MicrobesOnline Operon Predictions for Lysinibacillus sphaericus C3-41

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5627993 5627994 Bsph_0001 Bsph_0002 dnaA dnaA FALSE 0.558 35.000 0.005 NA   NA
 5627994 5627995 Bsph_0002 Bsph_0003 dnaA dnaA FALSE 0.369 72.000 0.005 NA   NA
 5627995 5627996 Bsph_0003 Bsph_0004 dnaA dnaA TRUE 0.984 -16.000 0.005 0.001   NA
 5627996 5627997 Bsph_0004 Bsph_0005 dnaA dnaN FALSE 0.525 171.000 0.328 1.000   NA
 5627997 5627998 Bsph_0005 Bsph_0006 dnaN   TRUE 0.628 112.000 0.103 1.000   NA
 5627998 5627999 Bsph_0006 Bsph_0007   recF TRUE 0.974 4.000 0.209 1.000   NA
 5627999 5628000 Bsph_0007 Bsph_0008 recF   TRUE 0.956 93.000 0.249 0.004 Y NA
 5628000 5628001 Bsph_0008 Bsph_0009     TRUE 0.989 26.000 0.306 0.001 Y NA
 5628001 5628002 Bsph_0009 Bsph_0010     FALSE 0.434 142.000 0.019 1.000 N NA
 5628002 5628003 Bsph_0010 Bsph_rRNA0116S     FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 5628003 5628004 Bsph_rRNA0116S Bsph_tRNA1     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628004 5628005 Bsph_tRNA1 Bsph_tRNA2     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628007 5628008 Bsph_rRNA0123S Bsph_rRNA015S     FALSE 0.076 189.000 0.000 NA   NA
 5628008 5628009 Bsph_rRNA015S Bsph_0014     FALSE 0.013 277.000 0.000 NA   NA
 5628009 5628010 Bsph_0014 Bsph_rRNA0216S     FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 5628010 5628011 Bsph_rRNA0216S Bsph_tRNA3     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628011 5628012 Bsph_tRNA3 Bsph_tRNA4     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628012 5628013 Bsph_tRNA4 Bsph_rRNA0223S     FALSE 0.027 229.000 0.000 NA   NA
 5628013 5628014 Bsph_rRNA0223S Bsph_rRNA025S     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5628014 5628015 Bsph_rRNA025S Bsph_0017     FALSE 0.010 298.000 0.000 NA   NA
 5628015 5628016 Bsph_0017 Bsph_0018     FALSE 0.521 142.000 0.067 1.000 N NA
 5628016 5628017 Bsph_0018 Bsph_0019     FALSE 0.533 101.000 0.030 1.000 N NA
 5628019 5628020 Bsph_0021 Bsph_0022   pdxT TRUE 0.994 2.000 0.488 NA Y NA
 5628020 5628021 Bsph_0022 Bsph_0023 pdxT   FALSE 0.006 410.000 0.010 NA N NA
 5628023 5628024 Bsph_0025 Bsph_0026 yozA czcD TRUE 0.899 19.000 0.139 1.000 N NA
 5628024 5628025 Bsph_0026 Bsph_0027 czcD   FALSE 0.401 70.000 0.012 NA   NA
 5628025 5628026 Bsph_0027 Bsph_0028   copZ TRUE 0.676 35.000 0.048 NA   NA
 5628026 5628027 Bsph_0028 Bsph_0029 copZ   TRUE 0.954 82.000 0.115 0.001 Y NA
 5628027 5628028 Bsph_0029 Bsph_0030     FALSE 0.376 151.000 0.015 1.000 N NA
 5628028 5628029 Bsph_0030 Bsph_0031     TRUE 0.998 0.000 0.255 0.001 Y NA
 5628029 5628030 Bsph_0031 Bsph_0032     FALSE 0.344 90.000 0.010 NA   NA
 5628030 5628031 Bsph_0032 Bsph_0033   bdlA FALSE 0.423 65.000 0.010 NA   NA
 5628031 5628032 Bsph_0033 Bsph_0034 bdlA   FALSE 0.455 86.000 0.049 NA   NA
 5628033 5628034 Bsph_0035 Bsph_0036 gltT glnL TRUE 0.868 91.000 1.000 1.000 N NA
 5628034 5628035 Bsph_0036 Bsph_tRNA85 glnL   FALSE 0.003 1388.000 0.000 NA   NA
 5628036 5628037 Bsph_0038 Bsph_0039     TRUE 0.776 22.000 0.071 NA   NA
 5628037 5628038 Bsph_0039 Bsph_0040   recR TRUE 0.861 54.000 0.604 NA   NA
 5628038 5628039 Bsph_0040 Bsph_0041 recR   TRUE 0.837 14.000 0.071 NA   NA
 5628039 5628040 Bsph_0041 Bsph_0042     TRUE 0.771 74.000 0.417 NA   NA
 5628040 5628041 Bsph_0042 Bsph_rRNA0316S     FALSE 0.011 291.000 0.000 NA   NA
 5628041 5628042 Bsph_rRNA0316S Bsph_tRNA5     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628042 5628043 Bsph_tRNA5 Bsph_tRNA6     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628043 5628044 Bsph_tRNA6 Bsph_rRNA0323S     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5628044 5628045 Bsph_rRNA0323S Bsph_rRNA035S     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5628045 5628046 Bsph_rRNA035S Bsph_0046     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 5628046 5628047 Bsph_0046 Bsph_0047     FALSE 0.130 186.000 0.040 NA   NA
 5628047 5628048 Bsph_0047 Bsph_0048     TRUE 0.960 1.000 0.045 1.000 N NA
 5628048 5628049 Bsph_0048 Bsph_0049     FALSE 0.009 370.000 0.038 NA   NA
 5628049 5628050 Bsph_0049 Bsph_0050   yaaR FALSE 0.017 345.000 0.104 NA   NA
 5628050 5628051 Bsph_0050 Bsph_0051 yaaR   FALSE 0.019 297.000 0.059 NA   NA
 5628051 5628052 Bsph_0051 Bsph_0052   yaaT TRUE 0.981 -7.000 0.372 NA   NA
 5628052 5628053 Bsph_0052 Bsph_0053 yaaT yabA TRUE 0.871 19.000 0.183 NA   NA
 5628053 5628054 Bsph_0053 Bsph_0054 yabA   TRUE 0.722 64.000 0.193 NA   NA
 5628054 5628055 Bsph_0054 Bsph_0055     TRUE 0.868 38.000 0.209 1.000   NA
 5628055 5628056 Bsph_0055 Bsph_0056   yabC TRUE 0.962 -3.000 0.041 1.000   NA
 5628058 5628059 Bsph_0058 Bsph_0059     FALSE 0.073 254.000 0.221 NA N NA
 5628059 5628060 Bsph_0059 Bsph_0060     FALSE 0.022 241.000 0.007 NA   NA
 5628060 5628061 Bsph_0060 Bsph_0061     FALSE 0.223 195.000 0.121 1.000   NA
 5628061 5628062 Bsph_0061 Bsph_0062   ksgA TRUE 0.974 -7.000 0.093 1.000 N NA
 5628062 5628063 Bsph_0062 Bsph_0063 ksgA   FALSE 0.253 157.000 0.035 NA   NA
 5628063 5628064 Bsph_0063 Bsph_0064   sspF FALSE 0.552 134.000 0.163 NA   NA
 5628064 5628065 Bsph_0064 Bsph_0065 sspF   FALSE 0.325 160.000 0.024 1.000   NA
 5628065 5628066 Bsph_0065 Bsph_0066     TRUE 0.720 57.000 0.062 1.000 N NA
 5628066 5628067 Bsph_0066 Bsph_0067   yabJ TRUE 0.978 -3.000 0.227 NA N NA
 5628067 5628068 Bsph_0067 Bsph_0068 yabJ spoVG FALSE 0.079 273.000 0.377 NA N NA
 5628068 5628069 Bsph_0068 Bsph_0069 spoVG   FALSE 0.294 104.000 0.000 NA   NA
 5628069 5628070 Bsph_0069 Bsph_0070   glmU TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5628070 5628071 Bsph_0070 Bsph_0071 glmU   TRUE 0.847 25.000 0.069 1.000 N NA
 5628071 5628072 Bsph_0071 Bsph_0072     FALSE 0.039 264.000 0.027 1.000 N NA
 5628072 5628073 Bsph_0072 Bsph_0073     TRUE 0.958 102.000 0.496 0.025 Y NA
 5628073 5628074 Bsph_0073 Bsph_0074     FALSE 0.073 204.000 0.033 NA   NA
 5628074 5628075 Bsph_0074 Bsph_0075     FALSE 0.314 143.000 0.035 NA   NA
 5628075 5628076 Bsph_0075 Bsph_0076     FALSE 0.139 248.000 0.026 NA Y NA
 5628076 5628077 Bsph_0076 Bsph_0077     FALSE 0.408 160.000 0.147 NA   NA
 5628077 5628078 Bsph_0077 Bsph_0078     TRUE 0.960 1.000 0.058 1.000   NA
 5628078 5628079 Bsph_0078 Bsph_0079     TRUE 0.966 -3.000 0.054 1.000   NA
 5628079 5628080 Bsph_0079 Bsph_0080     FALSE 0.470 140.000 0.108 NA   NA
 5628080 5628081 Bsph_0080 Bsph_0081     TRUE 0.988 -3.000 0.774 NA   NA
 5628081 5628082 Bsph_0081 Bsph_0082     TRUE 0.802 18.000 0.074 NA   NA
 5628082 5628083 Bsph_0082 Bsph_0083     TRUE 0.630 135.000 0.134 1.000 N NA
 5628084 5628085 Bsph_0084 Bsph_tRNA84     FALSE 0.223 145.000 0.000 NA   NA
 5628085 5628086 Bsph_tRNA84 Bsph_tRNA83     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5628086 5628087 Bsph_tRNA83 Bsph_tRNA82     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5628088 5628089 Bsph_0085 Bsph_0086     TRUE 0.770 38.000 0.041 1.000 N NA
 5628089 5628090 Bsph_0086 Bsph_0087     TRUE 0.819 68.000 0.067 0.043 N NA
 5628090 5628091 Bsph_0087 Bsph_0088     FALSE 0.043 330.000 0.192 1.000 N NA
 5628091 5628092 Bsph_0088 Bsph_0089   ytbE FALSE 0.273 163.000 0.006 1.000   NA
 5628092 5628093 Bsph_0089 Bsph_0090 ytbE   FALSE 0.261 164.000 0.003 1.000   NA
 5628093 5628094 Bsph_0090 Bsph_0091     TRUE 0.956 4.000 0.060 1.000 N NA
 5628094 5628095 Bsph_0091 Bsph_0092     TRUE 0.995 -16.000 0.019 0.006 Y NA
 5628095 5628096 Bsph_0092 Bsph_0093     FALSE 0.036 276.000 0.035 1.000 N NA
 5628096 5628097 Bsph_0093 Bsph_0094     TRUE 0.639 181.000 0.107 1.000 Y NA
 5628097 5628098 Bsph_0094 Bsph_0095     TRUE 0.998 -3.000 0.452 0.017 Y NA
 5628098 5628099 Bsph_0095 Bsph_0096     TRUE 0.979 28.000 0.532 1.000 Y NA
 5628099 5628100 Bsph_0096 Bsph_0097     TRUE 0.987 14.000 0.519 1.000 Y NA
 5628100 5628101 Bsph_0097 Bsph_0098     TRUE 0.994 0.000 0.176 1.000 Y NA
 5628101 5628102 Bsph_0098 Bsph_0099     TRUE 0.994 0.000 0.142 1.000 Y NA
 5628102 5628103 Bsph_0099 Bsph_0100     TRUE 0.605 70.000 0.025 1.000 N NA
 5628103 5628104 Bsph_0100 Bsph_0101     FALSE 0.539 179.000 0.004 1.000 Y NA
 5628104 5628105 Bsph_0101 Bsph_0102     FALSE 0.342 192.000 0.500 NA   NA
 5628105 5628106 Bsph_0102 Bsph_rRNA0416S     FALSE 0.003 630.000 0.000 NA   NA
 5628106 5628107 Bsph_rRNA0416S Bsph_tRNA7     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628107 5628108 Bsph_tRNA7 Bsph_tRNA8     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628108 5628109 Bsph_tRNA8 Bsph_rRNA0423S     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5628109 5628110 Bsph_rRNA0423S Bsph_rRNA045S     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5628111 5628112 Bsph_0105 Bsph_0106     FALSE 0.030 269.000 0.000 1.000 N NA
 5628112 5628113 Bsph_0106 Bsph_0107     TRUE 0.993 -10.000 0.222 0.001   NA
 5628113 5628114 Bsph_0107 Bsph_0108     TRUE 0.988 -3.000 0.750 NA   NA
 5628114 5628115 Bsph_0108 Bsph_0109   yqiR FALSE 0.539 139.000 0.167 NA   NA
 5628116 5628117 Bsph_0110 Bsph_0111     TRUE 0.996 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 5628117 5628118 Bsph_0111 Bsph_0112     TRUE 0.988 13.000 0.750 NA Y NA
 5628118 5628119 Bsph_0112 Bsph_0113     TRUE 0.972 28.000 0.474 NA Y NA
 5628119 5628120 Bsph_0113 Bsph_0114     TRUE 0.988 0.000 0.474 1.000 N NA
 5628121 5628122 Bsph_0115 Bsph_0116     FALSE 0.188 182.000 0.005 1.000 N NA
 5628126 5628127 Bsph_0120 Bsph_0121   dppC TRUE 0.976 14.000 0.125 1.000 Y NA
 5628127 5628128 Bsph_0121 Bsph_0122 dppC   TRUE 0.997 -3.000 0.165 0.040 Y NA
 5628129 5628130 Bsph_tRNA9 Bsph_0123     FALSE 0.004 472.000 0.000 NA   NA
 5628130 5628131 Bsph_0123 Bsph_0124   ydiB FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 5628131 5628132 Bsph_0124 Bsph_0125 ydiB ydiC TRUE 0.947 -3.000 0.002 1.000   NA
 5628132 5628133 Bsph_0125 Bsph_0126 ydiC   TRUE 0.883 20.000 0.127 1.000   NA
 5628133 5628134 Bsph_0126 Bsph_0127     TRUE 0.970 0.000 0.090 1.000   NA
 5628136 5628137 Bsph_0129 Bsph_0130     FALSE 0.534 157.000 0.167 1.000   NA
 5628137 5628138 Bsph_0130 Bsph_0131     TRUE 0.974 18.000 0.357 NA Y NA
 5628140 5628141 Bsph_0133 Bsph_0134   fecD FALSE 0.014 345.000 0.000 1.000 N NA
 5628141 5628142 Bsph_0134 Bsph_0135 fecD fecE TRUE 0.995 5.000 0.750 1.000 Y NA
 5628142 5628143 Bsph_0135 Bsph_0136 fecE   TRUE 0.987 14.000 0.500 1.000 Y NA
 5628144 5628145 Bsph_0137 Bsph_0138     TRUE 0.963 -3.000 0.045 1.000   NA
 5628145 5628146 Bsph_0138 Bsph_0139   tlpC TRUE 0.687 132.000 0.200 1.000 N NA
 5628146 5628147 Bsph_0139 Bsph_0140 tlpC   FALSE 0.003 557.000 0.000 NA   NA
 5628148 5628149 Bsph_0141 Bsph_0142     TRUE 0.969 -7.000 0.154 NA   NA
 5628150 5628151 Bsph_0143 Bsph_0144     TRUE 0.882 14.000 0.130 NA   NA
 5628151 5628152 Bsph_0144 Bsph_0145     FALSE 0.140 169.000 0.000 NA   NA
 5628153 5628154 Bsph_0146 Bsph_0147     FALSE 0.443 106.000 0.059 NA   NA
 5628154 5628155 Bsph_0147 Bsph_0148     FALSE 0.551 108.000 0.118 NA   NA
 5628157 5628158 Bsph_0150 Bsph_0151     TRUE 0.773 50.000 0.158 NA N NA
 5628158 5628159 Bsph_0151 Bsph_0152     FALSE 0.582 69.000 0.069 NA N NA
 5628159 5628160 Bsph_0152 Bsph_0153     TRUE 0.716 35.000 0.069 NA   NA
 5628160 5628161 Bsph_0153 Bsph_0154     FALSE 0.270 130.000 0.000 NA   NA
 5628161 5628162 Bsph_0154 Bsph_0155   srrA TRUE 0.989 8.000 0.231 1.000 Y NA
 5628163 5628164 Bsph_0156 Bsph_0157     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 5628165 5628166 Bsph_0159 Bsph_0160   fecE TRUE 0.995 6.000 0.857 1.000 Y NA
 5628167 5628168 Bsph_0161 Bsph_0162     TRUE 0.998 0.000 0.846 0.069 Y NA
 5628168 5628169 Bsph_0162 Bsph_0163     TRUE 0.816 72.000 0.333 1.000 N NA
 5628170 5628171 Bsph_0164 Bsph_0165     FALSE 0.432 70.000 0.022 NA   NA
 5628171 5628172 Bsph_0165 Bsph_0166     FALSE 0.352 104.000 0.022 NA   NA
 5628172 5628173 Bsph_0166 Bsph_0167     FALSE 0.003 623.000 0.000 NA   NA
 5628174 5628175 Bsph_0168 Bsph_0169     TRUE 0.959 -12.000 0.111 NA   NA
 5628176 5628177 Bsph_0170 Bsph_0171     TRUE 0.755 54.000 0.182 NA   NA
 5628177 5628178 Bsph_0171 Bsph_0172     FALSE 0.006 630.000 0.000 1.000   NA
 5628178 5628179 Bsph_0172 Bsph_0173     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5628179 5628180 Bsph_0173 Bsph_0174     TRUE 0.877 -27.000 0.000 NA   NA
 5628180 5628181 Bsph_0174 Bsph_0175     FALSE 0.120 196.000 0.000 1.000 N NA
 5628181 5628182 Bsph_0175 Bsph_0176     TRUE 0.997 -7.000 0.045 0.001 Y NA
 5628182 5628183 Bsph_0176 Bsph_0177     FALSE 0.478 113.000 0.000 1.000 N NA
 5628183 5628184 Bsph_0177 Bsph_0178     FALSE 0.500 99.000 0.014 1.000 N NA
 5628184 5628185 Bsph_0178 Bsph_0179   desK FALSE 0.036 323.000 0.118 1.000 N NA
 5628185 5628186 Bsph_0179 Bsph_0180 desK   TRUE 0.991 29.000 1.000 0.028 Y NA
 5628187 5628188 Bsph_0181 Bsph_0182   ybbM FALSE 0.364 74.000 0.006 NA   NA
 5628188 5628189 Bsph_0182 Bsph_0183 ybbM pstB TRUE 0.942 -3.000 0.047 NA   NA
 5628191 5628192 Bsph_0185 Bsph_0186     TRUE 0.921 14.000 0.127 1.000 N NA
 5628193 5628194 Bsph_0187 Bsph_0188     TRUE 0.987 19.000 0.194 0.003 Y NA
 5628194 5628195 Bsph_0188 Bsph_0189     FALSE 0.187 158.000 0.007 NA   NA
 5628195 5628196 Bsph_0189 Bsph_0190     FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 5628196 5628197 Bsph_0190 Bsph_0191     TRUE 0.795 36.000 0.143 NA   NA
 5628197 5628198 Bsph_0191 Bsph_0192     TRUE 0.810 39.000 0.188 NA   NA
 5628198 5628199 Bsph_0192 Bsph_0193     TRUE 0.970 0.000 0.179 NA   NA
 5628199 5628200 Bsph_0193 Bsph_0194   srtF TRUE 0.971 -3.000 0.154 NA   NA
 5628200 5628201 Bsph_0194 Bsph_0195 srtF   FALSE 0.303 193.000 0.036 0.033   NA
 5628201 5628202 Bsph_0195 Bsph_0196     TRUE 0.988 -3.000 0.714 NA   NA
 5628202 5628203 Bsph_0196 Bsph_0197     TRUE 0.987 -3.000 0.642 NA   NA
 5628203 5628204 Bsph_0197 Bsph_0198     FALSE 0.019 250.000 0.007 NA   NA
 5628204 5628205 Bsph_0198 Bsph_0199     FALSE 0.418 129.000 0.000 1.000   NA
 5628205 5628206 Bsph_0199 Bsph_0200     FALSE 0.007 476.000 0.000 1.000   NA
 5628206 5628207 Bsph_0200 Bsph_0201     TRUE 0.845 49.000 0.042 0.040   NA
 5628207 5628208 Bsph_0201 Bsph_rRNA0516S     FALSE 0.004 485.000 0.000 NA   NA
 5628208 5628209 Bsph_rRNA0516S Bsph_rRNA0523S     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 5628209 5628210 Bsph_rRNA0523S Bsph_rRNA055S     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5628210 5628211 Bsph_rRNA055S Bsph_0205     FALSE 0.009 316.000 0.000 NA   NA
 5628211 5628212 Bsph_0205 Bsph_0206     FALSE 0.206 150.000 0.000 NA   NA
 5628214 5628215 Bsph_0208 Bsph_0209     TRUE 0.997 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 5628215 5628216 Bsph_0209 Bsph_0210     TRUE 0.966 14.000 0.033 1.000 Y NA
 5628216 5628217 Bsph_0210 Bsph_0211     TRUE 0.841 130.000 0.072 1.000 Y NA
 5628217 5628218 Bsph_0211 Bsph_0212   yexA TRUE 0.995 3.000 0.460 1.000 Y NA
 5628218 5628219 Bsph_0212 Bsph_0213 yexA   TRUE 0.998 3.000 0.656 0.001 Y NA
 5628219 5628220 Bsph_0213 Bsph_0214     TRUE 0.998 -13.000 0.346 0.001 Y NA
 5628220 5628221 Bsph_0214 Bsph_0215     TRUE 0.994 -24.000 0.223 1.000 Y NA
 5628221 5628222 Bsph_0215 Bsph_0216     TRUE 0.909 94.000 0.248 1.000 Y NA
 5628222 5628223 Bsph_0216 Bsph_0217     TRUE 0.998 0.000 0.238 0.002 Y NA
 5628223 5628224 Bsph_0217 Bsph_0218   purH TRUE 0.901 106.000 0.225 1.000 Y NA
 5628224 5628225 Bsph_0218 Bsph_0219 purH   TRUE 0.923 74.000 0.238 1.000 Y NA
 5628227 5628228 Bsph_0221 Bsph_0222     TRUE 0.770 53.000 0.200 NA   NA
 5628228 5628229 Bsph_0222 Bsph_0223     TRUE 0.851 16.000 0.106 NA   NA
 5628229 5628230 Bsph_0223 Bsph_0224     FALSE 0.035 233.000 0.031 NA   NA
 5628230 5628231 Bsph_0224 Bsph_0225     TRUE 0.699 33.000 0.054 NA   NA
 5628231 5628232 Bsph_0225 Bsph_0226     TRUE 0.986 15.000 0.103 0.014 Y NA
 5628232 5628233 Bsph_0226 Bsph_0227     FALSE 0.330 86.000 0.004 NA   NA
 5628233 5628234 Bsph_0227 Bsph_0228     FALSE 0.024 233.000 0.000 NA   NA
 5628234 5628235 Bsph_0228 Bsph_0229     TRUE 0.992 25.000 0.643 0.001 Y NA
 5628235 5628236 Bsph_0229 Bsph_0230     TRUE 0.998 2.000 0.492 0.001 Y NA
 5628236 5628237 Bsph_0230 Bsph_0231     FALSE 0.165 161.000 0.002 NA   NA
 5628237 5628238 Bsph_0231 Bsph_0232     TRUE 0.617 34.000 0.022 NA   NA
 5628238 5628239 Bsph_0232 Bsph_0233     FALSE 0.008 317.000 0.000 NA   NA
 5628239 5628240 Bsph_0233 Bsph_0234     TRUE 0.949 12.000 0.400 NA   NA
 5628240 5628241 Bsph_0234 Bsph_0235     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.039 Y NA
 5628241 5628242 Bsph_0235 Bsph_0236     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5628242 5628243 Bsph_0236 Bsph_0237     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628243 5628244 Bsph_0237 Bsph_0238     TRUE 0.818 117.000 0.008 1.000 Y NA
 5628244 5628245 Bsph_0238 Bsph_0239     FALSE 0.132 193.000 0.000 1.000 N NA
 5628245 5628246 Bsph_0239 Bsph_0240     TRUE 0.612 72.000 0.033 1.000 N NA
 5628246 5628247 Bsph_0240 Bsph_0241     FALSE 0.310 163.000 0.013 1.000 N NA
 5628247 5628248 Bsph_0241 Bsph_0242   glpK TRUE 0.809 20.000 0.020 1.000 N NA
 5628248 5628249 Bsph_0242 Bsph_0243 glpK   FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 5628249 5628250 Bsph_0243 Bsph_0244     TRUE 0.843 44.000 0.333 NA   NA
 5628250 5628251 Bsph_0244 Bsph_0245     FALSE 0.016 314.000 0.000 1.000   NA
 5628253 5628254 Bsph_0247 Bsph_0249     FALSE 0.213 148.000 0.000 NA   NA
 5628254 5628255 Bsph_0249 Bsph_0250     FALSE 0.010 302.000 0.000 NA   NA
 5628255 5628256 Bsph_0250 Bsph_0251   tlpC TRUE 0.872 -40.000 0.000 NA   NA
 5628256 5628257 Bsph_0251 Bsph_0252 tlpC   TRUE 0.992 -10.000 1.000 1.000 N NA
 5628257 5628258 Bsph_0252 Bsph_0253     TRUE 0.932 22.000 0.375 1.000 N NA
 5628258 5628259 Bsph_0253 Bsph_0254     FALSE 0.564 146.000 0.250 NA   NA
 5628260 5628261 Bsph_0255 Bsph_0256     FALSE 0.015 265.000 0.000 NA   NA
 5628262 5628263 Bsph_0257 Bsph_0258     FALSE 0.505 177.000 0.683 NA   NA
 5628263 5628264 Bsph_0258 Bsph_0259     TRUE 0.893 46.000 0.761 NA   NA
 5628272 5628273 Bsph_0267 Bsph_0268     FALSE 0.505 43.000 0.000 NA   NA
 5628273 5628274 Bsph_0268 Bsph_0269     TRUE 0.965 13.000 1.000 NA   NA
 5628274 5628275 Bsph_0269 Bsph_0270     FALSE 0.006 361.000 0.000 NA   NA
 5628275 5628276 Bsph_0270 Bsph_0271     FALSE 0.494 45.000 0.000 NA   NA
 5628276 5628277 Bsph_0271 Bsph_0272     FALSE 0.378 68.000 0.000 NA   NA
 5628279 5628280 Bsph_0274 Bsph_0275     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 5628280 5628281 Bsph_0275 Bsph_0276     TRUE 0.857 58.000 0.667 NA   NA
 5628281 5628282 Bsph_0276 Bsph_0277     TRUE 0.955 -3.000 0.019 1.000   NA
 5628282 5628283 Bsph_0277 Bsph_0278   yfmL FALSE 0.074 219.000 0.000 1.000 N NA
 5628283 5628284 Bsph_0278 Bsph_0279 yfmL   TRUE 0.948 2.000 0.017 1.000 N NA
 5628284 5628285 Bsph_0279 Bsph_0280     TRUE 0.988 12.000 0.400 1.000 Y NA
 5628285 5628286 Bsph_0280 Bsph_0281     FALSE 0.476 110.000 0.000 1.000 N NA
 5628286 5628287 Bsph_0281 Bsph_0282     TRUE 0.996 -3.000 0.669 NA Y NA
 5628289 5628290 Bsph_0284 Bsph_0285     FALSE 0.003 504.000 0.000 NA   NA
 5628290 5628291 Bsph_0285 Bsph_0286     FALSE 0.149 172.000 0.016 NA   NA
 5628293 5628294 Bsph_0288 Bsph_0289   yjcK FALSE 0.128 176.000 0.015 NA   NA
 5628297 5628298 Bsph_0292 Bsph_0293     FALSE 0.244 139.000 0.000 NA   NA
 5628299 5628300 Bsph_0294 Bsph_0295 motA motB TRUE 0.961 41.000 0.257 1.000 Y NA
 5628302 5628303 Bsph_0297 Bsph_0298     TRUE 0.850 23.000 0.159 NA   NA
 5628304 5628305 Bsph_0299 Bsph_0300     FALSE 0.033 260.000 0.000 1.000 N NA
 5628308 5628309 Bsph_0303 Bsph_0304 yfkF   FALSE 0.022 237.000 0.000 NA   NA
 5628310 5628311 Bsph_0305 Bsph_0306     TRUE 0.788 29.000 0.025 1.000 N NA
 5628311 5628312 Bsph_0306 Bsph_0307   yfhF TRUE 0.640 57.000 0.025 1.000   NA
 5628313 5628314 Bsph_0308 Bsph_0309 recX   TRUE 0.941 -3.000 0.045 NA   NA
 5628314 5628315 Bsph_0309 Bsph_0310   yfhJ TRUE 0.958 1.000 0.116 NA   NA
 5628317 5628318 Bsph_0312 Bsph_0313     FALSE 0.468 89.000 0.002 1.000   NA
 5628318 5628319 Bsph_0313 Bsph_0314     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 5628319 5628320 Bsph_0314 Bsph_0315     FALSE 0.117 205.000 0.077 NA N NA
 5628320 5628321 Bsph_0315 Bsph_0316     FALSE 0.021 300.000 0.000 1.000 N NA
 5628321 5628322 Bsph_0316 Bsph_0317     TRUE 0.999 -16.000 1.000 0.005 Y NA
 5628322 5628323 Bsph_0317 Bsph_0318     TRUE 0.939 103.000 0.750 1.000 Y NA
 5628323 5628324 Bsph_0318 Bsph_0319     FALSE 0.486 217.000 0.067 0.039 Y NA
 5628324 5628325 Bsph_0319 Bsph_0320     TRUE 0.994 13.000 0.779 0.039 Y NA
 5628325 5628326 Bsph_0320 Bsph_0321     FALSE 0.031 265.000 0.000 1.000 N NA
 5628326 5628327 Bsph_0321 Bsph_0322     TRUE 0.986 33.000 0.364 0.004 Y NA
 5628327 5628328 Bsph_0322 Bsph_0323     TRUE 0.988 34.000 0.571 0.004 Y NA
 5628328 5628329 Bsph_0323 Bsph_0324     FALSE 0.475 110.000 0.071 NA   NA
 5628329 5628330 Bsph_0324 Bsph_0325     FALSE 0.364 123.000 0.026 NA   NA
 5628330 5628331 Bsph_0325 Bsph_0326     TRUE 0.982 -19.000 0.325 1.000   NA
 5628331 5628332 Bsph_0326 Bsph_0327     TRUE 0.982 -3.000 0.358 NA   NA
 5628332 5628333 Bsph_0327 Bsph_0328     TRUE 0.744 63.000 0.222 NA   NA
 5628333 5628334 Bsph_0328 Bsph_0329     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 5628334 5628335 Bsph_0329 Bsph_0330     TRUE 0.907 38.000 0.727 NA   NA
 5628336 5628337 Bsph_0331 Bsph_0332     FALSE 0.482 133.000 0.102 NA   NA
 5628338 5628339 Bsph_0333 Bsph_0334     TRUE 0.959 -3.000 0.017 1.000 N NA
 5628339 5628340 Bsph_0334 Bsph_0335     TRUE 0.689 113.000 0.146 1.000 N NA
 5628342 5628343 Bsph_0337 Bsph_rRNA0616S     FALSE 0.006 354.000 0.000 NA   NA
 5628343 5628344 Bsph_rRNA0616S Bsph_rRNA0623S     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 5628344 5628345 Bsph_rRNA0623S Bsph_rRNA065S     FALSE 0.299 118.000 0.000 NA   NA
 5628345 5628346 Bsph_rRNA065S Bsph_tRNA10     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5628346 5628347 Bsph_tRNA10 Bsph_tRNA11     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5628347 5628348 Bsph_tRNA11 Bsph_tRNA12     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5628348 5628349 Bsph_tRNA12 Bsph_tRNA13     TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 5628349 5628350 Bsph_tRNA13 Bsph_tRNA14     TRUE 0.603 26.000 0.000 NA   NA
 5628350 5628351 Bsph_tRNA14 Bsph_tRNA15     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5628351 5628352 Bsph_tRNA15 Bsph_tRNA16     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5628352 5628353 Bsph_tRNA16 Bsph_tRNA17     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5628353 5628354 Bsph_tRNA17 Bsph_tRNA18     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5628354 5628355 Bsph_tRNA18 Bsph_tRNA19     TRUE 0.611 24.000 0.000 NA   NA
 5628355 5628356 Bsph_tRNA19 Bsph_tRNA20     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628356 5628357 Bsph_tRNA20 Bsph_tRNA21     FALSE 0.494 45.000 0.000 NA   NA
 5628357 5628358 Bsph_tRNA21 Bsph_tRNA22     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628358 5628359 Bsph_tRNA22 Bsph_tRNA23     TRUE 0.816 7.000 0.000 NA   NA
 5628359 5628360 Bsph_tRNA23 Bsph_tRNA24     TRUE 0.797 9.000 0.000 NA   NA
 5628360 5628361 Bsph_tRNA24 Bsph_tRNA25     FALSE 0.476 48.000 0.000 NA   NA
 5628361 5628362 Bsph_tRNA25 Bsph_0340     FALSE 0.010 300.000 0.000 NA   NA
 5628364 5628365 Bsph_0342 Bsph_0343     FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 5628365 5628366 Bsph_0343 Bsph_0344     TRUE 0.986 3.000 1.000 NA   NA
 5628367 5628368 Bsph_0345 Bsph_0346     TRUE 0.925 4.000 0.000 1.000   NA
 5628368 5628369 Bsph_0346 Bsph_0347   qacR TRUE 0.985 1.000 0.400 1.000   NA
 5628370 5628371 Bsph_0348 Bsph_0349     FALSE 0.219 146.000 0.000 NA   NA
 5628373 5628374 Bsph_0351 Bsph_0352   ykfA FALSE 0.013 291.000 0.000 NA N NA
 5628374 5628375 Bsph_0352 Bsph_0353 ykfA   TRUE 0.904 11.000 0.095 NA N NA
 5628376 5628377 Bsph_0354 Bsph_0355     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 5628377 5628378 Bsph_0355 Bsph_0356     TRUE 0.735 16.000 0.024 NA   NA
 5628379 5628380 Bsph_0357 Bsph_0358     TRUE 0.698 68.000 0.077 1.000 N NA
 5628382 5628383 Bsph_0360 Bsph_0361     FALSE 0.577 85.000 0.111 NA   NA
 5628384 5628385 Bsph_0362 Bsph_0363     TRUE 0.669 55.000 0.022 1.000 N NA
 5628386 5628387 Bsph_0364 Bsph_0365 liaS yhcZ TRUE 0.994 13.000 0.536 0.027 Y NA
 5628389 5628390 Bsph_0367 Bsph_0368 yobV   TRUE 0.604 52.000 0.051 NA   NA
 5628391 5628392 Bsph_0369 Bsph_0370   yhdP FALSE 0.355 194.000 0.667 NA   NA
 5628392 5628393 Bsph_0370 Bsph_0371 yhdP   FALSE 0.298 120.000 0.000 NA   NA
 5628393 5628394 Bsph_0371 Bsph_0372     FALSE 0.023 235.000 0.000 NA   NA
 5628394 5628395 Bsph_0372 Bsph_0373     FALSE 0.485 145.000 0.143 NA   NA
 5628396 5628397 Bsph_0374 Bsph_0375   yheA TRUE 0.910 17.000 0.321 NA   NA
 5628397 5628398 Bsph_0375 Bsph_0376 yheA   FALSE 0.300 131.000 0.015 NA   NA
 5628398 5628399 Bsph_0376 Bsph_0377     FALSE 0.496 119.000 0.080 NA   NA
 5628403 5628404 Bsph_0381 Bsph_0382     TRUE 0.992 1.000 0.081 1.000 Y NA
 5628404 5628405 Bsph_0382 Bsph_0383     FALSE 0.577 73.000 0.031 1.000   NA
 5628405 5628406 Bsph_0383 Bsph_0384     TRUE 0.946 -13.000 0.074 NA   NA
 5628406 5628407 Bsph_0384 Bsph_0385     FALSE 0.135 193.000 0.074 NA   NA
 5628413 5628414 Bsph_0391 Bsph_0392     TRUE 0.978 0.000 0.330 NA   NA
 5628414 5628415 Bsph_0392 Bsph_0393     TRUE 0.980 -3.000 0.291 NA   NA
 5628415 5628416 Bsph_0393 Bsph_0394     FALSE 0.003 535.000 0.000 NA   NA
 5628417 5628418 Bsph_0395 Bsph_0396 prsA   FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 5628418 5628419 Bsph_0396 Bsph_0397     FALSE 0.520 128.000 0.111 NA   NA
 5628419 5628420 Bsph_0397 Bsph_0398     FALSE 0.194 176.000 0.060 NA   NA
 5628420 5628421 Bsph_0398 Bsph_0399     FALSE 0.176 158.000 0.000 NA   NA
 5628421 5628422 Bsph_0399 Bsph_0400     TRUE 0.870 -45.000 0.000 NA   NA
 5628422 5628423 Bsph_0400 Bsph_0401     FALSE 0.296 108.000 0.000 NA   NA
 5628423 5628424 Bsph_0401 Bsph_0402     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5628424 5628425 Bsph_0402 Bsph_0403     FALSE 0.147 173.000 0.017 NA   NA
 5628426 5628427 Bsph_0404 Bsph_0405 ecsA   TRUE 0.898 20.000 0.271 NA N NA
 5628428 5628429 Bsph_0406 Bsph_0407     FALSE 0.198 152.000 0.000 NA   NA
 5628430 5628431 Bsph_0408 Bsph_0409     TRUE 0.826 148.000 0.131 1.000 Y NA
 5628431 5628432 Bsph_0409 Bsph_0410     TRUE 0.969 15.000 0.069 1.000 Y NA
 5628436 5628437 Bsph_0414 Bsph_0415     TRUE 0.986 -3.000 0.543 NA   NA
 5628437 5628438 Bsph_0415 Bsph_0416   resE TRUE 0.997 -3.000 0.621 1.000 Y NA
 5628438 5628439 Bsph_0416 Bsph_0417 resE   TRUE 0.947 4.000 0.108 NA   NA
 5628439 5628440 Bsph_0417 Bsph_0418     FALSE 0.435 121.000 0.054 NA   NA
 5628440 5628441 Bsph_0418 Bsph_0419     FALSE 0.491 130.000 0.100 NA   NA
 5628443 5628444 Bsph_0421 Bsph_0422   yxdJ FALSE 0.566 101.000 0.049 1.000 N NA
 5628444 5628445 Bsph_0422 Bsph_0423 yxdJ   FALSE 0.187 177.000 0.000 1.000   NA
 5628445 5628446 Bsph_0423 Bsph_0424   yxdK TRUE 0.926 -49.000 0.000 1.000   NA
 5628446 5628447 Bsph_0424 Bsph_0425 yxdK   TRUE 0.969 12.000 1.000 NA   NA
 5628447 5628448 Bsph_0425 Bsph_0426   yxdL TRUE 0.950 13.000 0.500 NA   NA
 5628448 5628449 Bsph_0426 Bsph_0427 yxdL   TRUE 0.887 38.000 0.500 NA   NA
 5628449 5628450 Bsph_0427 Bsph_0428     TRUE 0.711 143.000 0.667 NA   NA
 5628450 5628451 Bsph_0428 Bsph_0429     FALSE 0.017 253.000 0.000 NA   NA
 5628451 5628452 Bsph_0429 Bsph_0430     FALSE 0.243 172.000 0.074 NA   NA
 5628454 5628455 Bsph_0432 Bsph_0433     TRUE 0.749 53.000 0.162 NA   NA
 5628455 5628456 Bsph_0433 Bsph_0434     FALSE 0.037 243.000 0.000 1.000   NA
 5628456 5628457 Bsph_0434 Bsph_0435     TRUE 0.902 46.000 0.494 1.000 N NA
 5628457 5628458 Bsph_0435 Bsph_0436     TRUE 0.927 14.000 0.169 1.000   NA
 5628458 5628459 Bsph_0436 Bsph_0437     TRUE 0.976 6.000 0.417 1.000   NA
 5628459 5628460 Bsph_0437 Bsph_0438     FALSE 0.030 266.000 0.012 1.000   NA
 5628460 5628461 Bsph_0438 Bsph_0439     TRUE 0.998 -7.000 0.239 0.004 Y NA
 5628461 5628462 Bsph_0439 Bsph_0440     TRUE 0.984 33.000 0.254 0.004 Y NA
 5628462 5628463 Bsph_0440 Bsph_0441     TRUE 0.995 5.000 0.096 0.004 Y NA
 5628463 5628464 Bsph_0441 Bsph_0442   hisH TRUE 0.997 -3.000 0.125 0.004 Y NA
 5628464 5628465 Bsph_0442 Bsph_0443 hisH hisF TRUE 0.996 -6.000 0.027 0.004 Y NA
 5628465 5628466 Bsph_0443 Bsph_0444 hisF hisIE TRUE 0.998 -3.000 0.430 0.004 Y NA
 5628466 5628467 Bsph_0444 Bsph_0445 hisIE   FALSE 0.426 130.000 0.007 1.000   NA
 5628467 5628468 Bsph_0445 Bsph_0446     FALSE 0.123 232.000 0.183 1.000   NA
 5628468 5628469 Bsph_0446 Bsph_0447     FALSE 0.016 329.000 0.000 1.000 N NA
 5628469 5628470 Bsph_0447 Bsph_0448     TRUE 0.945 10.000 0.263 NA   NA
 5628470 5628471 Bsph_0448 Bsph_0449   yvcK TRUE 0.959 5.000 0.214 NA   NA
 5628471 5628472 Bsph_0449 Bsph_0450 yvcK   TRUE 0.777 76.000 0.470 NA   NA
 5628472 5628473 Bsph_0450 Bsph_0451     FALSE 0.529 114.000 0.101 NA   NA
 5628475 5628476 Bsph_tRNA26 Bsph_0453     FALSE 0.004 499.000 0.000 NA   NA
 5628476 5628477 Bsph_0453 Bsph_0454   yckA TRUE 0.975 30.000 0.107 0.038 Y NA
 5628477 5628478 Bsph_0454 Bsph_0455 yckA glnQ TRUE 0.996 -3.000 0.392 1.000 Y NA
 5628480 5628481 Bsph_0457 Bsph_0459     FALSE 0.322 87.000 0.000 NA   NA
 5628481 5628482 Bsph_0459 Bsph_0460     FALSE 0.301 134.000 0.018 NA   NA
 5628482 5628483 Bsph_0460 Bsph_0461     FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5628483 5628484 Bsph_0461 Bsph_0462     FALSE 0.022 239.000 0.000 NA   NA
 5628484 5628485 Bsph_0462 Bsph_0463     FALSE 0.137 175.000 0.017 NA   NA
 5628485 5628486 Bsph_0463 Bsph_0464     TRUE 0.777 115.000 0.348 1.000 N NA
 5628486 5628487 Bsph_0464 Bsph_0465     FALSE 0.090 549.000 0.063 0.004 Y NA
 5628487 5628488 Bsph_0465 Bsph_0466     TRUE 0.964 27.000 0.141 1.000 Y NA
 5628488 5628489 Bsph_0466 Bsph_0467     TRUE 0.994 -7.000 0.138 1.000 Y NA
 5628489 5628490 Bsph_0467 Bsph_0468     TRUE 0.992 3.000 0.136 1.000 Y NA
 5628490 5628491 Bsph_0468 Bsph_0469     FALSE 0.003 712.000 0.000 NA   NA
 5628491 5628492 Bsph_0469 Bsph_0470     FALSE 0.299 118.000 0.000 NA   NA
 5628493 5628494 Bsph_0471 Bsph_0472     TRUE 0.961 -3.000 0.036 1.000   NA
 5628494 5628495 Bsph_0472 Bsph_0473     TRUE 0.840 49.000 0.387 NA   NA
 5628495 5628496 Bsph_0473 Bsph_0474     TRUE 0.985 -3.000 0.435 NA N NA
 5628496 5628497 Bsph_0474 Bsph_0475     FALSE 0.009 436.000 0.000 1.000 N NA
 5628497 5628498 Bsph_0475 Bsph_0476     FALSE 0.102 179.000 0.000 NA   NA
 5628498 5628499 Bsph_0476 Bsph_0477     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5628500 5628501 Bsph_0478 Bsph_0479     FALSE 0.170 189.000 0.032 1.000   NA
 5628501 5628502 Bsph_0479 Bsph_0480     TRUE 0.833 22.000 0.060 1.000   NA
 5628502 5628503 Bsph_0480 Bsph_0481     TRUE 0.864 72.000 0.143 0.020 N NA
 5628504 5628505 Bsph_0482 Bsph_0483     FALSE 0.446 109.000 0.000 1.000   NA
 5628505 5628506 Bsph_0483 Bsph_0484     TRUE 0.787 17.000 0.000 1.000   NA
 5628508 5628509 Bsph_0486 Bsph_0487     FALSE 0.006 658.000 0.000 1.000   NA
 5628510 5628511 Bsph_0488 Bsph_0489     FALSE 0.004 437.000 0.000 NA   NA
 5628511 5628512 Bsph_0489 Bsph_0490     FALSE 0.289 125.000 0.000 NA   NA
 5628513 5628514 Bsph_0491 Bsph_0492     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5628514 5628515 Bsph_0492 Bsph_0493     TRUE 0.934 17.000 0.543 NA   NA
 5628515 5628516 Bsph_0493 Bsph_0494     TRUE 0.846 13.000 0.065 NA   NA
 5628517 5628518 Bsph_0495 Bsph_0496 sugR   TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000   NA
 5628519 5628520 Bsph_0497 Bsph_0498     FALSE 0.570 102.000 0.136 NA   NA
 5628520 5628521 Bsph_0498 Bsph_0499     FALSE 0.003 704.000 0.000 NA   NA
 5628522 5628523 Bsph_0500 Bsph_0501     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5628524 5628525 Bsph_0502 Bsph_0503     FALSE 0.453 96.000 0.000 1.000   NA
 5628528 5628529 Bsph_0505 Bsph_0507     FALSE 0.004 494.000 0.000 NA   NA
 5628530 5628531 Bsph_0508 Bsph_0509     FALSE 0.444 124.000 0.061 NA   NA
 5628532 5628533 Bsph_0510 Bsph_0511     TRUE 0.616 64.000 0.016 1.000 N NA
 5628534 5628535 Bsph_0512 Bsph_0513     FALSE 0.296 108.000 0.000 NA   NA
 5628536 5628537 Bsph_0514 Bsph_0515     TRUE 0.972 4.000 0.333 NA   NA
 5628538 5628539 Bsph_0516 Bsph_0517     FALSE 0.054 227.000 0.000 1.000   NA
 5628542 5628543 Bsph_0520 Bsph_0521     FALSE 0.587 169.000 0.667 NA N NA
 5628545 5628546 Bsph_0523 Bsph_0524     FALSE 0.431 141.000 0.071 NA N NA
 5628546 5628547 Bsph_0524 Bsph_0525     TRUE 0.973 11.000 0.067 NA Y NA
 5628547 5628548 Bsph_0525 Bsph_0526     TRUE 0.922 38.000 0.067 NA Y NA
 5628548 5628549 Bsph_0526 Bsph_0527     TRUE 0.929 23.000 0.667 NA   NA
 5628549 5628550 Bsph_0527 Bsph_0528     TRUE 0.949 5.000 0.143 NA   NA
 5628550 5628551 Bsph_0528 Bsph_0529     FALSE 0.020 295.000 0.000 1.000   NA
 5628551 5628552 Bsph_0529 Bsph_0530     FALSE 0.550 106.000 0.039 1.000 N NA
 5628553 5628554 Bsph_0531 Bsph_0532   ydbP TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5628555 5628556 Bsph_0533 Bsph_0534     TRUE 0.967 49.000 0.588 1.000 Y NA
 5628556 5628557 Bsph_0534 Bsph_0535     FALSE 0.219 257.000 0.124 1.000 Y NA
 5628557 5628558 Bsph_0535 Bsph_0536     TRUE 0.866 49.000 0.060 0.037 N NA
 5628558 5628559 Bsph_0536 Bsph_0537     FALSE 0.265 196.000 0.170 1.000 N NA
 5628559 5628560 Bsph_0537 Bsph_0538     FALSE 0.429 92.000 0.043 NA   NA
 5628560 5628561 Bsph_0538 Bsph_0539     TRUE 0.871 -43.000 0.000 NA   NA
 5628561 5628562 Bsph_0539 Bsph_0540     TRUE 0.931 16.000 0.443 NA   NA
 5628562 5628563 Bsph_0540 Bsph_0541   metN FALSE 0.091 205.000 0.000 1.000   NA
 5628563 5628564 Bsph_0541 Bsph_0542 metN metN TRUE 0.931 -28.000 0.000 1.000   NA
 5628564 5628565 Bsph_0542 Bsph_0543 metN metI TRUE 0.980 29.000 0.642 1.000 Y NA
 5628565 5628566 Bsph_0543 Bsph_0544 metI   TRUE 0.892 67.000 0.128 NA Y NA
 5628566 5628567 Bsph_0544 Bsph_0545   vipA FALSE 0.003 691.000 0.000 NA N NA
 5628567 5628568 Bsph_0545 Bsph_0546 vipA   TRUE 0.860 53.000 0.286 1.000 N NA
 5628568 5628569 Bsph_0546 Bsph_0547     TRUE 0.961 -3.000 0.024 1.000 N NA
 5628569 5628570 Bsph_0547 Bsph_0548     TRUE 0.967 -3.000 0.060 1.000   NA
 5628570 5628571 Bsph_0548 Bsph_0549     TRUE 0.972 14.000 0.250 0.010   NA
 5628573 5628574 Bsph_0551 Bsph_0552     TRUE 0.969 19.000 0.139 1.000 Y NA
 5628574 5628575 Bsph_0552 Bsph_0553     TRUE 0.989 0.000 0.606 1.000 N NA
 5628575 5628576 Bsph_0553 Bsph_0554     TRUE 0.985 -10.000 0.292 1.000 N NA
 5628576 5628577 Bsph_0554 Bsph_0555     TRUE 0.886 81.000 0.152 0.001 N NA
 5628577 5628578 Bsph_0555 Bsph_0556   feuA FALSE 0.147 190.000 0.000 1.000 N NA
 5628578 5628579 Bsph_0556 Bsph_0557 feuA   FALSE 0.320 135.000 0.026 NA   NA
 5628579 5628580 Bsph_0557 Bsph_0558     TRUE 0.978 0.000 0.303 NA   NA
 5628580 5628581 Bsph_0558 Bsph_0559     TRUE 0.913 27.000 0.299 1.000   NA
 5628581 5628582 Bsph_0559 Bsph_0560   rpfG TRUE 0.779 37.000 0.046 1.000 N NA
 5628582 5628583 Bsph_0560 Bsph_0561 rpfG   TRUE 0.738 24.000 0.052 NA   NA
 5628583 5628584 Bsph_0561 Bsph_0562     FALSE 0.340 77.000 0.003 NA   NA
 5628584 5628585 Bsph_0562 Bsph_0563     TRUE 0.620 33.000 0.021 NA   NA
 5628587 5628588 Bsph_0566 Bsph_0567     FALSE 0.509 51.000 0.015 NA   NA
 5628590 5628591 Bsph_0569 Bsph_0570     TRUE 0.977 -3.000 0.237 NA   NA
 5628593 5628594 Bsph_0572 Bsph_0573   yutJ FALSE 0.032 225.000 0.000 NA   NA
 5628599 5628600 Bsph_0578 Bsph_0579     FALSE 0.251 136.000 0.000 NA   NA
 5628601 5628602 Bsph_0580 Bsph_0581     TRUE 0.802 22.000 0.031 1.000   NA
 5628602 5628603 Bsph_0581 Bsph_0582   lytS FALSE 0.219 207.000 0.000 0.015   NA
 5628603 5628604 Bsph_0582 Bsph_0583 lytS lytT TRUE 0.996 7.000 0.538 0.026 Y NA
 5628604 5628605 Bsph_0583 Bsph_0584 lytT   TRUE 0.748 161.000 0.082 1.000 Y NA
 5628605 5628606 Bsph_0584 Bsph_0585     FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5628608 5628609 Bsph_0587 Bsph_0588     FALSE 0.362 135.000 0.044 NA   NA
 5628609 5628610 Bsph_0588 Bsph_0589     FALSE 0.005 396.000 0.000 NA   NA
 5628610 5628611 Bsph_0589 Bsph_0590     TRUE 0.960 13.000 0.438 1.000   NA
 5628611 5628612 Bsph_0590 Bsph_0591     TRUE 0.966 0.000 0.143 NA   NA
 5628612 5628613 Bsph_0591 Bsph_0592     FALSE 0.531 46.000 0.015 NA   NA
