MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus thuringiensis str. 97-27

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 595198 595199 BT9727_0001 BT9727_0002 dnaA dnaN TRUE 0.611 179.000 0.097 1.000 Y NA
 595199 595200 BT9727_0002 BT9727_0003 dnaN   TRUE 0.587 116.000 0.260 NA   NA
 595200 595201 BT9727_0003 BT9727_0004   recF TRUE 0.785 13.000 0.247 NA   NA
 595201 595202 BT9727_0004 BT9727_0005 recF gyrB TRUE 0.977 39.000 0.257 0.005 Y NA
 595202 595203 BT9727_0005 BT9727_0006 gyrB gyrA TRUE 0.979 89.000 0.299 0.001 Y NA
 595203 5459410 BT9727_0006 rRNA-16SrRNA_1 gyrA   FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 5459410 5459411 rRNA-16SrRNA_1 tRNA-Ile-2     FALSE 0.030 148.000 0.000 NA   NA
 5459411 5459412 tRNA-Ile-2 tRNA-Ala-5     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 5459412 5459413 tRNA-Ala-5 rRNA-23SrRNA_1     FALSE 0.089 92.000 0.000 NA   NA
 5459413 5459414 rRNA-23SrRNA_1 rRNA-5SrRNA_1     FALSE 0.108 49.000 0.000 NA   NA
 595210 595211 BT9727_0009 BT9727_0010 guaB dacA FALSE 0.494 105.000 0.000 1.000 N NA
 595211 595212 BT9727_0010 BT9727_0011 dacA pdx1 FALSE 0.221 162.000 0.000 1.000 N NA
 595212 595213 BT9727_0011 BT9727_0012 pdx1 guaA TRUE 0.949 19.000 0.640 NA Y NA
 595213 595214 BT9727_0012 BT9727_0013 guaA serS FALSE 0.061 328.000 0.008 NA N NA
 595214 5459415 BT9727_0013 tRNA-Ser-5 serS   FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 5459415 595216 tRNA-Ser-5 BT9727_0014     FALSE 0.215 5.000 0.000 NA   NA
 595217 595218 BT9727_0015 BT9727_0016 dck dgk TRUE 0.994 3.000 0.333 0.001 Y NA
 595218 595219 BT9727_0016 BT9727_0017 dgk pncA TRUE 0.521 126.000 0.030 1.000 N NA
 595220 595221 BT9727_0018 BT9727_0019   dnaX FALSE 0.042 477.000 0.007 1.000 N NA
 595221 595222 BT9727_0019 BT9727_0020 dnaX   TRUE 0.580 23.000 0.064 NA   NA
 595222 595223 BT9727_0020 BT9727_0021   recR TRUE 0.838 15.000 0.615 NA   NA
 595223 595224 BT9727_0021 BT9727_0022 recR   TRUE 0.582 15.000 0.057 NA   NA
 595224 595225 BT9727_0022 BT9727_0023   bofA FALSE 0.250 216.000 0.333 NA   NA
 595225 5459416 BT9727_0023 rRNA-16SrRNA_2 bofA   FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 5459416 5459417 rRNA-16SrRNA_2 tRNA-Ile-4     FALSE 0.030 148.000 0.000 NA   NA
 5459417 5459418 tRNA-Ile-4 tRNA-Ala-1     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 5459418 5459419 tRNA-Ala-1 rRNA-23SrRNA_2     FALSE 0.089 92.000 0.000 NA   NA
 5459419 5459420 rRNA-23SrRNA_2 rRNA-5SrRNA_2     FALSE 0.108 49.000 0.000 NA   NA
 5459420 595231 rRNA-5SrRNA_2 BT9727_0025   cad FALSE 0.003 440.000 0.000 NA   NA
 595231 595232 BT9727_0025 BT9727_0026 cad tmk TRUE 0.900 2.000 0.067 1.000 N NA
 595232 595233 BT9727_0026 BT9727_0027 tmk holB TRUE 0.882 36.000 0.353 1.000 N NA
