MicrobesOnline Operon Predictions for Acinetobacter baumannii AYE

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5748965 5748966 ABAYE0001 ABAYE0002 dnaA dnaN TRUE 0.865 98.000 0.273 1.000 Y NA
 5748966 5748967 ABAYE0002 ABAYE0003 dnaN recF TRUE 0.994 15.000 0.344 1.000 Y NA
 5748967 5748968 ABAYE0003 ABAYE0004 recF gyrB TRUE 0.988 53.000 0.257 0.005 Y NA
 5748968 5748969 ABAYE0004 ABAYE0005 gyrB   FALSE 0.436 38.000 0.000 1.000 N NA
 5748970 5748971 ABAYE0006 ABAYE0007     FALSE 0.013 251.000 0.000 NA   NA
 5748972 5748973 ABAYE0008 ABAYE0009     FALSE 0.012 256.000 0.000 NA   NA
 5748973 5748974 ABAYE0009 ABAYE0010   adeT FALSE 0.009 301.000 0.000 NA   NA
 5748974 5748975 ABAYE0010 ABAYE0011 adeT   FALSE 0.256 125.000 0.007 NA   NA
 5748976 5748977 ABAYE0012 ABAYE0013     FALSE 0.146 128.000 0.000 NA   NA
 5748978 5748979 ABAYE0014 ABAYE_16s_4 tyrS   FALSE 0.004 875.000 0.000 NA   NA
 5748979 5748980 ABAYE_16s_4 ABAYEtRNA1     FALSE 0.209 115.000 0.000 NA   NA
 5748980 5748981 ABAYEtRNA1 ABAYEtRNA2     FALSE 0.452 56.000 0.000 NA   NA
 5748981 5748982 ABAYEtRNA2 ABAYE_23s_4     FALSE 0.007 341.000 0.000 NA   NA
 5748982 5748983 ABAYE_23s_4 ABAYE_5s_4     FALSE 0.038 176.000 0.000 NA   NA
 5748983 5748984 ABAYE_5s_4 ABAYE0016     FALSE 0.105 139.000 0.000 NA   NA
 5748986 5748987 ABAYE0019 ABAYE0020     TRUE 0.962 13.000 0.029 NA   NA
 5748988 5748989 ABAYE0021 ABAYE0022 sun fmt TRUE 0.986 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 5748990 5748991 ABAYE0023 ABAYE0024 ilvD   FALSE 0.009 314.000 0.000 NA   NA
 5748991 5748992 ABAYE0024 ABAYE0025     FALSE 0.355 79.000 0.000 NA   NA
 5748993 5748994 ABAYE0026 ABAYE0027     TRUE 0.604 80.000 0.125 1.000 N NA
 5748994 5748995 ABAYE0027 ABAYE0028   ppc FALSE 0.004 301.000 0.000 1.000 N NA
 5748995 5748996 ABAYE0028 ABAYE0029 ppc   FALSE 0.048 171.000 0.008 1.000 N NA
 5748997 5748998 ABAYE0030 ABAYE0031     TRUE 0.978 3.000 0.356 NA N NA
 5748998 5748999 ABAYE0031 ABAYE0032     FALSE 0.306 140.000 0.118 NA   NA
 5748999 5749000 ABAYE0032 ABAYE0033   dnaJ FALSE 0.362 105.000 0.003 NA   NA
 5749002 5749003 ABAYE0036 ABAYE0037 dapB   FALSE 0.489 52.000 0.000 NA   NA
 5749004 5749005 ABAYE0038 ABAYE0039   alrA TRUE 0.864 -64.000 0.119 NA   NA
 5749009 5749010 ABAYE0043 ABAYE0044   tag TRUE 0.779 39.000 0.033 1.000   NA
 5749010 5749011 ABAYE0044 ABAYE0045 tag   TRUE 0.731 31.000 0.000 NA   NA
 5749011 5749012 ABAYE0045 ABAYE0046     TRUE 0.984 10.000 0.250 NA   NA
 5749012 5749013 ABAYE0046 ABAYE0047   mutY TRUE 0.598 48.000 0.004 1.000   NA
 5749013 5749014 ABAYE0047 ABAYE0048 mutY   FALSE 0.091 141.000 0.004 1.000 N NA
 5749014 5749015 ABAYE0048 ABAYE0049     FALSE 0.049 185.000 0.035 1.000 N NA
 5749015 5749016 ABAYE0049 ABAYE0050     FALSE 0.120 172.000 0.071 NA   NA
 5749017 5749018 ABAYE0051 ABAYE0052     FALSE 0.238 110.000 0.000 NA   NA
 5749018 5749019 ABAYE0052 ABAYE0053     FALSE 0.131 106.000 0.000 1.000 N NA
 5749020 5749021 ABAYE0054 ABAYE0055     FALSE 0.010 286.000 0.000 NA   NA
 5749021 5749022 ABAYE0055 ABAYE0056   purC FALSE 0.031 190.000 0.000 NA   NA
 5749022 5749023 ABAYE0056 ABAYE0057 purC   TRUE 0.776 37.000 0.008 NA   NA
 5749023 5749024 ABAYE0057 ABAYE0058   dapA TRUE 0.955 13.000 0.012 NA   NA
 5749025 5749026 ABAYE0059 ABAYE0060 pncA   TRUE 0.913 19.000 0.005 1.000   NA
 5749026 5749027 ABAYE0060 ABAYE0061     FALSE 0.032 175.000 0.000 1.000   NA
 5749030 5749031 ABAYE0065 ABAYE0066 hmgR   FALSE 0.004 300.000 0.000 1.000 N NA
 5749031 5749032 ABAYE0066 ABAYE0067   hmgC TRUE 0.853 -9.000 0.069 1.000 N NA
 5749032 5749033 ABAYE0067 ABAYE0068 hmgC hmgB TRUE 0.982 -43.000 0.069 0.001 N NA
 5749034 5749035 ABAYE0069 ABAYE0070 aroP   FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 5749035 5749036 ABAYE0070 ABAYE0071     FALSE 0.035 179.000 0.000 NA   NA
 5749038 5749039 ABAYE0073 ABAYE0074 hutC   TRUE 0.940 -3.000 0.094 NA   NA
 5749039 5749040 ABAYE0074 ABAYE0075   hutU FALSE 0.013 252.000 0.000 NA   NA
 5749040 5749041 ABAYE0075 ABAYE0076 hutU hutH TRUE 0.981 88.000 0.132 0.001 Y NA
 5749041 5749042 ABAYE0076 ABAYE0077 hutH   TRUE 0.808 65.000 0.009 1.000 Y NA
 5749042 5749043 ABAYE0077 ABAYE0078   hutI TRUE 0.599 28.000 0.000 1.000 N NA
 5749043 5749044 ABAYE0078 ABAYE0079 hutI hutG TRUE 0.926 11.000 0.012 1.000 N NA
 5749044 5749045 ABAYE0079 ABAYE0080 hutG   FALSE 0.013 255.000 0.000 NA   NA
 5749045 5749046 ABAYE0080 ABAYE0081     FALSE 0.291 100.000 0.000 NA   NA
 5749046 5749047 ABAYE0081 ABAYE0082     TRUE 0.800 24.000 0.000 1.000   NA
 5749047 5749048 ABAYE0082 ABAYE0083     FALSE 0.004 663.000 0.000 NA   NA
 5749048 5749049 ABAYE0083 ABAYE0084     FALSE 0.005 479.000 0.000 NA   NA
 5749049 5749050 ABAYE0084 ABAYE0085     TRUE 0.846 -13.000 0.077 1.000 N NA
 5749050 5749051 ABAYE0085 ABAYE0086     TRUE 0.915 -58.000 0.308 NA   NA
 5749051 5749052 ABAYE0086 ABAYE0087     TRUE 0.681 -24.000 0.000 NA   NA
 5749052 5749053 ABAYE0087 ABAYE0088     FALSE 0.150 127.000 0.000 NA   NA
 5749054 5749055 ABAYE0089 ABAYE0090 glmS glmU TRUE 0.993 13.000 0.195 1.000 Y NA
 5749055 5749056 ABAYE0090 ABAYE0091 glmU pgpA TRUE 0.895 17.000 0.005 1.000 N NA
 5749056 5749057 ABAYE0091 ABAYE0093 pgpA thiL TRUE 0.926 -7.000 0.235 1.000 N NA
 5749057 5749058 ABAYE0093 ABAYE0094 thiL nusB TRUE 0.971 16.000 0.191 1.000 N NA
 5749058 5749059 ABAYE0094 ABAYE0095 nusB ribH TRUE 0.981 4.000 0.467 1.000 N NA
 5749059 5749060 ABAYE0095 ABAYE0096 ribH ribB/A TRUE 0.999 12.000 0.409 0.003 Y NA
 5749060 5749061 ABAYE0096 ABAYE0097 ribB/A   FALSE 0.015 240.000 0.000 NA   NA
 5749062 5749063 ABAYE0098 ABAYE0099 serB   FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 5749063 5749064 ABAYE0099 ABAYE0100     FALSE 0.048 254.000 0.118 NA   NA
 5749066 5749067 ABAYE0102 ABAYE0103 pncB rhdA FALSE 0.137 145.000 0.041 1.000 N NA
 5749067 5749068 ABAYE0103 ABAYE0104 rhdA psd TRUE 0.892 -3.000 0.056 1.000 N NA
 5749068 5749069 ABAYE0104 ABAYE0105 psd   FALSE 0.019 219.000 0.000 NA   NA
 5749070 5749071 ABAYE0106 ABAYE0107 phoR phoB TRUE 0.999 10.000 0.437 0.013 Y NA
 5749071 5749072 ABAYE0107 ABAYE0108 phoB   FALSE 0.050 256.000 0.000 1.000 Y NA
 5749074 5749075 ABAYE0110 ABAYE0111     TRUE 0.603 89.000 0.143 1.000 N NA
 5749075 5749076 ABAYE0111 ABAYE0112     TRUE 0.974 28.000 0.667 NA   NA
 5749076 5749077 ABAYE0112 ABAYE0113     TRUE 0.989 14.000 0.500 NA   NA
 5749077 5749078 ABAYE0113 ABAYE0115     TRUE 0.774 39.000 0.017 NA   NA
 5749079 5749080 ABAYE0116 ABAYE0117 gshA dsbB TRUE 0.947 15.000 0.047 1.000 N NA
 5749080 5749081 ABAYE0117 ABAYE0118 dsbB   FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   NA
 5749081 5749082 ABAYE0118 ABAYE0119     TRUE 0.918 12.000 0.000 NA   NA
 5749082 5749083 ABAYE0119 ABAYE0120     TRUE 0.846 22.000 0.000 NA   NA
 5749083 5749084 ABAYE0120 ABAYE0121     TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 5749084 5749085 ABAYE0121 ABAYE0122     TRUE 0.731 31.000 0.000 NA   NA
 5749085 5749086 ABAYE0122 ABAYE0123     FALSE 0.303 98.000 0.000 NA   NA
 5749088 5749089 ABAYE0125 ABAYE0126   parE TRUE 0.912 15.000 0.000 NA   NA
 5749090 5749091 ABAYE0127 ABAYE0128 allA alc TRUE 0.981 -24.000 0.667 1.000 Y NA
 5749093 5749094 ABAYE0130 ABAYE0131     FALSE 0.106 123.000 0.000 NA N NA
 5749094 5749095 ABAYE0131 ABAYE0132     TRUE 0.961 25.000 0.100 0.061   NA
 5749095 5749096 ABAYE0132 ABAYE0133     TRUE 0.977 -3.000 0.567 NA   NA
 5749096 5749097 ABAYE0133 ABAYE0134     TRUE 0.700 46.000 0.016 NA   NA
 5749098 5749099 ABAYE0135 ABAYE0136     FALSE 0.071 153.000 0.000 NA   NA
