MicrobesOnline Operon Predictions for Leptospira interrogans, 56601

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 289455 289456 LA_0001 LA_0002 dnaA dnaN FALSE 0.113 1656.000 0.328 1.000 Y NA
 289456 289457 LA_0002 LA_0003 dnaN recF FALSE 0.111 662.000 0.318 1.000 Y NA
 289457 289458 LA_0003 LA_0004 recF   TRUE 0.988 -3.000 0.089 NA   NA
 289458 289459 LA_0004 LA_0005   gyrB TRUE 0.882 64.000 0.028 NA   NA
 289459 289460 LA_0005 LA_0006 gyrB gyrA TRUE 0.997 19.000 0.306 0.002 Y NA
 289460 289461 LA_0006 LA_0007 gyrA   TRUE 0.984 5.000 0.003 1.000 N NA
 289461 289462 LA_0007 LA_0008     FALSE 0.066 151.000 0.000 NA   NA
 289462 289463 LA_0008 LA_0009     FALSE 0.018 242.000 0.000 NA   NA
 289464 289465 LA_0010 LA_0011   lipL21 FALSE 0.005 510.000 0.000 NA   NA
 289466 289467 LA_0012 LA_0013     TRUE 0.979 22.000 0.667 NA   NA
 289472 289473 LA_0018 LA_0019     FALSE 0.074 145.000 0.000 NA   NA
 289473 289474 LA_0019 LA_0020   fabG TRUE 0.987 5.000 0.667 NA   NA
 289474 289475 LA_0020 LA_0021 fabG sua5 TRUE 0.980 16.000 0.006 NA N NA
 289475 289476 LA_0021 LA_0022 sua5   FALSE 0.005 491.000 0.000 NA   NA
 289480 289481 LA_0025 LA_0027 fliG cyaA1 TRUE 0.895 65.000 0.005 1.000 N NA
 289481 289483 LA_0027 LA_0029 cyaA1   FALSE 0.007 623.000 0.000 1.000   NA
 289483 289484 LA_0029 LA_0030     TRUE 0.848 -22.000 0.000 NA   NA
 289484 289485 LA_0030 LA_0031     FALSE 0.022 225.000 0.000 NA   NA
 289485 289486 LA_0031 LA_0032     TRUE 0.986 4.000 0.048 NA   NA
 289487 289488 LA_0033 LA_0034 suhB   TRUE 0.965 20.000 0.005 NA   NA
 289488 289489 LA_0034 LA_0035   lacA FALSE 0.004 610.000 0.000 NA   NA
 289491 289492 LA_0036 LA_0038     TRUE 0.872 8.000 0.000 NA   NA
 289492 289493 LA_0038 LA_0039     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289493 289494 LA_0039 LA_0040   vacB TRUE 0.984 6.000 0.003 1.000 N NA
 289494 289495 LA_0040 LA_0041 vacB   FALSE 0.047 172.000 0.000 NA   NA
 289495 289496 LA_0041 LA_0042     TRUE 0.986 4.000 0.045 NA   NA
 289496 289497 LA_0042 LA_0043     FALSE 0.132 142.000 0.000 1.000   NA
 289499 289500 LA_0045 LA_0046 aroD gutQ TRUE 0.991 4.000 0.035 1.000 N NA
 289500 289501 LA_0046 LA_0047 gutQ nusG TRUE 0.989 -16.000 0.035 1.000 N NA
 289501 289502 LA_0047 LA_0048 nusG   TRUE 0.981 -16.000 1.000 NA   NA
 289503 289504 LA_0049 LA_0050 aer   FALSE 0.007 606.000 0.000 1.000   NA
 289504 289505 LA_0050 LA_0051   wcaG TRUE 0.992 -3.000 0.333 1.000   NA
 289505 289506 LA_0051 LA_0052 wcaG pntA TRUE 0.878 74.000 0.010 1.000 N NA
 289507 289508 LA_0053 LA_0054   hisS TRUE 0.984 -3.000 0.004 1.000   NA
 289508 289509 LA_0054 LA_0055 hisS   TRUE 0.980 7.000 0.004 1.000   NA
 289509 289510 LA_0055 LA_0056     TRUE 0.924 10.000 0.000 1.000   NA
 289513 289514 LA_0059 LA_0060     FALSE 0.086 220.000 0.000 0.036   NA
 289517 289518 LA_0063 LA_0064     TRUE 0.966 -36.000 0.005 NA   NA
 289519 289520 LA_0065 LA_0066 dinF gltP FALSE 0.383 188.000 0.006 0.088 N NA
 289521 289522 LA_0067 LA_0068     TRUE 0.987 -7.000 1.000 1.000   NA
 289522 289524 LA_0068 LA_0070     FALSE 0.006 1114.000 0.000 1.000   NA
 289525 289526 LA_0071 LA_0072   dcd TRUE 0.774 76.000 0.007 NA   NA
 289526 289527 LA_0072 LA_0073 dcd caiD TRUE 0.989 1.000 0.007 1.000 N NA
 289528 289529 LA_0074 LA_0075     FALSE 0.003 905.000 0.000 NA   NA
 289530 289531 LA_0076 LA_0077     FALSE 0.558 110.000 0.014 NA   NA
 289531 289532 LA_0077 LA_0078     TRUE 0.989 -3.000 0.375 NA   NA
 289538 289539 LA_0084 LA_0085     TRUE 0.965 39.000 0.176 NA   NA
 289541 289544 LA_0087 LA_0089     FALSE 0.004 692.000 0.000 NA   NA
 289544 289545 LA_0089 LA_0091     FALSE 0.100 128.000 0.000 NA   NA
 289546 289547 LA_0092 LA_0093     FALSE 0.037 192.000 0.000 NA   NA
 289547 289548 LA_0093 LA_0094     FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 289548 399250 LA_0094 LA_t01   tRNA-Arg-ACG FALSE 0.004 634.000 0.000 NA   NA
 399250 289549 LA_t01 LA_0095 tRNA-Arg-ACG   TRUE 0.879 6.000 0.000 NA   NA
 289549 289550 LA_0095 LA_0097     TRUE 0.976 -46.000 1.000 NA   NA
 289550 399249 LA_0097 LA_t02   tRNA-Ser-GCT FALSE 0.696 43.000 0.000 NA   NA
 399249 399248 LA_t02 LA_t03 tRNA-Ser-GCT tRNA-Ser-TGA TRUE 0.862 14.000 0.000 NA   NA
 289552 289553 LA_0098 LA_0099 trmA   FALSE 0.009 335.000 0.000 NA   NA
 289553 289554 LA_0099 LA_0100     FALSE 0.003 900.000 0.000 NA   NA
 289554 289555 LA_0100 LA_0101     FALSE 0.015 256.000 0.000 NA   NA
 289555 289556 LA_0101 LA_0102     TRUE 0.966 38.000 0.600 NA   NA
 289556 289557 LA_0102 LA_0103     TRUE 0.986 9.000 0.400 NA   NA
 289557 289558 LA_0103 LA_0104     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 289559 289560 LA_0105 LA_0106   faa1 FALSE 0.121 119.000 0.000 NA   NA
 289560 289561 LA_0106 LA_0107 faa1   FALSE 0.304 179.000 0.667 NA   NA
 289561 289562 LA_0107 LA_0108   aat TRUE 0.966 -27.000 0.004 NA   NA
 289562 289563 LA_0108 LA_0109 aat ligT TRUE 0.830 50.000 0.000 1.000 N NA
 289563 289564 LA_0109 LA_0110 ligT   TRUE 0.842 48.000 0.000 1.000 N NA
 289566 289567 LA_0112 LA_0113   metC FALSE 0.008 338.000 0.000 NA   NA
 289567 289568 LA_0113 LA_0114 metC prfA TRUE 0.897 60.000 0.002 1.000 N NA
 289569 289570 LA_0115 LA_0116     FALSE 0.185 101.000 0.000 NA   NA
 289571 289572 LA_0117 LA_0119     TRUE 0.986 12.000 0.028 1.000   NA
 289572 289574 LA_0119 LA_0120   glpG FALSE 0.010 467.000 0.000 1.000   NA
 289574 289575 LA_0120 LA_0121 glpG   FALSE 0.009 323.000 0.000 NA   NA
 289578 289579 LA_0124 LA_0125 hisB hisH TRUE 0.998 -3.000 0.125 0.004 Y NA
 289579 289580 LA_0125 LA_0126 hisH hisA TRUE 0.998 -3.000 0.124 0.004 Y NA
 289580 289581 LA_0126 LA_0127 hisA   TRUE 0.742 91.000 0.004 1.000 N NA
 289581 289582 LA_0127 LA_0128     FALSE 0.391 159.000 0.167 NA   NA
 289582 289583 LA_0128 LA_0129     FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 289584 289585 LA_0130 LA_0131 thiD   FALSE 0.010 1007.000 0.000 1.000 N NA
 289585 289586 LA_0131 LA_0132     TRUE 0.808 25.000 0.000 NA   NA
 289586 289587 LA_0132 LA_0133     FALSE 0.005 552.000 0.000 NA   NA
 289588 289589 LA_0134 LA_0135     TRUE 0.975 -3.000 0.003 NA   NA
 289589 289590 LA_0135 LA_0136     FALSE 0.499 133.000 0.667 NA   NA
 289590 289591 LA_0136 LA_0137     FALSE 0.420 153.000 0.375 NA   NA
 289591 289592 LA_0137 LA_0138     TRUE 0.989 -3.000 0.250 NA   NA
 289595 289596 LA_0141 LA_0142     FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 289596 289597 LA_0142 LA_0143     FALSE 0.126 117.000 0.000 NA   NA
 289598 289599 LA_0144 LA_0145 engB   TRUE 0.981 -3.000 0.003 1.000   NA
 289603 289604 LA_0149 LA_0150   mdlB TRUE 0.946 54.000 0.125 1.000   NA
 289605 289607 LA_0151 LA_0153     FALSE 0.309 167.000 1.000 NA   NA
 289607 289610 LA_0153 LA_0156     FALSE 0.004 1313.000 0.000 NA   NA
 289610 289611 LA_0156 LA_0157   aroC TRUE 0.801 62.000 0.002 NA   NA
 289611 289614 LA_0157 LA_0160 aroC nuoG FALSE 0.006 804.000 0.000 1.000   NA
 289614 289615 LA_0160 LA_0161 nuoG nuoI TRUE 0.991 -13.000 0.015 0.009   NA
 289619 289620 LA_0165 LA_0166 rpoE   TRUE 0.871 10.000 0.000 NA   NA
 289620 289623 LA_0166 LA_0169   frnE FALSE 0.004 1387.000 0.000 NA   NA
 289623 289625 LA_0169 LA_0171 frnE avtA FALSE 0.011 1191.000 0.000 1.000 N NA
 289625 289626 LA_0171 LA_0172 avtA   TRUE 0.718 88.000 0.019 NA   NA
 289626 406935 LA_0172 LA_r01   rrf FALSE 0.003 877.000 0.000 NA   NA
 406935 289629 LA_r01 LA_0175 rrf rpmH FALSE 0.026 216.000 0.000 NA   NA
 289629 289631 LA_0175 LA_0177 rpmH hlyA FALSE 0.049 327.000 0.005 NA   NA
 289631 289632 LA_0177 LA_0178 hlyA yidC TRUE 0.986 10.000 0.461 NA   NA
 289632 289633 LA_0178 LA_0179 yidC jag TRUE 0.978 32.000 0.254 1.000   NA
 289633 289634 LA_0179 LA_0180 jag trmE TRUE 0.989 -7.000 0.116 1.000   NA
 289634 289635 LA_0180 LA_0181 trmE sfcA TRUE 0.762 48.000 0.000 1.000   NA
 289635 289638 LA_0181 LA_0184 sfcA   FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 289638 289639 LA_0184 LA_0185   fumC FALSE 0.630 87.000 0.003 NA   NA
 289640 289641 LA_0186 LA_0187     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289641 289642 LA_0187 LA_0188     TRUE 0.823 23.000 0.000 NA   NA
 289642 289643 LA_0188 LA_0189     FALSE 0.528 60.000 0.000 NA   NA
 289643 289645 LA_0189 LA_0191     FALSE 0.038 187.000 0.000 NA   NA
 289645 289646 LA_0191 LA_0192     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 289646 289647 LA_0192 LA_0193     TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 289647 289648 LA_0193 LA_0194     TRUE 0.987 0.000 1.000 NA   NA
 289649 289652 LA_0195 LA_0198     FALSE 0.006 753.000 0.000 1.000   NA
 289652 289655 LA_0198 LA_0201     FALSE 0.006 415.000 0.000 NA   NA
 289655 289656 LA_0201 LA_0202     FALSE 0.573 54.000 0.000 NA   NA
 289656 289657 LA_0202 LA_0203     FALSE 0.004 1125.000 0.000 NA   NA
 289657 289658 LA_0203 LA_0204     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289658 289659 LA_0204 LA_0205     FALSE 0.350 77.000 0.000 NA   NA
 289659 289660 LA_0205 LA_0206     TRUE 0.871 10.000 0.000 NA   NA
 289660 289661 LA_0206 LA_0207     FALSE 0.667 46.000 0.000 NA   NA
 289661 289663 LA_0207 LA_0209     FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 289663 289664 LA_0209 LA_0210     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289664 289665 LA_0210 LA_0211     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289665 289666 LA_0211 LA_0212     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 289666 289667 LA_0212 LA_0213     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 289667 289668 LA_0213 LA_0214     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 289668 289669 LA_0214 LA_0215     FALSE 0.022 224.000 0.000 NA   NA
 289669 289670 LA_0215 LA_0216     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 289670 289671 LA_0216 LA_0217     FALSE 0.450 66.000 0.000 NA   NA
 289671 289672 LA_0217 LA_0218     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 289672 289673 LA_0218 LA_0219     FALSE 0.003 870.000 0.000 NA   NA
 289673 289675 LA_0219 LA_0221     FALSE 0.004 1052.000 0.000 NA   NA
 289678 289679 LA_0224 LA_0225   dltE TRUE 0.792 83.000 0.011 1.000   NA
 289679 289680 LA_0225 LA_0226 dltE   TRUE 0.988 -3.000 0.085 NA   NA
 289680 289681 LA_0226 LA_0227     TRUE 0.980 20.000 0.063 NA   NA
 289682 289683 LA_0228 LA_0229   suhB TRUE 0.976 -3.000 0.003 NA   NA
 289685 289686 LA_0231 LA_0232     TRUE 0.997 -16.000 0.286 0.021 Y NA
 289686 289687 LA_0232 LA_0233     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.021 Y NA
 289687 289688 LA_0233 LA_0234     TRUE 0.988 -3.000 0.750 NA   NA
 289691 289692 LA_0237 LA_0238 cyoE ctaA TRUE 0.995 16.000 0.321 1.000 Y NA
 289694 289695 LA_0240 LA_0241     TRUE 0.976 26.000 0.080 NA   NA
 289695 289696 LA_0241 LA_0242   cyoA TRUE 0.975 47.000 0.240 0.049   NA
 289696 289697 LA_0242 LA_0243 cyoA cyoB TRUE 0.997 11.000 0.571 0.003 Y NA
 289697 289698 LA_0243 LA_0244 cyoB cyoC TRUE 0.997 -13.000 0.308 0.003 Y NA
 289698 289701 LA_0244 LA_0247 cyoC   FALSE 0.004 1533.000 0.000 NA   NA
 289701 289702 LA_0247 LA_0248     FALSE 0.004 662.000 0.000 NA   NA
 289702 289703 LA_0248 LA_0249     TRUE 0.787 86.000 0.600 NA   NA
 289703 289704 LA_0249 LA_0250     TRUE 0.949 42.000 0.021 NA   NA
 289704 289705 LA_0250 LA_0251   pckA TRUE 0.832 62.000 0.004 NA   NA
 289707 289708 LA_0253 LA_0254     TRUE 0.740 37.000 0.000 NA   NA
 289708 289709 LA_0254 LA_0255   parA TRUE 0.984 -7.000 1.000 NA   NA
 289710 289712 LA_0256 LA_0258 gatB dnaE FALSE 0.011 1456.000 0.000 1.000 N NA
 289713 289715 LA_0259 LA_0262   nlpD FALSE 0.004 735.000 0.000 NA   NA
 289716 289717 LA_0261 LA_0263     TRUE 0.969 36.000 0.286 NA   NA
 289717 289718 LA_0263 LA_0264     FALSE 0.436 144.000 0.750 NA   NA
 289718 289719 LA_0264 LA_0265     TRUE 0.850 -21.000 0.000 NA   NA
 289719 289720 LA_0265 LA_0266     TRUE 0.988 5.000 0.273 NA   NA
 289722 289723 LA_0268 LA_0269     FALSE 0.004 763.000 0.000 NA   NA
 289723 289725 LA_0269 LA_0271     FALSE 0.004 630.000 0.000 NA   NA
 289725 289726 LA_0271 LA_0272     TRUE 0.982 13.000 1.000 NA   NA
 289727 289728 LA_0273 LA_0274 lolE   TRUE 0.993 2.000 0.214 1.000 N NA
 289732 289733 LA_0278 LA_0279     FALSE 0.025 218.000 0.000 NA   NA
 289733 289734 LA_0279 LA_0280   crp TRUE 0.882 86.000 0.182 0.035   NA
 289734 289735 LA_0280 LA_0281 crp alkA TRUE 0.982 21.000 0.006 1.000 N NA
 289735 289737 LA_0281 LA_0283 alkA   FALSE 0.003 852.000 0.000 NA   NA
 289737 289738 LA_0283 LA_0284     TRUE 0.841 74.000 1.000 NA   NA
 289738 10350607 LA_0284 LA_0284a     FALSE 0.020 231.000 0.000 NA   NA
 10350607 289740 LA_0284a LA_0286     FALSE 0.004 583.000 0.000 NA   NA
 289742 289743 LA_0288 LA_0289 cyaA2   FALSE 0.040 223.000 0.000 1.000   NA
 289745 289746 LA_0290 LA_0292   trmA FALSE 0.512 61.000 0.000 NA   NA
 289747 289748 LA_0293 LA_0294     TRUE 0.937 2.000 0.000 1.000   NA
 289751 289752 LA_0297 LA_0298   dnaJ1 TRUE 0.937 2.000 0.000 1.000   NA
 289753 289754 LA_0299 LA_0300 cstA   TRUE 0.991 -3.000 0.013 1.000 N NA
 289754 289755 LA_0300 LA_0301     FALSE 0.018 308.000 0.000 1.000   NA
 289755 289756 LA_0301 LA_0302     TRUE 0.879 6.000 0.000 NA   NA
 289757 289758 LA_0303 LA_0304     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289760 289761 LA_0306 LA_0307     FALSE 0.004 663.000 0.000 NA   NA
 289762 399246 LA_0308 LA_t05 hemK tRNA-Arg-CCT FALSE 0.004 1210.000 0.000 NA   NA
 399246 289763 LA_t05 LA_0309 tRNA-Arg-CCT crp TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 289763 289764 LA_0309 LA_0310 crp   TRUE 0.996 0.000 0.250 1.000 Y NA
 289764 289765 LA_0310 LA_0311     TRUE 0.992 11.000 0.150 1.000 N NA
 289765 289766 LA_0311 LA_0312     TRUE 0.986 19.000 0.019 1.000 N NA
 289766 289767 LA_0312 LA_0313   fusA FALSE 0.156 249.000 0.006 1.000 N NA
 10350608 289768 LA_0313a LA_0314   trkG FALSE 0.429 69.000 0.000 NA   NA
 289773 289774 LA_0319 LA_0320   thiX FALSE 0.007 715.000 0.000 1.000   NA
 289774 289775 LA_0320 LA_0321 thiX   FALSE 0.034 784.000 0.667 NA   NA
 289777 289779 LA_0323 LA_0325   adhP FALSE 0.004 680.000 0.000 NA   NA
 289779 289780 LA_0325 LA_0326 adhP ispA FALSE 0.027 322.000 0.000 1.000 N NA
 289780 289781 LA_0326 LA_0327 ispA tlyA TRUE 0.983 -19.000 0.005 1.000 N NA
 289781 289782 LA_0327 LA_0328 tlyA   FALSE 0.088 203.000 0.000 1.000 N NA
 289786 289787 LA_0332 LA_0333 ptps   TRUE 0.986 10.000 0.021 1.000   NA
 289787 289788 LA_0333 LA_0334     TRUE 0.776 78.000 0.004 1.000   NA
 289788 289789 LA_0334 LA_0335   pntB TRUE 0.995 3.000 0.065 0.001   NA
 289789 289791 LA_0335 LA_0337 pntB   FALSE 0.004 1475.000 0.000 NA   NA
 289791 289792 LA_0337 LA_0338     FALSE 0.007 386.000 0.000 NA   NA
 289797 289799 LA_0343 LA_0345   fliE FALSE 0.006 824.000 0.000 1.000   NA
 289799 289800 LA_0345 LA_0346 fliE flgC TRUE 0.998 3.000 0.156 0.006 Y NA
 289800 289801 LA_0346 LA_0347 flgC flgB TRUE 0.975 66.000 0.804 0.006 Y NA
 289803 289804 LA_0348 LA_0350     FALSE 0.007 397.000 0.000 NA   NA
 289804 289805 LA_0350 LA_0351     TRUE 0.972 33.000 0.333 NA   NA
 289805 289806 LA_0351 LA_0352     FALSE 0.034 198.000 0.000 NA   NA
 289807 289809 LA_0353 LA_0355     FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 289809 289811 LA_0355 LA_0357     FALSE 0.012 285.000 0.000 NA   NA
 289814 289815 LA_0360 LA_0361 gcvP gcvH TRUE 0.986 40.000 0.054 1.000 Y NA
 289815 289816 LA_0361 LA_0362 gcvH gcvT TRUE 0.997 18.000 0.103 0.001 Y NA
 289817 289818 LA_0363 LA_0364     FALSE 0.005 482.000 0.000 NA   NA
 289821 289822 LA_0366 LA_0368 serC   TRUE 0.978 0.000 0.004 NA   NA
 289822 289823 LA_0368 LA_0369   rpiB FALSE 0.005 487.000 0.000 NA   NA
 289823 289824 LA_0369 LA_0370 rpiB   FALSE 0.134 244.000 0.038 NA   NA
 289825 289826 LA_0371 LA_0372     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289826 289827 LA_0372 LA_0373     TRUE 0.939 0.000 0.000 1.000   NA
 289827 289828 LA_0373 LA_0374     TRUE 0.946 50.000 0.333 NA   NA
 289828 289829 LA_0374 LA_0375     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 289830 289831 LA_0376 LA_0377     FALSE 0.046 173.000 0.000 NA   NA
 289832 289833 LA_0378 LA_0379 hlyX   TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289835 289836 LA_0381 LA_0382     FALSE 0.015 262.000 0.000 NA   NA
 289836 289837 LA_0382 LA_0383     FALSE 0.350 77.000 0.000 NA   NA
 289837 289838 LA_0383 LA_0384   wcaJ FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 289839 289840 LA_0385 LA_0386     TRUE 0.986 -10.000 0.118 NA   NA
 289840 289841 LA_0386 LA_0387     TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 289842 289843 LA_0388 LA_0389 miaB   TRUE 0.984 -19.000 0.006 1.000 N NA
 289843 289844 LA_0389 LA_0390     FALSE 0.184 217.000 1.000 NA   NA
 289844 289845 LA_0390 LA_0391   clpA TRUE 0.986 3.000 0.041 NA   NA
 289845 289846 LA_0391 LA_0392 clpA   FALSE 0.509 145.000 0.111 1.000   NA
 289846 289847 LA_0392 LA_0393     FALSE 0.007 382.000 0.000 NA   NA
 289848 289849 LA_0394 LA_0395     TRUE 0.899 65.000 0.500 NA   NA
 289849 10350609 LA_0395 LA_0395a     TRUE 0.830 -43.000 0.000 NA   NA
 10350609 289850 LA_0395a LA_0396     TRUE 0.975 28.000 0.500 NA   NA
 289850 289851 LA_0396 LA_0397     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA N NA
 399245 289855 LA_t06 LA_0401 tRNA-Pro-GGG   FALSE 0.015 258.000 0.000 NA   NA
 289856 289857 LA_0402 LA_0403 ccmA   TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 289857 289858 LA_0403 LA_0404     FALSE 0.287 84.000 0.000 NA   NA
 289859 289860 LA_0405 LA_0406 ksgA   TRUE 0.974 -37.000 0.016 NA   NA
 289860 289861 LA_0406 LA_0407     FALSE 0.556 56.000 0.000 NA   NA
 289861 289862 LA_0407 LA_0408   trpS FALSE 0.004 612.000 0.000 NA   NA
 289862 289863 LA_0408 LA_0409 trpS   TRUE 0.985 -3.000 0.017 NA   NA
 289863 289864 LA_0409 LA_0410     TRUE 0.987 6.000 0.143 NA   NA
 289864 289865 LA_0410 LA_0411   etfA FALSE 0.684 125.000 0.143 1.000 N NA
 289865 289866 LA_0411 LA_0412 etfA etfB TRUE 0.997 12.000 0.060 0.016 Y NA
 289866 289867 LA_0412 LA_0413 etfB   TRUE 0.804 83.000 0.060 NA   NA
 289868 289869 LA_0414 LA_0415 ivd   TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 289871 289872 LA_0417 LA_0418     FALSE 0.010 467.000 0.000 1.000   NA
 289873 289874 LA_0419 LA_0420     FALSE 0.004 774.000 0.000 NA   NA
 289874 289875 LA_0420 LA_0421     FALSE 0.343 78.000 0.000 NA   NA
 289875 289877 LA_0421 LA_0423     FALSE 0.004 1173.000 0.000 NA   NA
 289877 289879 LA_0423 LA_0425     FALSE 0.004 720.000 0.000 NA   NA
 289879 289880 LA_0425 LA_0426     FALSE 0.036 195.000 0.000 NA   NA
 289880 289881 LA_0426 LA_0427     FALSE 0.004 668.000 0.000 NA   NA
 289881 289882 LA_0427 LA_0428     TRUE 0.972 18.000 0.008 NA   NA
 289882 289883 LA_0428 LA_0429     TRUE 0.872 9.000 0.000 NA   NA
 289884 289885 LA_0430 LA_0431     FALSE 0.004 1058.000 0.000 NA   NA
 289885 289886 LA_0431 LA_0432     TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 289886 289887 LA_0432 LA_0433     TRUE 0.872 8.000 0.000 NA   NA
 289888 289892 LA_0434 LA_0438     FALSE 0.004 821.000 0.000 NA   NA
 289892 289893 LA_0438 LA_0439   gpmI FALSE 0.012 596.000 0.000 1.000 N NA
 289897 289898 LA_0443 LA_0444     FALSE 0.094 160.000 0.000 1.000   NA
 289901 289902 LA_0447 LA_0448   uup FALSE 0.576 117.000 0.750 NA   NA
 289902 289903 LA_0448 LA_0449 uup pspE FALSE 0.050 504.000 0.500 NA   NA
 289903 289904 LA_0449 LA_0450 pspE   FALSE 0.005 503.000 0.000 NA   NA
 289905 289906 LA_0451 LA_0452     FALSE 0.006 407.000 0.000 NA   NA
 289906 289909 LA_0452 LA_0455     FALSE 0.004 822.000 0.000 NA   NA
 289911 289912 LA_0457 LA_0458 paaJ   FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 289913 289914 LA_0459 LA_0460 amiB1   TRUE 0.982 -3.000 0.009 NA   NA
 289917 289918 LA_0463 LA_0464 ribH nusB TRUE 0.993 1.000 0.347 1.000 N NA
 289918 289919 LA_0464 LA_0465 nusB   TRUE 0.983 -7.000 0.003 1.000 N NA
 289919 289920 LA_0465 LA_0466     TRUE 0.991 21.000 0.021 0.034 N NA
 289928 289931 LA_0474 LA_0477     FALSE 0.006 1102.000 0.000 1.000   NA
 289942 289943 LA_0488 LA_0489 uvrD   FALSE 0.018 491.000 0.000 0.075   NA
 289949 289950 LA_0495 LA_0496     FALSE 0.005 530.000 0.000 NA   NA
 289957 289958 LA_0503 LA_0504 dinP comF TRUE 0.870 28.000 0.000 1.000   NA
 289958 289959 LA_0504 LA_0505 comF   FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 289960 289963 LA_0506 LA_0509     FALSE 0.004 1101.000 0.000 NA   NA
 289963 289965 LA_0509 LA_0511     FALSE 0.004 707.000 0.000 NA   NA
 289965 289967 LA_0511 LA_0512   lpxD FALSE 0.007 617.000 0.000 1.000   NA
 289967 289968 LA_0512 LA_0514 lpxD   FALSE 0.010 905.000 0.000 1.000 N NA
 289968 289969 LA_0514 LA_0515     FALSE 0.025 264.000 0.000 1.000   NA
 289971 289972 LA_0517 LA_0518     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 289972 289974 LA_0518 LA_0520     FALSE 0.007 703.000 0.000 1.000   NA
 289974 289975 LA_0520 LA_0521     FALSE 0.472 64.000 0.000 NA   NA
 289975 289976 LA_0521 LA_0522   marR FALSE 0.017 250.000 0.000 NA   NA
 289977 289978 LA_0523 LA_0524   lat1 FALSE 0.006 901.000 0.000 1.000   NA
 289978 289979 LA_0524 LA_0525 lat1   TRUE 0.975 24.000 0.038 NA   NA
 289979 2159331 LA_0525 LA_r02   rrl FALSE 0.004 2153.000 0.000 NA   NA
 289986 289987 LA_0532 LA_0533   wecE FALSE 0.003 897.000 0.000 NA   NA
 289987 289988 LA_0533 LA_0534 wecE   FALSE 0.004 1267.000 0.000 NA   NA
 289994 289995 LA_0540 LA_0541     FALSE 0.168 105.000 0.000 NA   NA
 289995 289997 LA_0541 LA_0543     FALSE 0.018 307.000 0.000 1.000   NA
 289997 289998 LA_0543 LA_0544     FALSE 0.006 469.000 0.000 NA   NA
 290002 290003 LA_0548 LA_0549     TRUE 0.988 0.000 0.750 NA   NA
 290003 290004 LA_0549 LA_0550   acrB FALSE 0.004 1724.000 0.000 NA   NA
 290004 290005 LA_0550 LA_0551 acrB hisI FALSE 0.007 1059.000 0.000 NA N NA
 290005 290006 LA_0551 LA_0552 hisI   TRUE 0.881 49.000 0.002 NA   NA
 290006 290008 LA_0552 LA_0554     FALSE 0.004 1176.000 0.000 NA   NA
 290010 290011 LA_0556 LA_0557     TRUE 0.854 69.000 0.020 NA   NA
 290014 10350610 LA_0560 LA_0560a caiA   FALSE 0.086 135.000 0.000 NA   NA
 10350610 290015 LA_0560a LA_0561     FALSE 0.005 494.000 0.000 NA   NA
 290015 290016 LA_0561 LA_0562     FALSE 0.012 286.000 0.000 NA   NA
 290023 290024 LA_0569 LA_0570     FALSE 0.419 70.000 0.000 NA   NA
 290024 290025 LA_0570 LA_0571     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 290025 290026 LA_0571 LA_0572     TRUE 0.808 25.000 0.000 NA   NA
 290026 290027 LA_0572 LA_0573     FALSE 0.100 128.000 0.000 NA   NA
 290027 290028 LA_0573 LA_0574   dedA FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 290028 290029 LA_0574 LA_0575 dedA   TRUE 0.954 41.000 0.030 NA   NA
 290032 290033 LA_0578 LA_0579   sul1 TRUE 0.954 42.000 0.037 NA   NA
 290033 290034 LA_0579 LA_0580 sul1   FALSE 0.004 636.000 0.000 NA   NA
 290034 290036 LA_0580 LA_0581     FALSE 0.113 124.000 0.000 NA   NA
 290036 290037 LA_0581 LA_0583   czcA1 TRUE 0.989 -34.000 0.400 1.000 N NA
 290037 290039 LA_0583 LA_0585 czcA1   FALSE 0.010 810.000 0.000 1.000 N NA
 290042 290043 LA_0588 LA_0589     FALSE 0.040 182.000 0.000 NA   NA
 290043 290044 LA_0589 LA_0590     FALSE 0.023 223.000 0.000 NA   NA
 290044 290045 LA_0590 LA_0591     FALSE 0.010 311.000 0.000 NA   NA
 290045 290046 LA_0591 LA_0592     FALSE 0.007 373.000 0.000 NA   NA
 290046 290047 LA_0592 LA_0593   copZ TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 290047 290048 LA_0593 LA_0594 copZ zntA TRUE 0.995 -3.000 0.053 0.001   NA
 290049 290052 LA_0595 LA_0598     FALSE 0.003 894.000 0.000 NA   NA
 290060 290061 LA_0606 LA_0607     FALSE 0.537 59.000 0.000 NA   NA
 290061 290062 LA_0607 LA_0609     FALSE 0.016 254.000 0.000 NA   NA
 290064 290065 LA_0610 LA_0611   ftsA TRUE 0.989 2.000 0.389 NA   NA
 290065 290066 LA_0611 LA_0612 ftsA ftsZ TRUE 0.994 19.000 0.460 1.000 Y NA
 290069 290070 LA_0615 LA_0616   lipL41 TRUE 0.969 29.000 1.000 NA   NA
 290071 290072 LA_0617 LA_0618   nadA TRUE 0.978 -3.000 0.004 NA   NA
 290079 290081 LA_0625 LA_0627 recQ   FALSE 0.007 1315.000 0.000 NA N NA
 290081 290083 LA_0627 LA_0629     FALSE 0.003 1023.000 0.000 NA   NA
 290083 290084 LA_0629 LA_0630     TRUE 0.987 7.000 0.333 NA   NA
 290084 290085 LA_0630 LA_0631     TRUE 0.986 -7.000 0.667 NA   NA
 290085 290086 LA_0631 LA_0632   ptsN TRUE 0.794 86.000 0.286 NA   NA
 290086 290087 LA_0632 LA_0633 ptsN dppB TRUE 0.960 3.000 0.000 1.000 N NA
 290087 290088 LA_0633 LA_0634 dppB dppC TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.021 N NA
 290088 290089 LA_0634 LA_0635 dppC slpM TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 290090 290091 LA_0636 LA_0637   folC FALSE 0.012 1550.000 0.000 1.000 N NA
 290091 290092 LA_0637 LA_0638 folC aroE TRUE 0.989 -3.000 0.006 1.000 N NA
 290093 290094 LA_0639 LA_0640     FALSE 0.004 747.000 0.000 NA   NA
 290094 290095 LA_0640 LA_0641     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290097 290098 LA_0643 LA_0645     TRUE 0.983 1.000 0.011 NA   NA
 290099 290100 LA_0644 LA_0646   rpsA TRUE 0.987 -3.000 0.040 NA   NA
