MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus anthracis str. A0465

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6053249 6053250 BAM_3064 BAM_3065     FALSE 0.042 276.000 0.000 NA   NA
 6053250 6053251 BAM_3065 BAM_3066     FALSE 0.262 203.000 0.000 1.000 N NA
 6053252 6053253 BAM_3067 BAM_3068     TRUE 0.888 11.000 0.500 NA   NA
 6053254 6053255 BAM_3069 BAM_3070     FALSE 0.290 107.000 0.000 NA   NA
 6053255 6053256 BAM_3070 BAM_3071     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053256 6053257 BAM_3071 BAM_3072     FALSE 0.280 90.000 0.000 NA   NA
 6053257 6053258 BAM_3072 BAM_3073     TRUE 0.777 96.000 0.000 NA Y NA
 6053258 6053259 BAM_3073 BAM_3074     FALSE 0.290 163.000 0.000 NA N NA
 6053259 6053260 BAM_3074 BAM_3075     TRUE 0.868 0.000 0.000 1.000 N NA
 6053260 6053261 BAM_3075 BAM_3076     TRUE 0.739 15.000 0.000 1.000 N NA
 6053262 6053263 BAM_3077 BAM_3078     TRUE 0.645 3.000 0.000 NA   NA
 6053264 6053265 BAM_3079 BAM_3080     FALSE 0.245 41.000 0.000 NA   NA
 6053265 6053266 BAM_3080 BAM_3081     TRUE 0.647 1.000 0.000 NA   NA
 6053267 6053268 BAM_3082 BAM_3083     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053268 6053269 BAM_3083 BAM_3084     FALSE 0.091 202.000 0.000 NA   NA
 6053271 6053272 BAM_3086 BAM_3087     TRUE 0.782 84.000 1.000 NA   NA
 6053273 6053274 BAM_3088 BAM_3089     FALSE 0.011 616.000 0.000 NA   NA
 6053274 6053275 BAM_3089 BAM_3090     FALSE 0.438 15.000 0.000 NA   NA
 6053275 6053276 BAM_3090 BAM_3091     TRUE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 6053276 6053277 BAM_3091 BAM_3092     FALSE 0.055 250.000 0.000 NA   NA
 6053277 6053278 BAM_3092 BAM_3093     FALSE 0.063 298.000 0.000 1.000   NA
 6053280 6053281 BAM_3095 BAM_3096     FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 6053281 6053282 BAM_3096 BAM_3097   adP2 FALSE 0.073 370.000 0.000 1.000 N NA
 6053282 6053283 BAM_3097 BAM_3098 adP2   FALSE 0.050 259.000 0.000 NA   NA
 6053283 6053284 BAM_3098 BAM_3099     FALSE 0.284 94.000 0.000 NA   NA
 6053284 6053285 BAM_3099 BAM_3100     FALSE 0.336 -19.000 0.000 NA   NA
 6053285 6053286 BAM_3100 BAM_3101     FALSE 0.324 22.000 0.000 NA   NA
 6053286 6053287 BAM_3101 BAM_3102     FALSE 0.399 16.000 0.000 NA   NA
 6053287 6053288 BAM_3102 BAM_3103     TRUE 0.888 -3.000 0.333 NA   NA
 6053288 6053289 BAM_3103 BAM_3104     FALSE 0.274 148.000 0.000 1.000   NA
 6053289 6053290 BAM_3104 BAM_3105     TRUE 0.804 39.000 0.333 0.024   NA
 6053290 6053291 BAM_3105 BAM_3106     TRUE 0.812 19.000 0.184 1.000 N NA
 6053293 6053294 BAM_3108 BAM_3109     FALSE 0.324 22.000 0.000 NA   NA
 6053294 6053295 BAM_3109 BAM_3110     FALSE 0.239 45.000 0.000 NA   NA
 6053297 6053298 BAM_3112 BAM_3113     FALSE 0.282 30.000 0.000 NA   NA
 6053298 6053299 BAM_3113 BAM_3114     FALSE 0.420 -12.000 0.000 NA   NA
 6053299 6053300 BAM_3114 BAM_3115     TRUE 0.918 -12.000 0.750 1.000 N NA
 6053302 6053303 BAM_3117 BAM_3118     FALSE 0.308 186.000 0.000 1.000 N NA
 6053303 6053304 BAM_3118 BAM_3119     TRUE 0.930 0.000 0.600 NA   NA
 6053304 6053305 BAM_3119 BAM_3120     TRUE 0.613 6.000 0.000 NA   NA
 6053305 6053306 BAM_3120 BAM_3121     FALSE 0.223 66.000 0.000 NA   NA
 6053306 6053307 BAM_3121 BAM_3122     FALSE 0.084 207.000 0.000 NA   NA
 6053307 6053308 BAM_3122 BAM_3123     TRUE 0.616 25.000 0.000 1.000 N NA
 6053308 6053309 BAM_3123 BAM_3124     TRUE 0.527 49.000 0.000 1.000 N NA
 6053309 6053310 BAM_3124 BAM_3125     FALSE 0.360 18.000 0.000 NA   NA
 6053313 6053314 BAM_3128 BAM_3129     FALSE 0.273 82.000 0.000 NA   NA
 6053317 6053318 BAM_3132 BAM_3133     TRUE 0.981 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 6053318 6053319 BAM_3133 BAM_3134     TRUE 0.714 35.000 0.571 NA   NA
 6053319 6053320 BAM_3134 BAM_3135     FALSE 0.292 100.000 0.000 NA   NA
 6053320 6053321 BAM_3135 BAM_3136     FALSE 0.229 129.000 0.000 NA   NA
 6053321 6053322 BAM_3136 BAM_3137     FALSE 0.131 214.000 0.000 1.000   NA
 6053322 6053323 BAM_3137 BAM_3138     TRUE 0.470 14.000 0.000 NA   NA
 6053323 6053324 BAM_3138 BAM_3139     FALSE 0.438 15.000 0.000 NA   NA
 6053327 6053328 BAM_3142 BAM_3143 lysP   FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 6053328 6053329 BAM_3143 BAM_3144     FALSE 0.265 34.000 0.000 NA   NA
 6053332 6053333 BAM_3147 BAM_3148     FALSE 0.364 -16.000 0.000 NA   NA
 6053333 6053334 BAM_3148 BAM_3149     FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 6053336 6053337 BAM_3151 BAM_3152 lepB   TRUE 0.580 83.000 0.000 1.000 N NA
 6053339 6053340 BAM_3154 BAM_3155   pcp FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 6053340 6053341 BAM_3155 BAM_3156 pcp   FALSE 0.420 -12.000 0.000 NA   NA
 6053341 6053342 BAM_3156 BAM_3157     FALSE 0.056 248.000 0.000 NA   NA
 6053342 6053343 BAM_3157 BAM_3158     FALSE 0.251 121.000 0.000 NA   NA
 6053343 6053344 BAM_3158 BAM_3159     TRUE 0.943 2.000 0.940 NA   NA
 6053344 6053345 BAM_3159 BAM_3160     FALSE 0.438 15.000 0.000 NA   NA
 6053345 6053346 BAM_3160 BAM_3161     FALSE 0.239 45.000 0.000 NA   NA
 6053346 6053347 BAM_3161 BAM_3162     FALSE 0.321 -21.000 0.000 NA   NA
 6053347 6053348 BAM_3162 BAM_3163     FALSE 0.464 -9.000 0.000 NA   NA
 6053348 6053349 BAM_3163 BAM_3164     TRUE 0.813 15.000 0.065 1.000 N NA
 6053349 6053350 BAM_3164 BAM_3165   sipU FALSE 0.292 259.000 0.167 1.000 N NA
 6053350 6053351 BAM_3165 BAM_3166 sipU   TRUE 0.662 24.000 0.013 1.000 N NA
 6053351 6053352 BAM_3166 BAM_3167     FALSE 0.031 315.000 0.000 NA   NA
 6053352 6053353 BAM_3167 BAM_3168     FALSE 0.087 204.000 0.000 NA   NA
 6053355 6053356 BAM_3170 BAM_3171     FALSE 0.161 153.000 0.000 NA   NA
 6053356 6053357 BAM_3171 BAM_3172     FALSE 0.028 331.000 0.000 NA   NA
 6053359 6053360 BAM_3174 BAM_3175     FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 6053360 6053361 BAM_3175 BAM_3176     TRUE 0.641 4.000 0.000 NA   NA
 6053361 6053362 BAM_3176 BAM_3177     FALSE 0.234 161.000 0.000 1.000   NA
 6053362 6053363 BAM_3177 BAM_3178     FALSE 0.141 162.000 0.000 NA   NA
 6053366 6053367 BAM_3181 BAM_3182     FALSE 0.382 -15.000 0.000 NA   NA
 6053368 6053369 BAM_3183 BAM_3184     TRUE 0.800 -10.000 0.316 NA   NA
 6053369 6053370 BAM_3184 BAM_3185   cotF FALSE 0.025 343.000 0.000 NA   NA
 6053370 6053371 BAM_3185 BAM_3186 cotF   FALSE 0.172 148.000 0.000 NA   NA
 6053372 6053373 BAM_3187 BAM_3188     TRUE 0.672 92.000 0.333 NA   NA
 6053374 6053375 BAM_3189 BAM_3190     FALSE 0.238 73.000 0.000 NA   NA
 6053375 6053376 BAM_3190 BAM_3191     FALSE 0.071 221.000 0.000 NA   NA
 6053376 6053377 BAM_3191 BAM_3192     FALSE 0.100 195.000 0.000 NA   NA
 6053379 6053380 BAM_3194 BAM_3195   sasP2 FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 6053384 6053385 BAM_3199 BAM_3200 aspA3 ansA2 TRUE 0.764 54.000 0.000 1.000 Y NA
 6053386 6053387 BAM_3201 BAM_3202 ansR   FALSE 0.031 314.000 0.000 NA   NA
 6053388 6053389 BAM_3203 BAM_3204     FALSE 0.219 167.000 0.000 1.000   NA
 6053389 6053390 BAM_3204 BAM_3205   brnQ5 FALSE 0.330 274.000 0.000 1.000 Y NA
 6053390 6053391 BAM_3205 BAM_3206 brnQ5 proC2 TRUE 0.536 198.000 0.000 1.000 Y NA
 6053391 6053392 BAM_3206 BAM_3207 proC2   FALSE 0.031 316.000 0.000 NA   NA
 6053392 6053393 BAM_3207 BAM_3208     FALSE 0.137 165.000 0.000 NA   NA