 5628613 5628614 Bsph_0592 Bsph_0593     TRUE 0.977 88.000 0.791 0.001 Y NA
 5628615 5628616 Bsph_0594 Bsph_0595 cysA cysW TRUE 0.986 16.000 0.587 1.000 Y NA
 5628616 5628617 Bsph_0595 Bsph_0596 cysW cysT TRUE 0.991 11.000 0.935 0.001 N NA
 5628617 5628618 Bsph_0596 Bsph_0597 cysT   TRUE 0.977 12.000 0.112 0.001 N NA
 5628619 5628620 Bsph_0598 Bsph_0599     TRUE 0.864 13.000 0.011 1.000 N NA
 5628620 5628621 Bsph_0599 Bsph_0600     TRUE 0.850 79.000 0.021 1.000 Y NA
 5628621 5628622 Bsph_0600 Bsph_0601     TRUE 0.997 -3.000 0.101 0.001 Y NA
 5628623 5628624 Bsph_0602 Bsph_0603     TRUE 0.994 -16.000 0.244 1.000 Y NA
 5628624 5628625 Bsph_0603 Bsph_0604     TRUE 0.998 -3.000 0.829 0.065 Y NA
 5628625 5628626 Bsph_0604 Bsph_0605     TRUE 0.995 5.000 0.842 1.000 Y NA
 5628626 5628627 Bsph_0605 Bsph_0606     TRUE 0.998 -7.000 0.368 0.002 Y NA
 5628627 5628628 Bsph_0606 Bsph_0607     TRUE 0.994 0.000 0.341 NA Y NA
 5628628 5628629 Bsph_0607 Bsph_0608   mrpA TRUE 0.995 -13.000 0.439 NA Y NA
 5628632 5628633 Bsph_0611 Bsph_0612     TRUE 0.754 23.000 0.060 NA   NA
 5628634 5628635 Bsph_0613 Bsph_0614   patB FALSE 0.356 112.000 0.022 NA   NA
 5628635 5628636 Bsph_0614 Bsph_0615 patB   TRUE 0.918 -10.000 0.022 NA   NA
 5628639 5628640 Bsph_0618 Bsph_0619 sigY   TRUE 0.965 -7.000 0.125 NA   NA
 5628640 5628641 Bsph_0619 Bsph_0620     FALSE 0.404 85.000 0.027 NA   NA
 5628643 5628644 Bsph_0622 Bsph_0623     FALSE 0.051 242.000 0.023 1.000 N NA
 5628644 5628645 Bsph_0623 Bsph_0624     TRUE 0.835 85.000 0.008 1.000 Y NA
 5628645 5628646 Bsph_0624 Bsph_0625     FALSE 0.103 240.000 0.000 0.038 N NA
 5628647 5628648 Bsph_0626 Bsph_0627     FALSE 0.482 84.000 0.000 1.000   NA
 5628648 5628649 Bsph_0627 Bsph_0628     TRUE 0.812 15.000 0.061 NA   NA
 5628650 5628651 Bsph_rRNA0716S Bsph_rRNA0723S     FALSE 0.008 323.000 0.000 NA   NA
 5628651 5628652 Bsph_rRNA0723S Bsph_rRNA075S     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5628654 5628655 Bsph_0633 Bsph_0634     TRUE 0.845 89.000 0.029 1.000 Y NA
 5628657 5628658 Bsph_0636 Bsph_0637     TRUE 0.905 74.000 0.000 0.065 Y NA
 5628658 5628659 Bsph_0637 Bsph_0638     TRUE 0.851 37.000 0.286 NA   NA
 5628659 5628660 Bsph_0638 Bsph_0639   mtrA FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5628660 5628661 Bsph_0639 Bsph_0640 mtrA   TRUE 0.984 24.000 0.833 1.000 Y NA
 5628661 5628662 Bsph_0640 Bsph_0641     TRUE 0.678 74.000 0.100 1.000   NA
 5628664 5628665 Bsph_0643 Bsph_0644     FALSE 0.324 86.000 0.000 NA   NA
 5628665 5628666 Bsph_0644 Bsph_0645     FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 5628666 5628667 Bsph_0645 Bsph_0646     FALSE 0.116 175.000 0.000 NA   NA
 5628668 5628669 Bsph_0647 Bsph_0648     TRUE 0.928 -12.000 0.025 NA N NA
 5628669 5628670 Bsph_0648 Bsph_0649     TRUE 0.808 28.000 0.037 1.000 N NA
 5628670 5628671 Bsph_0649 Bsph_0650   fbpC TRUE 0.973 13.000 0.250 0.038 N NA
 5628671 5628672 Bsph_0650 Bsph_0651 fbpC   TRUE 0.921 66.000 0.000 0.038 Y NA
 5628672 5628673 Bsph_0651 Bsph_0652     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 5628673 5628674 Bsph_0652 Bsph_0653     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5628675 5628676 Bsph_0654 Bsph_0655     TRUE 0.760 21.000 0.000 1.000   NA
 5628676 5628677 Bsph_0655 Bsph_0656     FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 5628677 5628678 Bsph_0656 Bsph_0657   yxlF TRUE 0.975 -3.000 0.216 NA   NA
 5628678 5628679 Bsph_0657 Bsph_0658 yxlF   TRUE 0.986 -3.000 0.569 NA   NA
 5628680 5628681 Bsph_0659 Bsph_0660     FALSE 0.007 343.000 0.000 NA   NA
 5628686 5628687 Bsph_0665 Bsph_0666     TRUE 0.994 -10.000 0.364 NA Y NA
 5628687 5628688 Bsph_0666 Bsph_0667     TRUE 0.992 4.000 0.273 NA Y NA
 5628688 5628689 Bsph_0667 Bsph_0668     TRUE 0.996 2.000 0.079 0.002 Y NA
 5628689 5628690 Bsph_0668 Bsph_0669     TRUE 0.994 0.000 0.184 1.000 Y NA
 5628690 5628691 Bsph_0669 Bsph_0670   mrpF TRUE 0.944 87.000 0.214 0.065 Y NA
 5628691 5628692 Bsph_0670 Bsph_0671 mrpF   TRUE 0.994 -7.000 0.136 1.000 Y NA
 5628692 5628693 Bsph_0671 Bsph_0672   yqiX FALSE 0.021 298.000 0.000 1.000 N NA
 5628693 5628694 Bsph_0672 Bsph_0673 yqiX yqiY TRUE 0.933 97.000 0.154 0.046 Y NA
 5628694 5628695 Bsph_0673 Bsph_0674 yqiY   TRUE 0.997 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 5628695 5628696 Bsph_0674 Bsph_0675     FALSE 0.009 413.000 0.000 1.000   NA
 5628697 5628698 Bsph_0676 Bsph_0677     TRUE 0.988 12.000 0.667 NA Y NA
 5628698 5628699 Bsph_0677 Bsph_0678     TRUE 0.687 43.000 0.000 1.000 N NA
 5628699 5628700 Bsph_0678 Bsph_0679     TRUE 0.955 13.000 0.000 0.001   NA
 5628703 5628704 Bsph_0682 Bsph_0683     FALSE 0.016 256.000 0.000 NA   NA
 5628704 5628705 Bsph_0683 Bsph_0684     TRUE 0.707 14.000 0.000 NA   NA
 5628705 5628706 Bsph_0684 Bsph_0685     TRUE 0.678 39.000 0.000 1.000   NA
 5628706 5628707 Bsph_0685 Bsph_0686     FALSE 0.227 174.000 0.000 1.000 N NA
 5628707 5628708 Bsph_0686 Bsph_0687     TRUE 0.979 -13.000 0.375 NA   NA
 5628708 5628709 Bsph_0687 Bsph_0688     TRUE 0.977 2.000 0.375 NA   NA
 5628710 5628711 Bsph_0689 Bsph_0690   mrsR2 TRUE 0.973 45.000 0.765 1.000 Y NA
 5628712 5628713 Bsph_0691 Bsph_0692     FALSE 0.296 122.000 0.000 NA   NA
 5628713 5628714 Bsph_0692 Bsph_0693     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5628714 5628715 Bsph_0693 Bsph_0694     FALSE 0.144 168.000 0.000 NA   NA
 5628717 5628718 Bsph_0696 Bsph_0697     FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 5628718 5628719 Bsph_0697 Bsph_0698     TRUE 0.647 18.000 0.000 NA   NA
 5628720 5628721 Bsph_0699 Bsph_0700     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 5628721 5628722 Bsph_0700 Bsph_0701   ybbB TRUE 0.983 46.000 0.500 0.008 Y NA
 5628722 5628723 Bsph_0701 Bsph_0702 ybbB ybbB TRUE 0.970 27.000 0.000 0.008 Y NA
 5628723 5628724 Bsph_0702 Bsph_0703 ybbB   TRUE 0.973 98.000 1.000 0.008 Y NA
 5628724 5628725 Bsph_0703 Bsph_0704     FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5628728 5628729 Bsph_0707 Bsph_0708 ybbB   TRUE 0.901 101.000 0.000 0.008 Y NA
 5628730 5628731 Bsph_0709 Bsph_0710     FALSE 0.164 162.000 0.000 NA   NA
 5628734 5628735 Bsph_0713 Bsph_0714 mcpB   FALSE 0.008 429.000 0.000 1.000   NA
 5628735 5628736 Bsph_0714 Bsph_0715   thiC FALSE 0.014 330.000 0.000 1.000   NA
 5628737 5628738 Bsph_0716 Bsph_0717     FALSE 0.021 299.000 0.000 1.000 N NA
 5628739 5628740 Bsph_0718 Bsph_0719     TRUE 0.933 155.000 0.315 0.001 Y NA
 5628740 5628741 Bsph_0719 Bsph_0720     TRUE 0.977 -3.000 0.110 1.000 N NA
 5628741 5628742 Bsph_0720 Bsph_0721     FALSE 0.116 198.000 0.000 1.000 N NA
 5628742 5628743 Bsph_0721 Bsph_0722     TRUE 0.600 84.000 0.047 1.000 N NA
 5628743 5628744 Bsph_0722 Bsph_0723     TRUE 0.946 10.000 0.125 1.000 N NA
 5628744 5628745 Bsph_0723 Bsph_0724     TRUE 0.974 24.000 0.005 0.003 Y NA
 5628745 5628746 Bsph_0724 Bsph_0725     FALSE 0.354 145.000 0.000 1.000   NA
 5628746 5628747 Bsph_0725 Bsph_rRNA0816S     FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 5628747 5628748 Bsph_rRNA0816S Bsph_rRNA0823S     FALSE 0.008 323.000 0.000 NA   NA
 5628748 5628749 Bsph_rRNA0823S Bsph_rRNA085S     FALSE 0.364 71.000 0.000 NA   NA
 5628749 5628750 Bsph_rRNA085S Bsph_tRNA27     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5628750 5628751 Bsph_tRNA27 Bsph_tRNA28     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628751 5628752 Bsph_tRNA28 Bsph_tRNA29     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5628752 5628753 Bsph_tRNA29 Bsph_tRNA30     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5628753 5628754 Bsph_tRNA30 Bsph_tRNA31     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628754 5628755 Bsph_tRNA31 Bsph_tRNA32     FALSE 0.499 44.000 0.000 NA   NA
 5628755 5628756 Bsph_tRNA32 Bsph_tRNA33     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5628756 5628757 Bsph_tRNA33 Bsph_tRNA34     TRUE 0.707 14.000 0.000 NA   NA
 5628757 5628758 Bsph_tRNA34 Bsph_tRNA35     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5628758 5628759 Bsph_tRNA35 Bsph_tRNA36     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5628759 5628760 Bsph_tRNA36 Bsph_tRNA37     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5628760 5628761 Bsph_tRNA37 Bsph_tRNA38     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5628761 5628762 Bsph_tRNA38 Bsph_tRNA39     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628762 5628763 Bsph_tRNA39 Bsph_tRNA40     TRUE 0.816 7.000 0.000 NA   NA
 5628763 5628764 Bsph_tRNA40 Bsph_tRNA41     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628764 5628765 Bsph_tRNA41 Bsph_tRNA42     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628765 5628766 Bsph_tRNA42 Bsph_tRNA43     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5628766 5628767 Bsph_tRNA43 Bsph_0728     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5628767 5628768 Bsph_0728 Bsph_0729     FALSE 0.473 66.000 0.028 NA   NA
 5628770 5628771 Bsph_0731 Bsph_0732     FALSE 0.432 157.000 0.062 1.000 N NA
 5628771 5628772 Bsph_0732 Bsph_0733   resE TRUE 0.997 6.000 0.750 0.026 Y NA
 5628772 5628773 Bsph_0733 Bsph_0734 resE ycbN TRUE 0.832 105.000 0.680 1.000 N NA
 5628773 5628774 Bsph_0734 Bsph_0735 ycbN   TRUE 0.937 5.000 0.100 NA   NA
 5628774 5628775 Bsph_0735 Bsph_0736     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5628777 5628778 Bsph_0738 Bsph_0739 ykoG ykoH TRUE 0.946 39.000 0.100 1.000 Y NA
 5628778 5628779 Bsph_0739 Bsph_0740 ykoH   TRUE 0.986 -27.000 0.533 1.000   NA
 5628779 5628780 Bsph_0740 Bsph_0741     TRUE 0.895 87.000 0.250 0.001   NA
 5628780 5628781 Bsph_0741 Bsph_0742     FALSE 0.007 483.000 0.000 1.000   NA
 5628781 5628782 Bsph_0742 Bsph_0743     FALSE 0.012 375.000 0.000 1.000 N NA
 5628782 5628783 Bsph_0743 Bsph_0744     TRUE 0.989 0.000 0.014 1.000 Y NA
 5628783 5628784 Bsph_0744 Bsph_0745     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA   NA
 5628787 5628788 Bsph_0748 Bsph_0749     FALSE 0.294 106.000 0.000 NA   NA
 5628788 5628789 Bsph_0749 Bsph_0750     FALSE 0.398 145.000 0.080 NA   NA
 5628789 5628790 Bsph_0750 Bsph_0751     TRUE 0.968 -19.000 0.200 NA   NA
 5628791 5628792 Bsph_0752 Bsph_0754     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5628793 5628794 Bsph_0755 Bsph_0756   ypsA FALSE 0.335 102.000 0.017 NA   NA
 5628794 5628795 Bsph_0756 Bsph_0757 ypsA   FALSE 0.029 227.000 0.000 NA   NA
 5628796 5628797 Bsph_0758 Bsph_0759   yvrG TRUE 0.996 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5628799 5628800 Bsph_0761 Bsph_0762   yfeW TRUE 0.751 156.000 0.167 0.007 N NA
 5628800 5628801 Bsph_0762 Bsph_0763 yfeW yurO TRUE 0.968 -3.000 0.053 1.000 N NA
 5628801 5628802 Bsph_0763 Bsph_0764 yurO yurN TRUE 0.925 153.000 0.456 0.037 Y NA
 5628804 5628805 Bsph_0765 Bsph_0767 yurM   TRUE 0.948 -13.000 0.077 NA   NA
 5628805 5628806 Bsph_0767 Bsph_0768     TRUE 0.919 6.000 0.080 NA   NA
 5628806 5628807 Bsph_0768 Bsph_0769   ybbH TRUE 0.901 72.000 0.240 0.002   NA
 5628809 5628810 Bsph_0771 Bsph_0772     FALSE 0.004 478.000 0.000 NA   NA
 5628810 5628811 Bsph_0772 Bsph_0773   yjlD TRUE 0.830 46.000 0.310 NA   NA
 5628811 5628812 Bsph_0773 Bsph_0774 yjlD mcpC FALSE 0.521 128.000 0.034 1.000 N NA
 5628817 5628818 Bsph_0779 Bsph_0780   ydeL FALSE 0.466 151.000 0.154 NA   NA
 5628819 5628820 Bsph_0781 Bsph_0782     FALSE 0.467 114.000 0.009 1.000   NA
 5628821 5628822 Bsph_0783 Bsph_0784     TRUE 0.987 -3.000 0.636 NA   NA
 5628822 5628823 Bsph_0784 Bsph_0785     TRUE 0.848 147.000 0.667 0.030   NA
 5628823 5628824 Bsph_0785 Bsph_0786     TRUE 0.838 13.000 0.000 1.000   NA
 5628829 5628830 Bsph_0791 Bsph_0792     FALSE 0.576 142.000 0.000 0.089   NA
 5628830 5628831 Bsph_0792 Bsph_0793     TRUE 0.719 108.000 0.048 0.059   NA
 5628831 5628832 Bsph_0793 Bsph_0794     TRUE 0.768 17.000 0.048 NA   NA
 5628833 5628834 Bsph_0795 Bsph_0796 arsR   TRUE 0.982 0.000 0.413 NA   NA
 5628835 5628836 Bsph_0797 Bsph_0798     FALSE 0.098 207.000 0.000 1.000 N NA
 5628836 5628837 Bsph_0798 Bsph_0799     TRUE 0.771 120.000 0.333 1.000 N NA
 5628837 5628838 Bsph_0799 Bsph_0800     TRUE 0.997 0.000 0.056 0.001 Y NA
 5628838 5628839 Bsph_0800 Bsph_0801     FALSE 0.373 69.000 0.000 NA   NA
 5628839 5628840 Bsph_0801 Bsph_0802     FALSE 0.345 101.000 0.020 NA   NA
 5628842 5628843 Bsph_0804 Bsph_0805   yokL FALSE 0.003 993.000 0.000 NA   NA
 5628843 5628844 Bsph_0805 Bsph_0806 yokL   FALSE 0.006 709.000 0.000 1.000 N NA
 5628845 5628846 Bsph_0807 Bsph_0808     FALSE 0.319 104.000 0.010 NA   NA
 5628848 5628849 Bsph_0810 Bsph_0811 yxdM yxdL TRUE 0.809 65.000 0.444 NA   NA
 5628849 5628850 Bsph_0811 Bsph_0812 yxdL yxdK TRUE 0.840 125.000 0.833 1.000 N NA
 5628850 5628851 Bsph_0812 Bsph_0813 yxdK yxdJ TRUE 0.997 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 5628853 5628854 Bsph_0815 Bsph_0816   yehT FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 5628855 5628856 Bsph_0817 Bsph_0818 yocH   FALSE 0.485 125.000 0.023 1.000   NA
 5628856 5628857 Bsph_0818 Bsph_0819     FALSE 0.011 290.000 0.000 NA   NA
 5628857 5628858 Bsph_0819 Bsph_0820     FALSE 0.296 99.000 0.000 NA   NA
 5628858 5628859 Bsph_0820 Bsph_0821     TRUE 0.713 115.000 0.381 NA   NA
 5628859 5628860 Bsph_0821 Bsph_0822     TRUE 0.977 -3.000 0.237 NA   NA
 5628860 5628861 Bsph_0822 Bsph_0823     FALSE 0.018 249.000 0.000 NA   NA
 5628861 5628862 Bsph_0823 Bsph_0824   amhX FALSE 0.205 192.000 0.154 NA   NA
 5628862 5628863 Bsph_0824 Bsph_0825 amhX   FALSE 0.023 282.000 0.000 1.000   NA
 5628865 5628866 Bsph_0827 Bsph_0828     TRUE 0.923 12.000 0.189 NA   NA
 5628869 5628870 Bsph_0831 Bsph_0832     FALSE 0.385 125.000 0.036 NA   NA
 5628870 5628871 Bsph_0832 Bsph_0833     TRUE 0.782 30.000 0.036 1.000   NA
 5628873 5628874 Bsph_0835 Bsph_0836     FALSE 0.043 211.000 0.000 NA   NA
 5628876 5628877 Bsph_0838 Bsph_0839     FALSE 0.053 201.000 0.000 NA   NA
 5628878 5628879 Bsph_0840 Bsph_0841     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5628879 5628880 Bsph_0841 Bsph_0842     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 5628880 5628881 Bsph_0842 Bsph_0843     FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 5628883 5628884 Bsph_0845 Bsph_0846 ywfM   FALSE 0.556 77.000 0.087 NA   NA
 5628884 5628885 Bsph_0846 Bsph_0847     TRUE 0.854 14.000 0.087 NA   NA
 5628885 5628886 Bsph_0847 Bsph_0848     TRUE 0.890 27.000 0.333 NA   NA
 5628888 5628889 Bsph_0850 Bsph_0851     FALSE 0.553 104.000 0.056 1.000   NA
 5628889 5628890 Bsph_0851 Bsph_0852     FALSE 0.023 283.000 0.000 1.000   NA
 5628890 5628891 Bsph_0852 Bsph_0853     FALSE 0.060 224.000 0.000 1.000   NA
 5628893 5628894 Bsph_0855 Bsph_0856     FALSE 0.011 289.000 0.000 NA   NA
 5628894 5628895 Bsph_0856 Bsph_0857     TRUE 0.869 27.000 0.107 1.000 N NA
 5628895 5628896 Bsph_0857 Bsph_0858     TRUE 0.813 22.000 0.027 1.000 N NA
 5628896 5628897 Bsph_0858 Bsph_0859     FALSE 0.394 137.000 0.062 NA   NA
 5628899 5628900 Bsph_0861 Bsph_0862     TRUE 0.837 22.000 0.133 NA   NA
 5628902 5628903 Bsph_0864 Bsph_0865   yfiB FALSE 0.532 173.000 0.667 NA   NA
 5628903 5628904 Bsph_0865 Bsph_0866 yfiB   TRUE 0.997 0.000 0.167 0.004 Y NA
 5628904 5628905 Bsph_0866 Bsph_0867     FALSE 0.038 217.000 0.000 NA   NA
 5628905 5628906 Bsph_0867 Bsph_0868     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5628910 5628911 Bsph_0872 Bsph_0873     FALSE 0.314 96.000 0.006 NA   NA
 5628912 5628913 Bsph_0874 Bsph_0875     FALSE 0.110 283.000 0.000 1.000 Y NA
 5628913 5628914 Bsph_0875 Bsph_0876     FALSE 0.023 290.000 0.000 1.000 N NA
 5628914 5628915 Bsph_0876 Bsph_0877     TRUE 0.994 9.000 0.250 0.037 Y NA
 5628916 5628917 Bsph_0878 Bsph_0879     FALSE 0.131 318.000 0.000 0.063 Y NA
 5628918 5628919 Bsph_0880 Bsph_0881   spxA TRUE 0.916 24.000 0.250 1.000 N NA
 5628919 5628920 Bsph_0881 Bsph_0882 spxA   FALSE 0.009 411.000 0.000 1.000   NA
 5628920 5628921 Bsph_0882 Bsph_0883     TRUE 0.784 35.000 0.125 NA   NA
 5628921 5628922 Bsph_0883 Bsph_0884   neuA FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5628923 5628924 Bsph_0885 Bsph_0886     FALSE 0.536 120.000 0.043 1.000   NA
 5628924 5628925 Bsph_0886 Bsph_0887     TRUE 0.737 89.000 0.222 1.000   NA
 5628925 5628926 Bsph_0887 Bsph_0888     TRUE 0.970 2.000 0.222 NA   NA
 5628926 5628927 Bsph_0888 Bsph_0889     FALSE 0.400 157.000 0.125 NA   NA
 5628929 5628930 Bsph_0891 Bsph_0892     FALSE 0.006 372.000 0.000 NA   NA
 5628930 5628931 Bsph_0892 Bsph_rRNA0916S     FALSE 0.003 690.000 0.000 NA   NA
 5628931 5628932 Bsph_rRNA0916S Bsph_tRNA44     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628932 5628933 Bsph_tRNA44 Bsph_tRNA45     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628933 5628934 Bsph_tRNA45 Bsph_rRNA0923S     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5628934 5628935 Bsph_rRNA0923S Bsph_rRNA095S     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5628935 5628936 Bsph_rRNA095S Bsph_0895     FALSE 0.003 1145.000 0.000 NA   NA
 5628936 5628937 Bsph_0895 Bsph_0896     FALSE 0.570 91.000 0.037 1.000 N NA
 5628937 5628938 Bsph_0896 Bsph_0897     TRUE 0.795 148.000 0.074 1.000 Y NA
 5628938 5628939 Bsph_0897 Bsph_0898     TRUE 0.959 16.000 0.237 0.081   NA
 5628939 5628940 Bsph_0898 Bsph_0899     TRUE 0.986 -34.000 0.053 0.001   NA
 5628940 5628941 Bsph_0899 Bsph_0900     TRUE 0.826 65.000 0.553 NA   NA
 5628941 5628942 Bsph_0900 Bsph_0901     TRUE 0.952 15.000 0.778 NA   NA
 5628942 5628943 Bsph_0901 Bsph_0902     TRUE 0.995 -3.000 0.690 0.080 N NA
 5628943 5628944 Bsph_0902 Bsph_0903     TRUE 0.914 130.000 0.426 1.000 Y NA
 5628944 5628945 Bsph_0903 Bsph_0904     FALSE 0.506 71.000 0.037 NA N NA
 5628945 5628946 Bsph_0904 Bsph_0905     FALSE 0.006 355.000 0.000 NA   NA
 5628946 5628947 Bsph_0905 Bsph_0906     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5628947 5628948 Bsph_0906 Bsph_0907     FALSE 0.264 133.000 0.004 NA   NA
 5628948 5628949 Bsph_0907 Bsph_0908     FALSE 0.298 114.000 0.000 NA   NA
 5628949 5628950 Bsph_0908 Bsph_0909     FALSE 0.582 59.000 0.000 1.000   NA
 5628951 5628952 Bsph_0910 Bsph_0911     TRUE 0.993 -3.000 0.074 1.000 Y NA
 5628952 5628953 Bsph_0911 Bsph_0912     TRUE 0.957 15.000 0.500 1.000 N NA
 5628953 5628954 Bsph_0912 Bsph_0913   metI TRUE 0.902 14.000 0.077 1.000 N NA
 5628954 5628955 Bsph_0913 Bsph_0914 metI metN TRUE 0.997 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 5628955 5628956 Bsph_0914 Bsph_0915 metN metQ TRUE 0.929 105.000 0.880 NA Y NA
 5628961 5628962 Bsph_0920 Bsph_0921     TRUE 0.950 22.000 0.667 1.000 N NA
 5628962 5628963 Bsph_0921 Bsph_0922     TRUE 0.933 35.000 0.667 1.000 N NA
 5628965 5628966 Bsph_0924 Bsph_0925 tlpA   FALSE 0.013 349.000 0.000 1.000 N NA
 5628967 5628968 Bsph_0926 Bsph_0928     FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 5628969 5628970 Bsph_0929 Bsph_0930     FALSE 0.502 82.000 0.067 NA   NA
 5628970 5628971 Bsph_0930 Bsph_0931   cbiO TRUE 0.805 20.000 0.029 1.000   NA
 5628974 5628975 Bsph_0934 Bsph_0935     TRUE 0.950 14.000 0.644 NA   NA
 5628975 5628976 Bsph_0935 Bsph_0936     FALSE 0.003 538.000 0.000 NA   NA
 5628976 5628977 Bsph_0936 Bsph_0937     FALSE 0.017 252.000 0.000 NA   NA
 5628978 5628979 Bsph_0938 Bsph_0939     FALSE 0.465 76.000 0.044 NA   NA
 5628979 5628980 Bsph_0939 Bsph_0940     TRUE 0.964 0.000 0.130 NA   NA
 5628980 5628981 Bsph_0940 Bsph_0941     TRUE 0.705 28.000 0.042 NA   NA
 5628981 5628982 Bsph_0941 Bsph_0942   yhaA FALSE 0.192 156.000 0.005 NA   NA
 5628983 5628984 Bsph_0943 Bsph_0944 gerQ   TRUE 0.932 23.000 0.722 NA   NA
 5628986 5628987 Bsph_0946 Bsph_0947     TRUE 0.864 5.000 0.009 NA   NA
 5628990 5628991 Bsph_0950 Bsph_0951     FALSE 0.248 159.000 0.039 NA   NA
 5628991 5628992 Bsph_0951 Bsph_0952     FALSE 0.010 374.000 0.000 1.000   NA
 5628993 5628994 Bsph_0953 Bsph_0954 srtA   FALSE 0.157 178.000 0.039 NA   NA
 5628997 5628998 Bsph_0957 Bsph_0958     FALSE 0.164 162.000 0.000 NA   NA
 5628998 5628999 Bsph_0958 Bsph_0959   oxaA TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5628999 5629000 Bsph_0959 Bsph_0960 oxaA   FALSE 0.209 155.000 0.011 NA   NA
 5629000 5629001 Bsph_0960 Bsph_0961     TRUE 0.956 -3.000 0.079 NA   NA
 5629001 5629002 Bsph_0961 Bsph_0962     FALSE 0.132 193.000 0.000 1.000 N NA
 5629002 5629003 Bsph_0962 Bsph_0963     TRUE 0.986 -7.000 0.321 1.000 N NA
 5629003 5629004 Bsph_0963 Bsph_0964     TRUE 0.990 2.000 0.065 1.000 Y NA
 5629004 5629005 Bsph_0964 Bsph_0965     FALSE 0.044 241.000 0.000 1.000 N NA
 5629005 5629006 Bsph_0965 Bsph_0966   hmuU TRUE 0.995 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 5629006 5629007 Bsph_0966 Bsph_0967 hmuU   TRUE 0.996 -3.000 0.373 1.000 Y NA
 5629007 5629008 Bsph_0967 Bsph_0968     TRUE 0.649 83.000 0.092 1.000   NA
 5629008 5629009 Bsph_0968 Bsph_0969     FALSE 0.022 237.000 0.000 NA   NA
 5629009 5629010 Bsph_0969 Bsph_0970     TRUE 0.869 -46.000 0.000 NA   NA
 5629010 5629011 Bsph_0970 Bsph_0971     FALSE 0.339 189.000 0.205 1.000 N NA
 5629011 5629012 Bsph_0971 Bsph_0972     TRUE 0.993 0.000 0.118 1.000 Y NA
 5629012 5629013 Bsph_0972 Bsph_0973     TRUE 0.922 60.000 0.110 1.000 Y NA
 5629013 5629014 Bsph_0973 Bsph_0974     TRUE 0.920 155.000 0.270 0.004 Y NA
 5629014 5629015 Bsph_0974 Bsph_0975     TRUE 0.984 4.000 0.432 1.000 N NA
 5629015 5629016 Bsph_0975 Bsph_0976     TRUE 0.702 93.000 0.146 1.000 N NA
 5629016 5629017 Bsph_0976 Bsph_0977     FALSE 0.216 147.000 0.000 NA   NA
 5629017 5629018 Bsph_0977 Bsph_0978     FALSE 0.228 144.000 0.000 NA   NA
 5629018 5629019 Bsph_0978 Bsph_0979     FALSE 0.011 443.000 0.029 1.000 N NA
 5629021 5629022 Bsph_0981 Bsph_0982     FALSE 0.007 525.000 0.000 1.000 N NA
 5629022 5629023 Bsph_0982 Bsph_0983     TRUE 0.772 151.000 0.061 1.000 Y NA
 5629023 5629024 Bsph_0983 Bsph_0984     TRUE 0.894 13.000 0.049 1.000 N NA
 5629024 5629025 Bsph_0984 Bsph_0985     TRUE 0.714 95.000 0.170 1.000 N NA
 5629025 5629026 Bsph_0985 Bsph_0986     FALSE 0.062 227.000 0.005 1.000 N NA
 5629026 5629027 Bsph_0986 Bsph_0987     FALSE 0.565 32.000 0.002 NA   NA
 5629027 5629028 Bsph_0987 Bsph_0988     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5629028 5629029 Bsph_0988 Bsph_0989     TRUE 0.899 49.000 0.500 1.000 N NA
 5629029 5629030 Bsph_0989 Bsph_0990     TRUE 0.844 43.000 0.150 1.000 N NA
 5629030 5629031 Bsph_0990 Bsph_0991     TRUE 0.936 47.000 0.100 1.000 Y NA
 5629031 5629032 Bsph_0991 Bsph_0992     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.036 Y NA
 5629032 5629033 Bsph_0992 Bsph_0993     TRUE 0.866 93.000 1.000 1.000 N NA
 5629033 5629034 Bsph_0993 Bsph_0994     FALSE 0.007 503.000 0.000 1.000 N NA
 5629034 5629035 Bsph_0994 Bsph_0995     FALSE 0.436 156.000 0.062 1.000 N NA
 5629035 5629036 Bsph_0995 Bsph_0996     TRUE 0.996 -10.000 0.084 0.038 Y NA
 5629036 5629037 Bsph_0996 Bsph_0997   spoIIR TRUE 0.615 118.000 0.178 NA   NA
 5629037 5629038 Bsph_0997 Bsph_0998 spoIIR   FALSE 0.448 102.000 0.062 NA   NA
 5629038 5629039 Bsph_0998 Bsph_0999     FALSE 0.162 167.000 0.008 NA   NA
 5629039 5629040 Bsph_0999 Bsph_1000     FALSE 0.377 73.000 0.008 NA   NA
 5629040 5629041 Bsph_1000 Bsph_1001   mcpA TRUE 0.973 15.000 0.105 1.000 Y NA
 5629041 5629042 Bsph_1001 Bsph_1002 mcpA   FALSE 0.026 394.000 0.150 1.000 N NA
 5629042 5629043 Bsph_1002 Bsph_1003     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5629043 5629044 Bsph_1003 Bsph_1004     TRUE 0.869 -46.000 0.000 NA   NA
 5629044 5629045 Bsph_1004 Bsph_1005     TRUE 0.826 29.000 0.145 NA   NA
 5629045 5629046 Bsph_1005 Bsph_1006     FALSE 0.026 281.000 0.000 1.000 N NA
 5629046 5629047 Bsph_1006 Bsph_1007     FALSE 0.465 125.000 0.002 1.000 N NA
 5629047 5629048 Bsph_1007 Bsph_1008     FALSE 0.249 171.000 0.004 1.000 N NA
 5629048 5629049 Bsph_1008 Bsph_1009     FALSE 0.006 538.000 0.000 1.000   NA
 5629049 5629050 Bsph_1009 Bsph_1010     TRUE 0.893 37.000 0.330 1.000   NA
 5629050 5629051 Bsph_1010 Bsph_1011   atpE TRUE 0.904 64.000 0.189 0.003   NA
 5629051 5629052 Bsph_1011 Bsph_1012 atpE   TRUE 0.731 174.000 0.402 0.003   NA
 5629052 5629053 Bsph_1012 Bsph_1013     TRUE 0.998 -3.000 0.222 0.003 Y NA
 5629053 5629054 Bsph_1013 Bsph_1014     TRUE 0.992 29.000 0.864 0.003 Y NA
 5629054 5629055 Bsph_1014 Bsph_1015     TRUE 0.987 48.000 0.846 0.003 Y NA
 5629055 5629056 Bsph_1015 Bsph_1016     TRUE 0.986 49.000 0.724 0.003 Y NA
 5629056 5629057 Bsph_1016 Bsph_1017     TRUE 0.975 88.000 0.837 0.003 Y NA
 5629057 5629058 Bsph_1017 Bsph_1018     FALSE 0.447 78.000 0.039 NA   NA
 5629058 5629059 Bsph_1018 Bsph_1019     FALSE 0.027 367.000 0.279 NA   NA
 5629059 5629060 Bsph_1019 Bsph_1020     TRUE 0.769 82.000 0.243 1.000 N NA
 5629060 5629061 Bsph_1020 Bsph_1021     TRUE 0.831 32.000 0.090 1.000   NA
 5629061 5629062 Bsph_1021 Bsph_1022     FALSE 0.027 240.000 0.019 NA   NA
 5629062 5629063 Bsph_1022 Bsph_1023     FALSE 0.181 211.000 0.284 NA   NA
 5629063 5629064 Bsph_1023 Bsph_1024   flhO TRUE 0.941 13.000 0.186 1.000 N NA
 5629064 5629065 Bsph_1024 Bsph_1025 flhO flhP TRUE 0.985 31.000 0.248 0.003 Y NA
 5629065 5629066 Bsph_1025 Bsph_1026 flhP   TRUE 0.858 43.000 0.395 NA   NA
 5629066 5629067 Bsph_1026 Bsph_1027     FALSE 0.086 192.000 0.019 NA   NA
 5629067 5629068 Bsph_1027 Bsph_1028     FALSE 0.215 149.000 0.004 NA   NA
 5629068 5629069 Bsph_1028 Bsph_1029     TRUE 0.604 109.000 0.167 NA   NA
 5629072 5629073 Bsph_1032 Bsph_1033     TRUE 0.974 0.000 0.125 1.000   NA
 5629074 5629075 Bsph_1034 Bsph_1035     FALSE 0.258 200.000 0.400 NA   NA
 5629076 5629077 Bsph_1036 Bsph_1037     TRUE 0.978 0.000 0.328 NA   NA
 5629077 5629078 Bsph_1037 Bsph_1038     TRUE 0.744 21.000 0.049 NA   NA
 5629078 5629079 Bsph_1038 Bsph_1039     TRUE 0.953 -3.000 0.015 1.000   NA
 5629079 5629080 Bsph_1039 Bsph_1040     FALSE 0.003 893.000 0.000 NA N NA
 5629081 5629082 Bsph_1041 Bsph_1042     FALSE 0.003 837.000 0.000 NA   NA
 5629083 5629084 Bsph_1043 Bsph_1044     FALSE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 5629084 5629085 Bsph_1044 Bsph_1045     TRUE 0.907 33.000 0.000 NA Y NA
 5629086 5629087 Bsph_1046 Bsph_1047     FALSE 0.003 1127.000 0.000 NA   NA
 5629087 5629088 Bsph_1047 Bsph_1048     FALSE 0.003 1019.000 0.000 NA   NA
 5629088 5629089 Bsph_1048 Bsph_1049     FALSE 0.003 966.000 0.000 NA   NA
 5629089 5629090 Bsph_1049 Bsph_1050     FALSE 0.003 1007.000 0.000 NA   NA
 5629090 5629091 Bsph_1050 Bsph_1051     FALSE 0.037 218.000 0.000 NA   NA
 5629091 5629092 Bsph_1051 Bsph_1052     FALSE 0.006 354.000 0.000 NA   NA
 5629092 5629093 Bsph_1052 Bsph_1053     TRUE 0.890 -13.000 0.000 NA   NA
 5629093 5629094 Bsph_1053 Bsph_1054     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5629094 5629095 Bsph_1054 Bsph_1055     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5629095 5629096 Bsph_1055 Bsph_1056     FALSE 0.003 689.000 0.000 NA   NA
 5629096 5629097 Bsph_1056 Bsph_1057     FALSE 0.018 250.000 0.000 NA   NA
 5629097 5629098 Bsph_1057 Bsph_1058     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5629098 5629099 Bsph_1058 Bsph_1059     TRUE 0.797 9.000 0.000 NA   NA
 5629099 5629100 Bsph_1059 Bsph_1060     FALSE 0.003 757.000 0.000 NA   NA
 5629100 5629101 Bsph_1060 Bsph_1061     FALSE 0.278 128.000 0.000 NA   NA
 5629101 5629102 Bsph_1061 Bsph_1062     FALSE 0.003 768.000 0.000 NA   NA
 5629102 5629103 Bsph_1062 Bsph_1063     FALSE 0.003 679.000 0.000 NA   NA
 5629103 5629104 Bsph_1063 Bsph_1064     FALSE 0.003 669.000 0.000 NA   NA
 5629104 5629105 Bsph_1064 Bsph_1065     TRUE 0.882 -19.000 0.000 NA   NA
 5629105 5629106 Bsph_1065 Bsph_1066     FALSE 0.149 167.000 0.000 NA   NA
 5629106 5629107 Bsph_1066 Bsph_1067     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 5629107 5629108 Bsph_1067 Bsph_1068     FALSE 0.004 459.000 0.000 NA   NA
 5629108 5629109 Bsph_1068 Bsph_1069     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 5629109 5629110 Bsph_1069 Bsph_1070     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5629112 5629113 Bsph_1072 Bsph_1073     FALSE 0.004 473.000 0.000 NA   NA
 5629113 5629114 Bsph_1073 Bsph_1074     TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5629114 5629115 Bsph_1074 Bsph_1075     FALSE 0.003 675.000 0.000 NA   NA
 5629116 5629117 Bsph_1076 Bsph_1078     FALSE 0.087 185.000 0.000 NA   NA
 5629117 5629118 Bsph_1078 Bsph_1079   licT FALSE 0.006 674.000 0.000 1.000 N NA
 5629118 5629119 Bsph_1079 Bsph_1080 licT   FALSE 0.005 1242.000 0.000 1.000   NA
 5629120 5629121 Bsph_1081 Bsph_1082     FALSE 0.003 650.000 0.000 NA   NA
 5629121 5629122 Bsph_1082 Bsph_1083     FALSE 0.007 343.000 0.000 NA   NA
 5629122 5629123 Bsph_1083 Bsph_1084     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 5629124 5629125 Bsph_1085 Bsph_1086     FALSE 0.581 30.000 0.000 NA   NA
 5629125 5629126 Bsph_1086 Bsph_1087     FALSE 0.003 807.000 0.000 NA   NA
 5629126 5629127 Bsph_1087 Bsph_1088   gerXC FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 5629127 5629128 Bsph_1088 Bsph_1089 gerXC   TRUE 0.890 72.000 0.286 0.014   NA
 5629128 5629129 Bsph_1089 Bsph_1090     TRUE 0.994 -3.000 0.429 0.014   NA
 5629130 5629131 Bsph_1091 Bsph_1092     TRUE 0.991 6.000 0.000 0.009 Y NA
 5629131 5629132 Bsph_1092 Bsph_1093     TRUE 0.975 18.000 0.000 0.009 Y NA
 5629132 5629133 Bsph_1093 Bsph_1094     TRUE 0.995 0.000 0.000 0.009 Y NA
 5629135 5629136 Bsph_1096 Bsph_1097     FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 5629136 5629137 Bsph_1097 Bsph_1098     TRUE 0.880 -22.000 0.000 NA   NA
 5629139 5629140 Bsph_1100 Bsph_1101     FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 5629140 5629141 Bsph_1101 Bsph_1102     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 5629141 5629142 Bsph_1102 Bsph_1103     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 5629144 5629145 Bsph_1105 Bsph_1106     FALSE 0.003 945.000 0.000 NA   NA
 5629145 5629146 Bsph_1106 Bsph_1107     FALSE 0.005 411.000 0.000 NA   NA
 5629146 5629147 Bsph_1107 Bsph_1108   mcpA FALSE 0.006 639.000 0.000 1.000   NA
 5629149 5629150 Bsph_1110 Bsph_1111     FALSE 0.441 55.000 0.000 NA   NA
 5629151 5629152 Bsph_1112 Bsph_1113     FALSE 0.005 384.000 0.000 NA   NA
 5629155 5629156 Bsph_1116 Bsph_1117     FALSE 0.003 820.000 0.000 NA   NA
 5629156 5629157 Bsph_1117 Bsph_1118     FALSE 0.526 114.000 0.100 NA   NA
 5629158 5629159 Bsph_1119 Bsph_1120     TRUE 0.987 -3.000 0.667 NA   NA
 5629160 5629161 Bsph_1121 Bsph_1122     FALSE 0.062 195.000 0.000 NA   NA
 5629161 5629162 Bsph_1122 Bsph_1123     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5629162 5629163 Bsph_1123 Bsph_1124   yrvJ FALSE 0.076 291.000 0.000 NA Y NA
 5629164 5629165 Bsph_1125 Bsph_1126   rocA FALSE 0.029 263.000 0.000 1.000   NA
 5629165 5629166 Bsph_1126 Bsph_1127 rocA   TRUE 0.968 9.000 0.000 0.001   NA
 5629166 5629167 Bsph_1127 Bsph_1128     FALSE 0.092 276.000 0.000 0.001   NA
 5629171 5629172 Bsph_1132 Bsph_1133   brnQ FALSE 0.119 193.000 0.000 1.000   NA
 5629172 5629173 Bsph_1133 Bsph_1134 brnQ braB TRUE 0.983 -21.000 0.000 0.001   NA
 5629175 5629176 Bsph_1136 Bsph_1137     FALSE 0.003 506.000 0.000 NA   NA
 5629176 5629177 Bsph_1137 Bsph_1138   secA TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5629179 5629180 Bsph_1140 Bsph_1141   yvyE FALSE 0.031 228.000 0.009 NA   NA
 5629181 5629182 Bsph_1142 Bsph_1143 degS degU TRUE 0.987 31.000 0.519 0.025 Y NA
 5629182 5629183 Bsph_1143 Bsph_1144 degU   FALSE 0.010 296.000 0.000 NA   NA
 5629183 5629184 Bsph_1144 Bsph_1145     FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 5629184 5629185 Bsph_1145 Bsph_1146     TRUE 0.798 46.000 0.214 NA   NA
 5629185 5629186 Bsph_1146 Bsph_1147     TRUE 0.977 -3.000 0.130 1.000   NA
 5629186 5629187 Bsph_1147 Bsph_1148     FALSE 0.457 80.000 0.045 NA   NA
 5629187 5629188 Bsph_1148 Bsph_1149     TRUE 0.633 121.000 0.204 NA   NA
 5629188 5629189 Bsph_1149 Bsph_1150     TRUE 0.969 28.000 0.421 0.002   NA
 5629189 5629190 Bsph_1150 Bsph_1151     TRUE 0.969 17.000 0.233 0.002   NA
 5629190 5629191 Bsph_1151 Bsph_1152     TRUE 0.968 73.000 0.257 0.001 Y NA
 5629191 5629192 Bsph_1152 Bsph_1153     TRUE 0.742 61.000 0.207 NA   NA
 5629192 5629193 Bsph_1153 Bsph_1154     TRUE 0.928 15.000 0.375 NA   NA
 5629193 5629194 Bsph_1154 Bsph_1155     TRUE 0.889 36.000 0.489 NA   NA
 5629194 5629195 Bsph_1155 Bsph_1156     FALSE 0.337 180.000 0.111 1.000 N NA
 5629195 5629196 Bsph_1156 Bsph_1157     FALSE 0.527 88.000 0.083 NA   NA
 5629196 5629197 Bsph_1157 Bsph_1158     TRUE 0.968 3.000 0.231 NA   NA
 5629197 5629198 Bsph_1158 Bsph_1159     TRUE 0.974 2.000 0.286 NA   NA
 5629198 5629199 Bsph_1159 Bsph_1160     TRUE 0.663 25.000 0.020 NA   NA
 5629199 5629200 Bsph_1160 Bsph_1161     TRUE 0.996 -3.000 0.418 1.000 Y NA
 5629200 5629201 Bsph_1161 Bsph_1162     TRUE 0.995 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 5629201 5629202 Bsph_1162 Bsph_1163     TRUE 0.997 -3.000 0.549 1.000 Y NA
 5629202 5629203 Bsph_1163 Bsph_1164     TRUE 0.984 -7.000 0.292 1.000   NA
 5629203 5629204 Bsph_1164 Bsph_1165     TRUE 0.966 5.000 0.156 1.000   NA
 5629204 5629205 Bsph_1165 Bsph_1166     TRUE 0.995 -10.000 0.235 1.000 Y NA
 5629205 5629206 Bsph_1166 Bsph_1167     FALSE 0.520 40.000 0.000 NA   NA
 5629206 5629207 Bsph_1167 Bsph_1169     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5629207 5629208 Bsph_1169 Bsph_1170     FALSE 0.501 68.000 0.043 NA   NA
 5629208 5629209 Bsph_1170 Bsph_1171   flaG FALSE 0.064 200.000 0.000 NA N NA
 5629209 5629210 Bsph_1171 Bsph_1172 flaG   TRUE 0.969 22.000 0.298 NA Y NA
 5629210 5629211 Bsph_1172 Bsph_1173     TRUE 0.640 29.000 0.019 NA   NA
 5629211 5629212 Bsph_1173 Bsph_1174   fliS FALSE 0.144 211.000 0.174 NA   NA
 5629212 5629213 Bsph_1174 Bsph_1175 fliS   FALSE 0.082 194.000 0.023 NA   NA
 5629213 5629214 Bsph_1175 Bsph_1176     FALSE 0.305 100.000 0.006 NA   NA
 5629214 5629215 Bsph_1176 Bsph_1177     FALSE 0.365 142.000 0.041 NA N NA
 5629215 5629216 Bsph_1177 Bsph_1178   comK FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5629216 5629217 Bsph_1178 Bsph_1179 comK   FALSE 0.035 220.000 0.000 NA   NA
 5629219 5629220 Bsph_1181 Bsph_1182     FALSE 0.008 326.000 0.000 NA   NA
 5629220 5629221 Bsph_1182 Bsph_1183     TRUE 0.995 8.000 0.154 0.001 Y NA
 5629221 5629222 Bsph_1183 Bsph_1184   yvlB FALSE 0.063 196.000 0.006 NA   NA
 5629222 5629223 Bsph_1184 Bsph_1185 yvlB ftsE FALSE 0.038 217.000 0.000 NA   NA
 5629223 5629224 Bsph_1185 Bsph_1186 ftsE ftsX TRUE 0.957 56.000 0.431 1.000 Y NA
 5629224 5629225 Bsph_1186 Bsph_1187 ftsX   TRUE 0.947 24.000 0.026 1.000 Y NA
 5629225 5629226 Bsph_1187 Bsph_1188     FALSE 0.011 292.000 0.000 NA   NA
 5629226 5629227 Bsph_1188 Bsph_1189     TRUE 0.976 -3.000 0.222 NA   NA
 5629227 5629228 Bsph_1189 Bsph_1190     FALSE 0.040 246.000 0.000 1.000 N NA
 5629228 5629229 Bsph_1190 Bsph_1191     TRUE 0.740 122.000 0.024 0.009   NA
 5629229 5629230 Bsph_1191 Bsph_1192     TRUE 0.956 0.000 0.094 NA   NA
 5629231 5629232 Bsph_1193 Bsph_1194     FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 5629232 5629233 Bsph_1194 Bsph_1195   ygaZ TRUE 0.981 -3.000 0.338 NA   NA
 5629234 5629235 Bsph_1196 Bsph_1197     TRUE 0.821 12.000 0.033 NA   NA
 5629235 5629236 Bsph_1197 Bsph_1198     FALSE 0.012 280.000 0.000 NA   NA
 5629236 5629237 Bsph_1198 Bsph_1199     TRUE 0.998 2.000 0.408 0.002 Y NA
 5629237 5629238 Bsph_1199 Bsph_1200     FALSE 0.330 101.000 0.015 NA   NA
 5629238 5629239 Bsph_1200 Bsph_1201     FALSE 0.448 128.000 0.070 NA   NA
 5629239 5629240 Bsph_1201 Bsph_1202     FALSE 0.225 187.000 0.141 NA   NA
 5629240 5629241 Bsph_1202 Bsph_1203     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5629241 5629242 Bsph_1203 Bsph_1204     TRUE 0.873 -34.000 0.000 NA   NA
 5629243 5629244 Bsph_1205 Bsph_1206 yitS yitU FALSE 0.223 145.000 0.000 NA   NA
 5629244 5629245 Bsph_1206 Bsph_1207 yitU   TRUE 0.753 63.000 0.000 0.077   NA
 5629246 5629247 Bsph_1208 Bsph_1209     TRUE 0.867 33.000 0.303 NA   NA
 5629251 5629252 Bsph_1213 Bsph_1214     TRUE 0.992 10.000 0.076 0.001 Y NA
 5629254 5629255 Bsph_1216 Bsph_1217   mecA FALSE 0.009 436.000 0.063 NA N NA
 5629257 5629258 Bsph_1219 Bsph_1220     TRUE 0.828 54.000 0.398 NA   NA