 5749099 5749100 ABAYE0136 ABAYE0137     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5749100 5749101 ABAYE0137 ABAYE0138   dsbD TRUE 0.803 26.000 0.000 NA   NA
 5749102 5749103 ABAYE0139 ABAYE0140   est FALSE 0.127 176.000 0.182 NA N NA
 5749105 5749106 ABAYE0142 ABAYE0143   crc FALSE 0.006 456.000 0.008 1.000 N NA
 5749108 5749109 ABAYE0145 ABAYE0146     FALSE 0.023 208.000 0.000 NA   NA
 5749110 5749111 ABAYE0147 ABAYE0148 gshB murG FALSE 0.015 238.000 0.005 1.000 N NA
 5749111 5749112 ABAYE0148 ABAYE0149 murG murC TRUE 0.984 12.000 0.005 1.000 Y NA
 5749112 5749113 ABAYE0149 ABAYE0150 murC ddlB TRUE 0.987 38.000 0.008 0.005 Y NA
 5749113 5749114 ABAYE0150 ABAYE0151 ddlB ftsQ TRUE 0.994 3.000 0.410 NA Y NA
 5749114 5749115 ABAYE0151 ABAYE0152 ftsQ ftsA FALSE 0.482 61.000 0.007 NA N NA
 5749115 5749116 ABAYE0152 ABAYE0153 ftsA ftsZ FALSE 0.236 165.000 0.005 1.000 Y NA
 5749116 5749117 ABAYE0153 ABAYE0154 ftsZ lpxC FALSE 0.482 111.000 0.149 1.000 N NA
 5749119 5749120 ABAYE0156 ABAYE0157   aceE FALSE 0.011 251.000 0.000 1.000   NA
 5749120 5749121 ABAYE0157 ABAYE0158 aceE aceF TRUE 0.990 3.000 0.191 1.000 Y NA
 5749121 5749122 ABAYE0158 ABAYEmisc_RNA_1 aceF   FALSE 0.006 458.000 0.000 NA   NA
 5749122 5749123 ABAYEmisc_RNA_1 ABAYE0161     FALSE 0.369 76.000 0.000 NA   NA
 5749124 5749125 ABAYE0162 ABAYE0163     FALSE 0.007 376.000 0.000 NA   NA
 5749126 5749127 ABAYE0164 ABAYE0165     FALSE 0.329 92.000 0.000 NA   NA
 5749127 5749128 ABAYE0165 ABAYE0166   guaB FALSE 0.116 136.000 0.000 NA   NA
 5749128 5749129 ABAYE0166 ABAYE0167 guaB glmM FALSE 0.068 150.000 0.004 1.000 N NA
 5749129 5749130 ABAYE0167 ABAYE0168 glmM pdxH TRUE 0.917 11.000 0.006 1.000 N NA
 5749130 5749131 ABAYE0168 ABAYE0169 pdxH recJ TRUE 0.877 1.000 0.006 1.000 N NA
 5749133 5749134 ABAYE0171 ABAYE0173 prfB   FALSE 0.023 200.000 0.004 1.000 N NA
 5749134 5749135 ABAYE0173 ABAYE0174   xenB TRUE 0.836 29.000 0.041 1.000 N NA
 5749135 5749136 ABAYE0174 ABAYE0175 xenB kdtA FALSE 0.021 169.000 0.000 1.000 N NA
 5749136 5749137 ABAYE0175 ABAYE0176 kdtA   TRUE 0.917 -3.000 0.041 NA   NA
 5749138 5749139 ABAYE0177 ABAYE0178     FALSE 0.562 113.000 0.167 NA   NA
 5749143 5749144 ABAYE0182 ABAYE0183   msuE TRUE 0.934 25.000 0.095 1.000   NA
 5749146 5749147 ABAYE0185 ABAYE0186     FALSE 0.006 395.000 0.000 NA   NA
 5749148 5749149 ABAYE0187 ABAYE0188     TRUE 0.869 -19.000 0.062 NA   NA
 5749149 5749150 ABAYE0188 ABAYE0189     FALSE 0.046 170.000 0.000 NA   NA
 5749150 5749151 ABAYE0189 ABAYE0190     FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   NA
 5749152 5749153 ABAYE0191 ABAYE0192     FALSE 0.004 845.000 0.000 NA   NA
 5749153 5749154 ABAYE0192 ABAYE0193     TRUE 0.806 75.000 0.000 0.022   NA
 5749157 5749158 ABAYE0196 ABAYE0197     TRUE 0.944 4.000 0.065 1.000 N NA
 5749158 5749159 ABAYE0197 ABAYE0198     FALSE 0.414 65.000 0.000 NA   NA
 5749159 5749160 ABAYE0198 ABAYE0199   glpM FALSE 0.480 53.000 0.000 NA   NA
 5749162 5749163 ABAYE0201 ABAYE0202     FALSE 0.151 147.000 0.014 NA   NA
 5749163 5749164 ABAYE0202 ABAYE0203   ssb FALSE 0.569 52.000 0.014 NA N NA
 5749165 5749166 ABAYE0204 ABAYE0205     TRUE 0.977 -3.000 0.574 NA   NA
 5749167 5749168 ABAYE0206 ABAYE0207   gabP FALSE 0.007 306.000 0.000 1.000   NA
 5749170 5749171 ABAYE0209 ABAYE0210 gabT gabD TRUE 0.968 -3.000 0.529 1.000 N NA
 5749172 5749173 ABAYE0211 ABAYE0212     TRUE 0.718 21.000 0.000 1.000 N NA
 5749174 5749175 ABAYE0213 ABAYE0214     FALSE 0.006 401.000 0.000 NA   NA
 5749175 5749176 ABAYE0214 ABAYE0215     TRUE 0.939 -22.000 0.357 NA   NA
 5749176 5749177 ABAYE0215 ABAYE0216     TRUE 0.761 9.000 0.000 0.094   NA
 5749178 5749179 ABAYEtRNA72 ABAYE0217     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 5749182 5749183 ABAYE0220 ABAYE0221     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5749184 5749185 ABAYE0222 ABAYE0223     FALSE 0.381 112.000 0.074 1.000 N NA
 5749186 5749187 ABAYE0224 ABAYE0225     FALSE 0.020 216.000 0.000 NA   NA
 5749190 5749191 ABAYE0228 ABAYE0229     FALSE 0.079 148.000 0.000 NA   NA
 5749191 5749192 ABAYE0229 ABAYE0230     TRUE 0.905 16.000 0.000 NA   NA
 5749199 5749200 ABAYE0236 ABAYE0237     FALSE 0.160 97.000 0.000 1.000 N NA
 5749200 5749201 ABAYE0237 ABAYE0238     FALSE 0.540 46.000 0.000 NA   NA
 5749202 5749203 ABAYE0240 ABAYE0241 aqpZ   FALSE 0.060 133.000 0.000 1.000 N NA
 5749206 5749207 ABAYE0244 ABAYE0245     TRUE 0.948 13.000 0.010 1.000   NA
 5749207 5749208 ABAYE0245 ABAYE0246     TRUE 0.912 22.000 0.010 NA   NA
 5749211 5749212 ABAYE0250 ABAYE0251 hisA   FALSE 0.277 95.000 0.000 1.000   NA
 5749212 5749213 ABAYE0251 ABAYE0252     FALSE 0.296 87.000 0.000 1.000   NA
 5749213 5749214 ABAYE0252 ABAYE0253   hisH FALSE 0.171 136.000 0.007 1.000   NA
 5749214 5749215 ABAYE0253 ABAYE0254 hisH hisB TRUE 0.998 0.000 0.231 0.004 Y NA
 5749216 5749217 ABAYE0255 ABAYEtRNA3     FALSE 0.261 106.000 0.000 NA   NA
 5749217 5749218 ABAYEtRNA3 ABAYEtRNA4     FALSE 0.150 127.000 0.000 NA   NA
 5749219 5749220 ABAYE0256 ABAYE0257     FALSE 0.231 131.000 0.020 1.000   NA
 5749220 5749221 ABAYE0257 ABAYE0258   envZ FALSE 0.013 192.000 0.000 1.000 N NA
 5749221 5749222 ABAYE0258 ABAYE0259 envZ ompR TRUE 0.990 18.000 0.194 1.000 Y NA
 5749223 5749224 ABAYE0261 ABAYE0262     FALSE 0.004 290.000 0.000 1.000 N NA
 5749225 5749226 ABAYE0263 ABAYE0264 acr1 metY FALSE 0.009 274.000 0.000 1.000   NA
 5749227 5749228 ABAYE0265 ABAYE0266     FALSE 0.035 179.000 0.000 NA   NA
 5749230 5749231 ABAYE0268 ABAYE0269   czcC TRUE 0.928 55.000 1.000 NA   NA
 5749231 5749232 ABAYE0269 ABAYE0270 czcC czcB TRUE 0.957 -42.000 0.143 NA Y NA
 5749232 5749233 ABAYE0270 ABAYE0271 czcB czcA TRUE 0.894 -10.000 0.143 1.000 N NA
 5749233 5749234 ABAYE0271 ABAYE0272 czcA czcD TRUE 0.961 133.000 0.667 0.003 Y NA
 5749237 5749238 ABAYEtRNA70 ABAYEtRNA69     TRUE 0.761 29.000 0.000 NA   NA
 5749238 5749239 ABAYEtRNA69 ABAYE0275     FALSE 0.120 135.000 0.000 NA   NA
 5749239 5749240 ABAYE0275 ABAYE0276     FALSE 0.566 44.000 0.000 NA   NA
 5749240 5749241 ABAYE0276 ABAYEtRNA68     FALSE 0.178 122.000 0.000 NA   NA
 5749241 5749242 ABAYEtRNA68 ABAYEtRNA67     TRUE 0.803 26.000 0.000 NA   NA
 5749242 5749243 ABAYEtRNA67 ABAYE0277   gltX FALSE 0.439 58.000 0.000 NA   NA
 5749243 5749244 ABAYE0277 ABAYE0278 gltX   FALSE 0.285 117.000 0.003 NA   NA
 5749245 5749246 ABAYE0279 ABAYE0280 sbp mraW FALSE 0.008 223.000 0.000 1.000 N NA
 5749246 5749247 ABAYE0280 ABAYE0281 mraW ftsL TRUE 0.961 0.000 0.229 1.000 N NA
 5749247 5749248 ABAYE0281 ABAYE0282 ftsL ftsI TRUE 0.930 12.000 0.014 1.000 N NA
 5749248 5749249 ABAYE0282 ABAYE0283 ftsI murE TRUE 0.980 4.000 0.007 1.000 Y NA
 5749249 5749250 ABAYE0283 ABAYE0284 murE murF TRUE 0.999 9.000 0.163 0.003 Y NA
 5749250 5749251 ABAYE0284 ABAYE0285 murF mraY TRUE 0.998 1.000 0.163 0.005 Y NA
 5749251 5749252 ABAYE0285 ABAYE0286 mraY   FALSE 0.427 61.000 0.000 NA   NA
 5749252 5749253 ABAYE0286 ABAYE0287   rrm TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 5749255 5749256 ABAYE0290 ABAYE0291     TRUE 0.995 0.000 0.791 NA Y NA
 5749256 5749257 ABAYE0291 ABAYE0292     TRUE 0.992 -3.000 0.721 NA Y NA
 5749257 5749258 ABAYE0292 ABAYE0293     TRUE 0.997 8.000 0.782 NA Y NA
 5749258 5749259 ABAYE0293 ABAYE0294     TRUE 0.953 63.000 0.706 NA Y NA
 5749259 5749260 ABAYE0294 ABAYE0295   aroK TRUE 0.908 39.000 0.430 1.000 N NA
 5749260 5749261 ABAYE0295 ABAYE0296 aroK aroB TRUE 0.976 29.000 0.200 1.000 Y NA
 5749261 5749262 ABAYE0296 ABAYE0297 aroB   TRUE 0.941 16.000 0.005 NA   NA
 5749262 5749263 ABAYE0297 ABAYE0298   gltB FALSE 0.006 455.000 0.000 NA   NA
