MicrobesOnline Operon Predictions for Photorhabdus luminescens TTO1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 547430 547431 plu0001 plu0002 dnaA dnaN TRUE 0.998 5.000 0.328 1.000 Y 0.855
 547431 547432 plu0002 plu0003 dnaN recF TRUE 0.994 22.000 0.318 1.000 Y 0.904
 547432 547433 plu0003 plu0004 recF gyrB TRUE 0.997 20.000 0.249 0.006 Y 0.564
 547433 547434 plu0004 plu0005 gyrB   FALSE 0.261 141.000 0.000 NA   0.126
 547435 547436 plu0006 plu0007   asd FALSE 0.203 167.000 0.000 1.000   -0.660
 547436 547437 plu0007 plu0008 asd ogrK FALSE 0.148 207.000 0.000 1.000   0.093
 547437 547438 plu0008 plu0009 ogrK   TRUE 0.917 77.000 0.500 NA   0.757
 547438 547439 plu0009 plu0010     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   0.272
 547439 547440 plu0010 plu0011     TRUE 0.963 3.000 0.000 NA   0.891
 547440 547441 plu0011 plu0012     TRUE 0.820 -19.000 0.000 NA   NA
 547441 547442 plu0012 plu0013     TRUE 0.995 15.000 0.600 NA   NA
 547442 547443 plu0013 plu0014     TRUE 0.980 27.000 0.400 NA   0.987
 547443 547444 plu0014 plu0015     TRUE 0.998 11.000 0.667 NA   0.983
 547445 547446 plu0016 plu0017     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547446 547447 plu0017 plu0018     TRUE 0.922 16.000 0.000 NA   0.453
 547448 547449 plu0019 plu0020     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.935
 547449 547450 plu0020 plu0021     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.891
 547450 547451 plu0021 plu0022     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.951
 547451 547452 plu0022 plu0023     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   0.975
 547452 547453 plu0023 plu0024     TRUE 0.998 5.000 0.667 NA   0.997
 547453 547454 plu0024 plu0025     TRUE 0.963 0.000 0.000 NA   0.995
 547454 547455 plu0025 plu0026     FALSE 0.024 497.000 0.000 NA   0.985
 547455 547456 plu0026 plu0027     FALSE 0.071 283.000 0.000 NA   NA
 547459 547460 plu0030 plu0031     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547460 547461 plu0031 plu0032     TRUE 0.957 10.000 0.000 NA   0.896
 547462 547463 plu0033 plu0034     TRUE 0.676 48.000 0.000 NA   0.912
 547463 547464 plu0034 plu0035   rpmJ FALSE 0.028 415.000 0.000 NA   NA
 547464 547465 plu0035 plu0036 rpmJ rpmE TRUE 0.961 20.000 0.000 0.016   NA
 547465 547466 plu0036 plu0037 rpmE glmS FALSE 0.108 149.000 0.000 1.000 N -0.441
 547466 547467 plu0037 plu0038 glmS glmU TRUE 0.724 108.000 0.055 1.000 Y -0.082
 547467 547468 plu0038 plu0039 glmU atpC FALSE 0.189 129.000 0.067 1.000 N -0.151
 547468 547469 plu0039 plu0040 atpC atpD TRUE 0.999 22.000 0.837 0.003 Y -0.439
 547469 547470 plu0040 plu0041 atpD atpG TRUE 0.999 35.000 0.724 0.003 Y 0.954
 547470 547471 plu0041 plu0042 atpG atpA TRUE 0.997 59.000 0.846 0.003 Y 0.778
 547471 547472 plu0042 plu0043 atpA atpH TRUE 1.000 15.000 0.864 0.003 Y 0.559
 547472 547473 plu0043 plu0044 atpH atpF TRUE 0.998 13.000 0.242 0.003 Y 0.722
 547473 547474 plu0044 plu0045 atpF atpE TRUE 0.995 59.000 0.666 0.003 Y 0.795
 547474 547475 plu0045 plu0046 atpE atpB TRUE 0.993 54.000 0.557 0.003 Y 0.016
 547475 547476 plu0046 plu0047 atpB atpI TRUE 0.986 31.000 0.291 1.000 Y -0.075
 547476 547477 plu0047 plu0048 atpI gidB FALSE 0.004 611.000 0.005 1.000 N 0.927
 547477 547478 plu0048 plu0049 gidB gidA TRUE 0.991 14.000 0.466 1.000 N 0.383
 547478 547479 plu0049 plu0050 gidA mioC FALSE 0.020 381.000 0.000 1.000 N 0.571
 547479 547480 plu0050 plu0051 mioC asnC TRUE 0.550 92.000 0.165 1.000 N 0.567
 547482 547483 plu0053 plu0054     TRUE 0.996 5.000 0.443 NA   0.471
 547484 547485 plu0055 plu0056 rbsD rbsA TRUE 0.998 8.000 0.337 1.000 Y 0.932
 547485 547486 plu0056 plu0057 rbsA rbsC TRUE 0.999 7.000 0.504 1.000 Y 0.902
 547486 547487 plu0057 plu0058 rbsC rbsB TRUE 0.998 25.000 0.847 NA Y 0.785
 547487 547488 plu0058 plu0059 rbsB rbsK TRUE 0.960 64.000 0.347 NA Y 0.997
 547488 547489 plu0059 plu0060 rbsK rbsR TRUE 0.996 3.000 0.500 1.000 N 0.869
 547490 547491 plu0061 plu0062     TRUE 0.432 70.000 0.000 NA   -0.749
 547491 547492 plu0062 plu0063     TRUE 0.856 -19.000 0.000 NA   0.718
 547493 547494 plur001 plut001 16s_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 547494 547495 plut001 plur002 tRNA-Glu 23s_rRNA FALSE 0.146 188.000 0.000 NA   NA
 547495 547496 plur002 plur003 23s_rRNA 5s_rRNA FALSE 0.229 142.000 0.000 NA   NA
 547496 547497 plur003 plu0064 5s_rRNA   FALSE 0.174 171.000 0.000 NA   NA
 547497 547498 plu0064 plu0065     TRUE 0.917 -6.000 0.000 NA   NA
 547498 547499 plu0065 plu0066     TRUE 0.459 64.000 0.000 NA   NA
 547499 547500 plu0066 plu0067     TRUE 0.841 -15.000 0.000 NA   NA
 547501 547502 plu0068 plu0069     TRUE 0.771 -84.000 0.000 NA   NA
 547502 547503 plu0069 plu0070     FALSE 0.073 316.000 0.000 NA   0.850
 547503 547504 plu0070 plu0071     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.803
 547504 547505 plu0071 plu0072     FALSE 0.110 249.000 0.000 NA   0.641
 547505 547506 plu0072 plu0073     TRUE 0.998 -3.000 0.733 NA   0.973
 547506 547507 plu0073 plu0074   acs TRUE 0.725 65.000 0.147 NA   0.944
 547508 547509 plu0075 plu0076 sodA   TRUE 0.536 119.000 0.129 1.000   0.703
 547509 547510 plu0076 plu0077     FALSE 0.045 385.000 0.000 1.000   0.430
 547510 547511 plu0077 plu0078     TRUE 0.984 -7.000 0.298 NA   NA
 547512 547513 plu0079 plu0080     TRUE 0.984 2.000 0.167 NA   -0.178
 547513 547514 plu0080 plu0081     TRUE 0.943 -31.000 0.200 NA   0.187
 547514 547515 plu0081 plu0082     TRUE 0.902 28.000 0.120 NA   0.437
 547517 547518 plu0084 plu0085 trpS gph TRUE 0.979 5.000 0.118 1.000   0.748
 547518 547519 plu0085 plu0086 gph rpe TRUE 0.951 -10.000 0.120 1.000   0.820
 547519 547520 plu0086 plu0087 rpe dam FALSE 0.322 61.000 0.040 1.000 N 0.654
 547520 547521 plu0087 plu0088 dam damX TRUE 0.788 85.000 0.234 NA   0.804
 547521 547522 plu0088 plu0089 damX aroB FALSE 0.070 293.000 0.022 NA   0.928
 547522 547523 plu0089 plu0090 aroB aroK TRUE 0.960 48.000 0.208 1.000 Y 0.721
 547523 547524 plu0090 plu0091 aroK   FALSE 0.247 370.000 0.319 1.000   0.292
 547524 547525 plu0091 plu0092     TRUE 0.897 -7.000 0.009 NA   0.930
 547525 547526 plu0092 plu0093     TRUE 0.957 -13.000 0.174 NA   0.653
 547526 547527 plu0093 plu0094     TRUE 0.999 0.000 0.870 NA   0.739
 547530 547531 plu0097 plu0098   hslR TRUE 0.396 68.000 0.010 1.000   0.056
 547531 547532 plu0098 plu0099 hslR hslO TRUE 0.912 23.000 0.140 1.000 N 0.920
 547532 547533 plu0099 plu0100 hslO pckA FALSE 0.053 240.000 0.048 1.000 N 0.222
 547535 547536 plu0102 plu0103     TRUE 0.997 0.000 0.206 1.000 Y 0.864
 547536 547537 plu0103 plu0104     TRUE 0.723 108.000 0.235 NA   -0.049
 547537 547538 plu0104 plu0105   pulA FALSE 0.011 704.000 0.000 NA   0.222
 547538 547539 plu0105 plu0106 pulA   FALSE 0.055 355.000 0.000 NA   0.708
 547539 547540 plu0106 plu0107     TRUE 0.573 52.000 0.033 NA   0.564
 547540 547541 plu0107 plu0108     TRUE 0.959 8.000 0.000 NA   0.855
 547541 547542 plu0108 plu0109     TRUE 0.948 -3.000 0.027 NA   0.803
 547544 547545 plu0111 plu0112 cynT cynS TRUE 0.954 28.000 0.000 1.000 Y 0.226
 547547 547548 plu0114 plu0115     TRUE 0.958 0.000 0.000 NA   -0.211
 547548 547549 plu0115 plu0116     FALSE 0.006 1853.000 0.000 NA   -0.361
 547549 547550 plu0116 plu0117     TRUE 0.760 25.000 0.000 1.000 N 0.887
 547554 547555 plu0121 plu0122 uspA gdhA FALSE 0.044 262.000 0.000 1.000 N 0.388
 547556 547557 plu0123 plu0124   opdA TRUE 0.973 7.000 0.098 NA   0.734
 547558 547559 plut002 plu0125 tRNA-SeC(p)   FALSE 0.181 167.000 0.000 NA   NA
 547559 547560 plu0125 plu0126     TRUE 0.522 63.000 0.000 NA   0.478
 547560 547561 plu0126 plu0127   ISPlu4G FALSE 0.144 189.000 0.000 NA   NA
 547562 547563 plu0128 plu0129     FALSE 0.218 148.000 0.000 NA   NA
 547563 547564 plu0129 plu0130     FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 547565 547566 plu0131 plu0132     TRUE 0.794 33.000 0.000 NA   0.304
 547566 547567 plu0132 plu0133     FALSE 0.269 138.000 0.000 NA   0.162
 547567 547568 plu0133 plu0134     TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   -0.937
 547568 547569 plu0134 plu0135     TRUE 0.476 75.000 0.000 NA   0.931
 547569 547570 plu0135 plu0136     FALSE 0.354 114.000 0.000 NA   0.441
 547570 547571 plu0136 plu0137     TRUE 0.397 88.000 0.000 NA   -0.584
 547571 547572 plu0137 plu0138     FALSE 0.333 106.000 0.000 NA   NA
 547574 547575 plu0140 plu0141     TRUE 0.990 44.000 1.000 NA   0.166
 547575 547576 plu0141 plu0142     TRUE 0.997 20.000 0.875 NA   0.278
 547576 547577 plu0142 plu0143     TRUE 0.920 22.000 0.000 0.067 N 0.912
 547577 547578 plu0143 plu0144     TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.001 Y 0.073
 547578 547579 plu0144 plu0145     TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.067 N 0.155
 547579 547580 plu0145 plu0146     FALSE 0.312 58.000 0.000 1.000 N -0.237
 547580 547581 plu0146 plu0147     TRUE 0.914 15.000 0.000 NA   NA
 547581 547582 plu0147 plu0148     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547583 547584 plu0149 plu0150     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 547585 547586 plu0151 plu0152     TRUE 0.820 -19.000 0.000 NA   NA
 547586 547587 plu0152 plu0153     FALSE 0.021 539.000 0.000 NA   0.969
 547587 547588 plu0153 plu0154     TRUE 0.989 -3.000 0.222 NA   0.590
 547590 547591 plu0156 plu0157   cipB FALSE 0.007 936.000 0.000 NA   -0.524
 547591 547592 plu0157 plu0158 cipB   FALSE 0.012 764.000 0.000 NA   0.962
 547592 547593 plu0158 plu0159     TRUE 0.860 10.000 0.000 1.000 N NA
 547593 547594 plu0159 plu0160     TRUE 0.404 74.000 0.000 NA   NA
 547594 547595 plu0160 plu0161     FALSE 0.227 160.000 0.000 NA   0.371
 547595 547596 plu0161 plu0162     FALSE 0.040 373.000 0.000 1.000   NA
 547596 547597 plu0162 plu0163     FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 547597 547598 plu0163 plu0164     FALSE 0.022 493.000 0.000 NA   0.092
 547598 547599 plu0164 plu0165     FALSE 0.262 438.000 0.000 0.002 Y 0.400
 547599 547600 plu0165 plu0166     TRUE 0.476 309.000 0.000 0.002 Y 0.600
 547600 547601 plu0166 plu0167     TRUE 0.901 93.000 0.000 0.002 Y 0.960
 547601 547602 plu0167 plu0168     FALSE 0.004 660.000 0.000 1.000 N -0.905
 547602 547603 plu0168 plu0169     FALSE 0.085 255.000 0.000 NA   NA
 547604 547605 plu0170 plu0171 uxuA uxuR TRUE 0.626 38.000 0.047 1.000 N 0.894
 547605 547606 plu0171 plu0172 uxuR   TRUE 0.545 119.000 0.200 1.000 N 0.826
 547607 547608 plu0173 plu0174     TRUE 0.996 28.000 0.588 NA Y 0.837
 547608 547609 plu0174 plu0175   uxuB TRUE 0.994 28.000 0.471 1.000 Y 0.115
 547609 547610 plu0175 plu0176 uxuB uxaC TRUE 0.999 -3.000 0.647 1.000 Y 0.859
 547610 547611 plu0176 plu0177 uxaC kdgK TRUE 0.995 -3.000 0.176 1.000 Y 0.252
 547611 547612 plu0177 plu0178 kdgK eda TRUE 0.982 15.000 0.000 1.000 Y 0.141
 547613 547614 plu0179 plu0180     TRUE 0.919 -9.000 0.000 1.000   0.721
 547615 547616 plu0181 plu0182   cpmA FALSE 0.008 777.000 0.000 NA   NA
 547616 547617 plu0182 plu0183 cpmA cpmB TRUE 0.985 3.000 0.222 1.000 N 0.910
 547617 547618 plu0183 plu0184 cpmB cpmC TRUE 0.985 14.000 0.222 1.000   0.996
 547618 547619 plu0184 plu0185 cpmC cpmD TRUE 0.954 77.000 0.667 1.000   0.904
 547619 547620 plu0185 plu0186 cpmD cpmE TRUE 0.997 -13.000 1.000 1.000   0.879
 547620 547621 plu0186 plu0187 cpmE cpmF TRUE 0.945 8.000 0.000 NA   NA
 547621 547622 plu0187 plu0188 cpmF cpmG TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 547622 547623 plu0188 plu0189 cpmG cpmH TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547628 547629 plu0194 plu0195 glpD glpR FALSE 0.100 241.000 0.104 1.000 N 0.340
 547629 547630 plu0195 plu0196 glpR glpG TRUE 0.976 18.000 0.190 1.000   0.920
 547630 547631 plu0196 plu0197 glpG glpE TRUE 0.995 9.000 0.405 1.000   0.304
 547631 547632 plu0197 plu0198 glpE   FALSE 0.250 131.000 0.025 1.000   -0.127
 547632 547633 plu0198 plu0199     TRUE 0.561 60.000 0.066 1.000   NA
 547634 547635 plu0200 plu0201     FALSE 0.312 112.000 0.000 NA   NA
 547637 547638 plu0203 plu0204   bioH FALSE 0.021 469.000 0.000 NA   NA
 547638 547639 plu0204 plu0205 bioH   TRUE 0.413 77.000 0.000 NA   -0.544
 547639 547640 plu0205 plu0206     TRUE 0.905 -7.000 0.000 NA   -0.952
 547641 547642 plu0207 plu0208   feoB TRUE 0.996 10.000 0.455 NA   0.461
 547642 547643 plu0208 plu0209 feoB feoA TRUE 0.936 53.000 0.177 1.000 Y 0.623
 547643 547644 plu0209 plu0210 feoA   FALSE 0.016 398.000 0.000 1.000 N 0.279
 547644 547645 plu0210 plu0211   greB FALSE 0.186 423.000 0.123 1.000 Y 0.529
 547646 547647 plu0212 plu0213 ompR envZ TRUE 0.999 -3.000 0.584 1.000 Y -0.313
 547647 547648 plu0213 plu0214 envZ pstS FALSE 0.010 339.000 0.022 1.000 N -0.923
 547648 547649 plu0214 plu0215 pstS pstC TRUE 0.918 117.000 0.145 0.002 Y 0.634
 547649 547650 plu0215 plu0216 pstC pstA TRUE 1.000 2.000 0.537 0.002 Y -0.293
 547650 547651 plu0216 plu0217 pstA pstB TRUE 0.998 27.000 0.526 0.002 Y -0.441
 547651 547652 plu0217 plu0218 pstB phoU TRUE 0.996 15.000 0.317 NA Y 0.605
 547652 547653 plu0218 plu0219 phoU   FALSE 0.034 169.000 0.014 NA N -0.351
 547653 547654 plu0219 plu0220     TRUE 0.954 82.000 0.263 0.061 Y -0.287
 547654 547655 plu0220 plu0221     TRUE 0.999 2.000 0.282 0.018 Y 0.609
 547656 547657 plu0222 plu0223     FALSE 0.277 124.000 0.000 NA   -0.844
 547657 547658 plu0223 plu0224     FALSE 0.252 131.000 0.000 NA   -0.983
 547658 547659 plu0224 plu0225     TRUE 0.947 6.000 0.000 NA   NA
 547659 547660 plu0225 plu0226     TRUE 0.785 30.000 0.000 NA   NA
 547663 547664 plu0229 plu0230   hemN FALSE 0.250 194.000 0.107 NA   0.404
 547666 547667 plu0232 plu0233     FALSE 0.160 179.000 0.000 NA   NA
 547667 547668 plu0233 plu0234   tnpA TRUE 0.936 24.000 0.000 0.096   -0.025
 547669 547670 plu0235 plu0236 glnG glnL TRUE 0.999 10.000 0.587 0.077 Y -0.111
 547670 547671 plu0236 plu0237 glnL glnA FALSE 0.139 154.000 0.053 1.000 N 0.549
 547673 547674 plu0239 plu0240     FALSE 0.011 1055.000 0.000 0.083 N 0.849
 547675 547676 plu0241 plu0242   dtd TRUE 0.655 44.000 0.010 1.000   0.901
 547676 547677 plu0242 plu0243 dtd   TRUE 0.512 73.000 0.065 1.000   0.067
 547678 547679 plu0244 plu0245     FALSE 0.189 171.000 0.000 NA   -0.255
 547682 547683 plu0248 plu0249 gltS   FALSE 0.096 244.000 0.000 NA   -0.734
 547683 547684 plu0249 plu0250     FALSE 0.013 644.000 0.000 NA   0.086
 547685 547686 plu0251 plu0252     TRUE 0.973 3.000 0.118 NA   NA
 547687 547688 plu0253 plu0254   relB FALSE 0.037 407.000 0.000 NA   0.535
 547688 547689 plu0254 plu0255 relB   TRUE 0.985 -10.000 0.444 NA N 0.959
 547689 547690 plu0255 plu0256     FALSE 0.314 114.000 0.000 NA   -0.796
 547691 547692 plu0257 plu0258     TRUE 0.430 94.000 0.000 NA   1.000
 547692 547693 plu0258 plu0259   recG FALSE 0.013 656.000 0.000 NA   0.631
 547694 547695 plu0260 plu0261     FALSE 0.010 426.000 0.000 1.000 N -0.791
 547695 547696 plu0261 plu0262     TRUE 0.644 127.000 0.000 1.000 Y -0.258
 547696 547697 plu0262 plu0263     TRUE 0.756 38.000 0.000 1.000   -0.286
 547697 547698 plu0263 plu0264     TRUE 0.750 68.000 0.000 0.008   0.315
 547698 547699 plu0264 plu0265     TRUE 0.714 90.000 0.000 0.008   0.685
 547699 547700 plu0265 plu0266     TRUE 0.473 81.000 0.000 1.000   0.992
 547700 547701 plu0266 plu0267     TRUE 0.973 37.000 0.000 0.005 Y 0.514
 547701 547702 plu0267 plu0268     TRUE 0.503 184.000 0.000 1.000 Y 0.828
 547702 547703 plu0268 plu0269     FALSE 0.228 169.000 0.000 NA   0.848
 547703 547704 plu0269 plu0270     FALSE 0.311 132.000 0.000 NA   0.947
 547704 547705 plu0270 plu0271     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA   0.434
 547706 547707 plu0272 plu0273 spoT rpoZ TRUE 0.994 18.000 0.291 1.000 Y -0.090
 547707 547708 plu0273 plu0274 rpoZ gmk TRUE 0.908 55.000 0.471 1.000 N -0.547
 547709 547710 plu0275 plu0276     FALSE 0.324 109.000 0.000 NA   NA
 547711 547712 plu0277 plu0278     FALSE 0.323 237.000 0.000 NA Y NA
 547712 547713 plu0278 plu0279     FALSE 0.012 767.000 0.000 NA   0.894
 547713 547714 plu0279 plu0280     FALSE 0.021 538.000 0.000 NA   0.978
 547716 547717 plu0282 plu0283     FALSE 0.009 978.000 0.000 NA   0.823
 547717 547718 plu0283 plu0284     FALSE 0.062 303.000 0.000 NA   NA
 547718 547719 plu0284 plu0285     TRUE 0.975 -3.000 0.143 NA   NA
 547723 547724 plu0289 plu0290     FALSE 0.015 547.000 0.000 NA   NA
 547724 547725 plu0290 plu0291   avtA FALSE 0.111 219.000 0.000 NA   NA
 547725 547726 plu0291 plu0292 avtA tag FALSE 0.078 206.000 0.000 1.000 N 0.968
 547727 547728 plu0293 plu0294 glyQ glyS TRUE 1.000 10.000 0.651 0.001 Y 0.988
 547728 547729 plu0294 plu0295 glyS   FALSE 0.316 111.000 0.000 NA   NA
 547729 547730 plu0295 plut003   tRNA-Pro FALSE 0.194 160.000 0.000 NA   NA
 547731 547732 plu0296 plu0297     TRUE 0.942 86.000 0.625 NA   0.900
 547733 547734 plu0298 plu0299     TRUE 0.834 -21.000 0.000 1.000   -0.573
 547734 547735 plu0299 plu0300   dppA FALSE 0.018 603.000 0.000 1.000   0.796
 547735 547736 plu0300 plu0301 dppA dppB TRUE 0.852 119.000 0.087 0.046 Y 0.943
 547736 547737 plu0301 plu0302 dppB dppC TRUE 1.000 11.000 0.779 0.046 Y 0.904
 547737 547738 plu0302 plu0303 dppC dppD TRUE 0.999 13.000 0.560 1.000 Y 0.900
 547738 547739 plu0303 plu0304 dppD dppF TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y 0.993
 547739 547740 plu0304 plu0305 dppF   FALSE 0.061 357.000 0.000 1.000   0.903
 547740 547741 plu0305 plu0306     FALSE 0.274 179.000 0.083 1.000   0.975
 547742 547743 plu0307 plu0308     TRUE 0.595 56.000 0.043 1.000   0.989
 547747 547748 plu0312 plu0313 ISPlu5B   TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 547748 547749 plu0313 plu0314     TRUE 0.965 1.000 0.000 NA   0.865
 547751 547752 plu0316 plu0317 phlA phlB TRUE 0.950 66.000 0.600 NA   0.902
 547752 547753 plu0317 plu0318 phlB   FALSE 0.011 669.000 0.000 NA   -0.751
 547753 547754 plu0318 plu0319   ISPlu4F FALSE 0.087 250.000 0.000 NA   NA
 547755 547756 plu0320 plu0321     FALSE 0.028 420.000 0.000 NA   -0.652
 547756 547757 plu0321 plu0322     TRUE 0.800 28.000 0.000 NA   NA
 547757 547758 plu0322 plu0323     TRUE 0.921 14.000 0.000 NA   NA
 547759 547760 plu0324 plu0325     FALSE 0.013 599.000 0.000 NA   NA
 547762 547763 plu0327 plu0328   ISPlu11E FALSE 0.095 239.000 0.000 NA   NA
 547763 547764 plu0328 plu0329 ISPlu11E   FALSE 0.197 158.000 0.000 NA   NA
 547764 547765 plu0329 plu0330     FALSE 0.295 118.000 0.000 NA   NA
 547765 547766 plu0330 plu0331     FALSE 0.011 624.000 0.000 NA   NA
 547766 547767 plu0331 plu0332     FALSE 0.060 306.000 0.000 NA   NA
 547767 547768 plu0332 plu0333     TRUE 0.963 2.000 0.000 NA   0.747
 547768 547769 plu0333 plu0334   ISPlu9K FALSE 0.031 397.000 0.000 NA   NA
 547769 547770 plu0334 plu0335 ISPlu9K   TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 547770 547771 plu0335 plu0336   pmt2 TRUE 0.802 96.000 0.312 NA   NA
 547771 547772 plu0336 plu0337 pmt2   TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 547773 547774 plu0338 plu0339 dcm vsr TRUE 0.992 8.000 0.016 0.094 Y 0.056
 547774 547775 plu0339 plu0340 vsr   FALSE 0.119 198.000 0.024 NA   -0.227
 547776 547777 plu0341 plu0342     FALSE 0.185 174.000 0.000 NA   -0.221
 547777 547778 plu0342 plu0343     FALSE 0.266 137.000 0.000 NA   -0.050
 547778 547779 plu0343 plu0344     FALSE 0.018 505.000 0.000 NA   NA
 547781 547782 plu0346 plu0347     FALSE 0.059 307.000 0.000 NA   NA
 547782 547783 plu0347 plu0348     FALSE 0.021 471.000 0.000 NA   NA
 547783 547784 plu0348 plu0349     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 547786 547787 plu0351 plu0352     FALSE 0.014 568.000 0.000 NA   NA
 547787 547788 plu0352 plu0353     TRUE 0.954 0.000 0.000 NA   -0.781
 547788 547789 plu0353 plu0354     TRUE 0.991 22.000 0.500 NA   0.962
 547789 547790 plu0354 plu0355     TRUE 0.906 48.000 0.250 NA   0.976
 547790 547791 plu0355 plu0356     TRUE 0.899 22.000 0.000 NA   0.812
 547793 547794 plu0358 plu0359   pmt1 TRUE 0.392 80.000 0.000 NA   NA
 547794 547795 plu0359 plu0360 pmt1   TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 547795 547796 plu0360 plu0361     TRUE 0.998 6.000 0.711 NA   0.466
 547796 547797 plu0361 plu0362     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA   0.315
 547797 547798 plu0362 plu0363     TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000   0.933
 547798 547799 plu0363 plu0364     TRUE 0.995 11.000 0.471 NA   0.293
 547799 547800 plu0364 plu0365     TRUE 0.998 0.000 0.673 NA   0.824
 547800 547801 plu0365 plu0366     TRUE 0.999 3.000 0.765 NA   0.326
 547801 547802 plu0366 plu0367     TRUE 0.999 0.000 0.862 NA   0.708
 547802 547803 plu0367 plu0368     TRUE 0.997 6.000 0.510 NA   0.816
 547803 547804 plu0368 plu0369     TRUE 0.992 36.000 0.863 NA   0.324
 547804 547805 plu0369 plu0370     TRUE 0.997 2.000 0.552 NA   0.470
 547805 547806 plu0370 plu0371     TRUE 0.998 7.000 0.627 NA   0.475
 547806 547807 plu0371 plu0372     TRUE 0.996 24.000 0.821 NA   0.866
 547808 547809 plu0373 plu0374     FALSE 0.012 639.000 0.000 NA   -0.501
 547809 547810 plu0374 plu0375   gor TRUE 0.574 96.000 0.100 1.000   0.856
 547810 547811 plu0375 plu0376 gor   FALSE 0.095 266.000 0.000 NA   0.352
 547811 547812 plu0376 plu0377     TRUE 0.967 -3.000 0.083 NA   0.653
 547813 547814 plu0378 plu0379 mobB mobA TRUE 0.996 -3.000 0.064 0.003 Y 0.985
 547815 547816 plu0380 plu0381   dsbA TRUE 0.936 21.000 0.111 NA   0.111
 547817 547818 plu0382 plu0383     TRUE 0.529 66.000 0.000 1.000   0.686
 547818 547819 plu0383 plu0384     TRUE 0.833 28.000 0.000 NA   0.498
 547820 547821 plu0385 plu0386 ISPlu10K polA FALSE 0.148 475.000 0.000 0.093 Y NA
 547822 547823 plu0387 plu0388     TRUE 0.933 15.000 0.000 NA   0.983
 547823 547824 plu0388 plu0389     FALSE 0.046 368.000 0.000 NA   0.267
 547824 547825 plu0389 plu0390   engB FALSE 0.023 473.000 0.000 NA   -0.268
 547828 547829 plu0393 plu0394 pabA argD TRUE 0.727 124.000 0.088 1.000 Y 0.610
 547832 547833 plu0397 plu0398 prkB   TRUE 0.982 19.000 0.303 NA   -0.889
 547833 547834 plu0398 plu0399     TRUE 0.989 0.000 0.222 NA   -0.860
 547835 547836 plu0400 plu0401 ISPlu6L   FALSE 0.388 96.000 0.000 1.000   NA
 547837 547838 plu0402 plu0403     TRUE 0.879 31.000 0.087 1.000   0.907
 547838 547839 plu0403 plu0404     FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   -0.959
 547840 547841 plu0405 plu0406     TRUE 0.397 83.000 0.000 NA   -0.770
 547841 547842 plu0406 plu0407     TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 547842 547843 plu0407 plu0408     TRUE 0.720 38.000 0.000 NA   NA
 547843 547844 plu0408 plu0409     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547844 547845 plu0409 plu0410     FALSE 0.027 419.000 0.000 NA   NA
 547846 547847 plu0411 plu0412     TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA   -0.404
 547847 547848 plu0412 plu0413     TRUE 0.952 6.000 0.000 NA   -0.266
 547848 547849 plu0413 plu0414     TRUE 0.716 43.000 0.000 NA   0.714
 547849 547850 plu0414 plu0415     TRUE 0.912 43.000 0.000 1.000 Y 0.528
 547850 547851 plu0415 plu0416     FALSE 0.225 330.000 0.000 1.000 Y 0.901
 547851 547852 plu0416 plu0417     TRUE 0.983 15.000 0.000 1.000 Y 0.993
 547852 547853 plu0417 plu0418     TRUE 0.826 124.000 0.000 0.008 Y 0.654
 547856 547857 plu0421 plu0422   slyD TRUE 0.868 89.000 0.370 NA   0.819
 547859 547860 plu0424 plu0425 fkpA   FALSE 0.387 282.000 0.310 NA   0.765
 547860 547861 plu0425 plu0426     TRUE 0.990 0.000 0.220 NA   0.386
 547861 547862 plu0426 plu0427     TRUE 0.999 10.000 0.790 NA Y 0.457
 547862 547863 plu0427 plu0428     TRUE 0.999 21.000 0.804 NA Y 0.239
 547863 547864 plu0428 plu0429   rpsL FALSE 0.179 137.000 0.058 NA N 0.855
 547864 547865 plu0429 plu0430 rpsL rpsG TRUE 0.989 98.000 0.620 0.003 Y 0.325
 547865 547866 plu0430 plu0431 rpsG fusA TRUE 0.976 81.000 0.579 1.000 Y 0.633
 547866 547867 plu0431 plu0432 fusA tufB TRUE 0.882 73.000 0.003 0.001 Y NA
 547867 547868 plu0432 plu0433 tufB secE FALSE 0.029 275.000 0.000 1.000 N NA
 547868 547869 plu0433 plu0434 secE nusG TRUE 0.998 2.000 0.843 1.000 N 0.925
 547869 547870 plu0434 plu0435 nusG rplK TRUE 0.825 162.000 0.681 1.000 N 0.265
 547870 547871 plu0435 plu0436 rplK rplA TRUE 1.000 4.000 0.838 0.020 Y 0.508
 547871 547872 plu0436 plu0437 rplA rplJ TRUE 0.729 317.000 0.302 0.020 Y 0.536
 547872 547873 plu0437 plu0438 rplJ rplL TRUE 0.996 64.000 0.884 0.015 Y 0.378
 547873 547874 plu0438 plu0439 rplL rpoB FALSE 0.197 340.000 0.223 1.000   -0.438
 547874 547875 plu0439 plu0440 rpoB rpoC TRUE 0.977 131.000 0.851 0.001   0.493
 547877 547878 plu0442 plu0443     TRUE 0.925 17.000 0.000 NA   0.883
 547878 547879 plu0443 plu0444     TRUE 0.556 124.000 0.000 0.048   0.973
 547881 547882 plu0446 plu0447     TRUE 0.950 13.000 0.000 1.000   0.812
 547882 547883 plu0447 plu0448     TRUE 0.965 0.000 0.000 1.000   0.625
 547883 547884 plu0448 plu0449     FALSE 0.026 482.000 0.000 NA   0.612
 547884 547885 plu0449 plu0450     TRUE 0.952 11.000 0.000 NA   0.736
 547885 547886 plu0450 plu0451     TRUE 0.964 2.000 0.000 NA   0.952
 547886 547887 plu0451 plu0452     TRUE 0.954 11.000 0.000 NA   0.902
 547888 547889 plu0453 plu0454     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 547889 547890 plu0454 plu0455   malM TRUE 0.468 63.000 0.000 NA   NA
 547890 547891 plu0455 plu0456 malM lamB FALSE 0.131 249.000 0.057 1.000   0.660
 547891 547892 plu0456 plu0457 lamB malK TRUE 0.966 37.000 0.044 0.059 Y 0.817
 547893 547894 plu0458 plu0459 malE malF TRUE 0.675 122.000 0.040 1.000 Y 0.761
 547894 547895 plu0459 plu0460 malF malG TRUE 1.000 13.000 0.814 0.045 Y 0.650
 547897 547898 plu0462 plu0463     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 547898 547899 plu0463 plu0464     TRUE 0.997 17.000 0.800 NA   NA
 547899 547900 plu0464 plu0465     TRUE 0.983 35.000 0.600 NA   NA
 547900 547901 plu0465 plu0466     TRUE 0.981 38.000 0.600 NA   NA
 547901 547902 plu0466 plu0467     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   NA
 547903 547904 plu0468 plu0469 ISPlu10J malQ FALSE 0.002 1315.000 0.000 1.000 N NA
 547904 547905 plu0469 plu0470 malQ malP TRUE 0.994 10.000 0.039 0.017 Y 0.429
 547908 547909 plu0473 plu0474     TRUE 0.997 0.000 0.227 1.000 Y 0.601
 547909 547910 plu0474 plu0475     TRUE 0.987 5.000 0.182 1.000   0.664
 547910 547911 plu0475 plu0476     TRUE 0.898 72.000 0.400 1.000   0.964
 547911 547912 plu0476 plu0477     TRUE 0.922 15.000 0.033 NA   0.997
 547912 547913 plu0477 plu0478   ISPlu3Z FALSE 0.104 228.000 0.000 NA   NA
 547914 547915 plu0479 plu0480     FALSE 0.076 312.000 0.000 NA   0.862
 547915 547916 plu0480 plu0481   thiH FALSE 0.034 405.000 0.000 NA   -0.184
 547916 547917 plu0481 plu0482 thiH thiG TRUE 0.988 48.000 0.277 0.003 Y 0.896
 547917 547918 plu0482 plu0483 thiG thiS TRUE 0.986 2.000 0.008 1.000 Y -0.961
 547918 547919 plu0483 plu0484 thiS thiF TRUE 0.988 -3.000 0.057 1.000 Y -0.938
 547919 547920 plu0484 plu0485 thiF thiE TRUE 0.996 11.000 0.242 1.000 Y 0.971
 547920 547921 plu0485 plu0486 thiE thiC TRUE 0.988 -16.000 0.063 0.003 Y 0.928
 547921 547922 plu0486 plu0487 thiC   FALSE 0.039 300.000 0.000 1.000 N 0.761
 547923 547924 plu0488 plu0489 nudC hemE FALSE 0.199 113.000 0.040 1.000 N 0.970
 547924 547925 plu0489 plu0490 hemE nfi TRUE 0.890 5.000 0.028 1.000 N 0.981
 547925 547926 plu0490 plu0491 nfi   TRUE 0.538 77.000 0.086 NA   0.461
 547926 547927 plu0491 plu0492   dbhA TRUE 0.613 187.000 0.355 NA   -0.399
 547927 547928 plu0492 plu0493 dbhA   TRUE 0.995 6.000 0.375 NA   0.744
 547929 547930 plu0494 plu0495 purD purH TRUE 0.992 22.000 0.238 1.000 Y 0.985
 547931 547932 plur004 plut004 16s_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 547932 547933 plut004 plur005 tRNA-Glu 23s_rRNA FALSE 0.146 188.000 0.000 NA   NA
 547933 547934 plur005 plur006 23s_rRNA 5s_rRNA FALSE 0.287 120.000 0.000 NA   NA
 547934 547935 plur006 plu0496 5s_rRNA gntR FALSE 0.006 1240.000 0.000 NA   NA
 547935 547936 plu0496 plu0497 gntR gntK FALSE 0.120 169.000 0.000 1.000 N 0.846
 547936 547937 plu0497 plu0498 gntK gntU TRUE 0.999 0.000 0.500 1.000 Y 0.934
 547938 547939 plu0499 plu0500     FALSE 0.136 211.000 0.000 NA   0.186
 547939 547940 plu0500 plu0501     TRUE 0.995 -13.000 0.440 0.014   0.894
 547940 547941 plu0501 plu0502     TRUE 0.974 -13.000 0.244 1.000   0.958
 547941 547942 plu0502 plu0503   bax FALSE 0.133 206.000 0.000 1.000   -0.922
 547942 547943 plu0503 plu0504 bax   FALSE 0.007 1268.000 0.000 1.000   -0.101
 547943 547944 plu0504 plu0505     TRUE 0.952 12.000 0.000 1.000   0.731
 547944 547945 plu0505 plu0506     TRUE 0.998 26.000 0.857 1.000 Y 0.619
 547945 547946 plu0506 plu0507     TRUE 0.979 68.000 0.571 1.000 Y 0.534
 547946 547947 plu0507 plu0508     FALSE 0.010 833.000 0.000 NA   0.720
 547947 547948 plu0508 plu0509     TRUE 0.998 -3.000 0.679 NA   0.687
 547948 547949 plu0509 plu0510     TRUE 0.991 0.000 0.227 NA   0.500
 547949 547950 plu0510 plu0511     TRUE 0.773 33.000 0.000 NA   -0.629
 547951 547952 plu0512 plu0513     FALSE 0.090 247.000 0.000 NA   NA
 547952 547953 plu0513 plu0514   tcaZ FALSE 0.011 629.000 0.000 NA   NA
 547954 547955 plu0515 plu0516 tcaC   TRUE 0.530 65.000 0.000 NA   0.908
 547958 547959 plu0519 plu0520   deoC FALSE 0.227 327.000 0.000 1.000 Y 0.792
 547959 547960 plu0520 plu0521 deoC deoB FALSE 0.197 200.000 0.028 0.050 N 0.916
 547960 547961 plu0521 plu0522 deoB deoD TRUE 0.844 83.000 0.414 1.000 N 0.819
 547962 547963 plu0523 plu0524     TRUE 0.994 18.000 0.133 0.022 Y 0.943
 547963 547964 plu0524 plu0525     FALSE 0.027 330.000 0.000 1.000 N 0.501
 547964 547965 plu0525 plu0526     TRUE 0.836 -39.000 0.000 NA   0.873
 547965 547966 plu0526 plu0527     FALSE 0.025 495.000 0.000 NA   0.983
 547966 547967 plu0527 plu0528     TRUE 0.961 4.000 0.000 NA   0.980
 547968 547969 plu0529 plu0530     TRUE 0.394 78.000 0.000 NA   NA
 547969 547970 plu0530 plu0531     FALSE 0.203 155.000 0.000 NA   NA
 547970 547971 plu0531 plu0532     TRUE 0.895 18.000 0.000 NA   NA
 547971 547972 plu0532 plu0533     FALSE 0.289 133.000 0.000 NA   0.425
 547973 547974 plu0534 plu0535     FALSE 0.099 237.000 0.000 NA   -0.887
 547974 547975 plu0535 plu0536     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547975 547976 plu0536 plu0537     FALSE 0.183 165.000 0.000 NA   NA
 547976 547977 plu0537 plu0538     FALSE 0.051 335.000 0.000 NA   -0.555
 547977 547978 plu0538 plu0539     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   -0.801
 547978 547979 plu0539 plu0540     FALSE 0.189 164.000 0.000 NA   -0.824
 547979 547980 plu0540 plu0541     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.811
 547980 547981 plu0541 plu0542     TRUE 0.422 70.000 0.000 NA   NA
 547981 547982 plu0542 plu0543     FALSE 0.015 552.000 0.000 NA   NA
 547982 547983 plu0543 plu0544     TRUE 0.989 -13.000 0.147 0.091 Y NA
 547984 547985 plu0545 plu0546     FALSE 0.357 99.000 0.000 NA   NA
 547986 547987 plu0547 plu0548     TRUE 0.944 9.000 0.000 NA   NA
 547987 547988 plu0548 plu0549     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 547988 547989 plu0549 plu0550   smp FALSE 0.010 737.000 0.000 NA   0.121
 547990 547991 plu0551 plu0552 serB radA FALSE 0.114 147.000 0.024 1.000 N 0.883
 547991 547992 plu0552 plu0553 radA nadR TRUE 0.811 14.000 0.021 1.000 N 0.663
 547992 547993 plu0553 plu0554 nadR   FALSE 0.006 681.000 0.000 1.000 N 0.730
 547995 547996 plu0556 plu0557 slt trpR TRUE 0.670 60.000 0.167 1.000 N 0.709
 548002 548003 plu0563 plu0564 thrA thrB TRUE 0.995 3.000 0.133 1.000 Y 0.966
 548003 548004 plu0564 plu0565 thrB thrC TRUE 0.997 4.000 0.233 1.000 Y 0.945
 548006 548007 plu0567 plu0568   talB FALSE 0.013 724.000 0.000 1.000   0.745
 548007 548008 plu0568 plu0569 talB mog FALSE 0.207 82.000 0.042 1.000 N -0.466
 548008 548009 plu0569 plu0570 mog   FALSE 0.106 138.000 0.000 1.000 N NA
 548009 548010 plu0570 plu0571     FALSE 0.027 436.000 0.000 1.000   NA
 548010 548011 plu0571 plu0572     TRUE 0.959 6.000 0.000 NA   0.972
 548011 548012 plu0572 plu0573   ISPlu6K TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 548012 548013 plu0573 plu0574 ISPlu6K   TRUE 0.775 -60.000 0.000 NA   NA
 548013 548014 plu0574 plu0575   galT FALSE 0.036 409.000 0.000 NA   0.535
 548014 548015 plu0575 plu0576 galT galK TRUE 0.995 -7.000 0.370 0.001 N 0.839
 548015 548016 plu0576 plu0577 galK galM TRUE 0.982 33.000 0.051 0.001 Y 0.900
 548018 548019 plu0579 plu0580 dnaK dnaJ TRUE 0.951 114.000 0.236 0.004 Y 0.771
 548020 548021 plu0581 plu0582   bglB TRUE 0.691 29.000 0.000 1.000 N 0.990
 548021 548022 plu0582 plu0583 bglB bglF TRUE 0.790 76.000 0.000 1.000 Y 0.849
 548023 548024 plu0584 plu0585 bglG   TRUE 0.428 230.000 0.250 1.000   0.989
 548024 548025 plu0585 plu0586     FALSE 0.041 358.000 0.000 NA   NA
 548025 548026 plu0586 plu0587   nhaA FALSE 0.013 596.000 0.000 NA   NA
 548026 548027 plu0587 plu0588 nhaA nhaR FALSE 0.363 224.000 0.292 1.000 N 0.621
 548029 548030 plu0590 plu0591 ribF ileS TRUE 0.955 25.000 0.254 1.000 N 0.919
 548030 548031 plu0591 plu0592 ileS lspA TRUE 0.926 0.000 0.045 1.000 N 0.796
 548031 548032 plu0592 plu0593 lspA fkpB TRUE 0.973 6.000 0.154 1.000 N 0.843
 548032 548033 plu0593 plu0594 fkpB lytB TRUE 0.987 -19.000 0.626 1.000 N 0.493
 548036 548037 plu0597 plu0598     TRUE 0.994 -15.000 0.514 0.091   0.940
 548037 548038 plu0598 plu0599     TRUE 0.598 55.000 0.000 NA   0.942
 548038 548039 plu0599 plu0600     TRUE 0.991 -7.000 0.385 NA   0.955
 548040 548041 plu0601 plu0602   dapB FALSE 0.076 270.000 0.000 NA   NA
 548041 548042 plu0602 plu0603 dapB carA FALSE 0.102 436.000 0.034 1.000 Y -0.380
 548042 548043 plu0603 plu0604 carA carB TRUE 0.999 16.000 0.345 0.001 Y 0.802
 548046 548047 plu0607 plu0608 apaH apaG TRUE 0.987 3.000 0.267 NA N 0.209
 548047 548048 plu0608 plu0609 apaG ksgA TRUE 0.908 13.000 0.078 NA N 0.537
 548048 548049 plu0609 plu0610 ksgA pdxA TRUE 0.964 -7.000 0.197 1.000 N 0.800
 548049 548050 plu0610 plu0611 pdxA surA TRUE 0.989 -22.000 0.561 1.000   0.890
 548050 548051 plu0611 plu0612 surA imp TRUE 0.749 70.000 0.182 1.000   0.570
 548053 548054 plu0614 plu0615 rluA hepA TRUE 0.741 97.000 0.294 1.000 N 0.944
 548054 548055 plu0615 plu0616 hepA   FALSE 0.134 198.000 0.000 NA   NA
 548055 548056 plu0616 plu0617   thiQ FALSE 0.080 266.000 0.000 NA   NA
 548056 548057 plu0617 plu0618 thiQ thiP TRUE 0.994 -13.000 0.522 0.017 N 0.877
 548057 548058 plu0618 plu0619 thiP tbpA TRUE 0.994 -24.000 0.697 0.058 N 0.637
 548059 548060 plu0620 plu0621 nudH ptsP TRUE 0.855 10.000 0.012 1.000 N 0.880
 548060 548061 plu0621 plu0622 ptsP lgt FALSE 0.177 76.000 0.008 1.000 N 0.826
 548061 548062 plu0622 plu0623 lgt thyA TRUE 0.972 -3.000 0.164 1.000 N 0.860
 548062 548063 plu0623 plu0624 thyA   FALSE 0.328 128.000 0.000 NA   0.932
 548063 548064 plu0624 plu0625     TRUE 0.997 -3.000 0.556 NA   0.984
 548064 548065 plu0625 plu0626   ppdA FALSE 0.026 480.000 0.000 NA   0.691
 548065 548066 plu0626 plu0627 ppdA ppdB TRUE 0.854 168.000 0.368 NA Y -0.530
 548066 548067 plu0627 plu0628 ppdB   TRUE 0.994 6.000 0.373 NA   -0.774
 548067 548068 plu0628 plu0629   ppdC TRUE 0.993 -9.000 0.538 NA   -0.761
 548068 548069 plu0629 plu0630 ppdC recC TRUE 0.848 -7.000 0.076 NA N -0.733
 548069 548070 plu0630 plu0631 recC ptrA TRUE 0.914 16.000 0.092 1.000 N 0.918
 548070 548071 plu0631 plu0632 ptrA recB TRUE 0.946 -3.000 0.092 1.000 N 0.766
 548071 548072 plu0632 plu0633 recB recD TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.001 Y -0.068
 548072 548073 plu0633 plu0634 recD   FALSE 0.010 866.000 0.000 0.098 N -0.298
 548073 548074 plu0634 plu0635     TRUE 0.850 142.000 0.426 0.011 N 0.889
 548074 548075 plu0635 plu0636     FALSE 0.320 110.000 0.000 NA   NA
 548075 548076 plu0636 plu0637     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 548076 548077 plu0637 plu0638     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 548077 548078 plu0638 plu0639     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 548078 548079 plu0639 plu0640     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 548079 548080 plu0640 plu0641     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 548080 548081 plu0641 plu0642     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 548081 548082 plu0642 plu0643     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 548085 548086 plu0646 plu0647     TRUE 0.998 -3.000 0.833 NA   NA
 548086 548087 plu0647 plut005   tRNA-Met FALSE 0.068 290.000 0.000 NA   NA
 548087 548088 plut005 plut006 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.785 30.000 0.000 NA   NA
 548088 548089 plut006 plut007 tRNA-Met tRNA-Met FALSE 0.379 90.000 0.000 NA   NA
 548090 548091 plu0648 plu0649 mltA   FALSE 0.294 49.000 0.021 1.000 N 0.093
 548092 548093 plu0650 plu0651   csdA TRUE 0.982 21.000 0.122 0.002   0.585
 548094 548095 plu0652 plu0653 gcvA   TRUE 0.575 61.000 0.081 NA   -0.741
 548095 548096 plu0653 plu0654     TRUE 0.961 -7.000 0.144 NA   -0.334
 548096 548097 plu0654 plu0655   prtA FALSE 0.008 1185.000 0.000 NA   0.866
 548097 548098 plu0655 plu0656 prtA inh TRUE 0.690 55.000 0.095 1.000   0.377
 548098 548099 plu0656 plu0657 inh prtB TRUE 0.620 60.000 0.071 1.000   0.578
 548099 548100 plu0657 plu0658 prtB prtC TRUE 0.975 61.000 0.562 0.011   0.407
 548100 548101 plu0658 plu0659 prtC prtD TRUE 0.997 0.000 0.375 0.011 N 0.693
 548102 548103 plu0660 plu0661 xni   TRUE 0.743 64.000 0.178 NA   -0.480
 548103 548104 plu0661 plu0662     FALSE 0.354 123.000 0.079 NA   -0.703
 548105 548106 plu0663 plu0664 syd   FALSE 0.017 524.000 0.000 NA   -0.854
 548106 548107 plu0664 plu0665     TRUE 0.997 2.000 0.518 NA   -0.790
 548110 548111 plu0668 plu0669   dapD FALSE 0.115 215.000 0.035 NA   -0.139
 548111 548112 plu0669 plu0670 dapD glnD FALSE 0.192 172.000 0.097 1.000 N 0.935
 548112 548113 plu0670 plu0671 glnD map TRUE 0.541 138.000 0.243 1.000 N 0.658
 548114 548115 plu0672 plu0673 rpsB tsf TRUE 0.966 151.000 0.748 1.000 Y 0.857
 548115 548116 plu0673 plu0674 tsf pyrH TRUE 0.670 155.000 0.416 1.000 N 0.428
 548116 548117 plu0674 plu0675 pyrH frr TRUE 0.862 119.000 0.626 1.000 N -0.796
 548117 548118 plu0675 plu0676 frr dxr FALSE 0.024 267.000 0.032 1.000 N -0.873
 548118 548119 plu0676 plu0677 dxr uppS FALSE 0.378 215.000 0.025 1.000 Y 0.574
 548119 548120 plu0677 plu0678 uppS cdsA TRUE 0.998 10.000 0.400 1.000 Y 0.833
 548120 548121 plu0678 plu0679 cdsA ecfE TRUE 0.775 29.000 0.080 1.000 N 0.981
 548121 548122 plu0679 plu0680 ecfE yaeT TRUE 0.978 35.000 0.204 1.000 Y 0.936
 548122 548123 plu0680 plu0681 yaeT hlpA TRUE 0.935 111.000 0.354 1.000 Y 0.869
 548123 548124 plu0681 plu0682 hlpA lpxD TRUE 1.000 4.000 0.814 1.000 Y 0.963
 548124 548125 plu0682 plu0683 lpxD fabZ TRUE 0.861 163.000 0.796 1.000 N 0.595
 548125 548126 plu0683 plu0684 fabZ lpxA TRUE 0.998 4.000 0.850 1.000 N 0.557
 548126 548127 plu0684 plu0685 lpxA lpxB TRUE 0.994 20.000 0.289 1.000 Y 0.914
 548127 548128 plu0685 plu0686 lpxB rnhB TRUE 0.982 0.000 0.186 1.000 N 0.928
 548128 548129 plu0686 plu0687 rnhB dnaE TRUE 0.901 54.000 0.104 1.000 Y 0.936
 548129 548130 plu0687 plu0688 dnaE accA TRUE 0.944 14.000 0.122 1.000 N 0.911
 548130 548131 plu0688 plu0689 accA mesJ FALSE 0.067 339.000 0.123 1.000 N 0.879
 548134 548135 plu0692 plu0693 proS   FALSE 0.339 126.000 0.048 NA   0.958
 548135 548136 plu0693 plu0694   rcsF TRUE 0.989 -3.000 0.247 NA   0.341
 548136 548137 plu0694 plu0695 rcsF metQ TRUE 0.828 143.000 0.500 NA   0.643
 548137 548138 plu0695 plu0696 metQ metI TRUE 0.967 66.000 0.411 NA Y 0.853
 548138 548139 plu0696 plu0697 metI metN TRUE 0.998 -7.000 0.584 1.000 Y 0.880
 548140 548141 plu0698 plur007   16s_rRNA FALSE 0.034 385.000 0.000 NA   NA
 548141 548142 plur007 plut008 16s_rRNA tRNA-Ile TRUE 0.422 70.000 0.000 NA   NA
 548142 548143 plut008 plut009 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.249 133.000 0.000 NA   NA
 548143 548144 plut009 plur008 tRNA-Ala 23s_rRNA FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 548144 548145 plur008 plur009 23s_rRNA 5s_rRNA FALSE 0.295 118.000 0.000 NA   NA
 548145 548146 plur009 plut010 5s_rRNA tRNA-Asp FALSE 0.127 203.000 0.000 NA   NA
 548146 548147 plut010 plu0699 tRNA-Asp   FALSE 0.234 140.000 0.000 NA   NA
 548151 548152 plu0703 plu0704 cysJ cysI TRUE 1.000 0.000 0.791 0.001 Y 0.921
 548152 548153 plu0704 plu0705 cysI cysH TRUE 0.956 -3.000 0.116 1.000 N 0.838
 548154 548155 plu0706 plu0707     TRUE 0.982 -3.000 0.154 NA   0.980
 548156 548157 plu0708 plu0709 cysG cysD TRUE 0.998 10.000 0.417 1.000 Y 0.999
 548157 548158 plu0709 plu0710 cysD cysN TRUE 0.968 69.000 0.574 0.001 N 0.977
 548158 548159 plu0710 plu0711 cysN cysC TRUE 0.998 2.000 0.340 1.000 Y 0.920
 548159 548160 plu0711 plu0712 cysC   FALSE 0.044 147.000 0.013 1.000 N -0.881
 548160 548161 plu0712 plu0713   ispD TRUE 0.974 6.000 0.185 1.000 N -0.736
 548161 548162 plu0713 plu0714 ispD ispF TRUE 0.998 14.000 0.419 1.000 Y 0.743
 548162 548163 plu0714 plu0715 ispF   TRUE 0.986 4.000 0.173 1.000   0.699
 548163 548164 plu0715 plu0716   surE TRUE 0.962 -22.000 0.235 1.000   0.667
 548164 548165 plu0716 plu0717 surE pcm TRUE 0.992 -6.000 0.353 1.000   0.730
 548165 548166 plu0717 plu0718 pcm nlpD FALSE 0.073 152.000 0.030 1.000 N -0.649
 548166 548167 plu0718 plu0719 nlpD rpoS TRUE 0.627 52.000 0.142 1.000 N -0.727
 548168 548169 plu0720 plu0721 ISPlu3Y miaE FALSE 0.008 482.000 0.000 1.000 N NA
 548169 548170 plu0721 plu0722 miaE mutS TRUE 0.652 5.000 0.004 1.000 N -0.927
 548171 548172 plu0723 plu0724     TRUE 0.926 26.000 0.157 NA   NA
 548174 548175 plu0726 plu0727     TRUE 0.549 57.000 0.061 NA   -0.997
 548175 548176 plu0727 plu0728     FALSE 0.023 441.000 0.000 NA   -0.985
 548176 548177 plu0728 plu0729     FALSE 0.051 204.000 0.000 1.000 N -0.974
 548177 548178 plu0729 plu0730     FALSE 0.114 215.000 0.000 NA   NA
 548178 548179 plu0730 plu0731     FALSE 0.016 540.000 0.000 NA   NA
 548182 548183 plu0734 plu0735     FALSE 0.025 460.000 0.000 NA   -0.315
 548183 548184 plu0735 plu0736     FALSE 0.019 497.000 0.000 NA   -0.747
 548184 548185 plu0736 plu0737     FALSE 0.016 544.000 0.000 NA   -0.557
 548187 548188 plu0739 plu0740     TRUE 0.743 87.000 0.000 NA Y -0.336
 548188 548189 plu0740 plu0741     TRUE 0.986 -21.000 0.625 NA N 0.932
 548190 548191 plu0742 plu0743     FALSE 0.025 497.000 0.000 NA   0.751
 548191 548192 plu0743 plu0744     TRUE 0.480 85.000 0.000 1.000   0.832
 548192 548193 plu0744 plu0745     FALSE 0.024 522.000 0.000 1.000   0.703
 548193 548194 plu0745 plu0746     TRUE 0.986 15.000 0.263 NA   0.984
 548194 548195 plu0746 plu0747     TRUE 0.995 0.000 0.336 NA   0.856
 548195 548196 plu0747 plu0748     TRUE 0.980 21.000 0.276 NA   0.984
 548196 548197 plu0748 plu0749     TRUE 0.998 11.000 0.780 NA   0.955
 548197 548198 plu0749 plu0750     TRUE 0.977 -13.000 0.282 NA   0.980
 548198 548199 plu0750 plu0751     FALSE 0.021 544.000 0.000 NA   0.947
 548200 548201 plu0752 plu0753     FALSE 0.025 341.000 0.000 NA N 0.748
 548201 548202 plu0753 plu0754     TRUE 0.960 6.000 0.000 NA   0.822
 548202 548203 plu0754 plu0755     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   0.978
 548203 548204 plu0755 plu0756     FALSE 0.061 340.000 0.000 NA   0.794
 548204 548205 plu0756 plu0757     TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y 0.891
 548205 548206 plu0757 plu0758     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA N 0.708
 548206 548207 plu0758 plu0759     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA N 0.987
 548207 548208 plu0759 plu0760     TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000 N 0.805
 548208 548209 plu0760 plu0761     TRUE 0.725 26.000 0.000 1.000 N 0.996
 548209 548210 plu0761 plu0762     TRUE 0.956 5.000 0.105 1.000 N 0.964
 548210 548211 plu0762 plu0763     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   0.959
 548211 548212 plu0763 plu0764     TRUE 0.954 11.000 0.000 NA   0.900
 548212 548213 plu0764 plu0765     TRUE 0.964 2.000 0.000 NA   0.901
 548213 548214 plu0765 plu0766     FALSE 0.012 706.000 0.000 NA   0.605
 548214 548215 plu0766 plu0767     FALSE 0.144 200.000 0.000 NA   -0.221
 548215 548216 plu0767 plu0768   mrfI FALSE 0.007 1259.000 0.000 NA   0.021
 548217 548218 plu0769 plu0770 mrfA mrfB TRUE 0.891 84.000 0.000 0.008 Y 0.780
 548218 548219 plu0770 plu0771 mrfB mrfC TRUE 0.978 20.000 0.000 1.000 Y 0.858
 548219 548220 plu0771 plu0772 mrfC mrfD TRUE 0.930 124.000 0.400 1.000 Y 0.832
 548220 548221 plu0772 plu0773 mrfD mrfX TRUE 0.966 25.000 0.000 1.000 Y 0.805
 548221 548222 plu0773 plu0774 mrfX mrfE TRUE 0.992 -7.000 0.000 0.008 Y 0.916
 548222 548223 plu0774 plu0775 mrfE mrfF TRUE 0.996 15.000 0.571 NA   0.949
 548223 548224 plu0775 plu0776 mrfF mrfG TRUE 0.995 12.000 0.429 NA   0.993
 548224 548225 plu0776 plu0777 mrfG mrfH TRUE 0.846 28.000 0.000 NA   0.869
 548225 548226 plu0777 plu0778 mrfH mrfJ TRUE 0.819 31.000 0.000 NA   0.981
 548226 548227 plu0778 plu0779 mrfJ   FALSE 0.011 847.000 0.000 1.000   0.898
 548227 548228 plu0779 plu0780     FALSE 0.379 118.000 0.000 1.000   0.950
 548228 548229 plu0780 plu0781     TRUE 0.957 0.000 0.000 1.000   NA
 548229 548230 plu0781 plu0782     TRUE 0.771 34.000 0.000 1.000   NA
 548230 548231 plu0782 plu0783     TRUE 0.980 31.000 0.000 0.005 Y 0.942
 548231 548232 plu0783 plu0784     TRUE 0.745 84.000 0.000 1.000 Y NA
 548232 548233 plu0784 plu0785     FALSE 0.221 147.000 0.000 NA   NA
 548233 548234 plu0785 plu0786     FALSE 0.054 324.000 0.000 NA   -0.560
 548234 548235 plu0786 plu0787     TRUE 0.440 102.000 0.000 1.000   0.856
 548235 548236 plu0787 plu0788     TRUE 0.968 0.000 0.000 1.000   0.898
 548236 548237 plu0788 plu0789     TRUE 0.795 34.000 0.000 1.000   0.100
 548237 548238 plu0789 plu0790     TRUE 0.979 31.000 0.000 0.005 Y 0.559
 548238 548239 plu0790 plu0791     TRUE 0.781 83.000 0.000 1.000 Y 0.946
 548239 548240 plu0791 plu0792     TRUE 0.449 93.000 0.000 NA   0.922
 548241 548242 plu0793 plu0794     TRUE 0.930 17.000 0.000 1.000   0.827
 548242 548243 plu0794 plu0795     FALSE 0.276 179.000 0.100 1.000   -0.035
 548243 548244 plu0795 plu0796     TRUE 0.962 3.000 0.000 1.000   0.390
 548244 548245 plu0796 plu0797     TRUE 0.966 3.000 0.000 1.000   0.819
 548245 548246 plu0797 plu0798     FALSE 0.004 911.000 0.000 1.000 N 0.600
 548247 548248 plu0799 plu0800 tnaA mtr TRUE 0.747 111.000 0.077 1.000 Y 0.392
 548250 548251 plu0802 plu0803     FALSE 0.123 167.000 0.000 1.000 N 0.883
 548251 548252 plu0803 plu0804     FALSE 0.056 350.000 0.000 NA   0.659
 548252 548253 plu0804 plu0805   tccA3 FALSE 0.102 262.000 0.000 NA   0.670
 548253 548254 plu0805 plu0806 tccA3 tccB3 TRUE 0.655 49.000 0.000 NA   0.963
 548254 548255 plu0806 plu0807 tccB3   TRUE 0.417 102.000 0.000 NA   0.802
 548256 548257 plu0808 plu0809     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.737
 548257 548258 plu0809 plu0810   afuC FALSE 0.233 154.000 0.000 NA   0.142
 548258 548259 plu0810 plu0811 afuC afuB TRUE 0.993 16.000 0.381 0.043 N 0.925
 548259 548260 plu0811 plu0812 afuB afuA TRUE 0.984 122.000 0.667 0.043 Y 0.943
 548260 548261 plu0812 plu0813 afuA uhpC TRUE 0.994 14.000 0.407 0.043 N 0.541
 548261 548262 plu0813 plu0814 uhpC uhpB TRUE 0.944 89.000 0.611 0.074 N 0.585
 548262 548263 plu0814 plu0815 uhpB uhpA TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.010 Y 0.919
 548265 548266 plu0817 plu0818     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   NA
 548266 548267 plu0818 plu0819     TRUE 0.982 37.000 0.600 NA   NA
 548267 548268 plu0819 plu0820     TRUE 0.997 17.000 0.800 NA   NA
 548268 548269 plu0820 plu0821     TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 548269 548270 plu0821 plu0822     FALSE 0.012 603.000 0.000 NA   NA
 548270 548271 plu0822 plu0823     TRUE 0.391 81.000 0.000 NA   NA
 548271 548272 plu0823 plu0824     TRUE 0.811 27.000 0.000 NA   NA
 548272 548273 plu0824 plu0825     TRUE 0.998 5.000 0.800 NA   NA
 548273 548274 plu0825 plu0826     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 548275 548276 plu0827 plu0828     TRUE 0.485 60.000 0.000 NA   NA
 548276 548277 plu0828 plu0829     FALSE 0.377 92.000 0.000 NA   NA
 548277 548278 plu0829 plu0830     TRUE 0.791 34.000 0.000 1.000   -0.089
 548280 548281 plu0832 plu0833 agaR agaZ TRUE 0.973 36.000 0.182 1.000 Y 0.368
 548281 548282 plu0833 plu0834 agaZ agaS TRUE 0.982 -3.000 0.250 1.000 N -0.935
 548282 548283 plu0834 plu0835 agaS agaV TRUE 0.942 -34.000 0.286 1.000 N -0.399
 548283 548284 plu0835 plu0836 agaV agaC TRUE 1.000 11.000 0.905 0.008 Y -0.449
 548284 548285 plu0836 plu0837 agaC agaD TRUE 0.994 -10.000 0.143 0.008 Y 0.557
 548285 548286 plu0837 plu0838 agaD   TRUE 0.986 23.000 0.000 0.008 Y -0.292
 548286 548287 plu0838 plu0839   gatY TRUE 0.987 10.000 0.000 1.000 Y -0.714
 548287 548288 plu0839 plu0840 gatY   TRUE 0.936 25.000 0.130 1.000   0.791
 548288 548289 plu0840 plu0841     TRUE 0.651 88.000 0.000 0.037   -0.479
 548290 548291 plu0842 plu0843 speD speE TRUE 0.965 39.000 0.162 1.000 Y 0.998
 548291 548292 plu0843 plu0844 speE   TRUE 0.823 113.000 0.354 NA   0.930
 548293 548294 plu0845 plu0846 cueO   FALSE 0.096 269.000 0.000 NA   0.581
 548294 548295 plu0846 plu0847     TRUE 0.959 7.000 0.000 NA   0.932
 548295 548296 plu0847 plu0848     FALSE 0.185 191.000 0.000 NA   0.847
 548296 548297 plu0848 plu0849     FALSE 0.015 546.000 0.000 NA   NA
 548297 548298 plu0849 plu0850     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 548299 548300 plu0851 plu0852     FALSE 0.175 190.000 0.000 NA   0.582
 548300 548301 plu0852 plu0853     TRUE 0.960 6.000 0.000 NA   0.941
 548301 548302 plu0853 plu0854   ISPlu1F TRUE 0.827 -18.000 0.000 NA   NA
 548302 548303 plu0854 plu0855 ISPlu1F   TRUE 0.417 71.000 0.000 NA   NA
 548303 548304 plu0855 plu0856     TRUE 0.885 -10.000 0.000 NA   -0.722
 548304 548305 plu0856 plu0857     FALSE 0.206 160.000 0.000 NA   -0.503
 548305 548306 plu0857 plu0858     TRUE 0.921 14.000 0.000 NA   NA
 548307 548308 plu0859 plu0860     FALSE 0.019 370.000 0.000 1.000 N 0.152
 548308 548309 plu0860 plu0861     FALSE 0.117 221.000 0.000 1.000   NA
 548309 548310 plu0861 plu0862     TRUE 0.952 5.000 0.000 1.000   NA
 548310 548311 plu0862 plu0863     FALSE 0.253 140.000 0.000 NA   -0.224
 548311 548312 plu0863 plu0864     FALSE 0.047 335.000 0.000 NA   NA
 548313 548314 plu0865 plu0866     TRUE 0.980 11.000 0.154 NA   0.959
 548314 548315 plu0866 plu0867     FALSE 0.007 1520.000 0.000 NA   0.770
 548316 548317 plu0868 plu0869 yadG yadH TRUE 1.000 12.000 0.688 0.095 Y 0.945
 548318 548319 plu0870 plu0871 panD panC TRUE 0.958 68.000 0.342 1.000 Y 0.890
 548319 548320 plu0871 plu0872 panC panB TRUE 0.997 27.000 0.395 0.001 Y 0.951
 548320 548321 plu0872 plu0873 panB folK TRUE 0.859 71.000 0.117 1.000 Y 0.967
 548321 548322 plu0873 plu0874 folK pcnB TRUE 0.985 6.000 0.234 1.000 N 0.788
 548322 548323 plu0874 plu0875 pcnB   TRUE 0.974 28.000 0.131 1.000 Y 0.604
 548323 548324 plu0875 plu0876   dksA TRUE 0.766 63.000 0.231 1.000 N 0.910
 548324 548325 plu0876 plu0877 dksA sfsA FALSE 0.341 196.000 0.151 NA   0.921
 548325 548326 plu0877 plu0878 sfsA   FALSE 0.172 172.000 0.000 NA   NA
 548326 548327 plu0878 plu0879   cpmK TRUE 0.693 40.000 0.000 NA   NA
 548327 548328 plu0879 plu0880 cpmK cpmJ TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548328 548329 plu0880 plu0881 cpmJ cpmI TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 548330 548331 plu0882 plu0883 hrpB mrcB TRUE 0.542 94.000 0.158 1.000 N 0.709
 548331 548332 plu0883 plu0884 mrcB   FALSE 0.022 485.000 0.000 1.000   -0.824
 548332 548333 plu0884 plu0885     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.886
 548333 548334 plu0885 plu0886     TRUE 0.465 82.000 0.000 NA   0.810
 548334 548335 plu0886 plu0887     TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   0.898
 548335 548336 plu0887 plu0888     TRUE 0.958 8.000 0.000 NA   0.769
 548336 548337 plu0888 plu0889     TRUE 0.499 58.000 0.000 NA   NA
 548337 548338 plu0889 plu0890     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA   NA
 548338 548339 plu0890 plu0891     TRUE 0.530 65.000 0.000 NA   0.910
 548339 548340 plu0891 plu0892     TRUE 0.511 62.000 0.000 NA   0.083
 548340 548341 plu0892 plu0893     FALSE 0.095 262.000 0.000 NA   0.229
 548341 548342 plu0893 plu0894     FALSE 0.387 106.000 0.000 NA   0.548
 548342 548343 plu0894 plu0895     FALSE 0.283 128.000 0.000 NA   -0.353
 548343 548344 plu0895 plu0896     TRUE 0.965 -6.000 0.128 NA   0.547
 548344 548345 plu0896 plu0897     FALSE 0.011 793.000 0.000 NA   0.946
 548345 548346 plu0897 plu0898     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.007 Y 0.497
 548346 548347 plu0898 plu0899     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.001 Y 0.955
 548350 548351 plu0902 plu0903 hemL   TRUE 0.631 51.000 0.000 NA   0.804
 548353 548354 plu0905 plu0906 btuF mtnA FALSE 0.111 206.000 0.073 1.000 N 0.900
 548357 548358 plu0909 plu0910 rumA relA TRUE 0.658 42.000 0.082 1.000 N 0.742
 548358 548359 plu0910 plu0911 relA mazG TRUE 0.512 68.000 0.040 1.000   0.759
 548359 548360 plu0911 plu0912 mazG pyrG FALSE 0.112 222.000 0.025 1.000   0.352
 548360 548361 plu0912 plu0913 pyrG eno FALSE 0.368 74.000 0.068 1.000 N 0.907
 548361 548362 plu0913 plu0914 eno   FALSE 0.013 677.000 0.000 NA   0.691
 548362 548363 plu0914 plu0915     FALSE 0.115 191.000 0.019 NA   -0.566
 548363 548364 plu0915 plu0916     TRUE 0.854 23.000 0.019 1.000   0.224
 548364 548365 plu0916 plu0917     FALSE 0.016 560.000 0.000 1.000   NA
 548366 548367 plu0918 plu0919     TRUE 0.685 161.000 0.000 0.045 Y NA
 548367 548368 plu0919 plu0920     FALSE 0.334 322.000 0.000 0.045 Y NA
 548368 548369 plu0920 plu0921     FALSE 0.379 301.000 0.000 0.045 Y NA
 548369 548370 plu0921 plu0922     FALSE 0.342 318.000 0.000 0.045 Y NA
 548370 548371 plu0922 plu0923     FALSE 0.170 286.000 0.000 0.045   NA
 548371 548372 plu0923 plu0924     TRUE 0.393 162.000 0.000 0.045   NA
 548372 548373 plu0924 plu0925     TRUE 0.685 161.000 0.000 0.045 Y NA
 548376 548377 plu0928 plu0929     TRUE 0.992 -130.000 0.800 NA   -0.641
 548378 548379 plu0930 plu0931     FALSE 0.006 1007.000 0.000 NA   NA
 548380 548381 plu0932 plu0933     TRUE 0.999 6.000 1.000 NA   0.818
 548381 548382 plu0933 plu0934     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000   0.993
 548382 548383 plu0934 plu0935     TRUE 0.999 3.000 1.000 1.000   0.983
 548383 548384 plu0935 plu0936     TRUE 0.863 128.000 0.500 1.000   0.984
 548384 548385 plu0936 plu0937     TRUE 0.691 50.000 0.065 1.000   0.987
 548386 548387 plu0938 plu0939   mltD FALSE 0.014 649.000 0.000 NA   0.583
 548387 548388 plu0939 plu0940 mltD gloB TRUE 0.789 72.000 0.233 1.000   -0.595
 548391 548392 plu0943 plut011 dnaQ tRNA-Asp FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 548393 548394 plu0944 plu0945     FALSE 0.016 573.000 0.000 1.000   -0.498
 548396 548397 plu0947 plu0948     FALSE 0.081 381.000 0.118 1.000   0.550
 548397 548398 plu0948 plu0949     TRUE 0.399 298.000 0.000 0.054 Y 0.128
 548399 548400 plu0950 plu0951     TRUE 0.781 38.000 0.000 1.000   0.632
 548400 548401 plu0951 plu0952     TRUE 0.955 9.000 0.000 NA   0.597
 548401 548402 plu0952 plu0953     TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 548402 548403 plu0953 plu0954     TRUE 0.933 12.000 0.000 NA   NA
 548403 548404 plu0954 plu0955   epd FALSE 0.019 495.000 0.000 NA   -0.969
 548404 548405 plu0955 plu0956 epd pgk TRUE 0.910 84.000 0.070 0.005 Y 0.957
 548405 548406 plu0956 plu0957 pgk fba TRUE 0.918 63.000 0.056 0.005 Y -0.849
 548407 548408 plu0958 plu0959     TRUE 0.976 56.000 0.750 1.000   0.686
 548408 548409 plu0959 plu0960   tccC2 FALSE 0.025 463.000 0.000 NA   -0.159
 548409 548410 plu0960 plu0961 tccC2 tcdB1 FALSE 0.018 581.000 0.000 NA   0.770
 548410 548411 plu0961 plu0962 tcdB1 tcdA1 TRUE 0.624 53.000 0.000 1.000   0.984
 548413 548414 plu0964 plu0965 tccC5 tcdA4 FALSE 0.193 193.000 0.000 1.000   0.927
 548416 548417 plu0967 plu0968 tccC3 tchA FALSE 0.220 149.000 0.000 NA   -0.848
 548417 548418 plu0968 plu0969 tchA tcdB2 TRUE 0.544 53.000 0.000 NA   -0.870
 548418 548419 plu0969 plu0970 tcdB2 tcdA2 TRUE 0.601 57.000 0.000 1.000   0.819
 548419 548420 plu0970 plu0971 tcdA2 tcdA5 FALSE 0.022 473.000 0.000 NA   -0.519
 548422 548423 plu0973 plu0974   hpaC FALSE 0.023 470.000 0.000 1.000   NA
 548423 548424 plu0974 plu0975 hpaC hpaB TRUE 0.970 20.000 0.000 0.002   NA
 548424 548425 plu0975 plu0976 hpaB tccC4 FALSE 0.026 322.000 0.000 1.000 N 0.105
 548425 548426 plu0976 plu0977 tccC4   FALSE 0.032 268.000 0.000 1.000 N -0.841
 548426 548427 plu0977 plu0978     FALSE 0.009 725.000 0.000 NA   -0.903
 548427 548428 plu0978 plu0979     FALSE 0.013 612.000 0.000 NA   -0.624
 548428 548429 plu0979 plu0980   hpaA FALSE 0.033 438.000 0.000 NA   0.878
 548429 548430 plu0980 plu0981 hpaA hpaX TRUE 0.945 26.000 0.233 1.000 N 0.921
 548430 548431 plu0981 plu0982 hpaX hpaI TRUE 0.865 97.000 0.175 1.000 Y -0.466
 548431 548432 plu0982 plu0983 hpaI hpcG TRUE 0.992 12.000 0.439 1.000 N -0.254
 548432 548433 plu0983 plu0984 hpcG gabD TRUE 0.975 5.000 0.075 0.060 N 0.726
 548433 548434 plu0984 plu0985 gabD   TRUE 0.912 -10.000 0.136 1.000 N -0.268
 548434 548435 plu0985 plu0986   hpcD TRUE 0.871 3.000 0.039 1.000 N -0.716
 548435 548436 plu0986 plu0987 hpcD hpcB TRUE 0.990 14.000 0.330 1.000   0.026
 548436 548437 plu0987 plu0988 hpcB hpcC TRUE 0.894 65.000 0.378 1.000   -0.462
 548437 548438 plu0988 plu0989 hpcC hpaG2 TRUE 0.997 0.000 0.510 0.060 N -0.931
 548438 548439 plu0989 plu0990 hpaG2 hpaG1 TRUE 1.000 -3.000 0.618 0.001 Y 0.806
 548441 548442 plu0992 plu0993 ngrA phfB TRUE 0.496 46.000 0.000 1.000 N 0.981
 548442 548443 plu0993 plu0994 phfB phfA FALSE 0.111 408.000 0.000 0.007   0.992
 548443 548444 plu0994 plu0995 phfA phfD TRUE 0.850 28.000 0.000 1.000   0.987
 548444 548445 plu0995 plu0996 phfD phfC TRUE 0.990 6.000 0.000 1.000 Y 0.763
 548445 548446 plu0996 plu0997 phfC phfS TRUE 0.832 57.000 0.000 1.000 Y -0.614
 548447 548448 plu0998 plu0999     FALSE 0.018 546.000 0.000 NA   0.336
 548448 548449 plu0999 plu1000     TRUE 0.983 11.000 0.167 1.000   0.929
 548449 548450 plu1000 plu1001     TRUE 0.988 29.000 0.286 0.001   0.402
 548450 548451 plu1001 plu1002     FALSE 0.064 317.000 0.000 1.000   -0.368
 548451 548452 plu1002 plu1003     FALSE 0.155 125.000 0.000 1.000 N 0.136
 548452 548453 plu1003 plu1004     TRUE 0.627 35.000 0.000 1.000 N 0.612
 548453 548454 plu1004 plu1005     FALSE 0.385 55.000 0.000 1.000 N 0.618
 548456 548457 plu1007 plu1008     FALSE 0.013 591.000 0.000 NA   NA
 548457 548458 plu1008 plu1009     FALSE 0.320 110.000 0.000 NA   NA
 548459 548460 plu1010 plu1011     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 548460 548461 plu1011 plu1012     TRUE 0.857 -16.000 0.000 NA   0.280
 548462 548463 plu1013 plu1014     FALSE 0.068 288.000 0.000 NA   NA
 548464 548465 plu1015 plu1016     FALSE 0.071 283.000 0.000 NA   NA
 548465 548466 plu1016 plu1017     FALSE 0.377 92.000 0.000 NA   NA
 548468 548469 plu1019 plu1020     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548469 548470 plu1020 plu1021     FALSE 0.246 134.000 0.000 NA   NA
 548471 548472 plu1022 plu1023     TRUE 0.776 55.000 0.000 0.017   NA
 548472 548473 plu1023 plu1024     TRUE 0.975 27.000 0.000 0.087 Y 0.218
 548473 548474 plu1024 plu1025     TRUE 0.824 -64.000 0.000 NA   0.918
 548474 548475 plu1025 plu1026     TRUE 0.570 50.000 0.000 NA   NA
 548475 548476 plu1026 plu1027     FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 548476 548477 plu1027 plu1028     FALSE 0.013 700.000 0.000 NA   0.944
 548477 548478 plu1028 plu1029     TRUE 0.394 78.000 0.000 NA   NA
 548478 548479 plu1029 plu1030     FALSE 0.006 535.000 0.000 1.000 N NA
 548479 548480 plu1030 plu1031     TRUE 0.918 -7.000 0.100 1.000 N 0.934
 548480 548481 plu1031 plu1032     TRUE 0.995 -3.000 0.250 0.087   0.992
 548481 548482 plu1032 plu1033     TRUE 0.930 -7.000 0.040 1.000   0.882
 548482 548483 plu1033 plu1034     TRUE 0.463 64.000 0.000 NA   -0.892
 548483 548484 plu1034 plu1035     FALSE 0.136 229.000 0.000 NA   0.907
 548484 548485 plu1035 plu1036     FALSE 0.093 269.000 0.000 NA   0.424
 548485 548486 plu1036 plu1037     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   0.517
 548486 548487 plu1037 plu1038     FALSE 0.012 660.000 0.000 NA   0.174
 548487 548488 plu1038 plu1039     TRUE 0.448 74.000 0.000 NA   0.302
 548489 548490 plu1040 plu1041     FALSE 0.062 302.000 0.000 NA   NA
 548490 548491 plu1041 plu1042     TRUE 0.866 -13.000 0.000 NA   -0.431
 548491 548492 plu1042 plu1043     TRUE 0.944 13.000 0.000 NA   0.730
 548493 548494 plu1044 plu1045     FALSE 0.016 534.000 0.000 NA   NA
 548496 548497 plu1047 plu1048     TRUE 0.879 24.000 0.000 NA   0.728
 548497 548498 plu1048 plu1049   pilL FALSE 0.220 148.000 0.000 NA   -0.898
 548498 548499 plu1049 plu1050 pilL pilM TRUE 0.951 7.000 0.000 NA   -0.237
 548499 548500 plu1050 plu1051 pilM pilN TRUE 0.911 19.000 0.000 NA   0.558
 548500 548501 plu1051 plu1052 pilN pilO TRUE 0.881 24.000 0.000 NA   0.961
 548501 548502 plu1052 plu1053 pilO pilP TRUE 0.950 8.000 0.000 NA   -0.319
 548502 548503 plu1053 plu1054 pilP pilQ TRUE 0.940 14.000 0.000 NA   0.756
 548503 548504 plu1054 plu1055 pilQ pilR TRUE 0.981 -7.000 0.000 1.000 Y 0.561
 548504 548505 plu1055 plu1056 pilR pilS TRUE 0.965 69.000 0.800 NA   -0.321
 548505 548506 plu1056 plu1057 pilS pilU TRUE 0.960 1.000 0.000 NA   0.332
 548506 548507 plu1057 plu1058 pilU pilV TRUE 0.507 66.000 0.000 NA   0.637
 548507 548508 plu1058 plu1059 pilV   FALSE 0.042 357.000 0.000 NA   NA
 548508 548509 plu1059 plu1060     TRUE 0.917 -6.000 0.000 NA   NA
 548509 548510 plu1060 plu1061   IS_Pl3_3 TRUE 0.789 64.000 0.000 NA Y NA
 548510 548511 plu1061 plu1062 IS_Pl3_3   TRUE 0.763 33.000 0.000 NA   NA
 548511 548512 plu1062 plu1063     FALSE 0.108 221.000 0.000 NA   NA
 548513 548514 plu1064 plu1065     TRUE 0.965 3.000 0.061 NA   0.381
 548515 548516 plu1066 plu1067     FALSE 0.034 384.000 0.000 NA   NA
 548516 548517 plu1067 plu1068     TRUE 0.989 3.000 0.222 NA   -0.423
 548517 548518 plu1068 plu1069     TRUE 0.973 30.000 0.400 NA   -0.956
 548518 548519 plu1069 plu1070     TRUE 0.960 6.000 0.000 NA   0.883
 548519 548520 plu1070 plu1071     FALSE 0.380 104.000 0.000 NA   0.242
 548522 548523 plu1073 plu1074     TRUE 0.843 -19.000 0.000 NA   0.158
 548524 548525 plu1075 plu1076     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   -0.964
 548525 548526 plu1076 plu1077     TRUE 0.766 -120.000 0.000 NA   NA
 548527 548528 plu1078 plu1079     TRUE 0.987 -3.000 0.222 NA   NA
 548528 548529 plu1079 plu1080     TRUE 0.745 40.000 0.000 NA   0.676
 548529 548530 plu1080 plu1081     TRUE 0.913 19.000 0.000 NA   0.678
 548530 548531 plu1081 plu1082     FALSE 0.014 650.000 0.000 NA   0.993
 548531 548532 plu1082 plu1083     TRUE 0.927 -10.000 0.105 NA   -0.975
 548532 548533 plu1083 plu1084     TRUE 0.854 -13.000 0.000 NA   -0.995
 548533 548534 plu1084 plu1085     TRUE 0.971 -3.000 0.125 NA   -0.949
 548534 548535 plu1085 plu1086     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA   0.402
 548535 548536 plu1086 plu1087     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   -0.451
 548536 548537 plu1087 plu1088     TRUE 0.995 16.000 0.611 NA   -0.118
 548537 548538 plu1088 plu1089     TRUE 0.996 0.000 0.444 NA   -0.268
 548538 548539 plu1089 plu1090     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   -0.630
 548541 548542 plu1092 plu1093     TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 548543 548544 plu1094 plu1095     TRUE 0.614 47.000 0.000 NA   NA
 548545 548546 plu1096 plu1097     FALSE 0.101 232.000 0.000 NA   NA
 548547 548548 plu1098 plu1099     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 548548 548549 plu1099 plu1101     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 548549 548550 plu1101 plu1102     TRUE 0.782 -48.000 0.000 NA   NA
 548551 548552 plu1103 plu1104     TRUE 0.540 53.000 0.000 NA   NA
 548552 548553 plu1104 plu1105     TRUE 0.997 22.000 0.500 NA Y 0.004
 548553 548554 plu1105 plu1106     FALSE 0.051 244.000 0.000 1.000 N 0.344
 548556 548557 plu1108 plu1109     FALSE 0.249 133.000 0.000 NA   NA
 548557 548558 plu1109 plu1110     FALSE 0.157 181.000 0.000 NA   NA
 548558 548559 plu1110 plu1111     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.958
 548559 548560 plu1111 plu1112     TRUE 0.784 -45.000 0.000 NA   NA
 548560 548561 plu1112 plu1113     FALSE 0.015 554.000 0.000 NA   NA
 548561 548562 plu1113 plu1114   ISPlu9H TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 548562 548563 plu1114 plu1115 ISPlu9H   TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 548566 548567 plu1118 plu1119     FALSE 0.149 186.000 0.000 NA   NA
 548567 548568 plu1119 plu1120     TRUE 0.933 12.000 0.000 NA   NA
 548568 548569 plu1120 plu1121     TRUE 0.944 9.000 0.000 NA   NA
 548569 548570 plu1121 plu1122     FALSE 0.235 142.000 0.000 NA   -0.811
 548570 548571 plu1122 plu1123     TRUE 0.943 -3.000 0.000 NA   -0.879
 548571 548572 plu1123 plu1124     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 548572 548573 plu1124 plu1125     FALSE 0.036 376.000 0.000 NA   NA
 548573 548574 plu1125 plu1126     TRUE 0.989 -13.000 0.147 0.085 Y NA
 548575 548576 plu1127 plu1128     FALSE 0.374 93.000 0.000 NA   NA
 548577 548578 plu1129 plu1130     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548578 548579 plu1130 plu1131     FALSE 0.022 465.000 0.000 NA   NA
 548579 548580 plu1131 plu1132     TRUE 0.427 75.000 0.000 NA   -0.221
 548580 548581 plu1132 plu1133     TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA   -0.697
 548581 548582 plu1133 plu1134     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 548582 548583 plu1134 plu1135     FALSE 0.015 552.000 0.000 NA   NA
 548583 548584 plu1135 plu1136     TRUE 0.989 -13.000 0.147 0.085 Y NA
 548585 548586 plu1137 plu1138     FALSE 0.357 99.000 0.000 NA   NA
 548587 548588 plu1139 plu1140     TRUE 0.944 9.000 0.000 NA   NA
 548588 548589 plu1140 plu1141     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 548591 548592 plu1143 plu1144     TRUE 0.938 -13.000 0.147 NA   NA
 548592 548593 plu1144 plu1145     TRUE 0.739 36.000 0.000 NA   NA
 548594 548595 plu1146 plu1147     FALSE 0.357 99.000 0.000 NA   NA
 548596 548597 plu1148 plu1149     TRUE 0.944 9.000 0.000 NA   NA
 548597 548598 plu1149 plu1150     TRUE 0.862 49.000 0.000 NA Y NA
 548599 548600 plu1151 plu1152     FALSE 0.034 390.000 0.000 NA   -0.779
 548600 548601 plu1152 plu1153     FALSE 0.023 443.000 0.000 NA   NA
 548601 548602 plu1153 plu1154     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA   NA
 548602 548603 plu1154 plu1155     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   0.269
 548603 548604 plu1155 plu1156     TRUE 0.997 0.000 0.500 NA   0.881
 548604 548605 plu1156 plu1157     TRUE 0.904 78.000 0.500 NA   -0.835
 548605 548606 plu1157 plu1158     TRUE 0.828 68.000 0.250 NA   0.985
 548606 548607 plu1158 plu1159     TRUE 0.767 100.000 0.250 NA   0.436
 548607 548608 plu1159 plu1160     TRUE 0.459 66.000 0.000 NA   -0.661
 548608 548609 plu1160 plu1161     FALSE 0.380 89.000 0.000 NA   NA
 548609 548610 plu1161 plu1162     FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 548610 548611 plu1162 plu1163     FALSE 0.249 148.000 0.000 NA   0.222
 548611 548612 plu1163 plu1164     FALSE 0.246 134.000 0.000 NA   NA
 548612 548613 plu1164 plu1165     FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 548613 548614 plu1165 plu1166     FALSE 0.370 95.000 0.000 NA   NA
 548615 548616 plut012 plu1167 tRNA-Phe mltC FALSE 0.192 161.000 0.000 NA   NA
 548616 548617 plu1167 plu1168 mltC   TRUE 0.475 64.000 0.128 NA N NA
 548617 548618 plu1168 plu1169   mutY TRUE 0.827 31.000 0.150 NA N NA
 548619 548620 plu1170 plu1171     TRUE 0.976 0.000 0.092 NA   0.817
 548620 548621 plu1171 plu1172     TRUE 0.612 80.000 0.123 NA   0.602
 548621 548622 plu1172 plu1173     TRUE 0.685 48.000 0.059 NA   0.483
 548622 548623 plu1173 plu1174     TRUE 0.557 118.000 0.148 NA   0.416
 548624 548625 plu1175 plu1176     FALSE 0.013 621.000 0.000 NA   -0.311
 548625 548626 plu1176 plu1177     TRUE 0.965 -7.000 0.218 1.000 N -0.101
 548626 548627 plu1177 plu1178     TRUE 0.804 27.000 0.005 1.000   0.975
 548627 548628 plu1178 plu1179   proC TRUE 0.966 19.000 0.152 1.000   0.953
 548628 548629 plu1179 plu1180 proC   TRUE 0.917 26.000 0.125 NA   0.378
 548631 548632 plu1182 plu1183     TRUE 0.988 1.000 0.263 NA N 0.596
 548632 548633 plu1183 plu1184   gshB FALSE 0.381 110.000 0.120 NA N 0.862
 548633 548634 plu1184 plu1185 gshB   TRUE 0.981 10.000 0.173 NA   -0.648
 548636 548637 plu1187 plu1188     TRUE 0.923 32.000 0.157 1.000   0.975
 548642 548643 plu1193 plu1194 lcpA   TRUE 0.615 150.000 0.229 1.000   0.676
 548645 548646 plu1196 plu1197 nqrA nqrB TRUE 1.000 5.000 0.854 0.002 Y 0.785
 548646 548647 plu1197 plu1198 nqrB nqrC TRUE 0.999 -7.000 0.603 0.002 Y 0.905
 548647 548648 plu1198 plu1199 nqrC nqrD TRUE 0.998 -7.000 0.312 0.002 Y 0.994
 548648 548649 plu1199 plu1200 nqrD nqrE TRUE 0.998 9.000 0.188 0.002 Y -0.138
 548649 548650 plu1200 plu1201 nqrE nqrF TRUE 0.999 16.000 0.551 0.002 Y -0.178
 548650 548651 plu1201 plu1202 nqrF apbE TRUE 0.877 80.000 0.519 1.000 N -0.221
 548651 548652 plu1202 plu1203 apbE   TRUE 0.993 17.000 0.481 NA   0.497
 548653 548654 plu1204 plu1205     FALSE 0.176 170.000 0.000 NA   NA
 548654 548655 plu1205 plu1206     FALSE 0.148 187.000 0.000 NA   NA
 548655 548656 plu1206 plu1207     TRUE 0.499 58.000 0.000 NA   NA
 548656 548657 plu1207 plu1208     TRUE 0.720 38.000 0.000 NA   NA
 548657 548658 plu1208 plu1209     TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 548659 548660 plu1210 plu1211     TRUE 0.956 -21.000 0.000 1.000 Y 0.063
 548660 548661 plu1211 plu1212     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.010 Y 0.343
 548661 548662 plu1212 plu1213     TRUE 0.995 3.000 0.000 0.010 Y -0.108
 548662 548663 plu1213 plu1214     TRUE 0.926 2.000 0.000 1.000 N 0.856
 548663 548664 plu1214 plu1215     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.008 Y -0.053
 548664 548665 plu1215 plu1216     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548665 548666 plu1216 plu1217     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548666 548667 plu1217 plu1218     TRUE 0.925 0.000 0.000 1.000 N 0.966
 548667 548668 plu1218 plu1219     TRUE 0.904 -3.000 0.000 1.000 N 0.667
 548668 548669 plu1219 plu1220     TRUE 0.987 10.000 0.000 1.000 Y -0.597
 548669 548670 plu1220 plu1221     FALSE 0.240 163.000 0.000 NA   0.893
 548670 548671 plu1221 plu1222   ISPlu13C FALSE 0.059 307.000 0.000 NA   NA
 548672 548673 plu1223 plu1224     TRUE 0.931 -19.000 0.143 NA   0.984
 548675 548676 plu1226 plu1227     TRUE 0.995 13.000 0.520 NA   -0.921
 548676 548677 plu1227 plu1228     TRUE 0.976 -12.000 0.282 NA   -0.707
 548677 548678 plu1228 plu1229     TRUE 0.999 0.000 0.944 1.000   -0.492
 548678 548679 plu1229 plu1230     TRUE 0.998 13.000 0.623 0.058   0.629
 548679 548680 plu1230 plu1231     TRUE 0.994 24.000 0.660 1.000   0.991
 548680 548681 plu1231 plu1232     TRUE 0.993 30.000 0.791 NA   0.309
 548683 548684 plu1234 plu1235     FALSE 0.262 82.000 0.000 1.000 N 0.526
 548684 548685 plu1235 plu1236     FALSE 0.008 569.000 0.000 1.000 N 0.968
 548685 548686 plu1236 plu1237     TRUE 0.948 5.000 0.000 NA   NA
 548686 548687 plu1237 plu1238   hemR FALSE 0.037 373.000 0.000 NA   NA
 548690 548691 plu1241 plu1242 gpt   TRUE 0.927 15.000 0.060 NA   -0.852
 548691 548692 plu1242 plu1243   proB FALSE 0.176 198.000 0.000 NA   0.852
 548692 548693 plu1243 plu1244 proB proA TRUE 0.996 10.000 0.026 0.001 Y 0.918
 548693 548694 plu1244 plu1245 proA aroL FALSE 0.260 301.000 0.000 1.000 Y 0.413
 548694 548695 plu1245 plu1246 aroL aas FALSE 0.248 100.000 0.000 1.000 N 0.747
 548695 548696 plu1246 plu1247 aas   TRUE 0.968 13.000 0.124 NA   0.309
 548696 548697 plu1247 plu1248     TRUE 0.836 26.000 0.026 NA   0.938
 548697 548698 plu1248 plu1249   recA TRUE 0.412 123.000 0.082 NA   0.781
 548698 548699 plu1249 plu1250 recA alaS FALSE 0.058 391.000 0.054 0.090 N 0.854
 548699 548700 plu1250 plu1251 alaS csrA FALSE 0.019 247.000 0.020 1.000 N NA
 548700 548701 plu1251 plut013 csrA tRNA-Ser FALSE 0.033 391.000 0.000 NA   NA
 548701 548702 plut013 plut014 tRNA-Ser tRNA-Arg TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 548702 548703 plut014 plut015 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.382 88.000 0.000 NA   NA
 548703 548704 plut015 plut016 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.383 87.000 0.000 NA   NA
 548704 548705 plut016 plu1252 tRNA-Arg gshA FALSE 0.055 316.000 0.000 NA   NA
 548705 548706 plu1252 plu1253 gshA luxS FALSE 0.170 153.000 0.087 1.000 N -0.545
 548707 548708 plu1254 plu1255     TRUE 0.780 130.000 0.349 NA   0.917
 548709 548710 plu1256 plu1257 ffh rpsP TRUE 0.654 137.000 0.361 1.000 N -0.706
 548710 548711 plu1257 plu1258 rpsP rimM TRUE 0.998 19.000 0.342 0.013 Y -0.132
 548711 548712 plu1258 plu1259 rimM trmD TRUE 0.995 40.000 0.672 1.000 Y 0.444
 548712 548713 plu1259 plu1260 trmD rplS TRUE 0.979 65.000 0.567 1.000 Y 0.215
 548713 548714 plu1260 plu1261 rplS   FALSE 0.022 504.000 0.000 1.000   0.023
 548714 548715 plu1261 plu1262   aroF FALSE 0.020 547.000 0.000 1.000   0.523
 548715 548716 plu1262 plu1263 aroF tyrA TRUE 0.990 6.000 0.038 1.000 Y 0.875
 548717 548718 plu1264 plu1265   pheA FALSE 0.025 469.000 0.000 1.000   -0.667
 548718 548719 plu1265 plu1266 pheA   FALSE 0.021 270.000 0.015 NA N 0.502
 548719 548720 plu1266 plu1267     FALSE 0.061 288.000 0.004 NA   0.921
 548721 548722 plu1268 plu1269 rluD   TRUE 0.986 1.000 0.168 NA   0.325
 548722 548723 plu1269 plu1270   clpB FALSE 0.378 134.000 0.108 NA   -0.575
 548723 548724 plu1270 plur010 clpB 16s_rRNA FALSE 0.024 439.000 0.000 NA   NA
 548724 548725 plur010 plut017 16s_rRNA tRNA-Ile TRUE 0.429 69.000 0.000 NA   NA
 548725 548726 plut017 plut018 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 548726 548727 plut018 plur011 tRNA-Ala 23s_rRNA FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 548727 548728 plur011 plur012 23s_rRNA 5s_rRNA FALSE 0.295 118.000 0.000 NA   NA
 548729 548730 plu1271 plu1272 pssA   TRUE 0.431 161.000 0.121 0.058 N 0.878
 548730 548731 plu1272 plu1273     TRUE 0.823 -19.000 0.000 NA   -0.861
 548733 548734 plu1275 plu1276 emrB emrA TRUE 0.997 15.000 0.875 1.000 N 0.576
 548734 548735 plu1276 plu1277 emrA mprA FALSE 0.101 234.000 0.107 1.000 N -0.113
 548735 548736 plu1277 plu1278 mprA   FALSE 0.324 130.000 0.065 NA   -0.162
 548736 548737 plu1278 plu1279     TRUE 0.999 -3.000 0.915 NA   0.748
 548737 548738 plu1279 plu1280     FALSE 0.203 126.000 0.060 NA N 0.811
 548738 548739 plu1280 plu1281   proX FALSE 0.164 376.000 0.174 0.040 N 0.877
 548739 548740 plu1281 plu1282 proX proW TRUE 0.992 70.000 0.695 0.040 Y 0.944
 548740 548741 plu1282 plu1283 proW proV TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.072 Y 0.934
 548741 548742 plu1283 plu1284 proV nrdF FALSE 0.007 598.000 0.000 1.000 N 0.481
 548742 548743 plu1284 plu1285 nrdF nrdE TRUE 0.996 21.000 0.190 0.001 Y -0.376
 548743 548744 plu1285 plu1286 nrdE nrdI TRUE 0.996 3.000 0.216 NA Y 0.012
 548744 548745 plu1286 plu1287 nrdI nrdH TRUE 0.993 8.000 0.440 NA N 0.057
 548746 548747 plu1288 plu1289 ogt cspE FALSE 0.031 216.000 0.027 1.000 N -0.880
 548748 548749 plu1290 plu1291 crcB lipA FALSE 0.059 140.000 0.004 1.000 N 0.238
 548749 548750 plu1291 plu1292 lipA lipB TRUE 0.971 111.000 0.319 0.001 Y 0.804
 548750 548751 plu1292 plu1293 lipB   TRUE 0.584 144.000 0.219 NA   0.224
 548751 548752 plu1293 plu1294   dacA FALSE 0.335 141.000 0.081 NA   0.366
 548752 548753 plu1294 plu1295 dacA rlpA TRUE 0.860 205.000 0.475 NA Y 0.758
 548753 548754 plu1295 plu1296 rlpA rodA TRUE 0.845 14.000 0.035 NA N 0.935
 548754 548755 plu1296 plu1297 rodA pbpA TRUE 0.915 9.000 0.046 1.000 N 0.925
 548755 548756 plu1297 plu1298 pbpA   TRUE 0.685 41.000 0.031 NA   0.313
 548756 548757 plu1298 plu1299     TRUE 0.993 3.000 0.307 NA   -0.099
 548757 548758 plu1299 plu1300   nadD FALSE 0.303 108.000 0.032 NA   -0.725
 548758 548759 plu1300 plu1301 nadD holA TRUE 0.758 -16.000 0.045 1.000 N 0.836
 548759 548760 plu1301 plu1302 holA rlpB TRUE 0.978 -3.000 0.199 NA N 0.937
 548760 548761 plu1302 plu1303 rlpB leuS TRUE 0.966 14.000 0.182 NA N 0.830
 548761 548762 plu1303 plu1304 leuS gltL FALSE 0.205 163.000 0.002 0.090 N 0.837
 548762 548763 plu1304 plu1305 gltL gltK TRUE 0.998 0.000 0.379 1.000 Y 0.977
 548763 548764 plu1305 plu1306 gltK gltJ TRUE 1.000 1.000 0.933 0.016 Y 0.988
 548764 548765 plu1306 plu1307 gltJ gltI TRUE 0.872 133.000 0.150 0.040 Y 0.975
 548765 548766 plu1307 plu1308 gltI lnt FALSE 0.009 563.000 0.000 1.000 N 0.881
 548766 548767 plu1308 plu1309 lnt corC TRUE 0.996 8.000 0.557 1.000 N 0.570
 548767 548768 plu1309 plu1310 corC   TRUE 0.676 73.000 0.150 NA   0.432
 548768 548769 plu1310 plu1311     TRUE 0.996 -3.000 0.457 NA   0.624
 548769 548770 plu1311 plu1312   miaB TRUE 0.970 16.000 0.220 1.000 N 0.952
 548772 548773 plut019 plut020 tRNA-Gln tRNA-Met TRUE 0.947 6.000 0.000 NA   NA
 548773 548774 plut020 plut021 tRNA-Met tRNA-Gln TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 548774 548775 plut021 plut022 tRNA-Gln tRNA-Gln TRUE 0.540 53.000 0.000 NA   NA
 548775 548776 plut022 plut023 tRNA-Gln tRNA-Leu TRUE 0.793 29.000 0.000 NA   NA
 548776 548777 plut023 plut024 tRNA-Leu tRNA-Met TRUE 0.947 6.000 0.000 NA   NA
 548777 548778 plut024 plu1315 tRNA-Met nagC FALSE 0.210 152.000 0.000 NA   NA
 548778 548779 plu1315 plu1316 nagC nagA TRUE 0.998 16.000 0.571 1.000 Y 0.812
 548779 548780 plu1316 plu1317 nagA nagB TRUE 0.990 85.000 0.557 0.001 Y 0.375
 548780 548781 plu1317 plu1318 nagB nagE FALSE 0.269 278.000 0.022 1.000 Y 0.725
 548784 548785 plu1321 plu1322     FALSE 0.025 1543.000 0.000 NA Y -0.402
 548785 548786 plu1322 plu1323     FALSE 0.006 618.000 0.000 1.000 N 0.044
 548786 548787 plu1323 plu1324   chb FALSE 0.049 694.000 0.000 1.000 Y 0.224
 548787 548788 plu1324 plu1325 chb dinJ FALSE 0.020 321.000 0.000 NA N -0.578
 548788 548789 plu1325 plu1326 dinJ   TRUE 0.980 -13.000 0.308 NA   0.972
 548790 548791 plu1327 plu1328 fur fldA FALSE 0.076 366.000 0.156 1.000 N 0.958
 548791 548792 plu1328 plu1329 fldA   TRUE 0.762 175.000 0.473 1.000   0.676
 548792 548793 plu1329 plu1330     TRUE 0.490 139.000 0.000 0.067   0.761
 548793 548794 plu1330 plu1331     FALSE 0.267 350.000 0.400 1.000 N 0.805
 548794 548795 plu1331 plu1332   rtxD TRUE 0.997 3.000 0.085 0.010 Y 0.723
 548795 548796 plu1332 plu1333 rtxD rtxB TRUE 0.992 -7.000 0.000 0.010 Y 0.751
 548797 548798 plu1334 plu1335   rtxC TRUE 0.997 22.000 0.846 NA   0.747
 548798 548799 plu1335 plu1336 rtxC   FALSE 0.295 118.000 0.000 NA   NA
 548799 548800 plu1336 plu1337     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 548800 548801 plu1337 plu1338   ISPlu2E FALSE 0.127 203.000 0.000 NA   NA
 548801 548802 plu1338 plu1339 ISPlu2E   FALSE 0.013 600.000 0.000 NA   NA
 548802 548803 plu1339 plu1340     TRUE 0.634 45.000 0.000 NA   NA
 548803 548804 plu1340 plu1341     FALSE 0.020 551.000 0.000 NA   0.903
 548804 548805 plu1341 plu1342     FALSE 0.011 780.000 0.000 NA   0.604
 548805 548806 plu1342 plu1343     TRUE 0.824 -37.000 0.000 NA   0.495
 548806 548807 plu1343 plu1344     FALSE 0.009 720.000 0.000 NA   NA
 548807 548808 plu1344 plu1345   ISPlu11D FALSE 0.142 200.000 0.000 1.000   NA
 548809 548810 plu1346 plu1347     FALSE 0.148 187.000 0.000 NA   NA
 548810 548811 plu1347 plu1348     TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 548811 548812 plu1348 plu1349     FALSE 0.014 568.000 0.000 NA   NA
 548812 548813 plu1349 plu1350     TRUE 0.785 30.000 0.000 NA   NA
 548813 548814 plu1350 plu1351     TRUE 0.959 4.000 0.000 NA   0.606
 548814 548815 plu1351 plu1352     FALSE 0.079 274.000 0.000 NA   -0.600
 548815 548816 plu1352 plu1353     TRUE 0.605 48.000 0.000 NA   NA
 548816 548817 plu1353 plu1354     TRUE 0.679 41.000 0.000 NA   NA
 548817 548818 plu1354 plu1355     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   -0.522
 548818 548819 plu1355 plu1356     TRUE 0.828 -52.000 0.000 NA   0.940
 548819 548820 plu1356 plu1357     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 548820 548821 plu1357 plu1358     TRUE 0.764 -231.000 0.000 NA   NA
 548821 548822 plu1358 plu1359     FALSE 0.040 361.000 0.000 NA   NA
 548822 548823 plu1359 plu1360     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 548823 548824 plu1360 plu1361   ISPlu9G TRUE 0.857 23.000 0.000 NA   NA
 548824 548825 plu1361 plu1362 ISPlu9G   TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 548826 548827 plu1363 plu1364     FALSE 0.374 93.000 0.000 NA   NA
 548828 548829 plu1365 plu1366     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548829 548830 plu1366 plu1367     FALSE 0.010 702.000 0.000 NA   NA
 548830 548831 plu1367 plu1368     TRUE 0.862 49.000 0.000 NA Y NA
 548832 548833 plu1369 plu1370     FALSE 0.008 1242.000 0.000 1.000   0.472
 548833 548834 plu1370 plu1371   pbpC TRUE 0.972 57.000 0.711 1.000   0.991
 548834 548835 plu1371 plu1372 pbpC ndk FALSE 0.027 220.000 0.008 1.000 N 0.241
 548835 548836 plu1372 plu1373 ndk   FALSE 0.364 183.000 0.156 1.000   0.007
 548836 548837 plu1373 plu1374     TRUE 0.406 117.000 0.067 1.000   0.306
 548837 548838 plu1374 plu1375     TRUE 0.559 122.000 0.153 1.000   0.425
 548838 548839 plu1375 plu1376   gcpE TRUE 0.806 74.000 0.233 1.000   0.779
 548839 548840 plu1376 plu1377 gcpE hisS TRUE 0.539 119.000 0.207 1.000 N 0.330
 548840 548841 plu1377 plu1378 hisS   TRUE 0.990 12.000 0.259 1.000   0.884
 548841 548842 plu1378 plu1379     TRUE 0.994 15.000 0.492 1.000   0.712
 548842 548843 plu1379 plu1380   engA FALSE 0.253 291.000 0.203 1.000   0.369
 548844 548845 plu1381 plu1382     FALSE 0.238 161.000 0.000 NA   0.980
 548845 548846 plu1382 plu1383   hemF FALSE 0.048 233.000 0.000 1.000 N -0.293
 548849 548850 plu1386 plu1387   cysP FALSE 0.047 368.000 0.000 NA   0.391
 548850 548851 plu1387 plu1388 cysP cysT TRUE 0.998 0.000 0.479 0.002 N 0.469
 548851 548852 plu1388 plu1389 cysT cysW TRUE 0.999 0.000 0.583 0.001 N -0.589
 548852 548853 plu1389 plu1390 cysW cysA TRUE 0.993 15.000 0.180 1.000 Y 0.727
 548853 548854 plu1390 plu1391 cysA cysM FALSE 0.170 139.000 0.049 1.000 N 0.823
 548855 548856 plu1392 plu1393 crr ptsI TRUE 0.965 49.000 0.114 0.006 Y 0.975
 548856 548857 plu1393 plu1394 ptsI ptsH TRUE 0.755 185.000 0.088 0.006 Y 0.933
 548857 548858 plu1394 plu1395 ptsH cysK FALSE 0.004 554.000 0.019 1.000 N -0.050
 548858 548859 plu1395 plu1396 cysK cysZ TRUE 0.771 115.000 0.122 1.000 Y -0.655
 548860 548861 plu1397 plu1398 zipA ligA FALSE 0.220 62.000 0.013 1.000 N 0.612
 548861 548862 plu1398 plu1399 ligA nupC FALSE 0.023 361.000 0.000 1.000 N 0.632
 548862 548863 plu1399 plu1400 nupC   FALSE 0.368 84.000 0.022 NA   0.263
 548864 548865 plut025 plut026 tRNA-Ala tRNA-Ala TRUE 0.507 57.000 0.000 NA   NA
 548865 548866 plut026 plu1401 tRNA-Ala gltX FALSE 0.036 377.000 0.000 NA   NA
 548867 548868 plut027 plut028 tRNA-Val tRNA-Val TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 548868 548869 plut028 plut029 tRNA-Val tRNA-Val TRUE 0.623 46.000 0.000 NA   NA
 548869 548870 plut029 plut030 tRNA-Val tRNA-Lys TRUE 0.645 44.000 0.000 NA   NA
 548870 548871 plut030 plut031 tRNA-Lys tRNA-Lys TRUE 0.739 36.000 0.000 NA   NA
 548872 548873 plu1402 plu1403     TRUE 0.952 2.000 0.000 NA   NA
 548873 548874 plu1403 plu1404     TRUE 0.890 -9.000 0.000 NA   NA
 548875 548876 plut032 plu1405 tRNA-Lys glk FALSE 0.006 1018.000 0.000 NA   NA
 548876 548877 plu1405 plu1406 glk seqA FALSE 0.004 787.000 0.000 1.000 N 0.464
 548877 548878 plu1406 plu1407 seqA pgm TRUE 0.614 62.000 0.151 1.000 N 0.353
 548880 548881 plu1409 plu1410     TRUE 0.821 -34.000 0.000 1.000   -0.371
 548881 548882 plu1410 plu1411     TRUE 0.876 -13.000 0.000 NA   0.232
 548882 548883 plu1411 plu1412     FALSE 0.129 237.000 0.000 NA   0.852
 548883 548884 plu1412 plu1413     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.022 N 0.883
 548884 548885 plu1413 plu1414     TRUE 0.961 8.000 0.000 1.000   0.783
 548885 548886 plu1414 plu1415     FALSE 0.030 433.000 0.000 NA   0.304
 548887 548888 plu1416 plu1417 kdpE kdpD TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y -0.126
 548888 548889 plu1417 plu1418 kdpD kdpC TRUE 0.975 9.000 0.100 0.071 N -0.104
 548889 548890 plu1418 plu1419 kdpC kdpB TRUE 1.000 12.000 0.877 0.001 Y -0.494
 548890 548891 plu1419 plu1420 kdpB kdpA TRUE 0.996 21.000 0.201 0.001 Y 0.093
 548891 548892 plu1420 plu1421 kdpA ISPlu3X FALSE 0.007 501.000 0.000 1.000 N NA
 548892 548893 plu1421 plu1422 ISPlu3X   FALSE 0.261 129.000 0.000 NA   NA
 548894 548895 plu1423 plu1424     TRUE 0.406 67.000 0.010 NA   0.597
 548897 548898 plu1426 plu1427 sdhC sdhD TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001   0.992
 548898 548899 plu1427 plu1428 sdhD sdhA TRUE 1.000 1.000 0.705 0.002 Y 0.929
 548899 548900 plu1428 plu1429 sdhA sdhB TRUE 0.998 37.000 0.604 0.002 Y 0.584
 548900 548901 plu1429 plu1430 sdhB sucA FALSE 0.338 267.000 0.067 1.000 Y 0.178
 548901 548902 plu1430 plu1431 sucA sucB TRUE 0.999 15.000 0.667 1.000 Y 0.730
 548902 548903 plu1431 plu1432 sucB sucC TRUE 0.688 167.000 0.136 1.000 Y 0.789
 548903 548904 plu1432 plu1433 sucC sucD TRUE 1.000 3.000 0.806 0.001 Y 0.866
 548904 548905 plu1433 plu1434 sucD   FALSE 0.005 744.000 0.000 1.000 N 0.690
 548905 548906 plu1434 plu1435     TRUE 0.995 6.000 0.182 1.000 Y 0.123
 548906 548907 plu1435 plu1436     TRUE 0.889 49.000 0.000 1.000 Y 0.932
 548907 548908 plu1436 plu1437     TRUE 0.876 10.000 0.000 1.000 N -0.450
 548908 548909 plu1437 plu1438     TRUE 0.746 171.000 0.200 1.000 Y 0.361
 548909 548910 plu1438 plu1439     TRUE 0.892 33.000 0.143 NA   -0.374
 548910 548911 plu1439 plu1440     TRUE 0.749 40.000 0.000 NA   0.739
 548911 548912 plu1440 plu1441     TRUE 0.976 0.000 0.000 0.034 N 0.675
 548912 548913 plu1441 plu1442     TRUE 0.526 58.000 0.000 NA   -0.208
 548913 548914 plu1442 plu1443     TRUE 0.735 42.000 0.000 NA   0.820
 548914 548915 plu1443 plu1444     TRUE 0.940 14.000 0.000 NA   0.803
 548915 548916 plu1444 plu1445     TRUE 0.951 11.000 0.000 NA   0.655
 548916 548917 plu1445 plu1446     TRUE 0.902 21.000 0.000 NA   0.640
 548918 548919 plu1447 plu1448     TRUE 0.771 -84.000 0.000 NA   NA
 548920 548921 plu1449 plu1450 cydA cydB TRUE 0.998 15.000 0.348 0.037 Y 0.979
 548921 548922 plu1450 plu1451 cydB   FALSE 0.017 546.000 0.000 1.000   -0.608
 548922 548923 plu1451 plu1452   tolQ TRUE 0.997 -3.000 0.593 1.000   -0.625
 548923 548924 plu1452 plu1453 tolQ tolR TRUE 0.999 15.000 0.556 0.052 Y 0.859
 548924 548925 plu1453 plu1454 tolR tolA TRUE 0.598 46.000 0.114 NA N -0.823
 548925 548926 plu1454 plu1455 tolA tolB FALSE 0.075 214.000 0.051 NA N 0.875
 548926 548927 plu1455 plu1456 tolB pal TRUE 0.964 43.000 0.592 1.000 N -0.152
 548927 548928 plu1456 plu1457 pal   TRUE 0.967 10.000 0.088 1.000   -0.132
 548928 548929 plu1457 plut033   tRNA-Lys FALSE 0.218 148.000 0.000 NA   NA
 548929 548930 plut033 plut034 tRNA-Lys tRNA-Lys TRUE 0.747 35.000 0.000 NA   NA
 548930 548931 plut034 plut035 tRNA-Lys tRNA-Lys TRUE 0.720 38.000 0.000 NA   NA
 548931 548932 plut035 plut036 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548932 548933 plut036 plut037 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548933 548934 plut037 plut038 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548934 548935 plut038 plut039 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548935 548936 plut039 plut040 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548936 548937 plut040 plut041 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548939 548940 plu1459 plu1460     FALSE 0.090 247.000 0.000 NA   NA
 548940 548941 plu1460 plu1461     FALSE 0.029 410.000 0.000 NA   NA
 548941 548942 plu1461 plu1462     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA   0.381
 548942 548943 plu1462 plu1463     FALSE 0.036 406.000 0.000 NA   0.394
 548943 548944 plu1463 plu1464     FALSE 0.036 417.000 0.000 NA   0.978
 548945 548946 plu1465 plu1466     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   NA
 548946 548947 plu1466 plu1467     FALSE 0.059 307.000 0.000 NA   NA
 548948 548949 plu1468 plu1469 nadA pnuC TRUE 0.476 177.000 0.023 1.000 Y 0.589
 548949 548950 plu1469 plu1470 pnuC aroG FALSE 0.019 392.000 0.000 1.000 N 0.714
 548951 548952 plu1471 plu1472 gpmA   FALSE 0.170 160.000 0.009 NA   0.570
 548952 548953 plu1472 plu1473   modF FALSE 0.022 405.000 0.009 NA   -0.217
 548953 548954 plu1473 plu1474 modF modE FALSE 0.297 177.000 0.023 0.087   -0.526
 548955 548956 plu1475 plu1476   modA FALSE 0.048 374.000 0.072 NA   NA
 548956 548957 plu1476 plu1477 modA modB TRUE 0.982 137.000 0.627 0.001 Y -0.864
 548957 548958 plu1477 plu1478 modB modC TRUE 0.999 -6.000 0.537 0.001 Y 0.343
 548962 548963 plu1482 plu1483     TRUE 0.980 -7.000 0.250 NA   NA
 548965 548966 plu1485 plu1486 bioB bioF TRUE 0.998 0.000 0.168 0.002 Y 0.817
 548966 548967 plu1486 plu1487 bioF bioC TRUE 0.992 -16.000 0.133 0.002 Y 0.852
 548967 548968 plu1487 plu1488 bioC bioD TRUE 0.993 -7.000 0.054 0.002 Y 0.989
 548969 548970 plu1489 plu1490     TRUE 0.959 1.000 0.034 NA   0.742
 548971 548972 plu1491 plu1492 uvrB   FALSE 0.012 623.000 0.000 NA   NA
 548972 548973 plu1492 plu1493     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 548973 548974 plu1493 plu1494     TRUE 0.997 15.000 0.800 NA   NA
 548974 548975 plu1494 plu1495     TRUE 0.981 38.000 0.600 NA   NA
 548975 548976 plu1495 plu1496     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   NA
 548976 548977 plu1496 plu1497   ISPlu10H FALSE 0.026 421.000 0.000 NA   NA
 548979 548980 plu1499 plu1500 moaA moaC TRUE 0.969 40.000 0.039 0.003 Y 0.965
 548980 548981 plu1500 plu1501 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.003 Y 0.685
 548981 548982 plu1501 plu1502 moaD moaE TRUE 1.000 4.000 0.501 0.003 Y 0.658
 548982 548983 plu1502 plu1503 moaE   FALSE 0.154 183.000 0.025 NA   0.534
 548983 548984 plu1503 plu1504     FALSE 0.010 713.000 0.000 NA   -0.841
 548984 548985 plu1504 plu1505     FALSE 0.169 108.000 0.000 1.000 N -0.666
 548986 548987 plu1506 plu1507 ybhR ybhS TRUE 0.998 13.000 0.609 0.008 N -0.021
 548987 548988 plu1507 plu1508 ybhS ybhF TRUE 0.998 -3.000 0.547 0.087   0.958
 548988 548989 plu1508 plu1509 ybhF ybhG TRUE 0.997 10.000 0.545 1.000   0.962
 548989 548990 plu1509 plu1510 ybhG   TRUE 0.968 17.000 0.236 1.000 N -0.255
 548991 548992 plu1511 plu1512 rhlE   TRUE 0.990 4.000 0.033 1.000 Y 0.980
 548993 548994 plu1513 plu1514     TRUE 0.846 -18.000 0.000 NA   -0.026
 548994 548995 plu1514 plu1515     TRUE 0.930 27.000 0.143 1.000   0.990
 548995 548996 plu1515 plu1516     FALSE 0.063 309.000 0.000 1.000   -0.952
 548996 548997 plu1516 plu1517     FALSE 0.132 409.000 0.000 0.002   0.905
 548997 548998 plu1517 plu1518     FALSE 0.163 371.000 0.000 0.002   0.788
 548998 548999 plu1518 plu1519     FALSE 0.062 595.000 0.000 0.002   0.813
 548999 549000 plu1519 plu1520     FALSE 0.009 711.000 0.000 NA   NA
 549000 549001 plu1520 plu1521     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 549001 549002 plu1521 plu1522   sseA FALSE 0.367 96.000 0.000 NA   NA
 549002 549003 plu1522 plu1523 sseA   TRUE 0.700 44.000 0.069 NA   NA
 549004 549005 plu1524 plu1525 dinG   TRUE 0.991 0.000 0.000 1.000 Y 0.985
 549006 549007 plu1526 plu1527   dkgB FALSE 0.183 263.000 0.116 1.000   0.911
 549009 549010 plu1529 plu1530     FALSE 0.276 72.000 0.000 1.000 N 0.452
 549010 549011 plu1530 plu1531     TRUE 0.923 17.000 0.000 NA   0.974
 549011 549012 plu1531 plu1532     TRUE 0.510 65.000 0.000 NA   0.548
 549012 549013 plu1532 plu1533     FALSE 0.035 405.000 0.000 1.000   -0.449
 549013 549014 plu1533 plu1534     FALSE 0.070 292.000 0.000 NA   -0.631
 549014 549015 plu1534 plu1535     FALSE 0.070 295.000 0.000 NA   -0.450
 549019 549020 plu1539 plu1540 moeB moeA TRUE 0.999 0.000 0.323 0.003 Y -0.990
 549020 549021 plu1540 plu1541 moeA   FALSE 0.069 222.000 0.000 1.000 N 0.952
 549022 549023 plu1542 plu1543   folE TRUE 0.495 194.000 0.250 NA   0.558
 549023 549024 plu1543 plu1544 folE   TRUE 0.982 46.000 0.719 NA   0.696
 549025 549026 plu1545 plu1546 sanA maeA FALSE 0.098 267.000 0.045 NA   0.623
 549026 549027 plu1546 plu1547 maeA cdd FALSE 0.038 251.000 0.022 1.000 N 0.776
 549027 549028 plu1547 plu1548 cdd   TRUE 0.458 142.000 0.198 1.000 N 0.826
 549028 549029 plu1548 plu1549     TRUE 0.995 3.000 0.340 1.000   0.489
 549030 549031 plu1550 plu1551     TRUE 0.857 23.000 0.000 NA   NA
 549035 549036 plu1555 plu1556 mrp udk FALSE 0.161 258.000 0.073 0.087 N 0.850
 549036 549037 plu1556 plu1557 udk dcd TRUE 0.895 54.000 0.098 1.000 Y 0.996
 549037 549038 plu1557 plu1558 dcd asmA FALSE 0.374 59.000 0.057 NA N 0.994
 549041 549042 plu1561 plu1562     FALSE 0.016 616.000 0.000 NA   0.800
 549044 549045 plu1564 plu1565 hisI hisF TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y 0.995
 549045 549046 plu1565 plu1566 hisF hisA TRUE 0.998 -18.000 0.433 0.003 Y 0.994
 549046 549047 plu1566 plu1567 hisA hisH TRUE 0.999 6.000 0.210 0.003 Y 0.969
 549047 549048 plu1567 plu1568 hisH hisB TRUE 0.998 0.000 0.128 0.003 Y 0.991
 549048 549049 plu1568 plu1569 hisB hisD TRUE 0.996 0.000 0.010 0.003 Y 0.701
 549049 549050 plu1569 plu1570 hisD hisG TRUE 0.998 7.000 0.171 0.003 Y 0.416
 549054 549055 plu1574 plu1575     FALSE 0.016 588.000 0.000 NA   0.498
 549055 549056 plu1575 plu1576   cipA FALSE 0.007 1151.000 0.000 NA   0.506
 549058 549059 plu1578 plu1579 sdaC   FALSE 0.008 907.000 0.000 1.000   -0.604
 549059 549060 plu1579 plu1580     FALSE 0.253 131.000 0.000 NA   NA
 549060 549061 plu1580 plu1581   grxA FALSE 0.100 233.000 0.000 NA   NA
 549062 549063 plu1582 plu1583     TRUE 0.692 92.000 0.194 NA   -0.835
 549063 549064 plu1583 plu1584     TRUE 0.925 25.000 0.119 NA   0.827
 549065 549066 plu1585 plu1586 artM artQ TRUE 1.000 0.000 0.714 0.015 Y 0.835
 549066 549067 plu1586 plu1587 artQ artI TRUE 0.992 15.000 0.065 0.051 Y 0.991
 549067 549068 plu1587 plu1588 artI artP TRUE 0.981 20.000 0.081 1.000 Y 0.979
 549068 549069 plu1588 plu1589 artP   FALSE 0.081 304.000 0.000 NA   0.801
 549070 549071 plu1590 plu1591 macA macB TRUE 0.999 0.000 0.789 0.069 N 0.815
 549073 549074 plu1593 plu1594   clpA TRUE 0.985 33.000 0.596 NA   -0.687
 549075 549076 plu1595 plu1596 infA aat FALSE 0.052 157.000 0.020 1.000 N -0.717
 549076 549077 plu1596 plu1597 aat cydC TRUE 0.990 4.000 0.049 1.000 Y 0.617
 549077 549078 plu1597 plu1598 cydC cydD TRUE 1.000 3.000 0.631 0.008 Y -0.141
 549078 549079 plu1598 plu1599 cydD trxB TRUE 0.619 135.000 0.049 1.000 Y -0.409
 549080 549081 plu1600 plu1601 lrp ftsK TRUE 0.682 131.000 0.345 1.000 N 0.596
 549081 549082 plu1601 plu1602 ftsK lolA TRUE 0.399 219.000 0.305 1.000 N 0.806
 549082 549083 plu1602 plu1603 lolA   TRUE 0.974 8.000 0.167 1.000 N 0.739
 549083 549084 plu1603 plu1604   serS FALSE 0.184 232.000 0.078 0.087 N 0.403
 549087 549088 plu1607 plu1608     TRUE 0.707 39.000 0.000 NA   NA
 549088 549089 plu1608 plu1609   ISPlu1E FALSE 0.153 183.000 0.000 NA   NA
 549090 549091 plu1610 plu1611     FALSE 0.021 478.000 0.000 NA   NA
 549092 549093 plu1612 plu1613 pflA pflB FALSE 0.170 74.000 0.021 1.000 N 0.138
 549093 549094 plu1613 plu1614 pflB focA TRUE 0.675 56.000 0.172 1.000 N -0.436
 549094 549095 plu1614 plu1615 focA   FALSE 0.069 320.000 0.000 NA   0.736
 549096 549097 plu1616 plu1617 ansB   FALSE 0.205 170.000 0.000 1.000   -0.258
 549097 549098 plu1617 plu1618     TRUE 0.998 -3.000 0.650 1.000   -0.509
 549098 549099 plu1618 plu1619   serC FALSE 0.222 172.000 0.000 1.000   0.605
 549099 549100 plu1619 plu1620 serC aroA FALSE 0.293 250.000 0.033 1.000 Y -0.779
 549100 549101 plu1620 plu1621 aroA mssA FALSE 0.141 305.000 0.209 1.000 N -0.874
 549101 549102 plu1621 plu1622 mssA rpsA TRUE 0.459 182.000 0.281 1.000 N 0.944
 549102 549103 plu1622 plu1623 rpsA ihfB TRUE 0.767 66.000 0.292 1.000 N -0.916
 549103 549104 plu1623 plu1624 ihfB   FALSE 0.024 440.000 0.000 NA   NA
 549105 549106 plu1625 plu1626     TRUE 0.459 64.000 0.000 NA   NA
 549106 549107 plu1626 plu1627     FALSE 0.018 511.000 0.000 NA   NA
 549107 549108 plu1627 plu1628     TRUE 0.961 5.000 0.000 NA   0.804
 549109 549110 plu1629 plu1630   msbA TRUE 0.892 39.000 0.075 0.067   -0.098
 549110 549111 plu1630 plu1631 msbA lpxK TRUE 0.979 -3.000 0.205 1.000 N 0.666
 549111 549112 plu1631 plu1632 lpxK   FALSE 0.006 555.000 0.000 1.000 N -0.428
 549112 549113 plu1632 plu1633     FALSE 0.021 379.000 0.004 NA   NA
 549113 549114 plu1633 plu1634   kdsB TRUE 0.990 4.000 0.265 NA   NA
 549116 549117 plu1636 plu1637 smtA mukF TRUE 0.987 11.000 0.325 NA N 0.082
 549117 549118 plu1637 plu1638 mukF mukE TRUE 0.995 8.000 0.196 NA Y 0.066
 549118 549119 plu1638 plu1639 mukE mukB TRUE 1.000 -3.000 0.786 0.001 Y -0.627
 549119 549120 plu1639 plu1640 mukB   FALSE 0.061 308.000 0.000 NA   -0.763
 549122 549123 plu1642 plu1643     FALSE 0.221 147.000 0.000 NA   NA
 549123 549124 plu1643 plu1644     TRUE 0.634 45.000 0.000 NA   NA
 549125 549126 plu1645 plu1646   ISPlu6I TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 549126 549127 plu1646 plu1647 ISPlu6I   TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 549127 549128 plu1647 plu1648     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 549128 549129 plu1648 plu1649     FALSE 0.024 519.000 0.000 NA   0.906
 549131 549132 plu1651 plu1652     FALSE 0.374 105.000 0.000 NA   0.171
 549132 549133 plu1652 plu1653     TRUE 0.881 24.000 0.000 NA   0.786
 549133 549134 plu1653 plu1654     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 549134 549135 plu1654 plu1655     TRUE 0.459 64.000 0.000 NA   NA
 549135 549136 plu1655 plu1656     FALSE 0.365 110.000 0.000 1.000   -0.138
 549136 549137 plu1656 plu1657     TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA   -0.304
 549137 549138 plu1657 plu1658     TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 549138 549139 plu1658 plu1659     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 549139 549140 plu1659 plu1660     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 549140 549141 plu1660 plu1661     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549141 549142 plu1661 plu1662     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549142 549143 plu1662 plu1663     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549143 549144 plu1663 plu1664     TRUE 0.992 14.000 0.400 NA   NA
 549144 549145 plu1664 plu1665     TRUE 0.605 48.000 0.000 NA   -0.958
 549145 549146 plu1665 plu1666     TRUE 0.942 12.000 0.000 NA   0.062
 549146 549147 plu1666 plu1667     TRUE 0.966 54.000 0.667 NA   NA
 549147 549148 plu1667 plu1668     FALSE 0.014 565.000 0.000 NA   NA
 549148 549149 plu1668 plu1669     FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 549149 549150 plu1669 plu1670     FALSE 0.351 101.000 0.000 NA   NA
 549150 549151 plu1670 plu1671     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 549151 549152 plu1671 plu1672     TRUE 0.478 74.000 0.000 NA   0.941
 549152 549153 plu1672 plu1673     FALSE 0.127 203.000 0.000 NA   NA
 549153 549154 plu1673 plu1674     FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 549154 549155 plu1674 plu1675     TRUE 0.914 15.000 0.000 NA   NA
 549155 549156 plu1675 plu1676     TRUE 0.943 10.000 0.000 NA   -0.818
 549156 549157 plu1676 plu1677     TRUE 0.571 57.000 0.000 NA   0.698
 549157 549158 plu1677 plu1678     FALSE 0.254 143.000 0.000 1.000   -0.558
 549158 549159 plu1678 plu1679     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   -0.975
 549159 549160 plu1679 plu1680     TRUE 0.404 77.000 0.000 NA   -0.789
 549160 549161 plu1680 plu1681     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 549161 549162 plu1681 plu1682     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 549162 549163 plu1682 plu1683     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   -0.583
 549163 549164 plu1683 plu1684     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549164 549165 plu1684 plu1685     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549165 549166 plu1685 plu1686     TRUE 0.966 36.000 0.400 NA   NA
 549166 549167 plu1686 plu1687     TRUE 0.592 56.000 0.000 NA   0.825
 549167 549168 plu1687 plu1688     TRUE 0.935 12.000 0.000 NA   -0.836
 549168 549169 plu1688 plu1689     TRUE 0.852 176.000 0.667 NA   0.636
 549169 549170 plu1689 plu1690     FALSE 0.009 931.000 0.000 NA   0.700
 549170 549171 plu1690 plu1691     FALSE 0.144 192.000 0.000 NA   -0.861
 549171 549172 plu1691 plu1692     TRUE 0.459 81.000 0.000 NA   0.978
 549172 549173 plu1692 plu1693     TRUE 0.868 25.000 0.000 NA   0.736
 549173 549174 plu1693 plu1694     TRUE 0.955 10.000 0.000 NA   0.980
 549174 549175 plu1694 plu1695   ISPlu3W FALSE 0.160 179.000 0.000 NA   NA
 549175 549176 plu1695 plu1696 ISPlu3W   TRUE 0.592 50.000 0.000 1.000   NA
 549176 549177 plu1696 plu1697     FALSE 0.143 202.000 0.000 NA   -0.111
 549177 549178 plu1697 plu1698     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.901
 549178 549179 plu1698 plu1699     FALSE 0.363 97.000 0.000 NA   NA
 549179 549180 plu1699 plu1700     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 549180 549181 plu1700 plu1701     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 549181 549182 plu1701 plu1702     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549182 549183 plu1702 plu1703     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549183 549184 plu1703 plu1704     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549184 549185 plu1704 plu1705     TRUE 0.992 14.000 0.400 NA   NA
 549185 549186 plu1705 plu1706     TRUE 0.639 49.000 0.000 NA   0.491
 549186 549187 plu1706 plu1707     TRUE 0.946 12.000 0.000 NA   0.469
 549187 549188 plu1707 plu1708     TRUE 0.966 54.000 0.667 NA   NA
 549190 549191 plu1710 plu1711     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   NA
 549191 549192 plu1711 plu1712     FALSE 0.019 494.000 0.000 NA   NA
 549192 549193 plu1712 plu1713     FALSE 0.355 120.000 0.000 NA   0.908
 549193 549194 plu1713 plu1714     FALSE 0.058 339.000 0.000 NA   0.571
 549194 549195 plu1714 plu1715     FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 549195 549196 plu1715 plu1716     TRUE 0.833 25.000 0.000 NA   NA
 549196 549197 plu1716 plu1717     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 549197 549198 plu1717 plu1718     TRUE 0.459 64.000 0.000 NA   NA
 549198 549199 plu1718 plu1719     FALSE 0.162 188.000 0.000 NA   -0.106
 549199 549200 plu1719 plu1720     TRUE 0.925 -7.000 0.000 NA   0.983
 549200 549201 plu1720 plu1721     TRUE 0.651 44.000 0.000 NA   -0.823
 549201 549202 plu1721 plu1722     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   -0.942
 549202 549203 plu1722 plu1723     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   0.766
 549203 549204 plu1723 plu1724     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.859
 549204 549205 plu1724 plu1725     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549205 549206 plu1725 plu1726     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549206 549207 plu1726 plu1727     TRUE 0.992 14.000 0.400 NA   NA
 549207 549208 plu1727 plu1728     TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   0.034
 549208 549209 plu1728 plu1729     TRUE 0.947 12.000 0.000 NA   0.629
 549209 549210 plu1729 plu1730     TRUE 0.996 15.000 0.667 NA   NA
 549211 549212 plu1731 plu1732     FALSE 0.013 678.000 0.000 NA   0.969
 549212 549213 plu1732 plu1733     FALSE 0.245 158.000 0.000 NA   0.970
 549213 549214 plu1733 plu1734     TRUE 0.756 40.000 0.000 NA   0.862
 549214 549215 plu1734 plu1735     FALSE 0.367 117.000 0.000 NA   0.930
 549215 549216 plu1735 plu1736     TRUE 0.914 15.000 0.000 NA   NA
 549216 549217 plu1736 plu1737     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549217 549218 plu1737 plu1738     TRUE 0.958 5.000 0.000 NA   0.581
 549218 549219 plu1738 plu1739     TRUE 0.954 4.000 0.000 NA   -0.093
 549219 549220 plu1739 plu1740     TRUE 0.890 -13.000 0.000 NA   0.926
 549220 549221 plu1740 plu1741     TRUE 0.995 22.000 0.714 NA   0.728
 549221 549222 plu1741 plu1742     TRUE 1.000 7.000 0.857 1.000 Y 0.924
 549224 549225 plu1744 plu1745     FALSE 0.068 320.000 0.000 NA   0.724
 549225 549226 plu1745 plu1746   ISPlu4D FALSE 0.342 103.000 0.000 NA   NA
 549226 549227 plu1746 plu1747 ISPlu4D   TRUE 0.614 47.000 0.000 NA   NA
 549227 549228 plu1747 plu1748     TRUE 0.439 93.000 0.000 NA   0.723
 549228 549229 plu1748 plu1749     TRUE 0.769 46.000 0.089 NA   0.828
 549230 549231 plu1750 plu1751 aspC ompN FALSE 0.056 222.000 0.000 1.000 N 0.139
 549231 549232 plu1751 plu1752 ompN   FALSE 0.163 506.000 0.000 0.038 Y 0.540
 549232 549233 plu1752 plu1753   asnS FALSE 0.022 337.000 0.000 1.000 N -0.174
 549233 549234 plu1753 plu1754 asnS pcnB FALSE 0.069 205.000 0.034 1.000 N 0.933
 549235 549236 plu1755 plu1756 pepN   FALSE 0.166 176.000 0.000 NA   NA
 549236 549237 plu1756 plu1757     FALSE 0.287 120.000 0.000 NA   NA
 549237 549238 plu1757 plu1758   pyrD TRUE 0.446 66.000 0.000 NA   NA
 549238 549239 plu1758 plu1759 pyrD   FALSE 0.090 317.000 0.081 NA   0.513
 549240 549241 plu1760 plu1761   ISPlu6H FALSE 0.298 122.000 0.000 1.000   NA
 549241 549242 plu1761 plu1762 ISPlu6H   FALSE 0.121 218.000 0.000 1.000   NA
 549242 549243 plu1762 plu1763     FALSE 0.098 278.000 0.000 1.000   0.646
 549244 549245 plu1764 plu1765   uup TRUE 0.967 6.000 0.061 1.000   0.714
 549245 549246 plu1765 plu1766 uup pqiA TRUE 0.453 90.000 0.054 NA   0.477
 549246 549247 plu1766 plu1767 pqiA pqiB TRUE 0.997 21.000 0.819 NA   0.263
 549247 549248 plu1767 plu1768 pqiB   TRUE 0.996 -3.000 0.531 NA   0.150
 549248 549249 plu1768 plu1769   rmf FALSE 0.090 247.000 0.000 NA   NA
 549252 549253 plu1772 plu1773 fabA   TRUE 0.727 84.000 0.290 1.000 N -0.523
 549255 549256 plu1775 plu1776 ompA sulA FALSE 0.004 685.000 0.000 1.000 N -0.780
 549261 549262 plu1781 plu1782     FALSE 0.008 812.000 0.000 NA   NA
 11410706 549257   plu1777     FALSE NA 6008.000 0.000 NA   NA
 11553069 549257   plu1777     FALSE NA 6008.000 0.000 NA   NA
 11695461 549257   plu1777     FALSE NA 6008.000 0.000 NA   NA
 11410707 549257   plu1777     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11553070 549257   plu1777     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11695462 549257   plu1777     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11410708 549257   plu1777     FALSE NA 6068.000 0.000 NA   NA
 11553071 549257   plu1777     FALSE NA 6068.000 0.000 NA   NA
 11695463 549257   plu1777     FALSE NA 6068.000 0.000 NA   NA
 11410709 549257   plu1777     FALSE NA 6096.000 0.000 NA   NA
 11553072 549257   plu1777     FALSE NA 6096.000 0.000 NA   NA
 11695464 549257   plu1777     FALSE NA 6096.000 0.000 NA   NA
 11410710 549257   plu1777     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11553073 549257   plu1777     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11695465 549257   plu1777     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11410711 549257   plu1777     FALSE NA 6156.000 0.000 NA   NA
 11553074 549257   plu1777     FALSE NA 6156.000 0.000 NA   NA
 11695466 549257   plu1777     FALSE NA 6156.000 0.000 NA   NA
 11410712 549257   plu1777     FALSE NA 6188.000 0.000 NA   NA
 11553075 549257   plu1777     FALSE NA 6188.000 0.000 NA   NA
 11695467 549257   plu1777     FALSE NA 6188.000 0.000 NA   NA
 11410713 549257   plu1777     FALSE NA 6216.000 0.000 NA   NA
 11553076 549257   plu1777     FALSE NA 6216.000 0.000 NA   NA
 11695468 549257   plu1777     FALSE NA 6216.000 0.000 NA   NA
 11410714 549257   plu1777     FALSE NA 6248.000 0.000 NA   NA
 11553077 549257   plu1777     FALSE NA 6248.000 0.000 NA   NA
 11695469 549257   plu1777     FALSE NA 6248.000 0.000 NA   NA
 11410715 549257   plu1777     FALSE NA 6276.000 0.000 NA   NA
 11553078 549257   plu1777     FALSE NA 6276.000 0.000 NA   NA
 11695470 549257   plu1777     FALSE NA 6276.000 0.000 NA   NA
 11410716 549257   plu1777     FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11553079 549257   plu1777     FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11695471 549257   plu1777     FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11410717 549257   plu1777     FALSE NA 6336.000 0.000 NA   NA
 11553080 549257   plu1777     FALSE NA 6336.000 0.000 NA   NA
 11695472 549257   plu1777     FALSE NA 6336.000 0.000 NA   NA
 11410718 549257   plu1777     FALSE NA 6368.000 0.000 NA   NA
 11553081 549257   plu1777     FALSE NA 6368.000 0.000 NA   NA
 11695473 549257   plu1777     FALSE NA 6368.000 0.000 NA   NA
 549262 549263 plu1782 plu1783     FALSE 0.048 331.000 0.000 NA   NA
 11410719 549257   plu1777     FALSE NA 6396.000 0.000 NA   NA
 11553082 549257   plu1777     FALSE NA 6396.000 0.000 NA   NA
 11695474 549257   plu1777     FALSE NA 6396.000 0.000 NA   NA
 11410720 549257   plu1777     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11553083 549257   plu1777     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11695475 549257   plu1777     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11410721 549257   plu1777     FALSE NA 6456.000 0.000 NA   NA
 11553084 549257   plu1777     FALSE NA 6456.000 0.000 NA   NA
 11695476 549257   plu1777     FALSE NA 6456.000 0.000 NA   NA
 11410722 549257   plu1777     FALSE NA 6488.000 0.000 NA   NA
 11553085 549257   plu1777     FALSE NA 6488.000 0.000 NA   NA
 11695477 549257   plu1777     FALSE NA 6488.000 0.000 NA   NA
 11410723 549257   plu1777     FALSE NA 6516.000 0.000 NA   NA
 11553086 549257   plu1777     FALSE NA 6516.000 0.000 NA   NA
 11695478 549257   plu1777     FALSE NA 6516.000 0.000 NA   NA
 11410724 549257   plu1777     FALSE NA 6548.000 0.000 NA   NA
 11553087 549257   plu1777     FALSE NA 6548.000 0.000 NA   NA
 11695479 549257   plu1777     FALSE NA 6548.000 0.000 NA   NA
 11410725 549257   plu1777     FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11553088 549257   plu1777     FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11695480 549257   plu1777     FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11410726 549257   plu1777     FALSE NA 6608.000 0.000 NA   NA
 11553089 549257   plu1777     FALSE NA 6608.000 0.000 NA   NA
 11695481 549257   plu1777     FALSE NA 6608.000 0.000 NA   NA
 11410727 549257   plu1777     FALSE NA 6636.000 0.000 NA   NA
 11553090 549257   plu1777     FALSE NA 6636.000 0.000 NA   NA
 11695482 549257   plu1777     FALSE NA 6636.000 0.000 NA   NA
 11410728 549257   plu1777     FALSE NA 6668.000 0.000 NA   NA
 11553091 549257   plu1777     FALSE NA 6668.000 0.000 NA   NA
 11695483 549257   plu1777     FALSE NA 6668.000 0.000 NA   NA
 11410729 549257   plu1777     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11553092 549257   plu1777     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11695484 549257   plu1777     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11410730 549257   plu1777     FALSE NA 6728.000 0.000 NA   NA
 11553093 549257   plu1777     FALSE NA 6728.000 0.000 NA   NA
 11695485 549257   plu1777     FALSE NA 6728.000 0.000 NA   NA
 11410731 549257   plu1777     FALSE NA 6756.000 0.000 NA   NA
 11553094 549257   plu1777     FALSE NA 6756.000 0.000 NA   NA
 11695486 549257   plu1777     FALSE NA 6756.000 0.000 NA   NA
 11410732 549257   plu1777     FALSE NA 6786.000 0.000 NA   NA
 11553095 549257   plu1777     FALSE NA 6786.000 0.000 NA   NA
 11695487 549257   plu1777     FALSE NA 6786.000 0.000 NA   NA
 11410733 549257   plu1777     FALSE NA 6814.000 0.000 NA   NA
 11553096 549257   plu1777     FALSE NA 6814.000 0.000 NA   NA
 11695488 549257   plu1777     FALSE NA 6814.000 0.000 NA   NA
 11410734 549257   plu1777     FALSE NA 6846.000 0.000 NA   NA
 11553097 549257   plu1777     FALSE NA 6846.000 0.000 NA   NA
 11695489 549257   plu1777     FALSE NA 6846.000 0.000 NA   NA
 11410735 549257   plu1777     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11553098 549257   plu1777     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11695490 549257   plu1777     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11410736 549257   plu1777     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11553099 549257   plu1777     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11695491 549257   plu1777     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11410737 549257   plu1777     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11553100 549257   plu1777     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11695492 549257   plu1777     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11410738 549257   plu1777     FALSE NA 6966.000 0.000 NA   NA
 11553101 549257   plu1777     FALSE NA 6966.000 0.000 NA   NA
 11695493 549257   plu1777     FALSE NA 6966.000 0.000 NA   NA
 11410739 549257   plu1777     FALSE NA 6994.000 0.000 NA   NA
 11553102 549257   plu1777     FALSE NA 6994.000 0.000 NA   NA
 11695494 549257   plu1777     FALSE NA 6994.000 0.000 NA   NA
 11410740 549257   plu1777     FALSE NA 7026.000 0.000 NA   NA
 11553103 549257   plu1777     FALSE NA 7026.000 0.000 NA   NA
 11695495 549257   plu1777     FALSE NA 7026.000 0.000 NA   NA
 11410741 549257   plu1777     FALSE NA 7054.000 0.000 NA   NA
 11553104 549257   plu1777     FALSE NA 7054.000 0.000 NA   NA
 11695496 549257   plu1777     FALSE NA 7054.000 0.000 NA   NA
 11410742 549257   plu1777     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11553105 549257   plu1777     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11695497 549257   plu1777     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11410743 549257   plu1777     FALSE NA 7114.000 0.000 NA   NA
 11553106 549257   plu1777     FALSE NA 7114.000 0.000 NA   NA
 11695498 549257   plu1777     FALSE NA 7114.000 0.000 NA   NA
 11410744 549257   plu1777     FALSE NA 7146.000 0.000 NA   NA
 11553107 549257   plu1777     FALSE NA 7146.000 0.000 NA   NA
 11695499 549257   plu1777     FALSE NA 7146.000 0.000 NA   NA
 11410745 549257   plu1777     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11553108 549257   plu1777     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11695500 549257   plu1777     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11410746 549257   plu1777     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11553109 549257   plu1777     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11695501 549257   plu1777     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11410747 549257   plu1777     FALSE NA 7234.000 0.000 NA   NA
 11553110 549257   plu1777     FALSE NA 7234.000 0.000 NA   NA
 11695502 549257   plu1777     FALSE NA 7234.000 0.000 NA   NA
 11410748 549257   plu1777     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11553111 549257   plu1777     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11695503 549257   plu1777     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11410749 549257   plu1777     FALSE NA 7294.000 0.000 NA   NA
 11553112 549257   plu1777     FALSE NA 7294.000 0.000 NA   NA
 11695504 549257   plu1777     FALSE NA 7294.000 0.000 NA   NA
 11410750 549257   plu1777     FALSE NA 7326.000 0.000 NA   NA
 11553113 549257   plu1777     FALSE NA 7326.000 0.000 NA   NA
 11695505 549257   plu1777     FALSE NA 7326.000 0.000 NA   NA
 11410751 549257   plu1777     FALSE NA 7354.000 0.000 NA   NA
 11553114 549257   plu1777     FALSE NA 7354.000 0.000 NA   NA
 11695506 549257   plu1777     FALSE NA 7354.000 0.000 NA   NA
 11410752 549257   plu1777     FALSE NA 7386.000 0.000 NA   NA
 11553115 549257   plu1777     FALSE NA 7386.000 0.000 NA   NA
 11695507 549257   plu1777     FALSE NA 7386.000 0.000 NA   NA
 11410753 549257   plu1777     FALSE NA 7414.000 0.000 NA   NA
 11553116 549257   plu1777     FALSE NA 7414.000 0.000 NA   NA
 11695508 549257   plu1777     FALSE NA 7414.000 0.000 NA   NA
 11410754 549257   plu1777     FALSE NA 7446.000 0.000 NA   NA
 11553117 549257   plu1777     FALSE NA 7446.000 0.000 NA   NA
 11695509 549257   plu1777     FALSE NA 7446.000 0.000 NA   NA
 549267 549268 plut042 plu1787 tRNA-Ser   FALSE 0.333 106.000 0.000 NA   NA
 549268 549269 plu1787 plu1788   ISPlu3V FALSE 0.008 798.000 0.000 NA   NA
 549269 549270 plu1788 plu1789 ISPlu3V   FALSE 0.125 204.000 0.000 NA   NA
 549270 549271 plu1789 plu1790     FALSE 0.009 758.000 0.000 NA   NA
 11410755 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1367.000 0.000 NA   NA
 11553118 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1367.000 0.000 NA   NA
 11695510 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1367.000 0.000 NA   NA
 11410756 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11553119 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11695511 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11410757 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11553120 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11695512 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11410758 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11553121 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11695513 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11410759 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11553122 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11695514 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 549271 549272 plu1790 plu1791     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549272 549273 plu1791 plu1792     TRUE 0.389 94.000 0.000 NA   -0.475
 549273 549274 plu1792 plu1793     FALSE 0.012 680.000 0.000 NA   -0.023
 549274 549275 plu1793 plu1794     TRUE 0.999 -3.000 0.895 NA   0.960
 549275 549276 plu1794 plu1795     TRUE 0.995 24.000 0.787 NA   0.949
 549276 549277 plu1795 plu1796     TRUE 0.996 10.000 0.468 NA   0.959
 549277 549278 plu1796 plu1797     FALSE 0.011 654.000 0.000 NA   NA
 11410760 549276   plu1795     FALSE NA 694.000 0.000 NA   NA
 11553123 549276   plu1795     FALSE NA 694.000 0.000 NA   NA
 11695515 549276   plu1795     FALSE NA 694.000 0.000 NA   NA
 11410761 549276   plu1795     FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 11553124 549276   plu1795     FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 11695516 549276   plu1795     FALSE NA 722.000 0.000 NA   NA
 11410762 549276   plu1795     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11553125 549276   plu1795     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11695517 549276   plu1795     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11410763 549276   plu1795     FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11553126 549276   plu1795     FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11695518 549276   plu1795     FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11410764 549276   plu1795     FALSE NA 814.000 0.000 NA   NA
 11553127 549276   plu1795     FALSE NA 814.000 0.000 NA   NA
 11695519 549276   plu1795     FALSE NA 814.000 0.000 NA   NA
 11410765 549276   plu1795     FALSE NA 842.000 0.000 NA   NA
 11553128 549276   plu1795     FALSE NA 842.000 0.000 NA   NA
 11695520 549276   plu1795     FALSE NA 842.000 0.000 NA   NA
 11410766 549276   plu1795     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11553129 549276   plu1795     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11695521 549276   plu1795     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11410767 549276   plu1795     FALSE NA 902.000 0.000 NA   NA
 11553130 549276   plu1795     FALSE NA 902.000 0.000 NA   NA
 11695522 549276   plu1795     FALSE NA 902.000 0.000 NA   NA
 11410768 549276   plu1795     FALSE NA 934.000 0.000 NA   NA
 11553131 549276   plu1795     FALSE NA 934.000 0.000 NA   NA
 11695523 549276   plu1795     FALSE NA 934.000 0.000 NA   NA
 11410769 549276   plu1795     FALSE NA 962.000 0.000 NA   NA
 11553132 549276   plu1795     FALSE NA 962.000 0.000 NA   NA
 11695524 549276   plu1795     FALSE NA 962.000 0.000 NA   NA
 11410770 549276   plu1795     FALSE NA 994.000 0.000 NA   NA
 11553133 549276   plu1795     FALSE NA 994.000 0.000 NA   NA
 11695525 549276   plu1795     FALSE NA 994.000 0.000 NA   NA
 11410771 549276   plu1795     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11553134 549276   plu1795     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11695526 549276   plu1795     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11410772 549276   plu1795     FALSE NA 1054.000 0.000 NA   NA
 11553135 549276   plu1795     FALSE NA 1054.000 0.000 NA   NA
 11695527 549276   plu1795     FALSE NA 1054.000 0.000 NA   NA
 11410773 549276   plu1795     FALSE NA 1082.000 0.000 NA   NA
 11553136 549276   plu1795     FALSE NA 1082.000 0.000 NA   NA
 11695528 549276   plu1795     FALSE NA 1082.000 0.000 NA   NA
 11410774 549276   plu1795     FALSE NA 1114.000 0.000 NA   NA
 11553137 549276   plu1795     FALSE NA 1114.000 0.000 NA   NA
 11695529 549276   plu1795     FALSE NA 1114.000 0.000 NA   NA
 11410775 549276   plu1795     FALSE NA 1142.000 0.000 NA   NA
 11553138 549276   plu1795     FALSE NA 1142.000 0.000 NA   NA
 11695530 549276   plu1795     FALSE NA 1142.000 0.000 NA   NA
 11410776 549276   plu1795     FALSE NA 1174.000 0.000 NA   NA
 11553139 549276   plu1795     FALSE NA 1174.000 0.000 NA   NA
 11695531 549276   plu1795     FALSE NA 1174.000 0.000 NA   NA
 11410777 549276   plu1795     FALSE NA 1202.000 0.000 NA   NA
 11553140 549276   plu1795     FALSE NA 1202.000 0.000 NA   NA
 11695532 549276   plu1795     FALSE NA 1202.000 0.000 NA   NA
 549278 549279 plu1797 plu1798     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 11410778 549276   plu1795     FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11553141 549276   plu1795     FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11695533 549276   plu1795     FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11410779 549276   plu1795     FALSE NA 1262.000 0.000 NA   NA
 11553142 549276   plu1795     FALSE NA 1262.000 0.000 NA   NA
 11695534 549276   plu1795     FALSE NA 1262.000 0.000 NA   NA
 11410780 549276   plu1795     FALSE NA 1294.000 0.000 NA   NA
 11553143 549276   plu1795     FALSE NA 1294.000 0.000 NA   NA
 11695535 549276   plu1795     FALSE NA 1294.000 0.000 NA   NA
 11410781 549276   plu1795     FALSE NA 1322.000 0.000 NA   NA
 11553144 549276   plu1795     FALSE NA 1322.000 0.000 NA   NA
 11695536 549276   plu1795     FALSE NA 1322.000 0.000 NA   NA
 11410782 549276   plu1795     FALSE NA 1354.000 0.000 NA   NA
 11553145 549276   plu1795     FALSE NA 1354.000 0.000 NA   NA
 11695537 549276   plu1795     FALSE NA 1354.000 0.000 NA   NA
 11410783 549276   plu1795     FALSE NA 1382.000 0.000 NA   NA
 11553146 549276   plu1795     FALSE NA 1382.000 0.000 NA   NA
 11695538 549276   plu1795     FALSE NA 1382.000 0.000 NA   NA
 11410784 549276   plu1795     FALSE NA 1414.000 0.000 NA   NA
 11553147 549276   plu1795     FALSE NA 1414.000 0.000 NA   NA
 11695539 549276   plu1795     FALSE NA 1414.000 0.000 NA   NA
 11410785 549276   plu1795     FALSE NA 1442.000 0.000 NA   NA
 11553148 549276   plu1795     FALSE NA 1442.000 0.000 NA   NA
 11695540 549276   plu1795     FALSE NA 1442.000 0.000 NA   NA
 11410786 549276   plu1795     FALSE NA 1474.000 0.000 NA   NA
 11553149 549276   plu1795     FALSE NA 1474.000 0.000 NA   NA
 11695541 549276   plu1795     FALSE NA 1474.000 0.000 NA   NA
 11410787 549276   plu1795     FALSE NA 1502.000 0.000 NA   NA
 11553150 549276   plu1795     FALSE NA 1502.000 0.000 NA   NA
 11695542 549276   plu1795     FALSE NA 1502.000 0.000 NA   NA
 11410788 549276   plu1795     FALSE NA 1534.000 0.000 NA   NA
 11553151 549276   plu1795     FALSE NA 1534.000 0.000 NA   NA
 11695543 549276   plu1795     FALSE NA 1534.000 0.000 NA   NA
 11410789 549276   plu1795     FALSE NA 1562.000 0.000 NA   NA
 11553152 549276   plu1795     FALSE NA 1562.000 0.000 NA   NA
 11695544 549276   plu1795     FALSE NA 1562.000 0.000 NA   NA
 11410790 549276   plu1795     FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11553153 549276   plu1795     FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11695545 549276   plu1795     FALSE NA 1594.000 0.000 NA   NA
 11410791 549276   plu1795     FALSE NA 1622.000 0.000 NA   NA
 11553154 549276   plu1795     FALSE NA 1622.000 0.000 NA   NA
 11695546 549276   plu1795     FALSE NA 1622.000 0.000 NA   NA
 11410792 549276   plu1795     FALSE NA 1654.000 0.000 NA   NA
 11553155 549276   plu1795     FALSE NA 1654.000 0.000 NA   NA
 11695547 549276   plu1795     FALSE NA 1654.000 0.000 NA   NA
 11410793 549276   plu1795     FALSE NA 1682.000 0.000 NA   NA
 11553156 549276   plu1795     FALSE NA 1682.000 0.000 NA   NA
 11695548 549276   plu1795     FALSE NA 1682.000 0.000 NA   NA
 11410794 549276   plu1795     FALSE NA 1714.000 0.000 NA   NA
 11553157 549276   plu1795     FALSE NA 1714.000 0.000 NA   NA
 11695549 549276   plu1795     FALSE NA 1714.000 0.000 NA   NA
 11410795 549276   plu1795     FALSE NA 1742.000 0.000 NA   NA
 11553158 549276   plu1795     FALSE NA 1742.000 0.000 NA   NA
 11695550 549276   plu1795     FALSE NA 1742.000 0.000 NA   NA
 11410796 549276   plu1795     FALSE NA 1774.000 0.000 NA   NA
 11553159 549276   plu1795     FALSE NA 1774.000 0.000 NA   NA
 11695551 549276   plu1795     FALSE NA 1774.000 0.000 NA   NA
 11410797 549276   plu1795     FALSE NA 1802.000 0.000 NA   NA
 11553160 549276   plu1795     FALSE NA 1802.000 0.000 NA   NA
 11695552 549276   plu1795     FALSE NA 1802.000 0.000 NA   NA
 11410798 549276   plu1795     FALSE NA 1834.000 0.000 NA   NA
 11553161 549276   plu1795     FALSE NA 1834.000 0.000 NA   NA
 11695553 549276   plu1795     FALSE NA 1834.000 0.000 NA   NA
 11410799 549276   plu1795     FALSE NA 1862.000 0.000 NA   NA
 11553162 549276   plu1795     FALSE NA 1862.000 0.000 NA   NA
 11695554 549276   plu1795     FALSE NA 1862.000 0.000 NA   NA
 11410800 549276   plu1795     FALSE NA 1894.000 0.000 NA   NA
 11553163 549276   plu1795     FALSE NA 1894.000 0.000 NA   NA
 11695555 549276   plu1795     FALSE NA 1894.000 0.000 NA   NA
 11410801 549276   plu1795     FALSE NA 1922.000 0.000 NA   NA
 11553164 549276   plu1795     FALSE NA 1922.000 0.000 NA   NA
 11695556 549276   plu1795     FALSE NA 1922.000 0.000 NA   NA
 11410802 549276   plu1795     FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11553165 549276   plu1795     FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11695557 549276   plu1795     FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11410803 549276   plu1795     FALSE NA 1982.000 0.000 NA   NA
 11553166 549276   plu1795     FALSE NA 1982.000 0.000 NA   NA
 11695558 549276   plu1795     FALSE NA 1982.000 0.000 NA   NA
 11410804 549276   plu1795     FALSE NA 2014.000 0.000 NA   NA
 11553167 549276   plu1795     FALSE NA 2014.000 0.000 NA   NA
 11695559 549276   plu1795     FALSE NA 2014.000 0.000 NA   NA
 11410805 549276   plu1795     FALSE NA 2042.000 0.000 NA   NA
 11553168 549276   plu1795     FALSE NA 2042.000 0.000 NA   NA
 11695560 549276   plu1795     FALSE NA 2042.000 0.000 NA   NA
 11410806 549276   plu1795     FALSE NA 2074.000 0.000 NA   NA
 11553169 549276   plu1795     FALSE NA 2074.000 0.000 NA   NA
 11695561 549276   plu1795     FALSE NA 2074.000 0.000 NA   NA
 549280 549281 plu1799 plu1800     TRUE 0.958 48.000 0.199 1.000 Y 0.833
 549281 549282 plu1800 plu1801     TRUE 0.963 30.000 0.086 1.000 Y 0.946
 549282 549283 plu1801 plu1802     TRUE 0.519 76.000 0.064 1.000   0.536
 549283 549284 plu1802 plu1803     FALSE 0.023 535.000 0.000 1.000   0.774
 549284 549285 plu1803 plu1804     TRUE 0.414 104.000 0.000 1.000   0.593
 549285 549286 plu1804 plu1805     FALSE 0.056 366.000 0.000 1.000   0.925
 549286 549287 plu1805 plu1806     TRUE 0.952 2.000 0.093 1.000 N 0.449
 549288 549289 plu1807 plu1808     FALSE 0.122 209.000 0.000 NA   -0.829
 549289 549290 plu1808 plu1809     FALSE 0.102 270.000 0.000 NA   0.901
 549290 549291 plu1809 plu1810     TRUE 0.523 57.000 0.014 1.000   0.941
 549291 549292 plu1810 plu1811     TRUE 0.435 68.000 0.000 NA   NA
 549292 549293 plu1811 plu1812     TRUE 0.996 15.000 0.667 NA   NA
 549294 549295 plu1813 plu1814   htrB FALSE 0.014 724.000 0.000 0.060 N 0.191
 549296 549297 plu1815 plu1816 dinI   FALSE 0.117 244.000 0.000 NA   0.686
 549298 549299 plu1817 plu1818     FALSE 0.164 204.000 0.000 NA   0.854
 549299 549300 plu1818 plu1819   pyrC FALSE 0.156 193.000 0.000 NA   -0.107
 549300 549301 plu1819 plu1820 pyrC ISPlu6G FALSE 0.036 391.000 0.000 1.000   NA
 549302 549303 plu1821 plu1822     FALSE 0.020 528.000 0.000 NA   0.388
 549303 549304 plu1822 plu1823     TRUE 0.949 88.000 0.667 NA   0.852
 549307 549308 plu1826 plu1827     FALSE 0.084 257.000 0.000 NA   NA
 549308 549309 plu1827 plu1828     TRUE 0.506 61.000 0.000 1.000   -0.863
 549309 549310 plu1828 plu1829     FALSE 0.251 158.000 0.000 NA   0.883
 549311 549312 plu1830 plu1831     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   NA
 549312 549313 plu1831 plu1832     FALSE 0.130 201.000 0.000 NA   NA
 549314 549315 plu1833 plu1834     TRUE 0.593 56.000 0.000 NA   0.914
 549316 549317 plu1835 plu1836     FALSE 0.027 417.000 0.000 NA   NA
 549317 549318 plu1836 plu1837     TRUE 0.857 60.000 0.250 NA   0.943
 549319 549320 plu1838 plu1839     TRUE 0.784 -97.000 0.000 NA   -0.339
 549320 549321 plu1839 plut043   tRNA-Asn FALSE 0.179 168.000 0.000 NA   NA
 549321 549322 plut043 plut044 tRNA-Asn tRNA-Asn FALSE 0.082 259.000 0.000 NA   NA
 549322 549323 plut044 plut045 tRNA-Asn tRNA-Asn FALSE 0.037 375.000 0.000 NA   NA
 549325 549326 plut046 plu1841 tRNA-Asn   FALSE 0.223 145.000 0.000 NA   NA
 549327 549328 plu1842 plu1843     FALSE 0.024 464.000 0.000 1.000   NA
 549330 549331 plu1845 plu1846     TRUE 0.404 74.000 0.000 NA   NA
 549331 549332 plu1846 plu1847   flhD FALSE 0.005 2265.000 0.000 NA   NA
 549332 549333 plu1847 plu1848 flhD flhC TRUE 0.996 4.000 0.208 0.001   0.995
 549333 549334 plu1848 plu1849 flhC motA TRUE 0.806 137.000 0.408 1.000   0.766
 549334 549335 plu1849 plu1850 motA motB TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y 0.833
 549335 549336 plu1850 plu1851 motB cheA TRUE 1.000 3.000 0.913 1.000 Y 0.724
 549336 549337 plu1851 plu1852 cheA cheW TRUE 0.992 54.000 0.447 0.001 Y 0.669
 549337 549338 plu1852 plu1853 cheW cheD TRUE 0.842 177.000 0.149 0.003 Y 0.872
 549338 549339 plu1853 plu1854 cheD   TRUE 0.992 54.000 0.429 0.000 Y 0.682
 549339 549340 plu1854 plu1855   cheR TRUE 0.996 7.000 0.188 1.000 Y 0.936
 549340 549341 plu1855 plu1856 cheR cheB TRUE 0.980 -7.000 0.037 1.000 Y 0.660
 549341 549342 plu1856 plu1857 cheB cheY TRUE 0.648 320.000 0.200 0.007 Y 0.956
 549342 549343 plu1857 plu1858 cheY cheZ TRUE 0.996 10.000 0.200 1.000 Y 0.936
 549344 549345 plu1859 plu1860 ISPlu2   TRUE 0.623 46.000 0.000 NA   NA
 549345 549346 plu1860 plu1861     TRUE 0.523 55.000 0.000 NA   NA
 549346 549347 plu1861 plu1862     TRUE 0.907 -10.000 0.000 NA   0.752
 549347 549348 plu1862 plu1863     FALSE 0.337 105.000 0.000 NA   NA
 549349 549350 plu1864 plu1865     TRUE 0.413 72.000 0.000 NA   NA
 549350 549351 plu1865 plu1866     FALSE 0.092 182.000 0.000 NA N 0.813
 549351 549352 plu1866 plu1867     TRUE 0.889 21.000 0.000 NA   -0.212
 549352 549353 plu1867 plu1868     TRUE 0.948 7.000 0.000 NA   -0.635
 549353 549354 plu1868 plu1869     TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA   -0.312
 549354 549355 plu1869 plu1870     TRUE 1.000 -7.000 1.000 0.001 Y -0.835
 549355 549356 plu1870 plu1871     TRUE 0.995 -3.000 0.400 0.049 N -0.578
 549356 549357 plu1871 plu1872     TRUE 0.984 0.000 0.000 0.049   0.199
 549357 549358 plu1872 plu1873     TRUE 0.951 -3.000 0.000 1.000   -0.429
 549358 549359 plu1873 plu1874     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.029   0.632
 549359 549360 plu1874 plu1875     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   0.497
 549360 549361 plu1875 plu1876     TRUE 0.974 50.000 0.667 NA   0.566
 549362 549363 plu1877 plu1878     TRUE 0.610 52.000 0.000 NA   0.671
 549363 549364 plu1878 plu1879     TRUE 0.651 29.000 0.000 1.000 N 0.082
 549364 549365 plu1879 plu1880     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000 N 0.648
 549365 549366 plu1880 plu1881     FALSE 0.279 136.000 0.000 NA   0.315
 549366 549367 plu1881 plu1882     FALSE 0.008 1033.000 0.000 NA   0.930
 549368 549369 plu1883 plu1884     TRUE 0.967 10.000 0.000 0.049 N 0.657
 549369 549370 plu1884 plu1885     TRUE 0.931 -7.000 0.000 1.000   0.972
 549370 549371 plu1885 plu1886     FALSE 0.015 649.000 0.000 1.000   0.661
 549371 549372 plu1886 plu1887     FALSE 0.008 835.000 0.000 NA   -0.436
 549373 549374 plu1888 plu1889     FALSE 0.042 357.000 0.000 NA   NA
 549374 549375 plu1889 plu1890     FALSE 0.359 98.000 0.000 NA   NA
 549375 549376 plu1890 plu1891     TRUE 0.397 104.000 0.000 NA   0.998
 549376 549377 plu1891 plu1892     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.889
 549377 549378 plu1892 plu1893     TRUE 0.438 97.000 0.000 NA   0.846
 549378 549379 plu1893 plu1894     TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000   0.812
 549380 549381 plu1895 plu1896 flhB flhA TRUE 0.997 -7.000 0.287 0.009 Y -0.948
 549381 549382 plu1896 plu1897 flhA   FALSE 0.025 522.000 0.000 1.000   0.793
 549382 549383 plu1897 plu1898   ISPlu10G FALSE 0.220 232.000 0.000 0.071   NA
 549383 549384 plu1898 plu1899 ISPlu10G   FALSE 0.008 776.000 0.000 NA   NA
 549384 549385 plu1899 plu1900     FALSE 0.192 182.000 0.000 NA   0.990
 549385 549386 plu1900 plu1901     TRUE 0.917 19.000 0.000 NA   0.917
 549386 549387 plu1901 plu1902     TRUE 0.643 50.000 0.000 NA   0.815
 549387 549388 plu1902 plu1903     TRUE 0.569 59.000 0.000 NA   0.916
 549388 549389 plu1903 plu1904     TRUE 0.468 63.000 0.000 NA   NA
 549389 549390 plu1904 plu1905     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 549390 549391 plu1905 plu1906     TRUE 0.468 63.000 0.000 NA   NA
 549391 549392 plu1906 plu1907     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 549392 549393 plu1907 plu1908     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 549393 549394 plu1908 plu1909     FALSE 0.007 870.000 0.000 NA   NA
 549394 549395 plu1909 plu1910     TRUE 0.623 46.000 0.000 NA   NA
 549396 549397 plu1911 plu1912   flgN FALSE 0.030 448.000 0.000 1.000   0.255
 549397 549398 plu1912 plu1913 flgN flgM TRUE 0.999 12.000 0.361 0.002 Y 0.823
 549398 549399 plu1913 plu1914 flgM flgA TRUE 0.905 125.000 0.330 NA Y 0.780
 549400 549401 plu1915 plu1916 flgB flgC TRUE 1.000 6.000 0.643 0.003 Y 0.325
 549401 549402 plu1916 plu1917 flgC flgD TRUE 0.991 13.000 0.128 NA Y 0.466
 549402 549403 plu1917 plu1918 flgD flgE TRUE 0.949 28.000 0.023 NA Y 0.927
 549403 549404 plu1918 plu1919 flgE flgF TRUE 0.993 19.000 0.095 0.005 Y 0.763
 549404 549405 plu1919 plu1920 flgF flgG TRUE 0.998 24.000 0.420 0.001 Y 0.858
 549405 549406 plu1920 plu1921 flgG flgH TRUE 0.970 75.000 0.268 0.005 Y 0.677
 549406 549407 plu1921 plu1922 flgH flgI TRUE 0.995 13.000 0.085 0.006 Y 0.418
 549407 549408 plu1922 plu1923 flgI flgJ TRUE 0.996 -3.000 0.048 0.006 Y 0.916
 549408 549409 plu1923 plu1924 flgJ flgK TRUE 0.989 127.000 0.705 0.002 Y 0.885
 549409 549410 plu1924 plu1925 flgK flgL TRUE 0.950 75.000 0.142 0.001 Y 0.969
 549410 549411 plu1925 plu1926 flgL   FALSE 0.016 613.000 0.000 NA   0.969
 549411 549412 plu1926 plu1927     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.868
 549412 549413 plu1927 plu1928     TRUE 0.908 21.000 0.000 NA   0.844
 549413 549414 plu1928 plu1929     TRUE 0.997 8.000 0.600 NA   0.980
 549414 549415 plu1929 plu1930     TRUE 0.814 127.000 0.400 NA   0.849
 549416 549417 plu1931 plu1932     TRUE 0.719 77.000 0.189 NA   -0.068
 549417 549418 plu1932 plu1933     FALSE 0.020 482.000 0.000 NA   -0.955
 549419 549420 plu1934 plu1935     TRUE 0.421 101.000 0.000 NA   0.792
 549421 549422 plu1936 plu1937 fliR fliQ TRUE 0.997 3.000 0.097 0.002 Y 0.364
 549422 549423 plu1937 plu1938 fliQ fliP TRUE 0.999 21.000 0.827 0.009 Y 0.508
 549423 549424 plu1938 plu1939 fliP fliO TRUE 0.979 32.000 0.203 1.000 Y 0.187
 549424 549425 plu1939 plu1940 fliO fliN TRUE 0.954 107.000 0.443 1.000 Y 0.930
 549425 549426 plu1940 plu1941 fliN fliM TRUE 0.996 -7.000 0.137 0.001 Y 0.165
 549426 549427 plu1941 plu1942 fliM fliL TRUE 1.000 6.000 0.957 0.001 Y 0.299
 549427 549428 plu1942 plu1943 fliL fliK FALSE 0.335 174.000 0.119 1.000   0.572
 549428 549429 plu1943 plu1944 fliK fliJ TRUE 0.998 0.000 0.317 0.005   0.647
 549429 549430 plu1944 plu1945 fliJ fliI TRUE 0.952 43.000 0.016 0.006 Y 0.093
 549430 549431 plu1945 plu1946 fliI fliH TRUE 0.999 0.000 0.400 0.003 Y 0.445
 549431 549432 plu1946 plu1947 fliH fliG TRUE 0.991 -7.000 0.005 0.003 Y 0.938
 549432 549433 plu1947 plu1948 fliG fliF TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.005 Y 0.866
 549434 549435 plu1949 plu1950 fliE   FALSE 0.013 598.000 0.000 NA   -0.621
 549436 549437 plu1951 plu1952 fliT fliS TRUE 0.995 0.000 0.324 1.000   0.786
 549437 549438 plu1952 plu1953 fliS fliD TRUE 0.999 13.000 0.284 0.002 Y 0.917
 549439 549440 plu1954 plu1955 fliC fliA FALSE 0.045 247.000 0.000 1.000 N -0.036
 549440 549441 plu1955 plu1956 fliA fliZ TRUE 0.728 53.000 0.108 1.000   0.536
 549444 549445 plu1959 plu1960 xylB   TRUE 0.934 4.000 0.059 1.000 N 0.904
 549445 549446 plu1960 plu1961     FALSE 0.015 641.000 0.000 NA   0.788
 549446 549447 plu1961 plu1962     TRUE 0.982 43.000 0.667 NA   0.990
 549449 549450 plu1964 plu1965 wrbA   FALSE 0.044 380.000 0.000 1.000   0.140
 549452 549453 plu1966 plu1967     FALSE 0.012 625.000 0.000 NA   -0.687
 549453 549454 plu1967 plu1968   dsdC FALSE 0.027 310.000 0.000 1.000 N -0.276
 549455 549456 plu1969 plu1970 dsdX dsdA FALSE 0.045 685.000 0.037 1.000 Y -0.243
 549457 549458 plu1971 plu1972     FALSE 0.210 152.000 0.000 NA   NA
 549459 549460 plu1973 plu1974     TRUE 0.965 -31.000 0.278 NA   0.971
 549460 549461 plu1974 plu1975     FALSE 0.043 384.000 0.000 NA   0.526
 549461 549462 plu1975 plu1976     FALSE 0.178 182.000 0.000 NA   0.198
 549462 549463 plu1976 plu1977     FALSE 0.124 207.000 0.000 NA   -0.818
 549465 549466 plu1979 plu1980 sgcA sgaB TRUE 0.997 12.000 0.130 0.005 Y 0.432
 549466 549467 plu1980 plu1981 sgaB   TRUE 0.997 14.000 0.377 0.007   0.530
 549467 549468 plu1981 plu1982     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 549469 549470 plu1983 plu1984     FALSE 0.157 181.000 0.000 NA   NA
 549470 549471 plu1984 plu1985     TRUE 0.693 40.000 0.000 NA   NA
 549471 549472 plu1985 plu1986     FALSE 0.214 150.000 0.000 NA   NA
 549472 549473 plu1986 plu1987     FALSE 0.047 335.000 0.000 NA   NA
 549473 549474 plu1987 plu1988   malH FALSE 0.164 257.000 0.000 0.013 N 0.575
 549474 549475 plu1988 plu1989 malH   TRUE 0.998 14.000 0.462 1.000 Y 0.865
 549476 549477 plu1990 plu1991     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 549477 549478 plu1991 plu1992   fruB FALSE 0.020 575.000 0.000 1.000   0.888
 549478 549479 plu1992 plu1993 fruB fruA TRUE 0.909 70.000 0.000 0.005 Y 0.985
 549479 549480 plu1993 plu1994 fruA   FALSE 0.225 153.000 0.000 1.000   -0.884
 549480 549481 plu1994 plu1995     TRUE 0.995 24.000 0.562 0.056   0.990
 549481 549482 plu1995 plu1996     TRUE 0.717 117.000 0.233 NA   0.923
 549482 549483 plu1996 plu1997   php TRUE 0.827 44.000 0.125 NA   0.925
 549483 549484 plu1997 plu1998 php   TRUE 0.990 12.000 0.312 NA   -0.864
 549484 549485 plu1998 plu1999     TRUE 0.991 38.000 0.828 NA   0.640
 549485 549486 plu1999 plu2000     TRUE 0.664 48.000 0.045 NA   0.664
 549487 549488 plu2001 plu2002     TRUE 0.504 148.000 0.000 0.036   0.850
 549488 549489 plu2002 plu2003     TRUE 0.921 28.000 0.000 0.036   NA
 549489 549490 plu2003 plu2004     TRUE 0.405 292.000 0.000 0.036 Y NA
 549490 549491 plu2004 plu2005     TRUE 0.972 30.000 0.000 0.036 Y NA
 549491 549492 plu2005 plu2006     TRUE 0.970 31.000 0.000 0.036 Y NA
 549492 549493 plu2006 plu2007     TRUE 0.972 30.000 0.000 0.036 Y NA
 549493 549494 plu2007 plu2008     TRUE 0.970 31.000 0.000 0.036 Y NA
 549494 549495 plu2008 plu2009     TRUE 0.458 261.000 0.000 0.036 Y NA
 549495 549496 plu2009 plu2010     TRUE 0.438 271.000 0.000 0.036 Y NA
 549496 549497 plu2010 plu2011     TRUE 0.693 161.000 0.000 0.036 Y NA
 549497 549498 plu2011 plu2012     TRUE 0.693 161.000 0.000 0.036 Y NA
 549498 549499 plu2012 plu2013     TRUE 0.976 27.000 0.000 0.036 Y NA
 549499 549500 plu2013 plu2014     TRUE 0.841 -15.000 0.000 NA   NA
 549500 549501 plu2014 plu2015     TRUE 0.921 14.000 0.000 NA   NA
 549501 549502 plu2015 plu2016     TRUE 0.756 56.000 0.000 0.036   NA
 549504 549505 plu2018 plu2019     FALSE 0.101 653.000 0.000 0.036 Y 0.246
 549505 549506 plu2019 plu2020   rfaZ FALSE 0.007 1050.000 0.000 NA   -0.537
 549506 549507 plu2020 plu2021 rfaZ   TRUE 0.766 36.000 0.000 NA   0.058
 549508 549509 plu2022 plu2023     FALSE 0.011 794.000 0.000 NA   0.940
 11410807 549508   plu2022     FALSE NA 206.000 0.000 NA   NA
 11553170 549508   plu2022     FALSE NA 206.000 0.000 NA   NA
 11695562 549508   plu2022     FALSE NA 206.000 0.000 NA   NA
 11410808 549508   plu2022     FALSE NA 237.000 0.000 NA   NA
 11553171 549508   plu2022     FALSE NA 237.000 0.000 NA   NA
 11695563 549508   plu2022     FALSE NA 237.000 0.000 NA   NA
 11410809 549508   plu2022     FALSE NA 266.000 0.000 NA   NA
 11553172 549508   plu2022     FALSE NA 266.000 0.000 NA   NA
 11695564 549508   plu2022     FALSE NA 266.000 0.000 NA   NA
 11410810 549508   plu2022     FALSE NA 297.000 0.000 NA   NA
 11553173 549508   plu2022     FALSE NA 297.000 0.000 NA   NA
 11695565 549508   plu2022     FALSE NA 297.000 0.000 NA   NA
 11410811 549508   plu2022     FALSE NA 326.000 0.000 NA   NA
 11553174 549508   plu2022     FALSE NA 326.000 0.000 NA   NA
 11695566 549508   plu2022     FALSE NA 326.000 0.000 NA   NA
 549509 549510 plu2023 plu2024     TRUE 0.596 55.000 0.000 NA   0.960
 11410812 549508   plu2022     FALSE NA 3286.000 0.000 NA   NA
 11553175 549508   plu2022     FALSE NA 3286.000 0.000 NA   NA
 11695567 549508   plu2022     FALSE NA 3286.000 0.000 NA   NA
 11410813 549508   plu2022     FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11553176 549508   plu2022     FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11695568 549508   plu2022     FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11410814 549508   plu2022     FALSE NA 3346.000 0.000 NA   NA
 11553177 549508   plu2022     FALSE NA 3346.000 0.000 NA   NA
 11695569 549508   plu2022     FALSE NA 3346.000 0.000 NA   NA
 11410815 549508   plu2022     FALSE NA 3374.000 0.000 NA   NA
 11553178 549508   plu2022     FALSE NA 3374.000 0.000 NA   NA
 11695570 549508   plu2022     FALSE NA 3374.000 0.000 NA   NA
 11410816 549508   plu2022     FALSE NA 3406.000 0.000 NA   NA
 11553179 549508   plu2022     FALSE NA 3406.000 0.000 NA   NA
 11695571 549508   plu2022     FALSE NA 3406.000 0.000 NA   NA
 11410817 549508   plu2022     FALSE NA 3434.000 0.000 NA   NA
 11553180 549508   plu2022     FALSE NA 3434.000 0.000 NA   NA
 11695572 549508   plu2022     FALSE NA 3434.000 0.000 NA   NA
 11410818 549508   plu2022     FALSE NA 3466.000 0.000 NA   NA
 11553181 549508   plu2022     FALSE NA 3466.000 0.000 NA   NA
 11695573 549508   plu2022     FALSE NA 3466.000 0.000 NA   NA
 11410819 549508   plu2022     FALSE NA 3494.000 0.000 NA   NA
 11553182 549508   plu2022     FALSE NA 3494.000 0.000 NA   NA
 11695574 549508   plu2022     FALSE NA 3494.000 0.000 NA   NA
 549511 549512 plu2025 plut048   tRNA-Leu FALSE 0.069 285.000 0.000 NA   NA
 11410820 549508   plu2022     FALSE NA 3526.000 0.000 NA   NA
 11553183 549508   plu2022     FALSE NA 3526.000 0.000 NA   NA
 11695575 549508   plu2022     FALSE NA 3526.000 0.000 NA   NA
 11410821 549508   plu2022     FALSE NA 3554.000 0.000 NA   NA
 11553184 549508   plu2022     FALSE NA 3554.000 0.000 NA   NA
 11695576 549508   plu2022     FALSE NA 3554.000 0.000 NA   NA
 11410822 549508   plu2022     FALSE NA 3586.000 0.000 NA   NA
 11553185 549508   plu2022     FALSE NA 3586.000 0.000 NA   NA
 11695577 549508   plu2022     FALSE NA 3586.000 0.000 NA   NA
 11410823 549508   plu2022     FALSE NA 3614.000 0.000 NA   NA
 11553186 549508   plu2022     FALSE NA 3614.000 0.000 NA   NA
 11695578 549508   plu2022     FALSE NA 3614.000 0.000 NA   NA
 11410824 549508   plu2022     FALSE NA 3646.000 0.000 NA   NA
 11553187 549508   plu2022     FALSE NA 3646.000 0.000 NA   NA
 11695579 549508   plu2022     FALSE NA 3646.000 0.000 NA   NA
 11410825 549508   plu2022     FALSE NA 3674.000 0.000 NA   NA
 11553188 549508   plu2022     FALSE NA 3674.000 0.000 NA   NA
 11695580 549508   plu2022     FALSE NA 3674.000 0.000 NA   NA
 11410826 549508   plu2022     FALSE NA 3706.000 0.000 NA   NA
 11553189 549508   plu2022     FALSE NA 3706.000 0.000 NA   NA
 11695581 549508   plu2022     FALSE NA 3706.000 0.000 NA   NA
 11410827 549508   plu2022     FALSE NA 3734.000 0.000 NA   NA
 11553190 549508   plu2022     FALSE NA 3734.000 0.000 NA   NA
 11695582 549508   plu2022     FALSE NA 3734.000 0.000 NA   NA
 11410828 549508   plu2022     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11553191 549508   plu2022     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11695583 549508   plu2022     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11410829 549508   plu2022     FALSE NA 3794.000 0.000 NA   NA
 11553192 549508   plu2022     FALSE NA 3794.000 0.000 NA   NA
 11695584 549508   plu2022     FALSE NA 3794.000 0.000 NA   NA
 11410830 549508   plu2022     FALSE NA 3826.000 0.000 NA   NA
 11553193 549508   plu2022     FALSE NA 3826.000 0.000 NA   NA
 11695585 549508   plu2022     FALSE NA 3826.000 0.000 NA   NA
 11410831 549508   plu2022     FALSE NA 3854.000 0.000 NA   NA
 11553194 549508   plu2022     FALSE NA 3854.000 0.000 NA   NA
 11695586 549508   plu2022     FALSE NA 3854.000 0.000 NA   NA
 11410832 549508   plu2022     FALSE NA 3886.000 0.000 NA   NA
 11553195 549508   plu2022     FALSE NA 3886.000 0.000 NA   NA
 11695587 549508   plu2022     FALSE NA 3886.000 0.000 NA   NA
 549512 549513 plut048 plut049 tRNA-Leu tRNA-Cys TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 549513 549514 plut049 plut050 tRNA-Cys tRNA-Gly TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 549514 549515 plut050 plu2026 tRNA-Gly pgsA FALSE 0.223 145.000 0.000 NA   NA
 549515 549516 plu2026 plu2027 pgsA uvrC TRUE 0.778 58.000 0.227 1.000 N 0.981
 549516 549517 plu2027 plu2028 uvrC uvrY TRUE 0.931 -16.000 0.086 0.035 N 0.593
 549518 549519 plu2029 plu2030     FALSE 0.052 360.000 0.000 NA   0.640
 549519 549520 plu2030 plu2031     FALSE 0.104 261.000 0.000 NA   0.988
 549520 549521 plu2031 plu2032     FALSE 0.303 179.000 0.111 NA   0.972
 549521 549522 plu2032 plu2033   aqpZ FALSE 0.007 492.000 0.000 1.000 N -0.959
 549522 549523 plu2033 plu2034 aqpZ   FALSE 0.046 383.000 0.000 NA   0.946
 549523 549524 plu2034 plu2035     TRUE 0.899 22.000 0.000 NA   0.940
 549524 549525 plu2035 plu2036     FALSE 0.108 238.000 0.000 NA   -0.137
 549525 549526 plu2036 plu2037     FALSE 0.112 234.000 0.000 NA   -0.030
 549526 549527 plu2037 plu2038     FALSE 0.212 151.000 0.000 NA   NA
 549527 549528 plu2038 plu2039   phoH FALSE 0.050 328.000 0.000 NA   NA
 549529 549530 plu2040 plu2041     FALSE 0.296 139.000 0.000 NA   0.923
 549530 549531 plu2041 plu2042     FALSE 0.170 204.000 0.000 1.000   0.970
 549531 549532 plu2042 plu2043     TRUE 0.988 -10.000 0.000 0.031 Y 0.989
 549533 549534 plu2044 plu2045     TRUE 0.770 38.000 0.000 NA   0.709
 549535 549536 plu2046 plu2047   ISPlu3U FALSE 0.009 754.000 0.000 NA   NA
 549536 549537 plu2047 plu2048 ISPlu3U   FALSE 0.367 96.000 0.000 NA   NA
 549539 549540 plu2050 plu2051     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.821
 549541 549542 plu2052 plu2053     FALSE 0.019 497.000 0.000 NA   NA
 549543 549544 plu2054 plu2055   pth TRUE 0.783 142.000 0.184 1.000 Y -0.228
 549545 549546 plu2056 plu2057     FALSE 0.020 497.000 0.000 NA   -0.622
 549546 549547 plu2057 plu2058     FALSE 0.011 770.000 0.000 NA   0.975
 549547 549548 plu2058 plu2059     FALSE 0.017 585.000 0.000 NA   0.990
 549548 549549 plu2059 plu2060     FALSE 0.054 356.000 0.000 NA   0.990
 549549 549550 plu2060 plu2061     FALSE 0.059 340.000 0.000 NA   0.986
 549550 549551 plu2061 plu2062     FALSE 0.386 84.000 0.000 NA   NA
 549551 549552 plu2062 plu2063     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549552 549553 plu2063 plu2064     FALSE 0.371 115.000 0.000 NA   0.953
 549553 549554 plu2064 plu2065     FALSE 0.022 480.000 0.000 NA   -0.472
 549555 549556 plu2066 plu2067 prsA ispE FALSE 0.252 64.000 0.022 1.000 N 0.983
 549556 549557 plu2067 plu2068 ispE lolB TRUE 0.894 0.000 0.024 1.000 N 0.979
 549558 549559 plu2069 plu2070 hemA prfA TRUE 0.941 32.000 0.171 0.037 N 0.406
 549559 549560 plu2070 plu2071 prfA hemK TRUE 0.998 0.000 0.229 0.037 Y -0.816
 549560 549561 plu2071 plu2072 hemK   TRUE 0.876 -16.000 0.059 1.000   -0.199
 549561 549562 plu2072 plu2073   kdsA FALSE 0.316 156.000 0.089 1.000   -0.071
 549564 549565 plu2075 plu2076     FALSE 0.008 595.000 0.000 1.000 N 0.942
 549565 549566 plu2076 plu2077     FALSE 0.051 322.000 0.000 NA   -0.999
 549566 549567 plu2077 plu2078     FALSE 0.205 162.000 0.000 NA   -0.272
 549567 549568 plu2078 plu2079   luxC FALSE 0.018 540.000 0.000 NA   -0.072
 549568 549569 plu2079 plu2080 luxC luxD TRUE 0.997 13.000 0.667 1.000   0.416
 549569 549570 plu2080 plu2081 luxD luxA TRUE 0.909 177.000 0.889 1.000   0.513
 549570 549571 plu2081 plu2082 luxA luxB TRUE 1.000 18.000 0.875 0.000 Y -0.783
 549571 549572 plu2082 plu2083 luxB luxE TRUE 0.853 62.000 0.158 0.002 N 0.732
 549572 549573 plu2083 plu2084 luxE   FALSE 0.197 169.000 0.000 NA   -0.064
 549574 549575 plu2085 plut051   tRNA-Ser FALSE 0.057 312.000 0.000 NA   NA
 549576 549577 plu2086 plu2087     TRUE 0.493 73.000 0.046 1.000   0.672
 549578 549579 plu2088 plu2089     TRUE 0.906 38.000 0.196 NA   -0.799
 549580 549581 plu2090 plu2091 rimJ mviN FALSE 0.004 1397.000 0.008 1.000   -0.960
 549582 549583 plu2092 plu2093 argS   FALSE 0.057 355.000 0.000 NA   0.800
 549584 549585 plu2094 plu2095     TRUE 0.856 27.000 0.074 NA   -0.731
 549588 549589 plu2098 plu2099     TRUE 0.998 1.000 0.600 NA   0.992
 549590 549591 plu2100 plu2101   cutC FALSE 0.238 138.000 0.000 NA   NA
 549592 549593 plu2102 plu2103     TRUE 0.993 -3.000 0.315 NA   0.861
 549594 549595 plu2104 plu2105     TRUE 0.994 -10.000 0.571 NA   0.975
 549597 549598 plu2107 plu2108 aspS nudB TRUE 0.930 0.000 0.050 1.000 N 0.972
 549598 549599 plu2108 plu2109 nudB   TRUE 0.765 30.000 0.035 NA   -0.896
 549599 549600 plu2109 plu2110   ruvC TRUE 0.398 232.000 0.277 NA   NA
 549600 549601 plu2110 plu2111 ruvC ruvA TRUE 0.979 87.000 0.451 0.009 Y NA
 549601 549602 plu2111 plu2112 ruvA ruvB TRUE 0.999 17.000 0.549 0.001 Y 0.957
 549603 549604 plu2113 plu2114 znuB znuC TRUE 1.000 -3.000 0.755 0.073 Y 0.732
 549605 549606 plu2115 plu2116 znuA yebA TRUE 0.920 21.000 0.131 1.000 N 0.819
 549606 549607 plu2116 plu2117 yebA msbB TRUE 0.854 152.000 0.299 1.000 Y 0.184
 549608 549609 plu2118 plu2119 pykA   FALSE 0.012 616.000 0.000 NA   -0.860
 549609 549610 plu2119 plu2120     FALSE 0.042 395.000 0.000 NA   0.800
 549610 549611 plu2120 plu2121   hexR FALSE 0.023 473.000 0.000 NA   -0.125
 549612 549613 plu2122 plu2123 zwf   FALSE 0.011 499.000 0.000 1.000 N 0.741
 549613 549614 plu2123 plu2124     TRUE 1.000 5.000 0.869 0.056 Y 0.985
 549615 549616 plu2125 plu2126     FALSE 0.043 367.000 0.000 NA   -0.224
 549616 549617 plu2126 plu2127     TRUE 0.854 29.000 0.059 NA   0.952
 549617 549618 plu2127 plu2128     FALSE 0.081 305.000 0.000 NA   0.838
 549619 549620 plu2129 plu2130     FALSE 0.097 267.000 0.000 1.000   0.051
 549620 549621 plu2130 plu2131     TRUE 0.974 -7.000 0.174 1.000   0.993
 549621 549622 plu2131 plu2132     FALSE 0.059 233.000 0.000 1.000 N 0.581
 549622 549623 plu2132 plu2133     FALSE 0.201 84.000 0.024 1.000 N 0.669
 549623 549624 plu2133 plu2134   fadD FALSE 0.015 867.000 0.169 1.000 N 0.507
 549624 549625 plu2134 plu2135 fadD rnd TRUE 0.431 96.000 0.115 1.000 N 0.967
 549626 549627 plu2136 plu2137 minE minD TRUE 0.999 4.000 0.618 NA Y -0.091
 549627 549628 plu2137 plu2138 minD minC TRUE 0.996 24.000 0.466 1.000 Y 0.895
 549629 549630 plu2139 plu2140     FALSE 0.059 352.000 0.056 NA   0.474
 549630 549631 plu2140 plu2141     TRUE 0.899 25.000 0.088 NA   0.302
 549631 549632 plu2141 plu2142     FALSE 0.077 306.000 0.000 NA   0.984
 549633 549634 plu2143 plu2144   hslJ FALSE 0.066 324.000 0.000 NA   0.986
 549634 549635 plu2144 plu2145 hslJ ldhA TRUE 0.716 22.000 0.024 NA N 0.812
 549636 549637 plu2146 plu2147     TRUE 0.925 -3.000 0.023 NA   NA
 549637 549638 plu2147 plu2148     TRUE 0.997 13.000 0.726 NA   NA
 549640 549641 plu2150 plu2151 hrpA   FALSE 0.190 169.000 0.000 NA   -0.457
 549641 549642 plu2151 plu2152     FALSE 0.317 113.000 0.000 NA   -0.797
 549644 549645 plu2154 plu2155     TRUE 0.964 0.000 0.043 NA   0.869
 549646 549647 plu2156 plu2157     TRUE 0.999 20.000 1.000 1.000 Y -0.486
 549647 549648 plu2157 plu2158     TRUE 0.997 38.000 1.000 1.000 Y -0.194
 549648 549649 plu2158 plu2159     TRUE 0.985 115.000 1.000 1.000 Y -0.122
 549650 549651 plu2160 plu2161     TRUE 0.955 7.000 0.000 NA   0.364
 549653 549654 plu2163 plu2164     TRUE 0.998 1.000 0.656 NA   0.993
 549654 549655 plu2164 plu2165     TRUE 0.762 80.000 0.000 NA Y 0.344
 549657 549658 plu2167 plu2168 pntA pntB TRUE 1.000 11.000 0.745 0.000 Y 0.962
 549659 549660 plu2169 plu2170     FALSE 0.043 392.000 0.000 NA   0.940
 549661 549662 plu2171 plu2172 ureA ureB TRUE 0.972 92.000 0.267 0.001 Y 0.789
 549662 549663 plu2172 plu2173 ureB ureC TRUE 0.978 68.000 0.267 0.001 Y 0.791
 549663 549664 plu2173 plu2174 ureC ureE TRUE 0.723 75.000 0.067 0.001 N 0.905
 549664 549665 plu2174 plu2175 ureE ureF TRUE 0.999 -3.000 0.460 0.002 Y -0.177
 549665 549666 plu2175 plu2176 ureF ureG TRUE 0.947 53.000 0.064 0.002 Y -0.208
 549666 549667 plu2176 plu2177 ureG ureD TRUE 0.997 -3.000 0.095 0.002 Y 0.964
 549668 549669 plu2178 plu2179   fnr TRUE 0.953 136.000 0.619 1.000 Y -0.757
 549670 549671 plu2180 plu2181     TRUE 0.529 87.000 0.080 NA   0.794
 549671 549672 plu2181 plu2182     TRUE 0.779 41.000 0.080 NA   0.417
 549672 549673 plu2182 plu2183     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA   0.418
 549673 549674 plu2183 plu2184     TRUE 0.996 0.000 0.477 NA   -0.868
 549674 549675 plu2184 plu2185     TRUE 0.918 16.000 0.045 NA   0.063
 549675 549676 plu2185 plu2186     FALSE 0.064 329.000 0.000 NA   0.972
 549676 549677 plu2186 plu2187     TRUE 0.715 87.000 0.008 NA Y 0.988
 549677 549678 plu2187 plu2188     TRUE 0.763 33.000 0.000 NA   NA
 549679 549680 plu2189 plu2190     TRUE 0.732 37.000 0.000 NA   NA
 549681 549682 plu2191 plu2192     TRUE 0.903 3.000 0.000 1.000 N 0.044
 549682 549683 plu2192 plu2193     TRUE 0.957 11.000 0.000 1.000   0.846
 549683 549684 plu2193 plu2194     TRUE 0.642 49.000 0.000 1.000   0.094
 549684 549685 plu2194 plu2195     TRUE 0.762 36.000 0.000 NA   -0.093
 549685 549686 plu2195 plu2196     TRUE 0.826 -28.000 0.000 NA   0.247
 549686 549687 plu2196 plu2197     TRUE 0.954 9.000 0.000 NA   0.433
 549687 549688 plu2197 plu2198     TRUE 0.778 41.000 0.000 0.072 N 0.990
 549688 549689 plu2198 plu2199     TRUE 0.724 27.000 0.000 1.000 N 0.964
 549689 549690 plu2199 plu2200     TRUE 0.924 0.000 0.000 1.000 N 0.974
 549691 549692 plu2201 plu2202     TRUE 0.758 70.000 0.000 0.006   0.988
 549692 549693 plu2202 plu2203   hcaR FALSE 0.373 117.000 0.000 1.000   0.993
 549694 549695 plu2204 plu2205 hcaE hcaF TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.001 N 0.997
 549695 549696 plu2205 plu2206 hcaF hcaC TRUE 0.983 0.000 0.083 0.030 N 0.903
 549696 549697 plu2206 plu2207 hcaC hcaB TRUE 0.983 0.000 0.083 0.020 N 0.911
 549697 549698 plu2207 plu2208 hcaB   TRUE 0.966 -10.000 0.000 0.020   0.905
 549698 549699 plu2208 plu2209     TRUE 0.987 2.000 0.000 0.020   0.868
 549700 549701 plu2210 plu2211     TRUE 0.975 -3.000 0.143 NA   NA
 549701 549702 plu2211 plu2212     FALSE 0.038 369.000 0.000 NA   NA
 549703 549704 plu2213 plu2214     TRUE 0.479 61.000 0.000 NA   NA
 549704 549705 plu2214 plu2215     TRUE 0.961 0.000 0.000 NA   0.423
 549705 549706 plu2215 plu2216     TRUE 0.896 -9.000 0.000 NA   -0.553
 549706 549707 plu2216 plu2217     FALSE 0.003 1131.000 0.000 NA N -0.016
 549707 549708 plu2217 plu2218     TRUE 0.951 6.000 0.000 NA   -0.392
 549708 549709 plu2218 plu2219     TRUE 0.930 13.000 0.000 NA   -0.829
 549709 549710 plu2219 plu2220     TRUE 0.543 53.000 0.000 NA   -0.892
 549710 549711 plu2220 plu2221     TRUE 0.949 12.000 0.000 NA   0.740
 549711 549712 plu2221 plu2222     FALSE 0.239 144.000 0.000 NA   -0.448
 549713 549714 plu2223 plu2224     FALSE 0.253 156.000 0.000 NA   0.946
 549715 549716 plu2225 plu2226   mlc TRUE 0.923 132.000 0.408 NA Y 0.928
 549716 549717 plu2226 plu2227 mlc   TRUE 0.638 165.000 0.455 NA N -0.942
 549720 549721 plu2230 plu2231     FALSE 0.060 315.000 0.000 NA   -0.430
 549721 549722 plu2231 plu2232     TRUE 0.994 16.000 0.500 NA   0.927
 549722 549723 plu2232 plu2233     FALSE 0.244 132.000 0.029 NA   0.037
 549723 549724 plu2233 plu2234     FALSE 0.317 225.000 0.000 0.018   0.857
 549728 549729 plu2238 plu2239     FALSE 0.231 160.000 0.000 NA   0.484
 549729 549730 plu2239 plu2240     FALSE 0.279 140.000 0.000 NA   0.582
 549730 549731 plu2240 plu2241     TRUE 0.999 3.000 0.600 0.030   0.319
 549731 549732 plu2241 plu2242     TRUE 0.984 -3.000 0.179 1.000   -0.181
 549732 549733 plu2242 plu2243     TRUE 0.990 -3.000 0.077 1.000 Y 0.396
 549734 549735 plu2244 plu2245     FALSE 0.066 229.000 0.044 1.000 N 0.938
 549735 549736 plu2245 plu2246     TRUE 0.772 42.000 0.044 0.046 N 0.119
 549736 549737 plu2246 plu2247     TRUE 0.497 61.000 0.119 1.000 N -0.689
 549739 549740 plu2249 plu2250     FALSE 0.336 122.000 0.000 NA   0.702
 549740 549741 plu2250 plu2251     TRUE 0.990 11.000 0.250 NA   0.981
 549741 549742 plu2251 plu2252     TRUE 0.428 100.000 0.000 NA   0.919
 549744 549745 plu2254 plu2255     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549745 549746 plu2255 plu2256     FALSE 0.009 713.000 0.000 NA   NA
 549746 549747 plu2256 plu2257     FALSE 0.113 220.000 0.000 NA   -0.811
 549750 549751 plu2260 plu2261     FALSE 0.105 257.000 0.000 NA   0.998
 549751 549752 plu2261 plu2262     FALSE 0.011 666.000 0.000 NA   -0.242
 549752 549753 plu2262 plu2263     FALSE 0.167 204.000 0.000 1.000   0.692
 549753 549754 plu2263 plu2264     FALSE 0.238 156.000 0.000 NA   0.488
 549754 549755 plu2264 plu2265     TRUE 0.997 -3.000 0.286 NA Y 0.990
 549759 549760 plu2269 plu2270     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.992
 549760 549761 plu2270 plu2271     FALSE 0.062 304.000 0.000 NA   -0.853
 549762 549763 plu2272 plu2273   bglA TRUE 0.858 39.000 0.000 0.003 N 0.106
 549765 549766 plu2275 plu2276 xylA   FALSE 0.034 420.000 0.000 NA   0.623
 549766 549767 plu2276 plu2277     FALSE 0.085 295.000 0.000 NA   0.774
 549767 549768 plu2277 plu2278   ccdA TRUE 0.458 88.000 0.000 NA   0.875
 549768 549769 plu2278 plu2279 ccdA ccdB TRUE 0.998 2.000 0.667 NA   0.941
 549770 549771 plu2280 plu2281     TRUE 0.516 56.000 0.000 NA   NA
 549771 549772 plu2281 plu2282   ISPlu1C TRUE 0.827 -18.000 0.000 NA   NA
 549772 549773 plu2282 plu2283 ISPlu1C   FALSE 0.242 143.000 0.000 1.000   NA
 549773 549774 plu2283 plu2284   bvgS FALSE 0.286 145.000 0.000 1.000   0.673
 549774 549775 plu2284 plu2285 bvgS bvgR TRUE 0.996 4.000 0.000 0.007 Y 0.892
 549775 549776 plu2285 plu2286 bvgR   TRUE 0.836 31.000 0.000 1.000   0.843
 549776 549777 plu2286 plu2287     TRUE 0.628 50.000 0.000 1.000   0.147
 549777 549778 plu2287 plu2288     TRUE 0.928 -7.000 0.047 NA   0.946
 549778 549779 plu2288 plu2289     TRUE 0.930 16.000 0.050 NA   0.981
 549779 549780 plu2289 plu2290     TRUE 0.999 0.000 0.744 NA   0.508
 549780 549781 plu2290 plu2291     TRUE 0.996 4.000 0.465 NA   NA
 549781 549782 plu2291 plu2292     TRUE 0.917 -7.000 0.059 NA   NA
 549782 549783 plu2292 plu2293     TRUE 0.948 14.000 0.059 NA   0.882
 549783 549784 plu2293 plu2294     TRUE 0.990 -3.000 0.231 NA   0.863
 549784 549785 plu2294 plu2295     TRUE 0.799 35.000 0.000 NA   0.954
 549785 549786 plu2295 plu2296     TRUE 0.975 25.000 0.300 NA   0.965
 549786 549787 plu2296 plu2297     TRUE 0.984 -9.000 0.300 NA   0.606
 549787 549788 plu2297 plu2298     TRUE 0.959 5.000 0.000 NA   0.666
 549788 549789 plu2298 plu2299     TRUE 0.592 52.000 0.000 NA   0.248
 549789 549790 plu2299 plu2300     TRUE 0.554 57.000 0.042 NA   0.533
 549790 549791 plu2300 plu2301     TRUE 0.999 8.000 0.920 NA   0.275
 549793 549794 plu2303 plu2304     FALSE 0.028 416.000 0.000 NA   NA
 549795 549796 plu2305 plu2306     TRUE 0.992 -12.000 0.514 NA   0.974
 549797 549798 plu2307 plu2308     FALSE 0.116 213.000 0.000 NA   NA
 549798 549799 plu2308 plu2309     TRUE 0.995 -3.000 0.429 NA   0.806
 549799 549800 plu2309 plu2310     TRUE 0.564 54.000 0.000 NA   -0.022
 549804 549805 plu2314 plu2315 ISPlu3T   FALSE 0.027 288.000 0.000 1.000 N NA
 549806 549807 plu2316 plu2317     TRUE 0.950 -3.000 0.125 NA N -0.057
 549807 549808 plu2317 plu2318     FALSE 0.264 74.000 0.000 NA N 0.976
 549808 549809 plu2318 plu2319     TRUE 0.994 -55.000 0.250 0.006 Y 0.828
 549809 549810 plu2319 plu2320     TRUE 0.549 43.000 0.000 1.000 N 0.835
 549810 549811 plu2320 plu2321     TRUE 1.000 0.000 1.000 0.006 Y 0.689
 549811 549812 plu2321 plu2322     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y 0.849
 549812 549813 plu2322 plu2323     TRUE 0.994 27.000 0.406 1.000 Y 0.671
 549813 549814 plu2323 plu2324     TRUE 0.996 0.000 0.000 0.018 Y 0.736
 549814 549815 plu2324 plu2325     FALSE 0.062 193.000 0.000 1.000 N -0.786
 549815 549816 plu2325 plu2326     FALSE 0.021 536.000 0.000 NA   0.990
 549817 549818 plu2327 plu2328     TRUE 0.957 11.000 0.000 1.000   0.865
 549818 549819 plu2328 plu2329     TRUE 0.954 7.000 0.000 NA   0.241
 549820 549821 plu2330 plu2331     TRUE 0.732 37.000 0.000 NA   NA
 549821 549822 plu2331 plu2332     TRUE 0.769 -87.000 0.000 NA   NA
 549822 549823 plu2332 plu2333     TRUE 0.693 40.000 0.000 NA   NA
 549823 549824 plu2333 plu2334     TRUE 0.772 -78.000 0.000 NA   NA
 549824 549825 plu2334 plu2335     TRUE 0.817 -135.000 0.000 NA   0.887
 549828 549829 plu2338 plu2339     FALSE 0.067 326.000 0.000 NA   0.848
 549829 549830 plu2339 plu2340     FALSE 0.367 114.000 0.000 NA   0.985
 549830 549831 plu2340 plu2341     TRUE 0.982 45.000 0.375 1.000 Y 0.993
 549831 549832 plu2341 plu2342     FALSE 0.014 441.000 0.000 1.000 N 0.994
 549834 549835 plu2344 plu2345     FALSE 0.055 199.000 0.000 1.000 N -0.959
 549835 549836 plu2345 plu2346     TRUE 0.829 58.000 0.222 1.000   -0.854
 549836 549837 plu2346 plu2347   goaG TRUE 0.953 39.000 0.333 1.000   -0.645
 549837 549838 plu2347 plu2348 goaG   FALSE 0.086 295.000 0.000 NA   0.950
 549838 549839 plu2348 plu2349     TRUE 0.981 16.000 0.222 NA   0.999
 549846 549847 plu2356 plu2357 tus   TRUE 0.473 73.000 0.000 NA   0.700
 549847 549848 plu2357 plu2358     TRUE 0.995 -3.000 0.412 NA   0.980
 549850 549851 plu2360 plu2361 manA   TRUE 0.922 140.000 0.778 NA   0.894
 549851 549852 plu2361 plu2362   add TRUE 0.582 78.000 0.113 NA   0.363
 549853 549854 plu2363 plu2364     FALSE 0.131 227.000 0.000 NA   0.656
 549854 549855 plu2364 plu2365     TRUE 0.423 90.000 0.000 NA   0.314
 549855 549856 plu2365 plu2366     TRUE 0.997 -55.000 0.667 NA Y 0.759
 549856 549857 plu2366 plu2367     FALSE 0.041 359.000 0.000 NA   NA
 549857 549858 plu2367 plu2368     FALSE 0.302 116.000 0.000 NA   NA
 549858 549859 plu2368 plu2369     TRUE 0.998 0.000 0.689 NA   0.205
 549860 549861 plu2370 plu2371     FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 549861 549862 plu2371 plu2372     TRUE 0.971 18.000 0.176 NA   0.813
 549863 549864 plu2373 plu2374     FALSE 0.033 436.000 0.000 NA   0.851
 549864 549865 plu2374 plu2375     TRUE 0.401 209.000 0.207 NA   0.801
 549866 549867 plu2376 plu2377   rnfA TRUE 0.535 127.000 0.148 NA   0.729
 549867 549868 plu2377 plu2378 rnfA rnfB TRUE 1.000 0.000 0.564 0.029 Y 0.780
 549868 549869 plu2378 plu2379 rnfB rnfC TRUE 0.999 -7.000 0.537 0.005 Y 0.838
 549869 549870 plu2379 plu2380 rnfC rfnD TRUE 1.000 13.000 0.814 0.029 Y 0.902
 549870 549871 plu2380 plu2381 rfnD rfnG TRUE 1.000 10.000 0.924 0.029 Y 0.367
 549871 549872 plu2381 plu2382 rfnG rfnE TRUE 1.000 -3.000 0.908 0.029 Y 0.176
 549872 549873 plu2382 plu2383 rfnE nth TRUE 0.961 2.000 0.109 1.000 N 0.741
 549873 549874 plu2383 plu2384 nth rnb FALSE 0.059 140.000 0.005 1.000 N 0.182
 549874 549875 plu2384 plu2385 rnb   FALSE 0.018 529.000 0.000 1.000   -0.991
 549875 549876 plu2385 plu2386     TRUE 0.953 74.000 0.667 NA   0.881
 549876 549877 plu2386 plu2387     TRUE 0.573 58.000 0.000 NA   0.949
 549877 549878 plu2387 plu2388     TRUE 0.573 55.000 0.000 NA   0.393
 549878 549879 plu2388 plu2389     TRUE 0.988 19.000 0.400 NA   NA
 549879 549880 plu2389 plu2390     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549880 549881 plu2390 plu2391     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549881 549882 plu2391 plu2392     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA   0.248
 549882 549883 plu2392 plu2393     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   0.614
 549883 549884 plu2393 plu2394     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 549884 549885 plu2394 plu2395     TRUE 0.831 84.000 0.333 NA   NA
 549885 549886 plu2395 plu2396     TRUE 0.990 26.000 0.600 NA   0.387
 549886 549887 plu2396 plu2397     TRUE 0.726 43.000 0.000 NA   0.874
 549887 549888 plu2397 plu2398     TRUE 0.951 10.000 0.000 NA   0.264
 549888 549889 plu2398 plu2399     TRUE 0.841 25.000 0.000 NA   -0.609
 549889 549890 plu2399 plu2400     FALSE 0.136 215.000 0.000 NA   0.395
 549890 549891 plu2400 plu2401     FALSE 0.086 277.000 0.000 NA   0.178
 549891 549892 plu2401 plu2402     FALSE 0.189 162.000 0.000 NA   NA
 549893 549894 plu2403 plu2404     TRUE 0.875 -6.000 0.000 1.000 N 0.878
 549894 549895 plu2404 plu2405     TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   0.954
 549895 549896 plu2405 plu2406     TRUE 0.925 -7.000 0.000 NA   0.992
 549896 549897 plu2406 plu2407     FALSE 0.062 301.000 0.000 NA   NA
 549897 549898 plu2407 plu2408     TRUE 0.811 27.000 0.000 NA   NA
 549898 549899 plu2408 plu2409     TRUE 0.872 -15.000 0.000 NA   0.993
 549899 549900 plu2409 plu2410     TRUE 0.963 2.000 0.000 NA   0.990
 549900 549901 plu2410 plu2411     TRUE 0.454 81.000 0.000 NA   0.991
 549902 549903 plu2412 plu2413     TRUE 0.747 35.000 0.000 NA   NA
 549905 549906 plu2415 plu2416     TRUE 0.797 -31.000 0.000 NA   -0.945
 549906 549907 plu2416 plu2417     FALSE 0.151 212.000 0.000 NA   0.798
 549907 549908 plu2417 plu2418     FALSE 0.317 116.000 0.000 NA   -0.529
 549912 549913 plu2422 plu2423     TRUE 0.949 -3.000 0.000 NA   0.041
 549914 549915 plu2424 plu2425     TRUE 0.955 25.000 0.188 NA   0.989
 549915 549916 plu2425 plu2426     FALSE 0.043 390.000 0.000 1.000   0.308
 549916 549917 plu2426 plu2427   pyrF TRUE 0.797 -10.000 0.045 1.000 N 0.394
 549917 549918 plu2427 plu2428 pyrF   TRUE 0.725 45.000 0.125 1.000 N 0.901
 549918 549919 plu2428 plu2429     TRUE 0.997 7.000 0.576 NA   -0.640
 549919 549920 plu2429 plu2430     FALSE 0.192 161.000 0.000 NA   NA
 549924 549925 plu2434 plu2435 cysB topA FALSE 0.011 305.000 0.008 1.000 N -0.364
 549925 549926 plu2435 plu2436 topA   FALSE 0.208 153.000 0.000 NA   NA
 549926 549927 plu2436 plu2437     FALSE 0.023 451.000 0.000 NA   NA
 549931 549932 plu2441 plu2442     TRUE 0.408 73.000 0.000 NA   NA
 549932 549933 plu2442 plu2443     TRUE 0.471 75.000 0.000 NA   0.966
 549933 549934 plu2443 plu2444     FALSE 0.047 378.000 0.000 NA   0.976
 549935 549936 plu2445 plu2446     TRUE 0.453 81.000 0.000 NA   0.678
 549937 549938 plu2447 plu2448 ISPlu13A   FALSE 0.385 85.000 0.000 NA   NA
 549938 549939 plu2448 plu2449   cat3 FALSE 0.049 329.000 0.000 NA   NA
 549940 549941 plu2450 plu2451   btuR TRUE 0.929 0.000 0.050 1.000 N 0.734
 549943 549944 plu2453 plu2454     TRUE 0.890 -13.000 0.000 NA   0.856
 549945 549946 plu2455 plu2456     FALSE 0.060 314.000 0.000 NA   -0.442
 549946 549947 plu2456 plu2457   trpH TRUE 0.966 28.000 0.281 NA   0.739
 549947 549948 plu2457 plu2458 trpH   FALSE 0.069 310.000 0.000 1.000   -0.190
 549948 549949 plu2458 plu2459   tccB2 TRUE 0.903 128.000 0.667 NA   -0.620
 549949 549950 plu2459 plu2460 tccB2 tccA2 TRUE 0.984 -7.000 0.286 NA   -0.036
 549950 549951 plu2460 plu2461 tccA2   TRUE 0.803 97.000 0.286 NA   0.590
 549952 549953 plu2462 plu2463 trpE trpG TRUE 1.000 0.000 0.703 0.000 Y 0.903
 549953 549954 plu2463 plu2464 trpG trpD TRUE 0.988 14.000 0.083 1.000 Y 0.935
 549954 549955 plu2464 plu2465 trpD trpC TRUE 0.998 3.000 0.293 1.000 Y 0.786
 549955 549956 plu2465 plu2466 trpC trpB TRUE 0.969 77.000 0.221 0.001 Y 0.832
 549956 549957 plu2466 plu2467 trpB trpA TRUE 1.000 0.000 0.947 0.000 Y -0.214
 549957 549958 plu2467 plu2468 trpA   FALSE 0.008 838.000 0.000 NA   -0.601
 549958 549959 plu2468 plu2469     TRUE 0.952 2.000 0.000 NA   NA
 549959 549960 plu2469 plu2470     TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 549960 549961 plu2470 plu2471     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   NA
 549961 549962 plu2471 plu2472     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 549964 549965 plu2474 plu2475     TRUE 0.939 13.000 0.000 NA   0.250
 549965 549966 plu2475 plu2476     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   0.967
 549966 549967 plu2476 plu2477     FALSE 0.056 313.000 0.000 NA   NA
 549970 549971 plu2480 plu2481     FALSE 0.202 517.000 0.000 0.003 Y 0.984
 549971 549972 plu2481 plu2482     FALSE 0.120 266.000 0.000 0.054 N -0.070
 549973 549974 plu2483 plu2484 ispZ   TRUE 0.547 78.000 0.167 NA N 0.357
 549975 549976 plu2485 plu2486 tonB   TRUE 0.685 102.000 0.208 NA   NA
 549977 549978 plu2487 plu2488 cls   TRUE 0.726 112.000 0.231 NA   0.819
 549979 549980 plu2489 plu2490 oppF oppD TRUE 0.999 -3.000 0.420 0.001 Y 0.970
 549980 549981 plu2490 plu2491 oppD oppC TRUE 0.999 10.000 0.554 1.000 Y 0.998
 549981 549982 plu2491 plu2492 oppC oppB TRUE 1.000 15.000 0.870 0.031 Y 0.993
 549982 549983 plu2492 plu2493 oppB oppA2 TRUE 0.931 85.000 0.151 0.031 Y 0.968
 549983 549984 plu2493 plu2494 oppA2 oppA1 TRUE 0.931 139.000 0.292 0.031 Y 0.998
 549984 549985 plu2494 plu2495 oppA1   FALSE 0.007 555.000 0.000 NA N 0.455
 549989 549990 plu2499 plu2500     TRUE 0.992 9.000 0.091 1.000 Y 0.865
 549990 549991 plu2500 plu2501   galU TRUE 0.984 24.000 0.157 1.000 Y 0.985
 549991 549992 plu2501 plu2502 galU hnr FALSE 0.113 393.000 0.235 1.000 N 0.911
 549993 549994 plu2503 plu2504   purU TRUE 0.884 46.000 0.200 NA   0.778
 549994 549995 plu2504 plu2505 purU   TRUE 0.531 54.000 0.000 NA   NA
 549997 549998 plut052 plu2507 tRNA-Tyr   FALSE 0.032 393.000 0.000 NA   NA
 549998 549999 plu2507 plu2508     TRUE 0.974 0.000 0.097 NA   0.007
 549999 550000 plu2508 plu2509     TRUE 0.846 -25.000 0.044 NA   0.880
 550000 550001 plu2509 plu2510     TRUE 0.979 19.000 0.000 1.000 Y 0.799
 550001 550002 plu2510 plu2511     TRUE 0.987 13.000 0.000 1.000 Y 0.859
 550002 550003 plu2511 plu2512     TRUE 0.811 173.000 0.273 1.000 Y 0.716
 550003 550004 plu2512 plu2513     TRUE 0.996 3.000 0.186 1.000 Y 0.960
 550005 550006 plu2514 plu2515     FALSE 0.028 439.000 0.000 NA   0.226
 550006 550007 plu2515 plu2516     FALSE 0.271 129.000 0.000 NA   -0.693
 550007 550008 plu2516 plu2517     TRUE 0.851 25.000 0.000 NA   -0.016
 550008 550009 plu2517 plu2518     TRUE 0.956 10.000 0.000 NA   0.945
 550009 550010 plu2518 plu2519     TRUE 0.570 59.000 0.000 NA   0.888
 550010 550011 plu2519 plu2520     FALSE 0.275 128.000 0.000 NA   -0.644
 550011 550012 plu2520 plu2521     TRUE 0.910 -7.000 0.000 NA   -0.538
 550012 550013 plu2521 plu2522     TRUE 0.422 83.000 0.000 NA   0.026
 550013 550014 plu2522 plu2523     TRUE 0.993 -3.000 0.333 NA   -0.106
 550014 550015 plu2523 plu2524     TRUE 0.997 14.000 0.667 NA   0.631
 550015 550016 plu2524 plu2525     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 550016 550017 plu2525 plu2526     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 550017 550018 plu2526 plu2527     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 550018 550019 plu2527 plu2528     TRUE 0.992 14.000 0.400 NA   NA
 550019 550020 plu2528 plu2529     TRUE 0.660 49.000 0.000 NA   0.918
 550020 550021 plu2529 plu2530     TRUE 0.951 12.000 0.000 NA   0.862
 550021 550022 plu2530 plu2531     TRUE 0.616 53.000 0.000 NA   0.854
 550023 550024 plu2532 plu2533     FALSE 0.226 143.000 0.000 NA   NA
 550024 550025 plu2533 plu2534     TRUE 0.413 72.000 0.000 NA   NA
 550025 550026 plu2534 plu2535     FALSE 0.022 462.000 0.000 NA   NA
 550027 550028 plu2536 plu2537     TRUE 0.993 3.000 0.280 NA   0.880
 550028 550029 plu2537 plu2538     FALSE 0.297 139.000 0.000 NA   0.855
 550029 550030 plu2538 plu2539     TRUE 0.757 34.000 0.000 NA   -0.900
 550030 550031 plu2539 plu2540   ISPlu7D_orfB FALSE 0.038 369.000 0.000 NA   NA
 550031 550032 plu2540 plu2541 ISPlu7D_orfB ISPlu7D_orfA TRUE 0.986 -3.000 0.000 NA Y NA
 550032 550033 plu2541 plu2542 ISPlu7D_orfA   TRUE 0.570 50.000 0.000 NA   NA
 550033 550034 plu2542 plu2543     TRUE 0.391 109.000 0.000 NA   0.963
 550034 550035 plu2543 plu2544     TRUE 0.440 77.000 0.000 NA   0.276
 550036 550037 plu2545 plu2546     TRUE 0.553 62.000 0.000 NA   0.889
 550037 550038 plu2546 plu2547     TRUE 0.600 51.000 0.000 NA   0.218
 550041 550042 plu2550 plu2551 topB selD TRUE 0.890 6.000 0.041 1.000 N 0.129
 550042 550043 plu2551 plu2552 selD   TRUE 0.807 13.000 0.033 1.000 N -0.615
 550044 550045 plu2553 plu2554 sppA ansA FALSE 0.094 250.000 0.113 1.000 N -0.114
 550045 550046 plu2554 plu2555 ansA pncA TRUE 0.851 13.000 0.040 1.000 N 0.179
 550047 550048 plu2556 plu2557   msrB TRUE 0.766 83.000 0.216 NA   0.960
 550050 550051 plu2559 plu2560 mipA dadX FALSE 0.250 345.000 0.091 1.000 Y 0.506
 550051 550052 plu2560 plu2561 dadX dadA TRUE 0.974 7.000 0.168 1.000 N 0.997
 550052 550053 plu2561 plu2562 dadA fadR FALSE 0.010 521.000 0.000 1.000 N 0.599
 550054 550055 plu2563 plu2564 nhaB dsbB TRUE 0.785 182.000 0.723 1.000 N -0.932
 550056 550057 plu2565 plu2566     TRUE 0.605 54.000 0.000 NA   0.944
 550060 550061 plu2569 plu2570     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA   NA
 550061 550062 plu2570 plu2571     FALSE 0.065 296.000 0.000 NA   NA
 550062 550063 plu2571 plu2572     FALSE 0.212 151.000 0.000 NA   NA
 550063 550064 plu2572 plu2573     TRUE 0.785 30.000 0.000 NA   NA
 550066 550067 plu2575 plu2576     FALSE 0.128 209.000 0.000 NA   -0.479
 550068 550069 plu2577 plu2578   mppA TRUE 0.764 17.000 0.019 1.000 N 0.991
 550071 550072 plu2580 plu2581 tyrR   FALSE 0.209 257.000 0.137 NA   0.781
 550072 550073 plu2581 plu2582     TRUE 0.998 -3.000 0.791 NA   0.826
 550073 550074 plu2582 plu2583   pspC TRUE 0.778 67.000 0.190 NA   0.863
 550074 550075 plu2583 plu2584 pspC pspB TRUE 0.999 0.000 0.913 NA   0.964
 550075 550076 plu2584 plu2585 pspB pspA TRUE 0.990 37.000 0.739 NA   0.986
 550077 550078 plu2586 plu2587 pspF sapA TRUE 0.404 258.000 0.402 1.000 N 0.208
 550078 550079 plu2587 plu2588 sapA sapB TRUE 0.993 -3.000 0.264 0.031 N 0.403
 550079 550080 plu2588 plu2589 sapB sapC TRUE 0.996 -13.000 0.284 0.031 Y 0.082
 550080 550081 plu2589 plu2590 sapC sapD TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y -0.207
 550081 550082 plu2590 plu2591 sapD sapF TRUE 1.000 1.000 0.684 0.011 Y 0.190
 550082 550083 plu2591 plu2592 sapF fabI FALSE 0.124 175.000 0.078 1.000 N -0.461
 550083 550084 plu2592 plu2593 fabI   FALSE 0.030 435.000 0.000 1.000   -0.136
 550084 550085 plu2593 plu2594   gst FALSE 0.026 494.000 0.000 1.000   0.487
 550086 550087 plu2595 plu2596 pdxY tyrS FALSE 0.032 314.000 0.041 1.000 N 0.974
 550087 550088 plu2596 plu2597 tyrS pdxH FALSE 0.218 121.000 0.054 1.000 N 0.819
 550088 550089 plu2597 plu2598 pdxH anmK FALSE 0.288 50.000 0.013 NA N 0.907
 550091 550092 plu2600 plu2601 slyA   FALSE 0.015 561.000 0.000 NA   -0.675
 550093 550094 plu2602 plu2603 gloA rnt TRUE 0.972 0.000 0.136 1.000 N 0.887
 550098 550099 plu2607 plu2608   cfa FALSE 0.016 421.000 0.000 1.000 N 0.681
 550100 550101 plu2609 plu2610   ribE FALSE 0.035 407.000 0.000 1.000   -0.266
 550102 550103 plu2611 plut053 norM tRNA-Val FALSE 0.172 172.000 0.000 NA   NA
 550103 550104 plut053 plut054 tRNA-Val tRNA-Val TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 550104 550105 plut054 plu2612 tRNA-Val   FALSE 0.099 234.000 0.000 NA   NA
 550105 550106 plu2612 plu2613   pykF TRUE 0.951 7.000 0.000 NA   -0.271
 550109 550110 plu2616 plu2617   sufE TRUE 0.401 122.000 0.103 NA   -0.914
 550110 550111 plu2617 plu2618 sufE sufS TRUE 0.915 38.000 0.183 NA   0.807
 550111 550112 plu2618 plu2619 sufS sufD TRUE 0.978 -3.000 0.193 1.000 N 0.872
 550112 550113 plu2619 plu2620 sufD sufC TRUE 0.995 -25.000 0.482 1.000 Y 0.897
 550113 550114 plu2620 plu2621 sufC sufB TRUE 0.977 58.000 0.466 1.000 Y 0.434
 550114 550115 plu2621 plu2622 sufB sufA TRUE 0.934 13.000 0.041 NA   0.031
 550115 550116 plu2622 plu2623 sufA   FALSE 0.007 2404.000 0.000 NA   0.967
 550116 550117 plu2623 plu2624     TRUE 0.997 -3.000 0.625 NA   NA
 550117 550118 plu2624 plu2625     FALSE 0.157 181.000 0.000 NA   NA
 550118 550119 plu2625 plu2626     TRUE 0.952 -3.000 0.129 NA N -0.182
 550122 550123 plu2629 plu2630   aroH TRUE 0.527 142.000 0.165 1.000   0.946
 550123 550124 plu2630 plu2631 aroH   FALSE 0.183 173.000 0.054 NA   NA
 550124 550125 plu2631 plu2632   hmuR FALSE 0.379 90.000 0.000 NA   NA
 550125 550126 plu2632 plu2633 hmuR   TRUE 0.949 31.000 0.000 1.000 Y 0.640
 550126 550127 plu2633 plu2634     TRUE 0.998 -3.000 0.384 1.000 Y 0.107
 550127 550128 plu2634 plu2635     TRUE 1.000 -3.000 0.852 1.000 Y 0.422
 550128 550129 plu2635 plu2636     TRUE 0.997 0.000 0.220 1.000 Y 0.728
 550132 550133 plu2639 plu2640     FALSE 0.008 818.000 0.000 NA   NA
 550133 550134 plu2640 plu2641     FALSE 0.240 157.000 0.000 NA   0.632
 550135 550136 plu2642 plu2643     TRUE 0.501 46.000 0.000 1.000 N 0.966
 550136 550137 plu2643 plu2644     FALSE 0.195 110.000 0.000 1.000 N 0.275
 550138 550139 plu2645 plu2646     TRUE 0.994 -7.000 0.222 1.000 Y 0.753
 550139 550140 plu2646 plu2647     TRUE 0.971 -7.000 0.222 1.000 N 0.891
 550140 550141 plu2647 plu2648     TRUE 0.991 2.000 0.000 1.000 Y 0.741
 550143 550144 plu2650 plu2651     TRUE 0.994 -16.000 0.750 1.000   -0.935
 550144 550145 plu2651 plu2652     FALSE 0.259 150.000 0.000 NA   0.997
 550145 550146 plu2652 plu2653   nlpC FALSE 0.008 1010.000 0.000 NA   0.414
 550146 550147 plu2653 plu2654 nlpC pbgE3 TRUE 0.633 106.000 0.161 NA   0.750
 550147 550148 plu2654 plu2655 pbgE3 pbgE2 TRUE 0.999 -3.000 0.613 0.055   0.884
 550148 550149 plu2655 plu2656 pbgE2 pbgE1 TRUE 0.993 -3.000 0.182 0.055   0.968
 550149 550150 plu2656 plu2657 pbgE1 pbgP4 TRUE 0.919 8.000 0.051 1.000 N 0.968
 550150 550151 plu2657 plu2658 pbgP4 pbgP3 TRUE 0.999 0.000 0.447 1.000 Y 0.636
 550151 550152 plu2658 plu2659 pbgP3 pbgP2 TRUE 0.997 1.000 0.220 NA Y 0.710
 550152 550153 plu2659 plu2660 pbgP2 pbgP1 TRUE 0.998 1.000 0.378 NA Y 0.992
 550153 550154 plu2660 plu2661 pbgP1 btuD FALSE 0.266 161.000 0.129 1.000 N 0.721
 550154 550155 plu2661 plu2662 btuD btuC TRUE 0.994 4.000 0.133 1.000 Y 0.709
 550155 550156 plu2662 plu2663 btuC ihfA FALSE 0.249 66.000 0.023 1.000 N 0.736
 550156 550157 plu2663 plu2664 ihfA pheT TRUE 0.982 5.000 0.208 1.000 N 0.577
 550157 550158 plu2664 plu2665 pheT pheS TRUE 0.999 16.000 0.574 0.000 Y 0.657
 550158 550159 plu2665 plu2666 pheS rplT TRUE 0.537 272.000 0.202 1.000 Y 0.363
 550159 550160 plu2666 plu2667 rplT rpmI TRUE 0.998 42.000 0.928 0.010 Y NA
 550160 550161 plu2667 plu2668 rpmI infC TRUE 0.975 98.000 0.652 1.000 Y NA
 550161 550162 plu2668 plu2669 infC thrS TRUE 0.842 118.000 0.186 1.000 Y 0.203
 550162 550163 plu2669 plu2670 thrS   FALSE 0.022 378.000 0.000 1.000 N 0.969
 550163 550164 plu2670 plu2671     FALSE 0.003 956.000 0.000 NA N 0.591
 550165 550166 plu2672 plu2673 yfeA yfeB TRUE 1.000 -3.000 0.894 1.000 Y 0.963
 550166 550167 plu2673 plu2674 yfeB yfeC TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.069 Y 0.982
 550167 550168 plu2674 plu2675 yfeC yfeD TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.006 Y 0.979
 550168 550169 plu2675 plu2676 yfeD   FALSE 0.112 119.000 0.033 1.000 N -0.728
 550171 550172 plu2678 plu2679     FALSE 0.077 338.000 0.068 NA   0.924
 550172 550173 plu2679 plu2680     FALSE 0.264 188.000 0.102 NA   0.674
 550174 550175 plu2681 plu2682 htpX prc FALSE 0.088 330.000 0.042 0.018 N 0.042
 550175 550176 plu2682 plu2683 prc proQ TRUE 0.974 20.000 0.304 NA N 0.632
 550176 550177 plu2683 plu2684 proQ   TRUE 0.795 96.000 0.081 NA Y 0.857
 550179 550180 plu2686 plu2687     TRUE 0.828 200.000 0.704 NA   0.505
 550180 550181 plu2687 plu2688     TRUE 0.998 3.000 0.613 1.000   0.494
 550181 550182 plu2688 plu2689   ftnA FALSE 0.157 195.000 0.029 1.000   0.622
 550184 550185 plu2691 plu2692 pip   TRUE 0.436 74.000 0.034 NA   1.000
 550185 550186 plu2692 plu2693     TRUE 0.457 108.000 0.104 NA   NA
 550187 550188 plu2694 plu2695 pabB   TRUE 0.976 -3.000 0.116 1.000   0.974
 550188 550189 plu2695 plu2696   sdaA FALSE 0.385 175.000 0.136 1.000   0.910
 550189 550190 plu2696 plu2697 sdaA manX FALSE 0.006 623.000 0.000 1.000 N 0.217
 550190 550191 plu2697 plu2698 manX manY TRUE 0.978 59.000 0.255 0.006 Y 0.889
 550191 550192 plu2698 plu2699 manY manZ TRUE 1.000 14.000 0.939 0.006 Y 0.989
 550192 550193 plu2699 plu2700 manZ   TRUE 0.929 121.000 0.755 NA   -0.646
 550193 550194 plu2700 plu2701     FALSE 0.026 426.000 0.000 NA   -0.859
 550196 550197 plu2703 plu2704     FALSE 0.151 184.000 0.000 NA   NA
 550198 550199 plu2705 plu2706     TRUE 0.645 44.000 0.000 NA   NA
 550201 550202 plu2708 plu2709     TRUE 0.921 14.000 0.000 NA   -0.957
 550202 550203 plu2709 plu2710     TRUE 0.997 1.000 0.348 0.063   -0.287
 550203 550204 plu2710 plu2711     FALSE 0.346 109.000 0.000 NA   -0.313
 550204 550205 plu2711 plu2712   guaA TRUE 0.800 30.000 0.000 NA   -0.360
 550205 550206 plu2712 plu2713 guaA guaB TRUE 0.910 74.000 0.190 0.000   0.890
 550208 550209 plu2715 plu2716   ptrB TRUE 0.430 130.000 0.167 1.000 N 0.950
 550209 550210 plu2716 plu2717 ptrB   TRUE 0.493 132.000 0.200 1.000 N 0.820
 550210 550211 plu2717 plu2718     FALSE 0.266 154.000 0.048 NA   0.810
 550211 550212 plu2718 plu2719   maeB FALSE 0.344 87.000 0.032 NA   -0.973
 550213 550214 plu2720 plu2721 narP   FALSE 0.047 227.000 0.000 1.000 N -0.562
 550214 550215 plu2721 plu2722   dapE TRUE 0.990 2.000 0.292 1.000 N 0.907
 550215 550216 plu2722 plu2723 dapE   TRUE 0.988 -3.000 0.163 0.018 N 0.902
 550216 550217 plu2723 plu2724     TRUE 0.978 0.000 0.130 NA   NA
 550218 550219 plu2725 plu2726     TRUE 0.975 5.000 0.100 NA   0.927
 550219 550220 plu2726 plu2727   entA FALSE 0.060 339.000 0.000 NA   0.728
 550220 550221 plu2727 plu2728 entA entB TRUE 0.789 68.000 0.024 1.000 Y 0.962
 550221 550222 plu2728 plu2729 entB entE TRUE 0.985 23.000 0.172 1.000 Y -0.246
 550223 550224 plu2730 plu2731     FALSE 0.012 743.000 0.000 NA   0.980
 550224 550225 plu2731 plu2732     TRUE 0.954 -3.000 0.000 NA   0.998
 550225 550226 plu2732 plu2733     TRUE 0.919 18.000 0.000 NA   0.964
 550226 550227 plu2733 plu2734     TRUE 0.742 25.000 0.000 1.000 N 0.996
 550227 550228 plu2734 plu2735     TRUE 0.745 -16.000 0.000 1.000 N 0.992
 550228 550229 plu2735 plu2736     TRUE 0.991 3.000 0.000 1.000 Y 0.717
 550229 550230 plu2736 plu2737     TRUE 0.531 35.000 0.000 1.000 N -0.923
 550231 550232 plu2738 plu2739     TRUE 0.399 108.000 0.000 NA   0.929
 550232 550233 plu2739 plu2740     TRUE 0.925 -7.000 0.000 NA   0.987
 550233 550234 plu2740 plu2741     FALSE 0.119 244.000 0.000 NA   0.759
 550234 550235 plu2741 plu2742     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.006 Y 0.822
 550235 550236 plu2742 plu2743   ISPlu3R FALSE 0.012 396.000 0.000 1.000 N NA
 550236 550237 plu2743 plu2744 ISPlu3R purC FALSE 0.014 377.000 0.000 1.000 N NA
 550237 550238 plu2744 plu2745 purC nlpB FALSE 0.019 280.000 0.008 NA N 0.767
 550238 550239 plu2745 plu2746 nlpB dapA TRUE 0.977 17.000 0.032 NA Y 0.721
 550240 550241 plu2747 plu2748 gcvR bcp TRUE 0.797 27.000 0.102 1.000 N -0.617
 550243 550244 plu2750 plu2751     TRUE 0.991 10.000 0.259 1.000   0.938
 550245 550246 plu2752 plu2753     FALSE 0.087 277.000 0.000 NA   0.326
 550247 550248 plu2754 plu2755 celA celB TRUE 0.983 30.000 0.091 0.004 Y -0.896
 550248 550249 plu2755 plu2756 celB celC TRUE 0.993 19.000 0.091 0.004 Y 0.969
 550249 550250 plu2756 plu2757 celC celF TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y 0.187
 550250 550251 plu2757 plu2758 celF   FALSE 0.024 464.000 0.000 1.000   NA
 550253 550254 plu2760 plu2761 purM purN TRUE 0.999 -3.000 0.230 0.001 Y 0.948
 550254 550255 plu2761 plu2762 purN speG FALSE 0.132 122.000 0.017 1.000 N 0.831
 550255 550256 plu2762 plu2763 speG ppk FALSE 0.333 64.000 0.041 1.000 N 0.834
 550256 550257 plu2763 plu2764 ppk ppx TRUE 0.999 4.000 0.486 1.000 Y 0.313
 550258 550259 plu2765 plu2766     TRUE 0.695 70.000 0.146 1.000   0.549
 550260 550261 plu2767 plu2768     FALSE 0.250 51.000 0.007 NA N 0.870
 550261 550262 plu2768 plu2769     TRUE 0.981 28.000 0.017 0.001 Y 0.035
 550262 550263 plu2769 plu2770     TRUE 0.925 36.000 0.007 1.000 Y 0.914
 550264 550265 plu2771 plu2772     FALSE 0.022 320.000 0.000 1.000 N -0.842
 550265 550266 plu2772 plu2773     TRUE 0.948 26.000 0.013 1.000 Y -0.333
 550267 550268 plu2774 plu2775     TRUE 0.995 0.000 0.500 NA N -0.198
 550268 550269 plu2775 plu2776     TRUE 0.993 -3.000 0.156 NA Y -0.638
 550269 550270 plu2776 plu2777   baeS TRUE 0.467 121.000 0.070 0.055 N 0.954
 550270 550271 plu2777 plu2778 baeS baeR TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 Y -0.776
 550271 550272 plu2778 plu2779 baeR   TRUE 0.473 98.000 0.062 NA   0.810
 550272 550273 plu2779 plu2780     FALSE 0.120 199.000 0.008 NA   0.776
 550273 550274 plu2780 plu2781   fbaB FALSE 0.003 2187.000 0.000 1.000 N 0.703
 550275 550276 plu2782 plu2783 thiD cspC FALSE 0.025 300.000 0.000 1.000 N NA
 550278 550279 plu2785 plu2786 aroP   FALSE 0.063 300.000 0.000 NA   NA
 550283 550284 plu2790 plu2791     FALSE 0.068 301.000 0.095 1.000 N 0.755
 550284 550285 plu2791 plu2792     FALSE 0.003 2398.000 0.000 1.000 N 0.767
 550286 550287 plu2793 plu2794     TRUE 0.985 -3.000 0.008 1.000 Y 0.182
 550287 550288 plu2794 plu2795     TRUE 0.638 35.000 0.000 1.000 N 0.732
 550288 550289 plu2795 plu2796     TRUE 0.792 42.000 0.000 0.044 N 0.992
 550289 550290 plu2796 plu2797     TRUE 0.963 7.000 0.000 1.000   0.866
 550290 550291 plu2797 plu2798     TRUE 0.715 45.000 0.000 1.000   0.787
 550291 550292 plu2798 plu2799     FALSE 0.280 81.000 0.000 1.000 N 0.757
 550293 550294 plu2800 plu2801   icd FALSE 0.371 120.000 0.000 1.000   0.809
 550295 550296 plu2802 plu2803     TRUE 0.953 -7.000 0.182 1.000 N -0.319
 550296 550297 plu2803 plu2804   trmU TRUE 0.568 85.000 0.158 1.000 N 0.826
 550297 550298 plu2804 plu2805 trmU   TRUE 0.987 3.000 0.180 NA   0.938
 550298 550299 plu2805 plu2806   purB TRUE 0.920 24.000 0.093 NA   0.874
 550299 550300 plu2806 plu2807 purB phoP FALSE 0.036 238.000 0.011 1.000 N 0.806
 550300 550301 plu2807 plu2808 phoP phoQ TRUE 0.999 20.000 0.940 1.000 Y 0.905
 550301 550302 plu2808 plu2809 phoQ   TRUE 0.885 84.000 0.408 NA   0.698
 550303 550304 plu2810 plu2811 pepT cobB FALSE 0.163 56.000 0.019 1.000 N -0.987
 550304 550305 plu2811 plu2812 cobB lolE FALSE 0.231 92.000 0.030 1.000 N 0.903
 550305 550306 plu2812 plu2813 lolE lolD TRUE 0.985 0.000 0.125 0.040 N 0.043
 550306 550307 plu2813 plu2814 lolD lolC TRUE 0.977 -7.000 0.175 0.040 N -0.153
 550308 550309 plu2815 plu2816 mfd   FALSE 0.004 719.000 0.000 NA N -0.212
 550309 550310 plu2816 plu2817     TRUE 0.999 12.000 0.630 NA Y 0.531
 550312 550313 plu2819 plu2820     FALSE 0.009 797.000 0.000 1.000   -0.972
 550314 550315 plu2821 plu2822 ndh nagZ FALSE 0.019 406.000 0.000 1.000 N 0.808
 550315 550316 plu2822 plu2823 nagZ   FALSE 0.232 123.000 0.069 1.000 N 0.625
 550316 550317 plu2823 plu2824     TRUE 0.978 -13.000 0.310 NA   0.225
 550317 550318 plu2824 plu2825     FALSE 0.046 308.000 0.010 NA   0.107
 550318 550319 plu2825 plu2826     FALSE 0.179 71.000 0.013 NA N 0.932
 550319 550320 plu2826 plu2827   holB TRUE 0.973 26.000 0.110 NA Y 0.778
 550320 550321 plu2827 plu2828 holB tmk TRUE 0.985 0.000 0.211 1.000 N 0.913
 550321 550322 plu2828 plu2829 tmk   TRUE 0.989 6.000 0.209 NA   0.963
 550322 550323 plu2829 plu2830   pabC TRUE 0.800 65.000 0.204 NA   0.827
 550323 550324 plu2830 plu2831 pabC fabF FALSE 0.105 355.000 0.187 1.000 N 0.966
 550324 550325 plu2831 plu2832 fabF acpP TRUE 0.954 74.000 0.346 1.000 Y 0.910
 550325 550326 plu2832 plu2833 acpP fabG TRUE 0.942 155.000 0.321 0.003 Y 0.941
 550326 550327 plu2833 plu2834 fabG fabD TRUE 0.999 8.000 0.432 0.003 Y 0.724
 550327 550328 plu2834 plu2835 fabD fabH TRUE 0.994 25.000 0.182 0.003 Y 0.517
 550328 550329 plu2835 plu2836 fabH plsX TRUE 0.999 7.000 0.380 0.003 Y 0.965
 550329 550330 plu2836 plu2837 plsX rpmF TRUE 0.965 29.000 0.418 1.000 N NA
 550330 550331 plu2837 plu2838 rpmF   TRUE 0.996 13.000 0.599 NA   NA
 550334 550335 plu2841 plu2842 rne   FALSE 0.173 185.000 0.000 1.000   -0.438
 550336 550337 plu2843 plu2844     FALSE 0.007 2177.000 0.000 NA   0.983
 550338 550339 plu2845 plu2846     TRUE 0.987 17.000 0.316 NA   0.932
 550339 550340 plu2846 plu2847   sbcB FALSE 0.271 156.000 0.000 1.000   0.877
 550341 550342 plu2848 plu2849 dld   FALSE 0.063 195.000 0.021 1.000 N 0.906
 550342 550343 plu2849 plu2850     FALSE 0.015 719.000 0.000 0.055 N 0.364
 550343 550344 plu2850 plu2851     TRUE 0.629 131.000 0.033 1.000 Y 0.999
 550344 550345 plu2851 plu2852     TRUE 1.000 -3.000 0.833 1.000 Y 0.999
 550345 550346 plu2852 plu2853     TRUE 0.824 124.000 0.175 1.000 Y 0.993
 550346 550347 plu2853 plu2854   lysP FALSE 0.009 463.000 0.000 1.000 N -0.694
 550347 550348 plu2854 plu2855 lysP   FALSE 0.383 155.000 0.185 1.000 N 0.519
 550349 550350 plu2856 plu2857   nfo FALSE 0.324 123.000 0.040 NA   0.972
 550352 550353 plu2859 plu2860     FALSE 0.247 116.000 0.060 1.000 N 0.964
 550353 550354 plu2860 plu2861     FALSE 0.363 133.000 0.153 1.000 N 0.084
 550356 550357 plu2863 plu2864   spr FALSE 0.054 349.000 0.000 NA   0.460
 550358 550359 plu2865 plu2866   bcr FALSE 0.008 1100.000 0.000 NA   0.931
 550359 550360 plu2866 plu2867 bcr rsuA TRUE 0.762 44.000 0.145 1.000 N 0.983
 550361 550362 plu2868 plu2869   rplY FALSE 0.322 159.000 0.024 0.010 N 0.781
 550364 550365 plu2871 plu2872     TRUE 0.766 33.000 0.027 NA   0.482
 550365 550366 plu2872 plut055   tRNA-Pro TRUE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 550367 550368 plu2873 plu2874     TRUE 0.960 0.000 0.000 NA   0.183
 550368 550369 plu2874 plu2875     TRUE 0.890 -13.000 0.000 NA   0.899
 550369 550370 plu2875 plu2876     TRUE 0.971 -7.000 0.167 NA   0.965
 550370 550371 plu2876 plu2877     TRUE 0.995 -16.000 0.800 NA   0.702
 550371 550372 plu2877 plu2878     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   0.849
 550372 550373 plu2878 plu2879     TRUE 0.985 -25.000 0.500 NA   0.688
 550373 550374 plu2879 plu2880     TRUE 0.981 -25.000 0.429 NA   0.610
 550374 550375 plu2880 plu2881     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   0.027
 550375 550376 plu2881 plu2882     FALSE 0.249 147.000 0.000 NA   0.148
 550376 550377 plu2882 plu2883     FALSE 0.192 181.000 0.000 NA   0.639
 550377 550378 plu2883 plu2884     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 550380 550381 plu2886 plu2887     TRUE 0.466 69.000 0.000 NA   0.097
 550381 550382 plu2887 plu2888     TRUE 0.802 -25.000 0.000 NA   NA
 550382 550383 plu2888 plu2889     TRUE 0.895 18.000 0.000 NA   NA
 550383 550384 plu2889 plu2890     TRUE 0.998 0.000 0.571 NA   0.809
 550384 550385 plu2890 plu2891     TRUE 0.995 10.000 0.429 NA   -0.749
 550385 550386 plu2891 plu2892     TRUE 0.999 3.000 0.800 NA   0.057
 550386 550387 plu2892 plu2893     TRUE 0.996 -13.000 0.800 NA   0.900
 550387 550388 plu2893 plu2894     TRUE 0.846 -19.000 0.000 NA   0.312
 550388 550389 plu2894 plu2895     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.723
 550389 550390 plu2895 plu2896     TRUE 0.994 15.000 0.500 NA   0.778
 550390 550391 plu2896 plu2897     TRUE 0.999 5.000 1.000 NA   0.224
 550391 550392 plu2897 plu2898     TRUE 0.965 3.000 0.056 NA   0.732
 550392 550393 plu2898 plu2899     TRUE 0.977 4.000 0.111 NA   0.934
 550393 550394 plu2899 plu2900     TRUE 0.983 -40.000 0.500 NA   0.452
 550394 550395 plu2900 plu2901     TRUE 0.875 -15.000 0.000 NA   0.753
 550395 550396 plu2901 plu2902     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.871
 550396 550397 plu2902 plu2903     TRUE 0.635 45.000 0.000 NA   -0.918
 550399 550400 plu2905 plu2906     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   -0.468
 550400 550401 plu2906 plu2907     TRUE 0.948 12.000 0.000 NA   0.986
 550401 550402 plu2907 plu2908     TRUE 0.994 -3.000 0.400 NA   -0.055
 550404 550405 plu2910 plu2911     FALSE 0.102 238.000 0.000 NA   -0.583
 550405 550406 plu2911 plu2912     FALSE 0.049 369.000 0.000 NA   0.690
 550406 550407 plu2912 plu2913     FALSE 0.373 109.000 0.000 NA   0.479
 550407 550408 plu2913 plu2914     TRUE 0.954 0.000 0.000 NA   -0.819
 550408 550409 plu2914 plu2915     FALSE 0.120 208.000 0.000 NA   NA
 550409 550410 plu2915 plu2916     TRUE 0.540 53.000 0.000 NA   NA
 550410 550411 plu2916 plu2917     TRUE 0.936 -37.000 0.176 NA   0.747
 550411 550412 plu2917 plu2918     TRUE 0.483 72.000 0.000 1.000   0.411
 550412 550413 plu2918 plu2919     FALSE 0.031 414.000 0.000 NA   -0.236
 550413 550414 plu2919 plu2920     TRUE 0.702 45.000 0.000 NA   0.921
 550414 550415 plu2920 plu2921     FALSE 0.342 123.000 0.000 1.000   0.530
 550416 550417 plu2922 plu2923     TRUE 0.468 63.000 0.000 NA   NA
 550417 550418 plu2923 plu2924     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   NA
 550420 550421 plu2926 plu2927     FALSE 0.187 190.000 0.000 NA   0.881
 550421 550422 plu2927 plu2928     TRUE 0.961 5.000 0.000 NA   0.827
 550422 550423 plu2928 plu2929     FALSE 0.331 107.000 0.000 NA   NA
 550423 550424 plu2929 plu2930     TRUE 0.396 77.000 0.000 NA   NA
 550424 550425 plu2930 plu2931     FALSE 0.111 219.000 0.000 NA   NA
 550425 550426 plu2931 plu2932     TRUE 0.807 30.000 0.000 NA   0.027
 550426 550427 plu2932 plu2933     TRUE 0.424 70.000 0.000 NA   -0.901
 550427 550428 plu2933 plu2934     FALSE 0.040 391.000 0.000 NA   0.464
 550428 550429 plu2934 plu2935     TRUE 0.950 -3.000 0.000 NA   0.107
 550429 550430 plu2935 plu2936     TRUE 0.984 1.000 0.000 0.062   0.957
 550430 550431 plu2936 plu2937     TRUE 0.893 -9.000 0.000 NA   -0.801
 550431 550432 plu2937 plu2938     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA   NA
 550432 550433 plu2938 plu2939     TRUE 0.906 16.000 0.000 NA   NA
 550433 550434 plu2939 plu2940     TRUE 0.947 6.000 0.000 NA   -0.907
 550434 550435 plu2940 plu2941     FALSE 0.205 157.000 0.000 NA   -0.725
 550435 550436 plu2941 plu2942     FALSE 0.078 277.000 0.000 NA   -0.572
 550436 550437 plu2942 plu2943     TRUE 0.883 -13.000 0.000 NA   0.599
 550437 550438 plu2943 plu2944     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 550438 550439 plu2944 plu2945     FALSE 0.092 246.000 0.000 NA   NA
 550439 550440 plu2945 plu2946     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 550440 550441 plu2946 plu2947     TRUE 0.995 2.000 0.400 NA   -0.927
 550442 550443 plu2948 plu2949     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 550443 550444 plu2949 plu2950     TRUE 0.623 46.000 0.000 NA   NA
 550444 550445 plu2950 plu2951     TRUE 0.993 15.000 0.500 NA   NA
 550445 550446 plu2951 plu2952     FALSE 0.359 115.000 0.000 NA   0.644
 550446 550447 plu2952 plu2953     FALSE 0.069 314.000 0.000 NA   0.583
 550447 550448 plu2953 plu2954   ISPlu3Q TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 550448 550449 plu2954 plu2955 ISPlu3Q   TRUE 0.763 33.000 0.000 NA   NA
 550449 550450 plu2955 plu2956     FALSE 0.086 251.000 0.000 NA   NA
 550450 550451 plu2956 plu2957     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA   NA
 550451 550452 plu2957 plu2958     FALSE 0.010 704.000 0.000 NA   NA
 550452 550453 plu2958 plu2959     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 550453 550454 plu2959 plu2960     FALSE 0.021 534.000 0.000 NA   0.987
 550454 550455 plu2960 plu2961     FALSE 0.030 444.000 0.000 NA   0.997
 550455 550456 plu2961 plu2962     FALSE 0.386 83.000 0.000 NA   -0.987
 550456 550457 plu2962 plu2963     FALSE 0.006 1186.000 0.000 NA   -0.977
 550457 550458 plu2963 plu2964     FALSE 0.008 906.000 0.000 1.000   -0.926
 550458 550459 plu2964 plu2965     TRUE 0.966 23.000 0.000 1.000 Y -0.661
 550459 550460 plu2965 plu2966     TRUE 0.839 17.000 0.000 1.000 N 0.992
 550460 550461 plu2966 plu2967   cobD TRUE 0.938 -52.000 0.300 1.000 N -0.918
 550461 550462 plu2967 plu2968 cobD   TRUE 0.604 29.000 0.047 1.000 N -0.915
 550463 550464 plu2969 plu2970 eutA eutB TRUE 0.993 13.000 0.167 NA Y 0.965
 550464 550465 plu2970 plu2971 eutB eutC TRUE 0.990 23.000 0.000 0.000 Y 0.593
 550467 550468 plu2973 plu2974     TRUE 0.507 57.000 0.000 NA   NA
 550468 550469 plu2974 plu2975     TRUE 0.452 65.000 0.000 NA   NA
 550469 550470 plu2975 plu2976     TRUE 0.485 60.000 0.000 NA   NA
 550471 550472 plu2977 plu2978     TRUE 0.948 8.000 0.000 NA   -0.523
 550472 550473 plu2978 plu2979     FALSE 0.031 399.000 0.000 NA   NA
 550473 550474 plu2979 plu2980   cobT FALSE 0.052 322.000 0.000 NA   NA
 550474 550475 plu2980 plu2981 cobT cobC TRUE 0.813 5.000 0.023 1.000 N -0.754
 550475 550476 plu2981 plu2982 cobC   TRUE 0.737 41.000 0.000 1.000   0.388
 550476 550477 plu2982 plu2983     TRUE 0.925 16.000 0.000 NA   0.609
 550479 550480 plu2985 plu2986 cobS cobU TRUE 0.983 -3.000 0.003 1.000 Y -0.882
 550480 550481 plu2986 plu2987 cobU cbiP TRUE 0.983 -3.000 0.003 1.000 Y -0.882
 550481 550482 plu2987 plu2988 cbiP cbiL TRUE 0.606 190.000 0.003 0.006 Y -0.558
 550482 550483 plu2988 plu2989 cbiL cbiK TRUE 0.991 0.000 0.048 1.000 Y 0.134
 550483 550484 plu2989 plu2990 cbiK cbiJ TRUE 0.983 14.000 0.029 1.000 Y 0.824
 550484 550485 plu2990 plu2991 cbiJ cbiH TRUE 0.999 -3.000 0.423 0.006 Y 0.998
 550485 550486 plu2991 plu2992 cbiH cbiG TRUE 0.999 -6.000 0.352 0.006 Y 0.950
 550486 550487 plu2992 plu2993 cbiG cbiF TRUE 0.997 -19.000 0.397 0.006 Y -0.475
 550487 550488 plu2993 plu2994 cbiF cbiT TRUE 0.993 -7.000 0.056 0.006 Y 0.709
 550488 550489 plu2994 plu2995 cbiT cbiE TRUE 0.998 -10.000 0.300 0.000 Y 0.864
 550489 550490 plu2995 plu2996 cbiE cbiD TRUE 0.997 -3.000 0.126 0.006 Y 0.713
 550490 550491 plu2996 plu2997 cbiD cbiC TRUE 0.998 -3.000 0.168 0.006 Y 0.768
 550491 550492 plu2997 plu2998 cbiC cbiB TRUE 0.995 15.000 0.107 0.006 Y 0.669
 550492 550493 plu2998 plu2999 cbiB cbiA TRUE 0.997 -3.000 0.124 0.006 Y -0.141
 550494 550495 plu3000 plu3001     FALSE 0.029 423.000 0.000 NA   -0.011
 550495 550496 plu3001 plu3002     FALSE 0.008 823.000 0.000 NA   -0.888
 550496 550497 plu3002 plu3003     TRUE 0.963 0.000 0.000 NA   0.990
 550497 550498 plu3003 plu3004     FALSE 0.059 307.000 0.000 NA   NA
 550498 550499 plu3004 plu3005     TRUE 0.763 33.000 0.000 NA   NA
 550501 550502 plu3007 plu3008     FALSE 0.022 465.000 0.000 NA   NA
 550502 550503 plu3008 plu3009     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 550504 550505 plu3010 plu3011     TRUE 0.426 93.000 0.000 1.000   0.005
 550505 550506 plu3011 plu3012     FALSE 0.028 416.000 0.000 NA   NA
 550506 550507 plu3012 plu3013     TRUE 0.507 57.000 0.000 NA   NA
 550508 550509 plu3014 plu3015     FALSE 0.007 845.000 0.000 NA   NA
 550511 550512 plu3017 plu3018     FALSE 0.322 112.000 0.000 NA   -0.726
 550512 550513 plu3018 plu3019     TRUE 0.412 212.000 0.000 NA Y 0.965
 550513 550514 plu3019 plu3020     FALSE 0.239 160.000 0.000 NA   0.703
 550516 550517 plu3022 plu3023     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 550518 550519 plu3024 plu3025     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 550519 550520 plu3025 plu3026     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 550520 550521 plu3026 plu3027     TRUE 0.998 -3.000 0.792 NA   0.797
 550521 550522 plu3027 plu3028     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   0.884
 550522 550523 plu3028 plu3029     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.970
 550523 550524 plu3029 plu3030     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.952
 550524 550525 plu3030 plu3031     TRUE 0.446 91.000 0.000 NA   0.974
 550525 550526 plu3031 plu3032     TRUE 0.841 -15.000 0.000 NA   NA
 550526 550527 plu3032 plu3033     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 550527 550528 plu3033 plu3034     FALSE 0.173 193.000 0.000 NA   1.000
 550528 550529 plu3034 plu3035     FALSE 0.365 114.000 0.000 NA   0.992
 550529 550530 plu3035 plu3036     TRUE 0.971 10.000 0.100 NA   1.000
 550530 550531 plu3036 plu3037     TRUE 0.975 4.000 0.100 NA   0.992
 550531 550532 plu3037 plu3038     FALSE 0.023 520.000 0.000 NA   0.812
 550532 550533 plu3038 plut056   tRNA-Thr FALSE 0.006 1164.000 0.000 NA   NA
 550534 550535 plu3039 plu3040     TRUE 0.924 -10.000 0.070 NA   0.980
 550535 550536 plu3040 plu3041   paaK TRUE 0.952 14.000 0.070 NA   0.950
 550536 550537 plu3041 plu3042 paaK   TRUE 0.995 -3.000 0.041 0.025 Y 0.927
 550537 550538 plu3042 plu3043     TRUE 0.907 22.000 0.000 1.000   0.902
 550538 550539 plu3043 plu3044     TRUE 0.507 69.000 0.000 NA   0.894
 550539 550540 plu3044 plu3045     TRUE 0.954 1.000 0.019 NA   0.939
 550540 550541 plu3045 plu3046     TRUE 0.618 150.000 0.056 1.000 Y 0.734
 550543 550544 plu3047 plu3048   rcsB TRUE 0.999 5.000 0.558 1.000 Y 0.914
 550545 550546 plu3049 plu3050 rcsC gyrA FALSE 0.083 297.000 0.013 0.066 N 0.873
 550547 550548 plu3051 plu3052 ubiG nrdA FALSE 0.023 369.000 0.000 1.000 N 0.985
 550548 550549 plu3052 plu3053 nrdA nrdB TRUE 0.999 13.000 0.333 0.001 Y 0.881
 550549 550550 plu3053 plu3054 nrdB   TRUE 0.873 0.000 0.034 1.000 N -0.583
 550551 550552 plu3055 plu3056     TRUE 0.998 0.000 0.750 NA   -0.881
 550552 550553 plu3056 plu3057     FALSE 0.192 172.000 0.000 NA   0.027
 550553 550554 plu3057 plu3058     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.761
 550554 550555 plu3058 plu3059     FALSE 0.005 1585.000 0.000 NA   NA
 550555 550556 plu3059 plu3060     FALSE 0.185 164.000 0.000 NA   NA
 550556 550557 plu3060 plu3061     FALSE 0.185 164.000 0.000 NA   NA
 550557 550558 plu3061 plu3062     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 550558 550559 plu3062 plu3063     FALSE 0.118 227.000 0.000 NA   -0.034
 550559 550560 plu3063 plu3064     TRUE 0.962 0.000 0.000 NA   0.501
 550560 550561 plu3064 plu3065     TRUE 0.513 61.000 0.000 NA   -0.020
 550565 550566 plu3069 plu3070 menE menC TRUE 0.989 -12.000 0.283 0.001 N 0.755
 550566 550567 plu3070 plu3071 menC menB TRUE 0.999 0.000 0.171 0.001 Y 0.931
 550567 550568 plu3071 plu3072 menB   TRUE 0.960 -58.000 0.280 NA   0.992
 550568 550569 plu3072 plu3073   menD TRUE 0.993 -3.000 0.355 NA   -0.338
 550569 550570 plu3073 plu3074 menD menF TRUE 0.912 105.000 0.281 1.000 Y 0.235
 550571 550572 plu3075 plu3076     TRUE 0.680 47.000 0.000 NA   0.768
 550573 550574 plu3077 plu3078 nuoN nuoM TRUE 0.999 7.000 0.437 0.001 Y 0.383
 550574 550575 plu3078 plu3079 nuoM nuoL TRUE 0.999 21.000 0.713 0.001 Y 0.875
 550575 550576 plu3079 plu3080 nuoL nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.003 Y -0.265
 550576 550577 plu3080 plu3081 nuoK nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.269 0.001 Y -0.361
 550577 550578 plu3081 plu3082 nuoJ nuoI TRUE 0.999 13.000 0.428 0.003 Y 0.711
 550578 550579 plu3082 plu3083 nuoI nuoH TRUE 0.999 15.000 0.423 0.003 Y 0.094
 550579 550580 plu3083 plu3084 nuoH nuoG TRUE 1.000 -3.000 0.664 0.003 Y 0.299
 550580 550581 plu3084 plu3085 nuoG nuoF TRUE 0.960 67.000 0.180 0.003 Y 0.399
 550581 550582 plu3085 plu3086 nuoF nuoE TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.003 Y 0.752
 550582 550583 plu3086 plu3087 nuoE nuoC TRUE 0.999 3.000 0.407 0.003 Y 0.307
 550583 550584 plu3087 plu3088 nuoC nuoB TRUE 0.990 119.000 0.691 0.001 Y 0.802
 550584 550585 plu3088 plu3089 nuoB nuoA TRUE 0.999 18.000 0.377 0.001 Y 0.839
 550585 550586 plu3089 plu3090 nuoA lrhA FALSE 0.006 704.000 0.000 1.000 N 0.913
 550587 550588 plu3091 plu3092     FALSE 0.015 908.000 0.104 1.000   0.998
 550589 550590 plu3093 plu3094     FALSE 0.202 178.000 0.000 NA   0.982
 550591 550592 plu3095 plu3096 ackA pta TRUE 0.951 72.000 0.634 1.000   0.614
 550593 550594 plu3097 plu3098     FALSE 0.016 606.000 0.000 NA   0.982
 550594 550595 plu3098 plu3099   ISPlu10E FALSE 0.016 537.000 0.000 NA   NA
 550595 550596 plu3099 plu3100 ISPlu10E   FALSE 0.292 119.000 0.000 NA   NA
 550596 550597 plu3100 plu3101     FALSE 0.008 807.000 0.000 NA   NA
 550597 550598 plu3101 plu3102     FALSE 0.010 664.000 0.000 NA   NA
 550598 550599 plu3102 plu3103     TRUE 0.953 12.000 0.011 0.042 N 0.946
 550599 550600 plu3103 plu3104     TRUE 0.955 0.000 0.022 NA   0.948
 550600 550601 plu3104 plu3105     FALSE 0.010 897.000 0.000 NA   0.902
 550601 550602 plu3105 plu3106   astE TRUE 0.837 105.000 0.143 1.000 Y 0.987
 550602 550603 plu3106 plu3107 astE astB TRUE 0.992 13.000 0.126 1.000 Y 0.980
 550603 550604 plu3107 plu3108 astB astD TRUE 0.863 51.000 0.306 1.000 N 0.421
 550604 550605 plu3108 plu3109 astD astA TRUE 0.940 3.000 0.077 1.000 N 0.453
 550605 550606 plu3109 plu3110 astA argM TRUE 0.999 22.000 0.750 1.000 Y 0.961
 550606 550607 plu3110 plu3111 argM   FALSE 0.005 2093.000 0.000 NA   NA
 550607 550608 plu3111 plu3112     TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 550609 550610 plu3113 plu3114     TRUE 0.917 -6.000 0.000 NA   NA
 550610 550611 plu3114 plu3115     TRUE 0.789 64.000 0.000 NA Y NA
 550612 550613 plu3116 plu3117     TRUE 0.957 10.000 0.000 NA   0.888
 550615 550616 plu3119 plu3120     TRUE 0.948 5.000 0.000 NA   NA
 550616 550617 plu3120 plu3121     TRUE 0.906 16.000 0.000 NA   NA
 550617 550618 plu3121 plu3122     FALSE 0.046 340.000 0.000 NA   NA
 550618 550619 plu3122 plu3123     FALSE 0.006 1498.000 0.000 NA   NA
 550619 550620 plu3123 plu3124     FALSE 0.006 1464.000 0.000 NA   NA
 550621 550622 plu3125 plu3126     TRUE 0.998 0.000 0.170 0.007 Y -0.443
 550622 550623 plu3126 plu3127     TRUE 0.999 0.000 0.255 0.007 Y -0.771
 550623 550624 plu3127 plu3128     TRUE 0.522 120.000 0.143 NA   0.128
 550624 550625 plu3128 plu3129     FALSE 0.033 390.000 0.000 NA   NA
 550627 550628 plu3131 plu3132     FALSE 0.264 128.000 0.000 NA   NA
 550629 550630 plu3133 plu3134     FALSE 0.011 637.000 0.000 NA   NA
 550630 550631 plu3134 plu3135     FALSE 0.024 310.000 0.000 1.000 N -0.736
 550631 550632 plu3135 plu3136     TRUE 0.925 -7.000 0.000 NA   0.723
 550632 550633 plu3136 plu3137     TRUE 0.870 25.000 0.000 NA   0.781
 550633 550634 plu3137 plu3138     TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000   0.952
 550634 550635 plu3138 plu3139     FALSE 0.254 162.000 0.000 1.000   0.808
 550635 550636 plu3139 plu3140   ISPlu3P TRUE 0.421 75.000 0.000 1.000   NA
 550636 550637 plu3140 plu3141 ISPlu3P   FALSE 0.003 784.000 0.000 1.000 N NA
 550637 550638 plu3141 plu3142   lsrR FALSE 0.267 216.000 0.200 1.000 N 0.778
 550639 550640 plu3143 plu3144 lsrA lsrC TRUE 0.999 -6.000 0.818 1.000 Y 0.885
 550640 550641 plu3144 plu3145 lsrC lsrD TRUE 1.000 0.000 0.788 0.030 Y 0.751
 550641 550642 plu3145 plu3146 lsrD lsrB TRUE 0.991 63.000 0.844 NA Y 0.867
 550642 550643 plu3146 plu3147 lsrB lsrF TRUE 0.807 69.000 0.062 NA Y 0.357
 550643 550644 plu3147 plu3148 lsrF lsrG TRUE 0.943 12.000 0.028 1.000   0.694
 550645 550646 plu3149 plu3150 ISPlu2D   FALSE 0.031 402.000 0.000 NA   NA
 550646 550647 plu3150 plu3151     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 550647 550648 plu3151 plu3152     TRUE 0.890 -9.000 0.000 NA   NA
 550649 550650 plu3153 plu3154     FALSE 0.102 230.000 0.000 NA   NA
 550651 550652 plu3155 plu3156     FALSE 0.164 177.000 0.000 NA   NA
 550654 550655 plu3158 plu3159   pdl FALSE 0.024 482.000 0.000 1.000   -0.382
 550656 550657 plu3160 plu3161 ISPlu16A   FALSE 0.142 191.000 0.000 NA   NA
 550657 550658 plu3161 plu3162     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 550658 550659 plu3162 plu3163     TRUE 0.422 70.000 0.000 NA   NA
 550659 550660 plu3163 plu3164     FALSE 0.188 170.000 0.000 NA   -0.452
 550660 550661 plu3164 plu3165     FALSE 0.192 153.000 0.035 NA   -0.897
 550662 550663 plu3166 plu3167 ubiX purF TRUE 0.541 47.000 0.056 1.000 N 0.905
 550663 550664 plu3167 plu3168 purF cvpA TRUE 0.984 15.000 0.262 1.000   -0.813
 550664 550665 plu3168 plu3169 cvpA dedD FALSE 0.221 215.000 0.116 NA   0.392
 550665 550666 plu3169 plu3170 dedD folC TRUE 0.972 -10.000 0.216 NA   0.155
 550666 550667 plu3170 plu3171 folC accD TRUE 0.984 -7.000 0.383 1.000 N -0.320
 550667 550668 plu3171 plu3172 accD dedA FALSE 0.315 103.000 0.020 NA   0.165
 550668 550669 plu3172 plu3173 dedA truA TRUE 0.780 35.000 0.038 NA   0.984
 550669 550670 plu3173 plu3174 truA usg TRUE 0.894 -3.000 0.040 1.000 N 0.641
 550670 550671 plu3174 plu3175 usg pdxB TRUE 0.954 52.000 0.097 0.006 Y 0.403
 550671 550672 plu3175 plu3176 pdxB   FALSE 0.027 464.000 0.000 NA   0.392
 550674 550675 plu3178 plu3179 tctE tctD TRUE 0.999 -13.000 0.765 0.053 Y 0.827
 550675 550676 plu3179 plu3180 tctD   FALSE 0.030 453.000 0.000 NA   0.944
 550677 550678 plu3181 plu3182 tctC tctB TRUE 0.994 14.000 0.426 NA   0.805
 550678 550679 plu3182 plu3183 tctB tctA TRUE 0.984 11.000 0.192 NA   0.127
 550682 550683 plu3186 plu3187     TRUE 0.988 22.000 0.425 NA   0.583
 550683 550684 plu3187 plu3188     TRUE 0.948 23.000 0.153 NA   0.271
 550684 550685 plu3188 plu3189   aroC FALSE 0.354 89.000 0.005 1.000   0.569
 550685 550686 plu3189 plu3190 aroC   FALSE 0.315 75.000 0.081 1.000 N -0.786
 550686 550687 plu3190 plu3191     FALSE 0.062 220.000 0.000 1.000 N 0.406
 550687 550688 plu3191 plu3192   hutH TRUE 0.733 88.000 0.008 1.000 Y 0.838
 550688 550689 plu3192 plu3193 hutH hutU TRUE 0.999 9.000 0.315 0.001 Y 0.911
 550691 550692 plu3195 plu3196 hutC hutG FALSE 0.287 106.000 0.062 1.000 N 0.854
 550692 550693 plu3196 plu3197 hutG hutI TRUE 0.971 11.000 0.171 1.000 N 0.994
 550695 550696 plu3199 plu3200 sixA fadJ FALSE 0.018 407.000 0.000 1.000 N 0.965
 550696 550697 plu3200 plu3201 fadJ   TRUE 0.999 0.000 0.430 1.000 Y 0.989
 550701 550702 plu3204 plu3205   dctA FALSE 0.025 456.000 0.000 NA   -0.168
 550704 550705 plu3207 plu3208   ISPlu6F FALSE 0.337 105.000 0.000 NA   NA
 550705 550706 plu3208 plu3209 ISPlu6F   TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 550706 550707 plu3209 plu3210     FALSE 0.015 618.000 0.000 NA   0.521
 550709 550710 plu3212 plu3213     FALSE 0.020 491.000 0.000 NA   NA
 550712 550713 plu3215 plu3216     TRUE 0.995 0.000 0.364 NA   -0.759
 550713 550714 plu3216 plu3217     FALSE 0.024 494.000 0.000 NA   0.611
 550714 550715 plu3217 plu3218     FALSE 0.008 1145.000 0.000 NA   0.840
 550716 550717 plu3219 plu3220     TRUE 0.894 40.000 0.000 0.031   0.891
 550717 550718 plu3220 plu3221     FALSE 0.151 313.000 0.000 0.031   NA
 550719 550720 plu3222 plu3223     TRUE 0.955 5.000 0.000 NA   0.206
 550720 550721 plu3223 plu3224     TRUE 0.993 -22.000 0.750 NA   0.590
 550721 550722 plu3224 plu3225     TRUE 0.993 -36.000 0.750 NA   0.724
 550722 550723 plu3225 plu3226     FALSE 0.023 527.000 0.000 NA   0.882
 550723 550724 plu3226 plu3227     TRUE 0.645 44.000 0.000 NA   NA
 550724 550725 plu3227 plu3228     TRUE 0.997 -12.000 1.000 NA   NA
 550725 550726 plu3228 plu3229     TRUE 0.983 52.000 1.000 NA   NA
 550728 550729 plu3231 plu3232     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 550729 550730 plu3232 plu3233     TRUE 0.885 20.000 0.000 NA   NA
 550730 550731 plu3233 plu3234     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA   NA
 550731 550732 plu3234 plu3235     FALSE 0.382 88.000 0.000 NA   NA
 550732 550733 plu3235 plu3236     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA   0.421
 550733 550734 plu3236 plu3237     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 550734 550735 plu3237 plu3238     FALSE 0.007 839.000 0.000 NA   NA
 550735 550736 plu3238 plu3239     TRUE 0.981 17.000 0.250 NA   -0.024
 550736 550737 plu3239 plu3240     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   0.158
 550737 550738 plu3240 plu3241     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 550738 550739 plu3241 plu3242     TRUE 0.997 -12.000 1.000 NA   NA
 550739 550740 plu3242 plu3243     TRUE 0.983 52.000 1.000 NA   NA
 550740 550741 plu3243 plu3244     TRUE 0.983 52.000 1.000 NA   NA
 550741 550742 plu3244 plu3245     TRUE 0.996 10.000 0.500 NA   NA
 550742 550743 plu3245 plu3246     TRUE 0.997 4.000 0.500 NA   0.866
 550743 550744 plu3246 plu3247     FALSE 0.009 736.000 0.000 NA   NA
 550744 550745 plu3247 plu3248     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 550745 550746 plu3248 plu3249     FALSE 0.108 221.000 0.000 NA   NA
 550746 550747 plu3249 plu3250     TRUE 0.415 88.000 0.000 NA   0.023
 550747 550748 plu3250 plu3251     FALSE 0.205 179.000 0.000 NA   0.805
 550748 550749 plu3251 plu3252     TRUE 0.925 -7.000 0.000 NA   0.720
 550749 550750 plu3252 plu3253     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 550750 550751 plu3253 plu3254     FALSE 0.164 177.000 0.000 NA   NA
 550751 550752 plu3254 plu3255     TRUE 0.912 19.000 0.000 NA   0.596
 550753 550754 plu3256 plu3257     TRUE 0.917 -6.000 0.000 NA   NA
 550754 550755 plu3257 plu3258     TRUE 0.789 64.000 0.000 NA Y NA
 550756 550757 plu3259 plu3260     TRUE 0.949 -3.000 0.000 NA   -0.100
 550757 550758 plu3260 plu3261     TRUE 0.926 16.000 0.000 NA   0.714
 550758 550759 plu3261 plu3262     TRUE 0.790 32.000 0.000 NA   -0.123
 550759 550760 plu3262 plu3263     FALSE 0.008 1156.000 0.000 NA   0.859
 550760 550761 plu3263 plu3264     FALSE 0.287 120.000 0.000 NA   NA
 550761 550762 plu3264 plu3265     FALSE 0.007 909.000 0.000 NA   NA
 550764 550765 plu3267 plu3268   ISPlu4C FALSE 0.339 104.000 0.000 NA   NA
 550765 550766 plu3268 plu3269 ISPlu4C ISPlu10D FALSE 0.289 368.000 0.000 0.019 Y NA
 550767 550768 plu3270 plu3271     TRUE 0.466 83.000 0.000 NA   0.894
 550768 550769 plu3271 plu3272     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   -0.710
 550769 550770 plu3272 plu3273     TRUE 0.959 -16.000 0.200 NA   0.911
 550770 550771 plu3273 plu3274     TRUE 0.995 -13.000 0.750 NA   -0.629
 550772 550773 plu3275 plu3276   pepB TRUE 0.941 36.000 0.253 NA   -0.529
 550773 550774 plu3276 plu3277 pepB   FALSE 0.171 309.000 0.171 1.000   -0.639
 550774 550775 plu3277 plu3278   fdx TRUE 0.995 19.000 0.625 1.000   0.781
 550775 550776 plu3278 plu3279 fdx hscA TRUE 0.998 3.000 0.794 1.000 N 0.969
 550776 550777 plu3279 plu3280 hscA hscB TRUE 0.999 12.000 0.634 1.000 Y 0.904
 550777 550778 plu3280 plu3281 hscB   TRUE 0.978 38.000 0.500 1.000   0.744
 550778 550779 plu3281 plu3282   nifU TRUE 0.929 110.000 0.359 0.002   0.991
 550779 550780 plu3282 plu3283 nifU iscS TRUE 0.980 25.000 0.448 1.000 N 0.886
 550780 550781 plu3283 plu3284 iscS   TRUE 0.911 50.000 0.424 1.000 N -0.267
 550781 550782 plu3284 plu3285     TRUE 0.425 87.000 0.126 1.000 N -0.681
 550784 550785 plu3287 plu3288 treC treB TRUE 0.978 100.000 0.650 1.000 Y 0.869
 550785 550786 plu3288 plu3289 treB treR FALSE 0.377 149.000 0.168 1.000 N 0.734
 550786 550787 plu3289 plu3290 treR hctA TRUE 0.504 73.000 0.000 1.000   0.925
 550787 550788 plu3290 plu3291 hctA glyA FALSE 0.075 320.000 0.044 1.000   0.933
 550790 550791 plu3293 plu3294   recX FALSE 0.354 100.000 0.000 NA   NA
 550791 550792 plu3294 plu3295 recX   TRUE 0.932 -3.000 0.003 NA   0.735
 550792 550793 plu3295 plu3296     TRUE 0.556 60.000 0.000 NA   0.972
 550793 550794 plu3296 plu3297     FALSE 0.045 348.000 0.000 NA   -0.839
 550795 550796 plu3298 plu3299     TRUE 0.446 66.000 0.000 NA   NA
 550797 550798 plu3300 plu3301 ISPlu3N   FALSE 0.067 292.000 0.000 NA   NA
 550798 550799 plu3301 plu3302     TRUE 0.992 -39.000 0.714 NA   0.937
 550799 550800 plu3302 plu3303     FALSE 0.015 641.000 0.000 NA   0.869
 550800 550801 plu3303 plu3304     FALSE 0.257 151.000 0.000 NA   0.670
 550801 550802 plu3304 plu3305     TRUE 0.468 74.000 0.000 NA   0.706
 550802 550803 plu3305 plu3306     FALSE 0.037 418.000 0.000 NA   0.873
 550803 550804 plu3306 plu3307     TRUE 0.986 0.000 0.000 0.041   0.866
 550804 550805 plu3307 plu3308   ISPlu6E FALSE 0.028 422.000 0.000 1.000   NA
 550805 550806 plu3308 plu3309 ISPlu6E glnB FALSE 0.044 361.000 0.000 1.000   NA
 550806 550807 plu3309 plu3310 glnB nadE TRUE 0.950 16.000 0.151 1.000 N 0.938
 550807 550808 plu3310 plu3311 nadE   TRUE 0.621 67.000 0.065 0.065 N 0.902
 550808 550809 plu3311 plu3312     TRUE 0.978 -3.000 0.130 NA   0.921
 550809 550810 plu3312 plu3313     TRUE 0.623 94.000 0.132 NA   0.913
 550811 550812 plu3314 plu3315     FALSE 0.040 361.000 0.000 NA   -0.923
 550812 550813 plu3315 plu3316     TRUE 0.889 -13.000 0.000 NA   0.800
 550815 550816 plu3318 plu3319 yfhD adiA FALSE 0.145 131.000 0.000 1.000 N 0.176
 550817 550818 plu3320 plu3321     FALSE 0.088 249.000 0.000 NA   NA
 550819 550820 plu3322 plu3323 ISPlu7C_orfA ISPlu7C_orfB TRUE 0.986 -3.000 0.000 NA Y NA
 550822 550823 plu3325 plu3326     FALSE 0.069 285.000 0.000 NA   NA
 550823 550824 plu3326 plu3327     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 550824 550825 plu3327 plu3328     FALSE 0.007 840.000 0.000 NA   NA
 550825 550826 plu3328 plu3329     FALSE 0.251 156.000 0.000 NA   0.962
 550826 550827 plu3329 plu3330     FALSE 0.031 447.000 0.000 NA   0.930
 550827 550828 plu3330 plu3331     FALSE 0.018 573.000 0.000 NA   0.972
 550828 550829 plu3331 plu3332     TRUE 0.952 2.000 0.000 NA   NA
 550829 550830 plu3332 plu3333     FALSE 0.033 389.000 0.000 NA   NA
 550830 550831 plu3333 plu3334     FALSE 0.292 119.000 0.000 NA   NA
 550831 550832 plu3334 plu3335     FALSE 0.025 430.000 0.000 NA   NA
 550833 550834 plu3336 plu3337 acpS pdxJ TRUE 0.990 0.000 0.326 1.000 N -0.882
 550834 550835 plu3337 plu3338 pdxJ recO FALSE 0.238 195.000 0.166 1.000 N 0.372
 550835 550836 plu3338 plu3339 recO era TRUE 0.970 12.000 0.109 1.000   0.619
 550836 550837 plu3339 plu3340 era rnc TRUE 0.990 -3.000 0.127 0.032   0.970
 550837 550838 plu3340 plu3341 rnc lepB FALSE 0.336 175.000 0.117 1.000   0.722
 550838 550839 plu3341 plu3342 lepB lepA TRUE 0.971 21.000 0.187 1.000   0.835
 550839 550840 plu3342 plu3343 lepA rseC FALSE 0.069 194.000 0.045 NA N 0.361
 550840 550841 plu3343 plu3344 rseC rseB TRUE 0.999 0.000 0.609 NA Y 0.699
 550841 550842 plu3344 plu3345 rseB rseA TRUE 1.000 6.000 0.856 NA Y 0.376
 550842 550843 plu3345 plu3346 rseA rpoE TRUE 0.978 40.000 0.705 NA N 0.131
 550847 550848 plu3350 plu3351     FALSE 0.016 558.000 0.000 NA   -0.171
 550848 550849 plu3351 plu3352     TRUE 0.905 -7.000 0.000 NA   -0.949
 550849 550850 plu3352 plu3353   ISPlu3M TRUE 0.440 67.000 0.000 NA   NA
 550850 550851 plu3353 plu3354 ISPlu3M   TRUE 0.570 50.000 0.000 NA   NA
 550851 550852 plu3354 plu3355     FALSE 0.298 129.000 0.000 NA   0.292
 550852 550853 plu3355 plu3356     TRUE 0.420 86.000 0.000 NA   0.078
 550855 550856 plu3358 plu3359     TRUE 0.821 26.000 0.000 NA   NA
 550856 550857 plu3359 plu3360     TRUE 0.750 38.000 0.000 NA   0.108
 550857 550858 plu3360 plu3361     TRUE 0.954 7.000 0.000 NA   0.263
 550858 550859 plu3361 plu3362     FALSE 0.110 269.000 0.000 1.000   0.904
 550859 550860 plu3362 plu3363     TRUE 0.900 22.000 0.000 NA   0.881
 550860 550861 plu3363 plu3364     FALSE 0.026 489.000 0.000 NA   0.946
 550861 550862 plu3364 plu3365     FALSE 0.061 197.000 0.000 1.000 N -0.686
 550862 550863 plu3365 plu3366     TRUE 0.908 16.000 0.000 NA   -0.835
 550863 550864 plu3366 plu3367     FALSE 0.100 247.000 0.000 NA   -0.204
 550864 550865 plu3367 plu3368     TRUE 0.962 2.000 0.000 NA   0.633
 550865 550866 plu3368 plu3369     FALSE 0.012 700.000 0.000 NA   0.198
 550866 550867 plu3369 plu3370     TRUE 0.990 16.000 0.375 NA   0.202
 550870 550871 plu3373 plu3374 ppnK recN TRUE 0.574 89.000 0.170 1.000 N 0.990
 550871 550872 plu3374 plu3375 recN smpA FALSE 0.048 239.000 0.049 1.000 N -0.334
 550873 550874 plu3376 plu3377     TRUE 0.959 -7.000 0.124 NA   0.990
 550875 550876 plu3378 plu3379 smpB   FALSE 0.008 881.000 0.000 1.000   NA
 550876 550877 plu3379 plu3380     FALSE 0.226 143.000 0.000 NA   NA
 550878 550879 plu3381 plu3382     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 550879 550880 plu3382 plu3383     TRUE 0.988 -13.000 0.455 NA   0.550
 550880 550881 plu3383 plu3384     TRUE 0.988 1.000 0.182 NA   0.824
 550881 550882 plu3384 plu3385     TRUE 0.853 66.000 0.286 NA   0.992
 550882 550883 plu3385 plu3386     FALSE 0.357 99.000 0.000 NA   NA
 550883 550884 plu3386 plu3387     FALSE 0.198 157.000 0.000 NA   NA
 550884 550885 plu3387 plu3388     FALSE 0.028 464.000 0.000 NA   0.633
 550885 550886 plu3388 plu3389     TRUE 0.857 23.000 0.000 NA   -0.960
 550886 550887 plu3389 plu3390     TRUE 0.993 -3.000 0.375 NA   -0.940
 550887 550888 plu3390 plu3391     TRUE 0.999 -3.000 0.889 NA   -0.878
 550888 550889 plu3391 plu3392     TRUE 0.997 0.000 0.556 NA   0.566
 550889 550890 plu3392 plu3393     FALSE 0.129 206.000 0.000 NA   -0.590
 550890 550891 plu3393 plu3394     TRUE 0.999 0.000 0.778 NA   -0.124
 550891 550892 plu3394 plu3395     TRUE 0.998 0.000 0.615 NA   -0.798
 550892 550893 plu3395 plu3396     TRUE 0.988 -19.000 0.538 NA   0.475
 550893 550894 plu3396 plu3397     TRUE 0.997 0.000 0.500 NA   -0.933
 550894 550895 plu3397 plu3398     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   0.897
 550895 550896 plu3398 plu3399     TRUE 0.997 0.000 0.571 NA   -0.984
 550896 550897 plu3399 plu3400     TRUE 0.948 5.000 0.000 NA   -0.928
 550897 550898 plu3400 plu3401     TRUE 0.955 1.000 0.000 NA   -0.707
 550898 550899 plu3401 plu3402     TRUE 0.996 0.000 0.429 NA   -0.808
 550899 550900 plu3402 plu3403     TRUE 0.993 3.000 0.304 NA   0.116
 550900 550901 plu3403 plu3404     TRUE 0.935 18.000 0.087 NA   -0.017
 550901 550902 plu3404 plu3405     TRUE 0.683 47.000 0.000 NA   0.938
 550902 550903 plu3405 plu3406     TRUE 0.846 -22.000 0.000 NA   0.986
 550903 550904 plu3406 plu3407     TRUE 0.989 9.000 0.000 0.001   0.988
 550904 550905 plu3407 plu3408     TRUE 0.470 79.000 0.000 NA   0.862
 550906 550907 plu3409 plu3410 ISPlu7B_orfA ISPlu7B_orf TRUE 0.986 -3.000 0.000 NA Y NA
 550908 550909 plu3411 plu3412     TRUE 0.908 20.000 0.000 NA   0.677
 550909 550910 plu3412 plu3413     FALSE 0.271 131.000 0.000 NA   -0.371
 550910 550911 plu3413 plu3414     TRUE 0.412 93.000 0.000 1.000   -0.480
 550911 550912 plu3414 plu3415     TRUE 0.834 -16.000 0.000 NA   NA
 550914 550915 plu3417 plu3418     FALSE 0.010 816.000 0.000 1.000   0.354
 550915 550916 plu3418 plu3419     TRUE 0.978 89.000 0.750 0.030   0.680
 550918 550919 plu3421 plu3422     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 550919 550920 plu3422 plu3423     TRUE 0.835 -40.000 0.000 NA   0.882
 550920 550921 plu3423 plu3424     TRUE 0.585 56.000 0.000 NA   0.744
 550921 550922 plu3424 plu3425     TRUE 0.901 -9.000 0.000 NA   -0.075
 550922 550923 plu3425 plu3426     TRUE 0.744 38.000 0.000 NA   -0.122
 550923 550924 plu3426 plu3427     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   0.850
 550924 550925 plu3427 plu3428     FALSE 0.158 203.000 0.000 NA   0.667
 550925 550926 plu3428 plu3429     TRUE 0.963 0.000 0.000 NA   0.634
 550926 550927 plu3429 plu3430     TRUE 0.400 83.000 0.000 NA   -0.719
 550927 550928 plu3430 plu3431     FALSE 0.110 258.000 0.000 NA   0.887
 550928 550929 plu3431 plu3432     TRUE 0.984 0.000 0.167 NA   -0.825
 550929 550930 plu3432 plu3433     TRUE 0.997 -10.000 0.833 NA   NA
 550930 550931 plu3433 plu3434     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 550931 550932 plu3434 plu3435     TRUE 0.965 0.000 0.049 NA   0.992
 550932 550933 plu3435 plu3436     TRUE 0.971 -10.000 0.220 NA   -0.816
 550933 550934 plu3436 plu3437     TRUE 0.989 14.000 0.308 NA   0.145
 550934 550935 plu3437 plu3438     TRUE 0.982 32.000 0.500 NA   0.326
 550935 550936 plu3438 plu3439     FALSE 0.135 205.000 0.000 NA   -0.276
 550936 550937 plu3439 plu3440     TRUE 0.997 -7.000 0.818 NA   -0.182
 550937 550938 plu3440 plu3441     TRUE 0.989 2.000 0.200 NA   0.911
 550938 550939 plu3441 plu3442     TRUE 0.996 0.000 0.400 NA   0.906
 550939 550940 plu3442 plu3443     TRUE 0.997 -3.000 0.600 NA   -0.778
 550940 550941 plu3443 plu3444     TRUE 0.999 0.000 0.800 NA   0.999
 550941 550942 plu3444 plu3445     TRUE 0.997 -7.000 0.800 NA   0.991
 550942 550943 plu3445 plu3446     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   -0.697
 550943 550944 plu3446 plu3447     TRUE 0.910 -10.000 0.000 NA   0.917
 550944 550945 plu3447 plu3448     TRUE 0.951 3.000 0.000 NA   -0.853
 550947 550948 plu3450 plu3451     TRUE 0.897 18.000 0.000 NA   -0.874
 550948 550949 plu3451 plu3452     TRUE 0.891 23.000 0.000 NA   0.805
 550949 550950 plu3452 plu3453     TRUE 0.894 18.000 0.000 NA   -0.975
 550951 550952 plu3454 plu3455     TRUE 0.733 56.000 0.000 0.059   NA
 550952 550953 plu3455 plu3456     TRUE 0.911 53.000 0.333 NA   0.404
 550953 550954 plu3456 plu3457     TRUE 0.831 54.000 0.200 NA   0.444
 550954 550955 plu3457 plu3458     TRUE 0.698 239.000 0.571 1.000   0.676
 550955 550956 plu3458 plu3459     FALSE 0.022 459.000 0.000 NA   NA
 550956 550957 plu3459 plu3460     FALSE 0.160 179.000 0.000 NA   NA
 550957 550958 plu3460 plu3461     TRUE 0.960 -16.000 0.214 NA   0.330
 550959 550960 plu3462 plu3463     TRUE 0.653 101.000 0.167 NA   0.998
 550960 550961 plu3463 plu3464     FALSE 0.194 180.000 0.000 NA   0.649
 550961 550962 plu3464 plu3465     TRUE 0.882 46.000 0.000 0.001   NA
 550962 550963 plu3465 plu3467     TRUE 0.833 25.000 0.000 NA   NA
 550963 550964 plu3467 plu3468     TRUE 0.984 16.000 0.286 NA   -0.511
 550964 550965 plu3468 plu3469     TRUE 0.400 101.000 0.000 NA   0.447
 550965 550966 plu3469 plu3470     TRUE 0.939 16.000 0.061 NA   0.849
 550966 550967 plu3470 plu3471     FALSE 0.014 630.000 0.000 NA   0.452
 550967 550968 plu3471 plu3472     TRUE 0.999 2.000 0.429 0.063 Y 0.900
 550968 550969 plu3472 plu3473     TRUE 0.988 9.000 0.222 NA   -0.156
 550969 550970 plu3473 plu3474     TRUE 0.960 3.000 0.000 NA   0.461
 550970 550971 plu3474 plu3475     TRUE 0.996 15.000 0.625 NA   -0.278
 550971 550972 plu3475 plu3476     TRUE 0.575 58.000 0.000 NA   0.820
 550975 550976 plu3479 plu3480   ISPlu3L FALSE 0.166 176.000 0.000 NA   NA
 550976 550977 plu3480 plu3481 ISPlu3L   TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 550977 550978 plu3481 plu3482     TRUE 0.921 14.000 0.000 NA   NA
 550978 550979 plu3482 plu3483     TRUE 0.997 -3.000 0.600 NA   -0.704
 550979 550980 plu3483 plu3484     TRUE 0.549 52.000 0.000 NA   NA
 550980 550981 plu3484 plu3485     FALSE 0.014 570.000 0.000 NA   NA
 550981 550982 plu3485 plu3486     TRUE 0.948 5.000 0.000 NA   NA
 550982 550983 plu3486 plu3487     TRUE 0.923 77.000 0.571 NA   -0.946
 550985 550986 plu3489 plu3490     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 550987 550988 plu3491 plu3492     TRUE 0.975 -3.000 0.143 NA   NA
 550988 550989 plu3492 plu3493     FALSE 0.287 120.000 0.000 NA   NA
 550989 550990 plu3493 plu3494     TRUE 0.947 6.000 0.000 NA   NA
 550990 550991 plu3494 plu3495     TRUE 0.959 0.000 0.059 NA   NA
 550991 550992 plu3495 plu3496     TRUE 0.949 -10.000 0.147 NA   NA
 550992 550993 plu3496 plu3497     TRUE 0.831 -37.000 0.000 NA   0.708
 550993 550994 plu3497 plu3498     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 550994 550995 plu3498 plu3499     FALSE 0.026 423.000 0.000 NA   NA
 550996 550997 plu3500 plu3501     TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 550998 550999 plu3502 plu3503   fic FALSE 0.006 1028.000 0.000 NA   -0.962
 550999 551000 plu3503 plu3504 fic   TRUE 0.995 8.000 0.429 NA   -0.856
 551000 551001 plu3504 plu3505     TRUE 0.438 80.000 0.000 NA   0.338
 551001 551002 plu3505 plu3506     FALSE 0.022 210.000 0.014 NA N -0.318
 551002 551003 plu3506 plu3507     FALSE 0.012 747.000 0.000 NA   0.897
 551004 551005 plu3508 plu3509     FALSE 0.145 208.000 0.000 1.000   -0.042
 551008 551009 plu3512 plu3513     TRUE 0.538 83.000 0.000 0.050 N 0.979
 551009 551010 plu3513 plu3514     FALSE 0.347 257.000 0.222 1.000   0.949
 551010 551011 plu3514 plu3515     TRUE 0.458 83.000 0.000 NA   0.968
 551011 551012 plu3515 plu3516     FALSE 0.008 889.000 0.000 NA   0.068
 551013 551014 plu3517 plu3518     FALSE 0.007 613.000 0.000 1.000 N 0.733
 551015 551016 plu3519 plu3520     FALSE 0.147 208.000 0.000 NA   0.536
 551016 551017 plu3520 plu3521     FALSE 0.024 497.000 0.000 NA   0.662
 551017 551018 plu3521 plu3522     TRUE 0.982 -9.000 0.300 NA   NA
 551018 551019 plu3522 plu3523     TRUE 0.979 -13.000 0.333 NA   NA
 551021 551022 plu3525 plu3526     FALSE 0.139 194.000 0.000 NA   NA
 551022 551023 plu3526 plu3527     FALSE 0.163 182.000 0.000 NA   -0.618
 551023 551024 plu3527 plu3528     TRUE 0.958 3.000 0.000 1.000   -0.304
 551024 551025 plu3528 plu3529     FALSE 0.202 188.000 0.000 1.000   0.886
 551025 551026 plu3529 plu3530     FALSE 0.246 104.000 0.000 1.000 N 0.859
 551026 551027 plu3530 plu3531     TRUE 0.920 41.000 0.000 1.000 Y 0.605
 551027 551028 plu3531 plu3532     TRUE 0.938 36.000 0.000 1.000 Y 0.499
 551028 551029 plu3532 plu3533     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.005 Y -0.550
 551029 551030 plu3533 plu3534     TRUE 0.996 3.000 0.000 0.005 Y 0.980
 551030 551031 plu3534 plu3535     TRUE 0.996 0.000 0.000 0.005 Y -0.708
 551031 551032 plu3535 plu3536     TRUE 0.742 60.000 0.000 0.040   -0.235
 551032 551033 plu3536 plu3537     TRUE 0.913 19.000 0.000 NA   0.703
 551033 551034 plu3537 plu3538     TRUE 0.904 17.000 0.000 NA   -0.699
 551034 551035 plu3538 plu3539   prpE FALSE 0.003 1153.000 0.000 1.000 N 0.142
 551035 551036 plu3539 plu3540 prpE prpD TRUE 0.763 73.000 0.038 0.001   -0.051
 551036 551037 plu3540 plu3541 prpD prpC TRUE 0.857 55.000 0.216 1.000   0.957
 551037 551038 plu3541 plu3542 prpC prpB TRUE 0.914 61.000 0.502 1.000 N 0.584
 551042 551043 plu3546 plu3547 ISPlu15A   FALSE 0.161 204.000 0.000 NA   0.963
 551043 551044 plu3547 plut059   tRNA-Gly FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 551044 551045 plut059 plu3548 tRNA-Gly lysS FALSE 0.212 151.000 0.000 NA   NA
 551045 551046 plu3548 plu3549 lysS prfB TRUE 0.997 10.000 0.162 0.032 Y 0.753
 551046 551047 plu3549 plu3550 prfB recJ FALSE 0.014 324.000 0.028 1.000 N -0.856
 551047 551048 plu3550 plu3551 recJ dsbC TRUE 0.942 0.000 0.082 1.000 N 0.058
 551048 551049 plu3551 plu3552 dsbC xerD TRUE 0.805 24.000 0.079 1.000 N -0.120
 551051 551052 plu3554 plu3555     TRUE 0.855 -19.000 0.061 NA   -0.432
 551053 551054 plu3556 plu3557     TRUE 0.932 12.000 0.009 1.000   0.732
 551055 551056 plu3558 plu3559     FALSE 0.027 418.000 0.000 NA   NA
 551056 551057 plu3559 plu3560     FALSE 0.320 110.000 0.000 NA   NA
 551057 551058 plu3560 plu3561     FALSE 0.017 596.000 0.000 NA   0.735
 551058 551059 plu3561 plu3562     TRUE 0.689 22.000 0.009 1.000 N 0.912
 551059 551060 plu3562 plu3563     TRUE 0.977 -7.000 0.009 1.000 Y 0.894
 551060 551061 plu3563 plu3564     TRUE 0.958 -19.000 0.056 1.000 Y -0.831
 551061 551062 plu3564 plu3565     TRUE 0.482 44.000 0.056 1.000 N -0.562
 551062 551063 plu3565 plu3566     TRUE 0.677 25.000 0.021 1.000 N 0.892
 551063 551064 plu3566 plu3567     TRUE 0.864 -3.000 0.021 1.000 N 0.747
 551066 551067 plu3569 plu3570     FALSE 0.005 1733.000 0.000 NA   NA
 551067 551068 plu3570 plu3571     TRUE 0.857 23.000 0.000 NA   NA
 551068 551069 plu3571 plu3572     TRUE 0.468 63.000 0.000 NA   NA
 551069 551070 plu3572 plu3573     TRUE 0.413 72.000 0.000 NA   NA
 551070 551071 plu3573 plu3574     TRUE 0.468 63.000 0.000 NA   NA
 551071 551072 plu3574 plu3575     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 551072 551073 plu3575 plu3576     FALSE 0.037 374.000 0.000 NA   NA
 551073 551074 plu3576 plu3577     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 551076 551077 plu3579 plu3580     TRUE 0.990 -13.000 0.147 0.058 Y NA
 551078 551079 plu3581 plu3582     FALSE 0.342 103.000 0.000 NA   NA
 551080 551081 plu3583 plu3584     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 551085 551086 plu3588 plu3589     TRUE 0.990 -13.000 0.147 0.058 Y NA
 551087 551088 plu3590 plu3591     FALSE 0.342 103.000 0.000 NA   NA
 551089 551090 plu3592 plu3593     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 551090 551091 plu3593 plu3594     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 551091 551092 plu3594 plu3595     TRUE 0.824 -48.000 0.000 NA   0.987
 551092 551093 plu3595 plu3596   gcvP FALSE 0.016 622.000 0.000 NA   0.810
 551093 551094 plu3596 plu3597 gcvP gcvH TRUE 0.911 88.000 0.249 1.000 Y -0.765
 551094 551095 plu3597 plu3598 gcvH gcvT TRUE 0.960 122.000 0.317 0.001 Y -0.461
 551095 551096 plu3598 plu3599 gcvT visC FALSE 0.011 359.000 0.004 1.000 N 0.665
 551096 551097 plu3599 plu3600 visC ubiH TRUE 0.996 39.000 0.474 0.001 Y 0.356
 551097 551098 plu3600 plu3601 ubiH pepP TRUE 0.915 8.000 0.047 1.000 N 0.966
 551098 551099 plu3601 plu3602 pepP   TRUE 0.692 47.000 0.073 NA   -0.495
 551100 551101 plu3603 plu3604     FALSE 0.056 335.000 0.034 NA   0.774
 551102 551103 plu3605 plu3606 serA rpiA FALSE 0.038 273.000 0.029 1.000 N 0.859
 551103 551104 plu3606 plu3607 rpiA   FALSE 0.067 292.000 0.000 NA   NA
 551104 551105 plu3607 plu3608     FALSE 0.053 319.000 0.000 NA   NA
 551106 551107 plu3609 plu3610   iciA FALSE 0.359 98.000 0.000 NA   NA
 551108 551109 plu3611 plu3612     TRUE 0.437 114.000 0.075 NA   0.787
 551110 551111 plu3613 plu3614     TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000   -0.781
 551112 551113 plu3615 plu3616     FALSE 0.338 139.000 0.066 NA   0.932
 551114 551115 plu3617 plu3618     FALSE 0.267 137.000 0.000 NA   -0.023
 551116 551117 plu3619 plu3620 acnB   TRUE 0.471 76.000 0.000 NA   0.955
 551117 551118 plu3620 plu3621   lpdA FALSE 0.222 167.000 0.000 NA   0.677
 551118 551119 plu3621 plu3622 lpdA aceF TRUE 0.845 204.000 0.463 1.000 Y -0.833
 551119 551120 plu3622 plu3623 aceF aceE TRUE 0.994 15.000 0.220 1.000 Y 0.979
 551120 551121 plu3623 plu3624 aceE pdhR TRUE 0.401 190.000 0.276 1.000 N -0.142
 551121 551122 plu3624 plu3625 pdhR   FALSE 0.010 732.000 0.000 NA   -0.214
 551122 551123 plu3625 plu3626     TRUE 0.642 48.000 0.000 NA   0.142
 551123 551124 plu3626 plu3627     FALSE 0.096 270.000 0.000 NA   0.633
 551124 551125 plu3627 plu3628     TRUE 0.959 9.000 0.073 NA   -0.556
 551126 551127 plu3629 plu3630     FALSE 0.056 313.000 0.000 NA   NA
 551127 551128 plu3630 plu3631     FALSE 0.050 330.000 0.000 NA   -0.845
 551128 551129 plu3631 plu3632     TRUE 0.953 11.000 0.000 NA   0.809
 551129 551130 plu3632 plu3633     TRUE 0.782 -48.000 0.000 NA   NA
 551130 551131 plu3633 plu3634     FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 551131 551132 plu3634 plu3635     TRUE 0.399 98.000 0.000 NA   0.212
 551134 551135 plu3637 plu3638 nadC ppdD FALSE 0.029 198.000 0.015 NA N -0.050
 551135 551136 plu3638 plu3639 ppdD hofB TRUE 0.913 168.000 0.556 NA Y -0.869
 551136 551137 plu3639 plu3640 hofB hofC TRUE 0.999 3.000 0.571 1.000 Y 0.830
 551137 551138 plu3640 plu3641 hofC coaE FALSE 0.108 92.000 0.004 1.000 N 0.217
 551138 551139 plu3641 plu3642 coaE   TRUE 0.955 -7.000 0.110 NA   0.968
 551139 551140 plu3642 plu3643     TRUE 0.968 31.000 0.356 NA   NA
 551141 551142 plu3644 plu3645 mutT secA TRUE 0.471 121.000 0.168 1.000 N 0.875
 551142 551143 plu3645 plu3646 secA   TRUE 0.484 84.000 0.065 1.000   -0.148
 551145 551146 plu3648 plu3649 lpxC ftsZ TRUE 0.464 99.000 0.134 1.000 N 0.579
 551146 551147 plu3649 plu3650 ftsZ ftsA TRUE 0.973 63.000 0.460 1.000 Y 0.133
 551147 551148 plu3650 plu3651 ftsA ftsQ TRUE 0.936 42.000 0.389 NA N 0.961
 551148 551149 plu3651 plu3652 ftsQ ddl TRUE 0.998 2.000 0.372 NA Y 0.713
 551149 551150 plu3652 plu3653 ddl murC TRUE 0.996 -7.000 0.153 0.003 Y -0.368
 551150 551151 plu3653 plu3654 murC murG TRUE 0.960 56.000 0.283 1.000 Y 0.958
 551151 551152 plu3654 plu3655 murG ftsW TRUE 0.997 -3.000 0.647 1.000 N 0.791
 551152 551153 plu3655 plu3656 ftsW murD TRUE 0.996 0.000 0.297 0.002 N 0.669
 551153 551154 plu3656 plu3657 murD mraY TRUE 1.000 3.000 0.647 0.003 Y 0.353
 551154 551155 plu3657 plu3658 mraY murF TRUE 0.998 -6.000 0.309 0.003 Y -0.098
 551155 551156 plu3658 plu3659 murF murE TRUE 1.000 -3.000 0.569 0.001 Y 0.937
 551156 551157 plu3659 plu3660 murE ftsI TRUE 0.973 -13.000 0.059 1.000 Y 0.637
 551157 551158 plu3660 plu3661 ftsI ftsL TRUE 0.846 29.000 0.124 1.000 N 0.979
 551158 551159 plu3661 plu3662 ftsL mraW TRUE 0.985 0.000 0.227 1.000 N 0.373
 551159 551160 plu3662 plu3663 mraW mraZ TRUE 0.998 3.000 0.635 NA   0.873
 551160 551161 plu3663 plu3664 mraZ fruR FALSE 0.013 632.000 0.000 NA   -0.048
 551161 551162 plu3664 plu3665 fruR ilvH FALSE 0.273 88.000 0.063 1.000 N -0.341
 551162 551163 plu3665 plu3666 ilvH ilvI TRUE 0.999 3.000 0.371 0.001 Y -0.816
 551164 551165 plu3667 plu3668     TRUE 0.393 79.000 0.000 NA   NA
 551165 551166 plu3668 plu3669     TRUE 0.947 10.000 0.000 1.000   -0.862
 551167 551168 plu3670 plu3671   fadD FALSE 0.060 325.000 0.000 NA   0.355
 551168 551169 plu3671 plu3672 fadD leuO FALSE 0.058 235.000 0.050 1.000 N 0.235
 551170 551171 plu3673 plu3674 leuA leuB TRUE 0.998 3.000 0.126 0.001 Y 0.424
 551171 551172 plu3674 plu3675 leuB leuC TRUE 0.999 2.000 0.275 0.001 Y 0.592
 551172 551173 plu3675 plu3676 leuC leuD TRUE 0.999 9.000 0.309 0.001 Y 0.868
 551173 551174 plu3676 plu3677 leuD yabN FALSE 0.034 445.000 0.000 1.000   0.904
 551174 551175 plu3677 plu3678 yabN mutH FALSE 0.018 585.000 0.000 1.000   0.527
 551175 551176 plu3678 plu3679 mutH   FALSE 0.249 93.000 0.000 1.000 N 0.534
 551177 551178 plu3680 plu3681 speB speA TRUE 0.559 170.000 0.055 1.000 Y 0.760
 551178 551179 plu3681 plu3682 speA   FALSE 0.302 127.000 0.000 NA   0.219
 551180 551181 plu3683 plu3684 metK sprT FALSE 0.209 149.000 0.030 1.000   -0.755
 551182 551183 plu3685 plu3686     TRUE 0.784 -45.000 0.000 NA   NA
 551185 551186 plu3688 plu3689     TRUE 0.990 -13.000 0.147 0.057 Y NA
 551187 551188 plu3690 plu3691     FALSE 0.374 93.000 0.000 NA   NA
 551189 551190 plu3692 plu3693     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 551192 551193 plu3695 plu3696     FALSE 0.040 361.000 0.000 NA   NA
 551193 551194 plu3696 plu3697     TRUE 0.990 -13.000 0.147 0.057 Y NA
 551195 551196 plu3698 plu3699     FALSE 0.374 93.000 0.000 NA   NA
 551197 551198 plu3700 plu3701     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 551198 551199 plu3701 plu3702     FALSE 0.048 332.000 0.000 NA   NA
 551201 551202 plu3704 plu3705     TRUE 0.990 -13.000 0.147 0.057 Y NA
 551203 551204 plu3706 plu3707     TRUE 0.609 73.000 0.133 NA   NA
 551205 551206 plu3708 plu3709     TRUE 0.914 15.000 0.000 NA   NA
 551206 551207 plu3709 plu3711     TRUE 0.693 40.000 0.000 NA   NA
 551209 551210 plu3713 plu3714     TRUE 0.990 -13.000 0.147 0.057 Y NA
 551211 551212 plu3715 plu3716     TRUE 0.609 73.000 0.133 NA   NA
 551213 551214 plu3717 plu3718     TRUE 0.914 15.000 0.000 NA   NA
 551214 551215 plu3718 plu3719     TRUE 0.862 49.000 0.000 NA Y NA
 551215 551216 plu3719 plu3720     FALSE 0.003 809.000 0.000 NA N NA
 551216 551217 plu3720 plu3721     TRUE 0.811 54.000 0.000 0.029   0.873
 551217 551218 plu3721 plu3722   ISPlu3J FALSE 0.017 542.000 0.000 1.000   NA
 551218 551219 plu3722 plu3723 ISPlu3J   TRUE 0.763 33.000 0.000 NA   NA
 551219 551220 plu3723 plu3724   abgT FALSE 0.080 266.000 0.000 NA   NA
 551220 551221 plu3724 plu3725 abgT abgB TRUE 0.480 110.000 0.080 1.000   0.911
 551221 551222 plu3725 plu3726 abgB abgA TRUE 0.988 -7.000 0.128 0.002   0.946
 551224 551225 plu3728 plu3729 ISPlu3I   TRUE 0.678 43.000 0.000 1.000   NA
 551227 551228 plu3731 plu3732     TRUE 0.853 -13.000 0.115 1.000 N -0.931
 551228 551229 plu3732 plu3733     TRUE 0.647 158.000 0.385 1.000 N 0.775
 551229 551230 plu3733 plu3734     FALSE 0.255 231.000 0.000 0.030   NA
 551232 551233 plu3736 plu3737     FALSE 0.026 423.000 0.000 NA   NA
 551234 551235 plu3738 plu3739   aldB FALSE 0.006 566.000 0.000 1.000 N -0.376
 551238 551239 plu3742 plu3743 tehB wzc FALSE 0.139 248.000 0.000 0.031 N -0.870
 551239 551240 plu3743 plu3744 wzc wzb TRUE 0.972 62.000 1.000 1.000 N 0.992
 551240 551241 plu3744 plu3745 wzb   TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000 N 0.998
 551243 551244 plu3747 plu3748     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   -0.467
 551244 551245 plu3748 plu3749     TRUE 0.986 10.000 0.200 NA   0.998
 551245 551246 plu3749 plu3750     FALSE 0.040 365.000 0.000 NA   -0.911
 551246 551247 plu3750 plu3751     FALSE 0.007 877.000 0.000 NA   -0.987
 551247 551248 plu3751 plu3752     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.977
 551248 551249 plu3752 plu3753     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA   0.211
 551249 551250 plu3753 plu3754     TRUE 0.950 -3.000 0.000 NA   0.173
 551250 551251 plu3754 plu3755     TRUE 0.893 19.000 0.000 NA   -0.835
 551251 551252 plu3755 plu3756     TRUE 0.996 12.000 0.526 NA   0.878
 551252 551253 plu3756 plu3757     TRUE 0.993 -13.000 0.632 1.000   -0.179
 551253 551254 plu3757 plu3758     TRUE 0.989 10.000 0.235 1.000   0.069
 551254 551255 plu3758 plu3759     TRUE 0.997 12.000 0.556 NA   0.872
 551255 551256 plu3759 plu3760     TRUE 0.991 41.000 1.000 NA   -0.203
 551256 551257 plu3760 plu3761   sctV TRUE 0.990 -3.000 0.281 NA   -0.372
 551257 551258 plu3761 plu3762 sctV sctY TRUE 0.959 -3.000 0.062 1.000   -0.368
 551258 551259 plu3762 plu3763 sctY sctX TRUE 0.974 3.000 0.087 NA   0.963
 551259 551260 plu3763 plu3764 sctX   TRUE 0.988 -3.000 0.214 NA   0.574
 551260 551261 plu3764 plu3765     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.793
 551261 551262 plu3765 plu3766   sctW TRUE 0.827 -19.000 0.000 NA   -0.690
 551263 551264 plu3767 plu3768 sctN sctO TRUE 0.956 0.000 0.000 NA   -0.513
 551264 551265 plu3768 plu3769 sctO sctP TRUE 0.937 12.000 0.000 NA   -0.667
 551265 551266 plu3769 plu3770 sctP sctQ TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.004   0.683
 551266 551267 plu3770 plu3771 sctQ sctR TRUE 0.999 -3.000 0.529 1.000 Y 0.441
 551267 551268 plu3771 plu3772 sctR sctS TRUE 0.999 3.000 0.300 0.007 Y -0.573
 551268 551269 plu3772 plu3773 sctS sctT TRUE 0.995 -3.000 0.097 0.048 Y -0.615
 551269 551270 plu3773 plu3774 sctT sctU TRUE 0.999 -3.000 0.548 0.048 Y -0.170
 551270 551271 plu3774 plu3775 sctU   FALSE 0.004 900.000 0.000 1.000 N 0.968
 551271 551272 plu3775 plu3776     TRUE 0.917 115.000 0.615 NA   0.875
 551272 551273 plu3776 plu3777   sctB TRUE 0.996 15.000 0.583 NA   0.661
 551273 551274 plu3777 plu3778 sctB sctC TRUE 0.998 -3.000 0.750 1.000   0.840
 551274 551275 plu3778 plu3779 sctC sctD TRUE 0.988 -3.000 0.220 NA   0.717
 551275 551276 plu3779 plu3780 sctD sctE TRUE 0.992 0.000 0.268 NA   -0.761
 551276 551277 plu3780 plu3781 sctE sctF TRUE 0.993 -16.000 0.417 0.006   -0.080
 551277 551278 plu3781 plu3782 sctF sctG TRUE 0.999 3.000 0.556 0.006   0.152
 551278 551279 plu3782 plu3783 sctG sctH TRUE 0.999 -7.000 0.900 0.006   -0.680
 551279 551280 plu3783 plu3784 sctH sctI TRUE 0.928 76.000 0.333 0.006   -0.791
 551280 551281 plu3784 plu3785 sctI sctJ TRUE 0.997 7.000 0.333 0.007   -0.237
 551281 551282 plu3785 plu3786 sctJ sctK TRUE 0.999 0.000 0.800 1.000   0.836
 551282 551283 plu3786 plu3787 sctK sctL TRUE 0.993 -21.000 0.727 1.000   -0.043
 551283 551284 plu3787 plu3788 sctL   FALSE 0.244 155.000 0.000 1.000   0.115
 551284 551285 plu3788 plu3789     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.006   0.301
 551286 551287 plu3790 plu3791 cspI   FALSE 0.023 451.000 0.000 NA   NA
 551291 551292 plu3795 plu3796     FALSE 0.012 647.000 0.000 NA   0.037
 551293 551294 plu3797 plu3798     FALSE 0.140 225.000 0.000 NA   0.847
 551294 551295 plu3798 plu3799   atoD TRUE 0.951 -3.000 0.000 1.000   -0.338
 551295 551296 plu3799 plu3800 atoD atoA TRUE 0.997 3.000 0.000 0.001 Y 0.953
 551296 551297 plu3800 plu3801 atoA   FALSE 0.011 844.000 0.000 1.000   0.820
 551297 551298 plu3801 plu3802     TRUE 0.946 13.000 0.000 1.000   0.550
 551298 551299 plu3802 plu3803     FALSE 0.031 430.000 0.000 NA   0.448
 551301 551302 plu3805 plu3806 ppiB lpxH TRUE 0.988 11.000 0.237 1.000   -0.782
 551302 551303 plu3806 plu3807 lpxH purE FALSE 0.187 148.000 0.016 1.000   -0.698
 551303 551304 plu3807 plu3808 purE purK TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.000 Y -0.767
 551305 551306 plu3809 plu3810     FALSE 0.043 353.000 0.000 NA   NA
 551306 551307 plu3810 plu3811     FALSE 0.241 137.000 0.000 NA   NA
 551307 551308 plu3811 plu3812     FALSE 0.010 702.000 0.000 NA   NA
 551309 551310 plu3813 plu3814     TRUE 0.829 56.000 0.286 NA N 0.946
 551310 551311 plu3814 plu3815     TRUE 0.782 61.000 0.250 NA N 0.909
 551312 551313 plu3816 plu3817 ybbP ybbA TRUE 0.999 -3.000 0.535 1.000 Y 0.634
 551314 551315 plu3818 plu3819 tesA   TRUE 0.703 51.000 0.072 1.000   0.898
 551315 551316 plu3819 plu3820     TRUE 0.664 69.000 0.118 1.000   0.882
 551316 551317 plu3820 plu3821     TRUE 0.971 25.000 0.075 1.000 Y 0.958
 551317 551318 plu3821 plu3822     TRUE 0.987 3.000 0.023 NA Y -0.145
 551322 551323 plu3826 plu3827     FALSE 0.116 201.000 0.022 NA   0.048
 551325 551326 plu3829 plu3830 fsr   FALSE 0.165 242.000 0.000 0.048 N 0.901
 551326 551327 plu3830 plu3831     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   -0.803
 551328 551329 plu3832 plu3833   gsk FALSE 0.003 1150.000 0.000 1.000 N -0.018
 551329 551330 plu3833 plu3834 gsk fepE TRUE 0.654 99.000 0.238 1.000 N -0.074
 551330 551331 plu3834 plu3835 fepE hemH TRUE 0.759 184.000 0.667 1.000 N -0.594
 551331 551332 plu3835 plu3836 hemH adk FALSE 0.054 177.000 0.021 1.000 N 0.078
 551332 551333 plu3836 plu3837 adk htpG FALSE 0.191 183.000 0.035 0.061 N -0.453
 551335 551336 plu3839 plu3840 recR   TRUE 0.998 0.000 0.604 NA   0.870
 551336 551337 plu3840 plu3841   dnaX TRUE 0.925 57.000 0.411 NA   0.460
 551337 551338 plu3841 plu3842 dnaX apt FALSE 0.301 97.000 0.088 1.000 N -0.877
 551339 551340 plu3843 plu3844 priC   TRUE 0.988 23.000 0.474 NA   NA
 551343 551344 plu3847 plu3848     TRUE 0.900 41.000 0.211 NA   -0.841
 551344 551345 plu3848 plu3849     TRUE 0.999 -3.000 0.729 1.000 Y 0.967
 551345 551346 plu3849 plu3850   acrR FALSE 0.016 414.000 0.000 1.000 N 0.490
 551347 551348 plu3851 plu3852 acrA acrB TRUE 0.977 28.000 0.500 1.000 N 0.209
 551348 551349 plu3852 plu3853 acrB hha FALSE 0.007 1055.000 0.000 NA   -0.045
 551352 551353 plu3856 plu3857 amtB glnK TRUE 0.906 -13.000 0.156 1.000 N -0.754
 551353 551354 plu3857 plu3858 glnK mdlB FALSE 0.051 181.000 0.028 1.000 N -0.571
 551354 551355 plu3858 plu3859 mdlB mdlA TRUE 1.000 -7.000 0.911 0.006 Y 0.979
 551355 551356 plu3859 plu3860 mdlA   TRUE 0.546 87.000 0.179 1.000 N -0.950
 551357 551358 plu3861 plu3862     TRUE 0.727 33.000 0.016 1.000   -0.611
 551359 551360 plu3863 plu3864     FALSE 0.241 154.000 0.027 1.000   0.927
 551360 551361 plu3864 plu3865   ppiD FALSE 0.259 151.000 0.033 1.000   0.923
 551361 551362 plu3865 plu3866 ppiD hupB FALSE 0.013 294.000 0.011 1.000 N -0.493
 551362 551363 plu3866 plu3867 hupB lon FALSE 0.054 229.000 0.000 1.000 N 0.166
 551363 551364 plu3867 plu3868 lon clpX TRUE 0.767 209.000 0.201 0.061 Y 0.139
 551364 551365 plu3868 plu3869 clpX clpP TRUE 0.903 137.000 0.352 1.000 Y 0.465
 551365 551366 plu3869 plu3870 clpP tig TRUE 0.700 274.000 0.351 1.000 Y 0.442
 551366 551367 plu3870 plu3871 tig bolA FALSE 0.020 379.000 0.000 NA N 0.833
 551368 551369 plu3872 plu3873   ampG TRUE 0.820 54.000 0.256 NA N 0.830
 551369 551370 plu3873 plu3874 ampG   FALSE 0.107 251.000 0.000 NA   0.616
 551370 551371 plu3874 plu3875   cyoA FALSE 0.054 350.000 0.000 NA   0.526
 551371 551372 plu3875 plu3876 cyoA cyoB TRUE 0.999 5.000 0.204 0.002 Y 0.702
 551372 551373 plu3876 plu3877 cyoB cyoC TRUE 0.999 -10.000 0.697 0.026 Y 0.452
 551373 551374 plu3877 plu3878 cyoC cyoD TRUE 0.999 0.000 0.485 0.026 Y -0.593
 551374 551375 plu3878 plu3879 cyoD cyoE TRUE 0.975 13.000 0.118 0.048 N 0.428
 551375 551376 plu3879 plu3880 cyoE   FALSE 0.327 155.000 0.061 0.048 N 0.054
 551378 551379 plu3882 plu3883 apbA   TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA   0.265
 551381 551382 plu3885 plu3886 xseB ispA TRUE 0.902 5.000 0.035 1.000 N 0.741
 551382 551383 plu3886 plu3887 ispA dxs TRUE 0.845 63.000 0.060 1.000 Y 0.938
 551383 551384 plu3887 plu3888 dxs   FALSE 0.036 376.000 0.000 NA   NA
 551384 551385 plu3888 plu3889     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA   NA
 551385 551386 plu3889 plu3890     TRUE 0.996 -3.000 0.483 1.000   0.976
 551386 551387 plu3890 plu3891     FALSE 0.375 111.000 0.000 NA   0.695
 551387 551388 plu3891 plu3892     TRUE 0.950 6.000 0.000 NA   -0.521
 551389 551390 plu3893 plu3894     TRUE 0.544 62.000 0.000 NA   0.972
 551390 551391 plu3894 plu3895   pgpA FALSE 0.037 280.000 0.000 NA N 0.635
 551391 551392 plu3895 plu3896 pgpA thiL TRUE 0.962 -7.000 0.206 1.000 N -0.067
 551392 551393 plu3896 plu3897 thiL nusB TRUE 0.611 101.000 0.225 1.000 N -0.903
 551393 551394 plu3897 plu3898 nusB ribH TRUE 0.962 27.000 0.347 1.000 N -0.252
 551394 551395 plu3898 plu3899 ribH ribD TRUE 0.839 127.000 0.034 0.001 Y 0.204
 551395 551396 plu3899 plu3900 ribD   TRUE 0.987 5.000 0.277 NA N 0.618
 551396 551397 plu3900 plu3901   secF FALSE 0.062 116.000 0.004 NA N 0.237
 551397 551398 plu3901 plu3902 secF secD TRUE 0.998 11.000 0.206 0.001 Y 0.456
 551398 551399 plu3902 plu3903 secD yajC TRUE 0.953 28.000 0.045 NA Y 0.510
 551399 551400 plu3903 plu3904 yajC tgt TRUE 0.768 92.000 0.325 NA N 0.820
 551400 551401 plu3904 plu3905 tgt queA TRUE 0.960 151.000 0.360 0.000 Y 0.908
 551402 551403 plu3906 plu3907   ahpC FALSE 0.074 285.000 0.014 1.000   0.808
 551403 551404 plu3907 plu3908 ahpC ggt FALSE 0.064 220.000 0.000 1.000 N 0.506
 551405 551406 plu3909 plu3910 brnQ phoR FALSE 0.026 351.000 0.000 1.000 N 0.703
 551406 551407 plu3910 plu3911 phoR phoB TRUE 0.998 24.000 0.453 0.006 Y 0.969
 551408 551409 plu3912 plu3913 sbcD sbcC TRUE 1.000 -3.000 0.669 0.002 Y 0.933
 551410 551411 plu3914 plu3915     TRUE 0.833 25.000 0.000 NA   NA
 551411 551412 plu3915 plu3916     FALSE 0.007 2258.000 0.000 NA   0.751
 551412 551413 plu3916 plu3917     TRUE 0.940 -3.000 0.014 1.000   0.411
 551413 551414 plu3917 plu3918     FALSE 0.350 97.000 0.010 NA   0.846
 551414 551415 plu3918 plu3919     FALSE 0.322 130.000 0.050 NA   0.990
 551415 551416 plu3919 plu3920     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 551416 551417 plu3920 plu3921     TRUE 0.952 2.000 0.000 NA   NA
 551417 551418 plu3921 plu3922     FALSE 0.082 258.000 0.000 NA   NA
 551418 551419 plu3922 plu3923     TRUE 0.763 33.000 0.000 NA   NA
 551419 551420 plu3923 plu3924     FALSE 0.018 546.000 0.000 NA   0.383
 551420 551421 plu3924 plu3925     TRUE 0.755 40.000 0.000 NA   0.925
 551421 551422 plu3925 plu3926     FALSE 0.025 471.000 0.000 NA   0.264
 551422 551423 plu3926 plu3927   cpdB TRUE 0.450 40.000 0.012 1.000 N 0.874
 551424 551425 plu3928 plu3929   rdgC FALSE 0.069 206.000 0.000 1.000 N 0.398
 551425 551426 plu3929 plu3930 rdgC   FALSE 0.344 120.000 0.000 1.000   0.311
 551426 551427 plu3930 plu3931     FALSE 0.148 216.000 0.000 NA   0.847
 551427 551428 plu3931 plu3932     TRUE 0.920 -10.000 0.061 NA   0.764
 551428 551429 plu3932 plu3933     FALSE 0.112 221.000 0.000 NA   -0.740
 551430 551431 plu3934 plu3935     FALSE 0.079 524.000 0.000 0.002   0.729
 551431 551432 plu3935 plu3936     FALSE 0.037 386.000 0.000 1.000   -0.982
 551433 551434 plu3937 plu3938     FALSE 0.054 334.000 0.000 NA   -0.058
 551434 551435 plu3938 plu3939     TRUE 0.986 11.000 0.200 NA   0.939
 551436 551437 plu3940 plu3941 exbD exbB TRUE 1.000 4.000 0.810 0.036 Y 0.348
 551438 551439 plu3942 plu3943 metC sohA FALSE 0.215 149.000 0.000 NA   -0.976
 551439 551440 plu3943 plu3944 sohA   TRUE 0.959 6.000 0.000 NA   0.973
 551440 551441 plu3944 plu3945     FALSE 0.278 145.000 0.000 NA   0.790
 551441 551442 plu3945 plu3946   dkgA FALSE 0.036 400.000 0.040 NA   0.588
 551443 551444 plu3947 plu3948 sufI plsC FALSE 0.053 405.000 0.154 1.000 N 0.323
 551444 551445 plu3948 plu3949 plsC parC TRUE 0.737 23.000 0.043 1.000 N 0.035
 551445 551446 plu3949 plu3950 parC parE TRUE 0.978 42.000 0.106 0.001 Y 0.481
 551446 551447 plu3950 plu3951 parE   TRUE 0.784 73.000 0.217 NA   0.927
 551447 551448 plu3951 plu3952   icc TRUE 0.825 129.000 0.427 NA   0.907
 551448 551449 plu3952 plu3953 icc nudF TRUE 0.542 100.000 0.092 1.000   0.961
 551452 551453 plu3956 plu3957     TRUE 0.998 7.000 0.632 NA   0.904
 551453 551454 plu3957 plu3958   ISPlu3H FALSE 0.076 154.000 0.000 NA N NA
 551454 551455 plu3958 plu3959 ISPlu3H   FALSE 0.014 379.000 0.000 1.000 N NA
 551455 551456 plu3959 plu3960     TRUE 0.999 3.000 0.800 NA   0.967
 551457 551458 plu3961 plu3962     TRUE 0.440 67.000 0.000 NA   NA
 551458 551459 plu3962 plu3963   ribB FALSE 0.182 195.000 0.048 1.000   0.504
 551461 551462 plu3965 plu3966     TRUE 0.998 -3.000 0.740 NA   -0.695
 551462 551463 plu3966 plu3967     TRUE 0.993 22.000 0.625 NA   -0.627
 551463 551464 plu3967 plu3968   rfaE FALSE 0.063 590.000 0.000 1.000 Y 0.007
 551464 551465 plu3968 plu3969 rfaE glnE FALSE 0.380 88.000 0.083 1.000 N 0.873
 551465 551466 plu3969 plu3970 glnE   TRUE 0.830 34.000 0.053 1.000   0.837
 551467 551468 plu3971 plu3972   cca TRUE 0.905 16.000 0.106 NA N 0.275
 551469 551470 plu3973 plu3974 bacA folB FALSE 0.186 177.000 0.128 1.000 N -0.967
 551473 551474 plu3977 plu3978 rpsU dnaG FALSE 0.236 121.000 0.067 1.000 N 0.656
 551474 551475 plu3978 plu3979 dnaG rpoD TRUE 0.505 171.000 0.299 1.000 N 0.521
 551475 551476 plu3979 plut060 rpoD tRNA-Met FALSE 0.013 589.000 0.000 NA   NA
 551478 551479 plu3981 plu3982     TRUE 0.962 48.000 0.500 NA   0.991
 551482 551483 plu3985 plu3986     FALSE 0.344 121.000 0.000 NA   0.970
 551483 551484 plu3986 plu3987     FALSE 0.316 138.000 0.000 1.000   0.905
 551488 551489 plu3991 plu3992     FALSE 0.015 417.000 0.000 1.000 N 0.479
 551490 551491 plu3993 plu3994     FALSE 0.216 195.000 0.087 NA   0.194
 551491 551492 plu3994 plu3995     TRUE 0.988 2.000 0.185 NA   0.796
 551492 551493 plu3995 plu3996     TRUE 0.975 -7.000 0.185 NA   0.992
 551493 551494 plu3996 plu3997     FALSE 0.270 220.000 0.161 NA   -0.362
 551496 551497 plu3999 plu4000     FALSE 0.316 111.000 0.000 NA   NA
 551499 551500 plu4002 plu4003     TRUE 0.715 77.000 0.172 NA   0.810
 551500 551501 plu4003 plu4004     TRUE 0.930 25.000 0.187 1.000 N 0.915
 551501 551502 plu4004 plu4005     TRUE 0.997 11.000 0.613 NA   0.786
 551503 551504 plu4006 plu4007 mtgA elbB TRUE 0.963 5.000 0.066 NA   0.043
 551504 551505 plu4007 plu4008 elbB arcB FALSE 0.057 238.000 0.000 NA N 0.903
 551506 551507 plu4009 plu4010 gltB gltD TRUE 0.997 10.000 0.096 0.000 Y 0.720
 551507 551508 plu4010 plu4011 gltD   FALSE 0.100 239.000 0.000 NA   -0.698
 551509 551510 plu4012 plu4013 sspB sspA TRUE 0.999 4.000 0.831 NA   0.955
 551510 551511 plu4013 plu4014 sspA rpsI FALSE 0.014 347.000 0.014 NA N 0.880
 551511 551512 plu4014 plu4015 rpsI rplM TRUE 0.999 16.000 0.601 0.009 Y -0.353
 551512 551513 plu4015 plu4016 rplM   FALSE 0.054 255.000 0.003 NA   -0.750
 551514 551515 plu4017 plu4018   degQ FALSE 0.236 238.000 0.154 NA   -0.279
 551516 551517 plu4019 plu4020     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 551518 551519 plu4021 plu4022   degS FALSE 0.007 862.000 0.000 NA   NA
 551519 551520 plu4022 plu4023 degS   FALSE 0.012 616.000 0.000 NA   NA
 551520 551521 plu4023 plu4024     TRUE 0.499 58.000 0.000 NA   NA
 551521 551522 plu4024 plu4025     TRUE 0.955 9.000 0.000 NA   0.543
 551522 551523 plu4025 plu4026     FALSE 0.232 167.000 0.000 NA   0.928
 551523 551524 plu4026 plu4027     TRUE 0.409 104.000 0.000 NA   0.799
 551525 551526 plu4028 plu4029 murA   TRUE 0.830 52.000 0.258 NA N 0.932
 551526 551527 plu4029 plu4030     FALSE 0.316 399.000 0.453 NA   0.964
 551527 551528 plu4030 plu4031     TRUE 0.994 2.000 0.308 NA   0.988
 551528 551529 plu4031 plu4032     TRUE 0.929 34.000 0.188 NA   0.992
 551529 551530 plu4032 plu4033     TRUE 0.997 5.000 0.562 NA   0.990
 551530 551531 plu4033 plu4034     TRUE 0.999 11.000 0.530 NA Y 0.927
 551532 551533 plu4035 plu4036     TRUE 0.947 25.000 0.226 1.000 N 0.779
 551533 551534 plu4036 plu4037     TRUE 0.994 18.000 0.598 1.000   -0.988
 551534 551535 plu4037 plu4038     TRUE 0.995 21.000 0.617 NA   0.954
 551535 551536 plu4038 plu4039     TRUE 0.985 -19.000 0.459 NA   0.978
 551536 551537 plu4039 plu4040   yhbG TRUE 0.997 7.000 0.543 NA   0.803
 551537 551538 plu4040 plu4041 yhbG rpoN TRUE 0.938 28.000 0.163 1.000   0.880
 551538 551539 plu4041 plu4042 rpoN   TRUE 0.993 24.000 0.820 NA N 0.369
 551539 551540 plu4042 plu4043   ptsN TRUE 0.887 124.000 0.728 NA N 0.170
 551540 551541 plu4043 plu4044 ptsN   TRUE 0.726 84.000 0.186 NA   0.752
 551541 551542 plu4044 plu4045   ptsO TRUE 0.988 0.000 0.182 NA   0.795
 551542 551543 plu4045 plu4046 ptsO rnk FALSE 0.072 189.000 0.026 1.000 N 0.934
 551545 551546 plu4048 plu4049     TRUE 0.948 5.000 0.000 NA   NA
 551547 551548 plu4050 plu4051     TRUE 0.997 0.000 0.588 NA   NA
 551548 551549 plu4051 plu4052     TRUE 0.949 -10.000 0.147 NA   NA
 551549 551550 plu4052 plu4053     TRUE 0.790 -37.000 0.000 NA   NA
 551550 551551 plu4053 plu4054     TRUE 0.948 5.000 0.000 NA   NA
 551551 551552 plu4054 plu4055     TRUE 0.671 42.000 0.000 NA   NA
 551552 551553 plu4055 plu4056     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 551553 551554 plu4056 plu4057     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 551554 551555 plu4057 plu4058     TRUE 0.952 95.000 0.738 NA   0.422
 551555 551556 plu4058 plu4059     FALSE 0.372 112.000 0.000 NA   0.985
 551556 551557 plu4059 plu4060   pmbA FALSE 0.132 202.000 0.000 NA   -0.810
 551559 551560 plu4062 plu4063     TRUE 0.994 5.000 0.329 NA   0.614
 551560 551561 plu4063 plu4064   tldD TRUE 0.648 43.000 0.011 NA   0.810
 551561 551562 plu4064 plu4065 tldD   TRUE 0.992 6.000 0.259 NA   0.928
 551562 551563 plu4065 plu4066     TRUE 0.994 -3.000 0.358 NA   0.777
 551563 551564 plu4066 plu4067   cafA TRUE 0.923 48.000 0.296 NA   0.824
 551564 551565 plu4067 plu4068 cafA   TRUE 0.993 -3.000 0.417 NA N 0.854
 551565 551566 plu4068 plu4069   mreD TRUE 0.389 166.000 0.206 NA N 0.959
 551566 551567 plu4069 plu4070 mreD mreC TRUE 1.000 0.000 0.550 0.001 Y 0.931
 551567 551568 plu4070 plu4071 mreC mreB TRUE 0.901 112.000 0.689 1.000 N -0.130
 551569 551570 plu4072 plu4073   aroQ FALSE 0.054 210.000 0.000 1.000 N -0.538
 551570 551571 plu4073 plu4074 aroQ accB TRUE 0.929 30.000 0.254 1.000 N -0.486
 551571 551572 plu4074 plu4075 accB accC TRUE 0.999 13.000 0.275 0.001 Y 0.849
 551573 551574 plu4076 plu4077 ISPlu8B   FALSE 0.006 1067.000 0.000 NA   NA
 551574 551575 plu4077 plu4078     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   -0.713
 551575 551576 plu4078 plu4079     TRUE 0.964 0.000 0.120 NA N 0.884
 551576 551577 plu4079 plu4080     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.993
 551577 551578 plu4080 plu4081     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA   0.498
 551578 551579 plu4081 plu4082   ISPlu4B TRUE 0.951 6.000 0.000 1.000   NA
 551579 551580 plu4082 plu4083 ISPlu4B   FALSE 0.348 108.000 0.000 1.000   NA
 551580 551581 plu4083 plu4084     TRUE 0.705 39.000 0.038 1.000   NA
 551582 551583 plu4085 plu4086   panF TRUE 0.996 -10.000 0.682 NA   0.697
 551583 551584 plu4086 plu4087 panF prmA TRUE 0.517 43.000 0.041 1.000 N 0.728
 551584 551585 plu4087 plu4088 prmA   FALSE 0.277 284.000 0.042 1.000 Y 0.271
 551585 551586 plu4088 plu4089   fis TRUE 0.890 26.000 0.161 1.000 N -0.297
 551589 551590 plu4092 plu4093     TRUE 0.784 30.000 0.000 NA   -0.971
 551590 551591 plu4093 plu4094   livF FALSE 0.008 1103.000 0.000 NA   0.935
 551591 551592 plu4094 plu4095 livF livG TRUE 1.000 3.000 0.967 0.009 Y 0.975
 551592 551593 plu4095 plu4096 livG livM TRUE 0.999 -3.000 0.574 1.000 Y 0.841
 551593 551594 plu4096 plu4097 livM livH TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.027 Y 0.740
 551594 551595 plu4097 plu4098 livH livK TRUE 0.937 62.000 0.217 1.000 Y 0.806
 551597 551598 plu4100 plu4101 garK rpoH FALSE 0.083 97.000 0.005 1.000 N -0.413
 551598 551599 plu4101 plu4102 rpoH ftsX FALSE 0.014 437.000 0.051 1.000 N 0.167
 551599 551600 plu4102 plu4103 ftsX ftsE TRUE 0.987 -7.000 0.121 1.000 Y -0.358
 551600 551601 plu4103 plu4104 ftsE ftsY TRUE 0.981 7.000 0.117 0.060 N 0.683
 551602 551603 plu4105 plu4106     TRUE 0.900 24.000 0.063 NA   0.926
 551603 551604 plu4106 plu4107     FALSE 0.089 271.000 0.000 NA   0.296
 551604 551605 plu4107 plu4108   zntA TRUE 0.822 145.000 0.325 0.047   0.297
 551607 551608 plu4110 plu4111   ISPlu11B FALSE 0.064 297.000 0.000 NA   NA
 551609 551610 plu4112 plu4113 fucR   FALSE 0.054 357.000 0.000 NA   0.697
 551610 551611 plu4113 plu4114     FALSE 0.246 134.000 0.000 NA   NA
 551613 551614 plu4116 plu4117     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.856
 551614 551615 plu4117 plu4118     FALSE 0.025 427.000 0.000 NA   -0.982
 551616 551617 plu4119 plu4120 glpT glpQ TRUE 0.552 180.000 0.396 1.000 N -0.724
 551618 551619 plu4121 plu4122 genX   FALSE 0.020 532.000 0.000 NA   0.469
 551619 551620 plu4122 plu4123   ISPlu3G FALSE 0.054 318.000 0.000 NA   NA
 551621 551622 plu4124 plu4125 frdA frdB TRUE 0.999 -7.000 0.470 0.002 Y 0.891
 551622 551623 plu4125 plu4126 frdB frdC TRUE 0.999 17.000 0.454 0.002 Y -0.940
 551623 551624 plu4126 plu4127 frdC frdD TRUE 1.000 17.000 0.787 0.002 Y 0.935
 551624 551625 plu4127 plu4128 frdD ISPlu6D FALSE 0.138 203.000 0.000 1.000   NA
 551626 551627 plu4129 plu4130 sugE efp FALSE 0.052 226.000 0.000 1.000 N -0.189
 551629 551630 plu4132 plu4133     FALSE 0.011 784.000 0.000 NA   0.872
 551630 551631 plu4133 plu4134   groEL FALSE 0.005 647.000 0.000 1.000 N -0.124
 551631 551632 plu4134 plu4135 groEL groES TRUE 0.996 50.000 0.631 0.004 Y 0.845
 551632 551633 plu4135 plu4136 groES fxsA FALSE 0.172 198.000 0.040 1.000   0.753
 551634 551635 plu4137 plu4138 aspA dcuA FALSE 0.285 141.000 0.000 1.000   0.398
 551635 551636 plu4138 plu4139 dcuA dsbD FALSE 0.196 185.000 0.000 1.000   0.633
 551636 551637 plu4139 plu4140 dsbD   TRUE 0.987 -3.000 0.217 1.000   -0.624
 551637 551638 plu4140 plut061   tRNA-Phe FALSE 0.261 129.000 0.000 NA   NA
 551639 551640 plu4141 plu4142   mcf TRUE 0.748 40.000 0.000 NA   0.732
 551640 551641 plu4142 plu4143 mcf   FALSE 0.008 879.000 0.000 NA   -0.443
 551641 551642 plu4143 plu4144     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA   0.207
 551642 551643 plu4144 plu4145     TRUE 0.964 2.000 0.000 NA   0.915
 551643 551644 plu4145 plu4146     TRUE 0.958 9.000 0.000 NA   0.855
 551644 551645 plu4146 plu4147     TRUE 0.785 30.000 0.000 NA   NA
 551645 551646 plu4147 plu4148     TRUE 0.919 -4.000 0.000 NA   NA
 551646 551647 plu4148 plu4149     TRUE 0.916 19.000 0.000 NA   0.801
 551653 551654 plu4155 plu4156   ISPlu2C FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 551654 551655 plu4156 plu4157 ISPlu2C   TRUE 0.429 69.000 0.000 NA   NA
 551656 551657 plu4158 plu4159 ISPlu2B   TRUE 0.413 72.000 0.000 NA   NA
 551658 551659 plu4160 plu4161     TRUE 0.900 61.000 0.373 NA   0.020
 551661 551662 plu4163 plu4164   ISplu12A TRUE 0.789 64.000 0.000 NA Y NA
 551662 551663 plu4164 plu4165 ISplu12A   TRUE 0.917 -6.000 0.000 NA   NA
 551665 551666 plu4167 plu4168 tccC1 tccB1 FALSE 0.288 134.000 0.000 NA   0.456
 551666 551667 plu4168 plu4169 tccB1 tccA1 TRUE 0.437 95.000 0.000 NA   0.750
 551667 551668 plu4169 plu4170 tccA1   FALSE 0.025 428.000 0.000 NA   NA
 551668 551669 plu4170 plu4171     FALSE 0.324 109.000 0.000 NA   NA
 551669 551670 plu4171 plu4172     FALSE 0.377 92.000 0.000 NA   NA
 551670 551671 plu4172 plu4173     FALSE 0.320 110.000 0.000 NA   NA
 551671 551672 plu4173 plu4174     FALSE 0.328 108.000 0.000 NA   NA
 551672 551673 plu4174 plu4175     FALSE 0.324 109.000 0.000 NA   NA
 551673 551674 plu4175 plu4176     FALSE 0.324 109.000 0.000 NA   NA
 551674 551675 plu4176 plu4177     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 551675 551676 plu4177 plu4178     FALSE 0.033 401.000 0.000 1.000   NA
 551676 551677 plu4178 plu4179     TRUE 0.998 -3.000 0.545 0.038   -0.834
 551677 551678 plu4179 plu4180     TRUE 0.964 30.000 0.273 1.000   0.925
 551678 551679 plu4180 plu4181     TRUE 0.995 2.000 0.158 0.002   0.803
 551683 551684 plu4185 plu4186     FALSE 0.008 953.000 0.000 NA   -0.065
 551684 551685 plu4186 plu4187     TRUE 0.913 20.000 0.000 NA   0.922
 551685 551686 plu4187 plu4188     TRUE 0.960 0.000 0.000 NA   0.247
 551686 551687 plu4188 plu4189     TRUE 0.891 24.000 0.000 1.000   0.889
 551687 551688 plu4189 plu4190     TRUE 0.803 35.000 0.000 1.000   0.620
 551688 551689 plu4190 plu4191     TRUE 0.991 -7.000 0.000 0.015 Y 0.279
 551689 551690 plu4191 plu4192     FALSE 0.014 652.000 0.000 NA   0.928
 551690 551691 plu4192 plu4193     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   0.880
 551691 551692 plu4193 plu4194     TRUE 0.965 3.000 0.000 1.000   0.963
 551692 551693 plu4194 plu4195     FALSE 0.008 975.000 0.000 1.000   -0.345
 551693 551694 plu4195 plu4196     TRUE 0.455 91.000 0.000 NA   0.883
 551694 551695 plu4196 plu4197     FALSE 0.020 520.000 0.000 NA   0.057
 551695 551696 plu4197 plu4198     FALSE 0.171 186.000 0.000 NA   0.195
 551696 551697 plu4198 plu4199     TRUE 0.601 52.000 0.000 NA   0.473
 551697 551698 plu4199 plu4200     TRUE 0.991 4.000 0.250 NA   0.520
 551698 551699 plu4200 plu4201     TRUE 0.847 -19.000 0.000 NA   0.360
 551699 551700 plu4201 plu4202     TRUE 0.958 0.000 0.000 NA   -0.160
 551700 551701 plu4202 plu4203     TRUE 0.461 79.000 0.000 NA   0.977
 551701 551702 plu4203 plu4204     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 551702 551703 plu4204 plu4205     TRUE 0.720 38.000 0.000 NA   NA
 551703 551704 plu4205 plu4206     FALSE 0.152 211.000 0.000 NA   0.785
 551704 551705 plu4206 plu4207     TRUE 0.441 77.000 0.000 NA   0.312
 551707 551708 plu4209 plu4210     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 551708 551709 plu4210 plu4211     FALSE 0.351 101.000 0.000 NA   NA
 551709 551710 plu4211 plu4212     TRUE 0.800 -27.000 0.000 NA   NA
 551710 551711 plu4212 plu4213     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 551711 551712 plu4213 plu4214     FALSE 0.028 413.000 0.000 NA   NA
 551712 551713 plu4214 plu4215     TRUE 0.996 -7.000 0.625 NA   0.460
 551713 551714 plu4215 plu4216     TRUE 0.963 3.000 0.000 NA   0.874
 551714 551715 plu4216 plu4217     TRUE 0.835 28.000 0.000 NA   0.549
 551715 551716 plu4217 plu4218     FALSE 0.194 186.000 0.000 NA   0.869
 551716 551717 plu4218 plu4219     TRUE 0.460 78.000 0.000 NA   0.982
 551717 551718 plu4219 plu4220     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 551718 551719 plu4220 plu4221     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 551719 551720 plu4221 plu4222     TRUE 0.954 11.000 0.000 NA   0.923
 551720 551721 plu4222 plu4223     TRUE 0.954 -3.000 0.000 NA   0.666
 551721 551722 plu4223 plu4224     FALSE 0.055 249.000 0.000 1.000 N 0.746
 551722 551723 plu4224 plu4225     TRUE 0.925 17.000 0.000 NA   0.830
 551723 551724 plu4225 plu4226     TRUE 0.706 43.000 0.000 NA   0.496
 551724 551725 plu4226 plu4227     TRUE 0.920 17.000 0.000 NA   0.635
 551725 551726 plu4227 plu4228     FALSE 0.008 907.000 0.000 NA   0.155
 551726 551727 plu4228 plu4229     FALSE 0.078 280.000 0.000 NA   -0.395
 551728 551729 plu4230 plu4231     FALSE 0.035 420.000 0.000 NA   0.980
 551729 551730 plu4231 plu4232     FALSE 0.020 540.000 0.000 1.000   0.084
 551731 551732 plu4233 plu4234     FALSE 0.146 212.000 0.000 NA   0.685
 551732 551733 plu4234 plu4235     FALSE 0.151 184.000 0.000 NA   NA
 551733 551734 plu4235 plu4236     FALSE 0.386 84.000 0.000 NA   NA
 551734 551735 plu4236 plu4237     FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 551740 551741 plu4242 plu4243 ppxA ppxB TRUE 0.726 94.000 0.000 0.004   0.991
 551741 551742 plu4243 plu4244 ppxB   FALSE 0.020 486.000 0.000 NA   -0.931
 551742 551743 plu4244 plu4245     TRUE 0.693 40.000 0.000 NA   NA
 551743 551744 plu4245 plu4246     TRUE 0.634 45.000 0.000 NA   NA
 551745 551746 plu4247 plu4248   osmY FALSE 0.209 196.000 0.067 NA   0.891
 551746 551747 plu4248 plu4249 osmY prfC FALSE 0.041 387.000 0.000 NA   0.455
 551747 551748 plu4249 plu4250 prfC rimI FALSE 0.193 157.000 0.026 1.000   -0.323
 551748 551749 plu4250 plu4251 rimI holD TRUE 0.907 -31.000 0.121 1.000   0.510
 551750 551751 plu4252 plut062 rsmC tRNA-Leu FALSE 0.166 176.000 0.000 NA   NA
 551751 551752 plut062 plut063 tRNA-Leu tRNA-Leu TRUE 0.429 69.000 0.000 NA   NA
 551753 551754 plu4253 plu4254     FALSE 0.074 277.000 0.000 NA   NA
 551754 551755 plu4254 plu4255     TRUE 0.634 45.000 0.000 NA   NA
 551755 551756 plu4255 plu4256   phoA FALSE 0.027 344.000 0.000 1.000 N 0.689
 551756 551757 plu4256 plu4257 phoA   TRUE 0.687 105.000 0.013 NA Y 0.920
 551757 551758 plu4257 plu4258     FALSE 0.029 295.000 0.000 NA N 0.113
 551758 551759 plu4258 plu4259     FALSE 0.057 215.000 0.000 NA N 0.428
 551759 551760 plu4259 plu4260     FALSE 0.006 499.000 0.000 NA N -0.768
 551761 551762 plu4261 plu4262     FALSE 0.352 53.000 0.000 NA N 0.387
 551762 551763 plu4262 plu4263     TRUE 0.985 2.000 0.222 NA N 0.768
 551763 551764 plu4263 plu4264     TRUE 0.951 -3.000 0.000 1.000   -0.304
 551764 551765 plu4264 plu4265     TRUE 0.940 3.000 0.006 1.000   0.070
 551765 551766 plu4265 plu4266     TRUE 0.814 3.000 0.003 1.000 N 0.480
 551766 551767 plu4266 plu4267     TRUE 0.981 11.000 0.167 NA   0.554
 551767 551768 plu4267 plu4268     TRUE 0.973 3.000 0.083 NA   0.835
 551768 551769 plu4268 plu4269     TRUE 0.712 25.000 0.000 NA N 0.586
 551770 551771 plu4270 plu4271     TRUE 0.928 -7.000 0.000 NA   0.933
 551771 551772 plu4271 plu4272     TRUE 0.446 88.000 0.000 NA   0.987
 551772 551773 plu4272 plu4273     TRUE 0.972 71.000 0.864 NA   0.981
 551775 551776 plu4275 plu4276   ISPlu11A TRUE 0.693 40.000 0.000 NA   NA
 551776 551777 plu4276 plu4277 ISPlu11A   FALSE 0.342 103.000 0.000 NA   NA
 551777 551778 plu4277 plu4278     TRUE 0.912 16.000 0.000 NA   -0.472
 551778 551779 plu4278 plu4279     TRUE 0.438 96.000 0.000 NA   0.958
 551779 551780 plu4279 plu4280     TRUE 0.942 13.000 0.000 NA   0.574
 551780 551781 plu4280 plu4281     TRUE 0.865 25.000 0.000 NA   0.642
 551781 551782 plu4281 plu4282     FALSE 0.194 182.000 0.000 NA   0.979
 551782 551783 plu4282 plu4283     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.777
 551785 551786 plu4285 plu4286 feaB   TRUE 0.478 153.000 0.167 NA   0.995
 551786 551787 plu4286 plu4287     TRUE 0.882 65.000 0.333 NA   0.994
 551787 551788 plu4287 plu4288     FALSE 0.065 233.000 0.000 1.000 N 0.928
 551792 551793 plu4292 plu4293     FALSE 0.303 134.000 0.000 1.000   0.430
 551794 551795 plu4294 plu4295     FALSE 0.181 167.000 0.000 NA   NA
 551795 551796 plu4295 plu4296     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 551799 551800 plu4299 plu4300     FALSE 0.180 352.000 0.000 1.000 Y -0.497
 551801 551802 plu4301 plu4302     TRUE 0.999 0.000 0.939 NA   0.885
 551802 551803 plu4302 plu4303   pcp TRUE 0.991 10.000 0.300 NA   -0.771
 551803 551804 plu4303 plu4304 pcp   FALSE 0.349 87.000 0.017 1.000   -0.412
 551804 551805 plu4304 plu4305     TRUE 0.978 18.000 0.206 1.000   0.857
 551805 551806 plu4305 plu4306     TRUE 0.892 9.000 0.000 1.000 N 0.101
 551806 551807 plu4306 plu4307   rtcB FALSE 0.007 1257.000 0.000 NA   0.074
 551807 551808 plu4307 plu4308 rtcB   TRUE 0.983 6.000 0.154 NA   0.961
 551809 551810 plu4309 plu4310     FALSE 0.364 120.000 0.053 NA   0.972
 551810 551811 plu4310 plu4311     TRUE 0.936 13.000 0.045 NA   -0.116
 551811 551812 plu4311 plu4312     TRUE 0.995 1.000 0.379 NA   -0.554
 551812 551813 plu4312 plu4313     TRUE 0.574 66.000 0.071 NA   0.977
 551813 551814 plu4313 plu4314     TRUE 0.997 21.000 0.911 1.000   0.988
 551816 551817 plu4316 plu4317   folD TRUE 0.970 0.000 0.055 1.000   0.881
 551818 551819 plut064 plu4318 tRNA-Arg   TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 551819 551820 plu4318 plu4319   hsdM FALSE 0.059 325.000 0.000 NA   0.137
 551820 551821 plu4319 plu4320 hsdM hsdS TRUE 0.995 -3.000 0.072 0.054 Y 0.422
 551821 551822 plu4320 plu4321 hsdS prrC TRUE 0.964 2.000 0.000 NA   0.804
 551822 551823 plu4321 plu4322 prrC hsdR TRUE 0.815 26.000 0.017 NA   0.984
 551823 551824 plu4322 plu4323 hsdR   FALSE 0.076 405.000 0.000 0.054   NA
 551825 551826 plu4324 plu4325     FALSE 0.010 830.000 0.000 NA   0.918
 551826 551827 plu4325 plu4326     FALSE 0.175 198.000 0.000 NA   0.920
 551827 551828 plu4326 plu4327     TRUE 0.987 3.000 0.182 NA   0.735
 551828 551829 plu4327 plu4328     TRUE 0.981 3.000 0.128 NA   0.794
 551829 551830 plu4328 plu4329     FALSE 0.025 433.000 0.000 NA   NA
 551831 551832 plu4330 plu4331     TRUE 0.878 21.000 0.000 NA   NA
 551832 551833 plu4331 plu4332   adhC FALSE 0.049 329.000 0.000 NA   NA
 551833 551834 plu4332 plu4333 adhC   TRUE 0.773 123.000 0.327 1.000   0.532
 551834 551835 plu4333 plu4334     FALSE 0.007 912.000 0.000 NA   -0.621
 551835 551836 plu4334 plu4335     TRUE 0.408 73.000 0.000 NA   NA
 551836 551837 plu4335 plu4336     FALSE 0.374 93.000 0.000 NA   NA
 551837 551838 plu4336 plu4337   crtE FALSE 0.048 235.000 0.000 1.000 N -0.150
 551838 551839 plu4337 plu4338 crtE   TRUE 0.892 23.000 0.000 NA   0.891
 551841 551842 plu4340 plu4341   crtY FALSE 0.375 114.000 0.000 NA   0.945
 551842 551843 plu4341 plu4342 crtY crtI TRUE 0.990 -7.000 0.163 0.001   -0.553
 551843 551844 plu4342 plu4343 crtI crtB TRUE 0.988 -3.000 0.332 1.000 N -0.348
 551845 551846 plu4344 plu4345     TRUE 0.996 1.000 0.429 NA   0.446
 551846 551847 plu4345 plu4346     TRUE 0.910 -10.000 0.000 NA   0.896
 551847 551848 plu4346 plu4347     TRUE 0.915 -10.000 0.000 1.000   0.811
 551848 551849 plu4347 plu4348     FALSE 0.040 362.000 0.000 NA   NA
 551849 551850 plu4348 plu4349   ssb FALSE 0.039 364.000 0.000 NA   NA
 551852 551853 plu4351 plu4352     TRUE 0.791 3.000 0.008 NA N 0.453
 551854 551855 plu4353 plu4354     TRUE 0.972 40.000 0.517 NA   NA
 551856 551857 plu4355 plu4356   ISPlu10B TRUE 0.608 49.000 0.000 1.000   NA
 551857 551858 plu4356 plu4357 ISPlu10B tyrB FALSE 0.012 393.000 0.000 1.000 N NA
 551858 551859 plu4357 plu4358 tyrB alr TRUE 0.762 50.000 0.181 1.000 N 0.717
 551859 551860 plu4358 plu4359 alr dnaB TRUE 0.921 40.000 0.317 1.000 N 0.374
 551862 551863 plu4361 plu4362   ISPlu3E FALSE 0.012 617.000 0.000 NA   NA
 551863 551864 plu4362 plu4363 ISPlu3E   TRUE 0.570 50.000 0.000 NA   NA
 551864 551865 plu4363 plu4364     FALSE 0.016 581.000 0.000 NA   0.425
 551865 551866 plu4364 plu4365     FALSE 0.037 417.000 0.000 1.000   0.541
 551866 551867 plu4365 plu4366     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA   NA
 551867 551868 plu4366 plu4367     FALSE 0.050 325.000 0.000 NA   NA
 551868 551869 plu4367 plu4368     FALSE 0.134 203.000 0.000 NA   -0.644
 551869 551870 plu4368 plu4369     FALSE 0.258 155.000 0.000 NA   0.926
 551870 551871 plu4369 plu4370     TRUE 0.848 -21.000 0.000 NA   0.994
 551875 551876 plu4374 plu4375 lexA dgkA TRUE 0.395 120.000 0.141 1.000 N 0.552
 551878 551879 plu4377 plu4378 ubiA ubiC TRUE 0.990 23.000 0.248 NA Y -0.578
 551879 551880 plu4378 plu4379 ubiC pgi FALSE 0.020 314.000 0.000 NA N -0.645
 551881 551882 plu4380 plu4381 lysC dltC FALSE 0.008 978.000 0.000 1.000   -0.114
 551882 551883 plu4381 plu4382 dltC dltD TRUE 0.948 -3.000 0.036 NA   0.438
 551883 551884 plu4382 plu4383 dltD dltB TRUE 0.534 144.000 0.010 NA Y 0.404
 551884 551885 plu4383 plu4384 dltB dltA TRUE 0.992 -3.000 0.435 NA N -0.760
 551886 551887 plu4385 plu4386     TRUE 0.908 -16.000 0.105 NA   0.142
 551887 551888 plu4386 plu4387     FALSE 0.162 93.000 0.040 1.000 N -0.992
 551888 551889 plu4387 plu4388     TRUE 0.643 49.000 0.000 1.000   0.109
 551889 551890 plu4388 plu4389     TRUE 0.637 48.000 0.000 NA   0.000
 551890 551891 plu4389 plu4390     TRUE 0.909 -7.000 0.000 NA   -0.623
 551891 551892 plu4390 plu4391     FALSE 0.012 802.000 0.000 1.000   0.949
 551894 551895 plu4393 plu4394   aceK FALSE 0.026 422.000 0.000 NA   -0.948
 551895 551896 plu4394 plu4395 aceK aceA TRUE 0.923 52.000 0.455 1.000 N 0.908
 551896 551897 plu4395 plu4396 aceA aceB TRUE 0.806 97.000 0.118 1.000 Y -0.882
 551897 551898 plu4396 plu4397 aceB metA FALSE 0.037 300.000 0.000 1.000 N 0.607
 551898 551899 plu4397 plur013 metA 5s_rRNA FALSE 0.007 964.000 0.000 NA   NA
 551899 551900 plur013 plur014 5s_rRNA 23s_rRNA FALSE 0.287 120.000 0.000 NA   NA
 551900 551901 plur014 plut065 23s_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 551901 551902 plut065 plut066 tRNA-Ala tRNA-Ile FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 551902 551903 plut066 plur015 tRNA-Ile 16s_rRNA TRUE 0.429 69.000 0.000 NA   NA
 551903 551904 plur015 plu4398 16s_rRNA hemG FALSE 0.034 386.000 0.000 NA   NA
 551904 551905 plu4398 plu4399 hemG trkH TRUE 0.979 24.000 0.455 1.000 N -0.494
 551905 551906 plu4399 plu4400 trkH   TRUE 0.928 38.000 0.202 1.000   0.800
 551906 551907 plu4400 plu4401   pepQ TRUE 0.983 0.000 0.127 1.000   0.929
 551908 551909 plu4402 plu4403 fadB fadA TRUE 0.999 12.000 0.607 1.000 Y -0.819
 551910 551911 plu4404 plu4405 fre ubiD TRUE 0.990 11.000 0.090 NA Y 0.650
 551913 551914 plu4407 plu4408 hemB tatC FALSE 0.107 110.000 0.021 NA N 0.207
 551914 551915 plu4408 plu4409 tatC tatB TRUE 0.994 22.000 0.333 NA Y 0.676
 551915 551916 plu4409 plu4410 tatB tatA TRUE 0.996 4.000 0.188 1.000 Y 0.976
 551916 551917 plu4410 plu4411 tatA ubiB FALSE 0.126 227.000 0.032 1.000   0.716
 551917 551918 plu4411 plu4412 ubiB   TRUE 0.989 -13.000 0.432 1.000   0.948
 551918 551919 plu4412 plu4413   ubiE TRUE 0.967 17.000 0.145 1.000   0.859
 551919 551920 plu4413 plu4414 ubiE rmuC TRUE 0.474 73.000 0.047 NA   0.617
 551920 551921 plu4414 plu4415 rmuC   TRUE 0.565 106.000 0.125 NA   0.956
 551921 551922 plu4415 plu4416     TRUE 0.391 199.000 0.207 NA   -0.719
 551922 551923 plu4416 plu4417   udp FALSE 0.163 95.000 0.030 NA N 0.326
 551925 551926 plu4419 plu4420   metE FALSE 0.042 243.000 0.000 1.000 N -0.581
 551928 551929 plu4422 plu4423     FALSE 0.086 273.000 0.000 1.000   -0.544
 551929 551930 plu4423 plu4424     FALSE 0.120 358.000 0.000 0.026   -0.742
 551930 551931 plu4424 plu4425     TRUE 0.624 109.000 0.000 0.045   0.922
 551932 551933 plu4426 plu4427     FALSE 0.019 494.000 0.000 NA   NA
 551933 551934 plu4427 plu4428     FALSE 0.203 155.000 0.000 NA   NA
 551934 551935 plu4428 plu4429     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 551936 551937 plu4430 plu4431     TRUE 0.803 -70.000 0.000 NA   0.273
 551937 551938 plu4431 plu4432     TRUE 0.395 93.000 0.000 NA   -0.376
 551938 551939 plu4432 plu4433     TRUE 0.788 -88.000 0.000 NA   -0.186
 551940 551941 plu4434 plu4435     TRUE 0.811 27.000 0.000 NA   NA
 551942 551943 plu4436 plu4437     TRUE 0.741 39.000 0.000 NA   0.209
 551943 551944 plu4437 plu4438   ISPlu3D FALSE 0.045 342.000 0.000 NA   NA
 551944 551945 plu4438 plu4439 ISPlu3D   FALSE 0.015 546.000 0.000 NA   NA
 551945 551946 plu4439 plu4440     FALSE 0.008 775.000 0.000 NA   NA
 551946 551947 plu4440 plu4441     FALSE 0.280 203.000 0.000 0.054   NA
 551947 551948 plu4441 plu4442   ISPlu10A FALSE 0.145 306.000 0.000 0.054   NA
 551948 551949 plu4442 plu4443 ISPlu10A   FALSE 0.024 436.000 0.000 NA   NA
 551950 551951 plu4444 plu4445 fecI fecR TRUE 0.989 2.000 0.308 NA N -0.114
 551951 551952 plu4445 plu4446 fecR fecA TRUE 0.916 85.000 0.267 NA Y -0.677
 551952 551953 plu4446 plu4447 fecA fecB TRUE 0.930 60.000 0.211 1.000 Y -0.529
 551953 551954 plu4447 plu4448 fecB fecC TRUE 1.000 -3.000 0.864 1.000 Y -0.403
 551954 551955 plu4448 plu4449 fecC fecD TRUE 0.999 -3.000 0.340 0.026 Y 0.802
 551955 551956 plu4449 plu4450 fecD fecE TRUE 0.998 1.000 0.380 1.000 Y 0.982
 551956 551957 plu4450 plu4451 fecE   FALSE 0.021 526.000 0.000 1.000   0.150
 551957 551958 plu4451 plu4452     FALSE 0.244 168.000 0.000 1.000   0.842
 551958 551959 plu4452 plu4453     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y 0.942
 551959 551960 plu4453 plu4454     FALSE 0.022 516.000 0.000 NA   0.638
 551960 551961 plu4454 plu4455     FALSE 0.020 486.000 0.000 NA   NA
 551963 551964 plu4457 plu4458     TRUE 0.979 23.000 0.286 1.000   0.852
 551965 551966 plu4459 plu4460     FALSE 0.077 414.000 0.000 0.054   -0.269
 551966 551967 plu4460 plu4461     FALSE 0.021 497.000 0.000 NA   0.055
 551967 551968 plu4461 plu4462     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   -0.600
 551968 551969 plu4462 plu4463     TRUE 0.594 50.000 0.000 NA   -0.326
 551969 551970 plu4463 plu4464     TRUE 0.910 -10.000 0.000 NA   0.910
 551970 551971 plu4464 plu4465     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   NA
 551971 551972 plu4465 plu4466     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 551972 551973 plu4466 plu4467     TRUE 0.993 -16.000 0.636 NA   0.978
 551973 551974 plu4467 plu4468     TRUE 0.394 103.000 0.000 NA   0.517
 551975 551976 plu4469 plu4470     TRUE 0.993 3.000 0.333 NA   NA
 551976 551977 plu4470 plu4471     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   0.680
 551977 551978 plu4471 plu4472     FALSE 0.016 535.000 0.000 NA   NA
 551979 551980 plu4473 plu4474     TRUE 0.799 -28.000 0.000 NA   NA
 551982 551983 plu4476 plu4477     TRUE 0.634 51.000 0.000 NA   0.909
 551983 551984 plu4477 plut067   tRNA-Leu FALSE 0.111 219.000 0.000 NA   NA
 551986 551987 plu4479 plu4480     TRUE 0.999 0.000 0.631 0.045   -0.838
 551988 551989 plu4481 plu4482 pepA holC TRUE 0.896 64.000 0.494 1.000 N 0.324
 551989 551990 plu4482 plu4483 holC valS TRUE 0.909 14.000 0.089 1.000 N -0.230
 551990 551991 plu4483 plu4484 valS   FALSE 0.011 437.000 0.000 1.000 N -0.309
 551991 551992 plu4484 plu4485     TRUE 0.810 396.000 0.594 0.026 Y 0.907
 551992 551993 plu4485 plu4486     TRUE 0.995 -22.000 0.481 1.000 Y 0.954
 551993 551994 plu4486 plu4487     TRUE 0.787 88.000 0.056 1.000 Y 0.781
 551994 551995 plu4487 plu4488   tccC7 FALSE 0.087 357.000 0.000 0.026 N 0.848
 551997 551998 plu4490 plu4491 argI   TRUE 0.948 5.000 0.000 NA   NA
 551998 551999 plu4491 plu4492   pyrB TRUE 0.413 72.000 0.000 NA   NA
 551999 552000 plu4492 plu4493 pyrB   FALSE 0.009 828.000 0.000 NA   0.073
 552000 552001 plu4493 plu4494   ISPlu9A TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 552002 552003 plu4495 plu4496     FALSE 0.034 417.000 0.000 NA   0.503
 552004 552005 plu4497 plu4498 pyrI   FALSE 0.098 218.000 0.084 NA N 0.685
 552005 552006 plu4498 plu4499   nrdD FALSE 0.030 251.000 0.000 NA N -0.928
 552006 552007 plu4499 plu4500 nrdD nrdG TRUE 0.985 20.000 0.464 1.000 N -0.584
 552008 552009 plu4501 plu4502     FALSE 0.304 124.000 0.032 NA   0.963
 552011 552012 plu4504 plu4505     TRUE 0.912 50.000 0.295 NA   0.841
 552013 552014 plu4506 plu4507     TRUE 0.895 21.000 0.000 1.000   -0.392
 552014 552015 plu4507 plu4508     FALSE 0.105 145.000 0.000 1.000 N -0.750
 552015 552016 plu4508 plu4509     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   0.967
 552016 552017 plu4509 plu4510     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.983
 552017 552018 plu4510 plu4511     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y -0.918
 552018 552019 plu4511 plu4512     TRUE 0.894 -10.000 0.000 NA   -0.029
 552020 552021 plu4513 plu4514     FALSE 0.085 285.000 0.000 NA   0.523
 552021 552022 plu4514 plu4515     TRUE 0.974 0.000 0.086 NA   0.750
 552022 552023 plu4515 plu4516     TRUE 0.999 8.000 0.538 NA Y 0.988
 552025 552026 plu4518 plu4519 ISPlu7A_orfB ISPlu7A_orfA TRUE 0.986 -3.000 0.000 NA Y NA
 552027 552028 plu4520 plu4521     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA   0.465
 552028 552029 plu4521 plu4522   cstA TRUE 0.490 171.000 0.031 1.000 Y -0.008
 552030 552031 plu4523 plu4524 deaD nlpI FALSE 0.246 172.000 0.053 1.000   0.911
 552031 552032 plu4524 plu4525 nlpI pnp FALSE 0.127 248.000 0.071 1.000   -0.580
 552032 552033 plu4525 plu4526 pnp rpsO TRUE 0.747 246.000 0.335 1.000 Y 0.824
 552033 552034 plu4526 plu4527 rpsO truB TRUE 0.842 123.000 0.211 1.000 Y -0.719
 552034 552035 plu4527 plu4528 truB rbfA TRUE 0.998 0.000 0.318 1.000 Y 0.526
 552035 552036 plu4528 plu4529 rbfA infB TRUE 0.977 66.000 0.530 1.000 Y 0.407
 552036 552037 plu4529 plu4530 infB nusA TRUE 0.967 25.000 0.342 1.000 N 0.007
 552037 552038 plu4530 plu4531 nusA   TRUE 0.996 22.000 0.759 NA   0.807
 552038 552039 plu4531 plut068   tRNA-Met FALSE 0.117 212.000 0.000 NA   NA
 552039 552040 plut068 plut069 tRNA-Met tRNA-Leu TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 552040 552041 plut069 plu4532 tRNA-Leu secG TRUE 0.507 57.000 0.000 NA   NA
 552041 552042 plu4532 plu4533 secG mrsA FALSE 0.056 177.000 0.016 1.000 N 0.444
 552042 552043 plu4533 plu4534 mrsA folP TRUE 0.986 -3.000 0.260 1.000 N 0.735
 552043 552044 plu4534 plu4535 folP ftsH TRUE 0.788 83.000 0.325 1.000 N 0.885
 552044 552045 plu4535 plu4536 ftsH rrmJ TRUE 0.738 49.000 0.152 1.000 N 0.896
 552049 552050 plu4540 plu4541   rpmA TRUE 0.462 253.000 0.335 1.000   0.106
 552050 552051 plu4541 plu4542 rpmA rplU TRUE 0.999 20.000 0.667 0.009 Y 0.461
 552053 552054 plu4544 plu4545     TRUE 0.834 56.000 0.000 0.003   0.754
 552059 552060 plu4550 plu4551 fbp ppa FALSE 0.006 618.000 0.043 1.000 N 0.411
 552061 552062 plu4552 plu4553     TRUE 0.984 3.000 0.167 NA   -0.072
 552062 552063 plu4553 plu4554     TRUE 0.997 -3.000 0.575 NA   0.586
 552064 552065 plu4555 plu4556 msrA   FALSE 0.243 155.000 0.042 NA   0.721
 552072 552073 plu4563 plu4564     TRUE 0.943 11.000 0.000 NA   -0.372
 552073 552074 plu4564 plu4565     FALSE 0.134 213.000 0.000 NA   0.176
 552074 552075 plu4565 plu4566     TRUE 0.772 24.000 0.000 1.000 N 0.965
 552075 552076 plu4566 plu4567     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y 0.993
 552076 552077 plu4567 plu4568     TRUE 0.976 -10.000 0.000 1.000 Y 0.996
 552077 552078 plu4568 plu4569   ISPlu6A FALSE 0.009 787.000 0.000 1.000   NA
 552078 552079 plu4569 plu4570 ISPlu6A rplI FALSE 0.072 292.000 0.000 1.000   NA
 552079 552080 plu4570 plu4571 rplI rpsR TRUE 0.996 39.000 0.499 0.009 Y 0.305
 552080 552081 plu4571 plu4572 rpsR priB TRUE 0.964 5.000 0.128 1.000 N 0.664
 552081 552082 plu4572 plu4573 priB rpsF TRUE 0.961 6.000 0.122 1.000 N 0.709
 552082 552083 plu4573 plu4574 rpsF   FALSE 0.217 304.000 0.017 1.000 Y 0.181
 552083 552084 plu4574 plu4575   rnr TRUE 0.622 128.000 0.147 0.011 N 0.605
 552084 552085 plu4575 plu4576 rnr   TRUE 0.891 45.000 0.038 NA Y 0.403
 552085 552086 plu4576 plu4577   purA FALSE 0.028 191.000 0.010 NA N 0.106
 552086 552087 plu4577 plu4578 purA hflC FALSE 0.096 148.000 0.019 1.000 N 0.753
 552087 552088 plu4578 plu4579 hflC hflK TRUE 1.000 6.000 0.947 0.009 Y 0.513
 552088 552089 plu4579 plu4580 hflK hflX TRUE 0.815 106.000 0.184 0.045   0.820
 552089 552090 plu4580 plu4581 hflX hfq TRUE 0.618 97.000 0.141 1.000   0.215
 552090 552091 plu4581 plu4582 hfq miaA TRUE 0.893 111.000 0.531 1.000   0.047
 552091 552092 plu4582 plu4583 miaA mutL TRUE 0.979 -7.000 0.188 0.058 N 0.042
 552092 552093 plu4583 plu4584 mutL amiB TRUE 0.939 10.000 0.092 1.000 N 0.309
 552093 552094 plu4584 plu4585 amiB   TRUE 0.560 79.000 0.109 NA   -0.122
 552099 552100 plu4590 plu4591     TRUE 0.919 19.000 0.041 1.000   0.902
 552102 552103 plu4593 plu4594     TRUE 0.998 0.000 0.679 NA   0.301
 552104 552105 plut070 plut071 tRNA-Gly tRNA-Gly TRUE 0.446 66.000 0.000 NA   NA
 552105 552106 plut071 plut072 tRNA-Gly tRNA-Gly TRUE 0.516 56.000 0.000 NA   NA
 552106 552107 plut072 plu4595 tRNA-Gly orn FALSE 0.131 200.000 0.000 NA   NA
 552108 552109 plu4596 plu4597   psd TRUE 0.573 75.000 0.095 1.000   0.364
 552109 552110 plu4597 plu4598 psd   TRUE 0.886 27.000 0.148 1.000 N 0.655
 552112 552113 plu4600 plu4601     TRUE 0.934 15.000 0.000 NA   0.968
 552113 552114 plu4601 plu4602     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.939
 552114 552115 plu4602 plu4603     TRUE 0.963 3.000 0.000 NA   0.941
 552115 552116 plu4603 plu4604     TRUE 0.952 2.000 0.000 NA   NA
 552116 552117 plu4604 plu4605     TRUE 0.847 24.000 0.000 NA   NA
 552117 552118 plu4605 plu4606     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 552118 552119 plu4606 plu4607     FALSE 0.185 164.000 0.000 NA   NA
 552119 552120 plu4607 plu4608     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 552120 552121 plu4608 plu4609     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 552121 552122 plu4609 plu4610     FALSE 0.185 164.000 0.000 NA   NA
 552122 552123 plu4610 plu4611     TRUE 0.811 27.000 0.000 NA   NA
 552124 552125 plu4612 plu4613     TRUE 0.461 72.000 0.000 NA   0.359
 552126 552127 plu4614 plu4615     TRUE 0.971 43.000 0.500 NA   0.846
 552127 552128 plu4615 plu4616   insA FALSE 0.202 178.000 0.000 1.000   0.360
 552129 552130 plu4617 plu4618 ISPlu5A   FALSE 0.140 201.000 0.000 1.000   NA
 552130 552131 plu4618 plu4619   pldB TRUE 0.991 23.000 0.524 1.000   0.654
 552131 552132 plu4619 plu4620 pldB recQ TRUE 0.788 15.000 0.014 1.000 N 0.969
 552133 552134 plu4621 plu4622   fhuE TRUE 0.971 51.000 0.455 0.001 N 0.581
 552134 552135 plu4622 plu4623 fhuE fepB TRUE 0.960 69.000 0.364 1.000 Y 0.827
 552135 552136 plu4623 plu4624 fepB fepD TRUE 0.999 -3.000 0.455 1.000 Y 0.947
 552136 552137 plu4624 plu4625 fepD fepG TRUE 0.999 -13.000 0.818 0.026 Y 0.972
 552137 552138 plu4625 plu4626 fepG fepC TRUE 0.997 -15.000 0.583 1.000 Y 0.838
 552138 552139 plu4626 plu4627 fepC fhuF FALSE 0.189 175.000 0.031 NA   0.959
 552139 552140 plu4627 plu4628 fhuF   FALSE 0.053 359.000 0.000 NA   0.979
 552140 552141 plu4628 plu4629     TRUE 0.985 31.000 0.667 NA N 0.873
 552141 552142 plu4629 plu4630     TRUE 0.991 0.000 0.048 NA Y 0.894
 552142 552143 plu4630 plu4631     FALSE 0.253 296.000 0.000 NA Y 0.206
 552143 552144 plu4631 plu4632   rarD TRUE 0.474 112.000 0.099 NA   0.460
 552144 552145 plu4632 plu4633 rarD   TRUE 0.949 8.000 0.000 1.000   NA
 552145 552146 plu4633 plu4634     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 552147 552148 plu4635 plu4636 corA uvrD FALSE 0.184 96.000 0.021 1.000 N 0.982
 552148 552149 plu4636 plu4637 uvrD   TRUE 0.694 67.000 0.128 1.000   0.941
 552149 552150 plu4637 plu4638   xerC TRUE 0.996 0.000 0.367 1.000   0.910
 552150 552151 plu4638 plu4639 xerC   TRUE 0.998 -3.000 0.714 NA   0.993
 552151 552152 plu4639 plu4640   dapF TRUE 0.917 33.000 0.175 NA   -0.015
 552152 552153 plu4640 plu4641 dapF   TRUE 0.514 49.000 0.021 NA   NA
 552156 552157 plu4644 plu4645 hemC hemD TRUE 0.999 -3.000 0.205 0.001 Y 0.969
 552157 552158 plu4645 plu4646 hemD hemX TRUE 0.998 21.000 0.600 1.000 Y 0.828
 552158 552159 plu4646 plu4647 hemX hemY TRUE 0.995 4.000 0.144 1.000 Y 0.846
 552160 552161 plu4648 plu4649   ISPlu4A TRUE 0.435 68.000 0.000 NA   NA
 552161 552162 plu4649 plut073 ISPlu4A tRNA-Pro FALSE 0.006 988.000 0.000 NA   NA
 552162 552163 plut073 plut074 tRNA-Pro tRNA-Leu TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 552163 552164 plut074 plut075 tRNA-Leu tRNA-His TRUE 0.906 16.000 0.000 NA   NA
 552164 552165 plut075 plut076 tRNA-His tRNA-Arg TRUE 0.396 77.000 0.000 NA   NA
 552165 552166 plut076 plu4650 tRNA-Arg yifK FALSE 0.070 284.000 0.000 NA   NA
 552166 552167 plu4650 plu4651 yifK wecG FALSE 0.061 244.000 0.000 1.000 N 0.869
 552167 552168 plu4651 plu4652 wecG wzyE TRUE 0.958 -9.000 0.126 1.000   0.857
 552168 552169 plu4652 plu4653 wzyE wecF TRUE 0.998 -3.000 0.684 1.000   0.978
 552169 552170 plu4653 plu4654 wecF wzxE TRUE 0.997 -3.000 0.605 1.000   0.004
 552170 552171 plu4654 plu4655 wzxE wecE TRUE 0.990 2.000 0.218 1.000   0.257
 552171 552172 plu4655 plu4656 wecE wecD TRUE 0.992 2.000 0.248 1.000   0.510
 552172 552173 plu4656 plu4657 wecD rffH TRUE 0.596 107.000 0.145 1.000   0.258
 552173 552174 plu4657 plu4658 rffH rffG TRUE 0.999 22.000 0.739 0.001 Y 0.974
 552174 552175 plu4658 plu4659 rffG wecC TRUE 0.997 -3.000 0.273 1.000 Y 0.434
 552175 552176 plu4659 plu4660 wecC wecB TRUE 0.995 20.000 0.348 1.000 Y 0.197
 552176 552177 plu4660 plu4661 wecB wzzE TRUE 0.987 127.000 0.677 0.002 Y 0.499
 552177 552178 plu4661 plu4662 wzzE wecA TRUE 0.999 30.000 0.735 0.002 Y -0.863
 552178 552179 plu4662 plu4663 wecA rho FALSE 0.013 421.000 0.000 1.000 N 0.162
 552179 552180 plu4663 plu4664 rho trxA FALSE 0.017 477.000 0.087 1.000 N -0.143
 552181 552182 plu4665 plu4666 rhlB gppA TRUE 0.992 6.000 0.406 NA N 0.326
 552183 552184 plu4667 plu4668 rep ilvC FALSE 0.037 210.000 0.005 1.000 N 0.741
 552185 552186 plu4669 plu4670 ilvY   FALSE 0.128 581.000 0.000 0.033 Y 0.348
 552188 552189 plu4672 plu4673     TRUE 0.966 17.000 0.211 1.000 N 0.832
 552189 552190 plu4673 plu4674     TRUE 0.991 -3.000 0.400 1.000 N -0.169
 552190 552191 plu4674 plu4675     TRUE 0.795 33.000 0.000 1.000   -0.270
 552191 552192 plu4675 plu4676     FALSE 0.217 156.000 0.000 1.000   -0.881
 552192 552193 plu4676 plu4677     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   0.094
 552193 552194 plu4677 plu4678     TRUE 0.779 57.000 0.000 0.037   0.686
 552194 552195 plu4678 plu4679     FALSE 0.030 323.000 0.000 1.000 N 0.626
 552195 552196 plu4679 plu4680     TRUE 0.960 8.000 0.000 1.000   0.642
 552197 552198 plu4681 plu4682 ilvA ilvD TRUE 0.993 5.000 0.106 1.000 Y 0.480
 552198 552199 plu4682 plu4683 ilvD ilvE TRUE 0.525 193.000 0.075 1.000 Y 0.810
 552199 552200 plu4683 plu4684 ilvE ilvM TRUE 0.966 24.000 0.205 1.000   0.918
 552200 552201 plu4684 plu4685 ilvM ilvG TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001   0.349
 552205 552206 plut077 plut078 tRNA-Trp tRNA-Asp TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 552206 552207 plut078 plur016 tRNA-Asp 5s_rRNA FALSE 0.127 203.000 0.000 NA   NA
 552207 552208 plur016 plur017 5s_rRNA 23s_rRNA FALSE 0.229 142.000 0.000 NA   NA
 552208 552209 plur017 plut079 23s_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.146 188.000 0.000 NA   NA
 552209 552210 plut079 plur018 tRNA-Glu 16s_rRNA FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 552212 552213 plu4690 plu4691   aroE TRUE 0.949 -3.000 0.043 NA   0.251
 552213 552214 plu4691 plu4692 aroE   TRUE 0.913 13.000 0.087 NA N 0.223
 552214 552215 plu4692 plu4693     TRUE 0.947 14.000 0.137 NA N 0.701
 552215 552216 plu4693 plu4694   smf TRUE 0.742 74.000 0.004 1.000 Y 0.759
 552217 552218 plu4695 plu4696 def fmt TRUE 0.985 25.000 0.058 0.013 Y 0.966
 552218 552219 plu4696 plu4697 fmt rsmB TRUE 0.945 71.000 0.305 1.000 Y 0.981
 552219 552220 plu4697 plu4698 rsmB trkA TRUE 0.584 57.000 0.122 1.000 N 0.990
 552221 552222 plu4699 plu4700   zntR TRUE 0.771 80.000 0.219 NA   0.975
 552222 552223 plu4700 plu4701 zntR rplQ FALSE 0.091 135.000 0.005 1.000 N 0.863
 552223 552224 plu4701 plu4702 rplQ rpoA TRUE 0.985 41.000 0.873 1.000 N -0.452
 552224 552225 plu4702 plu4703 rpoA rpsD TRUE 0.983 26.000 0.549 1.000 N 0.249
 552225 552226 plu4703 plu4704 rpsD rpsK TRUE 0.996 38.000 0.509 0.011 Y -0.303
 552226 552227 plu4704 plu4705 rpsK rpsM TRUE 1.000 16.000 0.810 0.009 Y 0.972
 552227 552228 plu4705 plu4706 rpsM secY FALSE 0.015 299.000 0.011 1.000 N -0.037
 552228 552229 plu4706 plu4707 secY rplO TRUE 0.997 8.000 0.730 1.000 N 0.159
 552229 552230 plu4707 plu4708 rplO rpmD TRUE 1.000 4.000 0.653 0.001 Y NA
 552230 552231 plu4708 plu4709 rpmD rpsE TRUE 1.000 6.000 0.789 0.011 Y NA
 552231 552232 plu4709 plu4710 rpsE rplR TRUE 1.000 15.000 0.814 0.011 Y 0.660
 552232 552233 plu4710 plu4711 rplR rplF TRUE 1.000 10.000 0.815 0.009 Y 0.666
 552233 552234 plu4711 plu4712 rplF rpsH TRUE 1.000 15.000 0.808 0.009 Y 0.822
 552234 552235 plu4712 plu4713 rpsH rpsN TRUE 0.997 34.000 0.473 0.009 Y 0.680
 552235 552236 plu4713 plu4714 rpsN rplE TRUE 0.999 13.000 0.496 0.009 Y -0.039
 552236 552237 plu4714 plu4715 rplE rplX TRUE 1.000 15.000 0.758 0.009 Y 0.883
 552237 552238 plu4715 plu4716 rplX rplN TRUE 1.000 11.000 0.810 0.011 Y -0.103
 552238 552239 plu4716 plu4717 rplN rpsQ TRUE 0.978 180.000 0.791 0.011 Y 0.836
 552239 552240 plu4717 plu4718 rpsQ rpmC TRUE 0.995 0.000 0.029 0.009 Y NA
 552240 552241 plu4718 plu4719 rpmC rplP TRUE 0.995 0.000 0.029 0.009 Y NA
 552241 552242 plu4719 plu4720 rplP rpsC TRUE 1.000 13.000 0.828 0.011 Y 0.953
 552242 552243 plu4720 plu4721 rpsC rplV TRUE 0.999 18.000 0.719 0.011 Y 0.706
 552243 552244 plu4721 plu4722 rplV rpsS TRUE 1.000 15.000 0.769 0.011 Y 0.939
 552244 552245 plu4722 plu4723 rpsS rplB TRUE 1.000 15.000 0.820 0.011 Y 0.847
 552245 552246 plu4723 plu4724 rplB rplW TRUE 1.000 20.000 0.849 0.011 Y 0.931
 552246 552247 plu4724 plu4725 rplW rplD TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.009 Y -0.039
 552247 552248 plu4725 plu4726 rplD rplC TRUE 0.999 17.000 0.486 0.009 Y 0.603
 552248 552249 plu4726 plu4727 rplC rpsJ TRUE 0.994 33.000 0.307 0.011 Y 0.276
 552249 552250 plu4727 plu4728 rpsJ bfr FALSE 0.040 304.000 0.000 1.000 N 0.891
 552250 552251 plu4728 plu4729 bfr bfd TRUE 0.752 77.000 0.053 NA Y NA
 552251 552252 plu4729 plu4730 bfd tufA FALSE 0.003 754.000 0.000 NA N NA
 552252 552253 plu4730 plut080 tufA tRNA-Thr FALSE 0.312 112.000 0.000 NA   NA
 552253 552254 plut080 plut081 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 552254 552255 plut081 plut082 tRNA-Gly tRNA-Tyr FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 552255 552256 plut082 plut083 tRNA-Tyr tRNA-Thr TRUE 0.906 16.000 0.000 NA   NA
 552258 552259 plu4732 plu4733 birA murB TRUE 0.981 -3.000 0.211 1.000 N 0.987
 552259 552260 plu4733 plur019 murB 5s_rRNA FALSE 0.238 138.000 0.000 NA   NA
 552260 552261 plur019 plut084 5s_rRNA tRNA-Thr TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 552261 552262 plut084 plur020 tRNA-Thr 5s_rRNA TRUE 0.693 40.000 0.000 NA   NA
 552262 552263 plur020 plur021 5s_rRNA 23s_rRNA FALSE 0.229 142.000 0.000 NA   NA
 552263 552264 plur021 plut085 23s_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.146 188.000 0.000 NA   NA
 552264 552265 plut085 plur022 tRNA-Glu 16s_rRNA FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 552265 552266 plur022 plu4734 16s_rRNA murI FALSE 0.039 368.000 0.000 NA   NA
 552266 552267 plu4734 plu4735 murI btuB TRUE 0.615 -55.000 0.025 1.000 N 0.869
 552269 552270 plu4737 plu4738     TRUE 0.955 24.000 0.194 NA   -0.433
 552272 552273 plu4740 plu4741 oxyR argH FALSE 0.014 280.000 0.002 1.000 N 0.167
 552273 552274 plu4741 plu4742 argH argG TRUE 0.853 153.000 0.278 1.000 Y 0.859
 552274 552275 plu4742 plu4743 argG argB TRUE 0.901 69.000 0.029 0.002 Y -0.459
 552275 552276 plu4743 plu4744 argB argC TRUE 0.989 26.000 0.097 0.002 Y 0.378
 552277 552278 plu4745 plu4746 argE ppc FALSE 0.046 283.000 0.053 1.000 N 0.589
 552278 552279 plu4746 plu4747 ppc   FALSE 0.371 94.000 0.000 NA   NA
 552279 552280 plu4747 plu4748     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 552281 552282 plu4749 plu4750     TRUE 0.959 3.000 0.000 NA   0.395
 552282 552283 plu4750 plu4751   ISPlu3B FALSE 0.006 1012.000 0.000 NA   NA
 552283 552284 plu4751 plu4752 ISPlu3B   FALSE 0.021 470.000 0.000 NA   NA
 552284 552285 plu4752 plu4753     TRUE 0.570 50.000 0.000 NA   NA
 552285 552286 plu4753 plu4754   metF FALSE 0.040 363.000 0.000 NA   NA
 552286 552287 plu4754 plu4755 metF metL FALSE 0.181 345.000 0.017 1.000 Y 0.891
 552287 552288 plu4755 plu4756 metL metB TRUE 0.999 3.000 0.428 1.000 Y 0.981
 552291 552292 plu4759 plu4760 priA cytR FALSE 0.018 327.000 0.013 1.000 N 0.797
 552292 552293 plu4760 plu4761 cytR ftsN TRUE 0.724 70.000 0.245 NA N 0.991
 552293 552294 plu4761 plu4762 ftsN hslV FALSE 0.290 124.000 0.122 NA N -0.182
 552294 552295 plu4762 plu4763 hslV hslU TRUE 0.999 12.000 0.752 1.000 Y 0.756
 552295 552296 plu4763 plu4764 hslU menA FALSE 0.263 96.000 0.051 1.000 N 0.558
 552296 552297 plu4764 plu4765 menA menG TRUE 0.716 150.000 0.158 NA Y -0.901
 552299 552300 plu4767 plu4768 glpF glpK TRUE 0.502 31.000 0.010 1.000 N 0.664
 552300 552301 plu4768 plu4769 glpK fpr FALSE 0.142 409.000 0.000 1.000 Y 0.976
 552303 552304 plu4771 plu4772   tpiA FALSE 0.290 135.000 0.058 NA   -0.310
 552305 552306 plu4773 plu4774 sbp pfkA FALSE 0.105 172.000 0.049 1.000 N 0.374
 552306 552307 plu4774 plu4775 pfkA   FALSE 0.039 382.000 0.000 1.000   -0.727
 552307 552308 plu4775 plu4776     TRUE 0.997 -3.000 0.595 1.000   -0.751
 552308 552309 plu4776 plu4777     TRUE 0.994 -7.000 0.246 1.000 Y 0.496
 552310 552311 plu4778 plu4779     TRUE 0.958 9.000 0.000 NA   0.867
 552313 552314 plu4781 plu4782     TRUE 0.995 -3.000 0.385 NA   0.990
 552316 552317 plu4784 plu4785     TRUE 0.984 -7.000 0.300 NA   NA
 552317 552318 plu4785 plu4786     FALSE 0.008 772.000 0.000 NA   NA
 552318 552319 plu4786 plu4787     TRUE 0.776 -58.000 0.000 NA   NA
 552319 552320 plu4787 plu4788     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 552320 552321 plu4788 plu4789     TRUE 0.833 25.000 0.000 NA   NA
 552321 552322 plu4789 plu4790     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 552326 552327 plu4794 plu4795 cpxR cpxA TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y 0.987
 552327 552328 plu4795 plu4796 cpxA wblA FALSE 0.018 402.000 0.000 1.000 N 0.721
 552328 552329 plu4796 plu4797 wblA wblB TRUE 0.978 15.000 0.060 0.024   0.960
 552329 552330 plu4797 plu4798 wblB wblC TRUE 0.943 19.000 0.114 1.000   -0.816
 552330 552331 plu4798 plu4799 wblC wblD TRUE 0.981 15.000 0.048 1.000 Y -0.466
 552331 552332 plu4799 plu4800 wblD wzxA TRUE 0.953 6.000 0.045 1.000   -0.668
 552332 552333 plu4800 plu4801 wzxA wblE TRUE 0.962 8.000 0.000 1.000   0.879
 552333 552334 plu4801 plu4802 wblE wblL TRUE 0.893 -10.000 0.000 1.000   -0.769
 552334 552335 plu4802 plu4803 wblL wblG TRUE 0.967 -3.000 0.071 1.000   0.752
 552335 552336 plu4803 plu4804 wblG wblH TRUE 0.992 6.000 0.099 1.000 Y -0.454
 552336 552337 plu4804 plu4805 wblH wblI TRUE 0.994 -3.000 0.146 1.000 Y 0.214
 552337 552338 plu4805 plu4806 wblI wblJ TRUE 0.513 170.000 0.000 NA Y 0.280
 552338 552339 plu4806 plu4807 wblJ wblK TRUE 0.986 11.000 0.029 NA Y 0.881
 552339 552340 plu4807 plu4808 wblK wblF TRUE 0.998 1.000 0.382 NA Y 0.302
 552340 552341 plu4808 plu4809 wblF wblM TRUE 0.985 10.000 0.027 NA Y -0.551
 552341 552342 plu4809 plu4810 wblM wblN FALSE 0.035 410.000 0.000 1.000   -0.079
 552342 552343 plu4810 plu4811 wblN wblO FALSE 0.010 776.000 0.000 1.000   -0.116
 552343 552344 plu4811 plu4812 wblO wblP TRUE 0.983 -3.000 0.194 NA   NA
 552344 552345 plu4812 plu4813 wblP wblQ TRUE 0.555 52.000 0.047 NA   NA
 552345 552346 plu4813 plu4814 wblQ wzxB TRUE 0.768 45.000 0.106 1.000   -0.788
 552346 552347 plu4814 plu4815 wzxB ISplu3A FALSE 0.060 314.000 0.000 1.000   NA
 552347 552348 plu4815 plu4816 ISplu3A wblR FALSE 0.229 142.000 0.000 NA   NA
 552348 552349 plu4816 plu4817 wblR wzy TRUE 0.852 -22.000 0.000 NA   0.830
 552349 552350 plu4817 plu4818 wzy wblS TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   -0.205
 552350 552351 plu4818 plu4819 wblS wblT FALSE 0.019 511.000 0.000 NA   -0.306
 552351 552352 plu4819 plu4820 wblT wblU TRUE 0.989 10.000 0.000 NA Y 0.904
 552352 552353 plu4820 plu4821 wblU wblV TRUE 0.958 8.000 0.000 1.000   0.395
 552353 552354 plu4821 plu4822 wblV wblW FALSE 0.016 624.000 0.000 1.000   0.987
 552354 552355 plu4822 plu4823 wblW wblX TRUE 0.979 -12.000 0.148 0.029   0.283
 552355 552356 plu4823 plu4824 wblX wblY TRUE 0.971 4.000 0.154 1.000 N 0.348
 552356 552357 plu4824 plu4825 wblY wblZ TRUE 0.791 -18.000 0.063 1.000 N 0.784
 552357 552358 plu4825 plu4826 wblZ   TRUE 0.747 35.000 0.000 NA   NA
 552358 552359 plu4826 plu4827     FALSE 0.312 112.000 0.000 NA   NA
 552359 552360 plu4827 plu4828     TRUE 0.895 18.000 0.000 NA   NA
 552360 552361 plu4828 plu4829     FALSE 0.032 393.000 0.000 NA   NA
 552361 552362 plu4829 plu4830     FALSE 0.016 537.000 0.000 NA   NA
 552362 552363 plu4830 plu4831   galE FALSE 0.087 201.000 0.000 1.000 N 0.876
 552363 552364 plu4831 plu4832 galE   FALSE 0.228 142.000 0.000 NA   -0.987
 552364 552365 plu4832 plu4833     FALSE 0.143 220.000 0.000 NA   0.807
 552365 552366 plu4833 plu4834     FALSE 0.158 199.000 0.000 1.000   -0.118
 552366 552367 plu4834 plu4835     TRUE 0.716 39.000 0.000 NA   -0.725
 552367 552368 plu4835 plu4836     FALSE 0.085 278.000 0.000 NA   0.236
 552369 552370 plu4837 plu4838 cysE gpsA TRUE 0.942 44.000 0.429 1.000 N 0.956
 552370 552371 plu4838 plu4839 gpsA secB TRUE 0.983 0.000 0.206 1.000 N 0.459
 552371 552372 plu4839 plu4840 secB   TRUE 0.580 70.000 0.158 NA N 0.739
 552373 552374 plu4841 plu4842     TRUE 0.940 -10.000 0.088 1.000   0.854
 552377 552378 plu4845 plu4846 tdh kbl TRUE 0.995 10.000 0.547 1.000 N 0.977
 552379 552380 plu4847 plu4848 rfaD rfaF TRUE 0.994 11.000 0.146 1.000 Y 0.964
 552380 552381 plu4848 plu4849 rfaF rfaC TRUE 0.999 0.000 0.205 0.001 Y 0.813
 552382 552383 plu4850 plu4851 walV walW FALSE 0.111 268.000 0.000 1.000   0.854
 552383 552384 plu4851 plu4852 walW rfaG TRUE 0.997 -3.000 0.111 0.014 Y 0.951
 552384 552385 plu4852 plu4853 rfaG rfaQ TRUE 0.997 -3.000 0.235 1.000 Y 0.979
 552386 552387 plu4854 plu4855 kdtA kdtX TRUE 0.992 1.000 0.083 NA Y 0.633
 552387 552388 plu4855 plu4856 kdtX coaD TRUE 0.847 -3.000 0.023 NA N 0.727
 552391 552392 plu4859 plu4860 walM walN TRUE 0.992 -19.000 0.188 0.014 Y 0.410
 552392 552393 plu4860 plu4861 walN walO TRUE 0.970 -19.000 0.083 1.000 Y 0.850
 552393 552394 plu4861 plu4862 walO walR TRUE 0.589 188.000 0.111 1.000 Y 0.938
 552394 552395 plu4862 plu4863 walR rpmG FALSE 0.020 171.000 0.003 1.000 N NA
 552395 552396 plu4863 plu4864 rpmG rpmB TRUE 0.999 12.000 0.332 0.009 Y NA
 552396 552397 plu4864 plu4865 rpmB radC FALSE 0.010 240.000 0.002 1.000 N -0.890
 552398 552399 plu4866 plu4867 dfp dut TRUE 0.917 -22.000 0.201 1.000 N 0.048
 552399 552400 plu4867 plu4868 dut ttk FALSE 0.053 241.000 0.060 1.000 N -0.705
 552401 552402 plu4869 plu4870 pyrE rph TRUE 0.407 85.000 0.108 1.000 N 0.254
 552404 552405 plu4872 plu4873     FALSE 0.019 513.000 0.000 NA   -0.249
 552405 552406 plu4873 plu4874     FALSE 0.104 228.000 0.000 NA   NA
 552406 552407 plu4874 plu4875     FALSE 0.086 251.000 0.000 NA   NA
 552408 552409 plu4876 plu4877     TRUE 0.896 -10.000 0.000 NA   0.105
 552409 552410 plu4877 plu4878     FALSE 0.018 504.000 0.000 NA   NA
 552411 552412 plu4879 plu4880     FALSE 0.020 527.000 0.000 NA   0.207
 552412 552413 plu4880 plu4881     FALSE 0.110 220.000 0.000 NA   NA
 552413 552414 plu4881 plu4882     FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 552414 552415 plu4882 plu4883     TRUE 0.689 48.000 0.000 1.000   0.789
 552418 552419 plu4886 plu4887     TRUE 0.960 1.000 0.000 NA   0.302
 552419 552420 plu4887 plu4888   fdoH TRUE 0.943 11.000 0.000 NA   -0.346
 552420 552421 plu4888 plu4889 fdoH fdoI TRUE 1.000 -3.000 0.944 0.000 Y 0.094
 552422 552423 plu4890 plu4891     FALSE 0.034 961.000 0.000 0.001   0.571
 552423 552424 plu4891 plu4892     FALSE 0.059 630.000 0.000 0.001   0.814
 552424 552425 plu4892 plu4893   ISPlu1A FALSE 0.010 709.000 0.000 1.000   NA
 552425 552426 plu4893 plu4894 ISPlu1A   FALSE 0.074 289.000 0.000 1.000   NA
 552426 552427 plu4894 plu4895     FALSE 0.043 713.000 0.000 0.001   -0.439
 552428 552429 plu4896 plu4897 fdhE selA TRUE 0.931 11.000 0.083 NA N 0.922
 552429 552430 plu4897 plu4898 selA selB TRUE 0.992 34.000 0.569 0.000 N 0.832
 552430 552431 plu4898 plu4899 selB   FALSE 0.145 108.000 0.015 1.000 N 0.721
 552432 552433 plu4900 plu4901 hipA hipB TRUE 0.998 0.000 0.675 NA   -0.884
 552434 552435 plu4902 plu4903     TRUE 0.506 69.000 0.000 NA   0.833
 552435 552436 plu4903 plu4904     TRUE 0.704 27.000 0.000 NA N 0.937
 552437 552438 plu4905 plu4906 trmE   TRUE 0.528 247.000 0.221 0.044   0.850
 552438 552439 plu4906 plu4907     TRUE 0.996 3.000 0.461 NA   0.093
 552439 552440 plu4907 plu4908   rnpA TRUE 0.986 -36.000 0.540 NA   0.541
 552440 552441 plu4908 plu4909 rnpA rpmH TRUE 0.997 17.000 0.787 1.000   NA