 6053393 6053394 BAM_3208 BAM_3209     FALSE 0.289 108.000 0.000 NA   NA
 6053394 6053395 BAM_3209 BAM_3210   gerAC FALSE 0.068 225.000 0.000 NA   NA
 6053395 6053396 BAM_3210 BAM_3211 gerAC   FALSE 0.205 -1043.000 0.000 NA   NA
 6053396 6053397 BAM_3211 BAM_3212   gerAB TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053397 6053398 BAM_3212 BAM_3213 gerAB gerAA FALSE 0.296 27.000 0.000 NA   NA
 6053398 6053399 BAM_3213 BAM_3214 gerAA   FALSE 0.261 78.000 0.000 NA   NA
 6053399 6053400 BAM_3214 BAM_3215     FALSE 0.176 147.000 0.000 NA   NA
 6053400 6053401 BAM_3215 BAM_3216     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053401 6053402 BAM_3216 BAM_3217     FALSE 0.012 545.000 0.000 NA   NA
 6053402 6053403 BAM_3217 BAM_3218     TRUE 0.630 5.000 0.000 NA   NA
 6053403 6053404 BAM_3218 BAM_3219     FALSE 0.228 54.000 0.000 NA   NA
 6053404 6053405 BAM_3219 BAM_3220   glsA2 FALSE 0.014 488.000 0.000 NA   NA
 6053405 6053406 BAM_3220 BAM_3221 glsA2   TRUE 0.777 125.000 0.000 1.000 Y NA
 6053409 6053410 BAM_3224 BAM_3225     TRUE 0.639 24.000 0.200 NA   NA
 6053411 6053412 BAM_3226 BAM_3227     FALSE 0.071 221.000 0.000 NA   NA
 6053412 6053413 BAM_3227 BAM_3228     FALSE 0.036 686.000 0.000 1.000 N NA
 6053413 6053414 BAM_3228 BAM_3229     FALSE 0.405 114.000 0.000 1.000   NA
 6053415 6053416 BAM_3230 BAM_3231     TRUE 0.815 174.000 0.000 0.003 Y NA
 6053416 6053417 BAM_3231 BAM_3232     TRUE 0.843 -3.000 0.167 NA   NA
 6053417 6053418 BAM_3232 BAM_3233     TRUE 0.470 14.000 0.000 NA   NA
 6053419 6053420 BAM_3234 BAM_3235     FALSE 0.014 491.000 0.000 NA   NA
 6053420 6053421 BAM_3235 BAM_3236     FALSE 0.015 443.000 0.000 NA   NA
 6053421 6053422 BAM_3236 BAM_3237     FALSE 0.033 306.000 0.000 NA   NA
 6053422 6053423 BAM_3237 BAM_3238     FALSE 0.258 36.000 0.000 NA   NA
 6053427 6053428 BAM_3242 BAM_3243     FALSE 0.293 104.000 0.000 NA   NA
 6053428 6053429 BAM_3243 BAM_3244     TRUE 0.580 113.000 0.000 1.000 N NA
 6053429 6053430 BAM_3244 BAM_3245     FALSE 0.366 165.000 0.000 1.000 N NA
 6053430 6053431 BAM_3245 BAM_3246     FALSE 0.458 81.000 0.070 NA   NA
 6053431 6053432 BAM_3246 BAM_3247     TRUE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 6053432 6053433 BAM_3247 BAM_3248     FALSE 0.010 643.000 0.000 NA   NA
 6053435 6053436 BAM_3250 BAM_3251     FALSE 0.098 196.000 0.000 NA   NA
 6053438 6053439 BAM_3253 BAM_3254 mntA   TRUE 0.882 18.000 0.031 1.000 Y NA
 6053439 6053440 BAM_3254 BAM_3255     TRUE 0.955 -3.000 0.042 1.000 Y NA
 6053440 6053441 BAM_3255 BAM_3256     FALSE 0.021 373.000 0.000 NA   NA
 6053441 6053442 BAM_3256 BAM_3257     FALSE 0.227 56.000 0.000 NA   NA
 6053444 6053445 BAM_3259 BAM_3260   arsC FALSE 0.159 154.000 0.000 NA   NA
 6053445 6053446 BAM_3260 BAM_3261 arsC acr3 TRUE 0.885 26.000 0.000 0.001 N NA
 6053446 6053447 BAM_3261 BAM_3262 acr3   TRUE 0.719 19.000 0.032 1.000 N NA
 6053447 6053448 BAM_3262 BAM_3263   arsR TRUE 0.645 60.000 0.094 1.000 N NA
 6053448 6053449 BAM_3263 BAM_3264 arsR   FALSE 0.015 447.000 0.000 NA   NA
 6053449 6053450 BAM_3264 BAM_3265     TRUE 0.502 13.000 0.000 NA   NA
 6053450 6053451 BAM_3265 BAM_3266   hscC TRUE 0.767 0.000 0.000 1.000   NA
 6053451 6053452 BAM_3266 BAM_3267 hscC   FALSE 0.013 508.000 0.000 NA   NA
 6053452 6053453 BAM_3267 BAM_3268     FALSE 0.034 305.000 0.000 NA   NA
 6053455 6053456 BAM_3270 BAM_3271     FALSE 0.047 266.000 0.000 NA   NA
 6053456 6053457 BAM_3271 BAM_3272     TRUE 0.470 14.000 0.000 NA   NA
 6053458 6053459 BAM_3273 BAM_3274     FALSE 0.211 136.000 0.000 NA   NA
 6053460 6053461 BAM_3275 BAM_3276     FALSE 0.200 140.000 0.000 NA   NA
 6053461 6053462 BAM_3276 BAM_3277     FALSE 0.048 264.000 0.000 NA   NA
 6053462 6053463 BAM_3277 BAM_3278     TRUE 0.676 -16.000 0.000 1.000 N NA
 6053463 6053464 BAM_3278 BAM_3279     FALSE 0.058 416.000 0.000 1.000 N NA
 6053464 6053465 BAM_3279 BAM_3280     FALSE 0.031 316.000 0.000 NA   NA
 6053466 6053467 BAM_3281 BAM_3282     FALSE 0.216 -99.000 0.000 NA   NA
 6053468 6053469 BAM_3283 BAM_3284     FALSE 0.073 218.000 0.000 NA   NA
 6053469 6053470 BAM_3284 BAM_3285     FALSE 0.153 325.000 0.429 NA   NA
 6053470 6053471 BAM_3285 BAM_3286   cypD FALSE 0.131 283.000 0.000 1.000 N NA
 6053471 6053472 BAM_3286 BAM_3287 cypD   FALSE 0.245 41.000 0.000 NA   NA
 6053472 6053473 BAM_3287 BAM_3288     FALSE 0.020 375.000 0.000 NA   NA
 6053475 6053476 BAM_3290 BAM_3291     FALSE 0.024 346.000 0.000 NA   NA
 6053476 6053477 BAM_3291 BAM_3292     TRUE 0.645 3.000 0.000 NA   NA
 6053478 6053479 BAM_3293 BAM_3294     TRUE 0.977 -3.000 0.442 1.000 Y NA
 6053480 6053481 BAM_3295 BAM_3296     FALSE 0.029 325.000 0.000 NA   NA
 6053481 6053482 BAM_3296 BAM_3297     FALSE 0.010 961.000 0.000 NA   NA
 6053484 6053485 BAM_3299 BAM_3300     FALSE 0.023 353.000 0.000 NA   NA
 6053485 6053486 BAM_3300 BAM_3301     FALSE 0.227 55.000 0.000 NA   NA
 6053486 6053487 BAM_3301 BAM_3302     FALSE 0.096 197.000 0.000 NA   NA
 6053487 6053488 BAM_3302 BAM_3303     TRUE 0.530 -6.000 0.000 NA   NA
 6053488 6053489 BAM_3303 BAM_3304     FALSE 0.011 634.000 0.000 NA   NA
 6053489 6053490 BAM_3304 BAM_3305     TRUE 0.613 6.000 0.000 NA   NA
 6053490 6053491 BAM_3305 BAM_3306     FALSE 0.025 341.000 0.000 NA   NA
 6053491 6053492 BAM_3306 BAM_3307     TRUE 0.831 -3.000 0.138 NA   NA
 6053492 6053493 BAM_3307 BAM_3308     TRUE 0.905 -7.000 0.629 1.000   NA
 6053493 6053494 BAM_3308 BAM_3309     TRUE 0.874 -3.000 0.143 1.000   NA
 6053494 6053495 BAM_3309 BAM_3310     FALSE 0.256 77.000 0.000 NA   NA
 6053495 6053496 BAM_3310 BAM_3311     FALSE 0.444 -10.000 0.000 NA   NA
 6053496 6053497 BAM_3311 BAM_3312     FALSE 0.039 432.000 0.000 NA N NA
 6053498 6053499 BAM_3313 BAM_3314     FALSE 0.167 150.000 0.000 NA   NA
 6053500 6053501 BAM_3315 BAM_3316     TRUE 0.923 0.000 0.500 NA   NA
 6053502 6053503 BAM_3317 BAM_3318     FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 6053504 6053505 BAM_3319 BAM_3320     TRUE 0.985 2.000 0.750 1.000 Y NA
 6053505 6053506 BAM_3320 BAM_3321     FALSE 0.272 81.000 0.000 NA   NA
 6053507 6053508 BAM_3322 BAM_3323     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 6053508 6053509 BAM_3323 BAM_3324     FALSE 0.238 -42.000 0.000 NA   NA
 6053509 6053510 BAM_3324 BAM_3325   paiB1 FALSE 0.318 23.000 0.000 NA   NA
 6053511 6053512 BAM_3326 BAM_3327     FALSE 0.015 449.000 0.000 NA   NA
 6053512 6053513 BAM_3327 BAM_3328     FALSE 0.251 38.000 0.000 NA   NA
 6053513 6053514 BAM_3328 BAM_3329     TRUE 0.647 2.000 0.000 NA   NA
 6053514 6053515 BAM_3329 BAM_3330     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA Y NA
 6053519 6053520 BAM_3334 BAM_3335     FALSE 0.050 260.000 0.000 NA   NA
 6053520 6053521 BAM_3335 BAM_3336     TRUE 0.641 4.000 0.000 NA   NA
 6053521 6053522 BAM_3336 BAM_3337     FALSE 0.012 568.000 0.000 NA   NA
 6053522 6053523 BAM_3337 BAM_3338     FALSE 0.014 471.000 0.000 NA   NA
 6053523 6053524 BAM_3338 BAM_3339     FALSE 0.246 75.000 0.000 NA   NA
 6053524 6053525 BAM_3339 BAM_3340     TRUE 0.821 18.000 0.455 1.000   NA
 6053525 6053526 BAM_3340 BAM_3341     FALSE 0.400 -13.000 0.000 NA   NA
 6053526 6053527 BAM_3341 BAM_3342     FALSE 0.236 48.000 0.000 NA   NA