 5749263 5749264 ABAYE0298 ABAYE0299 gltB gltD TRUE 0.989 70.000 0.272 0.001 Y NA
 5749264 5749265 ABAYE0299 ABAYE0300 gltD   FALSE 0.128 167.000 0.061 NA   NA
 5749265 5749266 ABAYE0300 ABAYE0301     FALSE 0.232 131.000 0.010 NA   NA
 5749266 5749267 ABAYE0301 ABAYE0302     TRUE 0.929 22.000 0.036 NA   NA
 5749267 5749268 ABAYE0302 ABAYE0303     TRUE 0.951 -6.000 0.250 NA   NA
 5749268 5749269 ABAYE0303 ABAYE0304     FALSE 0.007 346.000 0.000 NA   NA
 5749269 5749270 ABAYE0304 ABAYE0306     FALSE 0.008 245.000 0.000 NA N NA
 5749271 5749272 ABAYE0307 ABAYE0308 bfrB   FALSE 0.071 284.000 0.026 NA Y NA
 5749272 5749273 ABAYE0308 ABAYE0309     FALSE 0.039 195.000 0.017 NA N NA
 5749273 5749274 ABAYE0309 ABAYE0310     FALSE 0.279 121.000 0.035 NA N NA
 5749274 5749275 ABAYE0310 ABAYE0311   rpoZ FALSE 0.088 209.000 0.000 1.000 Y NA
 5749275 5749276 ABAYE0311 ABAYE0312 rpoZ gmk TRUE 0.784 73.000 0.410 1.000 N NA
 5749277 5749278 ABAYE0313 ABAYE0314 ispH   FALSE 0.062 170.000 0.014 NA N NA
 5749278 5749279 ABAYE0314 ABAYE0315     TRUE 0.972 -6.000 0.091 NA Y NA
 5749279 5749280 ABAYE0315 ABAYE0316   comB TRUE 0.982 1.000 0.429 NA   NA
 5749280 5749281 ABAYE0316 ABAYE0317 comB   TRUE 0.979 -3.000 0.667 NA   NA
 5749281 5749282 ABAYE0317 ABAYE0318     TRUE 0.979 0.000 0.400 NA   NA
 5749282 5749283 ABAYE0318 ABAYE0319   comE TRUE 0.988 11.000 0.400 NA   NA
 5749283 5749284 ABAYE0319 ABAYE0320 comE comF TRUE 0.990 -9.000 0.000 0.004 Y NA
 5749284 5749285 ABAYE0320 ABAYE0321 comF rpsP FALSE 0.037 147.000 0.000 1.000 N NA
 5749285 5749286 ABAYE0321 ABAYE0322 rpsP rimM TRUE 0.998 20.000 0.380 0.018 Y NA
 5749286 5749287 ABAYE0322 ABAYE0323 rimM trmD TRUE 0.968 46.000 0.687 1.000 Y NA
 5749287 5749288 ABAYE0323 ABAYE0324 trmD rplS FALSE 0.353 208.000 0.597 1.000 Y NA
 5749289 5749290 ABAYE0325 ABAYE0326   lifO FALSE 0.587 82.000 0.067 1.000   NA
 5749291 5749292 ABAYE0327 ABAYE0328 truB   TRUE 0.844 26.000 0.003 1.000   NA
 5749292 5749293 ABAYE0328 ABAYE0329     FALSE 0.042 210.000 0.023 1.000   NA
 5749294 5749295 ABAYE0330 ABAYE0331     TRUE 0.883 91.000 1.000 NA   NA
 5749295 5749296 ABAYE0331 ABAYE0332   serA FALSE 0.445 99.000 0.011 NA   NA
 5749297 5749298 ABAYE0333 ABAYE0334     TRUE 0.599 87.000 0.065 NA   NA
 5749299 5749300 ABAYE0335 ABAYE0336   mdaB TRUE 0.950 -13.000 0.123 0.051   NA
 5749301 5749302 ABAYE0337 ABAYE0338   mdfA FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 5749303 5749304 ABAYE0339 ABAYE0340   sodC FALSE 0.029 193.000 0.000 NA   NA
 5749304 5749305 ABAYE0340 ABAYE0342 sodC   FALSE 0.388 74.000 0.000 NA   NA
 5749305 5749306 ABAYE0342 ABAYE0343     FALSE 0.353 123.000 0.048 NA   NA
 5749307 5749308 ABAYE0344 ABAYE0345     FALSE 0.439 122.000 0.100 NA   NA
 5749309 5749310 ABAYE0346 ABAYE0347     TRUE 0.978 7.000 0.167 NA   NA
 5749311 5749312 ABAYE0348 ABAYE0349     FALSE 0.006 414.000 0.000 NA   NA
 5749312 5749313 ABAYE0349 ABAYE0351   gdh FALSE 0.017 1036.000 0.000 1.000 Y NA
 5749313 5749314 ABAYE0351 ABAYE0352 gdh astC FALSE 0.292 145.000 0.000 1.000 Y NA
 5749314 5749315 ABAYE0352 ABAYE0353 astC astA TRUE 0.986 19.000 0.105 1.000 Y NA
 5749315 5749316 ABAYE0353 ABAYE0354 astA astD TRUE 0.976 0.000 0.500 1.000 N NA
 5749316 5749317 ABAYE0354 ABAYE0355 astD astB TRUE 0.935 18.000 0.053 1.000 N NA
 5749317 5749318 ABAYE0355 ABAYE0356 astB astE TRUE 0.993 13.000 0.213 1.000 Y NA
 5749320 5749321 ABAYE0358 ABAYE0359     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 5749322 5749323 ABAYE0360 ABAYE0361     TRUE 0.876 95.000 1.000 NA   NA
 5749323 5749324 ABAYE0361 ABAYE0362     FALSE 0.076 149.000 0.000 NA   NA
 5749325 5749326 ABAYE0363 ABAYE0364     TRUE 0.666 36.000 0.000 NA   NA
 5749327 5749328 ABAYE0365 ABAYE0366     TRUE 0.983 5.000 0.300 NA   NA
 5749328 5749329 ABAYE0366 ABAYE0367   glyS FALSE 0.566 44.000 0.000 NA   NA
 5749329 5749330 ABAYE0367 ABAYE0368 glyS glyQ TRUE 0.999 0.000 0.616 0.001 Y NA
 5749331 5749332 ABAYE0369 ABAYE0370     FALSE 0.035 173.000 0.000 1.000   NA
 5749332 5749333 ABAYE0370 ABAYE0371     TRUE 0.985 3.000 0.488 NA   NA
 5749333 5749334 ABAYE0371 ABAYE0372     FALSE 0.130 133.000 0.000 NA   NA
 5749339 5749340 ABAYE0377 ABAYE0378 aroE hemF FALSE 0.070 174.000 0.052 1.000 N NA
 5749340 5749341 ABAYE0378 ABAYE0379 hemF ribA TRUE 0.792 74.000 0.010 1.000 Y NA
 5749342 5749343 ABAYE0381 ABAYE0382 dxs suhB FALSE 0.166 123.000 0.005 1.000 N NA
 5749343 5749344 ABAYE0382 ABAYE0383 suhB   FALSE 0.003 398.000 0.000 1.000 N NA
 5749344 5749345 ABAYE0383 ABAYE0385   ttg2A FALSE 0.002 404.000 0.000 0.079 N NA
 5749345 5749346 ABAYE0385 ABAYE0386 ttg2A ttg2B TRUE 0.989 -3.000 0.466 NA Y NA
 5749346 5749347 ABAYE0386 ABAYE0387 ttg2B ttg2C TRUE 0.918 0.000 0.007 NA   NA
 5749347 5749348 ABAYE0387 ABAYE0388 ttg2C   TRUE 0.972 9.000 0.087 NA   NA
 5749348 5749349 ABAYE0388 ABAYE0389     TRUE 0.990 12.000 0.538 NA   NA
 5749351 5749352 ABAYE0391 ABAYE0392     TRUE 0.912 15.000 0.000 NA   NA
 5749353 5749354 ABAYE0393 ABAYE0394   recG TRUE 0.799 -13.000 0.007 1.000   NA
 5749355 5749356 ABAYE0395 ABAYE0396     TRUE 0.850 53.000 0.286 NA   NA
 5749358 5749359 ABAYE0398 ABAYE0399 tesB   FALSE 0.141 134.000 0.013 1.000 N NA
 5749360 5749361 ABAYE0400 ABAYE0401     FALSE 0.243 124.000 0.004 NA   NA
 5749361 5749362 ABAYE0401 ABAYE0402     FALSE 0.344 109.000 0.004 NA   NA
 5749362 5749363 ABAYE0402 ABAYE0403     FALSE 0.504 77.000 0.038 NA N NA
 5749363 5749364 ABAYE0403 ABAYE0404     FALSE 0.087 146.000 0.000 NA   NA
 5749364 5749365 ABAYE0404 ABAYE0405     TRUE 0.712 44.000 0.011 NA   NA
 5749366 5749367 ABAYE0406 ABAYE0407   rpsJ FALSE 0.007 237.000 0.000 1.000 N NA
 5749367 5749368 ABAYE0407 ABAYE0408 rpsJ rplC TRUE 0.986 58.000 0.749 0.023 Y NA
 5749368 5749369 ABAYE0408 ABAYE0409 rplC rplD TRUE 0.999 12.000 0.958 0.017 Y NA
 5749369 5749370 ABAYE0409 ABAYE0410 rplD rplW TRUE 0.993 -3.000 0.904 1.000 Y NA
 5749370 5749371 ABAYE0410 ABAYE0411 rplW rplB TRUE 0.997 12.000 0.915 1.000 Y NA
 5749371 5749372 ABAYE0411 ABAYE0412 rplB rpsS TRUE 0.999 14.000 0.894 0.023 Y NA
 5749372 5749373 ABAYE0412 ABAYE0413 rpsS rplV TRUE 0.999 9.000 0.968 0.023 Y NA
 5749373 5749374 ABAYE0413 ABAYE0414 rplV rpsC TRUE 0.999 2.000 0.905 0.023 Y NA
 5749374 5749375 ABAYE0414 ABAYE0415 rpsC rplP TRUE 0.999 4.000 0.894 0.023 Y NA
 5749375 5749376 ABAYE0415 ABAYE0416 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.868 0.017 Y NA
 5749376 5749377 ABAYE0416 ABAYE0417 rpmC rpsQ TRUE 0.998 -3.000 0.911 0.017 Y NA
 5749377 5749378 ABAYE0417 ABAYE0418 rpsQ rplN TRUE 0.979 93.000 0.850 0.023 Y NA
 5749378 5749379 ABAYE0418 ABAYE0419 rplN rplX TRUE 0.999 10.000 0.958 0.023 Y NA
 5749379 5749380 ABAYE0419 ABAYE0420 rplX rplE TRUE 0.999 16.000 0.894 0.017 Y NA
 5749380 5749381 ABAYE0420 ABAYE0421 rplE rpsN TRUE 0.999 10.000 0.435 0.017 Y NA
 5749381 5749382 ABAYE0421 ABAYE0422 rpsN rpsH TRUE 0.999 12.000 0.425 0.017 Y NA
 5749382 5749383 ABAYE0422 ABAYE0423 rpsH rplF TRUE 0.999 14.000 0.956 0.017 Y NA
 5749383 5749384 ABAYE0423 ABAYE0424 rplF rplR TRUE 0.999 15.000 0.886 0.017 Y NA
 5749384 5749385 ABAYE0424 ABAYE0425 rplR rpsE TRUE 0.999 3.000 0.973 0.023 Y NA
 5749385 5749386 ABAYE0425 ABAYE0426 rpsE rpmD TRUE 0.999 7.000 0.782 0.023 Y NA
 5749386 5749387 ABAYE0426 ABAYE0427 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.677 0.003 Y NA
 5749387 5749388 ABAYE0427 ABAYE0428 rplO secY TRUE 0.990 7.000 0.873 1.000 N NA
 5749388 5749389 ABAYE0428 ABAYE0429 secY rpmJ TRUE 0.898 21.000 0.033 1.000 N NA
 5749389 5749390 ABAYE0429 ABAYE0430 rpmJ rpsM TRUE 0.942 108.000 0.166 0.017 Y NA