 5629259 5629260 Bsph_1221 Bsph_1222   yjbI TRUE 0.967 -7.000 0.138 NA   NA
 5629260 5629261 Bsph_1222 Bsph_1223 yjbI   FALSE 0.047 220.000 0.024 NA   NA
 5629261 5629262 Bsph_1223 Bsph_1224     TRUE 0.749 56.000 0.188 NA   NA
 5629263 5629264 Bsph_1225 Bsph_1226     TRUE 0.799 54.000 0.283 NA   NA
 5629264 5629265 Bsph_1226 Bsph_1227     TRUE 0.988 3.000 0.725 1.000   NA
 5629265 5629266 Bsph_1227 Bsph_1228     TRUE 0.932 29.000 0.480 1.000 N NA
 5629266 5629267 Bsph_1228 Bsph_1229     FALSE 0.242 140.000 0.000 NA   NA
 5629267 5629268 Bsph_1229 Bsph_1230     TRUE 0.890 -13.000 0.000 NA   NA
 5629268 5629269 Bsph_1230 Bsph_1231     TRUE 0.735 30.000 0.065 NA   NA
 5629271 5629272 Bsph_1233 Bsph_1234     TRUE 0.977 1.000 0.333 NA   NA
 5629272 5629273 Bsph_1234 Bsph_1235     TRUE 0.990 -6.000 1.000 NA   NA
 5629273 5629274 Bsph_1235 Bsph_1236     TRUE 0.952 17.000 1.000 NA   NA
 5629274 5629275 Bsph_1236 Bsph_1237     FALSE 0.387 66.000 0.000 NA   NA
 5629275 5629276 Bsph_1237 Bsph_1238     FALSE 0.249 137.000 0.000 NA   NA
 5629276 5629277 Bsph_1238 Bsph_1239     TRUE 0.930 4.000 0.069 NA   NA
 5629278 5629279 Bsph_1240 Bsph_1241     TRUE 0.940 4.000 0.028 1.000   NA
 5629279 5629280 Bsph_1241 Bsph_1242     TRUE 0.728 82.000 0.287 NA N NA
 5629282 5629283 Bsph_1244 Bsph_1245   yliD TRUE 0.983 13.000 0.833 0.035   NA
 5629283 5629284 Bsph_1245 Bsph_1246 yliD   TRUE 0.994 14.000 0.833 0.035 Y NA
 5629285 5629286 Bsph_1247 Bsph_1248 yliA   FALSE 0.006 563.000 0.000 1.000   NA
 5629286 5629287 Bsph_1248 Bsph_1249     FALSE 0.008 427.000 0.000 1.000   NA
 5629287 5629288 Bsph_1249 Bsph_1250     TRUE 0.928 19.000 0.333 1.000   NA
 5629288 5629289 Bsph_1250 Bsph_1251     TRUE 0.998 -19.000 0.667 0.035 Y NA
 5629289 5629290 Bsph_1251 Bsph_1252   lplA TRUE 0.991 20.000 0.800 0.035 Y NA
 5629290 5629291 Bsph_1252 Bsph_1253 lplA   FALSE 0.469 172.000 0.400 NA   NA
 5629291 5629292 Bsph_1253 Bsph_1254     TRUE 0.931 -3.000 0.028 NA   NA
 5629292 5629293 Bsph_1254 Bsph_1255   yurK TRUE 0.611 70.000 0.028 1.000 N NA
 5629293 5629294 Bsph_1255 Bsph_1256 yurK   TRUE 0.766 72.000 0.182 1.000 N NA
 5629294 5629295 Bsph_1256 Bsph_1257     TRUE 0.996 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 5629295 5629296 Bsph_1257 Bsph_1258     TRUE 0.749 41.000 0.033 1.000 N NA
 5629296 5629297 Bsph_1258 Bsph_1259   glcK TRUE 0.636 67.000 0.033 1.000 N NA
 5629298 5629299 Bsph_1260 Bsph_1261 msmX   TRUE 0.735 83.000 0.321 NA N NA
 5629299 5629300 Bsph_1261 Bsph_1262     FALSE 0.004 487.000 0.000 NA N NA
 5629301 5629302 Bsph_1263 Bsph_1264     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5629302 5629303 Bsph_1264 Bsph_1265     TRUE 0.982 2.000 0.515 NA   NA
 5629303 5629304 Bsph_1265 Bsph_1266     TRUE 0.828 66.000 0.000 NA Y NA
 5629304 5629305 Bsph_1266 Bsph_1267     TRUE 0.856 11.000 0.036 NA N NA
 5629305 5629306 Bsph_1267 Bsph_1268   fhuB TRUE 0.946 96.000 0.877 1.000 Y NA
 5629306 5629307 Bsph_1268 Bsph_1269 fhuB fepC TRUE 0.994 6.000 0.657 1.000 Y NA
 5629307 5629308 Bsph_1269 Bsph_1270 fepC   TRUE 0.982 -3.000 0.373 NA   NA
 5629310 5629311 Bsph_1272 Bsph_1273     FALSE 0.480 187.000 1.000 NA   NA
 5629311 5629312 Bsph_1273 Bsph_1274     TRUE 0.718 78.000 0.154 1.000   NA
 5629312 5629313 Bsph_1274 Bsph_1275     TRUE 0.945 -3.000 0.054 NA   NA
 5629313 5629314 Bsph_1275 Bsph_1276     FALSE 0.379 126.000 0.036 NA   NA
 5629314 5629315 Bsph_1276 Bsph_1277     FALSE 0.356 187.000 0.024 0.034 N NA
 5629315 5629316 Bsph_1277 Bsph_1278     FALSE 0.427 140.000 0.024 1.000   NA
 5629318 5629319 Bsph_1280 Bsph_1281     FALSE 0.019 309.000 0.000 1.000 N NA
 5629319 5629320 Bsph_1281 Bsph_1282     TRUE 0.643 135.000 0.003 0.036 N NA
 5629320 5629321 Bsph_1282 Bsph_1283     FALSE 0.078 193.000 0.003 NA N NA
 5629321 5629322 Bsph_1283 Bsph_1284     TRUE 0.656 123.000 0.217 NA N NA
 5629322 5629323 Bsph_1284 Bsph_1285     FALSE 0.008 339.000 0.000 NA N NA
 5629323 5629324 Bsph_1285 Bsph_1286     FALSE 0.349 146.000 0.000 1.000   NA
 5629328 5629329 Bsph_1290 Bsph_1291     TRUE 0.629 121.000 0.087 1.000 N NA
 5629330 5629331 Bsph_1292 Bsph_1293     FALSE 0.373 69.000 0.000 NA   NA
 5629331 5629332 Bsph_1293 Bsph_1294     TRUE 0.800 62.000 0.375 NA   NA
 5629332 5629333 Bsph_1294 Bsph_1295     FALSE 0.463 80.000 0.048 NA   NA
 5629334 5629335 Bsph_1296 Bsph_1297     FALSE 0.446 117.000 0.057 NA   NA
 5629335 5629336 Bsph_1297 Bsph_1298     FALSE 0.013 274.000 0.000 NA   NA
 5629338 5629339 Bsph_1300 Bsph_1301     FALSE 0.043 211.000 0.000 NA   NA
 5629339 5629340 Bsph_1301 Bsph_1302   cheV FALSE 0.574 66.000 0.015 1.000   NA
 5629340 5629341 Bsph_1302 Bsph_1303 cheV   FALSE 0.474 140.000 0.033 1.000 N NA
 5629341 5629342 Bsph_1303 Bsph_1304     TRUE 0.991 -10.000 0.056 1.000 Y NA
 5629342 5629343 Bsph_1304 Bsph_1305     TRUE 0.751 30.000 0.004 1.000 N NA
 5629345 5629346 Bsph_1307 Bsph_1308   mmsA TRUE 0.982 8.000 0.091 0.001 N NA
 5629346 5629347 Bsph_1308 Bsph_1309 mmsA   TRUE 0.696 77.000 0.105 1.000 N NA
 5629347 5629348 Bsph_1309 Bsph_1310     TRUE 0.923 13.000 0.105 1.000 N NA
 5629348 5629349 Bsph_1310 Bsph_1311     TRUE 0.962 17.000 0.286 0.076 N NA
 5629349 5629350 Bsph_1311 Bsph_1312     FALSE 0.585 154.000 0.021 0.035 N NA
 5629350 5629351 Bsph_1312 Bsph_1313     FALSE 0.462 64.000 0.021 NA   NA
 5629351 5629352 Bsph_1313 Bsph_1314     FALSE 0.068 199.000 0.017 NA   NA
 5629352 5629353 Bsph_1314 Bsph_1315   ykuM TRUE 0.712 69.000 0.214 NA   NA
 5629353 5629354 Bsph_1315 Bsph_1316 ykuM   FALSE 0.138 185.000 0.045 NA   NA
 5629354 5629355 Bsph_1316 Bsph_1317   ybhF TRUE 0.959 3.000 0.150 NA   NA
 5629355 5629356 Bsph_1317 Bsph_1318 ybhF   TRUE 0.982 -3.000 0.350 NA   NA
 5629356 5629357 Bsph_1318 Bsph_1319     TRUE 0.926 13.000 0.250 NA   NA
 5629357 5629358 Bsph_1319 Bsph_1320     TRUE 0.938 12.000 0.286 NA   NA
 5629358 5629359 Bsph_1320 Bsph_1321     TRUE 0.983 -3.000 0.412 NA   NA
 5629359 5629360 Bsph_1321 Bsph_1322     TRUE 0.754 12.000 0.000 NA   NA
 5629360 5629361 Bsph_1322 Bsph_1323     TRUE 0.886 -16.000 0.000 NA   NA
 5629361 5629362 Bsph_1323 Bsph_1324     FALSE 0.578 104.000 0.143 NA   NA
 5629363 5629364 Bsph_1325 Bsph_1326     FALSE 0.052 202.000 0.000 NA   NA
 5629364 5629365 Bsph_1326 Bsph_1327     FALSE 0.008 490.000 0.000 1.000 N NA
 5629365 5629366 Bsph_1327 Bsph_1328     TRUE 0.997 -3.000 0.253 0.034 Y NA
 5629366 5629367 Bsph_1328 Bsph_1329   potB TRUE 0.956 105.000 0.492 0.034 Y NA
 5629367 5629368 Bsph_1329 Bsph_1330 potB potA TRUE 0.976 -10.000 0.000 0.042   NA
 5629368 5629369 Bsph_1330 Bsph_1331 potA   FALSE 0.520 173.000 0.000 0.001   NA
 5629369 5629370 Bsph_1331 Bsph_1332     TRUE 0.930 18.000 0.326 1.000   NA
 5629371 5629372 Bsph_1333 Bsph_1334     TRUE 0.679 180.000 0.006 0.035 Y NA
 5629372 5629373 Bsph_1334 Bsph_1335   ykqB FALSE 0.429 151.000 0.041 1.000 N NA
 5629373 5629374 Bsph_1335 Bsph_1336 ykqB   TRUE 0.878 7.000 0.041 NA   NA
 5629374 5629375 Bsph_1336 Bsph_1337     FALSE 0.232 158.000 0.028 NA   NA
 5629375 5629376 Bsph_1337 Bsph_1338     TRUE 0.898 127.000 0.028 0.022 Y NA
 5629376 5629377 Bsph_1338 Bsph_1339   mccF TRUE 0.878 16.000 0.133 NA N NA
 5629378 5629379 Bsph_1340 Bsph_1341 rimL   FALSE 0.571 137.000 0.200 NA   NA
 5629379 5629380 Bsph_1341 Bsph_1342     FALSE 0.316 135.000 0.025 NA   NA
 5629381 5629382 Bsph_1343 Bsph_1344     TRUE 0.998 1.000 1.000 0.083 Y NA
 5629382 5629383 Bsph_1344 Bsph_1345     FALSE 0.079 188.000 0.000 NA   NA
 5629388 5629389 Bsph_1350 Bsph_1351   ykqC FALSE 0.015 322.000 0.000 1.000   NA
 5629389 5629390 Bsph_1351 Bsph_1352 ykqC   TRUE 0.973 6.000 0.576 NA   NA
 5629390 5629391 Bsph_1352 Bsph_1353     FALSE 0.228 144.000 0.000 NA   NA
 5629391 5629392 Bsph_1353 Bsph_1354     TRUE 0.869 -48.000 0.000 NA   NA
 5629395 5629396 Bsph_1357 Bsph_1358 potA fbpB TRUE 0.992 -7.000 0.875 1.000 N NA
 5629396 5629397 Bsph_1358 Bsph_1359 fbpB   TRUE 0.994 -3.000 0.429 0.034 N NA
 5629397 5629398 Bsph_1359 Bsph_1360     TRUE 0.906 14.000 0.086 1.000 N NA
 5629398 5629399 Bsph_1360 Bsph_1361   phnX TRUE 0.984 -10.000 0.315 1.000   NA
 5629401 5629402 Bsph_1363 Bsph_1364     TRUE 0.998 4.000 0.484 0.001 Y NA
 5629402 5629403 Bsph_1364 Bsph_1365     TRUE 0.983 48.000 0.883 0.076 Y NA
 5629403 5629404 Bsph_1365 Bsph_1366     TRUE 0.995 6.000 0.948 1.000 Y NA
 5629404 5629405 Bsph_1366 Bsph_1367     FALSE 0.528 122.000 0.026 1.000 N NA
 5629406 5629407 Bsph_1368 Bsph_1369     TRUE 0.937 18.000 0.667 NA   NA
 5629407 5629408 Bsph_1369 Bsph_1370     TRUE 0.770 95.000 0.600 NA   NA
 5629408 5629409 Bsph_1370 Bsph_1371   citT FALSE 0.584 150.000 0.182 1.000   NA
 5629409 5629410 Bsph_1371 Bsph_1372 citT   TRUE 0.997 -7.000 0.818 1.000 Y NA
 5629411 5629412 Bsph_1373 Bsph_1374     TRUE 0.991 -7.000 0.727 1.000   NA
 5629413 5629414 Bsph_1375 Bsph_1376     FALSE 0.008 451.000 0.000 1.000   NA
 5629415 5629416 Bsph_1377 Bsph_1378     TRUE 0.822 21.000 0.108 NA   NA
 5629418 5629419 Bsph_1380 Bsph_1381     FALSE 0.022 238.000 0.000 NA   NA
 5629421 5629422 Bsph_1383 Bsph_1384 typA ylaH FALSE 0.383 123.000 0.032 NA   NA
 5629422 5629423 Bsph_1384 Bsph_1385 ylaH   FALSE 0.093 191.000 0.023 NA   NA
 5629423 5629424 Bsph_1385 Bsph_1386   nrtD TRUE 0.995 0.000 0.528 NA Y NA
 5629424 5629425 Bsph_1386 Bsph_1387 nrtD ssuC TRUE 0.997 -7.000 0.876 1.000 Y NA
 5629426 5629427 Bsph_1388 Bsph_1389     TRUE 0.919 12.000 0.173 NA   NA
 5629428 5629429 Bsph_1390 Bsph_1391     TRUE 0.775 63.000 0.300 NA   NA
 5629429 5629430 Bsph_1391 Bsph_1392     TRUE 0.893 13.000 0.046 1.000 N NA
 5629430 5629431 Bsph_1392 Bsph_1393     FALSE 0.003 606.000 0.000 NA   NA
 5629433 5629434 Bsph_1395 Bsph_1396 ctaB   FALSE 0.294 101.000 0.000 NA   NA
 5629434 5629435 Bsph_1396 Bsph_1398     FALSE 0.515 41.000 0.000 NA   NA
 5629435 5629436 Bsph_1398 Bsph_1399     TRUE 0.999 0.000 0.925 0.001 Y NA
 5629436 5629437 Bsph_1399 Bsph_1400   ctaF TRUE 0.978 91.000 0.950 0.001 Y NA
 5629437 5629438 Bsph_1400 Bsph_1401 ctaF   FALSE 0.454 184.000 0.707 NA   NA
 5629438 5629439 Bsph_1401 Bsph_1402     TRUE 0.869 41.000 0.415 NA   NA
 5629440 5629441 Bsph_1403 Bsph_1404   ylbA FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 5629442 5629443 Bsph_1405 Bsph_1406     FALSE 0.081 188.000 0.004 NA   NA
 5629449 5629450 Bsph_1412 Bsph_1413     FALSE 0.492 45.000 0.003 NA   NA
 5629450 5629451 Bsph_1413 Bsph_1414     TRUE 0.984 2.000 0.367 1.000 N NA
 5629455 5629456 Bsph_1418 Bsph_1419     TRUE 0.921 25.000 0.599 NA   NA
 5629456 5629457 Bsph_1419 Bsph_1420     FALSE 0.486 125.000 0.010 1.000 N NA
 5629457 5629458 Bsph_1420 Bsph_1421     FALSE 0.543 131.000 0.069 1.000   NA
 5629458 5629459 Bsph_1421 Bsph_1422     FALSE 0.148 188.000 0.008 1.000   NA
 5629459 5629460 Bsph_1422 Bsph_1423     FALSE 0.084 219.000 0.091 NA   NA
 5629460 5629461 Bsph_1423 Bsph_1424     FALSE 0.033 274.000 0.099 NA   NA
 5629461 5629462 Bsph_1424 Bsph_1425     FALSE 0.021 262.000 0.025 NA   NA
 5629462 5629463 Bsph_1425 Bsph_1426     TRUE 0.840 63.000 0.635 NA   NA
 5629463 5629464 Bsph_1426 Bsph_1427     TRUE 0.968 1.000 0.077 1.000 N NA
 5629464 5629465 Bsph_1427 Bsph_1428     TRUE 0.986 -3.000 0.316 1.000 N NA
 5629465 5629466 Bsph_1428 Bsph_1429     TRUE 0.972 58.000 0.157 0.001 Y NA
 5629466 5629467 Bsph_1429 Bsph_1430     FALSE 0.285 126.000 0.000 NA   NA
 5629467 5629468 Bsph_1430 Bsph_1432     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5629468 5629469 Bsph_1432 Bsph_1433     TRUE 0.986 -10.000 0.008 0.001   NA
 5629469 5629470 Bsph_1433 Bsph_1434     TRUE 0.910 41.000 0.067 0.005 N NA
 5629470 5629471 Bsph_1434 Bsph_1435     FALSE 0.357 126.000 0.015 NA N NA
 5629471 5629472 Bsph_1435 Bsph_1436   ylxW TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5629472 5629473 Bsph_1436 Bsph_1437 ylxW ylxX FALSE 0.264 132.000 0.000 NA   NA
 5629473 5629474 Bsph_1437 Bsph_1438 ylxX   TRUE 0.958 4.000 0.165 NA   NA
 5629474 5629475 Bsph_1438 Bsph_1439   ftsA FALSE 0.459 96.000 0.062 NA   NA
 5629475 5629476 Bsph_1439 Bsph_1440 ftsA ftsZ TRUE 0.842 54.000 0.460 NA   NA
 5629476 5629477 Bsph_1440 Bsph_1441 ftsZ ftsZ TRUE 0.880 -34.000 0.006 NA   NA
 5629477 5629478 Bsph_1441 Bsph_1442 ftsZ   FALSE 0.024 296.000 0.024 1.000   NA
 5629478 5629479 Bsph_1442 Bsph_1443     TRUE 0.838 107.000 0.856 1.000   NA
 5629479 5629480 Bsph_1443 Bsph_1444     TRUE 0.965 115.000 0.602 0.009 Y NA
 5629480 5629481 Bsph_1444 Bsph_1445     FALSE 0.540 153.000 0.276 NA   NA
 5629481 5629482 Bsph_1445 Bsph_1446   ylmE FALSE 0.342 78.000 0.004 NA   NA
 5629482 5629483 Bsph_1446 Bsph_1447 ylmE   TRUE 0.971 -10.000 0.194 NA   NA
 5629483 5629484 Bsph_1447 Bsph_1448     TRUE 0.706 108.000 0.370 NA   NA
 5629484 5629485 Bsph_1448 Bsph_1449     FALSE 0.147 233.000 0.287 1.000   NA
 5629485 5629486 Bsph_1449 Bsph_1450   divIVA TRUE 0.765 96.000 0.579 NA   NA
 5629486 5629487 Bsph_1450 Bsph_1451 divIVA   FALSE 0.006 441.000 0.012 NA N NA
 5629489 5629490 Bsph_1453 Bsph_1454     TRUE 0.751 23.000 0.057 NA   NA
 5629490 5629491 Bsph_1454 Bsph_1455     TRUE 0.959 11.000 0.500 NA   NA
 5629491 5629492 Bsph_1455 Bsph_1456   lspA TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5629492 5629493 Bsph_1456 Bsph_1457 lspA   TRUE 0.981 -49.000 0.000 0.001   NA
 5629493 5629494 Bsph_1457 Bsph_1458     TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000   NA
 5629494 5629495 Bsph_1458 Bsph_1459     FALSE 0.138 206.000 0.048 1.000 N NA
 5629495 5629496 Bsph_1459 Bsph_1460     TRUE 0.976 15.000 0.140 1.000 Y NA
 5629496 5629497 Bsph_1460 Bsph_1461     FALSE 0.520 190.000 0.064 1.000 Y NA
 5629497 5629498 Bsph_1461 Bsph_1462     TRUE 0.995 2.000 0.452 1.000 Y NA
 5629498 5629499 Bsph_1462 Bsph_1463     TRUE 0.994 0.000 0.155 1.000 Y NA
 5629499 5629500 Bsph_1463 Bsph_1464     TRUE 0.997 -7.000 0.117 0.001 Y NA
 5629500 5629501 Bsph_1464 Bsph_1465     TRUE 0.975 2.000 0.147 1.000 N NA
 5629501 5629502 Bsph_1465 Bsph_1466     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5629502 5629503 Bsph_1466 Bsph_1468     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5629503 5629504 Bsph_1468 Bsph_1469     TRUE 0.993 1.000 0.133 1.000 Y NA
 5629506 5629507 Bsph_1471 Bsph_1472 oppD oppF TRUE 0.995 -3.000 0.477 0.006   NA
 5629507 5629508 Bsph_1472 Bsph_1473 oppF oppB TRUE 0.988 2.000 0.727 1.000   NA
 5629508 5629509 Bsph_1473 Bsph_1474 oppB oppC TRUE 0.987 37.000 0.727 0.034 Y NA
 5629509 5629510 Bsph_1474 Bsph_1475 oppC oppA TRUE 0.983 17.000 0.122 0.034 Y NA
 5629511 5629512 Bsph_1476 Bsph_1477 oppF oppD TRUE 0.990 -7.000 0.125 0.006   NA
 5629512 5629513 Bsph_1477 Bsph_1478 oppD oppC TRUE 0.995 5.000 0.667 1.000 Y NA
 5629513 5629514 Bsph_1478 Bsph_1479 oppC oppB TRUE 0.998 0.000 0.545 0.034 Y NA
 5629514 5629515 Bsph_1479 Bsph_1480 oppB oppA FALSE 0.459 211.000 0.000 0.034 Y NA
 5629515 5629516 Bsph_1480 Bsph_1481 oppA tlpA FALSE 0.006 910.000 0.000 1.000 N NA
 5629516 5629517 Bsph_1481 Bsph_1482 tlpA   FALSE 0.020 253.000 0.000 NA N NA
 5629518 5629519 Bsph_1483 Bsph_1484     TRUE 0.828 44.000 0.276 NA   NA
 5629519 5629520 Bsph_1484 Bsph_1485     TRUE 0.984 4.000 0.471 1.000 N NA
 5629520 5629521 Bsph_1485 Bsph_1486   coaBC TRUE 0.721 89.000 0.192 1.000   NA
 5629521 5629522 Bsph_1486 Bsph_1487 coaBC   TRUE 0.974 -3.000 0.099 1.000   NA
 5629522 5629523 Bsph_1487 Bsph_1488     TRUE 0.688 54.000 0.029 1.000 N NA
 5629523 5629524 Bsph_1488 Bsph_1489     TRUE 0.994 2.000 0.031 0.021 Y NA
 5629524 5629525 Bsph_1489 Bsph_1490     TRUE 0.996 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 5629525 5629526 Bsph_1490 Bsph_1491   yloN TRUE 0.976 0.000 0.135 1.000   NA
 5629526 5629527 Bsph_1491 Bsph_1492 yloN   TRUE 0.963 4.000 0.105 1.000   NA
 5629527 5629528 Bsph_1492 Bsph_1493     TRUE 0.996 3.000 0.704 1.000 Y NA
 5629528 5629529 Bsph_1493 Bsph_1494     TRUE 0.945 12.000 0.196 1.000   NA
 5629529 5629530 Bsph_1494 Bsph_1495     TRUE 0.976 3.000 0.213 1.000   NA
 5629530 5629531 Bsph_1495 Bsph_1496     TRUE 0.954 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5629532 5629533 Bsph_1497 Bsph_1498   kdgR FALSE 0.033 251.000 0.000 1.000   NA
 5629534 5629535 Bsph_1499 Bsph_1500     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5629535 5629536 Bsph_1500 Bsph_1502     FALSE 0.297 111.000 0.000 NA   NA
 5629536 5629537 Bsph_1502 Bsph_1503     TRUE 0.939 38.000 0.062 1.000 Y NA
 5629537 5629538 Bsph_1503 Bsph_1504     FALSE 0.005 383.000 0.000 NA   NA
 5629538 5629539 Bsph_1504 Bsph_1505     TRUE 0.928 19.000 0.567 NA   NA
 5629539 5629540 Bsph_1505 Bsph_1506     FALSE 0.017 353.000 0.045 1.000   NA
 5629540 5629541 Bsph_1506 Bsph_1507     TRUE 0.868 -49.000 0.000 NA   NA
 5629541 5629542 Bsph_1507 Bsph_1508     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5629542 5629543 Bsph_1508 Bsph_1509   yofA FALSE 0.341 163.000 0.029 1.000 N NA
 5629543 5629544 Bsph_1509 Bsph_1510 yofA   TRUE 0.682 89.000 0.250 NA   NA
 5629544 5629545 Bsph_1510 Bsph_1511     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5629545 5629546 Bsph_1511 Bsph_1512     TRUE 0.965 13.000 1.000 NA   NA
 5629546 5629547 Bsph_1512 Bsph_1513     TRUE 0.930 34.000 0.667 1.000   NA
 5629547 5629548 Bsph_1513 Bsph_1514     FALSE 0.477 112.000 0.000 1.000 N NA
 5629548 5629549 Bsph_1514 Bsph_1515     TRUE 0.731 124.000 0.225 1.000 N NA
 5629549 5629550 Bsph_1515 Bsph_1516   plsX TRUE 0.952 3.000 0.035 1.000 N NA
 5629550 5629551 Bsph_1516 Bsph_1517 plsX   TRUE 0.984 18.000 0.106 0.005 Y NA
 5629551 5629552 Bsph_1517 Bsph_1518     TRUE 0.948 -7.000 0.008 1.000   NA
 5629552 5629553 Bsph_1518 Bsph_1519   fabG TRUE 0.978 -7.000 0.149 1.000   NA
 5629553 5629554 Bsph_1519 Bsph_1520 fabG   TRUE 0.967 50.000 0.100 0.005 Y NA
 5629554 5629555 Bsph_1520 Bsph_1521     FALSE 0.017 253.000 0.000 NA   NA
 5629555 5629556 Bsph_1521 Bsph_1522     FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5629556 5629557 Bsph_1522 Bsph_1523     TRUE 0.968 4.000 0.120 1.000 N NA
 5629557 5629558 Bsph_1523 Bsph_1524   ftsY TRUE 0.989 3.000 0.165 0.011 N NA
 5629558 5629559 Bsph_1524 Bsph_1525 ftsY   FALSE 0.027 327.000 0.081 1.000   NA
 5629559 5629560 Bsph_1525 Bsph_1526     TRUE 0.930 13.000 0.151 1.000   NA
 5629560 5629561 Bsph_1526 Bsph_1527     TRUE 0.784 95.000 0.361 1.000 N NA
 5629561 5629562 Bsph_1527 Bsph_1528     TRUE 0.943 16.000 0.385 1.000   NA
 5629562 5629563 Bsph_1528 Bsph_1529   rimM FALSE 0.039 369.000 0.324 1.000   NA
 5629563 5629564 Bsph_1529 Bsph_1530 rimM   TRUE 0.997 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5629564 5629565 Bsph_1530 Bsph_1531     TRUE 0.933 117.000 0.567 1.000 Y NA
 5629565 5629566 Bsph_1531 Bsph_1532     FALSE 0.511 106.000 0.020 1.000 N NA
 5629566 5629567 Bsph_1532 Bsph_1533     TRUE 0.676 58.000 0.049 1.000   NA
 5629567 5629568 Bsph_1533 Bsph_1534     FALSE 0.529 155.000 0.148 1.000   NA
 5629568 5629569 Bsph_1534 Bsph_1535     TRUE 0.607 33.000 0.016 NA   NA
 5629569 5629570 Bsph_1535 Bsph_1536     TRUE 0.965 -3.000 0.115 NA   NA
 5629570 5629571 Bsph_1536 Bsph_1537     FALSE 0.415 148.000 0.038 1.000   NA
 5629571 5629572 Bsph_1537 Bsph_1538     TRUE 0.989 18.000 0.173 0.001 Y NA
 5629572 5629573 Bsph_1538 Bsph_1539     FALSE 0.328 168.000 0.037 1.000 N NA
 5629573 5629574 Bsph_1539 Bsph_1540     FALSE 0.313 92.000 0.000 NA   NA
 5629574 5629575 Bsph_1540 Bsph_1542     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5629575 5629576 Bsph_1542 Bsph_1543     FALSE 0.049 286.000 0.105 1.000 N NA
 5629576 5629577 Bsph_1543 Bsph_1544     TRUE 0.882 22.000 0.113 1.000 N NA
 5629577 5629578 Bsph_1544 Bsph_1545   hslU TRUE 0.997 0.000 0.752 1.000 Y NA
 5629578 5629579 Bsph_1545 Bsph_1546 hslU   TRUE 0.698 88.000 0.131 1.000 N NA
 5629579 5629580 Bsph_1546 Bsph_1547   flgB FALSE 0.009 581.000 0.037 1.000 N NA
 5629580 5629581 Bsph_1547 Bsph_1548 flgB flgC TRUE 0.998 4.000 0.804 0.003 Y NA
 5629581 5629582 Bsph_1548 Bsph_1549 flgC fliE TRUE 0.974 48.000 0.156 0.003 Y NA
 5629582 5629583 Bsph_1549 Bsph_1550 fliE   TRUE 0.946 118.000 0.164 0.004 Y NA
 5629583 5629584 Bsph_1550 Bsph_1551   fliG TRUE 0.992 16.000 0.477 0.004 Y NA
 5629584 5629585 Bsph_1551 Bsph_1552 fliG fliH TRUE 0.862 65.000 0.048 NA Y NA
 5629585 5629586 Bsph_1552 Bsph_1553 fliH   TRUE 0.986 6.000 0.152 NA Y NA
 5629586 5629587 Bsph_1553 Bsph_1554     TRUE 0.994 1.000 0.241 1.000 Y NA
 5629587 5629588 Bsph_1554 Bsph_1555     TRUE 0.956 5.000 0.095 1.000   NA
 5629588 5629589 Bsph_1555 Bsph_1556     TRUE 0.911 25.000 0.267 1.000   NA
 5629589 5629590 Bsph_1556 Bsph_1557     TRUE 0.992 4.000 0.304 NA Y NA
 5629590 5629591 Bsph_1557 Bsph_1558     TRUE 0.850 16.000 0.105 NA   NA
 5629591 5629592 Bsph_1558 Bsph_1559   flgG TRUE 0.615 87.000 0.148 NA   NA
 5629592 5629593 Bsph_1559 Bsph_1560 flgG   TRUE 0.822 105.000 0.077 NA Y NA
 5629593 5629594 Bsph_1560 Bsph_1561     TRUE 0.988 5.000 0.149 NA Y NA
 5629594 5629595 Bsph_1561 Bsph_1562   fliM TRUE 0.988 32.000 0.323 0.001 Y NA
 5629595 5629596 Bsph_1562 Bsph_1563 fliM fliY TRUE 0.999 -7.000 0.508 0.001 Y NA
 5629596 5629597 Bsph_1563 Bsph_1564 fliY cheY TRUE 0.989 7.000 0.203 1.000 Y NA
 5629597 5629598 Bsph_1564 Bsph_1565 cheY fliZ TRUE 0.961 5.000 0.101 1.000 N NA
 5629598 5629599 Bsph_1565 Bsph_1566 fliZ fliP TRUE 0.996 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 5629599 5629600 Bsph_1566 Bsph_1567 fliP fliQ TRUE 0.991 14.000 0.206 0.003 Y NA
 5629600 5629601 Bsph_1567 Bsph_1568 fliQ fliR TRUE 0.998 5.000 0.817 0.002 Y NA
 5629601 5629602 Bsph_1568 Bsph_1569 fliR flhB TRUE 0.996 2.000 0.750 1.000 Y NA
 5629602 5629603 Bsph_1569 Bsph_1570 flhB flhA TRUE 0.986 25.000 0.203 0.003 Y NA
 5629603 5629604 Bsph_1570 Bsph_1571 flhA flhF TRUE 0.996 0.000 0.440 1.000 Y NA
 5629604 5629605 Bsph_1571 Bsph_1572 flhF   TRUE 0.988 -3.000 0.382 1.000 N NA
 5629605 5629606 Bsph_1572 Bsph_1573     TRUE 0.977 1.000 0.153 1.000 N NA
 5629606 5629607 Bsph_1573 Bsph_1574   cheA TRUE 0.991 16.000 0.390 0.016 Y NA
 5629607 5629608 Bsph_1574 Bsph_1575 cheA cheW TRUE 0.983 27.000 0.184 0.016 Y NA
 5629608 5629609 Bsph_1575 Bsph_1576 cheW   TRUE 0.982 10.000 0.180 NA Y NA
 5629609 5629610 Bsph_1576 Bsph_1577     TRUE 0.996 0.000 0.606 NA Y NA
 5629610 5629611 Bsph_1577 Bsph_1578     FALSE 0.162 174.000 0.028 NA   NA
 5629611 5629612 Bsph_1578 Bsph_1579     FALSE 0.003 660.000 0.008 NA   NA
 5629612 5629613 Bsph_1579 Bsph_1580     TRUE 0.655 24.000 0.017 NA   NA
 5629613 5629614 Bsph_1580 Bsph_1581     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5629614 5629615 Bsph_1581 Bsph_1582     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5629615 5629616 Bsph_1582 Bsph_1583     FALSE 0.144 172.000 0.012 NA   NA
 5629616 5629617 Bsph_1583 Bsph_1584     TRUE 0.939 103.000 0.748 1.000 Y NA
 5629617 5629618 Bsph_1584 Bsph_1585     FALSE 0.275 215.000 0.416 1.000 N NA
 5629618 5629619 Bsph_1585 Bsph_1586     TRUE 0.990 0.000 0.626 1.000 N NA
 5629619 5629620 Bsph_1586 Bsph_1587     TRUE 0.835 49.000 0.009 0.021   NA
 5629620 5629621 Bsph_1587 Bsph_1588     FALSE 0.067 316.000 0.409 1.000   NA
 5629621 5629622 Bsph_1588 Bsph_1589     TRUE 0.994 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 5629622 5629623 Bsph_1589 Bsph_1590     TRUE 0.905 63.000 0.071 1.000 Y NA
 5629623 5629624 Bsph_1590 Bsph_1591     TRUE 0.907 47.000 0.568 1.000 N NA
 5629624 5629625 Bsph_1591 Bsph_1592     FALSE 0.524 149.000 0.095 1.000 N NA
 5629625 5629626 Bsph_1592 Bsph_1593     FALSE 0.320 198.000 0.070 0.035 N NA
 5629626 5629627 Bsph_1593 Bsph_1594   ylxS FALSE 0.013 341.000 0.059 NA   NA
 5629627 5629628 Bsph_1594 Bsph_1595 ylxS nusA TRUE 0.923 31.000 0.759 NA   NA
 5629628 5629629 Bsph_1595 Bsph_1596 nusA   TRUE 0.866 137.000 0.323 NA Y NA
 5629629 5629630 Bsph_1596 Bsph_1597   ylxQ TRUE 0.984 -3.000 0.408 NA N NA
 5629630 5629631 Bsph_1597 Bsph_1598 ylxQ   TRUE 0.980 15.000 0.223 1.000 Y NA
 5629631 5629632 Bsph_1598 Bsph_1599     TRUE 0.958 0.000 0.102 NA   NA
 5629632 5629633 Bsph_1599 Bsph_1600     TRUE 0.610 73.000 0.113 NA   NA
 5629633 5629634 Bsph_1600 Bsph_1601     TRUE 0.868 126.000 0.111 1.000 Y NA
 5629634 5629635 Bsph_1601 Bsph_1602   ribC TRUE 0.954 13.000 0.308 1.000 N NA
 5629635 5629636 Bsph_1602 Bsph_1603 ribC   FALSE 0.528 154.000 0.119 1.000 N NA
 5629638 5629639 Bsph_1604 Bsph_1606     FALSE 0.008 448.000 0.000 1.000   NA
 5629639 5629640 Bsph_1606 Bsph_1607     FALSE 0.556 123.000 0.057 1.000   NA
 5629642 5629643 Bsph_1609 Bsph_1610     TRUE 0.936 10.000 0.200 NA   NA
 5629643 5629644 Bsph_1610 Bsph_1611     TRUE 0.979 -6.000 0.153 1.000   NA
 5629644 5629645 Bsph_1611 Bsph_1612     FALSE 0.555 83.000 0.034 1.000   NA
 5629645 5629646 Bsph_1612 Bsph_1613     TRUE 0.967 14.000 0.038 1.000 Y NA
 5629646 5629647 Bsph_1613 Bsph_1614     FALSE 0.030 260.000 0.000 1.000   NA
 5629647 5629648 Bsph_1614 Bsph_1615     FALSE 0.360 154.000 0.026 1.000   NA
 5629648 5629649 Bsph_1615 Bsph_1616   ymfC FALSE 0.276 187.000 0.115 1.000   NA
 5629649 5629650 Bsph_1616 Bsph_1617 ymfC   TRUE 0.744 55.000 0.087 1.000   NA
 5629650 5629651 Bsph_1617 Bsph_1618     FALSE 0.013 420.000 0.048 1.000   NA
 5629651 5629652 Bsph_1618 Bsph_1619     TRUE 0.987 0.000 0.438 1.000   NA
 5629652 5629653 Bsph_1619 Bsph_1620     TRUE 0.994 2.000 0.720 0.034   NA
 5629653 5629654 Bsph_1620 Bsph_1621     FALSE 0.314 175.000 0.077 1.000   NA
 5629654 5629655 Bsph_1621 Bsph_1622     TRUE 0.996 -3.000 0.872 0.005   NA
 5629655 5629656 Bsph_1622 Bsph_1623     TRUE 0.986 0.000 0.397 1.000   NA
 5629656 5629657 Bsph_1623 Bsph_1624     TRUE 0.851 45.000 0.386 NA   NA
 5629657 5629658 Bsph_1624 Bsph_1625     FALSE 0.165 224.000 0.388 NA   NA
 5629658 5629659 Bsph_1625 Bsph_1626     TRUE 0.938 17.000 0.371 1.000   NA
 5629659 5629660 Bsph_1626 Bsph_1627     TRUE 0.829 30.000 0.077 1.000   NA
 5629660 5629661 Bsph_1627 Bsph_1628     TRUE 0.900 18.000 0.151 1.000   NA
 5629661 5629662 Bsph_1628 Bsph_1629     FALSE 0.087 231.000 0.083 1.000   NA
 5629662 5629663 Bsph_1629 Bsph_1630   ymdA FALSE 0.007 524.000 0.018 1.000   NA
 5629663 5629664 Bsph_1630 Bsph_1631 ymdA   FALSE 0.348 147.000 0.004 1.000   NA
 5629664 5629665 Bsph_1631 Bsph_1632     FALSE 0.046 209.000 0.000 NA   NA
 5629665 5629666 Bsph_1632 Bsph_1633   ywqC TRUE 0.826 70.000 0.667 NA   NA
 5629666 5629667 Bsph_1633 Bsph_1634 ywqC   TRUE 0.990 0.000 0.667 1.000 N NA
 5629667 5629668 Bsph_1634 Bsph_1635   yveP TRUE 0.912 11.000 0.047 1.000 N NA
 5629668 5629669 Bsph_1635 Bsph_1636 yveP   TRUE 0.887 128.000 0.000 0.014 Y NA
 5629669 5629670 Bsph_1636 Bsph_1637     TRUE 0.777 33.000 0.043 1.000   NA
 5629670 5629671 Bsph_1637 Bsph_1638     TRUE 0.941 0.000 0.056 NA   NA
 5629671 5629672 Bsph_1638 Bsph_1639     FALSE 0.308 119.000 0.005 NA   NA
 5629672 5629673 Bsph_1639 Bsph_1640     FALSE 0.268 179.000 0.139 NA   NA
 5629673 5629674 Bsph_1640 Bsph_1641   korA FALSE 0.016 259.000 0.000 NA   NA
 5629674 5629675 Bsph_1641 Bsph_1642 korA korB TRUE 0.998 0.000 0.437 0.001 Y NA
 5629675 5629676 Bsph_1642 Bsph_1643 korB   FALSE 0.278 128.000 0.000 NA   NA
 5629676 5629677 Bsph_1643 Bsph_1644     FALSE 0.021 240.000 0.000 NA   NA
 5629677 5629678 Bsph_1644 Bsph_1645     TRUE 0.924 -10.000 0.029 NA   NA
 5629678 5629679 Bsph_1645 Bsph_1646     FALSE 0.590 71.000 0.032 1.000   NA
 5629679 5629680 Bsph_1646 Bsph_1647     TRUE 0.995 -3.000 0.774 0.033   NA
 5629680 5629681 Bsph_1647 Bsph_1648   potA TRUE 0.996 -3.000 0.360 1.000 Y NA
 5629681 5629682 Bsph_1648 Bsph_1649 potA   TRUE 0.974 -3.000 0.083 1.000 N NA
 5629682 5629683 Bsph_1649 Bsph_1650     TRUE 0.960 0.000 0.033 1.000 N NA
 5629683 5629684 Bsph_1650 Bsph_1651     FALSE 0.539 78.000 0.022 1.000   NA
 5629684 5629685 Bsph_1651 Bsph_1652   ymcB FALSE 0.369 179.000 0.002 0.028   NA
 5629685 5629686 Bsph_1652 Bsph_1653 ymcB   TRUE 0.928 1.000 0.041 NA   NA
 5629686 5629687 Bsph_1653 Bsph_1654     TRUE 0.596 132.000 0.209 NA   NA
 5629687 5629688 Bsph_1654 Bsph_1655   mutS FALSE 0.351 128.000 0.027 NA   NA
 5629688 5629689 Bsph_1655 Bsph_1656 mutS mutL TRUE 0.985 34.000 0.220 0.001 Y NA
 5629689 5629690 Bsph_1656 Bsph_1657 mutL   TRUE 0.949 0.000 0.002 1.000 N NA
 5629690 5629691 Bsph_1657 Bsph_1658     TRUE 0.997 4.000 0.182 0.001 Y NA
 5629691 5629692 Bsph_1658 Bsph_1659     TRUE 0.729 22.000 0.029 NA N NA
 5629692 5629693 Bsph_1659 Bsph_1660     TRUE 0.927 -13.000 0.025 NA N NA
 5629693 5629694 Bsph_1660 Bsph_1661     FALSE 0.006 388.000 0.000 NA N NA
 5629696 5629697 Bsph_1663 Bsph_1664     FALSE 0.006 559.000 0.000 1.000   NA
 5629699 5629700 Bsph_1666 Bsph_1667   glnR FALSE 0.243 182.000 0.046 1.000 N NA
 5629700 5629701 Bsph_1667 Bsph_1668 glnR glnA TRUE 0.601 55.000 0.000 1.000   NA
 5629701 5629702 Bsph_1668 Bsph_1669 glnA glnA TRUE 0.922 26.000 0.000 0.001   NA
 5629704 5629705 Bsph_1671 Bsph_1672     FALSE 0.045 210.000 0.000 NA   NA
 5629705 5629706 Bsph_1672 Bsph_1674   cbrC TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5629706 5629707 Bsph_1674 Bsph_1675 cbrC cbrD TRUE 0.948 27.000 0.039 1.000 Y NA
 5629707 5629708 Bsph_1675 Bsph_1676 cbrD   FALSE 0.540 105.000 0.111 NA   NA
 5629708 5629709 Bsph_1676 Bsph_1677     FALSE 0.005 395.000 0.000 NA   NA
 5629710 5629711 Bsph_1678 Bsph_1679   icaC FALSE 0.166 183.000 0.062 NA   NA
 5629712 5629713 Bsph_1680 Bsph_1681     FALSE 0.428 82.000 0.034 NA   NA
 5629713 5629714 Bsph_1681 Bsph_1682   comC FALSE 0.015 265.000 0.000 NA   NA
 5629714 5629715 Bsph_1682 Bsph_1683 comC yvdE TRUE 0.769 20.000 0.005 1.000   NA
 5629717 5629718 Bsph_1685 Bsph_1686     TRUE 0.937 -3.000 0.038 NA   NA
 5629719 5629720 Bsph_1687 Bsph_1688     TRUE 0.763 144.000 0.017 1.000 Y NA
 5629721 5629722 Bsph_1689 Bsph_1690     FALSE 0.479 126.000 0.080 NA   NA
 5629723 5629724 Bsph_1691 Bsph_1692     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 5629724 5629725 Bsph_1692 Bsph_1693   vraS TRUE 0.998 -7.000 0.853 0.023 Y NA
 5629725 5629726 Bsph_1693 Bsph_1694 vraS   TRUE 0.988 -3.000 0.679 NA   NA
 5629726 5629727 Bsph_1694 Bsph_1695     FALSE 0.341 176.000 0.210 NA   NA
 5629727 5629728 Bsph_1695 Bsph_1696     TRUE 0.937 16.000 0.514 NA   NA
 5629729 5629730 Bsph_1697 Bsph_1698     TRUE 0.662 82.000 0.197 NA   NA
 5629730 5629731 Bsph_1698 Bsph_1699   luxS FALSE 0.228 144.000 0.000 NA   NA
 5629733 5629734 Bsph_1701 Bsph_1702     TRUE 0.859 14.000 0.095 NA   NA
 5629734 5629735 Bsph_1702 Bsph_1703     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5629736 5629737 Bsph_1704 Bsph_1705     FALSE 0.566 54.000 0.040 NA   NA
 5629738 5629739 Bsph_1706 Bsph_1707     FALSE 0.459 53.000 0.004 NA   NA
 5629739 5629740 Bsph_1707 Bsph_1708     FALSE 0.169 172.000 0.027 NA   NA
 5629740 5629741 Bsph_1708 Bsph_1709     FALSE 0.280 172.000 0.027 1.000 N NA
 5629741 5629742 Bsph_1709 Bsph_1710     TRUE 0.799 72.000 0.267 1.000 N NA
 5629742 5629743 Bsph_1710 Bsph_1711     TRUE 0.866 13.000 0.013 1.000 N NA
 5629743 5629744 Bsph_1711 Bsph_1712     FALSE 0.042 243.000 0.000 1.000 N NA
 5629744 5629745 Bsph_1712 Bsph_1713     TRUE 0.998 5.000 0.669 0.002 Y NA
 5629745 5629746 Bsph_1713 Bsph_1714     FALSE 0.358 214.000 0.842 1.000 N NA
 5629746 5629747 Bsph_1714 Bsph_1715     TRUE 0.823 16.000 0.019 1.000   NA
 5629747 5629748 Bsph_1715 Bsph_1716     FALSE 0.113 194.000 0.002 1.000   NA
 5629748 5629749 Bsph_1716 Bsph_1717     FALSE 0.055 200.000 0.003 NA   NA
 5629751 5629752 Bsph_1719 Bsph_1720     TRUE 0.947 14.000 0.570 NA   NA
 5629752 5629753 Bsph_1720 Bsph_1721     FALSE 0.441 76.000 0.021 NA N NA
 5629753 5629754 Bsph_1721 Bsph_1722     FALSE 0.009 452.000 0.010 1.000 N NA
 5629754 5629755 Bsph_1722 Bsph_1723     FALSE 0.026 328.000 0.069 1.000 N NA
 5629755 5629756 Bsph_1723 Bsph_1724     TRUE 0.980 8.000 0.094 NA Y NA
 5629756 5629757 Bsph_1724 Bsph_1725     TRUE 0.992 -3.000 0.120 NA Y NA
 5629757 5629758 Bsph_1725 Bsph_1726   resD TRUE 0.709 110.000 0.178 1.000 N NA
 5629758 5629759 Bsph_1726 Bsph_1727 resD resE TRUE 0.940 83.000 0.511 1.000 Y NA
 5629759 5629760 Bsph_1727 Bsph_1728 resE   TRUE 0.636 92.000 0.078 1.000 N NA
 5629760 5629761 Bsph_1728 Bsph_1729     TRUE 0.989 -3.000 0.917 NA   NA
 5629761 5629762 Bsph_1729 Bsph_1730     FALSE 0.004 492.000 0.000 NA   NA
 5629762 5629763 Bsph_1730 Bsph_1731     FALSE 0.186 163.000 0.016 NA   NA
 5629763 5629764 Bsph_1731 Bsph_1732     FALSE 0.555 168.000 0.333 1.000   NA
 5629764 5629765 Bsph_1732 Bsph_1733     TRUE 0.839 79.000 1.000 NA   NA
 5629765 5629766 Bsph_1733 Bsph_1734     FALSE 0.003 591.000 0.000 NA   NA
 5629766 5629767 Bsph_1734 Bsph_1735     TRUE 0.965 -49.000 0.111 1.000   NA
 5629767 5629768 Bsph_1735 Bsph_1736     TRUE 0.961 10.000 0.000 0.003   NA
 5629770 5629771 Bsph_1738 Bsph_1739     FALSE 0.004 457.000 0.000 NA   NA
 5629773 5629774 Bsph_1741 Bsph_1742   yqgG TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5629774 5629775 Bsph_1742 Bsph_1743 yqgG   FALSE 0.417 60.000 0.000 NA   NA
 5629775 5629776 Bsph_1743 Bsph_1744   ykkC FALSE 0.561 33.000 0.000 NA   NA
 5629776 5629777 Bsph_1744 Bsph_1745 ykkC ykkD TRUE 0.998 0.000 0.560 0.057 Y NA
 5629778 5629779 Bsph_1746 Bsph_1747   opuAB TRUE 0.947 69.000 0.118 0.033 Y NA
 5629779 5629780 Bsph_1747 Bsph_1748 opuAB opuAA TRUE 0.997 -7.000 0.177 0.091 Y NA
 5629780 5629781 Bsph_1748 Bsph_1749 opuAA   FALSE 0.400 159.000 0.052 1.000 N NA
 5629782 5629783 Bsph_1750 Bsph_1751   ribD TRUE 0.995 1.000 0.004 0.002 Y NA
 5629783 5629784 Bsph_1751 Bsph_1752 ribD   TRUE 0.990 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 5629784 5629785 Bsph_1752 Bsph_1753     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5629786 5629787 Bsph_1754 Bsph_1755     FALSE 0.294 103.000 0.000 NA   NA
 5629787 5629788 Bsph_1755 Bsph_1757     FALSE 0.448 54.000 0.000 NA   NA
 5629788 5629789 Bsph_1757 Bsph_1758     FALSE 0.185 200.000 0.083 1.000 N NA
 5629790 5629791 Bsph_1759 Bsph_1760     FALSE 0.146 187.000 0.044 NA N NA
 5629791 5629792 Bsph_1760 Bsph_1761     TRUE 0.873 13.000 0.095 NA   NA
 5629794 5629795 Bsph_1763 Bsph_1764     FALSE 0.009 306.000 0.000 NA   NA
 5629796 5629797 Bsph_1765 Bsph_1766     TRUE 0.665 47.000 0.071 NA   NA
 5629797 5629798 Bsph_1766 Bsph_1767     TRUE 0.878 19.000 0.208 NA   NA
 5629798 5629799 Bsph_1767 Bsph_1768     TRUE 0.691 160.000 0.017 1.000 Y NA
 5629799 5629800 Bsph_1768 Bsph_1769   yhiH TRUE 0.997 -3.000 0.713 1.000 Y NA
 5629802 5629803 Bsph_1771 Bsph_1772   xkdA FALSE 0.006 359.000 0.000 NA   NA
 5629803 5629804 Bsph_1772 Bsph_1773 xkdA   FALSE 0.577 96.000 0.133 NA   NA
 5629805 5629806 Bsph_1774 Bsph_1775     FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 5629806 5629807 Bsph_1775 Bsph_1776     FALSE 0.012 279.000 0.000 NA   NA
 5629807 5629808 Bsph_1776 Bsph_1777     FALSE 0.003 797.000 0.000 NA   NA
 5629808 5629809 Bsph_1777 Bsph_1778     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5629809 5629810 Bsph_1778 Bsph_1779   xkdK TRUE 0.976 2.000 0.333 NA   NA
 5629810 5629811 Bsph_1779 Bsph_1780 xkdK   TRUE 0.918 16.000 0.333 NA   NA
 5629811 5629812 Bsph_1780 Bsph_1781   xkdN1 FALSE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 5629812 5629813 Bsph_1781 Bsph_1782 xkdN1   FALSE 0.005 409.000 0.000 NA   NA
 5629813 5629814 Bsph_1782 Bsph_1783     TRUE 0.635 80.000 0.154 NA   NA
 5629814 5629815 Bsph_1783 Bsph_1784     TRUE 0.934 17.000 0.538 NA   NA
 5629815 5629816 Bsph_1784 Bsph_1785     TRUE 0.977 2.000 0.375 NA   NA
 5629816 5629817 Bsph_1785 Bsph_1786     TRUE 0.978 0.000 0.320 NA   NA
 5629817 5629818 Bsph_1786 Bsph_1787     TRUE 0.987 0.000 0.720 NA   NA
 5629818 5629819 Bsph_1787 Bsph_1788     TRUE 0.987 -7.000 0.708 NA   NA
 5629819 5629820 Bsph_1788 Bsph_1789     TRUE 0.936 0.000 0.047 NA   NA
 5629820 5629821 Bsph_1789 Bsph_1790     TRUE 0.803 14.000 0.047 NA   NA
 5629821 5629822 Bsph_1790 Bsph_1791     FALSE 0.023 235.000 0.000 NA   NA
 5629822 5629823 Bsph_1791 Bsph_1792     TRUE 0.895 13.000 0.133 NA   NA
 5629823 5629824 Bsph_1792 Bsph_1793     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5629824 5629825 Bsph_1793 Bsph_1794     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 5629825 5629826 Bsph_1794 Bsph_1795     FALSE 0.040 215.000 0.000 NA   NA
 5629826 5629827 Bsph_1795 Bsph_1796     FALSE 0.017 255.000 0.000 NA   NA
 5629827 5629828 Bsph_1796 Bsph_1797     FALSE 0.108 177.000 0.000 NA   NA
 5629828 5629829 Bsph_1797 Bsph_1798     TRUE 0.716 32.000 0.000 1.000   NA