 595233 595234 BT9727_0027 BT9727_0028 holB   TRUE 0.908 -3.000 0.276 NA   NA
 595234 595235 BT9727_0028 BT9727_0029     TRUE 0.882 0.000 0.204 NA   NA
 595235 595236 BT9727_0029 BT9727_0030     FALSE 0.437 121.000 0.116 NA   NA
 595236 595237 BT9727_0030 BT9727_0031     TRUE 0.894 -13.000 0.167 NA   NA
 595237 595238 BT9727_0031 BT9727_0032     TRUE 0.861 -31.000 0.039 1.000   NA
 595240 595241 BT9727_0034 BT9727_0035 metS tatD FALSE 0.434 166.000 0.208 NA N NA
 595241 595242 BT9727_0035 BT9727_0036 tatD rnmV FALSE 0.421 215.000 0.060 NA Y NA
 595242 595243 BT9727_0036 BT9727_0037 rnmV ksgA TRUE 0.932 -3.000 0.104 1.000 N NA
 595243 595244 BT9727_0037 BT9727_0038 ksgA   FALSE 0.319 111.000 0.023 NA   NA
 595244 595245 BT9727_0038 BT9727_0039   veg FALSE 0.156 239.000 0.156 NA   NA
 595245 595246 BT9727_0039 BT9727_0040 veg ispE FALSE 0.018 459.000 0.031 NA   NA
 595246 595247 BT9727_0040 BT9727_0041 ispE purR TRUE 0.743 55.000 0.051 1.000 N NA
 595247 595248 BT9727_0041 BT9727_0042 purR purR TRUE 0.666 123.000 0.295 NA N NA
 595248 595249 BT9727_0042 BT9727_0043 purR spoVG TRUE 0.500 153.000 0.232 NA N NA
 595249 595250 BT9727_0043 BT9727_0044 spoVG gcaD FALSE 0.230 325.000 0.018 1.000 Y NA
 595250 595251 BT9727_0044 BT9727_0045 gcaD prs TRUE 0.795 19.000 0.069 1.000 N NA
 595251 595252 BT9727_0045 BT9727_0046 prs spoVC TRUE 0.663 73.000 0.006 1.000 N NA
 595252 595253 BT9727_0046 BT9727_0047 spoVC   FALSE 0.389 71.000 0.015 NA   NA
 595253 595254 BT9727_0047 BT9727_0048   mfd FALSE 0.374 100.000 0.020 NA   NA
 595254 595255 BT9727_0048 BT9727_0049 mfd spoVT TRUE 0.661 137.000 0.038 NA Y NA
 595255 595256 BT9727_0049 BT9727_0050 spoVT   FALSE 0.169 231.000 0.173 NA   NA
 595256 595257 BT9727_0050 BT9727_0051     TRUE 0.719 13.000 0.061 1.000   NA
 595257 595258 BT9727_0051 BT9727_0052   hslR TRUE 0.683 15.000 0.055 1.000   NA
 595258 595259 BT9727_0052 BT9727_0053 hslR   TRUE 0.663 41.000 0.126 NA   NA
 595259 595260 BT9727_0053 BT9727_0054     TRUE 0.941 -3.000 0.709 NA   NA
 595260 595261 BT9727_0054 BT9727_0055   divIC TRUE 0.833 -3.000 0.086 NA   NA
 595261 595262 BT9727_0055 BT9727_0056 divIC   TRUE 0.650 88.000 0.007 1.000 N NA
 595262 5459421 BT9727_0056 tRNA-Met-1     FALSE 0.024 161.000 0.000 NA   NA
 5459421 5459422 tRNA-Met-1 tRNA-Glu-7     FALSE 0.170 11.000 0.000 NA   NA
 5459422 595265 tRNA-Glu-7 BT9727_0057   spoIIE FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 595265 595266 BT9727_0057 BT9727_0058 spoIIE mesJ FALSE 0.215 234.000 0.049 1.000 N NA
 595266 595267 BT9727_0058 BT9727_0059 mesJ hprT TRUE 0.955 -3.000 0.082 0.046 N NA
 595267 595268 BT9727_0059 BT9727_0060 hprT ftsH TRUE 0.819 86.000 0.237 1.000 N NA
 595268 595269 BT9727_0060 BT9727_0061 ftsH   FALSE 0.200 225.000 0.023 1.000 N NA
