5520953 BCQ_0308 BCQ_0309 frnE   FALSE 0.016 356.000 0.000 NA   NA
 5520953 5520954 BCQ_0309 BCQ_0310     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 5520954 5520955 BCQ_0310 BCQ_0312     FALSE 0.119 49.000 0.000 NA   NA
 5520956 5520957 BCQ_0313 BCQ_0314     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 5520957 5520958 BCQ_0314 BCQ_0315     FALSE 0.148 27.000 0.000 NA   NA
 5520958 5520959 BCQ_0315 BCQ_0316     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 5520961 5520962 BCQ_0318 BCQ_0319     FALSE 0.100 68.000 0.000 NA   NA
 5520963 5520964 BCQ_0320 BCQ_0321     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 5520964 5520965 BCQ_0321 BCQ_0323     FALSE 0.115 51.000 0.000 NA   NA
 5520967 5520968 BCQ_0325 BCQ_0326 putA   FALSE 0.004 1195.000 0.000 NA   NA
 5520968 5520969 BCQ_0326 BCQ_0327     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 5520969 5520970 BCQ_0327 BCQ_0329     FALSE 0.117 50.000 0.000 NA   NA
 5520972 5520973 BCQ_0331 BCQ_0332     FALSE 0.069 133.000 0.000 NA   NA
 5520973 5520974 BCQ_0332 BCQ_0333     FALSE 0.106 60.000 0.000 NA   NA
 5520976 5520977 BCQ_0335 BCQ_0336     FALSE 0.425 -3.000 0.000 NA   NA
 5520977 5520978 BCQ_0336 BCQ_0337     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 5520978 5520979 BCQ_0337 BCQ_0339     FALSE 0.117 50.000 0.000 NA   NA
 5520979 5520980 BCQ_0339 BCQ_0340   purE FALSE 0.005 794.000 0.000 NA   NA
 5520980 5520981 BCQ_0340 BCQ_0341 purE purK TRUE 0.964 63.000 0.108 0.001 Y NA
 5520981 5520982 BCQ_0341 BCQ_0342 purK purB TRUE 0.967 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 5520982 5520983 BCQ_0342 BCQ_0343 purB purC TRUE 0.805 89.000 0.065 1.000 Y NA
 5520983 5520984 BCQ_0343 BCQ_0344 purC purS TRUE 0.987 -7.000 0.453 1.000 Y NA
 5520984 5520985 BCQ_0344 BCQ_0345 purS purQ TRUE 0.997 -3.000 0.668 0.001 Y NA
 5520985 5520986 BCQ_0345 BCQ_0346 purQ purL TRUE 0.997 -16.000 0.322 0.001 Y NA
 5520986 5520987 BCQ_0346 BCQ_0347 purL purF TRUE 0.981 -15.000 0.201 1.000 Y NA
 5520987 5520988 BCQ_0347 BCQ_0348 purF purM TRUE 0.854 102.000 0.189 1.000 Y NA
 5520988 5520989 BCQ_0348 BCQ_0349 purM purN TRUE 0.994 -3.000 0.186 0.002 Y NA
 5520989 5520990 BCQ_0349 BCQ_0350 purN purH TRUE 0.918 25.000 0.204 1.000 Y NA
 5520990 5520991 BCQ_0350 BCQ_0351 purH purD TRUE 0.839 125.000 0.229 1.000 Y NA
 5520992 5520993 BCQ_0352 BCQ_0353     TRUE 0.833 17.000 0.533 NA   NA
 5520993 5520994 BCQ_0353 BCQ_0354     FALSE 0.044 221.000 0.000 NA   NA
 5520995 5520996 BCQ_0355 BCQ_0356   pcrA TRUE 0.568 13.000 0.042 NA   NA
 5520996 5520997 BCQ_0356 BCQ_0357 pcrA ligA TRUE 0.873 178.000 0.087 0.010 Y NA
 5520997 5520998 BCQ_0357 BCQ_0358 ligA   FALSE 0.191 17.000 0.000 NA   NA
 5520998 5520999 BCQ_0358 BCQ_0359     FALSE 0.089 96.000 0.000 NA   NA
 5520999 5521000 BCQ_0359 BCQ_0360   rocA FALSE 0.252 154.000 0.005 1.000   NA
 5521000 5521001 BCQ_0360 BCQ_0361 rocA   FALSE 0.050 187.000 0.000 NA   NA
 5521003 5521004 BCQ_0363 BCQ_0364     TRUE 0.977 -10.000 0.130 1.000 Y NA
 5521004 5521005 BCQ_0364 BCQ_0365     TRUE 0.878 22.000 0.118 NA Y NA
 5521006 5521007 BCQ_0366 BCQ_0367   arsA FALSE 0.447 -7.000 0.000 NA   NA
 5521007 5521008 BCQ_0367 BCQ_0368 arsA   TRUE 0.463 81.000 0.000 1.000 N NA
 5521009 5521010 BCQ_0369 BCQ_0370 yubF gatC FALSE 0.130 142.000 0.004 NA   NA
 5521010 5521011 BCQ_0370 BCQ_0371 gatC gatA TRUE 0.992 16.000 0.686 0.001 Y NA
 5521011 5521012 BCQ_0371 BCQ_0372 gatA gatB TRUE 0.992 15.000 0.502 0.001 Y NA
 5521012 5521013 BCQ_0372 BCQ_0373 gatB   FALSE 0.072 616.000 0.034 1.000 N NA
 5521015 5521016 BCQ_0375 BCQ_0376   gabT FALSE 0.285 143.000 0.016 1.000   NA
 5521016 5521017 BCQ_0376 BCQ_0377 gabT   TRUE 0.627 117.000 0.118 1.000 N NA
 5521017 5521018 BCQ_0377 BCQ_0378   gadD TRUE 0.575 35.000 0.000 1.000 N NA
 5521018 5521019 BCQ_0378 BCQ_0379 gadD   TRUE 0.793 48.000 0.250 1.000 N NA
 5521020 5521021 BCQ_0380 BCQ_0381 ampS   TRUE 0.657 117.000 0.154 1.000 N NA
 5521021 5521022 BCQ_0381 BCQ_0382   nupC FALSE 0.321 178.000 0.000 1.000 N NA
 5521023 5521024 BCQ_0383 BCQ_0384 trmA   TRUE 0.765 97.000 0.016 1.000 Y NA
 5521024 5521025 BCQ_0384 BCQ_0385   kinA FALSE 0.063 513.000 0.000 1.000 N NA
 5521025 5521026 BCQ_0385 BCQ_0386 kinA ilvB TRUE 0.645 196.000 0.375 1.000 N NA
 5521028 5521029 BCQ_0388 BCQ_0389   narA FALSE 0.004 1288.000 0.000 NA   NA
 5521029 5521030 BCQ_0389 BCQ_0390 narA   FALSE 0.304 10.000 0.000 NA   NA
 5521030 5521031 BCQ_0390 BCQ_0391     FALSE 0.176 19.000 0.000 NA   NA
 5521031 5521032 BCQ_0391 BCQ_0392   idh FALSE 0.447 -7.000 0.000 NA   NA
 5521032 5521033 BCQ_0392 BCQ_0393 idh glcD TRUE 0.924 -7.000 0.000 0.028   NA
 5521033 5521034 BCQ_0393 BCQ_0394 glcD argE FALSE 0.278 223.000 0.000 1.000 N NA
 5521034 5521035 BCQ_0394 BCQ_0395 argE   FALSE 0.170 20.000 0.000 NA   NA
 5521035 5521036 BCQ_0395 BCQ_0396     FALSE 0.095 75.000 0.000 NA   NA
 5521036 5521037 BCQ_0396 BCQ_0397     FALSE 0.041 231.000 0.000 NA   NA