 5749390 5749391 ABAYE0430 ABAYE0431 rpsM rpsK TRUE 0.997 20.000 0.205 0.017 Y NA
 5749391 5749392 ABAYE0431 ABAYE0432 rpsK rpsD TRUE 0.999 13.000 0.575 0.023 Y NA
 5749392 5749393 ABAYE0432 ABAYE0433 rpsD rpoA TRUE 0.980 18.000 0.497 1.000 N NA
 5749393 5749394 ABAYE0433 ABAYE0434 rpoA rplQ TRUE 0.986 19.000 0.883 1.000 N NA
 5749394 5749395 ABAYE0434 ABAYE0435 rplQ   FALSE 0.029 181.000 0.003 1.000 N NA
 5749397 5749398 ABAYE0437 ABAYE0438     TRUE 0.947 7.000 0.008 NA   NA
 5749398 5749399 ABAYE0438 ABAYE0439     FALSE 0.004 770.000 0.000 NA   NA
 5749399 5749400 ABAYE0439 ABAYE0440     FALSE 0.359 78.000 0.000 NA   NA
 5749400 5749401 ABAYE0440 ABAYE0441     FALSE 0.031 188.000 0.000 NA   NA
 5749402 5749403 ABAYE0442 ABAYE0443     TRUE 0.962 12.000 0.030 NA   NA
 5749403 5749404 ABAYE0443 ABAYE0444   prlC TRUE 0.951 23.000 0.106 NA   NA
 5749404 5749405 ABAYE0444 ABAYE0445 prlC rnr FALSE 0.057 134.000 0.000 1.000 N NA
 5749406 5749407 ABAYEtRNA5 ABAYEtRNA6     TRUE 0.916 11.000 0.000 NA   NA
 5749407 5749408 ABAYEtRNA6 ABAYEtRNA7     TRUE 0.618 40.000 0.000 NA   NA
 5749408 5749409 ABAYEtRNA7 ABAYE0447     FALSE 0.252 108.000 0.000 NA   NA
 5749413 5749414 ABAYE0450 ABAYE0451     TRUE 0.763 40.000 0.016 NA   NA
 5749419 5749420 ABAYE0456 ABAYE0457 xpt   TRUE 0.945 4.000 0.015 NA   NA
 5749420 5749421 ABAYE0457 ABAYE0458     FALSE 0.212 158.000 0.125 NA   NA
 5749423 5749424 ABAYE0460 ABAYE0461   phoL TRUE 0.987 10.000 0.361 NA   NA
 5749424 5749425 ABAYE0461 ABAYE0462 phoL   TRUE 0.852 38.000 0.161 1.000 N NA
 5749426 5749427 ABAYE0463 ABAYE0464     FALSE 0.481 58.000 0.014 1.000 N NA
 5749427 5749428 ABAYE0464 ABAYE0465   mdh FALSE 0.009 212.000 0.000 1.000 N NA
 5749428 5749429 ABAYE0465 ABAYE0466 mdh   FALSE 0.102 164.000 0.017 NA   NA
 5749430 5749431 ABAYE0467 ABAYE0468     TRUE 0.600 68.000 0.026 NA   NA
 5749432 5749433 ABAYE0469 ABAYE0470   pssA TRUE 0.713 42.000 0.013 1.000   NA
 5749433 5749434 ABAYE0470 ABAYE0471 pssA   TRUE 0.948 7.000 0.009 NA   NA
 5749434 5749435 ABAYE0471 ABAYE_16s_5     FALSE 0.005 489.000 0.000 NA   NA
 5749435 5749436 ABAYE_16s_5 ABAYEtRNA9     FALSE 0.209 115.000 0.000 NA   NA
 5749436 5749437 ABAYEtRNA9 ABAYEtRNA10     FALSE 0.452 56.000 0.000 NA   NA
 5749437 5749438 ABAYEtRNA10 ABAYE_23s_5     FALSE 0.007 341.000 0.000 NA   NA
 5749438 5749439 ABAYE_23s_5 ABAYE_5s_5     FALSE 0.038 176.000 0.000 NA   NA
 5749439 5749440 ABAYE_5s_5 ABAYE0474     FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 5749440 5749441 ABAYE0474 ABAYE0475     TRUE 0.699 -19.000 0.000 NA   NA
 5749441 5749442 ABAYE0475 ABAYE0476     FALSE 0.363 77.000 0.000 NA   NA
 5749444 5749445 ABAYE0478 ABAYE0479     TRUE 0.983 6.000 0.276 NA   NA
 5749445 5749446 ABAYE0479 ABAYE0480     TRUE 0.995 11.000 0.457 1.000 Y NA
 5749446 5749447 ABAYE0480 ABAYE0481     TRUE 0.964 43.000 0.488 1.000 Y NA
 5749447 5749448 ABAYE0481 ABAYE0482     TRUE 0.995 11.000 0.390 1.000 Y NA
 5749448 5749449 ABAYE0482 ABAYE0483     TRUE 0.991 19.000 0.476 0.090 Y NA
 5749450 5749451 ABAYE0484 ABAYE0485   sspB TRUE 0.940 18.000 0.014 NA   NA
 5749451 5749452 ABAYE0485 ABAYE0486 sspB sspA TRUE 0.993 7.000 0.918 NA   NA
 5749452 5749453 ABAYE0486 ABAYE0487 sspA rpsI FALSE 0.058 171.000 0.011 NA N NA
 5749453 5749454 ABAYE0487 ABAYE0488 rpsI rplM TRUE 0.999 13.000 0.979 0.017 Y NA
 5749455 5749456 ABAYE0489 ABAYE0490 pdxA ksgA TRUE 0.954 24.000 0.254 1.000 N NA
 5749456 5749457 ABAYE0490 ABAYE0491 ksgA apaH TRUE 0.935 1.000 0.031 1.000   NA
 5749458 5749459 ABAYE0492 ABAYE0493     FALSE 0.355 79.000 0.000 NA   NA
 5749459 5749460 ABAYE0493 ABAYE0494     TRUE 0.978 11.000 0.130 NA   NA
 5749460 5749461 ABAYE0494 ABAYE0495   hflX TRUE 0.689 43.000 0.004 NA   NA
 5749465 5749466 ABAYE0500 ABAYE0501     TRUE 0.988 15.000 0.548 NA N NA
 5749466 5749467 ABAYE0501 ABAYE0502     TRUE 0.989 6.000 0.609 NA   NA
 5749468 5749469 ABAYE_16s_6 ABAYEtRNA11     FALSE 0.209 115.000 0.000 NA   NA
 5749469 5749470 ABAYEtRNA11 ABAYEtRNA12     FALSE 0.452 56.000 0.000 NA   NA
 5749470 5749471 ABAYEtRNA12 ABAYE_23s_6     FALSE 0.007 341.000 0.000 NA   NA
 5749471 5749472 ABAYE_23s_6 ABAYE_5s_6     FALSE 0.038 176.000 0.000 NA   NA
 5749473 5749474 ABAYE0505 ABAYE0506     FALSE 0.338 87.000 0.000 NA   NA
 5749474 5749475 ABAYE0506 ABAYE0507     FALSE 0.008 340.000 0.000 NA   NA
 5749477 5749478 ABAYE0509 ABAYE0510     TRUE 0.808 75.000 0.000 0.021   NA
 5749479 5749480 ABAYE0511 ABAYE0512   thi3 TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5749480 5749481 ABAYE0512 ABAYE0513 thi3   TRUE 0.935 2.000 0.012 NA   NA
 5749482 5749483 ABAYE0514 ABAYE0515     TRUE 0.781 36.000 0.007 NA   NA
 5749485 5749486 ABAYE0517 ABAYE0518     TRUE 0.862 -6.000 0.010 NA   NA
 5749486 5749487 ABAYE0518 ABAYE0519     TRUE 0.780 -43.000 0.013 NA   NA
 5749487 5749488 ABAYE0519 ABAYE0520     TRUE 0.915 35.000 0.209 NA   NA
 5749490 5749491 ABAYE0522 ABAYE0523   radC TRUE 0.830 62.000 0.333 NA   NA
 5749493 5749494 ABAYE0525 ABAYE0526 secF secD TRUE 0.999 9.000 0.235 0.001 Y NA
 5749494 5749495 ABAYE0526 ABAYE0527 secD   TRUE 0.917 52.000 0.125 NA Y NA
 5749495 5749496 ABAYE0527 ABAYE0528   tgt TRUE 0.699 99.000 0.348 NA N NA
 5749496 5749497 ABAYE0528 ABAYE0529 tgt   FALSE 0.038 176.000 0.000 NA   NA
 5749497 5749498 ABAYE0529 ABAYE0530     FALSE 0.338 87.000 0.000 NA   NA
 5749498 5749499 ABAYE0530 ABAYE0531   queA TRUE 0.689 34.000 0.000 NA   NA
 5749500 5749501 ABAYEtRNA13 ABAYE0532     FALSE 0.036 178.000 0.000 NA   NA
 5749502 5749503 ABAYE0533 ABAYE0534     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 5749503 5749504 ABAYE0534 ABAYE0535     TRUE 0.915 10.000 0.000 NA   NA
 5749504 5749505 ABAYE0535 ABAYE0536     TRUE 0.898 10.000 0.000 1.000   NA
 5749505 5749506 ABAYE0536 ABAYE0537     TRUE 0.728 -12.000 0.000 NA   NA
 5749506 5749507 ABAYE0537 ABAYE0538     TRUE 0.756 -7.000 0.000 NA   NA
 5749507 5749508 ABAYE0538 ABAYE0539     TRUE 0.736 -10.000 0.000 NA   NA
 5749508 5749509 ABAYE0539 ABAYE0540     TRUE 0.629 39.000 0.000 NA   NA
 5749509 5749510 ABAYE0540 ABAYE0541     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 5749510 5749511 ABAYE0541 ABAYE0542     FALSE 0.322 94.000 0.000 NA   NA
 5749513 5749514 ABAYE0544 ABAYE0545     FALSE 0.161 125.000 0.000 NA   NA
 5749514 5749515 ABAYE0545 ABAYE0546     FALSE 0.252 108.000 0.000 NA   NA
 5749515 5749516 ABAYE0546 ABAYE0547     TRUE 0.905 16.000 0.000 NA   NA
 5749517 5749518 ABAYE0548 ABAYE0549     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5749519 5749520 ABAYE0550 ABAYE0551     TRUE 0.652 -21.000 0.000 1.000   NA
 5749520 5749521 ABAYE0551 ABAYE0552     FALSE 0.142 130.000 0.000 NA   NA
 5749521 5749522 ABAYE0552 ABAYE0553     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5749522 5749523 ABAYE0553 ABAYE0554     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 5749523 5749524 ABAYE0554 ABAYE0555     FALSE 0.069 154.000 0.000 NA   NA
 5749524 5749525 ABAYE0555 ABAYE0556     FALSE 0.406 67.000 0.000 NA   NA
 5749525 5749526 ABAYE0556 ABAYE0557     TRUE 0.918 13.000 0.000 NA   NA
 5749526 5749527 ABAYE0557 ABAYE0558     FALSE 0.074 150.000 0.000 NA   NA
 5749527 5749528 ABAYE0558 ABAYE0559     TRUE 0.918 12.000 0.000 NA   NA
 5749528 5749529 ABAYE0559 ABAYE0560     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5749529 5749530 ABAYE0560 ABAYE0561     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 5749530 5749531 ABAYE0561 ABAYE0562     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 5749531 5749532 ABAYE0562 ABAYE0563     FALSE 0.392 73.000 0.000 NA   NA
