MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus anthracis str. Ames

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 262847 262848 BA0001 BA0002 dnaA dnaN-1 TRUE 0.710 179.000 0.097 1.000 Y NA
 262848 262849 BA0002 BA0003 dnaN-1   TRUE 0.614 128.000 0.260 1.000   NA
 262849 262850 BA0003 BA0004   recF TRUE 0.863 13.000 0.247 1.000   NA
 262850 262851 BA0004 BA0005 recF gyrB TRUE 0.963 39.000 0.257 0.004 Y NA
 262851 262852 BA0005 BA0006 gyrB gyrA TRUE 0.980 89.000 0.299 0.001 Y NA
 262852 5918241 BA0006 Ba16SA gyrA   FALSE 0.031 269.000 0.000 NA   NA
 5918241 5918242 Ba16SA tRNA-Ile-1     FALSE 0.084 151.000 0.000 NA   NA
 5918242 5918243 tRNA-Ile-1 tRNA-Ala-1     FALSE 0.438 9.000 0.000 NA   NA
 5918243 5918244 tRNA-Ala-1 Ba23SA     FALSE 0.183 95.000 0.000 NA   NA
 5918244 5918245 Ba23SA Ba5SA     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 5918245 262853 Ba5SA BA0008   guaB FALSE 0.006 1150.000 0.000 NA   NA
 262853 262854 BA0008 BA0009 guaB dacA TRUE 0.540 114.000 0.000 1.000 N NA
 262854 262855 BA0009 BA0010 dacA   FALSE 0.342 162.000 0.000 1.000 N NA
 262855 262856 BA0010 BA0011     TRUE 0.950 19.000 0.640 NA Y NA
 262856 262857 BA0011 BA0012   serS FALSE 0.112 328.000 0.008 NA N NA
 262857 5918246 BA0012 tRNA-Ser-1 serS   FALSE 0.079 157.000 0.000 NA   NA
 5918246 262858 tRNA-Ser-1 BA0013     FALSE 0.448 8.000 0.000 NA   NA
 262859 262860 BA0014 BA0015     TRUE 0.996 3.000 0.333 0.001 Y NA
 262860 262861 BA0015 BA0016     TRUE 0.593 126.000 0.030 1.000 N NA
 262862 262863 BA0017 BA0018     TRUE 0.537 -10.000 0.000 NA   NA
 262863 262864 BA0018 BA0019   dnaX FALSE 0.086 477.000 0.007 1.000 N NA
 262864 262865 BA0019 BA0020 dnaX   TRUE 0.530 23.000 0.064 NA   NA
 262865 262866 BA0020 BA0021   recR TRUE 0.861 15.000 0.615 NA   NA
 262866 262867 BA0021 BA0022 recR   TRUE 0.629 15.000 0.057 NA   NA
 262867 262868 BA0022 BA0024   bofA FALSE 0.321 215.000 0.333 NA   NA
 262868 5918247 BA0024 Ba16SB bofA   FALSE 0.037 246.000 0.000 NA   NA
 5918247 5918248 Ba16SB tRNA-Ile-2     FALSE 0.084 151.000 0.000 NA   NA
 5918248 5918249 tRNA-Ile-2 tRNA-Ala-2     FALSE 0.438 9.000 0.000 NA   NA
 5918249 5918250 tRNA-Ala-2 Ba23SB     FALSE 0.183 95.000 0.000 NA   NA
 5918250 5918251 Ba23SB Ba5SB     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 5918251 262869 Ba5SB BA0025     FALSE 0.057 191.000 0.000 NA   NA
 262869 262870 BA0025 BA0026   cad-1 TRUE 0.595 72.000 0.232 NA   NA
 262870 262871 BA0026 BA0027 cad-1 tmk TRUE 0.928 2.000 0.067 1.000 N NA
 262871 262872 BA0027 BA0028 tmk holB TRUE 0.840 36.000 0.353 1.000 N NA
 262872 262873 BA0028 BA0029 holB   TRUE 0.912 -3.000 0.276 NA   NA
 262873 262874 BA0029 BA0030     TRUE 0.770 15.000 0.204 NA   NA
 262874 262875 BA0030 BA0031     FALSE 0.460 121.000 0.116 NA   NA
 262875 262876 BA0031 BA0032     TRUE 0.880 -13.000 0.167 NA   NA
 262876 262877 BA0032 BA0033     TRUE 0.839 -31.000 0.039 1.000   NA
 262879 262880 BA0036 BA0037 metS   TRUE 0.507 166.000 0.208 NA N NA
 262880 262881 BA0037 BA0038     TRUE 0.556 215.000 0.060 NA Y NA
 262881 262882 BA0038 BA0039   ksgA TRUE 0.944 -3.000 0.104 1.000 N NA
 262882 262883 BA0039 BA0040 ksgA   FALSE 0.340 111.000 0.023 NA   NA
 262883 262884 BA0040 BA0041     FALSE 0.203 239.000 0.156 NA   NA
 262884 262885 BA0041 BA0042   sspF TRUE 0.575 92.000 0.146 NA   NA
 262885 262886 BA0042 BA0043 sspF ispE FALSE 0.130 197.000 0.019 NA   NA
 262886 262887 BA0043 BA0044 ispE purR TRUE 0.671 55.000 0.051 1.000 N NA
 262887 262888 BA0044 BA0045 purR   TRUE 0.529 -13.000 0.000 NA   NA
 262888 262889 BA0045 BA0046     FALSE 0.275 17.000 0.000 NA   NA
 262889 262890 BA0046 BA0047   spoVG TRUE 0.558 153.000 0.232 NA N NA
 262890 262891 BA0047 BA0048 spoVG gcaD FALSE 0.373 323.000 0.018 1.000 Y NA
 262891 262892 BA0048 BA0049 gcaD prs TRUE 0.800 19.000 0.069 1.000 N NA
 262892 262893 BA0049 BA0050 prs spoVC TRUE 0.624 73.000 0.006 1.000 N NA
 262893 262894 BA0050 BA0051 spoVC   FALSE 0.320 71.000 0.015 NA   NA
 262894 262895 BA0051 BA0052   mfd FALSE 0.351 106.000 0.020 NA   NA
 262895 262896 BA0052 BA0053 mfd spoVT TRUE 0.732 136.000 0.038 NA Y NA
 262896 262897 BA0053 BA0054 spoVT   FALSE 0.222 231.000 0.173 NA   NA
 262897 262898 BA0054 BA0055     TRUE 0.774 13.000 0.061 1.000   NA
 262898 262899 BA0055 BA0056     TRUE 0.728 15.000 0.055 1.000   NA
 262899 262900 BA0056 BA0057     FALSE 0.506 59.000 0.126 NA   NA
 262900 262901 BA0057 BA0058     TRUE 0.947 -3.000 0.709 NA   NA
 262901 262902 BA0058 BA0059   divIC-1 TRUE 0.847 -3.000 0.086 NA   NA
 262902 262903 BA0059 BA0060 divIC-1   TRUE 0.755 88.000 0.123 1.000 N NA
 262903 5918252 BA0060 tRNA-Met-1     FALSE 0.075 161.000 0.000 NA   NA
 5918252 5918253 tRNA-Met-1 tRNA-Glu-1     FALSE 0.334 14.000 0.000 NA   NA
 5918253 262904 tRNA-Glu-1 BA0061   spoIIE FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 262904 262905 BA0061 BA0062 spoIIE   FALSE 0.314 234.000 0.049 1.000 N NA
 262905 262906 BA0062 BA0063   hpt-1 TRUE 0.954 -3.000 0.082 0.044 N NA
 262906 262907 BA0063 BA0064 hpt-1 ftsH TRUE 0.795 86.000 0.237 1.000 N NA
 262907 262908 BA0064 BA0065 ftsH   FALSE 0.302 225.000 0.023 1.000 N NA
 262908 262909 BA0065 BA0066   hslO TRUE 0.903 7.000 0.050 1.000 N NA
 262909 262910 BA0066 BA0067 hslO cysK-1 TRUE 0.681 105.000 0.035 1.000 N NA
 262910 262911 BA0067 BA0068 cysK-1 pabB TRUE 0.672 221.000 0.174 1.000 Y NA
 262911 262912 BA0068 BA0069 pabB pabA-1 TRUE 0.984 6.000 0.090 0.013 Y NA
 262912 262913 BA0069 BA0070 pabA-1 pabC TRUE 0.977 -6.000 0.090 1.000 Y NA
 262913 262914 BA0070 BA0071 pabC folP TRUE 0.982 -7.000 0.186 1.000 Y NA
 262914 262915 BA0071 BA0072 folP folB TRUE 0.983 1.000 0.273 1.000 Y NA
 262915 262916 BA0072 BA0073 folB folK TRUE 0.983 -3.000 0.240 1.000 Y NA
 262916 262917 BA0073 BA0074 folK   TRUE 0.900 -48.000 0.022 1.000 N NA
 262917 262918 BA0074 BA0075     TRUE 0.646 48.000 0.016 1.000 N NA
 262918 262919 BA0075 BA0076   lysS TRUE 0.729 160.000 0.062 1.000 Y NA
 262919 5918254 BA0076 Ba16SC lysS   FALSE 0.013 401.000 0.000 NA   NA
 5918254 632446 Ba16SC Ba23SC     FALSE 0.062 179.000 0.000 NA   NA
 632446 5918255 Ba23SC Ba5SC     FALSE 0.162 50.000 0.000 NA   NA
 5918255 262920 Ba5SC BA0077   ctsR FALSE 0.051 207.000 0.000 NA   NA
 262920 262921 BA0077 BA0078 ctsR   TRUE 0.508 174.000 0.714 NA   NA
 262921 262922 BA0078 BA0079     TRUE 0.951 5.000 0.837 1.000   NA
 262922 262923 BA0079 BA0080     TRUE 0.865 23.000 0.344 1.000 N NA
 262923 262924 BA0080 BA0081   radA TRUE 0.940 97.000 0.083 0.010 Y NA
 262924 262925 BA0081 BA0082 radA   TRUE 0.895 4.000 0.139 1.000   NA
 262925 262926 BA0082 BA0083     FALSE 0.272 161.000 0.088 NA   NA
 262926 262927 BA0083 BA0084   ispD TRUE 0.669 17.000 0.116 NA   NA
 262927 262928 BA0084 BA0085 ispD ispF TRUE 0.879 115.000 0.143 1.000 Y NA
 262928 262929 BA0085 BA0086 ispF gltX TRUE 0.686 90.000 0.032 1.000 N NA