 5521037 5521038 BCQ_0397 BCQ_0398     TRUE 0.988 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5521038 5521039 BCQ_0398 BCQ_0399   nprR FALSE 0.212 135.000 0.000 1.000   NA
 5521041 5521042 BCQ_0401 BCQ_0402 bcP dhbF TRUE 0.542 47.000 0.000 1.000 N NA
 5521042 5521043 BCQ_0402 BCQ_0403 dhbF   FALSE 0.072 127.000 0.000 NA   NA
 5521044 5521045 BCQ_0404 BCQ_0405     TRUE 0.812 6.000 0.000 0.051   NA
 5521046 5521047 BCQ_0406 BCQ_0407     FALSE 0.261 94.000 0.037 NA   NA
 5521048 5521049 BCQ_0408 BCQ_0409     TRUE 0.549 15.000 0.057 NA   NA
 5521052 5521053 BCQ_0412 BCQ_0413 amhX   FALSE 0.043 224.000 0.000 NA   NA
 5521054 5521055 BCQ_0414 BCQ_0415 ahpF ahpC TRUE 0.965 15.000 0.567 1.000 Y NA
 5521056 5521057 BCQ_0416 BCQ_0417 mtrK   TRUE 0.826 13.000 0.157 1.000   NA
 5521057 5521058 BCQ_0417 BCQ_0418   fucA TRUE 0.518 55.000 0.000 1.000 N NA
 5521058 5521059 BCQ_0418 BCQ_0419 fucA   FALSE 0.034 254.000 0.000 NA   NA
 5521059 5521060 BCQ_0419 BCQ_0420     FALSE 0.425 -3.000 0.000 NA   NA
 5521061 5521062 BCQ_0421 BCQ_0422   fhuB TRUE 0.987 -3.000 0.517 1.000 Y NA
 5521062 5521063 BCQ_0422 BCQ_0423 fhuB fhuD TRUE 0.896 73.000 0.345 1.000 Y NA
 5521066 5521067 BCQ_0426 BCQ_0427   cotB FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 5521067 5521068 BCQ_0427 BCQ_0428 cotB   FALSE 0.007 533.000 0.000 NA   NA
 5521068 5521069 BCQ_0428 BCQ_0429     FALSE 0.447 -7.000 0.000 NA   NA
 5521069 5521070 BCQ_0429 BCQ_0430     FALSE 0.039 238.000 0.000 NA   NA
 5521070 5521071 BCQ_0430 BCQ_0431     FALSE 0.007 531.000 0.000 NA   NA
 5521073 5521074 BCQ_0433 BCQ_0434     FALSE 0.224 122.000 0.035 NA   NA
 5521075 5521076 BCQ_0435 BCQ_0436     FALSE 0.250 140.000 0.000 NA N NA
 5521078 5521079 BCQ_0438 BCQ_0439     TRUE 0.453 -13.000 0.000 NA   NA
 5521079 5521080 BCQ_0439 BCQ_0440   resD FALSE 0.425 -3.000 0.000 NA   NA
 5521080 5521081 BCQ_0440 BCQ_0441 resD   FALSE 0.156 201.000 0.000 1.000   NA
 5521081 5521082 BCQ_0441 BCQ_0442     TRUE 0.992 -25.000 0.625 0.051 Y NA
 5521082 5521083 BCQ_0442 BCQ_0443   glnQ TRUE 0.807 122.000 0.125 1.000 Y NA
 5521084 5521085 BCQ_0444 BCQ_0445 mcpA   FALSE 0.256 239.000 0.000 1.000 N NA
 5521085 5521086 BCQ_0445 BCQ_0446   ptsG TRUE 0.738 206.000 0.167 1.000 Y NA
 5521086 5521087 BCQ_0446 BCQ_0447 ptsG   TRUE 0.931 5.000 0.750 NA   NA
 5521087 5521088 BCQ_0447 BCQ_0448     FALSE 0.024 306.000 0.000 NA   NA
 5521088 5521089 BCQ_0448 BCQ_0449   topB FALSE 0.049 192.000 0.000 NA   NA
 5521089 5521090 BCQ_0449 BCQ_0450 topB   FALSE 0.023 802.000 0.000 NA N NA
 5521091 5521092 BCQ_0451 BCQ_0452     TRUE 0.935 -3.000 0.000 NA Y NA
 5521092 5521093 BCQ_0452 BCQ_0453     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5521094 5521095 BCQ_0454 BCQ_0455     FALSE 0.010 437.000 0.000 NA   NA
 5521095 5521096 BCQ_0455 BCQ_0456     FALSE 0.061 148.000 0.000 NA   NA
 5521096 5521097 BCQ_0456 BCQ_0457   ydbJ FALSE 0.350 4.000 0.000 NA   NA
 5521097 5521098 BCQ_0457 BCQ_0458 ydbJ   TRUE 0.451 -10.000 0.000 NA   NA
 5521098 5521099 BCQ_0458 BCQ_0459     FALSE 0.102 65.000 0.000 NA   NA
 5521101 5521102 BCQ_0461 BCQ_0462 thiM thiE TRUE 0.979 17.000 0.113 0.002 Y NA
 5521102 5521103 BCQ_0462 BCQ_0463 thiE   FALSE 0.239 80.000 0.026 NA   NA
 5521105 5521106 BCQ_0465 BCQ_0466 cheW   FALSE 0.032 264.000 0.000 NA   NA
 5521106 5521107 BCQ_0466 BCQ_0467     TRUE 0.931 -28.000 0.365 NA   NA
 5521107 5521108 BCQ_0467 BCQ_0468     TRUE 0.979 -3.000 0.379 NA Y NA
 5521108 5521109 BCQ_0468 BCQ_0469     TRUE 0.693 138.000 0.076 NA Y NA
 5521109 5521110 BCQ_0469 BCQ_0470     FALSE 0.100 67.000 0.000 NA   NA
 5521110 5521111 BCQ_0470 BCQ_0471     FALSE 0.024 306.000 0.000 NA   NA
 5521113 5521114 BCQ_0473 BCQ_0474     FALSE 0.295 11.000 0.000 NA   NA
 5521114 5521115 BCQ_0474 BCQ_0475     FALSE 0.230 14.000 0.000 NA   NA
 5521115 5521116 BCQ_0475 BCQ_0476     FALSE 0.072 127.000 0.000 NA   NA
 5521116 5521117 BCQ_0476 BCQ_0477     FALSE 0.092 81.000 0.000 NA   NA
 5521117 5521118 BCQ_0477 BCQ_0478     TRUE 0.750 66.000 0.750 NA   NA
 5521118 5521119 BCQ_0478 BCQ_0479     FALSE 0.109 57.000 0.000 NA   NA
 5521119 5521120 BCQ_0479 BCQ_0480     FALSE 0.254 13.000 0.000 NA   NA
 5521121 5521122 BCQ_0481 BCQ_0482     FALSE 0.254 109.000 0.040 NA   NA
 5521123 5521124 BCQ_0483 BCQ_0484   proS FALSE 0.017 347.000 0.000 NA   NA
 5521126 5521127 BCQ_0486 BCQ_0487   terD FALSE 0.414 129.000 0.050 NA N NA
 5521127 5521128 BCQ_0487 BCQ_0488 terD terD TRUE 0.985 24.000 0.625 0.003 Y NA
 5521128 5521129 BCQ_0488 BCQ_0489 terD   TRUE 0.973 80.000 0.583 0.003 Y NA
 5521129 5521130 BCQ_0489 BCQ_0490     TRUE 0.766 73.000 0.292 1.000 N NA
 5521130 5521131 BCQ_0490 BCQ_0491     TRUE 0.460 108.000 0.167 NA   NA
 5521131 5521132 BCQ_0491 BCQ_0492     TRUE 0.833 19.000 0.615 NA   NA
 5521133 5521134 BCQ_0493 BCQ_0494 pacL   FALSE 0.049 191.000 0.000 NA   NA
 5521135 5521136 BCQ_0495 BCQ_0496 ptp   FALSE 0.166 120.000 0.008 NA   NA