 5749532 5749533 ABAYE0563 ABAYE0564     TRUE 0.962 -3.000 0.250 NA   NA
 5749533 5749534 ABAYE0564 ABAYE0565     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 5749534 5749535 ABAYE0565 ABAYE0566     TRUE 0.710 -15.000 0.000 NA   NA
 5749535 5749536 ABAYE0566 ABAYE0567     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 5749536 5749537 ABAYE0567 ABAYE0568     TRUE 0.743 -9.000 0.000 NA   NA
 5749537 5749538 ABAYE0568 ABAYE0569     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5749538 5749539 ABAYE0569 ABAYE0570     TRUE 0.939 53.000 0.000 0.002   NA
 5749539 5749540 ABAYE0570 ABAYE0571     TRUE 0.900 11.000 0.000 1.000   NA
 5749540 5749541 ABAYE0571 ABAYE0572     TRUE 0.674 32.000 0.000 1.000   NA
 5749542 5749543 ABAYE0573 ABAYE0574     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5749543 5749544 ABAYE0574 ABAYE0575     FALSE 0.004 1266.000 0.000 NA   NA
 5749544 5749545 ABAYE0575 ABAYE0576   glnE TRUE 0.796 69.000 0.007 1.000 Y NA
 5749545 5749546 ABAYE0576 ABAYE0577 glnE ilvE TRUE 0.960 13.000 0.077 1.000 N NA
 5749546 5749547 ABAYE0577 ABAYE0578 ilvE   FALSE 0.452 68.000 0.006 NA N NA
 5749547 5749548 ABAYE0578 ABAYE0579     TRUE 0.953 23.000 0.118 NA   NA
 5749548 5749549 ABAYE0579 ABAYE0580     TRUE 0.928 -3.000 0.064 NA   NA
 5749549 5749550 ABAYE0580 ABAYE0581     TRUE 0.873 -3.000 0.022 NA N NA
 5749550 5749551 ABAYE0581 ABAYE0582     TRUE 0.988 12.000 0.032 NA Y NA
 5749553 5749554 ABAYE0584 ABAYE0585     TRUE 0.746 30.000 0.000 NA   NA
 5749557 5749558 ABAYE0588 ABAYE0589 aspS   FALSE 0.067 171.000 0.003 NA   NA
 5749559 5749560 ABAYE0591 ABAYE0592     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA N NA
 5749563 5749564 ABAYE0595 ABAYE0596   acdA FALSE 0.164 119.000 0.000 1.000   NA
 5749564 5749565 ABAYE0596 ABAYE0597 acdA acdB TRUE 0.768 168.000 0.167 0.009 Y NA
 5749565 5749566 ABAYE0597 ABAYE0598 acdB   FALSE 0.010 290.000 0.000 NA   NA
 5749567 5749568 ABAYE0599 ABAYE0600 baeS baeR TRUE 0.994 20.000 0.764 1.000 Y NA
 5749569 5749570 ABAYE0601 ABAYE0602     FALSE 0.374 114.000 0.038 1.000   NA
 5749572 5749573 ABAYE0604 ABAYE0605     FALSE 0.532 73.000 0.016 1.000   NA
 5749573 5749574 ABAYE0605 ABAYE0606     FALSE 0.445 96.000 0.016 1.000   NA
 5749574 5749575 ABAYE0606 ABAYEmisc_RNA_3     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5749576 5749577 ABAYE0607 ABAYE0608 trpF trpB TRUE 0.999 2.000 0.415 0.002 Y NA
 5749577 5749578 ABAYE0608 ABAYE0609 trpB   TRUE 0.946 10.000 0.004 NA   NA
 5749578 5749579 ABAYE0609 ABAYE0610     TRUE 0.841 38.000 0.065 NA   NA
 5749581 5749582 ABAYE0612 ABAYE0613   trpA FALSE 0.006 245.000 0.000 1.000 N NA
 5749582 5749583 ABAYE0613 ABAYE0614 trpA accD TRUE 0.943 -3.000 0.204 1.000 N NA
 5749583 5749584 ABAYE0614 ABAYE0615 accD folC TRUE 0.936 -3.000 0.167 1.000 N NA
 5749584 5749585 ABAYE0615 ABAYE0616 folC   TRUE 0.893 -3.000 0.010 NA   NA
 5749586 5749587 ABAYE0617 ABAYE0618     TRUE 0.787 -3.000 0.000 1.000   NA
 5749587 5749588 ABAYE0618 ABAYE0619     FALSE 0.010 262.000 0.000 1.000   NA
 5749589 5749590 ABAYE0620 ABAYE0621 secA   FALSE 0.195 133.000 0.004 NA   NA
 5749591 5749592 ABAYE0622 ABAYE0623     FALSE 0.261 135.000 0.007 0.064   NA
 5749593 5749594 ABAYE0624 ABAYE0625     TRUE 0.959 13.000 0.020 NA   NA
 5749595 5749596 ABAYE0626 ABAYE0627     TRUE 0.993 16.000 1.000 NA   NA
 5749596 5749597 ABAYE0627 ABAYE0628     FALSE 0.352 135.000 0.125 NA   NA
 5749597 5749598 ABAYE0628 ABAYE0629     TRUE 0.994 21.000 0.682 1.000 Y NA
 5749598 5749599 ABAYE0629 ABAYE0630     FALSE 0.129 107.000 0.000 1.000 N NA
 5749600 5749601 ABAYE0631 ABAYE0632     FALSE 0.511 136.000 0.667 1.000 N NA
 5749601 5749602 ABAYE0632 ABAYE0633   gcd FALSE 0.087 174.000 0.083 1.000 N NA
 5749602 5749603 ABAYE0633 ABAYE0634 gcd cysI FALSE 0.174 167.000 0.083 0.061 N NA
 5749603 5749604 ABAYE0634 ABAYE0635 cysI   TRUE 0.890 -13.000 0.095 1.000   NA
 5749604 5749605 ABAYE0635 ABAYE0636     FALSE 0.304 83.000 0.000 1.000   NA
 5749606 5749607 ABAYE0637 ABAYE0638     TRUE 0.728 127.000 1.000 NA   NA
 5749607 5749608 ABAYE0638 ABAYE0639     TRUE 0.803 109.000 1.000 NA N NA
 5749610 5749611 ABAYE0642 ABAYE0643   lysP FALSE 0.014 245.000 0.000 NA   NA
 5749611 5749612 ABAYE0643 ABAYE0644 lysP rsmC TRUE 0.956 22.000 0.231 1.000 N NA
 5749612 5749613 ABAYE0644 ABAYE0645 rsmC   FALSE 0.560 63.000 0.049 1.000 N NA
 5749614 5749615 ABAYE0646 ABAYE0647 typA mscL FALSE 0.005 256.000 0.000 1.000 N NA
 5749615 5749616 ABAYE0647 ABAYE0648 mscL   FALSE 0.151 143.000 0.005 NA   NA
 5749617 5749618 ABAYE0649 ABAYE0650 ppiC mutM TRUE 0.901 20.000 0.004 1.000   NA
 5749619 5749620 ABAYE0651 ABAYE0653     FALSE 0.060 133.000 0.000 1.000 N NA
 5749620 5749621 ABAYE0653 ABAYE0654     TRUE 0.941 10.000 0.033 1.000 N NA
 5749621 5749622 ABAYE0654 ABAYE0655     TRUE 0.598 66.000 0.037 1.000   NA
 5749623 5749624 ABAYE0656 ABAYE0657     FALSE 0.028 183.000 0.000 1.000   NA
 5749624 5749625 ABAYE0657 ABAYE0658     FALSE 0.073 146.000 0.000 1.000   NA
 5749626 5749627 ABAYE0659 ABAYE0660     FALSE 0.093 144.000 0.000 NA   NA
 5749627 5749628 ABAYE0660 ABAYE0661     FALSE 0.332 91.000 0.000 NA   NA
 5749628 5749629 ABAYE0661 ABAYE0662     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 5749630 5749631 ABAYE0663 ABAYE0664 proS nolG FALSE 0.459 59.000 0.004 NA N NA
 5749631 5749632 ABAYE0664 ABAYE0665 nolG nolF TRUE 0.988 16.000 0.643 NA N NA
 5749632 5749633 ABAYE0665 ABAYE0666 nolF   TRUE 0.741 60.000 0.111 NA   NA
 5749634 5749635 ABAYE0667 ABAYE0668 pilG pilH TRUE 0.995 24.000 0.409 0.010   NA
 5749635 5749636 ABAYE0668 ABAYE0669 pilH pilI TRUE 0.806 61.000 0.281 1.000   NA
 5749636 5749637 ABAYE0669 ABAYE0670 pilI pilJ TRUE 1.000 11.000 0.817 0.001 Y NA
 5749637 5749638 ABAYE0670 ABAYE0671 pilJ   TRUE 0.947 147.000 0.542 0.001 Y NA
 5749638 5749639 ABAYE0671 ABAYE0672     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 5749639 5749640 ABAYE0672 ABAYE0674     FALSE 0.015 238.000 0.000 NA   NA
 5749640 5749641 ABAYE0674 ABAYE0675     TRUE 0.854 8.000 0.000 NA N NA
 5749642 5749643 ABAYE0676 ABAYE0677 dapE ecnB FALSE 0.223 126.000 0.007 1.000   NA
 5749643 5749644 ABAYE0677 ABAYE0678 ecnB   FALSE 0.499 99.000 0.034 NA   NA
 5749645 5749646 ABAYE0679 ABAYE0680     FALSE 0.172 151.000 0.048 NA   NA
 5749646 5749647 ABAYE0680 ABAYEtRNA14     FALSE 0.024 207.000 0.000 NA   NA
 5749647 5749648 ABAYEtRNA14 ABAYEtRNA15     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5749648 5749649 ABAYEtRNA15 ABAYEtRNA16     FALSE 0.516 48.000 0.000 NA   NA
 5749649 5749650 ABAYEtRNA16 ABAYEtRNA17     TRUE 0.846 22.000 0.000 NA   NA
 5749650 5749651 ABAYEtRNA17 ABAYEtRNA18     TRUE 0.618 40.000 0.000 NA   NA
 5749651 5749652 ABAYEtRNA18 ABAYEtRNA19     FALSE 0.406 67.000 0.000 NA   NA
 5749653 5749654 ABAYE0681 ABAYE0682     FALSE 0.150 127.000 0.000 NA   NA
 5749654 5749655 ABAYE0682 ABAYE0683     FALSE 0.173 158.000 0.074 NA   NA
 5749655 5749656 ABAYE0683 ABAYE0684     FALSE 0.489 101.000 0.037 NA   NA
 5749659 5749660 ABAYE0688 ABAYE0689     FALSE 0.291 100.000 0.000 NA   NA
 5749660 5749661 ABAYE0689 ABAYE0690     FALSE 0.156 169.000 0.133 1.000   NA
 5749661 5749662 ABAYE0690 ABAYE0691   tdcB FALSE 0.022 198.000 0.000 1.000   NA
 5749662 5749663 ABAYE0691 ABAYE0692 tdcB sbmA FALSE 0.007 237.000 0.000 1.000 N NA
 5749665 5749666 ABAYE0694 ABAYE0695     FALSE 0.344 84.000 0.000 NA   NA
 5749667 5749668 ABAYE0696 ABAYE0697   gatB FALSE 0.038 170.000 0.000 1.000   NA
 5749668 5749669 ABAYE0697 ABAYE0698 gatB gatA TRUE 0.999 0.000 0.502 0.002 Y NA