 262929 262930 BA0086 BA0088 gltX cysE FALSE 0.094 433.000 0.008 1.000 N NA
 262930 262931 BA0088 BA0089 cysE cysS TRUE 0.946 -19.000 0.071 0.044 N NA
 262931 262932 BA0089 BA0090 cysS   TRUE 0.903 3.000 0.151 1.000   NA
 262932 262933 BA0090 BA0091     TRUE 0.976 -3.000 0.177 0.003   NA
 262933 262934 BA0091 BA0092     TRUE 0.840 4.000 0.113 NA   NA
 262934 262935 BA0092 BA0093   sigH TRUE 0.629 68.000 0.315 NA   NA
 262935 262936 BA0093 BA0094 sigH rpmG-1 FALSE 0.499 132.000 0.112 1.000   NA
 262936 262937 BA0094 BA0095 rpmG-1   TRUE 0.702 33.000 0.176 1.000   NA
 262937 262938 BA0095 BA0096   nusG TRUE 0.805 132.000 0.829 1.000 N NA
 262938 262939 BA0096 BA0097 nusG rplK TRUE 0.703 168.000 0.762 1.000 N NA
 262939 262940 BA0097 BA0098 rplK rplA TRUE 0.895 178.000 0.831 0.020 Y NA
 262940 262941 BA0098 BA0099 rplA rplJ TRUE 0.797 233.000 0.377 0.020 Y NA
 262941 262942 BA0099 BA0100 rplJ rplL TRUE 0.963 68.000 0.888 0.016 Y NA
 262942 262943 BA0100 BA0101 rplL   TRUE 0.857 75.000 0.053 1.000 Y NA
 262943 262944 BA0101 BA0102   rpoB FALSE 0.193 293.000 0.012 1.000 N NA
 262944 262945 BA0102 BA0103 rpoB rpoC TRUE 0.984 65.000 0.875 0.001 Y NA
 262945 262946 BA0103 BA0104 rpoC   TRUE 0.567 114.000 0.037 NA N NA
 262946 262947 BA0104 BA0105   rpsL TRUE 0.808 115.000 0.043 NA Y NA
 262947 262948 BA0105 BA0106 rpsL rpsG TRUE 0.982 30.000 0.935 0.003 Y NA
 262948 262949 BA0106 BA0107 rpsG fusA TRUE 0.727 208.000 0.272 1.000 Y NA
 262949 262950 BA0107 BA0108 fusA tuf TRUE 0.972 118.000 0.221 0.001 Y NA
 262950 262951 BA0108 BA0109 tuf rpsJ FALSE 0.429 399.000 0.340 1.000 Y NA
 262951 262952 BA0109 BA0110 rpsJ rplC TRUE 0.966 35.000 0.749 0.020 Y NA
 262952 262953 BA0110 BA0111 rplC rplD TRUE 0.975 26.000 0.958 0.016 Y NA
 262953 262954 BA0111 BA0112 rplD rplW TRUE 0.994 0.000 0.904 0.016 Y NA
 262954 262955 BA0112 BA0113 rplW rplB TRUE 0.974 29.000 0.915 0.016 Y NA
 262955 262956 BA0113 BA0114 rplB rpsS TRUE 0.959 61.000 0.894 0.020 Y NA
 262956 262957 BA0114 BA0115 rpsS rplV TRUE 0.979 18.000 0.968 0.020 Y NA
 262957 262958 BA0115 BA0116 rplV rpsC TRUE 0.992 4.000 0.905 0.020 Y NA
 262958 262959 BA0116 BA0117 rpsC rplP TRUE 0.993 2.000 0.894 0.020 Y NA
 262959 262960 BA0117 BA0118 rplP rpmC TRUE 0.994 -10.000 0.868 0.016 Y NA
 262960 262961 BA0118 BA0119 rpmC rpsQ TRUE 0.978 21.000 0.911 0.016 Y NA
 262961 262962 BA0119 BA0120 rpsQ rplN TRUE 0.963 44.000 0.850 0.020 Y NA
 262962 262963 BA0120 BA0121 rplN rplX TRUE 0.967 39.000 0.958 0.020 Y NA
 262963 262964 BA0121 BA0122 rplX rplE TRUE 0.974 27.000 0.894 0.016 Y NA
 262964 262965 BA0122 BA0123 rplE rpsN TRUE 0.961 34.000 0.376 0.016 Y NA
 262965 262966 BA0123 BA0124 rpsN rpsH TRUE 0.963 30.000 0.359 0.016 Y NA
 262966 262967 BA0124 BA0125 rpsH rplF TRUE 0.972 33.000 0.956 0.016 Y NA
 262967 262968 BA0125 BA0126 rplF rplR TRUE 0.972 32.000 0.886 0.016 Y NA
 262968 262969 BA0126 BA0127 rplR rpsE TRUE 0.975 22.000 0.973 0.020 Y NA
 262969 262970 BA0127 BA0128 rpsE rpmD TRUE 0.984 14.000 0.782 0.020 Y NA
 262970 262971 BA0128 BA0129 rpmD rplO TRUE 0.982 34.000 0.677 0.002 Y NA
 262971 262972 BA0129 BA0130 rplO secY-1 TRUE 0.975 0.000 0.873 1.000 N NA
 262972 262973 BA0130 BA0131 secY-1 adk TRUE 0.761 57.000 0.198 1.000 N NA
 262973 262974 BA0131 BA0132 adk maP-1 TRUE 0.960 0.000 0.313 1.000 N NA
 262974 262975 BA0132 BA0133 maP-1 infA TRUE 0.858 69.000 0.058 1.000 Y NA
 262975 262976 BA0133 BA0134 infA rpmJ TRUE 0.750 36.000 0.323 1.000   NA
 262976 262977 BA0134 BA0135 rpmJ rpsM TRUE 0.899 22.000 0.436 0.016   NA
 262977 262978 BA0135 BA0136 rpsM rpsK TRUE 0.970 25.000 0.530 0.016 Y NA
 262978 262979 BA0136 BA0137 rpsK rpoA TRUE 0.619 181.000 0.440 1.000 N NA
 262979 262980 BA0137 BA0138 rpoA rplQ TRUE 0.887 36.000 0.883 1.000 N NA
 262980 262981 BA0138 BA0139 rplQ   TRUE 0.581 104.000 0.000 1.000 N NA
 262981 262982 BA0139 BA0140     TRUE 0.977 -24.000 0.014 0.030 Y NA
 262982 262983 BA0140 BA0141     TRUE 0.981 -12.000 0.196 1.000 Y NA
 262983 262984 BA0141 BA0143   rplM FALSE 0.043 911.000 0.000 1.000 N NA
 262984 262985 BA0143 BA0144 rplM rpsI TRUE 0.977 22.000 0.979 0.016 Y NA
 262985 262986 BA0144 BA0145 rpsI   FALSE 0.158 163.000 0.011 NA   NA
 262986 262987 BA0145 BA0146   cwlD TRUE 0.568 67.000 0.190 NA   NA
 262987 262988 BA0146 BA0147 cwlD   TRUE 0.582 145.000 0.228 NA N NA
 262992 262993 BA0151 BA0152     FALSE 0.078 158.000 0.000 NA   NA
 262993 5918256 BA0152 Ba16SD     TRUE 0.549 -4.000 0.000 NA   NA
 5918256 632523 Ba16SD Ba23SD     FALSE 0.062 179.000 0.000 NA   NA
 632523 5918257 Ba23SD Ba5SD     FALSE 0.174 87.000 0.000 NA   NA
 5918257 5918258 Ba5SD tRNA-Asn-1     FALSE 0.430 10.000 0.000 NA   NA
 5918258 5918259 tRNA-Asn-1 tRNA-Thr-1     FALSE 0.483 5.000 0.000 NA   NA
 5918259 5918260 tRNA-Thr-1 tRNA-Glu-2     FALSE 0.216 25.000 0.000 NA   NA
 5918260 5918261 tRNA-Glu-2 tRNA-Val-1     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 5918261 5918262 tRNA-Val-1 tRNA-Tyr-1     FALSE 0.262 18.000 0.000 NA   NA
 5918262 5918263 tRNA-Tyr-1 tRNA-Gln-1     FALSE 0.156 66.000 0.000 NA   NA
 5918263 5918264 tRNA-Gln-1 tRNA-Lys-1     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 5918264 5918265 tRNA-Lys-1 tRNA-Gly-1     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 5918265 5918266 tRNA-Gly-1 tRNA-Ala-3     FALSE 0.418 11.000 0.000 NA   NA
 5918266 262994 tRNA-Ala-3 BA0154   rocF FALSE 0.005 1471.000 0.000 NA   NA
 262994 262995 BA0154 BA0155 rocF   FALSE 0.036 249.000 0.000 NA   NA
 262995 262996 BA0155 BA0156     TRUE 0.939 -7.000 0.554 NA   NA
 262996 262997 BA0156 BA0157   glmM TRUE 0.887 -7.000 0.167 NA   NA
 262997 262998 BA0157 BA0158 glmM   FALSE 0.027 288.000 0.000 NA   NA
 262998 262999 BA0158 BA0159   glmS FALSE 0.362 13.000 0.000 NA   NA
 262999 263000 BA0159 BA0160 glmS   FALSE 0.016 364.000 0.000 NA   NA
 263000 263001 BA0160 BA0161   gntR FALSE 0.013 407.000 0.000 NA   NA
 263001 263002 BA0161 BA0163 gntR gntP-1 FALSE 0.031 1648.000 0.000 1.000 N NA
 263002 263003 BA0163 BA0164 gntP-1 yqjI FALSE 0.417 265.000 0.000 1.000 Y NA
 263003 263004 BA0164 BA0165 yqjI   FALSE 0.106 343.000 0.000 1.000 N NA
 263004 263005 BA0165 BA0166     FALSE 0.141 119.000 0.000 NA   NA
 263006 263007 BA0167 BA0168     FALSE 0.038 241.000 0.000 NA   NA
 263007 263008 BA0168 BA0169     TRUE 0.925 0.000 0.222 1.000   NA
 263008 263009 BA0169 BA0170     FALSE 0.096 141.000 0.000 NA   NA
 263009 263010 BA0170 BA0171     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263010 263011 BA0171 BA0173     FALSE 0.006 1254.000 0.000 NA   NA
 263011 263012 BA0173 BA0174     TRUE 0.979 -25.000 0.190 1.000 Y NA
 263012 263013 BA0174 BA0175     TRUE 0.967 13.000 0.500 NA Y NA
 263013 263014 BA0175 BA0176     FALSE 0.109 280.000 0.000 NA N NA
 263015 263016 BA0177 BA0178     FALSE 0.111 133.000 0.000 NA   NA
 263016 263017 BA0178 BA0179     TRUE 0.788 -3.000 0.034 NA   NA