 5521136 5521137 BCQ_0496 BCQ_0497   rbn TRUE 0.787 7.000 0.130 NA   NA
 5521139 5521140 BCQ_0499 BCQ_0500     FALSE 0.075 123.000 0.000 NA   NA
 5521145 5521146 BCQ_0505 BCQ_0506     FALSE 0.062 146.000 0.000 NA   NA
 5521146 5521147 BCQ_0506 BCQ_0507     FALSE 0.058 156.000 0.000 NA   NA
 5521148 5521149 BCQ_0508 BCQ_0509 cax   FALSE 0.421 115.000 0.141 NA   NA
 5521151 5521152 BCQ_0511 BCQ_0512   fumA FALSE 0.202 207.000 0.071 NA   NA
 5521152 5521153 BCQ_0512 BCQ_0513 fumA   TRUE 0.623 128.000 0.136 1.000 N NA
 5521153 5521154 BCQ_0513 BCQ_0514   alkA TRUE 0.702 60.000 0.119 1.000 N NA
 5521154 5521155 BCQ_0514 BCQ_0515 alkA trmA TRUE 0.916 11.000 0.213 1.000 N NA
 5521155 5521156 BCQ_0515 BCQ_0516 trmA truA TRUE 0.889 57.000 0.000 0.019 Y NA
 5521156 5521157 BCQ_0516 BCQ_0517 truA   FALSE 0.065 141.000 0.000 NA   NA
 5521157 5521158 BCQ_0517 BCQ_0518     TRUE 0.889 3.000 0.308 NA   NA
 5521159 5521160 BCQ_0519 BCQ_0520   rocR FALSE 0.092 80.000 0.000 NA   NA
 5521161 5521162 BCQ_0521 BCQ_0522   rocE FALSE 0.086 105.000 0.000 NA   NA
 5521162 5521163 BCQ_0522 BCQ_0523 rocE   TRUE 0.727 96.000 0.000 1.000 Y NA
 5521165 5521166 BCQ_0525 BCQ_0526     TRUE 0.737 115.000 1.000 NA   NA
 5521167 5521168 BCQ_0527 BCQ_0528   glsA FALSE 0.312 176.000 0.133 NA   NA
 5521169 5521170 BCQ_0529 BCQ_0530 nagE pbpX FALSE 0.232 254.000 0.000 1.000 N NA
 5521170 5521171 BCQ_0530 BCQ_0531 pbpX   FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 5521171 5521172 BCQ_0531 BCQ_0532     FALSE 0.191 17.000 0.000 NA   NA
 5521172 5521173 BCQ_0532 BCQ_0533     FALSE 0.090 89.000 0.000 NA   NA
 5521173 5521174 BCQ_0533 BCQ_0534     TRUE 0.451 -10.000 0.000 NA   NA
 5521174 5521175 BCQ_0534 BCQ_0535   galE TRUE 0.964 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 5521175 5521176 BCQ_0535 BCQ_0536 galE   TRUE 0.455 -19.000 0.000 NA   NA
 5521176 5521177 BCQ_0536 BCQ_0537   pflB FALSE 0.018 340.000 0.000 NA   NA
 5521177 5521178 BCQ_0537 BCQ_0538 pflB pflA TRUE 0.648 70.000 0.083 1.000 N NA
 5521178 5521179 BCQ_0538 BCQ_0539 pflA ugtP FALSE 0.092 413.000 0.000 1.000 N NA
 5521180 5521181 BCQ_0540 BCQ_0541     FALSE 0.082 111.000 0.000 NA   NA
 5521181 5521182 BCQ_0541 BCQ_0542     FALSE 0.158 242.000 0.000 NA N NA
 5521182 5521183 BCQ_0542 BCQ_0543     FALSE 0.247 264.000 0.087 1.000   NA
 5521184 5521185 BCQ_0544 BCQ_0545 recX   TRUE 0.645 10.000 0.049 NA   NA
 5521186 5521187 BCQ_0546 BCQ_0547     TRUE 0.551 38.000 0.133 NA   NA
 5521192 5521193 BCQ_0552 BCQ_0553 sspE   FALSE 0.396 0.000 0.000 NA   NA
 5521193 5521194 BCQ_0553 BCQ_0554     FALSE 0.105 61.000 0.000 NA   NA
 5521194 5521195 BCQ_0554 BCQ_0555     FALSE 0.154 252.000 0.069 NA   NA
 5521195 5521196 BCQ_0555 BCQ_0556     TRUE 0.707 55.000 0.230 NA N NA
 5521197 5521198 BCQ_0557 BCQ_0558   gltB FALSE 0.210 261.000 0.130 NA   NA
 5521198 5521199 BCQ_0558 BCQ_0559 gltB hemL FALSE 0.373 199.000 0.020 1.000 N NA
 5521200 5521201 BCQ_0560 BCQ_0561     TRUE 0.960 -7.000 0.909 NA   NA
 5521201 5521202 BCQ_0561 BCQ_0562     TRUE 0.938 5.000 0.909 NA   NA
 5521202 5521203 BCQ_0562 BCQ_0563   lctB TRUE 0.520 73.000 0.188 NA   NA
 5521203 5521204 BCQ_0563 BCQ_0564 lctB bcP FALSE 0.324 45.000 0.031 NA   NA
 5521204 5521205 BCQ_0564 BCQ_0565 bcP perR FALSE 0.184 332.000 0.013 1.000 N NA
 5521207 5521208 BCQ_0567 BCQ_0568     FALSE 0.052 179.000 0.000 NA   NA
 5521208 5521209 BCQ_0568 BCQ_0571     FALSE 0.087 103.000 0.000 NA   NA
 5521209 5521210 BCQ_0571 BCQ_0572     FALSE 0.280 12.000 0.000 NA   NA
 5521210 5521211 BCQ_0572 BCQ_0573     FALSE 0.363 3.000 0.000 NA   NA
 5521211 5521212 BCQ_0573 BCQ_0574     FALSE 0.183 18.000 0.000 NA   NA
 5521212 5521213 BCQ_0574 BCQ_0575     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 5521213 5521214 BCQ_0575 BCQ_0576     FALSE 0.151 25.000 0.000 NA   NA
 5521214 5521215 BCQ_0576 BCQ_0577     FALSE 0.350 4.000 0.000 NA   NA
 5521215 5521216 BCQ_0577 BCQ_0578     FALSE 0.304 10.000 0.000 NA   NA
 5521216 5521217 BCQ_0578 BCQ_0579     FALSE 0.176 19.000 0.000 NA   NA
 5521217 5521218 BCQ_0579 BCQ_0580     FALSE 0.295 11.000 0.000 NA   NA
 5521218 5521219 BCQ_0580 BCQ_0581     FALSE 0.313 8.000 0.000 NA   NA
 5521219 5521220 BCQ_0581 BCQ_0582     FALSE 0.170 20.000 0.000 NA   NA
 5521220 5521221 BCQ_0582 BCQ_0583     FALSE 0.103 64.000 0.000 NA   NA
 5521221 5521222 BCQ_0583 BCQ_0584     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 5521222 5521223 BCQ_0584 BCQ_0585     FALSE 0.213 15.000 0.000 NA   NA
 5521223 5521224 BCQ_0585 BCQ_0586     FALSE 0.295 11.000 0.000 NA   NA
 5521224 5521225 BCQ_0586 BCQ_0587   codV FALSE 0.051 180.000 0.000 NA   NA
 5521227 5521228 BCQ_0589 BCQ_0590     FALSE 0.425 -3.000 0.000 NA   NA
 5521228 5521229 BCQ_0590 BCQ_0591     TRUE 0.451 -10.000 0.000 NA   NA
 5521229 5521230 BCQ_0591 BCQ_0592     FALSE 0.396 0.000 0.000 NA   NA
 5521230 5521231 BCQ_0592 BCQ_0593     FALSE 0.069 132.000 0.000 NA   NA