 290100 290101 LA_0646 LA_0647 rpsA cspR TRUE 0.996 5.000 0.007 0.019 Y NA
 290101 290102 LA_0647 LA_0648 cspR   TRUE 0.945 46.000 0.007 NA N NA
 290102 290103 LA_0648 LA_0649   uvrB TRUE 0.978 7.000 0.003 NA N NA
 290103 290104 LA_0649 LA_0650 uvrB glpG TRUE 0.969 18.000 0.002 1.000   NA
 290104 10350611 LA_0650 LA_0650a glpG   FALSE 0.004 740.000 0.000 NA   NA
 290108 290109 LA_0654 LA_0655   dnaJ2 TRUE 0.986 10.000 0.200 NA   NA
 290109 290110 LA_0655 LA_0656 dnaJ2 manA TRUE 0.990 6.000 0.200 1.000   NA
 290110 290111 LA_0656 LA_0657 manA mcrA TRUE 0.989 10.000 0.143 1.000   NA
 290111 290113 LA_0657 LA_0659 mcrA   FALSE 0.030 1023.000 0.039 NA   NA
 290117 290119 LA_0663 LA_0665     FALSE 0.004 835.000 0.000 NA   NA
 290119 290120 LA_0665 LA_0666   mauG FALSE 0.483 78.000 0.000 1.000   NA
 10350612 290124 LA_0668 LA_0670     TRUE 0.756 34.000 0.000 NA   NA
 290124 290125 LA_0670 LA_0671   gltA FALSE 0.094 131.000 0.000 NA   NA
 290125 290127 LA_0671 LA_0673 gltA spsF FALSE 0.011 1339.000 0.000 1.000 N NA
 290127 290128 LA_0673 LA_0674 spsF   TRUE 0.990 -25.000 0.500 1.000 N NA
 290128 290129 LA_0674 LA_0675     TRUE 0.957 50.000 0.286 1.000   NA
 290129 290130 LA_0675 LA_0676     FALSE 0.199 242.000 0.286 1.000   NA
 290130 290132 LA_0676 LA_0678     FALSE 0.042 919.000 0.000 0.013 Y NA
 290132 10350613 LA_0678 LA_0678a     FALSE 0.019 238.000 0.000 NA   NA
 290136 290138 LA_0682 LA_0684     FALSE 0.005 518.000 0.000 NA   NA
 290138 290139 LA_0684 LA_0685     FALSE 0.130 254.000 0.773 NA   NA
 290139 290140 LA_0685 LA_0686     FALSE 0.093 300.000 0.711 NA   NA
 290140 290141 LA_0686 LA_0687     TRUE 0.986 3.000 0.948 NA   NA
 290141 290142 LA_0687 LA_0688     TRUE 0.987 -3.000 0.891 NA   NA
 290142 290143 LA_0688 LA_0689     TRUE 0.989 0.000 0.664 NA   NA
 290143 290144 LA_0689 LA_0690     TRUE 0.989 1.000 0.025 1.000   NA
 290144 290147 LA_0690 LA_0693   lysC FALSE 0.008 2498.000 0.000 1.000   NA
 290148 290149 LA_0694 LA_0695     FALSE 0.004 1406.000 0.000 NA   NA
 290150 290151 LA_0696 LA_0697     TRUE 0.986 8.000 0.120 NA   NA
 290151 290153 LA_0697 LA_0699     FALSE 0.399 153.000 0.080 NA   NA
 290153 290154 LA_0699 LA_0700     FALSE 0.264 198.000 0.100 NA   NA
 290154 290155 LA_0700 LA_0701     FALSE 0.011 407.000 0.000 1.000   NA
 290159 290160 LA_0705 LA_0706     FALSE 0.006 1181.000 0.000 1.000   NA
 290163 290164 LA_0709 LA_0710     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 290164 290165 LA_0710 LA_0711     FALSE 0.022 224.000 0.000 NA   NA
 290165 290166 LA_0711 LA_0712     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 290166 290167 LA_0712 LA_0713     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 290167 290168 LA_0713 LA_0714     TRUE 0.828 -48.000 0.000 NA   NA
 290168 290169 LA_0714 LA_0715     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 290170 290171 LA_0716 LA_0717     FALSE 0.254 146.000 0.000 0.016   NA
 290174 290177 LA_0720 LA_0723   ruvC FALSE 0.036 1018.000 0.277 NA   NA
 290177 290180 LA_0723 LA_0726 ruvC   FALSE 0.012 1648.000 0.000 1.000 N NA
 290180 290181 LA_0726 LA_0727   carB FALSE 0.532 127.000 0.004 1.000 N NA
 10350614 10350615 LA_0727a LA_0727b     TRUE 0.832 -37.000 0.000 NA   NA
 290188 290189 LA_0734 LA_0735     TRUE 0.980 5.000 0.010 NA   NA
 290189 290190 LA_0735 LA_0736   fusA2 FALSE 0.004 663.000 0.000 NA   NA
 290190 290191 LA_0736 LA_0737 fusA2 tufB TRUE 0.978 51.000 0.002 0.001 Y NA
 290191 290192 LA_0737 LA_0738 tufB rpsJ TRUE 0.995 15.000 0.318 1.000 Y NA
 290192 290193 LA_0738 LA_0739 rpsJ rplC TRUE 0.997 12.000 0.467 0.025 Y NA
 290193 290194 LA_0739 LA_0740 rplC rplD TRUE 0.996 18.000 0.544 0.019 Y NA
 290194 290195 LA_0740 LA_0741 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.307 0.019 Y NA
 290195 290196 LA_0741 LA_0742 rplW rplB TRUE 0.997 4.000 0.849 0.018 Y NA
 290196 290197 LA_0742 LA_0743 rplB rpsS TRUE 0.997 9.000 0.820 0.025 Y NA
 290197 290198 LA_0743 LA_0744 rpsS rplV TRUE 0.997 0.000 0.769 0.025 Y NA
 290198 290199 LA_0744 LA_0745 rplV rpsC TRUE 0.997 13.000 0.719 0.025 Y NA
 290199 290200 LA_0745 LA_0746 rpsC rplP TRUE 0.995 23.000 0.828 0.025 Y NA
 290200 290201 LA_0746 LA_0747 rplP rpmC TRUE 0.994 -3.000 0.802 0.019   NA
 290201 290202 LA_0747 LA_0748 rpmC rpsQ TRUE 0.915 76.000 0.828 0.019   NA
 290202 290203 LA_0748 LA_0749 rpsQ rplN TRUE 0.997 2.000 0.791 0.025 Y NA
 290203 290204 LA_0749 LA_0750 rplN rplX TRUE 0.997 0.000 0.810 0.025 Y NA
 290204 290205 LA_0750 LA_0751 rplX rplE TRUE 0.997 4.000 0.758 0.019 Y NA
 290205 290206 LA_0751 LA_0752 rplE rpsN TRUE 0.996 20.000 0.496 0.019 Y NA
 290206 290207 LA_0752 LA_0753 rpsN rpsH TRUE 0.996 20.000 0.473 0.019 Y NA
 290207 290208 LA_0753 LA_0754 rpsH rplF TRUE 0.994 27.000 0.808 0.019 Y NA
 290208 290209 LA_0754 LA_0755 rplF rplR TRUE 0.997 4.000 0.815 0.019 Y NA
 290209 290210 LA_0755 LA_0756 rplR rpsE TRUE 0.997 2.000 0.814 0.025 Y NA
 290210 290211 LA_0756 LA_0757 rpsE rpmD TRUE 0.996 13.000 0.789 0.025 Y NA
 290211 290212 LA_0757 LA_0758 rpmD rplO TRUE 0.997 16.000 0.653 0.003 Y NA
 290212 290213 LA_0758 LA_0759 rplO secY TRUE 0.990 15.000 0.730 1.000 N NA
 290213 290214 LA_0759 LA_0760 secY adk TRUE 0.992 8.000 0.241 1.000 N NA
 290214 290215 LA_0760 LA_0761 adk infA TRUE 0.992 3.000 0.059 1.000 N NA
 290215 10350617 LA_0761 LA_0761a infA rpmJ TRUE 0.989 9.000 0.104 1.000   NA
 10350617 290216 LA_0761a LA_0762 rpmJ rpsM TRUE 0.994 4.000 0.194 0.019   NA
 290216 290217 LA_0762 LA_0763 rpsM rpsK TRUE 0.997 3.000 0.810 0.019 Y NA
 290217 290218 LA_0763 LA_0764 rpsK rpsD TRUE 0.997 12.000 0.509 0.025 Y NA
 290218 290219 LA_0764 LA_0765 rpsD rpoA TRUE 0.988 23.000 0.549 1.000 N NA
 290219 290220 LA_0765 LA_0766 rpoA rplQ TRUE 0.992 2.000 0.873 1.000 N NA
 290223 290227 LA_0769 LA_0773     FALSE 0.004 2146.000 0.000 NA   NA
 290230 290231 LA_0776 LA_0777     TRUE 0.979 -16.000 0.018 NA   NA
 290231 290232 LA_0777 LA_0778   pyrB TRUE 0.971 6.000 0.003 NA   NA
 290232 290233 LA_0778 LA_0779 pyrB   TRUE 0.962 1.000 0.000 1.000 N NA
 290233 290235 LA_0779 LA_0781     FALSE 0.005 509.000 0.000 NA   NA
 290235 290236 LA_0781 LA_0782     FALSE 0.512 61.000 0.000 NA   NA
 290238 290239 LA_0784 LA_0785     FALSE 0.006 401.000 0.000 NA   NA
 290240 290241 LA_0786 LA_0787   spoU TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA N NA
 290241 290242 LA_0787 LA_0788 spoU   TRUE 0.989 -3.000 0.213 NA   NA
 290242 290243 LA_0788 LA_0789     TRUE 0.976 -22.000 0.014 NA   NA
 290243 290244 LA_0789 LA_0790   gltA TRUE 0.966 39.000 0.250 NA   NA
 290244 290245 LA_0790 LA_0791 gltA   FALSE 0.576 112.000 0.008 1.000   NA
 290248 290250 LA_0794 LA_0795     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 290250 290252 LA_0795 LA_0798     FALSE 0.004 790.000 0.000 NA   NA
 290252 290253 LA_0798 LA_0799     FALSE 0.581 120.000 0.600 NA   NA
 290253 290254 LA_0799 LA_0800   pdxA TRUE 0.942 58.000 0.022 1.000 N NA
 290254 290255 LA_0800 LA_0801 pdxA   TRUE 0.946 44.000 0.022 NA   NA
 290255 290256 LA_0801 LA_0802   pilF TRUE 0.981 19.000 0.667 NA   NA
 290258 290259 LA_0804 LA_0805     FALSE 0.168 105.000 0.000 NA   NA
 290259 290260 LA_0805 LA_0806   tmk FALSE 0.017 250.000 0.000 NA   NA
 290262 290263 LA_0808 LA_0809   degQ FALSE 0.105 223.000 0.000 0.003   NA
 290263 290264 LA_0809 LA_0810 degQ ruvB TRUE 0.986 1.000 0.003 1.000 N NA
 290264 290265 LA_0810 LA_0811 ruvB   TRUE 0.962 -25.000 0.003 NA   NA
 290265 290266 LA_0811 LA_0812     TRUE 0.985 15.000 0.500 NA   NA
 290266 290267 LA_0812 LA_0813     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 290268 290269 LA_0814 LA_0815     TRUE 0.746 36.000 0.000 NA   NA
 290269 290270 LA_0815 LA_0816   citB TRUE 0.990 1.000 0.000 0.026 Y NA
 290270 290271 LA_0816 LA_0817 citB   FALSE 0.004 659.000 0.000 NA   NA
 290271 290272 LA_0817 LA_0818     TRUE 0.978 24.000 0.667 NA   NA
 290273 290274 LA_0819 LA_0820     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 290274 290275 LA_0820 LA_0821     TRUE 0.986 -3.000 0.026 NA   NA
 290277 290278 LA_0823 LA_0824     FALSE 0.597 116.000 0.667 NA   NA
 290278 290279 LA_0824 LA_0825     FALSE 0.071 218.000 0.000 1.000 N NA
 290279 290280 LA_0825 LA_0826     TRUE 0.854 -19.000 0.000 NA   NA
 290281 290282 LA_0827 LA_0828   paaJ TRUE 0.951 37.000 0.011 NA   NA
 290282 290283 LA_0828 LA_0829 paaJ   FALSE 0.287 84.000 0.000 NA   NA
 290283 290286 LA_0829 LA_0832   birA FALSE 0.004 1137.000 0.000 NA   NA
 290286 290287 LA_0832 LA_0833 birA   TRUE 0.993 2.000 0.147 1.000 N NA
 290289 290290 LA_0835 LA_0836     FALSE 0.038 186.000 0.000 NA   NA
 290290 290292 LA_0836 LA_0838   murD FALSE 0.004 1575.000 0.000 NA   NA
 290293 290294 LA_0839 LA_0840 spoIIAA trpC TRUE 0.987 7.000 0.008 1.000 N NA
 290294 290295 LA_0840 LA_0841 trpC   FALSE 0.006 1088.000 0.000 1.000   NA
 290295 290296 LA_0841 LA_0842     TRUE 0.944 31.000 0.003 NA   NA
 290296 290297 LA_0842 LA_0843     TRUE 0.984 15.000 0.091 NA   NA
 290297 290299 LA_0843 LA_0845     FALSE 0.010 1046.000 0.000 1.000 N NA
 290299 290300 LA_0845 LA_0846     TRUE 0.989 -3.000 0.021 1.000   NA
 290300 290301 LA_0846 LA_0847     FALSE 0.460 65.000 0.000 NA   NA
 290301 10350619 LA_0847 LA_0847a     FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 10350619 290303 LA_0847a LA_0848   rplU FALSE 0.010 310.000 0.000 NA   NA
 290303 290304 LA_0848 LA_0850 rplU   TRUE 0.995 -3.000 0.208 NA Y NA
 290304 290305 LA_0850 LA_0851   rpmA TRUE 0.994 -10.000 0.203 NA Y NA
 290305 290306 LA_0851 LA_0852 rpmA obgE FALSE 0.675 115.000 0.335 1.000   NA
 290306 290307 LA_0852 LA_0853 obgE proB TRUE 0.988 14.000 0.206 1.000   NA
 290308 290309 LA_0854 LA_0855 proA nadD TRUE 0.993 4.000 0.170 1.000 N NA
 290309 290312 LA_0855 LA_0858 nadD   FALSE 0.004 1702.000 0.000 NA   NA
 290312 290314 LA_0858 LA_0860     FALSE 0.003 866.000 0.000 NA   NA
 290314 290315 LA_0860 LA_0861   spoIIAA TRUE 0.870 -10.000 0.000 NA   NA
 290317 290318 LA_0863 LA_0864 ilvB ilvA TRUE 0.925 42.000 0.000 0.002   NA
 290318 290319 LA_0864 LA_0865 ilvA   FALSE 0.641 48.000 0.000 NA   NA
 290331 290332 LA_0876 LA_0878 sigX dshA TRUE 0.983 11.000 1.000 NA   NA
 290336 290337 LA_0882 LA_0883     FALSE 0.573 54.000 0.000 NA   NA
 290338 290339 LA_0884 LA_0885 nuoN nuoM TRUE 0.998 -3.000 0.126 0.003 Y NA
 290339 290340 LA_0885 LA_0886 nuoM nuoL FALSE 0.250 449.000 0.183 0.003 Y NA
 290340 290341 LA_0886 LA_0887 nuoL nuoK TRUE 0.997 -6.000 0.790 0.008 Y NA
 290341 290342 LA_0887 LA_0888 nuoK nuoJ TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.003 Y NA
 290342 290343 LA_0888 LA_0889 nuoJ nuoH TRUE 0.996 14.000 0.032 0.008 Y NA
 290343 290344 LA_0889 LA_0890 nuoH nuoF TRUE 0.997 -3.000 0.008 0.008 Y NA
 290344 290345 LA_0890 LA_0891 nuoF nuoE TRUE 0.997 16.000 0.061 0.008 Y NA
 290345 290346 LA_0891 LA_0892 nuoE nuoD TRUE 0.998 0.000 0.097 0.008 Y NA
 290346 290347 LA_0892 LA_0893 nuoD nuoC TRUE 0.998 2.000 0.096 0.008 Y NA
 290347 290348 LA_0893 LA_0894 nuoC nuoB TRUE 0.998 -3.000 0.125 0.003 Y NA
 290348 290349 LA_0894 LA_0895 nuoB nuoA TRUE 0.997 -9.000 0.498 0.003 Y NA
 290352 290353 LA_0898 LA_0899   maoC TRUE 0.983 13.000 0.039 NA   NA
 290353 290354 LA_0899 LA_0900 maoC marR TRUE 0.981 31.000 0.039 1.000 N NA
 290354 290357 LA_0900 LA_0903 marR   FALSE 0.007 1544.000 0.000 1.000   NA
 290357 290359 LA_0903 LA_0905     FALSE 0.004 766.000 0.000 NA   NA
 290360 290362 LA_0906 LA_0908     FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 290363 290365 LA_0909 LA_0910 mgsA   FALSE 0.004 625.000 0.000 NA   NA
 290366 290367 LA_0912 LA_0913     TRUE 0.995 -3.000 0.200 0.031   NA
 290367 10350621 LA_0913 LA_0913a     FALSE 0.005 492.000 0.000 NA   NA
 10350621 290368 LA_0913a LA_0914     FALSE 0.679 45.000 0.000 NA   NA
 290368 290369 LA_0914 LA_0915   acuC FALSE 0.003 971.000 0.000 NA   NA
 290372 290373 LA_0918 LA_0919 caiD   TRUE 0.992 0.000 0.333 1.000   NA
 290377 290378 LA_0923 LA_0924     FALSE 0.495 62.000 0.000 NA   NA
 290378 290379 LA_0924 LA_0925     FALSE 0.068 149.000 0.000 NA   NA
 290379 290381 LA_0925 LA_0927     FALSE 0.007 600.000 0.000 1.000   NA
 290381 290383 LA_0927 LA_0929     FALSE 0.006 888.000 0.000 1.000   NA
 290383 290384 LA_0929 LA_0930     TRUE 0.989 6.000 0.012 1.000 N NA
 290386 290388 LA_0932 LA_0934 pldB   FALSE 0.007 1716.000 0.000 1.000   NA
 290389 290390 LA_0935 LA_0936     FALSE 0.126 117.000 0.000 NA   NA
 290390 290391 LA_0936 LA_0937     TRUE 0.892 2.000 0.000 NA   NA
 290391 290392 LA_0937 LA_0938     FALSE 0.004 753.000 0.000 NA   NA
 290392 290393 LA_0938 LA_0939     TRUE 0.977 2.000 0.004 NA   NA
 290393 290394 LA_0939 LA_0940     TRUE 0.973 -9.000 0.004 NA   NA
 290395 290396 LA_0941 LA_0942   nusA TRUE 0.987 2.000 0.759 NA   NA
 290396 290397 LA_0942 LA_0943 nusA infB TRUE 0.960 65.000 0.342 0.023 N NA
 290397 290398 LA_0943 LA_0944 infB rbfA TRUE 0.995 10.000 0.530 1.000 Y NA
 290398 290399 LA_0944 LA_0945 rbfA truB TRUE 0.993 -43.000 0.111 1.000 Y NA
 290399 290400 LA_0945 LA_0946 truB rpsO TRUE 0.971 52.000 0.013 1.000 Y NA
 290400 290401 LA_0946 LA_0947 rpsO pnp TRUE 0.995 12.000 0.335 1.000 Y NA
 290401 290402 LA_0947 LA_0948 pnp pqqL TRUE 0.983 22.000 0.057 1.000   NA
 290402 290404 LA_0948 LA_0950 pqqL   FALSE 0.004 778.000 0.000 NA   NA
 290404 290405 LA_0950 LA_0951     FALSE 0.013 271.000 0.000 NA   NA
 290405 290406 LA_0951 LA_0952   glpG TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 290406 290408 LA_0952 LA_0954 glpG   FALSE 0.003 882.000 0.000 NA   NA
 290408 290410 LA_0954 LA_0956   gltB1 FALSE 0.006 423.000 0.000 NA   NA
 290412 290413 LA_0958 LA_0959     FALSE 0.004 616.000 0.000 NA   NA
 290414 290416 LA_0960 LA_0962     FALSE 0.008 344.000 0.000 NA   NA
 290416 290418 LA_0962 LA_0964   recQ FALSE 0.007 709.000 0.000 1.000   NA
 290419 290420 LA_0965 LA_0966 recC recB TRUE 0.997 -10.000 0.542 0.001 Y NA
 290420 290421 LA_0966 LA_0967 recB recD TRUE 0.998 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 290421 290423 LA_0967 LA_0969 recD ccmA FALSE 0.028 314.000 0.000 1.000 N NA
 290423 290424 LA_0969 LA_0970 ccmA   TRUE 0.990 -3.000 0.048 1.000   NA
 290424 290425 LA_0970 LA_0971   fabG TRUE 0.924 10.000 0.000 1.000   NA
 290429 290432 LA_0975 LA_0978     FALSE 0.004 662.000 0.000 NA   NA
 290432 290433 LA_0978 LA_0979     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 290434 290437 LA_0980 LA_0983 thiC   FALSE 0.004 1259.000 0.000 NA   NA
 290437 290438 LA_0983 LA_0984   cdc9 FALSE 0.097 129.000 0.000 NA   NA
 290438 290439 LA_0984 LA_0985 cdc9   FALSE 0.274 104.000 0.000 1.000   NA
 290439 290440 LA_0985 LA_0986     FALSE 0.007 378.000 0.000 NA   NA
 290440 290443 LA_0986 LA_0989     FALSE 0.004 764.000 0.000 NA   NA
 290445 290446 LA_0991 LA_0992     TRUE 0.943 49.000 0.067 NA   NA
 290447 290448 LA_0993 LA_0994 cyaA4   TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290448 290449 LA_0994 LA_0995     TRUE 0.882 5.000 0.000 NA   NA
 290449 290450 LA_0995 LA_0996     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 290450 290451 LA_0996 LA_0997     FALSE 0.005 541.000 0.000 NA   NA
 10350622 290453 LA_0997a LA_0999     TRUE 0.894 1.000 0.000 NA   NA
 290453 290454 LA_0999 LA_1000     FALSE 0.078 142.000 0.000 NA   NA
 290454 290455 LA_1000 LA_1001   vapC FALSE 0.199 98.000 0.000 NA   NA
 290455 290456 LA_1001 LA_1002 vapC vagC TRUE 0.989 0.000 0.359 NA   NA
 290456 290457 LA_1002 LA_1003 vagC   FALSE 0.017 248.000 0.000 NA   NA
 290457 290458 LA_1003 LA_1004     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 290458 290459 LA_1004 LA_1005     FALSE 0.021 226.000 0.000 NA   NA
 290460 290461 LA_1006 LA_1007   btuE FALSE 0.011 668.000 0.000 1.000 N NA
 290461 290462 LA_1007 LA_1008 btuE phuW FALSE 0.025 696.000 0.011 NA   NA
 290462 290463 LA_1008 LA_1009 phuW mrcA TRUE 0.955 37.000 0.016 NA   NA
 290463 290464 LA_1009 LA_1010 mrcA   TRUE 0.985 -10.000 0.667 NA   NA
 290464 290467 LA_1010 LA_1013     FALSE 0.004 1038.000 0.000 NA   NA
 290468 290469 LA_1014 LA_1015     FALSE 0.017 250.000 0.000 NA   NA
 290469 290470 LA_1015 LA_1016     TRUE 0.882 5.000 0.000 NA   NA
 290470 290471 LA_1016 LA_1017     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290471 290472 LA_1017 LA_1018     FALSE 0.010 313.000 0.000 NA   NA
 290472 290473 LA_1018 LA_1019     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290473 290474 LA_1019 LA_1020   rpmE TRUE 0.913 59.000 0.004 1.000 N NA
 290474 290475 LA_1020 LA_1021 rpmE rho TRUE 0.988 21.000 0.115 1.000 N NA
 290475 290476 LA_1021 LA_1022 rho   FALSE 0.118 148.000 0.000 1.000   NA
 290477 290478 LA_1023 LA_1024     TRUE 0.872 9.000 0.000 NA   NA
 290481 290483 LA_1027 LA_1029 sph1 sph2 FALSE 0.018 1005.000 0.000 0.002   NA
 290483 290484 LA_1029 LA_1030 sph2   FALSE 0.007 698.000 0.000 1.000   NA
 290490 290491 LA_1036 LA_1037     FALSE 0.009 327.000 0.000 NA   NA
 290491 290493 LA_1037 LA_1039     FALSE 0.006 421.000 0.000 NA   NA
 290493 290494 LA_1039 LA_1040     FALSE 0.174 104.000 0.000 NA   NA
 290494 290497 LA_1040 LA_1043   nlpD FALSE 0.004 738.000 0.000 NA   NA
 290497 290498 LA_1043 LA_1044 nlpD   TRUE 0.972 54.000 0.214 NA Y NA
 290498 290499 LA_1044 LA_1045   mrcA TRUE 0.846 102.000 0.125 NA Y NA
 290499 290500 LA_1045 LA_1046 mrcA   TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 290501 290502 LA_1047 LA_1048 lysA ispD TRUE 0.987 -22.000 0.024 1.000 N NA
 290502 290505 LA_1048 LA_1051 ispD   FALSE 0.004 1592.000 0.000 NA   NA
 290505 290506 LA_1051 LA_1052     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290506 290507 LA_1052 LA_1053     TRUE 0.862 14.000 0.000 NA   NA
 290507 290508 LA_1053 LA_1054     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290508 290509 LA_1054 LA_1055     FALSE 0.158 107.000 0.000 NA   NA
 290509 290510 LA_1055 LA_1056     FALSE 0.512 61.000 0.000 NA   NA
 290510 290511 LA_1056 LA_1057     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290511 290512 LA_1057 LA_1058     TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 290512 290513 LA_1058 LA_1059     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290513 290514 LA_1059 LA_1060     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290514 290515 LA_1060 LA_1061     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290515 290516 LA_1061 LA_1062     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 290516 290517 LA_1062 LA_1063     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290517 290518 LA_1063 LA_1064     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290518 290519 LA_1064 LA_1065     TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 290519 290520 LA_1065 LA_1066     FALSE 0.074 145.000 0.000 NA   NA
 290520 290521 LA_1066 LA_1067     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 290523 290524 LA_1069 LA_1070   cyaA FALSE 0.605 126.000 0.667 1.000   NA
 290524 290525 LA_1070 LA_1071 cyaA   TRUE 0.879 6.000 0.000 NA   NA
 290525 290526 LA_1071 LA_1072     FALSE 0.004 665.000 0.000 NA   NA
 290526 290527 LA_1072 LA_1073     FALSE 0.636 112.000 0.341 NA   NA
 290527 290528 LA_1073 LA_1074   mhpD FALSE 0.004 734.000 0.000 NA   NA
 290533 290534 LA_1079 LA_1080   pepN TRUE 0.746 36.000 0.000 NA   NA
 290534 290535 LA_1080 LA_1081 pepN   FALSE 0.149 140.000 0.000 NA N NA
 290535 290536 LA_1081 LA_1082     TRUE 0.982 2.000 0.010 NA   NA
 290539 290540 LA_1085 LA_1086 uvrD   TRUE 0.935 3.000 0.000 1.000   NA
 290540 290541 LA_1086 LA_1087     TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 290541 290542 LA_1087 LA_1088     TRUE 0.978 -30.000 1.000 NA   NA
 290542 290544 LA_1088 LA_1090     FALSE 0.004 573.000 0.000 NA   NA
 290548 290549 LA_1094 LA_1095     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 290550 290551 LA_1096 LA_1097 lpxB   TRUE 0.937 53.000 0.173 NA   NA
 290551 290552 LA_1097 LA_1098     TRUE 0.978 13.000 0.011 NA   NA
 290552 290553 LA_1098 LA_1099     TRUE 0.947 39.000 0.011 NA   NA
 290553 290554 LA_1099 LA_1100     TRUE 0.976 22.000 1.000 NA   NA
 290554 290555 LA_1100 LA_1101   sucD FALSE 0.172 287.000 0.222 1.000 N NA
 290555 290556 LA_1101 LA_1102 sucD sucC TRUE 0.997 13.000 0.059 0.001 Y NA
 290556 290557 LA_1102 LA_1103 sucC   FALSE 0.004 1209.000 0.000 NA   NA
 290557 290558 LA_1103 LA_1104   dnaJ3 TRUE 0.982 -31.000 0.400 NA   NA
 290559 290560 LA_1105 LA_1106 miaB   TRUE 0.984 -3.000 0.005 1.000   NA
 290560 290561 LA_1106 LA_1107     TRUE 0.949 32.000 0.005 NA   NA
 10350624 10350625 LA_t08 LA_t09 tRNA-Glu-TTC tRNA-Lys-TTT TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 10350625 290564 LA_t09 LA_1110 tRNA-Lys-TTT purA FALSE 0.381 74.000 0.000 NA   NA
 290564 290565 LA_1110 LA_1111 purA hisS2 TRUE 0.980 38.000 0.161 1.000 N NA
 290566 290568 LA_1112 LA_1114 gpsA   FALSE 0.012 606.000 0.000 1.000 N NA
 290573 290575 LA_1119 LA_1121 dut   FALSE 0.004 1171.000 0.000 NA   NA
 290576 290577 LA_1122 LA_1123     FALSE 0.004 557.000 0.000 NA   NA
 290577 290578 LA_1123 LA_1124   cutE TRUE 0.963 0.000 0.000 1.000 N NA
 290582 290583 LA_1128 LA_1129 splB   TRUE 0.848 -22.000 0.000 NA   NA
 290583 290584 LA_1129 LA_1130   fadE1 FALSE 0.046 174.000 0.000 NA   NA
 290584 290585 LA_1130 LA_1131 fadE1 pcm FALSE 0.130 171.000 0.000 1.000 N NA
 290587 10350628 LA_1133 LA_1133a     FALSE 0.006 432.000 0.000 NA   NA
 10350628 290589 LA_1133a LA_1135     FALSE 0.004 726.000 0.000 NA   NA
 290589 290590 LA_1135 LA_1136     FALSE 0.006 459.000 0.000 NA   NA
 290590 290591 LA_1136 LA_1137     TRUE 0.985 22.000 0.300 1.000   NA
 290591 290592 LA_1137 LA_1138   miaB TRUE 0.989 9.000 0.300 1.000   NA
 290592 290593 LA_1138 LA_1139 miaB pgsA TRUE 0.987 -3.000 0.003 1.000 N NA
 290593 290594 LA_1139 LA_1140 pgsA trpD TRUE 0.979 -25.000 0.003 1.000 N NA
 290594 290595 LA_1140 LA_1141 trpD yajC TRUE 0.894 56.000 0.003 NA N NA
 290595 10350629 LA_1141 LA_1141a yajC   TRUE 0.977 -3.000 0.003 NA   NA
 10350629 290596 LA_1141a LA_1142   secD TRUE 0.983 11.000 0.038 NA   NA
 290596 290597 LA_1142 LA_1143 secD secF TRUE 0.998 5.000 0.244 0.001 Y NA
 290597 290598 LA_1143 LA_1144 secF ribD1 TRUE 0.993 0.000 0.100 1.000 N NA
 290598 290599 LA_1144 LA_1145 ribD1 ribC TRUE 0.990 -15.000 0.002 1.000 Y NA
 290599 290601 LA_1145 LA_1147 ribC ribB FALSE 0.097 1644.000 0.040 1.000 Y NA
 290601 290606 LA_1147 LA_1152 ribB   FALSE 0.004 1460.000 0.000 NA   NA
 290606 290609 LA_1152 LA_1155   sbp FALSE 0.004 1985.000 0.000 NA   NA
 290609 290610 LA_1155 LA_1156 sbp cysU TRUE 0.988 34.000 0.026 0.002 N NA
 290610 290611 LA_1156 LA_1157 cysU cysW TRUE 0.996 -3.000 0.935 0.001 N NA
 290611 290612 LA_1157 LA_1158 cysW cysA TRUE 0.996 2.000 0.587 1.000 Y NA
 290613 290615 LA_1159 LA_1161   fadL FALSE 0.004 1637.000 0.000 NA   NA
 290616 290617 LA_1162 LA_1163     TRUE 0.882 5.000 0.000 NA   NA
 290617 290618 LA_1163 LA_1164     TRUE 0.986 10.000 0.500 NA   NA
 290618 290620 LA_1164 LA_1166   pdxH FALSE 0.011 422.000 0.000 1.000   NA
 290620 290621 LA_1166 LA_1167 pdxH   FALSE 0.048 171.000 0.000 NA   NA
 290621 290622 LA_1167 LA_1168     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290627 290628 LA_1173 LA_1174 acs   FALSE 0.015 507.000 0.000 1.000 N NA
 290628 290629 LA_1174 LA_1175   mutL FALSE 0.082 206.000 0.000 1.000 N NA
 290629 290630 LA_1175 LA_1176 mutL   TRUE 0.958 -31.000 0.002 NA   NA
 290632 290633 LA_1178 LA_1179     TRUE 0.977 -3.000 0.003 NA   NA
 290634 290635 LA_1180 LA_1182   hisC FALSE 0.004 671.000 0.000 NA   NA
 290636 290637 LA_1181 LA_1183     TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 290639 290640 LA_1185 LA_1186     FALSE 0.607 121.000 0.000 0.020 Y NA
 290640 290642 LA_1186 LA_1188     FALSE 0.006 1156.000 0.000 1.000   NA
 290642 290643 LA_1188 LA_1189     FALSE 0.051 165.000 0.000 NA   NA
 290643 290644 LA_1189 LA_1190     TRUE 0.941 52.000 0.286 NA   NA
 290645 290646 LA_1191 LA_1192     TRUE 0.803 26.000 0.000 NA   NA
 290646 10350630 LA_1192 LA_1192a     TRUE 0.870 -10.000 0.000 NA   NA
 10350630 290649 LA_1192a LA_1196     FALSE 0.004 684.000 0.000 NA   NA
 290650 290651 LA_1195 LA_1197   rsbU TRUE 0.979 -25.000 1.000 NA   NA
 290651 290652 LA_1197 LA_1198 rsbU ech4 TRUE 0.991 8.000 0.081 1.000 N NA
 290652 290654 LA_1198 LA_1200 ech4   FALSE 0.009 315.000 0.000 NA   NA
 290657 290658 LA_1203 LA_1204 dltB   FALSE 0.518 133.000 0.273 NA   NA
 290658 290659 LA_1204 LA_1205   rpoE TRUE 0.902 64.000 0.125 NA   NA
 290659 290660 LA_1205 LA_1206 rpoE   TRUE 0.987 -19.000 0.188 1.000   NA
 290660 290661 LA_1206 LA_1207     FALSE 0.007 691.000 0.000 1.000   NA
 290661 290663 LA_1207 LA_1209     FALSE 0.094 160.000 0.000 1.000   NA
 290667 290668 LA_1213 LA_1214   tlpB FALSE 0.004 1280.000 0.000 NA   NA
 290671 290673 LA_1217 LA_1219   glpG FALSE 0.004 731.000 0.000 NA   NA
 290674 290675 LA_1220 LA_1221   mrcA TRUE 0.990 -3.000 1.000 1.000   NA
 290675 290676 LA_1221 LA_1222 mrcA aceF TRUE 0.754 88.000 0.004 1.000 N NA
 290676 290677 LA_1222 LA_1223 aceF lpd TRUE 0.995 14.000 0.253 1.000 Y NA