 263017 263018 BA0179 BA0180     FALSE 0.162 79.000 0.000 NA   NA
 263018 263019 BA0180 BA0181     FALSE 0.122 128.000 0.000 NA   NA
 263019 263020 BA0181 BA0183     FALSE 0.035 251.000 0.000 NA   NA
 263022 263023 BA0185 BA0186     TRUE 0.959 17.000 0.222 0.040 Y NA
 263023 263024 BA0186 BA0187     TRUE 0.978 -43.000 0.200 1.000 Y NA
 263024 263025 BA0187 BA0188     TRUE 0.942 -3.000 0.000 0.004   NA
 263025 263026 BA0188 BA0189     TRUE 0.566 14.000 0.000 1.000   NA
 263028 263029 BA0191 BA0192     FALSE 0.250 19.000 0.000 NA   NA
 263029 263030 BA0192 BA0193     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 263031 263032 BA0194 BA0195     FALSE 0.292 388.000 0.000 0.040 Y NA
 263032 263033 BA0195 BA0196     FALSE 0.035 392.000 0.000 1.000   NA
 263033 263034 BA0196 BA0197     FALSE 0.327 68.000 0.000 1.000   NA
 263035 263036 BA0198 BA0199     TRUE 0.546 -7.000 0.000 NA   NA
 263037 263038 BA0200 BA0202   modB FALSE 0.182 287.000 0.000 0.067 N NA
 263039 263040 BA0203 BA0205     FALSE 0.007 951.000 0.000 NA   NA
 263041 263042 BA0206 BA0207     FALSE 0.362 13.000 0.000 NA   NA
 263042 263043 BA0207 BA0208     FALSE 0.094 142.000 0.000 NA   NA
 263044 263045 BA0210 BA0211     TRUE 0.808 22.000 0.667 NA   NA
 263047 263048 BA0213 BA0216     FALSE 0.066 475.000 0.000 1.000 N NA
 263048 263049 BA0216 BA0217     FALSE 0.086 149.000 0.000 NA   NA
 263049 263050 BA0217 BA0218     FALSE 0.141 119.000 0.000 NA   NA
 263050 263051 BA0218 BA0219     FALSE 0.102 138.000 0.000 NA   NA
 263051 263052 BA0219 BA0221     FALSE 0.009 572.000 0.000 NA   NA
 263052 263053 BA0221 BA0222     FALSE 0.154 59.000 0.000 NA   NA
 263057 263058 BA0226 BA0228     FALSE 0.008 643.000 0.000 NA   NA
 263060 263061 BA0230 BA0231     FALSE 0.025 298.000 0.000 NA   NA
 263061 263062 BA0231 BA0232     TRUE 0.923 109.000 0.222 0.040 Y NA
 263062 263063 BA0232 BA0233     TRUE 0.981 13.000 0.667 0.040 Y NA
 263063 263064 BA0233 BA0234     TRUE 0.975 11.000 0.333 1.000 Y NA
 263064 263065 BA0234 BA0235     TRUE 0.996 -3.000 0.444 0.002 Y NA
 263065 263066 BA0235 BA0238     FALSE 0.005 1314.000 0.000 NA   NA
 263066 263067 BA0238 BA0239     FALSE 0.175 43.000 0.000 NA   NA
 263067 263068 BA0239 BA0240   hppD FALSE 0.022 311.000 0.000 NA   NA
 263068 263069 BA0240 BA0241 hppD   TRUE 0.723 67.000 0.111 1.000 N NA
 263069 263070 BA0241 BA0242     TRUE 0.967 -34.000 0.042 1.000 Y NA
 263070 263071 BA0242 BA0243     FALSE 0.362 13.000 0.000 NA   NA
 263071 263072 BA0243 BA0244     FALSE 0.160 111.000 0.000 NA   NA
 263072 263073 BA0244 BA0246   murF FALSE 0.032 1530.000 0.000 1.000 N NA
 263073 263074 BA0246 BA0247 murF   FALSE 0.229 305.000 0.079 1.000 N NA
 263074 263075 BA0247 BA0248     TRUE 0.829 97.000 0.000 1.000 Y NA
 263077 263078 BA0250 BA0251 acpS   TRUE 0.605 94.000 0.027 NA N NA
 263078 263079 BA0251 BA0252   dal-1 TRUE 0.861 119.000 0.231 NA Y NA
 263079 263080 BA0252 BA0253 dal-1   FALSE 0.231 310.000 0.189 NA N NA
 263080 263081 BA0253 BA0254     TRUE 0.943 5.000 0.376 NA N NA
 263081 263082 BA0254 BA0255     TRUE 0.642 68.000 0.025 1.000 N NA
 263084 5918267 BA0257 tRNA-Asn-2     FALSE 0.150 115.000 0.000 NA   NA
 5918267 5918268 tRNA-Asn-2 tRNA-Ser-2     FALSE 0.497 4.000 0.000 NA   NA
 5918268 5918269 tRNA-Ser-2 tRNA-Glu-3     FALSE 0.438 9.000 0.000 NA   NA
 5918269 5918270 tRNA-Glu-3 tRNA-Val-2     FALSE 0.483 5.000 0.000 NA   NA
 5918270 5918271 tRNA-Val-2 tRNA-Asp-1     FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 5918271 5918272 tRNA-Asp-1 tRNA-Gln-2     FALSE 0.177 89.000 0.000 NA   NA
 5918272 5918273 tRNA-Gln-2 tRNA-Lys-2     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 5918273 5918274 tRNA-Lys-2 tRNA-Leu-1     FALSE 0.262 18.000 0.000 NA   NA
 5918274 5918275 tRNA-Leu-1 tRNA-Arg-1     FALSE 0.183 96.000 0.000 NA   NA
 5918275 5918276 tRNA-Arg-1 tRNA-Pro-1     FALSE 0.483 5.000 0.000 NA   NA
 5918276 5918277 tRNA-Pro-1 tRNA-Gly-2     TRUE 0.519 2.000 0.000 NA   NA
 5918277 5918278 tRNA-Gly-2 Ba16SE     FALSE 0.175 104.000 0.000 NA   NA
 5918278 5918279 Ba16SE Ba23SE     FALSE 0.062 179.000 0.000 NA   NA
 5918279 5918280 Ba23SE Ba5SE     FALSE 0.162 50.000 0.000 NA   NA
 5918280 5918281 Ba5SE tRNA-Met-2     FALSE 0.362 13.000 0.000 NA   NA
 5918281 5918282 tRNA-Met-2 tRNA-Asp-2     FALSE 0.497 4.000 0.000 NA   NA
 5918282 263085 tRNA-Asp-2 BA0258     FALSE 0.065 175.000 0.000 NA   NA
 263085 263086 BA0258 BA0259     TRUE 0.868 -19.000 0.147 NA   NA
 263086 263087 BA0259 BA0260   rimI TRUE 0.826 20.000 0.415 1.000   NA
 263087 263088 BA0260 BA0261 rimI gcP TRUE 0.916 0.000 0.170 1.000   NA
 263091 263092 BA0264 BA0265     TRUE 0.895 -3.000 0.185 NA   NA
 263093 263094 BA0266 BA0267 groES groEL TRUE 0.934 39.000 0.463 1.000 Y NA
 263094 263095 BA0267 BA0268 groEL guaA FALSE 0.077 408.000 0.000 1.000 N NA
 263095 263096 BA0268 BA0270 guaA   FALSE 0.037 385.000 0.000 1.000   NA
 263096 263097 BA0270 BA0271     FALSE 0.207 145.000 0.000 1.000   NA
 263097 263098 BA0271 BA0272     TRUE 0.883 -16.000 0.000 0.022   NA
 263098 5918283 BA0272 Ba16SF     FALSE 0.021 323.000 0.000 NA   NA
 5918283 5918284 Ba16SF Ba23SF     FALSE 0.062 179.000 0.000 NA   NA
 5918284 5918285 Ba23SF Ba5SF     FALSE 0.162 50.000 0.000 NA   NA
 263099 263100 BA0273 BA0274     FALSE 0.040 233.000 0.000 NA   NA
 263100 263101 BA0274 BA0275     FALSE 0.211 27.000 0.000 NA   NA
 263101 263102 BA0275 BA0276     FALSE 0.024 304.000 0.000 NA   NA
 263102 263103 BA0276 BA0278     FALSE 0.006 1246.000 0.000 NA   NA
 263103 263104 BA0278 BA0279     FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 263104 263105 BA0279 BA0280     FALSE 0.071 166.000 0.000 NA   NA
 263106 5918286 BA0281 Ba16SG     TRUE 0.549 -4.000 0.000 NA   NA
 5918286 5918287 Ba16SG Ba23SG     FALSE 0.062 179.000 0.000 NA   NA
 5918287 5918288 Ba23SG Ba5SG     FALSE 0.160 51.000 0.000 NA   NA
 263107 263108 BA0283 BA0284 bacA-1   FALSE 0.262 18.000 0.000 NA   NA
 263108 263109 BA0284 BA0285     TRUE 0.912 -16.000 0.333 NA   NA
 263109 263110 BA0285 BA0286     TRUE 0.710 69.000 0.333 1.000   NA
 263110 263111 BA0286 BA0287     TRUE 0.705 59.000 0.333 1.000   NA
 5918289 5918290 Ba16SH Ba23SH     FALSE 0.062 179.000 0.000 NA   NA
 5918290 5918291 Ba23SH Ba5SH     FALSE 0.160 51.000 0.000 NA   NA
 5918291 263112 Ba5SH BA0288   purE FALSE 0.008 699.000 0.000 NA   NA
 263112 263113 BA0288 BA0289 purE purK TRUE 0.995 -3.000 0.108 0.001 Y NA
 263113 263114 BA0289 BA0290 purK purB TRUE 0.975 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 263114 263115 BA0290 BA0291 purB purC TRUE 0.877 89.000 0.065 1.000 Y NA
 263115 263116 BA0291 BA0292 purC   TRUE 0.987 -7.000 0.453 1.000 Y NA
 263116 263117 BA0292 BA0293   purQ TRUE 0.997 -3.000 0.668 0.001 Y NA
 263117 263118 BA0293 BA0294 purQ purL TRUE 0.996 -16.000 0.322 0.001 Y NA
 263118 263119 BA0294 BA0295 purL purF TRUE 0.981 -15.000 0.201 1.000 Y NA