 5749669 5749670 ABAYE0698 ABAYE0699 gatA gatC TRUE 0.994 54.000 0.686 0.002 Y NA
 5749671 5749672 ABAYE0700 ABAYE0701 mreB mreC TRUE 0.979 17.000 0.392 1.000 N NA
 5749672 5749673 ABAYE0701 ABAYE0703 mreC mreD TRUE 0.997 -13.000 0.503 0.003 Y NA
 5749673 5749674 ABAYE0703 ABAYE0704 mreD   TRUE 0.923 -12.000 0.241 NA N NA
 5749674 5749675 ABAYE0704 ABAYE0705   cafA TRUE 0.678 102.000 0.339 NA N NA
 5749675 5749676 ABAYE0705 ABAYE0707 cafA   FALSE 0.158 140.000 0.004 NA   NA
 5749677 5749678 ABAYE0708 ABAYE0709 wax-dgaT   FALSE 0.064 171.000 0.005 1.000   NA
 5749680 5749681 ABAYE0711 ABAYE0712     FALSE 0.005 599.000 0.000 NA   NA
 5749683 5749684 ABAYE0714 ABAYE0715     FALSE 0.391 107.000 0.043 NA N NA
 5749685 5749686 ABAYE0716 ABAYE0717 uppP   FALSE 0.027 159.000 0.000 1.000 N NA
 5749686 5749687 ABAYE0717 ABAYE0718     FALSE 0.407 -67.000 0.000 1.000 N NA
 5749687 5749688 ABAYE0718 ABAYE0719   hchA FALSE 0.028 194.000 0.000 NA   NA
 5749689 5749690 ABAYEtRNA66 ABAYE0720   aroP FALSE 0.363 77.000 0.000 NA   NA
 5749691 5749692 ABAYE0721 ABAYE0722   ispA FALSE 0.060 159.000 0.000 NA   NA
 5749692 5749693 ABAYE0722 ABAYE0723 ispA   FALSE 0.431 60.000 0.000 NA   NA
 5749694 5749695 ABAYE0724 ABAYE0725     TRUE 0.991 29.000 0.906 NA Y NA
 5749695 5749696 ABAYE0725 ABAYE0726     FALSE 0.426 106.000 0.020 NA   NA
 5749696 5749697 ABAYE0726 ABAYE0727     FALSE 0.565 68.000 0.023 1.000   NA
 5749698 5749699 ABAYE0728 ABAYE0730     FALSE 0.005 543.000 0.000 NA   NA
 5749699 5749700 ABAYE0730 ABAYE0731   eptA FALSE 0.034 181.000 0.000 NA   NA
 5749700 5749701 ABAYE0731 ABAYE0732 eptA qseB TRUE 0.896 15.000 0.000 1.000   NA
 5749701 5749702 ABAYE0732 ABAYE0733 qseB qseC TRUE 0.993 26.000 1.000 1.000 Y NA
 5749703 5749704 ABAYE0734 ABAYE0735     FALSE 0.133 153.000 0.030 1.000   NA
 5749704 5749705 ABAYE0735 ABAYE0736     FALSE 0.005 273.000 0.000 1.000 N NA
 5749706 5749707 ABAYE0737 ABAYE0738     FALSE 0.285 122.000 0.020 1.000   NA
 5749707 5749708 ABAYE0738 ABAYE0739     FALSE 0.326 93.000 0.000 NA   NA
 5749710 5749711 ABAYE0741 ABAYE0742     TRUE 0.926 26.000 0.071 NA   NA
 5749711 5749712 ABAYE0742 ABAYE0743     FALSE 0.461 55.000 0.000 NA   NA
 5749713 5749714 ABAYE0744 ABAYE0745     TRUE 0.967 8.000 0.064 NA   NA
 5749714 5749715 ABAYE0745 ABAYE0746     FALSE 0.384 110.000 0.016 NA   NA
 5749715 5749716 ABAYE0746 ABAYE0747     TRUE 0.986 -3.000 0.500 0.044 N NA
 5749716 5749717 ABAYE0747 ABAYE0748     TRUE 0.967 13.000 0.107 1.000 N NA
 5749717 5749718 ABAYE0748 ABAYE0749     TRUE 0.924 25.000 0.071 1.000   NA
 5749718 5749719 ABAYE0749 ABAYE0750     FALSE 0.085 179.000 0.044 NA   NA
 5749719 5749720 ABAYE0750 ABAYE0751   ispB TRUE 0.924 9.000 0.005 NA N NA
 5749721 5749722 ABAYE0753 ABAYE0754 rplU rpmA TRUE 0.999 19.000 0.710 0.016 Y NA
 5749722 5749723 ABAYE0754 ABAYE0755 rpmA lolA FALSE 0.006 241.000 0.000 1.000 N NA
 5749723 5749724 ABAYE0755 ABAYE0756 lolA   FALSE 0.492 92.000 0.014 NA   NA
 5749724 5749725 ABAYE0756 ABAYE0757   serS FALSE 0.301 113.000 0.003 NA   NA
 5749725 5749726 ABAYE0757 ABAYE0758 serS cysG FALSE 0.487 68.000 0.028 1.000 N NA
 5749726 5749727 ABAYE0758 ABAYE0759 cysG   FALSE 0.196 77.000 0.000 1.000 N NA
 5749730 5749731 ABAYE0762 ABAYE0763     FALSE 0.006 251.000 0.000 1.000 N NA
 5749731 5749732 ABAYE0763 ABAYE0764     TRUE 0.990 2.000 0.909 NA   NA
 5749732 5749733 ABAYE0764 ABAYE0765   lipB FALSE 0.472 81.000 0.004 NA   NA
 5749733 5749734 ABAYE0765 ABAYE0766 lipB   FALSE 0.161 184.000 0.244 NA   NA
 5749734 5749735 ABAYE0766 ABAYE0767   rpoD FALSE 0.517 86.000 0.019 NA   NA
 5749736 5749737 ABAYE0769 ABAYE0770     FALSE 0.549 76.000 0.019 NA   NA
 5749741 5749742 ABAYE0774 ABAYE0775 sdhC sdhD TRUE 0.999 0.000 0.958 0.002 Y NA
 5749742 5749743 ABAYE0775 ABAYE0776 sdhD sdhA TRUE 1.000 13.000 0.754 0.002 Y NA
 5749743 5749744 ABAYE0776 ABAYE0777 sdhA sdhB TRUE 1.000 15.000 0.714 0.002 Y NA
 5749744 5749745 ABAYE0777 ABAYE0780 sdhB sucA FALSE 0.041 571.000 0.078 1.000 Y NA
 5749745 5749746 ABAYE0780 ABAYE0781 sucA sucB TRUE 0.994 0.000 0.758 1.000 Y NA
 5749746 5749747 ABAYE0781 ABAYE0782 sucB lpd TRUE 0.915 63.000 0.276 1.000 Y NA
 5749747 5749748 ABAYE0782 ABAYE0783 lpd sucC FALSE 0.439 148.000 0.082 1.000 Y NA
 5749748 5749749 ABAYE0783 ABAYE0784 sucC sucD TRUE 0.999 15.000 0.275 0.001 Y NA
 5749749 5749750 ABAYE0784 ABAYE0786 sucD   FALSE 0.005 624.000 0.000 NA   NA
 5749752 5749753 ABAYE0789 ABAYE0790     TRUE 0.845 30.000 0.010 NA   NA
 5749753 5749754 ABAYE0790 ABAYE0791     FALSE 0.015 238.000 0.000 NA   NA
 5749754 5749755 ABAYE0791 ABAYE0792     FALSE 0.006 460.000 0.000 NA   NA
 5749755 5749756 ABAYE0792 ABAYE0793     FALSE 0.083 147.000 0.000 NA   NA
 5749756 5749757 ABAYE0793 ABAYE0794     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 5749760 5749761 ABAYE0797 ABAYE0798   cat FALSE 0.156 121.000 0.000 1.000   NA
 5749761 5749762 ABAYE0798 ABAYE0799 cat greA FALSE 0.313 79.000 0.000 1.000   NA
 5749762 5749763 ABAYE0799 ABAYE0800 greA carB TRUE 0.731 88.000 0.385 1.000 N NA
 5749763 5749764 ABAYE0800 ABAYE0801 carB carA TRUE 0.999 15.000 0.227 0.001 Y NA
 5749766 5749767 ABAYE0803 ABAYE0804     TRUE 0.948 15.000 0.006 NA   NA
 5749768 5749769 ABAYE0805 ABAYE0806 ftsJ ftsH FALSE 0.145 135.000 0.007 NA N NA
 5749769 5749770 ABAYE0806 ABAYE0807 ftsH folP FALSE 0.143 132.000 0.008 1.000 N NA
 5749770 5749771 ABAYE0807 ABAYE0808 folP   FALSE 0.189 135.000 0.005 NA   NA
 5749772 5749773 ABAYE0809 ABAYEtRNA65     FALSE 0.461 55.000 0.000 NA   NA
 5749775 5749776 ABAYEtRNA64 ABAYEtRNA63     TRUE 0.918 12.000 0.000 NA   NA
 5749777 5749778 ABAYE0812 ABAYE0813 folD   FALSE 0.012 241.000 0.000 1.000   NA
 5749779 5749780 ABAYE0814 ABAYE0815   kgtP FALSE 0.202 117.000 0.000 NA   NA
 5749781 5749782 ABAYE0816 ABAYE0817 glpk glpD TRUE 0.822 155.000 0.013 0.001 Y NA
 5749784 5749785 ABAYE0819 ABAYE0820     TRUE 0.956 -19.000 0.645 1.000   NA
 5749785 5749786 ABAYE0820 ABAYE0821     FALSE 0.008 285.000 0.000 1.000   NA
 5749786 5749787 ABAYE0821 ABAYE0822   groES FALSE 0.012 241.000 0.000 1.000   NA
 5749787 5749788 ABAYE0822 ABAYE0823 groES groEL TRUE 0.886 59.000 0.130 0.073 Y NA
 5749792 5749793 ABAYE0827 ABAYE0828     FALSE 0.418 64.000 0.000 NA   NA
 5749794 5749795 ABAYE0829 ABAYE0831 htpX   FALSE 0.012 258.000 0.000 NA   NA
 5749796 5749797 ABAYE0832 ABAYE0833     FALSE 0.024 207.000 0.000 NA   NA
 5749799 5749800 ABAYE0835 ABAYEtRNA20 greB   FALSE 0.334 90.000 0.000 NA   NA
 5749803 5749804 ABAYE0839 ABAYE0840     FALSE 0.197 118.000 0.000 NA   NA
 5749804 5749805 ABAYE0840 ABAYE0841     FALSE 0.042 173.000 0.000 NA   NA
 5749805 5749806 ABAYE0841 ABAYE0842     FALSE 0.516 48.000 0.000 NA   NA
 5749806 5749807 ABAYE0842 ABAYE0843     FALSE 0.434 59.000 0.000 NA   NA
 5749807 5749808 ABAYE0843 ABAYE0844     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 5749810 5749811 ABAYE0846 ABAYE0847     TRUE 0.849 38.000 0.000 0.047   NA
 5749814 5749815 ABAYE0850 ABAYE0851   fdhD TRUE 0.994 79.000 1.000 0.001 Y NA
 5749815 5749816 ABAYE0851 ABAYE0852 fdhD   FALSE 0.188 120.000 0.000 NA   NA
 5749816 5749817 ABAYE0852 ABAYE0853   pdxB FALSE 0.266 105.000 0.000 NA   NA
 5749817 5749818 ABAYE0853 ABAYE0854 pdxB   TRUE 0.742 -30.000 0.029 1.000 N NA
 5749819 5749820 ABAYE0855 ABAYE0856   radA FALSE 0.346 83.000 0.000 NA   NA
 5749821 5749822 ABAYE0858 ABAYE0859 cycA   TRUE 0.778 120.000 1.000 NA   NA
 5749822 5749823 ABAYE0859 ABAYE0860   lysA TRUE 0.891 23.000 0.003 NA   NA
 5749823 5749824 ABAYE0860 ABAYE0861 lysA dapF TRUE 0.999 6.000 0.113 0.002 Y NA