 595269 595270 BT9727_0061 BT9727_0062   hslO TRUE 0.861 7.000 0.050 1.000 N NA
 595270 595271 BT9727_0062 BT9727_0063 hslO cysK TRUE 0.658 105.000 0.035 1.000 N NA
 595271 595272 BT9727_0063 BT9727_0064 cysK pabB TRUE 0.554 221.000 0.174 1.000 Y NA
 595272 595273 BT9727_0064 BT9727_0065 pabB pabA TRUE 0.980 6.000 0.090 0.013 Y NA
 595273 595274 BT9727_0065 BT9727_0066 pabA pabC TRUE 0.973 -6.000 0.090 1.000 Y NA
 595274 595275 BT9727_0066 BT9727_0067 pabC sul TRUE 0.980 -7.000 0.186 1.000 Y NA
 595275 595276 BT9727_0067 BT9727_0068 sul folB TRUE 0.976 1.000 0.273 1.000 Y NA
 595276 595277 BT9727_0068 BT9727_0069 folB folK TRUE 0.979 -3.000 0.240 1.000 Y NA
 595277 595278 BT9727_0069 BT9727_0070 folK   TRUE 0.908 -48.000 0.022 1.000 N NA
 595278 595279 BT9727_0070 BT9727_0071     TRUE 0.734 24.000 0.016 1.000 N NA
 595279 595280 BT9727_0071 BT9727_0072   lysS TRUE 0.645 160.000 0.062 1.000 Y NA
 595280 5459423 BT9727_0072 rRNA-16SrRNA_3 lysS   FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 5459423 5459424 rRNA-16SrRNA_3 rRNA-23SrRNA_3     FALSE 0.019 176.000 0.000 NA   NA
 5459424 5459425 rRNA-23SrRNA_3 rRNA-5SrRNA_3     FALSE 0.084 101.000 0.000 NA   NA
 5459425 5459426 rRNA-5SrRNA_3 tRNA-Val-5     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 5459426 5459427 tRNA-Val-5 tRNA-Thr-1     FALSE 0.248 2.000 0.000 NA   NA
 5459427 5459428 tRNA-Thr-1 tRNA-Lys-4     FALSE 0.170 11.000 0.000 NA   NA
 5459428 5459429 tRNA-Lys-4 tRNA-Leu-8     FALSE 0.144 13.000 0.000 NA   NA
 5459429 5459430 tRNA-Leu-8 tRNA-Gly-2     FALSE 0.122 27.000 0.000 NA   NA
 5459430 5459431 tRNA-Gly-2 tRNA-Leu-6     FALSE 0.133 14.000 0.000 NA   NA
 5459431 5459432 tRNA-Leu-6 tRNA-Arg-5     FALSE 0.258 1.000 0.000 NA   NA
 5459432 5459433 tRNA-Arg-5 tRNA-Pro-2     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 5459433 5459434 tRNA-Pro-2 tRNA-Ala-3     FALSE 0.198 7.000 0.000 NA   NA
 5459434 5459435 tRNA-Ala-3 rRNA-16SrRNA_4     FALSE 0.083 102.000 0.000 NA   NA
 5459435 5459436 rRNA-16SrRNA_4 rRNA-23SrRNA_4     FALSE 0.019 176.000 0.000 NA   NA
 5459436 5459437 rRNA-23SrRNA_4 rRNA-5SrRNA_4     FALSE 0.109 48.000 0.000 NA   NA
 5459437 595296 rRNA-5SrRNA_4 BT9727_0075   ctsR FALSE 0.015 204.000 0.000 NA   NA
 595296 595297 BT9727_0075 BT9727_0076 ctsR   FALSE 0.440 174.000 0.714 NA   NA
 595297 595298 BT9727_0076 BT9727_0077   karG TRUE 0.935 5.000 0.837 1.000   NA
 595298 595299 BT9727_0077 BT9727_0078 karG clpC TRUE 0.883 23.000 0.344 1.000 N NA
 595299 595300 BT9727_0078 BT9727_0079 clpC radA TRUE 0.950 97.000 0.083 0.009 Y NA
 595300 595301 BT9727_0079 BT9727_0080 radA   TRUE 0.869 4.000 0.139 1.000   NA
 595301 595302 BT9727_0080 BT9727_0081     FALSE 0.232 161.000 0.088 NA   NA
 595302 595303 BT9727_0081 BT9727_0082   ispD TRUE 0.672 17.000 0.116 NA   NA