 263119 263120 BA0295 BA0296 purF purM TRUE 0.843 107.000 0.006 1.000 Y NA
 263120 263121 BA0296 BA0297 purM purN TRUE 0.991 -3.000 0.005 0.002 Y NA
 263121 263122 BA0297 BA0298 purN purH TRUE 0.927 25.000 0.204 1.000 Y NA
 263122 263123 BA0298 BA0299 purH purD TRUE 0.882 122.000 0.229 1.000 Y NA
 263124 263125 BA0300 BA0301     TRUE 0.827 17.000 0.533 NA   NA
 263125 263126 BA0301 BA0302     FALSE 0.050 210.000 0.000 NA   NA
 263127 263128 BA0304 BA0305   pcrA TRUE 0.651 13.000 0.042 NA   NA
 263128 263129 BA0305 BA0306 pcrA ligA TRUE 0.967 16.000 0.087 0.011 Y NA
 263129 263130 BA0306 BA0307 ligA   FALSE 0.275 17.000 0.000 NA   NA
 263130 263131 BA0307 BA0308     FALSE 0.183 96.000 0.000 NA   NA
 263131 263132 BA0308 BA0309     FALSE 0.269 154.000 0.005 1.000   NA
 263132 263133 BA0309 BA0310     FALSE 0.059 186.000 0.000 NA   NA
 263135 263136 BA0312 BA0313     TRUE 0.979 -10.000 0.130 1.000 Y NA
 263136 263137 BA0313 BA0314     TRUE 0.900 22.000 0.118 NA Y NA
 263138 263139 BA0315 BA0316     FALSE 0.154 59.000 0.000 NA   NA
 263139 263140 BA0316 BA0318     FALSE 0.006 1250.000 0.000 NA   NA
 263141 263142 BA0320 BA0321 gatC gatA TRUE 0.992 16.000 0.686 0.001 Y NA
 263142 263143 BA0321 BA0322 gatA gatB TRUE 0.992 15.000 0.502 0.001 Y NA
 263143 263144 BA0322 BA0323 gatB   FALSE 0.099 471.000 0.034 1.000 N NA
 263144 263145 BA0323 BA0324     FALSE 0.220 140.000 0.000 1.000   NA
 263145 263146 BA0324 BA0325   gabT FALSE 0.282 155.000 0.016 1.000   NA
 263146 263147 BA0325 BA0326 gabT   TRUE 0.724 113.000 0.118 1.000 N NA
 263147 263148 BA0326 BA0327   gabD TRUE 0.887 -7.000 0.000 1.000 N NA
 263148 263149 BA0327 BA0328 gabD   TRUE 0.791 48.000 0.250 1.000 N NA
 263150 263151 BA0329 BA0330 ampS   TRUE 0.730 117.000 0.154 1.000 N NA
 263151 263152 BA0330 BA0331     TRUE 0.801 152.000 0.000 0.012 Y NA
 263152 263153 BA0331 BA0332     FALSE 0.206 240.000 0.000 1.000 N NA
 263154 263155 BA0333 BA0334     TRUE 0.860 97.000 0.016 1.000 Y NA
 263155 263156 BA0334 BA0335     FALSE 0.029 276.000 0.000 NA   NA
 263156 263157 BA0335 BA0336     FALSE 0.028 279.000 0.000 NA   NA
 263157 263158 BA0336 BA0337     FALSE 0.183 95.000 0.000 NA   NA
 263159 263160 BA0338 BA0339     TRUE 0.630 15.000 0.057 NA   NA
 263163 263164 BA0342 BA0343 amhX   FALSE 0.083 152.000 0.000 NA   NA
 263165 263166 BA0344 BA0345 ahpF ahpC TRUE 0.969 15.000 0.567 1.000 Y NA
 263167 263168 BA0346 BA0347     TRUE 0.839 13.000 0.157 1.000   NA
 263168 263169 BA0347 BA0348   fucA TRUE 0.546 55.000 0.000 1.000 N NA
 263170 263171 BA0349 BA0350     TRUE 0.988 -3.000 0.517 1.000 Y NA
 263171 263172 BA0350 BA0351     TRUE 0.914 73.000 0.345 1.000 Y NA
 263175 263176 BA0354 BA0356     FALSE 0.006 1290.000 0.000 NA   NA
 263176 263177 BA0356 BA0357     TRUE 0.546 -7.000 0.000 NA   NA
 263177 263178 BA0357 BA0358     FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 263178 263179 BA0358 BA0360     FALSE 0.007 878.000 0.000 NA   NA
 263181 263182 BA0362 BA0363     FALSE 0.322 123.000 0.035 NA   NA
 263183 263184 BA0364 BA0365     FALSE 0.299 144.000 0.000 NA N NA
 263186 263187 BA0368 BA0369     FALSE 0.322 170.000 0.000 1.000 N NA
 263188 263189 BA0370 BA0371     FALSE 0.211 237.000 0.000 1.000 N NA
 263189 263190 BA0371 BA0372     TRUE 0.753 173.000 0.167 1.000 Y NA
 263190 263191 BA0372 BA0373     TRUE 0.934 5.000 0.750 NA   NA
 263191 263192 BA0373 BA0374     FALSE 0.023 306.000 0.000 NA   NA
 263194 263195 BA0376 BA0377 thiM thiE TRUE 0.975 17.000 0.113 0.003 Y NA
 263197 263198 BA0379 BA0380     FALSE 0.032 264.000 0.000 NA   NA
 263198 263199 BA0380 BA0381     TRUE 0.911 -28.000 0.365 NA   NA
 263199 263200 BA0381 BA0382     TRUE 0.983 -3.000 0.379 NA Y NA
 263200 263201 BA0382 BA0383     TRUE 0.970 -3.000 0.076 NA Y NA
 263201 263202 BA0383 BA0384     FALSE 0.140 292.000 0.000 0.029   NA
 263204 263205 BA0386 BA0387     FALSE 0.418 11.000 0.000 NA   NA
 263205 263206 BA0387 BA0388     FALSE 0.334 14.000 0.000 NA   NA
 263206 263207 BA0388 BA0389     FALSE 0.028 283.000 0.000 NA   NA
 263207 263208 BA0389 BA0390     TRUE 0.737 67.000 0.750 NA   NA
 263208 263209 BA0390 BA0391     FALSE 0.153 114.000 0.000 NA   NA
 263209 263210 BA0391 BA0392     FALSE 0.362 13.000 0.000 NA   NA
 263211 263212 BA0393 BA0394     FALSE 0.387 109.000 0.040 NA   NA
 263213 263214 BA0395 BA0396   proS-1 FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 263216 263217 BA0398 BA0399     TRUE 0.595 129.000 0.050 1.000 N NA
 263217 263218 BA0399 BA0400     TRUE 0.979 24.000 0.625 0.004 Y NA
 263218 263219 BA0400 BA0401     TRUE 0.969 81.000 0.583 0.004 Y NA
 263219 263220 BA0401 BA0402     TRUE 0.793 74.000 0.292 1.000 N NA
 263220 263221 BA0402 BA0403     TRUE 0.557 110.000 0.167 NA   NA
 263221 263222 BA0403 BA0404     TRUE 0.819 19.000 0.615 NA   NA
 263223 263224 BA0405 BA0406     FALSE 0.057 192.000 0.000 NA   NA
 263225 263226 BA0407 BA0408     FALSE 0.302 54.000 0.008 NA   NA
 263226 263227 BA0408 BA0409     TRUE 0.560 39.000 0.130 NA   NA
 263229 263230 BA0411 BA0412     FALSE 0.133 123.000 0.000 NA   NA
 263233 263234 BA0416 BA0417     FALSE 0.169 107.000 0.000 NA   NA
 263234 263235 BA0417 BA0418     FALSE 0.084 151.000 0.000 NA   NA
 263236 263237 BA0419 BA0420 cax   TRUE 0.547 82.000 0.141 NA   NA
 263239 263240 BA0422 BA0423   fumA FALSE 0.181 207.000 0.071 NA   NA
 263240 263241 BA0423 BA0424 fumA   TRUE 0.685 127.000 0.136 1.000 N NA
 263241 263242 BA0424 BA0426     FALSE 0.064 934.000 0.033 1.000 N NA
 263243 263244 BA0427 BA0428     FALSE 0.047 716.000 0.000 1.000 N NA
 263245 263246 BA0429 BA0430     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263246 263247 BA0430 BA0431     FALSE 0.069 168.000 0.000 NA   NA
 263249 263250 BA0433 BA0434     FALSE 0.262 18.000 0.000 NA   NA
 263250 263251 BA0434 BA0435     FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 263251 263252 BA0435 BA0436     FALSE 0.503 -27.000 0.000 NA   NA
 263252 263253 BA0436 BA0437     FALSE 0.205 30.000 0.000 NA   NA
 263253 263254 BA0437 BA0438     FALSE 0.128 126.000 0.000 NA   NA
 263254 263255 BA0438 BA0439     FALSE 0.496 -31.000 0.000 NA   NA
 263255 263256 BA0439 BA0440     FALSE 0.292 16.000 0.000 NA   NA
 263256 263257 BA0440 BA0441     FALSE 0.216 25.000 0.000 NA   NA
 263257 263258 BA0441 BA0442     FALSE 0.028 281.000 0.000 NA   NA
 263258 263259 BA0442 BA0443     FALSE 0.292 16.000 0.000 NA   NA
 263259 263260 BA0443 BA0444     FALSE 0.185 38.000 0.000 NA   NA
 263260 263261 BA0444 BA0445     FALSE 0.175 43.000 0.000 NA   NA
 263261 263262 BA0445 BA0446     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 263262 263263 BA0446 BA0447     FALSE 0.185 38.000 0.000 NA   NA
 263263 263264 BA0447 BA0448     FALSE 0.362 13.000 0.000 NA   NA
 263264 263265 BA0448 BA0449     FALSE 0.213 26.000 0.000 NA   NA
 263265 263266 BA0449 BA0450     FALSE 0.173 44.000 0.000 NA   NA
 263266 263267 BA0450 BA0452     FALSE 0.010 487.000 0.000 NA   NA