 6053528 6053529 BAM_3343 BAM_3344     FALSE 0.106 237.000 0.000 1.000   NA
 6053529 6053530 BAM_3344 BAM_3345     TRUE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 6053531 6053532 BAM_3346 BAM_3347     FALSE 0.029 326.000 0.000 NA   NA
 6053533 6053534 BAM_3348 BAM_3349     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053534 6053535 BAM_3349 BAM_3350     FALSE 0.240 44.000 0.000 NA   NA
 6053536 6053537 BAM_3351 BAM_3352     FALSE 0.010 713.000 0.000 NA   NA
 6053538 6053539 BAM_3353 BAM_3354     FALSE 0.019 387.000 0.000 NA   NA
 6053540 6053541 BAM_3355 BAM_3356     FALSE 0.010 697.000 0.000 NA   NA
 6053541 6053542 BAM_3356 BAM_3357     FALSE 0.044 273.000 0.000 NA   NA
 6053542 6053543 BAM_3357 BAM_3358     FALSE 0.044 271.000 0.000 NA   NA
 6053543 6053544 BAM_3358 BAM_3359     FALSE 0.098 196.000 0.000 NA   NA
 6053544 6053545 BAM_3359 BAM_3360     FALSE 0.284 110.000 0.000 NA   NA
 6053545 6053546 BAM_3360 BAM_3361     FALSE 0.077 213.000 0.000 NA   NA
 6053548 6053549 BAM_3363 BAM_3364     FALSE 0.289 108.000 0.000 NA   NA
 6053549 6053550 BAM_3364 BAM_3365     FALSE 0.057 355.000 0.000 NA N NA
 6053550 6053551 BAM_3365 BAM_3366   sdaAA1 FALSE 0.247 294.000 0.000 NA Y NA
 6053551 6053552 BAM_3366 BAM_3367 sdaAA1 sdaAB1 FALSE 0.318 23.000 0.000 NA   NA
 6053552 6053553 BAM_3367 BAM_3368 sdaAB1   FALSE 0.364 -16.000 0.000 NA   NA
 6053553 6053554 BAM_3368 BAM_3369     FALSE 0.010 710.000 0.000 NA   NA
 6053554 6053555 BAM_3369 BAM_3370     FALSE 0.093 200.000 0.000 NA   NA
 6053555 6053556 BAM_3370 BAM_3371     FALSE 0.273 82.000 0.000 NA   NA
 6053556 6053557 BAM_3371 BAM_3372   hypF TRUE 0.568 79.000 0.000 1.000 N NA
 6053557 6053558 BAM_3372 BAM_3373 hypF   TRUE 0.828 30.000 0.011 1.000 Y NA
 6053558 6053559 BAM_3373 BAM_3374     FALSE 0.275 83.000 0.000 NA   NA
 6053559 6053560 BAM_3374 BAM_3375     FALSE 0.296 27.000 0.000 NA   NA
 6053560 6053561 BAM_3375 BAM_3376     FALSE 0.087 204.000 0.000 NA   NA
 6053563 6053564 BAM_3378 BAM_3379     FALSE 0.187 144.000 0.000 NA   NA
 6053564 6053565 BAM_3379 BAM_3380     TRUE 0.746 14.000 0.143 NA   NA
 6053565 6053566 BAM_3380 BAM_3381   serC TRUE 0.958 13.000 0.264 1.000 Y NA
 6053566 6053567 BAM_3381 BAM_3382 serC   FALSE 0.038 289.000 0.000 NA   NA
 6053567 6053568 BAM_3382 BAM_3383     FALSE 0.349 -18.000 0.000 NA   NA
 6053568 6053569 BAM_3383 BAM_3384     TRUE 0.883 -10.000 1.000 NA   NA
 6053569 6053570 BAM_3384 BAM_3385     FALSE 0.033 306.000 0.000 NA   NA
 6053570 6053571 BAM_3385 BAM_3386     FALSE 0.280 90.000 0.000 NA   NA
 6053571 6053572 BAM_3386 BAM_3387     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 6053572 6053573 BAM_3387 BAM_3388     FALSE 0.040 282.000 0.000 NA   NA
 6053575 6053576 BAM_3390 BAM_3391     FALSE 0.269 80.000 0.000 NA   NA
 6053576 6053577 BAM_3391 BAM_3392     FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 6053577 6053578 BAM_3392 BAM_3393     FALSE 0.080 211.000 0.000 NA   NA
 6053584 6053585 BAM_3399 BAM_3400     TRUE 0.596 -16.000 0.091 NA   NA
 6053585 6053586 BAM_3400 BAM_3401     FALSE 0.196 141.000 0.000 NA   NA
 6053587 6053588 BAM_3402 BAM_3403     TRUE 0.812 16.000 0.200 NA N NA
 6053588 6053589 BAM_3403 BAM_3404     TRUE 0.746 101.000 0.250 NA N NA
 6053590 6053591 BAM_3405 BAM_3406     FALSE 0.117 181.000 0.000 NA   NA
 6053591 6053592 BAM_3406 BAM_3407     TRUE 0.890 -7.000 0.714 NA   NA
 6053592 6053593 BAM_3407 BAM_3408     TRUE 0.869 -3.000 0.250 NA   NA
 6053594 6053595 BAM_3409 BAM_3410     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 6053596 6053597 BAM_3411 BAM_3412     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053597 6053598 BAM_3412 BAM_3413     TRUE 0.739 15.000 0.000 1.000 N NA
 6053598 6053599 BAM_3413 BAM_3414   alo FALSE 0.049 332.000 0.000 1.000   NA
 6053601 6053602 BAM_3416 BAM_3417     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053602 6053603 BAM_3417 BAM_3418     FALSE 0.451 24.000 0.000 1.000   NA
 6053603 6053604 BAM_3418 BAM_3419     FALSE 0.054 252.000 0.000 NA   NA
 6053606 6053607 BAM_3421 BAM_3422     FALSE 0.291 28.000 0.000 NA   NA
 6053607 6053608 BAM_3422 BAM_3423     FALSE 0.111 184.000 0.000 NA   NA
 6053608 6053609 BAM_3423 BAM_3424     TRUE 0.591 66.000 0.317 NA   NA
 6053609 6053610 BAM_3424 BAM_3425     TRUE 0.816 -21.000 0.605 1.000   NA
 6053610 6053611 BAM_3425 BAM_3426     TRUE 0.472 23.000 0.047 NA   NA
 6053611 6053612 BAM_3426 BAM_3427     FALSE 0.226 57.000 0.000 NA   NA
 6053612 6053613 BAM_3427 BAM_3428     FALSE 0.026 337.000 0.000 NA   NA
 6053613 6053614 BAM_3428 BAM_3429     FALSE 0.026 339.000 0.000 NA   NA
 6053616 6053617 BAM_3431 BAM_3432     FALSE 0.016 428.000 0.000 NA   NA
 6053617 6053618 BAM_3432 BAM_3433     FALSE 0.091 202.000 0.000 NA   NA
 6053618 6053619 BAM_3433 BAM_3434     TRUE 0.546 11.000 0.000 NA   NA
 6053619 6053620 BAM_3434 BAM_3435     FALSE 0.025 341.000 0.000 NA   NA
 6053620 6053621 BAM_3435 BAM_3436     FALSE 0.019 620.000 0.036 NA   NA
 6053622 6053623 BAM_3437 BAM_3438 hisS1   FALSE 0.028 327.000 0.000 NA   NA
 6053623 6053624 BAM_3438 BAM_3439     FALSE 0.047 266.000 0.000 NA   NA
 6053626 6053627 BAM_3441 BAM_3442     FALSE 0.159 154.000 0.000 NA   NA
 6053628 6053629 BAM_3443 BAM_3444 pykA1   FALSE 0.283 93.000 0.000 NA   NA
 6053629 6053630 BAM_3444 BAM_3445     FALSE 0.293 103.000 0.000 NA   NA
 6053630 6053631 BAM_3445 BAM_3446     FALSE 0.275 113.000 0.000 NA   NA
 6053631 6053632 BAM_3446 BAM_3447     FALSE 0.226 57.000 0.000 NA   NA
 6053632 6053633 BAM_3447 BAM_3448     TRUE 0.868 -7.000 0.500 NA   NA
 6053633 6053634 BAM_3448 BAM_3449     TRUE 0.490 87.000 0.087 NA   NA
 6053635 6053636 BAM_3450 BAM_3451     TRUE 0.728 -12.000 0.182 NA   NA
 6053637 6053638 BAM_3452 BAM_3453     FALSE 0.124 174.000 0.000 NA   NA
 6053640 6053641 BAM_3455 BAM_3456     FALSE 0.118 180.000 0.000 NA   NA
 6053642 6053643 BAM_3457 BAM_3458     FALSE 0.360 18.000 0.000 NA   NA
 6053644 6053645 BAM_3459 BAM_3460     FALSE 0.100 195.000 0.000 NA   NA
 6053645 6053646 BAM_3460 BAM_3461     FALSE 0.422 62.000 0.000 NA N NA
 6053646 6053647 BAM_3461 BAM_3462     TRUE 0.738 123.000 0.000 NA Y NA
 6053647 6053648 BAM_3462 BAM_3463   maa FALSE 0.226 57.000 0.000 NA   NA
 6053648 6053649 BAM_3463 BAM_3464 maa   FALSE 0.033 307.000 0.000 NA   NA
 6053649 6053650 BAM_3464 BAM_3465     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053650 6053651 BAM_3465 BAM_3466     TRUE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 6053651 6053652 BAM_3466 BAM_3467     FALSE 0.256 77.000 0.000 NA   NA
 6053654 6053655 BAM_3469 BAM_3470     FALSE 0.223 64.000 0.000 NA   NA
 6053656 6053657 BAM_3471 BAM_3472     FALSE 0.042 278.000 0.000 NA   NA
 6053658 6053659 BAM_3473 BAM_3474     FALSE 0.245 41.000 0.000 NA   NA
 6053662 6053663 BAM_3477 BAM_3478     FALSE 0.256 77.000 0.000 NA   NA
 6053664 6053665 BAM_3479 BAM_3480     FALSE 0.151 200.000 0.034 NA   NA
 6053665 6053666 BAM_3480 BAM_3481     TRUE 0.779 53.000 1.000 1.000   NA
 6053666 6053667 BAM_3481 BAM_3482     TRUE 0.568 120.000 0.100 1.000   NA
 6053671 6053672 BAM_3486 BAM_3487   gntK TRUE 0.783 122.000 0.000 1.000 Y NA
 6053672 6053673 BAM_3487 BAM_3488 gntK gntP2 TRUE 0.763 56.000 0.000 1.000 Y NA
 6053673 6053674 BAM_3488 BAM_3489 gntP2   FALSE 0.173 390.000 0.000 1.000 Y NA