 595303 595304 BT9727_0082 BT9727_0083 ispD ispF TRUE 0.860 115.000 0.143 1.000 Y NA
 595304 595305 BT9727_0083 BT9727_0084 ispF gltX TRUE 0.689 90.000 0.032 1.000 N NA
 595305 595306 BT9727_0084 BT9727_0085 gltX cysE FALSE 0.049 433.000 0.008 1.000 N NA
 595306 595307 BT9727_0085 BT9727_0086 cysE cysS TRUE 0.958 -19.000 0.071 0.045 N NA
 595307 595308 BT9727_0086 BT9727_0087 cysS   TRUE 0.880 3.000 0.151 1.000   NA
 595308 595309 BT9727_0087 BT9727_0088     TRUE 0.977 -3.000 0.177 0.003   NA
 595309 595310 BT9727_0088 BT9727_0089     TRUE 0.804 4.000 0.113 NA   NA
 595310 595311 BT9727_0089 BT9727_0090   spo0H TRUE 0.729 68.000 0.315 NA   NA
 595311 595312 BT9727_0090 BT9727_0091 spo0H secE FALSE 0.059 314.000 0.000 1.000 N NA
 595312 595313 BT9727_0091 BT9727_0092 secE nusG TRUE 0.813 119.000 0.829 1.000 N NA
 595313 595314 BT9727_0092 BT9727_0093 nusG rplK TRUE 0.630 168.000 0.762 1.000 N NA
 595314 595315 BT9727_0093 BT9727_0094 rplK rplA TRUE 0.880 177.000 0.831 0.017 Y NA
 595315 595316 BT9727_0094 BT9727_0095 rplA rplJ TRUE 0.764 233.000 0.377 0.017 Y NA
 595316 595317 BT9727_0095 BT9727_0096 rplJ rplL TRUE 0.978 68.000 0.888 0.013 Y NA
 595317 595318 BT9727_0096 BT9727_0097 rplL   TRUE 0.876 77.000 0.053 1.000 Y NA
 595318 595319 BT9727_0097 BT9727_0098   rpoB FALSE 0.114 294.000 0.012 1.000 N NA
 595319 595320 BT9727_0098 BT9727_0099 rpoB rpoC TRUE 0.989 38.000 0.875 0.001 Y NA
 595320 595321 BT9727_0099 BT9727_0100 rpoC   TRUE 0.618 81.000 0.037 NA N NA
 595321 595322 BT9727_0100 BT9727_0101   rpsl TRUE 0.770 115.000 0.043 NA Y NA
 595322 595323 BT9727_0101 BT9727_0102 rpsl rpsG TRUE 0.987 30.000 0.935 0.003 Y NA
 595323 595324 BT9727_0102 BT9727_0103 rpsG fusA TRUE 0.628 208.000 0.272 1.000 Y NA
 595324 595325 BT9727_0103 BT9727_0104 fusA tufA TRUE 0.962 118.000 0.221 0.001 Y NA
 595325 595326 BT9727_0104 BT9727_0105 tufA rpsJ FALSE 0.296 399.000 0.340 1.000 Y NA
 595326 595327 BT9727_0105 BT9727_0106 rpsJ rplC TRUE 0.980 35.000 0.749 0.017 Y NA
 595327 595328 BT9727_0106 BT9727_0107 rplC rplD TRUE 0.983 26.000 0.958 0.013 Y NA
 595328 595329 BT9727_0107 BT9727_0108 rplD rplW TRUE 0.994 0.000 0.904 0.013 Y NA
 595329 595330 BT9727_0108 BT9727_0109 rplW rplB TRUE 0.982 29.000 0.915 0.017 Y NA
 595330 595331 BT9727_0109 BT9727_0110 rplB rpsS TRUE 0.977 61.000 0.894 0.017 Y NA
 595331 595332 BT9727_0110 BT9727_0111 rpsS rplV TRUE 0.982 18.000 0.968 0.017 Y NA
 595332 595333 BT9727_0111 BT9727_0112 rplV rpsC TRUE 0.991 4.000 0.905 0.017 Y NA
 595333 595334 BT9727_0112 BT9727_0113 rpsC rplP TRUE 0.992 2.000 0.894 0.017 Y NA
 595334 595335 BT9727_0113 BT9727_0114 rplP rpmC TRUE 0.995 -34.000 0.868 0.013 Y NA
 595335 595336 BT9727_0114 BT9727_0115 rpmC rpsQ TRUE 0.983 21.000 0.911 0.013 Y NA
 595336 595337 BT9727_0115 BT9727_0116 rpsQ rplN TRUE 0.980 44.000 0.850 0.017 Y NA