 263267 263268 BA0452 BA0453     FALSE 0.200 32.000 0.000 NA   NA
 263268 263269 BA0453 BA0454     FALSE 0.171 106.000 0.000 NA   NA
 263269 263270 BA0454 BA0455     FALSE 0.057 191.000 0.000 NA   NA
 263270 263271 BA0455 BA0456     FALSE 0.148 116.000 0.000 NA   NA
 263271 263272 BA0456 BA0457     FALSE 0.209 28.000 0.000 NA   NA
 263272 263273 BA0457 BA0459     FALSE 0.008 675.000 0.000 NA   NA
 263275 263276 BA0461 BA0462 54   TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263276 263277 BA0462 BA0463     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263277 263278 BA0463 BA0464     FALSE 0.180 101.000 0.000 NA   NA
 263278 263279 BA0464 BA0465     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263279 263280 BA0465 BA0467     FALSE 0.006 1184.000 0.000 NA   NA
 263280 263281 BA0467 BA0468     TRUE 0.653 19.000 0.127 NA   NA
 263281 263282 BA0468 BA0469     FALSE 0.292 16.000 0.000 NA   NA
 263282 263283 BA0469 BA0470     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263283 263284 BA0470 BA0471     TRUE 0.908 -3.000 0.250 NA   NA
 263284 263285 BA0471 BA0472     TRUE 0.930 -7.000 0.417 NA   NA
 263285 263286 BA0472 BA0473     TRUE 0.928 -3.000 0.389 NA   NA
 263286 263287 BA0473 BA0474     TRUE 0.527 1.000 0.000 NA   NA
 263287 263288 BA0474 BA0475     FALSE 0.483 5.000 0.000 NA   NA
 263288 263289 BA0475 BA0476     TRUE 0.645 111.000 0.333 NA   NA
 263289 263290 BA0476 BA0477     FALSE 0.262 18.000 0.000 NA   NA
 263290 263291 BA0477 BA0478     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263291 263292 BA0478 BA0479     FALSE 0.314 15.000 0.000 NA   NA
 263292 263293 BA0479 BA0480     FALSE 0.156 66.000 0.000 NA   NA
 263293 263294 BA0480 BA0481     FALSE 0.158 69.000 0.000 NA   NA
 263294 263295 BA0481 BA0482     FALSE 0.262 18.000 0.000 NA   NA
 263295 263296 BA0482 BA0483     FALSE 0.183 95.000 0.000 NA   NA
 263296 263297 BA0483 BA0484     FALSE 0.159 73.000 0.000 NA   NA
 263297 263298 BA0484 BA0485     TRUE 0.536 0.000 0.000 NA   NA
 263299 263300 BA0486 BA0488     FALSE 0.006 1201.000 0.000 NA   NA
 263300 263301 BA0488 BA0489   rocR-1 FALSE 0.170 84.000 0.000 NA   NA
 263302 263303 BA0490 BA0492     FALSE 0.173 105.000 0.000 NA   NA
 263303 263304 BA0492 BA0493     TRUE 0.829 96.000 0.000 1.000 Y NA
 263306 263307 BA0495 BA0496     TRUE 0.755 115.000 1.000 NA   NA
 263308 263309 BA0497 BA0498     FALSE 0.183 39.000 0.000 NA   NA
 263309 263310 BA0498 BA0499   glsA-1 TRUE 0.525 -15.000 0.000 NA   NA
 263311 263312 BA0500 BA0501     FALSE 0.094 142.000 0.000 NA   NA
 263312 263313 BA0501 BA0502     FALSE 0.187 255.000 0.000 1.000 N NA
 263313 263314 BA0502 BA0503     FALSE 0.082 154.000 0.000 NA   NA
 263314 263315 BA0503 BA0504     FALSE 0.275 17.000 0.000 NA   NA
 263315 263316 BA0504 BA0505     FALSE 0.505 -25.000 0.000 NA   NA
 263316 263317 BA0505 BA0507     FALSE 0.006 1230.000 0.000 NA   NA
 263317 263318 BA0507 BA0508     TRUE 0.546 -7.000 0.000 NA   NA
 263318 263319 BA0508 BA0509   pfl FALSE 0.018 340.000 0.000 NA   NA
 263319 263320 BA0509 BA0510 pfl pflA TRUE 0.704 70.000 0.083 1.000 N NA
 263320 263321 BA0510 BA0511 pflA   FALSE 0.076 413.000 0.000 1.000 N NA
 263322 263323 BA0512 BA0513     FALSE 0.160 111.000 0.000 NA   NA
 263323 263324 BA0513 BA0514     FALSE 0.142 242.000 0.000 NA N NA
 263324 263325 BA0514 BA0515     FALSE 0.424 141.000 0.087 1.000   NA
 263326 263327 BA0516 BA0517     TRUE 0.590 16.000 0.049 NA   NA
 263328 263329 BA0518 BA0519     TRUE 0.548 44.000 0.133 NA   NA
 263334 263335 BA0524 BA0526     FALSE 0.378 189.000 0.353 NA   NA
 263335 263336 BA0526 BA0527     FALSE 0.146 233.000 0.069 NA   NA
 263336 263337 BA0527 BA0528     TRUE 0.720 55.000 0.230 NA N NA
 263338 263339 BA0529 BA0530     FALSE 0.162 261.000 0.130 NA   NA
 263339 263340 BA0530 BA0531   hemL-1 FALSE 0.348 200.000 0.020 1.000 N NA
 263341 263342 BA0532 BA0533     TRUE 0.952 -7.000 0.909 NA   NA
 263342 263343 BA0533 BA0534     TRUE 0.939 5.000 0.909 NA   NA
 263343 263344 BA0534 BA0535     TRUE 0.570 73.000 0.188 NA   NA
 263344 263345 BA0535 BA0536   bcP FALSE 0.379 45.000 0.031 NA   NA
 263345 263346 BA0536 BA0537 bcP   FALSE 0.195 292.000 0.013 1.000 N NA
 263348 5918292 BA0539 Ba16SI     TRUE 0.549 -4.000 0.000 NA   NA
 5918292 5918293 Ba16SI Ba23SI     FALSE 0.067 172.000 0.000 NA   NA
 5918293 5918294 Ba23SI Ba5SI     FALSE 0.180 101.000 0.000 NA   NA
 5918294 5918295 Ba5SI tRNA-Asn-3     FALSE 0.438 9.000 0.000 NA   NA
 5918295 5918296 tRNA-Asn-3 tRNA-Ser-3     TRUE 0.509 3.000 0.000 NA   NA
 5918296 5918297 tRNA-Ser-3 tRNA-Glu-4     FALSE 0.262 18.000 0.000 NA   NA
 5918297 5918298 tRNA-Glu-4 tRNA-Val-3     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 5918298 5918299 tRNA-Val-3 tRNA-Met-3     FALSE 0.216 25.000 0.000 NA   NA
 5918299 5918300 tRNA-Met-3 tRNA-Asp-3     FALSE 0.497 4.000 0.000 NA   NA
 5918300 5918301 tRNA-Asp-3 tRNA-Phe-1     FALSE 0.430 10.000 0.000 NA   NA
 5918301 5918302 tRNA-Phe-1 tRNA-Thr-2     FALSE 0.250 19.000 0.000 NA   NA
 5918302 5918303 tRNA-Thr-2 tRNA-Tyr-2     FALSE 0.418 11.000 0.000 NA   NA
 5918303 5918304 tRNA-Tyr-2 tRNA-Trp-1     FALSE 0.448 8.000 0.000 NA   NA
 5918304 5918305 tRNA-Trp-1 tRNA-His-1     FALSE 0.242 20.000 0.000 NA   NA
 5918305 5918306 tRNA-His-1 tRNA-Gln-3     FALSE 0.155 64.000 0.000 NA   NA
 5918306 5918307 tRNA-Gln-3 tRNA-Gly-3     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 5918307 5918308 tRNA-Gly-3 tRNA-Cys-1     FALSE 0.314 15.000 0.000 NA   NA
 5918308 5918309 tRNA-Cys-1 tRNA-Leu-2     FALSE 0.418 11.000 0.000 NA   NA
 263350 263351 BA0541 BA0542     FALSE 0.143 118.000 0.000 NA   NA
 263351 263352 BA0542 BA0543     FALSE 0.026 487.000 0.000 1.000   NA
 263352 263353 BA0543 BA0544     FALSE 0.283 188.000 0.071 1.000   NA
 263353 5918310 BA0544 tRNA-Gly-4     FALSE 0.150 115.000 0.000 NA   NA
 5918310 263354 tRNA-Gly-4 BA0545     FALSE 0.054 199.000 0.000 NA   NA
 263354 263355 BA0545 BA0546     FALSE 0.366 45.000 0.026 NA   NA
 263355 263356 BA0546 BA0547     FALSE 0.461 59.000 0.091 NA   NA
 263356 263357 BA0547 BA0548     FALSE 0.476 128.000 0.000 1.000 N NA
 263359 263360 BA0550 BA0551     FALSE 0.050 446.000 0.089 NA   NA
 263360 263361 BA0551 BA0552     FALSE 0.074 162.000 0.000 NA   NA
 263361 263362 BA0552 BA0553     FALSE 0.186 155.000 0.000 1.000   NA
 263364 263365 BA0555 BA0556     FALSE 0.037 247.000 0.000 NA   NA
 263365 263366 BA0556 BA0557     TRUE 0.836 13.000 0.306 NA   NA
 263366 263367 BA0557 BA0558     FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 263367 263368 BA0558 BA0559     TRUE 0.787 152.000 0.000 0.016 Y NA
 263370 263371 BA0562 BA0563     FALSE 0.107 135.000 0.000 NA   NA
 263371 263372 BA0563 BA0564     FALSE 0.010 536.000 0.000 NA   NA
 263372 263373 BA0564 BA0565     FALSE 0.009 559.000 0.000 NA   NA
 263373 263374 BA0565 BA0566     TRUE 0.863 -36.000 0.000 1.000 N NA
 263374 263375 BA0566 BA0567     TRUE 0.970 0.000 0.000 0.048 Y NA
 263375 263376 BA0567 BA0568     TRUE 0.992 -3.000 0.852 0.037 Y NA
 263376 263377 BA0568 BA0569     TRUE 0.965 22.000 0.615 0.037 Y NA
 263377 263378 BA0569 BA0570     FALSE 0.031 416.000 0.000 1.000   NA
 263378 263379 BA0570 BA0571     FALSE 0.195 150.000 0.000 1.000   NA
 263379 263380 BA0571 BA0572     TRUE 0.979 -3.000 0.103 1.000 Y NA
 263380 263381 BA0572 BA0573     FALSE 0.045 219.000 0.000 NA   NA
 263381 263382 BA0573 BA0574     FALSE 0.334 14.000 0.000 NA   NA
 263382 263383 BA0574 BA0575     FALSE 0.035 254.000 0.000 NA   NA
 263383 263384 BA0575 BA0576     TRUE 0.868 79.000 0.074 1.000 Y NA
 263384 263385 BA0576 BA0577     TRUE 0.938 30.000 0.333 0.085 Y NA
 263385 263386 BA0577 BA0578     TRUE 0.761 123.000 0.308 1.000 N NA
 263386 263387 BA0578 BA0579     TRUE 0.883 60.000 0.143 1.000 Y NA
 263388 263389 BA0580 BA0581     FALSE 0.148 116.000 0.000 NA   NA
 263391 263392 BA0583 BA0584     FALSE 0.201 147.000 0.000 1.000   NA
 263392 263393 BA0584 BA0585     TRUE 0.941 66.000 1.000 1.000 Y NA
 263395 263396 BA0587 BA0588   fdhD-1 FALSE 0.222 229.000 0.000 1.000 N NA
 263397 263398 BA0589 BA0591     FALSE 0.020 688.000 0.000 1.000   NA
 263398 263399 BA0591 BA0592   ald-1 FALSE 0.093 368.000 0.000 1.000 N NA
 263399 263400 BA0592 BA0593 ald-1   TRUE 0.948 104.000 1.000 1.000 Y NA
 263400 263401 BA0593 BA0594     FALSE 0.175 267.000 0.000 1.000 N NA
 263401 263402 BA0594 BA0595     TRUE 0.798 25.000 0.120 1.000 N NA
 263404 263405 BA0597 BA0598     TRUE 0.509 3.000 0.000 NA   NA
 263405 263406 BA0598 BA0599     FALSE 0.070 167.000 0.000 NA   NA
 263408 263409 BA0602 BA0603     TRUE 0.816 16.000 0.400 NA   NA
 263410 263411 BA0604 BA0605     FALSE 0.149 235.000 0.000 NA N NA
 263411 263412 BA0605 BA0606     FALSE 0.112 276.000 0.000 NA N NA
 263413 263414 BA0607 BA0608     FALSE 0.167 108.000 0.000 NA   NA
 263414 263415 BA0608 BA0609   aspA-1 FALSE 0.170 84.000 0.000 NA   NA
 263417 263418 BA0612 BA0613     TRUE 0.726 46.000 0.333 1.000   NA
 263419 263420 BA0614 BA0615     FALSE 0.088 382.000 0.000 1.000 N NA
 263421 263422 BA0616 BA0617     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.037 Y NA
 263422 263423 BA0617 BA0618     TRUE 0.925 13.000 0.000 1.000 Y NA
 263425 263426 BA0620 BA0621     TRUE 0.750 45.000 0.125 1.000 N NA
 263426 263427 BA0621 BA0622     TRUE 0.547 66.000 0.000 1.000 N NA
 263428 263429 BA0623 BA0624     TRUE 0.939 4.000 0.810 NA   NA
 263429 263430 BA0624 BA0625   cls-1 FALSE 0.266 128.000 0.000 1.000   NA
 263431 263432 BA0626 BA0627     FALSE 0.202 31.000 0.000 NA   NA
 263432 263433 BA0627 BA0628     FALSE 0.016 359.000 0.000 NA   NA
 263435 263436 BA0630 BA0631 treR treB TRUE 0.604 138.000 0.097 1.000 N NA
 263436 263437 BA0631 BA0632 treB treC TRUE 0.973 14.000 0.645 1.000 Y NA
 263438 263439 BA0633 BA0634 gerKC gerKB TRUE 0.975 -19.000 0.500 0.007   NA
 263439 263440 BA0634 BA0635 gerKB gerKA TRUE 0.919 -19.000 0.000 0.007   NA
 263441 263442 BA0636 BA0637     FALSE 0.220 24.000 0.000 NA   NA
 263442 263443 BA0637 BA0638     FALSE 0.122 128.000 0.000 NA   NA
 263443 263444 BA0638 BA0639     TRUE 0.726 134.000 0.000 1.000 Y NA
 263444 263445 BA0639 BA0640     TRUE 0.970 13.000 0.360 1.000 Y NA
 263445 263446 BA0640 BA0641     TRUE 0.910 63.000 0.180 0.048 Y NA
 263446 263447 BA0641 BA0642     TRUE 0.995 1.000 0.980 0.004 Y NA
 263447 263448 BA0642 BA0643     TRUE 0.584 205.000 0.000 0.062 Y NA
 263448 263449 BA0643 BA0644     TRUE 0.901 -25.000 0.009 1.000 N NA
 263449 263450 BA0644 BA0645     TRUE 0.544 62.000 0.000 1.000 N NA
 263450 263451 BA0645 BA0646     FALSE 0.309 177.000 0.000 1.000 N NA
 263451 263452 BA0646 BA0647     FALSE 0.009 611.000 0.000 NA   NA
 263455 263456 BA0650 BA0651     TRUE 0.979 12.000 0.667 1.000 Y NA
 263457 263458 BA0653 BA0654     TRUE 0.764 66.000 0.200 1.000 N NA
 263458 263459 BA0654 BA0655     FALSE 0.050 209.000 0.000 NA   NA
 263460 263461 BA0656 BA0657     TRUE 0.953 15.000 0.064 0.037 Y NA
 263461 263462 BA0657 BA0658     TRUE 0.957 19.000 0.282 0.037 Y NA
 263462 263463 BA0658 BA0659     TRUE 0.876 15.000 0.444 1.000   NA
 263463 263464 BA0659 BA0661   glpT FALSE 0.014 1290.000 0.000 1.000   NA
 263465 263466 BA0662 BA0664   rbsR FALSE 0.119 1758.000 0.000 0.046 Y NA
 263466 263467 BA0664 BA0665 rbsR rbsK TRUE 0.830 14.000 0.027 1.000 N NA
 263467 263468 BA0665 BA0666 rbsK rbsD TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 263468 263469 BA0666 BA0667 rbsD rbsA TRUE 0.921 118.000 0.611 1.000 Y NA
 263469 263470 BA0667 BA0668 rbsA rbsC TRUE 0.988 3.000 0.879 1.000 Y NA
 263470 263471 BA0668 BA0669 rbsC rbsB TRUE 0.965 15.000 0.712 NA Y NA
 263471 263472 BA0669 BA0670 rbsB   TRUE 0.834 35.000 0.013 NA Y NA
 263472 263473 BA0670 BA0672     FALSE 0.054 317.000 0.000 1.000   NA
 263473 263474 BA0672 BA0673     FALSE 0.021 319.000 0.000 NA   NA
 263476 263477 BA0675 BA0676     FALSE 0.141 119.000 0.000 NA   NA
 263477 263478 BA0676 BA0677   plC FALSE 0.035 254.000 0.000 NA   NA
 263478 263479 BA0677 BA0678 plC spH TRUE 0.672 59.000 0.250 1.000   NA
 263479 263480 BA0678 BA0679 spH   FALSE 0.406 108.000 0.045 NA   NA
 263480 263481 BA0679 BA0680     TRUE 0.935 -12.000 0.182 NA N NA
 263484 263485 BA0683 BA0684     TRUE 0.664 133.000 0.154 1.000 N NA
 263486 263487 BA0685 BA0686     FALSE 0.323 113.000 0.000 1.000   NA
 263487 263488 BA0686 BA0687     TRUE 0.546 -7.000 0.000 NA   NA
 263488 263489 BA0687 BA0688     FALSE 0.166 48.000 0.000 NA   NA
 263491 263492 BA0690 BA0691 brnQ-1   FALSE 0.105 136.000 0.000 NA   NA
 263493 263494 BA0692 BA0693     FALSE 0.144 182.000 0.000 1.000   NA
 263495 263496 BA0694 BA0695     FALSE 0.248 132.000 0.000 1.000   NA
 263496 263497 BA0695 BA0696     FALSE 0.483 5.000 0.000 NA   NA
 263498 263499 BA0697 BA0698     TRUE 0.644 15.000 0.065 NA   NA
 263499 263500 BA0698 BA0699     FALSE 0.336 72.000 0.022 NA   NA
 263500 263501 BA0699 BA0700   qoxD FALSE 0.284 222.000 0.000 0.062 N NA
 263501 263502 BA0700 BA0701 qoxD qoxC TRUE 0.983 1.000 0.308 1.000 Y NA
 263502 263503 BA0701 BA0702 qoxC qoxB TRUE 0.972 14.000 0.308 0.037 Y NA
 263503 263504 BA0702 BA0703 qoxB qoxA TRUE 0.965 34.000 0.308 0.006 Y NA
 263504 263505 BA0703 BA0704 qoxA   FALSE 0.028 282.000 0.000 NA   NA
 263506 263507 BA0705 BA0707     FALSE 0.005 1310.000 0.000 NA   NA
 263507 263508 BA0707 BA0708     TRUE 0.949 -3.000 0.778 NA   NA
 263508 263509 BA0708 BA0709   gerLA FALSE 0.450 145.000 0.125 1.000   NA
 263509 263510 BA0709 BA0710 gerLA gerLB TRUE 0.909 94.000 0.800 0.007   NA
 263510 263511 BA0710 BA0711 gerLB gerLC TRUE 0.921 -16.000 0.000 0.007   NA
 263511 263512 BA0711 BA0712 gerLC   FALSE 0.397 12.000 0.000 NA   NA
 263514 263515 BA0715 BA0716     TRUE 0.891 71.000 0.172 1.000 Y NA
 263515 263516 BA0716 BA0717     TRUE 0.996 3.000 0.849 0.002 Y NA
 263516 263517 BA0717 BA0718     FALSE 0.053 201.000 0.000 NA   NA
 633103 633104 Ba16SJ Ba23SJ     FALSE 0.062 179.000 0.000 NA   NA
 633104 633105 Ba23SJ Ba5SJ     FALSE 0.179 102.000 0.000 NA   NA
 633105 5918311 Ba5SJ tRNA-Val-4     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 5918311 5918312 tRNA-Val-4 tRNA-Gln-4     FALSE 0.397 12.000 0.000 NA   NA
 5918312 5918313 tRNA-Gln-4 tRNA-Lys-3     FALSE 0.483 5.000 0.000 NA   NA
 5918313 5918314 tRNA-Lys-3 tRNA-Leu-3     FALSE 0.314 15.000 0.000 NA   NA
 5918314 5918315 tRNA-Leu-3 tRNA-Gly-5     FALSE 0.205 30.000 0.000 NA   NA
 5918315 5918316 tRNA-Gly-5 tRNA-Leu-4     FALSE 0.275 17.000 0.000 NA   NA
 5918316 5918317 tRNA-Leu-4 tRNA-Arg-2     FALSE 0.497 4.000 0.000 NA   NA
 5918317 5918318 tRNA-Arg-2 tRNA-Pro-2     FALSE 0.418 11.000 0.000 NA   NA
 5918318 5918319 tRNA-Pro-2 tRNA-Ala-4     FALSE 0.275 17.000 0.000 NA   NA
 5918319 5918320 tRNA-Ala-4 tRNA-Ser-4     FALSE 0.236 21.000 0.000 NA   NA
 5918320 5918321 tRNA-Ser-4 tRNA-Ser-5     FALSE 0.156 55.000 0.000 NA   NA
 5918321 5918322 tRNA-Ser-5 tRNA-Met-4     FALSE 0.236 21.000 0.000 NA   NA
 5918322 5918323 tRNA-Met-4 tRNA-Asp-4     FALSE 0.483 5.000 0.000 NA   NA
 5918323 5918324 tRNA-Asp-4 tRNA-Phe-2     FALSE 0.438 9.000 0.000 NA   NA
 5918324 5918325 tRNA-Phe-2 tRNA-Thr-3     FALSE 0.430 10.000 0.000 NA   NA
 5918325 5918326 tRNA-Thr-3 tRNA-Trp-2     FALSE 0.457 7.000 0.000 NA   NA
 5918326 527244 tRNA-Trp-2 tRNA-Ile-3     FALSE 0.418 11.000 0.000 NA   NA
 527244 5918327 tRNA-Ile-3 tRNA-Asn-4     FALSE 0.438 9.000 0.000 NA   NA
 5918327 5918328 tRNA-Asn-4 tRNA-Glu-5     TRUE 0.519 2.000 0.000 NA   NA
 5918328 263519 tRNA-Glu-5 BA0720     FALSE 0.100 139.000 0.000 NA   NA
 263519 263520 BA0720 BA0721     FALSE 0.025 295.000 0.000 NA   NA
 263521 263522 BA0722 BA0723     FALSE 0.314 15.000 0.000 NA   NA
 263522 263523 BA0723 BA0724     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 263524 263525 BA0725 BA0726     TRUE 0.917 -31.000 0.054 1.000 N NA
 263525 263526 BA0726 BA0727     TRUE 0.986 0.000 0.412 1.000 Y NA
 263526 263527 BA0727 BA0728     TRUE 0.974 -3.000 0.116 NA Y NA
 263527 263528 BA0728 BA0729   tenI TRUE 0.833 11.000 0.029 NA N NA
 263528 263529 BA0729 BA0730 tenI goxB TRUE 0.930 -7.000 0.053 1.000 N NA
 263529 263530 BA0730 BA0731 goxB   TRUE 0.826 16.000 0.061 1.000 N NA
 263530 263531 BA0731 BA0732   thiG TRUE 0.972 3.000 0.065 1.000 Y NA
 263531 263532 BA0732 BA0733 thiG   TRUE 0.979 -7.000 0.004 0.028 Y NA
 263532 263533 BA0733 BA0734   thiD-1 TRUE 0.955 16.000 0.286 1.000 Y NA
 263533 263534 BA0734 BA0735 thiD-1   FALSE 0.011 442.000 0.000 NA   NA
 263534 263535 BA0735 BA0736     FALSE 0.496 -31.000 0.000 NA   NA
 263535 263536 BA0736 BA0737     FALSE 0.205 30.000 0.000 NA   NA
 263536 263537 BA0737 BA0738     FALSE 0.017 346.000 0.000 NA   NA
 263537 263538 BA0738 BA0739   kdpA FALSE 0.183 97.000 0.000 NA   NA
 263538 263539 BA0739 BA0740 kdpA kdpB TRUE 0.993 14.000 0.531 0.001 Y NA
 263539 263540 BA0740 BA0741 kdpB kdpC TRUE 0.982 17.000 0.044 0.001 Y NA
 263540 263541 BA0741 BA0742 kdpC kdpD TRUE 0.759 57.000 0.571 1.000   NA
 263543 263544 BA0744 BA0745     TRUE 0.531 129.000 0.133 1.000   NA
 263544 263545 BA0745 BA0746     FALSE 0.275 17.000 0.000 NA   NA
 263547 263548 BA0748 BA0750     FALSE 0.064 546.000 0.200 NA   NA
 263548 263549 BA0750 BA0751     TRUE 0.786 105.000 1.000 NA   NA
 263550 263551 BA0752 BA0753 scrK scrB TRUE 0.964 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 263551 263552 BA0753 BA0754 scrB scrA TRUE 0.935 18.000 0.139 1.000 Y NA
 263552 263553 BA0754 BA0755 scrA scrR TRUE 0.698 129.000 0.190 1.000 N NA
 263553 263554 BA0755 BA0756 scrR   FALSE 0.143 118.000 0.000 NA   NA
 263554 263555 BA0756 BA0757     TRUE 0.644 73.000 0.333 NA   NA
 263555 263556 BA0757 BA0758     TRUE 0.871 13.000 0.286 1.000   NA
 263556 263557 BA0758 BA0759     FALSE 0.071 166.000 0.000 NA   NA
 263557 263558 BA0759 BA0760     TRUE 0.508 117.000 0.143 NA   NA
 263558 263559 BA0760 BA0762   gerYC FALSE 0.006 1167.000 0.000 NA   NA
 263559 263560 BA0762 BA0763 gerYC gerYA TRUE 0.915 84.000 1.000 0.006   NA
 263560 263561 BA0763 BA0764 gerYA   FALSE 0.130 125.000 0.000 NA   NA
 263561 263562 BA0764 BA0765     FALSE 0.470 6.000 0.000 NA   NA
 263563 263564 BA0766 BA0767   spoVR FALSE 0.148 116.000 0.000 NA   NA
 263564 263565 BA0767 BA0768 spoVR   FALSE 0.167 108.000 0.000 NA   NA
 263567 263568 BA0771 BA0772     FALSE 0.109 134.000 0.000 NA   NA
 263568 263569 BA0772 BA0773     FALSE 0.397 12.000 0.000 NA   NA
 263569 263570 BA0773 BA0774     FALSE 0.179 102.000 0.000 NA   NA
 263570 263571 BA0774 BA0775     FALSE 0.059 186.000 0.000 NA   NA
 263571 263572 BA0775 BA0776     FALSE 0.177 89.000 0.000 NA   NA
 263572 263573 BA0776 BA0777     TRUE 0.699 39.000 0.207 1.000   NA
 263573 263574 BA0777 BA0778     FALSE 0.383 35.000 0.000 1.000   NA
 263574 263575 BA0778 BA0779     FALSE 0.434 59.000 0.000 NA N NA
 263575 263576 BA0779 BA0781     FALSE 0.007 885.000 0.000 NA   NA
 263577 263578 BA0782 BA0783     TRUE 0.546 146.000 0.500 NA   NA
 263580 263581 BA0785 BA0787     FALSE 0.117 331.000 0.000 1.000 N NA
 263582 263583 BA0789 BA0790     FALSE 0.159 73.000 0.000 NA   NA
 263583 263584 BA0790 BA0791   celC-1 TRUE 0.784 112.000 0.000 0.006 N NA
 263584 263585 BA0791 BA0792 celC-1 celA-1 TRUE 0.982 2.000 0.000 0.006 Y NA
 263585 263586 BA0792 BA0793 celA-1 celB-1 TRUE 0.910 83.000 0.000 0.006 Y NA
 263586 263587 BA0793 BA0794 celB-1   TRUE 0.508 -24.000 0.000 NA   NA
 263587 263588 BA0794 BA0795     TRUE 0.537 -10.000 0.000 NA   NA
 263589 263590 BA0796 BA0797     FALSE 0.009 571.000 0.000 NA   NA
 263590 263591 BA0797 BA0798     TRUE 0.945 3.000 0.000 NA Y NA
 263591 263592 BA0798 BA0799     TRUE 0.889 -3.000 0.000 1.000 N NA
 263594 263595 BA0802 BA0803 brnQ-2 cotJC FALSE 0.237 219.000 0.000 1.000 N NA
 263595 263596 BA0803 BA0804 cotJC cotJB TRUE 0.888 13.000 0.375 1.000   NA
 263596 263597 BA0804 BA0805 cotJB cotJA TRUE 0.949 -3.000 0.778 NA   NA
 263598 263599 BA0806 BA0807     TRUE 0.848 15.000 0.500 NA   NA
 263601 263602 BA0809 BA0810     FALSE 0.418 11.000 0.000 NA   NA
 263602 263603 BA0810 BA0811     FALSE 0.173 105.000 0.000 NA   NA
 263603 263604 BA0811 BA0812     FALSE 0.236 21.000 0.000 NA   NA
 263604 263605 BA0812 BA0813     FALSE 0.207 29.000 0.000 NA   NA
 263605 263606 BA0813 BA0814     FALSE 0.158 70.000 0.000 NA   NA
 263606 263607 BA0814 BA0815     FALSE 0.019 336.000 0.000 NA   NA
 263607 263608 BA0815 BA0816     FALSE 0.469 131.000 0.182 NA   NA
 263608 263609 BA0816 BA0817     FALSE 0.362 13.000 0.000 NA   NA
 263611 263612 BA0819 BA0820     FALSE 0.128 126.000 0.000 NA   NA
 263612 263613 BA0820 BA0821     FALSE 0.205 30.000 0.000 NA   NA
 263613 263614 BA0821 BA0822     TRUE 0.802 156.000 0.089 0.001   NA
 263614 263615 BA0822 BA0823     TRUE 0.768 25.000 0.289 1.000   NA
 263615 263616 BA0823 BA0824     TRUE 0.621 49.000 0.269 NA   NA
 263616 263617 BA0824 BA0825     FALSE 0.075 161.000 0.000 NA   NA
 263617 263618 BA0825 BA0827     FALSE 0.080 156.000 0.000 NA   NA
 263618 263619 BA0827 BA0828     TRUE 0.536 0.000 0.000 NA   NA
 263621 263622 BA0830 BA0831     FALSE 0.465 129.000 0.000 1.000 N NA
 263622 263623 BA0831 BA0832     FALSE 0.097 359.000 0.000 1.000 N NA
 263623 263624 BA0832 BA0833     TRUE 0.988 3.000 0.556 0.060 Y NA
 263624 263625 BA0833 BA0834     FALSE 0.448 133.000 0.000 1.000 N NA
 263625 263626 BA0834 BA0835   blT FALSE 0.251 211.000 0.000 1.000 N NA
 263628 263629 BA0837 BA0838     FALSE 0.242 20.000 0.000 NA   NA
 263632 263633 BA0841 BA0842     FALSE 0.039 238.000 0.000 NA   NA
 263633 263634 BA0842 BA0843     FALSE 0.423 24.000 0.000 1.000   NA
 263634 263635 BA0843 BA0844     FALSE 0.186 205.000 0.000 NA N NA
 263635 263636 BA0844 BA0845     TRUE 0.837 61.000 1.000 NA N NA
 263637 263638 BA0847 BA0848 racE-1   FALSE 0.155 113.000 0.000 NA   NA
 263640 263641 BA0851 BA0852     FALSE 0.037 243.000 0.000 NA   NA
 263641 263642 BA0852 BA0855     FALSE 0.042 2272.000 0.000 0.047 N NA
 263642 263643 BA0855 BA0856     TRUE 0.990 -22.000 0.680 0.047 Y NA
 263643 263644 BA0856 BA0857     TRUE 0.924 29.000 0.210 1.000 Y NA
 263647 263648 BA0860 BA0861     TRUE 0.831 21.000 0.867 NA   NA
 263649 263650 BA0862 BA0863     FALSE 0.225 142.000 0.026 NA   NA
 263651 263652 BA0864 BA0865     FALSE 0.229 22.000 0.000 NA   NA
 263653 263654 BA0866 BA0867 alsS alsD TRUE 0.887 17.000 0.311 1.000 N NA
 263655 263656 BA0868 BA0869     FALSE 0.229 22.000 0.000 NA   NA
 263657 263658 BA0870 BA0871     FALSE 0.026 485.000 0.000 1.000   NA
 263659 263660 BA0872 BA0873     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263661 263662 BA0875 BA0876     FALSE 0.143 315.000 0.000 0.081 N NA
 263664 263665 BA0878 BA0879     FALSE 0.019 334.000 0.000 NA   NA
 263665 263666 BA0879 BA0880     FALSE 0.016 359.000 0.000 NA   NA
 263667 263668 BA0881 BA0882   secA-1 TRUE 0.520 15.000 0.010 NA   NA
 263669 263670 BA0883 BA0884   csaB FALSE 0.213 142.000 0.000 1.000   NA
 263670 263671 BA0884 BA0885 csaB sap FALSE 0.008 676.000 0.000 NA   NA
 263671 263672 BA0885 BA0887 sap eag FALSE 0.007 722.000 0.000 NA   NA
 263673 263674 BA0888 BA0889     TRUE 0.786 25.000 0.600 NA   NA
 263675 263676 BA0890 BA0891     TRUE 0.811 10.000 0.130 NA   NA
 263676 263677 BA0891 BA0892     FALSE 0.157 53.000 0.000 NA   NA
 263679 263680 BA0894 BA0895     FALSE 0.036 250.000 0.000 NA   NA
 263682 263683 BA0897 BA0898     FALSE 0.143 240.000 0.000 NA N NA
 263683 263684 BA0898 BA0899     FALSE 0.152 232.000 0.000 NA N NA
 263686 263687 BA0901 BA0902     TRUE 0.905 20.000 0.037 1.000 Y NA
 263687 263688 BA0902 BA0904     FALSE 0.005 1355.000 0.000 NA   NA
 263688 263689 BA0904 BA0905     FALSE 0.013 411.000 0.000 NA   NA
 263689 263690 BA0905 BA0906     FALSE 0.158 52.000 0.000 NA   NA
 263690 263691 BA0906 BA0908     FALSE 0.007 755.000 0.000 NA   NA
 263691 263692 BA0908 BA0909     TRUE 0.846 60.000 0.000 0.036 Y NA
 263692 263693 BA0909 BA0910     TRUE 0.980 7.000 0.154 0.036 Y NA
 263693 263694 BA0910 BA0912     FALSE 0.123 1012.000 0.000 1.000 Y NA
 263694 263695 BA0912 BA0913     TRUE 0.525 -15.000 0.000 NA   NA
 263695 263696 BA0913 BA0915     FALSE 0.009 560.000 0.000 NA   NA
 263696 263697 BA0915 BA0916     FALSE 0.068 170.000 0.000 NA   NA
 263697 263698 BA0916 BA0917     FALSE 0.188 37.000 0.000 NA   NA
 263698 263699 BA0917 BA0918     TRUE 0.525 -15.000 0.000 NA   NA
 263699 263700 BA0918 BA0919     FALSE 0.157 68.000 0.000 NA   NA
 263701 263702 BA0920 BA0921     FALSE 0.022 316.000 0.000 NA   NA
 263703 263704 BA0923 BA0924     TRUE 0.964 19.000 0.727 0.081 Y NA
 263704 263705 BA0924 BA0925     TRUE 0.944 -3.000 0.364 1.000   NA
 263705 263706 BA0925 BA0926     FALSE 0.107 224.000 0.000 1.000   NA
 263706 263707 BA0926 BA0927     TRUE 0.591 100.000 0.000 1.000 N NA
 263707 263708 BA0927 BA0928     FALSE 0.501 -28.000 0.000 NA   NA
 263708 263709 BA0928 BA0929     FALSE 0.018 344.000 0.000 NA   NA
 263709 263710 BA0929 BA0930     FALSE 0.497 4.000 0.000 NA   NA
 263710 263711 BA0930 BA0931     FALSE 0.438 9.000 0.000 NA   NA
 263711 263712 BA0931 BA0932     FALSE 0.156 54.000 0.000 NA   NA
 263712 263713 BA0932 BA0933     FALSE 0.053 201.000 0.000 NA   NA
 263713 263714 BA0933 BA0934     TRUE 0.551 -3.000 0.000 NA   NA
 263714 263715 BA0934 BA0935     FALSE 0.197 33.000 0.000 NA   NA
 263715 263716 BA0935 BA0936     FALSE 0.125 127.000 0.000 NA   NA
 263716 263717 BA0936 BA0937     FALSE 0.229 22.000 0.000 NA   NA
 263724 263725 BA0945 BA0946     TRUE 0.792 -18.000 0.050 NA   NA
 263725 263726 BA0946 BA0947     TRUE 0.906 -7.000 0.250 NA   NA
 263726 263727 BA0947 BA0948     FALSE 0.053 201.000 0.000 NA   NA
 263729 263730 BA0950 BA0951     FALSE 0.061 181.000 0.000 NA   NA
 263731 263732 BA0952 BA0953     FALSE 0.145 117.000 0.000 NA   NA
 263733 263734 BA0954 BA0955     TRUE 0.678 58.000 0.143 NA N NA
 263734 263735 BA0955 BA0956     FALSE 0.013 400.000 0.000 NA   NA
 263736 263737 BA0957 BA0958     FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 263737 263738 BA0958 BA0959   pssA TRUE 0.576 44.000 0.000 1.000 N NA
 263738 263739 BA0959 BA0960 pssA   FALSE 0.423 24.000 0.000 1.000   NA
 263739 263740 BA0960 BA0961     FALSE 0.026 293.000 0.000 NA   NA
 263740 263741 BA0961 BA0962     FALSE 0.015 376.000 0.000 NA   NA
 263742 263743 BA0963 BA0964     TRUE 0.876 20.000 0.600 NA N NA
 263747 263748 BA0969 BA0971     FALSE 0.011 443.000 0.000 NA   NA
 263749 263750 BA0972 BA0973     FALSE 0.033 259.000 0.000 NA   NA
 263750 263751 BA0973 BA0975     FALSE 0.009 546.000 0.000 NA   NA
 263755 263756 BA0980 BA0981     FALSE 0.023 307.000 0.000 NA   NA
 263756 263757 BA0981 BA0982     FALSE 0.096 141.000 0.000 NA   NA
 263757 263758 BA0982 BA0983     FALSE 0.275 17.000 0.000 NA   NA
 263759 263760 BA0984 BA0985     FALSE 0.041 232.000 0.000 NA   NA
 263761 263762 BA0986 BA0987     FALSE 0.160 51.000 0.000 NA   NA
 263762 263763 BA0987 BA0988     FALSE 0.159 76.000 0.000 NA   NA
 263765 263766 BA0990 BA0991 rsbV rsbW TRUE 0.985 7.000 0.805 1.000 Y NA
 263766 263767 BA0991 BA0992 rsbW sigB TRUE 0.966 -34.000 0.618 1.000 N NA
 263767 263768 BA0992 BA0993 sigB   TRUE 0.551 70.000 0.000 1.000 N NA
 263768 263769 BA0993 BA0994     FALSE 0.311 176.000 0.000 1.000 N NA
 263770 263771 BA0995 BA0996     TRUE 0.930 17.000 0.083 1.000 Y NA
 263771 263772 BA0996 BA0997     FALSE 0.051 206.000 0.000 NA   NA
 263773 263774 BA0998 BA0999     FALSE 0.181 40.000 0.000 NA   NA
 263774 263775 BA0999 BA1000     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 263775 263776 BA1000 BA1001     FALSE 0.093 143.000 0.000 NA   NA
 263776 263777 BA1001 BA1002     FALSE 0.033 260.000 0.000 NA   NA
 263778 263779 BA1003 BA1004     FALSE 0.143 118.000 0.000 NA   NA