 6053674 6053675 BAM_3489 BAM_3490     TRUE 0.766 52.000 0.000 1.000 Y NA
 6053675 6053676 BAM_3490 BAM_3491   tkt1 TRUE 0.819 105.000 0.000 1.000 Y NA
 6053676 6053677 BAM_3491 BAM_3492 tkt1 zwf TRUE 0.800 40.000 0.009 1.000 Y NA
 6053677 6053678 BAM_3492 BAM_3493 zwf   FALSE 0.229 351.000 0.000 0.001   NA
 6053678 6053679 BAM_3493 BAM_3494     FALSE 0.414 90.000 0.000 1.000   NA
 6053679 6053680 BAM_3494 BAM_3495     TRUE 0.907 14.000 0.000 1.000 Y NA
 6053680 6053681 BAM_3495 BAM_3496     FALSE 0.238 126.000 0.000 NA   NA
 6053683 6053684 BAM_3498 BAM_3499     FALSE 0.244 42.000 0.000 NA   NA
 6053684 6053685 BAM_3499 BAM_3500     FALSE 0.040 588.000 0.000 1.000 N NA
 6053685 6053686 BAM_3500 BAM_3501     FALSE 0.248 156.000 0.000 1.000   NA
 6053686 6053687 BAM_3501 BAM_3502     FALSE 0.044 343.000 0.000 1.000   NA
 6053687 6053688 BAM_3502 BAM_3503     FALSE 0.020 383.000 0.000 NA   NA
 6053688 6053689 BAM_3503 BAM_3504     FALSE 0.017 412.000 0.000 NA   NA
 6053689 6053690 BAM_3504 BAM_3505     TRUE 0.521 17.000 0.000 1.000   NA
 6053690 6053691 BAM_3505 BAM_3506     FALSE 0.021 580.000 0.000 1.000   NA
 6053691 6053692 BAM_3506 BAM_3507     FALSE 0.242 43.000 0.000 NA   NA
 6053694 6053695 BAM_3509 BAM_3510     FALSE 0.009 1153.000 0.000 NA   NA
 6053695 6053696 BAM_3510 BAM_3511     FALSE 0.223 131.000 0.000 NA   NA
 6053696 6053697 BAM_3511 BAM_3512     FALSE 0.138 164.000 0.000 NA   NA
 6053697 6053698 BAM_3512 BAM_3513     FALSE 0.284 110.000 0.000 NA   NA
 6053698 6053699 BAM_3513 BAM_3515     TRUE 0.528 12.000 0.000 NA   NA
 6053701 6053702 BAM_3517 BAM_3518     FALSE 0.400 33.000 0.000 1.000   NA
 6053702 6053703 BAM_3518 BAM_3519   cfa FALSE 0.125 218.000 0.000 1.000   NA
 6053703 6053704 BAM_3519 BAM_3520 cfa   FALSE 0.071 323.000 0.000 NA N NA
 6053704 6053705 BAM_3520 BAM_3521     TRUE 0.501 191.000 0.000 NA Y NA
 6053706 6053707 BAM_3522 BAM_3523     FALSE 0.265 79.000 0.000 NA   NA
 6053708 6053709 BAM_3524 BAM_3525     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 6053709 6053710 BAM_3525 BAM_3526     FALSE 0.291 28.000 0.000 NA   NA
 6053712 6053713 BAM_3528 BAM_3529     TRUE 0.670 12.000 0.000 1.000   NA
 6053713 6053714 BAM_3529 BAM_3530     TRUE 0.651 -3.000 0.000 0.083   NA
 6053714 6053715 BAM_3530 BAM_3531     TRUE 0.812 -3.000 0.000 0.083 N NA
 6053715 6053716 BAM_3531 BAM_3532     FALSE 0.385 146.000 0.000 0.083 N NA
 6053716 6053717 BAM_3532 BAM_3533     FALSE 0.214 135.000 0.000 NA   NA
 6053717 6053718 BAM_3533 BAM_3534     FALSE 0.258 36.000 0.000 NA   NA
 6053720 6053721 BAM_3536 BAM_3537     FALSE 0.420 -12.000 0.000 NA   NA
 6053723 6053724 BAM_3539 BAM_3540     FALSE 0.064 232.000 0.000 NA   NA
 6053724 6053725 BAM_3540 BAM_3541     FALSE 0.237 47.000 0.000 NA   NA
 6053725 6053726 BAM_3541 BAM_3542     FALSE 0.120 178.000 0.000 NA   NA
 6053726 6053727 BAM_3542 BAM_3543   sigI TRUE 0.878 -7.000 0.588 NA   NA
 6053727 6053728 BAM_3543 BAM_3544 sigI   FALSE 0.012 570.000 0.000 NA   NA
 6053728 6053729 BAM_3544 BAM_3545     FALSE 0.242 43.000 0.000 NA   NA
 6053729 6053730 BAM_3545 BAM_3546     FALSE 0.025 343.000 0.000 NA   NA
 6053732 6053733 BAM_3548 BAM_3549     FALSE 0.176 147.000 0.000 NA   NA
 6053735 6053736 BAM_3551 BAM_3552     FALSE 0.046 269.000 0.000 NA   NA
 6053736 6053737 BAM_3552 BAM_3553     TRUE 0.961 1.000 0.938 NA N NA
 6053737 6053738 BAM_3553 BAM_3554     FALSE 0.360 155.000 0.125 NA   NA
 6053738 6053739 BAM_3554 BAM_3555     TRUE 0.710 76.000 0.600 NA   NA
 6053739 6053740 BAM_3555 BAM_3556     FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 6053740 6053741 BAM_3556 BAM_3557     TRUE 0.502 13.000 0.000 NA   NA
 6053742 6053743 BAM_3558 BAM_3559     FALSE 0.049 261.000 0.000 NA   NA
 6053744 6053745 BAM_3560 BAM_3561 bla2   FALSE 0.317 139.000 0.000 1.000   NA
 6053745 6053746 BAM_3561 BAM_3562     FALSE 0.261 35.000 0.000 NA   NA
 6053749 6053750 BAM_3565 BAM_3566     FALSE 0.281 111.000 0.000 NA   NA
 6053751 6053752 BAM_3567 BAM_3568     FALSE 0.042 278.000 0.000 NA   NA
 6053752 6053753 BAM_3568 BAM_3569     FALSE 0.127 171.000 0.000 NA   NA
 6053753 6053754 BAM_3569 BAM_3570     TRUE 0.470 14.000 0.000 NA   NA
 6053755 6053756 BAM_3571 BAM_3572     TRUE 0.889 14.000 0.931 NA   NA
 6053756 6053757 BAM_3572 BAM_3573     FALSE 0.293 105.000 0.000 NA   NA
 6053757 6053758 BAM_3573 BAM_3574     FALSE 0.360 18.000 0.000 NA   NA
 6053761 6053762 BAM_3577 BAM_3578     FALSE 0.045 630.000 0.000 0.062 N NA
 6053764 6053765 BAM_3580 BAM_3581     FALSE 0.141 162.000 0.000 NA   NA
 6053765 6053766 BAM_3581 BAM_3582     FALSE 0.226 58.000 0.000 NA   NA
 6053769 6053770 BAM_2534 BAM_2535   gpm FALSE 0.391 168.000 0.009 1.000 N NA
 6053772 6053773 BAM_2537 BAM_2538     FALSE 0.275 113.000 0.000 NA   NA
 6053773 6053774 BAM_2538 BAM_2539     FALSE 0.256 77.000 0.000 NA   NA
 6053775 6053776 BAM_2540 BAM_2541     FALSE 0.021 373.000 0.000 NA   NA
 6053779 6053780 BAM_2544 BAM_2545   pepD FALSE 0.187 144.000 0.000 NA   NA
 6053781 6053782 BAM_2546 BAM_2547     FALSE 0.028 329.000 0.000 NA   NA
 6053783 6053784 BAM_2548 BAM_2549     FALSE 0.214 222.000 0.000 1.000 N NA
 6053784 6053785 BAM_2549 BAM_2550     FALSE 0.444 -10.000 0.000 NA   NA
 6053787 6053788 BAM_2552 BAM_2553     FALSE 0.256 77.000 0.000 NA   NA
 6053788 6053789 BAM_2553 BAM_2554   bla1 FALSE 0.096 327.000 0.000 1.000 N NA
 6053792 6053793 BAM_2557 BAM_2558 csbX   FALSE 0.233 -46.000 0.000 NA   NA
 6053794 6053795 BAM_2559 BAM_2560     FALSE 0.428 100.000 0.000 1.000   NA
 6053795 6053796 BAM_2560 BAM_2561   mmsA2 TRUE 0.762 39.000 0.286 1.000 N NA
 6053796 6053797 BAM_2561 BAM_2562 mmsA2   FALSE 0.227 -49.000 0.000 NA   NA
 6053797 6053798 BAM_2562 BAM_2563     FALSE 0.286 29.000 0.000 NA   NA
 6053798 6053799 BAM_2563 BAM_2564     TRUE 0.756 123.000 0.277 1.000 N NA
 6053799 6053800 BAM_2564 BAM_2565   fba1 TRUE 0.765 129.000 0.000 1.000 Y NA
 6053800 6053801 BAM_2565 BAM_2566 fba1   FALSE 0.292 106.000 0.000 NA   NA
 6053801 6053802 BAM_2566 BAM_2567     FALSE 0.277 85.000 0.000 NA   NA
 6053804 6053805 BAM_2569 BAM_2570     FALSE 0.033 307.000 0.000 NA   NA
 6053806 6053807 BAM_2571 BAM_2572     TRUE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 6053808 6053809 BAM_2573 BAM_2574     TRUE 0.613 6.000 0.000 NA   NA
 6053813 6053814 BAM_2578 BAM_2579     FALSE 0.034 305.000 0.000 NA   NA
 6053814 6053815 BAM_2579 BAM_2580     FALSE 0.229 129.000 0.000 NA   NA
 6053815 6053816 BAM_2580 BAM_2581     FALSE 0.013 531.000 0.000 NA   NA
 6053817 6053818 BAM_2582 BAM_2583     FALSE 0.018 394.000 0.000 NA   NA
 6053819 6053820 BAM_2584 BAM_2585     FALSE 0.053 445.000 0.000 1.000 N NA
 6053820 6053821 BAM_2585 BAM_2586     FALSE 0.184 145.000 0.000 NA   NA
 6053823 6053824 BAM_2588 BAM_2589     TRUE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 6053824 6053825 BAM_2589 BAM_2590     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 6053825 6053826 BAM_2590 BAM_2591     FALSE 0.281 111.000 0.000 NA   NA
 6053826 6053827 BAM_2591 BAM_2592     FALSE 0.081 210.000 0.000 NA   NA
 6053827 6053828 BAM_2592 BAM_2593     FALSE 0.057 245.000 0.000 NA   NA
 6053828 6053829 BAM_2593 BAM_2594     TRUE 0.956 -3.000 0.125 NA Y NA