 5629831 5629832 Bsph_1800 Bsph_1801     FALSE 0.487 46.000 0.000 NA   NA
 5629833 5629834 Bsph_1802 Bsph_1803     TRUE 0.763 34.000 0.100 NA   NA
 5629835 5629836 Bsph_1804 Bsph_1805     TRUE 0.959 6.000 0.275 NA   NA
 5629836 5629837 Bsph_1805 Bsph_1806     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5629838 5629839 Bsph_1807 Bsph_1808     FALSE 0.007 328.000 0.000 NA   NA
 5629839 5629840 Bsph_1808 Bsph_1809     FALSE 0.404 63.000 0.000 NA   NA
 5629841 5629842 Bsph_1810 Bsph_1811     TRUE 0.917 20.000 0.000 0.008 N NA
 5629842 5629843 Bsph_1811 Bsph_1812     TRUE 0.937 55.000 0.000 0.033 Y NA
 5629843 5629844 Bsph_1812 Bsph_1813     FALSE 0.019 311.000 0.000 1.000 N NA
 5629846 5629847 Bsph_1815 Bsph_1816 yxaF   FALSE 0.352 151.000 0.000 1.000 N NA
 5629847 5629848 Bsph_1816 Bsph_1817     FALSE 0.012 365.000 0.000 1.000 N NA
 5629848 5629849 Bsph_1817 Bsph_1818     TRUE 0.944 20.000 0.500 1.000 N NA
 5629850 5629851 Bsph_1819 Bsph_1820 yiaA   FALSE 0.278 128.000 0.000 NA   NA
 5629852 5629853 Bsph_1821 Bsph_1822     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 5629854 5629855 Bsph_1823 Bsph_1824     TRUE 0.806 58.000 0.000 0.013   NA
 5629855 5629856 Bsph_1824 Bsph_1825     TRUE 0.993 -13.000 0.429 0.013   NA
 5629857 5629858 Bsph_1826 Bsph_1827 degU   FALSE 0.005 417.000 0.000 NA   NA
 5629858 5629859 Bsph_1827 Bsph_1828     FALSE 0.007 331.000 0.000 NA   NA
 5629859 5629860 Bsph_1828 Bsph_1829   tlpA TRUE 0.884 -18.000 0.000 NA   NA
 5629860 5629861 Bsph_1829 Bsph_1830 tlpA   FALSE 0.007 468.000 0.000 1.000   NA
 5629861 5629862 Bsph_1830 Bsph_1831     TRUE 0.980 -3.000 0.312 NA   NA
 5629862 5629863 Bsph_1831 Bsph_1832   araC FALSE 0.005 421.000 0.000 NA   NA
 5629863 5629864 Bsph_1832 Bsph_1833 araC   TRUE 0.683 84.000 0.105 1.000 N NA
 5629864 5629865 Bsph_1833 Bsph_1834     TRUE 0.671 28.000 0.016 NA N NA
 5629865 5629866 Bsph_1834 Bsph_1835     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   NA
 5629867 5629868 Bsph_1836 Bsph_1837     FALSE 0.201 151.000 0.000 NA   NA
 5629869 5629870 Bsph_1838 Bsph_1839     FALSE 0.519 80.000 0.071 NA   NA
 5629870 5629871 Bsph_1839 Bsph_1840     FALSE 0.004 451.000 0.000 NA   NA
 5629871 5629872 Bsph_1840 Bsph_1841     FALSE 0.027 804.000 0.000 1.000 Y NA
 5629872 5629873 Bsph_1841 Bsph_1842     TRUE 0.926 -3.000 0.009 NA N NA
 5629873 5629874 Bsph_1842 Bsph_1843     TRUE 0.995 -3.000 0.400 NA Y NA
 5629874 5629875 Bsph_1843 Bsph_1844     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.001 Y NA
 5629875 5629876 Bsph_1844 Bsph_1845     TRUE 0.969 12.000 0.002 1.000 Y NA
 5629876 5629877 Bsph_1845 Bsph_1846     FALSE 0.282 160.000 0.000 1.000   NA
 5629878 5629879 Bsph_1847 Bsph_1848     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 5629881 5629882 Bsph_1850 Bsph_1851     FALSE 0.023 291.000 0.000 1.000 N NA
 5629883 5629884 Bsph_1852 Bsph_1853     FALSE 0.006 1096.000 0.000 1.000 N NA
 5629884 5629885 Bsph_1853 Bsph_1854     FALSE 0.115 277.000 0.000 1.000 Y NA
 5629885 5629886 Bsph_1854 Bsph_1855     FALSE 0.021 240.000 0.000 NA   NA
 5629886 5629887 Bsph_1855 Bsph_1856     FALSE 0.318 131.000 0.021 NA   NA
 5629887 5629888 Bsph_1856 Bsph_1857     FALSE 0.174 198.000 0.077 1.000   NA
 5629888 5629889 Bsph_1857 Bsph_1858     TRUE 0.988 23.000 0.385 0.023 Y NA
 5629889 5629890 Bsph_1858 Bsph_1859     FALSE 0.587 127.000 0.083 1.000   NA
 5629890 5629891 Bsph_1859 Bsph_1860     TRUE 0.652 125.000 0.250 NA   NA
 5629891 5629892 Bsph_1860 Bsph_1861     FALSE 0.032 225.000 0.000 NA   NA
 5629892 5629893 Bsph_1861 Bsph_1862     FALSE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 5629893 5629894 Bsph_1862 Bsph_1863     FALSE 0.455 53.000 0.000 NA   NA
 5629897 5629898 Bsph_1866 Bsph_1867 mcpC yufN TRUE 0.915 51.000 0.857 1.000   NA
 5629900 5629901 Bsph_1869 Bsph_1870     FALSE 0.004 428.000 0.000 NA   NA
 5629901 5629902 Bsph_1870 Bsph_1871     TRUE 0.959 35.000 0.377 0.003   NA
 5629902 5629903 Bsph_1871 Bsph_1872     TRUE 0.997 -3.000 0.065 0.002 Y NA
 5629903 5629904 Bsph_1872 Bsph_1873     FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5629904 5629905 Bsph_1873 Bsph_1874     FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5629906 5629907 Bsph_1875 Bsph_1876     FALSE 0.341 84.000 0.006 NA   NA
 5629907 5629908 Bsph_1876 Bsph_1877     FALSE 0.415 93.000 0.038 NA   NA
 5629909 5629910 Bsph_1878 Bsph_1879     TRUE 0.912 12.000 0.148 NA   NA
 5629910 5629911 Bsph_1879 Bsph_1880     FALSE 0.351 135.000 0.039 NA   NA
 5629911 5629912 Bsph_1880 Bsph_1881     TRUE 0.991 0.000 0.849 1.000   NA
 5629912 5629913 Bsph_1881 Bsph_1882     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5629913 5629914 Bsph_1882 Bsph_1883     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5629914 5629915 Bsph_1883 Bsph_1884     FALSE 0.339 78.000 0.000 NA   NA
 5629916 5629917 Bsph_1885 Bsph_1886     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 5629917 5629918 Bsph_1886 Bsph_1887     FALSE 0.487 72.000 0.047 NA   NA
 5629918 5629919 Bsph_1887 Bsph_1888     TRUE 0.836 14.000 0.013 1.000   NA
 5629923 5629924 Bsph_1892 Bsph_1893     TRUE 0.981 -18.000 0.464 NA   NA
 5629926 5629927 Bsph_1896 Bsph_1897     FALSE 0.299 118.000 0.000 NA   NA
 5629928 5629929 Bsph_1898 Bsph_1899     TRUE 0.868 16.000 0.065 1.000   NA
 5629930 5629931 Bsph_1900 Bsph_1901 yybF   TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5629932 5629933 Bsph_1902 Bsph_1903     FALSE 0.257 150.000 0.024 NA   NA
 5629933 5629934 Bsph_1903 Bsph_1904     FALSE 0.264 132.000 0.000 NA   NA
 5629935 5629936 Bsph_1905 Bsph_1906     TRUE 0.983 1.000 0.508 NA   NA
 5629936 5629937 Bsph_1906 Bsph_1907     FALSE 0.583 72.000 0.032 1.000   NA
 5629937 5629938 Bsph_1907 Bsph_1908     FALSE 0.469 147.000 0.067 1.000   NA
 5629938 5629939 Bsph_1908 Bsph_1909     FALSE 0.470 114.000 0.011 1.000   NA
 5629939 5629940 Bsph_1909 Bsph_1910     FALSE 0.322 102.000 0.011 NA   NA
 5629940 5629941 Bsph_1910 Bsph_1911     TRUE 0.940 5.000 0.107 NA   NA
 5629943 5629944 Bsph_1913 Bsph_1914     TRUE 0.602 97.000 0.157 NA   NA
 5629944 5629945 Bsph_1914 Bsph_1915   ypeB TRUE 0.893 31.000 0.408 NA   NA
 5629945 5629946 Bsph_1915 Bsph_1916 ypeB   TRUE 0.660 87.000 0.205 NA   NA
 5629946 5629947 Bsph_1916 Bsph_1917     FALSE 0.363 97.000 0.009 NA N NA
 5629947 5629948 Bsph_1917 Bsph_1918     FALSE 0.561 103.000 0.047 1.000 N NA
 5629948 5629949 Bsph_1918 Bsph_1919   engA FALSE 0.026 293.000 0.032 1.000   NA
 5629949 5629950 Bsph_1919 Bsph_1920 engA engA TRUE 0.981 -19.000 0.006 0.003   NA
 5629950 5629951 Bsph_1920 Bsph_1921 engA   FALSE 0.575 108.000 0.068 1.000   NA
 5629951 5629952 Bsph_1921 Bsph_1922     FALSE 0.026 242.000 0.021 NA   NA
 5629952 5629953 Bsph_1922 Bsph_1923     FALSE 0.344 199.000 0.771 NA   NA
 5629953 5629954 Bsph_1923 Bsph_1924     FALSE 0.310 93.000 0.000 NA   NA
 5629954 5629955 Bsph_1924 Bsph_1925     FALSE 0.296 108.000 0.000 NA   NA
 5629955 5629956 Bsph_1925 Bsph_1926     FALSE 0.309 94.000 0.000 NA   NA
 5629956 5629957 Bsph_1926 Bsph_1929     FALSE 0.072 191.000 0.000 NA   NA
 5629957 5629958 Bsph_1929 Bsph_1930     FALSE 0.166 220.000 0.154 1.000 N NA
 5629958 5629959 Bsph_1930 Bsph_1931   mtrB TRUE 0.753 63.000 0.130 1.000   NA
 5629959 5629960 Bsph_1931 Bsph_1932 mtrB gerCA FALSE 0.109 246.000 0.245 1.000   NA
 5629960 5629961 Bsph_1932 Bsph_1933 gerCA   TRUE 0.825 15.000 0.012 1.000   NA
 5629961 5629962 Bsph_1933 Bsph_1934     TRUE 0.949 20.000 0.020 1.000 Y NA
 5629962 5629963 Bsph_1934 Bsph_1935     TRUE 0.606 87.000 0.054 1.000 N NA
 5629963 5629964 Bsph_1935 Bsph_1936   xerD FALSE 0.479 117.000 0.000 1.000 N NA
 5629964 5629965 Bsph_1936 Bsph_1937 xerD   FALSE 0.294 106.000 0.000 NA   NA
 5629965 5629966 Bsph_1937 Bsph_1938     FALSE 0.003 1173.000 0.000 NA   NA
 5629966 5629967 Bsph_1938 Bsph_1939     FALSE 0.282 127.000 0.000 NA   NA
 5629967 5629968 Bsph_1939 Bsph_1940     FALSE 0.003 587.000 0.000 NA   NA
 5629968 5629969 Bsph_1940 Bsph_1941     TRUE 0.917 31.000 0.667 NA   NA
 5629969 5629970 Bsph_1941 Bsph_1942     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5629970 5629971 Bsph_1942 Bsph_1943     FALSE 0.035 221.000 0.000 NA   NA
 5629971 5629972 Bsph_1943 Bsph_1944     TRUE 0.886 -16.000 0.000 NA   NA
 5629972 5629973 Bsph_1944 Bsph_1945     TRUE 0.949 3.000 0.104 NA   NA
 5629973 5629974 Bsph_1945 Bsph_1946     FALSE 0.393 65.000 0.000 NA   NA
 5629974 5629975 Bsph_1946 Bsph_1947     FALSE 0.339 78.000 0.000 NA   NA
 5629975 5629976 Bsph_1947 Bsph_1948     FALSE 0.408 62.000 0.000 NA   NA
 5629976 5629977 Bsph_1948 Bsph_1949     TRUE 0.892 -12.000 0.000 NA   NA
 5629977 5629978 Bsph_1949 Bsph_1950     FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 5629978 5629979 Bsph_1950 Bsph_1951     TRUE 0.902 12.000 0.125 NA   NA
 5629979 5629980 Bsph_1951 Bsph_1952     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5629980 5629981 Bsph_1952 Bsph_1953     FALSE 0.299 118.000 0.000 NA   NA
 5629981 5629982 Bsph_1953 Bsph_1954     FALSE 0.026 271.000 0.000 1.000   NA
 5629982 5629983 Bsph_1954 Bsph_1955     TRUE 0.977 15.000 0.167 1.000 Y NA
 5629983 5629984 Bsph_1955 Bsph_1956     TRUE 0.951 70.000 0.182 0.071 Y NA
 5629984 5629985 Bsph_1956 Bsph_1957     TRUE 0.748 118.000 0.500 NA   NA
 5629985 5629986 Bsph_1957 Bsph_1958     FALSE 0.326 85.000 0.000 NA   NA
 5629986 5629987 Bsph_1958 Bsph_1960     FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 5629987 5629988 Bsph_1960 Bsph_1961     TRUE 0.996 4.000 0.110 0.001 Y NA
 5629988 5629989 Bsph_1961 Bsph_1962     TRUE 0.992 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 5629989 5629990 Bsph_1962 Bsph_1963     TRUE 0.963 19.000 0.078 1.000 Y NA
 5629990 5629991 Bsph_1963 Bsph_1964     TRUE 0.993 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 5629991 5629992 Bsph_1964 Bsph_1965     FALSE 0.466 149.000 0.069 1.000   NA
 5629992 5629993 Bsph_1965 Bsph_1966     TRUE 0.825 72.000 0.017 0.001   NA
 5629993 5629994 Bsph_1966 Bsph_1967     FALSE 0.457 97.000 0.005 1.000   NA
 5629994 5629995 Bsph_1967 Bsph_1968   ypiB TRUE 0.913 9.000 0.104 NA   NA
 5629995 5629996 Bsph_1968 Bsph_1969 ypiB   TRUE 0.698 142.000 0.583 NA   NA
 5629996 5629997 Bsph_1969 Bsph_1970     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5629997 5629998 Bsph_1970 Bsph_1971     FALSE 0.136 170.000 0.000 NA   NA
 5629998 5629999 Bsph_1971 Bsph_1972     FALSE 0.108 177.000 0.000 NA   NA
 5629999 5630000 Bsph_1972 Bsph_1973     TRUE 0.917 20.000 0.447 NA   NA
 5630000 5630001 Bsph_1973 Bsph_1974     TRUE 0.897 42.000 0.095 0.031   NA
 5630001 5630002 Bsph_1974 Bsph_1975     FALSE 0.009 427.000 0.069 NA   NA
 5630002 5630003 Bsph_1975 Bsph_1976     TRUE 0.622 61.000 0.083 NA   NA
 5630005 5630006 Bsph_1978 Bsph_1979     TRUE 0.935 0.000 0.044 NA   NA
 5630006 5630007 Bsph_1979 Bsph_1980     TRUE 0.920 20.000 0.044 0.034 N NA
 5630007 5630008 Bsph_1980 Bsph_1981     TRUE 0.740 34.000 0.009 1.000 N NA
 5630008 5630009 Bsph_1981 Bsph_1982     TRUE 0.975 -13.000 0.126 1.000 N NA
 5630009 5630010 Bsph_1982 Bsph_1983   birA FALSE 0.584 146.000 0.134 1.000 N NA
 5630011 5630012 Bsph_1984 Bsph_1985     FALSE 0.082 187.000 0.000 NA   NA
 5630012 5630013 Bsph_1985 Bsph_1986     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5630014 5630015 Bsph_1987 Bsph_1988     TRUE 0.998 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 5630015 5630016 Bsph_1988 Bsph_1989     TRUE 0.988 12.000 0.342 1.000 Y NA
 5630016 5630017 Bsph_1989 Bsph_1990     FALSE 0.026 282.000 0.000 1.000 N NA
 5630017 5630018 Bsph_1990 Bsph_1991     FALSE 0.078 217.000 0.000 1.000 N NA
 5630020 5630021 Bsph_1993 Bsph_1995   yihN TRUE 0.615 23.000 0.000 NA   NA
 5630023 5630024 Bsph_1997 Bsph_1998     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5630024 5630025 Bsph_1998 Bsph_1999   adaA FALSE 0.123 173.000 0.000 NA   NA
 5630025 5630026 Bsph_1999 Bsph_2000 adaA   FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 5630026 5630027 Bsph_2000 Bsph_2002     TRUE 0.871 -43.000 0.000 NA   NA
 5630027 5630028 Bsph_2002 Bsph_2003   yuzA FALSE 0.473 56.000 0.014 NA   NA
 5630029 5630030 Bsph_2004 Bsph_2005     TRUE 0.975 13.000 1.000 1.000 N NA
 5630030 5630031 Bsph_2005 Bsph_2006     FALSE 0.583 150.000 0.286 NA N NA
 5630032 5630033 Bsph_2007 Bsph_2008     TRUE 0.697 45.000 0.012 1.000 N NA
 5630033 5630034 Bsph_2008 Bsph_2009     FALSE 0.295 100.000 0.000 NA   NA
 5630034 5630035 Bsph_2009 Bsph_2011     TRUE 0.707 14.000 0.000 NA   NA
 5630035 5630036 Bsph_2011 Bsph_2012     FALSE 0.337 79.000 0.000 NA   NA
 5630036 5630037 Bsph_2012 Bsph_2013     FALSE 0.542 36.000 0.000 NA   NA
 5630037 5630038 Bsph_2013 Bsph_2015     FALSE 0.487 46.000 0.000 NA   NA
 5630040 5630041 Bsph_2018 Bsph_2019   ybxG FALSE 0.575 31.000 0.000 NA   NA
 5630041 5630042 Bsph_2019 Bsph_2020 ybxG gerIA TRUE 0.680 150.000 0.105 0.055   NA
 5630042 5630043 Bsph_2020 Bsph_2021 gerIA gerHB TRUE 0.962 32.000 0.500 0.013   NA
 5630043 5630044 Bsph_2021 Bsph_2022 gerHB   TRUE 0.995 -3.000 0.500 0.013   NA
 5630046 5630047 Bsph_2024 Bsph_2025     FALSE 0.324 172.000 0.143 NA   NA
 5630049 5630050 Bsph_2027 Bsph_2028     FALSE 0.003 570.000 0.000 NA   NA
 5630050 5630051 Bsph_2028 Bsph_2029     FALSE 0.005 390.000 0.000 NA   NA
 5630052 5630053 Bsph_2030 Bsph_2031     TRUE 0.874 -33.000 0.000 NA   NA
 5630054 5630055 Bsph_2032 Bsph_2033     FALSE 0.318 89.000 0.000 NA   NA
 5630055 5630056 Bsph_2033 Bsph_2034     TRUE 0.611 24.000 0.000 NA   NA
 5630056 5630057 Bsph_2034 Bsph_2035     FALSE 0.471 49.000 0.000 NA   NA
 5630058 5630059 Bsph_2036 Bsph_2037     FALSE 0.006 367.000 0.000 NA   NA
 5630059 5630060 Bsph_2037 Bsph_2038     TRUE 0.989 -3.000 0.957 NA   NA
 5630061 5630062 Bsph_2039 Bsph_2040   ydiF FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5630062 5630063 Bsph_2040 Bsph_2041 ydiF   FALSE 0.005 401.000 0.000 NA   NA
 5630063 5630064 Bsph_2041 Bsph_2042     FALSE 0.004 471.000 0.000 NA   NA
 5630064 5630065 Bsph_2042 Bsph_2043     TRUE 0.615 23.000 0.000 NA   NA
 5630065 5630066 Bsph_2043 Bsph_2044   ribAB TRUE 0.954 18.000 0.026 1.000 Y NA
 5630066 5630067 Bsph_2044 Bsph_2045 ribAB   TRUE 0.980 18.000 0.022 0.002 Y NA
 5630067 5630068 Bsph_2045 Bsph_2046     FALSE 0.322 151.000 0.002 1.000   NA
 5630070 5630071 Bsph_2048 Bsph_2049     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5630071 5630072 Bsph_2049 Bsph_2050     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5630072 5630073 Bsph_2050 Bsph_2051     TRUE 0.865 57.000 0.710 NA   NA
 5630073 5630074 Bsph_2051 Bsph_2052     FALSE 0.290 183.000 0.200 NA   NA
 5630075 5630076 Bsph_2053 Bsph_2054     FALSE 0.007 331.000 0.000 NA   NA
 5630076 5630077 Bsph_2054 Bsph_2055     TRUE 0.948 4.000 0.114 NA   NA
 5630078 5630079 Bsph_2056 Bsph_2057     TRUE 0.890 13.000 0.123 NA   NA
 5630079 5630080 Bsph_2057 Bsph_2058     FALSE 0.529 100.000 0.027 1.000 N NA
 5630080 5630081 Bsph_2058 Bsph_2059     TRUE 0.984 16.000 0.429 1.000 Y NA
 5630082 5630083 Bsph_2060 Bsph_2061     FALSE 0.018 249.000 0.000 NA   NA
 5630085 5630086 Bsph_2063 Bsph_2064   yclJ TRUE 0.871 90.000 0.077 1.000 Y NA
 5630086 5630087 Bsph_2064 Bsph_2065 yclJ   TRUE 0.807 33.000 0.056 1.000 N NA
 5630087 5630088 Bsph_2065 Bsph_2066     FALSE 0.003 629.000 0.000 NA   NA
 5630089 5630090 Bsph_2067 Bsph_2068     FALSE 0.003 502.000 0.000 NA   NA
 5630091 5630092 Bsph_2069 Bsph_2070     FALSE 0.294 103.000 0.000 NA   NA
 5630093 5630094 Bsph_2071 Bsph_2072 ycdT   FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 5630094 5630095 Bsph_2072 Bsph_2073     TRUE 0.917 17.000 0.367 NA   NA
 5630095 5630096 Bsph_2073 Bsph_2074     FALSE 0.587 29.000 0.000 NA   NA
 5630096 5630097 Bsph_2074 Bsph_2076   dnaD FALSE 0.294 123.000 0.000 NA   NA
 5630097 5630098 Bsph_2076 Bsph_2077 dnaD   TRUE 0.975 13.000 0.075 1.000 Y NA
 5630098 5630099 Bsph_2077 Bsph_2078     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5630100 5630101 Bsph_2079 Bsph_2080     TRUE 0.948 2.000 0.028 1.000   NA
 5630102 5630103 Bsph_2081 Bsph_2082     TRUE 0.891 -25.000 0.010 NA   NA
 5630105 5630106 Bsph_2084 Bsph_2085     TRUE 0.802 42.000 0.189 NA   NA
 5630106 5630107 Bsph_2085 Bsph_2086     TRUE 0.930 20.000 0.649 NA   NA
 5630107 5630108 Bsph_2086 Bsph_2087     TRUE 0.788 20.000 0.074 NA   NA
 5630108 5630109 Bsph_2087 Bsph_2088     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5630109 5630110 Bsph_2088 Bsph_2089     FALSE 0.011 287.000 0.000 NA   NA
 5630110 5630111 Bsph_2089 Bsph_2090     FALSE 0.224 154.000 0.017 NA   NA
 5630111 5630112 Bsph_2090 Bsph_2091     FALSE 0.003 933.000 0.000 NA   NA
 5630112 5630113 Bsph_2091 Bsph_2092   ypsC TRUE 0.893 4.000 0.008 NA N NA
 5630113 5630114 Bsph_2092 Bsph_2093 ypsC   TRUE 0.794 86.000 0.012 NA Y NA
 5630114 5630115 Bsph_2093 Bsph_2094     FALSE 0.084 246.000 0.000 0.100 N NA
 5630115 5630116 Bsph_2094 Bsph_2095     TRUE 0.983 8.000 0.069 1.000 Y NA
 5630116 5630117 Bsph_2095 Bsph_2096   eutH TRUE 0.676 86.000 0.103 1.000 N NA
 5630117 5630118 Bsph_2096 Bsph_2097 eutH eutS TRUE 0.972 27.000 0.273 1.000 Y NA
 5630118 5630119 Bsph_2097 Bsph_2098 eutS eutP TRUE 0.988 11.000 0.333 1.000 Y NA
 5630119 5630120 Bsph_2098 Bsph_2099 eutP eutA TRUE 0.981 18.000 0.667 NA Y NA
 5630120 5630121 Bsph_2099 Bsph_2100 eutA   TRUE 0.994 6.000 1.000 NA Y NA
 5630121 5630122 Bsph_2100 Bsph_2101     TRUE 0.993 31.000 1.000 0.001 Y NA
 5630122 5630123 Bsph_2101 Bsph_2102   eutL TRUE 0.977 12.000 0.064 1.000 Y NA
 5630123 5630124 Bsph_2102 Bsph_2103 eutL   TRUE 0.892 16.000 0.085 1.000 N NA
 5630124 5630125 Bsph_2103 Bsph_2104   eutM TRUE 0.979 17.000 0.500 NA Y NA
 5630125 5630126 Bsph_2104 Bsph_2105 eutM   TRUE 0.891 91.000 0.250 NA Y NA
 5630126 5630127 Bsph_2105 Bsph_2106     TRUE 0.989 13.000 1.000 NA Y NA
 5630127 5630128 Bsph_2106 Bsph_2107     TRUE 0.919 37.000 0.051 NA Y NA
 5630128 5630129 Bsph_2107 Bsph_2108     TRUE 0.994 -7.000 0.231 NA Y NA
 5630129 5630130 Bsph_2108 Bsph_2109     TRUE 0.985 0.000 0.007 NA Y NA
 5630130 5630131 Bsph_2109 Bsph_2110     FALSE 0.009 305.000 0.000 NA   NA
 5630131 5630132 Bsph_2110 Bsph_2111     FALSE 0.393 65.000 0.000 NA   NA
 5630132 5630133 Bsph_2111 Bsph_2113     FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5630134 5630135 Bsph_2114 Bsph_2116     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5630135 5630136 Bsph_2116 Bsph_2117     FALSE 0.024 234.000 0.000 NA   NA
 5630136 5630137 Bsph_2117 Bsph_2118     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 5630138 5630139 Bsph_2119 Bsph_2120     FALSE 0.032 225.000 0.000 NA   NA
 5630139 5630140 Bsph_2120 Bsph_2121     TRUE 0.984 23.000 0.133 0.004 Y NA
 5630140 5630141 Bsph_2121 Bsph_2122     TRUE 0.973 -3.000 0.077 1.000 N NA
 5630141 5630142 Bsph_2122 Bsph_2123     TRUE 0.834 32.000 0.077 1.000 N NA
 5630142 5630143 Bsph_2123 Bsph_2124   yliC FALSE 0.133 383.000 0.104 0.031 Y NA
 5630143 5630144 Bsph_2124 Bsph_2125 yliC   TRUE 0.990 12.000 0.134 0.031 Y NA
 5630144 5630145 Bsph_2125 Bsph_2126     TRUE 0.980 6.000 0.600 1.000   NA
 5630145 5630146 Bsph_2126 Bsph_2127     TRUE 0.959 8.000 0.013 0.027   NA
 5630146 5630147 Bsph_2127 Bsph_2128     TRUE 0.846 14.000 0.008 1.000 N NA
 5630147 5630148 Bsph_2128 Bsph_2129     TRUE 0.984 4.000 0.053 NA Y NA
 5630148 5630149 Bsph_2129 Bsph_2130     TRUE 0.859 6.000 0.018 NA   NA
 5630150 5630151 Bsph_2131 Bsph_2132     TRUE 0.977 8.000 1.000 NA   NA
 5630151 5630152 Bsph_2132 Bsph_2133     FALSE 0.341 77.000 0.000 NA   NA
 5630153 5630154 Bsph_2134 Bsph_2135     FALSE 0.014 621.000 0.000 0.086 N NA
 5630154 5630155 Bsph_2135 Bsph_2136     TRUE 0.930 13.000 0.130 1.000 N NA
 5630155 5630156 Bsph_2136 Bsph_2137     TRUE 0.600 67.000 0.087 NA   NA
 5630156 5630157 Bsph_2137 Bsph_2138   ompR2 FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 5630157 5630158 Bsph_2138 Bsph_2139 ompR2 vanSB TRUE 0.977 20.000 0.333 1.000 Y NA
 5630158 5630159 Bsph_2139 Bsph_2140 vanSB   TRUE 0.893 107.000 0.000 0.023 Y NA
 5630159 5630160 Bsph_2140 Bsph_2141     FALSE 0.114 255.000 0.000 NA Y NA
 5630160 5630161 Bsph_2141 Bsph_2142     FALSE 0.009 306.000 0.000 NA   NA
 5630161 5630162 Bsph_2142 Bsph_2143     FALSE 0.201 151.000 0.000 NA   NA
 5630164 5630165 Bsph_2145 Bsph_2146     TRUE 0.872 11.000 0.008 1.000   NA
 5630165 5630166 Bsph_2146 Bsph_2147     FALSE 0.005 753.000 0.000 1.000   NA
 5630166 5630167 Bsph_2147 Bsph_2148     FALSE 0.009 398.000 0.000 1.000   NA
 5630167 5630168 Bsph_2148 Bsph_2149     FALSE 0.055 230.000 0.000 1.000 N NA
 5630169 5630170 Bsph_2150 Bsph_2151     FALSE 0.298 101.000 0.004 NA   NA
 5630170 5630171 Bsph_2151 Bsph_2152     FALSE 0.128 194.000 0.004 1.000 N NA
 5630172 5630173 Bsph_2153 Bsph_2154     TRUE 0.899 -10.000 0.005 NA   NA
 5630178 5630179 Bsph_2159 Bsph_2160     FALSE 0.023 430.000 0.000 0.031 N NA
 5630181 5630182 Bsph_2162 Bsph_2163     TRUE 0.884 -18.000 0.000 NA   NA
 5630183 5630184 Bsph_2164 Bsph_2165     FALSE 0.010 418.000 0.000 1.000 N NA
 5630184 5630185 Bsph_2165 Bsph_2166     FALSE 0.005 376.000 0.000 NA   NA
 5630185 5630186 Bsph_2166 Bsph_2167     FALSE 0.391 154.000 0.105 NA   NA
 5630188 5630189 Bsph_2169 Bsph_2170     TRUE 0.981 -3.000 0.150 1.000 N NA
 5630190 5630191 Bsph_2171 Bsph_2172     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5630191 5630192 Bsph_2172 Bsph_2173     TRUE 0.643 53.000 0.000 1.000 N NA
 5630193 5630194 Bsph_2174 Bsph_2175 ywqM   FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5630194 5630195 Bsph_2175 Bsph_2176     FALSE 0.116 175.000 0.000 NA   NA
 5630196 5630197 Bsph_2177 Bsph_2178     TRUE 0.707 14.000 0.000 NA   NA
 5630197 5630198 Bsph_2178 Bsph_2179     TRUE 0.771 96.000 0.000 0.001   NA
 5630198 5630199 Bsph_2179 Bsph_2180     FALSE 0.003 703.000 0.000 NA   NA
 5630199 5630200 Bsph_2180 Bsph_2182     FALSE 0.154 165.000 0.000 NA   NA
 5630200 5630201 Bsph_2182 Bsph_2183     FALSE 0.275 208.000 0.364 1.000   NA
 5630201 5630202 Bsph_2183 Bsph_2184     FALSE 0.153 293.000 0.461 0.031   NA
 5630202 5630203 Bsph_2184 Bsph_2185     FALSE 0.024 276.000 0.000 1.000   NA
 5630205 5630206 Bsph_2187 Bsph_2188     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5630207 5630208 Bsph_2189 Bsph_2190     FALSE 0.285 195.000 0.400 NA   NA
 5630208 5630209 Bsph_2190 Bsph_2191     FALSE 0.264 132.000 0.000 NA   NA
 5630211 5630212 Bsph_2193 Bsph_2195     FALSE 0.346 75.000 0.000 NA   NA
 5630212 5630213 Bsph_2195 Bsph_2196     FALSE 0.289 101.000 0.002 NA   NA
 5630213 5630214 Bsph_2196 Bsph_2197     TRUE 0.977 -10.000 0.286 NA   NA
 5630214 5630215 Bsph_2197 Bsph_2198     FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 5630219 5630220 Bsph_2202 Bsph_2203     TRUE 0.981 -45.000 0.000 0.001   NA
 5630220 5630221 Bsph_2203 Bsph_2204     FALSE 0.009 437.000 0.000 1.000 N NA
 5630221 5630222 Bsph_2204 Bsph_2205     TRUE 0.998 4.000 0.636 0.001 Y NA
 5630222 5630223 Bsph_2205 Bsph_2206     TRUE 0.919 13.000 0.095 1.000 N NA
 5630223 5630224 Bsph_2206 Bsph_2207     FALSE 0.577 74.000 0.095 NA   NA
 5630224 5630225 Bsph_2207 Bsph_2208     TRUE 0.893 16.000 0.200 NA   NA
 5630225 5630226 Bsph_2208 Bsph_2209     FALSE 0.003 722.000 0.000 NA   NA
 5630226 5630227 Bsph_2209 Bsph_2210   yjjK FALSE 0.007 722.000 0.031 1.000   NA
 5630227 5630228 Bsph_2210 Bsph_2211 yjjK   TRUE 0.847 13.000 0.008 1.000   NA
 5630228 5630229 Bsph_2211 Bsph_2212     FALSE 0.024 288.000 0.000 1.000 N NA
 5630229 5630230 Bsph_2212 Bsph_2213     TRUE 0.994 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 5630230 5630231 Bsph_2213 Bsph_2214     TRUE 0.994 -10.000 0.600 0.069 N NA
 5630231 5630232 Bsph_2214 Bsph_2215     TRUE 0.984 11.000 0.600 0.069 N NA
 5630232 5630233 Bsph_2215 Bsph_2216     TRUE 0.918 16.000 0.154 1.000 N NA
 5630233 5630234 Bsph_2216 Bsph_2217     TRUE 0.996 -31.000 0.154 0.004 Y NA
 5630234 5630235 Bsph_2217 Bsph_2218     TRUE 0.894 41.000 0.009 NA Y NA
 5630235 5630236 Bsph_2218 Bsph_2219     TRUE 0.850 60.000 0.009 NA Y NA
 5630236 5630237 Bsph_2219 Bsph_2220     TRUE 0.988 17.000 0.300 0.031 Y NA
 5630237 5630238 Bsph_2220 Bsph_2221     TRUE 0.993 4.000 0.049 0.031 Y NA
 5630243 5630244 Bsph_2226 Bsph_2227     FALSE 0.564 76.000 0.091 NA   NA
 5630244 5630245 Bsph_2227 Bsph_2228   yxxF TRUE 0.943 0.000 0.000 1.000   NA
 5630245 5630246 Bsph_2228 Bsph_2229 yxxF   FALSE 0.480 85.000 0.000 1.000   NA
 5630246 5630247 Bsph_2229 Bsph_2230     TRUE 0.993 13.000 0.281 0.002 Y NA
 5630247 5630248 Bsph_2230 Bsph_2231     FALSE 0.006 367.000 0.000 NA   NA
 5630250 5630251 Bsph_2233 Bsph_2234 yybE   TRUE 0.882 -19.000 0.000 NA   NA
 5630252 5630253 Bsph_2235 Bsph_2236 yvaK   FALSE 0.399 64.000 0.000 NA   NA
 5630253 5630254 Bsph_2236 Bsph_2237     FALSE 0.149 167.000 0.000 NA   NA
 5630257 5630258 Bsph_2241 Bsph_2242     TRUE 0.797 59.000 0.333 NA   NA
 5630259 5630260 Bsph_2243 Bsph_2244     TRUE 0.934 2.000 0.057 NA   NA
 5630260 5630261 Bsph_2244 Bsph_2245     TRUE 0.866 66.000 1.000 NA   NA
 5630261 5630262 Bsph_2245 Bsph_2246     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5630262 5630263 Bsph_2246 Bsph_2247     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5630263 5630264 Bsph_2247 Bsph_2248     TRUE 0.901 8.000 0.074 NA   NA
 5630264 5630265 Bsph_2248 Bsph_2249     FALSE 0.068 303.000 0.000 NA Y NA
 5630265 5630266 Bsph_2249 Bsph_2250     FALSE 0.076 189.000 0.000 NA   NA
 5630266 5630267 Bsph_2250 Bsph_2251     FALSE 0.306 123.000 0.006 NA   NA
 5630267 5630268 Bsph_2251 Bsph_2252     FALSE 0.063 196.000 0.006 NA   NA
 5630268 5630269 Bsph_2252 Bsph_2253     FALSE 0.354 134.000 0.039 NA   NA
 5630272 5630273 Bsph_2256 Bsph_2257 yvbY   FALSE 0.298 114.000 0.000 NA   NA
 5630273 5630274 Bsph_2257 Bsph_2258   ykgF TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5630274 5630275 Bsph_2258 Bsph_2259 ykgF   TRUE 0.956 15.000 0.947 NA   NA
 5630275 5630276 Bsph_2259 Bsph_2260     FALSE 0.120 174.000 0.000 NA   NA
 5630277 5630278 Bsph_2262 Bsph_2263 ccdA cheY TRUE 0.805 124.000 0.500 1.000 N NA
 5630278 5630279 Bsph_2263 Bsph_2264 cheY   TRUE 0.842 25.000 0.133 NA N NA
 5630280 5630281 Bsph_2265 Bsph_2266     FALSE 0.364 71.000 0.000 NA   NA
 5630282 5630283 Bsph_2267 Bsph_2268     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5630283 5630284 Bsph_2268 Bsph_2269     TRUE 0.741 67.000 0.250 NA   NA
 5630284 5630285 Bsph_2269 Bsph_2270   ypmQ FALSE 0.531 105.000 0.105 NA   NA
 5630285 5630286 Bsph_2270 Bsph_2271 ypmQ   FALSE 0.401 124.000 0.041 NA   NA
 5630288 5630289 Bsph_2273 Bsph_2274     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5630289 5630290 Bsph_2274 Bsph_2275     FALSE 0.181 157.000 0.000 NA   NA
 5630290 5630291 Bsph_2275 Bsph_2276   mcpA FALSE 0.107 364.000 0.000 0.014 Y NA
 5630293 5630294 Bsph_2278 Bsph_2279     TRUE 0.909 2.000 0.011 NA N NA
 5630294 5630295 Bsph_2279 Bsph_2280   ddpX FALSE 0.004 469.000 0.000 NA   NA
 5630295 5630296 Bsph_2280 Bsph_2281 ddpX   TRUE 0.950 -3.000 0.065 NA   NA
 5630296 5630297 Bsph_2281 Bsph_2282   aliB FALSE 0.134 243.000 0.000 NA Y NA
 5630297 5630298 Bsph_2282 Bsph_2283 aliB amiC TRUE 0.946 120.000 0.273 0.031 Y NA
 5630298 5630299 Bsph_2283 Bsph_2284 amiC amiD TRUE 0.998 0.000 0.556 0.031 Y NA
 5630299 5630300 Bsph_2284 Bsph_2285 amiD amiE TRUE 0.997 -7.000 0.650 1.000 Y NA
 5630300 5630301 Bsph_2285 Bsph_2286 amiE amiF TRUE 0.998 -13.000 0.333 0.005 Y NA
 5630301 5630302 Bsph_2286 Bsph_2287 amiF   TRUE 0.959 -3.000 0.074 NA N NA
 5630302 5630303 Bsph_2287 Bsph_2288     FALSE 0.010 296.000 0.000 NA   NA
 5630303 5630304 Bsph_2288 Bsph_2289     TRUE 0.966 -3.000 0.125 NA   NA
 5630305 5630306 Bsph_2290 Bsph_2291     TRUE 0.942 24.000 1.000 NA   NA
 5630306 5630307 Bsph_2291 Bsph_2292     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 5630307 5630308 Bsph_2292 Bsph_2293     TRUE 0.624 21.000 0.000 NA   NA
 5630309 5630310 Bsph_2294 Bsph_2295 opuCA   TRUE 0.974 11.000 0.218 0.085 N NA
 5630310 5630311 Bsph_2295 Bsph_2296     FALSE 0.324 128.000 0.018 NA   NA
 5630311 5630312 Bsph_2296 Bsph_2297     TRUE 0.703 39.000 0.071 NA   NA
 5630312 5630313 Bsph_2297 Bsph_2298   ebrA TRUE 0.772 47.000 0.071 1.000 N NA
 5630313 5630314 Bsph_2298 Bsph_2299 ebrA ebrB TRUE 0.992 13.000 0.333 0.053 Y NA
 5630314 5630315 Bsph_2299 Bsph_2300 ebrB   FALSE 0.443 123.000 0.000 1.000   NA
 5630315 5630316 Bsph_2300 Bsph_2301     FALSE 0.045 210.000 0.000 NA   NA
 5630316 5630317 Bsph_2301 Bsph_2302     FALSE 0.335 80.000 0.000 NA   NA
 5630317 5630318 Bsph_2302 Bsph_2303     TRUE 0.974 -10.000 0.000 0.098   NA
 5630320 5630321 Bsph_2305 Bsph_2306     TRUE 0.935 162.000 0.500 0.001 Y NA
 5630322 5630323 Bsph_2307 Bsph_2308 ywtD   FALSE 0.020 244.000 0.000 NA   NA
 5630324 5630325 Bsph_2309 Bsph_2310     FALSE 0.378 68.000 0.000 NA   NA
 5630325 5630326 Bsph_2310 Bsph_2311     FALSE 0.004 465.000 0.000 NA   NA
 5630326 5630327 Bsph_2311 Bsph_2312     FALSE 0.092 183.000 0.000 NA   NA
 5630327 5630328 Bsph_2312 Bsph_2314     TRUE 0.880 -22.000 0.000 NA   NA
 5630328 5630329 Bsph_2314 Bsph_2315   yahD FALSE 0.232 143.000 0.000 NA   NA
 5630330 5630331 Bsph_2316 Bsph_2317     TRUE 0.956 9.000 0.000 0.017   NA
 5630331 5630332 Bsph_2317 Bsph_2318   narQ TRUE 0.990 -3.000 0.143 0.022   NA
 5630332 5630333 Bsph_2318 Bsph_2319 narQ   TRUE 0.711 79.000 0.278 NA   NA
 5630333 5630334 Bsph_2319 Bsph_2320     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5630337 5630338 Bsph_2323 Bsph_2324 hfuC   TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5630338 5630339 Bsph_2324 Bsph_2326   fhuB TRUE 0.611 24.000 0.000 NA   NA
 5630339 5630340 Bsph_2326 Bsph_2327 fhuB   TRUE 0.706 182.000 0.857 0.031   NA
 5630340 5630341 Bsph_2327 Bsph_2328   fhuG TRUE 0.876 30.000 0.000 0.031   NA
 5630341 5630342 Bsph_2328 Bsph_2329 fhuG   FALSE 0.290 158.000 0.000 1.000   NA
 5630342 5630343 Bsph_2329 Bsph_2330   marR FALSE 0.006 560.000 0.000 1.000   NA
 5630343 5630344 Bsph_2330 Bsph_2331 marR   TRUE 0.953 14.000 0.370 1.000 N NA
 5630344 5630345 Bsph_2331 Bsph_2332     FALSE 0.185 163.000 0.000 NA N NA
 5630345 5630346 Bsph_2332 Bsph_2333     TRUE 0.993 7.000 0.812 NA Y NA
 5630346 5630347 Bsph_2333 Bsph_2334     TRUE 0.990 -25.000 0.119 NA Y NA
 5630349 5630350 Bsph_2336 Bsph_2337     TRUE 0.735 132.000 0.522 NA N NA
 5630350 5630351 Bsph_2337 Bsph_2338     TRUE 0.988 -3.000 0.731 NA   NA
 5630351 5630352 Bsph_2338 Bsph_2339     TRUE 0.963 -7.000 0.115 NA   NA
 5630353 5630354 Bsph_2340 Bsph_2341     FALSE 0.007 339.000 0.000 NA   NA
 5630355 5630356 Bsph_2342 Bsph_2343   yhcF TRUE 0.963 -3.000 0.105 NA   NA
 5630356 5630357 Bsph_2343 Bsph_2344 yhcF yhcG TRUE 0.971 10.000 0.421 1.000 N NA
 5630357 5630358 Bsph_2344 Bsph_2345 yhcG yhcH TRUE 0.970 44.000 0.133 0.025 Y NA
 5630358 5630359 Bsph_2345 Bsph_2346 yhcH   TRUE 0.966 5.000 0.286 NA   NA
 5630359 5630360 Bsph_2346 Bsph_2347     FALSE 0.150 174.000 0.022 NA   NA
 5630360 5630361 Bsph_2347 Bsph_2348   nagA TRUE 0.913 49.000 0.032 1.000 Y NA
 5630361 5630362 Bsph_2348 Bsph_2349 nagA   FALSE 0.566 74.000 0.028 1.000   NA
 5630362 5630363 Bsph_2349 Bsph_2350     TRUE 0.780 41.000 0.071 1.000   NA
 5630363 5630364 Bsph_2350 Bsph_2351     TRUE 0.990 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 5630364 5630365 Bsph_2351 Bsph_2352   ptsI TRUE 0.997 -3.000 0.140 0.003 Y NA
 5630365 5630366 Bsph_2352 Bsph_2353 ptsI   TRUE 0.983 -19.000 0.000 0.001   NA
 5630367 5630368 Bsph_2354 Bsph_2355     TRUE 0.603 26.000 0.000 NA   NA
 5630369 5630370 Bsph_2356 Bsph_2357     FALSE 0.569 32.000 0.000 NA   NA
 5630370 5630371 Bsph_2357 Bsph_2359     FALSE 0.378 68.000 0.000 NA   NA
 5630372 5630373 Bsph_2360 Bsph_2362     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 5630374 5630375 Bsph_2363 Bsph_2364     TRUE 0.781 92.000 0.007 NA Y NA
 5630375 5630376 Bsph_2364 Bsph_2365   ycbL FALSE 0.061 227.000 0.000 1.000 N NA
 5630376 5630377 Bsph_2365 Bsph_2366 ycbL   FALSE 0.346 75.000 0.000 NA   NA
 5630377 5630378 Bsph_2366 Bsph_2367     FALSE 0.346 75.000 0.000 NA   NA
 5630378 5630379 Bsph_2367 Bsph_2368     TRUE 0.792 16.000 0.054 NA   NA
 5630379 5630380 Bsph_2368 Bsph_2369     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5630381 5630382 Bsph_2370 Bsph_2371     FALSE 0.418 125.000 0.050 NA   NA
 5630385 5630386 Bsph_2374 Bsph_2375     TRUE 0.942 11.000 0.273 NA   NA
 5630386 5630387 Bsph_2375 Bsph_2376     FALSE 0.127 172.000 0.000 NA   NA
 5630387 5630388 Bsph_2376 Bsph_2378     FALSE 0.530 38.000 0.000 NA   NA
 5630388 5630389 Bsph_2378 Bsph_2379   bceA TRUE 0.978 4.000 0.250 1.000 N NA
 5630389 5630390 Bsph_2379 Bsph_2380 bceA   TRUE 0.781 125.000 0.400 1.000 N NA
 5630390 5630391 Bsph_2380 Bsph_2381     TRUE 0.985 -13.000 0.667 NA   NA
 5630391 5630392 Bsph_2381 Bsph_2382     FALSE 0.298 120.000 0.000 NA   NA
 5630392 5630393 Bsph_2382 Bsph_2383     FALSE 0.213 148.000 0.000 NA   NA
 5630393 5630394 Bsph_2383 Bsph_2384   aepA TRUE 0.799 19.000 0.021 1.000   NA
 5630396 5630397 Bsph_2386 Bsph_2387     FALSE 0.409 117.000 0.041 NA   NA
 5630397 5630398 Bsph_2387 Bsph_2388     TRUE 0.812 109.000 1.000 NA   NA
 5630398 5630399 Bsph_2388 Bsph_2389     TRUE 0.986 -10.000 0.100 0.068 N NA
 5630399 5630400 Bsph_2389 Bsph_2390     TRUE 0.862 23.000 0.100 1.000   NA
 5630400 5630401 Bsph_2390 Bsph_2391     FALSE 0.524 39.000 0.000 NA   NA
 5630401 5630402 Bsph_2391 Bsph_2392     TRUE 0.817 58.000 0.400 NA   NA
 5630402 5630403 Bsph_2392 Bsph_2393     FALSE 0.298 98.000 0.000 NA   NA
 5630403 5630404 Bsph_2393 Bsph_2394     FALSE 0.499 44.000 0.000 NA   NA
 5630404 5630405 Bsph_2394 Bsph_2395     FALSE 0.373 69.000 0.000 NA   NA
 5630405 5630406 Bsph_2395 Bsph_2396     TRUE 0.636 91.000 0.182 NA   NA
 5630407 5630408 Bsph_2397 Bsph_2398     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5630409 5630410 Bsph_2399 Bsph_2400     TRUE 0.956 -3.000 0.021 1.000   NA
 5630410 5630411 Bsph_2400 Bsph_2401     FALSE 0.425 112.000 0.049 NA   NA
 5630411 5630412 Bsph_2401 Bsph_2402     FALSE 0.494 72.000 0.049 NA   NA
 5630412 5630413 Bsph_2402 Bsph_2403     FALSE 0.003 505.000 0.000 NA   NA
 5630417 5630418 Bsph_2407 Bsph_2408     FALSE 0.505 72.000 0.054 NA   NA
 5630418 5630419 Bsph_2408 Bsph_2409     TRUE 0.943 -7.000 0.054 NA   NA
 5630419 5630420 Bsph_2409 Bsph_2410     TRUE 0.976 9.000 1.000 NA   NA
 5630420 5630421 Bsph_2410 Bsph_2411     FALSE 0.003 524.000 0.000 NA   NA
 5630423 5630424 Bsph_2413 Bsph_2414     TRUE 0.972 4.000 0.333 NA   NA
 5630424 5630425 Bsph_2414 Bsph_2415     TRUE 0.837 46.000 0.333 NA   NA
 5630425 5630426 Bsph_2415 Bsph_2416     FALSE 0.003 592.000 0.000 NA   NA
 5630426 5630427 Bsph_2416 Bsph_2417     TRUE 0.813 120.000 1.000 NA   NA
 5630427 5630428 Bsph_2417 Bsph_2418   yhhS FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 5630428 5630429 Bsph_2418 Bsph_2419 yhhS   TRUE 0.737 77.000 0.182 1.000   NA
 5630430 5630431 Bsph_2420 Bsph_2421     TRUE 0.764 141.000 1.000 NA   NA
 5630434 5630435 Bsph_2424 Bsph_2425     FALSE 0.265 154.000 0.035 NA   NA
 5630439 5630440 Bsph_2429 Bsph_2430     FALSE 0.042 212.000 0.000 NA   NA
 5630442 5630443 Bsph_2432 Bsph_2433 ybbD   FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 5630445 5630446 Bsph_2435 Bsph_2436     TRUE 0.979 0.000 0.333 NA   NA
 5630448 5630449 Bsph_2438 Bsph_2439     FALSE 0.006 622.000 0.000 1.000 N NA
 5630449 5630450 Bsph_2439 Bsph_2440     FALSE 0.318 89.000 0.000 NA   NA
 5630450 5630451 Bsph_2440 Bsph_2441     FALSE 0.136 170.000 0.000 NA   NA
 5630451 5630452 Bsph_2441 Bsph_2442   cobD TRUE 0.913 -3.000 0.009 NA   NA
 5630452 5630453 Bsph_2442 Bsph_2443 cobD   TRUE 0.974 -13.000 0.112 1.000 N NA
 5630453 5630454 Bsph_2443 Bsph_2444     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5630454 5630455 Bsph_2444 Bsph_2445   cobP TRUE 0.859 13.000 0.006 1.000 N NA
 5630455 5630456 Bsph_2445 Bsph_2446 cobP   TRUE 0.898 -9.000 0.000 NA   NA
 5630456 5630457 Bsph_2446 Bsph_2447     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5630457 5630458 Bsph_2447 Bsph_2448     TRUE 0.950 -27.000 0.028 1.000 N NA
 5630458 5630459 Bsph_2448 Bsph_2449     TRUE 0.984 0.000 0.434 NA N NA
 5630459 5630460 Bsph_2449 Bsph_2450     TRUE 0.703 33.000 0.056 NA   NA
 5630460 5630461 Bsph_2450 Bsph_2451     TRUE 0.960 12.000 0.639 NA   NA