 5521231 5521232 BCQ_0593 BCQ_0594     FALSE 0.213 15.000 0.000 NA   NA
 5521232 5521233 BCQ_0594 BCQ_0595     FALSE 0.013 387.000 0.000 NA   NA
 5521235 5521236 BCQ_0597 BCQ_0598     FALSE 0.131 39.000 0.000 NA   NA
 5521236 5521237 BCQ_0598 BCQ_0599     FALSE 0.140 32.000 0.000 NA   NA
 5521238 5521239 BCQ_0600 BCQ_0601 phrA rapA FALSE 0.396 0.000 0.000 NA   NA
 5521240 5521241 BCQ_0602 BCQ_0603     FALSE 0.183 18.000 0.000 NA   NA
 5521241 5521242 BCQ_0603 BCQ_0604     FALSE 0.019 339.000 0.000 NA   NA
 5521242 5521243 BCQ_0604 BCQ_0605     FALSE 0.007 569.000 0.000 NA   NA
 5521243 5521244 BCQ_0605 BCQ_0606   mutT FALSE 0.096 73.000 0.000 NA   NA
 5521244 5521245 BCQ_0606 BCQ_0607 mutT   FALSE 0.030 488.000 0.000 1.000   NA
 5521245 5521246 BCQ_0607 BCQ_0608   bdbD FALSE 0.320 188.000 0.071 1.000   NA
 5521246 5521247 BCQ_0608 BCQ_0609 bdbD   FALSE 0.080 115.000 0.000 NA   NA
 5521247 5521248 BCQ_0609 BCQ_0610     FALSE 0.024 302.000 0.000 NA   NA
 5521248 5521249 BCQ_0610 BCQ_0611     FALSE 0.035 250.000 0.000 NA   NA
 5521249 5521250 BCQ_0611 BCQ_0612     FALSE 0.308 45.000 0.026 NA   NA
 5521250 5521251 BCQ_0612 BCQ_0613   cspR FALSE 0.424 59.000 0.091 NA   NA
 5521251 5521252 BCQ_0613 BCQ_0614 cspR   FALSE 0.398 128.000 0.000 1.000 N NA
 5521254 5521255 BCQ_0616 BCQ_0617 prkA   FALSE 0.056 448.000 0.089 NA   NA
 5521255 5521256 BCQ_0617 BCQ_0618     FALSE 0.057 161.000 0.000 NA   NA
 5521258 5521259 BCQ_0620 BCQ_0621 colA   FALSE 0.036 248.000 0.000 NA   NA
 5521259 5521260 BCQ_0621 BCQ_0622     TRUE 0.826 13.000 0.306 NA   NA
 5521260 5521261 BCQ_0622 BCQ_0623   cheW FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 5521261 5521262 BCQ_0623 BCQ_0624 cheW citS TRUE 0.813 151.000 0.000 0.017 Y NA
 5521262 5521263 BCQ_0624 BCQ_0625 citS citT TRUE 0.982 0.000 0.333 0.086 Y NA
 5521265 5521266 BCQ_0627 BCQ_0628     FALSE 0.069 132.000 0.000 NA   NA
 5521266 5521267 BCQ_0628 BCQ_0629     FALSE 0.013 392.000 0.000 NA   NA
 5521267 5521268 BCQ_0629 BCQ_0630     FALSE 0.044 220.000 0.000 NA   NA
 5521268 5521269 BCQ_0630 BCQ_0631   glpP FALSE 0.023 308.000 0.000 NA   NA
 5521269 5521270 BCQ_0631 BCQ_0632 glpP   TRUE 0.878 -36.000 0.000 1.000 N NA
 5521270 5521271 BCQ_0632 BCQ_0633     TRUE 0.965 0.000 0.000 0.050 Y NA
 5521271 5521272 BCQ_0633 BCQ_0634     TRUE 0.993 -3.000 0.852 0.039 Y NA
 5521272 5521273 BCQ_0634 BCQ_0635     TRUE 0.971 22.000 0.615 0.039 Y NA
 5521273 5521274 BCQ_0635 BCQ_0636   pphA FALSE 0.044 401.000 0.000 1.000   NA
 5521274 5521275 BCQ_0636 BCQ_0637 pphA llrF FALSE 0.151 213.000 0.000 1.000   NA
 5521275 5521276 BCQ_0637 BCQ_0638 llrF   TRUE 0.949 12.000 0.103 1.000 Y NA
 5521276 5521277 BCQ_0638 BCQ_0639     FALSE 0.038 241.000 0.000 NA   NA
 5521277 5521278 BCQ_0639 BCQ_0640     FALSE 0.230 14.000 0.000 NA   NA
 5521278 5521279 BCQ_0640 BCQ_0641   mcpA FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 5521279 5521280 BCQ_0641 BCQ_0642 mcpA   TRUE 0.927 79.000 0.074 0.008 Y NA
 5521280 5521281 BCQ_0642 BCQ_0643     TRUE 0.934 30.000 0.333 0.086 Y NA
 5521281 5521282 BCQ_0643 BCQ_0644   maeN FALSE 0.338 357.000 0.308 1.000 N NA
 5521282 5521283 BCQ_0644 BCQ_0645 maeN sfcA TRUE 0.866 60.000 0.143 1.000 Y NA
 5521284 5521285 BCQ_0646 BCQ_0647     FALSE 0.079 116.000 0.000 NA   NA
 5521287 5521288 BCQ_0649 BCQ_0650     FALSE 0.197 146.000 0.000 1.000   NA
 5521288 5521289 BCQ_0650 BCQ_0651   llrF TRUE 0.831 66.000 1.000 1.000   NA
 5521291 5521292 BCQ_0653 BCQ_0654   fdhD FALSE 0.268 232.000 0.000 1.000 N NA
 5521293 5521294 BCQ_0655 BCQ_0656 fdhF   TRUE 0.917 13.000 1.000 NA   NA
 5521294 5521295 BCQ_0656 BCQ_0657   glpQ FALSE 0.226 192.000 0.083 NA   NA
 5521295 5521296 BCQ_0657 BCQ_0658 glpQ ald FALSE 0.115 369.000 0.000 1.000 N NA
 5521296 5521297 BCQ_0658 BCQ_0659 ald   TRUE 0.877 200.000 1.000 1.000 Y NA
 5521297 5521298 BCQ_0659 BCQ_0660   arsR FALSE 0.175 303.000 0.000 1.000 N NA
 5521298 5521299 BCQ_0660 BCQ_0661 arsR   TRUE 0.783 24.000 0.120 1.000 N NA
 5521301 5521302 BCQ_0663 BCQ_0664 nprR   FALSE 0.374 2.000 0.000 NA   NA
 5521302 5521303 BCQ_0664 BCQ_0665   npr FALSE 0.055 167.000 0.000 NA   NA
 5521305 5521306 BCQ_0667 BCQ_0668     TRUE 0.813 16.000 0.400 NA   NA
 5521307 5521308 BCQ_0669 BCQ_0670 vanW lytR FALSE 0.165 235.000 0.000 NA N NA
 5521308 5521309 BCQ_0670 BCQ_0671 lytR nupC FALSE 0.197 191.000 0.000 NA N NA
 5521310 5521311 BCQ_0672 BCQ_0673 gloA   FALSE 0.071 129.000 0.000 NA   NA
 5521311 5521312 BCQ_0673 BCQ_0674   aspA FALSE 0.056 163.000 0.000 NA   NA
 5521313 5521314 BCQ_0675 BCQ_0676   lctP FALSE 0.079 116.000 0.000 NA   NA
 5521315 5521316 BCQ_0677 BCQ_0678 arsR sspH TRUE 0.646 118.000 0.333 1.000   NA
 5521317 5521318 BCQ_0679 BCQ_0680 ptr2 fecB FALSE 0.107 382.000 0.000 1.000 N NA
 5521319 5521320 BCQ_0681 BCQ_0682 fecC fecD TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.039 Y NA