 6053829 6053830 BAM_2594 BAM_2596     TRUE 0.807 25.000 0.429 NA N NA
 6053831 6053832 BAM_2595 BAM_2597     TRUE 0.593 7.000 0.000 NA   NA
 6053833 6053834 BAM_2598 BAM_2599     FALSE 0.074 217.000 0.000 NA   NA
 6053834 6053835 BAM_2599 BAM_2600     TRUE 0.879 16.000 0.000 1.000 Y NA
 6053835 6053836 BAM_2600 BAM_2601     FALSE 0.296 27.000 0.000 NA   NA
 6053836 6053837 BAM_2601 BAM_2602   mvaB TRUE 0.534 22.000 0.081 NA   NA
 6053837 6053838 BAM_2602 BAM_2603 mvaB   TRUE 0.891 5.000 0.070 0.081 N NA
 6053838 6053839 BAM_2603 BAM_2604     TRUE 0.981 3.000 0.452 1.000 Y NA
 6053839 6053840 BAM_2604 BAM_2605     TRUE 0.833 50.000 0.093 1.000 Y NA
 6053840 6053841 BAM_2605 BAM_2606     FALSE 0.221 170.000 0.047 NA   NA
 6053841 6053842 BAM_2606 BAM_2607     FALSE 0.251 121.000 0.000 NA   NA
 6053842 6053843 BAM_2607 BAM_2608     FALSE 0.436 49.000 0.000 NA N NA
 6053843 6053844 BAM_2608 BAM_2609     TRUE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 6053844 6053845 BAM_2609 BAM_2610     TRUE 0.645 3.000 0.000 NA   NA
 6053846 6053847 BAM_2611 BAM_2612     FALSE 0.299 182.000 0.069 1.000   NA
 6053847 6053848 BAM_2612 BAM_2613     TRUE 0.946 -10.000 0.903 0.020   NA
 6053849 6053850 BAM_2614 BAM_2615     FALSE 0.046 269.000 0.000 NA   NA
 6053850 6053851 BAM_2615 BAM_2616     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053851 6053852 BAM_2616 BAM_2617     TRUE 0.521 17.000 0.000 1.000   NA
 6053852 6053853 BAM_2617 BAM_2618     FALSE 0.419 94.000 0.000 1.000   NA
 6053853 6053854 BAM_2618 BAM_2619     FALSE 0.289 108.000 0.000 NA   NA
 6053854 6053855 BAM_2619 BAM_2620     FALSE 0.129 170.000 0.000 NA   NA
 6053855 6053856 BAM_2620 BAM_2621     FALSE 0.232 71.000 0.000 NA   NA
 6053856 6053857 BAM_2621 BAM_2622     FALSE 0.023 355.000 0.000 NA   NA
 6053857 6053858 BAM_2622 BAM_2623     FALSE 0.209 137.000 0.000 NA   NA
 6053858 6053859 BAM_2623 BAM_2624     FALSE 0.278 88.000 0.000 NA   NA
 6053859 6053860 BAM_2624 BAM_2625     FALSE 0.269 80.000 0.000 NA   NA
 6053860 6053861 BAM_2625 BAM_2626     FALSE 0.020 382.000 0.000 NA   NA
 6053861 6053862 BAM_2626 BAM_2627     TRUE 0.935 -3.000 1.000 NA   NA
 6053862 6053863 BAM_2627 BAM_2628     TRUE 0.648 35.000 0.333 NA   NA
 6053863 6053864 BAM_2628 BAM_2629     TRUE 0.546 122.000 0.000 1.000 N NA
 6053866 6053867 BAM_2631 BAM_2632     FALSE 0.115 182.000 0.000 NA   NA
 6053867 6053868 BAM_2632 BAM_2633     FALSE 0.233 50.000 0.000 NA   NA
 6053872 6053873 BAM_2637 BAM_2638     FALSE 0.261 78.000 0.000 NA   NA
 6053873 6053874 BAM_2638 BAM_2639     FALSE 0.232 71.000 0.000 NA   NA
 6053874 6053875 BAM_2639 BAM_2640     FALSE 0.209 137.000 0.000 NA   NA
 6053876 6053877 BAM_2641 BAM_2642     FALSE 0.220 -70.000 0.000 NA   NA
 6053878 6053879 BAM_2643 BAM_2644     FALSE 0.072 219.000 0.000 NA   NA
 6053879 6053880 BAM_2644 BAM_2645     FALSE 0.020 376.000 0.000 NA   NA
 6053880 6053881 BAM_2645 BAM_2646     FALSE 0.043 274.000 0.000 NA   NA
 6053881 6053882 BAM_2646 BAM_2647     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6053886 6053887 BAM_2651 BAM_2652     FALSE 0.265 34.000 0.000 NA   NA
 6053887 6053888 BAM_2652 BAM_2653     TRUE 0.532 126.000 0.000 1.000 N NA
 6053888 6053889 BAM_2653 BAM_2654     TRUE 0.613 6.000 0.000 NA   NA
 6053889 6053890 BAM_2654 BAM_2655     FALSE 0.213 -106.000 0.000 NA   NA
 6053892 6053893 BAM_2657 BAM_2658     TRUE 0.697 10.000 0.000 1.000   NA
 6053893 6053894 BAM_2658 BAM_2659     FALSE 0.019 385.000 0.000 NA   NA
 6053894 6053895 BAM_2659 BAM_2660     FALSE 0.031 314.000 0.000 NA   NA
 6053895 6053896 BAM_2660 BAM_2661     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6053896 6053897 BAM_2661 BAM_2662     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053897 6053898 BAM_2662 BAM_2663     FALSE 0.225 68.000 0.000 NA   NA
 6053900 6053901 BAM_2665 BAM_2666     FALSE 0.278 88.000 0.000 NA   NA
 6053901 6053902 BAM_2666 BAM_2667     TRUE 0.783 122.000 0.000 1.000 Y NA
 6053902 6053903 BAM_2667 BAM_2668   ddlB TRUE 0.878 5.000 0.008 1.000 N NA
 6053903 6053904 BAM_2668 BAM_2669 ddlB tenA FALSE 0.139 275.000 0.000 1.000 N NA
 6053904 6053905 BAM_2669 BAM_2670 tenA   FALSE 0.101 194.000 0.000 NA   NA
 6053905 6053906 BAM_2670 BAM_2671     FALSE 0.241 -39.000 0.000 NA   NA
 6053906 6053907 BAM_2671 BAM_2672     FALSE 0.020 378.000 0.000 NA   NA
 6053907 6053908 BAM_2672 BAM_2673     FALSE 0.276 84.000 0.000 NA   NA
 6053910 6053911 BAM_2675 BAM_2676     FALSE 0.267 116.000 0.000 NA   NA
 6053912 6053913 BAM_2677 BAM_2678     FALSE 0.286 109.000 0.000 NA   NA
 6053914 6053915 BAM_2679 BAM_2680     FALSE 0.261 78.000 0.000 NA   NA
 6053915 6053916 BAM_2680 BAM_2681     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6053916 6053917 BAM_2681 BAM_2682     FALSE 0.236 127.000 0.000 NA   NA
 6053917 6053918 BAM_2682 BAM_2683     FALSE 0.196 141.000 0.000 NA   NA
 6053920 6053921 BAM_2685 BAM_2686     FALSE 0.176 147.000 0.000 NA   NA
 6053921 6053922 BAM_2686 BAM_2687   cypA FALSE 0.146 160.000 0.000 NA   NA
 6053922 6053923 BAM_2687 BAM_2688 cypA   FALSE 0.046 269.000 0.000 NA   NA
 6053923 6053924 BAM_2688 BAM_2689     FALSE 0.444 -10.000 0.000 NA   NA
 6053924 6053925 BAM_2689 BAM_2690     FALSE 0.232 71.000 0.000 NA   NA
 6053927 6053928 BAM_2692 BAM_2693     TRUE 0.714 113.000 0.000 0.008   NA
 6053928 6053929 BAM_2693 BAM_2694     FALSE 0.199 178.000 0.000 1.000   NA
 6053929 6053930 BAM_2694 BAM_2695     FALSE 0.014 477.000 0.000 NA   NA
 6053930 6053931 BAM_2695 BAM_2696     FALSE 0.280 90.000 0.000 NA   NA
 6053931 6053932 BAM_2696 BAM_2697     FALSE 0.069 223.000 0.000 NA   NA
 6053932 6053933 BAM_2697 BAM_2698     FALSE 0.090 336.000 0.000 1.000 N NA
 6053935 6053936 BAM_2700 BAM_2701     TRUE 0.886 11.000 0.493 NA   NA
 6053936 6053937 BAM_2701 BAM_2702     TRUE 0.901 -7.000 0.582 1.000   NA
 6053937 6053938 BAM_2702 BAM_2703     FALSE 0.281 91.000 0.000 NA   NA
 6053939 6053940 BAM_2704 BAM_2705 kinB2   FALSE 0.412 88.000 0.000 1.000   NA
 6053941 6053942 BAM_2706 BAM_2707     FALSE 0.127 171.000 0.000 NA   NA
 6053942 6053943 BAM_2707 BAM_2708     FALSE 0.091 335.000 0.000 1.000 N NA
 6053943 6053944 BAM_2708 BAM_2709     FALSE 0.012 535.000 0.000 NA   NA
 6053944 6053945 BAM_2709 BAM_2710     FALSE 0.278 112.000 0.000 NA   NA
 6053945 6053946 BAM_2710 BAM_2711     TRUE 0.756 5.000 0.000 1.000   NA
 6053946 6053947 BAM_2711 BAM_2712     FALSE 0.093 200.000 0.000 NA   NA
 6053947 6053948 BAM_2712 BAM_2713     FALSE 0.093 200.000 0.000 NA   NA
 6053949 6053950 BAM_2714 BAM_2715     FALSE 0.324 22.000 0.000 NA   NA
 6053951 6053952 BAM_2716 BAM_2717     FALSE 0.223 64.000 0.000 NA   NA
 6053952 6053953 BAM_2717 BAM_2718     TRUE 0.496 75.000 0.122 NA   NA
 6053953 6053954 BAM_2718 BAM_2719     FALSE 0.023 358.000 0.000 NA   NA
 6053956 6053957 BAM_2721 BAM_2722   adP1 FALSE 0.166 151.000 0.000 NA   NA
 6053957 6053958 BAM_2722 BAM_2723 adP1   FALSE 0.070 222.000 0.000 NA   NA
 6053958 6053959 BAM_2723 BAM_2724     FALSE 0.103 192.000 0.000 NA   NA
 6053959 6053960 BAM_2724 BAM_2725     FALSE 0.399 16.000 0.000 NA   NA
 6053961 6053962 BAM_2726 BAM_2727     TRUE 0.562 178.000 1.000 NA   NA
 6053963 6053964 BAM_2728 BAM_2729     FALSE 0.361 46.000 0.000 1.000   NA