 5630463 5630464 Bsph_2453 Bsph_2454 yfiB   TRUE 0.998 -3.000 0.240 0.003 Y NA
 5630464 5630465 Bsph_2454 Bsph_2455     TRUE 0.706 20.000 0.028 NA   NA
 5630465 5630466 Bsph_2455 Bsph_2456     FALSE 0.297 112.000 0.000 NA   NA
 5630466 5630467 Bsph_2456 Bsph_2457     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5630467 5630468 Bsph_2457 Bsph_2458   yrkP TRUE 0.979 2.000 0.421 NA   NA
 5630468 5630469 Bsph_2458 Bsph_2459 yrkP   TRUE 0.996 -16.000 0.500 1.000 Y NA
 5630470 5630471 Bsph_2460 Bsph_2461   soxR FALSE 0.576 123.000 0.069 1.000   NA
 5630472 5630473 Bsph_2462 Bsph_2463     TRUE 0.669 30.000 0.031 NA   NA
 5630473 5630474 Bsph_2463 Bsph_2464     FALSE 0.127 194.000 0.071 NA   NA
 5630474 5630475 Bsph_2464 Bsph_2465     FALSE 0.441 55.000 0.000 NA   NA
 5630475 5630476 Bsph_2465 Bsph_2466     FALSE 0.515 41.000 0.000 NA   NA
 5630476 5630477 Bsph_2466 Bsph_2467     TRUE 0.787 45.000 0.182 NA   NA
 5630477 5630478 Bsph_2467 Bsph_2468     FALSE 0.006 359.000 0.000 NA   NA
 5630478 5630479 Bsph_2468 Bsph_2469     TRUE 0.723 16.000 0.019 NA   NA
 5630481 5630482 Bsph_2471 Bsph_2472     FALSE 0.433 161.000 0.182 NA   NA
 5630482 5630483 Bsph_2472 Bsph_2473     TRUE 0.890 55.000 1.000 NA   NA
 5630483 5630484 Bsph_2473 Bsph_2474     FALSE 0.393 65.000 0.000 NA   NA
 5630486 5630487 Bsph_2476 Bsph_2477     FALSE 0.004 452.000 0.000 NA   NA
 5630489 5630490 Bsph_2479 Bsph_2480     TRUE 0.604 61.000 0.004 1.000 N NA
 5630490 5630491 Bsph_2480 Bsph_2481     TRUE 0.897 -10.000 0.004 NA   NA
 5630493 5630494 Bsph_2483 Bsph_2484     FALSE 0.392 162.000 0.143 NA   NA
 5630496 5630497 Bsph_2486 Bsph_2487     FALSE 0.518 96.000 0.091 NA   NA
 5630497 5630498 Bsph_2487 Bsph_2488     TRUE 0.774 30.000 0.091 NA   NA
 5630498 5630499 Bsph_2488 Bsph_2489     TRUE 0.687 158.000 1.000 NA   NA
 5630499 5630500 Bsph_2489 Bsph_2490     FALSE 0.005 407.000 0.000 NA   NA
 5630500 5630501 Bsph_2490 Bsph_2491     FALSE 0.020 242.000 0.000 NA   NA
 5630503 5630504 Bsph_2493 Bsph_2494   ydeE FALSE 0.008 426.000 0.000 1.000   NA
 5630505 5630506 Bsph_2495 Bsph_2496     FALSE 0.322 98.000 0.009 NA   NA
 5630506 5630507 Bsph_2496 Bsph_2497     FALSE 0.584 115.000 0.143 NA   NA
 5630508 5630509 Bsph_2498 Bsph_2499     TRUE 0.917 23.000 0.500 NA   NA
 5630509 5630510 Bsph_2499 Bsph_2500     TRUE 0.715 104.000 0.400 NA   NA
 5630510 5630511 Bsph_2500 Bsph_2501     TRUE 0.720 118.000 0.400 NA   NA
 5630511 5630512 Bsph_2501 Bsph_2502     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   NA
 5630514 5630515 Bsph_2504 Bsph_2505     TRUE 0.720 114.000 0.400 NA   NA
 5630516 5630517 Bsph_2506 Bsph_2507     FALSE 0.004 470.000 0.000 NA   NA
 5630517 5630518 Bsph_2507 Bsph_2508     FALSE 0.535 120.000 0.105 NA   NA
 5630519 5630520 Bsph_2509 Bsph_2510     FALSE 0.072 191.000 0.000 NA   NA
 5630522 5630523 Bsph_2512 Bsph_2513     FALSE 0.007 336.000 0.000 NA   NA
 5630523 5630524 Bsph_2513 Bsph_2514     FALSE 0.008 321.000 0.000 NA   NA
 5630524 5630525 Bsph_2514 Bsph_2515     FALSE 0.322 95.000 0.007 NA   NA
 5630528 5630529 Bsph_2518 Bsph_2519     FALSE 0.005 406.000 0.000 NA   NA
 5630529 5630530 Bsph_2519 Bsph_2520     FALSE 0.014 577.000 0.000 0.082   NA
 5630533 5630534 Bsph_2523 Bsph_2524     FALSE 0.010 303.000 0.000 NA   NA
 5630536 5630537 Bsph_2526 Bsph_2527     TRUE 0.903 9.000 0.083 NA   NA
 5630539 5630540 Bsph_2529 Bsph_2530     FALSE 0.008 321.000 0.000 NA   NA
 5630540 5630541 Bsph_2530 Bsph_2531     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5630544 5630545 Bsph_2534 Bsph_2535     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5630546 5630547 Bsph_2537 Bsph_2538     FALSE 0.005 383.000 0.000 NA   NA
 5630547 5630548 Bsph_2538 Bsph_2539     FALSE 0.010 296.000 0.000 NA   NA
 5630548 5630549 Bsph_2539 Bsph_2540     FALSE 0.403 195.000 1.000 NA   NA
 5630549 5630550 Bsph_2540 Bsph_2541     FALSE 0.003 549.000 0.000 NA   NA
 5630550 5630551 Bsph_2541 Bsph_2542     FALSE 0.105 178.000 0.000 NA   NA
 5630551 5630552 Bsph_2542 Bsph_2543     FALSE 0.005 381.000 0.000 NA   NA
 5630555 5630556 Bsph_2546 Bsph_2547     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 5630557 5630558 Bsph_2548 Bsph_2549     FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5630558 5630559 Bsph_2549 Bsph_2550     FALSE 0.004 425.000 0.000 NA   NA
 5630559 5630560 Bsph_2550 Bsph_2551     TRUE 0.950 -12.000 0.081 NA   NA
 5630560 5630561 Bsph_2551 Bsph_2552     FALSE 0.411 66.000 0.009 NA   NA
 5630561 5630562 Bsph_2552 Bsph_2553     FALSE 0.003 560.000 0.000 NA   NA
 5630562 5630563 Bsph_2553 Bsph_2554     FALSE 0.003 521.000 0.000 NA   NA
 5630564 5630565 Bsph_2555 Bsph_2556     FALSE 0.003 711.000 0.000 NA   NA
 5630566 5630567 Bsph_2557 Bsph_2558     FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 5630567 5630568 Bsph_2558 Bsph_2559     FALSE 0.364 71.000 0.000 NA   NA
 5630568 5630569 Bsph_2559 Bsph_2560     FALSE 0.079 188.000 0.000 NA   NA
 5630569 5630570 Bsph_2560 Bsph_2561     FALSE 0.003 764.000 0.000 NA   NA
 5630570 5630571 Bsph_2561 Bsph_2562     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5630571 5630572 Bsph_2562 Bsph_2563     TRUE 0.797 9.000 0.000 NA   NA
 5630575 5630576 Bsph_2566 Bsph_2567     TRUE 0.964 3.000 0.096 1.000   NA
 5630577 5630578 Bsph_2568 Bsph_2569 sigV   TRUE 0.982 -25.000 0.600 NA   NA
 5630578 5630579 Bsph_2569 Bsph_2570     FALSE 0.298 114.000 0.000 NA   NA
 5630581 5630582 Bsph_2572 Bsph_2573     FALSE 0.013 337.000 0.000 1.000   NA
 5630582 5630583 Bsph_2573 Bsph_2574     FALSE 0.294 106.000 0.000 NA   NA
 5630583 5630584 Bsph_2574 Bsph_2575     FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 5630584 5630585 Bsph_2575 Bsph_2576     FALSE 0.003 894.000 0.000 NA   NA
 5630586 5630587 Bsph_2578 Bsph_2579     FALSE 0.003 1075.000 0.000 NA   NA
 5630587 5630588 Bsph_2579 Bsph_2580     FALSE 0.007 481.000 0.000 1.000   NA
 5630589 5630590 Bsph_2581 Bsph_2582 yfiE   TRUE 0.880 -22.000 0.000 NA   NA
 5630593 5630594 Bsph_2585 Bsph_2586     TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5630594 5630595 Bsph_2586 Bsph_2587     FALSE 0.003 622.000 0.000 NA   NA
 5630595 5630596 Bsph_2587 Bsph_2588     FALSE 0.510 42.000 0.000 NA   NA
 5630596 5630597 Bsph_2588 Bsph_2589     FALSE 0.004 445.000 0.000 NA   NA
 5630597 5630598 Bsph_2589 Bsph_2590     FALSE 0.127 172.000 0.000 NA   NA
 5630599 5630600 Bsph_2591 Bsph_2592     FALSE 0.007 328.000 0.000 NA   NA
 5630600 5630601 Bsph_2592 Bsph_2593     FALSE 0.072 191.000 0.000 NA   NA
 5630601 5630602 Bsph_2593 Bsph_2594     FALSE 0.520 40.000 0.000 NA   NA
 5630602 5630603 Bsph_2594 Bsph_2599     FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 5630604 5630605 Bsph_2600 Bsph_2602   gerKB FALSE 0.515 41.000 0.000 NA   NA
 5630605 5630606 Bsph_2602 Bsph_2603 gerKB   TRUE 0.922 55.000 0.294 0.012   NA
 5630606 5630607 Bsph_2603 Bsph_2604     FALSE 0.015 1035.000 0.000 0.012   NA
 5630607 5630608 Bsph_2604 Bsph_2605     TRUE 0.970 5.000 0.000 0.012   NA
 5630609 5630610 Bsph_2606 Bsph_2607     FALSE 0.076 189.000 0.000 NA   NA
 5630611 5630612 Bsph_2608 Bsph_2609     FALSE 0.008 326.000 0.000 NA   NA
 5630612 5630613 Bsph_2609 Bsph_2610     FALSE 0.251 136.000 0.000 NA   NA
 5630614 5630615 Bsph_2611 Bsph_2612     FALSE 0.005 398.000 0.000 NA   NA
 5630615 5630616 Bsph_2612 Bsph_2613     FALSE 0.021 241.000 0.000 NA   NA
 5630616 5630617 Bsph_2613 Bsph_2614   ntpA TRUE 0.609 150.000 0.000 0.016 N NA
 5630619 5630620 Bsph_2616 Bsph_2617     TRUE 0.838 13.000 0.000 1.000   NA
 5630620 5630621 Bsph_2617 Bsph_2618   yxiE TRUE 0.980 -25.000 0.000 0.003   NA
 5630621 5630622 Bsph_2618 Bsph_2619 yxiE   FALSE 0.499 44.000 0.000 NA   NA
 5630622 5630623 Bsph_2619 Bsph_2620     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 5630623 5630624 Bsph_2620 Bsph_2621     FALSE 0.020 243.000 0.000 NA   NA
 5630624 5630625 Bsph_2621 Bsph_2622     FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 5630625 5630626 Bsph_2622 Bsph_2623   yrkC FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 5630626 5630627 Bsph_2623 Bsph_2624 yrkC   FALSE 0.005 465.000 0.000 NA N NA
 5630627 5630628 Bsph_2624 Bsph_2625     TRUE 0.952 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5630628 5630629 Bsph_2625 Bsph_2626     FALSE 0.588 64.000 0.000 1.000 N NA
 5630629 5630630 Bsph_2626 Bsph_2627     FALSE 0.478 86.000 0.000 1.000   NA
 5630630 5630631 Bsph_2627 Bsph_2628     TRUE 0.970 2.000 0.116 1.000   NA
 5630631 5630632 Bsph_2628 Bsph_2629     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5630633 5630634 Bsph_2630 Bsph_2631     FALSE 0.032 225.000 0.000 NA   NA
 5630634 5630635 Bsph_2631 Bsph_2632   gerKC FALSE 0.008 319.000 0.000 NA   NA
 5630636 5630637 Bsph_2633 Bsph_2634     FALSE 0.003 927.000 0.000 NA   NA
 5630637 5630638 Bsph_2634 Bsph_2635     FALSE 0.159 163.000 0.000 NA   NA
 5630641 5630642 Bsph_2638 Bsph_2639     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5630643 5630644 Bsph_2640 Bsph_2641     FALSE 0.005 393.000 0.000 NA   NA
 5630644 5630645 Bsph_2641 Bsph_2642     FALSE 0.021 241.000 0.000 NA   NA
 5630650 5630651 Bsph_2648 Bsph_2649     FALSE 0.003 555.000 0.000 NA   NA
 5630652 5630653 Bsph_2650 Bsph_2651     FALSE 0.005 392.000 0.000 NA   NA
 5630653 5630654 Bsph_2651 Bsph_2652     FALSE 0.003 604.000 0.000 NA   NA
 5630656 5630657 Bsph_2654 Bsph_2655     FALSE 0.053 201.000 0.000 NA   NA
 5630657 5630658 Bsph_2655 Bsph_2656     FALSE 0.012 280.000 0.000 NA   NA
 5630658 5630659 Bsph_2656 Bsph_2657     FALSE 0.005 411.000 0.000 NA   NA
 5630659 5630660 Bsph_2657 Bsph_2658     FALSE 0.004 453.000 0.000 NA   NA
 5630660 5630661 Bsph_2658 Bsph_2659     FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5630661 5630662 Bsph_2659 Bsph_2660     FALSE 0.003 1129.000 0.000 NA   NA
 5630662 5630663 Bsph_2660 Bsph_2661     FALSE 0.223 145.000 0.000 NA   NA
 5630665 5630666 Bsph_2663 Bsph_2664     TRUE 0.760 22.000 0.061 NA   NA
 5630668 5630669 Bsph_2666 Bsph_2667   smtA6 FALSE 0.016 258.000 0.000 NA   NA
 5630669 5630670 Bsph_2667 Bsph_2668 smtA6   TRUE 0.954 1.000 0.036 1.000   NA
 5630670 5630671 Bsph_2668 Bsph_2669     FALSE 0.014 331.000 0.000 1.000   NA
 5630671 5630672 Bsph_2669 Bsph_2670     TRUE 0.975 0.000 0.247 NA   NA
 5630672 5630673 Bsph_2670 Bsph_2671     TRUE 0.733 15.000 0.017 NA   NA
 5630673 5630674 Bsph_2671 Bsph_2672     TRUE 0.817 10.000 0.017 NA   NA
 5630674 5630675 Bsph_2672 Bsph_2673     FALSE 0.452 183.000 0.667 NA   NA
 5630675 5630676 Bsph_2673 Bsph_2674     FALSE 0.053 201.000 0.000 NA   NA
 5630676 5630677 Bsph_2674 Bsph_2675     FALSE 0.025 232.000 0.000 NA   NA
 5630677 5630678 Bsph_2675 Bsph_2676     FALSE 0.003 557.000 0.000 NA   NA
 5630682 5630683 Bsph_2680 Bsph_2681     TRUE 0.957 0.000 0.100 NA   NA
 5630683 5630684 Bsph_2681 Bsph_2682     TRUE 0.952 12.000 0.030 0.019   NA
 5630685 5630686 Bsph_2683 Bsph_2684     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5630686 5630687 Bsph_2684 Bsph_2685     FALSE 0.019 296.000 0.000 1.000   NA
 5630688 5630689 Bsph_2686 Bsph_2687     FALSE 0.311 192.000 0.400 NA   NA
 5630690 5630691 Bsph_2688 Bsph_2689     FALSE 0.423 215.000 0.000 0.071 Y NA
 5630691 5630692 Bsph_2689 Bsph_2690   comP TRUE 0.997 -25.000 1.000 1.000 Y NA
 5630693 5630694 Bsph_2691 Bsph_2692     FALSE 0.336 79.000 0.003 NA   NA
 5630694 5630695 Bsph_2692 Bsph_2693     FALSE 0.102 179.000 0.003 NA   NA
 5630695 5630696 Bsph_2693 Bsph_2694     TRUE 0.822 93.000 1.000 NA   NA
 5630696 5630697 Bsph_2694 Bsph_2695   ywnA TRUE 0.814 115.000 1.000 NA   NA
 5630697 5630698 Bsph_2695 Bsph_2696 ywnA   TRUE 0.852 72.000 1.000 NA   NA
 5630698 5630699 Bsph_2696 Bsph_2697     FALSE 0.022 285.000 0.000 1.000   NA
 5630699 5630700 Bsph_2697 Bsph_2698     FALSE 0.389 144.000 0.000 1.000 N NA
 5630700 5630701 Bsph_2698 Bsph_2699     FALSE 0.008 468.000 0.000 1.000 N NA
 5630701 5630702 Bsph_2699 Bsph_2700     TRUE 0.987 15.000 0.067 0.001 Y NA
 5630702 5630703 Bsph_2700 Bsph_2701     TRUE 0.997 -3.000 0.051 0.001 Y NA
 5630703 5630704 Bsph_2701 Bsph_2702   ureE TRUE 0.913 53.000 0.087 0.001 N NA
 5630704 5630705 Bsph_2702 Bsph_2703 ureE ureF TRUE 0.991 20.000 0.460 0.002 Y NA
 5630705 5630706 Bsph_2703 Bsph_2704 ureF ureG TRUE 0.992 18.000 0.439 0.002 Y NA
 5630706 5630707 Bsph_2704 Bsph_2705 ureG ureD TRUE 0.935 152.000 0.337 0.002 Y NA
 5630707 5630708 Bsph_2705 Bsph_2706 ureD   TRUE 0.649 55.000 0.012 1.000 N NA
 5630708 5630709 Bsph_2706 Bsph_2707   appB TRUE 0.997 -10.000 0.235 0.029 Y NA
 5630709 5630710 Bsph_2707 Bsph_2708 appB appC TRUE 0.998 -3.000 0.353 0.029 Y NA
 5630710 5630711 Bsph_2708 Bsph_2709 appC   TRUE 0.983 11.000 0.118 1.000 Y NA
 5630711 5630712 Bsph_2709 Bsph_2710   nikE TRUE 0.993 -19.000 0.000 0.024 Y NA
 5630713 5630714 Bsph_2711 Bsph_2712     FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5630715 5630716 Bsph_2713 Bsph_2714     FALSE 0.008 321.000 0.000 NA   NA
 5630716 5630717 Bsph_2714 Bsph_2715     FALSE 0.024 234.000 0.000 NA   NA
 5630717 5630718 Bsph_2715 Bsph_2716     FALSE 0.003 1127.000 0.000 NA   NA
 5630720 5630721 Bsph_2718 Bsph_2719     TRUE 0.826 53.000 0.200 1.000   NA
 5630721 5630722 Bsph_2719 Bsph_2720     FALSE 0.359 72.000 0.000 NA   NA
 5630723 5630724 Bsph_2722 Bsph_2723 ywbD   TRUE 0.904 3.000 0.025 NA   NA
 5630725 5630726 Bsph_2724 Bsph_2725     TRUE 0.754 30.000 0.005 1.000 N NA
 5630726 5630727 Bsph_2725 Bsph_2726     FALSE 0.010 296.000 0.000 NA   NA
 5630729 5630730 Bsph_2728 Bsph_2729     TRUE 0.887 -15.000 0.000 NA   NA
 5630730 5630731 Bsph_2729 Bsph_2730     FALSE 0.148 184.000 0.051 NA   NA
 5630731 5630732 Bsph_2730 Bsph_2731     TRUE 0.981 5.000 0.828 NA   NA
 5630732 5630733 Bsph_2731 Bsph_2732     TRUE 0.822 13.000 0.047 NA   NA
 5630733 5630734 Bsph_2732 Bsph_2733     TRUE 0.997 -7.000 0.054 0.001 Y NA
 5630736 5630737 Bsph_2735 Bsph_2736     TRUE 0.600 112.000 0.159 NA   NA
 5630737 5630738 Bsph_2736 Bsph_2737     TRUE 0.986 2.000 0.040 0.001   NA
 5630740 5630741 Bsph_2739 Bsph_2740     FALSE 0.015 265.000 0.000 NA   NA
 5630741 5630742 Bsph_2740 Bsph_2741     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5630745 5630746 Bsph_2744 Bsph_2745     FALSE 0.461 52.000 0.000 NA   NA
 5630747 5630748 Bsph_2746 Bsph_2747     FALSE 0.074 215.000 0.000 1.000   NA
 5630751 5630752 Bsph_2750 Bsph_2751     FALSE 0.034 324.000 0.000 0.080   NA
 5630752 5630753 Bsph_2751 Bsph_2752     TRUE 0.801 18.000 0.074 NA   NA
 5630754 5630755 Bsph_2753 Bsph_2754     TRUE 0.781 44.000 0.069 1.000 N NA
 5630755 5630756 Bsph_2754 Bsph_2755     FALSE 0.079 188.000 0.000 NA   NA
 5630756 5630757 Bsph_2755 Bsph_2756     FALSE 0.144 168.000 0.000 NA   NA
 5630759 5630760 Bsph_2758 Bsph_2759     FALSE 0.016 520.000 0.000 0.038   NA
 5630760 5630761 Bsph_2759 Bsph_2760   yurT TRUE 0.813 50.000 0.286 NA   NA
 5630762 5630763 Bsph_2761 Bsph_2762     FALSE 0.007 338.000 0.000 NA   NA
 5630765 5630766 Bsph_2764 Bsph_2765     FALSE 0.495 94.000 0.074 NA   NA
 5630767 5630768 Bsph_2766 Bsph_2767     FALSE 0.304 120.000 0.004 NA   NA
 5630768 5630769 Bsph_2767 Bsph_2768     TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5630769 5630770 Bsph_2768 Bsph_2769     FALSE 0.009 307.000 0.000 NA   NA
 5630772 5630773 Bsph_2771 Bsph_2773     FALSE 0.359 72.000 0.000 NA   NA
 5630773 5630774 Bsph_2773 Bsph_2775     FALSE 0.004 445.000 0.000 NA   NA
 5630774 5630775 Bsph_2775 Bsph_2776     FALSE 0.029 227.000 0.000 NA   NA
 5630775 5630776 Bsph_2776 Bsph_2777     TRUE 0.995 -3.000 0.500 0.011   NA
 5630776 5630777 Bsph_2777 Bsph_2778     TRUE 0.988 -10.000 0.111 0.011   NA
 5630781 5630782 Bsph_2782 Bsph_2783     TRUE 0.951 48.000 0.015 0.020 Y NA
 5630782 5630783 Bsph_2783 Bsph_2784     TRUE 0.927 96.000 0.438 1.000 Y NA
 5630783 5630784 Bsph_2784 Bsph_2785     FALSE 0.021 302.000 0.006 1.000 N NA
 5630784 5630785 Bsph_2785 Bsph_2786     TRUE 0.944 86.000 0.667 1.000 Y NA
 5630785 5630786 Bsph_2786 Bsph_2787     FALSE 0.006 639.000 0.000 1.000 N NA
 5630786 5630787 Bsph_2787 Bsph_2788   glnP TRUE 0.876 170.000 0.339 0.035 Y NA
 5630787 5630788 Bsph_2788 Bsph_2789 glnP yqiZ TRUE 0.990 13.000 0.758 1.000 Y NA
 5630788 5630789 Bsph_2789 Bsph_2790 yqiZ   FALSE 0.014 272.000 0.000 NA   NA
 5630790 5630791 Bsph_2791 Bsph_2792     TRUE 0.982 -3.000 0.373 NA   NA
 5630793 5630794 Bsph_2794 Bsph_2795     TRUE 0.904 25.000 0.200 1.000 N NA
 5630795 5630796 Bsph_2796 Bsph_2797   cspA FALSE 0.033 223.000 0.000 NA   NA
 5630796 5630797 Bsph_2797 Bsph_2798 cspA   FALSE 0.008 325.000 0.000 NA   NA
 5630798 5630799 Bsph_2799 Bsph_2800     TRUE 0.878 -25.000 0.000 NA   NA
 5630799 5630800 Bsph_2800 Bsph_2801     FALSE 0.320 88.000 0.000 NA   NA
 5630801 5630802 Bsph_2802 Bsph_2803     TRUE 0.699 80.000 0.250 NA   NA
 5630802 5630803 Bsph_2803 Bsph_2804     TRUE 0.921 20.000 0.250 1.000 N NA
 5630803 5630804 Bsph_2804 Bsph_2805     TRUE 0.725 133.000 0.065 0.024   NA
 5630806 5630807 Bsph_2807 Bsph_2808     FALSE 0.003 864.000 0.000 NA   NA
 5630807 5630808 Bsph_2808 Bsph_2809     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5630809 5630810 Bsph_2810 Bsph_2811     TRUE 0.777 41.000 0.143 NA   NA
 5630811 5630812 Bsph_2812 Bsph_2813     FALSE 0.008 325.000 0.000 NA   NA
 5630812 5630813 Bsph_2813 Bsph_2814     FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 5630813 5630814 Bsph_2814 Bsph_2815     TRUE 0.612 77.000 0.127 NA   NA
 5630814 5630815 Bsph_2815 Bsph_2816     FALSE 0.417 60.000 0.000 NA   NA
 5630815 5630816 Bsph_2816 Bsph_2817     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5630816 5630817 Bsph_2817 Bsph_2818     TRUE 0.929 -34.000 0.000 1.000   NA
 5630818 5630819 Bsph_2819 Bsph_2820 vanRB adhB FALSE 0.154 185.000 0.000 1.000   NA
 5630820 5630821 Bsph_2821 Bsph_2822     FALSE 0.003 502.000 0.000 NA   NA
 5630821 5630822 Bsph_2822 Bsph_2823     FALSE 0.167 161.000 0.000 NA   NA
 5630822 5630823 Bsph_2823 Bsph_2824     FALSE 0.520 40.000 0.000 NA   NA
 5630823 5630824 Bsph_2824 Bsph_2825     FALSE 0.003 1022.000 0.000 NA   NA
 5630824 5630825 Bsph_2825 Bsph_2826     TRUE 0.984 -3.000 0.222 1.000 N NA
 5630825 5630826 Bsph_2826 Bsph_2827     FALSE 0.004 457.000 0.000 NA   NA
 5630826 5630827 Bsph_2827 Bsph_2828   lipA FALSE 0.006 373.000 0.000 NA   NA
 5630828 5630829 Bsph_2829 Bsph_2830     FALSE 0.294 105.000 0.000 NA   NA
 5630830 5630831 Bsph_2831 Bsph_2832     FALSE 0.003 1107.000 0.000 NA   NA
 5630833 5630834 Bsph_2834 Bsph_2835     FALSE 0.007 329.000 0.000 NA   NA
 5630834 5630835 Bsph_2835 Bsph_2836     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5630835 5630836 Bsph_2836 Bsph_2837   yycB FALSE 0.437 77.000 0.021 NA N NA
 5630836 5630837 Bsph_2837 Bsph_2838 yycB   FALSE 0.441 55.000 0.000 NA   NA
 5630837 5630838 Bsph_2838 Bsph_2839     FALSE 0.016 257.000 0.000 NA   NA
 5630838 5630839 Bsph_2839 Bsph_2840     TRUE 0.899 8.000 0.014 1.000   NA
 5630841 5630842 Bsph_2842 Bsph_2843 msrR   FALSE 0.535 65.000 0.051 NA   NA
 5630842 5630843 Bsph_2843 Bsph_2844     FALSE 0.368 70.000 0.000 NA   NA
 5630846 5630847 Bsph_2848 Bsph_2849     FALSE 0.006 364.000 0.000 NA   NA
 5630849 5630850 Bsph_2851 Bsph_2852     FALSE 0.491 62.000 0.027 NA   NA
 5630850 5630851 Bsph_2852 Bsph_2853     TRUE 0.888 50.000 0.805 NA   NA
 5630852 5630853 Bsph_2854 Bsph_2855     FALSE 0.007 340.000 0.000 NA   NA
 5630853 5630854 Bsph_2855 Bsph_2856     TRUE 0.605 54.000 0.057 NA   NA
 5630856 5630857 Bsph_2858 Bsph_2859     FALSE 0.050 204.000 0.000 NA   NA
 5630857 5630858 Bsph_2859 Bsph_2860     FALSE 0.005 378.000 0.000 NA   NA
 5630858 5630859 Bsph_2860 Bsph_2861     FALSE 0.018 318.000 0.000 1.000 N NA
 5630860 5630861 Bsph_2862 Bsph_2863     TRUE 0.994 -7.000 0.250 NA Y NA
 5630861 5630862 Bsph_2863 Bsph_2864     FALSE 0.005 412.000 0.000 NA   NA
 5630862 5630863 Bsph_2864 Bsph_2865     TRUE 0.944 5.000 0.125 NA   NA
 5630864 5630865 Bsph_2866 Bsph_2867     FALSE 0.020 244.000 0.000 NA   NA
 5630865 5630866 Bsph_2867 Bsph_2868     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5630866 5630867 Bsph_2868 Bsph_2869     FALSE 0.560 133.000 0.167 NA   NA
 5630867 5630868 Bsph_2869 Bsph_2870     FALSE 0.477 151.000 0.167 NA   NA
 5630869 5630870 Bsph_2871 Bsph_2872 gerHC   TRUE 0.872 120.000 0.333 0.011   NA
 5630870 5630871 Bsph_2872 Bsph_2873     TRUE 0.977 17.000 0.667 0.011   NA
 5630872 5630873 Bsph_2874 Bsph_2875     FALSE 0.017 253.000 0.000 NA   NA
 5630873 5630874 Bsph_2875 Bsph_2876     FALSE 0.062 223.000 0.000 1.000   NA
 5630874 5630875 Bsph_2876 Bsph_2877     TRUE 0.927 13.000 0.118 1.000 N NA
 5630875 5630876 Bsph_2877 Bsph_2878     TRUE 0.995 -3.000 0.256 1.000 Y NA
 5630877 5630878 Bsph_2879 Bsph_2881     FALSE 0.176 158.000 0.000 NA   NA
 5630878 5630879 Bsph_2881 Bsph_2882     FALSE 0.421 59.000 0.000 NA   NA
 5630879 5630880 Bsph_2882 Bsph_2883     FALSE 0.430 57.000 0.000 NA   NA
 5630882 5630883 Bsph_2885 Bsph_2886   qoxC TRUE 0.911 98.000 0.959 0.028   NA
 5630883 5630884 Bsph_2886 Bsph_2887 qoxC qoxB TRUE 0.999 -3.000 0.957 0.028 Y NA
 5630884 5630885 Bsph_2887 Bsph_2888 qoxB   TRUE 0.949 69.000 0.085 0.007 Y NA
 5630886 5630887 Bsph_2889 Bsph_2890     FALSE 0.003 926.000 0.000 NA   NA
 5630887 5630888 Bsph_2890 Bsph_2891     FALSE 0.007 338.000 0.000 NA   NA
 5630890 5630891 Bsph_2893 Bsph_2894     FALSE 0.387 66.000 0.000 NA   NA
 5630891 5630892 Bsph_2894 Bsph_2895     FALSE 0.004 444.000 0.000 NA   NA
 5630894 5630895 Bsph_2897 Bsph_2898     FALSE 0.013 335.000 0.000 1.000   NA
 5630895 5630896 Bsph_2898 Bsph_2899     TRUE 0.735 28.000 0.059 NA   NA
 5630896 5630897 Bsph_2899 Bsph_2900     FALSE 0.290 133.000 0.013 NA   NA
 5630897 5630898 Bsph_2900 Bsph_2901     TRUE 0.984 19.000 0.200 0.063 Y NA
 5630898 5630899 Bsph_2901 Bsph_2902     TRUE 0.982 0.000 0.412 NA   NA
 5630899 5630900 Bsph_2902 Bsph_2903     TRUE 0.965 -3.000 0.118 NA   NA
 5630900 5630901 Bsph_2903 Bsph_2904     TRUE 0.988 -3.000 0.800 NA   NA
 5630901 5630902 Bsph_2904 Bsph_2905     FALSE 0.005 882.000 0.000 1.000   NA
 5630906 5630907 Bsph_2909 Bsph_2910     FALSE 0.004 462.000 0.000 NA   NA
 5630907 5630908 Bsph_2910 Bsph_2911     TRUE 0.873 -34.000 0.000 NA   NA
 5630908 5630909 Bsph_2911 Bsph_2912     FALSE 0.004 439.000 0.000 NA   NA
 5630909 5630910 Bsph_2912 Bsph_2913     TRUE 0.833 58.000 0.244 1.000 N NA
 5630910 5630911 Bsph_2913 Bsph_2914     FALSE 0.008 454.000 0.000 1.000   NA
 5630911 5630912 Bsph_2914 Bsph_2915   yxeB FALSE 0.006 632.000 0.000 1.000   NA
 5630912 5630913 Bsph_2915 Bsph_2916 yxeB ybbB TRUE 0.927 136.000 0.143 0.006 Y NA
 5630913 5630914 Bsph_2916 Bsph_2917 ybbB   FALSE 0.003 652.000 0.000 NA   NA
 5630914 5630915 Bsph_2917 Bsph_2918     FALSE 0.003 637.000 0.000 NA   NA
 5630917 5630918 Bsph_2920 Bsph_2921     TRUE 0.928 33.000 0.143 0.029   NA
 5630919 5630920 Bsph_2922 Bsph_2923     FALSE 0.005 938.000 0.000 1.000   NA
 5630920 5630921 Bsph_2923 Bsph_2924   accD TRUE 0.998 -7.000 0.234 0.002 Y NA
 5630921 5630922 Bsph_2924 Bsph_2925 accD   FALSE 0.007 335.000 0.000 NA   NA
 5630922 5630923 Bsph_2925 Bsph_2926     FALSE 0.003 1340.000 0.000 NA   NA
 5630923 5630924 Bsph_2926 Bsph_2927   vanS FALSE 0.444 130.000 0.000 1.000 N NA
 5630924 5630925 Bsph_2927 Bsph_2928 vanS vanR FALSE 0.546 216.000 0.462 1.000 Y NA
 5630925 5630926 Bsph_2928 Bsph_2929 vanR   FALSE 0.179 183.000 0.000 1.000 N NA
 5630926 5630927 Bsph_2929 Bsph_2930     TRUE 0.944 37.000 0.080 1.000 Y NA
 5630927 5630928 Bsph_2930 Bsph_2931   adaA TRUE 0.992 -7.000 0.176 0.010 N NA
 5630928 5630929 Bsph_2931 Bsph_2932 adaA   FALSE 0.478 86.000 0.059 NA   NA
 5630931 5630932 Bsph_2934 Bsph_2935     TRUE 0.697 64.000 0.154 NA   NA
 5630932 5630933 Bsph_2935 Bsph_2936     FALSE 0.017 252.000 0.000 NA   NA
 5630933 5630934 Bsph_2936 Bsph_2937     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5630934 5630935 Bsph_2937 Bsph_2938     TRUE 0.868 -49.000 0.000 NA   NA
 5630935 5630936 Bsph_2938 Bsph_2939     TRUE 0.932 20.000 0.667 NA   NA
 5630936 5630937 Bsph_2939 Bsph_2940     TRUE 0.900 39.000 0.667 NA   NA
 5630937 5630938 Bsph_2940 Bsph_2941     FALSE 0.003 931.000 0.000 NA   NA
 5630938 5630939 Bsph_2941 Bsph_2942     FALSE 0.027 230.000 0.000 NA   NA
 5630939 5630940 Bsph_2942 Bsph_2943   yhcH TRUE 0.890 44.000 0.667 NA   NA
 5630940 5630941 Bsph_2943 Bsph_2944 yhcH   TRUE 0.962 12.000 0.667 NA   NA
 5630941 5630942 Bsph_2944 Bsph_2945     TRUE 0.937 18.000 0.667 NA   NA
 5630942 5630943 Bsph_2945 Bsph_2946     FALSE 0.111 176.000 0.000 NA   NA
 5630943 5630944 Bsph_2946 Bsph_2947     FALSE 0.037 218.000 0.000 NA   NA
 5630944 5630945 Bsph_2947 Bsph_2948     FALSE 0.012 367.000 0.000 1.000 N NA
 5630945 5630946 Bsph_2948 Bsph_2949     FALSE 0.476 48.000 0.000 NA   NA
 5630946 5630947 Bsph_2949 Bsph_2950     FALSE 0.246 138.000 0.000 NA   NA
 5630947 5630948 Bsph_2950 Bsph_2951     FALSE 0.009 307.000 0.000 NA   NA
 5630948 5630949 Bsph_2951 Bsph_2952     TRUE 0.798 67.000 0.429 NA   NA
 5630949 5630950 Bsph_2952 Bsph_2953     TRUE 0.943 7.000 0.173 NA   NA
 5630953 5630954 Bsph_2956 Bsph_2957     FALSE 0.010 385.000 0.000 1.000   NA
 5630955 5630956 Bsph_2958 Bsph_2959     TRUE 0.834 54.000 0.412 NA   NA
 5630956 5630957 Bsph_2959 Bsph_2960     TRUE 0.948 14.000 0.583 NA   NA
 5630957 5630958 Bsph_2960 Bsph_2961     TRUE 0.857 36.000 0.158 1.000   NA
 5630958 5630959 Bsph_2961 Bsph_2962   rhbF TRUE 0.996 0.000 0.400 1.000 Y NA
 5630959 5630960 Bsph_2962 Bsph_2963 rhbF rhbC TRUE 0.932 149.000 0.214 0.001 Y NA
 5630960 5630961 Bsph_2963 Bsph_2964 rhbC   FALSE 0.007 473.000 0.000 1.000   NA
 5630963 5630964 Bsph_2966 Bsph_2967     TRUE 0.984 15.000 0.029 0.002 Y NA
 5630964 5630965 Bsph_2967 Bsph_2968     TRUE 0.974 11.000 0.020 1.000 Y NA
 5630965 5630966 Bsph_2968 Bsph_2969     TRUE 0.728 46.000 0.033 1.000 N NA
 5630966 5630967 Bsph_2969 Bsph_2970     TRUE 0.858 43.000 0.218 1.000   NA
 5630967 5630968 Bsph_2970 Bsph_2971     TRUE 0.713 99.000 0.216 1.000   NA
 5630970 5630971 Bsph_2973 Bsph_2974 nikE dppD TRUE 0.996 3.000 0.129 0.023 Y NA
 5630971 5630972 Bsph_2974 Bsph_2975 dppD nikC TRUE 0.990 11.000 0.429 1.000 Y NA
 5630972 5630973 Bsph_2975 Bsph_2976 nikC nikB TRUE 0.978 35.000 0.200 0.028 Y NA
 5630973 5630974 Bsph_2976 Bsph_2977 nikB   TRUE 0.940 156.000 0.833 0.028 Y NA
 5630974 5630975 Bsph_2977 Bsph_2978     FALSE 0.035 488.000 0.000 1.000 Y NA
 5630975 5630976 Bsph_2978 Bsph_2979     TRUE 0.985 20.000 0.085 0.001 Y NA
 5630978 5630979 Bsph_2981 Bsph_2982     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5630979 5630980 Bsph_2982 Bsph_2983     FALSE 0.136 170.000 0.000 NA   NA
 5630980 5630981 Bsph_2983 Bsph_2984     FALSE 0.082 187.000 0.000 NA   NA
 5630981 5630982 Bsph_2984 Bsph_2985     FALSE 0.016 257.000 0.000 NA   NA
 5630982 5630983 Bsph_2985 Bsph_2986     FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 5630983 5630984 Bsph_2986 Bsph_2987     FALSE 0.298 98.000 0.000 NA   NA
 5630984 5630985 Bsph_2987 Bsph_2988     FALSE 0.009 331.000 0.000 NA N NA
 5630985 5630986 Bsph_2988 Bsph_2989   arsB FALSE 0.588 64.000 0.000 1.000 N NA
 5630986 5630987 Bsph_2989 Bsph_2990 arsB   FALSE 0.582 65.000 0.000 1.000 N NA
 5630987 5630988 Bsph_2990 Bsph_2991     FALSE 0.004 423.000 0.000 NA   NA
 5630989 5630990 Bsph_2992 Bsph_2993     FALSE 0.046 209.000 0.000 NA   NA
 5630993 5630994 Bsph_2996 Bsph_2997     FALSE 0.298 114.000 0.000 NA   NA
 5630994 5630995 Bsph_2997 Bsph_2998     FALSE 0.005 412.000 0.000 NA   NA
 5630995 5630996 Bsph_2998 Bsph_2999     FALSE 0.278 128.000 0.000 NA   NA
 5630996 5630997 Bsph_2999 Bsph_3000     FALSE 0.016 319.000 0.000 1.000   NA
 5630997 5630998 Bsph_3000 Bsph_3001     FALSE 0.298 114.000 0.000 NA   NA
 5630999 5631000 Bsph_3002 Bsph_3003     TRUE 0.988 1.000 1.000 NA   NA
 5631000 5631001 Bsph_3003 Bsph_3004     FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 5631001 5631002 Bsph_3004 Bsph_3005     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5631002 5631003 Bsph_3005 Bsph_3009     FALSE 0.322 87.000 0.000 NA   NA
 5631004 5631005 Bsph_3010 Bsph_3012     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5631005 5631006 Bsph_3012 Bsph_3013     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5631006 5631007 Bsph_3013 Bsph_3014     TRUE 0.994 -25.000 0.253 1.000 Y NA
 5631007 5631008 Bsph_3014 Bsph_3015     TRUE 0.982 -3.000 0.364 NA   NA
 5631008 5631009 Bsph_3015 Bsph_3016     TRUE 0.934 2.000 0.057 NA   NA
 5631009 5631010 Bsph_3016 Bsph_3017     FALSE 0.005 390.000 0.000 NA   NA
 5631010 5631011 Bsph_3017 Bsph_3019     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5631012 5631013 Bsph_3020 Bsph_3021     TRUE 0.649 20.000 0.008 NA   NA
 5631013 5631014 Bsph_3021 Bsph_3022     TRUE 0.688 148.000 0.667 NA   NA
 5631014 5631015 Bsph_3022 Bsph_3023   gerKC TRUE 0.974 31.000 1.000 0.011   NA
 5631015 5631016 Bsph_3023 Bsph_3024 gerKC   TRUE 0.983 5.000 1.000 NA   NA
 5631016 5631017 Bsph_3024 Bsph_3025     TRUE 0.927 34.000 1.000 NA   NA
 5631020 5631021 Bsph_3028 Bsph_3029     TRUE 0.784 34.000 0.118 NA   NA
 5631023 5631024 Bsph_3032 Bsph_3033     TRUE 0.969 0.000 0.170 NA   NA
 5631024 5631025 Bsph_3033 Bsph_3034     FALSE 0.133 171.000 0.000 NA   NA
 5631025 5631026 Bsph_3034 Bsph_3035     FALSE 0.006 353.000 0.000 NA   NA
 5631030 5631031 Bsph_3039 Bsph_3040     FALSE 0.047 237.000 0.000 1.000 N NA
 5631033 5631034 Bsph_3042 Bsph_3044     FALSE 0.006 357.000 0.000 NA   NA
 5631034 5631035 Bsph_3044 Bsph_3045     FALSE 0.487 46.000 0.000 NA   NA
 5631035 5631036 Bsph_3045 Bsph_3046     FALSE 0.581 30.000 0.000 NA   NA
 5631036 5631037 Bsph_3046 Bsph_3047     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5631037 5631038 Bsph_3047 Bsph_3048     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5631038 5631039 Bsph_3048 Bsph_3049     FALSE 0.022 239.000 0.000 NA   NA
 5631041 5631042 Bsph_3052 Bsph_3053     FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 5631042 5631043 Bsph_3053 Bsph_3054     FALSE 0.003 603.000 0.000 NA   NA
 5631043 5631044 Bsph_3054 Bsph_3055     FALSE 0.003 845.000 0.000 NA   NA
 5631044 5631045 Bsph_3055 Bsph_3056     FALSE 0.003 666.000 0.000 NA   NA
 5631045 5631046 Bsph_3056 Bsph_3057     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 5631046 5631047 Bsph_3057 Bsph_3058     FALSE 0.223 145.000 0.000 NA   NA
 5631047 5631048 Bsph_3058 Bsph_3059     FALSE 0.561 33.000 0.000 NA   NA
 5631048 5631049 Bsph_3059 Bsph_3060     FALSE 0.017 253.000 0.000 NA   NA
 5631049 5631050 Bsph_3060 Bsph_3061     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5631050 5631051 Bsph_3061 Bsph_3062     TRUE 0.886 -16.000 0.000 NA   NA
 5631051 5631052 Bsph_3062 Bsph_3063     FALSE 0.057 198.000 0.000 NA   NA
 5631052 5631053 Bsph_3063 Bsph_3064     FALSE 0.003 1466.000 0.000 NA   NA
 5631055 5631056 Bsph_3066 Bsph_3067   hrtA TRUE 0.703 34.000 0.000 1.000   NA
 5631056 5631057 Bsph_3067 Bsph_3068 hrtA   TRUE 0.888 1.000 0.000 NA   NA
 5631057 5631058 Bsph_3068 Bsph_3070     FALSE 0.140 169.000 0.000 NA   NA
 5631058 5631059 Bsph_3070 Bsph_3071     FALSE 0.003 776.000 0.000 NA   NA
 5631059 5631060 Bsph_3071 Bsph_3072     TRUE 0.631 47.000 0.056 NA   NA
 5631060 5631061 Bsph_3072 Bsph_3073     FALSE 0.136 189.000 0.000 1.000   NA
 5631066 5631067 Bsph_3078 Bsph_3079     FALSE 0.154 165.000 0.000 NA   NA
 5631069 5631070 Bsph_3081 Bsph_3082     TRUE 0.626 90.000 0.167 NA   NA
 5631070 5631071 Bsph_3082 Bsph_3083     FALSE 0.027 229.000 0.000 NA   NA
 5631071 5631072 Bsph_3083 Bsph_3084     FALSE 0.005 404.000 0.000 NA   NA
 5631073 5631074 Bsph_3085 Bsph_3086     FALSE 0.003 1080.000 0.000 NA   NA
 5631074 5631075 Bsph_3086 Bsph_3087   ykvL FALSE 0.508 46.000 0.008 NA   NA
 5631075 5631076 Bsph_3087 Bsph_3088 ykvL   TRUE 0.871 47.000 0.280 1.000 N NA
 5631076 5631077 Bsph_3088 Bsph_3089   queC TRUE 0.956 3.000 0.062 1.000   NA
 5631077 5631078 Bsph_3089 Bsph_3090 queC   FALSE 0.553 120.000 0.053 1.000   NA
 5631079 5631080 Bsph_3091 Bsph_3092     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 5631081 5631082 Bsph_3093 Bsph_3094     FALSE 0.482 94.000 0.069 NA   NA
 5631082 5631083 Bsph_3094 Bsph_3095     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 5631083 5631084 Bsph_3095 Bsph_3096     FALSE 0.003 957.000 0.000 NA   NA
 5631085 5631086 Bsph_3097 Bsph_3098     FALSE 0.038 217.000 0.000 NA   NA
 5631088 5631089 Bsph_3100 Bsph_3101     FALSE 0.003 671.000 0.000 NA   NA
 5631089 5631090 Bsph_3101 Bsph_3102     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 5631090 5631091 Bsph_3102 Bsph_3103     TRUE 0.877 -27.000 0.000 NA   NA
 5631094 5631095 Bsph_3106 Bsph_3107     FALSE 0.017 255.000 0.000 NA   NA
 5631095 5631096 Bsph_3107 Bsph_3108     FALSE 0.004 455.000 0.000 NA   NA
 5631096 5631097 Bsph_3108 Bsph_3109     TRUE 0.765 15.000 0.031 NA   NA
 5631097 5631098 Bsph_3109 Bsph_3110     FALSE 0.224 147.000 0.005 NA   NA
 5631098 5631099 Bsph_3110 Bsph_3111     TRUE 0.740 13.000 0.005 NA   NA
 5631101 5631102 Bsph_3113 Bsph_3114     FALSE 0.228 144.000 0.000 NA   NA
 5631102 5631103 Bsph_3114 Bsph_3115     FALSE 0.006 358.000 0.000 NA   NA
 5631103 5631104 Bsph_3115 Bsph_3116     FALSE 0.176 158.000 0.000 NA   NA
 5631104 5631105 Bsph_3116 Bsph_3117     FALSE 0.430 57.000 0.000 NA   NA
 5631105 5631106 Bsph_3117 Bsph_3118     FALSE 0.136 170.000 0.000 NA   NA
 5631106 5631107 Bsph_3118 Bsph_3119     FALSE 0.359 72.000 0.000 NA   NA
 5631107 5631108 Bsph_3119 Bsph_3120     FALSE 0.046 209.000 0.000 NA   NA
 5631111 5631112 Bsph_3123 Bsph_3124     FALSE 0.003 972.000 0.000 NA   NA
 5631114 5631115 Bsph_3126 Bsph_3127     FALSE 0.003 781.000 0.000 NA   NA
 5631117 5631118 Bsph_3129 Bsph_3130 yhjR   FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 5631118 5631119 Bsph_3130 Bsph_3131     FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5631122 5631123 Bsph_3134 Bsph_3135     TRUE 0.874 -33.000 0.000 NA   NA
 5631124 5631125 Bsph_3136 Bsph_3137     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5631126 5631127 Bsph_3138 Bsph_3139     FALSE 0.310 93.000 0.000 NA   NA
 5631127 5631128 Bsph_3139 Bsph_3140     FALSE 0.378 68.000 0.000 NA   NA
 5631128 5631129 Bsph_3140 Bsph_3141     FALSE 0.547 66.000 0.000 1.000   NA
 5631129 5631130 Bsph_3141 Bsph_3142     FALSE 0.005 413.000 0.000 NA   NA
 5631130 5631131 Bsph_3142 Bsph_3143     FALSE 0.008 317.000 0.000 NA   NA
 5631131 5631132 Bsph_3143 Bsph_3144     TRUE 0.934 14.000 0.383 NA   NA
 5631134 5631135 Bsph_3146 Bsph_3147     FALSE 0.530 38.000 0.000 NA   NA
 5631137 5631138 Bsph_3149 Bsph_3150     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 5631138 5631139 Bsph_3150 Bsph_3152     FALSE 0.079 188.000 0.000 NA   NA
 5631141 5631142 Bsph_3154 Bsph_3155     FALSE 0.296 99.000 0.000 NA   NA
 5631142 5631143 Bsph_3155 Bsph_3156     FALSE 0.027 230.000 0.000 NA   NA
 5631147 5631148 Bsph_3160 Bsph_3161     FALSE 0.024 234.000 0.000 NA   NA
 5631149 5631150 Bsph_3162 Bsph_3163     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 5631151 5631152 Bsph_3164 Bsph_3165   yeaB FALSE 0.286 164.000 0.000 1.000 N NA
 5631154 5631155 Bsph_3167 Bsph_3168     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5631155 5631156 Bsph_3168 Bsph_3169     FALSE 0.006 345.000 0.000 NA   NA
 5631156 5631157 Bsph_3169 Bsph_3170     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5631157 5631158 Bsph_3170 Bsph_3171     TRUE 0.984 3.000 0.733 NA   NA
 5631158 5631159 Bsph_3171 Bsph_3172     FALSE 0.015 322.000 0.000 1.000   NA
 5631160 5631161 Bsph_3173 Bsph_3174     FALSE 0.003 725.000 0.000 NA   NA
 5631161 5631162 Bsph_3174 Bsph_3175     FALSE 0.003 858.000 0.000 NA   NA
 5631163 5631164 Bsph_3176 Bsph_3177     TRUE 0.816 7.000 0.000 NA   NA
 5631166 5631167 Bsph_3179 Bsph_3180     FALSE 0.471 49.000 0.000 NA   NA
 5631167 5631168 Bsph_3180 Bsph_3181     TRUE 0.989 -7.000 1.000 NA   NA
 5631169 5631170 Bsph_3182 Bsph_3183     TRUE 0.991 9.000 1.000 0.007   NA
 5631170 5631171 Bsph_3183 Bsph_3184     FALSE 0.160 236.000 0.667 NA   NA
 5631171 5631172 Bsph_3184 Bsph_3185     FALSE 0.003 1852.000 0.000 NA   NA
 5631172 5631173 Bsph_3185 Bsph_3186     TRUE 0.993 -13.000 0.429 0.011   NA
 5631173 5631174 Bsph_3186 Bsph_3187     TRUE 0.890 30.000 0.000 0.011   NA