 595337 595338 BT9727_0116 BT9727_0117 rplN rplX TRUE 0.981 39.000 0.958 0.017 Y NA
 595338 595339 BT9727_0117 BT9727_0118 rplX rplE TRUE 0.983 27.000 0.894 0.013 Y NA
 595339 595340 BT9727_0118 BT9727_0119 rplE rpsN TRUE 0.977 34.000 0.376 0.013 Y NA
 595340 595341 BT9727_0119 BT9727_0120 rpsN rpsH TRUE 0.977 30.000 0.359 0.013 Y NA
 595341 595342 BT9727_0120 BT9727_0121 rpsH rplF TRUE 0.983 33.000 0.956 0.013 Y NA
 595342 595343 BT9727_0121 BT9727_0122 rplF rplR TRUE 0.983 32.000 0.886 0.013 Y NA
 595343 595344 BT9727_0122 BT9727_0123 rplR rplR TRUE 0.982 22.000 0.973 0.017 Y NA
 595344 595345 BT9727_0123 BT9727_0124 rplR rpmD TRUE 0.983 14.000 0.782 0.017 Y NA
 595345 595346 BT9727_0124 BT9727_0125 rpmD rplO TRUE 0.987 34.000 0.677 0.002 Y NA
 595346 595347 BT9727_0125 BT9727_0126 rplO secY TRUE 0.967 0.000 0.873 1.000 N NA
 595347 595348 BT9727_0126 BT9727_0127 secY adk TRUE 0.828 57.000 0.198 1.000 N NA
 595348 595349 BT9727_0127 BT9727_0128 adk map TRUE 0.950 0.000 0.313 1.000 N NA
 595349 595350 BT9727_0128 BT9727_0129 map infA TRUE 0.884 69.000 0.058 1.000 Y NA
 595350 595351 BT9727_0129 BT9727_0130 infA rpsM TRUE 0.787 171.000 0.099 0.019 Y NA
 595351 595352 BT9727_0130 BT9727_0131 rpsM rpsK TRUE 0.980 25.000 0.530 0.013 Y NA
 595352 595353 BT9727_0131 BT9727_0132 rpsK rpoA TRUE 0.532 181.000 0.440 1.000 N NA
 595353 595354 BT9727_0132 BT9727_0133 rpoA rplQ TRUE 0.914 36.000 0.883 1.000 N NA
 595354 595355 BT9727_0133 BT9727_0134 rplQ   TRUE 0.777 44.000 0.069 1.000 N NA
 595355 595356 BT9727_0134 BT9727_0135     TRUE 0.983 -24.000 0.033 0.031 Y NA
 595356 595357 BT9727_0135 BT9727_0136     TRUE 0.973 -12.000 0.074 1.000 Y NA
 595357 595358 BT9727_0136 BT9727_0137   truA TRUE 0.887 15.000 0.333 1.000 N NA
 595358 595359 BT9727_0137 BT9727_0138 truA rplM TRUE 0.661 153.000 0.047 1.000 Y NA
 595359 595360 BT9727_0138 BT9727_0139 rplM   TRUE 0.983 22.000 0.979 0.013 Y NA
 595360 595361 BT9727_0139 BT9727_0140     FALSE 0.119 163.000 0.011 NA   NA
 595361 595362 BT9727_0140 BT9727_0141   cwlD TRUE 0.676 67.000 0.190 NA   NA
 595362 595363 BT9727_0141 BT9727_0142 cwlD mrp TRUE 0.535 145.000 0.228 NA N NA
 595367 5459438 BT9727_0146 rRNA-16SrRNA_5     FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 5459438 5459439 rRNA-16SrRNA_5 rRNA-23SrRNA_5     FALSE 0.019 176.000 0.000 NA   NA
 5459439 5459440 rRNA-23SrRNA_5 rRNA-5SrRNA_5     FALSE 0.090 86.000 0.000 NA   NA
 5459440 5459441 rRNA-5SrRNA_5 tRNA-Asn-3     FALSE 0.177 10.000 0.000 NA   NA
 5459441 5459442 tRNA-Asn-3 tRNA-Thr-3     FALSE 0.248 2.000 0.000 NA   NA
 5459442 5459443 tRNA-Thr-3 tRNA-Glu-4     FALSE 0.120 22.000 0.000 NA   NA
 5459443 5459444 tRNA-Glu-4 tRNA-Val-6     FALSE 0.236 3.000 0.000 NA   NA
 5459444 5459445 tRNA-Val-6 tRNA-Tyr-2     FALSE 0.128 15.000 0.000 NA   NA
 5459445 5459446 tRNA-Tyr-2 tRNA-Gln-4     FALSE 0.099 63.000 0.000 NA   NA
 5459446 5459447 tRNA-Gln-4 tRNA-Lys-1     FALSE 0.236 3.000 0.000 NA   NA
 5459447 5459448 tRNA-Lys-1 tRNA-Gly-6     FALSE 0.236 3.000 0.000 NA   NA
 5459448 5459449 tRNA-Gly-6 tRNA-Ala-2     FALSE 0.188 8.000 0.000 NA   NA
 5459449 595380 tRNA-Ala-2 BT9727_0148   garK FALSE 0.084 101.000 0.000 NA   NA
 595380 595381 BT9727_0148 BT9727_0149 garK rocF FALSE 0.138 210.000 0.000 1.000 N NA
 595381 595382 BT9727_0149 BT9727_0150 rocF   FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 595382 595383 BT9727_0150 BT9727_0151     TRUE 0.940 -7.000 0.554 NA   NA
 595383 595384 BT9727_0151 BT9727_0152   glmM TRUE 0.892 -7.000 0.167 NA   NA
 595384 595385 BT9727_0152 BT9727_0153 glmM glmS FALSE 0.047 486.000 0.033 1.000 N NA
 595387 595388 BT9727_0155 BT9727_0156   gntR FALSE 0.003 408.000 0.000 NA   NA
 595388 595389 BT9727_0156 BT9727_0157 gntR gntK TRUE 0.844 -7.000 0.000 1.000 N NA
 595389 595390 BT9727_0157 BT9727_0158 gntK gntP TRUE 0.896 117.000 0.417 1.000 Y NA
 595390 595391 BT9727_0158 BT9727_0159 gntP gntZ FALSE 0.255 265.000 0.000 1.000 Y NA
 595391 595392 BT9727_0159 BT9727_0160 gntZ   FALSE 0.051 340.000 0.000 1.000 N NA
 595392 595393 BT9727_0160 BT9727_0161     FALSE 0.053 119.000 0.000 NA   NA
 595394 595395 BT9727_0162 BT9727_0163     FALSE 0.010 241.000 0.000 NA   NA
 595398 595399 BT9727_0166 BT9727_0167     FALSE 0.040 133.000 0.000 NA   NA
 595399 595400 BT9727_0167 BT9727_0168     TRUE 0.763 -3.000 0.034 NA   NA
 595400 595401 BT9727_0168 BT9727_0169     FALSE 0.093 76.000 0.000 NA   NA
 595401 595402 BT9727_0169 BT9727_0170   tcaB FALSE 0.053 119.000 0.000 NA   NA
 595402 595403 BT9727_0170 BT9727_0171 tcaB   FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 595405 595406 BT9727_0173 BT9727_0174 oppB oppC TRUE 0.961 18.000 0.222 0.042 Y NA
 595406 595407 BT9727_0174 BT9727_0175 oppC oppD TRUE 0.981 -43.000 0.200 1.000 Y NA
 595407 595408 BT9727_0175 BT9727_0176 oppD oppF TRUE 0.969 -3.000 0.087 0.004   NA
 595408 595409 BT9727_0176 BT9727_0177 oppF oppA TRUE 0.733 14.000 0.087 1.000   NA
 595411 595412 BT9727_0179 BT9727_0180     FALSE 0.297 276.000 0.000 0.063 Y NA
 595412 595413 BT9727_0180 BT9727_0181     FALSE 0.493 59.000 0.045 NA   NA
 595414 595415 BT9727_0182 BT9727_0183 oppA oppA FALSE 0.187 388.000 0.000 0.042 Y NA
 595415 595416 BT9727_0183 BT9727_0184 oppA   FALSE 0.014 393.000 0.000 1.000   NA
 595416 595417 BT9727_0184 BT9727_0185   proC TRUE 0.595 2.000 0.000 1.000   NA
 595419 595420 BT9727_0187 BT9727_0188 glcU modB FALSE 0.098 302.000 0.000 0.070 N NA
 595420 595421 BT9727_0188 BT9727_0189 modB modA TRUE 0.994 6.000 0.634 0.001 Y NA
 595424 595425 BT9727_0192 BT9727_0193     FALSE 0.002 534.000 0.000 NA   NA
 595425 595426 BT9727_0193 BT9727_0194     FALSE 0.026 475.000 0.000 1.000 N NA
 595426 595427 BT9727_0194 BT9727_0195     FALSE 0.029 150.000 0.000 NA   NA
 595427 595428 BT9727_0195 BT9727_0196     FALSE 0.053 119.000 0.000 NA   NA
 595428 595429 BT9727_0196 BT9727_0197     FALSE 0.036 138.000 0.000 NA   NA
 595429 595430 BT9727_0197 BT9727_0198     FALSE 0.002 743.000 0.000 NA   NA
 595430 595431 BT9727_0198 BT9727_0199     FALSE 0.088 97.000 0.000 NA   NA
 595435 595436 BT9727_0203 BT9727_0204     FALSE 0.048 125.000 0.000 NA   NA
 595436 595437 BT9727_0204 BT9727_0205   oppA FALSE 0.006 898.000 0.000 1.000   NA
 595437 595438 BT9727_0205 BT9727_0206 oppA oppB TRUE 0.938 104.000 0.222 0.041 Y NA
 595438 595439 BT9727_0206 BT9727_0207 oppB oppC TRUE 0.974 16.000 0.667 0.041 Y NA
 595439 595440 BT9727_0207 BT9727_0208 oppC oppD TRUE 0.964 11.000 0.333 1.000 Y NA
 595440 595441 BT9727_0208 BT9727_0209 oppD oppF TRUE 0.995 -3.000 0.444 0.003 Y NA
 595445 595446 BT9727_0213 BT9727_0214 hppD   TRUE 0.784 67.000 0.111 1.000 N NA
 595446 595447 BT9727_0214 BT9727_0215     TRUE 0.969 -34.000 0.042 1.000 Y NA
 595447 595448 BT9727_0215 BT9727_0216     FALSE 0.113 234.000 0.000 1.000 N NA
 595448 595449 BT9727_0216 BT9727_0217   ddl FALSE 0.038 383.000 0.000 1.000 N NA
 595449 595450 BT9727_0217 BT9727_0218 ddl murF TRUE 0.967 61.000 0.156 0.006 Y NA
 595450 595451 BT9727_0218 BT9727_0219 murF deaD FALSE 0.144 306.000 0.079 1.000 N NA
 595451 595452 BT9727_0219 BT9727_0220 deaD   TRUE 0.796 97.000 0.000 1.000 Y NA
 595454 595455 BT9727_0222 BT9727_0223 acpS   TRUE 0.597 94.000 0.027 NA N NA
 595455 595456 BT9727_0223 BT9727_0224   alr TRUE 0.833 119.000 0.231 NA Y NA
 595456 595457 BT9727_0224 BT9727_0225 alr   FALSE 0.152 310.000 0.189 NA N NA
 595457 595458 BT9727_0225 BT9727_0226     TRUE 0.924 5.000 0.376 NA N NA
 595458 595459 BT9727_0226 BT9727_0227     TRUE 0.701 62.000 0.025 1.000 N NA
 595459 595460 BT9727_0227 BT9727_0228     FALSE 0.070 370.000 0.210 NA   NA
 595460 5459450 BT9727_0228 tRNA-Asn-1     FALSE 0.061 115.000 0.000 NA   NA
 5459450 5459451 tRNA-Asn-1 tRNA-Ser-2     FALSE 0.258 1.000 0.000 NA   NA
 5459451 5459452 tRNA-Ser-2 tRNA-Glu-1     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 5459452 5459453 tRNA-Glu-1 tRNA-Val-3     FALSE 0.248 2.000 0.000 NA   NA
 5459453 5459454 tRNA-Val-3 tRNA-Asp-4     FALSE 0.112 44.000 0.000 NA   NA
 5459454 5459455 tRNA-Asp-4 tRNA-Gln-3     FALSE 0.090 85.000 0.000 NA   NA
 5459455 5459456 tRNA-Gln-3 tRNA-Lys-5     FALSE 0.236 3.000 0.000 NA   NA
 5459456 5459457 tRNA-Lys-5 tRNA-Leu-5     FALSE 0.133 14.000 0.000 NA   NA
 5459457 5459458 tRNA-Leu-5 tRNA-Arg-3     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 5459458 595470 tRNA-Arg-3 tRNA-Pro-4     FALSE 0.248 2.000 0.000 NA   NA