 6053967 6053968 BAM_2732 BAM_2733     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 6053969 6053970 BAM_2734 BAM_2735     FALSE 0.306 25.000 0.000 NA   NA
 6053970 6053971 BAM_2735 BAM_2736     FALSE 0.204 139.000 0.000 NA   NA
 6053971 6053972 BAM_2736 BAM_2737     FALSE 0.196 141.000 0.000 NA   NA
 6053972 6053973 BAM_2737 BAM_2738     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 6053973 6053974 BAM_2738 BAM_2739     FALSE 0.458 23.000 0.000 1.000   NA
 6053974 6053975 BAM_2739 BAM_2740     FALSE 0.089 203.000 0.000 NA   NA
 6053975 6053976 BAM_2740 BAM_2741     FALSE 0.293 102.000 0.000 NA   NA
 6053976 6053977 BAM_2741 BAM_2742     FALSE 0.273 32.000 0.000 NA   NA
 6053977 6053978 BAM_2742 BAM_2743     FALSE 0.039 285.000 0.000 NA   NA
 6053978 6053979 BAM_2743 BAM_2744     FALSE 0.102 274.000 0.000 NA N NA
 6053979 6053980 BAM_2744 BAM_2745     FALSE 0.026 634.000 0.000 NA N NA
 6053980 6053981 BAM_2745 BAM_2746   dnaN2 TRUE 0.577 32.000 0.000 1.000 N NA
 6053981 6053982 BAM_2746 BAM_2747 dnaN2   FALSE 0.458 23.000 0.000 1.000   NA
 6053982 6053983 BAM_2747 BAM_2748     FALSE 0.289 98.000 0.000 NA   NA
 6053983 6053984 BAM_2748 BAM_2749     FALSE 0.238 73.000 0.000 NA   NA
 6053986 6053987 BAM_2751 BAM_2752     FALSE 0.211 136.000 0.000 NA   NA
 6053987 6053988 BAM_2752 BAM_2753     FALSE 0.256 119.000 0.000 NA   NA
 6053989 6053990 BAM_2754 BAM_2755     FALSE 0.265 79.000 0.000 NA   NA
 6053990 6053991 BAM_2755 BAM_2756     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 6053991 6053992 BAM_2756 BAM_2757     FALSE 0.279 89.000 0.000 NA   NA
 6053992 6053993 BAM_2757 BAM_2758     FALSE 0.047 266.000 0.000 NA   NA
 6053993 6053994 BAM_2758 BAM_2759     TRUE 0.502 13.000 0.000 NA   NA
 6053996 6053997 BAM_2761 BAM_2762     TRUE 0.647 2.000 0.000 NA   NA
 6053997 6053998 BAM_2762 BAM_2763     FALSE 0.374 17.000 0.000 NA   NA
 6053998 6053999 BAM_2763 BAM_2764     FALSE 0.421 64.000 0.000 NA N NA
 6053999 6054000 BAM_2764 BAM_2765     TRUE 0.489 83.000 0.000 NA N NA
 6054002 6054003 BAM_2767 BAM_2768     FALSE 0.261 78.000 0.000 NA   NA
 6054003 6054004 BAM_2768 BAM_2769     FALSE 0.291 28.000 0.000 NA   NA
 6054004 6054005 BAM_2769 BAM_2770     FALSE 0.435 181.000 0.400 NA   NA
 6054006 6054007 BAM_2771 BAM_2772     FALSE 0.200 140.000 0.000 NA   NA
 6054008 6054009 BAM_2773 BAM_2774     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054009 6054010 BAM_2774 BAM_2775     FALSE 0.167 150.000 0.000 NA   NA
 6054010 6054011 BAM_2775 BAM_2776     FALSE 0.204 139.000 0.000 NA   NA
 6054011 6054012 BAM_2776 BAM_2777     FALSE 0.267 -31.000 0.000 NA   NA
 6054012 6054013 BAM_2777 BAM_2778     FALSE 0.238 126.000 0.000 NA   NA
 6054013 6054014 BAM_2778 BAM_2779     FALSE 0.172 148.000 0.000 NA   NA
 6054014 6054015 BAM_2779 BAM_2780     FALSE 0.204 139.000 0.000 NA   NA
 6054015 6054016 BAM_2780 BAM_2781     FALSE 0.286 109.000 0.000 NA   NA
 6054016 6054017 BAM_2781 BAM_2782     FALSE 0.209 137.000 0.000 NA   NA
 6054018 6054019 BAM_2783 BAM_2784     FALSE 0.091 202.000 0.000 NA   NA
 6054019 6054020 BAM_2784 BAM_2785     FALSE 0.009 967.000 0.000 NA   NA
 6054021 6054022 BAM_2786 BAM_2787     TRUE 0.516 56.000 0.000 1.000 N NA
 6054022 6054023 BAM_2787 BAM_2788     TRUE 0.715 33.000 0.333 1.000   NA
 6054023 6054024 BAM_2788 BAM_2789     FALSE 0.239 45.000 0.000 NA   NA
 6054024 6054025 BAM_2789 BAM_2790     FALSE 0.010 662.000 0.000 NA   NA
 6054027 6054028 BAM_2792 BAM_2793     FALSE 0.015 460.000 0.000 NA   NA
 6054028 6054029 BAM_2793 BAM_2794     TRUE 0.863 1.000 0.154 NA   NA
 6054029 6054030 BAM_2794 BAM_2795     FALSE 0.127 251.000 0.000 NA N NA
 6054032 6054033 BAM_2797 BAM_2798     FALSE 0.214 135.000 0.000 NA   NA
 6054034 6054035 BAM_2799 BAM_2800     FALSE 0.022 360.000 0.000 NA   NA
 6054035 6054036 BAM_2800 BAM_2802     FALSE 0.296 27.000 0.000 NA   NA
 6054037 6054038 BAM_2801 BAM_2803     TRUE 0.528 12.000 0.000 NA   NA
 6054040 6054041 BAM_2805 BAM_2806     FALSE 0.374 17.000 0.000 NA   NA
 6054041 6054042 BAM_2806 BAM_2807     FALSE 0.227 56.000 0.000 NA   NA
 6054042 6054043 BAM_2807 BAM_2808     FALSE 0.289 108.000 0.000 NA   NA
 6054043 6054044 BAM_2808 BAM_2809     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 6054044 6054045 BAM_2809 BAM_2810     FALSE 0.275 113.000 0.000 NA   NA
 6054045 6054046 BAM_2810 BAM_2811   ypeB FALSE 0.434 27.000 0.040 NA   NA
 6054046 6054047 BAM_2811 BAM_2812 ypeB sleB TRUE 0.830 16.000 0.380 1.000   NA
 6054049 6054050 BAM_2814 BAM_2815   kynA TRUE 0.615 117.000 0.020 1.000 N NA
 6054050 6054051 BAM_2815 BAM_2816 kynA kynB TRUE 0.643 34.000 0.180 1.000   NA
 6054051 6054052 BAM_2816 BAM_2817 kynB kynU TRUE 0.910 3.000 0.223 1.000   NA
 6054056 6054057 BAM_2821 BAM_2822     FALSE 0.163 152.000 0.000 NA   NA
 6054057 6054058 BAM_2822 BAM_2823     FALSE 0.209 137.000 0.000 NA   NA
 6054058 6054059 BAM_2823 BAM_2824     FALSE 0.278 112.000 0.000 NA   NA
 6054059 6054060 BAM_2824 BAM_2825     FALSE 0.241 125.000 0.000 NA   NA
 6054060 6054061 BAM_2825 BAM_2826     FALSE 0.360 18.000 0.000 NA   NA
 6054061 6054062 BAM_2826 BAM_2827     FALSE 0.166 151.000 0.000 NA   NA
 6054062 6054063 BAM_2827 BAM_2828     TRUE 0.786 13.000 0.000 1.000 N NA
 6054065 6054066 BAM_2830 BAM_2831     FALSE 0.400 33.000 0.000 1.000   NA
 6054066 6054067 BAM_2831 BAM_2832     TRUE 0.790 94.000 0.429 NA N NA
 6054067 6054068 BAM_2832 BAM_2833     FALSE 0.226 58.000 0.000 NA   NA
 6054068 6054069 BAM_2833 BAM_2834     FALSE 0.324 22.000 0.000 NA   NA
 6054071 6054072 BAM_2836 BAM_2837 acoL acoC TRUE 0.931 16.000 0.188 1.000 Y NA
 6054072 6054073 BAM_2837 BAM_2838 acoC acoB TRUE 0.845 28.000 0.062 0.078 Y NA
 6054073 6054074 BAM_2838 BAM_2839 acoB acoA TRUE 0.960 18.000 0.043 0.002 Y NA
 6054074 6054075 BAM_2839 BAM_2840 acoA   FALSE 0.364 -16.000 0.000 NA   NA
 6054075 6054076 BAM_2840 BAM_2841     FALSE 0.277 31.000 0.000 NA   NA
 6054077 6054078 BAM_2842 BAM_2843     FALSE 0.244 42.000 0.000 NA   NA
 6054079 6054080 BAM_2844 BAM_2845     FALSE 0.338 20.000 0.000 NA   NA
 6054080 6054081 BAM_2845 BAM_2846     FALSE 0.286 29.000 0.000 NA   NA
 6054081 6054082 BAM_2846 BAM_2847     FALSE 0.283 93.000 0.000 NA   NA
 6054082 6054083 BAM_2847 BAM_2848     FALSE 0.227 69.000 0.000 NA   NA
 6054083 6054084 BAM_2848 BAM_2849     FALSE 0.270 115.000 0.000 NA   NA
 6054084 6054085 BAM_2849 BAM_2850     FALSE 0.014 477.000 0.000 NA   NA
 6054085 6054086 BAM_2850 BAM_2851   proV2 TRUE 0.897 -7.000 0.000 0.097 Y NA
 6054088 6054089 BAM_2853 BAM_2854 clpP1   TRUE 0.851 22.000 0.429 1.000 N NA
 6054090 6054091 BAM_2855 BAM_2856   rpiA TRUE 0.861 5.000 0.000 1.000 N NA
 6054091 6054092 BAM_2856 BAM_2857 rpiA   FALSE 0.424 108.000 0.000 1.000   NA
 6054093 6054094 BAM_2858 BAM_2859     FALSE 0.015 438.000 0.000 NA   NA
 6054094 6054095 BAM_2859 BAM_2860     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054095 6054096 BAM_2860 BAM_2861     FALSE 0.254 37.000 0.000 NA   NA
 6054096 6054097 BAM_2861 BAM_2862     FALSE 0.399 16.000 0.000 NA   NA
 6054097 6054098 BAM_2862 BAM_2863     FALSE 0.223 66.000 0.000 NA   NA
 6054098 6054099 BAM_2863 BAM_2864     FALSE 0.348 19.000 0.000 NA   NA
 6054099 6054100 BAM_2864 BAM_2865     FALSE 0.292 106.000 0.000 NA   NA