 5631175 5631176 Bsph_3188 Bsph_3190     FALSE 0.003 795.000 0.000 NA   NA
 5631176 5631177 Bsph_3190 Bsph_3191     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 5631177 5631178 Bsph_3191 Bsph_3192     FALSE 0.003 516.000 0.000 NA   NA
 5631178 5631179 Bsph_3192 Bsph_3193     FALSE 0.507 172.000 0.000 0.002   NA
 5631179 5631180 Bsph_3193 Bsph_3194     FALSE 0.004 446.000 0.000 NA   NA
 5631180 5631181 Bsph_3194 Bsph_3195     FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 5631181 5631182 Bsph_3195 Bsph_3196     FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 5631183 5631184 Bsph_3197 Bsph_3198     TRUE 0.693 36.000 0.000 1.000   NA
 5631185 5631186 Bsph_3199 Bsph_3200     FALSE 0.524 39.000 0.000 NA   NA
 5631188 5631189 Bsph_3202 Bsph_3203     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5631189 5631190 Bsph_3203 Bsph_3204     FALSE 0.304 181.000 0.200 NA   NA
 5631190 5631191 Bsph_3204 Bsph_3205     TRUE 0.974 -3.000 0.200 NA   NA
 5631191 5631192 Bsph_3205 Bsph_3206     FALSE 0.003 532.000 0.000 NA   NA
 5631194 5631195 Bsph_3208 Bsph_3209   ohrA TRUE 0.918 26.000 0.286 1.000 N NA
 5631196 5631197 Bsph_3210 Bsph_3211     FALSE 0.009 304.000 0.000 NA   NA
 5631197 5631198 Bsph_3211 Bsph_3213   ydfK FALSE 0.404 63.000 0.000 NA   NA
 5631198 5631199 Bsph_3213 Bsph_3214 ydfK   FALSE 0.043 211.000 0.000 NA   NA
 5631200 5631201 Bsph_3215 Bsph_3217     FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 5631205 5631206 Bsph_3221 Bsph_3222     TRUE 0.994 -3.000 0.250 NA Y NA
 5631207 5631208 Bsph_3223 Bsph_3224     TRUE 0.931 17.000 0.300 1.000   NA
 5631208 5631209 Bsph_3224 Bsph_3225     FALSE 0.232 143.000 0.000 NA   NA
 5631211 5631212 Bsph_3227 Bsph_3228     FALSE 0.505 43.000 0.000 NA   NA
 5631213 5631214 Bsph_3229 Bsph_3230     FALSE 0.007 343.000 0.000 NA   NA
 5631214 5631215 Bsph_3230 Bsph_3231     TRUE 0.799 13.000 0.031 NA   NA
 5631215 5631216 Bsph_3231 Bsph_3232     TRUE 0.996 -3.000 0.346 1.000 Y NA
 5631216 5631217 Bsph_3232 Bsph_3233   gltC FALSE 0.457 157.000 0.077 1.000 N NA
 5631218 5631219 Bsph_3234 Bsph_3235     TRUE 0.991 -3.000 0.023 1.000 Y NA
 5631220 5631221 Bsph_3236 Bsph_3237     FALSE 0.004 448.000 0.000 NA   NA
 5631221 5631222 Bsph_3237 Bsph_3238     TRUE 0.635 37.000 0.034 NA   NA
 5631222 5631223 Bsph_3238 Bsph_3239   dacF TRUE 0.805 95.000 0.500 1.000   NA
 5631223 5631224 Bsph_3239 Bsph_3240 dacF   FALSE 0.437 125.000 0.000 1.000   NA
 5631224 5631225 Bsph_3240 Bsph_3241     FALSE 0.435 56.000 0.000 NA   NA
 5631225 5631226 Bsph_3241 Bsph_3242     TRUE 0.701 70.000 0.200 NA   NA
 5631226 5631227 Bsph_3242 Bsph_3243     FALSE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 5631227 5631228 Bsph_3243 Bsph_3244     FALSE 0.309 94.000 0.000 NA   NA
 5631228 5631229 Bsph_3244 Bsph_3245     FALSE 0.467 160.000 0.222 NA   NA
 5631230 5631231 Bsph_3246 Bsph_3247     FALSE 0.297 112.000 0.000 NA   NA
 5631231 5631232 Bsph_3247 Bsph_3248     FALSE 0.004 437.000 0.000 NA   NA
 5631233 5631234 Bsph_3249 Bsph_3250     TRUE 0.737 15.000 0.019 NA   NA
 5631234 5631235 Bsph_3250 Bsph_3251     TRUE 0.615 23.000 0.000 NA   NA
 5631235 5631236 Bsph_3251 Bsph_3252     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5631238 5631239 Bsph_3254 Bsph_3255     FALSE 0.274 129.000 0.000 NA   NA
 5631239 5631240 Bsph_3255 Bsph_3256     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5631240 5631241 Bsph_3256 Bsph_3257     TRUE 0.707 14.000 0.000 NA   NA
 5631241 5631242 Bsph_3257 Bsph_3258     FALSE 0.468 100.000 0.070 NA   NA
 5631242 5631243 Bsph_3258 Bsph_3259     FALSE 0.017 252.000 0.000 NA   NA
 5631243 5631244 Bsph_3259 Bsph_3260     FALSE 0.004 481.000 0.000 NA   NA
 5631244 5631245 Bsph_3260 Bsph_3261     FALSE 0.006 661.000 0.000 1.000   NA
 5631245 5631246 Bsph_3261 Bsph_3262   pknB FALSE 0.005 981.000 0.000 1.000   NA
 5631248 5631249 Bsph_3264 Bsph_3265     FALSE 0.008 322.000 0.000 NA   NA
 5631249 5631250 Bsph_3265 Bsph_3266     TRUE 0.876 -30.000 0.000 NA   NA
 5631250 5631251 Bsph_3266 Bsph_3267     FALSE 0.003 856.000 0.000 NA   NA
 5631251 5631252 Bsph_3267 Bsph_3268     FALSE 0.017 252.000 0.000 NA   NA
 5631252 5631253 Bsph_3268 Bsph_3269     FALSE 0.421 193.000 1.000 NA   NA
 5631253 5631254 Bsph_3269 Bsph_3270     FALSE 0.042 212.000 0.000 NA   NA
 5631255 5631256 Bsph_3271 Bsph_3272     FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 5631256 5631257 Bsph_3272 Bsph_3273     FALSE 0.003 638.000 0.000 NA   NA
 5631261 5631262 Bsph_3277 Bsph_3278     FALSE 0.533 108.000 0.105 NA   NA
 5631263 5631264 Bsph_3279 Bsph_3280     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   NA
 5631264 5631265 Bsph_3280 Bsph_3281   ydhL FALSE 0.484 91.000 0.067 NA   NA
 5631265 5631266 Bsph_3281 Bsph_3282 ydhL   FALSE 0.003 1414.000 0.000 NA N NA
 5631266 5631267 Bsph_3282 Bsph_3283     FALSE 0.477 151.000 0.167 NA   NA
 5631267 5631268 Bsph_3283 Bsph_3284   lytR FALSE 0.007 339.000 0.000 NA   NA
 5631269 5631270 Bsph_3285 Bsph_3286     TRUE 0.971 24.000 0.222 1.000 Y NA
 5631271 5631272 Bsph_3287 Bsph_3288     FALSE 0.131 317.000 0.000 0.065 Y NA
 5631272 5631273 Bsph_3288 Bsph_3289     TRUE 0.731 59.000 0.074 1.000 N NA
 5631275 5631276 Bsph_3291 Bsph_3292     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5631277 5631278 Bsph_3294 Bsph_3295     TRUE 0.991 -3.000 0.229 0.074   NA
 5631278 5631279 Bsph_3295 Bsph_3296     TRUE 0.793 15.000 0.048 NA   NA
 5631280 5631281 Bsph_3297 Bsph_3298     TRUE 0.980 -6.000 0.021 0.060   NA
 5631281 5631282 Bsph_3298 Bsph_3299     TRUE 0.956 -10.000 0.021 1.000 N NA
 5631282 5631283 Bsph_3299 Bsph_3300     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5631283 5631284 Bsph_3300 Bsph_3303     TRUE 0.615 23.000 0.000 NA   NA
 5631284 5631285 Bsph_3303 Bsph_3304     TRUE 0.739 27.000 0.003 1.000   NA
 5631285 5631286 Bsph_3304 Bsph_3305     TRUE 0.989 -7.000 1.000 NA   NA
 5631286 5631287 Bsph_3305 Bsph_3306     FALSE 0.476 48.000 0.000 NA   NA
 5631287 5631288 Bsph_3306 Bsph_3307     TRUE 0.988 -7.000 0.400 1.000 N NA
 5631290 5631291 Bsph_3309 Bsph_3310     FALSE 0.003 777.000 0.000 NA   NA
 5631292 5631293 Bsph_3311 Bsph_3312   modB TRUE 0.998 4.000 0.430 0.000 Y NA
 5631294 5631295 Bsph_3313 Bsph_3314     TRUE 0.998 -7.000 0.501 0.002 Y NA
 5631295 5631296 Bsph_3314 Bsph_3315     TRUE 0.996 -3.000 0.040 0.002 Y NA
 5631296 5631297 Bsph_3315 Bsph_3316   moeA TRUE 0.996 -36.000 0.075 0.002 Y NA
 5631297 5631298 Bsph_3316 Bsph_3317 moeA moeB TRUE 0.990 14.000 0.900 1.000 Y NA
 5631299 5631300 Bsph_3318 Bsph_3319     TRUE 0.997 -3.000 0.056 0.002 Y NA
 5631300 5631301 Bsph_3319 Bsph_3320     TRUE 0.996 -7.000 0.020 0.002 Y NA
 5631302 5631303 Bsph_3321 Bsph_3322     TRUE 0.802 91.000 0.400 1.000 N NA
 5631303 5631304 Bsph_3322 Bsph_3323     TRUE 0.731 60.000 0.182 NA   NA
 5631305 5631306 Bsph_3324 Bsph_3325     TRUE 0.982 5.000 0.929 NA   NA
 5631306 5631307 Bsph_3325 Bsph_3326     TRUE 0.910 12.000 0.143 NA   NA
 5631308 5631309 Bsph_3327 Bsph_3328     FALSE 0.282 127.000 0.000 NA   NA
 5631309 5631310 Bsph_3328 Bsph_3329   yieJ FALSE 0.465 51.000 0.000 NA   NA
 5631310 5631311 Bsph_3329 Bsph_3330 yieJ   FALSE 0.592 36.000 0.017 NA   NA
 5631313 5631314 Bsph_3332 Bsph_3333     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5631314 5631315 Bsph_3333 Bsph_3335     FALSE 0.282 127.000 0.000 NA   NA
 5631315 5631316 Bsph_3335 Bsph_3336   regX3 TRUE 0.975 24.000 0.308 1.000 Y NA
 5631318 5631319 Bsph_3338 Bsph_3339     FALSE 0.076 189.000 0.000 NA   NA
 5631319 5631320 Bsph_3339 Bsph_3340   ydeG TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5631320 5631321 Bsph_3340 Bsph_3341 ydeG   FALSE 0.469 58.000 0.000 NA N NA
 5631321 5631322 Bsph_3341 Bsph_3342     FALSE 0.217 155.000 0.000 NA N NA
 5631322 5631323 Bsph_3342 Bsph_3343   mntD FALSE 0.032 229.000 0.000 NA N NA
 5631323 5631324 Bsph_3343 Bsph_3344 mntD   TRUE 0.754 12.000 0.000 NA   NA
 5631324 5631325 Bsph_3344 Bsph_3346   mntB FALSE 0.461 52.000 0.000 NA   NA
 5631325 5631326 Bsph_3346 Bsph_3347 mntB mntA TRUE 0.997 1.000 0.898 1.000 Y NA
 5631326 5631327 Bsph_3347 Bsph_3348 mntA   FALSE 0.007 509.000 0.000 1.000 N NA
 5631328 5631329 Bsph_3349 Bsph_3350     TRUE 0.615 126.000 0.200 NA   NA
 5631330 5631331 Bsph_3351 Bsph_3353     FALSE 0.105 178.000 0.000 NA   NA
 5631331 5631332 Bsph_3353 Bsph_3354     FALSE 0.060 224.000 0.000 1.000   NA
 5631332 5631333 Bsph_3354 Bsph_3355   ywoF TRUE 0.661 116.000 0.133 1.000   NA
 5631333 5631334 Bsph_3355 Bsph_3356 ywoF   TRUE 0.801 33.000 0.133 NA   NA
 5631334 5631335 Bsph_3356 Bsph_3357     FALSE 0.015 262.000 0.000 NA   NA
 5631335 5631336 Bsph_3357 Bsph_3358     FALSE 0.471 96.000 0.009 1.000   NA
 5631338 5631339 Bsph_3360 Bsph_3361     FALSE 0.003 628.000 0.000 NA   NA
 5631341 5631342 Bsph_3363 Bsph_3364     FALSE 0.341 77.000 0.000 NA   NA
 5631343 5631344 Bsph_3365 Bsph_3366     TRUE 0.920 14.000 0.000 0.046   NA
 5631344 5631345 Bsph_3366 Bsph_3367     FALSE 0.297 157.000 0.000 1.000   NA
 5631345 5631346 Bsph_3367 Bsph_3368     TRUE 0.973 -7.000 0.200 NA   NA
 5631346 5631347 Bsph_3368 Bsph_3369     FALSE 0.228 144.000 0.000 NA   NA
 5631347 5631348 Bsph_3369 Bsph_3370     TRUE 0.993 0.000 0.333 0.011   NA
 5631349 5631350 Bsph_3371 Bsph_3372   ywjA FALSE 0.152 166.000 0.000 NA   NA
 5631351 5631352 Bsph_3373 Bsph_3375     FALSE 0.005 378.000 0.000 NA   NA
 5631353 5631354 Bsph_3376 Bsph_3377     TRUE 0.921 18.000 0.250 1.000   NA
 5631354 5631355 Bsph_3377 Bsph_3378     TRUE 0.944 7.000 0.095 1.000   NA
 5631355 5631356 Bsph_3378 Bsph_3379     TRUE 0.636 107.000 0.095 1.000 N NA
 5631356 5631357 Bsph_3379 Bsph_3380     TRUE 0.796 65.000 0.400 NA   NA
 5631357 5631358 Bsph_3380 Bsph_3381     FALSE 0.294 102.000 0.000 NA   NA
 5631358 5631359 Bsph_3381 Bsph_3382     FALSE 0.026 270.000 0.000 1.000   NA
 5631359 5631360 Bsph_3382 Bsph_3383     FALSE 0.008 472.000 0.000 1.000 N NA
 5631360 5631361 Bsph_3383 Bsph_3384     TRUE 0.987 14.000 0.023 0.000 Y NA
 5631361 5631362 Bsph_3384 Bsph_3385     TRUE 0.985 18.000 0.076 0.001 Y NA
 5631362 5631363 Bsph_3385 Bsph_3386     TRUE 0.897 145.000 0.033 0.001 Y NA
 5631363 5631364 Bsph_3386 Bsph_3387     TRUE 0.992 -13.000 0.103 1.000 Y NA
 5631364 5631365 Bsph_3387 Bsph_3388     TRUE 0.950 95.000 0.130 0.001 Y NA
 5631365 5631366 Bsph_3388 Bsph_3389     TRUE 0.989 21.000 0.249 0.001 Y NA
 5631366 5631367 Bsph_3389 Bsph_3390     FALSE 0.135 445.000 0.089 0.001 Y NA
 5631367 5631368 Bsph_3390 Bsph_3391     FALSE 0.011 383.000 0.000 1.000 N NA
 5631368 5631369 Bsph_3391 Bsph_3392     TRUE 0.985 -12.000 0.571 NA N NA
 5631369 5631370 Bsph_3392 Bsph_3393     FALSE 0.248 153.000 0.025 NA   NA
 5631373 5631374 Bsph_3396 Bsph_3397     FALSE 0.017 325.000 0.000 1.000 N NA
 5631374 5631375 Bsph_3397 Bsph_3398     TRUE 0.998 3.000 0.600 0.004 Y NA
 5631376 5631377 Bsph_3399 Bsph_3400     FALSE 0.011 287.000 0.000 NA   NA
 5631377 5631378 Bsph_3400 Bsph_3401     FALSE 0.441 55.000 0.000 NA   NA
 5631378 5631379 Bsph_3401 Bsph_3402     FALSE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 5631379 5631380 Bsph_3402 Bsph_3403     FALSE 0.005 418.000 0.000 NA   NA
 5631380 5631381 Bsph_3403 Bsph_3404     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5631381 5631382 Bsph_3404 Bsph_3405     TRUE 0.875 -31.000 0.000 NA   NA
 5631382 5631383 Bsph_3405 Bsph_3406     FALSE 0.181 157.000 0.000 NA   NA
 5631383 5631384 Bsph_3406 Bsph_3407     TRUE 0.831 12.000 0.040 NA   NA
 5631384 5631385 Bsph_3407 Bsph_3408     FALSE 0.387 66.000 0.000 NA   NA
 5631385 5631386 Bsph_3408 Bsph_3409     FALSE 0.003 586.000 0.000 NA   NA
 5631386 5631387 Bsph_3409 Bsph_3410     FALSE 0.007 336.000 0.000 NA   NA
 5631387 5631388 Bsph_3410 Bsph_3411     TRUE 0.922 81.000 0.278 1.000 Y NA
 5631388 5631389 Bsph_3411 Bsph_3412     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5631389 5631390 Bsph_3412 Bsph_3413     TRUE 0.786 87.000 0.625 NA   NA
 5631390 5631391 Bsph_3413 Bsph_3414     TRUE 0.787 20.000 0.017 1.000   NA
 5631391 5631392 Bsph_3414 Bsph_3415     TRUE 0.956 9.000 0.188 1.000   NA
 5631393 5631394 Bsph_3416 Bsph_3417 yqjO   TRUE 0.901 60.000 0.087 0.000   NA
 5631394 5631395 Bsph_3417 Bsph_3418     TRUE 0.655 113.000 0.128 1.000   NA
 5631397 5631398 Bsph_3420 Bsph_3421     FALSE 0.297 110.000 0.000 NA   NA
 5631399 5631400 Bsph_3422 Bsph_3423     TRUE 0.907 16.000 0.259 NA   NA
 5631400 5631401 Bsph_3423 Bsph_3424     TRUE 0.810 17.000 0.074 NA   NA
 5631401 5631402 Bsph_3424 Bsph_3425     TRUE 0.727 54.000 0.143 NA   NA
 5631402 5631403 Bsph_3425 Bsph_3426     FALSE 0.513 102.000 0.095 NA   NA
 5631403 5631404 Bsph_3426 Bsph_3427     FALSE 0.016 258.000 0.000 NA   NA
 5631404 5631405 Bsph_3427 Bsph_3428     FALSE 0.022 237.000 0.000 NA   NA
 5631405 5631406 Bsph_3428 Bsph_3429     FALSE 0.469 90.000 0.000 1.000   NA
 5631406 5631407 Bsph_3429 Bsph_3430     TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000   NA
 5631407 5631408 Bsph_3430 Bsph_3431     TRUE 0.901 144.000 0.078 0.007 Y NA
 5631408 5631409 Bsph_3431 Bsph_3432     TRUE 0.845 14.000 0.007 1.000 N NA
 5631409 5631410 Bsph_3432 Bsph_3433     TRUE 0.780 34.000 0.050 1.000   NA
 5631410 5631411 Bsph_3433 Bsph_3434     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.001   NA
 5631411 5631412 Bsph_3434 Bsph_3435     TRUE 0.996 -3.000 0.014 0.002 Y NA
 5631412 5631413 Bsph_3435 Bsph_3436     TRUE 0.990 -7.000 0.014 1.000 Y NA
 5631413 5631414 Bsph_3436 Bsph_3437     TRUE 0.987 12.000 0.032 0.007 Y NA
 5631414 5631415 Bsph_3437 Bsph_3438     TRUE 0.998 -7.000 0.397 0.007 Y NA
 5631415 5631416 Bsph_3438 Bsph_3439     TRUE 0.998 0.000 0.291 0.007 Y NA
 5631416 5631417 Bsph_3439 Bsph_3440     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5631417 5631418 Bsph_3440 Bsph_3442     TRUE 0.878 -25.000 0.000 NA   NA
 5631418 5631419 Bsph_3442 Bsph_3443     TRUE 0.997 0.000 0.102 0.007 Y NA
 5631419 5631420 Bsph_3443 Bsph_3444     TRUE 0.985 13.000 0.026 0.007 Y NA
 5631420 5631421 Bsph_3444 Bsph_3445     TRUE 0.972 6.000 0.026 0.007   NA
 5631421 5631422 Bsph_3445 Bsph_3446     TRUE 0.984 0.000 0.025 0.007   NA
 5631422 5631423 Bsph_3446 Bsph_3447     TRUE 0.971 5.000 0.008 0.026 N NA
 5631424 5631425 Bsph_3448 Bsph_3449     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5631425 5631426 Bsph_3449 Bsph_3450   cbiN TRUE 0.998 2.000 0.861 0.007 Y NA
 5631426 5631427 Bsph_3450 Bsph_3451 cbiN   TRUE 0.982 69.000 0.804 0.001 Y NA
 5631427 5631428 Bsph_3451 Bsph_3452   cbiO TRUE 0.997 -3.000 0.082 0.001 Y NA
 5631428 5631429 Bsph_3452 Bsph_3453 cbiO   FALSE 0.018 320.000 0.000 1.000 N NA
 5631430 5631431 Bsph_3454 Bsph_3455     TRUE 0.619 114.000 0.095 1.000   NA
 5631432 5631433 Bsph_3456 Bsph_3457     TRUE 0.914 5.000 0.057 NA   NA
 5631433 5631434 Bsph_3457 Bsph_3458     TRUE 0.990 -3.000 0.057 0.001   NA
 5631435 5631436 Bsph_3459 Bsph_3460     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5631436 5631437 Bsph_3460 Bsph_3461     FALSE 0.050 234.000 0.000 1.000 N NA
 5631441 5631442 Bsph_3465 Bsph_3466     FALSE 0.006 372.000 0.000 NA   NA
 5631442 5631443 Bsph_3466 Bsph_3467     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5631443 5631444 Bsph_3467 Bsph_3468     FALSE 0.542 36.000 0.000 NA   NA
 5631444 5631445 Bsph_3468 Bsph_3470     FALSE 0.481 47.000 0.000 NA   NA
 5631447 5631448 Bsph_3472 Bsph_3473   ydeC TRUE 0.655 124.000 0.250 NA   NA
 5631449 5631450 Bsph_3474 Bsph_3475 ydeD   FALSE 0.215 166.000 0.036 NA   NA
 5631451 5631452 Bsph_3476 Bsph_3477     FALSE 0.360 144.000 0.000 1.000   NA
 5631452 5631453 Bsph_3477 Bsph_3478   tlpC FALSE 0.473 88.000 0.000 1.000   NA
 5631454 5631455 Bsph_3479 Bsph_3480     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5631455 5631456 Bsph_3480 Bsph_3481     TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5631457 5631458 Bsph_3482 Bsph_3483     TRUE 0.832 28.000 0.062 1.000 N NA
 5631458 5631459 Bsph_3483 Bsph_3484     FALSE 0.280 138.000 0.015 NA   NA
 5631459 5631460 Bsph_3484 Bsph_3485     FALSE 0.274 129.000 0.000 NA   NA
 5631460 5631461 Bsph_3485 Bsph_3486     TRUE 0.956 6.000 0.108 1.000 N NA
 5631461 5631462 Bsph_3486 Bsph_3487     FALSE 0.020 243.000 0.000 NA   NA
 5631462 5631463 Bsph_3487 Bsph_3488     FALSE 0.014 378.000 0.097 NA   NA
 5631463 5631464 Bsph_3488 Bsph_3489     FALSE 0.357 100.000 0.023 NA   NA
 5631464 5631465 Bsph_3489 Bsph_3490     TRUE 0.981 0.000 0.366 NA N NA
 5631465 5631466 Bsph_3490 Bsph_3491     TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.001 Y NA
 5631466 5631467 Bsph_3491 Bsph_3492     TRUE 0.718 122.000 0.032 0.059 N NA
 5631467 5631468 Bsph_3492 Bsph_3493     TRUE 0.923 165.000 0.882 0.059 Y NA
 5631468 5631469 Bsph_3493 Bsph_3494     TRUE 0.999 0.000 0.897 0.000 Y NA
 5631469 5631470 Bsph_3494 Bsph_3495     TRUE 0.931 88.000 0.414 1.000 Y NA
 5631470 5631471 Bsph_3495 Bsph_3496     FALSE 0.199 191.000 0.052 1.000 N NA
 5631473 5631474 Bsph_3498 Bsph_3499     TRUE 0.882 -19.000 0.000 NA   NA
 5631474 5631475 Bsph_3499 Bsph_3500     TRUE 0.810 17.000 0.074 NA   NA
 5631475 5631476 Bsph_3500 Bsph_3501     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5631476 5631477 Bsph_3501 Bsph_3502     FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5631477 5631478 Bsph_3502 Bsph_3503     FALSE 0.029 263.000 0.000 1.000   NA
 5631478 5631479 Bsph_3503 Bsph_3504     FALSE 0.034 360.000 0.393 NA   NA
 5631479 5631480 Bsph_3504 Bsph_3505     FALSE 0.159 174.000 0.027 NA   NA
 5631480 5631481 Bsph_3505 Bsph_3506   recN FALSE 0.589 125.000 0.079 1.000   NA
 5631481 5631482 Bsph_3506 Bsph_3507 recN   TRUE 0.803 34.000 0.056 1.000 N NA
 5631482 5631483 Bsph_3507 Bsph_3508     TRUE 0.611 92.000 0.064 1.000 N NA
 5631483 5631484 Bsph_3508 Bsph_3509     TRUE 0.981 0.000 0.189 1.000 N NA
 5631484 5631485 Bsph_3509 Bsph_3510     TRUE 0.690 162.000 0.024 1.000 Y NA
 5631485 5631486 Bsph_3510 Bsph_3511     TRUE 0.965 4.000 0.100 1.000 N NA
 5631486 5631487 Bsph_3511 Bsph_3512     TRUE 0.999 -3.000 0.412 0.000 Y NA
 5631487 5631488 Bsph_3512 Bsph_3513     FALSE 0.053 232.000 0.000 1.000 N NA
 5631488 5631489 Bsph_3513 Bsph_3514   folD FALSE 0.447 132.000 0.007 1.000 N NA
 5631489 5631490 Bsph_3514 Bsph_3515 folD   TRUE 0.813 32.000 0.056 1.000 N NA
 5631491 5631492 Bsph_3516 Bsph_3517     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5631492 5631493 Bsph_3517 Bsph_3518     FALSE 0.270 177.000 0.047 1.000 N NA
 5631494 5631495 Bsph_3519 Bsph_3520     FALSE 0.306 128.000 0.012 NA   NA
 5631495 5631496 Bsph_3520 Bsph_3521     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5631496 5631497 Bsph_3521 Bsph_3522     FALSE 0.006 365.000 0.000 NA   NA
 5631497 5631498 Bsph_3522 Bsph_3523     FALSE 0.003 591.000 0.000 NA   NA
 5631498 5631499 Bsph_3523 Bsph_3524     FALSE 0.524 39.000 0.000 NA   NA
 5631499 5631500 Bsph_3524 Bsph_3525     FALSE 0.176 158.000 0.000 NA   NA
 5631500 5631501 Bsph_3525 Bsph_3526     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 5631501 5631502 Bsph_3526 Bsph_3527     TRUE 0.892 -12.000 0.000 NA   NA
 5631502 5631503 Bsph_3527 Bsph_3528     TRUE 0.988 -3.000 0.800 NA   NA
 5631503 5631504 Bsph_3528 Bsph_3529     FALSE 0.003 861.000 0.000 NA   NA
 5631504 5631505 Bsph_3529 Bsph_3530     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5631505 5631506 Bsph_3530 Bsph_3531     FALSE 0.003 753.000 0.000 NA   NA
 5631506 5631507 Bsph_3531 Bsph_3532     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5631507 5631508 Bsph_3532 Bsph_3533     FALSE 0.021 241.000 0.000 NA   NA
 5631508 5631509 Bsph_3533 Bsph_3534   xerD FALSE 0.009 314.000 0.000 NA   NA
 5631509 5631510 Bsph_3534 Bsph_3535 xerD xerD TRUE 0.882 131.000 0.500 0.007   NA
 5631510 5631511 Bsph_3535 Bsph_3536 xerD   FALSE 0.474 100.000 0.000 1.000 N NA
 5631511 5631512 Bsph_3536 Bsph_3537     TRUE 0.973 14.000 0.086 1.000 Y NA
 5631512 5631513 Bsph_3537 Bsph_3538     FALSE 0.068 200.000 0.020 NA   NA
 5631513 5631514 Bsph_3538 Bsph_3539     TRUE 0.906 31.000 0.509 NA   NA
 5631514 5631515 Bsph_3539 Bsph_3540     FALSE 0.021 241.000 0.000 NA   NA
 5631515 5631516 Bsph_3540 Bsph_3541     FALSE 0.435 67.000 0.018 NA   NA
 5631516 5631517 Bsph_3541 Bsph_3542     TRUE 0.980 6.000 1.000 NA   NA
 5631517 5631518 Bsph_3542 Bsph_3543     FALSE 0.410 91.000 0.034 NA   NA
 5631520 5631521 Bsph_3545 Bsph_3546     TRUE 0.910 18.000 0.160 1.000 N NA
 5631521 5631522 Bsph_3546 Bsph_3547     TRUE 0.993 3.000 0.168 1.000 Y NA
 5631522 5631523 Bsph_3547 Bsph_3548     FALSE 0.340 79.000 0.004 NA   NA
 5631525 5631526 Bsph_3550 Bsph_3551     TRUE 0.953 0.000 0.083 NA   NA
 5631526 5631527 Bsph_3551 Bsph_3552     FALSE 0.039 247.000 0.000 1.000 N NA
 5631527 5631528 Bsph_3552 Bsph_3553     FALSE 0.004 454.000 0.000 NA   NA
 5631528 5631529 Bsph_3553 Bsph_3554     FALSE 0.005 403.000 0.000 NA   NA
 5631529 5631530 Bsph_3554 Bsph_3555     FALSE 0.037 218.000 0.000 NA   NA
 5631530 5631531 Bsph_3555 Bsph_3556     FALSE 0.441 55.000 0.000 NA   NA
 5631531 5631532 Bsph_3556 Bsph_3557     TRUE 0.884 -18.000 0.000 NA   NA
 5631533 5631534 Bsph_3558 Bsph_3559     FALSE 0.003 598.000 0.000 NA   NA
 5631534 5631535 Bsph_3559 Bsph_3560   ydgF TRUE 0.733 99.000 0.000 0.004   NA
 5631536 5631537 Bsph_3561 Bsph_3563     FALSE 0.326 85.000 0.000 NA   NA
 5631537 5631538 Bsph_3563 Bsph_3564     TRUE 0.804 23.000 0.097 NA   NA
 5631538 5631539 Bsph_3564 Bsph_3565     FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 5631539 5631540 Bsph_3565 Bsph_3566     TRUE 0.634 145.000 0.400 NA   NA
 5631540 5631541 Bsph_3566 Bsph_3567   comP FALSE 0.020 242.000 0.000 NA   NA
 5631541 5631542 Bsph_3567 Bsph_3568 comP   TRUE 0.989 -9.000 1.000 NA   NA
 5631542 5631543 Bsph_3568 Bsph_3569     FALSE 0.014 271.000 0.000 NA   NA
 5631543 5631544 Bsph_3569 Bsph_3570     TRUE 0.749 27.000 0.065 NA   NA
 5631544 5631545 Bsph_3570 Bsph_3571     FALSE 0.007 338.000 0.000 NA   NA
 5631545 5631546 Bsph_3571 Bsph_3572     FALSE 0.368 70.000 0.000 NA   NA
 5631546 5631547 Bsph_3572 Bsph_3573     FALSE 0.185 156.000 0.000 NA   NA
 5631547 5631548 Bsph_3573 Bsph_3574     FALSE 0.003 561.000 0.000 NA   NA
 5631549 5631550 Bsph_3575 Bsph_3576     FALSE 0.133 171.000 0.000 NA   NA
 5631550 5631551 Bsph_3576 Bsph_3577     FALSE 0.005 384.000 0.000 NA   NA
 5631552 5631553 Bsph_3578 Bsph_3579     FALSE 0.003 1046.000 0.000 NA   NA
 5631553 5631554 Bsph_3579 Bsph_3580     FALSE 0.299 116.000 0.000 NA   NA
 5631554 5631555 Bsph_3580 Bsph_3581     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5631559 5631560 Bsph_3585 Bsph_3586     FALSE 0.012 285.000 0.000 NA   NA
 5631560 5631561 Bsph_3586 Bsph_3587     FALSE 0.003 1512.000 0.000 NA   NA
 5631561 5631562 Bsph_3587 Bsph_3588     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5631562 5631563 Bsph_3588 Bsph_3589     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5631563 5631564 Bsph_3589 Bsph_3590     TRUE 0.910 34.000 0.667 NA   NA
 5631564 5631565 Bsph_3590 Bsph_3591     TRUE 0.744 106.000 0.500 NA   NA
 5631565 5631566 Bsph_3591 Bsph_3592     TRUE 0.941 25.000 1.000 NA   NA
 5631566 5631567 Bsph_3592 Bsph_3593     TRUE 0.920 32.000 0.750 NA   NA
 5631567 5631568 Bsph_3593 Bsph_3594     TRUE 0.987 -3.000 0.667 NA   NA
 5631568 5631569 Bsph_3594 Bsph_3595     TRUE 0.851 41.000 0.333 NA   NA
 5631569 5631570 Bsph_3595 Bsph_3596     TRUE 0.856 39.000 0.333 NA   NA
 5631570 5631571 Bsph_3596 Bsph_3597     TRUE 0.818 53.000 0.333 NA   NA
 5631571 5631572 Bsph_3597 Bsph_3598     TRUE 0.985 -9.000 0.625 NA   NA
 5631572 5631573 Bsph_3598 Bsph_3599     TRUE 0.860 53.000 0.556 NA   NA
 5631573 5631574 Bsph_3599 Bsph_3600     TRUE 0.861 158.000 0.429 1.000 Y NA
 5631574 5631575 Bsph_3600 Bsph_3601     TRUE 0.966 7.000 0.429 NA   NA
 5631575 5631576 Bsph_3601 Bsph_3602     TRUE 0.776 114.000 0.667 NA   NA
 5631576 5631577 Bsph_3602 Bsph_3603   dnaJ TRUE 0.733 33.000 0.071 NA   NA
 5631577 5631578 Bsph_3603 Bsph_3604 dnaJ   FALSE 0.563 89.000 0.107 NA   NA
 5631578 5631579 Bsph_3604 Bsph_3605     FALSE 0.029 227.000 0.000 NA   NA
 5631579 5631580 Bsph_3605 Bsph_3606     FALSE 0.003 576.000 0.000 NA   NA
 5631580 5631581 Bsph_3606 Bsph_3607     FALSE 0.438 131.000 0.002 1.000 N NA
 5631581 5631582 Bsph_3607 Bsph_3608     TRUE 0.998 -7.000 0.316 0.000 Y NA
 5631582 5631583 Bsph_3608 Bsph_3609     TRUE 0.983 26.000 0.092 0.001 Y NA
 5631583 5631584 Bsph_3609 Bsph_3610     FALSE 0.034 503.000 0.000 1.000 Y NA
 5631584 5631585 Bsph_3610 Bsph_3611     FALSE 0.036 226.000 0.000 NA N NA
 5631585 5631586 Bsph_3611 Bsph_3612     TRUE 0.933 -7.000 0.036 NA   NA
 5631586 5631587 Bsph_3612 Bsph_3613     TRUE 0.934 -7.000 0.036 NA   NA
 5631587 5631588 Bsph_3613 Bsph_3614     TRUE 0.978 0.000 0.320 NA   NA
 5631588 5631589 Bsph_3614 Bsph_3615     TRUE 0.997 11.000 0.861 0.001 Y NA
 5631589 5631590 Bsph_3615 Bsph_3616     TRUE 0.987 -25.000 0.639 1.000   NA
 5631591 5631592 Bsph_3617 Bsph_3618     TRUE 0.733 118.000 0.432 NA   NA
 5631595 5631596 Bsph_3621 Bsph_3622   yqgS FALSE 0.008 497.000 0.000 1.000 N NA
 5631596 5631597 Bsph_3622 Bsph_3623 yqgS   FALSE 0.009 313.000 0.000 NA   NA
 5631597 5631598 Bsph_3623 Bsph_3624     FALSE 0.378 74.000 0.010 NA   NA
 5631599 5631600 Bsph_3625 Bsph_3626     FALSE 0.018 282.000 0.031 NA   NA
 5631601 5631602 Bsph_3627 Bsph_3628   trpE TRUE 0.998 -3.000 0.293 0.001 Y NA
 5631602 5631603 Bsph_3628 Bsph_3629 trpE   FALSE 0.086 208.000 0.000 1.000   NA
 5631603 5631604 Bsph_3629 Bsph_3630     FALSE 0.278 128.000 0.000 NA   NA
 5631604 5631605 Bsph_3630 Bsph_3631     FALSE 0.346 75.000 0.000 NA   NA
 5631605 5631606 Bsph_3631 Bsph_3632   phoU FALSE 0.035 220.000 0.000 NA   NA
 5631606 5631607 Bsph_3632 Bsph_3633 phoU pstB TRUE 0.969 14.000 0.118 NA Y NA
 5631607 5631608 Bsph_3633 Bsph_3634 pstB yqgI TRUE 0.991 13.000 0.125 0.002 Y NA
 5631608 5631609 Bsph_3634 Bsph_3635 yqgI yqgH TRUE 0.998 1.000 0.485 0.002 Y NA
 5631609 5631610 Bsph_3635 Bsph_3636 yqgH   TRUE 0.861 98.000 0.077 1.000 Y NA
 5631614 5631615 Bsph_3640 Bsph_3641     FALSE 0.126 175.000 0.009 NA   NA
 5631615 5631616 Bsph_3641 Bsph_3642     FALSE 0.378 68.000 0.000 NA   NA
 5631616 5631617 Bsph_3642 Bsph_3643     TRUE 0.868 -49.000 0.000 NA   NA
 5631618 5631619 Bsph_3644 Bsph_3645     FALSE 0.593 53.000 0.049 NA   NA
 5631619 5631620 Bsph_3645 Bsph_3646     FALSE 0.295 98.000 0.002 NA   NA
 5631620 5631621 Bsph_3646 Bsph_3647     TRUE 0.746 13.000 0.007 NA   NA
 5631623 5631624 Bsph_3649 Bsph_3650     FALSE 0.025 232.000 0.000 NA   NA
 5631624 5631625 Bsph_3650 Bsph_3651   yrkA FALSE 0.523 93.000 0.088 NA   NA
 5631625 5631626 Bsph_3651 Bsph_3652 yrkA   TRUE 0.658 100.000 0.250 NA   NA
 5631626 5631627 Bsph_3652 Bsph_3653     FALSE 0.274 129.000 0.000 NA   NA
 5631627 5631628 Bsph_3653 Bsph_3655     FALSE 0.014 270.000 0.000 NA   NA
 5631629 5631630 Bsph_3656 Bsph_3657     FALSE 0.009 405.000 0.000 1.000   NA
 5631630 5631631 Bsph_3657 Bsph_3658     FALSE 0.594 43.000 0.029 NA   NA
 5631631 5631632 Bsph_3658 Bsph_3659     FALSE 0.544 141.000 0.182 NA   NA
 5631632 5631633 Bsph_3659 Bsph_3660     FALSE 0.591 98.000 0.074 1.000   NA
 5631634 5631635 Bsph_3661 Bsph_3662     FALSE 0.452 81.000 0.043 NA   NA
 5631636 5631637 Bsph_3663 Bsph_3664     FALSE 0.007 331.000 0.000 NA   NA
 5631637 5631638 Bsph_3664 Bsph_3665     TRUE 0.974 0.000 0.230 NA   NA
 5631638 5631639 Bsph_3665 Bsph_3666   ydaL TRUE 0.759 53.000 0.180 NA   NA
 5631639 5631640 Bsph_3666 Bsph_3667 ydaL   TRUE 0.960 -10.000 0.111 NA   NA
 5631640 5631641 Bsph_3667 Bsph_3668   ydaJ TRUE 0.967 -7.000 0.067 1.000   NA
 5631641 5631642 Bsph_3668 Bsph_3669 ydaJ   FALSE 0.073 268.000 0.000 0.021   NA
 5631643 5631644 Bsph_3670 Bsph_3671     FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 5631645 5631646 Bsph_3672 Bsph_3673     TRUE 0.997 -3.000 0.480 1.000 Y NA
 5631646 5631647 Bsph_3673 Bsph_3674   zurA TRUE 0.995 -33.000 0.130 0.082 Y NA
 5631649 5631650 Bsph_3676 Bsph_3677     TRUE 0.978 13.000 0.104 1.000 Y NA
 5631652 5631653 Bsph_3679 Bsph_3680     TRUE 0.975 100.000 0.877 0.001 Y NA
 5631653 5631654 Bsph_3680 Bsph_3681     TRUE 0.991 16.000 0.201 0.001 Y NA
 5631655 5631656 Bsph_3682 Bsph_3683 kdpD kdpE TRUE 0.983 9.000 0.081 1.000 Y NA
 5631656 5631657 Bsph_3683 Bsph_3684 kdpE   FALSE 0.043 211.000 0.000 NA   NA
 5631657 5631658 Bsph_3684 Bsph_3685     TRUE 0.699 75.000 0.231 NA   NA
 5631659 5631660 Bsph_3686 Bsph_3687 dctR   TRUE 0.990 28.000 1.000 0.063 Y NA
 5631661 5631662 Bsph_3688 Bsph_3689     FALSE 0.031 265.000 0.000 1.000 N NA
 5631667 5631668 Bsph_3694 Bsph_3695     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 5631668 5631669 Bsph_3695 Bsph_3696     FALSE 0.004 466.000 0.000 NA   NA
 5631669 5631670 Bsph_3696 Bsph_3697   yqfO TRUE 0.788 16.000 0.051 NA   NA
 5631670 5631671 Bsph_3697 Bsph_3698 yqfO   TRUE 0.962 1.000 0.138 NA   NA
 5631671 5631672 Bsph_3698 Bsph_3699     TRUE 0.871 -42.000 0.000 NA   NA
 5631672 5631673 Bsph_3699 Bsph_3700     FALSE 0.255 165.000 0.057 NA   NA
 5631673 5631674 Bsph_3700 Bsph_3701     FALSE 0.009 314.000 0.000 NA   NA
 5631674 5631675 Bsph_3701 Bsph_3702     FALSE 0.070 215.000 0.053 NA   NA
 5631675 5631676 Bsph_3702 Bsph_3703     TRUE 0.889 33.000 0.209 1.000 N NA
 5631676 5631677 Bsph_3703 Bsph_3704     FALSE 0.053 208.000 0.011 NA   NA
 5631677 5631678 Bsph_3704 Bsph_3705   yqzB TRUE 0.934 18.000 0.621 NA   NA
 5631682 5631683 Bsph_3709 Bsph_3710 recO   FALSE 0.447 162.000 0.108 1.000   NA
 5631683 5631684 Bsph_3710 Bsph_3711     TRUE 0.969 -13.000 0.098 1.000   NA
 5631684 5631685 Bsph_3711 Bsph_3712     TRUE 0.925 23.000 0.000 0.001   NA
 5631685 5631686 Bsph_3712 Bsph_3713     TRUE 0.772 66.000 0.179 1.000   NA
 5631686 5631687 Bsph_3713 Bsph_3714     TRUE 0.959 1.000 0.123 NA   NA
 5631687 5631688 Bsph_3714 Bsph_3715     TRUE 0.938 9.000 0.182 NA   NA
 5631688 5631689 Bsph_3715 Bsph_3716     FALSE 0.150 224.000 0.172 1.000   NA
 5631689 5631690 Bsph_3716 Bsph_3717     TRUE 0.965 -3.000 0.114 NA   NA
 5631690 5631691 Bsph_3717 Bsph_3718     TRUE 0.902 2.000 0.018 NA   NA
 5631691 5631692 Bsph_3718 Bsph_3719     TRUE 0.888 56.000 1.000 NA   NA
 5631692 5631693 Bsph_3719 Bsph_3720   yqfA TRUE 0.645 26.000 0.016 NA   NA
 5631693 5631694 Bsph_3720 Bsph_3721 yqfA   TRUE 0.980 4.000 0.367 1.000   NA
 5631694 5631695 Bsph_3721 Bsph_3722     FALSE 0.012 344.000 0.000 1.000   NA
 5631695 5631696 Bsph_3722 Bsph_3723     FALSE 0.004 461.000 0.000 NA   NA
 5631697 5631698 Bsph_3724 Bsph_3725     TRUE 0.983 27.000 0.133 0.003 Y NA
 5631699 5631700 Bsph_3726 Bsph_3727     TRUE 0.762 82.000 0.438 NA   NA
 5631700 5631701 Bsph_3727 Bsph_3728     FALSE 0.006 348.000 0.000 NA   NA
 5631701 5631702 Bsph_3728 Bsph_3729     FALSE 0.003 525.000 0.000 NA   NA
 5631702 5631703 Bsph_3729 Bsph_3730     TRUE 0.888 1.000 0.000 NA   NA
 5631703 5631704 Bsph_3730 Bsph_3731     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5631704 5631705 Bsph_3731 Bsph_3732     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 5631707 5631708 Bsph_3734 Bsph_3735     FALSE 0.294 106.000 0.000 NA   NA
 5631708 5631709 Bsph_3735 Bsph_3736     FALSE 0.494 45.000 0.000 NA   NA
 5631709 5631710 Bsph_3736 Bsph_3737     FALSE 0.242 140.000 0.000 NA   NA
 5631710 5631711 Bsph_3737 Bsph_3738     TRUE 0.611 24.000 0.000 NA   NA
 5631711 5631712 Bsph_3738 Bsph_3739     FALSE 0.455 53.000 0.000 NA   NA
 5631712 5631713 Bsph_3739 Bsph_3740     FALSE 0.012 279.000 0.000 NA   NA
 5631713 5631714 Bsph_3740 Bsph_3741     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5631714 5631715 Bsph_3741 Bsph_3742     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5631715 5631716 Bsph_3742 Bsph_3743     TRUE 0.974 -7.000 0.214 NA   NA
 5631716 5631717 Bsph_3743 Bsph_3744     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5631717 5631718 Bsph_3744 Bsph_3745     TRUE 0.888 1.000 0.000 NA   NA
 5631718 5631719 Bsph_3745 Bsph_3746     FALSE 0.232 143.000 0.000 NA   NA
 5631719 5631720 Bsph_3746 Bsph_3747     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5631720 5631721 Bsph_3747 Bsph_3748     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5631721 5631722 Bsph_3748 Bsph_3749     FALSE 0.393 65.000 0.000 NA   NA
 5631722 5631723 Bsph_3749 Bsph_3750     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5631723 5631724 Bsph_3750 Bsph_3751     TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 5631724 5631725 Bsph_3751 Bsph_3752     FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5631725 5631726 Bsph_3752 Bsph_3753     TRUE 0.647 18.000 0.000 NA   NA
 5631726 5631727 Bsph_3753 Bsph_3755     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5631727 5631728 Bsph_3755 Bsph_3756     TRUE 0.983 -10.000 0.500 NA   NA
 5631728 5631729 Bsph_3756 Bsph_3757     TRUE 0.986 0.000 0.667 NA   NA
 5631729 5631730 Bsph_3757 Bsph_3758     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5631730 5631731 Bsph_3758 Bsph_3759     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5631731 5631732 Bsph_3759 Bsph_3760     TRUE 0.754 12.000 0.000 NA   NA
 5631732 5631733 Bsph_3760 Bsph_3761     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5631733 5631734 Bsph_3761 Bsph_3762     TRUE 0.888 1.000 0.000 NA   NA
 5631734 5631735 Bsph_3762 Bsph_3763     TRUE 0.939 -13.000 0.000 1.000   NA
 5631735 5631736 Bsph_3763 Bsph_3764     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5631736 5631737 Bsph_3764 Bsph_3765     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5631737 5631738 Bsph_3765 Bsph_3767     TRUE 0.886 -16.000 0.000 NA   NA
 5631738 5631739 Bsph_3767 Bsph_3768     FALSE 0.206 150.000 0.000 NA   NA
 5631741 5631742 Bsph_3770 Bsph_3771     TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000   NA
 5631742 5631743 Bsph_3771 Bsph_3772     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5631743 5631744 Bsph_3772 Bsph_3773     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5631744 5631745 Bsph_3773 Bsph_3774     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5631745 5631746 Bsph_3774 Bsph_3775     FALSE 0.047 208.000 0.000 NA   NA
 5631746 5631747 Bsph_3775 Bsph_3776     FALSE 0.346 75.000 0.000 NA   NA
 5631747 5631748 Bsph_3776 Bsph_3777     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5631748 5631749 Bsph_3777 Bsph_3778     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5631749 5631750 Bsph_3778 Bsph_3779     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5631750 5631751 Bsph_3779 Bsph_3780     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5631751 5631752 Bsph_3780 Bsph_3781     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5631752 5631753 Bsph_3781 Bsph_3782     TRUE 0.878 -25.000 0.000 NA   NA
 5631753 5631754 Bsph_3782 Bsph_3783     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5631754 5631755 Bsph_3783 Bsph_3784     TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 5631755 5631756 Bsph_3784 Bsph_3785     FALSE 0.017 255.000 0.000 NA   NA
 5631757 5631758 Bsph_3786 Bsph_3787     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5631760 5631761 Bsph_3789 Bsph_3790   yqeV FALSE 0.035 255.000 0.000 1.000 N NA
 5631762 5631763 Bsph_3791 Bsph_3792     FALSE 0.294 123.000 0.000 NA   NA
 5631763 5631764 Bsph_3792 Bsph_3793     FALSE 0.015 265.000 0.000 NA   NA
 5631764 5631765 Bsph_3793 Bsph_3794   yqeU FALSE 0.017 252.000 0.000 NA   NA
 5631765 5631766 Bsph_3794 Bsph_3795 yqeU   FALSE 0.333 81.000 0.000 NA   NA
 5631766 5631767 Bsph_3795 Bsph_3797   dnaJ TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5631767 5631768 Bsph_3797 Bsph_3798 dnaJ dnaK FALSE 0.521 236.000 0.196 0.002 Y NA
 5631768 5631769 Bsph_3798 Bsph_3799 dnaK   TRUE 0.961 76.000 0.224 0.004 Y NA
 5631769 5631770 Bsph_3799 Bsph_3800     TRUE 0.981 3.000 0.286 1.000 N NA
 5631770 5631771 Bsph_3800 Bsph_3801     TRUE 0.699 69.000 0.082 1.000 N NA
 5631771 5631772 Bsph_3801 Bsph_3802     FALSE 0.021 301.000 0.000 1.000 N NA
 5631772 5631773 Bsph_3802 Bsph_3803     FALSE 0.508 53.000 0.017 NA   NA
 5631773 5631774 Bsph_3803 Bsph_3804     FALSE 0.018 250.000 0.000 NA   NA
 5631775 5631776 Bsph_3805 Bsph_3806     FALSE 0.014 343.000 0.000 1.000 N NA