 5521320 5521321 BCQ_0682 BCQ_0683 fecD fecE TRUE 0.903 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5521323 5521324 BCQ_0685 BCQ_0686 bioF galE TRUE 0.742 45.000 0.125 1.000 N NA
 5521324 5521325 BCQ_0686 BCQ_0687 galE pyrE FALSE 0.430 113.000 0.000 1.000 N NA
 5521325 5521326 BCQ_0687 BCQ_0688 pyrE   TRUE 0.734 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5521327 5521328 BCQ_0689 BCQ_0690   norQ TRUE 0.937 4.000 0.810 NA   NA
 5521328 5521329 BCQ_0690 BCQ_0691 norQ cls FALSE 0.223 128.000 0.000 1.000   NA
 5521330 5521331 BCQ_0692 BCQ_0693     FALSE 0.142 31.000 0.000 NA   NA
 5521331 5521332 BCQ_0693 BCQ_0694     FALSE 0.009 460.000 0.000 NA   NA
 5521334 5521335 BCQ_0696 BCQ_0697 treR treB FALSE 0.377 138.000 0.000 1.000 N NA
 5521335 5521336 BCQ_0697 BCQ_0698 treB treB FALSE 0.170 20.000 0.000 NA   NA
 5521336 5521337 BCQ_0698 BCQ_0699 treB treB FALSE 0.170 20.000 0.000 NA   NA
 5521337 5521338 BCQ_0699 BCQ_0700 treB treC TRUE 0.911 14.000 0.022 1.000 Y NA
 5521339 5521340 BCQ_0701 BCQ_0702 gerKC gerKB TRUE 0.986 -19.000 0.500 0.010   NA
 5521340 5521341 BCQ_0702 BCQ_0703 gerKB gerKA TRUE 0.949 -28.000 0.000 0.010   NA
 5521342 5521343 BCQ_0704 BCQ_0705     FALSE 0.153 24.000 0.000 NA   NA
 5521343 5521344 BCQ_0705 BCQ_0706   alsT FALSE 0.028 284.000 0.000 NA   NA
 5521344 5521345 BCQ_0706 BCQ_0707 alsT glnQ TRUE 0.958 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 5521345 5521346 BCQ_0707 BCQ_0708 glnQ glnH TRUE 0.966 13.000 0.360 1.000 Y NA
 5521346 5521347 BCQ_0708 BCQ_0709 glnH glnP TRUE 0.817 194.000 0.180 0.050 Y NA
 5521347 5521348 BCQ_0709 BCQ_0710 glnP glnP TRUE 0.996 1.000 0.980 0.005 Y NA
 5521348 5521349 BCQ_0710 BCQ_0711 glnP rocE TRUE 0.644 205.000 0.000 0.062 Y NA
 5521349 5521350 BCQ_0711 BCQ_0712 rocE   TRUE 0.903 -25.000 0.009 1.000 N NA
 5521350 5521351 BCQ_0712 BCQ_0713     TRUE 0.504 60.000 0.000 1.000 N NA
 5521351 5521352 BCQ_0713 BCQ_0714   rpoD FALSE 0.318 179.000 0.000 1.000 N NA
 5521352 5521353 BCQ_0714 BCQ_0715 rpoD   TRUE 0.456 -34.000 0.000 NA   NA
 5521356 5521357 BCQ_0718 BCQ_0719 lcoS lcoR TRUE 0.929 12.000 0.667 1.000   NA
 5521358 5521359 BCQ_0720 BCQ_0721     FALSE 0.048 194.000 0.000 NA   NA
 5521359 5521360 BCQ_0721 BCQ_0722   uspA TRUE 0.741 66.000 0.200 1.000 N NA
 5521360 5521361 BCQ_0722 BCQ_0723 uspA   FALSE 0.044 219.000 0.000 NA   NA
 5521362 5521363 BCQ_0724 BCQ_0725 oppA oppC TRUE 0.959 13.000 0.064 0.039 Y NA
 5521363 5521364 BCQ_0725 BCQ_0726 oppC oppB TRUE 0.963 18.000 0.282 0.039 Y NA
 5521364 5521365 BCQ_0726 BCQ_0727 oppB oppF TRUE 0.877 15.000 0.444 1.000   NA
 5521365 5521366 BCQ_0727 BCQ_0728 oppF oppD TRUE 0.987 -13.000 0.371 0.003   NA
 5521366 5521367 BCQ_0728 BCQ_0729 oppD glpT FALSE 0.197 284.000 0.000 1.000 N NA
 5521368 5521369 BCQ_0730 BCQ_0731     TRUE 0.898 20.000 0.500 1.000 N NA
 5521369 5521370 BCQ_0731 BCQ_0732   rbsR TRUE 0.632 138.000 0.182 1.000 N NA
 5521370 5521371 BCQ_0732 BCQ_0733 rbsR rbsK TRUE 0.787 14.000 0.027 1.000 N NA
 5521371 5521372 BCQ_0733 BCQ_0734 rbsK rbsD TRUE 0.982 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 5521372 5521373 BCQ_0734 BCQ_0735 rbsD rbsA TRUE 0.901 118.000 0.611 1.000 Y NA
 5521373 5521374 BCQ_0735 BCQ_0736 rbsA rbsC TRUE 0.987 3.000 0.879 1.000 Y NA
 5521374 5521375 BCQ_0736 BCQ_0737 rbsC rbsB TRUE 0.961 15.000 0.712 NA Y NA
 5521375 5521376 BCQ_0737 BCQ_0738 rbsB tal TRUE 0.791 35.000 0.013 NA Y NA
 5521376 5521377 BCQ_0738 BCQ_0739 tal inA FALSE 0.073 324.000 0.000 1.000   NA
 5521379 5521380 BCQ_0741 BCQ_0742 adhB   FALSE 0.077 119.000 0.000 NA   NA
 5521380 5521381 BCQ_0742 BCQ_0743   plC FALSE 0.034 254.000 0.000 NA   NA
 5521381 5521382 BCQ_0743 BCQ_0744 plC   FALSE 0.030 270.000 0.000 NA   NA
 5521382 5521383 BCQ_0744 BCQ_0745   spH FALSE 0.089 95.000 0.000 NA   NA
 5521383 5521384 BCQ_0745 BCQ_0746 spH   FALSE 0.299 75.000 0.045 NA   NA
 5521384 5521385 BCQ_0746 BCQ_0747     TRUE 0.934 -12.000 0.182 NA N NA
 5521388 5521389 BCQ_0750 BCQ_0751 bacA mcpC TRUE 0.624 133.000 0.154 1.000 N NA
 5521390 5521391 BCQ_0752 BCQ_0753     FALSE 0.261 104.000 0.000 1.000   NA
 5521391 5521392 BCQ_0753 BCQ_0754     TRUE 0.963 -7.000 1.000 NA   NA
 5521392 5521393 BCQ_0754 BCQ_0755     FALSE 0.078 117.000 0.000 NA   NA
 5521393 5521394 BCQ_0755 BCQ_0756     FALSE 0.065 140.000 0.000 NA   NA
 5521396 5521397 BCQ_0758 BCQ_0759   brnQ FALSE 0.092 80.000 0.000 NA   NA
 5521397 5521398 BCQ_0759 BCQ_0760 brnQ   FALSE 0.070 131.000 0.000 NA   NA
 5521399 5521400 BCQ_0761 BCQ_0762   proY FALSE 0.165 182.000 0.000 1.000   NA
 5521401 5521402 BCQ_0763 BCQ_0764     FALSE 0.093 290.000 0.000 1.000   NA
 5521402 5521403 BCQ_0764 BCQ_0765     FALSE 0.337 5.000 0.000 NA   NA
 5521403 5521404 BCQ_0765 BCQ_0766     FALSE 0.131 39.000 0.000 NA   NA
 5521405 5521406 BCQ_0767 BCQ_0768   napA FALSE 0.072 327.000 0.000 1.000   NA
 5521406 5521407 BCQ_0768 BCQ_0769 napA qoxD FALSE 0.383 220.000 0.000 0.061 N NA
 5521407 5521408 BCQ_0769 BCQ_0770 qoxD qoxC TRUE 0.979 1.000 0.308 1.000 Y NA