 6054100 6054101 BAM_2865 BAM_2866     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 6054101 6054102 BAM_2866 BAM_2867     TRUE 0.502 13.000 0.000 NA   NA
 6054103 6054104 BAM_2868 BAM_2869     TRUE 0.914 3.000 0.400 NA   NA
 6054105 6054106 BAM_2870 BAM_2871     FALSE 0.143 207.000 0.000 1.000   NA
 6054106 6054107 BAM_2871 BAM_2872     FALSE 0.296 27.000 0.000 NA   NA
 6054107 6054108 BAM_2872 BAM_2873     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054108 6054109 BAM_2873 BAM_2874     FALSE 0.184 145.000 0.000 NA   NA
 6054109 6054110 BAM_2874 BAM_2875     FALSE 0.261 35.000 0.000 NA   NA
 6054110 6054111 BAM_2875 BAM_2876     FALSE 0.400 -13.000 0.000 NA   NA
 6054111 6054112 BAM_2876 BAM_2877     FALSE 0.129 170.000 0.000 NA   NA
 6054112 6054113 BAM_2877 BAM_2878     FALSE 0.223 63.000 0.000 NA   NA
 6054115 6054116 BAM_2880 BAM_2881     FALSE 0.110 185.000 0.000 NA   NA
 6054116 6054117 BAM_2881 BAM_2882   recQ2 FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 6054118 6054119 BAM_2883 BAM_2884     FALSE 0.011 618.000 0.000 NA   NA
 6054120 6054121 BAM_2885 BAM_2886     FALSE 0.290 99.000 0.000 NA   NA
 6054123 6054124 BAM_2888 BAM_2889     FALSE 0.230 -48.000 0.000 NA   NA
 6054124 6054125 BAM_2889 BAM_2890   ppaC FALSE 0.292 106.000 0.000 NA   NA
 6054125 6054126 BAM_2890 BAM_2891 ppaC   FALSE 0.230 162.000 0.000 1.000   NA
 6054126 6054127 BAM_2891 BAM_2892     FALSE 0.117 225.000 0.000 1.000   NA
 6054127 6054128 BAM_2892 BAM_2893     FALSE 0.125 218.000 0.000 1.000   NA
 6054128 6054129 BAM_2893 BAM_2894     FALSE 0.430 103.000 0.000 1.000   NA
 6054129 6054130 BAM_2894 BAM_2895     TRUE 0.596 108.000 0.000 1.000 N NA
 6054130 6054131 BAM_2895 BAM_2896   dapA1 TRUE 0.829 19.000 0.250 1.000 N NA
 6054131 6054132 BAM_2896 BAM_2897 dapA1   TRUE 0.912 23.000 0.250 1.000 Y NA
 6054132 6054133 BAM_2897 BAM_2898     TRUE 0.992 -3.000 0.273 0.001 Y NA
 6054133 6054134 BAM_2898 BAM_2899     TRUE 0.971 -3.000 0.231 1.000 Y NA
 6054135 6054136 BAM_2900 BAM_2901     FALSE 0.091 202.000 0.000 NA   NA
 6054136 6054137 BAM_2901 BAM_2902     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054137 6054138 BAM_2902 BAM_2903   gidA1 TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054139 6054140 BAM_2904 BAM_2905     TRUE 0.549 -12.000 0.030 NA   NA
 6054141 6054142 BAM_2906 BAM_2907     FALSE 0.063 235.000 0.000 NA   NA
 6054145 6054146 BAM_2910 BAM_2911 dltD2   FALSE 0.110 267.000 0.000 NA N NA
 6054146 6054147 BAM_2911 BAM_2912     TRUE 0.560 118.000 0.000 1.000 N NA
 6054147 6054148 BAM_2912 BAM_2913     TRUE 0.720 21.000 0.118 NA N NA
 6054148 6054149 BAM_2913 BAM_2914     TRUE 0.886 40.000 0.471 NA Y NA
 6054149 6054150 BAM_2914 BAM_2915     FALSE 0.163 152.000 0.000 NA   NA
 6054150 6054151 BAM_2915 BAM_2916   divIC2 FALSE 0.050 260.000 0.000 NA   NA
 6054151 6054152 BAM_2916 BAM_2917 divIC2   FALSE 0.013 500.000 0.000 NA   NA
 6054154 6054155 BAM_2919 BAM_2920     FALSE 0.032 312.000 0.000 NA   NA
 6054155 6054156 BAM_2920 BAM_2921     FALSE 0.091 202.000 0.000 NA   NA
 6054158 6054159 BAM_2923 BAM_2924     FALSE 0.155 201.000 0.000 1.000   NA
 6054159 6054160 BAM_2924 BAM_2925     TRUE 0.958 -7.000 0.261 1.000 Y NA
 6054162 6054163 BAM_2927 BAM_2928     FALSE 0.046 269.000 0.000 NA   NA
 6054163 6054164 BAM_2928 BAM_2929     FALSE 0.230 53.000 0.000 NA   NA
 6054164 6054165 BAM_2929 BAM_2930     FALSE 0.338 20.000 0.000 NA   NA
 6054165 6054166 BAM_2930 BAM_2931     FALSE 0.399 16.000 0.000 NA   NA
 6054166 6054167 BAM_2931 BAM_2932     TRUE 0.502 13.000 0.000 NA   NA
 6054167 6054168 BAM_2932 BAM_2933     FALSE 0.251 38.000 0.000 NA   NA
 6054168 6054169 BAM_2933 BAM_2934     FALSE 0.084 207.000 0.000 NA   NA
 6054169 6054170 BAM_2934 BAM_2935     TRUE 0.502 13.000 0.000 NA   NA
 6054171 6054172 BAM_2936 BAM_2937     FALSE 0.058 244.000 0.000 NA   NA
 6054175 6054176 BAM_2940 BAM_2941     FALSE 0.306 25.000 0.000 NA   NA
 6054176 6054177 BAM_2941 BAM_2942     TRUE 0.799 19.000 0.625 NA   NA
 6054177 6054178 BAM_2942 BAM_2943     TRUE 0.807 14.000 0.286 NA   NA
 6054178 6054179 BAM_2943 BAM_2944     FALSE 0.234 161.000 0.000 1.000   NA
 6054181 6054182 BAM_2946 BAM_2947     FALSE 0.291 28.000 0.000 NA   NA
 6054182 6054183 BAM_2947 BAM_2948     FALSE 0.290 99.000 0.000 NA   NA
 6054183 6054184 BAM_2948 BAM_2949     FALSE 0.310 -22.000 0.000 NA   NA
 6054184 6054185 BAM_2949 BAM_2950     TRUE 0.648 78.000 0.333 NA   NA
 6054185 6054186 BAM_2950 BAM_2951     FALSE 0.204 174.000 0.000 1.000   NA
 6054186 6054187 BAM_2951 BAM_2952     TRUE 0.769 78.000 1.000 NA   NA
 6054187 6054188 BAM_2952 BAM_2953     FALSE 0.265 79.000 0.000 NA   NA
 6054188 6054189 BAM_2953 BAM_2954     FALSE 0.098 196.000 0.000 NA   NA
 6054189 6054190 BAM_2954 BAM_2955     FALSE 0.163 152.000 0.000 NA   NA
 6054191 6054192 BAM_2956 BAM_2957     FALSE 0.232 51.000 0.000 NA   NA
 6054192 6054193 BAM_2957 BAM_2958     FALSE 0.048 265.000 0.000 NA   NA
 6054193 6054194 BAM_2958 BAM_2959     FALSE 0.163 152.000 0.000 NA   NA
 6054194 6054195 BAM_2959 BAM_2960     FALSE 0.251 -34.000 0.000 NA   NA
 6054195 6054196 BAM_2960 BAM_2961     FALSE 0.127 171.000 0.000 NA   NA
 6054196 6054197 BAM_2961 BAM_2962     FALSE 0.117 181.000 0.000 NA   NA
 6054197 6054198 BAM_2962 BAM_2963     FALSE 0.425 57.000 0.000 NA N NA
 6054198 6054199 BAM_2963 BAM_2964   coaA TRUE 0.499 93.000 0.000 NA N NA
 6054200 6054201 BAM_2965 BAM_2966     FALSE 0.106 188.000 0.000 NA   NA
 6054201 6054202 BAM_2966 BAM_2967     FALSE 0.225 60.000 0.000 NA   NA
 6054202 6054203 BAM_2967 BAM_2968     FALSE 0.268 33.000 0.000 NA   NA
 6054203 6054204 BAM_2968 BAM_2969     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054204 6054205 BAM_2969 BAM_2970     FALSE 0.293 104.000 0.000 NA   NA
 6054205 6054206 BAM_2970 BAM_2971     FALSE 0.243 124.000 0.000 NA   NA
 6054207 6054208 BAM_2972 BAM_2973     FALSE 0.137 165.000 0.000 NA   NA
 6054208 6054209 BAM_2973 BAM_2974     TRUE 0.794 28.000 1.000 NA   NA
 6054209 6054210 BAM_2974 BAM_2975     FALSE 0.286 29.000 0.000 NA   NA
 6054210 6054211 BAM_2975 BAM_2976     FALSE 0.296 27.000 0.000 NA   NA
 6054211 6054212 BAM_2976 BAM_2977     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 6054212 6054213 BAM_2977 BAM_2978     FALSE 0.301 26.000 0.000 NA   NA
 6054216 6054217 BAM_2981 BAM_2982   ssuD FALSE 0.187 144.000 0.000 NA   NA
 6054217 6054218 BAM_2982 BAM_2983 ssuD   TRUE 0.681 77.000 0.091 1.000 N NA
 6054218 6054219 BAM_2983 BAM_2984     FALSE 0.374 17.000 0.000 NA   NA
 6054219 6054220 BAM_2984 BAM_2985     FALSE 0.292 100.000 0.000 NA   NA
 6054220 6054221 BAM_2985 BAM_2986     FALSE 0.360 18.000 0.000 NA   NA
 6054221 6054222 BAM_2986 BAM_2987     FALSE 0.066 228.000 0.000 NA   NA
 6054222 6054223 BAM_2987 BAM_2988     FALSE 0.237 47.000 0.000 NA   NA
 6054223 6054224 BAM_2988 BAM_2989     FALSE 0.081 210.000 0.000 NA   NA
 6054224 6054225 BAM_2989 BAM_2990     FALSE 0.293 104.000 0.000 NA   NA
 6054225 6054226 BAM_2990 BAM_2991     TRUE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 6054226 6054227 BAM_2991 BAM_2992     TRUE 0.502 13.000 0.000 NA   NA
 6054227 6054228 BAM_2992 BAM_2993     FALSE 0.243 124.000 0.000 NA   NA
 6054228 6054229 BAM_2993 BAM_2994   aacC7 FALSE 0.458 16.000 0.003 NA   NA