 5631776 5631777 Bsph_3806 Bsph_3807     TRUE 0.987 -16.000 0.500 1.000 N NA
 5631778 5631779 Bsph_3808 Bsph_3809     FALSE 0.009 404.000 0.000 1.000   NA
 5631779 5631780 Bsph_3809 Bsph_3810     FALSE 0.066 199.000 0.000 NA N NA
 5631780 5631781 Bsph_3810 Bsph_3811     FALSE 0.011 287.000 0.000 NA   NA
 5631782 5631783 Bsph_3812 Bsph_3813     TRUE 0.981 4.000 0.069 0.016   NA
 5631783 5631784 Bsph_3813 Bsph_3814     FALSE 0.040 215.000 0.000 NA   NA
 5631788 5631789 Bsph_3818 Bsph_3819     FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 5631790 5631791 Bsph_3820 Bsph_3821     FALSE 0.003 567.000 0.000 NA   NA
 5631791 5631792 Bsph_3821 Bsph_3822     FALSE 0.087 185.000 0.000 NA   NA
 5631795 5631796 Bsph_3825 Bsph_3826     FALSE 0.487 46.000 0.000 NA   NA
 5631797 5631798 Bsph_3827 Bsph_3828     FALSE 0.003 561.000 0.000 NA   NA
 5631801 5631802 Bsph_3831 Bsph_3832     FALSE 0.329 83.000 0.000 NA   NA
 5631803 5631804 Bsph_3833 Bsph_3834 lepA   FALSE 0.038 250.000 0.000 1.000 N NA
 5631804 5631805 Bsph_3834 Bsph_3835     FALSE 0.005 415.000 0.000 NA   NA
 5631805 5631806 Bsph_3835 Bsph_3836     FALSE 0.501 87.000 0.070 NA   NA
 5631808 5631809 Bsph_3838 Bsph_3839     FALSE 0.561 33.000 0.000 NA   NA
 5631809 5631810 Bsph_3839 Bsph_3840     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 5631812 5631813 Bsph_3842 Bsph_3843     FALSE 0.501 135.000 0.055 1.000   NA
 5631813 5631814 Bsph_3843 Bsph_3844     TRUE 0.634 108.000 0.095 1.000 N NA
 5631814 5631815 Bsph_3844 Bsph_3845     FALSE 0.087 196.000 0.033 NA   NA
 5631815 5631816 Bsph_3845 Bsph_3846     TRUE 0.913 -3.000 0.009 NA   NA
 5631816 5631817 Bsph_3846 Bsph_3847     TRUE 0.950 1.000 0.085 NA   NA
 5631817 5631818 Bsph_3847 Bsph_3848     TRUE 0.970 -3.000 0.149 NA   NA
 5631818 5631819 Bsph_3848 Bsph_3849     TRUE 0.989 8.000 0.199 1.000 Y NA
 5631819 5631820 Bsph_3849 Bsph_3850   yqeI TRUE 0.932 10.000 0.150 NA N NA
 5631820 5631821 Bsph_3850 Bsph_3851 yqeI   TRUE 0.930 6.000 0.089 NA N NA
 5631821 5631822 Bsph_3851 Bsph_3852     TRUE 0.897 37.000 0.336 1.000   NA
 5631822 5631823 Bsph_3852 Bsph_3853     TRUE 0.989 -3.000 0.555 1.000   NA
 5631823 5631824 Bsph_3853 Bsph_3854     TRUE 0.711 37.000 0.015 1.000   NA
 5631825 5631826 Bsph_3855 Bsph_3856     FALSE 0.477 108.000 0.004 1.000 N NA
 5631827 5631828 Bsph_3857 Bsph_3858     FALSE 0.472 53.000 0.006 NA   NA
 5631828 5631829 Bsph_3858 Bsph_3859   yrrS FALSE 0.539 60.000 0.041 NA   NA
 5631829 5631830 Bsph_3859 Bsph_3860 yrrS   FALSE 0.318 155.000 0.065 NA   NA
 5631830 5631831 Bsph_3860 Bsph_3861     FALSE 0.192 200.000 0.095 1.000 N NA
 5631831 5631832 Bsph_3861 Bsph_3862     TRUE 0.974 0.000 0.100 1.000 N NA
 5631832 5631833 Bsph_3862 Bsph_3863     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5631833 5631834 Bsph_3863 Bsph_3865   yrrN TRUE 0.873 -34.000 0.000 NA   NA
 5631834 5631835 Bsph_3865 Bsph_3866 yrrN   TRUE 0.958 6.000 0.142 1.000   NA
 5631835 5631836 Bsph_3866 Bsph_3867     FALSE 0.090 228.000 0.154 NA   NA
 5631836 5631837 Bsph_3867 Bsph_3868     FALSE 0.039 284.000 0.151 NA   NA
 5631837 5631838 Bsph_3868 Bsph_3869     FALSE 0.370 124.000 0.028 NA   NA
 5631838 5631839 Bsph_3869 Bsph_3870     TRUE 0.932 19.000 0.651 NA   NA
 5631839 5631840 Bsph_3870 Bsph_3871     TRUE 0.777 86.000 0.537 NA   NA
 5631840 5631841 Bsph_3871 Bsph_3872     FALSE 0.317 90.000 0.000 NA   NA
 5631841 5631842 Bsph_3872 Bsph_3873     TRUE 0.797 9.000 0.000 NA   NA
 5631842 5631843 Bsph_3873 Bsph_3874   corA FALSE 0.012 368.000 0.000 1.000 N NA
 5631843 5631844 Bsph_3874 Bsph_3875 corA pvcC FALSE 0.008 467.000 0.000 1.000 N NA
 5631844 5631845 Bsph_3875 Bsph_3876 pvcC   FALSE 0.465 132.000 0.017 1.000 N NA
 5631846 5631847 Bsph_3877 Bsph_3878     TRUE 0.886 -16.000 0.003 NA   NA
 5631847 5631848 Bsph_3878 Bsph_3879     FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 5631849 5631850 Bsph_3880 Bsph_3881     FALSE 0.167 182.000 0.000 1.000   NA
 5631850 5631851 Bsph_3881 Bsph_3882     FALSE 0.563 75.000 0.017 1.000 N NA
 5631851 5631852 Bsph_3882 Bsph_3883     FALSE 0.344 76.000 0.000 NA   NA
 5631852 5631853 Bsph_3883 Bsph_3885   yrzC FALSE 0.074 190.000 0.000 NA   NA
 5631855 5631856 Bsph_3887 Bsph_3888     FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 5631856 5631857 Bsph_3888 Bsph_3889     FALSE 0.285 128.000 0.005 NA   NA
 5631857 5631858 Bsph_3889 Bsph_3890     FALSE 0.051 211.000 0.000 NA N NA
 5631858 5631859 Bsph_3890 Bsph_3891     TRUE 0.846 19.000 0.133 NA   NA
 5631859 5631860 Bsph_3891 Bsph_3892     TRUE 0.838 25.000 0.071 1.000   NA
 5631860 5631861 Bsph_3892 Bsph_3893     TRUE 0.971 47.000 0.071 0.001 Y NA
 5631861 5631862 Bsph_3893 Bsph_3894     TRUE 0.994 17.000 0.667 0.001 Y NA
 5631862 5631863 Bsph_3894 Bsph_3895     FALSE 0.088 207.000 0.000 1.000   NA
 5631863 5631864 Bsph_3895 Bsph_3896     FALSE 0.476 110.000 0.015 1.000   NA
 5631864 5631865 Bsph_3896 Bsph_3897     TRUE 0.798 18.000 0.015 1.000   NA
 5631865 5631866 Bsph_3897 Bsph_3898     TRUE 0.963 -16.000 0.071 1.000   NA
 5631866 5631867 Bsph_3898 Bsph_3899     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5631867 5631868 Bsph_3899 Bsph_3901     FALSE 0.003 597.000 0.000 NA   NA
 5631868 5631869 Bsph_3901 Bsph_3902     TRUE 0.960 62.000 0.161 0.027 Y NA
 5631871 5631872 Bsph_3904 Bsph_3905 ycgA   FALSE 0.441 143.000 0.100 NA   NA
 5631872 5631873 Bsph_3905 Bsph_3906     TRUE 0.652 58.000 0.095 NA   NA
 5631873 5631874 Bsph_3906 Bsph_3907     FALSE 0.293 123.000 0.003 NA   NA
 5631874 5631875 Bsph_3907 Bsph_3908     TRUE 0.893 28.000 0.177 1.000 N NA
 5631875 5631876 Bsph_3908 Bsph_3909     FALSE 0.058 206.000 0.000 NA N NA
 5631876 5631877 Bsph_3909 Bsph_3910     TRUE 0.952 2.000 0.085 NA N NA
 5631877 5631878 Bsph_3910 Bsph_3911     TRUE 0.785 99.000 0.027 NA Y NA
 5631880 5631881 Bsph_3913 Bsph_3914     TRUE 0.868 31.000 0.128 1.000 N NA
 5631881 5631882 Bsph_3914 Bsph_3915     FALSE 0.146 187.000 0.000 1.000   NA
 5631882 5631883 Bsph_3915 Bsph_3916     FALSE 0.473 88.000 0.000 1.000   NA
 5631883 5631884 Bsph_3916 Bsph_3917     TRUE 0.998 -3.000 0.248 0.000 Y NA
 5631884 5631885 Bsph_3917 Bsph_3918     TRUE 0.690 223.000 0.375 0.001 Y NA
 5631885 5631886 Bsph_3918 Bsph_3919     TRUE 0.998 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 5631886 5631887 Bsph_3919 Bsph_3920     TRUE 0.995 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 5631887 5631888 Bsph_3920 Bsph_3921     TRUE 0.988 -3.000 0.006 0.000   NA
 5631888 5631889 Bsph_3921 Bsph_3922     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5631891 5631892 Bsph_3925 Bsph_3926 secD   FALSE 0.005 389.000 0.000 NA   NA
 5631892 5631893 Bsph_3926 Bsph_3927     TRUE 0.875 -31.000 0.000 NA   NA
 5631893 5631894 Bsph_3927 Bsph_3928     TRUE 0.918 3.000 0.040 NA   NA
 5631898 5631899 Bsph_3932 Bsph_3933     FALSE 0.080 264.000 0.325 NA N NA
 5631899 5631900 Bsph_3933 Bsph_3934   queA TRUE 0.981 57.000 0.360 0.000 Y NA
 5631900 5631901 Bsph_3934 Bsph_3935 queA   TRUE 0.647 18.000 0.000 NA   NA
 5631901 5631902 Bsph_3935 Bsph_3937     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5631902 5631903 Bsph_3937 Bsph_3938     TRUE 0.979 18.000 0.549 0.001   NA
 5631903 5631904 Bsph_3938 Bsph_3939     FALSE 0.294 112.000 0.002 NA   NA
 5631904 5631905 Bsph_3939 Bsph_3940     FALSE 0.296 191.000 0.333 NA   NA
 5631907 5631908 Bsph_3942 Bsph_3943     TRUE 0.636 22.000 0.006 NA   NA
 5631908 5631909 Bsph_3943 Bsph_3944   pheB FALSE 0.533 182.000 0.054 0.000   NA
 5631909 5631910 Bsph_3944 Bsph_3945 pheB   TRUE 0.896 4.000 0.024 NA   NA
 5631910 5631911 Bsph_3945 Bsph_3946     TRUE 0.891 2.000 0.008 NA   NA
 5631911 5631912 Bsph_3946 Bsph_3947     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5631912 5631913 Bsph_3947 Bsph_3948     FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 5631913 5631914 Bsph_3948 Bsph_3949     TRUE 0.994 -3.000 0.203 NA Y NA
 5631914 5631915 Bsph_3949 Bsph_3950     TRUE 0.926 56.000 0.208 NA Y NA
 5631915 5631916 Bsph_3950 Bsph_3951     FALSE 0.366 143.000 0.000 1.000   NA
 5631916 5631917 Bsph_3951 Bsph_3952     TRUE 0.940 14.000 0.000 0.004   NA
 5631917 5631918 Bsph_3952 Bsph_3953   minD FALSE 0.423 128.000 0.000 1.000   NA
 5631918 5631919 Bsph_3953 Bsph_3954 minD minC TRUE 0.995 2.000 0.368 1.000 Y NA
 5631919 5631920 Bsph_3954 Bsph_3955 minC mreD TRUE 0.866 28.000 0.106 1.000 N NA
 5631920 5631921 Bsph_3955 Bsph_3956 mreD mreC TRUE 0.998 0.000 0.550 0.002 Y NA
 5631921 5631922 Bsph_3956 Bsph_3957 mreC mreB TRUE 0.892 62.000 0.689 1.000 N NA
 5631922 5631923 Bsph_3957 Bsph_3958 mreB radC FALSE 0.008 592.000 0.017 1.000 N NA
 5631923 5631924 Bsph_3958 Bsph_3959 radC   TRUE 0.676 34.000 0.032 NA N NA
 5631924 5631925 Bsph_3959 Bsph_3960     FALSE 0.310 98.000 0.006 NA   NA
 5631925 5631926 Bsph_3960 Bsph_3961   folC FALSE 0.309 180.000 0.200 NA   NA
 5631926 5631927 Bsph_3961 Bsph_3962 folC   TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.000 Y NA
 5631927 5631928 Bsph_3962 Bsph_3963     TRUE 0.770 138.000 1.000 NA   NA
 5631928 5631929 Bsph_3963 Bsph_3964     FALSE 0.024 234.000 0.000 NA   NA
 5631929 5631930 Bsph_3964 Bsph_3965     FALSE 0.003 604.000 0.000 NA   NA
 5631930 5631931 Bsph_3965 Bsph_3966     FALSE 0.413 175.000 0.333 NA   NA
 5631931 5631932 Bsph_3966 Bsph_3967     FALSE 0.020 242.000 0.000 NA   NA
 5631932 5631933 Bsph_3967 Bsph_3968     TRUE 0.997 1.000 0.126 0.001 Y NA
 5631933 5631934 Bsph_3968 Bsph_3969     TRUE 0.996 -3.000 0.009 0.001 Y NA
 5631934 5631935 Bsph_3969 Bsph_3970     TRUE 0.996 -10.000 0.004 0.001 Y NA
 5631935 5631936 Bsph_3970 Bsph_3971     TRUE 0.838 19.000 0.040 1.000 N NA
 5631936 5631937 Bsph_3971 Bsph_3972     FALSE 0.474 189.000 0.613 1.000 N NA
 5631937 5631938 Bsph_3972 Bsph_3973     FALSE 0.084 197.000 0.032 NA   NA
 5631938 5631939 Bsph_3973 Bsph_3974     TRUE 0.882 19.000 0.222 NA   NA
 5631939 5631940 Bsph_3974 Bsph_3975     FALSE 0.577 167.000 0.643 NA   NA
 5631940 5631941 Bsph_3975 Bsph_3976     FALSE 0.291 176.000 0.143 NA   NA
 5631941 5631942 Bsph_3976 Bsph_3977   engB FALSE 0.249 136.000 0.002 NA   NA
 5631942 5631943 Bsph_3977 Bsph_3978 engB   TRUE 0.818 26.000 0.055 1.000   NA
 5631943 5631944 Bsph_3978 Bsph_3979   clpX FALSE 0.322 230.000 0.004 0.080 Y NA
 5631944 5631945 Bsph_3979 Bsph_3980 clpX   FALSE 0.088 514.000 0.033 0.002 Y NA
 5631945 5631946 Bsph_3980 Bsph_3981   ysoA FALSE 0.475 119.000 0.014 1.000   NA
 5631947 5631948 Bsph_3982 Bsph_3983     FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5631948 5631949 Bsph_3983 Bsph_3984     FALSE 0.003 819.000 0.000 NA   NA
 5631949 5631950 Bsph_3984 Bsph_3985   qoxB TRUE 0.958 43.000 0.000 0.006 Y NA
 5631950 5631951 Bsph_3985 Bsph_3986 qoxB qoxB TRUE 0.985 0.000 0.000 0.001   NA
 5631951 5631952 Bsph_3986 Bsph_3987 qoxB qoxC TRUE 0.976 2.000 0.000 0.024   NA
 5631952 5631953 Bsph_3987 Bsph_3988 qoxC   TRUE 0.997 0.000 0.959 1.000 Y NA
 5631953 5631954 Bsph_3988 Bsph_3989     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   NA
 5631955 5631956 Bsph_3990 Bsph_3991     TRUE 0.744 51.000 0.059 1.000 N NA
 5631956 5631957 Bsph_3991 Bsph_3992     FALSE 0.511 73.000 0.059 NA   NA
 5631957 5631958 Bsph_3992 Bsph_3993     FALSE 0.323 153.000 0.062 NA   NA
 5631958 5631959 Bsph_3993 Bsph_3994     FALSE 0.050 205.000 0.000 NA   NA
 5631959 5631960 Bsph_3994 Bsph_3995     TRUE 0.990 -3.000 0.118 0.010   NA
 5631960 5631961 Bsph_3995 Bsph_3996     TRUE 0.946 20.000 0.118 0.010   NA
 5631962 5631963 Bsph_3997 Bsph_3998     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 5631963 5631964 Bsph_3998 Bsph_3999     FALSE 0.562 170.000 0.667 NA   NA
 5631965 5631966 Bsph_4000 Bsph_4001     FALSE 0.512 69.000 0.050 NA   NA
 5631968 5631969 Bsph_4003 Bsph_4004     FALSE 0.006 346.000 0.000 NA   NA
 5631969 5631970 Bsph_4004 Bsph_4005     FALSE 0.007 513.000 0.000 1.000 N NA
 5631970 5631971 Bsph_4005 Bsph_4006   agrC TRUE 0.951 85.000 0.875 1.000 Y NA
 5631971 5631972 Bsph_4006 Bsph_4007 agrC   FALSE 0.028 350.000 0.250 NA   NA
 5631972 5631973 Bsph_4007 Bsph_4008     TRUE 0.901 16.000 0.225 NA   NA
 5631973 5631974 Bsph_4008 Bsph_4009     FALSE 0.274 158.000 0.050 NA   NA
 5631974 5631975 Bsph_4009 Bsph_4010     TRUE 0.922 20.000 0.500 NA   NA
 5631975 5631976 Bsph_4010 Bsph_4011     TRUE 0.812 67.000 0.500 NA   NA
 5631976 5631977 Bsph_4011 Bsph_4012     TRUE 0.969 12.000 1.000 NA   NA
 5631977 5631978 Bsph_4012 Bsph_4013     TRUE 0.945 21.000 1.000 NA   NA
 5631978 5631979 Bsph_4013 Bsph_4014     TRUE 0.989 0.000 1.000 NA   NA
 5631979 5631980 Bsph_4014 Bsph_4015     TRUE 0.948 6.000 0.174 NA   NA
 5631980 5631981 Bsph_4015 Bsph_4016     TRUE 0.846 13.000 0.066 NA   NA
 5631981 5631982 Bsph_4016 Bsph_4017     TRUE 0.861 12.000 0.066 NA   NA
 5631982 5631983 Bsph_4017 Bsph_4018     TRUE 0.881 44.000 0.571 NA   NA
 5631983 5631984 Bsph_4018 Bsph_4019     FALSE 0.292 124.000 0.000 NA   NA
 5631984 5631985 Bsph_4019 Bsph_4020     FALSE 0.339 78.000 0.000 NA   NA
 5631986 5631987 Bsph_4021 Bsph_4022     FALSE 0.006 366.000 0.000 NA   NA
 5631987 5631988 Bsph_4022 Bsph_4023     TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5631988 5631989 Bsph_4023 Bsph_4024     FALSE 0.326 85.000 0.000 NA   NA
 5631990 5631991 Bsph_4025 Bsph_4026     FALSE 0.547 35.000 0.000 NA   NA
 5631991 5631992 Bsph_4026 Bsph_4027     TRUE 0.882 -19.000 0.000 NA   NA
 5631994 5631995 Bsph_4029 Bsph_4030     FALSE 0.009 307.000 0.000 NA   NA
 5631995 5631996 Bsph_4030 Bsph_4031     FALSE 0.004 481.000 0.000 NA   NA
 5631997 5631998 Bsph_4032 Bsph_4033     FALSE 0.003 1206.000 0.000 NA   NA
 5631998 5631999 Bsph_4033 Bsph_4034     FALSE 0.006 353.000 0.000 NA   NA
 5631999 5632000 Bsph_4034 Bsph_4035     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 5632001 5632002 Bsph_4036 Bsph_4037     FALSE 0.005 376.000 0.000 NA   NA
 5632002 5632003 Bsph_4037 Bsph_4038     FALSE 0.003 610.000 0.000 NA   NA
 5632006 5632007 Bsph_4040 Bsph_4041     FALSE 0.274 129.000 0.000 NA   NA
 5632008 5632009 Bsph_4042 Bsph_4043     TRUE 0.877 36.000 0.400 NA   NA
 5632009 5632010 Bsph_4043 Bsph_4044     FALSE 0.305 101.000 0.006 NA   NA
 5632010 5632011 Bsph_4044 Bsph_4045     FALSE 0.364 71.000 0.000 NA   NA
 5632011 5632012 Bsph_4045 Bsph_4046     TRUE 0.838 13.000 0.000 1.000   NA
 5632012 5632013 Bsph_4046 Bsph_4047     TRUE 0.981 2.000 0.262 1.000 N NA
 5632013 5632014 Bsph_4047 Bsph_4048     FALSE 0.033 289.000 0.048 1.000 N NA
 5632014 5632015 Bsph_4048 Bsph_4049   ysmB TRUE 0.809 22.000 0.024 1.000 N NA
 5632015 5632016 Bsph_4049 Bsph_4050 ysmB gerE TRUE 0.944 75.000 0.138 0.032 Y NA
 5632016 5632017 Bsph_4050 Bsph_4051 gerE   FALSE 0.365 188.000 0.275 1.000   NA
 5632017 5632018 Bsph_4051 Bsph_4052     FALSE 0.078 233.000 0.072 1.000   NA
 5632018 5632019 Bsph_4052 Bsph_4053     TRUE 0.996 6.000 0.231 0.001 Y NA
 5632019 5632020 Bsph_4053 Bsph_4054     TRUE 0.968 68.000 0.184 0.001 Y NA
 5632022 5632023 Bsph_4056 Bsph_4057     FALSE 0.010 421.000 0.009 1.000 N NA
 5632023 5632024 Bsph_4057 Bsph_4058     FALSE 0.523 119.000 0.023 1.000 N NA
 5632024 5632025 Bsph_4058 Bsph_4059     FALSE 0.554 120.000 0.039 1.000 N NA
 5632025 5632026 Bsph_4059 Bsph_4060     FALSE 0.009 442.000 0.000 1.000 N NA
 5632026 5632027 Bsph_4060 Bsph_4061     TRUE 0.984 38.000 0.373 0.005 Y NA
 5632027 5632028 Bsph_4061 Bsph_4062     TRUE 0.754 117.000 0.275 1.000 N NA
 5632028 5632029 Bsph_4062 Bsph_4063   ysiA TRUE 0.899 36.000 0.294 1.000 N NA
 5632029 5632030 Bsph_4063 Bsph_4064 ysiA   TRUE 0.790 110.000 0.406 1.000 N NA
 5632030 5632031 Bsph_4064 Bsph_4065     FALSE 0.011 396.000 0.071 NA   NA
 5632031 5632032 Bsph_4065 Bsph_4066     TRUE 0.763 23.000 0.065 NA   NA
 5632032 5632033 Bsph_4066 Bsph_4067     TRUE 0.967 19.000 0.114 1.000 Y NA
 5632033 5632034 Bsph_4067 Bsph_4068     TRUE 0.696 60.000 0.066 1.000   NA
 5632034 5632035 Bsph_4068 Bsph_4069     TRUE 0.924 6.000 0.091 NA   NA
 5632036 5632037 Bsph_4070 Bsph_4071     FALSE 0.025 274.000 0.000 1.000   NA
 5632038 5632039 Bsph_4072 Bsph_4073     TRUE 0.996 13.000 0.574 0.000 Y NA
 5632039 5632040 Bsph_4073 Bsph_4074     FALSE 0.050 392.000 0.006 1.000 Y NA
 5632042 5632043 Bsph_4076 Bsph_4077   rsbQ TRUE 0.977 -16.000 0.333 NA   NA
 5632043 5632044 Bsph_4077 Bsph_4078 rsbQ   FALSE 0.490 149.000 0.167 NA   NA
 5632045 5632046 Bsph_4079 Bsph_4080 yaaH   FALSE 0.018 301.000 0.000 1.000   NA
 5632047 5632048 Bsph_4081 Bsph_4082 ykoW   FALSE 0.051 233.000 0.000 1.000 N NA
 5632049 5632050 Bsph_4083 Bsph_4084     TRUE 0.686 34.000 0.050 NA   NA
 5632051 5632052 Bsph_4085 Bsph_4086   ytmM TRUE 0.837 18.000 0.048 1.000   NA
 5632052 5632053 Bsph_4086 Bsph_4087 ytmM ytmL TRUE 0.995 12.000 0.476 0.005 Y NA
 5632053 5632054 Bsph_4087 Bsph_4088 ytmL ytmK TRUE 0.980 25.000 0.125 0.025 Y NA
 5632054 5632055 Bsph_4088 Bsph_4089 ytmK   TRUE 0.951 20.000 0.667 1.000 N NA
 5632055 5632056 Bsph_4089 Bsph_4090     TRUE 0.891 13.000 0.105 NA N NA
 5632056 5632057 Bsph_4090 Bsph_4091     TRUE 0.932 47.000 0.158 NA Y NA
 5632057 5632058 Bsph_4091 Bsph_4092   ywbI FALSE 0.219 186.000 0.105 NA N NA
 5632058 5632059 Bsph_4092 Bsph_4093 ywbI   FALSE 0.019 308.000 0.000 1.000 N NA
 5632059 5632060 Bsph_4093 Bsph_4094     FALSE 0.035 247.000 0.000 1.000   NA
 5632060 5632061 Bsph_4094 Bsph_4095     FALSE 0.047 232.000 0.000 1.000   NA
 5632061 5632062 Bsph_4095 Bsph_4096     FALSE 0.428 97.000 0.049 NA   NA
 5632064 5632065 Bsph_4098 Bsph_4099     FALSE 0.285 135.000 0.014 NA   NA
 5632065 5632066 Bsph_4099 Bsph_4100     TRUE 0.984 56.000 0.928 0.009 Y NA
 5632066 5632067 Bsph_4100 Bsph_4101     TRUE 0.978 32.000 0.652 1.000 Y NA
 5632067 5632068 Bsph_4101 Bsph_4102     FALSE 0.045 413.000 0.000 1.000 Y NA
 5632068 5632069 Bsph_4102 Bsph_4103   dnaI FALSE 0.021 426.000 0.000 0.079 N NA
 5632069 5632070 Bsph_4103 Bsph_4104 dnaI   FALSE 0.320 88.000 0.000 NA   NA
 5632070 5632071 Bsph_4104 Bsph_4106     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5632071 5632072 Bsph_4106 Bsph_4107     FALSE 0.087 186.000 0.004 NA   NA
 5632072 5632073 Bsph_4107 Bsph_4108     FALSE 0.394 194.000 0.044 0.001   NA
 5632073 5632074 Bsph_4108 Bsph_4109     FALSE 0.106 204.000 0.020 1.000   NA
 5632074 5632075 Bsph_4109 Bsph_4110     TRUE 0.960 -40.000 0.066 1.000 N NA
 5632075 5632076 Bsph_4110 Bsph_4111     TRUE 0.977 13.000 0.101 1.000 Y NA
 5632076 5632077 Bsph_4111 Bsph_4112     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 5632077 5632078 Bsph_4112 Bsph_4113     FALSE 0.204 152.000 0.005 NA   NA
 5632078 5632079 Bsph_4113 Bsph_4114     TRUE 0.999 0.000 0.947 0.007 Y NA
 5632079 5632080 Bsph_4114 Bsph_4115     FALSE 0.483 121.000 0.005 1.000 N NA
 5632080 5632081 Bsph_4115 Bsph_4116     TRUE 0.991 -3.000 0.840 1.000   NA
 5632081 5632082 Bsph_4116 Bsph_4117   phoR FALSE 0.011 370.000 0.000 1.000   NA
 5632082 5632083 Bsph_4117 Bsph_4118 phoR phoP TRUE 0.961 33.000 0.159 1.000 Y NA
 5632083 5632084 Bsph_4118 Bsph_4119 phoP   TRUE 0.655 54.000 0.082 NA   NA
 5632084 5632085 Bsph_4119 Bsph_4120     FALSE 0.005 443.000 0.022 NA   NA
 5632085 5632086 Bsph_4120 Bsph_4121     TRUE 0.621 184.000 0.115 1.000 Y NA
 5632086 5632087 Bsph_4121 Bsph_4122     FALSE 0.455 53.000 0.000 NA   NA
 5632089 5632090 Bsph_4125 Bsph_4126     FALSE 0.094 228.000 0.082 1.000   NA
 5632090 5632091 Bsph_4126 Bsph_4127     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.000   NA
 5632091 5632092 Bsph_4127 Bsph_4128     TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5632092 5632093 Bsph_4128 Bsph_4131     FALSE 0.009 312.000 0.000 NA   NA
 5632093 5632094 Bsph_4131 Bsph_4132     TRUE 0.998 -7.000 0.234 0.001 Y NA
 5632094 5632095 Bsph_4132 Bsph_4133   gntR TRUE 0.794 25.000 0.032 1.000   NA
 5632095 5632096 Bsph_4133 Bsph_4134 gntR   FALSE 0.511 133.000 0.056 1.000   NA
 5632096 5632097 Bsph_4134 Bsph_4135     TRUE 0.926 43.000 0.159 0.007   NA
 5632099 5632100 Bsph_4137 Bsph_4138     FALSE 0.112 201.000 0.021 1.000   NA
 5632104 5632105 Bsph_4142 Bsph_4143     TRUE 0.652 90.000 0.089 1.000 N NA
 5632105 5632106 Bsph_4143 Bsph_4144   yteJ FALSE 0.345 138.000 0.040 NA   NA
 5632106 5632107 Bsph_4144 Bsph_4145 yteJ   TRUE 0.867 13.000 0.087 NA   NA
 5632107 5632108 Bsph_4145 Bsph_4146   acsA FALSE 0.177 184.000 0.004 1.000 N NA
 5632109 5632110 Bsph_4147 Bsph_4148     TRUE 0.995 -12.000 0.010 0.003 Y NA
 5632110 5632111 Bsph_4148 Bsph_4149     TRUE 0.995 -10.000 0.000 0.003 Y NA
 5632112 5632113 Bsph_4150 Bsph_4151   thiI FALSE 0.321 153.000 0.005 1.000   NA
 5632113 5632114 Bsph_4151 Bsph_4152 thiI   TRUE 0.986 0.000 0.349 1.000 N NA
 5632114 5632115 Bsph_4152 Bsph_4153     TRUE 0.680 117.000 0.011 0.055   NA
 5632115 5632116 Bsph_4153 Bsph_4154   ezrA FALSE 0.517 84.000 0.017 1.000   NA
 5632117 5632118 Bsph_4155 Bsph_4156   yebR TRUE 0.685 25.000 0.016 NA N NA
 5632121 5632122 Bsph_4159 Bsph_4160     FALSE 0.052 202.000 0.000 NA   NA
 5632123 5632124 Bsph_4161 Bsph_4162     FALSE 0.494 45.000 0.000 NA   NA
 5632124 5632125 Bsph_4162 Bsph_4163     FALSE 0.010 296.000 0.000 NA   NA
 5632125 5632126 Bsph_4163 Bsph_4164     FALSE 0.020 243.000 0.000 NA   NA
 5632127 5632128 Bsph_4165 Bsph_4166     FALSE 0.298 98.000 0.000 NA   NA
 5632128 5632129 Bsph_4166 Bsph_4167     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 5632131 5632132 Bsph_4169 Bsph_4170     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5632132 5632133 Bsph_4170 Bsph_4171     TRUE 0.624 21.000 0.000 NA   NA
 5632133 5632134 Bsph_4171 Bsph_4172     FALSE 0.007 330.000 0.000 NA   NA
 5632134 5632135 Bsph_4172 Bsph_4173     FALSE 0.341 77.000 0.000 NA   NA
 5632135 5632136 Bsph_4173 Bsph_4174     TRUE 0.976 -3.000 0.222 NA   NA
 5632137 5632138 Bsph_4175 Bsph_4176     TRUE 0.893 49.000 0.500 1.000   NA
 5632139 5632140 Bsph_4177 Bsph_4178     FALSE 0.140 169.000 0.000 NA   NA
 5632142 5632143 Bsph_4180 Bsph_4181     TRUE 0.678 39.000 0.000 1.000   NA
 5632143 5632144 Bsph_4181 Bsph_4182     FALSE 0.003 602.000 0.000 NA   NA
 5632144 5632145 Bsph_4182 Bsph_4183     FALSE 0.346 75.000 0.000 NA   NA
 5632146 5632147 Bsph_4184 Bsph_4185     FALSE 0.004 452.000 0.000 NA   NA
 5632147 5632148 Bsph_4185 Bsph_4186     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5632148 5632149 Bsph_4186 Bsph_4187     FALSE 0.003 511.000 0.000 NA   NA
 5632149 5632150 Bsph_4187 Bsph_4188     FALSE 0.563 141.000 0.091 1.000 N NA
 5632152 5632153 Bsph_4190 Bsph_4191     TRUE 0.825 113.000 0.021 1.000 Y NA
 5632154 5632155 Bsph_4192 Bsph_4193     TRUE 0.880 74.000 0.063 1.000 Y NA
 5632155 5632156 Bsph_4193 Bsph_4194   argJ TRUE 0.994 5.000 0.008 0.001 Y NA
 5632156 5632157 Bsph_4194 Bsph_4195 argJ   TRUE 0.996 9.000 0.303 0.001 Y NA
 5632157 5632158 Bsph_4195 Bsph_4196     FALSE 0.064 226.000 0.000 1.000 N NA
 5632159 5632160 Bsph_4197 Bsph_4198 acuA acuB TRUE 0.899 25.000 0.036 0.055   NA
 5632160 5632161 Bsph_4198 Bsph_4199 acuB acuC TRUE 0.950 0.000 0.019 1.000   NA
 5632162 5632163 Bsph_4200 Bsph_4201     FALSE 0.241 175.000 0.017 1.000 N NA
 5632165 5632166 Bsph_4203 Bsph_4204 ytxH   TRUE 0.606 138.000 0.259 NA   NA
 5632166 5632167 Bsph_4204 Bsph_4205     FALSE 0.329 109.000 0.014 NA   NA
 5632167 5632168 Bsph_4205 Bsph_4206     FALSE 0.185 228.000 0.017 0.003 N NA
 5632168 5632169 Bsph_4206 Bsph_4207     FALSE 0.069 262.000 0.143 1.000   NA
 5632169 5632170 Bsph_4207 Bsph_4208     TRUE 0.986 -3.000 0.511 NA   NA
 5632170 5632171 Bsph_4208 Bsph_4209     FALSE 0.354 73.000 0.000 NA   NA
 5632171 5632172 Bsph_4209 Bsph_4210     FALSE 0.296 99.000 0.000 NA   NA
 5632172 5632173 Bsph_4210 Bsph_4211     FALSE 0.294 101.000 0.000 NA   NA
 5632173 5632174 Bsph_4211 Bsph_4212     TRUE 0.631 60.000 0.084 NA   NA
 5632176 5632177 Bsph_4214 Bsph_4215   ytnP FALSE 0.477 118.000 0.015 1.000   NA
 5632177 5632178 Bsph_4215 Bsph_4216 ytnP   TRUE 0.670 87.000 0.117 1.000   NA
 5632178 5632179 Bsph_4216 Bsph_4217     FALSE 0.463 97.000 0.007 1.000   NA
 5632179 5632180 Bsph_4217 Bsph_4218     TRUE 0.924 3.000 0.049 NA   NA
 5632180 5632181 Bsph_4218 Bsph_4219     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 5632181 5632182 Bsph_4219 Bsph_4220     TRUE 0.974 28.000 0.347 1.000 Y NA
 5632184 5632185 Bsph_4222 Bsph_4223 yfiN   FALSE 0.314 165.000 0.020 1.000 N NA
 5632185 5632186 Bsph_4223 Bsph_4224     TRUE 0.893 11.000 0.031 1.000   NA
 5632186 5632187 Bsph_4224 Bsph_4225     FALSE 0.029 261.000 0.000 1.000   NA
 5632189 5632190 Bsph_4227 Bsph_4228   yhjX FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 5632190 5632191 Bsph_4228 Bsph_4229 yhjX yyaM FALSE 0.005 763.000 0.000 1.000   NA
 5632191 5632192 Bsph_4229 Bsph_4230 yyaM   FALSE 0.202 191.000 0.069 1.000   NA
 5632192 5632193 Bsph_4230 Bsph_4231     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.003 Y NA
 5632193 5632194 Bsph_4231 Bsph_4232   yliB TRUE 0.922 43.000 0.667 1.000 N NA
 5632195 5632196 Bsph_4233 Bsph_4234 oppB dppB TRUE 0.993 15.000 0.765 0.025 Y NA
 5632196 5632197 Bsph_4234 Bsph_4235 dppB appD TRUE 0.980 15.000 0.245 1.000 Y NA
 5632197 5632198 Bsph_4235 Bsph_4236 appD   TRUE 0.998 -3.000 0.265 0.003 Y NA
 5632198 5632199 Bsph_4236 Bsph_4237   lytS TRUE 0.933 38.000 0.294 0.078   NA
 5632199 5632200 Bsph_4237 Bsph_4238 lytS   TRUE 0.950 39.000 0.412 0.017   NA
 5632200 5632201 Bsph_4238 Bsph_4239     TRUE 0.955 5.000 0.176 NA   NA
 5632201 5632202 Bsph_4239 Bsph_4240     FALSE 0.003 642.000 0.000 NA   NA
 5632203 5632204 Bsph_4241 Bsph_4242     FALSE 0.012 362.000 0.000 1.000 N NA
 5632204 5632205 Bsph_4242 Bsph_4243     TRUE 0.799 22.000 0.017 1.000 N NA
 5632205 5632206 Bsph_4243 Bsph_4244   yqjV FALSE 0.457 146.000 0.042 1.000 N NA
 5632207 5632208 Bsph_4245 Bsph_4247     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5632209 5632210 Bsph_4248 Bsph_4249     FALSE 0.012 377.000 0.000 1.000 N NA
 5632213 5632214 Bsph_4252 Bsph_4253     FALSE 0.482 85.000 0.004 1.000   NA
 5632215 5632216 Bsph_4254 Bsph_4255 ytmA   TRUE 0.957 -10.000 0.036 1.000   NA
 5632216 5632217 Bsph_4255 Bsph_4256     FALSE 0.076 218.000 0.000 1.000 N NA
 5632217 5632218 Bsph_4256 Bsph_4257   kipR TRUE 0.947 12.000 0.182 1.000 N NA
 5632218 5632219 Bsph_4257 Bsph_4258 kipR   TRUE 0.620 126.000 0.091 1.000 N NA
 5632219 5632220 Bsph_4258 Bsph_4259     TRUE 0.957 -7.000 0.091 NA   NA
 5632220 5632221 Bsph_4259 Bsph_4260   appF TRUE 0.744 80.000 0.375 NA   NA
 5632221 5632222 Bsph_4260 Bsph_4261 appF oppD TRUE 0.960 80.000 0.231 0.003 Y NA
 5632222 5632223 Bsph_4261 Bsph_4262 oppD dppC TRUE 0.992 0.000 0.071 1.000 Y NA
 5632223 5632224 Bsph_4262 Bsph_4263 dppC   TRUE 0.996 3.000 0.167 0.025 Y NA
 5632225 5632226 Bsph_4264 Bsph_4265     TRUE 0.600 133.000 0.100 1.000 N NA
 5632226 5632227 Bsph_4265 Bsph_4266     TRUE 0.998 -3.000 0.231 0.003 Y NA
 5632227 5632228 Bsph_4266 Bsph_4267     TRUE 0.749 27.000 0.065 NA   NA
 5632230 5632231 Bsph_4269 Bsph_4270     FALSE 0.505 43.000 0.000 NA   NA
 5632231 5632232 Bsph_4270 Bsph_4271     FALSE 0.462 51.000 0.002 NA   NA
 5632232 5632233 Bsph_4271 Bsph_4272   adcA FALSE 0.294 109.000 0.002 NA   NA
 5632234 5632235 Bsph_4273 Bsph_4274     FALSE 0.017 258.000 0.005 NA   NA
 5632235 5632236 Bsph_4274 Bsph_4275     FALSE 0.536 144.000 0.193 NA   NA
 5632236 5632237 Bsph_4275 Bsph_4276     TRUE 0.817 64.000 0.280 1.000   NA
 5632237 5632238 Bsph_4276 Bsph_4277   menD TRUE 0.986 -3.000 0.355 1.000   NA
 5632238 5632239 Bsph_4277 Bsph_4278 menD   TRUE 0.977 -7.000 0.142 1.000   NA
 5632239 5632240 Bsph_4278 Bsph_4279     FALSE 0.347 196.000 0.000 0.000   NA
 5632241 5632242 Bsph_4280 Bsph_4281     FALSE 0.285 126.000 0.000 NA   NA
 5632243 5632244 Bsph_4282 Bsph_4283     TRUE 0.705 46.000 0.021 1.000 N NA
 5632244 5632245 Bsph_4283 Bsph_4284   skgA FALSE 0.586 86.000 0.040 1.000 N NA
 5632247 5632248 Bsph_4286 Bsph_4287     FALSE 0.414 130.000 0.000 1.000   NA
 5632248 5632249 Bsph_4287 Bsph_tRNA80     FALSE 0.111 176.000 0.000 NA   NA
 5632249 5632250 Bsph_tRNA80 Bsph_tRNA79     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5632250 5632251 Bsph_tRNA79 Bsph_tRNA78     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5632251 5632252 Bsph_tRNA78 Bsph_tRNA77     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5632252 5632253 Bsph_tRNA77 Bsph_tRNA76     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5632253 5632254 Bsph_tRNA76 Bsph_tRNA75     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5632254 5632255 Bsph_tRNA75 Bsph_tRNA74     FALSE 0.430 57.000 0.000 NA   NA
 5632255 5632256 Bsph_tRNA74 Bsph_tRNA73     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5632256 5632257 Bsph_tRNA73 Bsph_tRNA72     FALSE 0.461 52.000 0.000 NA   NA
 5632257 5632258 Bsph_tRNA72 Bsph_tRNA71     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5632258 5632259 Bsph_tRNA71 Bsph_tRNA70     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5632259 5632260 Bsph_tRNA70 Bsph_tRNA69     FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5632260 5632261 Bsph_tRNA69 Bsph_tRNA68     TRUE 0.647 18.000 0.000 NA   NA
 5632261 5632262 Bsph_tRNA68 Bsph_tRNA67     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5632262 5632263 Bsph_tRNA67 Bsph_tRNA66     TRUE 0.797 9.000 0.000 NA   NA
 5632263 5632264 Bsph_tRNA66 Bsph_tRNA65     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5632264 5632265 Bsph_tRNA65 Bsph_tRNA64     FALSE 0.536 37.000 0.000 NA   NA
 5632265 5632266 Bsph_tRNA64 Bsph_tRNA63     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5632266 5632267 Bsph_tRNA63 Bsph_tRNA62     TRUE 0.816 7.000 0.000 NA   NA
 5632267 5632268 Bsph_tRNA62 Bsph_tRNA61     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5632268 5632269 Bsph_tRNA61 Bsph_rRNA105S     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5632269 5632270 Bsph_rRNA105S Bsph_4288     FALSE 0.017 253.000 0.000 NA   NA
 5632271 5632272 Bsph_4289 Bsph_4290     TRUE 0.997 -43.000 0.223 0.002 Y NA
 5632272 5632273 Bsph_4290 Bsph_4291     TRUE 0.997 -13.000 0.198 0.002 Y NA
 5632273 5632274 Bsph_4291 Bsph_4292     FALSE 0.014 272.000 0.000 NA   NA
 5632275 5632276 Bsph_tRNA60 Bsph_tRNA59     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5632276 5632277 Bsph_tRNA59 Bsph_tRNA58     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5632277 5632278 Bsph_tRNA58 Bsph_tRNA57     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5632278 5632279 Bsph_tRNA57 Bsph_tRNA56     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5632279 5632280 Bsph_tRNA56 Bsph_tRNA55     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5632280 5632281 Bsph_tRNA55 Bsph_tRNA54     FALSE 0.430 57.000 0.000 NA   NA
 5632281 5632282 Bsph_tRNA54 Bsph_tRNA53     FALSE 0.587 29.000 0.000 NA   NA
 5632282 5632283 Bsph_tRNA53 Bsph_tRNA52     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5632283 5632284 Bsph_tRNA52 Bsph_4293     FALSE 0.313 92.000 0.000 NA   NA
 5632284 5632285 Bsph_4293 Bsph_4294     TRUE 0.718 68.000 0.215 NA   NA
 5632285 5632286 Bsph_4294 Bsph_4295     TRUE 0.791 144.000 0.049 1.000 Y NA
 5632286 5632287 Bsph_4295 Bsph_4296     TRUE 0.990 -22.000 0.838 1.000 N NA
 5632287 5632288 Bsph_4296 Bsph_4297     TRUE 0.997 0.000 0.714 1.000 Y NA
 5632288 5632289 Bsph_4297 Bsph_4298   rsbU TRUE 0.981 19.000 0.440 1.000 Y NA
 5632289 5632290 Bsph_4298 Bsph_4299 rsbU   TRUE 0.995 4.000 0.617 1.000 Y NA
 5632290 5632291 Bsph_4299 Bsph_4300     FALSE 0.059 353.000 0.000 1.000 Y NA
 5632291 5632292 Bsph_4300 Bsph_4301     TRUE 0.964 5.000 0.260 NA   NA
 5632292 5632293 Bsph_4301 Bsph_4302     FALSE 0.037 272.000 0.108 NA   NA
 5632293 5632294 Bsph_4302 Bsph_4303     TRUE 0.811 148.000 0.194 NA Y NA
 5632294 5632295 Bsph_4303 Bsph_4304     TRUE 0.887 -15.000 0.000 NA   NA
 5632295 5632296 Bsph_4304 Bsph_4305     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5632298 5632299 Bsph_4307 Bsph_4308 ydaF   FALSE 0.558 108.000 0.125 NA   NA
 5632299 5632300 Bsph_4308 Bsph_4309     TRUE 0.986 -7.000 0.600 NA   NA
 5632300 5632301 Bsph_4309 Bsph_4310     FALSE 0.317 125.000 0.011 NA   NA
 5632301 5632302 Bsph_4310 Bsph_4311     FALSE 0.012 353.000 0.006 1.000   NA
 5632302 5632303 Bsph_4311 Bsph_4312     TRUE 0.769 43.000 0.069 1.000   NA
 5632303 5632304 Bsph_4312 Bsph_4313     TRUE 0.988 12.000 0.035 0.004 Y NA
 5632304 5632305 Bsph_4313 Bsph_4314     FALSE 0.301 100.000 0.004 NA   NA
 5632308 5632309 Bsph_4317 Bsph_4318 norA   FALSE 0.254 135.000 0.000 NA   NA
 5632310 5632311 Bsph_4320 Bsph_4321     FALSE 0.384 151.000 0.091 NA   NA
 5632311 5632312 Bsph_4321 Bsph_4322   oxaA TRUE 0.898 52.000 1.000 NA   NA
 5632312 5632313 Bsph_4322 Bsph_4323 oxaA   TRUE 0.620 169.000 0.500 1.000 N NA
 5632314 5632315 Bsph_4324 Bsph_4325     FALSE 0.006 350.000 0.000 NA   NA
 5632315 5632316 Bsph_4325 Bsph_4326     FALSE 0.455 110.000 0.049 NA N NA
 5632317 5632318 Bsph_4327 Bsph_4328     FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 5632318 5632319 Bsph_4328 Bsph_4329     FALSE 0.260 133.000 0.000 NA   NA
 5632319 5632320 Bsph_4329 Bsph_4330     FALSE 0.258 138.000 0.006 NA   NA
 5632320 5632321 Bsph_4330 Bsph_4331   mntR TRUE 0.597 30.000 0.006 NA   NA
 5632321 5632322 Bsph_4331 Bsph_4332 mntR   FALSE 0.294 123.000 0.000 NA   NA
 5632322 5632323 Bsph_4332 Bsph_4333     FALSE 0.007 336.000 0.000 NA   NA
 5632323 5632324 Bsph_4333 Bsph_4334     TRUE 0.987 -19.000 0.500 1.000 N NA
 5632324 5632325 Bsph_4334 Bsph_4335     TRUE 0.728 145.000 0.500 1.000   NA
 5632325 5632326 Bsph_4335 Bsph_4336     FALSE 0.016 316.000 0.000 1.000   NA
 5632326 5632327 Bsph_4336 Bsph_4337     TRUE 0.647 55.000 0.010 1.000 N NA
 5632327 5632328 Bsph_4337 Bsph_4338     FALSE 0.093 209.000 0.000 1.000 N NA
 5632329 5632330 Bsph_4339 Bsph_4340     TRUE 0.727 36.000 0.077 NA   NA
 5632331 5632332 Bsph_4341 Bsph_4342     FALSE 0.014 339.000 0.000 1.000 N NA
 5632332 5632333 Bsph_4342 Bsph_4343     FALSE 0.477 196.000 1.000 1.000 N NA
 5632337 5632338 Bsph_4347 Bsph_4348 rpiR3 yceI FALSE 0.019 309.000 0.000 1.000 N NA
 5632339 5632340 Bsph_4349 Bsph_4350     TRUE 0.995 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 5632340 5632341 Bsph_4350 Bsph_4351     FALSE 0.525 181.000 0.003 1.000 Y NA
 5632342 5632343 Bsph_4352 Bsph_4353     FALSE 0.500 167.000 0.025 0.067 N NA
 5632343 5632344 Bsph_4353 Bsph_4354     FALSE 0.022 238.000 0.000 NA   NA
 5632344 5632345 Bsph_4354 Bsph_4355   comA FALSE 0.005 415.000 0.000 NA   NA
 5632345 5632346 Bsph_4355 Bsph_4356 comA comP TRUE 0.999 -7.000 1.000 0.017 Y NA
 5632346 5632347 Bsph_4356 Bsph_4357 comP   TRUE 0.852 72.000 1.000 NA   NA
 5632347 5632348 Bsph_4357 Bsph_4358   comQ TRUE 0.958 15.000 1.000 NA   NA
 5632350 5632351 Bsph_4360 Bsph_4361     TRUE 0.954 2.000 0.048 1.000   NA
 5632351 5632352 Bsph_4361 Bsph_4362     TRUE 0.930 65.000 0.196 1.000 Y NA
 5632352 5632353 Bsph_4362 Bsph_4363   fatC TRUE 0.997 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 5632353 5632354 Bsph_4363 Bsph_4364 fatC   TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5632354 5632355 Bsph_4364 Bsph_4366     FALSE 0.011 287.000 0.000 NA   NA
 5632355 5632356 Bsph_4366 Bsph_4367     TRUE 0.767 64.000 0.286 NA   NA
 5632356 5632357 Bsph_4367 Bsph_4368     TRUE 0.980 13.000 0.625 0.054   NA
 5632357 5632358 Bsph_4368 Bsph_4369     TRUE 0.982 0.000 0.250 1.000   NA
 5632358 5632359 Bsph_4369 Bsph_4370     FALSE 0.037 244.000 0.000 1.000   NA
 5632359 5632360 Bsph_4370 Bsph_4371   hflX FALSE 0.011 373.000 0.000 1.000   NA
 5632360 5632361 Bsph_4371 Bsph_4372 hflX   FALSE 0.382 138.000 0.002 1.000   NA
 5632363 5632364 Bsph_4374 Bsph_4375 macB ytrE TRUE 0.987 2.000 0.500 1.000 N NA
 5632365 5632366 Bsph_4376 Bsph_4377 ykaA   TRUE 0.928 22.000 0.007 NA Y NA
 5632366 5632367 Bsph_4377 Bsph_4378   mmpL11 TRUE 0.603 108.000 0.083 1.000   NA
 5632368 5632369 Bsph_4379 Bsph_4380     FALSE 0.152 183.000 0.050 NA   NA
 5632369 5632370 Bsph_4380 Bsph_4381     TRUE 0.756 24.000 0.062 NA   NA
 5632370 5632371 Bsph_4381 Bsph_4382     FALSE 0.356 131.000 0.035 NA   NA
 5632371 5632372 Bsph_4382 Bsph_4383   yubA TRUE 0.824 12.000 0.035 NA   NA
 5632372 5632373 Bsph_4383 Bsph_4384 yubA   FALSE 0.043 211.000 0.000 NA   NA
 5632373 5632374 Bsph_4384 Bsph_4385     FALSE 0.450 96.000 0.057 NA   NA