 5521408 5521409 BCQ_0770 BCQ_0771 qoxC qoxB TRUE 0.975 14.000 0.308 0.035 Y NA
 5521409 5521410 BCQ_0771 BCQ_0772 qoxB qoxA TRUE 0.973 34.000 0.308 0.006 Y NA
 5521410 5521411 BCQ_0772 BCQ_0773 qoxA rocE FALSE 0.280 283.000 0.000 0.061 N NA
 5521412 5521413 BCQ_0774 BCQ_0775   amaA TRUE 0.703 134.000 1.000 NA   NA
 5521413 5521414 BCQ_0775 BCQ_0776 amaA   TRUE 0.809 2.000 0.111 NA   NA
 5521414 5521415 BCQ_0776 BCQ_0777     TRUE 0.953 -3.000 0.778 NA   NA
 5521415 5521416 BCQ_0777 BCQ_0778   gerLA TRUE 0.448 145.000 0.125 1.000   NA
 5521416 5521417 BCQ_0778 BCQ_0779 gerLA gerLB TRUE 0.912 94.000 0.800 0.010   NA
 5521417 5521418 BCQ_0779 BCQ_0780 gerLB gerLC TRUE 0.949 -16.000 0.000 0.010   NA
 5521418 5521419 BCQ_0780 BCQ_0781 gerLC   FALSE 0.280 12.000 0.000 NA   NA
 5521420 5521421 BCQ_0782 BCQ_0783 feoB feoB TRUE 0.990 -22.000 0.364 0.001   NA
 5521421 5521422 BCQ_0783 BCQ_0784 feoB feoA TRUE 0.924 -3.000 0.216 1.000   NA
 5521423 5521424 BCQ_0785 BCQ_0786 pstS pstC TRUE 0.863 71.000 0.172 1.000 Y NA
 5521424 5521425 BCQ_0786 BCQ_0787 pstC pstA TRUE 0.996 3.000 0.849 0.002 Y NA
 5521427 5521428 BCQ_0789 BCQ_0790     FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5521428 5521429 BCQ_0790 BCQ_0792     FALSE 0.087 104.000 0.000 NA   NA
 5521429 5521430 BCQ_0792 BCQ_0793     FALSE 0.309 9.000 0.000 NA   NA
 5521430 5521431 BCQ_0793 BCQ_0794     FALSE 0.309 9.000 0.000 NA   NA
 5521431 5521432 BCQ_0794 BCQ_0795     FALSE 0.280 12.000 0.000 NA   NA
 5521432 5521433 BCQ_0795 BCQ_0796     FALSE 0.337 5.000 0.000 NA   NA
 5521433 5521434 BCQ_0796 BCQ_0797     FALSE 0.213 15.000 0.000 NA   NA
 5521434 5521435 BCQ_0797 BCQ_0798     FALSE 0.143 30.000 0.000 NA   NA
 5521435 5521436 BCQ_0798 BCQ_0799     FALSE 0.191 17.000 0.000 NA   NA
 5521436 5521437 BCQ_0799 BCQ_0800     FALSE 0.350 4.000 0.000 NA   NA
 5521437 5521438 BCQ_0800 BCQ_0801     FALSE 0.295 11.000 0.000 NA   NA
 5521438 5521439 BCQ_0801 BCQ_0802     FALSE 0.200 16.000 0.000 NA   NA
 5521439 5521440 BCQ_0802 BCQ_0803     FALSE 0.165 21.000 0.000 NA   NA
 5521440 5521441 BCQ_0803 BCQ_0804     FALSE 0.114 52.000 0.000 NA   NA
 5521441 5521442 BCQ_0804 BCQ_0805     FALSE 0.146 28.000 0.000 NA   NA
 5521442 5521443 BCQ_0805 BCQ_0806     FALSE 0.350 4.000 0.000 NA   NA
 5521443 5521444 BCQ_0806 BCQ_0807     FALSE 0.304 10.000 0.000 NA   NA
 5521444 5521445 BCQ_0807 BCQ_0808     FALSE 0.304 10.000 0.000 NA   NA
 5521445 5521446 BCQ_0808 BCQ_0809     FALSE 0.319 7.000 0.000 NA   NA
 5521446 5521447 BCQ_0809 BCQ_0810     FALSE 0.295 11.000 0.000 NA   NA
 5521447 5521448 BCQ_0810 BCQ_0811     FALSE 0.309 9.000 0.000 NA   NA
 5521448 5521449 BCQ_0811 BCQ_0812     FALSE 0.374 2.000 0.000 NA   NA
 5521449 5521450 BCQ_0812 BCQ_0813     FALSE 0.070 131.000 0.000 NA   NA
 5521450 5521451 BCQ_0813 BCQ_0814     FALSE 0.026 295.000 0.000 NA   NA
 5521453 5521454 BCQ_0816 BCQ_0817 tenA   TRUE 0.924 -31.000 0.054 1.000 N NA
 5521454 5521455 BCQ_0817 BCQ_0818     TRUE 0.983 0.000 0.412 1.000 Y NA
 5521455 5521456 BCQ_0818 BCQ_0819     TRUE 0.965 -3.000 0.116 NA Y NA
 5521456 5521457 BCQ_0819 BCQ_0820   tenI TRUE 0.769 11.000 0.029 NA N NA
 5521457 5521458 BCQ_0820 BCQ_0821 tenI goxB TRUE 0.921 -7.000 0.053 1.000 N NA
 5521458 5521459 BCQ_0821 BCQ_0822 goxB thiS TRUE 0.790 16.000 0.061 1.000 N NA
 5521459 5521460 BCQ_0822 BCQ_0823 thiS thiG TRUE 0.960 3.000 0.065 1.000 Y NA
 5521460 5521461 BCQ_0823 BCQ_0824 thiG thiF TRUE 0.881 71.000 0.004 0.028 Y NA
 5521461 5521462 BCQ_0824 BCQ_0825 thiF thiD TRUE 0.947 16.000 0.286 1.000 Y NA
 5521462 5521463 BCQ_0825 BCQ_0826 thiD   FALSE 0.020 327.000 0.000 NA   NA
 5521463 5521464 BCQ_0826 BCQ_0827     FALSE 0.029 277.000 0.000 NA   NA
 5521464 5521465 BCQ_0827 BCQ_0828     FALSE 0.018 345.000 0.000 NA   NA
 5521465 5521466 BCQ_0828 BCQ_0829   kdpA FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 5521466 5521467 BCQ_0829 BCQ_0830 kdpA kdpB TRUE 0.993 14.000 0.531 0.001 Y NA
 5521467 5521468 BCQ_0830 BCQ_0831 kdpB kdpC TRUE 0.978 17.000 0.044 0.001 Y NA
 5521468 5521469 BCQ_0831 BCQ_0832 kdpC kdpD TRUE 0.602 201.000 0.571 1.000   NA
 5521471 5521472 BCQ_0834 BCQ_0835     TRUE 0.493 129.000 0.133 1.000   NA
 5521472 5521473 BCQ_0835 BCQ_0836     FALSE 0.048 199.000 0.000 NA   NA
 5521473 5521474 BCQ_0836 BCQ_0837     FALSE 0.090 88.000 0.000 NA   NA
 5521474 5521475 BCQ_0837 BCQ_0838     FALSE 0.304 10.000 0.000 NA   NA
 5521475 5521476 BCQ_0838 BCQ_0839     FALSE 0.384 1.000 0.000 NA   NA
 5521476 5521477 BCQ_0839 BCQ_0840     FALSE 0.120 48.000 0.000 NA   NA
 5521478 5521479 BCQ_0841 BCQ_0842 rbsC rbsA TRUE 0.991 -82.000 0.957 1.000 Y NA
 5521479 5521480 BCQ_0842 BCQ_0843 rbsA rbsB TRUE 0.977 0.000 0.383 NA Y NA
 5521480 5521481 BCQ_0843 BCQ_0844 rbsB   FALSE 0.027 287.000 0.000 NA   NA
 5521482 5521483 BCQ_0845 BCQ_0846     TRUE 0.542 66.000 0.200 NA   NA
 5521483 5521484 BCQ_0846 BCQ_0847     TRUE 0.798 57.000 1.000 NA   NA