 6054231 6054232 BAM_2996 BAM_2997     FALSE 0.331 21.000 0.000 NA   NA
 6054232 6054233 BAM_2997 BAM_2998     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054233 6054234 BAM_2998 BAM_2999     FALSE 0.242 -37.000 0.000 NA   NA
 6054234 6054235 BAM_2999 BAM_3000     TRUE 0.604 57.000 0.333 NA   NA
 6054235 6054236 BAM_3000 BAM_3001     FALSE 0.229 70.000 0.000 NA   NA
 6054236 6054237 BAM_3001 BAM_3002     FALSE 0.399 16.000 0.000 NA   NA
 6054237 6054238 BAM_3002 BAM_3003     TRUE 0.883 35.000 0.000 0.020 Y NA
 6054238 6054239 BAM_3003 BAM_3004     TRUE 0.547 16.000 0.000 1.000   NA
 6054239 6054240 BAM_3004 BAM_3005     FALSE 0.374 17.000 0.000 NA   NA
 6054240 6054241 BAM_3005 BAM_3006     FALSE 0.022 366.000 0.000 NA   NA
 6054241 6054242 BAM_3006 BAM_3007     FALSE 0.444 -10.000 0.000 NA   NA
 6054243 6054244 BAM_3008 BAM_3009     FALSE 0.146 160.000 0.000 NA   NA
 6054244 6054245 BAM_3009 BAM_3010     FALSE 0.281 111.000 0.000 NA   NA
 6054246 6054247 BAM_3011 BAM_3012     FALSE 0.023 517.000 0.000 1.000   NA
 6054247 6054248 BAM_3012 BAM_3013     FALSE 0.020 378.000 0.000 NA   NA
 6054248 6054249 BAM_3013 BAM_3014     FALSE 0.039 287.000 0.000 NA   NA
 6054249 6054250 BAM_3014 BAM_3015     TRUE 0.647 1.000 0.000 NA   NA
 6054250 6054251 BAM_3015 BAM_3016     FALSE 0.053 254.000 0.000 NA   NA
 6054251 6054252 BAM_3016 BAM_3017     FALSE 0.079 270.000 0.000 1.000   NA
 6054252 6054253 BAM_3017 BAM_3018   aroA FALSE 0.182 186.000 0.000 1.000   NA
 6054253 6054254 BAM_3018 BAM_3019 aroA tyrA TRUE 0.900 17.000 0.069 1.000 Y NA
 6054254 6054255 BAM_3019 BAM_3020 tyrA hisC2 TRUE 0.916 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 6054255 6054256 BAM_3020 BAM_3021 hisC2 aroC2 TRUE 0.854 19.000 0.000 1.000 Y NA
 6054256 6054257 BAM_3021 BAM_3022 aroC2   FALSE 0.245 123.000 0.000 NA   NA
 6054257 6054258 BAM_3022 BAM_3023     FALSE 0.223 64.000 0.000 NA   NA
 6054258 6054259 BAM_3023 BAM_3024     FALSE 0.012 541.000 0.000 NA   NA
 6054259 6054260 BAM_3024 BAM_3025     FALSE 0.236 48.000 0.000 NA   NA
 6054262 6054263 BAM_3027 BAM_3028     TRUE 0.663 17.000 0.000 0.075 N NA
 6054263 6054264 BAM_3028 BAM_3029     FALSE 0.338 20.000 0.000 NA   NA
 6054266 6054267 BAM_3031 BAM_3032     FALSE 0.107 187.000 0.000 NA   NA
 6054267 6054268 BAM_3032 BAM_3033     FALSE 0.240 44.000 0.000 NA   NA
 6054268 6054269 BAM_3033 BAM_3034     FALSE 0.232 51.000 0.000 NA   NA
 6054269 6054270 BAM_3034 BAM_3035     FALSE 0.444 -10.000 0.000 NA   NA
 6054271 6054272 BAM_3036 BAM_3037     FALSE 0.241 125.000 0.000 NA   NA
 6054275 6054276 BAM_3040 BAM_3041     TRUE 0.979 -3.000 0.929 NA Y NA
 6054278 6054279 BAM_3042 BAM_3044     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054280 6054281 BAM_3045 BAM_3046     TRUE 0.969 0.000 1.000 1.000 N NA
 6054281 6054282 BAM_3046 BAM_3047     TRUE 0.604 26.000 0.167 NA   NA
 6054282 6054283 BAM_3047 BAM_3048     TRUE 0.593 7.000 0.000 NA   NA
 6054284 6054285 BAM_3049 BAM_3050     FALSE 0.026 337.000 0.000 NA   NA
 6054285 6054286 BAM_3050 BAM_3051     FALSE 0.275 83.000 0.000 NA   NA
 6054286 6054287 BAM_3051 BAM_3052     FALSE 0.288 97.000 0.000 NA   NA
 6054287 6054288 BAM_3052 BAM_3053     FALSE 0.288 97.000 0.000 NA   NA
 6054288 6054289 BAM_3053 BAM_3054     TRUE 0.665 52.000 0.500 NA   NA
 6054290 6054291 BAM_3055 BAM_3056     FALSE 0.087 204.000 0.000 NA   NA
 6054292 6054293 BAM_3057 BAM_3058 proA proB TRUE 0.965 30.000 0.316 0.002 Y NA
 6054293 6054294 BAM_3058 BAM_3059 proB   FALSE 0.014 494.000 0.000 NA   NA
 6054296 6054297 BAM_3061 BAM_3062 rocB   FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 6054298 6054299 BAM_4878 BAM_4879   gap1 FALSE 0.277 85.000 0.000 NA   NA
 6054299 6054300 BAM_4879 BAM_4880 gap1   TRUE 0.650 110.000 0.029 1.000 N NA
 6054300 6054301 BAM_4880 BAM_4881     FALSE 0.336 52.000 0.031 NA   NA
 6054301 6054302 BAM_4881 BAM_4882   mutM FALSE 0.371 73.000 0.044 NA   NA
 6054302 6054303 BAM_4882 BAM_4883 mutM polA TRUE 0.945 13.000 0.107 1.000 Y NA
 6054303 6054304 BAM_4883 BAM_4884 polA phoR FALSE 0.148 287.000 0.011 1.000 N NA
 6054304 6054305 BAM_4884 BAM_4885 phoR phoP TRUE 0.955 -7.000 0.301 0.079 Y NA
 6054305 6054306 BAM_4885 BAM_4886 phoP   FALSE 0.172 148.000 0.000 NA   NA
 6054308 6054309 BAM_4888 BAM_4889   mdh FALSE 0.271 217.000 0.027 1.000 N NA
 6054309 6054310 BAM_4889 BAM_4890 mdh citC TRUE 0.900 20.000 0.117 1.000 Y NA
 6054310 6054311 BAM_4890 BAM_4891 citC citZ TRUE 0.753 161.000 0.131 1.000 Y NA
 6054311 6054312 BAM_4891 BAM_4892 citZ   FALSE 0.036 388.000 0.047 NA   NA
 6054314 6054315 BAM_4894 BAM_4895   pyk FALSE 0.236 200.000 0.052 1.000   NA
 6054315 6054316 BAM_4895 BAM_4896 pyk pfkA TRUE 0.941 54.000 0.254 0.004 Y NA
 6054316 6054317 BAM_4896 BAM_4897 pfkA accA TRUE 0.601 129.000 0.044 1.000 N NA
 6054317 6054318 BAM_4897 BAM_4898 accA accD TRUE 0.982 -12.000 0.232 0.001 Y NA
 6054318 6054319 BAM_4898 BAM_4899 accD   FALSE 0.375 186.000 0.037 1.000 N NA
 6054319 6054320 BAM_4899 BAM_4900     TRUE 0.879 15.000 0.263 1.000 N NA
 6054320 6054321 BAM_4900 BAM_4901   dnaE TRUE 0.745 104.000 0.128 1.000 N NA
 6054322 6054323 BAM_4902 BAM_4903     TRUE 0.883 -3.000 0.310 NA   NA
 6054324 6054325 BAM_4904 BAM_4905     FALSE 0.283 93.000 0.000 NA   NA
 6054327 6054328 BAM_4907 BAM_4908     FALSE 0.117 181.000 0.000 NA   NA
 6054328 6054329 BAM_4908 BAM_4909     FALSE 0.101 194.000 0.000 NA   NA
 6054333 6054334 BAM_4913 BAM_4914     FALSE 0.331 21.000 0.000 NA   NA
 6054336 6054337 BAM_4916 BAM_4917     FALSE 0.019 392.000 0.000 NA   NA
 6054337 6054338 BAM_4917 BAM_4918     FALSE 0.238 73.000 0.000 NA   NA
 6054338 6054339 BAM_4918 BAM_4919     TRUE 0.645 3.000 0.000 NA   NA
 6054339 6054340 BAM_4919 BAM_4920     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054340 6054341 BAM_4920 BAM_4921     FALSE 0.239 45.000 0.000 NA   NA
 6054342 6054343 BAM_4922 BAM_4923     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA   NA
 6054344 6054345 BAM_4924 BAM_4925 ald2   FALSE 0.231 214.000 0.000 1.000 N NA
 6054349 6054350 BAM_4929 BAM_4930   argH2 FALSE 0.290 99.000 0.000 NA   NA
 6054350 6054351 BAM_4930 BAM_4931 argH2 argG TRUE 0.973 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 6054352 6054353 BAM_4932 BAM_4933     FALSE 0.399 16.000 0.000 NA   NA
 6054355 6054356 BAM_4935 BAM_4936     FALSE 0.011 632.000 0.000 NA   NA
 6054358 6054359 BAM_4938 BAM_4939     FALSE 0.235 72.000 0.000 NA   NA
 6054360 6054361 BAM_4940 BAM_4941 ackA   FALSE 0.234 299.000 0.203 1.000 N NA
 6054361 6054362 BAM_4941 BAM_4942     TRUE 0.511 200.000 0.319 1.000 N NA
 6054362 6054363 BAM_4942 BAM_4943     FALSE 0.364 135.000 0.061 NA   NA
 6054363 6054364 BAM_4943 BAM_4944     TRUE 0.682 13.000 0.062 NA   NA
 6054366 6054367 BAM_4946 BAM_4947     FALSE 0.229 70.000 0.000 NA   NA
 6054367 6054368 BAM_4947 BAM_4948     FALSE 0.293 103.000 0.000 NA   NA
 6054368 6054369 BAM_4948 BAM_4949   sspB FALSE 0.139 278.000 0.091 1.000   NA
 6054369 6054370 BAM_4949 BAM_4950 sspB thiI FALSE 0.454 81.000 0.007 1.000   NA
 6054370 6054371 BAM_4950 BAM_4951 thiI   TRUE 0.940 7.000 0.344 1.000 N NA
 6054371 6054372 BAM_4951 BAM_4952   ezrA FALSE 0.465 169.000 0.075 1.000 N NA
 6054376 6054377 BAM_4956 BAM_4957     FALSE 0.235 72.000 0.000 NA   NA