 5749824 5749825 ABAYE0861 ABAYE0862 dapF   TRUE 0.720 40.000 0.003 NA   NA
 5749827 5749828 ABAYE0864 ABAYE0865 xerC etfB FALSE 0.003 437.000 0.000 1.000 N NA
 5749828 5749829 ABAYE0865 ABAYE0866 etfB etfA TRUE 0.999 18.000 0.474 0.010 Y NA
 5749829 5749830 ABAYE0866 ABAYE0867 etfA gyrA FALSE 0.003 366.000 0.000 1.000 N NA
 5749831 5749832 ABAYE0868 ABAYE0869     TRUE 0.898 10.000 0.000 1.000   NA
 5749832 5749833 ABAYE0869 ABAYE0870     TRUE 0.944 0.000 0.051 NA   NA
 5749833 5749834 ABAYE0870 ABAYE0871     TRUE 0.930 -3.000 0.068 NA   NA
 5749834 5749835 ABAYE0871 ABAYE0872     FALSE 0.012 265.000 0.000 NA   NA
 5749835 5749836 ABAYE0872 ABAYE0873     TRUE 0.981 -3.000 0.737 NA   NA
 5749836 5749837 ABAYE0873 ABAYE0874     TRUE 0.988 4.000 0.571 NA   NA
 5749837 5749838 ABAYE0874 ABAYE0875     TRUE 0.988 13.000 0.614 1.000 N NA
 5749841 5749842 ABAYE0880 ABAYE0881     TRUE 0.916 11.000 0.000 NA   NA
 5749842 5749843 ABAYE0881 ABAYE0882   lolC FALSE 0.011 248.000 0.000 1.000   NA
 5749843 5749844 ABAYE0882 ABAYE0883 lolC lolD TRUE 0.958 -43.000 0.599 0.054 N NA
 5749844 5749845 ABAYE0883 ABAYE0884 lolD comA FALSE 0.450 86.000 0.008 1.000   NA
 5749847 5749848 ABAYE0886 ABAYE0887     TRUE 0.943 19.000 0.034 NA   NA
 5749849 5749850 ABAYE0888 ABAYE0889 purN purM TRUE 0.998 -3.000 0.303 0.002 Y NA
 5749851 5749852 ABAYE0890 ABAYE0891     TRUE 0.975 21.000 0.310 NA   NA
 5749852 5749853 ABAYE0891 ABAYE0892     FALSE 0.010 290.000 0.000 NA   NA
 5749853 5749854 ABAYE0892 ABAYE0893     TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5749855 5749856 ABAYE0894 ABAYE0895     TRUE 0.969 -28.000 1.000 NA   NA
 5749856 5749857 ABAYE0895 ABAYE0897     TRUE 0.868 -10.000 0.034 NA   NA
 5749857 5749858 ABAYE0897 ABAYE0898     FALSE 0.151 139.000 0.034 1.000 N NA
 5749858 5749859 ABAYE0898 ABAYE0899   fbp FALSE 0.581 57.000 0.048 1.000 N NA
 5749859 5749860 ABAYE0899 ABAYE0901 fbp pal FALSE 0.003 426.000 0.000 1.000 N NA
 5749860 5749861 ABAYE0901 ABAYE0902 pal tolB TRUE 0.916 16.000 0.011 1.000 N NA
 5749861 5749862 ABAYE0902 ABAYE0904 tolB tolA TRUE 0.941 94.000 0.215 0.006   NA
 5749862 5749863 ABAYE0904 ABAYE0905 tolA tolR TRUE 0.983 4.000 0.572 0.098   NA
 5749863 5749864 ABAYE0905 ABAYE0906 tolR tolQ TRUE 0.995 0.000 0.507 0.054 Y NA
 5749864 5749865 ABAYE0906 ABAYE0907 tolQ   TRUE 0.884 24.000 0.007 1.000   NA
 5749865 5749866 ABAYE0907 ABAYE0908     FALSE 0.127 127.000 0.000 1.000   NA
 5749866 5749867 ABAYE0908 ABAYE0909   ruvB FALSE 0.020 206.000 0.000 1.000   NA
 5749867 5749868 ABAYE0909 ABAYE0910 ruvB ruvA TRUE 0.999 9.000 0.116 0.001 Y NA
 5749868 5749869 ABAYE0910 ABAYE0911 ruvA dgt FALSE 0.299 92.000 0.003 1.000 N NA
 5749870 5749871 ABAYE0912 ABAYE0913 purL   FALSE 0.184 83.000 0.000 1.000 N NA
 5749871 5749872 ABAYE0913 ABAYE0914     FALSE 0.006 395.000 0.000 NA   NA
 5749875 5749876 ABAYE0917 ABAYE0918   bcp FALSE 0.171 123.000 0.000 NA   NA
 5749876 5749877 ABAYE0918 ABAYE0919 bcp   TRUE 0.889 18.000 0.000 NA   NA
 5749877 5749878 ABAYE0919 ABAYE0920     FALSE 0.332 91.000 0.000 NA   NA
 5749878 5749879 ABAYE0920 ABAYE0921     TRUE 0.954 14.000 0.011 NA   NA
 5749879 5749880 ABAYE0921 ABAYE0922     TRUE 0.919 29.000 0.096 NA   NA
 5749880 5749881 ABAYE0922 ABAYE0923   dapD FALSE 0.191 79.000 0.000 1.000 N NA
 5749883 5749884 ABAYE0925 ABAYE0926 cbl cysA TRUE 0.609 72.000 0.093 1.000 N NA
 5749884 5749885 ABAYE0926 ABAYE0927 cysA cysW TRUE 0.997 12.000 0.683 1.000 Y NA
 5749885 5749886 ABAYE0927 ABAYE0928 cysW cysT TRUE 0.994 -36.000 0.836 0.001 N NA
 5749886 5749887 ABAYE0928 ABAYE0929 cysT   FALSE 0.573 81.000 0.041 NA   NA
 5749887 5749888 ABAYE0929 ABAYE0930   cysP TRUE 0.898 31.000 0.080 NA   NA
 5749889 5749890 ABAYE0931 ABAYE0932 pabC   TRUE 0.972 2.000 0.182 NA   NA
 5749890 5749891 ABAYE0932 ABAYE0933   tmk TRUE 0.981 10.000 0.192 NA   NA
 5749891 5749892 ABAYE0933 ABAYE0934 tmk   FALSE 0.066 138.000 0.000 NA N NA
 5749894 5749895 ABAYE0936 ABAYE0937     FALSE 0.380 121.000 0.054 NA   NA
 5749895 5749896 ABAYE0937 ABAYE0938   lepA FALSE 0.036 178.000 0.000 NA   NA
 5749896 5749897 ABAYE0938 ABAYE0939 lepA lepB TRUE 0.721 71.000 0.224 1.000 N NA
 5749897 5749898 ABAYE0939 ABAYE0940 lepB   TRUE 0.913 24.000 0.023 NA   NA
 5749898 5749899 ABAYE0940 ABAYE0941   rnc TRUE 0.781 -28.000 0.006 NA   NA
 5749899 5749900 ABAYE0941 ABAYE0942 rnc era TRUE 0.986 6.000 0.058 0.042   NA
 5749900 5749901 ABAYE0942 ABAYE0943 era   TRUE 0.877 19.000 0.000 NA   NA
 5749901 5749902 ABAYE0943 ABAYE0944   recO TRUE 0.918 13.000 0.000 NA   NA
 5749902 5749903 ABAYE0944 ABAYE0945 recO pdxJ TRUE 0.973 14.000 0.168 1.000 N NA
 5749903 5749904 ABAYE0945 ABAYE0946 pdxJ   TRUE 0.920 7.000 0.005 NA N NA
 5749904 5749905 ABAYE0946 ABAYE0947     FALSE 0.011 270.000 0.000 NA   NA
 5749912 5749913 ABAYE0953 ABAYE0954     FALSE 0.136 175.000 0.118 NA   NA
 5749914 5749915 ABAYE0955 ABAYE0956 uvrB   FALSE 0.289 94.000 0.003 1.000 N NA
 5749915 5749916 ABAYE0956 ABAYE0957   rarD FALSE 0.532 112.000 0.143 1.000   NA
 5749916 5749917 ABAYE0957 ABAYE0958 rarD gap FALSE 0.016 217.000 0.000 1.000   NA
 5749917 5749918 ABAYE0958 ABAYE0959 gap   FALSE 0.178 144.000 0.020 NA   NA
 5749918 5749919 ABAYE0959 ABAYE0960     TRUE 0.992 12.000 0.667 NA   NA
 5749919 5749920 ABAYE0960 ABAYE0961     FALSE 0.082 165.000 0.004 NA   NA
 5749920 5749921 ABAYE0961 ABAYE0962   proB TRUE 0.973 16.000 0.139 1.000   NA
 5749922 5749923 ABAYE0963 ABAYE0964     TRUE 0.828 -33.000 0.040 NA   NA
 5749925 5749926 ABAYE0966 ABAYE0967     FALSE 0.232 111.000 0.000 NA   NA
 5749927 5749928 ABAYE0968 ABAYE0969   wecB TRUE 0.971 3.000 0.167 1.000   NA
 5749929 5749930 ABAYE0970 ABAYE0971     TRUE 0.688 -22.000 0.000 NA   NA
 5749930 5749931 ABAYE0971 ABAYE0972     TRUE 0.876 1.000 0.000 NA   NA
 5749931 5749932 ABAYE0972 ABAYE0973     TRUE 0.886 -13.000 0.071 NA   NA
 5749932 5749933 ABAYE0973 ABAYE0974     TRUE 0.990 0.000 1.000 NA   NA
 5749933 5749934 ABAYE0974 ABAYE0975   phrB FALSE 0.047 195.000 0.007 NA   NA
 5749934 5749935 ABAYE0975 ABAYE0976 phrB slyD FALSE 0.296 51.000 0.000 1.000 N NA
 5749935 5749936 ABAYE0976 ABAYE0977 slyD ndh FALSE 0.053 136.000 0.000 1.000 N NA
 5749936 5749937 ABAYE0977 ABAYE0978 ndh   FALSE 0.175 91.000 0.000 1.000 N NA
 5749938 5749939 ABAYE0979 ABAYE0980   idh FALSE 0.005 401.000 0.000 1.000   NA
 5749942 5749943 ABAYE0983 ABAYE0984     FALSE 0.245 109.000 0.000 NA   NA
 5749943 5749944 ABAYE0984 ABAYE0985     FALSE 0.007 348.000 0.000 NA   NA
 5749945 5749946 ABAYE0986 ABAYE0988     FALSE 0.022 198.000 0.000 1.000   NA
 5749946 5749947 ABAYE0988 ABAYE0989     FALSE 0.134 149.000 0.020 1.000   NA
 5749947 5749948 ABAYE0989 ABAYE0990     FALSE 0.145 123.000 0.000 1.000   NA
 5749952 5749953 ABAYE0994 ABAYE0995     FALSE 0.171 123.000 0.000 NA   NA
 5749953 5749954 ABAYE0995 ABAYE0996     TRUE 0.976 -3.000 0.513 NA   NA
 5749954 5749955 ABAYE0996 ABAYE0997     TRUE 0.984 16.000 0.308 NA   NA
 5749955 5749956 ABAYE0997 ABAYE0998     TRUE 0.989 0.000 0.929 NA   NA
 5749956 5749957 ABAYE0998 ABAYE0999     TRUE 0.979 27.000 0.800 NA   NA
 5749957 5749958 ABAYE0999 ABAYE1000     TRUE 0.969 0.000 0.200 NA   NA
 5749958 6725413 ABAYE1000       FALSE NA 132.000 0.000 NA   NA