 5521485 5521486 BCQ_0848 BCQ_0849   trxA TRUE 0.616 73.000 0.333 NA   NA
 5521486 5521487 BCQ_0849 BCQ_0850 trxA dsbB TRUE 0.868 13.000 0.286 1.000   NA
 5521487 5521488 BCQ_0850 BCQ_0851 dsbB   FALSE 0.055 166.000 0.000 NA   NA
 5521488 5521489 BCQ_0851 BCQ_0852     FALSE 0.416 118.000 0.143 NA   NA
 5521489 5521490 BCQ_0852 BCQ_0853   gerB TRUE 0.580 46.000 0.182 NA   NA
 5521490 5521491 BCQ_0853 BCQ_0854 gerB gerAC TRUE 0.940 17.000 0.333 0.010   NA
 5521491 5521492 BCQ_0854 BCQ_0855 gerAC gerYA TRUE 0.989 -3.000 1.000 0.010   NA
 5521492 5521493 BCQ_0855 BCQ_0856 gerYA   FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 5521494 5521495 BCQ_0857 BCQ_0858   spoVR FALSE 0.080 115.000 0.000 NA   NA
 5521495 5521496 BCQ_0858 BCQ_0859 spoVR   FALSE 0.083 110.000 0.000 NA   NA
 5521496 5521497 BCQ_0859 BCQ_0860     FALSE 0.004 899.000 0.000 NA   NA
 5521497 5521498 BCQ_0860 BCQ_0861   ndh FALSE 0.022 312.000 0.000 NA   NA
 5521498 5521499 BCQ_0861 BCQ_0862 ndh   FALSE 0.050 186.000 0.000 NA   NA
 5521499 5521500 BCQ_0862 BCQ_0863     FALSE 0.090 89.000 0.000 NA   NA
 5521500 5521501 BCQ_0863 BCQ_0864     TRUE 0.710 39.000 0.207 1.000   NA
 5521501 5521502 BCQ_0864 BCQ_0865     FALSE 0.360 39.000 0.000 1.000   NA
 5521502 5521503 BCQ_0865 BCQ_0866     TRUE 0.961 25.000 0.000 0.001 Y NA
 5521503 5521504 BCQ_0866 BCQ_0867     FALSE 0.049 431.000 0.000 NA N NA
 5521504 5521505 BCQ_0867 BCQ_0868     TRUE 0.937 15.000 0.292 NA Y NA
 5521505 5521506 BCQ_0868 BCQ_0869     TRUE 0.639 61.000 0.333 NA   NA
 5521506 5521507 BCQ_0869 BCQ_0870     FALSE 0.138 34.000 0.000 NA   NA
 5521508 5521509 BCQ_0871 BCQ_0872     TRUE 0.566 149.000 0.500 NA   NA
 5521511 5521512 BCQ_0874 BCQ_0875   norA FALSE 0.126 353.000 0.000 1.000 N NA
 5521513 5521514 BCQ_0876 BCQ_0877   licT FALSE 0.067 135.000 0.000 NA   NA
 5521514 5521515 BCQ_0877 BCQ_0878 licT celC TRUE 0.762 112.000 0.000 0.008 N NA
 5521515 5521516 BCQ_0878 BCQ_0879 celC celA TRUE 0.982 2.000 0.000 0.006 Y NA
 5521516 5521517 BCQ_0879 BCQ_0880 celA celB TRUE 0.900 83.000 0.000 0.006 Y NA
 5521517 5521518 BCQ_0880 BCQ_0881 celB   TRUE 0.456 -24.000 0.000 NA   NA
 5521518 5521519 BCQ_0881 BCQ_0882     TRUE 0.451 -10.000 0.000 NA   NA
 5521519 5521520 BCQ_0882 BCQ_0883     FALSE 0.048 194.000 0.000 NA   NA
 5521521 5521522 BCQ_0884 BCQ_0885     FALSE 0.010 448.000 0.000 NA   NA
 5521522 5521523 BCQ_0885 BCQ_0886     TRUE 0.950 27.000 1.000 NA Y NA
 5521523 5521524 BCQ_0886 BCQ_0887     FALSE 0.445 105.000 0.000 1.000 N NA
 5521525 5521526 BCQ_0888 BCQ_0889   oppC FALSE 0.090 89.000 0.000 NA   NA
 5521526 5521527 BCQ_0889 BCQ_0890 oppC oppC TRUE 0.966 2.000 0.000 0.038 Y NA
 5521528 5521529 BCQ_0891 BCQ_0892 brnQ-2 cotJC FALSE 0.285 218.000 0.000 1.000 N NA
 5521529 5521530 BCQ_0892 BCQ_0893 cotJC cotJB TRUE 0.889 13.000 0.375 1.000   NA
 5521530 5521531 BCQ_0893 BCQ_0894 cotJB cotJA TRUE 0.953 -3.000 0.778 NA   NA
 5521532 5521533 BCQ_0895 BCQ_0896     TRUE 0.846 15.000 0.500 NA   NA
 5521535 5521536 BCQ_0898 BCQ_0899   dedA FALSE 0.295 11.000 0.000 NA   NA
 5521536 5521537 BCQ_0899 BCQ_0900 dedA   FALSE 0.089 98.000 0.000 NA   NA
 5521537 5521538 BCQ_0900 BCQ_0901     FALSE 0.213 15.000 0.000 NA   NA
 5521538 5521539 BCQ_0901 BCQ_0902     FALSE 0.005 877.000 0.000 NA   NA
 5521539 5521540 BCQ_0902 BCQ_0903     TRUE 0.501 80.000 0.182 NA   NA
 5521540 5521541 BCQ_0903 BCQ_0904     FALSE 0.254 13.000 0.000 NA   NA
 5521543 5521544 BCQ_0906 BCQ_0907 napA   FALSE 0.076 120.000 0.000 NA   NA
 5521544 5521545 BCQ_0907 BCQ_0908     FALSE 0.086 105.000 0.000 NA   NA
 5521545 5521546 BCQ_0908 BCQ_0909     TRUE 0.814 154.000 0.089 0.001   NA
 5521546 5521547 BCQ_0909 BCQ_0910   scrA TRUE 0.777 25.000 0.289 1.000   NA
 5521547 5521548 BCQ_0910 BCQ_0911 scrA   TRUE 0.630 49.000 0.269 NA   NA
 5521548 5521549 BCQ_0911 BCQ_0912     FALSE 0.057 162.000 0.000 NA   NA
 5521549 5521550 BCQ_0912 BCQ_0913     FALSE 0.059 155.000 0.000 NA   NA
 5521550 5521551 BCQ_0913 BCQ_0914     FALSE 0.396 0.000 0.000 NA   NA
 5521553 5521554 BCQ_0916 BCQ_0917     FALSE 0.395 129.000 0.000 1.000 N NA
 5521554 5521555 BCQ_0917 BCQ_0918     FALSE 0.124 354.000 0.000 1.000 N NA
 5521555 5521556 BCQ_0918 BCQ_0919     TRUE 0.987 3.000 0.556 0.060 Y NA
 5521556 5521557 BCQ_0919 BCQ_0920     FALSE 0.346 156.000 0.000 1.000 N NA
 5521557 5521558 BCQ_0920 BCQ_0921   blT FALSE 0.254 240.000 0.000 1.000 N NA
 5521560 5521561 BCQ_0923 BCQ_0924     FALSE 0.170 20.000 0.000 NA   NA
 5521564 5521565 BCQ_0927 BCQ_0928     FALSE 0.038 241.000 0.000 NA   NA
 5521565 5521566 BCQ_0928 BCQ_0929   katB FALSE 0.386 29.000 0.000 1.000   NA
 5521566 5521567 BCQ_0929 BCQ_0930 katB   FALSE 0.109 300.000 0.000 NA N NA
 5521567 5521568 BCQ_0930 BCQ_0931   arcD TRUE 0.850 61.000 1.000 NA N NA
 5521569 5521570 BCQ_0932 BCQ_0933 racE   FALSE 0.081 113.000 0.000 NA   NA
 5521572 5521573 BCQ_0935 BCQ_0936   yheH TRUE 0.996 -3.000 0.679 0.004 Y NA
 5521573 5521574 BCQ_0936 BCQ_0937 yheH   FALSE 0.333 272.000 0.000 0.048 N NA
 5521574 5521575 BCQ_0937 BCQ_0938     TRUE 0.993 -22.000 0.680 0.048 Y NA
 5521575 5521576 BCQ_0938 BCQ_0939     TRUE 0.915 29.000 0.210 1.000 Y NA
 5521579 5521580 BCQ_0942 BCQ_0943 yheD yheC TRUE 0.850 21.000 0.867 NA   NA
 5521581 5521582 BCQ_0944 BCQ_0945 yheB yheA FALSE 0.173 143.000 0.026 NA   NA
 5521582 5521583 BCQ_0945 BCQ_0946 yheA   FALSE 0.027 289.000 0.000 NA   NA
 5521583 5521584 BCQ_0946 BCQ_0947   comP FALSE 0.048 200.000 0.000 NA   NA
 5521584 5521585 BCQ_0947 BCQ_0948 comP comA TRUE 0.864 43.000 1.000 1.000   NA
 5521585 5521586 BCQ_0948 BCQ_0949 comA   FALSE 0.017 350.000 0.000 NA   NA
 5521586 5521587 BCQ_0949 BCQ_0950     FALSE 0.056 164.000 0.000 NA   NA
 5521587 5521588 BCQ_0950 BCQ_0951     FALSE 0.076 121.000 0.000 NA   NA
 5521588 5521589 BCQ_0951 BCQ_0952     TRUE 0.808 51.000 1.000 NA   NA
 5521589 5521590 BCQ_0952 BCQ_0953     TRUE 0.754 104.000 1.000 NA   NA
 5521591 5521592 BCQ_0954 BCQ_0955     FALSE 0.160 22.000 0.000 NA   NA
 5521593 5521594 BCQ_0956 BCQ_0957 alsS alsD TRUE 0.882 17.000 0.311 1.000 N NA
 5521594 5521595 BCQ_0957 BCQ_0958 alsD   FALSE 0.113 54.000 0.000 NA   NA
 5521599 5521600 BCQ_0962 BCQ_0963 hemN   FALSE 0.279 77.000 0.000 1.000   NA
 5521600 5521601 BCQ_0963 BCQ_0964     TRUE 0.818 81.000 0.500 0.048   NA
 5521601 5521602 BCQ_0964 BCQ_0965   fadD FALSE 0.239 250.000 0.000 1.000 N NA
 5521604 5521605 BCQ_0967 BCQ_0968     FALSE 0.048 197.000 0.000 NA   NA
 5521606 5521607 BCQ_0969 BCQ_0970   secA-1 FALSE 0.401 15.000 0.010 NA   NA
 5521608 5521609 BCQ_0971 BCQ_0972 csaA pppA FALSE 0.297 142.000 0.022 1.000   NA
 5521609 5521610 BCQ_0972 BCQ_0973 pppA sap FALSE 0.005 678.000 0.000 NA   NA
 5521610 5521611 BCQ_0973 BCQ_0974 sap eag FALSE 0.005 715.000 0.000 NA   NA
 5521612 5521613 BCQ_0975 BCQ_0976   algI TRUE 0.801 25.000 0.600 NA   NA
 5521614 5521615 BCQ_0977 BCQ_0978     TRUE 0.775 10.000 0.130 NA   NA
 5521617 5521618 BCQ_0980 BCQ_0981   crt FALSE 0.125 44.000 0.000 NA   NA
 5521619 5521620 BCQ_0982 BCQ_0983     FALSE 0.063 143.000 0.000 NA   NA
 5521621 5521622 BCQ_0984 BCQ_0985     FALSE 0.159 241.000 0.000 NA N NA
 5521622 5521623 BCQ_0985 BCQ_0986     FALSE 0.170 232.000 0.000 NA N NA
 5521625 5521626 BCQ_0988 BCQ_0989 prdF arcB TRUE 0.883 20.000 0.037 1.000 Y NA
 5521626 5521627 BCQ_0989 BCQ_0990 arcB   FALSE 0.425 -3.000 0.000 NA   NA
 5521627 5521628 BCQ_0990 BCQ_0991     FALSE 0.138 34.000 0.000 NA   NA
 5521630 5521631 BCQ_0993 BCQ_0994 oppA   TRUE 0.852 60.000 0.000 0.037 Y NA
 5521631 5521632 BCQ_0994 BCQ_0995   oppC TRUE 0.978 7.000 0.154 0.037 Y NA
 5521632 5521633 BCQ_0995 BCQ_0996 oppC oppD TRUE 0.603 177.000 0.000 1.000 Y NA
 5521633 5521634 BCQ_0996 BCQ_0997 oppD oppF TRUE 0.990 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 5521636 5521637 BCQ_0999 BCQ_1000   citT TRUE 0.960 24.000 0.727 0.083 Y NA
 5521637 5521638 BCQ_1000 BCQ_1001 citT   TRUE 0.945 -3.000 0.364 1.000   NA
 5521638 5521639 BCQ_1001 BCQ_1002     FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 5521639 5521640 BCQ_1002 BCQ_1003     FALSE 0.132 38.000 0.000 NA   NA
 5521640 5521641 BCQ_1003 BCQ_1004   pcrA FALSE 0.261 246.000 0.000 0.048   NA
 5521641 5521642 BCQ_1004 BCQ_1005 pcrA   FALSE 0.274 80.000 0.000 1.000   NA
 5521642 5521643 BCQ_1005 BCQ_1006     TRUE 0.453 99.000 0.000 1.000 N NA
 5521643 5521644 BCQ_1006 BCQ_1007     TRUE 0.456 -28.000 0.000 NA   NA
 5521644 5521645 BCQ_1007 BCQ_1008     FALSE 0.025 301.000 0.000 NA   NA
 5521645 5521646 BCQ_1008 BCQ_1009     TRUE 0.506 15.000 0.040 NA   NA
 5521646 5521647 BCQ_1009 BCQ_1010     TRUE 0.944 0.000 0.714 NA   NA
 5521649 5521650 BCQ_1012 BCQ_1013     FALSE 0.350 4.000 0.000 NA   NA
 5521650 5521651 BCQ_1013 BCQ_1014     FALSE 0.309 9.000 0.000 NA   NA
 5521651 5521652 BCQ_1014 BCQ_1015   smc FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 5521652 5521653 BCQ_1015 BCQ_1016 smc   TRUE 0.926 10.000 0.875 NA   NA
 5521653 5521654 BCQ_1016 BCQ_1017   sbcC TRUE 0.960 -43.000 0.857 NA   NA
 5521654 5521655 BCQ_1017 BCQ_1018 sbcC   TRUE 0.989 -40.000 0.560 0.004   NA
 5521655 5521656 BCQ_1018 BCQ_1019     FALSE 0.012 415.000 0.000 NA   NA
 5521656 5521657 BCQ_1019 BCQ_1020     FALSE 0.021 324.000 0.000 NA   NA
 5521657 5521658 BCQ_1020 BCQ_1021   dnaB FALSE 0.044 219.000 0.000 NA   NA
 5521660 5521661 BCQ_1023 BCQ_1024   dnaB FALSE 0.447 -7.000 0.000 NA   NA
 5521664 5521665 BCQ_1027 BCQ_1028     TRUE 0.933 -3.000 0.438 NA   NA
 5521665 5521666 BCQ_1028 BCQ_1029     TRUE 0.906 -7.000 0.250 NA   NA
 5521666 5521667 BCQ_1029 BCQ_1030     FALSE 0.044 221.000 0.000 NA   NA
 5521669 5521670 BCQ_1032 BCQ_1033     FALSE 0.051 181.000 0.000 NA   NA
 5521671 5521672 BCQ_1034 BCQ_1035     FALSE 0.078 118.000 0.000 NA   NA
 5521674 5521675 BCQ_1037 BCQ_1038     FALSE 0.032 263.000 0.000 NA   NA
 5521675 5521676 BCQ_1038 BCQ_1039   pssA TRUE 0.551 44.000 0.000 1.000 N NA
 5521676 5521677 BCQ_1039