 290677 290678 LA_1223 LA_1224 lpd sucA TRUE 0.988 24.000 0.005 1.000 Y NA
 290678 290679 LA_1224 LA_1225 sucA   FALSE 0.014 267.000 0.000 NA   NA
 290679 290680 LA_1225 LA_1226     FALSE 0.061 157.000 0.000 NA   NA
 290680 290682 LA_1226 LA_1228     FALSE 0.005 477.000 0.000 NA   NA
 290684 290685 LA_1230 LA_1231   htpG1 TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290685 290687 LA_1231 LA_1233 htpG1   FALSE 0.011 693.000 0.000 1.000 N NA
 290687 290688 LA_1233 LA_1234     FALSE 0.008 525.000 0.000 1.000   NA
 290688 290689 LA_1234 LA_1235     TRUE 0.861 -15.000 0.000 NA   NA
 290689 290692 LA_1235 LA_1238     FALSE 0.004 1844.000 0.000 NA   NA
 290692 290693 LA_1238 LA_1239   carA TRUE 0.973 6.000 0.004 NA   NA
 290695 10350631 LA_1241 LA_1241a     TRUE 0.886 4.000 0.000 NA   NA
 290696 290697 LA_1242 LA_1243 infC rpmI TRUE 0.990 33.000 0.652 1.000 Y NA
 290697 290698 LA_1243 LA_1244 rpmI rplT TRUE 0.997 0.000 0.928 0.018 Y NA
 290698 290699 LA_1244 LA_1245 rplT   FALSE 0.675 88.000 0.003 1.000   NA
 290699 290700 LA_1245 LA_1246   zapA TRUE 0.971 8.000 0.003 NA   NA
 290700 290701 LA_1246 LA_1247 zapA   TRUE 0.968 30.000 0.034 NA   NA
 290701 290704 LA_1247 LA_1250   cheW FALSE 0.012 609.000 0.000 1.000 N NA
 290704 290705 LA_1250 LA_1251 cheW cheA TRUE 0.998 0.000 0.070 0.012 Y NA
 290705 290706 LA_1251 LA_1252 cheA cheB TRUE 0.997 6.000 0.028 0.012 Y NA
 290706 290707 LA_1252 LA_1253 cheB cheY TRUE 0.997 2.000 0.028 0.020 Y NA
 290707 290708 LA_1253 LA_1254 cheY scpA TRUE 0.966 18.000 0.004 NA   NA
 290708 290709 LA_1254 LA_1255 scpA scpB TRUE 0.981 -33.000 0.570 NA   NA
 290709 290710 LA_1255 LA_1256 scpB pheA TRUE 0.985 -7.000 0.009 NA N NA
 290710 290711 LA_1256 LA_1257 pheA tyrA TRUE 0.996 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 290711 290712 LA_1257 LA_1258 tyrA aroA TRUE 0.994 -19.000 0.100 1.000 Y NA
 290712 290713 LA_1258 LA_1259 aroA cmk TRUE 0.992 -7.000 0.209 1.000 N NA
 290713 290714 LA_1259 LA_1260 cmk rpsA TRUE 0.962 53.000 0.281 1.000 N NA
 290714 290715 LA_1260 LA_1261 rpsA   TRUE 0.965 25.000 0.003 1.000   NA
 290715 290716 LA_1261 LA_1262   hisG TRUE 0.980 0.000 0.002 1.000   NA
 290716 290717 LA_1262 LA_1263 hisG rpmF FALSE 0.032 297.000 0.000 1.000 N NA
 290717 290718 LA_1263 LA_1264 rpmF plsX TRUE 0.992 6.000 0.418 1.000 N NA
 290718 290725 LA_1264 LA_1271 plsX   FALSE 0.004 1838.000 0.000 NA   NA
 290726 290727 LA_1272 LA_1273     FALSE 0.003 1022.000 0.000 NA   NA
 290729 290730 LA_1275 LA_1276     FALSE 0.072 146.000 0.000 NA   NA
 290736 290737 LA_1282 LA_1283     TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 290737 290738 LA_1283 LA_1284   lolE TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 290738 290739 LA_1284 LA_1285 lolE salX TRUE 0.993 2.000 0.067 1.000 N NA
 290739 290740 LA_1285 LA_1286 salX   TRUE 0.862 64.000 0.004 1.000   NA
 290740 290743 LA_1286 LA_1289     FALSE 0.004 621.000 0.000 NA   NA
 290744 290745 LA_1290 LA_1291     TRUE 0.830 -43.000 0.000 NA   NA
 290745 290746 LA_1291 LA_1292     FALSE 0.005 502.000 0.000 NA   NA
 290746 290747 LA_1292 LA_1293     TRUE 0.986 -16.000 0.008 1.000 N NA
 290749 290751 LA_1295 LA_1297     FALSE 0.005 544.000 0.000 NA   NA
 290756 290757 LA_1302 LA_1303 smpB engA TRUE 0.969 25.000 0.005 1.000   NA
 290757 290758 LA_1303 LA_1304 engA   TRUE 0.988 -3.000 0.014 1.000   NA
 290758 290759 LA_1304 LA_1305     TRUE 0.974 -25.000 0.012 NA   NA
 290759 290760 LA_1305 LA_1306     TRUE 0.761 89.000 0.667 NA   NA
 290764 290766 LA_1310 LA_1312     FALSE 0.004 567.000 0.000 NA   NA
 290766 10350632 LA_1312 LA_t11   tRNA-Met-CAT TRUE 0.823 23.000 0.000 NA   NA
 10350632 10350633 LA_t11 LA_1312a tRNA-Met-CAT   FALSE 0.512 61.000 0.000 NA   NA
 290767 290771 LA_1313 LA_1317 glnA   FALSE 0.004 792.000 0.000 NA   NA
 290775 290777 LA_1321 LA_1323 dsbD purL FALSE 0.011 1357.000 0.000 1.000 N NA
 290777 290778 LA_1323 LA_1324 purL   TRUE 0.976 16.000 0.004 1.000   NA
 290778 290779 LA_1324 LA_1325   ileS TRUE 0.980 8.000 0.004 1.000   NA
 290780 290781 LA_1326 LA_1327     TRUE 0.989 -3.000 0.600 NA   NA
 290782 290783 LA_1328 LA_1329     TRUE 0.982 16.000 0.750 NA   NA
 290783 290784 LA_1329 LA_1330     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290784 290785 LA_1330 LA_1331     FALSE 0.096 130.000 0.000 NA   NA
 290787 290788 LA_1333 LA_1334 gatA   FALSE 0.006 968.000 0.000 1.000   NA
 290788 290789 LA_1334 LA_1335   aarF TRUE 0.985 12.000 0.111 NA   NA
 290789 290790 LA_1335 LA_1336 aarF lspA TRUE 0.989 -3.000 0.111 NA   NA
 290790 290791 LA_1336 LA_1337 lspA crp TRUE 0.990 5.000 0.074 NA N NA
 290791 290792 LA_1337 LA_1338 crp perM TRUE 0.984 -7.000 0.034 NA   NA
 290793 290794 LA_1339 LA_1340   nctP1 FALSE 0.035 309.000 0.000 0.072   NA
 290799 290801 LA_1345 LA_1347     FALSE 0.018 240.000 0.000 NA   NA
 290801 290802 LA_1347 LA_1348     TRUE 0.995 -7.000 0.047 1.000 Y NA
 290805 290807 LA_1351 LA_1353 capA1   FALSE 0.004 1040.000 0.000 NA   NA
 290807 290808 LA_1353 LA_1354     FALSE 0.697 75.000 0.000 0.022   NA
 290808 290810 LA_1354 LA_1356   cirA FALSE 0.008 595.000 0.000 1.000   NA
 290810 290811 LA_1356 LA_1357 cirA   TRUE 0.988 2.000 0.667 NA   NA
 290811 290812 LA_1357 LA_1358   arp FALSE 0.004 624.000 0.000 NA   NA
 290812 290813 LA_1358 LA_1359 arp   FALSE 0.005 478.000 0.000 NA   NA
 290813 290815 LA_1359 LA_1361     FALSE 0.003 964.000 0.000 NA   NA
 290815 290816 LA_1361 LA_1362     FALSE 0.024 220.000 0.000 NA   NA
 290816 290817 LA_1362 LA_1363     FALSE 0.036 195.000 0.000 NA   NA
 290817 290818 LA_1363 LA_1364     TRUE 0.981 7.000 0.014 NA   NA
 290818 290819 LA_1364 LA_1365   dltB TRUE 0.926 36.000 0.002 NA   NA
 290819 290820 LA_1365 LA_1366 dltB   TRUE 0.984 -22.000 0.273 NA   NA
 290826 290828 LA_1372 LA_1374 tetA1   FALSE 0.003 1006.000 0.000 NA   NA
 290829 290831 LA_1375 LA_1377     FALSE 0.006 881.000 0.000 1.000   NA
 290832 290836 LA_1378 LA_1382 bipA   FALSE 0.011 1297.000 0.000 1.000 N NA
 290836 290837 LA_1382 LA_1383     FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 290838 290839 LA_1384 LA_1385     FALSE 0.054 160.000 0.000 NA   NA
 290839 290842 LA_1385 LA_1388   grs1 FALSE 0.004 1226.000 0.000 NA   NA
 290843 290844 LA_1389 LA_1390     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 290844 290845 LA_1390 LA_1391   prmA TRUE 0.984 -3.000 0.014 NA   NA
 290845 290846 LA_1391 LA_1392 prmA rbsK TRUE 0.987 5.000 0.014 NA N NA
 290847 290850 LA_1393 LA_1396     FALSE 0.004 605.000 0.000 NA   NA
 290850 290851 LA_1396 LA_1397     TRUE 0.916 59.000 0.750 NA   NA
 290851 290852 LA_1397 LA_1398     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 290854 290856 LA_1400 LA_1402     FALSE 0.003 984.000 0.000 NA   NA
 290856 290857 LA_1402 LA_1403     FALSE 0.004 2121.000 0.000 NA   NA
 290857 290858 LA_1403 LA_1404     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 290863 290864 LA_1409 LA_1410 glyA lplA TRUE 0.969 40.000 0.012 1.000 N NA
 290864 290866 LA_1410 LA_1412 lplA   FALSE 0.003 887.000 0.000 NA   NA
 290868 290870 LA_1413 LA_1416   prpB FALSE 0.004 696.000 0.000 NA   NA
 290870 290871 LA_1416 LA_1417 prpB gloA FALSE 0.013 370.000 0.000 1.000   NA
 290873 290874 LA_1419 LA_1420 cyaA   TRUE 0.808 25.000 0.000 NA   NA
 290874 290875 LA_1420 LA_1421     TRUE 0.988 3.000 0.667 NA   NA
 290875 290876 LA_1421 LA_1422     TRUE 0.966 38.000 0.154 NA   NA
 290876 290877 LA_1422 LA_1423   fabH TRUE 0.969 25.000 0.015 NA   NA
 290877 290878 LA_1423 LA_1424 fabH scoA TRUE 0.983 34.000 0.015 NA Y NA
 290879 290881 LA_1425 LA_1427   fabG FALSE 0.007 367.000 0.000 NA   NA
 290881 290882 LA_1427 LA_1428 fabG ptc1 FALSE 0.011 698.000 0.000 1.000 N NA
 290883 290884 LA_1429 LA_1430   fabB TRUE 0.985 11.000 0.667 NA   NA
 290884 290886 LA_1430 LA_1432 fabB   FALSE 0.011 1351.000 0.000 1.000 N NA
 290886 290887 LA_1432 LA_1433     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 290887 290889 LA_1433 LA_1435     FALSE 0.004 1696.000 0.000 NA   NA
 290889 290890 LA_1435 LA_1436   hit TRUE 0.969 17.000 0.005 NA   NA
 290890 290891 LA_1436 LA_1437 hit nagC TRUE 0.994 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 290891 290892 LA_1437 LA_1438 nagC salX TRUE 0.993 -3.000 0.086 1.000 N NA
 290892 290893 LA_1438 LA_1439 salX   TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000   NA
 290895 290897 LA_1441 LA_1444     FALSE 0.003 862.000 0.000 NA   NA
 290898 290899 LA_1443 LA_1445     TRUE 0.989 0.000 0.250 NA   NA
 290899 290900 LA_1445 LA_1446   czcB TRUE 0.994 18.000 0.375 1.000 Y NA
 290900 290901 LA_1446 LA_1447 czcB lexA TRUE 0.962 53.000 0.167 1.000 N NA
 290901 290902 LA_1447 LA_1448 lexA   TRUE 0.966 39.000 0.250 NA   NA
 290902 290903 LA_1448 LA_1449   prc TRUE 0.976 -10.000 0.006 NA   NA
 290903 290904 LA_1449 LA_1450 prc qri7 TRUE 0.993 5.000 0.017 0.033 N NA
 290904 290905 LA_1450 LA_1451 qri7 pssA TRUE 0.986 -3.000 0.003 1.000 N NA
 290906 290907 LA_1452 LA_1453     FALSE 0.031 203.000 0.000 NA   NA
 290907 290908 LA_1453 LA_1454     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 290909 290910 LA_1455 LA_1456   radC TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 290910 290911 LA_1456 LA_1457 radC tagG TRUE 0.989 -6.000 0.050 NA N NA
 290911 290912 LA_1457 LA_1458 tagG tagH TRUE 0.995 -3.000 0.050 NA Y NA
 290912 290913 LA_1458 LA_1459 tagH ugd TRUE 0.980 49.000 0.059 1.000 Y NA
 290916 290917 LA_1462 LA_1463 purK purE TRUE 0.997 12.000 0.201 0.001 Y NA
 290917 290918 LA_1463 LA_1464 purE murF TRUE 0.930 51.000 0.003 1.000 N NA
 290921 290922 LA_1467 LA_1468     TRUE 0.879 6.000 0.000 NA   NA
 290922 10350636 LA_1468 LA_1468a     TRUE 0.979 22.000 0.667 NA   NA
 10350636 290924 LA_1468a LA_1470     FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 290933 290934 LA_1479 LA_1480     TRUE 0.892 2.000 0.000 NA   NA
 290934 290935 LA_1480 LA_1481   proC TRUE 0.892 2.000 0.000 NA   NA
 290937 290939 LA_1483 LA_1484     FALSE 0.036 1141.000 0.143 NA   NA
 290939 290940 LA_1484 LA_1486     TRUE 0.983 -21.000 0.667 NA   NA
 290940 290941 LA_1486 LA_1487   mnmA TRUE 0.983 -3.000 0.004 1.000   NA
 290941 290942 LA_1487 LA_1488 mnmA lldD TRUE 0.989 17.000 0.006 0.097 N NA
 290942 290943 LA_1488 LA_1489 lldD   TRUE 0.812 81.000 0.048 NA   NA
 290943 290944 LA_1489 LA_1490   rluA TRUE 0.985 9.000 0.088 NA   NA
 290944 290945 LA_1490 LA_1491 rluA nhaC TRUE 0.988 -3.000 0.019 1.000   NA
 290945 290946 LA_1491 LA_1492 nhaC   TRUE 0.994 9.000 0.047 0.001   NA
 290946 290947 LA_1492 LA_1493   nlpD FALSE 0.265 197.000 0.019 1.000   NA
 290947 290948 LA_1493 LA_1494 nlpD   FALSE 0.058 159.000 0.000 NA   NA
 290948 290949 LA_1494 LA_1495     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 290949 290950 LA_1495 LA_1496     TRUE 0.781 30.000 0.000 NA   NA
 290951 290952 LA_1497 LA_1498     TRUE 0.816 24.000 0.000 NA   NA
 290952 290953 LA_1498 LA_1499     FALSE 0.243 89.000 0.000 NA   NA
 290961 290962 LA_1507 LA_1508     TRUE 0.985 8.000 0.667 NA   NA
 290962 290964 LA_1508 LA_1510     FALSE 0.005 532.000 0.000 NA   NA
 290965 290966 LA_1511 LA_1513 nadB prc TRUE 0.990 2.000 0.013 1.000 N NA
 290969 290970 LA_1515 LA_1516   miaA TRUE 0.985 10.000 0.017 1.000   NA
 290970 290971 LA_1516 LA_1517 miaA hfq TRUE 0.982 17.000 0.017 1.000   NA
 290971 10350638 LA_1517 LA_1517a hfq   TRUE 0.989 0.000 0.667 NA   NA
 10350638 290972 LA_1517a LA_1518   manC TRUE 0.986 -3.000 0.032 NA   NA
 290974 290975 LA_1520 LA_1521   cheW TRUE 0.985 9.000 0.750 NA   NA
 290975 290976 LA_1521 LA_1522 cheW   TRUE 0.923 -10.000 0.000 1.000   NA
 290977 290978 LA_1523 LA_1524     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 290978 290980 LA_1524 LA_1526     FALSE 0.041 181.000 0.000 NA   NA
 290982 10350639 LA_1528 LA_1528a     FALSE 0.553 71.000 0.000 1.000   NA
 290989 290990 LA_1535 LA_1536     FALSE 0.135 114.000 0.000 NA   NA
 290990 290991 LA_1536 LA_1537     TRUE 0.894 1.000 0.000 NA   NA
 290992 290993 LA_1538 LA_1539     TRUE 0.832 21.000 0.000 NA   NA
 290993 290995 LA_1539 LA_1541     FALSE 0.004 766.000 0.000 NA   NA
 290995 290996 LA_1541 LA_1542     TRUE 0.981 -37.000 0.192 NA   NA
 290996 290997 LA_1542 LA_1543     FALSE 0.006 472.000 0.000 NA   NA
 291000 291002 LA_1547 LA_1548   kefB FALSE 0.225 134.000 0.000 1.000 N NA
 291002 291003 LA_1548 LA_1549 kefB   TRUE 0.849 47.000 0.000 1.000 N NA
 291003 291004 LA_1549 LA_1550     TRUE 0.986 1.000 1.000 NA   NA
 291004 291006 LA_1550 LA_1552     FALSE 0.043 177.000 0.000 NA   NA
 291007 291008 LA_1553 LA_1554     TRUE 0.964 41.000 0.333 NA   NA
 291008 291009 LA_1554 LA_1555     TRUE 0.978 -13.000 0.013 NA   NA
 291009 291010 LA_1555 LA_1556     FALSE 0.068 347.000 0.013 1.000   NA
 291010 291013 LA_1556 LA_1559     FALSE 0.008 345.000 0.000 NA   NA
 291014 291017 LA_1560 LA_1563   ibpA FALSE 0.004 1379.000 0.000 NA   NA
 291017 291018 LA_1563 LA_1564 ibpA ibpA TRUE 0.992 21.000 0.250 NA Y NA
 291018 291019 LA_1564 LA_1565 ibpA   FALSE 0.006 469.000 0.000 NA   NA
 291019 291020 LA_1565 LA_1566     FALSE 0.019 238.000 0.000 NA   NA
 291020 291021 LA_1566 LA_1567     FALSE 0.003 946.000 0.000 NA   NA
 291021 291022 LA_1567 LA_1568     TRUE 0.854 -19.000 0.000 NA   NA
 291022 291023 LA_1568 LA_1569     FALSE 0.006 448.000 0.000 NA   NA
 291023 291026 LA_1569 LA_1572     FALSE 0.003 889.000 0.000 NA   NA
 291030 291031 LA_1576 LA_1577   wcaG TRUE 0.989 5.000 0.059 1.000   NA
 291031 291032 LA_1577 LA_1578 wcaG   TRUE 0.911 17.000 0.000 1.000   NA
 291032 291033 LA_1578 LA_1579   gmhA TRUE 0.856 32.000 0.000 1.000   NA
 291033 291034 LA_1579 LA_1580 gmhA wcaG TRUE 0.979 7.000 0.000 1.000 Y NA
 291034 291035 LA_1580 LA_1581 wcaG gcd1 TRUE 0.976 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 291035 291036 LA_1581 LA_1582 gcd1 rfaE TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.017 Y NA
 291036 291037 LA_1582 LA_1583 rfaE wcaG TRUE 0.996 3.000 0.222 1.000 Y NA
 291037 291038 LA_1583 LA_1584 wcaG   TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291038 291039 LA_1584 LA_1585   tktN1 TRUE 0.986 13.000 0.308 NA   NA
 291039 291040 LA_1585 LA_1586 tktN1 tktC1 TRUE 0.994 -9.000 0.778 NA Y NA
 291040 291041 LA_1586 LA_1587 tktC1   FALSE 0.007 380.000 0.000 NA   NA
 291041 291042 LA_1587 LA_1588     TRUE 0.987 -3.000 0.857 NA   NA
 291042 291043 LA_1588 LA_1589     TRUE 0.886 4.000 0.000 NA   NA
 291043 291044 LA_1589 LA_1590     TRUE 0.926 7.000 0.000 1.000   NA
 291046 291047 LA_1592 LA_1593 snoG1   TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 291047 291048 LA_1593 LA_1594   snoG2 TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291048 291049 LA_1594 LA_1595 snoG2 wecE TRUE 0.892 2.000 0.000 NA   NA
 291049 291050 LA_1595 LA_1596 wecE   TRUE 0.992 -7.000 0.100 1.000 N NA
 291050 291051 LA_1596 LA_1597     FALSE 0.013 271.000 0.000 NA   NA
 291051 291052 LA_1597 LA_1598   cysE2 FALSE 0.070 148.000 0.000 NA   NA
 291052 291053 LA_1598 LA_1599 cysE2   TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291053 291054 LA_1599 LA_1600   sunT FALSE 0.100 128.000 0.000 NA   NA
 291054 291055 LA_1600 LA_1601 sunT   FALSE 0.086 135.000 0.000 NA   NA
 291055 291056 LA_1601 LA_1602     TRUE 0.851 17.000 0.000 NA   NA
 291056 291057 LA_1602 LA_1603     TRUE 0.986 2.000 0.038 NA   NA
 291057 291058 LA_1603 LA_1604     FALSE 0.061 157.000 0.000 NA   NA
 291058 291059 LA_1604 LA_1605   neuA FALSE 0.046 174.000 0.000 NA   NA
 291059 291060 LA_1605 LA_1606 neuA wcaG TRUE 0.995 3.000 0.020 1.000 Y NA
 291060 291061 LA_1606 LA_1607 wcaG wecE TRUE 0.996 0.000 0.418 1.000 Y NA
 291061 291062 LA_1607 LA_1608 wecE   TRUE 0.990 -7.000 0.185 1.000   NA
 291062 291063 LA_1608 LA_1609   spsE TRUE 0.987 -22.000 0.292 1.000   NA
 291063 291064 LA_1609 LA_1610 spsE NnaC TRUE 0.996 -3.000 0.549 1.000 Y NA
 291064 291065 LA_1610 LA_1611 NnaC gcd1 FALSE 0.347 249.000 0.131 1.000 Y NA
 291065 291066 LA_1611 LA_1612 gcd1   FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 291066 291067 LA_1612 LA_1613   spsE TRUE 0.796 27.000 0.000 NA   NA
 291067 291068 LA_1613 LA_1614 spsE wecE TRUE 0.982 22.000 0.000 0.031 Y NA
 291068 291069 LA_1614 LA_1615 wecE neuA TRUE 0.981 5.000 0.000 1.000 Y NA
 291069 291070 LA_1615 LA_1616 neuA adeH FALSE 0.648 74.000 0.000 1.000 N NA
 291070 291071 LA_1616 LA_1617 adeH moaA TRUE 0.969 1.000 0.000 0.056   NA
 291071 291072 LA_1617 LA_1618 moaA   FALSE 0.014 264.000 0.000 NA   NA
 291072 291073 LA_1618 LA_1619   nodU FALSE 0.019 313.000 0.000 NA N NA
 291073 291074 LA_1619 LA_1620 nodU   FALSE 0.133 115.000 0.000 NA   NA
 291074 291075 LA_1620 LA_1621   nagB FALSE 0.297 161.000 0.019 NA   NA
 291075 291076 LA_1621 LA_1622 nagB wbbJ FALSE 0.221 113.000 0.000 1.000   NA
 291076 291078 LA_1622 LA_1624 wbbJ hpcH FALSE 0.007 613.000 0.000 1.000   NA
 291078 291079 LA_1624 LA_1625 hpcH kdsB TRUE 0.980 35.000 0.059 1.000 N NA
 291079 291080 LA_1625 LA_1626 kdsB   TRUE 0.987 3.000 0.013 1.000   NA
 291080 291081 LA_1626 LA_1627   suhB TRUE 0.988 13.000 0.087 1.000   NA
 291081 291082 LA_1627 LA_1628 suhB   FALSE 0.050 208.000 0.000 1.000   NA
 291082 291083 LA_1628 LA_1629   serA TRUE 0.977 44.000 0.095 0.056   NA
 291083 291084 LA_1629 LA_1630 serA   TRUE 0.986 -7.000 0.095 NA   NA
 291084 291085 LA_1630 LA_1631   gcd1 TRUE 0.871 11.000 0.000 NA   NA
 291085 291086 LA_1631 LA_1632 gcd1 rfbG TRUE 0.996 3.000 0.624 1.000 Y NA
 291086 291087 LA_1632 LA_1633 rfbG   TRUE 0.996 3.000 0.088 1.000 Y NA
 291087 291088 LA_1633 LA_1634   galE3 TRUE 0.994 0.000 0.006 1.000 Y NA
 291088 291089 LA_1634 LA_1635 galE3   TRUE 0.972 8.000 0.000 NA Y NA
 291089 291090 LA_1635 LA_1636     FALSE 0.121 119.000 0.000 NA   NA
 291090 291091 LA_1636 LA_1637     FALSE 0.100 128.000 0.000 NA   NA
 291091 291092 LA_1637 LA_1638     TRUE 0.923 11.000 0.000 1.000   NA
 291092 291093 LA_1638 LA_1639     TRUE 0.939 0.000 0.000 1.000   NA
 291093 291094 LA_1639 LA_1640     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291094 291095 LA_1640 LA_1641     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 291095 291096 LA_1641 LA_1642     FALSE 0.236 90.000 0.000 NA   NA
 291096 291097 LA_1642 LA_1643     FALSE 0.020 518.000 0.000 0.017   NA
 291097 291098 LA_1643 LA_1644     TRUE 0.989 7.000 0.162 1.000   NA
 291098 291099 LA_1644 LA_1645   wecB TRUE 0.996 4.000 0.477 1.000 Y NA
 291099 291100 LA_1645 LA_1646 wecB   TRUE 0.995 10.000 0.125 1.000 Y NA
 291100 291101 LA_1646 LA_1647   wcaJ TRUE 0.993 4.000 0.015 NA Y NA
 291101 291102 LA_1647 LA_1648 wcaJ   FALSE 0.621 50.000 0.000 NA   NA
 291102 291103 LA_1648 LA_1649   rfbX FALSE 0.009 324.000 0.000 NA   NA
 291103 291104 LA_1649 LA_1650 rfbX hlpA TRUE 0.987 4.000 0.100 NA   NA
 291104 291106 LA_1650 LA_1652 hlpA   FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 291106 291107 LA_1652 LA_1653     FALSE 0.004 641.000 0.000 NA   NA
 291107 291108 LA_1653 LA_1654     FALSE 0.067 150.000 0.000 NA   NA
 291108 291109 LA_1654 LA_1655   wecE TRUE 0.981 14.000 0.024 NA   NA
 291109 291110 LA_1655 LA_1656 wecE   FALSE 0.299 143.000 0.000 NA Y NA
 291110 291111 LA_1656 LA_1657     FALSE 0.005 510.000 0.000 NA   NA
 291111 291112 LA_1657 LA_1658     FALSE 0.004 714.000 0.000 NA   NA
 291112 291113 LA_1658 LA_1659   rfbC FALSE 0.160 196.000 0.000 NA Y NA
 291113 291114 LA_1659 LA_1660 rfbC rfbD TRUE 0.995 4.000 0.033 1.000 Y NA
 291114 291115 LA_1660 LA_1661 rfbD rfbB TRUE 0.997 -3.000 0.033 0.006 Y NA
 291115 291116 LA_1661 LA_1662 rfbB rfbA TRUE 0.998 1.000 0.222 0.007 Y NA
 291116 291117 LA_1662 LA_1663 rfbA   FALSE 0.004 1051.000 0.000 NA   NA
 291117 291118 LA_1663 LA_1664   rfbF2 TRUE 0.985 5.000 0.038 NA   NA
 291120 291121 LA_1666 LA_1667   citT TRUE 0.953 41.000 0.025 NA   NA
 291121 291122 LA_1667 LA_1668 citT   FALSE 0.006 1136.000 0.000 1.000   NA
 291122 291123 LA_1668 LA_1669     TRUE 0.894 1.000 0.000 NA   NA
 291123 291125 LA_1669 LA_1671     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 291125 291128 LA_1671 LA_1674   capA2 FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   NA
 291128 291129 LA_1674 LA_1675 capA2 rpsF TRUE 0.779 65.000 0.002 NA   NA
 291129 291130 LA_1675 LA_1676 rpsF ssb TRUE 0.990 -7.000 0.025 1.000 N NA
 291130 291131 LA_1676 LA_1677 ssb rpsR TRUE 0.988 12.000 0.016 1.000 N NA
 291131 291132 LA_1677 LA_1678 rpsR rplI TRUE 0.997 10.000 0.499 0.017 Y NA
 291132 291133 LA_1678 LA_1679 rplI dnaB TRUE 0.989 18.000 0.100 1.000 N NA
 291133 291134 LA_1679 LA_1680 dnaB aspS TRUE 0.976 33.000 0.003 0.094 N NA
 291134 291135 LA_1680 LA_1681 aspS   FALSE 0.149 110.000 0.000 NA   NA
 291135 291136 LA_1681 LA_1682   phoH TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 291136 291137 LA_1682 LA_1683 phoH   TRUE 0.985 5.000 0.009 1.000   NA
 291137 291138 LA_1683 LA_1684     TRUE 0.888 69.000 0.182 NA   NA
 291138 291139 LA_1684 LA_1685   recO TRUE 0.967 -27.000 0.005 NA   NA
 291139 291140 LA_1685 LA_1686 recO   TRUE 0.963 -16.000 0.002 NA   NA
 291140 291142 LA_1686 LA_1688   argS FALSE 0.006 403.000 0.000 NA   NA
 291142 291143 LA_1688 LA_1689 argS cinA TRUE 0.981 0.000 0.003 1.000   NA
 291143 291144 LA_1689 LA_1690 cinA   TRUE 0.983 -3.000 0.010 NA   NA
 291145 291146 LA_1691 LA_1692     FALSE 0.004 557.000 0.000 NA   NA
 291146 291147 LA_1692 LA_1693   baeS TRUE 0.997 0.000 0.026 0.094 Y NA
 291147 291148 LA_1693 LA_1694 baeS   TRUE 0.984 7.000 1.000 NA   NA
 291148 291149 LA_1694 LA_1695   secG TRUE 0.786 68.000 0.003 NA   NA
 291149 291150 LA_1695 LA_1696 secG tpiA FALSE 0.669 97.000 0.002 1.000 N NA
 291154 291155 LA_1700 LA_1701     FALSE 0.264 86.000 0.000 NA   NA
 291155 291156 LA_1701 LA_1702     FALSE 0.403 85.000 0.000 1.000   NA
 291156 291157 LA_1702 LA_1703   pgk TRUE 0.826 39.000 0.000 1.000   NA
 291157 291158 LA_1703 LA_1704 pgk gapA TRUE 0.996 4.000 0.007 0.003 Y NA
 291163 291164 LA_1709 LA_1710     TRUE 0.931 5.000 0.000 1.000   NA
 291164 291165 LA_1710 LA_1711     TRUE 0.961 -22.000 0.000 0.014   NA
 291165 291166 LA_1711 LA_1712   sipA FALSE 0.085 167.000 0.000 1.000   NA
 291168 291169 LA_1713 LA_1715 paaY   FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 291169 291173 LA_1715 LA_1719   cysK FALSE 0.004 676.000 0.000 NA   NA
 291173 291175 LA_1719 LA_1721 cysK topA FALSE 0.030 1543.000 0.002 1.000 N NA
 291178 291179 LA_1724 LA_1726 modF   TRUE 0.996 -3.000 0.300 0.094 N NA
 291180 291181 LA_1725 LA_1727     TRUE 0.985 11.000 0.667 NA   NA
 291182 291183 LA_1728 LA_1729   panD FALSE 0.636 90.000 0.005 NA   NA
 291183 291184 LA_1729 LA_1730 panD   TRUE 0.957 27.000 0.005 NA   NA
 291185 291187 LA_1731 LA_1733 lipB   FALSE 0.027 429.000 0.003 NA   NA
 291187 291188 LA_1733 LA_1734     TRUE 0.986 7.000 0.600 NA   NA
 291188 291189 LA_1734 LA_1735   mviN TRUE 0.979 4.000 0.006 NA   NA
 291189 291190 LA_1735 LA_1736 mviN   TRUE 0.976 10.000 0.006 NA   NA
 291190 291191 LA_1736 LA_1737     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 291194 291195 LA_1740 LA_1741     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 291197 291198 LA_1743 LA_1744 cheR cheB TRUE 0.874 74.000 0.039 1.000   NA
 291198 291199 LA_1744 LA_1745 cheB   TRUE 0.991 3.000 0.167 1.000   NA
 291199 291200 LA_1745 LA_1746     TRUE 0.997 14.000 0.167 0.014 Y NA
 291202 291203 LA_1748 LA_1749   tra5 TRUE 0.964 6.000 0.000 0.063   NA
 291206 291207 LA_1752 LA_1753     FALSE 0.004 799.000 0.000 NA   NA
 291210 291211 LA_1756 LA_1757     TRUE 0.781 30.000 0.000 NA   NA
 291211 291212 LA_1757 LA_1758     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291215 291216 LA_1761 LA_1762     FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 291216 291217 LA_1762 LA_1763     FALSE 0.419 70.000 0.000 NA   NA
 291217 291218 LA_1763 LA_1764     FALSE 0.287 84.000 0.000 NA   NA
 291218 291219 LA_1764 LA_1765     FALSE 0.028 208.000 0.000 NA   NA
 291219 291221 LA_1765 LA_1767     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 291222 291224 LA_1768 LA_1770     FALSE 0.026 373.000 0.000 0.062   NA
 291224 291225 LA_1770 LA_1771     TRUE 0.978 19.000 1.000 NA   NA
 291227 291228 LA_1773 LA_1774     TRUE 0.973 25.000 1.000 NA   NA
 291232 291233 LA_1778 LA_1779     FALSE 0.010 313.000 0.000 NA   NA
 291233 291234 LA_1779 LA_1780   mazE FALSE 0.008 336.000 0.000 NA   NA
 291234 291235 LA_1780 LA_1781 mazE mazF TRUE 0.995 -6.000 0.531 NA Y NA
 291236 291237 LA_1782 LA_1783     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 291237 291240 LA_1783 LA_1786     FALSE 0.007 392.000 0.000 NA   NA
 291243 291245 LA_1789 LA_1791     FALSE 0.031 204.000 0.000 NA   NA
 291248 291250 LA_1794 LA_1796     FALSE 0.005 507.000 0.000 NA   NA
 291252 291253 LA_1798 LA_1799     TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 291253 291254 LA_1799 LA_1800     FALSE 0.004 591.000 0.000 NA   NA
 291254 291257 LA_1800 LA_1803     FALSE 0.004 653.000 0.000 NA   NA
 291257 10350640 LA_1803 LA_1803a     FALSE 0.006 449.000 0.000 NA   NA
 10350640 291260 LA_1803a LA_1806     FALSE 0.004 726.000 0.000 NA   NA
 291260 291261 LA_1806 LA_1807     FALSE 0.653 47.000 0.000 NA   NA
 291262 10350641 LA_1808 LA_1808a     FALSE 0.008 353.000 0.000 NA   NA
 291265 291266 LA_1811 LA_1812 tra5   TRUE 0.964 6.000 0.000 0.062   NA
 291267 10350642 LA_1813 LA_1813a     FALSE 0.303 83.000 0.000 NA   NA
 10350642 291269 LA_1813a LA_1815     FALSE 0.004 1517.000 0.000 NA   NA
 291269 291271 LA_1815 LA_1816     FALSE 0.114 123.000 0.000 NA   NA
 291271 10350643 LA_1816 LA_1816a     TRUE 0.848 -22.000 0.000 NA   NA
 291275 291277 LA_1821 LA_1823 cysE   FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 291277 291278 LA_1823 LA_1824     FALSE 0.037 189.000 0.000 NA   NA
 291279 291280 LA_1825 LA_1827     FALSE 0.006 454.000 0.000 NA   NA
 291283 291284 LA_1829 LA_1830     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291284 291285 LA_1830 LA_1831     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 291285 291286 LA_1831 LA_1833     TRUE 0.886 4.000 0.000 NA   NA
 291289 291290 LA_1835 LA_1836     FALSE 0.027 210.000 0.000 NA   NA
 291290 291291 LA_1836 LA_1837   parA FALSE 0.122 146.000 0.000 1.000   NA
 291291 291292 LA_1837 LA_1838 parA spo0J TRUE 0.992 -3.000 0.033 1.000 N NA
 291292 291293 LA_1838 LA_1839 spo0J   FALSE 0.006 415.000 0.000 NA   NA
 291298 291300 LA_1844 LA_1846     FALSE 0.004 590.000 0.000 NA   NA
 291300 291301 LA_1846 LA_1847     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291301 291302 LA_1847 LA_1848     FALSE 0.003 857.000 0.000 NA   NA
 291302 291303 LA_1848 LA_1849     TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 291303 291304 LA_1849 LA_1850     FALSE 0.105 127.000 0.000 NA   NA
 291304 291305 LA_1850 LA_1851     FALSE 0.004 558.000 0.000 NA   NA
 291305 291306 LA_1851 LA_1852     FALSE 0.335 79.000 0.000 NA   NA
 291306 291307 LA_1852 LA_1853   phnB FALSE 0.108 126.000 0.000 NA   NA
 291307 291308 LA_1853 LA_1854 phnB   FALSE 0.004 802.000 0.000 NA   NA
 291309 291311 LA_1855 LA_1857 flgG fur FALSE 0.010 1051.000 0.000 1.000 N NA
 291312 291313 LA_1858 LA_1859 arp katE TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 291313 291314 LA_1859 LA_1860 katE   FALSE 0.019 404.000 0.000 1.000 N NA
 291315 291316 LA_1861 LA_1862   spoU FALSE 0.004 791.000 0.000 NA   NA
 291316 291317 LA_1862 LA_1863 spoU cysS TRUE 0.902 90.000 0.088 1.000 Y NA
 291317 291318 LA_1863 LA_1864 cysS axeA TRUE 0.982 -3.000 0.003 NA N NA
 291318 291319 LA_1864 LA_1865 axeA folD TRUE 0.987 16.000 0.081 NA N NA
 291320 291321 LA_1866 LA_1867 asnC   FALSE 0.012 400.000 0.000 1.000   NA
 291321 291322 LA_1867 LA_1868     FALSE 0.004 1277.000 0.000 NA   NA
 291322 291323 LA_1868 LA_1869     TRUE 0.829 -45.000 0.000 NA   NA
 291323 291324 LA_1869 LA_1870     TRUE 0.832 21.000 0.000 NA   NA
 291324 291326 LA_1870 LA_1872     FALSE 0.005 538.000 0.000 NA   NA
 291327 291328 LA_1873 LA_1874     FALSE 0.004 815.000 0.000 NA   NA
 291328 291329 LA_1874 LA_1875   dinG TRUE 0.952 35.000 0.009 NA   NA
 291329 291331 LA_1875 LA_1877 dinG   FALSE 0.541 119.000 0.009 1.000   NA
 291334 291337 LA_1880 LA_1883     FALSE 0.004 2354.000 0.000 NA   NA
 291337 291338 LA_1883 LA_1884     TRUE 0.978 19.000 1.000 NA   NA
 291338 291339 LA_1884 LA_1885     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 291340 291341 LA_1886 LA_1887     TRUE 0.982 12.000 0.027 NA   NA
 291341 291342 LA_1887 LA_1888   lepA FALSE 0.266 126.000 0.000 1.000 N NA
 291342 291343 LA_1888 LA_1889 lepA   FALSE 0.025 330.000 0.000 1.000 N NA
 291343 291344 LA_1889 LA_1890   lpxD FALSE 0.006 892.000 0.000 1.000   NA
 291350 291351 LA_1896 LA_1897 sdhB sdhA TRUE 0.998 0.000 0.470 0.001 Y NA
 291351 291352 LA_1897 LA_1898 sdhA   TRUE 0.993 19.000 0.598 0.001   NA
 291353 291354 LA_1899 LA_1900     TRUE 0.984 -10.000 0.051 NA   NA
 291354 10350644 LA_1900 LA_1902     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 10350644 291358 LA_1902 LA_1904     FALSE 0.009 329.000 0.000 NA   NA
 291358 291359 LA_1904 LA_1905     TRUE 0.871 10.000 0.000 NA   NA
 291359 291360 LA_1905 LA_1906     FALSE 0.274 85.000 0.000 NA   NA
 291362 291364 LA_1908 LA_1910     FALSE 0.003 860.000 0.000 NA   NA
 291364 291365 LA_1910 LA_1911   serA FALSE 0.054 160.000 0.000 NA   NA
 291370 291371 LA_1916 LA_1917     TRUE 0.950 47.000 0.100 NA   NA
 291371 291372 LA_1917 LA_1918     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 291374 291377 LA_1920 LA_1922 rbpA2   FALSE 0.004 787.000 0.000 NA   NA
 291378 291379 LA_1924 LA_1925   tatC TRUE 0.987 2.000 0.012 NA N NA
 291379 291380 LA_1925 LA_1926 tatC tatA TRUE 0.995 -3.000 0.093 NA Y NA
 291381 291382 LA_1927 LA_1928   trxA TRUE 0.987 6.000 0.143 NA   NA
 291382 291383 LA_1928 LA_1929 trxA cgs1 TRUE 0.988 23.000 0.143 1.000 N NA
 291383 291384 LA_1929 LA_1930 cgs1 caiA TRUE 0.988 18.000 1.000 1.000 N NA
 291384 291385 LA_1930 LA_1931 caiA   TRUE 0.719 40.000 0.000 NA   NA
 291385 291386 LA_1931 LA_1932     FALSE 0.162 106.000 0.000 NA   NA
 291387 291388 LA_1933 LA_1934 tetA2   TRUE 0.951 43.000 0.031 NA   NA
 291388 291389 LA_1934 LA_1935     TRUE 0.933 44.000 0.008 NA   NA
 291389 291390 LA_1935 LA_1936     TRUE 0.894 60.000 0.005 1.000   NA
 291390 291391 LA_1936 LA_1937     FALSE 0.004 1346.000 0.000 NA   NA
 291393 291395 LA_1939 LA_1941     FALSE 0.004 729.000 0.000 NA   NA
 291395 291396 LA_1941 LA_1942     FALSE 0.009 322.000 0.000 NA   NA
 291396 291398 LA_1942 LA_1944     FALSE 0.004 559.000 0.000 NA   NA
 291398 10350646 LA_1944 LA_t13   tRNA-Met-CAT FALSE 0.010 303.000 0.000 NA   NA
 10350646 291399 LA_t13 LA_1945 tRNA-Met-CAT   FALSE 0.537 59.000 0.000 NA   NA
 291399 291400 LA_1945 LA_1946     TRUE 0.984 -16.000 0.667 NA   NA
 291400 291401 LA_1946 LA_1947     TRUE 0.882 5.000 0.000 NA   NA
 291401 291402 LA_1947 LA_1948     TRUE 0.945 17.000 0.000 1.000 N NA
 291402 291403 LA_1948 LA_1949     TRUE 0.879 71.000 0.182 NA   NA
 291403 291404 LA_1949 LA_1950     FALSE 0.131 264.000 0.182 NA   NA
 291405 10350647 LA_1951 LA_1951a eno   FALSE 0.095 305.000 0.020 1.000   NA
 10350647 291407 LA_1951a LA_1953   clpP TRUE 0.986 11.000 0.030 1.000   NA
 291407 291408 LA_1953 LA_1954 clpP   TRUE 0.980 14.000 0.020 NA   NA
 291408 291409 LA_1954 LA_1955     TRUE 0.975 24.000 0.042 NA   NA
 291409 291410 LA_1955 LA_1956     TRUE 0.983 11.000 0.038 NA   NA
 291410 291411 LA_1956 LA_1957     TRUE 0.981 -25.000 0.058 NA   NA
 291411 291412 LA_1957 LA_1958     FALSE 0.196 224.000 0.400 NA   NA
 291412 291413 LA_1958 LA_1959   guaA TRUE 0.991 -3.000 0.091 1.000   NA
 291413 291414 LA_1959 LA_1960 guaA secA FALSE 0.684 111.000 0.015 1.000 N NA
 291414 291415 LA_1960 LA_1961 secA   TRUE 0.816 24.000 0.000 NA   NA
 291415 291416 LA_1961 LA_1962     FALSE 0.185 101.000 0.000 NA   NA
 291416 291417 LA_1962 LA_1963     FALSE 0.426 148.000 0.667 NA   NA
 291417 10350648 LA_1963 LA_1963a     TRUE 0.871 11.000 0.000 NA   NA
 10350648 291418 LA_1963a LA_1964     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 291418 291419 LA_1964 LA_1965     TRUE 0.988 2.000 0.136 NA   NA
 291419 291420 LA_1965 LA_1966   czcA2 TRUE 0.987 6.000 0.111 NA   NA
 291420 291421 LA_1966 LA_1967 czcA2 czcA3 FALSE 0.059 535.000 0.000 0.004 Y NA
 291422 291424 LA_1968 LA_1970   pcnB FALSE 0.004 1420.000 0.000 NA   NA
 291424 291425 LA_1970 LA_1971 pcnB   TRUE 0.976 -7.000 0.006 NA   NA
 291425 291426 LA_1971 LA_1972   rnhA FALSE 0.008 346.000 0.000 NA   NA
 291426 291427 LA_1972 LA_1973 rnhA   TRUE 0.985 -3.000 0.020 NA   NA
 291428 291430 LA_1974 LA_1975     FALSE 0.653 61.000 0.000 1.000   NA
 291430 291431 LA_1975 LA_1977     TRUE 0.982 19.000 0.025 1.000   NA
 291431 291432 LA_1977 LA_1978     TRUE 0.894 1.000 0.000 NA   NA
 291432 291433 LA_1978 LA_1979     TRUE 0.841 19.000 0.000 NA   NA
 291433 291434 LA_1979 LA_1980     FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 291435 291436 LA_1981 LA_1982     TRUE 0.886 4.000 0.000 NA   NA
 291436 291437 LA_1982 LA_1984     FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 291440 291441 LA_1986 LA_1987     TRUE 0.976 1.000 0.003 NA   NA
 291441 291442 LA_1987 LA_1988     TRUE 0.982 9.000 0.021 NA   NA
 291445 291446 LA_1991 LA_1992 thiE wecG TRUE 0.937 55.000 0.010 1.000 N NA
 291449 291450 LA_1995 LA_1996 lysS   TRUE 0.986 9.000 0.333 NA   NA
 291450 291451 LA_1996 LA_1997     TRUE 0.946 50.000 0.286 NA   NA
 291451 291452 LA_1997 LA_1998     FALSE 0.027 211.000 0.000 NA   NA
 291452 291453 LA_1998 LA_1999     TRUE 0.832 21.000 0.000 NA   NA
 291453 10350649 LA_1999 LA_t14   tRNA-Leu-GAG FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 10350649 291455 LA_t14 LA_2001 tRNA-Leu-GAG pgsA FALSE 0.573 54.000 0.000 NA   NA
 10350650 291457 LA_t15 LA_2003 tRNA-Asp-GTC   FALSE 0.004 1423.000 0.000 NA   NA
 291457 291458 LA_2003 LA_2004     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291458 10350651 LA_2004 LA_2004a     FALSE 0.008 359.000 0.000 NA   NA
 291460 291461 LA_2006 LA_2007   fliG FALSE 0.013 279.000 0.000 NA   NA
 291461 291462 LA_2007 LA_2008 fliG aceF TRUE 0.986 6.000 0.005 1.000 N NA
 291462 291463 LA_2008 LA_2009 aceF acoB TRUE 0.996 22.000 0.254 0.053 Y NA
 291463 291464 LA_2009 LA_2010 acoB acoA TRUE 0.998 0.000 0.456 0.001 Y NA
 291465 291466 LA_2011 LA_2012     TRUE 0.875 98.000 0.776 1.000 Y NA
 291466 291467 LA_2012 LA_2013     FALSE 0.013 270.000 0.000 NA   NA
 291467 291468 LA_2013 LA_2014   creD TRUE 0.980 -12.000 0.019 NA   NA
 291468 291470 LA_2014 LA_2016 creD   FALSE 0.004 668.000 0.000 NA   NA
 291470 291471 LA_2016 LA_2017   flaB1 FALSE 0.004 788.000 0.000 NA   NA
 291471 291473 LA_2017 LA_2019 flaB1 flaB2 FALSE 0.029 458.000 0.000 0.002   NA
 291473 291474 LA_2019 LA_2020 flaB2   FALSE 0.004 1051.000 0.000 NA   NA
 291476 291477 LA_2022 LA_2023     FALSE 0.264 86.000 0.000 NA   NA
 291477 291478 LA_2023 LA_2024     FALSE 0.004 782.000 0.000 NA   NA
 291479 291480 LA_2025 LA_2026     TRUE 0.977 -31.000 0.030 NA   NA
 291480 291481 LA_2026 LA_2027     TRUE 0.986 -3.000 0.023 NA   NA
 291481 291482 LA_2027 LA_2028     FALSE 0.009 324.000 0.000 NA   NA
 291482 291484 LA_2028 LA_2030     FALSE 0.073 226.000 0.000 0.065   NA
 291484 291485 LA_2030 LA_2031     FALSE 0.274 85.000 0.000 NA   NA
 291486 291488 LA_2032 LA_2035     FALSE 0.004 1695.000 0.000 NA   NA
 291489 291490 LA_2034 LA_2036     FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 291494 291495 LA_2040 LA_2041     TRUE 0.983 -3.000 0.010 NA   NA
 291499 291500 LA_2045 LA_2046 mraW   TRUE 0.970 7.000 0.003 NA   NA
 291500 291501 LA_2046 LA_2047   murE TRUE 0.969 -25.000 0.006 NA   NA
 291501 291502 LA_2047 LA_2048 murE mraY TRUE 0.777 138.000 0.011 0.006 Y NA
 291502 291503 LA_2048 LA_2049 mraY ftsW TRUE 0.991 -3.000 0.003 0.036 N NA
 291503 291504 LA_2049 LA_2050 ftsW murG TRUE 0.993 -3.000 0.058 1.000 N NA
 291504 291505 LA_2050 LA_2051 murG murC TRUE 0.995 3.000 0.036 1.000 Y NA
 291505 291506 LA_2051 LA_2052 murC   FALSE 0.185 101.000 0.000 NA   NA
 291506 291507 LA_2052 LA_2053     TRUE 0.989 -3.000 0.589 NA   NA
 291508 291509 LA_2054 LA_2055 mmsB mce FALSE 0.449 160.000 0.200 NA N NA
 291509 291510 LA_2055 LA_2056 mce ttg2A TRUE 0.989 30.000 0.333 NA Y NA
 291510 291511 LA_2056 LA_2057 ttg2A ttg2B TRUE 0.995 4.000 0.333 NA Y NA
 291511 291512 LA_2057 LA_2059 ttg2B   TRUE 0.989 -3.000 0.167 NA   NA
 291514 291515 LA_2060 LA_2061   metX TRUE 0.988 4.000 0.509 NA   NA
 291515 291516 LA_2061 LA_2062 metX met17 FALSE 0.274 259.000 0.021 1.000 Y NA
 291518 291519 LA_2064 LA_2065     TRUE 0.979 13.000 0.014 NA   NA
 291519 291520 LA_2065 LA_2066     TRUE 0.913 61.000 0.667 NA   NA
 291520 291521 LA_2066 LA_2068   spoVK FALSE 0.512 128.000 0.750 NA   NA
 291525 291526 LA_2071 LA_2072 hflC hflC TRUE 0.997 2.000 0.952 0.065 Y NA
 291526 291527 LA_2072 LA_2073 hflC   TRUE 0.986 32.000 0.034 NA Y NA
 291529 291530 LA_2074 LA_2076   argH TRUE 0.961 27.000 0.003 1.000   NA
 291530 291531 LA_2076 LA_2077 argH   TRUE 0.982 -3.000 0.003 1.000   NA
 291531 291532 LA_2077 LA_2078     TRUE 0.987 -3.000 0.034 NA   NA
 291532 291534 LA_2078 LA_2080     FALSE 0.004 572.000 0.000 NA   NA
 291534 291535 LA_2080 LA_2081   fliM TRUE 0.982 -3.000 0.008 NA   NA
 291538 291539 LA_2084 LA_2085     TRUE 0.978 18.000 0.008 1.000   NA
 10350654 10350655 LA_t16 LA_t17 tRNA-Cys-GCA tRNA-Leu-TAA TRUE 0.836 20.000 0.000 NA   NA
 291544 291545 LA_2090 LA_2091     TRUE 0.977 -13.000 0.011 NA   NA
 291545 291546 LA_2091 LA_2092   gmhA TRUE 0.984 2.000 0.019 NA   NA
 291546 291547 LA_2092 LA_2093 gmhA dppD TRUE 0.988 11.000 0.012 1.000 N NA
 291547 291548 LA_2093 LA_2094 dppD   TRUE 0.978 24.000 0.667 NA   NA
 291548 291549 LA_2094 LA_2095   leuC FALSE 0.282 158.000 0.008 NA   NA
 291549 291550 LA_2095 LA_2096 leuC leuD TRUE 0.997 20.000 0.309 0.001 Y NA
 291550 291551 LA_2096 LA_2097 leuD cysK TRUE 0.993 16.000 0.023 1.000 Y NA
 291551 291552 LA_2097 LA_2098 cysK   TRUE 0.991 -3.000 0.019 1.000 N NA
 10350656 291555 LA_2100a LA_2101   rpoE FALSE 0.573 54.000 0.000 NA   NA
 291555 291556 LA_2101 LA_2102 rpoE   TRUE 0.952 34.000 0.008 NA   NA
 291556 291557 LA_2102 LA_2103   clpS TRUE 0.984 -3.000 0.013 NA   NA
 291557 291558 LA_2103 LA_2104 clpS clpA TRUE 0.981 -39.000 0.596 NA   NA
 291558 291559 LA_2104 LA_2105 clpA ggt TRUE 0.984 14.000 0.004 1.000 N NA
 291559 291560 LA_2105 LA_2106 ggt gshA TRUE 0.991 -3.000 0.018 1.000 N NA
 291560 291561 LA_2106 LA_2107 gshA   TRUE 0.990 -12.000 0.036 1.000 N NA
 291562 291563 LA_2108 LA_2109     TRUE 0.995 -3.000 0.286 0.003   NA
 291563 291564 LA_2109 LA_2110   bolA TRUE 0.988 -3.000 0.011 NA N NA
 291564 291566 LA_2110 LA_2112 bolA bolA FALSE 0.021 1909.000 0.000 NA Y NA
 291566 291567 LA_2112 LA_2113 bolA   TRUE 0.986 4.000 0.011 NA N NA
 291567 291568 LA_2113 LA_2114   ccmA TRUE 0.997 -3.000 0.688 0.088 Y NA
 291568 291569 LA_2114 LA_2115 ccmA lpd TRUE 0.985 19.000 0.013 1.000 N NA
 291569 291570 LA_2115 LA_2116 lpd gloB FALSE 0.470 124.000 0.004 1.000   NA
 291570 291571 LA_2116 LA_2117 gloB   FALSE 0.027 210.000 0.000 NA   NA
 291572 291573 LA_2118 LA_2119   glpK TRUE 0.846 70.000 0.006 1.000   NA
 291574 291575 LA_2120 LA_2121 fliG3   FALSE 0.455 134.000 1.000 NA   NA
 291575 291576 LA_2121 LA_2122     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 291576 291577 LA_2122 LA_2123     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 291577 291578 LA_2123 LA_2124   dltB FALSE 0.239 197.000 1.000 NA   NA
 291578 291579 LA_2124 LA_2126 dltB sppA TRUE 0.961 36.000 0.006 NA N NA
 291581 291583 LA_2127 LA_2129   ssl2 FALSE 0.010 1006.000 0.000 1.000 N NA
 291583 291584 LA_2129 LA_2130 ssl2   TRUE 0.955 52.000 0.029 1.000 N NA
 291584 291585 LA_2130 LA_2131     TRUE 0.988 4.000 0.500 NA   NA
 291585 291586 LA_2131 LA_2132     TRUE 0.982 -12.000 1.000 NA   NA
 291590 291591 LA_2136 LA_2137     TRUE 0.983 9.000 1.000 NA   NA
 291592 291593 LA_2138 LA_2139 dsbG mdh TRUE 0.980 27.000 0.014 1.000 N NA
 291593 291594 LA_2139 LA_2140 mdh bioF TRUE 0.984 18.000 0.009 1.000 N NA
 291594 291595 LA_2140 LA_2141 bioF bioD TRUE 0.995 0.000 0.020 1.000 Y NA
 291595 291596 LA_2141 LA_2142 bioD bioA TRUE 0.998 -3.000 0.051 0.001 Y NA
 291596 291597 LA_2142 LA_2143 bioA bioB TRUE 0.993 41.000 0.176 0.001 Y NA
 291597 291598 LA_2143 LA_2144 bioB pafAH FALSE 0.013 557.000 0.000 1.000 N NA
 291598 291599 LA_2144 LA_2145 pafAH serB TRUE 0.992 8.000 0.005 1.000 Y NA
 291600 291601 LA_2146 LA_2147 mutS trpF TRUE 0.988 -3.000 0.004 1.000 N NA
 291603 291604 LA_2149 LA_2150     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291605 291606 LA_2151 LA_2152   leuB TRUE 0.988 17.000 0.025 1.000 N NA
 291606 291607 LA_2152 LA_2153 leuB argD TRUE 0.993 17.000 0.025 1.000 Y NA
 291607 291608 LA_2153 LA_2154 argD manB TRUE 0.993 -3.000 0.167 1.000 N NA
 291608 10350657 LA_2154 LA_2154a manB   FALSE 0.114 123.000 0.000 NA   NA
 291609 291610 LA_2155 LA_2156     TRUE 0.989 0.000 0.333 NA   NA
 291611 291614 LA_2157 LA_2160     FALSE 0.004 1469.000 0.000 NA   NA
 291616 291617 LA_2162 LA_2163 rpmB nth TRUE 0.976 -73.000 0.003 1.000 N NA
 291617 291618 LA_2163 LA_2164 nth   TRUE 0.977 7.000 0.002 NA N NA
 291618 291619 LA_2164 LA_2165   prfB TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 291619 291620 LA_2165 LA_2166 prfB uvrC FALSE 0.008 526.000 0.000 1.000   NA
 291620 291621 LA_2166 LA_2167 uvrC   TRUE 0.858 62.000 0.003 1.000   NA
 291621 291622 LA_2167 LA_2168     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 291622 291623 LA_2168 LA_2169     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 291623 291624 LA_2169 LA_2170     TRUE 0.832 -37.000 0.000 NA   NA
 291627 291628 LA_2173 LA_2174 rfaF1   TRUE 0.989 -3.000 0.419 NA   NA
 291630 291631 LA_2176 LA_2177   faa1 TRUE 0.923 -10.000 0.000 1.000   NA
 291631 291632 LA_2177 LA_2178 faa1 argC TRUE 0.956 6.000 0.000 1.000 N NA
 291632 291633 LA_2178 LA_2179 argC recA FALSE 0.047 251.000 0.000 1.000 N NA
 291633 291634 LA_2179 LA_2180 recA   FALSE 0.024 222.000 0.000 NA   NA
 291636 291637 LA_2182 LA_2183     TRUE 0.966 38.000 0.133 NA   NA
 291637 291638 LA_2183 LA_2184   tldD TRUE 0.903 49.000 0.005 NA   NA
 291638 291639 LA_2184 LA_2185 tldD tldD TRUE 0.989 -3.000 0.114 NA   NA
 291639 291640 LA_2185 LA_2186 tldD   TRUE 0.843 74.000 0.038 NA   NA
 291640 291641 LA_2186 LA_2187   pbpC FALSE 0.246 205.000 0.027 1.000   NA
 291641 291642 LA_2187 LA_2188 pbpC   TRUE 0.925 53.000 0.010 1.000   NA
 291642 291643 LA_2188 LA_2189     TRUE 0.989 2.000 0.431 NA   NA
 291644 291645 LA_2190 LA_2191 apbA   TRUE 0.892 2.000 0.000 NA   NA
 291645 291646 LA_2191 LA_2192     TRUE 0.946 50.000 0.286 NA   NA
 291646 291647 LA_2192 LA_2193   uvrD TRUE 0.984 8.000 0.012 1.000   NA
 291647 291648 LA_2193 LA_2194 uvrD slpA TRUE 0.986 -19.000 0.012 1.000 N NA
 291648 291649 LA_2194 LA_2195 slpA   TRUE 0.790 84.000 0.057 NA   NA
 291649 291650 LA_2195 LA_2196     FALSE 0.015 259.000 0.000 NA   NA
 291650 291651 LA_2196 LA_2197   nemA FALSE 0.010 913.000 0.000 1.000 N NA
 291658 291659 LA_2204 LA_2205     FALSE 0.004 565.000 0.000 NA   NA
 291659 291660 LA_2205 LA_2206     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 291660 291661 LA_2206 LA_2207     FALSE 0.058 159.000 0.000 NA   NA
 291662 291663 LA_2208 LA_2209   sua5 TRUE 0.976 -19.000 0.012 NA   NA
 291666 291667 LA_2212 LA_2213 uvrA   TRUE 0.970 17.000 0.002 1.000   NA
 291668 291669 LA_2214 LA_2215 czcD motB TRUE 0.992 0.000 0.039 1.000 N NA
 291671 291673 LA_2217 LA_2219 mgtE   FALSE 0.236 209.000 0.286 NA   NA
 291673 291674 LA_2219 LA_2220     FALSE 0.005 501.000 0.000 NA   NA
 291674 291675 LA_2220 LA_2221   mgtA TRUE 0.970 -16.000 0.000 0.001   NA
 291675 291676 LA_2221 LA_2222 mgtA   FALSE 0.021 645.000 0.000 0.063 N NA
 291676 291677 LA_2222 LA_2223     TRUE 0.971 39.000 0.000 0.013 Y NA
 291681 10350658 LA_2227 LA_2227a     TRUE 0.834 -36.000 0.000 NA   NA
 10350658 291682 LA_2227a LA_2228     TRUE 0.828 -46.000 0.000 NA   NA
 291682 291683 LA_2228 LA_2229   rpsU FALSE 0.077 176.000 0.000 1.000   NA
 291683 291684 LA_2229 LA_2230 rpsU   TRUE 0.930 60.000 0.004 0.024   NA
 291684 291685 LA_2230 LA_2231   dnaG TRUE 0.986 19.000 0.137 1.000   NA
 291685 291686 LA_2231 LA_2232 dnaG rpoD TRUE 0.990 17.000 0.299 1.000 N NA
 291691 291692 LA_2237 LA_2238 tyrS   TRUE 0.953 46.000 0.005 1.000 N NA
 291694 291695 LA_2240 LA_2241     FALSE 0.006 450.000 0.000 NA   NA
 291695 291696 LA_2241 LA_2242     TRUE 0.796 27.000 0.000 NA   NA
 291696 291698 LA_2242 LA_2244     FALSE 0.004 1220.000 0.000 NA   NA
 291700 291702 LA_2246 LA_2248     FALSE 0.004 612.000 0.000 NA   NA
 291702 291703 LA_2248 LA_2249     FALSE 0.003 899.000 0.000 NA   NA
 291704 291705 LA_2250 LA_2251     FALSE 0.004 761.000 0.000 NA   NA
 291706 291707 LA_2252 LA_2253 thiJ sir2 TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291707 291708 LA_2253 LA_2254 sir2   FALSE 0.033 201.000 0.000 NA   NA
 291709 291710 LA_2255 LA_2256   dltB TRUE 0.983 10.000 1.000 NA   NA
 291710 291711 LA_2256 LA_2258 dltB   TRUE 0.983 4.000 0.015 NA   NA
 291712 291713 LA_2257 LA_2259     FALSE 0.012 287.000 0.000 NA   NA
 291713 291714 LA_2259 LA_2260     TRUE 0.705 89.000 0.017 NA   NA
 291716 291717 LA_2262 LA_2263 adas arp TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291717 291718 LA_2263 LA_2264 arp   FALSE 0.287 84.000 0.000 NA   NA
 291719 291720 LA_2265 LA_2266 caiD   FALSE 0.275 192.000 0.667 NA   NA
 291720 291721 LA_2266 LA_2267     TRUE 0.987 7.000 0.222 NA   NA
 291722 291723 LA_2268 LA_2269   nifS TRUE 0.977 -25.000 0.023 NA   NA
 291723 291726 LA_2269 LA_2272 nifS   FALSE 0.005 489.000 0.000 NA   NA
 291726 291727 LA_2272 LA_2273     FALSE 0.111 125.000 0.000 NA   NA
 291729 291730 LA_2275 LA_2276   mcrA FALSE 0.598 52.000 0.000 NA   NA
 291730 291731 LA_2276 LA_2277 mcrA   TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291732 291733 LA_2278 LA_2279     TRUE 0.985 -6.000 0.041 NA   NA
 291733 291734 LA_2279 LA_2280   fliS TRUE 0.987 6.000 0.167 NA   NA
 291736 291737 LA_2282 LA_2283 purN purH TRUE 0.996 4.000 0.225 1.000 Y NA
 291737 291738 LA_2283 LA_2284 purH   TRUE 0.975 3.000 0.003 NA   NA
 291738 291739 LA_2284 LA_2285     TRUE 0.967 31.000 1.000 NA   NA
 291739 291740 LA_2285 LA_2286   mipB FALSE 0.216 180.000 0.008 NA   NA
 291740 291741 LA_2286 LA_2287 mipB   FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 291743 291744 LA_2289 LA_2290   dltB TRUE 0.984 14.000 0.667 NA   NA
 291744 291745 LA_2290 LA_2291 dltB rsuA TRUE 0.990 -3.000 0.040 NA N NA
 291746 291747 LA_2292 LA_2293 lipA   TRUE 0.971 -12.000 0.004 NA   NA
 291747 291748 LA_2293 LA_2294     FALSE 0.006 423.000 0.000 NA   NA
 291749 291750 LA_2295 LA_2296 lipL45   FALSE 0.192 100.000 0.000 NA   NA
 291751 291752 LA_2297 LA_2298     FALSE 0.006 870.000 0.000 1.000   NA
 291752 291753 LA_2298 LA_2299     FALSE 0.180 102.000 0.000 NA   NA
 291754 291755 LA_2300 LA_2301     TRUE 0.986 13.000 0.400 NA   NA
 291755 291756 LA_2301 LA_2302     TRUE 0.982 16.000 0.049 NA   NA
 291757 291760 LA_2303 LA_2306 fabG lpxC FALSE 0.025 336.000 0.000 1.000 N NA
 291760 291761 LA_2306 LA_2307 lpxC ptsA TRUE 0.953 46.000 0.005 1.000 N NA
 291762 291763 LA_2308 LA_2309   faa1 TRUE 0.735 94.000 0.667 NA   NA
 291763 291765 LA_2309 LA_2312 faa1 trxA FALSE 0.019 417.000 0.000 1.000 N NA
 291768 291769 LA_2314 LA_2315   cysQ TRUE 0.748 105.000 1.000 1.000 N NA
 291769 291770 LA_2315 LA_2316 cysQ   TRUE 0.973 25.000 1.000 NA   NA
 291770 291771 LA_2316 LA_2317   uvrD FALSE 0.484 63.000 0.000 NA   NA
 291771 291772 LA_2317 LA_2318 uvrD   TRUE 0.959 4.000 0.000 1.000 N NA
 291772 291773 LA_2318 LA_2319   exbD TRUE 0.987 19.000 0.028 1.000 N NA
 291773 291774 LA_2319 LA_2320 exbD tolQ TRUE 0.997 3.000 0.028 0.022 Y NA
 291774 291775 LA_2320 LA_2321 tolQ recN FALSE 0.603 112.000 0.004 1.000 N NA
 291775 291776 LA_2321 LA_2322 recN   FALSE 0.008 359.000 0.000 NA   NA
 291777 291778 LA_2323 LA_2324   fabG TRUE 0.987 -10.000 1.000 1.000   NA
 291778 291779 LA_2324 LA_2325 fabG arsR FALSE 0.399 177.000 1.000 1.000 N NA
 291780 291781 LA_2326 LA_2327 rfaD ubiD TRUE 0.982 15.000 0.009 NA N NA
 291781 291782 LA_2327 LA_2328 ubiD mutY TRUE 0.982 -3.000 0.002 NA N NA
 291782 291783 LA_2328 LA_2329 mutY   TRUE 0.725 82.000 0.000 0.023 N NA
 291783 291784 LA_2329 LA_2330     TRUE 0.892 46.000 0.002 NA   NA
 291784 291785 LA_2330 LA_2331     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 291786 291789 LA_2332 LA_2335 ubiA ubiX FALSE 0.102 1433.000 0.091 1.000 Y NA
 291790 291791 LA_2336 LA_2337   mrp TRUE 0.938 47.000 0.022 NA   NA
 291791 291792 LA_2337 LA_2338 mrp   TRUE 0.991 2.000 0.022 1.000 N NA
 291792 291793 LA_2338 LA_2339     TRUE 0.986 -3.000 0.027 NA   NA
 291794 291796 LA_2340 LA_2342     FALSE 0.005 502.000 0.000 NA   NA
 291797 291799 LA_2343 LA_2345   hslU FALSE 0.011 1427.000 0.000 1.000 N NA
 291799 291800 LA_2345 LA_2346 hslU hslV TRUE 0.995 10.000 0.752 1.000 Y NA
 291800 291801 LA_2346 LA_2347 hslV xerD TRUE 0.985 -13.000 0.005 1.000 N NA
 291801 291803 LA_2347 LA_2349 xerD pth FALSE 0.161 220.000 0.002 1.000 N NA
 291803 291804 LA_2349 LA_2350 pth leuA TRUE 0.982 -12.000 0.003 1.000 N NA
 291804 291805 LA_2350 LA_2351 leuA mutS2 TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291808 291809 LA_2353 LA_2355     TRUE 0.984 7.000 0.043 NA   NA
 291809 291810 LA_2355 LA_2356   xseA TRUE 0.975 4.000 0.004 NA   NA
 291810 291811 LA_2356 LA_2357 xseA xseB TRUE 0.998 2.000 0.412 0.001 Y NA
 291815 291816 LA_2361 LA_2362 tdh   FALSE 0.005 485.000 0.000 NA   NA
 291816 291819 LA_2362 LA_2365     FALSE 0.005 545.000 0.000 NA   NA
 291819 291820 LA_2365 LA_2366     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 291820 291821 LA_2366 LA_2367   ftsA2 TRUE 0.984 8.000 0.039 NA   NA
 291821 291822 LA_2367 LA_2368 ftsA2   TRUE 0.995 6.000 0.039 1.000 Y NA
 291822 291823 LA_2368 LA_2369     TRUE 0.823 74.000 0.018 NA   NA
 291823 291824 LA_2369 LA_2370     TRUE 0.981 10.000 0.018 NA   NA
 291824 291825 LA_2370 LA_2371     TRUE 0.979 -25.000 1.000 NA   NA
 291825 291826 LA_2371 LA_2372   gspG TRUE 0.840 70.000 0.014 NA   NA
 291826 291827 LA_2372 LA_2373 gspG gspF TRUE 0.996 22.000 0.599 0.002 Y NA
 291827 291828 LA_2373 LA_2374 gspF gspE TRUE 0.998 6.000 0.119 0.002 Y NA
 291828 291829 LA_2374 LA_2375 gspE gspD TRUE 0.998 4.000 0.149 0.002 Y NA
 291829 291830 LA_2375 LA_2376 gspD gspC TRUE 0.995 5.000 0.065 1.000 Y NA
 291830 291831 LA_2376 LA_2377 gspC nlpD TRUE 0.789 56.000 0.000 1.000 N NA
 291831 291832 LA_2377 LA_2378 nlpD   TRUE 0.843 -25.000 0.000 NA   NA
 291834 291835 LA_2380 LA_2381     FALSE 0.574 96.000 0.004 NA   NA
 291835 291837 LA_2381 LA_2383     FALSE 0.024 716.000 0.010 NA   NA
 291837 291838 LA_2383 LA_2384   flhB1 TRUE 0.989 -3.000 0.154 NA   NA
 291838 291839 LA_2384 LA_2385 flhB1   TRUE 0.989 1.000 0.286 NA   NA
 291839 291840 LA_2385 LA_2386   rnhB TRUE 0.724 74.000 0.002 NA   NA
 291840 291841 LA_2386 LA_2387 rnhB rplS TRUE 0.991 7.000 0.066 1.000 N NA
 291841 291842 LA_2387 LA_2388 rplS trmD TRUE 0.993 -40.000 0.567 1.000 Y NA
 291842 291843 LA_2388 LA_2389 trmD rimM TRUE 0.995 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 291843 291844 LA_2389 LA_2390 rimM   TRUE 0.990 -7.000 0.324 1.000   NA
 291844 291845 LA_2390 LA_2391   rpsP TRUE 0.992 0.000 0.385 1.000   NA
 291845 291848 LA_2391 LA_2394 rpsP rpe FALSE 0.011 696.000 0.000 1.000 N NA
 291848 291849 LA_2394 LA_2395 rpe   TRUE 0.989 -3.000 0.026 1.000   NA
 291849 291850 LA_2395 LA_2396   fmt TRUE 0.984 -3.000 0.005 1.000   NA
 291850 291852 LA_2396 LA_2398 fmt priA FALSE 0.648 127.000 0.052 1.000 N NA
 291852 291853 LA_2398 LA_2399 priA   TRUE 0.977 -3.000 0.003 NA   NA
 291853 291854 LA_2399 LA_2400   atoC TRUE 0.980 -7.000 0.012 NA   NA
 291854 291855 LA_2400 LA_2401 atoC   TRUE 0.993 8.000 0.533 0.085   NA
 291855 291856 LA_2401 LA_2402   fruB TRUE 0.983 14.000 0.013 1.000   NA
 291856 291857 LA_2402 LA_2403 fruB hprK TRUE 0.987 -28.000 0.036 1.000 N NA
 291857 291858 LA_2403 LA_2404 hprK rpoN TRUE 0.990 5.000 0.017 1.000 N NA
 291858 291859 LA_2404 LA_2405 rpoN yhbG TRUE 0.990 -3.000 0.059 1.000   NA
 291859 291860 LA_2405 LA_2406 yhbG   TRUE 0.973 31.000 0.543 NA   NA
 291860 291861 LA_2406 LA_2407     TRUE 0.985 -3.000 0.020 NA   NA
 291861 291862 LA_2407 LA_2408   kdsA TRUE 0.974 12.000 0.005 NA   NA
 291862 291863 LA_2408 LA_2409 kdsA pyrG TRUE 0.993 3.000 0.138 1.000 N NA
 291863 291864 LA_2409 LA_2410 pyrG tagD FALSE 0.171 199.000 0.003 1.000   NA
 291864 291865 LA_2410 LA_2411 tagD rfaE TRUE 0.995 1.000 0.032 0.001   NA
 291867 291868 LA_2413 LA_2414 nlpC ptr2 TRUE 0.959 50.000 0.400 NA N NA
 291868 291869 LA_2414 LA_2415 ptr2   TRUE 0.978 -24.000 0.008 1.000   NA
 291873 291874 LA_2419 LA_2420   lytB FALSE 0.077 176.000 0.000 1.000   NA
 291874 291875 LA_2420 LA_2421 lytB   FALSE 0.013 590.000 0.000 1.000 N NA
 291875 291876 LA_2421 LA_2422     TRUE 0.983 -37.000 0.000 0.021 Y NA
 291876 291877 LA_2422 LA_2423     TRUE 0.997 14.000 0.400 0.017 Y NA
 291877 291878 LA_2423 LA_2424     TRUE 0.985 9.000 0.667 NA   NA
 291878 291879 LA_2424 LA_2425   cheA TRUE 0.886 4.000 0.000 NA   NA
 291879 291880 LA_2425 LA_2426 cheA   TRUE 0.991 45.000 0.333 0.010 Y NA
 291880 291881 LA_2426 LA_2427   cheW TRUE 0.997 13.000 0.500 0.010 Y NA
 291881 291882 LA_2427 LA_2428 cheW cheD TRUE 0.996 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 291882 291883 LA_2428 LA_2429 cheD cheB TRUE 0.996 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 291886 291887 LA_2432 LA_2433 accC1 pccB1 TRUE 0.995 7.000 0.750 1.000 Y NA
 291887 291888 LA_2433 LA_2434 pccB1 spoIIAA TRUE 0.900 77.000 0.667 1.000 N NA
 291888 291889 LA_2434 LA_2435 spoIIAA   TRUE 0.995 -16.000 0.500 1.000 Y NA
 291889 291890 LA_2435 LA_2436     TRUE 0.983 15.000 0.750 NA   NA
 10350661 291891 LA_t19 LA_2437 tRNA-Ala-GGC   FALSE 0.063 155.000 0.000 NA   NA
 291891 291892 LA_2437 LA_2438   def TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 291892 291893 LA_2438 LA_2439 def   TRUE 0.980 20.000 0.012 NA N NA
 291894 10350662 LA_2440 LA_r03   rrs FALSE 0.003 871.000 0.000 NA   NA
 10350662 291897 LA_r03 LA_2443 rrs   FALSE 0.004 1506.000 0.000 NA   NA
 291897 291898 LA_2443 LA_2444     FALSE 0.032 202.000 0.000 NA   NA
 291898 10350663 LA_2444 LA_2444a     FALSE 0.091 133.000 0.000 NA   NA
 10350663 291900 LA_2444a LA_2446     FALSE 0.175 170.000 0.000 0.019   NA
 291900 291901 LA_2446 LA_2447     TRUE 0.833 58.000 0.000 0.019   NA
 291901 291902 LA_2447 LA_2448     TRUE 0.743 71.000 0.000 0.019   NA
 291902 291904 LA_2448 LA_2450     FALSE 0.106 210.000 0.000 0.019   NA
 291904 291906 LA_2450 LA_2452     FALSE 0.106 210.000 0.000 0.019   NA
 291906 291907 LA_2452 LA_2453     FALSE 0.012 402.000 0.000 1.000   NA
 291910 291911 LA_2456 LA_2457   map TRUE 0.871 11.000 0.000 NA   NA
 291911 291912 LA_2457 LA_2458 map   TRUE 0.969 43.000 0.429 1.000   NA
 291912 291913 LA_2458 LA_2459     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 291914 291915 LA_2460 LA_2461     TRUE 0.753 81.000 0.009 NA   NA
 291915 291916 LA_2461 LA_2462   ccmA TRUE 0.901 60.000 0.024 NA   NA
 291916 291917 LA_2462 LA_2463 ccmA gldF TRUE 0.979 -19.000 0.024 NA   NA
 291917 291918 LA_2463 LA_2464 gldF gldG TRUE 0.987 -3.000 0.039 NA   NA
 291918 291919 LA_2464 LA_2465 gldG   TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 291919 291920 LA_2465 LA_2466   ste14 FALSE 0.006 431.000 0.000 NA   NA
 291922 291923 LA_2468 LA_2469   CheX TRUE 0.987 0.000 1.000 NA   NA
 291923 291924 LA_2469 LA_2470 CheX   FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 291925 291926 LA_2471 LA_2472     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 291927 291929 LA_2473 LA_2474     FALSE 0.016 344.000 0.000 NA N NA
 291931 291932 LA_2477 LA_2478 tfoX   FALSE 0.396 73.000 0.000 NA   NA
 291932 291933 LA_2478 LA_2480   rsbW TRUE 0.980 21.000 0.069 NA   NA
 291933 291937 LA_2480 LA_2483 rsbW xerD FALSE 0.041 494.000 0.003 1.000 N NA
 291938 291940 LA_2484 LA_2486     FALSE 0.511 131.000 0.021 1.000   NA
 291940 291942 LA_2486 LA_2488     FALSE 0.004 591.000 0.000 NA   NA
 291943 291944 LA_2489 LA_2490 dltB   TRUE 0.986 -10.000 0.600 NA   NA
 291946 291947 LA_2492 LA_2493     TRUE 0.838 -31.000 0.000 NA   NA
 291947 291948 LA_2493 LA_2494   trxB FALSE 0.011 1164.000 0.000 1.000 N NA
 291950 291951 LA_2496 LA_2497     TRUE 0.942 51.000 0.500 NA   NA
 291952 291953 LA_2498 LA_2499 ats1   TRUE 0.911 70.000 0.429 NA N NA
 291953 291955 LA_2499 LA_2501   mhpC FALSE 0.008 1645.000 0.000 NA N NA
 291960 291961 LA_2506 LA_2507 hisF gatA TRUE 0.987 -3.000 0.003 1.000 N NA
 291961 291962 LA_2507 LA_2508 gatA gatC TRUE 0.998 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 291962 291963 LA_2508 LA_2509 gatC wcaJ TRUE 0.960 27.000 0.002 NA N NA
 291963 291964 LA_2509 LA_2510 wcaJ   TRUE 0.994 3.000 0.051 NA Y NA
 291964 291965 LA_2510 LA_2511   bacA TRUE 0.980 24.000 0.026 NA N NA
 291965 291966 LA_2511 LA_2512 bacA lipL31 TRUE 0.984 7.000 0.039 NA   NA
 291966 291967 LA_2512 LA_2513 lipL31 mfd TRUE 0.900 47.000 0.003 NA   NA
 291967 291968 LA_2513 LA_2514 mfd panC TRUE 0.987 -3.000 0.003 1.000 N NA
 291968 291969 LA_2514 LA_2515 panC hisD TRUE 0.969 31.000 0.003 1.000 N NA
 291970 291972 LA_2516 LA_2518 xthA   FALSE 0.040 1424.000 0.000 0.056 Y NA
 291983 291984 LA_2529 LA_2530     TRUE 0.934 53.000 0.095 NA   NA
 291984 291985 LA_2530 LA_2531     TRUE 0.984 15.000 0.095 NA   NA
 291986 291987 LA_2532 LA_2533     TRUE 0.985 23.000 0.000 0.003 Y NA
 291987 291989 LA_2533 LA_2535   ppiB FALSE 0.012 1806.000 0.000 1.000 N NA
 291990 291991 LA_2536 LA_2537 cyaA8   TRUE 0.985 -16.000 1.000 1.000   NA
 291991 291992 LA_2537 LA_2538     TRUE 0.983 -10.000 1.000 NA   NA
 291993 291994 LA_2539 LA_2540 uup   TRUE 0.964 43.000 0.006 0.084   NA
 291999 292000 LA_2545 LA_2546   capC TRUE 0.988 -3.000 0.733 NA   NA
 292000 292001 LA_2546 LA_2547 capC capB TRUE 0.994 -12.000 0.182 0.001   NA
 292001 292002 LA_2547 LA_2548 capB   TRUE 0.937 2.000 0.000 1.000   NA
 292002 292003 LA_2548 LA_2549   baeS TRUE 0.929 61.000 0.000 0.016 Y NA
 292003 292004 LA_2549 LA_2550 baeS fkpA FALSE 0.245 109.000 0.000 1.000   NA
 292004 292005 LA_2550 LA_2551 fkpA   TRUE 0.988 -3.000 0.015 1.000   NA
 292006 292009 LA_2552 LA_2554     FALSE 0.012 285.000 0.000 NA   NA
 292009 292010 LA_2554 LA_2556     FALSE 0.009 484.000 0.000 1.000   NA
 292010 292011 LA_2556 LA_2557     FALSE 0.196 99.000 0.000 NA   NA
 292012 292013 LA_2558 LA_2559 clpX clpP TRUE 0.995 11.000 0.352 1.000 Y NA
 292013 292014 LA_2559 LA_2560 clpP tig TRUE 0.996 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 292014 10350664 LA_2560 LA_t20 tig tRNA-Gly-GCC TRUE 0.751 35.000 0.000 NA   NA
 10350664 292015 LA_t20 LA_2562 tRNA-Gly-GCC tesA FALSE 0.484 63.000 0.000 NA   NA
 292016 292017 LA_2561 LA_2563 bglX hemN TRUE 0.986 -3.000 0.002 1.000 N NA
 292017 292019 LA_2563 LA_2565 hemN   FALSE 0.004 649.000 0.000 NA   NA
 292023 292024 LA_2569 LA_2570 ilvH ilvB TRUE 0.997 -3.000 0.015 0.001 Y NA
 292026 292028 LA_2572 LA_2574 pilF tlpA FALSE 0.013 549.000 0.000 1.000 N NA
 292028 292029 LA_2574 LA_2575 tlpA   FALSE 0.321 81.000 0.000 NA   NA
 292031 292032 LA_2577 LA_2578 aarF feoA TRUE 0.988 -3.000 0.054 NA   NA
 292032 292033 LA_2578 LA_2579 feoA feoB TRUE 0.984 -13.000 0.019 1.000   NA
 292033 292034 LA_2579 LA_2580 feoB   TRUE 0.989 12.000 0.019 1.000 N NA
 292034 292035 LA_2580 LA_2581   spsE TRUE 0.995 16.000 0.250 1.000 Y NA
 292035 292036 LA_2581 LA_2582 spsE nlpD TRUE 0.927 -7.000 0.000 1.000   NA
 10350665 292041 LA_2585 LA_2587     FALSE 0.010 310.000 0.000 NA   NA
 292042 292043 LA_2588 LA_2589   fliH TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 292043 292044 LA_2589 LA_2590 fliH fliG TRUE 0.997 4.000 0.014 0.004 Y NA
 292044 292045 LA_2590 LA_2591 fliG fliF TRUE 0.997 -3.000 0.008 0.006 Y NA
 292046 292047 LA_2592 LA_2593 fliI   TRUE 0.995 4.000 0.241 0.010   NA
 292047 292048 LA_2593 LA_2594   flaB5 FALSE 0.312 159.000 0.016 NA   NA
 292048 292049 LA_2594 LA_2595 flaB5   TRUE 0.985 13.000 0.143 NA   NA
 292049 292050 LA_2595 LA_2596     FALSE 0.641 48.000 0.000 NA   NA
 292052 292053 LA_2598 LA_2599 gmk   FALSE 0.106 291.000 0.143 NA   NA
 292053 292054 LA_2599 LA_2600     TRUE 0.985 0.000 0.018 NA   NA
 292054 292055 LA_2600 LA_2601     TRUE 0.952 46.000 0.667 NA   NA
 292055 292056 LA_2601 LA_2602     TRUE 0.985 9.000 0.087 NA   NA
 292056 292057 LA_2602 LA_2603   fliA TRUE 0.984 26.000 0.050 1.000 N NA
 292057 292058 LA_2603 LA_2604 fliA   FALSE 0.436 128.000 0.012 NA   NA
 292058 292059 LA_2604 LA_2605     TRUE 0.983 4.000 0.018 NA   NA
 292059 292060 LA_2605 LA_2606   flhF TRUE 0.985 28.000 0.382 1.000 N NA
 292060 292061 LA_2606 LA_2607 flhF flhA TRUE 0.978 53.000 0.440 1.000 Y NA
 292061 292062 LA_2607 LA_2608 flhA flhB TRUE 0.997 10.000 0.207 0.004 Y NA
 292062 292063 LA_2608 LA_2609 flhB fliR TRUE 0.996 -3.000 0.218 1.000 Y NA
 292063 292064 LA_2609 LA_2610 fliR fliQ TRUE 0.998 7.000 0.185 0.002 Y NA
 292064 292065 LA_2610 LA_2611 fliQ fliP TRUE 0.998 -3.000 0.049 0.004 Y NA
 292065 292066 LA_2611 LA_2612 fliP   TRUE 0.797 81.000 0.008 1.000   NA
 292066 292067 LA_2612 LA_2613   fliY TRUE 0.987 -3.000 0.010 1.000   NA
 292067 292069 LA_2613 LA_2615 fliY   FALSE 0.004 568.000 0.000 NA   NA
 292069 292070 LA_2615 LA_2616   alsT FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 292074 292075 LA_2620 LA_2621 erg3 dltE TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 292077 292078 LA_2623 LA_2624 gst   TRUE 0.843 74.000 0.038 NA   NA
 292080 292081 LA_2626 LA_2627     FALSE 0.021 226.000 0.000 NA   NA
 292085 292086 LA_2631 LA_2632 clpS tktC2 FALSE 0.572 119.000 0.071 NA   NA
 292086 292087 LA_2632 LA_2633 tktC2 metK TRUE 0.985 8.000 0.004 1.000 N NA
 292088 292091 LA_2634 LA_2637   lipL32 FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 292091 292093 LA_2637 LA_2639 lipL32 caiA FALSE 0.004 1447.000 0.000 NA   NA
 292093 292094 LA_2639 LA_2640 caiA   FALSE 0.436 68.000 0.000 NA   NA
 292094 10350666 LA_2640 LA_2640a     FALSE 0.009 335.000 0.000 NA   NA
 10350666 292095 LA_2640a LA_2641     FALSE 0.031 204.000 0.000 NA   NA
 292095 292096 LA_2641 LA_2642     FALSE 0.287 84.000 0.000 NA   NA
 292099 292102 LA_2645 LA_2648     FALSE 0.004 805.000 0.000 NA   NA
 292102 292103 LA_2648 LA_2649     FALSE 0.011 290.000 0.000 NA   NA
 292105 292106 LA_2651 LA_2652   tra5 TRUE 0.964 6.000 0.000 0.056   NA
 292106 292108 LA_2652 LA_2654 tra5 groES FALSE 0.012 2114.000 0.000 1.000 N NA
 292108 292109 LA_2654 LA_2655 groES groEL TRUE 0.996 15.000 0.028 0.006 Y NA
 292109 292110 LA_2655 LA_2656 groEL   FALSE 0.174 104.000 0.000 NA   NA
 292110 292113 LA_2656 LA_2659     FALSE 0.004 1107.000 0.000 NA   NA
 292113 292114 LA_2659 LA_2660     TRUE 0.989 -13.000 0.333 1.000   NA
 292114 292115 LA_2660 LA_2661     TRUE 0.992 -24.000 0.333 0.009   NA
 292115 292116 LA_2661 LA_2662     TRUE 0.983 4.000 0.006 1.000   NA
 292117 292118 LA_2663 LA_2664   flgI TRUE 0.987 -3.000 0.045 NA   NA
 292118 292119 LA_2664 LA_2665 flgI flgH TRUE 0.998 -3.000 0.235 0.010 Y NA
 292119 292120 LA_2665 LA_2666 flgH flgA TRUE 0.988 -3.000 0.085 NA   NA
 292120 292121 LA_2666 LA_2667 flgA flgG TRUE 0.983 19.000 0.319 NA   NA
 292121 292122 LA_2667 LA_2668 flgG   FALSE 0.007 729.000 0.000 1.000   NA
 292122 292125 LA_2668 LA_2671     FALSE 0.004 1988.000 0.000 NA   NA
 292126 292128 LA_2672 LA_2674   abgB FALSE 0.004 1108.000 0.000 NA   NA
 292130 292132 LA_2676 LA_2678     FALSE 0.003 867.000 0.000 NA   NA
 292133 292134 LA_2679 LA_2680   tra5 TRUE 0.964 6.000 0.000 0.055   NA
 292135 292136 LA_2681 LA_2682     TRUE 0.726 39.000 0.000 NA   NA
 292136 292137 LA_2682 LA_2683     FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 292137 292138 LA_2683 LA_2684     FALSE 0.264 86.000 0.000 NA   NA
 292138 292139 LA_2684 LA_2685     FALSE 0.443 67.000 0.000 NA   NA
 292139 292140 LA_2685 LA_2686     FALSE 0.679 45.000 0.000 NA   NA
 292140 292141 LA_2686 LA_2687   pepP FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 292141 292142 LA_2687 LA_2688 pepP rfaF TRUE 0.991 -3.000 0.018 1.000 N NA
 292142 292143 LA_2688 LA_2689 rfaF thl TRUE 0.990 14.000 0.075 1.000 N NA
 292144 292145 LA_2690 LA_2691 bfr   TRUE 0.989 -3.000 0.006 1.000 N NA
 292145 292146 LA_2691 LA_2692     TRUE 0.979 16.000 0.006 1.000   NA
 292152 292153 LA_2698 LA_2699     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA N NA
 292153 292154 LA_2699 LA_2701   kamA TRUE 0.992 -7.000 0.300 1.000 N NA
 292156 292157 LA_2702 LA_2703     TRUE 0.951 44.000 0.040 NA   NA
 292157 292158 LA_2703 LA_2704     FALSE 0.135 114.000 0.000 NA   NA
 292159 292160 LA_2705 LA_2706   thiH FALSE 0.003 860.000 0.000 NA   NA
 292160 292163 LA_2706 LA_2709 thiH   FALSE 0.011 1472.000 0.000 1.000 N NA
 292163 292165 LA_2709 LA_2711     FALSE 0.021 227.000 0.000 NA   NA
 292167 292169 LA_2713 LA_2715     FALSE 0.005 548.000 0.000 NA   NA
 292169 292171 LA_2715 LA_2717     FALSE 0.041 629.000 0.000 0.082 Y NA
 292171 292172 LA_2717 LA_2718     FALSE 0.005 537.000 0.000 NA   NA
 292172 292173 LA_2718 LA_2719     TRUE 0.984 -3.000 0.013 NA   NA
 292173 292174 LA_2719 LA_2720     FALSE 0.313 82.000 0.000 NA   NA
 292174 292176 LA_2720 LA_2722     FALSE 0.004 676.000 0.000 NA   NA
 292176 292177 LA_2722 LA_2723     FALSE 0.149 110.000 0.000 NA   NA
 292181 292182 LA_2726 LA_2728     FALSE 0.009 333.000 0.000 NA   NA
 292183 292184 LA_2729 LA_2730     FALSE 0.003 1004.000 0.000 NA   NA
 292184 292185 LA_2730 LA_2731     FALSE 0.039 184.000 0.000 NA   NA
 292185 292187 LA_2731 LA_2733   prfC FALSE 0.004 1135.000 0.000 NA   NA
 292187 292189 LA_2733 LA_2735 prfC accB FALSE 0.005 552.000 0.000 NA   NA
 292189 292190 LA_2735 LA_2736 accB accC2 TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292190 292191 LA_2736 LA_2737 accC2   TRUE 0.996 -3.000 0.008 0.048 Y NA
 292191 292192 LA_2737 LA_2738     FALSE 0.019 234.000 0.000 NA   NA
 292193 292194 LA_2739 LA_2740   truA FALSE 0.316 171.000 0.054 NA   NA
 292194 292195 LA_2740 LA_2741 truA   TRUE 0.983 3.000 0.013 NA   NA
 292195 292196 LA_2741 LA_2742     TRUE 0.948 45.000 1.000 NA   NA
 292196 292201 LA_2742 LA_2746     FALSE 0.004 1828.000 0.000 NA   NA
 292201 292202 LA_2746 LA_2748   sbp TRUE 0.975 29.000 0.182 NA   NA
 292205 10350667 LA_2751 LA_2751a     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 292207 292208 LA_2753 LA_2754   rodA FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 292208 292209 LA_2754 LA_2755 rodA ftsI TRUE 0.988 -13.000 0.161 1.000   NA
 292209 292210 LA_2755 LA_2756 ftsI mreD TRUE 0.991 2.000 0.133 1.000   NA
 292210 292211 LA_2756 LA_2757 mreD mreC TRUE 0.995 -3.000 0.550 0.002   NA
 292211 292213 LA_2757 LA_2759 mreC mreB TRUE 0.978 38.000 0.689 1.000 N NA
 292215 292216 LA_2761 LA_2762 ppx   FALSE 0.006 453.000 0.000 NA   NA
 292216 292218 LA_2762 LA_2764     FALSE 0.004 2681.000 0.000 NA   NA
 292224 292225 LA_2770 LA_2771   dltB FALSE 0.034 198.000 0.000 NA   NA
 292225 292226 LA_2771 LA_2772 dltB   TRUE 0.985 12.000 0.667 NA   NA
 292226 292227 LA_2772 LA_2773     TRUE 0.933 4.000 0.000 1.000   NA
 292227 292228 LA_2773 LA_2774     TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 292228 292229 LA_2774 LA_2775   atpC FALSE 0.669 83.000 0.003 NA   NA
 292229 292230 LA_2775 LA_2776 atpC atpD TRUE 0.997 6.000 0.837 0.003 Y NA
 292230 292231 LA_2776 LA_2778 atpD atpG TRUE 0.997 18.000 0.724 0.003 Y NA
 292231 292233 LA_2778 LA_2779 atpG atpA TRUE 0.997 15.000 0.846 0.003 Y NA
 292233 292234 LA_2779 LA_2780 atpA atpH TRUE 0.997 -10.000 0.864 0.003 Y NA
 292234 292235 LA_2780 LA_2781 atpH atpF TRUE 0.998 5.000 0.222 0.003 Y NA
 292235 292236 LA_2781 LA_2782 atpF atpE TRUE 0.997 4.000 0.013 0.003 Y NA
 292236 292237 LA_2782 LA_2783 atpE atpB TRUE 0.992 36.000 0.015 0.003 Y NA
 292237 10350668 LA_2783 LA_2783a atpB   FALSE 0.217 168.000 0.004 NA   NA
 10350668 292241 LA_2783a LA_2787     FALSE 0.004 1104.000 0.000 NA   NA
 292241 292242 LA_2787 LA_2788   lepB TRUE 0.982 -30.000 0.333 NA   NA
 292243 292244 LA_2789 LA_2790     TRUE 0.991 3.000 0.250 1.000   NA
 292247 292250 LA_2793 LA_2796 corA   FALSE 0.004 1178.000 0.000 NA   NA
 292250 292251 LA_2796 LA_2797     TRUE 0.859 15.000 0.000 NA   NA
 292251 292252 LA_2797 LA_2798     FALSE 0.004 758.000 0.000 NA   NA
 292257 292259 LA_2803 LA_2805     FALSE 0.009 506.000 0.000 1.000   NA
 292259 292262 LA_2805 LA_2808   sufB FALSE 0.022 2001.000 0.000 0.060 N NA
 292262 292263 LA_2808 LA_2809 sufB ahpC FALSE 0.034 493.000 0.000 1.000 Y NA
 292263 292265 LA_2809 LA_2811 ahpC   FALSE 0.003 964.000 0.000 NA   NA
 292267 292269 LA_2813 LA_2816     FALSE 0.004 1865.000 0.000 NA   NA
 292270 292271 LA_2815 LA_2817     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 292271 292272 LA_2817 LA_2818     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 292275 10350669 LA_2821 LA_t21   tRNA-Leu-CAA TRUE 0.823 23.000 0.000 NA   NA
 10350669 292277 LA_t21 LA_2823 tRNA-Leu-CAA   FALSE 0.004 2534.000 0.000 NA   NA
 292278 292280 LA_2824 LA_2826     FALSE 0.004 787.000 0.000 NA   NA
 292280 292281 LA_2826 LA_2827     FALSE 0.003 884.000 0.000 NA   NA
 292281 292282 LA_2827 LA_2828     TRUE 0.997 12.000 0.400 0.016 Y NA
 292282 292283 LA_2828 LA_2829     TRUE 0.997 -7.000 0.071 0.016 Y NA
 292283 292284 LA_2829 LA_2830     TRUE 0.933 4.000 0.000 1.000   NA
 292284 292285 LA_2830 LA_2831     FALSE 0.313 131.000 0.000 0.016   NA
 292285 292286 LA_2831 LA_2832   rssA FALSE 0.581 68.000 0.000 1.000   NA
 292286 292288 LA_2832 LA_2834 rssA cyaA FALSE 0.009 487.000 0.000 1.000   NA
 292288 292289 LA_2834 LA_2835 cyaA   TRUE 0.935 3.000 0.000 1.000   NA
 292289 292290 LA_2835 LA_2836     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292294 292295 LA_2840 LA_2841 argF citE FALSE 0.574 140.000 0.043 1.000 N NA
 292297 292298 LA_2843 LA_2844 chpK chpI TRUE 0.992 -13.000 0.375 0.054   NA
 292298 292299 LA_2844 LA_2845 chpI   FALSE 0.006 817.000 0.000 1.000   NA
 292301 292302 LA_2847 LA_2848   flgE FALSE 0.055 235.000 0.000 1.000 N NA
 292302 292303 LA_2848 LA_2849 flgE flgD TRUE 0.976 28.000 0.298 NA   NA
 292303 292304 LA_2849 LA_2850 flgD   TRUE 0.977 15.000 0.012 NA   NA
 292304 10350671 LA_2850 LA_2852     FALSE 0.004 1473.000 0.000 NA   NA
 10350671 292308 LA_2852 LA_2854     FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 292311 292312 LA_2857 LA_2858     FALSE 0.007 855.000 0.000 NA N NA
 292313 292314 LA_2859 LA_2860     FALSE 0.598 52.000 0.000 NA   NA
 292314 292316 LA_2860 LA_2862     FALSE 0.006 892.000 0.000 1.000   NA
 292316 292317 LA_2862 LA_2863     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292320 292321 LA_2866 LA_2867     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 292322 292324 LA_2868 LA_2870 infB2   FALSE 0.004 817.000 0.000 NA   NA
 292325 292326 LA_2871 LA_2872     FALSE 0.011 294.000 0.000 NA   NA
 292326 292327 LA_2872 LA_2873     FALSE 0.185 101.000 0.000 NA   NA
 292330 292331 LA_2876 LA_2877     TRUE 0.987 -3.000 0.043 NA   NA
 292332 292333 LA_2878 LA_2879     FALSE 0.257 106.000 0.000 1.000   NA
 292333 292334 LA_2879 LA_2880     TRUE 0.986 -10.000 0.571 NA   NA
 292335 292336 LA_2881 LA_2882     TRUE 0.976 23.000 1.000 NA   NA
 292336 292337 LA_2882 LA_2883     FALSE 0.008 353.000 0.000 NA   NA
 292337 292338 LA_2883 LA_2884     FALSE 0.005 505.000 0.000 NA   NA
 292346 292348 LA_2892 LA_2894     FALSE 0.007 391.000 0.000 NA   NA
 292353 292354 LA_2899 LA_2900     FALSE 0.004 609.000 0.000 NA   NA
 292354 292355 LA_2900 LA_2901   nlpD TRUE 0.986 1.000 1.000 NA   NA
 292355 292357 LA_2901 LA_2903 nlpD ruvA FALSE 0.011 1538.000 0.000 1.000 N NA
 292357 292359 LA_2903 LA_2905 ruvA ubiB FALSE 0.007 682.000 0.000 1.000   NA
 292359 292361 LA_2905 LA_2907 ubiB   FALSE 0.023 275.000 0.000 1.000   NA
 292362 292363 LA_2908 LA_2909     TRUE 0.834 -36.000 0.000 NA   NA
 292363 292364 LA_2909 LA_2910     FALSE 0.006 468.000 0.000 NA   NA
 292364 292367 LA_2910 LA_2914     FALSE 0.004 686.000 0.000 NA   NA
 292367 10350672 LA_2914 LA_2914a     TRUE 0.955 19.000 0.000 0.022   NA
 292368 292369 LA_2915 LA_2916   radA FALSE 0.021 373.000 0.000 1.000 N NA
 292369 292370 LA_2916 LA_2917 radA rnd TRUE 0.982 -3.000 0.003 1.000   NA
 292371 292372 LA_2918 LA_2919 galA   TRUE 0.928 54.000 0.067 NA   NA
 292372 292373 LA_2919 LA_2920     FALSE 0.077 348.000 0.500 NA   NA
 292374 292375 LA_2921 LA_2922     TRUE 0.988 2.000 0.667 NA   NA
 292375 292376 LA_2922 LA_2923   acuC TRUE 0.988 3.000 0.333 NA   NA
 292377 292379 LA_2924 LA_2926 pykF   FALSE 0.011 1435.000 0.000 1.000 N NA
 292379 292381 LA_2926 LA_2927     FALSE 0.634 121.000 0.000 0.006 Y NA
 292381 292382 LA_2927 LA_2929     TRUE 0.985 20.000 0.000 0.006 Y NA
 292382 292383 LA_2929 LA_2930     TRUE 0.983 24.000 0.000 0.006 Y NA
 292383 292384 LA_2930 LA_2931     TRUE 0.818 87.000 0.000 0.006 Y NA
 292384 292385 LA_2931 LA_2932     TRUE 0.808 89.000 0.000 0.006 Y NA
 292385 292386 LA_2932 LA_2933     TRUE 0.712 107.000 0.000 0.006 Y NA
 292387 292388 LA_2934 LA_2935 eriC purM TRUE 0.953 11.000 0.000 1.000 N NA
 292388 292389 LA_2935 LA_2936 purM   TRUE 0.893 46.000 0.002 NA   NA
 292389 292393 LA_2936 LA_2940     FALSE 0.004 1442.000 0.000 NA   NA
 292393 292394 LA_2940 LA_2941     TRUE 0.864 -13.000 0.000 NA   NA
 292396 292397 LA_2943 LA_2944     FALSE 0.460 65.000 0.000 NA   NA
 292397 292399 LA_2944 LA_2946     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 292399 292400 LA_2946 LA_2947   sseA FALSE 0.034 199.000 0.000 NA   NA
 292400 10350673 LA_2947 LA_2947a sseA   FALSE 0.667 46.000 0.000 NA   NA
 292401 292402 LA_2948 LA_2949   htrA1 TRUE 0.984 -7.000 1.000 NA   NA
 292402 292403 LA_2949 LA_2950 htrA1 htrA2 TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.018   NA
 292403 292404 LA_2950 LA_2951 htrA2   TRUE 0.974 37.000 0.500 1.000   NA
 292405 292406 LA_2952 LA_2953     TRUE 0.989 -3.000 0.111 NA   NA
 292406 292407 LA_2953 LA_2954     TRUE 0.994 2.000 0.065 0.059   NA
 292408 292409 LA_2955 LA_2956 plsC mcm1 TRUE 0.991 37.000 0.023 0.047 Y NA
 292409 292410 LA_2956 LA_2957 mcm1   FALSE 0.022 281.000 0.000 1.000   NA
 292410 292411 LA_2957 LA_2958     FALSE 0.003 996.000 0.000 NA   NA
 292416 292418 LA_2963 LA_2964     FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 292418 292419 LA_2964 LA_2966     TRUE 0.941 28.000 0.000 0.018   NA
 292419 292420 LA_2966 LA_2967     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292421 292422 LA_2968 LA_2969 cyaA   FALSE 0.004 804.000 0.000 NA   NA
 292422 292423 LA_2969 LA_2971     FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 292424 292425 LA_2970 LA_2972     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 292425 292426 LA_2972 LA_2973     FALSE 0.607 116.000 0.136 NA   NA
 292426 292427 LA_2973 LA_2974   mauG TRUE 0.953 47.000 0.227 NA   NA
 292427 292428 LA_2974 LA_2975 mauG   TRUE 0.982 -28.000 0.429 NA   NA
 292428 292429 LA_2975 LA_2976     TRUE 0.987 0.000 1.000 NA   NA
 292429 292430 LA_2976 LA_2977   trmA FALSE 0.040 182.000 0.000 NA   NA
 292433 292435 LA_2980 LA_2982 spoIID salX FALSE 0.011 721.000 0.000 1.000 N NA
 292435 292436 LA_2982 LA_2983 salX   TRUE 0.980 6.000 0.000 1.000 Y NA
 292436 292437 LA_2983 LA_2984     TRUE 0.915 61.000 0.118 NA   NA
 292437 292439 LA_2984 LA_2986     FALSE 0.004 832.000 0.000 NA   NA
 292440 292441 LA_2987 LA_2988   pyrE TRUE 0.973 -22.000 0.009 NA   NA
 292446 292447 LA_2993 LA_2994     TRUE 0.976 -3.000 0.003 NA   NA
 292447 292448 LA_2994 LA_2995     TRUE 0.968 13.000 0.003 NA   NA
 292448 292449 LA_2995 LA_2996   eutG TRUE 0.852 77.000 0.231 NA   NA
 292449 292450 LA_2996 LA_2997 eutG acm FALSE 0.010 1015.000 0.000 1.000 N NA
 292450 292451 LA_2997 LA_2998 acm   FALSE 0.020 631.000 0.000 NA Y NA
 292451 292452 LA_2998 LA_2999   recJ TRUE 0.983 3.000 0.004 NA N NA
 292456 292457 LA_3003 LA_3004 nlpD   FALSE 0.043 399.000 0.000 1.000 Y NA
 292458 292464 LA_3005 LA_3011   ftsK FALSE 0.007 1619.000 0.000 1.000   NA
 292465 292468 LA_3012 LA_3015     FALSE 0.003 877.000 0.000 NA   NA
 292468 292469 LA_3015 LA_3016     TRUE 0.816 24.000 0.000 NA   NA
 292469 292470 LA_3016 LA_3017   lemA FALSE 0.443 67.000 0.000 NA   NA
 292470 292471 LA_3017 LA_3018 lemA   FALSE 0.352 163.000 0.091 NA   NA
 292471 292472 LA_3018 LA_3019     TRUE 0.984 16.000 0.127 NA   NA
 292472 292473 LA_3019 LA_3020   mmcQ TRUE 0.886 4.000 0.000 NA   NA
 292478 292479 LA_3025 LA_3026     FALSE 0.004 705.000 0.000 NA   NA
 292484 292486 LA_3031 LA_3033     FALSE 0.028 208.000 0.000 NA   NA
 292489 292492 LA_3036 LA_3039     FALSE 0.006 452.000 0.000 NA   NA
 292494 292495 LA_3041 LA_3042 cyaA   FALSE 0.018 241.000 0.000 NA   NA
 292495 292498 LA_3042 LA_3044     FALSE 0.004 575.000 0.000 NA   NA
 292498 292500 LA_3044 LA_3047     FALSE 0.026 213.000 0.000 NA   NA
 292500 292502 LA_3047 LA_3049     FALSE 0.004 1448.000 0.000 NA   NA
 292503 292504 LA_3050 LA_3051 sph4 murI FALSE 0.008 343.000 0.000 NA   NA
 292504 292505 LA_3051 LA_3052 murI   TRUE 0.967 33.000 0.004 1.000 N NA
 292505 292506 LA_3052 LA_3054   degQ TRUE 0.965 41.000 0.008 1.000 N NA
 292507 292508 LA_3053 LA_3055     TRUE 0.796 27.000 0.000 NA   NA
 292508 292509 LA_3055 LA_3056     TRUE 0.789 28.000 0.000 NA   NA
 292512 292513 LA_3059 LA_3060     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 292513 292514 LA_3060 LA_3061     FALSE 0.130 116.000 0.000 NA   NA
 292514 292515 LA_3061 LA_3062     FALSE 0.031 203.000 0.000 NA   NA
 292520 292521 LA_3067 LA_3068 tolB   TRUE 0.986 4.000 0.750 NA   NA
 292521 292522 LA_3068 LA_3069     TRUE 0.983 14.000 0.750 NA   NA
 292522 292523 LA_3069 LA_3070     TRUE 0.977 24.000 0.750 NA   NA
 292524 292525 LA_3071 LA_3072     TRUE 0.971 33.000 0.182 NA   NA
 292525 292526 LA_3072 LA_3073     FALSE 0.213 95.000 0.000 NA   NA
 292526 292528 LA_3073 LA_3075     FALSE 0.004 1741.000 0.000 NA   NA
 292528 292529 LA_3075 LA_3076     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 292529 292530 LA_3076 LA_3077     TRUE 0.866 -12.000 0.000 NA   NA
 292531 292532 LA_3078 LA_3079     FALSE 0.004 2188.000 0.000 NA   NA
 292532 292533 LA_3079 LA_3080   purB TRUE 0.972 1.000 0.002 NA   NA
 292533 292536 LA_3080 LA_3083 purB   FALSE 0.004 700.000 0.000 NA   NA
 292536 292537 LA_3083 LA_3084     TRUE 0.985 11.000 0.667 NA   NA
 292537 292538 LA_3084 LA_3085   spoT TRUE 0.990 14.000 0.074 1.000 N NA
 292538 292539 LA_3085 LA_3086 spoT nadC TRUE 0.986 5.000 0.004 1.000 N NA
 292539 10350674 LA_3086 LA_r04 nadC rrs FALSE 0.003 992.000 0.000 NA   NA
 292545 10350675 LA_3093 LA_3093a     TRUE 0.872 8.000 0.000 NA   NA
 292546 292547 LA_3092 LA_3094   fur TRUE 0.974 31.000 0.375 NA   NA
 292547 292548 LA_3094 LA_3095 fur tgt TRUE 0.993 -3.000 0.083 1.000 N NA
 292548 292549 LA_3095 LA_3096 tgt spoIIAA TRUE 0.918 71.000 0.065 1.000 N NA
 292549 292550 LA_3096 LA_3097 spoIIAA lipL71 TRUE 0.956 48.000 0.065 1.000   NA
 10350676 292552 LA_3097a LA_3099     TRUE 0.887 85.000 0.100 0.021   NA
 292552 292553 LA_3099 LA_3100     FALSE 0.067 185.000 0.000 1.000   NA
 292555 292556 LA_3102 LA_3103     FALSE 0.004 619.000 0.000 NA   NA
 292556 292557 LA_3103 LA_3104   rtn FALSE 0.006 427.000 0.000 NA   NA
 292558 10350677 LA_3105 LA_3106     FALSE 0.004 789.000 0.000 NA   NA
 292561 292562 LA_3108 LA_3109 kdpE kdpD TRUE 0.981 4.000 0.000 1.000 Y NA
 292562 292563 LA_3109 LA_3110 kdpD kdpC TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.057 N NA
 292563 292564 LA_3110 LA_3111 kdpC kdpB TRUE 0.997 11.000 0.877 0.001 Y NA
 292564 292565 LA_3111 LA_3112 kdpB kdpA TRUE 0.997 11.000 0.059 0.001 Y NA
 292565 292566 LA_3112 LA_3113 kdpA   FALSE 0.030 246.000 0.000 1.000   NA
 292566 292567 LA_3113 LA_3114     FALSE 0.057 201.000 0.000 1.000   NA
 292567 292568 LA_3114 LA_3115     TRUE 0.729 97.000 0.429 NA   NA
 292571 292572 LA_3118 LA_3119     TRUE 0.989 2.000 0.333 NA   NA
 292573 292574 LA_3120 LA_3121     FALSE 0.594 66.000 0.000 1.000   NA
 292574 292579 LA_3121 LA_3126     FALSE 0.007 1231.000 0.000 1.000   NA
 292579 292580 LA_3126 LA_3127   nctP2 TRUE 0.931 5.000 0.000 1.000   NA
 292586 292588 LA_3133 LA_3135   paaJ FALSE 0.011 1224.000 0.000 1.000 N NA
 292592 292596 LA_3139 LA_3143 mauG caiA FALSE 0.021 1426.000 0.000 0.033 N NA
 292596 292597 LA_3143 LA_3144 caiA caiB FALSE 0.111 182.000 0.000 1.000 N NA
 292600 292601 LA_3147 LA_3148     FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 292601 292602 LA_3148 LA_3149     TRUE 0.955 46.000 0.400 NA   NA
 292602 292603 LA_3149 LA_3150     TRUE 0.986 11.000 0.400 NA   NA
 292608 292609 LA_3155 LA_3156     FALSE 0.014 353.000 0.000 1.000   NA
 292611 10350678 LA_3158 LA_3158a adhP   FALSE 0.026 215.000 0.000 NA   NA
 292613 292615 LA_3160 LA_3161 gcpE   FALSE 0.224 92.000 0.000 NA   NA
 292614 292617 LA_3162 LA_3165     FALSE 0.004 1131.000 0.000 NA   NA
 292617 292619 LA_3165 LA_3166     FALSE 0.010 301.000 0.000 NA   NA
 292619 292620 LA_3166 LA_3167     FALSE 0.687 57.000 0.000 1.000   NA
 292620 292621 LA_3167 LA_3168     FALSE 0.070 148.000 0.000 NA   NA
 292623 292625 LA_3170 LA_3172   ara1 FALSE 0.007 1227.000 0.000 1.000   NA
 292625 292626 LA_3172 LA_3173 ara1 uup FALSE 0.013 366.000 0.000 1.000   NA
 292626 292628 LA_3173 LA_3175 uup   FALSE 0.003 939.000 0.000 NA   NA
 292628 292630 LA_3175 LA_3176     FALSE 0.008 343.000 0.000 NA   NA
 292630 292632 LA_3176 LA_3179     FALSE 0.004 658.000 0.000 NA   NA
 292632 292633 LA_3179 LA_3180     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 292633 292634 LA_3180 LA_3181     FALSE 0.004 785.000 0.000 NA   NA
 292634 292635 LA_3181 LA_3182     TRUE 0.996 0.000 0.267 NA Y NA
 11527012 292634   LA_3181     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11669375 292634   LA_3181     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11811767 292634   LA_3181     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11527013 292634   LA_3181     FALSE NA 686.000 0.000 NA   NA
 11669376 292634   LA_3181     FALSE NA 686.000 0.000 NA   NA
 11811768 292634   LA_3181     FALSE NA 686.000 0.000 NA   NA
 11527014 292634   LA_3181     FALSE NA 720.000 0.000 NA   NA
 11669377 292634   LA_3181     FALSE NA 720.000 0.000 NA   NA
 11811769 292634   LA_3181     FALSE NA 720.000 0.000 NA   NA
 11527015 292634   LA_3181     FALSE NA 757.000 0.000 NA   NA
 11669378 292634   LA_3181     FALSE NA 757.000 0.000 NA   NA
 11811770 292634   LA_3181     FALSE NA 757.000 0.000 NA   NA
 11527016 292634   LA_3181     FALSE NA 791.000 0.000 NA   NA
 11669379 292634   LA_3181     FALSE NA 791.000 0.000 NA   NA
 11811771 292634   LA_3181     FALSE NA 791.000 0.000 NA   NA
 11527017 292634   LA_3181     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11669380 292634   LA_3181     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11811772 292634   LA_3181     FALSE NA 828.000 0.000 NA   NA
 11527018 292634   LA_3181     FALSE NA 862.000 0.000 NA   NA
 11669381 292634   LA_3181     FALSE NA 862.000 0.000 NA   NA
 11811773 292634   LA_3181     FALSE NA 862.000 0.000 NA   NA
 11527019 292634   LA_3181     FALSE NA 899.000 0.000 NA   NA
 11669382 292634   LA_3181     FALSE NA 899.000 0.000 NA   NA
 11811774 292634   LA_3181     FALSE NA 899.000 0.000 NA   NA
 11527020 292634   LA_3181     FALSE NA 1056.000 0.000 NA   NA
 11669383 292634   LA_3181     FALSE NA 1056.000 0.000 NA   NA
 11811775 292634   LA_3181     FALSE NA 1056.000 0.000 NA   NA
 11527021 292634   LA_3181     FALSE NA 1092.000 0.000 NA   NA
 11669384 292634   LA_3181     FALSE NA 1092.000 0.000 NA   NA
 11811776 292634   LA_3181     FALSE NA 1092.000 0.000 NA   NA
 11527022 292634   LA_3181     FALSE NA 1127.000 0.000 NA   NA
 11669385 292634   LA_3181     FALSE NA 1127.000 0.000 NA   NA
 11811777 292634   LA_3181     FALSE NA 1127.000 0.000 NA   NA
 11527023 292634   LA_3181     FALSE NA 1163.000 0.000 NA   NA
 11669386 292634   LA_3181     FALSE NA 1163.000 0.000 NA   NA
 11811778 292634   LA_3181     FALSE NA 1163.000 0.000 NA   NA
 11527024 292634   LA_3181     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11669387 292634   LA_3181     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11811779 292634   LA_3181     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11527025 292634   LA_3181     FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11669388 292634   LA_3181     FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11811780 292634   LA_3181     FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11527026 292634   LA_3181     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 11669389 292634   LA_3181     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 11811781 292634   LA_3181     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 11527027 292634   LA_3181     FALSE NA 1306.000 0.000 NA   NA
 11669390 292634   LA_3181     FALSE NA 1306.000 0.000 NA   NA
 11811782 292634   LA_3181     FALSE NA 1306.000 0.000 NA   NA
 11527028 292634   LA_3181     FALSE NA 1341.000 0.000 NA   NA
 11669391 292634   LA_3181     FALSE NA 1341.000 0.000 NA   NA
 11811783 292634   LA_3181     FALSE NA 1341.000 0.000 NA   NA
 11527029 292634   LA_3181     FALSE NA 1872.000 0.000 NA   NA
 11669392 292634   LA_3181     FALSE NA 1872.000 0.000 NA   NA
 11811784 292634   LA_3181     FALSE NA 1872.000 0.000 NA   NA
 292639 292640 LA_3186 LA_3187     FALSE 0.004 615.000 0.000 NA   NA
 11527030 292634   LA_3181     FALSE NA 1908.000 0.000 NA   NA
 11669393 292634   LA_3181     FALSE NA 1908.000 0.000 NA   NA
 11811785 292634   LA_3181     FALSE NA 1908.000 0.000 NA   NA
 11527031 292634   LA_3181     FALSE NA 1943.000 0.000 NA   NA
 11669394 292634   LA_3181     FALSE NA 1943.000 0.000 NA   NA
 11811786 292634   LA_3181     FALSE NA 1943.000 0.000 NA   NA
 11527032 292634   LA_3181     FALSE NA 1979.000 0.000 NA   NA
 11669395 292634   LA_3181     FALSE NA 1979.000 0.000 NA   NA
 11811787 292634   LA_3181     FALSE NA 1979.000 0.000 NA   NA
 11527033 292634   LA_3181     FALSE NA 2015.000 0.000 NA   NA
 11669396 292634   LA_3181     FALSE NA 2015.000 0.000 NA   NA
 11811788 292634   LA_3181     FALSE NA 2015.000 0.000 NA   NA
 11527034 292634   LA_3181     FALSE NA 2051.000 0.000 NA   NA
 11669397 292634   LA_3181     FALSE NA 2051.000 0.000 NA   NA
 11811789 292634   LA_3181     FALSE NA 2051.000 0.000 NA   NA
 11527035 292634   LA_3181     FALSE NA 2087.000 0.000 NA   NA
 11669398 292634   LA_3181     FALSE NA 2087.000 0.000 NA   NA
 11811790 292634   LA_3181     FALSE NA 2087.000 0.000 NA   NA
 11527036 292634   LA_3181     FALSE NA 2123.000 0.000 NA   NA
 11669399 292634   LA_3181     FALSE NA 2123.000 0.000 NA   NA
 11811791 292634   LA_3181     FALSE NA 2123.000 0.000 NA   NA
 11527037 292634   LA_3181     FALSE NA 2235.000 0.000 NA   NA
 11669400 292634   LA_3181     FALSE NA 2235.000 0.000 NA   NA
 11811792 292634   LA_3181     FALSE NA 2235.000 0.000 NA   NA
 11527038 292634   LA_3181     FALSE NA 2271.000 0.000 NA   NA
 11669401 292634   LA_3181     FALSE NA 2271.000 0.000 NA   NA
 11811793 292634   LA_3181     FALSE NA 2271.000 0.000 NA   NA
 11527039 292634   LA_3181     FALSE NA 2305.000 0.000 NA   NA
 11669402 292634   LA_3181     FALSE NA 2305.000 0.000 NA   NA
 11811794 292634   LA_3181     FALSE NA 2305.000 0.000 NA   NA
 11527040 292634   LA_3181     FALSE NA 2341.000 0.000 NA   NA
 11669403 292634   LA_3181     FALSE NA 2341.000 0.000 NA   NA
 11811795 292634   LA_3181     FALSE NA 2341.000 0.000 NA   NA
 11527041 292634   LA_3181     FALSE NA 2378.000 0.000 NA   NA
 11669404 292634   LA_3181     FALSE NA 2378.000 0.000 NA   NA
 11811796 292634   LA_3181     FALSE NA 2378.000 0.000 NA   NA
 11527042 292634   LA_3181     FALSE NA 2414.000 0.000 NA   NA
 11669405 292634   LA_3181     FALSE NA 2414.000 0.000 NA   NA
 11811797 292634   LA_3181     FALSE NA 2414.000 0.000 NA   NA
 11527043 292634   LA_3181     FALSE NA 2450.000 0.000 NA   NA
 11669406 292634   LA_3181     FALSE NA 2450.000 0.000 NA   NA
 11811798 292634   LA_3181     FALSE NA 2450.000 0.000 NA   NA
 11527044 292634   LA_3181     FALSE NA 2486.000 0.000 NA   NA
 11669407 292634   LA_3181     FALSE NA 2486.000 0.000 NA   NA
 11811799 292634   LA_3181     FALSE NA 2486.000 0.000 NA   NA
 11527045 292634   LA_3181     FALSE NA 2522.000 0.000 NA   NA
 11669408 292634   LA_3181     FALSE NA 2522.000 0.000 NA   NA
 11811800 292634   LA_3181     FALSE NA 2522.000 0.000 NA   NA
 292642 292643 LA_3189 LA_3190     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292643 292644 LA_3190 LA_3191     TRUE 0.988 2.000 0.143 NA   NA
 292644 292645 LA_3191 LA_3192   devR FALSE 0.460 65.000 0.000 NA   NA
 292645 292646 LA_3192 LA_3193 devR devS TRUE 0.832 21.000 0.000 NA   NA
 292648 292649 LA_3195 LA_3196     FALSE 0.027 212.000 0.000 NA   NA
 292649 292650 LA_3196 LA_3197   hsdM FALSE 0.008 350.000 0.000 NA   NA
 292650 292651 LA_3197 LA_3198 hsdM hsdS TRUE 0.997 -3.000 0.017 0.051 Y NA
 292651 292652 LA_3198 LA_3199 hsdS prrC TRUE 0.987 -3.000 0.041 NA   NA
 292652 292653 LA_3199 LA_3200 prrC hsdR TRUE 0.986 8.000 0.178 NA   NA
 10350681 292654 LA_3200b LA_3201     FALSE 0.009 328.000 0.000 NA   NA
 292654 292656 LA_3201 LA_3203     FALSE 0.081 140.000 0.000 NA   NA
 292657 292659 LA_3205 LA_3206     FALSE 0.025 264.000 0.000 1.000   NA
 292659 292660 LA_3206 LA_3207     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.018 Y NA
 292662 292663 LA_3209 LA_3210     TRUE 0.704 42.000 0.000 NA   NA
 292666 292667 LA_3213 LA_3214     TRUE 0.704 42.000 0.000 NA   NA
 292669 292670 LA_3216 LA_3217 ispA   TRUE 0.913 52.000 0.013 NA   NA
 292670 292672 LA_3217 LA_3219   tktN2 FALSE 0.004 1158.000 0.000 NA   NA
 292672 292673 LA_3219 LA_3220 tktN2   TRUE 0.899 63.000 0.061 NA   NA
 10350682 10350683 LA_t22 LA_t23 tRNA-Thr-TGT tRNA-Tyr-GTA TRUE 0.871 11.000 0.000 NA   NA
 10350683 292677 LA_t23 LA_3224 tRNA-Tyr-GTA   FALSE 0.004 2371.000 0.000 NA   NA
 292680 292683 LA_3227 LA_3230     FALSE 0.027 211.000 0.000 NA   NA
 292686 292687 LA_3233 LA_3234   cyaA TRUE 0.929 6.000 0.000 1.000   NA
 292687 292688 LA_3234 LA_3235 cyaA   TRUE 0.850 -21.000 0.000 NA   NA
 292692 292693 LA_3239 LA_3240   lipL48 FALSE 0.061 157.000 0.000 NA   NA
 292693 292694 LA_3240 LA_3241 lipL48   FALSE 0.381 74.000 0.000 NA   NA
 292694 292695 LA_3241 LA_3242     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292695 292696 LA_3242 LA_3243     FALSE 0.004 1218.000 0.000 NA   NA
 292696 292697 LA_3243 LA_3244   tolQ FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 292697 292698 LA_3244 LA_3245 tolQ   TRUE 0.994 27.000 0.044 0.019 Y NA
 292698 292699 LA_3245 LA_3246   exbD TRUE 0.997 3.000 0.047 0.014 Y NA
 292699 292700 LA_3246 LA_3247 exbD   TRUE 0.993 4.000 0.047 0.055   NA
 292700 292702 LA_3247 LA_3249     FALSE 0.007 666.000 0.000 1.000   NA
 292702 292703 LA_3249 LA_3250     TRUE 0.967 6.000 0.000 0.020   NA
 292705 292706 LA_3252 LA_3253     TRUE 0.838 -31.000 0.000 NA   NA
 292706 292708 LA_3253 LA_3255     FALSE 0.004 814.000 0.000 NA   NA
 292708 292711 LA_3255 LA_3258     FALSE 0.004 1666.000 0.000 NA   NA
 292711 292713 LA_3258 LA_3260     FALSE 0.004 755.000 0.000 NA   NA
 292713 292715 LA_3260 LA_3262     FALSE 0.054 160.000 0.000 NA   NA
 292715 292716 LA_3262 LA_3263     TRUE 0.984 12.000 0.750 NA   NA
 292716 292717 LA_3263 LA_3264     TRUE 0.986 6.000 0.067 NA   NA
 292717 292718 LA_3264 LA_3265     TRUE 0.859 15.000 0.000 NA   NA
 292718 292719 LA_3265 LA_3266     TRUE 0.988 0.000 0.730 NA   NA
 292719 292720 LA_3266 LA_3267     TRUE 0.990 26.000 0.550 NA Y NA
 292720 292721 LA_3267 LA_3268     TRUE 0.991 20.000 0.679 0.011   NA
 292723 292724 LA_3270 LA_3271     FALSE 0.004 2096.000 0.000 NA   NA
 292730 292729 LA_3277 LA_3276     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 292728 292727 LA_3275 LA_3274     TRUE 0.870 -10.000 0.000 NA   NA
 292726 292734 LA_3273 LA_3281     FALSE 0.004 805.000 0.000 NA   NA
 292734 292735 LA_3281 LA_3282     TRUE 0.967 6.000 0.000 0.020   NA
 292735 292737 LA_3282 LA_3284     FALSE 0.007 718.000 0.000 1.000   NA
 292737 292738 LA_3284 LA_3285   dxs TRUE 0.959 34.000 0.006 1.000   NA
 292738 292739 LA_3285 LA_3286 dxs cyaA14 TRUE 0.968 33.000 0.004 1.000 N NA
 292741 292742 LA_3288 LA_3289 trpA trpB TRUE 0.997 -3.000 0.007 0.001 Y NA
 292742 292743 LA_3289 LA_3290 trpB proS TRUE 0.987 3.000 0.004 1.000 N NA
 292743 292744 LA_3290 LA_3291 proS   TRUE 0.980 6.000 0.004 1.000   NA
 292744 292745 LA_3291 LA_3292   dxr TRUE 0.984 -6.000 0.010 1.000   NA
 292745 292746 LA_3292 LA_3293 dxr cdsA TRUE 0.996 7.000 0.372 1.000 Y NA
 292746 292747 LA_3293 LA_3294 cdsA uppS TRUE 0.996 -7.000 0.400 1.000 Y NA
 292747 292748 LA_3294 LA_3295 uppS frr TRUE 0.993 2.000 0.409 1.000 N NA
 292748 292749 LA_3295 LA_3296 frr pyrH TRUE 0.988 -10.000 0.015 1.000 N NA
 292749 292750 LA_3296 LA_3297 pyrH tsf TRUE 0.986 4.000 0.011 1.000   NA
 292750 292751 LA_3297 LA_3298 tsf rpsB TRUE 0.988 12.000 0.748 1.000   NA
 292751 292753 LA_3298 LA_3300 rpsB   FALSE 0.020 302.000 0.000 NA N NA
 292753 292754 LA_3300 LA_3301     TRUE 0.986 9.000 0.095 NA   NA
 292754 292755 LA_3301 LA_3302   acpS TRUE 0.981 4.000 0.003 1.000   NA
 292755 292756 LA_3302 LA_3303 acpS   TRUE 0.977 -3.000 0.003 NA   NA
 292756 292757 LA_3303 LA_3304     TRUE 0.980 3.000 0.007 NA   NA
 292757 292758 LA_3304 LA_3305   dapB TRUE 0.969 13.000 0.003 NA   NA
 292758 292759 LA_3305 LA_3306 dapB dapA TRUE 0.992 4.000 0.003 1.000 Y NA
 292765 292767 LA_3312 LA_3314     FALSE 0.004 1241.000 0.000 NA   NA
 292767 292768 LA_3314 LA_3315   rimL FALSE 0.088 165.000 0.000 1.000   NA
 292768 292769 LA_3315 LA_3316 rimL   FALSE 0.124 118.000 0.000 NA   NA
 292769 292770 LA_3316 LA_3317   folA FALSE 0.402 72.000 0.000 NA   NA
 292770 292772 LA_3317 LA_3319 folA   FALSE 0.007 678.000 0.000 1.000   NA
 292773 292774 LA_3320 LA_3321     FALSE 0.125 203.000 0.000 0.016   NA
 292774 292775 LA_3321 LA_3322     TRUE 0.887 48.000 0.000 0.016   NA
 292775 292776 LA_3322 LA_3323     FALSE 0.122 204.000 0.000 0.016   NA
 292776 292777 LA_3323 LA_3324     FALSE 0.131 200.000 0.000 0.016   NA
 292778 292780 LA_3325 LA_3327     FALSE 0.006 453.000 0.000 NA   NA
 292781 292782 LA_3328 LA_3329   tra5 TRUE 0.965 6.000 0.000 0.050   NA
 292783 292784 LA_3330 LA_3331     FALSE 0.008 360.000 0.000 NA   NA
 292784 292785 LA_3331 LA_3332     FALSE 0.022 225.000 0.000 NA   NA
 292785 292786 LA_3332 LA_3333     FALSE 0.005 540.000 0.000 NA   NA
 292787 292789 LA_3334 LA_3336     FALSE 0.007 392.000 0.000 NA   NA
 292789 292790 LA_3336 LA_3337     TRUE 0.872 9.000 0.000 NA   NA
 292790 292792 LA_3337 LA_3338     FALSE 0.006 750.000 0.000 1.000   NA
 292792 292793 LA_3338 LA_3340     TRUE 0.960 -85.000 0.000 0.003   NA
 292795 292797 LA_3342 LA_3344     FALSE 0.004 720.000 0.000 NA   NA
 292799 292802 LA_3345 LA_3349   ccmE FALSE 0.050 318.000 0.005 NA   NA
 292802 292803 LA_3349 LA_3350 ccmE ccmF TRUE 0.995 27.000 0.086 0.001 Y NA
 292803 292804 LA_3350 LA_3351 ccmF   TRUE 0.987 -3.000 0.049 NA   NA
 292804 292805 LA_3351 LA_3352     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 292805 292806 LA_3352 LA_3353     TRUE 0.978 -33.000 1.000 NA   NA
 292808 292809 LA_3355 LA_3356   gst FALSE 0.007 799.000 0.000 NA N NA
 292810 292811 LA_3357 LA_3358     FALSE 0.004 708.000 0.000 NA   NA
 292811 292813 LA_3358 LA_3360     FALSE 0.004 654.000 0.000 NA   NA
 292813 292814 LA_3360 LA_3361     TRUE 0.987 5.000 0.500 NA   NA
 292814 292815 LA_3361 LA_3362     TRUE 0.988 -10.000 0.082 1.000   NA
 292815 292816 LA_3362 LA_3363   caiA TRUE 0.985 21.000 0.122 1.000   NA
 292818 292819 LA_3365 LA_3366 thiM caiD FALSE 0.022 365.000 0.000 1.000 N NA
 292820 292821 LA_3367 LA_3368     FALSE 0.450 66.000 0.000 NA   NA
 292821 292822 LA_3368 LA_3369     TRUE 0.892 2.000 0.000 NA   NA
 292822 10350684 LA_3369 LA_t24   tRNA-Ala-TGC FALSE 0.004 1317.000 0.000 NA   NA
 10350684 10350685 LA_t24 LA_t25 tRNA-Ala-TGC tRNA-Ile-GAT TRUE 0.859 15.000 0.000 NA   NA
 10350685 292823 LA_t25 LA_3370 tRNA-Ile-GAT   FALSE 0.436 68.000 0.000 NA   NA
 292823 292824 LA_3370 LA_3371   mdoC TRUE 0.984 11.000 0.054 NA   NA
 292824 292825 LA_3371 LA_3372 mdoC crp TRUE 0.725 93.000 0.054 NA   NA
 292831 292832 LA_3378 LA_3379 greA flaA1 FALSE 0.061 197.000 0.000 1.000   NA
 292832 292833 LA_3379 LA_3380 flaA1 flaA2 TRUE 0.991 24.000 0.200 0.005   NA
 292833 292836 LA_3380 LA_3383 flaA2   FALSE 0.003 997.000 0.000 NA   NA
 292836 292838 LA_3383 LA_3385     FALSE 0.004 586.000 0.000 NA   NA
 292840 292841 LA_3387 LA_3388     FALSE 0.019 236.000 0.000 NA   NA
 10350686 292843 LA_3388a LA_3390     FALSE 0.004 1356.000 0.000 NA   NA
 292843 292844 LA_3390 LA_3392     TRUE 0.987 4.000 0.667 NA   NA
 292849 292850 LA_3396 LA_3397     FALSE 0.364 75.000 0.000 NA   NA
 292850 292851 LA_3397 LA_3398     FALSE 0.120 226.000 0.008 NA   NA
 292851 292852 LA_3398 LA_3399     TRUE 0.987 -3.000 0.012 1.000   NA
 292852 292853 LA_3399 LA_3400     TRUE 0.987 0.000 0.013 1.000   NA
 292853 292854 LA_3400 LA_3401   pqqL TRUE 0.995 2.000 0.113 0.008   NA
 292855 292856 LA_3402 LA_3403     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 292858 292859 LA_3405 LA_3406     FALSE 0.011 291.000 0.000 NA   NA
 292859 292860 LA_3406 LA_3407   alaS TRUE 0.976 -3.000 0.003 NA   NA
 292860 292861 LA_3407 LA_3408 alaS rpsI TRUE 0.859 84.000 0.002 1.000 Y NA
 292861 292862 LA_3408 LA_3409 rpsI rplM TRUE 0.997 11.000 0.601 0.013 Y NA
 292862 292863 LA_3409 LA_3410 rplM   FALSE 0.003 987.000 0.000 NA   NA
 292865 292867 LA_3412 LA_3414 thiL   FALSE 0.003 901.000 0.000 NA   NA
 292867 292868 LA_3414 LA_3415     FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 292869 292870 LA_3416 LA_3417 rpsG rpsL TRUE 0.997 18.000 0.620 0.002 Y NA
 292870 292872 LA_3417 LA_3419 rpsL rpoC FALSE 0.103 398.000 0.122 1.000 N NA
 292872 292873 LA_3419 LA_3420 rpoC rpoB TRUE 0.998 4.000 0.851 0.001 Y NA
 292873 292874 LA_3420 LA_3421 rpoB rplL FALSE 0.296 223.000 0.223 1.000 N NA
 292874 292875 LA_3421 LA_3422 rplL rplJ TRUE 0.978 50.000 0.884 1.000 Y NA
 292875 292876 LA_3422 LA_3423 rplJ rplA TRUE 0.992 28.000 0.302 1.000 Y NA
 292876 292877 LA_3423 LA_3424 rplA rplK TRUE 0.997 7.000 0.838 0.017 Y NA
 292877 292878 LA_3424 LA_3425 rplK nusG TRUE 0.985 27.000 0.681 1.000 N NA
 292878 292879 LA_3425 LA_3426 nusG secE TRUE 0.983 28.000 0.843 1.000 N NA
 292879 10350687 LA_3426 LA_t26 secE tRNA-Trp-CCA FALSE 0.608 51.000 0.000 NA   NA
 10350687 10350688 LA_t26 LA_t27 tRNA-Trp-CCA tRNA-Thr-GGT TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 10350689 292883 LA_3426a LA_3430     FALSE 0.009 315.000 0.000 NA   NA
 292885 292886 LA_3432 LA_3433     FALSE 0.688 44.000 0.000 NA   NA
 292886 292887 LA_3433 LA_3434   amiC TRUE 0.980 -19.000 0.032 NA   NA
 292887 292888 LA_3434 LA_3435 amiC srmB TRUE 0.985 -33.000 0.019 1.000 N NA
 292888 292889 LA_3435 LA_3436 srmB   TRUE 0.991 -3.000 0.013 1.000 N NA
 292890 292891 LA_3437 LA_3438 tdcF   TRUE 0.983 -10.000 1.000 NA   NA
 292893 292894 LA_3440 LA_3441   pepA FALSE 0.004 1152.000 0.000 NA   NA
 292894 292895 LA_3441 LA_3442 pepA bcp TRUE 0.987 -3.000 0.004 1.000 N NA
 292895 292897 LA_3442 LA_3444 bcp   FALSE 0.010 1038.000 0.000 1.000 N NA
 292902 292903 LA_3449 LA_3450 ribF   TRUE 0.780 96.000 0.021 1.000 N NA
 292903 292904 LA_3450 LA_3451   rsbU TRUE 0.997 4.000 0.667 0.006 Y NA
 292906 292907 LA_3453 LA_3454   fliD TRUE 0.981 18.000 0.056 NA   NA
 292908 292909 LA_3455 LA_3456 glpF   FALSE 0.006 1122.000 0.000 1.000   NA
 292913 292914 LA_3459 LA_3461 ppk glcD TRUE 0.986 11.000 0.006 1.000 N NA
 292914 292915 LA_3461 LA_3462 glcD   TRUE 0.988 0.000 0.014 1.000   NA
 292915 292916 LA_3462 LA_3463     TRUE 0.977 -18.000 0.014 NA   NA
 292921 10350690 LA_3468 LA_3468a fecA   FALSE 0.328 80.000 0.000 NA   NA
 10350690 292922 LA_3468a LA_3469   irpA FALSE 0.032 202.000 0.000 NA   NA
 292922 292923 LA_3469 LA_3470 irpA   TRUE 0.979 32.000 0.436 NA N NA
 292923 292924 LA_3470 LA_3471   irpA TRUE 0.988 -3.000 0.713 NA   NA
 292925 10350691 LA_3472 LA_3472a     FALSE 0.004 1467.000 0.000 NA   NA
 10350691 292926 LA_3472a LA_3473     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 292926 292927 LA_3473 LA_3474     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292927 292928 LA_3474 LA_3475     TRUE 0.836 20.000 0.000 NA   NA
 292928 292929 LA_3475 LA_3476     TRUE 0.851 17.000 0.000 NA   NA
 292929 292930 LA_3476 LA_3477     TRUE 0.756 34.000 0.000 NA   NA
 292930 292931 LA_3477 LA_3478     FALSE 0.561 55.000 0.000 NA   NA
 292931 292932 LA_3478 LA_3479     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 292932 292933 LA_3479 LA_3480     TRUE 0.873 -9.000 0.000 NA   NA
 292934 292935 LA_3481 LA_3482     FALSE 0.117 121.000 0.000 NA   NA
 292935 292936 LA_3482 LA_3483   tra5 TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292938 292939 LA_3485 LA_3486 estA   TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 292939 292942 LA_3486 LA_3489   flgC2 FALSE 0.004 1316.000 0.000 NA   NA
 292942 292943 LA_3489 LA_3490 flgC2   FALSE 0.005 497.000 0.000 NA   NA
 292943 292944 LA_3490 LA_3491     FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 292944 292945 LA_3491 LA_3492     FALSE 0.004 834.000 0.000 NA   NA
 292947 292950 LA_3494 LA_3497     FALSE 0.004 757.000 0.000 NA   NA
 292950 292951 LA_3497 LA_3498   phoU FALSE 0.078 142.000 0.000 NA   NA
 292951 292952 LA_3498 LA_3499 phoU   FALSE 0.004 631.000 0.000 NA   NA
 292952 292953 LA_3499 LA_3500     FALSE 0.007 394.000 0.000 NA   NA
 292954 10350692 LA_3501 LA_3501a     FALSE 0.004 658.000 0.000 NA   NA
 10350692 10350693 LA_3501a LA_3501b     TRUE 0.986 7.000 0.667 NA   NA
 10350693 292957 LA_3501b LA_3504     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 292957 292958 LA_3504 LA_3505     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 292959 292960 LA_3506 LA_3507     TRUE 0.810 100.000 0.333 1.000 N NA
 292960 292961 LA_3507 LA_3508   petE TRUE 0.998 0.000 0.500 0.010 Y NA
 292961 292962 LA_3508 LA_3509 petE mauG TRUE 0.990 33.000 0.600 0.010 N NA
 292962 292964 LA_3509 LA_3511 mauG purL FALSE 0.011 1344.000 0.000 1.000 N NA
 292964 292965 LA_3511 LA_3512 purL purS TRUE 0.998 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 292965 292966 LA_3512 LA_3513 purS purC TRUE 0.994 -24.000 0.049 1.000 Y NA
 292966 292967 LA_3513 LA_3514 purC   TRUE 0.989 -3.000 0.006 1.000 N NA
 292967 292968 LA_3514 LA_3515   ccmC TRUE 0.987 7.000 0.008 1.000 N NA
 292968 292969 LA_3515 LA_3516 ccmC ccmB TRUE 0.986 57.000 0.501 0.001 Y NA
 292969 292970 LA_3516 LA_3517 ccmB ccmA TRUE 0.989 -28.000 0.196 1.000 N NA
 10350694 292974 LA_3517a LA_3521     FALSE 0.007 394.000 0.000 NA   NA
 292974 292975 LA_3521 LA_3522     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 292980 292981 LA_3527 LA_3528   mrr TRUE 0.879 6.000 0.000 NA   NA
 292981 292982 LA_3528 LA_3529 mrr   FALSE 0.182 125.000 0.000 1.000   NA
 292984 292985 LA_3531 LA_3532 arsR   TRUE 0.984 -19.000 0.286 NA   NA
 292985 292986 LA_3532 LA_3533     TRUE 0.735 92.000 0.067 NA   NA
 292986 292987 LA_3533 LA_3534     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 292987 292988 LA_3534 LA_3535     TRUE 0.828 22.000 0.000 NA   NA
 292988 292989 LA_3535 LA_3536     FALSE 0.013 270.000 0.000 NA   NA
 292989 292990 LA_3536 LA_3537     FALSE 0.004 675.000 0.000 NA   NA
 292990 292991 LA_3537 LA_3538     TRUE 0.866 13.000 0.000 NA   NA
 292991 292992 LA_3538 LA_3539     TRUE 0.952 12.000 0.000 1.000 N NA
 292993 292995 LA_3540 LA_3542 sphH   FALSE 0.006 1015.000 0.000 1.000   NA
 292995 292996 LA_3542 LA_3543     FALSE 0.003 998.000 0.000 NA   NA
 292996 292997 LA_3543 LA_3544     FALSE 0.008 349.000 0.000 NA   NA
 292997 292998 LA_3544 LA_3545     TRUE 0.987 7.000 0.182 NA   NA
 292998 292999 LA_3545 LA_3546     FALSE 0.005 479.000 0.000 NA   NA
 292999 293000 LA_3546 LA_3547     FALSE 0.150 184.000 0.002 NA   NA
 293000 293004 LA_3547 LA_3551     FALSE 0.003 954.000 0.000 NA   NA
 293004 293005 LA_3551 LA_3552     TRUE 0.979 0.000 0.004 NA   NA
 293007 10350695 LA_3553 LA_3553a     FALSE 0.004 1086.000 0.000 NA   NA
 293010 293011 LA_3557 LA_3558   paaD FALSE 0.005 478.000 0.000 NA   NA
 293011 293012 LA_3558 LA_3559 paaD iscU FALSE 0.105 292.000 0.152 NA   NA
 293012 293013 LA_3559 LA_3560 iscU csdB TRUE 0.987 -16.000 0.013 1.000 N NA
 293013 293014 LA_3560 LA_3561 csdB nirD TRUE 0.992 6.000 0.375 1.000 N NA
 293014 293015 LA_3561 LA_3562 nirD   TRUE 0.989 -3.000 0.005 1.000 N NA
 293015 293016 LA_3562 LA_3563   sufC TRUE 0.995 -19.000 0.482 1.000 Y NA
 293017 293018 LA_3564 LA_3565 atsE glpK FALSE 0.003 960.000 0.000 NA   NA
 293018 293024 LA_3565 LA_3571 glpK   FALSE 0.007 1539.000 0.000 1.000   NA
 293024 10350696 LA_3571 LA_3571a     FALSE 0.229 91.000 0.000 NA   NA
 10350696 293025 LA_3571a LA_3572     FALSE 0.632 49.000 0.000 NA   NA
 293026 293027 LA_3573 LA_3574 kdsB fliL TRUE 0.991 0.000 0.020 1.000 N NA
 293027 293028 LA_3574 LA_3575 fliL fliL FALSE 0.270 218.000 0.000 0.001 Y NA
 293028 293029 LA_3575 LA_3576 fliL motB TRUE 0.987 41.000 0.115 1.000 Y NA
 293029 293030 LA_3576 LA_3577 motB motA TRUE 0.995 16.000 0.383 1.000 Y NA
 293030 293031 LA_3577 LA_3578 motA flbD TRUE 0.995 6.000 0.301 NA Y NA
 293031 293032 LA_3578 LA_3579 flbD   TRUE 0.987 5.000 0.014 NA N NA
 293032 293033 LA_3579 LA_3580     FALSE 0.313 82.000 0.000 NA   NA
 293035 293036 LA_3582 LA_3583   smf TRUE 0.966 -43.000 0.002 1.000   NA
 293036 293037 LA_3583 LA_3584 smf   TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 293037 293039 LA_3584 LA_3586     FALSE 0.004 1908.000 0.000 NA   NA
 293044 293047 LA_3591 LA_3594 ispF   FALSE 0.007 629.000 0.000 1.000   NA
 293049 293050 LA_3596 LA_3597 lon wecE TRUE 0.957 45.000 0.006 1.000 N NA
 293050 293051 LA_3597 LA_3598 wecE dps FALSE 0.016 485.000 0.000 1.000 N NA
 293053 293055 LA_3600 LA_3602     FALSE 0.004 760.000 0.000 NA   NA
 293055 293056 LA_3602 LA_3603     FALSE 0.004 1041.000 0.000 NA   NA
 293058 293059 LA_3604 LA_3606 pldB   FALSE 0.597 117.000 0.600 NA   NA
 293059 293060 LA_3606 LA_3607   maoC TRUE 0.989 2.000 0.429 NA   NA
 293060 293061 LA_3607 LA_3608 maoC   FALSE 0.006 471.000 0.000 NA   NA
 293063 293064 LA_3609 LA_3611     FALSE 0.004 644.000 0.000 NA   NA
 293064 293065 LA_3611 LA_3612     TRUE 0.808 25.000 0.000 NA   NA
 293066 293067 LA_3613 LA_3614 apbA   FALSE 0.265 105.000 0.000 1.000   NA
 293067 293068 LA_3614 LA_3615     FALSE 0.045 217.000 0.000 1.000   NA
 293069 293070 LA_3616 LA_3617 cutA   TRUE 0.968 25.000 0.005 1.000   NA
 293071 293072 LA_3618 LA_3619     TRUE 0.961 -16.000 0.000 0.020   NA
 293075 293076 LA_3622 LA_3623 amtB   FALSE 0.006 854.000 0.000 1.000   NA
 293077 293078 LA_3624 LA_3625   polA TRUE 0.987 -3.000 0.003 1.000 N NA
 293080 293081 LA_3627 LA_3628 caiA trpE TRUE 0.782 87.000 0.006 1.000 N NA
 293081 293082 LA_3628 LA_3629 trpE pabA TRUE 0.998 0.000 0.044 0.001 Y NA
 293082 293083 LA_3629 LA_3630 pabA mdlB TRUE 0.871 72.000 0.005 1.000 N NA
 293083 293084 LA_3630 LA_3631 mdlB   TRUE 0.939 -3.000 0.000 1.000   NA
 293089 10350698 LA_3636 LA_3636a pyrC   TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 10350698 293090 LA_3636a LA_3637     FALSE 0.004 1436.000 0.000 NA   NA
 293091 293092 LA_3638 LA_3639 thrA   FALSE 0.199 98.000 0.000 NA   NA
 293092 293093 LA_3639 LA_3640     FALSE 0.003 868.000 0.000 NA   NA
 293094 293095 LA_3641 LA_3642     FALSE 0.023 223.000 0.000 NA   NA
 293095 293097 LA_3642 LA_3644   ech7 FALSE 0.004 562.000 0.000 NA   NA
 293097 293098 LA_3644 LA_3645 ech7 ssb FALSE 0.029 308.000 0.000 1.000 N NA
 293098 293099 LA_3645 LA_3646 ssb   FALSE 0.007 667.000 0.000 1.000   NA
 293099 293101 LA_3646 LA_3648     FALSE 0.006 1041.000 0.000 1.000   NA
 293101 293102 LA_3648 LA_3649     TRUE 0.864 -13.000 0.000 NA   NA
 293102 293104 LA_3649 LA_3651     FALSE 0.004 1416.000 0.000 NA   NA
 293104 293105 LA_3651 LA_3652   rpoE TRUE 0.986 -10.000 0.500 NA   NA
 293105 293106 LA_3652 LA_3653 rpoE   TRUE 0.986 -10.000 0.600 NA   NA
 293106 293110 LA_3653 LA_3657     FALSE 0.004 1390.000 0.000 NA   NA
 293110 293112 LA_3657 LA_3659     FALSE 0.004 1495.000 0.000 NA   NA
 293113 293114 LA_3660 LA_3661     FALSE 0.022 225.000 0.000 NA   NA
 293114 293115 LA_3661 LA_3662     TRUE 0.938 1.000 0.000 1.000   NA
 293118 293119 LA_3665 LA_3666     TRUE 0.986 -3.000 0.003 1.000 N NA
 293119 293121 LA_3666 LA_3668     FALSE 0.011 1290.000 0.000 1.000 N NA
 293122 293125 LA_3669 LA_3672     FALSE 0.007 388.000 0.000 NA   NA
 293125 293126 LA_3672 LA_3673   msrA FALSE 0.040 227.000 0.000 NA N NA
 293126 293128 LA_3673 LA_3675 msrA   FALSE 0.006 450.000 0.000 NA   NA
 293129 293130 LA_3676 LA_3677 caiA   TRUE 0.892 2.000 0.000 NA   NA
 293130 293132 LA_3677 LA_3679   wbbJ FALSE 0.004 1478.000 0.000 NA   NA
 293132 293133 LA_3679 LA_3680 wbbJ   FALSE 0.003 1003.000 0.000 NA   NA
 293134 293137 LA_3681 LA_3684   uup FALSE 0.007 1301.000 0.000 1.000   NA
 293138 293141 LA_3685 LA_3688     FALSE 0.004 1564.000 0.000 NA   NA
 293141 293143 LA_3688 LA_3690     FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 293143 293145 LA_3690 LA_3692   mrcA FALSE 0.008 338.000 0.000 NA   NA
 293147 293148 LA_3694 LA_3695 mdlB lpxK TRUE 0.981 24.000 0.009 1.000 N NA
 293148 293149 LA_3695 LA_3696 lpxK   FALSE 0.003 912.000 0.000 NA   NA
 293152 293156 LA_3699 LA_3703 arsC hrcA FALSE 0.011 1257.000 0.000 1.000 N NA
 293156 293157 LA_3703 LA_3704 hrcA grpE TRUE 0.986 14.000 0.007 1.000 N NA
 293157 293158 LA_3704 LA_3705 grpE dnaK TRUE 0.992 35.000 0.018 0.005 Y NA
 293158 293160 LA_3705 LA_3706 dnaK dnaJ FALSE 0.390 293.000 0.196 0.002 Y NA
 293160 293162 LA_3706 LA_3709 dnaJ mviM FALSE 0.021 286.000 0.000 1.000   NA
 293162 293163 LA_3709 LA_3710 mviM   TRUE 0.964 24.000 0.006 NA   NA
 293163 293164 LA_3710 LA_3711     FALSE 0.004 562.000 0.000 NA   NA
 293165 293166 LA_3712 LA_3713   salX TRUE 0.994 -3.000 0.245 1.000 N NA
 293172 293173 LA_3719 LA_3720     FALSE 0.152 133.000 0.000 1.000   NA
 293173 293175 LA_3720 LA_3722     FALSE 0.005 546.000 0.000 NA   NA
 293175 293176 LA_3722 LA_3723     FALSE 0.443 67.000 0.000 NA   NA
 293176 293177 LA_3723 LA_3724     FALSE 0.009 318.000 0.000 NA   NA
 293177 293178 LA_3724 LA_3725     TRUE 0.859 15.000 0.000 NA   NA
 293178 293179 LA_3725 LA_3726     FALSE 0.134 141.000 0.000 1.000   NA
 293179 293180 LA_3726 LA_3727     FALSE 0.025 218.000 0.000 NA   NA
 293180 293182 LA_3727 LA_3729     FALSE 0.004 620.000 0.000 NA   NA
 293182 293183 LA_3729 LA_3730     FALSE 0.005 542.000 0.000 NA   NA
 293183 293184 LA_3730 LA_3731     FALSE 0.004 569.000 0.000 NA   NA
 293186 293187 LA_3733 LA_3734     TRUE 0.986 12.000 0.400 NA   NA
 293187 293188 LA_3734 LA_3735     TRUE 0.816 24.000 0.000 NA   NA
 293188 293189 LA_3735 LA_3736     TRUE 0.871 11.000 0.000 NA   NA
 293189 293190 LA_3736 LA_3737   acrA FALSE 0.014 347.000 0.000 1.000   NA
 293190 293191 LA_3737 LA_3738 acrA czcA4 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA N NA
 293191 293192 LA_3738 LA_3739 czcA4   FALSE 0.207 96.000 0.000 NA   NA
 293192 293193 LA_3739 LA_3740     TRUE 0.864 -13.000 0.000 NA   NA
 293193 293194 LA_3740 LA_3741     TRUE 0.864 -13.000 0.000 NA   NA
 293194 293195 LA_3741 LA_3742     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 293197 293198 LA_3744 LA_3745     TRUE 0.983 12.000 1.000 NA   NA
 293198 293200 LA_3745 LA_3747   thrC FALSE 0.027 509.000 0.005 NA   NA
 293200 293201 LA_3747 LA_3748 thrC   TRUE 0.978 4.000 0.005 NA   NA
 293201 293202 LA_3748 LA_3749     TRUE 0.710 91.000 0.026 NA   NA
 293204 293205 LA_3751 LA_3752     FALSE 0.077 341.000 0.667 NA   NA
 293205 293206 LA_3752 LA_3753     FALSE 0.003 944.000 0.000 NA   NA
 293206 293207 LA_3753 LA_3754   sipC FALSE 0.688 44.000 0.000 NA   NA
 293211 293215 LA_3758 LA_3762 rbpA3   FALSE 0.004 1168.000 0.000 NA   NA
 293215 293216 LA_3762 LA_3763   valS FALSE 0.042 179.000 0.000 NA   NA
 293216 293217 LA_3763 LA_3764 valS purD TRUE 0.991 2.000 0.003 0.072 N NA
 293217 293218 LA_3764 LA_3765 purD   TRUE 0.974 2.000 0.003 NA   NA
 293218 293220 LA_3765 LA_3767   prfB FALSE 0.015 882.000 0.002 NA   NA
 293220 293222 LA_3767 LA_3769 prfB   FALSE 0.045 175.000 0.000 NA   NA
 293222 293223 LA_3769 LA_3770     FALSE 0.484 63.000 0.000 NA   NA
 293223 293227 LA_3770 LA_3774     FALSE 0.004 1157.000 0.000 NA   NA
 293227 293228 LA_3774 LA_3775   tra5 TRUE 0.993 6.000 0.273 0.048   NA
 293228 293230 LA_3775 LA_3777 tra5 crcB FALSE 0.011 1149.000 0.000 1.000 N NA
 293230 293231 LA_3777 LA_3778 crcB   FALSE 0.006 450.000 0.000 NA   NA
 293231 293232 LA_3778 LA_3779     TRUE 0.950 44.000 1.000 NA   NA
 293232 293233 LA_3779 LA_3780     TRUE 0.851 17.000 0.000 NA   NA
 293233 293234 LA_3780 LA_3781     TRUE 0.871 10.000 0.000 NA   NA
 293235 293236 LA_3782 LA_3783   add FALSE 0.031 254.000 0.000 NA N NA
 293241 293242 LA_3788 LA_3789     FALSE 0.008 361.000 0.000 NA   NA
 293242 293243 LA_3789 LA_3790     FALSE 0.321 81.000 0.000 NA   NA
 293243 293246 LA_3790 LA_3793     FALSE 0.003 957.000 0.000 NA   NA
 293246 293247 LA_3793 LA_3794     TRUE 0.777 83.000 0.023 NA   NA
 293248 293249 LA_3795 LA_3796     TRUE 0.988 3.000 0.167 NA   NA
 293249 293250 LA_3796 LA_3797     TRUE 0.985 13.000 0.600 NA   NA
 293250 293251 LA_3797 LA_3798     TRUE 0.989 0.000 0.667 NA   NA
 293252 10350700 LA_3799 LA_t28 rpsT tRNA-Val-TAC TRUE 0.851 17.000 0.000 NA   NA
 10350700 293253 LA_t28 LA_3800 tRNA-Val-TAC manB TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 293253 293254 LA_3800 LA_3801 manB glmS TRUE 0.988 3.000 0.006 1.000 N NA
 293254 293255 LA_3801 LA_3802 glmS rfbA TRUE 0.983 6.000 0.006 1.000   NA
 293255 293256 LA_3802 LA_3803 rfbA pccB2 TRUE 0.911 17.000 0.000 1.000   NA
 293256 293258 LA_3803 LA_3805 pccB2   FALSE 0.004 1139.000 0.000 NA   NA
 293258 293259 LA_3805 LA_3806   amtB FALSE 0.213 95.000 0.000 NA   NA
 293259 293260 LA_3806 LA_3807 amtB glnK TRUE 0.977 39.000 0.061 1.000 N NA
 293260 293262 LA_3807 LA_3809 glnK   FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 293262 293264 LA_3809 LA_3811   speE1 FALSE 0.003 894.000 0.000 NA   NA
 293265 293267 LA_3812 LA_3814     FALSE 0.005 491.000 0.000 NA   NA
 293271 293272 LA_3818 LA_3819   hflB TRUE 0.980 -3.000 0.006 NA   NA
 293272 293273 LA_3819 LA_3820 hflB pth FALSE 0.326 160.000 0.003 1.000 N NA
 293273 293274 LA_3820 LA_3821 pth rplY TRUE 0.989 47.000 0.496 0.020 Y NA
 293274 293275 LA_3821 LA_3822 rplY prsA TRUE 0.982 18.000 0.005 1.000 N NA
 293275 293276 LA_3822 LA_3823 prsA glmU TRUE 0.991 -3.000 0.077 1.000   NA
 293276 10350701 LA_3823 LA_t29 glmU tRNA-Gln-TTG TRUE 0.803 26.000 0.000 NA   NA
 10350701 293277 LA_t29 LA_3824 tRNA-Gln-TTG ispE TRUE 0.882 5.000 0.000 NA   NA
 293277 293278 LA_3824 LA_3825 ispE   FALSE 0.010 503.000 0.000 NA N NA
 10350702 293280 LA_2825a LA_3827     TRUE 0.885 70.000 0.400 NA   NA
 293280 293281 LA_3827 LA_3828     FALSE 0.004 557.000 0.000 NA   NA
 293285 293286 LA_3832 LA_3833 tag   FALSE 0.004 586.000 0.000 NA   NA
 293287 10350703 LA_3834 LA_3834a     FALSE 0.008 343.000 0.000 NA   NA
 293291 293292 LA_3838 LA_3839     FALSE 0.003 836.000 0.000 NA   NA
 293298 293299 LA_3845 LA_3846 acrR acrB FALSE 0.239 113.000 0.000 NA N NA
 293299 293301 LA_3846 LA_3848 acrB   FALSE 0.004 1696.000 0.000 NA   NA
 293301 293302 LA_3848 LA_3849     TRUE 0.983 10.000 1.000 NA   NA
 293304 293306 LA_3851 LA_3853     FALSE 0.038 188.000 0.000 NA   NA
 293307 293308 LA_3854 LA_3855     FALSE 0.396 73.000 0.000 NA   NA
 293309 293310 LA_3856 LA_3857     FALSE 0.025 217.000 0.000 NA   NA
 293310 293311 LA_3857 LA_3858     TRUE 0.861 -15.000 0.000 NA   NA
 293314 293315 LA_3861 LA_3862     TRUE 0.928 54.000 0.065 NA   NA
 293315 293316 LA_3862 LA_3863   coaE TRUE 0.974 -3.000 0.003 NA   NA
 293320 293321 LA_3867 LA_3868     FALSE 0.303 83.000 0.000 NA   NA
 293321 293322 LA_3868 LA_3869   citB TRUE 0.974 -3.000 0.000 0.017   NA
 293322 293323 LA_3869 LA_3870 citB   FALSE 0.003 926.000 0.000 NA   NA
 293324 10350704 LA_3871 LA_3871a czcA5   FALSE 0.004 572.000 0.000 NA   NA
 293325 293326 LA_3872 LA_3873 sppA   TRUE 0.981 7.000 0.018 NA   NA
 293326 293327 LA_3873 LA_3874   surE TRUE 0.984 -3.000 0.013 NA   NA
 293327 293329 LA_3874 LA_3876 surE   FALSE 0.006 941.000 0.000 1.000   NA
 293329 10350705 LA_3876 LA_t30   tRNA-Pro-TGG TRUE 0.746 36.000 0.000 NA   NA
 10350705 10350706 LA_t30 LA_t31 tRNA-Pro-TGG tRNA-Arg-TCT TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 10350706 10350707 LA_t31 LA_t32 tRNA-Arg-TCT tRNA-His-GTG TRUE 0.851 17.000 0.000 NA   NA
 293336 293337 LA_3883 LA_3884     TRUE 0.926 14.000 0.000 NA N NA
 293337 293338 LA_3884 LA_3885   galK TRUE 0.963 -3.000 0.000 1.000 N NA
 293341 293343 LA_3888 LA_3890 pgi   FALSE 0.004 1542.000 0.000 NA   NA
 293345 293346 LA_3892 LA_3893 rfbM2   TRUE 0.989 -3.000 0.642 NA   NA
 293346 293347 LA_3893 LA_3894     TRUE 0.882 5.000 0.000 NA   NA
 293347 293348 LA_3894 LA_3895     TRUE 0.979 29.000 0.000 0.011 Y NA
 293351 293352 LA_3898 LA_3899     FALSE 0.015 1092.000 0.000 0.019   NA
 293352 293353 LA_3899 LA_3900     TRUE 0.838 -31.000 0.000 NA   NA
 293353 293356 LA_3900 LA_3903     FALSE 0.004 1151.000 0.000 NA   NA
 293364 293365 LA_3911 LA_3912     TRUE 0.912 51.000 0.010 NA   NA
 10350708 293366 LA_t33 LA_3913 tRNA-Val-GAC   FALSE 0.024 219.000 0.000 NA   NA
 293369 293370 LA_3916 LA_3917     FALSE 0.123 273.000 0.400 NA   NA
 293371 293374 LA_3918 LA_3921 metG glnD FALSE 0.010 966.000 0.000 1.000 N NA
 293375 293376 LA_3922 LA_3923     TRUE 0.855 16.000 0.000 NA   NA
 293376 293377 LA_3923 LA_3924     FALSE 0.005 473.000 0.000 NA   NA
 293379 293380 LA_3926 LA_3927 acrB tolC FALSE 0.007 787.000 0.000 NA N NA
 293380 293381 LA_3927 LA_3928 tolC caiA TRUE 0.928 70.000 0.250 1.000 N NA
 293381 293382 LA_3928 LA_3929 caiA   FALSE 0.010 861.000 0.000 1.000 N NA
 293383 293386 LA_3930 LA_3933 murB   FALSE 0.004 692.000 0.000 NA   NA
 293388 293389 LA_3935 LA_3936 dfp   TRUE 0.977 17.000 0.016 NA   NA
 293389 293390 LA_3936 LA_3937   tlyC TRUE 0.973 16.000 0.003 1.000   NA
 293390 293391 LA_3937 LA_3938 tlyC   FALSE 0.042 220.000 0.000 1.000   NA
 293391 293392 LA_3938 LA_3939   gpsA TRUE 0.987 6.000 0.030 1.000   NA
 293393 293395 LA_3940 LA_3941     FALSE 0.585 112.000 1.000 NA   NA
 293395 293396 LA_3941 LA_3943     TRUE 0.988 3.000 0.667 NA   NA
 293396 293397 LA_3943 LA_3944     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 293397 293398 LA_3944 LA_3945   recG TRUE 0.980 -19.000 0.028 NA   NA
 293401 293402 LA_3948 LA_3949 galE lpxA TRUE 0.995 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 293403 293405 LA_3950 LA_3952     FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 293405 10350709 LA_3952 LA_3952a     FALSE 0.004 1058.000 0.000 NA   NA
 10350709 293407 LA_3952a LA_3954     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 293407 293408 LA_3954 LA_3955     TRUE 0.968 6.000 0.000 0.019   NA
 293408 293409 LA_3955 LA_3956     FALSE 0.079 229.000 0.000 0.019   NA
 293410 293411 LA_3957 LA_3958 aroF panB TRUE 0.822 75.000 0.002 1.000 N NA
 293411 293412 LA_3958 LA_3959 panB folK TRUE 0.995 -16.000 0.117 1.000 Y NA
 293412 293413 LA_3959 LA_3960 folK dnaC TRUE 0.981 -3.000 0.003 1.000   NA
 293414 293415 LA_3961 LA_3962     FALSE 0.003 854.000 0.000 NA   NA
 293417 293418 LA_3964 LA_3965 gmd norM TRUE 0.868 44.000 0.000 1.000 N NA
 293418 293419 LA_3965 LA_3966 norM   FALSE 0.006 439.000 0.000 NA   NA
 293422 293423 LA_3969 LA_3970     FALSE 0.313 166.000 1.000 NA   NA
 293423 293424 LA_3970 LA_3971   trkG TRUE 0.986 0.000 0.026 NA   NA
 293424 293425 LA_3971 LA_3972 trkG ktrA TRUE 0.997 13.000 0.330 0.003 Y NA
 293428 293429 LA_3975 LA_3976 acyP   TRUE 0.984 -10.000 0.014 1.000   NA
 293429 293430 LA_3976 LA_3977   invA TRUE 0.984 0.000 0.005 1.000   NA
 293433 293435 LA_3980 LA_3982 ugpQ   FALSE 0.501 135.000 0.222 NA   NA
 293438 293439 LA_3985 LA_3986 mltA   FALSE 0.392 103.000 0.000 1.000 N NA
 293439 293440 LA_3986 LA_3987     FALSE 0.004 582.000 0.000 NA   NA
 293440 293441 LA_3987 LA_3988     FALSE 0.003 959.000 0.000 NA   NA
 293441 293443 LA_3988 LA_3990     FALSE 0.004 573.000 0.000 NA   NA
 293443 293444 LA_3990 LA_3991     TRUE 0.828 22.000 0.000 NA   NA
 293444 293446 LA_3991 LA_3993     FALSE 0.004 685.000 0.000 NA   NA
 293448 293450 LA_3996 LA_3997     FALSE 0.011 408.000 0.000 1.000   NA
 293451 293452 LA_3998 LA_3999   choB TRUE 0.991 47.000 0.095 0.001 Y NA
 293452 293453 LA_3999 LA_4000 choB   FALSE 0.016 321.000 0.000 1.000   NA
 293457 293459 LA_4004 LA_4005 sph3   FALSE 0.008 361.000 0.000 NA   NA
 293459 10350710 LA_4005 LA_4005a     FALSE 0.544 58.000 0.000 NA   NA
 293461 293462 LA_4008 LA_4009 cyaA16 choA FALSE 0.018 308.000 0.000 1.000   NA
 293462 293463 LA_4009 LA_4010 choA   TRUE 0.975 29.000 0.400 NA   NA
 293463 293464 LA_4010 LA_4011     TRUE 0.984 -15.000 0.667 NA   NA
 293468 293470 LA_4016 LA_4017 paaI   FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 293470 293472 LA_4017 LA_4019   ribD FALSE 0.011 448.000 0.000 1.000   NA
 293472 293473 LA_4019 LA_4021 ribD   TRUE 0.989 -3.000 0.143 NA   NA
 293475 293476 LA_4022 LA_4023     FALSE 0.027 522.000 0.006 NA   NA
 293479 293480 LA_4026 LA_4027     TRUE 0.860 74.000 0.667 NA   NA
 293480 293483 LA_4027 LA_4030     FALSE 0.003 1027.000 0.000 NA   NA
 293483 293485 LA_4030 LA_4032     FALSE 0.003 850.000 0.000 NA   NA
 293487 293488 LA_4034 LA_4035 paaY pheT FALSE 0.008 554.000 0.000 1.000   NA
 293488 293489 LA_4035 LA_4036 pheT   TRUE 0.861 79.000 0.002 0.070 N NA
 293489 293490 LA_4036 LA_4037     TRUE 0.985 1.000 0.006 NA N NA
 293493 293494 LA_4040 LA_4041 ppa uhpC TRUE 0.943 58.000 0.023 1.000 N NA
 293494 293495 LA_4041 LA_4042 uhpC   FALSE 0.213 95.000 0.000 NA   NA
 293497 293499 LA_4044 LA_4046     FALSE 0.004 2197.000 0.000 NA   NA
 293499 293503 LA_4046 LA_4049   srmB FALSE 0.004 618.000 0.000 NA   NA
 293503 293504 LA_4049 LA_4051 srmB   FALSE 0.376 127.000 0.004 NA   NA
 293506 10350711 LA_4053 LA_t34   tRNA-Thr-CGT FALSE 0.014 267.000 0.000 NA   NA
 10350711 293508 LA_t34 LA_4055 tRNA-Thr-CGT   FALSE 0.512 61.000 0.000 NA   NA
 293508 293509 LA_4055 LA_4056   arp TRUE 0.756 84.000 0.019 NA   NA
 293516 293517 LA_4063 LA_4064 mazG   TRUE 0.975 -3.000 0.003 NA   NA
 293517 293518 LA_4064 LA_4065     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 293519 293520 LA_4066 LA_4067   icd FALSE 0.629 95.000 0.008 NA   NA
 293520 293521 LA_4067 LA_4068 icd   TRUE 0.837 69.000 0.012 NA   NA
 293522 293523 LA_4069 LA_4070     TRUE 0.972 32.000 0.500 NA   NA
 293523 293524 LA_4070 LA_4071     FALSE 0.008 361.000 0.000 NA   NA
 293526 293529 LA_4073 LA_4076     FALSE 0.004 1099.000 0.000 NA   NA
 293529 293531 LA_4076 LA_4078     FALSE 0.068 149.000 0.000 NA   NA
 293532 293533 LA_4079 LA_4080 murA hycB TRUE 0.990 -3.000 0.010 1.000 N NA
 293533 293534 LA_4080 LA_4081 hycB   TRUE 0.810 42.000 0.000 1.000   NA
 293535 293536 LA_4082 LA_4083     TRUE 0.983 10.000 1.000 NA   NA
 293536 293537 LA_4083 LA_4084     FALSE 0.006 467.000 0.000 NA   NA
 293537 293538 LA_4084 LA_4085   adhP TRUE 0.988 5.000 0.035 1.000   NA
 293538 293539 LA_4085 LA_4086 adhP   TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 293540 293541 LA_4087 LA_4088     TRUE 0.980 -21.000 1.000 NA   NA
 293542 293544 LA_4089 LA_4092   purF FALSE 0.006 1066.000 0.000 1.000   NA
 293545 293546 LA_4091 LA_4093 rnd   TRUE 0.963 32.000 0.006 1.000   NA
 293546 293549 LA_4093 LA_4096     FALSE 0.004 1729.000 0.000 NA   NA
 293549 293550 LA_4096 LA_4097     TRUE 0.989 -3.000 0.250 NA   NA
 293550 293551 LA_4097 LA_4098   rpoE TRUE 0.989 0.000 0.375 NA   NA
 293551 293552 LA_4098 LA_4099 rpoE   TRUE 0.984 -16.000 0.667 NA   NA
 293552 293553 LA_4099 LA_4100     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 293553 293556 LA_4100 LA_4102   vicR FALSE 0.004 1309.000 0.000 NA   NA
 293556 293557 LA_4102 LA_4104 vicR vicK TRUE 0.993 -10.000 0.008 1.000 Y NA
 293557 293558 LA_4104 LA_4105 vicK argJ TRUE 0.845 75.000 0.004 1.000 N NA
 293558 293559 LA_4105 LA_4106 argJ   TRUE 0.968 -19.000 0.004 NA   NA
 293559 293560 LA_4106 LA_4107   rsbP TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 293561 293562 LA_4108 LA_4109     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 293562 293563 LA_4109 LA_4110     TRUE 0.989 -3.000 0.188 NA   NA
 293563 10350712 LA_4110 LA_4110a     FALSE 0.003 1030.000 0.000 NA   NA
 10350712 293566 LA_4110a LA_4113     FALSE 0.335 79.000 0.000 NA   NA
 293566 293567 LA_4113 LA_4114     FALSE 0.381 74.000 0.000 NA   NA
 293567 293568 LA_4114 LA_4115   maoC FALSE 0.062 277.000 0.000 NA Y NA
 293568 293570 LA_4115 LA_4117 maoC caiA FALSE 0.023 830.000 0.000 1.000 Y NA
 293570 293572 LA_4117 LA_4119 caiA lig FALSE 0.010 1029.000 0.000 1.000 N NA
 293572 293573 LA_4119 LA_4120 lig nlpD TRUE 0.971 19.000 0.003 1.000   NA
 293573 293574 LA_4120 LA_4121 nlpD   FALSE 0.012 281.000 0.000 NA   NA
 293574 293575 LA_4121 LA_4122   rpoE TRUE 0.979 18.000 1.000 NA   NA
 293575 293576 LA_4122 LA_4123 rpoE   TRUE 0.983 8.000 1.000 NA   NA
 293579 293580 LA_4126 LA_4127     FALSE 0.100 307.000 0.000 0.069 Y NA
 293580 293581 LA_4127 LA_4128     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 293581 293582 LA_4128 LA_4129   arp TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 293583 293584 LA_4130 LA_4131     FALSE 0.013 559.000 0.000 1.000 N NA
 293584 293586 LA_4131 LA_4133     FALSE 0.003 973.000 0.000 NA   NA
 293588 293590 LA_4135 LA_4137     FALSE 0.004 2130.000 0.000 NA   NA
 293591 293592 LA_4138 LA_4139 fadB fadA TRUE 0.992 16.000 0.008 1.000 Y NA
 293592 293593 LA_4139 LA_4140 fadA   TRUE 0.988 3.000 0.125 NA   NA
 293595 10350713 LA_4142 LA_4142a     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 293597 293598 LA_4144 LA_4145     TRUE 0.828 -46.000 0.000 NA   NA
 293599 293601 LA_4146 LA_4148     FALSE 0.004 599.000 0.000 NA   NA
 293602 293603 LA_4149 LA_4150   pheS TRUE 0.939 38.000 0.002 1.000   NA
 293603 293604 LA_4150 LA_4151 pheS murC TRUE 0.991 -3.000 0.003 0.069 N NA
 293604 293605 LA_4151 LA_4152 murC   TRUE 0.983 -3.000 0.010 NA   NA
 293605 293606 LA_4152 LA_4153     TRUE 0.982 -13.000 1.000 NA   NA
 293606 293607 LA_4153 LA_4154     TRUE 0.989 -3.000 0.300 NA   NA
 293607 293608 LA_4154 LA_4155     TRUE 0.989 -3.000 0.300 NA   NA
 293608 293609 LA_4155 LA_4156   ccmA TRUE 0.988 5.000 0.429 NA   NA
 293609 293610 LA_4156 LA_4157 ccmA   FALSE 0.007 388.000 0.000 NA   NA
 293610 293611 LA_4157 LA_4158     TRUE 0.796 27.000 0.000 NA   NA
 293612 293613 LA_4159 LA_4160     FALSE 0.008 339.000 0.000 NA   NA
 293614 293617 LA_4161 LA_4164     FALSE 0.046 1039.000 0.000 0.003 Y NA
 293619 293620 LA_4165 LA_4167 argG coaD TRUE 0.987 -3.000 0.003 1.000 N NA
 293620 293621 LA_4167 LA_4168 coaD ndk TRUE 0.982 10.000 0.002 1.000 N NA
 293621 293623 LA_4168 LA_4170 ndk   FALSE 0.005 475.000 0.000 NA   NA
 293623 293624 LA_4170 LA_4171   leuB FALSE 0.003 915.000 0.000 NA   NA
 293624 293625 LA_4171 LA_4172 leuB   FALSE 0.047 276.000 0.000 0.040   NA
 293626 293627 LA_4173 LA_4174     TRUE 0.997 5.000 0.500 0.017 Y NA
 293627 293629 LA_4174 LA_4176     FALSE 0.005 520.000 0.000 NA   NA
 293630 293631 LA_4177 LA_4178     TRUE 0.988 -3.000 0.068 NA   NA
 293631 293632 LA_4178 LA_4179     FALSE 0.004 652.000 0.000 NA   NA
 293632 293633 LA_4179 LA_4180     TRUE 0.983 -3.000 0.009 NA   NA
 293634 293635 LA_4181 LA_4182     TRUE 0.859 15.000 0.000 NA   NA
 293635 293636 LA_4182 LA_4183   motB4 TRUE 0.986 12.000 0.500 NA   NA
 293636 293637 LA_4183 LA_4184 motB4   TRUE 0.844 75.000 0.750 NA   NA
 293637 293638 LA_4184 LA_4185     TRUE 0.989 -3.000 0.600 NA   NA
 293638 293640 LA_4185 LA_4187     FALSE 0.006 422.000 0.000 NA   NA
 293640 293641 LA_4187 LA_4188     FALSE 0.085 137.000 0.000 NA   NA
 293641 293642 LA_4188 LA_4189     TRUE 0.937 2.000 0.000 1.000   NA
 293642 293643 LA_4189 LA_4190   gltX TRUE 0.894 73.000 0.008 0.068   NA
 293643 293644 LA_4190 LA_4191 gltX   TRUE 0.982 -3.000 0.008 NA   NA
 293646 293647 LA_4193 LA_4194 gyrA gyrB2 TRUE 0.994 -3.000 0.021 0.001   NA
 293647 293648 LA_4194 LA_4195 gyrB2   FALSE 0.512 61.000 0.000 NA   NA
 293648 293649 LA_4195 LA_4196     FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 293655 293656 LA_4202 LA_4203     FALSE 0.461 145.000 0.400 NA   NA
 293656 293657 LA_4203 LA_4204   cobT FALSE 0.052 161.000 0.000 NA   NA
 293657 293658 LA_4204 LA_4205 cobT cobS TRUE 0.998 -3.000 0.164 0.006 Y NA
 293658 293659 LA_4205 LA_4206 cobS gpmB TRUE 0.991 -15.000 0.102 1.000 N NA
 293659 293660 LA_4206 LA_4207 gpmB   FALSE 0.004 599.000 0.000 NA   NA
 293661 293662 LA_4208 LA_4209     TRUE 0.985 2.000 0.021 NA   NA
 293662 293663 LA_4209 LA_4210   eriC FALSE 0.003 976.000 0.000 NA   NA
 293663 293665 LA_4210 LA_4212 eriC   FALSE 0.004 821.000 0.000 NA   NA
 293665 293666 LA_4212 LA_4214     TRUE 0.952 45.000 0.060 NA   NA
 293667 293668 LA_4213 LA_4215 nlpD   TRUE 0.927 -7.000 0.000 1.000   NA
 293669 293670 LA_4216 LA_4217 cysI cysG TRUE 0.978 37.000 0.051 1.000 N NA
 293670 293671 LA_4217 LA_4218 cysG cysG TRUE 0.997 -10.000 0.077 0.002 Y NA
 293671 293672 LA_4218 LA_4219 cysG cysN TRUE 0.992 4.000 0.051 1.000 N NA
 293672 293673 LA_4219 LA_4220 cysN cysD TRUE 0.996 0.000 0.744 0.001 N NA
 293673 293674 LA_4220 LA_4221 cysD cysH TRUE 0.996 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 293677 293679 LA_4224 LA_4226     FALSE 0.004 1380.000 0.000 NA   NA
 293679 10350714 LA_4226 LA_4226a     FALSE 0.005 485.000 0.000 NA   NA
 10350714 293680 LA_4226a LA_4227     FALSE 0.015 262.000 0.000 NA   NA
 293680 293681 LA_4227 LA_4228   dppB TRUE 0.738 102.000 0.097 1.000   NA
 293681 293682 LA_4228 LA_4229 dppB dppC TRUE 0.995 -3.000 0.742 0.013   NA
 293682 293683 LA_4229 LA_4230 dppC dppD TRUE 0.990 -3.000 0.046 1.000   NA
 293683 293684 LA_4230 LA_4231 dppD dppD TRUE 0.998 -3.000 0.046 0.001 Y NA
 293684 293685 LA_4231 LA_4232 dppD   TRUE 0.981 -21.000 0.042 NA   NA
 293685 293686 LA_4232 LA_4233     TRUE 0.975 24.000 0.042 NA   NA
 293686 293688 LA_4233 LA_4235     FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   NA
 293689 293690 LA_4236 LA_4237 mutS3   TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 293692 293695 LA_4240 LA_4242   ilvC FALSE 0.008 583.000 0.000 1.000   NA
 293695 293696 LA_4242 LA_4243 ilvC   FALSE 0.010 1013.000 0.000 1.000 N NA
 293697 293698 LA_4244 LA_4245 osmC   FALSE 0.021 368.000 0.000 1.000 N NA
 293698 293699 LA_4245 LA_4246     FALSE 0.557 108.000 0.000 1.000 Y NA
 293699 293700 LA_4246 LA_4247     TRUE 0.981 19.000 0.074 NA   NA
 293701 293702 LA_4248 LA_4249     FALSE 0.012 641.000 0.000 1.000 N NA
 293702 293704 LA_4249 LA_4251   ada FALSE 0.013 576.000 0.000 1.000 N NA
 293706 293707 LA_4253 LA_4254 fepB acs TRUE 0.985 22.000 0.021 1.000 N NA
 293707 293708 LA_4254 LA_4255 acs folE TRUE 0.885 79.000 0.042 1.000 N NA
 293711 293712 LA_4258 LA_4259     TRUE 0.854 -19.000 0.000 NA   NA
 293712 293714 LA_4259 LA_4261     FALSE 0.007 1514.000 0.000 1.000   NA
 293719 293720 LA_4266 LA_4267 purT   FALSE 0.061 157.000 0.000 NA   NA
 293720 293721 LA_4267 LA_4269     FALSE 0.021 226.000 0.000 NA   NA
 293723 293725 LA_4270 LA_4272     FALSE 0.008 355.000 0.000 NA   NA
 293725 293726 LA_4272 LA_4273     TRUE 0.981 19.000 0.667 NA   NA
 293726 293727 LA_4273 LA_4274   hycD TRUE 0.992 -33.000 0.019 1.000 Y NA
 293727 293728 LA_4274 LA_4275 hycD   TRUE 0.976 19.000 0.019 NA   NA
 293728 293729 LA_4275 LA_4276   hyfF TRUE 0.989 -3.000 0.182 NA   NA
 293729 293730 LA_4276 LA_4277 hyfF hycE TRUE 0.996 1.000 0.097 1.000 Y NA
 293730 293731 LA_4277 LA_4278 hycE hycG TRUE 0.996 -3.000 0.233 1.000 Y NA
 293731 293732 LA_4278 LA_4279 hycG   FALSE 0.041 181.000 0.000 NA   NA
 293732 293733 LA_4279 LA_4280     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 293735 293738 LA_4282 LA_4285     FALSE 0.004 1174.000 0.000 NA   NA
 293739 293740 LA_4286 LA_4287     FALSE 0.017 313.000 0.000 1.000   NA
 293740 293741 LA_4287 LA_4288   ccmA TRUE 0.975 1.000 0.000 0.009   NA
 293741 293742 LA_4288 LA_4289 ccmA   TRUE 0.994 -3.000 0.344 0.068   NA
 293742 293743 LA_4289 LA_4290   pyrD TRUE 0.982 27.000 0.003 0.049 N NA
 293743 293744 LA_4290 LA_4291 pyrD   FALSE 0.497 104.000 0.003 NA   NA
 293744 293745 LA_4291 LA_4292     TRUE 0.979 23.000 0.667 NA   NA
 293747 293748 LA_4294 LA_4295 sixA hpt TRUE 0.986 0.000 0.006 NA N NA
 293748 293749 LA_4295 LA_4296 hpt kefB FALSE 0.032 292.000 0.000 1.000 N NA
 293749 293750 LA_4296 LA_4297 kefB   TRUE 0.983 6.000 0.021 NA   NA
 293751 293752 LA_4298 LA_4299 marR btuE TRUE 0.982 24.000 0.014 1.000 N NA
 293753 293754 LA_4300 LA_4301   kefB TRUE 0.986 11.000 0.133 NA   NA
 293754 293757 LA_4301 LA_4304 kefB   FALSE 0.003 995.000 0.000 NA   NA
 293758 293759 LA_4305 LA_4306   csrA FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 293759 293760 LA_4306 LA_4307 csrA   TRUE 0.989 0.000 0.135 NA   NA
 293760 293761 LA_4307 LA_4308   flgL TRUE 0.962 42.000 0.385 NA   NA
 293761 293762 LA_4308 LA_4309 flgL flgK TRUE 0.993 41.000 0.186 0.001 Y NA
 293762 293763 LA_4309 LA_4310 flgK   TRUE 0.987 33.000 0.069 0.002   NA
 293765 293767 LA_4312 LA_4315     FALSE 0.004 789.000 0.000 NA   NA
 293771 293772 LA_4318 LA_4319     TRUE 0.983 9.000 1.000 NA   NA
 293772 293773 LA_4319 LA_4320     TRUE 0.968 19.000 0.005 NA   NA
 293774 293775 LA_4321 LA_4322     TRUE 0.973 -34.000 0.014 NA   NA
 10350717 293777 LA_t35 LA_4324 tRNA-Gly-TCC   FALSE 0.004 2049.000 0.000 NA   NA
 293778 293779 LA_4325 LA_4326   lpxD FALSE 0.512 61.000 0.000 NA   NA
 293780 293782 LA_4327 LA_4329     FALSE 0.007 619.000 0.000 1.000   NA
 293782 293783 LA_4329 LA_4330   cumB FALSE 0.009 517.000 0.000 1.000   NA
 293783 10350718 LA_4330 LA_t36 cumB tRNA-Ser-GGA TRUE 0.746 36.000 0.000 NA   NA
 10350718 293784 LA_t36 LA_4331 tRNA-Ser-GGA dnaX TRUE 0.871 11.000 0.000 NA   NA
 293784 293785 LA_4331 LA_4332 dnaX   TRUE 0.988 5.000 0.411 NA   NA
 293785 293786 LA_4332 LA_4333   recR TRUE 0.984 -19.000 0.604 NA   NA
 293788 293789 LA_4335 LA_4336     TRUE 0.988 4.000 0.500 NA   NA
 293789 293790 LA_4336 LA_4337     FALSE 0.616 64.000 0.000 1.000   NA
 293790 293792 LA_4337 LA_4339   serS FALSE 0.006 1103.000 0.000 1.000   NA
 293792 293793 LA_4339 LA_4340 serS tatD TRUE 0.981 -7.000 0.004 NA N NA
 293794 293795 LA_4341 LA_4342     TRUE 0.996 0.000 0.312 NA Y NA
 293795 293796 LA_4342 LA_4343     TRUE 0.988 -3.000 0.076 NA   NA
 293798 293799 LA_4345 LA_4346   parB FALSE 0.495 62.000 0.000 NA   NA
 293799 293800 LA_4346 LA_4347 parB parA TRUE 0.992 3.000 0.827 1.000 N NA
 293800 293801 LA_4347 LA_4348 parA gidB TRUE 0.990 -22.000 0.339 1.000 N NA
 293801 293802 LA_4348 LA_4349 gidB   FALSE 0.010 1035.000 0.000 1.000 N NA
 293802 10350719 LA_4349 LA_4351   tra5 FALSE 0.004 777.000 0.000 NA   NA
 10350719 293806 LA_4351 LA_4353 tra5   TRUE 0.879 6.000 0.000 NA   NA
 293813 293814 LA_4360 LA_4361 ilvE dnaX2 TRUE 0.986 7.000 0.005 1.000 N NA
 293814 289455 LA_4361 LA_0001 dnaX2 dnaA FALSE 0.037 464.000 0.000 1.000 Y NA
 293815 293816 LB001 LB002   metF TRUE 0.989 11.000 0.200 1.000   NA
 293822 293824 LB008 LB010   hemA FALSE 0.019 298.000 0.000 1.000   NA
 293824 293825 LB010 LB011 hemA hemC TRUE 0.989 -15.000 0.004 0.001   NA
 293825 293826 LB011 LB012 hemC hemB TRUE 0.996 -31.000 0.020 0.001 Y NA
 293826 293827 LB012 LB013 hemB hemL TRUE 0.997 -3.000 0.007 0.001 Y NA
 293827 293828 LB013 LB014 hemL   TRUE 0.994 0.000 0.429 1.000 N NA
 293828 293829 LB014 LB015     TRUE 0.996 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 293829 293830 LB015 LB016   hemE TRUE 0.985 -10.000 0.005 1.000 N NA
 293830 293831 LB016 LB017 hemE hemF TRUE 0.995 -93.000 0.012 0.002 Y NA
 293831 293832 LB017 LB018 hemF   TRUE 0.803 80.000 0.029 NA   NA
 293832 293834 LB018 LB020   hemG FALSE 0.222 212.000 0.167 NA   NA
 293834 293836 LB020 LB022 hemG   FALSE 0.012 635.000 0.000 1.000 N NA
 293837 293838 LB023 LB024     TRUE 0.973 41.000 0.004 0.001   NA
 293838 293839 LB024 LB025     FALSE 0.015 260.000 0.000 NA   NA
 293840 293841 LB026 LB027 parA3 parB3 TRUE 0.991 -7.000 0.750 1.000 N NA
 293841 293842 LB027 LB028 parB3   TRUE 0.697 100.000 0.074 NA   NA
 293846 293848 LB031 LB034     FALSE 0.012 396.000 0.000 1.000   NA
 293848 293849 LB034 LB035   amsI TRUE 0.973 -24.000 0.003 1.000   NA
 293849 293850 LB035 LB036 amsI ndh TRUE 0.973 30.000 0.005 1.000 N NA
 293850 293851 LB036 LB037 ndh   TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 293853 293854 LB039 LB040     FALSE 0.667 46.000 0.000 NA   NA
 293855 293856 LB041 LB042     TRUE 0.986 10.000 0.154 NA   NA
 293856 293857 LB042 LB043     TRUE 0.911 62.000 0.154 NA   NA
 293857 293858 LB043 LB044     FALSE 0.009 326.000 0.000 NA   NA
 293861 293862 LB047 LB048     FALSE 0.005 494.000 0.000 NA   NA
 293862 293864 LB048 LB050     FALSE 0.004 1109.000 0.000 NA   NA
 293864 293865 LB050 LB051     FALSE 0.066 151.000 0.000 NA   NA
 293865 293866 LB051 LB052     TRUE 0.985 7.000 0.764 NA   NA
 293866 293867 LB052 LB053     TRUE 0.984 -3.000 0.014 NA   NA
 293867 293868 LB053 LB054   vwa1 TRUE 0.986 -3.000 0.023 NA   NA
 293868 293869 LB054 LB055 vwa1 vwa2 TRUE 0.810 84.000 0.404 NA   NA
 293869 293870 LB055 LB056 vwa2   TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 293870 293871 LB056 LB057   batD TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 293871 293872 LB057 LB058 batD htpG2 TRUE 0.979 -3.000 0.004 NA   NA
 293872 293873 LB058 LB059 htpG2   TRUE 0.961 18.000 0.003 NA   NA
 293876 293877 LB062 LB063     TRUE 0.991 -3.000 0.049 NA N NA
 293879 293880 LB065 LB066     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 293880 293882 LB066 LB068     FALSE 0.007 378.000 0.000 NA   NA
 293882 293883 LB068 LB069     FALSE 0.004 716.000 0.000 NA   NA
 293883 293884 LB069 LB070     FALSE 0.004 1279.000 0.000 NA   NA
 293884 293885 LB070 LB071     FALSE 0.004 580.000 0.000 NA   NA
 293885 293886 LB071 LB072     FALSE 0.004 677.000 0.000 NA   NA
 293887 293888 LB073 LB074   mcm2 TRUE 0.986 26.000 0.094 1.000 N NA
 293890 293891 LB075 LB077     FALSE 0.004 1140.000 0.000 NA   NA
 293893 293894 LB079 LB080 hisE   FALSE 0.496 109.000 0.005 NA   NA
 293894 293896 LB080 LB082     FALSE 0.006 469.000 0.000 NA   NA
 293896 293897 LB082 LB083   acpP FALSE 0.067 493.000 0.000 0.002 Y NA
 293897 293898 LB083 LB084 acpP   TRUE 0.956 54.000 0.068 1.000 N NA
 293898 293899 LB084 LB085     FALSE 0.021 375.000 0.000 1.000 N NA
 293899 293900 LB085 LB086   aroB TRUE 0.987 -3.000 0.003 1.000 N NA
 293900 293901 LB086 LB087 aroB   TRUE 0.992 0.000 0.041 1.000 N NA
 293901 293902 LB087 LB088     FALSE 0.009 327.000 0.000 NA   NA
 293902 293903 LB088 LB089     FALSE 0.005 517.000 0.000 NA   NA
 293903 293904 LB089 LB090     FALSE 0.621 50.000 0.000 NA   NA
 293905 293906 LB091 LB092     FALSE 0.573 54.000 0.000 NA   NA
 293906 293907 LB092 LB093   fadD FALSE 0.550 57.000 0.000 NA   NA
 293910 293911 LB096 LB098     TRUE 0.884 40.000 0.000 1.000 N NA
 293911 293913 LB098 LB099     FALSE 0.010 310.000 0.000 NA   NA
 293917 293918 LB103 LB104     FALSE 0.014 265.000 0.000 NA   NA
 293919 293920 LB105 LB106     TRUE 0.961 2.000 0.000 1.000 N NA
 293920 293921 LB106 LB107     TRUE 0.821 73.000 0.004 1.000   NA
 293921 293922 LB107 LB108   metH TRUE 0.935 47.000 0.006 1.000   NA
 293922 293923 LB108 LB109 metH   FALSE 0.512 109.000 0.006 NA   NA
 293926 293927 LB112 LB114   argB FALSE 0.297 178.000 0.004 1.000 N NA
 293930 293931 LB116 LB117     TRUE 0.977 -7.000 0.002 1.000   NA
 293932 293933 LB118 LB119 cyaA18   FALSE 0.004 1164.000 0.000 NA   NA
 293933 293934 LB119 LB120     TRUE 0.948 47.000 0.074 NA   NA
 293934 293935 LB120 LB121     TRUE 0.982 17.000 0.074 NA   NA
 293936 293937 LB122 LB123   aroK FALSE 0.571 116.000 0.003 1.000 N NA
 293937 293938 LB123 LB124 aroK   TRUE 0.987 -3.000 0.003 1.000 N NA
 293938 293939 LB124 LB125   cheD2 TRUE 0.996 6.000 0.600 1.000 Y NA
 293940 293941 LB126 LB127 traB   FALSE 0.009 324.000 0.000 NA   NA
 293944 293945 LB130 LB131     FALSE 0.139 285.000 0.000 0.004 Y NA
 293947 293948 LB133 LB134     FALSE 0.003 916.000 0.000 NA   NA
 293950 293951 LB136 LB137     TRUE 0.871 11.000 0.000 NA   NA
 293951 293952 LB137 LB138     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 293952 293953 LB138 LB139     TRUE 0.935 3.000 0.000 1.000   NA
 293953 293955 LB139 LB141     FALSE 0.004 1620.000 0.000 NA   NA
 293955 293956 LB141 LB142     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 293956 293957 LB142 LB143     FALSE 0.472 64.000 0.000 NA   NA
 293957 293958 LB143 LB144     TRUE 0.980 21.000 0.667 NA   NA
 293960 293961 LB146 LB147     FALSE 0.119 120.000 0.000 NA   NA
 293962 293963 LB148 LB149   pmgA FALSE 0.005 554.000 0.000 NA   NA
 293963 293964 LB149 LB150 pmgA cobD TRUE 0.985 17.000 0.009 1.000 N NA
 293964 293965 LB150 LB151 cobD cbiP TRUE 0.998 4.000 0.092 0.006 Y NA
 293965 293966 LB151 LB152 cbiP cobP TRUE 0.996 0.000 0.031 1.000 Y NA
 293966 293967 LB152 LB153 cobP   TRUE 0.971 -24.000 0.006 NA   NA
 293967 293968 LB153 LB154   cbiA TRUE 0.983 -3.000 0.012 NA   NA
 293968 293969 LB154 LB155 cbiA cobA TRUE 0.998 0.000 0.054 0.006 Y NA
 293969 293970 LB155 LB156 cobA cbiF TRUE 0.997 -3.000 0.007 0.006 Y NA
 293970 293971 LB156 LB157 cbiF cbiH TRUE 0.997 14.000 0.040 0.006 Y NA
 293971 293972 LB157 LB158 cbiH cbiG TRUE 0.998 -3.000 0.352 0.006 Y NA
 293972 293973 LB158 LB159 cbiG cobI TRUE 0.997 -13.000 0.056 0.006 Y NA
 293973 293974 LB159 LB160 cobI cbiE TRUE 0.998 3.000 0.128 0.006 Y NA
 293974 293975 LB160 LB161 cbiE cbiC TRUE 0.998 -3.000 0.054 0.006 Y NA
 293975 293976 LB161 LB162 cbiC cbiD TRUE 0.997 6.000 0.102 0.006 Y NA
 293976 293977 LB162 LB163 cbiD   TRUE 0.993 4.000 0.005 1.000 Y NA
 293977 293978 LB163 LB164     TRUE 0.987 6.000 0.200 NA   NA
 293978 293979 LB164 LB165   cbiX TRUE 0.953 45.000 0.700 NA   NA
 293984 293985 LB170 LB171     TRUE 0.981 -7.000 0.014 NA   NA
 293985 293986 LB171 LB172     TRUE 0.970 24.000 0.014 NA   NA
 293986 293988 LB172 LB174   htpX FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 293988 293990 LB174 LB176 htpX   FALSE 0.038 522.000 0.002 1.000 N NA
 293990 293991 LB176 LB177     TRUE 0.958 38.000 0.002 1.000 N NA
 293991 293992 LB177 LB178     TRUE 0.996 15.000 0.034 0.015 Y NA
 293995 293996 LB181 LB182     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 293996 293997 LB182 LB183     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 294000 294001 LB186 LB187     TRUE 0.985 -25.000 0.088 1.000   NA
 294003 294005 LB190 LB191     FALSE 0.003 891.000 0.000 NA   NA
 294005 294006 LB191 LB192     TRUE 0.982 -21.000 0.057 NA   NA
 294006 294008 LB192 LB194     TRUE 0.808 25.000 0.000 NA   NA
 294011 294012 LB197 LB198     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 294012 294013 LB198 LB199     FALSE 0.208 159.000 0.002 NA   NA
 294013 294015 LB199 LB201   lonA FALSE 0.015 258.000 0.000 NA   NA
 294015 294016 LB201 LB202 lonA   TRUE 0.971 26.000 0.002 1.000 N NA
 294017 294018 LB203 LB204   mtfA TRUE 0.982 20.000 0.500 NA   NA
 294018 294019 LB204 LB205 mtfA   TRUE 0.985 5.000 1.000 NA   NA
 294019 294021 LB205 LB207     FALSE 0.006 433.000 0.000 NA   NA
 294021 294022 LB207 LB208     TRUE 0.878 72.000 0.333 NA   NA
 294022 294023 LB208 LB209     TRUE 0.859 15.000 0.000 NA   NA
 294023 294024 LB209 LB210     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 294024 294025 LB210 LB211     TRUE 0.987 7.000 0.500 NA   NA
 294025 294026 LB211 LB212     TRUE 0.983 -3.000 0.011 NA   NA
 294027 294028 LB213 LB214 exbD2   TRUE 0.995 -3.000 0.082 0.017   NA
 294029 294031 LB215 LB217 ubiE   FALSE 0.276 140.000 0.002 NA   NA
 294031 294032 LB217 LB218     FALSE 0.679 45.000 0.000 NA   NA
 294033 294036 LB219 LB222     FALSE 0.004 1312.000 0.000 NA   NA
 294036 10350720 LB222 LB_222a     TRUE 0.977 18.000 0.006 1.000   NA
 10350720 294037 LB_222a LB223     FALSE 0.027 255.000 0.000 1.000   NA
 294037 294038 LB223 LB224     TRUE 0.995 0.000 0.273 0.044   NA
 294039 294040 LB225 LB226     FALSE 0.158 107.000 0.000 NA   NA
 294040 294042 LB226 LB228     FALSE 0.004 1118.000 0.000 NA   NA
 294042 294044 LB228 LB230     FALSE 0.013 949.000 0.000 0.044   NA
 294044 294045 LB230 LB231     TRUE 0.980 42.000 0.273 0.044   NA
 294046 294049 LB232 LB235     FALSE 0.004 1470.000 0.000 NA   NA
 294049 294051 LB235 LB237     FALSE 0.070 466.000 0.000 0.005 Y NA
 294051 294052 LB237 LB238     FALSE 0.227 112.000 0.000 1.000   NA
 294052 294054 LB238 LB240     FALSE 0.026 378.000 0.000 0.048   NA
 294056 294057 LB242 LB243     TRUE 0.959 43.000 0.133 NA   NA
 294057 294058 LB243 LB244     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 294058 294059 LB244 LB245     FALSE 0.006 869.000 0.000 1.000   NA
 10350721 294062 LB_245a LB248     FALSE 0.014 264.000 0.000 NA   NA
 294064 294065 LB250 LB251     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 294065 294066 LB251 LB252     FALSE 0.167 128.000 0.000 1.000   NA
 294066 294068 LB252 LB254     FALSE 0.008 591.000 0.000 1.000   NA
 294069 294071 LB255 LB257     FALSE 0.009 329.000 0.000 NA   NA
 294071 294072 LB257 LB258     TRUE 0.986 13.000 0.333 NA   NA
 294075 294076 LB261 LB262   galF TRUE 0.734 106.000 0.400 NA N NA
 294076 294077 LB262 LB263 galF   TRUE 0.965 33.000 1.000 NA   NA
 294078 294079 LB264 LB265     FALSE 0.003 930.000 0.000 NA   NA
 294080 294081 LB266 LB267     FALSE 0.006 892.000 0.000 1.000   NA
 294081 294082 LB267 LB268     TRUE 0.986 11.000 0.023 1.000   NA
 294082 294083 LB268 LB269     TRUE 0.919 63.000 0.750 1.000   NA
 294085 294086 LB271 LB272     TRUE 0.957 -21.000 0.000 0.026   NA
 294086 294087 LB272 LB273   mcm2 TRUE 0.838 92.000 0.222 1.000 N NA
 294087 294088 LB273 LB274 mcm2 mcm3 TRUE 0.998 -3.000 0.024 0.001 Y NA
 294088 294089 LB274 LB275 mcm3 argK TRUE 0.989 13.000 0.366 NA N NA
 294089 294090 LB275 LB276 argK   FALSE 0.004 1091.000 0.000 NA   NA
 294090 294091 LB276 LB277     FALSE 0.358 157.000 1.000 NA   NA
 294091 294092 LB277 LB278     TRUE 0.986 2.000 1.000 NA   NA
 294092 294093 LB278 LB279     TRUE 0.968 30.000 1.000 NA   NA
 294093 294094 LB279 LB280     TRUE 0.989 0.000 0.667 NA   NA
 294094 294095 LB280 LB281   exbB TRUE 0.834 79.000 0.667 NA   NA
 294095 294096 LB281 LB282 exbB exbD3 TRUE 0.935 90.000 0.750 0.017 Y NA
 294096 294097 LB282 LB283 exbD3   TRUE 0.994 10.000 0.750 0.048 N NA
 294097 294099 LB283 LB285     FALSE 0.004 1183.000 0.000 NA   NA
 294099 294100 LB285 LB286   gltB2 FALSE 0.484 63.000 0.000 NA   NA
 294100 294101 LB286 LB287 gltB2   FALSE 0.008 336.000 0.000 NA   NA
 294101 294102 LB287 LB288     TRUE 0.879 6.000 0.000 NA   NA
 294102 294103 LB288 LB289     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 294103 294104 LB289 LB290     FALSE 0.020 228.000 0.000 NA   NA
 294105 294106 LB291 LB292     TRUE 0.985 13.000 0.024 1.000   NA
 294106 294107 LB292 LB293     TRUE 0.986 2.000 0.009 1.000   NA
 294107 294108 LB293 LB294     TRUE 0.963 23.000 0.002 1.000   NA
 294109 294111 LB295 LB297   pstS FALSE 0.008 1814.000 0.000 NA N NA
 294111 294112 LB297 LB298 pstS   FALSE 0.532 75.000 0.000 NA N NA
 294112 294113 LB298 LB299     FALSE 0.601 110.000 1.000 NA   NA
 294113 294114 LB299 LB300     TRUE 0.917 55.000 1.000 NA   NA
 294114 294115 LB300 LB301     TRUE 0.985 11.000 0.667 NA   NA
 294117 294118 LB303 LB304     TRUE 0.980 42.000 0.273 0.044   NA
 294118 294119 LB304 LB305     FALSE 0.005 488.000 0.000 NA   NA
 294119 294121 LB305 LB307     FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 294124 294125 LB310 LB311 pyrF speE2 TRUE 0.985 12.000 0.004 1.000 N NA
 294125 294126 LB311 LB312 speE2   TRUE 0.871 10.000 0.000 NA   NA
 294126 10350722 LB312 LB_312a   speD FALSE 0.192 100.000 0.000 NA   NA
 10350722 294130 LB_312a LB316 speD   FALSE 0.005 476.000 0.000 NA   NA
 294131 294132 LB317 LB318     TRUE 0.955 51.000 0.400 1.000   NA
 294132 294133 LB318 LB319     TRUE 0.977 21.000 1.000 NA   NA
 294133 294134 LB319 LB320     TRUE 0.896 -3.000 0.000 NA   NA
 294135 294136 LB321 LB322     TRUE 0.905 61.000 0.048 NA   NA
 294137 294139 LB323 LB325     FALSE 0.007 379.000 0.000 NA   NA
 294141 294142 LB327 LB328 acn ompA FALSE 0.039 269.000 0.000 1.000 N NA
 294142 294143 LB328 LB329 ompA lysS2 FALSE 0.344 176.000 0.009 1.000 N NA
 294148 294149 LB334 LB335   phhB TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 294151 294153 LB337 LB339     FALSE 0.096 130.000 0.000 NA   NA
 10350723 294155 LB_340a LB341     TRUE 0.984 17.000 0.500 NA   NA
 294155 294156 LB341 LB342     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 294156 294157 LB342 LB343     FALSE 0.168 105.000 0.000 NA   NA
 294160 294162 LB346 LB348     FALSE 0.004 800.000 0.000 NA   NA
 294164 294165 LB350 LB351     FALSE 0.032 202.000 0.000 NA   NA
 294165 294167 LB351 LB353   pyk2 FALSE 0.016 254.000 0.000 NA   NA
 294167 294168 LB353 LB354 pyk2   TRUE 0.961 39.000 0.059 NA   NA
 294168 294169 LB354 LB355   asd TRUE 0.979 13.000 0.014 NA   NA
 294169 294170 LB355 LB356 asd   TRUE 0.915 52.000 0.014 NA   NA
 294173 294175 LB359 LB361     FALSE 0.004 1708.000 0.000 NA   NA
 294175 294176 LB361 LB362     TRUE 0.945 49.000 0.667 NA   NA
 294176 294177 LB362 LB363     TRUE 0.812 83.000 0.667 NA   NA
 294177 294178 LB363 LB364     TRUE 0.988 2.000 0.071 NA   NA
 294179 294180 LB365 LB366 parA4 parB4 TRUE 0.985 -16.000 1.000 1.000   NA
 294180 294181 LB366 LB367 parB4   FALSE 0.006 434.000 0.000 NA   NA
 294181 293815 LB367 LB001     TRUE 0.976 27.000 0.600 NA   NA