 5632374 5632375 Bsph_4385 Bsph_4386     FALSE 0.339 78.000 0.000 NA   NA
 5632375 5632376 Bsph_4386 Bsph_4388     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 5632376 5632377 Bsph_4388 Bsph_4389   tlpC FALSE 0.502 209.000 0.000 0.011 Y NA
 5632377 5632378 Bsph_4389 Bsph_4390 tlpC   FALSE 0.421 59.000 0.000 NA   NA
 5632378 5632379 Bsph_4390 Bsph_4392     FALSE 0.359 72.000 0.000 NA   NA
 5632379 5632380 Bsph_4392 Bsph_4393   yeeI TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5632382 5632383 Bsph_4395 Bsph_4396   yhdO FALSE 0.477 110.000 0.003 1.000 N NA
 5632383 5632384 Bsph_4396 Bsph_4397 yhdO   FALSE 0.523 80.000 0.017 1.000   NA
 5632384 5632385 Bsph_4397 Bsph_4398   norM TRUE 0.939 3.000 0.017 1.000   NA
 5632385 5632386 Bsph_4398 Bsph_4399 norM   FALSE 0.389 150.000 0.017 1.000 N NA
 5632386 5632387 Bsph_4399 Bsph_4400     FALSE 0.446 136.000 0.015 1.000 N NA
 5632387 5632388 Bsph_4400 Bsph_4401     TRUE 0.947 -16.000 0.023 1.000   NA
 5632388 5632389 Bsph_4401 Bsph_4402     FALSE 0.008 443.000 0.000 1.000   NA
 5632389 5632390 Bsph_4402 Bsph_4403     FALSE 0.519 87.000 0.021 1.000   NA
 5632392 5632393 Bsph_4405 Bsph_4406   ubiB FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 5632395 5632396 Bsph_4408 Bsph_4409     FALSE 0.150 232.000 0.000 0.005 N NA
 5632396 5632397 Bsph_4409 Bsph_4410     TRUE 0.959 3.000 0.071 1.000   NA
 5632397 5632398 Bsph_4410 Bsph_4411   yrkI TRUE 0.665 69.000 0.071 1.000   NA
 5632398 5632399 Bsph_4411 Bsph_4412 yrkI   FALSE 0.478 146.000 0.069 1.000   NA
 5632399 5632400 Bsph_4412 Bsph_4413     FALSE 0.596 91.000 0.138 NA   NA
 5632400 5632401 Bsph_4413 Bsph_4414     TRUE 0.768 17.000 0.048 NA   NA
 5632401 5632402 Bsph_4414 Bsph_4415     TRUE 0.935 46.000 0.175 NA Y NA
 5632402 5632403 Bsph_4415 Bsph_4416     TRUE 0.986 12.000 0.410 NA Y NA
 5632403 5632404 Bsph_4416 Bsph_4417     TRUE 0.645 43.000 0.051 NA   NA
 5632404 5632405 Bsph_4417 Bsph_4418     FALSE 0.113 181.000 0.014 NA   NA
 5632407 5632408 Bsph_4420 Bsph_4421     TRUE 0.603 45.000 0.037 NA   NA
 5632408 5632409 Bsph_4421 Bsph_4422     FALSE 0.244 139.000 0.000 NA   NA
 5632409 5632410 Bsph_4422 Bsph_4423     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5632410 5632411 Bsph_4423 Bsph_4424     FALSE 0.219 146.000 0.000 NA   NA
 5632412 5632413 Bsph_4425 Bsph_4426 mcpA   FALSE 0.006 827.000 0.000 1.000 N NA
 5632413 5632414 Bsph_4426 Bsph_4427     TRUE 0.982 -34.000 0.000 0.001   NA
 5632415 5632416 Bsph_4428 Bsph_4429     FALSE 0.009 408.000 0.000 1.000   NA
 5632416 5632417 Bsph_4429 Bsph_4430     TRUE 0.755 16.000 0.032 NA   NA
 5632417 5632418 Bsph_4430 Bsph_4431     FALSE 0.082 198.000 0.032 NA   NA
 5632419 5632420 Bsph_4432 Bsph_4433     TRUE 0.981 2.000 0.279 1.000   NA
 5632423 5632424 Bsph_4436 Bsph_4437     TRUE 0.969 12.000 1.000 NA   NA
 5632424 5632425 Bsph_4437 Bsph_4438     TRUE 0.980 -13.000 0.400 NA   NA
 5632425 5632426 Bsph_4438 Bsph_4439     TRUE 0.769 86.000 0.500 NA   NA
 5632427 5632428 Bsph_4440 Bsph_4441     FALSE 0.213 188.000 0.133 NA   NA
 5632429 5632430 Bsph_4442 Bsph_4443     FALSE 0.006 346.000 0.000 NA   NA
 5632430 5632431 Bsph_4443 Bsph_4444     FALSE 0.191 154.000 0.000 NA   NA
 5632431 5632432 Bsph_4444 Bsph_4445     FALSE 0.542 129.000 0.133 NA   NA
 5632432 5632433 Bsph_4445 Bsph_4446   fhuC TRUE 0.814 46.000 0.250 NA   NA
 5632433 5632434 Bsph_4446 Bsph_4447 fhuC feuC TRUE 0.978 30.000 0.545 1.000 Y NA
 5632434 5632435 Bsph_4447 Bsph_4448 feuC feuB TRUE 0.990 29.000 0.909 0.024 Y NA
 5632435 5632436 Bsph_4448 Bsph_4449 feuB   TRUE 0.881 123.000 0.136 1.000 Y NA
 5632436 5632437 Bsph_4449 Bsph_4450     FALSE 0.069 223.000 0.000 1.000 N NA
 5632437 5632438 Bsph_4450 Bsph_4451     TRUE 0.959 11.000 0.500 NA   NA
 5632442 5632443 Bsph_4455 Bsph_4456   expZ TRUE 0.663 57.000 0.100 NA   NA
 5632445 5632446 Bsph_4458 Bsph_4459     FALSE 0.008 320.000 0.000 NA   NA
 5632446 5632447 Bsph_4459 Bsph_4460     FALSE 0.003 571.000 0.000 NA   NA
 5632447 5632448 Bsph_4460 Bsph_4461     TRUE 0.822 10.000 0.006 NA N NA
 5632451 5632452 Bsph_4464 Bsph_4465     FALSE 0.242 140.000 0.000 NA   NA
 5632452 5632453 Bsph_4465 Bsph_4466   yjdF FALSE 0.455 68.000 0.026 NA   NA
 5632453 5632454 Bsph_4466 Bsph_4467 yjdF   FALSE 0.482 55.000 0.015 NA   NA
 5632455 5632456 Bsph_4468 Bsph_4469     TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5632456 5632457 Bsph_4469 Bsph_4470   ycxC TRUE 0.993 -13.000 0.000 0.066 Y NA
 5632458 5632459 Bsph_4471 Bsph_4472     FALSE 0.471 129.000 0.083 NA   NA
 5632460 5632461 Bsph_4473 Bsph_4474     FALSE 0.532 69.000 0.000 1.000   NA
 5632461 5632462 Bsph_4474 Bsph_4475     TRUE 0.872 20.000 0.200 NA   NA
 5632462 5632463 Bsph_4475 Bsph_4476     TRUE 0.988 0.000 0.889 NA   NA
 5632463 5632464 Bsph_4476 Bsph_4477     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5632464 5632465 Bsph_4477 Bsph_4478     TRUE 0.877 78.000 0.333 0.076 N NA
 5632465 5632466 Bsph_4478 Bsph_4479   sphR TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5632470 5632471 Bsph_4483 Bsph_4484 ytcD   FALSE 0.520 40.000 0.000 NA   NA
 5632472 5632473 Bsph_4485 Bsph_4486     FALSE 0.185 163.000 0.000 NA N NA
 5632473 5632474 Bsph_4486 Bsph_4487     FALSE 0.406 313.000 0.800 0.005 Y NA
 5632474 5632475 Bsph_4487 Bsph_4488     FALSE 0.007 343.000 0.000 NA   NA
 5632475 5632476 Bsph_4488 Bsph_4489     FALSE 0.005 392.000 0.000 NA   NA
 5632477 5632478 Bsph_4490 Bsph_4491     FALSE 0.313 92.000 0.000 NA   NA
 5632479 5632480 Bsph_4492 Bsph_4493     TRUE 0.675 23.000 0.022 NA   NA
 5632480 5632481 Bsph_4493 Bsph_4494   ybfO FALSE 0.326 162.000 0.091 NA   NA
 5632482 5632483 Bsph_4495 Bsph_4496     FALSE 0.430 57.000 0.000 NA   NA
 5632483 5632484 Bsph_4496 Bsph_4497     FALSE 0.335 80.000 0.000 NA   NA
 5632485 5632486 Bsph_4498 Bsph_4499     FALSE 0.075 214.000 0.000 1.000   NA
 5632488 5632489 Bsph_4501 Bsph_4502     TRUE 0.966 -19.000 0.077 1.000 N NA
 5632490 5632491 Bsph_4503 Bsph_4504     FALSE 0.505 43.000 0.000 NA   NA
 5632491 5632492 Bsph_4504 Bsph_4505     FALSE 0.425 58.000 0.000 NA   NA
 5632492 5632493 Bsph_4505 Bsph_4506   ydbI FALSE 0.397 92.000 0.030 NA   NA
 5632495 5632496 Bsph_4508 Bsph_4511     FALSE 0.344 76.000 0.000 NA   NA
 5632496 5632497 Bsph_4511 Bsph_4512     FALSE 0.421 141.000 0.080 NA   NA
 5632497 5632498 Bsph_4512 Bsph_4513     TRUE 0.886 11.000 0.080 NA   NA
 5632498 5632499 Bsph_4513 Bsph_4514   lrpC TRUE 0.634 81.000 0.065 1.000 N NA
 5632501 5632502 Bsph_4516 Bsph_4517 yffB   FALSE 0.578 107.000 0.056 1.000 N NA
 5632502 5632503 Bsph_4517 Bsph_4518     FALSE 0.027 229.000 0.000 NA   NA
 5632503 5632504 Bsph_4518 Bsph_4520     FALSE 0.003 801.000 0.000 NA   NA
 5632504 5632505 Bsph_4520 Bsph_4521     FALSE 0.144 168.000 0.000 NA   NA
 5632505 5632506 Bsph_4521 Bsph_4522     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5632506 5632507 Bsph_4522 Bsph_4523     FALSE 0.299 119.000 0.000 NA   NA
 5632507 5632508 Bsph_4523 Bsph_4524   cutR TRUE 0.971 50.000 0.816 1.000 Y NA
 5632508 5632509 Bsph_4524 Bsph_4525 cutR   FALSE 0.050 204.000 0.000 NA   NA
 5632509 5632510 Bsph_4525 Bsph_4526   msrA FALSE 0.015 266.000 0.000 NA   NA
 5632512 5632513 Bsph_4528 Bsph_4529     TRUE 0.944 -16.000 0.004 1.000 N NA
 5632514 5632515 Bsph_4530 Bsph_4531     TRUE 0.989 -3.000 0.833 NA   NA
 5632516 5632517 Bsph_4532 Bsph_4533   bcrA TRUE 0.980 5.000 0.714 NA   NA
 5632517 5632518 Bsph_4533 Bsph_4534 bcrA   TRUE 0.990 1.000 0.750 1.000 N NA
 5632518 5632519 Bsph_4534 Bsph_4535   marR FALSE 0.059 539.000 0.000 0.031 Y NA
 5632519 5632520 Bsph_4535 Bsph_4536 marR   TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5632520 5632521 Bsph_4536 Bsph_4537     FALSE 0.568 149.000 0.286 NA   NA
 5632521 5632522 Bsph_4537 Bsph_4538     TRUE 0.926 -13.000 0.037 NA   NA
 5632522 5632523 Bsph_4538 Bsph_4539     FALSE 0.008 319.000 0.000 NA   NA
 5632523 5632524 Bsph_4539 Bsph_4540     FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5632524 5632525 Bsph_4540 Bsph_4541     FALSE 0.012 286.000 0.000 NA   NA
 5632526 5632527 Bsph_4542 Bsph_4543     FALSE 0.399 64.000 0.000 NA   NA
 5632530 5632531 Bsph_4546 Bsph_4547   comP TRUE 0.743 26.000 0.000 1.000   NA
 5632531 5632532 Bsph_4547 Bsph_4548 comP   FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5632532 5632533 Bsph_4548 Bsph_4549   comQ TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5632534 5632535 Bsph_4550 Bsph_4551   arlR FALSE 0.003 1288.000 0.000 NA   NA
 5632535 5632536 Bsph_4551 Bsph_4552 arlR   TRUE 0.994 -7.000 0.130 1.000 Y NA
 5632537 5632538 Bsph_4553 Bsph_4554     TRUE 0.942 -10.000 0.000 1.000   NA
 5632538 5632539 Bsph_4554 Bsph_4555     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5632539 5632540 Bsph_4555 Bsph_4556     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5632542 5632543 Bsph_4558 Bsph_4559     FALSE 0.006 530.000 0.000 1.000   NA
 5632545 5632546 Bsph_4561 Bsph_4562     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5632546 5632547 Bsph_4562 Bsph_4563     FALSE 0.025 284.000 0.000 1.000 N NA
 5632547 5632548 Bsph_4563 Bsph_4564     FALSE 0.005 828.000 0.000 1.000   NA
 5632548 5632549 Bsph_4564 Bsph_4565     FALSE 0.439 124.000 0.003 1.000   NA
 5632549 5632550 Bsph_4565 Bsph_4566     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5632550 5632551 Bsph_4566 Bsph_4567     FALSE 0.294 103.000 0.000 NA   NA
 5632551 5632552 Bsph_4567 Bsph_4568     TRUE 0.985 -7.000 0.502 NA   NA
 5632552 5632553 Bsph_4568 Bsph_4569     FALSE 0.268 150.000 0.028 NA   NA
 5632553 5632554 Bsph_4569 Bsph_4570     TRUE 0.984 14.000 0.583 NA Y NA
 5632554 5632555 Bsph_4570 Bsph_4571     FALSE 0.577 134.000 0.083 1.000 N NA
 5632555 5632556 Bsph_4571 Bsph_tRNA51     FALSE 0.085 186.000 0.000 NA   NA
 5632556 5632557 Bsph_tRNA51 Bsph_tRNA50     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5632557 5632558 Bsph_tRNA50 Bsph_tRNA49     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5632558 5632559 Bsph_tRNA49 Bsph_tRNA48     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5632559 5632560 Bsph_tRNA48 Bsph_tRNA47     FALSE 0.364 71.000 0.000 NA   NA
 5632560 5632561 Bsph_tRNA47 Bsph_tRNA46     FALSE 0.298 113.000 0.000 NA   NA
 5632563 5632564 Bsph_rRNA115S Bsph_rRNA1123S     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5632564 5632565 Bsph_rRNA1123S Bsph_rRNA1116S     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 5632569 5632570 Bsph_4578 Bsph_4579     TRUE 0.775 73.000 0.211 1.000 N NA
 5632570 5632571 Bsph_4579 Bsph_4580     FALSE 0.307 132.000 0.018 NA   NA
 5632573 5632574 Bsph_4582 Bsph_4583     TRUE 0.970 26.000 0.601 0.009   NA
 5632574 5632575 Bsph_4583 Bsph_4584     FALSE 0.011 479.000 0.052 1.000   NA
 5632575 5632576 Bsph_4584 Bsph_4585   cbiO TRUE 0.932 14.000 0.170 1.000 N NA
 5632576 5632577 Bsph_4585 Bsph_4586 cbiO cbiO TRUE 0.994 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 5632577 5632578 Bsph_4586 Bsph_4587 cbiO cbiO TRUE 0.998 -24.000 0.713 0.020 Y NA
 5632578 5632579 Bsph_4587 Bsph_4588 cbiO   FALSE 0.017 425.000 0.074 1.000 N NA
 5632579 5632580 Bsph_4588 Bsph_4589     TRUE 0.909 57.000 0.873 1.000 N NA
 5632580 5632581 Bsph_4589 Bsph_4590     TRUE 0.708 140.000 0.308 1.000 N NA
 5632581 5632582 Bsph_4590 Bsph_4591     TRUE 0.971 26.000 0.009 0.009 Y NA
 5632582 5632583 Bsph_4591 Bsph_4592     TRUE 0.723 176.000 0.004 0.012 Y NA
 5632583 5632584 Bsph_4592 Bsph_4593     FALSE 0.015 414.000 0.059 1.000 N NA
 5632584 5632585 Bsph_4593 Bsph_4594     TRUE 0.794 71.000 0.241 1.000 N NA
 5632585 5632586 Bsph_4594 Bsph_4595     TRUE 0.951 24.000 0.730 1.000 N NA
 5632586 5632587 Bsph_4595 Bsph_4596     TRUE 0.990 35.000 0.653 0.001 Y NA
 5632587 5632588 Bsph_4596 Bsph_4597     TRUE 0.984 52.000 0.789 0.012 Y NA
 5632588 5632589 Bsph_4597 Bsph_4598     TRUE 0.992 22.000 0.814 0.012 Y NA
 5632589 5632590 Bsph_4598 Bsph_4599     FALSE 0.184 310.000 0.815 0.009   NA
 5632590 5632591 Bsph_4599 Bsph_4600     TRUE 0.971 31.000 0.808 0.009   NA
 5632591 5632592 Bsph_4600 Bsph_4601     TRUE 0.988 30.000 0.473 0.009 Y NA
 5632592 5632593 Bsph_4601 Bsph_4602     TRUE 0.986 37.000 0.496 0.009 Y NA
 5632593 5632594 Bsph_4602 Bsph_4603     TRUE 0.974 30.000 0.057 0.009 Y NA
 5632594 5632595 Bsph_4603 Bsph_4604     TRUE 0.971 36.000 0.071 0.012 Y NA
 5632595 5632596 Bsph_4604 Bsph_4605     TRUE 0.986 43.000 0.791 0.012 Y NA
 5632596 5632597 Bsph_4605 Bsph_4606     TRUE 0.976 73.000 0.828 0.009 Y NA
 5632597 5632598 Bsph_4606 Bsph_4607     TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.009 Y NA
 5632598 5632599 Bsph_4607 Bsph_4608     TRUE 0.998 2.000 0.828 0.012 Y NA
 5632599 5632600 Bsph_4608 Bsph_4609     TRUE 0.998 4.000 0.719 0.012 Y NA
 5632600 5632601 Bsph_4609 Bsph_4610     TRUE 0.991 23.000 0.769 0.012 Y NA
 5632601 5632602 Bsph_4610 Bsph_4611     TRUE 0.981 61.000 0.820 0.012 Y NA
 5632602 5632603 Bsph_4611 Bsph_4612     TRUE 0.985 48.000 0.849 0.012 Y NA
 5632603 5632604 Bsph_4612 Bsph_4613     TRUE 0.998 0.000 0.307 0.009 Y NA
 5632604 5632605 Bsph_4613 Bsph_4614     TRUE 0.989 27.000 0.544 0.009 Y NA
 5632605 5632606 Bsph_4614 Bsph_4615     TRUE 0.963 91.000 0.467 0.012 Y NA
 5632606 5632607 Bsph_4615 Bsph_4616     FALSE 0.004 470.000 0.000 NA   NA
 5632607 5632608 Bsph_4616 Bsph_4617     TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 5632608 5632609 Bsph_4617 Bsph_4618     FALSE 0.296 99.000 0.000 NA   NA
 5632609 5632610 Bsph_4618 Bsph_4619     FALSE 0.461 52.000 0.000 NA   NA
 5632610 5632611 Bsph_4619 Bsph_4620   bceB FALSE 0.005 394.000 0.000 NA   NA
 5632611 5632612 Bsph_4620 Bsph_4621 bceB bceA TRUE 0.975 -19.000 0.176 1.000   NA
 5632612 5632613 Bsph_4621 Bsph_4622 bceA bceS TRUE 0.796 97.000 0.125 0.075 N NA
 5632613 5632614 Bsph_4622 Bsph_4623 bceS bceR TRUE 0.995 7.000 0.958 1.000 Y NA
 5632614 5632615 Bsph_4623 Bsph_4624 bceR   FALSE 0.510 83.000 0.002 1.000 N NA
 5632615 5632616 Bsph_4624 Bsph_4625     TRUE 0.960 137.000 0.400 0.000 Y NA
 5632616 5632617 Bsph_4625 Bsph_4626     TRUE 0.942 81.000 0.579 1.000 Y NA
 5632617 5632618 Bsph_4626 Bsph_4627     TRUE 0.843 181.000 0.224 0.002 Y NA
 5632618 5632619 Bsph_4627 Bsph_4628     TRUE 0.948 99.000 0.239 0.012 Y NA
 5632619 5632620 Bsph_4628 Bsph_4629     FALSE 0.551 133.000 0.065 1.000 N NA
 5632620 5632621 Bsph_4629 Bsph_4630     TRUE 0.717 230.000 0.851 0.001 Y NA
 5632621 5632622 Bsph_4630 Bsph_4631     FALSE 0.044 243.000 0.008 1.000 N NA
 5632622 5632623 Bsph_4631 Bsph_4632     TRUE 0.880 71.000 0.050 1.000 Y NA
 5632623 5632624 Bsph_4632 Bsph_4633     TRUE 0.977 74.000 0.884 0.009 Y NA
 5632624 5632625 Bsph_4633 Bsph_4634     FALSE 0.540 233.000 0.302 0.012 Y NA
 5632625 5632626 Bsph_4634 Bsph_4635     TRUE 0.969 117.000 0.838 0.012 Y NA
 5632626 5632627 Bsph_4635 Bsph_4636   nusG FALSE 0.162 258.000 0.681 1.000 N NA
 5632627 5632628 Bsph_4636 Bsph_4637 nusG   FALSE 0.041 503.000 0.843 1.000   NA
 5632628 5632629 Bsph_4637 Bsph_4638     FALSE 0.018 306.000 0.000 1.000   NA
 5632629 5632630 Bsph_4638 Bsph_4639     TRUE 0.770 69.000 0.361 NA   NA
 5632630 5632631 Bsph_4639 Bsph_4640     TRUE 0.951 3.000 0.109 NA   NA
 5632631 5632632 Bsph_4640 Bsph_4641     TRUE 0.985 6.000 0.150 0.002   NA
 5632632 5632633 Bsph_4641 Bsph_4642     TRUE 0.956 6.000 0.129 1.000   NA
 5632633 5632634 Bsph_4642 Bsph_4643     TRUE 0.985 -3.000 0.039 0.025 N NA
 5632634 5632635 Bsph_4643 Bsph_4644     FALSE 0.008 472.000 0.008 1.000 N NA
 5632635 5632636 Bsph_4644 Bsph_4645     TRUE 0.636 90.000 0.076 1.000 N NA
 5632636 5632637 Bsph_4645 Bsph_4646     FALSE 0.157 344.000 0.419 1.000 Y NA
 5632637 5632638 Bsph_4646 Bsph_4647     TRUE 0.895 12.000 0.108 NA   NA
 5632638 5632639 Bsph_4647 Bsph_4648   radA FALSE 0.068 217.000 0.056 NA   NA
 5632639 5632640 Bsph_4648 Bsph_4649 radA   TRUE 0.928 92.000 0.062 0.008 Y NA
 5632640 5632641 Bsph_4649 Bsph_4650     TRUE 0.988 -7.000 0.425 1.000 N NA
 5632641 5632642 Bsph_4650 Bsph_4651     TRUE 0.992 -3.000 0.848 1.000   NA
 5632642 5632643 Bsph_4651 Bsph_4652   ctsR TRUE 0.972 8.000 0.681 NA   NA
 5632643 5632644 Bsph_4652 Bsph_4653 ctsR   FALSE 0.021 241.000 0.000 NA   NA
 5632645 5632646 Bsph_4654 Bsph_4655   corA TRUE 0.839 29.000 0.071 1.000 N NA
 5632649 5632650 Bsph_4658 Bsph_4659     FALSE 0.155 171.000 0.000 NA N NA
 5632650 5632651 Bsph_4659 Bsph_4660     FALSE 0.510 42.000 0.000 NA   NA
 5632651 5632652 Bsph_4660 Bsph_4661     FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 5632652 5632653 Bsph_4661 Bsph_4662     TRUE 0.783 16.000 0.049 NA   NA
 5632654 5632655 Bsph_4663 Bsph_4664     TRUE 0.615 23.000 0.000 NA   NA
 5632656 5632657 Bsph_4665 Bsph_4666   braG FALSE 0.299 115.000 0.000 NA   NA
 5632657 5632658 Bsph_4666 Bsph_4667 braG livG TRUE 0.995 0.000 0.046 0.019 Y NA
 5632658 5632659 Bsph_4667 Bsph_4668 livG braE TRUE 0.996 0.000 0.349 1.000 Y NA
 5632659 5632660 Bsph_4668 Bsph_4669 braE braD TRUE 0.997 1.000 0.363 0.024 Y NA
 5632660 5632661 Bsph_4669 Bsph_4670 braD   TRUE 0.793 151.000 0.088 1.000 Y NA
 5632661 5632662 Bsph_4670 Bsph_4671     FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 5632662 5632663 Bsph_4671 Bsph_4672     FALSE 0.170 160.000 0.000 NA   NA
 5632669 5632670 Bsph_4678 Bsph_4679     TRUE 0.675 24.000 0.023 NA   NA
 5632670 5632671 Bsph_4679 Bsph_4680     FALSE 0.436 136.000 0.023 1.000   NA
 5632671 5632672 Bsph_4680 Bsph_4681     TRUE 0.931 32.000 1.000 NA   NA
 5632672 5632673 Bsph_4681 Bsph_4682     FALSE 0.333 81.000 0.000 NA   NA
 5632675 5632676 Bsph_4684 Bsph_4685 ytmN yxeN TRUE 0.979 14.000 0.176 1.000 Y NA
 5632676 5632677 Bsph_4685 Bsph_4686 yxeN ytmL TRUE 0.994 13.000 0.545 0.005 Y NA
 5632677 5632678 Bsph_4686 Bsph_4687 ytmL ytmK TRUE 0.986 31.000 0.455 0.024 Y NA
 5632678 5632679 Bsph_4687 Bsph_4688 ytmK   TRUE 0.799 32.000 0.043 1.000 N NA
 5632682 5632683 Bsph_4691 Bsph_4692   mcpB FALSE 0.306 256.000 0.000 0.001 Y NA
 5632685 5632686 Bsph_4694 Bsph_4695     FALSE 0.132 193.000 0.000 1.000 N NA
 5632690 5632691 Bsph_4699 Bsph_4700     FALSE 0.427 137.000 0.077 NA   NA
 5632692 5632693 Bsph_4701 Bsph_4702     TRUE 0.993 3.000 0.169 1.000 Y NA
 5632694 5632695 Bsph_4703 Bsph_4704     FALSE 0.193 175.000 0.040 NA N NA
 5632695 5632696 Bsph_4704 Bsph_4705     TRUE 0.982 -3.000 0.380 NA   NA
 5632696 5632697 Bsph_4705 Bsph_4706     TRUE 0.931 3.000 0.060 NA   NA
 5632697 5632698 Bsph_4706 Bsph_4707     TRUE 0.904 13.000 0.154 NA   NA
 5632698 5632699 Bsph_4707 Bsph_4708     TRUE 0.682 93.000 0.143 1.000   NA
 5632699 5632700 Bsph_4708 Bsph_4709     FALSE 0.270 130.000 0.000 NA   NA
 5632701 5632702 Bsph_4710 Bsph_4711     FALSE 0.032 225.000 0.000 NA   NA
 5632702 5632703 Bsph_4711 Bsph_4712     FALSE 0.010 379.000 0.000 1.000   NA
 5632703 5632704 Bsph_4712 Bsph_4713     TRUE 0.706 134.000 0.500 NA   NA
 5632706 5632707 Bsph_4715 Bsph_4716     FALSE 0.021 240.000 0.000 NA   NA
 5632708 5632709 Bsph_4717 Bsph_4718     TRUE 0.985 5.000 0.680 1.000 N NA
 5632709 5632710 Bsph_4718 Bsph_4719     TRUE 0.987 16.000 0.696 1.000 Y NA
 5632710 5632711 Bsph_4719 Bsph_4720     TRUE 0.939 28.000 0.012 1.000 Y NA
 5632712 5632713 Bsph_4721 Bsph_4722     FALSE 0.339 78.000 0.000 NA   NA
 5632716 5632717 Bsph_4725 Bsph_4726     TRUE 0.920 28.000 0.333 1.000 N NA
 5632718 5632719 Bsph_4727 Bsph_4728     FALSE 0.294 106.000 0.000 NA   NA
 5632722 5632723 Bsph_4731 Bsph_4732 ydhP   FALSE 0.005 430.000 0.000 NA N NA
 5632723 5632724 Bsph_4732 Bsph_4733     TRUE 0.868 -49.000 0.000 NA   NA
 5632726 5632727 Bsph_4735 Bsph_4736     FALSE 0.015 262.000 0.000 NA   NA
 5632730 5632731 Bsph_4739 Bsph_4740 tlpB   FALSE 0.005 413.000 0.000 NA   NA
 5632733 5632734 Bsph_4742 Bsph_4743     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 5632734 5632735 Bsph_4743 Bsph_4744     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5632735 5632736 Bsph_4744 Bsph_4745     FALSE 0.105 178.000 0.000 NA   NA
 5632736 5632737 Bsph_4745 Bsph_4746     FALSE 0.003 722.000 0.000 NA   NA
 5632737 5632738 Bsph_4746 Bsph_4747     FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 5632738 5632739 Bsph_4747 Bsph_4748     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 5632739 5632740 Bsph_4748 Bsph_4749     FALSE 0.045 210.000 0.000 NA   NA
 5632740 5632741 Bsph_4749 Bsph_4750     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5632741 5632742 Bsph_4750 Bsph_4751     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5632742 5632743 Bsph_4751 Bsph_4752     FALSE 0.296 122.000 0.000 NA   NA
 5632743 5632744 Bsph_4752 Bsph_4753     FALSE 0.315 91.000 0.000 NA   NA
 5632744 5632745 Bsph_4753 Bsph_4754     FALSE 0.011 291.000 0.000 NA   NA
 5632745 5632746 Bsph_4754 Bsph_4755   yycJ FALSE 0.354 166.000 0.060 1.000   NA
 5632746 5632747 Bsph_4755 Bsph_4756 yycJ   TRUE 0.970 0.000 0.176 NA   NA
 5632747 5632748 Bsph_4756 Bsph_4757   yycH TRUE 0.987 -13.000 0.890 NA   NA
 5632748 5632749 Bsph_4757 Bsph_4758 yycH   TRUE 0.985 -9.000 0.575 NA   NA
 5632749 5632750 Bsph_4758 Bsph_4759   yycF TRUE 0.893 171.000 0.597 0.057 Y NA
 5632750 5632751 Bsph_4759 Bsph_4760 yycF   FALSE 0.092 214.000 0.013 1.000 N NA
 5632753 5632754 Bsph_4762 Bsph_4763     FALSE 0.054 237.000 0.018 1.000 N NA
 5632754 5632755 Bsph_4763 Bsph_4764     TRUE 0.893 14.000 0.064 1.000 N NA
 5632755 5632756 Bsph_4764 Bsph_4765     TRUE 0.643 53.000 0.003 1.000 N NA
 5632756 5632757 Bsph_4765 Bsph_4766     TRUE 0.745 14.000 0.017 NA   NA
 5632757 5632758 Bsph_4766 Bsph_4767     FALSE 0.062 226.000 0.069 NA   NA
 5632758 5632759 Bsph_4767 Bsph_4768     TRUE 0.689 42.000 0.002 1.000 N NA
 5632759 5632760 Bsph_4768 Bsph_4769     TRUE 0.659 48.000 0.002 1.000 N NA
 5632762 5632763 Bsph_4771 Bsph_4772   engD FALSE 0.510 83.000 0.002 1.000 N NA
 5632763 5632764 Bsph_4772 Bsph_4773 engD   FALSE 0.460 97.000 0.064 NA   NA
 5632764 5632765 Bsph_4773 Bsph_4774   ybiO TRUE 0.965 2.000 0.171 NA   NA
 5632765 5632766 Bsph_4774 Bsph_4775 ybiO   FALSE 0.003 632.000 0.000 NA   NA
 5632766 5632767 Bsph_4775 Bsph_4776     FALSE 0.384 78.000 0.017 NA   NA
 5632767 5632768 Bsph_4776 Bsph_4777     TRUE 0.992 -7.000 0.827 1.000 N NA
 5632768 5632769 Bsph_4777 Bsph_4778     FALSE 0.125 216.000 0.069 1.000 N NA
 5632769 5632770 Bsph_4778 Bsph_4779     FALSE 0.306 181.000 0.089 1.000 N NA
 5632770 5632771 Bsph_4779 Bsph_4780     TRUE 0.803 116.000 0.466 1.000 N NA
 5632771 5632772 Bsph_4780 Bsph_4781     TRUE 0.905 28.000 0.266 1.000   NA
 5632772 5632773 Bsph_4781 Bsph_4782     FALSE 0.078 244.000 0.116 1.000   NA
 5632773 5632774 Bsph_4782 Bsph_4783   oxaA TRUE 0.969 -3.000 0.071 1.000   NA
 5632774 5632775 Bsph_4783 Bsph_4784 oxaA   FALSE 0.561 33.000 0.000 NA   NA
 5632775 5632776 Bsph_4784 Bsph_4785     FALSE 0.089 184.000 0.000 NA   NA
 5632776 5632777 Bsph_4785 Bsph_4786     TRUE 0.841 93.000 0.787 1.000   NA
 5627806 5627807 Bsph_p001 Bsph_p002     TRUE 0.752 144.000 1.000 NA   NA
 5627807 5627808 Bsph_p002 Bsph_p003     TRUE 0.603 26.000 0.000 NA   NA
 5627808 5627809 Bsph_p003 Bsph_p004     FALSE 0.216 147.000 0.000 NA   NA
 5627809 5627810 Bsph_p004 Bsph_p005     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5627810 5627811 Bsph_p005 Bsph_p006     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5627811 5627812 Bsph_p006 Bsph_p007     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5627812 5627813 Bsph_p007 Bsph_p008     FALSE 0.520 40.000 0.000 NA   NA
 5627813 5627814 Bsph_p008 Bsph_p009     FALSE 0.035 221.000 0.000 NA   NA
 5627814 5627815 Bsph_p009 Bsph_p010     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 5627815 5627816 Bsph_p010 Bsph_p011     FALSE 0.282 127.000 0.000 NA   NA
 5627816 5627817 Bsph_p011 Bsph_p012     FALSE 0.404 63.000 0.000 NA   NA
 5627817 5627818 Bsph_p012 Bsph_p013     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5627818 5627819 Bsph_p013 Bsph_p014     FALSE 0.004 441.000 0.000 NA   NA
 5627819 5627820 Bsph_p014 Bsph_p015   dnaG2 FALSE 0.003 736.000 0.000 NA   NA
 5627820 5627821 Bsph_p015 Bsph_p016 dnaG2   TRUE 0.951 12.000 0.000 0.005   NA
 5627821 5627822 Bsph_p016 Bsph_p017     TRUE 0.917 29.000 0.000 0.001   NA
 5627822 5627823 Bsph_p017 Bsph_p018     FALSE 0.573 199.000 0.000 0.005 Y NA
 5627823 5627824 Bsph_p018 Bsph_p019     FALSE 0.244 168.000 0.000 1.000   NA
 5627824 5627825 Bsph_p019 Bsph_p020     TRUE 0.888 1.000 0.000 NA   NA
 5627825 5627826 Bsph_p020 Bsph_p021     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5627826 5627827 Bsph_p021 Bsph_p022     FALSE 0.448 54.000 0.000 NA   NA
 5627827 5627828 Bsph_p022 Bsph_p023     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 5627828 5627829 Bsph_p023 Bsph_p024     TRUE 0.983 -7.000 0.429 NA   NA
 5627829 5627830 Bsph_p024 Bsph_p025     FALSE 0.015 262.000 0.000 NA   NA
 5627830 5627831 Bsph_p025 Bsph_p026     FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 5627831 5627832 Bsph_p026 Bsph_p027     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 5627832 5627833 Bsph_p027 Bsph_p028     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5627833 5627834 Bsph_p028 Bsph_p029     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5627834 5627835 Bsph_p029 Bsph_p030     TRUE 0.611 24.000 0.000 NA   NA
 5627835 5627836 Bsph_p030 Bsph_p031     FALSE 0.408 62.000 0.000 NA   NA
 5627836 5627837 Bsph_p031 Bsph_p032     FALSE 0.267 131.000 0.000 NA   NA
 5627837 5627838 Bsph_p032 Bsph_p033     FALSE 0.004 450.000 0.000 NA   NA
 5627838 5627839 Bsph_p033 Bsph_p034     FALSE 0.006 358.000 0.000 NA   NA
 5627839 5627840 Bsph_p034 Bsph_p035     FALSE 0.435 56.000 0.000 NA   NA
 5627842 5627843 Bsph_p037 Bsph_p038     FALSE 0.448 54.000 0.000 NA   NA
 5627843 5627844 Bsph_p038 Bsph_p039     TRUE 0.754 12.000 0.000 NA   NA
 5627844 5627845 Bsph_p039 Bsph_p040     FALSE 0.494 45.000 0.000 NA   NA
 5627845 5627846 Bsph_p040 Bsph_p041     FALSE 0.018 249.000 0.000 NA   NA
 5627846 5627847 Bsph_p041 Bsph_p042     FALSE 0.005 386.000 0.000 NA   NA
 5627847 5627848 Bsph_p042 Bsph_p043     TRUE 0.979 -42.000 0.500 NA   NA
 5627848 5627849 Bsph_p043 Bsph_p044     TRUE 0.937 -31.000 0.015 1.000   NA
 5627849 5627850 Bsph_p044 Bsph_p045     TRUE 0.901 31.000 0.003 0.003   NA
 5627850 5627851 Bsph_p045 Bsph_p046     FALSE 0.244 168.000 0.000 1.000   NA
 5627851 5627852 Bsph_p046 Bsph_p047     FALSE 0.515 41.000 0.000 NA   NA
 5627852 5627853 Bsph_p047 Bsph_p048     FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 5627853 5627854 Bsph_p048 Bsph_p049     FALSE 0.322 87.000 0.000 NA   NA
 5627854 5627855 Bsph_p049 Bsph_p050     TRUE 0.880 60.000 1.000 NA   NA
 5627855 5627856 Bsph_p050 Bsph_p051     TRUE 0.720 130.000 0.500 NA   NA
 5627856 5627857 Bsph_p051 Bsph_p052     TRUE 0.743 104.000 0.500 NA   NA
 5627857 5627858 Bsph_p052 Bsph_p053     TRUE 0.615 23.000 0.000 NA   NA
 5627858 5627859 Bsph_p053 Bsph_p054     TRUE 0.872 -37.000 0.000 NA   NA
 5627859 5627860 Bsph_p054 Bsph_p055     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5627860 5627861 Bsph_p055 Bsph_p056     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5627861 5627862 Bsph_p056 Bsph_p057     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5627862 5627863 Bsph_p057 Bsph_p058     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5627863 5627864 Bsph_p058 Bsph_p059     FALSE 0.296 122.000 0.000 NA   NA
 5627864 5627865 Bsph_p059 Bsph_p060     FALSE 0.383 67.000 0.000 NA   NA
 5627865 5627866 Bsph_p060 Bsph_p061     FALSE 0.149 167.000 0.000 NA   NA
 5627866 5627867 Bsph_p061 Bsph_p062     FALSE 0.003 760.000 0.000 NA   NA
 5627867 5627868 Bsph_p062 Bsph_p063     FALSE 0.465 51.000 0.000 NA   NA
 5627868 5627869 Bsph_p063 Bsph_p064     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5627869 5627870 Bsph_p064 Bsph_p065     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5627872 5627873 Bsph_p067 Bsph_p068     FALSE 0.004 455.000 0.000 NA   NA
 5627873 5627874 Bsph_p068 Bsph_p069     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5627874 5627875 Bsph_p069 Bsph_p070     FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 5627875 5627876 Bsph_p070 Bsph_p071     FALSE 0.461 52.000 0.000 NA   NA
 5627876 5627877 Bsph_p071 Bsph_p072     FALSE 0.022 239.000 0.000 NA   NA
 5627877 5627878 Bsph_p072 Bsph_p073     FALSE 0.063 194.000 0.000 NA   NA
 5627878 5627879 Bsph_p073 Bsph_p074     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   NA
 5627879 5627880 Bsph_p074 Bsph_p075     FALSE 0.195 153.000 0.000 NA   NA
 5627880 5627881 Bsph_p075 Bsph_p076     FALSE 0.008 325.000 0.000 NA   NA
 5627881 5627882 Bsph_p076 Bsph_p077     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5627882 5627883 Bsph_p077 Bsph_p078     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5627883 5627884 Bsph_p078 Bsph_p079     FALSE 0.465 51.000 0.000 NA   NA
 5627884 5627885 Bsph_p079 Bsph_p080     FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 5627885 5627886 Bsph_p080 Bsph_p081     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5627886 5627887 Bsph_p081 Bsph_p082     FALSE 0.520 40.000 0.000 NA   NA
 5627887 5627888 Bsph_p082 Bsph_p083     FALSE 0.309 94.000 0.000 NA   NA
 5627888 5627889 Bsph_p083 Bsph_p084     FALSE 0.004 461.000 0.000 NA   NA
 5627891 5627892 Bsph_p086 Bsph_p087     FALSE 0.004 471.000 0.000 NA   NA
 5627892 5627893 Bsph_p087 Bsph_p088     FALSE 0.003 912.000 0.000 NA   NA
 5627894 5627895 Bsph_p089 Bsph_p090     FALSE 0.313 92.000 0.000 NA   NA
 5627895 5627896 Bsph_p090 Bsph_p091     FALSE 0.309 94.000 0.000 NA   NA
 5627896 5627897 Bsph_p091 Bsph_p092     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 5627897 5627898 Bsph_p092 Bsph_p093     FALSE 0.326 85.000 0.000 NA   NA
 5627898 5627899 Bsph_p093 Bsph_p094     FALSE 0.239 141.000 0.000 NA   NA
 5627899 5627900 Bsph_p094 Bsph_p095     FALSE 0.085 186.000 0.000 NA   NA
 5627900 5627901 Bsph_p095 Bsph_p096     FALSE 0.024 234.000 0.000 NA   NA
 5627901 5627902 Bsph_p096 Bsph_p097     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5627902 5627903 Bsph_p097 Bsph_p098     FALSE 0.003 715.000 0.000 NA   NA
 5627903 5627904 Bsph_p098 Bsph_p099     FALSE 0.004 463.000 0.000 NA   NA
 5627904 5627905 Bsph_p099 Bsph_p100     FALSE 0.296 99.000 0.000 NA   NA
 5627905 5627906 Bsph_p100 Bsph_p101     FALSE 0.005 378.000 0.000 NA   NA
 5627906 5627907 Bsph_p101 Bsph_p102     FALSE 0.569 32.000 0.000 NA   NA
 5627907 5627908 Bsph_p102 Bsph_p103     FALSE 0.393 65.000 0.000 NA   NA
 5627908 5627909 Bsph_p103 Bsph_p104     FALSE 0.003 1104.000 0.000 NA   NA
 5627909 5627910 Bsph_p104 Bsph_p105     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5627910 5627911 Bsph_p105 Bsph_p106     FALSE 0.105 178.000 0.000 NA   NA
 5627911 5627912 Bsph_p106 Bsph_p107     FALSE 0.346 75.000 0.000 NA   NA
 5627912 5627913 Bsph_p107 Bsph_p108     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5627913 5627914 Bsph_p108 Bsph_p109     FALSE 0.092 183.000 0.000 NA   NA
 5627914 5627915 Bsph_p109 Bsph_p110     FALSE 0.404 63.000 0.000 NA   NA
 5627915 5627916 Bsph_p110 Bsph_p111     FALSE 0.003 554.000 0.000 NA   NA
 5627916 5627917 Bsph_p111 Bsph_p112     FALSE 0.294 101.000 0.000 NA   NA
 5627917 5627918 Bsph_p112 Bsph_p113   abrB TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5627918 5627919 Bsph_p113 Bsph_p114 abrB   FALSE 0.294 101.000 0.000 NA   NA
 5627919 5627920 Bsph_p114 Bsph_p115     TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5627920 5627921 Bsph_p115 Bsph_p116     FALSE 0.003 759.000 0.000 NA   NA
 5627921 5627922 Bsph_p116 Bsph_p117     FALSE 0.003 1225.000 0.000 NA   NA
 5627922 5627923 Bsph_p117 Bsph_p118     TRUE 0.989 -7.000 0.948 NA   NA
 5627923 5627924 Bsph_p118 Bsph_p119     TRUE 0.952 16.000 0.891 NA   NA
 5627924 5627925 Bsph_p119 Bsph_p120     FALSE 0.012 280.000 0.000 NA   NA
 5627925 5627926 Bsph_p120 Bsph_p121     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5627926 5627927 Bsph_p121 Bsph_p122     FALSE 0.515 41.000 0.000 NA   NA
 5627927 5627928 Bsph_p122 Bsph_p123     FALSE 0.542 36.000 0.000 NA   NA
 5627928 5627929 Bsph_p123 Bsph_p124     FALSE 0.092 183.000 0.000 NA   NA
 5627929 5627930 Bsph_p124 Bsph_p125     FALSE 0.465 51.000 0.000 NA   NA
 5627930 5627931 Bsph_p125 Bsph_p126     FALSE 0.140 169.000 0.000 NA   NA
 5627931 5627932 Bsph_p126 Bsph_p127     FALSE 0.003 564.000 0.000 NA   NA
 5627932 5627933 Bsph_p127 Bsph_p128     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5627933 5627934 Bsph_p128 Bsph_p129     FALSE 0.430 57.000 0.000 NA   NA
 5627935 5627936 Bsph_p130 Bsph_p131     FALSE 0.195 153.000 0.000 NA   NA
 5627937 5627938 Bsph_p132 Bsph_p133   radC FALSE 0.299 116.000 0.000 NA   NA
 5627938 5627939 Bsph_p133 Bsph_p134 radC   FALSE 0.076 189.000 0.000 NA   NA
 5627939 5627940 Bsph_p134 Bsph_p135     FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5627940 5627941 Bsph_p135 Bsph_p136     FALSE 0.561 33.000 0.000 NA   NA
 5627941 5627942 Bsph_p136 Bsph_p137     FALSE 0.294 106.000 0.000 NA   NA
 5627942 5627943 Bsph_p137 Bsph_p138     TRUE 0.624 21.000 0.000 NA   NA
 5627943 5627944 Bsph_p138 Bsph_p139     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5627949 5627950 Bsph_p144 Bsph_p145     TRUE 0.991 9.000 1.000 0.006   NA
 5627950 5627951 Bsph_p145 Bsph_p146     FALSE 0.160 236.000 0.667 NA   NA
 5627951 5627952 Bsph_p146 Bsph_p147     FALSE 0.003 1852.000 0.000 NA   NA
 5627952 5627953 Bsph_p147 Bsph_p148     TRUE 0.993 -13.000 0.429 0.009   NA
 5627953 5627954 Bsph_p148 Bsph_p149     TRUE 0.892 30.000 0.000 0.009   NA
 5627955 5627956 Bsph_p150 Bsph_p151     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5627956 5627957 Bsph_p151 Bsph_p152     FALSE 0.003 579.000 0.000 NA   NA
 5627957 5627958 Bsph_p152 Bsph_p153     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 5627958 5627959 Bsph_p153 Bsph_p154     FALSE 0.003 516.000 0.000 NA   NA
 5627959 5627960 Bsph_p154 Bsph_p155     FALSE 0.530 172.000 0.000 0.001   NA
 5627960 5627961 Bsph_p155 Bsph_p156     FALSE 0.004 446.000 0.000 NA   NA
 5627961 5627962 Bsph_p156 Bsph_p157     FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 5627962 5627963 Bsph_p157 Bsph_p158     FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 5627964 5627965 Bsph_p159 Bsph_p160     TRUE 0.693 36.000 0.000 1.000   NA
 5627966 5627967 Bsph_p161 Bsph_p162     FALSE 0.524 39.000 0.000 NA   NA
 5627969 5627970 Bsph_p164 Bsph_p165     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5627970 5627971 Bsph_p165 Bsph_p168     FALSE 0.019 246.000 0.000 NA   NA
 5627971 5627972 Bsph_p168 Bsph_p169     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5627972 5627973 Bsph_p169 Bsph_p170     FALSE 0.004 496.000 0.000 NA   NA
 5627973 5627974 Bsph_p170 Bsph_p171     FALSE 0.408 62.000 0.000 NA   NA
 5627974 5627975 Bsph_p171 Bsph_p172     FALSE 0.270 130.000 0.000 NA   NA
 5627975 5627976 Bsph_p172 Bsph_p173     FALSE 0.299 116.000 0.000 NA   NA
 5627976 5627977 Bsph_p173 Bsph_p174     TRUE 0.944 16.000 0.667 NA   NA
 5627977 5627978 Bsph_p174 Bsph_p175     FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 5627978 5627979 Bsph_p175 Bsph_p176     FALSE 0.009 313.000 0.000 NA   NA
 5627979 5627980 Bsph_p176 Bsph_p177     TRUE 0.988 -13.000 1.000 NA   NA
 5627980 5627981 Bsph_p177 Bsph_p178     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5627981 5627982 Bsph_p178 Bsph_p179     FALSE 0.476 48.000 0.000 NA   NA
 5627982 5627983 Bsph_p179 Bsph_p180     FALSE 0.296 99.000 0.000 NA   NA
 5627983 5627984 Bsph_p180 Bsph_p181     TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 5627984 5627985 Bsph_p181 Bsph_p182     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5627985 5627986 Bsph_p182 Bsph_p183     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5627986 5627987 Bsph_p183 Bsph_p184     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5627987 5627988 Bsph_p184 Bsph_p185     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5627988 5627989 Bsph_p185 Bsph_p186     FALSE 0.341 77.000 0.000 NA   NA
 5627989 5627990 Bsph_p186 Bsph_p187     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5627990 5627991 Bsph_p187 Bsph_p188   repX FALSE 0.011 291.000 0.000 NA   NA
 5627991 5627992 Bsph_p188 Bsph_p189 repX   FALSE 0.461 52.000 0.000 NA   NA