 6725413 6725414         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725414 6725415         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725415 6725416         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725416 6725417         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725417 6725418         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725418 6725419         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725419 6725420         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725420 6725421         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725421 6725422         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725422 6725423         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725423 6725424         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725424 6725425         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725425 6725426         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725426 6725427         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725427 6725428         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725428 6725429         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725429 6725430         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725430 6725431         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725431 6725432         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725432 6725433         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725433 6725434         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725434 6725435         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725435 6725436         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725436 6725437         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725437 6725438         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725438 6725439         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725439 6725440         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725440 6725441         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725441 6725442         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725442 6725443         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725443 6725444         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725444 6725445         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725445 6725446         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725446 6725447         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725447 6725448         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725448 6725449         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725449 6725450         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725450 6725451         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725451 6725452         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725452 6725453         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725453 6725454         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725454 6725455         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725455 6725456         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725456 6725457         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725457 6725458         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725458 6725459         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725459 6725460         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725460 6725461         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725461 6725462         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725462 6725463         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725463 6725464         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725464 6725465         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725465 6725466         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725466 6725467         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725467 6725468         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725468 6725469         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725469 6725470         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725470 6725471         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725471 6725472         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725472 6725473         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725473 6725474         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725474 6725475         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725475 6725476         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725476 6725477         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725477 6725478         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725478 6725479         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725479 6725480         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725480 6725481         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725481 6725482         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725482 6725483         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725483 6725484         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725484 6725485         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725485 6725486         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725486 6725487         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725487 6725488         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725488 6725489         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725489 6725490         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725490 6725491         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725491 6725492         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725492 6725493         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725493 6725494         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725494 6725495         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725495 6725496         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725496 6725497         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725497 6725498         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725498 6725499         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725499 6725500         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725500 6725501         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725501 6725502         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725502 6725503         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725503 6725504         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725504 6725505         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725505 6725506         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725506 6725507         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725507 6725508         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725508 6725509         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725509 6725510         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725510 6725511         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725511 6725512         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725512 6725513         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725513 6725522         TRUE NA -27.000 0.000 NA   NA
 6725522 6725514         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6725514 6725523         TRUE NA -32.000 0.000 NA   NA
 6725523 6725515         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA