MicrobesOnline Operon Predictions for Bdellovibrio bacteriovorus HD100

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1762278 1762279 Bd0001 Bd0002 dnaA dnaN TRUE 0.911 233.000 0.273 1.000 Y NA
 1762279 1762280 Bd0002 Bd0003 dnaN   TRUE 0.996 0.000 0.344 1.000 Y NA
 1762280 1762281 Bd0003 Bd0004     TRUE 0.978 87.000 0.257 0.005 Y NA
 1762281 1762282 Bd0004 Bd0005   gyrA TRUE 0.992 24.000 0.299 0.002 Y NA
 1762282 1762283 Bd0005 Bd0006 gyrA   TRUE 0.611 2.000 0.000 NA   NA
 1762283 1762284 Bd0006 Bd0007     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762284 1762285 Bd0007 Bd0008     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762285 1762286 Bd0008 Bd0009   atpB TRUE 0.625 -10.000 0.000 NA   NA
 1762286 1762287 Bd0009 Bd0010 atpB atpE/H TRUE 0.978 33.000 0.010 0.005   NA
 1762289 1762290 Bd0012 Bd0013     FALSE 0.255 44.000 0.000 NA   NA
 1762291 1762292 Bd0014 Bd0015 pmm pdxA FALSE 0.492 48.000 0.000 1.000 N NA
 1762292 1762293 Bd0015 Bd0017 pdxA surA TRUE 0.993 -7.000 0.032 1.000 N NA
 1762293 1762294 Bd0017 Bd0018 surA ppiC TRUE 0.987 14.000 0.021 0.005   NA
 1762294 1762295 Bd0018 Bd0019 ppiC ppiD TRUE 0.766 13.000 0.000 0.005   NA
 1762295 1762296 Bd0019 Bd0020 ppiD   FALSE 0.247 48.000 0.000 NA   NA
 1762296 1762297 Bd0020 Bd0021   etfA TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1762297 1762298 Bd0021 Bd0022 etfA etfB TRUE 0.993 11.000 0.493 0.019 Y NA
 1762299 1762300 Bd0024 Bd0025 sdhC sdhA TRUE 0.983 12.000 0.732 0.002   NA
 1762300 1762301 Bd0025 Bd0026 sdhA sdhB TRUE 0.993 11.000 0.877 0.002 Y NA
 1762301 1762302 Bd0026 Bd0027 sdhB   FALSE 0.066 301.000 0.000 NA   NA
 1762302 1762303 Bd0027 Bd0028     FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 1762303 1762304 Bd0028 Bd0029     FALSE 0.107 107.000 0.000 NA   NA
 1762305 1762306 Bd0030 Bd0031 pcbD   FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 1762307 1762308 Bd0032 Bd0033 rpsF   FALSE 0.329 20.000 0.000 NA   NA
 1762308 1762309 Bd0033 Bd0034   rplI TRUE 0.967 17.000 0.045 NA   NA
 1762309 1762310 Bd0034 Bd0035 rplI   FALSE 0.179 172.000 0.000 1.000 N NA
 1762311 1762312 Bd0036 Bd0037     FALSE 0.095 115.000 0.000 NA   NA
 1762312 1762313 Bd0037 Bd0038   dnaB FALSE 0.493 15.000 0.000 1.000   NA
 1762313 1762314 Bd0038 Bd0039 dnaB fis FALSE 0.485 103.000 0.000 1.000 Y NA
 1762314 1762315 Bd0039 Bd0040 fis   TRUE 0.530 36.000 0.000 1.000 N NA
 1762316 1762317 Bd0041 Bd0042 ftsK   FALSE 0.185 73.000 0.000 NA   NA
 1762317 1762318 Bd0042 Bd0043     TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1762318 1762319 Bd0043 Bd0044     TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 1762319 1762320 Bd0044 Bd0045   dapF TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762320 1762321 Bd0045 Bd0046 dapF dapA TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1762321 1762322 Bd0046 Bd0047 dapA dapB TRUE 0.996 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 1762322 1762323 Bd0047 Bd0048 dapB   TRUE 0.736 -3.000 0.000 1.000   NA
 1762323 1762324 Bd0048 Bd0049   talC FALSE 0.296 62.000 0.000 1.000   NA
 1762324 1762325 Bd0049 Bd0050 talC   TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762325 1762326 Bd0050 Bd0051     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 1762328 1762329 Bd0054 Bd0055     FALSE 0.131 94.000 0.000 NA   NA
 1762329 1762330 Bd0055 Bd0056     FALSE 0.158 107.000 0.000 1.000   NA
 1762332 1762333 Bd0058 Bd0059 gatC gatA TRUE 0.995 10.000 0.686 0.002 Y NA
 1762333 1762334 Bd0059 Bd0060 gatA gatB TRUE 0.997 -10.000 0.502 0.002 Y NA
 1762334 1762335 Bd0060 Bd0061 gatB   TRUE 0.630 16.000 0.000 1.000 N NA
 1762335 1762336 Bd0061 Bd0062     TRUE 0.526 8.000 0.000 NA   NA
 1762336 1762337 Bd0062 Bd0063     FALSE 0.139 90.000 0.000 NA   NA
 1762341 1762342 Bd0068 Bd0069 rpmE prfA TRUE 0.923 148.000 0.008 1.000 Y NA
 1762342 1762343 Bd0069 Bd0070 prfA hemK TRUE 0.994 4.000 0.434 1.000 Y NA
 1762343 1762344 Bd0070 Bd0071 hemK murA TRUE 0.993 2.000 0.037 1.000 N NA
 1762345 1762346 Bd0072 Bd0073     FALSE 0.204 134.000 0.000 1.000 N NA
 1762346 1762347 Bd0073 Bd0074     FALSE 0.076 142.000 0.000 NA   NA
 1762348 1762349 Bd0075 Bd0076     FALSE 0.301 28.000 0.000 NA   NA
 1762349 1762350 Bd0076 Bd0077   serS FALSE 0.284 33.000 0.000 NA   NA
 1762350 1762351 Bd0077 trna_0001 serS   FALSE 0.126 97.000 0.000 NA   NA
 1762351 1762352 trna_0001 Bd0078     FALSE 0.086 125.000 0.000 NA   NA
 1762352 1762353 Bd0078 Bd0080   dedA TRUE 0.537 7.000 0.000 NA   NA
 1762354 1762355 Bd0081 Bd0082 cyaB   TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 1762356 1762357 Bd0083 Bd0084     FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1762357 1762358 Bd0084 Bd0085     FALSE 0.204 64.000 0.000 NA   NA
 1762358 1762359 Bd0085 Bd0086     FALSE 0.352 17.000 0.000 NA   NA
 1762359 1762360 Bd0086 Bd0087     FALSE 0.228 56.000 0.000 NA   NA
 1762360 1762361 Bd0087 Bd0088     FALSE 0.066 231.000 0.000 NA   NA
 1762361 1762362 Bd0088 Bd0089     FALSE 0.160 82.000 0.000 NA   NA
 1762362 1762363 Bd0089 Bd0090     FALSE 0.066 222.000 0.000 NA   NA
 1762367 1762368 Bd0092 Bd0093     FALSE 0.415 25.000 0.000 1.000   NA
 1762368 1762369 Bd0093 Bd0094     FALSE 0.238 52.000 0.000 NA   NA
 1762369 1762370 Bd0094 trna_0004     FALSE 0.220 58.000 0.000 NA   NA
 1762370 1762371 trna_0004 Bd0095     FALSE 0.109 106.000 0.000 NA   NA
 1762371 1762372 Bd0095 Bd0096     TRUE 0.526 8.000 0.000 NA   NA
 1762372 1762373 Bd0096 Bd0097   groES FALSE 0.070 161.000 0.000 NA   NA
 1762373 1762374 Bd0097 Bd0099 groES groEL TRUE 0.677 57.000 0.000 1.000 Y NA
 1762376 1762377 Bd0101 Bd0102   cheY FALSE 0.256 43.000 0.000 NA   NA
 1762377 1762378 Bd0102 Bd0103 cheY   TRUE 0.623 -13.000 0.000 NA   NA
 1762379 1762380 Bd0108 Bd0109     FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 1762380 1762381 Bd0109 Bd0110   TadB FALSE 0.291 31.000 0.000 NA   NA
 1762381 1762382 Bd0110 Bd0111 TadB TadA TRUE 0.992 4.000 0.667 NA Y NA
 1762382 1762383 Bd0111 Bd0112 TadA PilQ TRUE 0.691 53.000 0.000 1.000 Y NA
 1762383 1762384 Bd0112 Bd0113 PilQ CpaB TRUE 0.694 35.000 0.000 NA Y NA
 1762384 1762385 Bd0113 Bd0114 CpaB   FALSE 0.344 18.000 0.000 NA   NA
 1762385 1762386 Bd0114 Bd0115     TRUE 0.630 -6.000 0.000 NA   NA
 1762386 1762387 Bd0115 Bd0117     FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1762387 1762388 Bd0117 Bd0118     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762388 1762389 Bd0118 Bd0119     FALSE 0.241 51.000 0.000 NA   NA
 1762389 1762390 Bd0119 Bd0120     FALSE 0.072 154.000 0.000 NA   NA
 1762390 1762391 Bd0120 Bd0121     FALSE 0.457 11.000 0.000 NA   NA
 1762391 1762392 Bd0121 Bd0122   hprT FALSE 0.174 299.000 0.000 1.000 N NA
 1762392 1762393 Bd0122 Bd0123 hprT   TRUE 0.526 13.000 0.000 1.000   NA
 1762393 1762394 Bd0123 Bd0125   comL TRUE 0.849 0.000 0.000 0.019   NA
 1762394 1762395 Bd0125 Bd0126 comL   TRUE 0.558 35.000 0.000 0.019   NA
 1762396 1762397 Bd0127 Bd0129 argD dapE TRUE 0.923 1.000 0.000 1.000 Y NA
 1762397 1762398 Bd0129 Bd0130 dapE astA TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1762398 1762399 Bd0130 Bd0131 astA astD TRUE 0.799 4.000 0.000 1.000 N NA
 1762399 1762400 Bd0131 Bd0132 astD   TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762402 1762403 Bd0134 Bd0135 lysC   FALSE 0.490 49.000 0.000 1.000 N NA
 1762403 1762404 Bd0135 Bd0136     FALSE 0.263 233.000 0.000 0.021 N NA
 1762404 1762405 Bd0136 Bd0137   typA FALSE 0.220 123.000 0.000 1.000 N NA
 1762405 1762406 Bd0137 Bd0138 typA nodI TRUE 0.836 0.000 0.000 1.000 N NA
 1762406 1762407 Bd0138 Bd0139 nodI nodJ TRUE 0.989 0.000 0.543 NA N NA
 1762408 1762409 Bd0140 Bd0141     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762409 1762410 Bd0141 Bd0142   dfrA TRUE 0.636 8.000 0.000 1.000   NA
 1762410 1762411 Bd0142 Bd0143 dfrA   TRUE 0.736 -3.000 0.000 1.000   NA
 1762412 1762413 Bd0144 Bd0145 motA motB TRUE 0.818 15.000 0.000 1.000 Y NA
 1762414 1762415 Bd0146 Bd0147 bglX2   TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1762416 1762417 Bd0148 Bd0149     FALSE 0.130 95.000 0.000 NA   NA
 1762417 1762418 Bd0149 Bd0150     TRUE 0.511 9.000 0.000 NA   NA
 1762419 1762420 Bd0152 Bd0153     TRUE 0.973 13.000 0.190 NA   NA
 1762420 1762421 Bd0153 Bd0154     TRUE 0.990 -3.000 0.075 NA   NA
 1762421 1762422 Bd0154 Bd0155     FALSE 0.276 36.000 0.000 NA   NA
 1762422 1762423 Bd0155 Bd0156   nifA FALSE 0.067 201.000 0.000 NA   NA
 1762423 1762424 Bd0156 Bd0157 nifA   FALSE 0.175 77.000 0.000 NA   NA
 1762424 1762425 Bd0157 Bd0158   ygaD FALSE 0.324 21.000 0.000 NA   NA
 1762425 1762426 Bd0158 Bd0159 ygaD uvrA TRUE 0.695 12.000 0.000 1.000 N NA
 1762426 1762427 Bd0159 Bd0160 uvrA mrcA TRUE 0.839 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1762427 1762428 Bd0160 Bd0161 mrcA   FALSE 0.213 61.000 0.000 NA   NA
 1762428 1762429 Bd0161 Bd0162   mscL FALSE 0.097 112.000 0.000 NA   NA
 1762429 1762430 Bd0162 Bd0163 mscL ydiY TRUE 0.771 16.000 0.000 NA Y NA
 1762431 1762432 Bd0164 Bd0165   ftsE FALSE 0.185 73.000 0.000 NA   NA
 1762432 1762433 Bd0165 Bd0166 ftsE ftsX FALSE 0.331 138.000 0.000 NA Y NA
 1762433 1762434 Bd0166 Bd0168 ftsX nlpD TRUE 0.995 3.000 0.069 NA Y NA
 1762434 1762435 Bd0168 Bd0169 nlpD ctpA TRUE 0.989 5.000 0.313 0.061 N NA
 1762435 1762436 Bd0169 Bd0170 ctpA   FALSE 0.204 64.000 0.000 NA   NA
 1762437 1762438 Bd0172 Bd0173     FALSE 0.084 127.000 0.000 NA   NA
 1762439 1762440 Bd0175 Bd0176 trx   TRUE 0.559 5.000 0.000 NA   NA
 1762441 1762442 Bd0177 Bd0178 ppiA glnE TRUE 0.735 36.000 0.000 1.000 Y NA
 1762442 1762443 Bd0178 Bd0179 glnE aglW TRUE 0.833 -7.000 0.000 1.000 N NA
 1762443 1762444 Bd0179 Bd0180 aglW   TRUE 0.817 14.000 0.000 0.008 N NA
 1762444 1762445 Bd0180 Bd0181   aglV TRUE 0.987 9.000 0.381 1.000 N NA
 1762445 1762446 Bd0181 Bd0182 aglV aglX TRUE 0.996 3.000 0.116 0.053 Y NA
 1762446 1762447 Bd0182 Bd0183 aglX   FALSE 0.213 61.000 0.000 NA   NA
 1762448 1762449 Bd0184 Bd0186   sufB TRUE 0.992 -7.000 0.087 NA N NA
 1762449 1762450 Bd0186 Bd0187 sufB sufC TRUE 0.977 43.000 0.461 1.000 Y NA
 1762450 1762451 Bd0187 Bd0188 sufC sufD TRUE 0.989 10.000 0.705 1.000 Y NA
 1762451 1762452 Bd0188 Bd0189 sufD csdB TRUE 0.990 6.000 0.025 1.000 N NA
 1762452 1762453 Bd0189 Bd0190 csdB NifU TRUE 0.839 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1762453 1762454 Bd0190 Bd0191 NifU   TRUE 0.537 7.000 0.000 NA   NA
 1762455 1762456 Bd0192 Bd0193     TRUE 0.620 -18.000 0.000 NA   NA
 1762456 1762457 Bd0193 Bd0194     FALSE 0.071 158.000 0.000 NA   NA
 1762458 1762459 Bd0197 Bd0198 xseA xseB TRUE 0.997 2.000 0.434 0.001 Y NA
 1762459 1762460 Bd0198 Bd0199 xseB yqiD TRUE 0.990 4.000 0.324 1.000 N NA
 1762460 1762461 Bd0199 Bd0200 yqiD   TRUE 0.993 2.000 0.092 1.000 N NA
 1762461 1762462 Bd0200 Bd0201     TRUE 0.571 11.000 0.000 1.000   NA
 1762462 1762463 Bd0201 Bd0202   pepP TRUE 0.622 9.000 0.000 1.000   NA
 1762467 1762468 Bd0206 Bd0208   glpD TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1762470 1762471 Bd0210 Bd0211   mreB FALSE 0.231 55.000 0.000 NA   NA
 1762471 1762472 Bd0211 Bd0213 mreB   FALSE 0.302 60.000 0.000 1.000   NA
 1762472 1762473 Bd0213 Bd0214     FALSE 0.189 71.000 0.000 NA   NA
 1762473 1762474 Bd0214 Bd0216     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762474 1762475 Bd0216 Bd0217     FALSE 0.071 158.000 0.000 NA   NA
 1762477 1762478 Bd0220 Bd0221     TRUE 0.988 1.000 0.217 NA   NA
 1762478 1762479 Bd0221 Bd0222     FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 1762481 1762482 Bd0224 Bd0225     FALSE 0.109 106.000 0.000 NA   NA
 1762484 1762485 Bd0227 Bd0228   prkA FALSE 0.175 77.000 0.000 NA   NA
 1762485 1762486 Bd0228 Bd0229 prkA yhbH TRUE 0.989 0.000 0.063 NA   NA
 1762486 1762487 Bd0229 Bd0231 yhbH   TRUE 0.957 13.000 0.712 NA   NA
 1762487 1762488 Bd0231 Bd0232   yciH TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762488 1762489 Bd0232 Bd0233 yciH   TRUE 0.600 19.000 0.000 1.000 N NA
 1762489 1762490 Bd0233 Bd0234     FALSE 0.302 60.000 0.000 1.000   NA
 1762491 1762492 Bd0235 Bd0236 rhlE   TRUE 0.698 51.000 0.000 1.000 Y NA
 1762492 1762493 Bd0236 Bd0237     TRUE 0.836 0.000 0.000 1.000 N NA
 1762493 1762494 Bd0237 Bd0238     TRUE 0.511 9.000 0.000 NA   NA
 1762495 1762496 Bd0239 Bd0240 rpsU   TRUE 0.925 93.000 0.025 0.033   NA
 1762496 1762497 Bd0240 Bd0241   dnaG TRUE 0.974 15.000 0.165 1.000   NA
 1762497 1762498 Bd0241 Bd0242 dnaG rpoD TRUE 0.981 15.000 0.164 1.000 N NA
 1762498 1762499 Bd0242 trna_0005 rpoD   FALSE 0.075 144.000 0.000 NA   NA
 1762499 1762500 trna_0005 Bd0243     FALSE 0.066 293.000 0.000 NA   NA
 1762501 1762502 Bd0244 Bd0245   atoE FALSE 0.076 142.000 0.000 NA   NA
 1762502 1762503 Bd0245 Bd0246 atoE   FALSE 0.093 116.000 0.000 NA   NA
 1762505 1762506 Bd0248 Bd0249     TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1762506 1762507 Bd0249 Bd0250     TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1762509 1762510 Bd0252 Bd0253     TRUE 0.839 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1762510 1762511 Bd0253 Bd0254   uvrC FALSE 0.297 83.000 0.000 0.036   NA
 1762511 1762512 Bd0254 Bd0255 uvrC   FALSE 0.431 21.000 0.000 1.000   NA
 1762515 1762516 Bd0258 Bd0259 prsA nhaC TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1762516 1762517 Bd0259 Bd0260 nhaC   FALSE 0.255 44.000 0.000 NA   NA
 1762517 1762518 Bd0260 Bd0262   tsr FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1762518 1762519 Bd0262 Bd0263 tsr   FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 1762522 1762523 Bd0266 Bd0267 gcvH glnA TRUE 0.615 75.000 0.000 1.000 Y NA
 1762523 1762524 Bd0267 Bd0268 glnA glnB TRUE 0.984 32.000 0.005 1.000 Y NA
 1762525 1762526 Bd0269 Bd0271   cspR TRUE 0.628 -7.000 0.000 NA   NA
 1762526 1762527 Bd0271 Bd0272 cspR secA FALSE 0.208 131.000 0.000 1.000 N NA
 1762527 1762528 Bd0272 Bd0273 secA   TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1762528 1762529 Bd0273 Bd0274     TRUE 0.620 -19.000 0.000 NA   NA
 1762529 1762530 Bd0274 Bd0275     FALSE 0.145 87.000 0.000 NA   NA
 1762531 1762532 Bd0276 Bd0277     TRUE 0.611 2.000 0.000 NA   NA
 1762532 1762533 Bd0277 Bd0278     FALSE 0.196 67.000 0.000 NA   NA
 1762533 1762534 Bd0278 Bd0279     FALSE 0.182 74.000 0.000 NA   NA
 1762534 1762535 Bd0279 Bd0280   fabH TRUE 0.984 18.000 0.300 NA Y NA
 1762536 1762537 Bd0281 Bd0282 fabG   FALSE 0.224 57.000 0.000 NA   NA
 1762537 1762538 Bd0282 Bd0283     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762538 1762539 Bd0283 Bd0284     FALSE 0.073 149.000 0.000 NA   NA
 1762539 1762540 Bd0284 Bd0285     TRUE 0.514 16.000 0.000 0.046   NA
 1762540 1762541 Bd0285 Bd0286   ctaC TRUE 0.987 7.000 0.200 0.046   NA
 1762541 1762542 Bd0286 Bd0287 ctaC ctaD TRUE 0.995 11.000 0.400 0.003 Y NA
 1762542 1762543 Bd0287 Bd0288 ctaD ctaE TRUE 0.998 -13.000 0.364 0.003 Y NA
 1762543 1762544 Bd0288 Bd0289 ctaE   TRUE 0.979 4.000 0.615 NA   NA
 1762544 1762545 Bd0289 Bd0290   ctaB TRUE 0.526 8.000 0.000 NA   NA
 1762547 1762548 Bd0292 Bd0293     FALSE 0.291 31.000 0.000 NA   NA
 1762548 1762549 Bd0293 Bd0294     FALSE 0.314 24.000 0.000 NA   NA
 1762551 1762552 Bd0296 Bd0297   pbpC TRUE 0.991 -3.000 0.027 1.000   NA
 1762553 1762554 Bd0298 Bd0299     FALSE 0.327 53.000 0.000 1.000   NA
 1762554 1762555 Bd0299 Bd0300     TRUE 0.681 12.000 0.000 0.028   NA
 1762555 1762556 Bd0300 Bd0301     TRUE 0.894 7.000 0.000 1.000 Y NA
 1762557 1762558 Bd0302 Bd0303 phnD rnk FALSE 0.173 219.000 0.000 1.000 N NA
 1762562 1762563 Bd0307 Bd0308 strB   FALSE 0.142 88.000 0.000 NA   NA
 1762564 1762565 Bd0309 Bd0310     TRUE 0.620 -19.000 0.000 NA   NA
 1762568 1762569 Bd0314 Bd0315   tpx FALSE 0.210 62.000 0.000 NA   NA
 1762569 1762570 Bd0315 Bd0316 tpx rhlE TRUE 0.555 29.000 0.000 1.000 N NA
 1762571 1762572 Bd0317 Bd0318     TRUE 0.973 1.000 1.000 NA   NA
 1762572 1762573 Bd0318 Bd0319     TRUE 0.972 2.000 1.000 NA   NA
 1762574 1762575 Bd0320 Bd0321 rbp infA FALSE 0.277 67.000 0.000 1.000   NA
 1762576 1762577 Bd0322 Bd0323 dadA   FALSE 0.370 80.000 0.000 1.000 N NA
 1762579 1762580 Bd0325 Bd0326   btuE TRUE 0.811 3.000 0.000 1.000 N NA
 1762581 1762582 Bd0327 Bd0328   rhs TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762582 1762583 Bd0328 Bd0329 rhs   TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762584 1762585 trna_0006 Bd0330     FALSE 0.168 79.000 0.000 NA   NA
 1762585 1762586 Bd0330 Bd0331   bcsA TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762586 1762587 Bd0331 Bd0332 bcsA ndh TRUE 0.500 45.000 0.000 1.000 N NA
 1762587 1762588 Bd0332 Bd0333 ndh   FALSE 0.070 164.000 0.000 NA   NA
 1762588 1762589 Bd0333 Bd0334     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762589 1762590 Bd0334 Bd0335     FALSE 0.431 21.000 0.000 1.000   NA
 1762591 1762592 Bd0336 Bd0338 slyD   FALSE 0.067 200.000 0.000 NA   NA
 1762592 1762593 Bd0338 Bd0339   rbp FALSE 0.082 130.000 0.000 NA   NA
 1762593 1762594 Bd0339 Bd0340 rbp   FALSE 0.277 67.000 0.000 1.000   NA
 1762594 1762595 Bd0340 Bd0341     TRUE 0.987 -3.000 0.843 1.000 N NA
 1762595 1762596 Bd0341 Bd0342     TRUE 0.992 0.000 0.381 1.000 N NA
 1762596 1762597 Bd0342 Bd0344     FALSE 0.419 47.000 0.000 NA N NA
 1762598 1762599 Bd0345 Bd0346 napA   TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762600 1762601 Bd0347 Bd0348     TRUE 0.952 36.000 0.024 NA   NA
 1762601 1762602 Bd0348 Bd0349   dinP TRUE 0.540 33.000 0.000 1.000 N NA
 1762602 1762603 Bd0349 Bd0350 dinP   FALSE 0.196 67.000 0.000 NA   NA
 1762603 1762604 Bd0350 Bd0351     FALSE 0.182 74.000 0.000 NA   NA
 1762605 1762606 Bd0354 Bd0355     TRUE 0.620 -18.000 0.000 NA   NA
 1762606 1762607 Bd0355 Bd0356     TRUE 0.833 -7.000 0.000 1.000 N NA
 1762608 1762609 Bd0357 Bd0358 dppA   FALSE 0.399 54.000 0.000 0.038   NA
 1762609 1762610 Bd0358 Bd0360   dppC TRUE 0.984 -3.000 0.913 0.038   NA
 1762610 1762611 Bd0360 Bd0361 dppC   FALSE 0.070 161.000 0.000 NA   NA
 1762611 1762612 Bd0361 Bd0362     FALSE 0.104 108.000 0.000 NA   NA
 1762613 1762614 Bd0364 Bd0365 speA   FALSE 0.292 99.000 0.000 1.000 N NA
 1762615 1762616 Bd0367 Bd0368 pleD   TRUE 0.500 45.000 0.000 1.000 N NA
 1762616 1762617 Bd0368 Bd0370     FALSE 0.369 38.000 0.000 1.000   NA
 1762617 1762618 Bd0370 Bd0371     FALSE 0.157 83.000 0.000 NA   NA
 1762620 1762621 Bd0373 Bd0374 trxB   TRUE 0.636 8.000 0.000 1.000   NA
 1762621 1762622 Bd0374 Bd0375     FALSE 0.068 181.000 0.000 NA   NA
 1762622 1762623 Bd0375 Bd0376     FALSE 0.394 14.000 0.000 NA   NA
 1762624 1762625 Bd0377 Bd0378     FALSE 0.066 215.000 0.000 NA   NA
 1762625 1762626 Bd0378 Bd0379   pgp FALSE 0.091 119.000 0.000 NA   NA
 1762626 1762627 Bd0379 Bd0380 pgp ompA FALSE 0.408 27.000 0.000 1.000   NA
 1762628 1762629 Bd0381 Bd0382     FALSE 0.069 170.000 0.000 NA   NA
 1762630 1762631 Bd0383 Bd0384   dnaE FALSE 0.241 51.000 0.000 NA   NA
 1762631 1762632 Bd0384 Bd0385 dnaE   TRUE 0.628 -7.000 0.000 NA   NA
 1762632 1762633 Bd0385 Bd0386   recA TRUE 0.982 8.000 0.003 NA   NA
 1762633 1762634 Bd0386 Bd0387 recA   FALSE 0.182 74.000 0.000 NA   NA
 1762636 1762637 Bd0389 Bd0390 ogt   FALSE 0.249 47.000 0.000 NA   NA
 1762637 1762638 Bd0390 Bd0391     FALSE 0.087 123.000 0.000 NA   NA
 1762638 1762639 Bd0391 Bd0392     FALSE 0.163 81.000 0.000 NA   NA
 1762639 1762640 Bd0392 Bd0393     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762640 1762641 Bd0393 Bd0394   ace FALSE 0.151 85.000 0.000 NA   NA
 1762641 1762642 Bd0394 Bd0395 ace tcaB FALSE 0.176 474.000 0.000 1.000 N NA
 1762642 1762643 Bd0395 Bd0396 tcaB   FALSE 0.214 86.000 0.000 1.000   NA
 1762644 1762645 Bd0397 Bd0398     TRUE 0.949 54.000 0.182 1.000   NA
 1762648 1762649 Bd0401 Bd0402     FALSE 0.166 80.000 0.000 NA   NA
 1762650 1762651 Bd0403 Bd0404   atoB FALSE 0.337 19.000 0.000 NA   NA
 1762651 1762652 Bd0404 Bd0405 atoB fabG TRUE 0.711 45.000 0.000 1.000 Y NA
 1762652 1762653 Bd0405 Bd0406 fabG   FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1762655 1762656 Bd0408 Bd0409 flaA   FALSE 0.067 200.000 0.000 NA   NA
 1762656 1762657 Bd0409 Bd0410   hag FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 1762657 1762658 Bd0410 Bd0411 hag   FALSE 0.231 55.000 0.000 NA   NA
 1762659 1762660 Bd0412 Bd0413     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762660 1762661 Bd0413 Bd0414     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762661 1762662 Bd0414 Bd0415     TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1762662 1762663 Bd0415 Bd0416     FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1762663 1762664 Bd0416 Bd0417     FALSE 0.101 288.000 0.000 1.000   NA
 1762664 1762665 Bd0417 Bd0418     TRUE 0.736 -3.000 0.000 1.000   NA
 1762665 1762666 Bd0418 Bd0419     TRUE 0.994 6.000 0.500 0.038 Y NA
 1762666 1762667 Bd0419 Bd0420   aglR TRUE 0.994 -3.000 0.833 0.050 Y NA
 1762667 1762668 Bd0420 Bd0421 aglR   FALSE 0.195 93.000 0.000 1.000   NA
 1762668 1762669 Bd0421 Bd0422   aarF FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1762669 1762670 Bd0422 Bd0423 aarF vacB FALSE 0.352 17.000 0.000 NA   NA
 1762670 1762671 Bd0423 Bd0425 vacB   FALSE 0.066 256.000 0.000 NA   NA
 1762671 1762672 Bd0425 Bd0426     FALSE 0.071 158.000 0.000 NA   NA
 1762673 1762674 Bd0427 Bd0428     FALSE 0.238 52.000 0.000 NA   NA
 1762674 1762675 Bd0428 Bd0429     FALSE 0.087 123.000 0.000 NA   NA
 1762675 1762676 Bd0429 Bd0433   ybiF FALSE 0.067 471.000 0.000 NA   NA
 1762677 1762678 Bd0434 Bd0435     FALSE 0.067 192.000 0.000 NA   NA
 1762678 1762679 Bd0435 Bd0436     FALSE 0.457 11.000 0.000 NA   NA
 1762679 1762680 Bd0436 Bd0437     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762680 1762681 Bd0437 Bd0438     TRUE 0.626 -9.000 0.000 NA   NA
 1762683 1762684 Bd0441 Bd0442   rbsC FALSE 0.493 15.000 0.000 1.000   NA
 1762684 1762685 Bd0442 Bd0443 rbsC rbsD TRUE 0.990 1.000 0.361 0.037   NA
 1762685 1762686 Bd0443 Bd0444 rbsD rbsA TRUE 0.991 -3.000 0.082 1.000   NA
 1762686 1762687 Bd0444 Bd0445 rbsA rbsB TRUE 0.722 1.000 0.000 1.000   NA
 1762688 1762689 Bd0446 Bd0447     FALSE 0.109 106.000 0.000 NA   NA
 1762690 1762691 Bd0448 Bd0449     FALSE 0.476 16.000 0.000 1.000   NA
 1762691 1762692 Bd0449 Bd0450     FALSE 0.067 197.000 0.000 NA   NA
 1762693 1762694 Bd0451 Bd0452     FALSE 0.202 65.000 0.000 NA   NA
 1762694 1762695 Bd0452 Bd0453     FALSE 0.085 126.000 0.000 NA   NA
 1762695 1762696 Bd0453 Bd0454     TRUE 0.526 8.000 0.000 NA   NA
 1762696 1762697 Bd0454 Bd0456     TRUE 0.511 9.000 0.000 NA   NA
 1762697 1762698 Bd0456 Bd0457     FALSE 0.091 119.000 0.000 NA   NA
 1762699 1762700 Bd0458 Bd0459 valS   FALSE 0.066 210.000 0.000 NA   NA
 1762700 1762701 Bd0459 Bd0460     FALSE 0.112 105.000 0.000 NA   NA
 1762701 1762702 Bd0460 Bd0461   tetA TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1762704 1762705 Bd0463 Bd0464     TRUE 0.966 18.000 0.064 NA   NA
 1762705 1762706 Bd0464 Bd0465   proC FALSE 0.373 60.000 0.000 NA N NA
 1762706 1762707 Bd0465 Bd0466 proC   FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1762709 1762710 Bd0468 Bd0469   maf FALSE 0.315 77.000 0.000 NA N NA
 1762711 1762712 Bd0470 Bd0471 tadC   TRUE 0.985 5.000 0.032 NA   NA
 1762712 1762713 Bd0471 Bd0472     TRUE 0.623 -13.000 0.000 NA   NA
 1762713 1762714 Bd0472 Bd0473     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762714 1762715 Bd0473 Bd0474     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762715 1762716 Bd0474 Bd0475     TRUE 0.611 2.000 0.000 NA   NA
 1762718 1762719 Bd0477 Bd0478 tolQ tolR TRUE 0.918 3.000 0.000 0.050 Y NA
 1762721 1762722 Bd0480 Bd0481     TRUE 0.628 -7.000 0.000 NA   NA
 1762722 1762723 Bd0481 Bd0482     FALSE 0.083 129.000 0.000 NA   NA
 1762723 1762724 Bd0482 Bd0483   pssA TRUE 0.619 74.000 0.000 1.000 Y NA
 1762724 1762725 Bd0483 Bd0484 pssA asd TRUE 0.986 11.000 0.008 1.000 N NA
 1762725 1762726 Bd0484 Bd0485 asd   TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1762726 1762727 Bd0485 Bd0486     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762729 1762730 Bd0489 Bd0490     FALSE 0.069 167.000 0.000 NA   NA
 1762730 1762731 Bd0490 Bd0491   truA FALSE 0.218 59.000 0.000 NA   NA
 1762731 1762732 Bd0491 Bd0492 truA rplM TRUE 0.941 112.000 0.003 1.000 Y NA
 1762732 1762733 Bd0492 Bd0493 rplM rpsI TRUE 0.985 14.000 0.979 0.019 Y NA
 1762733 1762734 Bd0493 Bd0494 rpsI   FALSE 0.066 211.000 0.000 NA   NA
 1762734 1762735 Bd0494 Bd0495     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762737 1762738 Bd0498 Bd0499   torS FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1762738 1762739 Bd0499 Bd0500 torS   FALSE 0.113 104.000 0.000 NA   NA
 1762740 1762741 Bd0501 Bd0502 alaS recX TRUE 0.989 -13.000 0.086 NA   NA
 1762741 1762742 Bd0502 Bd0503 recX   FALSE 0.171 78.000 0.000 NA   NA
 1762743 1762744 Bd0504 Bd0505     FALSE 0.487 50.000 0.000 1.000 N NA
 1762744 1762745 Bd0505 Bd0506     TRUE 0.676 13.000 0.000 1.000 N NA
 1762747 1762748 Bd0508 Bd0509 rhbD pgpA FALSE 0.404 52.000 0.000 NA N NA
 1762748 1762749 Bd0509 Bd0510 pgpA che TRUE 0.988 1.000 0.011 NA   NA
 1762749 1762750 Bd0510 Bd0512 che recA TRUE 0.866 103.000 0.007 NA   NA
 1762752 1762753 Bd0515 Bd0516     FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1762753 1762754 Bd0516 Bd0517     FALSE 0.171 78.000 0.000 NA   NA
 1762754 1762755 Bd0517 Bd0518   cdh FALSE 0.073 150.000 0.000 NA   NA
 1762755 1762756 Bd0518 Bd0519 cdh mltA FALSE 0.133 121.000 0.000 1.000   NA
 1762757 1762758 Bd0520 Bd0521   apr FALSE 0.310 25.000 0.000 NA   NA
 1762758 1762759 Bd0521 Bd0522 apr bsaA FALSE 0.114 144.000 0.000 1.000   NA
 1762760 1762761 Bd0523 Bd0524     FALSE 0.259 42.000 0.000 NA   NA
 1762764 1762765 Bd0528 Bd0529 lysC mltD TRUE 0.793 -3.000 0.000 NA N NA
 1762766 1762767 Bd0530 Bd0531 flgE flgG TRUE 0.805 67.000 0.000 0.001 Y NA
 1762767 1762768 Bd0531 Bd0532 flgG flgA TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1762768 1762769 Bd0532 Bd0534 flgA flgH TRUE 0.989 -3.000 0.096 NA   NA
 1762769 1762770 Bd0534 Bd0535 flgH flgI TRUE 0.872 -7.000 0.000 0.013   NA
 1762770 1762771 Bd0535 Bd0536 flgI flgJ TRUE 0.791 310.000 0.103 NA   NA
 1762771 1762772 Bd0536 Bd0537 flgJ flgM TRUE 0.910 81.000 0.020 NA   NA
 1762772 1762773 Bd0537 Bd0538 flgM   TRUE 0.889 132.000 0.464 0.003   NA
 1762773 1762774 Bd0538 Bd0540   flgK TRUE 0.914 134.000 0.018 0.002   NA
 1762774 1762775 Bd0540 Bd0542 flgK flgL TRUE 0.970 63.000 0.015 0.001   NA
 1762775 1762776 Bd0542 Bd0543 flgL   TRUE 0.778 554.000 0.248 NA   NA
 1762777 1762778 Bd0544 Bd0545     FALSE 0.102 109.000 0.000 NA   NA
 1762779 1762780 Bd0546 Bd0547 menA   TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762780 1762781 Bd0547 Bd0548   menE TRUE 0.929 66.000 0.111 NA   NA
 1762781 1762782 Bd0548 Bd0550 menE   TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762785 1762786 Bd0553 Bd0554     FALSE 0.104 108.000 0.000 NA   NA
 1762786 1762787 Bd0554 Bd0556     FALSE 0.457 11.000 0.000 NA   NA
 1762788 1762789 Bd0557 Bd0558 ispB menA TRUE 0.912 -3.000 0.000 NA Y NA
 1762789 1762790 Bd0558 Bd0559 menA   TRUE 0.620 -18.000 0.000 NA   NA
 1762790 1762791 Bd0559 Bd0560     TRUE 0.623 -13.000 0.000 NA   NA
 1762791 1762792 Bd0560 Bd0561   rsbU FALSE 0.314 24.000 0.000 NA   NA
 1762792 1762793 Bd0561 Bd0562 rsbU citZ FALSE 0.200 138.000 0.000 1.000 N NA
 1762794 1762795 Bd0564 Bd0565     TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1762797 1762798 Bd0567 Bd0569     FALSE 0.117 102.000 0.000 NA   NA
 1762799 1762800 Bd0570 Bd0571     TRUE 0.608 18.000 0.000 1.000 N NA
 1762800 1762801 Bd0571 Bd0572     TRUE 0.628 -7.000 0.000 NA   NA
 1762801 1762802 Bd0572 Bd0573     FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 1762802 1762803 Bd0573 Bd0574     FALSE 0.070 162.000 0.000 NA   NA
 1762803 1762804 Bd0574 Bd0575     TRUE 0.952 36.000 0.139 NA   NA
 1762804 1762805 Bd0575 Bd0577     TRUE 0.983 12.000 0.087 NA N NA
 1762805 1762806 Bd0577 Bd0578   cheA FALSE 0.101 329.000 0.000 1.000   NA
 1762806 1762807 Bd0578 Bd0579 cheA cheW TRUE 0.857 -3.000 0.000 0.017   NA
 1762807 1762808 Bd0579 Bd0580 cheW cheB TRUE 0.954 -3.000 0.000 0.018 Y NA
 1762808 1762809 Bd0580 Bd0581 cheB   TRUE 0.755 9.000 0.000 1.000 N NA
 1762812 1762813 Bd0584 Bd0585   ddlA FALSE 0.219 124.000 0.000 1.000 N NA
 1762813 1762814 Bd0585 Bd0586 ddlA elb FALSE 0.350 66.000 0.000 NA N NA
 1762814 1762815 Bd0586 Bd0588 elb   FALSE 0.192 69.000 0.000 NA   NA
 1762815 1762816 Bd0588 Bd0589     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762817 1762818 Bd0590 Bd0591 fer   TRUE 0.625 -10.000 0.000 NA   NA
 1762818 1762819 Bd0591 Bd0592     FALSE 0.382 15.000 0.000 NA   NA
 1762819 1762820 Bd0592 Bd0593   thiB TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1762820 1762821 Bd0593 Bd0594 thiB thiP TRUE 0.991 -3.000 0.702 0.036 N NA
 1762821 1762822 Bd0594 Bd0595 thiP thiQ TRUE 0.719 -22.000 0.000 1.000   NA
 1762824 1762825 Bd0597 Bd0599     FALSE 0.099 111.000 0.000 NA   NA
 1762825 1762826 Bd0599 Bd0600     FALSE 0.310 25.000 0.000 NA   NA
 1762826 1762827 Bd0600 Bd0601     FALSE 0.092 117.000 0.000 NA   NA
 1762827 1762828 Bd0601 Bd0602     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762828 1762829 Bd0602 Bd0603     TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1762829 1762830 Bd0603 Bd0604   hag FALSE 0.067 462.000 0.000 NA   NA
 1762832 1762833 Bd0606 Bd0607 hag   FALSE 0.067 391.000 0.000 NA   NA
 1762835 1762836 Bd0609 Bd0610   fliD FALSE 0.068 173.000 0.000 NA   NA
 1762836 1762837 Bd0610 Bd0611 fliD fliS TRUE 0.992 38.000 0.061 0.002 Y NA
 1762837 1762838 Bd0611 Bd0613 fliS   FALSE 0.314 24.000 0.000 NA   NA
 1762838 1762839 Bd0613 Bd0614     FALSE 0.074 147.000 0.000 NA   NA
 1762839 1762840 Bd0614 Bd0615     TRUE 0.611 2.000 0.000 NA   NA
 1762840 1762841 Bd0615 Bd0616     TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1762841 1762842 Bd0616 Bd0618     TRUE 0.817 57.000 0.000 0.004 Y NA
 1762842 1762843 Bd0618 Bd0619     TRUE 0.623 -13.000 0.000 NA   NA
 1762843 1762844 Bd0619 Bd0620     FALSE 0.279 35.000 0.000 NA   NA
 1762844 1762845 Bd0620 Bd0621     TRUE 0.736 -3.000 0.000 1.000   NA
 1762845 1762846 Bd0621 Bd0622     TRUE 0.696 3.000 0.000 1.000   NA
 1762846 1762847 Bd0622 Bd0623   ppaT TRUE 0.992 -7.000 0.348 1.000 N NA
 1762847 1762848 Bd0623 Bd0624 ppaT aspC TRUE 0.714 11.000 0.000 1.000 N NA
 1762850 1762851 Bd0627 Bd0628     TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1762851 1762852 Bd0628 Bd0629     FALSE 0.102 109.000 0.000 NA   NA
 1762853 1762854 Bd0630 Bd0631     FALSE 0.075 146.000 0.000 NA   NA
 1762854 1762855 Bd0631 Bd0632     FALSE 0.069 167.000 0.000 NA   NA
 1762856 1762857 Bd0633 Bd0634 pal   FALSE 0.318 23.000 0.000 NA   NA
 1762857 1762858 Bd0634 Bd0635     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762858 1762859 Bd0635 Bd0636   gcp TRUE 0.666 5.000 0.000 1.000   NA
 1762859 1762860 Bd0636 Bd0637 gcp   TRUE 0.993 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1762860 1762861 Bd0637 Bd0638   smpB TRUE 0.830 1.000 0.000 1.000 N NA
 1762861 1762862 Bd0638 Bd0639 smpB   FALSE 0.074 147.000 0.000 NA   NA
 1762862 1762863 Bd0639 Bd0641     FALSE 0.067 567.000 0.000 NA   NA
 1762864 1762865 Bd0642 Bd0643 yugS   TRUE 0.617 -27.000 0.000 NA   NA
 1762865 1762866 Bd0643 Bd0644     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762868 1762869 Bd0646 Bd0647     FALSE 0.067 192.000 0.000 NA   NA
 1762869 1762870 Bd0647 Bd0648     FALSE 0.134 93.000 0.000 NA   NA
 1762870 1762871 Bd0648 Bd0649   map FALSE 0.185 73.000 0.000 NA   NA
 1762872 1762873 Bd0651 Bd0652     FALSE 0.281 34.000 0.000 NA   NA
 1762874 1762875 Bd0654 Bd0655     TRUE 0.626 -9.000 0.000 NA   NA
 1762875 1762876 Bd0655 Bd0656   hly3 FALSE 0.180 75.000 0.000 NA   NA
 1762876 1762877 Bd0656 Bd0657 hly3 tetA FALSE 0.325 67.000 0.000 0.043   NA
 1762878 1762879 Bd0658 Bd0659     FALSE 0.220 58.000 0.000 NA   NA
 1762883 1762884 Bd0663 Bd0664   lipA FALSE 0.480 52.000 0.000 1.000 N NA
 1762884 1762885 Bd0664 Bd0665 lipA   TRUE 0.839 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1762885 1762886 Bd0665 Bd0666     FALSE 0.199 66.000 0.000 NA   NA
 1762887 1762888 Bd0667 Bd0668     TRUE 0.695 12.000 0.000 1.000 N NA
 1762888 1762889 Bd0668 Bd0669     FALSE 0.279 35.000 0.000 NA   NA
 1762889 1762890 Bd0669 Bd0670     FALSE 0.077 141.000 0.000 NA   NA
 1762890 1762891 Bd0670 Bd0671     FALSE 0.291 31.000 0.000 NA   NA
 1762892 1762893 Bd0672 Bd0673     FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1762895 1762896 Bd0675 Bd0676     FALSE 0.075 146.000 0.000 NA   NA
 1762896 1762897 Bd0676 Bd0677     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762898 1762899 Bd0678 Bd0679     FALSE 0.321 22.000 0.000 NA   NA
 1762899 1762900 Bd0679 Bd0680     FALSE 0.241 51.000 0.000 NA   NA
 1762901 1762902 Bd0681 Bd0682     FALSE 0.168 79.000 0.000 NA   NA
 1762903 1762904 trna_0007 Bd0683     FALSE 0.224 57.000 0.000 NA   NA
 1762904 1762905 Bd0683 Bd0684     TRUE 0.996 11.000 0.013 0.001 Y NA
 1762906 1762907 Bd0685 Bd0687     FALSE 0.228 56.000 0.000 NA   NA
 1762910 1762911 Bd0690 Bd0691     FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1762911 1762912 Bd0691 Bd0692     TRUE 0.826 -36.000 0.000 1.000 N NA
 1762912 1762913 Bd0692 Bd0693     FALSE 0.223 102.000 0.000 NA N NA
 1762913 1762914 Bd0693 Bd0694     FALSE 0.218 59.000 0.000 NA   NA
 1762914 1762915 Bd0694 Bd0695     FALSE 0.267 39.000 0.000 NA   NA
 1762915 1762916 Bd0695 Bd0696     FALSE 0.099 111.000 0.000 NA   NA
 1762916 1762917 Bd0696 Bd0697     FALSE 0.066 261.000 0.000 NA   NA
 1762917 1762918 Bd0697 Bd0698     FALSE 0.307 26.000 0.000 NA   NA
 1762918 1762919 Bd0698 Bd0699     TRUE 0.511 9.000 0.000 NA   NA
 1762919 1762920 Bd0699 Bd0700     TRUE 0.989 -58.000 0.058 NA   NA
 1762921 1762922 Bd0701 Bd0702     FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1762922 1762923 Bd0702 Bd0703     FALSE 0.075 146.000 0.000 NA   NA
 1762923 1762924 Bd0703 Bd0704     FALSE 0.259 42.000 0.000 NA   NA
 1762924 1762925 Bd0704 Bd0705     FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 1762927 1762928 Bd0707 Bd0708     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 1762928 1762929 Bd0708 Bd0709   macB TRUE 0.987 -3.000 0.714 0.098 N NA
 1762929 1762930 Bd0709 Bd0710 macB   FALSE 0.134 93.000 0.000 NA   NA
 1762931 1762932 Bd0711 Bd0712   capM1 FALSE 0.360 82.000 0.000 1.000 N NA
 1762932 1762933 Bd0712 Bd0713 capM1   TRUE 0.559 5.000 0.000 NA   NA
 1762933 1762934 Bd0713 Bd0714   mutT TRUE 0.624 -12.000 0.000 NA   NA
 1762934 1762935 Bd0714 Bd0715 mutT pyrD TRUE 0.722 -13.000 0.000 1.000   NA
 1762935 1762936 Bd0715 Bd0717 pyrD   TRUE 0.836 0.000 0.000 1.000 N NA
 1762939 1762940 Bd0720 Bd0721 rfaE dopA TRUE 0.626 12.000 0.000 NA N NA
 1762940 1762941 Bd0721 Bd0722 dopA slyD FALSE 0.134 209.000 0.000 NA N NA
 1762942 1762943 Bd0723 Bd0724     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762944 1762945 Bd0725 Bd0726     TRUE 0.628 -7.000 0.000 NA   NA
 1762945 1762946 Bd0726 Bd0727     TRUE 0.617 -28.000 0.000 NA   NA
 1762947 1762948 Bd0728 Bd0729     TRUE 0.622 9.000 0.000 1.000   NA
 1762948 1762949 Bd0729 Bd0730     FALSE 0.082 131.000 0.000 NA   NA
 1762949 1762950 Bd0730 Bd0731     TRUE 0.626 -9.000 0.000 NA   NA
 1762951 1762952 Bd0733 Bd0734 yloN pfkB TRUE 0.571 11.000 0.000 1.000   NA
 1762952 1762953 Bd0734 Bd0735 pfkB   FALSE 0.069 171.000 0.000 NA   NA
 1762954 1762955 Bd0736 Bd0737 choA   TRUE 0.774 7.000 0.000 1.000 N NA
 1762956 1762957 Bd0738 Bd0739     FALSE 0.202 65.000 0.000 NA   NA
 1762957 1762958 Bd0739 Bd0740     TRUE 0.611 2.000 0.000 NA   NA
 1762958 1762959 Bd0740 Bd0741   pgi FALSE 0.100 232.000 0.000 1.000   NA
 1762959 1762960 Bd0741 Bd0742 pgi   TRUE 0.707 8.000 0.000 NA N NA
 1762960 1762961 Bd0742 Bd0743   rpoE FALSE 0.135 444.000 0.000 NA N NA
 1762961 1762962 Bd0743 Bd0745 rpoE   TRUE 0.537 7.000 0.000 NA   NA
 1762962 1762963 Bd0745 Bd0746     FALSE 0.310 25.000 0.000 NA   NA
 1762964 1762965 Bd0747 Bd0748     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762965 1762966 Bd0748 Bd0749   papC TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1762966 1762967 Bd0749 Bd0750 papC   TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1762967 1762968 Bd0750 Bd0751     FALSE 0.284 33.000 0.000 NA   NA
 1762968 1762969 Bd0751 Bd0752     FALSE 0.291 31.000 0.000 NA   NA
 1762969 1762970 Bd0752 Bd0753     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762970 1762971 Bd0753 Bd0754     FALSE 0.301 28.000 0.000 NA   NA
 1762971 1762972 Bd0754 Bd0755     FALSE 0.067 358.000 0.000 NA   NA
 1762972 1762973 Bd0755 Bd0756     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762974 1762975 Bd0757 Bd0758     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762977 1762978 Bd0760 Bd0761   phoH FALSE 0.076 142.000 0.000 NA   NA
 1762978 1762979 Bd0761 Bd0762 phoH maoC TRUE 0.600 19.000 0.000 1.000 N NA
 1762979 1762980 Bd0762 Bd0763 maoC   TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1762980 1762981 Bd0763 Bd0765   doxD FALSE 0.265 40.000 0.000 NA   NA
 1762988 1762989 Bd0774 Bd0776   dnl1 FALSE 0.189 71.000 0.000 NA   NA
 1762989 1762990 Bd0776 Bd0777 dnl1   FALSE 0.078 138.000 0.000 NA   NA
 1762990 1762991 Bd0777 Bd0778   pdhD FALSE 0.297 81.000 0.000 NA N NA
 1762991 1762992 Bd0778 Bd0779 pdhD pdhC TRUE 0.639 67.000 0.000 1.000 Y NA
 1762992 1762993 Bd0779 Bd0780 pdhC   FALSE 0.160 82.000 0.000 NA   NA
 1762994 1762995 Bd0781 Bd0782 sfsA   FALSE 0.068 186.000 0.000 NA   NA
 1762995 1762996 Bd0782 Bd0783     FALSE 0.083 129.000 0.000 NA   NA
 1762996 1762997 Bd0783 Bd0784     FALSE 0.123 99.000 0.000 NA   NA
 1762997 1762998 Bd0784 Bd0785     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1762999 1763000 Bd0786 Bd0789     FALSE 0.095 115.000 0.000 NA   NA
 1763001 1763002 Bd0790 Bd0791     FALSE 0.069 170.000 0.000 NA   NA
 1763002 1763003 Bd0791 Bd0792     FALSE 0.329 20.000 0.000 NA   NA
 1763003 1763004 Bd0792 Bd0793   cpaF FALSE 0.310 25.000 0.000 NA   NA
 1763004 1763005 Bd0793 Bd0794 cpaF   FALSE 0.084 127.000 0.000 NA   NA
 1763005 1763006 Bd0794 Bd0796   eno TRUE 0.628 -7.000 0.000 NA   NA
 1763006 1763007 Bd0796 Bd0797 eno tcmJ FALSE 0.066 296.000 0.000 NA   NA
 1763008 1763009 Bd0798 Bd0799 catA ankB TRUE 0.968 4.000 1.000 NA   NA
 1763010 1763011 Bd0800 Bd0801     FALSE 0.178 100.000 0.000 1.000   NA
 1763011 1763012 Bd0801 Bd0802   polA FALSE 0.408 64.000 0.000 0.031   NA
 1763016 1763017 Bd0806 Bd0807   cks TRUE 0.736 -3.000 0.000 1.000   NA
 1763017 1763018 Bd0807 Bd0808 cks pyrG TRUE 0.993 0.000 0.011 1.000 N NA
 1763018 1763019 Bd0808 Bd0809 pyrG kpsF TRUE 0.608 18.000 0.000 1.000 N NA
 1763019 1763020 Bd0809 Bd0810 kpsF   FALSE 0.160 82.000 0.000 NA   NA
 1763020 1763021 Bd0810 Bd0811   araC FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 1763024 1763025 Bd0813 Bd0814     FALSE 0.106 165.000 0.000 1.000   NA
 1763027 1763028 Bd0816 Bd0817     FALSE 0.196 67.000 0.000 NA   NA
 1763029 1763030 Bd0818 Bd0819     TRUE 0.981 2.000 0.667 NA   NA
 1763030 1763031 Bd0819 Bd0820     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1763031 1763032 Bd0820 Bd0821     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763033 1763034 Bd0822 Bd0823   glnQ FALSE 0.086 124.000 0.000 NA   NA
 1763034 1763035 Bd0823 Bd0824 glnQ glnP TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1763035 1763036 Bd0824 Bd0825 glnP glnH TRUE 0.996 0.000 0.462 0.046 Y NA
 1763037 1763038 Bd0826 Bd0827     FALSE 0.233 54.000 0.000 NA   NA
 1763038 1763039 Bd0827 Bd0828     TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1763039 1763040 Bd0828 Bd0829     FALSE 0.394 14.000 0.000 NA   NA
 1763040 1763041 Bd0829 Bd0831     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763041 1763042 Bd0831 Bd0832   agmU TRUE 0.992 4.000 0.286 0.016   NA
 1763042 1763043 Bd0832 Bd0833 agmU aglT TRUE 0.864 0.000 0.000 0.016   NA
 1763043 1763044 Bd0833 Bd0834 aglT   FALSE 0.067 328.000 0.000 NA   NA
 1763044 1763045 Bd0834 Bd0836   aglR FALSE 0.297 29.000 0.000 NA   NA
 1763045 1763046 Bd0836 Bd0837 aglR tolR TRUE 0.984 13.000 0.833 0.046 Y NA
 1763046 1763047 Bd0837 Bd0838 tolR aglS TRUE 0.990 0.000 0.500 0.034   NA
 1763047 1763048 Bd0838 Bd0840 aglS   FALSE 0.102 109.000 0.000 NA   NA
 1763048 1763049 Bd0840 Bd0842   nrtD TRUE 0.989 -3.000 0.013 NA   NA
 1763049 1763050 Bd0842 Bd0843 nrtD rpoN TRUE 0.957 43.000 0.053 1.000   NA
 1763050 1763051 Bd0843 Bd0844 rpoN   FALSE 0.101 332.000 0.000 1.000   NA
 1763051 1763052 Bd0844 Bd0845   aprT FALSE 0.288 64.000 0.000 1.000   NA
 1763052 1763053 Bd0845 Bd0846 aprT   TRUE 0.951 5.000 0.000 0.004 Y NA
 1763053 1763054 Bd0846 Bd0847     TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1763054 1763055 Bd0847 Bd0848   PSrp-1 FALSE 0.131 94.000 0.000 NA   NA
 1763055 1763056 Bd0848 Bd0849 PSrp-1   FALSE 0.263 41.000 0.000 NA   NA
 1763056 1763057 Bd0849 Bd0850   metK FALSE 0.086 125.000 0.000 NA   NA
 1763057 1763058 Bd0850 Bd0851 metK lepA TRUE 0.544 32.000 0.000 1.000 N NA
 1763058 1763059 Bd0851 Bd0852 lepA lepB TRUE 0.714 11.000 0.000 1.000 N NA
 1763059 1763060 Bd0852 Bd0853 lepB lepB TRUE 0.965 1.000 0.000 0.001 Y NA
 1763060 1763061 Bd0853 Bd0854 lepB lepB TRUE 0.536 77.000 0.000 0.001   NA
 1763061 1763062 Bd0854 Bd0855 lepB pyrB FALSE 0.376 36.000 0.000 1.000   NA
 1763062 1763063 Bd0855 Bd0856 pyrB carA TRUE 0.996 0.000 0.003 1.000 Y NA
 1763063 1763064 Bd0856 Bd0857 carA   TRUE 0.989 -3.000 0.007 NA   NA
 1763064 1763065 Bd0857 Bd0858   carB FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 1763065 1763066 Bd0858 Bd0859 carB phoD TRUE 0.839 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1763066 1763067 Bd0859 Bd0860 phoD phnC TRUE 0.774 7.000 0.000 1.000 N NA
 1763067 1763068 Bd0860 Bd0861 phnC pilI TRUE 0.985 5.000 0.196 NA   NA
 1763068 1763069 Bd0861 Bd0862 pilI pilD TRUE 0.611 2.000 0.000 NA   NA
 1763069 1763070 Bd0862 Bd0863 pilD pilM FALSE 0.349 171.000 0.000 1.000 Y NA
 1763070 1763071 Bd0863 Bd0864 pilM pilN TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA Y NA
 1763071 1763072 Bd0864 Bd0865 pilN pilO TRUE 0.993 -7.000 0.721 NA Y NA
 1763072 1763073 Bd0865 Bd0866 pilO pilP TRUE 0.992 -3.000 0.782 NA Y NA
 1763073 1763074 Bd0866 Bd0867 pilP pilQ TRUE 0.984 24.000 0.152 NA Y NA
 1763074 1763075 Bd0867 Bd0868 pilQ   FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1763075 1763076 Bd0868 Bd0869     FALSE 0.067 345.000 0.000 NA   NA
 1763078 1763079 Bd0871 trna_0009     FALSE 0.071 156.000 0.000 NA   NA
 1763079 3358422 trna_0009 Bd_r01     FALSE 0.066 269.000 0.000 NA   NA
 3358422 1763080 Bd_r01 trna_0010     FALSE 0.079 136.000 0.000 NA   NA
 1763080 3358423 trna_0010 Bd_r02     FALSE 0.093 116.000 0.000 NA   NA
 3358423 3358424 Bd_r02 Bd_r03     FALSE 0.066 248.000 0.000 NA   NA
 1763081 1763082 Bd0873 Bd0874     FALSE 0.069 168.000 0.000 NA   NA
 1763083 1763084 Bd0875 Bd0876   fliG FALSE 0.188 72.000 0.000 NA   NA
 1763086 1763087 Bd0878 Bd0879   pcp FALSE 0.337 19.000 0.000 NA   NA
 1763087 1763088 Bd0879 Bd0880 pcp   FALSE 0.171 78.000 0.000 NA   NA
 1763088 1763089 Bd0880 Bd0881   rpoE TRUE 0.511 9.000 0.000 NA   NA
 1763089 1763090 Bd0881 Bd0882 rpoE   TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763092 1763093 Bd0884 Bd0885     FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1763093 1763094 Bd0885 Bd0886     FALSE 0.070 163.000 0.000 NA   NA
 1763094 1763095 Bd0886 Bd0887   tolC FALSE 0.131 94.000 0.000 NA   NA
 1763095 1763096 Bd0887 Bd0888 tolC acrF TRUE 0.773 2.000 0.000 NA N NA
 1763096 1763097 Bd0888 Bd0889 acrF pcd FALSE 0.362 63.000 0.000 NA N NA
 1763099 1763100 Bd0892 Bd0893     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1763100 1763101 Bd0893 Bd0894     TRUE 0.976 11.000 0.273 NA   NA
 1763102 1763103 Bd0895 Bd0896     TRUE 0.988 0.000 0.333 NA   NA
 1763103 1763104 Bd0896 Bd0897     FALSE 0.112 147.000 0.000 1.000   NA
 1763105 1763106 Bd0898 Bd0899 adhC esd FALSE 0.461 17.000 0.000 1.000   NA
 1763108 1763109 Bd0901 Bd0902   lysR FALSE 0.476 16.000 0.000 1.000   NA
 1763109 1763110 Bd0902 Bd0903 lysR lysR FALSE 0.406 460.000 0.000 0.034 Y NA
 1763111 1763112 Bd0904 Bd0905 ccpA ABC1 FALSE 0.436 12.000 0.000 NA   NA
 1763113 1763114 Bd0906 Bd0907   rsmC FALSE 0.294 30.000 0.000 NA   NA
 1763116 1763117 Bd0909 Bd0910   catD FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1763117 1763118 Bd0910 Bd0911 catD yeeZ TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1763118 1763119 Bd0911 Bd0912 yeeZ   FALSE 0.191 70.000 0.000 NA   NA
 1763120 1763121 Bd0913 Bd0914     FALSE 0.071 160.000 0.000 NA   NA
 1763122 1763123 Bd0915 Bd0916 mkl pacL TRUE 0.714 11.000 0.000 1.000 N NA
 1763123 1763124 Bd0916 Bd0917 pacL hspC FALSE 0.385 57.000 0.000 NA N NA
 1763124 1763125 Bd0917 Bd0919 hspC pspE TRUE 0.556 16.000 0.000 NA N NA
 1763126 1763127 Bd0920 Bd0921     FALSE 0.337 19.000 0.000 NA   NA
 1763128 1763129 Bd0922 Bd0923 htrA   FALSE 0.356 169.000 0.000 0.052 Y NA
 1763130 1763131 Bd0925 Bd0926     FALSE 0.329 20.000 0.000 NA   NA
 1763132 1763133 Bd0927 Bd0928   mdh FALSE 0.077 141.000 0.000 NA   NA
 1763134 1763135 Bd0929 Bd0930   pfpI TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1763136 1763137 Bd0931 Bd0932 merR mcp FALSE 0.338 49.000 0.000 1.000   NA
 1763138 1763139 Bd0933 Bd0934   endA FALSE 0.079 135.000 0.000 NA   NA
 1763139 1763140 Bd0934 Bd0936 endA   FALSE 0.099 111.000 0.000 NA   NA
 1763140 1763141 Bd0936 trna_0011     FALSE 0.134 93.000 0.000 NA   NA
 1763146 1763147 Bd0941 Bd0942 rplX   FALSE 0.067 194.000 0.000 NA   NA
 1763147 1763148 Bd0942 Bd0943     FALSE 0.457 11.000 0.000 NA   NA
 1763148 1763149 Bd0943 Bd0944     FALSE 0.077 141.000 0.000 NA   NA
 1763149 1763150 Bd0944 Bd0945   etf-QO FALSE 0.238 52.000 0.000 NA   NA
 1763150 1763151 Bd0945 Bd0946 etf-QO   FALSE 0.484 51.000 0.000 1.000 N NA
 1763151 1763152 Bd0946 Bd0947     FALSE 0.344 18.000 0.000 NA   NA
 1763152 1763153 Bd0947 Bd0948     FALSE 0.267 39.000 0.000 NA   NA
 1763154 1763155 Bd0949 Bd0950     FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 1763156 1763157 Bd0952 Bd0953   infA FALSE 0.154 84.000 0.000 NA   NA
 1763157 1763158 Bd0953 Bd0954 infA   TRUE 0.611 48.000 0.000 0.025 N NA
 1763158 1763159 Bd0954 Bd0955     FALSE 0.382 15.000 0.000 NA   NA
 1763160 1763161 Bd0956 Bd0957     TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1763162 1763163 Bd0958 Bd0959 tldD pmbA TRUE 0.989 0.000 0.174 NA   NA
 1763163 1763164 Bd0959 Bd0961 pmbA lea TRUE 0.611 2.000 0.000 NA   NA
 1763164 1763165 Bd0961 Bd0962 lea   FALSE 0.218 59.000 0.000 NA   NA
 1763167 1763168 Bd0964 Bd0965 topA   FALSE 0.136 92.000 0.000 NA   NA
 1763168 1763169 Bd0965 Bd0967   prc FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 1763171 1763172 Bd0969 Bd0970     FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1763172 1763173 Bd0970 Bd0972     FALSE 0.073 149.000 0.000 NA   NA
 1763173 1763174 Bd0972 Bd0974     TRUE 0.998 0.000 0.061 0.001 Y NA
 1763174 1763175 Bd0974 Bd0975     TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1763175 1763176 Bd0975 Bd0976     FALSE 0.066 209.000 0.000 NA   NA
 1763176 1763177 Bd0976 Bd0977     FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1763178 1763179 Bd0978 Bd0979   pyrE FALSE 0.256 43.000 0.000 NA   NA
 1763179 1763180 Bd0979 Bd0980 pyrE cutA TRUE 0.755 9.000 0.000 1.000 N NA
 1763180 1763181 Bd0980 Bd0981 cutA corB TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1763182 1763183 Bd0982 Bd0983     FALSE 0.087 123.000 0.000 NA   NA
 1763184 1763185 Bd0984 Bd0986     TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1763185 1763186 Bd0986 Bd0987   fusA-2 FALSE 0.067 200.000 0.000 NA   NA
 1763187 1763188 Bd0988 Bd0989 recQ sndH FALSE 0.461 17.000 0.000 1.000   NA
 1763188 1763189 Bd0989 Bd0990 sndH aat TRUE 0.836 0.000 0.000 1.000 N NA
 1763190 1763191 Bd0991 Bd0992   cwlJ TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763192 1763193 Bd0993 Bd0994   splA TRUE 0.732 0.000 0.000 1.000   NA
 1763193 1763194 Bd0994 Bd0995 splA   TRUE 0.622 9.000 0.000 1.000   NA
 1763194 1763195 Bd0995 Bd0996     FALSE 0.145 87.000 0.000 NA   NA
 1763196 1763197 Bd0997 Bd0998     FALSE 0.288 32.000 0.000 NA   NA
 1763197 1763198 Bd0998 Bd0999   tolC FALSE 0.382 15.000 0.000 NA   NA
 1763198 1763199 Bd0999 Bd1000 tolC   TRUE 0.630 -6.000 0.000 NA   NA
 1763203 1763204 Bd1004 Bd1005 ygiD yceI TRUE 0.611 2.000 0.000 NA   NA
 1763206 1763207 Bd1007 Bd1008   thiL FALSE 0.202 65.000 0.000 NA   NA
 1763208 1763209 Bd1010 Bd1011 ppk sixA TRUE 0.987 8.000 0.006 NA N NA
 1763210 1763211 Bd1012 Bd1013     FALSE 0.067 201.000 0.000 NA   NA
 1763211 1763212 Bd1013 Bd1014   ppx FALSE 0.224 57.000 0.000 NA   NA
 1763213 1763214 Bd1015 Bd1016   phoU FALSE 0.131 94.000 0.000 NA   NA
 1763214 1763215 Bd1016 Bd1017 phoU phoB TRUE 0.516 20.000 0.000 NA N NA
 1763215 1763216 Bd1017 Bd1018 phoB phoR TRUE 0.996 -3.000 0.142 0.059 Y NA
 1763216 1763217 Bd1018 Bd1019 phoR   TRUE 0.647 11.000 0.000 NA N NA
 1763219 1763220 Bd1021 Bd1023   gldA FALSE 0.126 97.000 0.000 NA   NA
 1763220 1763221 Bd1023 Bd1024 gldA gldF TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763221 1763222 Bd1024 Bd1025 gldF gldG TRUE 0.979 4.000 0.600 NA   NA
 1763222 1763223 Bd1025 Bd1026 gldG   TRUE 0.989 0.000 0.067 NA   NA
 1763223 1763224 Bd1026 Bd1027   lmbP TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1763224 1763225 Bd1027 Bd1028 lmbP   TRUE 0.615 -54.000 0.000 NA   NA
 1763225 1763226 Bd1028 Bd1029     FALSE 0.066 305.000 0.000 NA   NA
 1763228 1763229 Bd1031 Bd1032   mepA FALSE 0.220 58.000 0.000 NA   NA
 1763229 1763230 Bd1032 Bd1034 mepA   FALSE 0.259 42.000 0.000 NA   NA
 1763231 1763232 Bd1035 Bd1036   secG FALSE 0.259 42.000 0.000 NA   NA
 1763233 1763234 Bd1037 Bd1038     FALSE 0.123 99.000 0.000 NA   NA
 1763234 1763235 Bd1038 Bd1040   tmk TRUE 0.537 7.000 0.000 NA   NA
 1763235 1763236 Bd1040 Bd1041 tmk holB TRUE 0.984 11.000 0.353 1.000 N NA
 1763236 1763237 Bd1041 Bd1042 holB tatD TRUE 0.980 42.000 0.090 NA Y NA
 1763239 1763240 Bd1044 Bd1045     FALSE 0.076 143.000 0.000 NA   NA
 1763240 1763241 Bd1045 Bd1046     FALSE 0.090 120.000 0.000 NA   NA
 1763241 1763242 Bd1046 Bd1047     FALSE 0.109 106.000 0.000 NA   NA
 1763242 1763243 Bd1047 Bd1049   gapdh FALSE 0.111 148.000 0.000 1.000   NA
 1763243 1763244 Bd1049 Bd1050 gapdh pgk TRUE 0.954 4.000 0.000 0.004 Y NA
 1763244 1763245 Bd1050 Bd1051 pgk tpiA FALSE 0.374 143.000 0.000 1.000 Y NA
 1763246 1763247 Bd1052 Bd1053     FALSE 0.394 14.000 0.000 NA   NA
 1763247 1763248 Bd1053 Bd1054   asnS FALSE 0.067 339.000 0.000 NA   NA
 1763250 1763251 Bd1057 Bd1058   msrA FALSE 0.320 91.000 0.000 1.000 N NA
 1763251 1763252 Bd1058 Bd1059 msrA hyuB TRUE 0.495 47.000 0.000 1.000 N NA
 1763252 1763253 Bd1059 Bd1060 hyuB hyuA TRUE 0.991 -3.000 0.036 1.000   NA
 1763254 1763255 Bd1061 Bd1062 hisC cmk TRUE 0.983 13.000 0.010 1.000 N NA
 1763255 1763256 Bd1062 Bd1063 cmk   FALSE 0.066 228.000 0.000 NA   NA
 1763258 1763259 Bd1065 Bd1066   rpsA FALSE 0.066 234.000 0.000 NA   NA
 1763259 1763260 Bd1066 Bd1067 rpsA sppA FALSE 0.189 150.000 0.000 1.000 N NA
 1763260 1763261 Bd1067 Bd1068 sppA   TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1763261 1763262 Bd1068 Bd1069   hit FALSE 0.085 126.000 0.000 NA   NA
 1763262 1763263 Bd1069 Bd1071 hit   TRUE 0.666 5.000 0.000 1.000   NA
 1763263 1763264 Bd1071 Bd1072     FALSE 0.188 72.000 0.000 NA   NA
 1763264 1763265 Bd1072 Bd1073     FALSE 0.076 142.000 0.000 NA   NA
 1763265 1763266 Bd1073 Bd1074   futA FALSE 0.107 107.000 0.000 NA   NA
 1763268 1763269 Bd1076 Bd1077 fliL   FALSE 0.149 110.000 0.000 1.000   NA
 1763269 1763270 Bd1077 Bd1078     TRUE 0.842 3.000 0.000 0.016   NA
 1763272 1763273 Bd1080 Bd1081 lysR mcp FALSE 0.323 75.000 0.000 NA N NA
 1763273 1763274 Bd1081 Bd1082 mcp   FALSE 0.072 155.000 0.000 NA   NA
 1763274 1763275 Bd1082 Bd1084     FALSE 0.215 60.000 0.000 NA   NA
 1763275 1763276 Bd1084 Bd1085     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763278 1763279 Bd1087 Bd1089     FALSE 0.163 81.000 0.000 NA   NA
 1763279 1763280 Bd1089 Bd1090     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1763281 1763282 Bd1091 Bd1093     FALSE 0.066 266.000 0.000 NA   NA
 1763282 1763283 Bd1093 Bd1094     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1763283 1763284 Bd1094 Bd1096     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 1763284 1763285 Bd1096 Bd1097   nusB TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1763285 1763286 Bd1097 Bd1098 nusB   TRUE 0.995 -61.000 0.009 NA Y NA
 1763287 1763288 Bd1100 Bd1101   sun TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763288 1763289 Bd1101 Bd1102 sun   FALSE 0.207 63.000 0.000 NA   NA
 1763289 1763290 Bd1102 Bd1103     FALSE 0.121 100.000 0.000 NA   NA
 1763292 1763293 Bd1105 Bd1106 lgt   FALSE 0.067 401.000 0.000 NA   NA
 1763295 1763296 Bd1108 Bd1110     FALSE 0.344 18.000 0.000 NA   NA
 1763296 1763297 Bd1110 Bd1111     TRUE 0.985 -13.000 0.430 NA   NA
 1763297 1763298 Bd1111 Bd1112     TRUE 0.988 -3.000 0.766 1.000 N NA
 1763299 1763300 Bd1113 Bd1114 frpA   FALSE 0.271 38.000 0.000 NA   NA
 1763302 1763303 Bd1116 Bd1117 cyaA   FALSE 0.394 14.000 0.000 NA   NA
 1763303 1763304 Bd1117 Bd1118     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1763305 1763306 Bd1119 Bd1120 greB   FALSE 0.213 61.000 0.000 NA   NA
 1763306 1763307 Bd1120 Bd1121     TRUE 0.592 3.000 0.000 NA   NA
 1763309 1763310 Bd1123 Bd1124   mltE TRUE 0.793 -3.000 0.000 NA N NA
 1763310 1763311 Bd1124 Bd1125 mltE mltD FALSE 0.288 64.000 0.000 1.000   NA
 1763311 1763312 Bd1125 Bd1126 mltD mcp FALSE 0.101 200.000 0.000 1.000   NA
 1763315 1763316 Bd1129 Bd1130   yapH FALSE 0.070 166.000 0.000 NA   NA
 1763320 1763321 Bd1137 Bd1139   yhfA FALSE 0.401 53.000 0.000 NA N NA
 1763321 1763322 Bd1139 Bd1140 yhfA   FALSE 0.196 67.000 0.000 NA   NA
 1763322 1763323 Bd1140 Bd1141     FALSE 0.117 102.000 0.000 NA   NA
 1763323 1763324 Bd1141 Bd1144   ybaN FALSE 0.148 86.000 0.000 NA   NA
 1763324 1763325 Bd1144 Bd1145 ybaN acrD TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763325 1763326 Bd1145 Bd1146 acrD   FALSE 0.104 108.000 0.000 NA   NA
 1763328 1763329 Bd1148 Bd1149     FALSE 0.071 158.000 0.000 NA   NA
 1763331 1763332 Bd1151 Bd1152   pqiB FALSE 0.253 45.000 0.000 NA   NA
 1763332 1763333 Bd1152 Bd1153 pqiB pqiA TRUE 0.989 -28.000 0.033 NA   NA
 1763334 1763335 Bd1154 Bd1155 katA ankB FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1763335 1763336 Bd1155 Bd1156 ankB   FALSE 0.066 266.000 0.000 NA   NA
 1763336 1763337 Bd1156 Bd1158   smc FALSE 0.066 311.000 0.000 NA   NA
 1763337 1763338 Bd1158 Bd1159 smc   FALSE 0.066 224.000 0.000 NA   NA
 1763338 1763339 Bd1159 Bd1160     FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1763339 1763340 Bd1160 Bd1161     TRUE 0.548 6.000 0.000 NA   NA
 1763342 1763343 Bd1163 Bd1164     TRUE 0.793 -3.000 0.000 NA N NA
 1763345 1763346 Bd1167 Bd1168     FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1763346 1763347 Bd1168 Bd1169     TRUE 0.622 1.000 0.000 NA   NA
 1763348 1763349 Bd1170 Bd1171     TRUE 0.573 4.000 0.000 NA   NA
 1763349 1763350 Bd1171 Bd1172     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763351 1763352 Bd1173 Bd1174 ftsY   FALSE 0.117 102.000 0.000 NA   NA
 1763353 1763354 Bd1175 Bd1176     FALSE 0.314 24.000 0.000 NA   NA
 1763355 1763356 Bd1177 Bd1179     FALSE 0.073 151.000 0.000 NA   NA
 1763356 1763357 Bd1179 Bd1180     TRUE 0.634 0.000 0.000 NA   NA
 1763357 1763358 Bd1180 Bd1181   ycbB FALSE 0.086 125.000 0.000 NA   NA
 1763358 1763359 Bd1181 Bd1183 ycbB   TRUE 0.526 8.000 0.000 NA   NA
 1763359 1763360 Bd1183 Bd1184     FALSE 0.413 13.000 0.000 NA   NA
 1763360 1763361 Bd1184 Bd1185     FALSE 0.075 146.000 0.000 NA   NA
 1763361 1763362 Bd1185 Bd1186     TRUE 0.963 21.000 0.042 NA   NA
 1763362 1763363 Bd1186 Bd1188     TRUE 0.986 8.000 0.057 1.000   NA
 1763363 1763364 Bd1188 Bd1189   tyrS TRUE 0.993 -3.000 0.007 0.024   NA
 1763364 1763365 Bd1189 Bd1190 tyrS   FALSE 0.411 26.000 0.000 1.000   NA
 1763365 1763366 Bd1190 Bd1192     FALSE 0.204 64.000 0.000 NA   NA
 1763367 1763368 Bd1193 Bd1194 sufA spl1 FALSE 0.344 18.000 0.000 NA   NA
 1763368 1763369 Bd1194 Bd1195 spl1   FALSE 0.210 62.000 0.000 NA   NA
 1763370 1763371 Bd1196 Bd1198 nrdE rpsA FALSE 0.323 90.000 0.000 1.000 N NA
 1763371 1763372 Bd1198 Bd1199 rpsA   FALSE 0.067 195.000 0.000 NA   NA
 1763374 1763375 Bd1201 Bd1203   spoU TRUE 0.586 21.000 0.000 1.000 N NA
 1763375 1763376 Bd1203 Bd1204 spoU   FALSE 0.299 61.000 0.000 1.000   NA
 1763376 1763377 Bd1204 Bd1205     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763379 1763380 Bd1207 Bd1208 lemA   TRUE 0.972 14.000 0.036 NA   NA
 1763380 1763381 Bd1208 Bd1209     TRUE 0.793 273.000 0.038 NA   NA
 1763381 1763382 Bd1209 Bd1210     FALSE 0.139 90.000 0.000 NA   NA
 1763382 1763383 Bd1210 trna_0012     FALSE 0.191 70.000 0.000 NA   NA
 1763383 1763384 trna_0012 Bd1211   ydeI FALSE 0.078 140.000 0.000 NA   NA
 1763385 1763386 Bd1212 Bd1213     FALSE 0.366 16.000 0.000 NA   NA
 1763386 1763387 Bd1213 Bd1214     FALSE 0.095 115.000 0.000 NA   NA
 1763387 1763388 Bd1214 Bd1215     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763388 1763389 Bd1215 Bd1218     FALSE 0.096 114.000 0.000 NA   NA
 1763389 1763390 Bd1218 Bd1219     TRUE 0.638 -3.000 0.000 NA   NA
 1763390 1763391 Bd1219 Bd1220     FALSE 0.069 172.000 0.000 NA   NA
 1763393 1763394 Bd1223 Bd1224 glk amy TRUE 0.712 2.000 0.000 1.000   NA
 1763394 1763395 Bd1224 Bd1225 amy malK TRUE 0.598 10.000 0.000 1.000   NA
 1763395 1763396 Bd1225 Bd1226 malK malG TRUE 0.930 2.000 0.000 0.042 Y NA
 1763396 1763397 Bd1226 Bd1227 malG malF TRUE 0.912 0.000 0.000 0.087 Y NA
 1763397 1763398 Bd1227 Bd1228 malF amyX TRUE 0.926 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1763400 1763401 Bd1231 Bd1232     FALSE 0.486 10.000 0.000 NA   NA
 1763402 1763403 Bd1233 Bd1234 amn   FALSE