 595470 5459459 tRNA-Pro-4 tRNA-Gly-3     FALSE 0.277 -1.000 0.000 NA   NA
 5459459 5459460 tRNA-Gly-3 rRNA-16SrRNA_6     FALSE 0.084 101.000 0.000 NA   NA
 5459460 5459461 rRNA-16SrRNA_6 rRNA-23SrRNA_6     FALSE 0.019 176.000 0.000 NA   NA
 5459461 5459462 rRNA-23SrRNA_6 rRNA-5SrRNA_6     FALSE 0.108 49.000 0.000 NA   NA
 5459462 5459463 rRNA-5SrRNA_6 tRNA-Met-4     FALSE 0.177 10.000 0.000 NA   NA
 5459463 5459464 tRNA-Met-4 tRNA-Asp-1     FALSE 0.258 1.000 0.000 NA   NA
 5459464 595477 tRNA-Asp-1 BT9727_0230     FALSE 0.020 172.000 0.000 NA   NA
 595477 595478 BT9727_0230 BT9727_0231     TRUE 0.888 -19.000 0.147 NA   NA
 595478 595479 BT9727_0231 BT9727_0232   rimI TRUE 0.858 14.000 0.415 1.000   NA
 595479 595480 BT9727_0232 BT9727_0233 rimI gcP TRUE 0.903 0.000 0.170 1.000   NA
 595483 595484 BT9727_0236 BT9727_0237     TRUE 0.888 -3.000 0.185 NA   NA
 595485 595486 BT9727_0238 BT9727_0239 groES groEL TRUE 0.951 39.000 0.463 1.000 Y NA
 595486 595487 BT9727_0239 BT9727_0240 groEL guaA FALSE 0.036 399.000 0.000 1.000 N NA
 595487 595488 BT9727_0240 BT9727_0241 guaA   FALSE 0.015 385.000 0.000 1.000   NA
 595488 595489 BT9727_0241 BT9727_0242     FALSE 0.130 145.000 0.000 1.000   NA
 595489 595490 BT9727_0242 BT9727_0243     TRUE 0.912 -16.000 0.000 0.021   NA
 595490 5459465 BT9727_0243 rRNA-16SrRNA_7     FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 5459465 5459466 rRNA-16SrRNA_7 rRNA-23SrRNA_7     FALSE 0.019 176.000 0.000 NA   NA
 5459466 5459467 rRNA-23SrRNA_7 rRNA-5SrRNA_7     FALSE 0.109 48.000 0.000 NA   NA
 5459467 595494 rRNA-5SrRNA_7 BT9727_0245     FALSE 0.002 724.000 0.000 NA   NA
 595494 595495 BT9727_0245 BT9727_0246   frnE FALSE 0.011 233.000 0.000 NA   NA
 595495 5459468 BT9727_0246 rRNA-16SrRNA_8 frnE   FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 5459468 5459469 rRNA-16SrRNA_8 rRNA-23SrRNA_8     FALSE 0.019 176.000 0.000 NA   NA
 5459469 5459470 rRNA-23SrRNA_8 rRNA-5SrRNA_8     FALSE 0.109 47.000 0.000 NA   NA
 5459470 595499 rRNA-5SrRNA_8 BT9727_0248   galE FALSE 0.002 486.000 0.000 NA   NA
 595499 595500 BT9727_0248 BT9727_0249 galE galE FALSE 0.328 239.000 0.000 0.002   NA
 595500 5459471 BT9727_0249 rRNA-16SrRNA_9 galE   FALSE 0.001 1135.000 0.000 NA   NA
 595504 595505 BT9727_0251 BT9727_0252 bacA bcrB FALSE 0.124 18.000 0.000 NA   NA
 595505 595506 BT9727_0252 BT9727_0253 bcrB bcrA TRUE 0.926 -16.000 0.333 NA   NA
 595506 595507 BT9727_0253 BT9727_0254 bcrA   TRUE 0.790 69.000 0.333 1.000   NA
 595507 595508 BT9727_0254 BT9727_0255     TRUE 0.944 -19.000 0.333 1.000   NA
 5459473 5459474 rRNA-16SrRNA_10 rRNA-23SrRNA_9     FALSE 0.019 176.000 0.000 NA   NA
 5459474 3396254 rRNA-23SrRNA_9 BT9727_r02     FALSE 0.109 47.000 0.000 NA   NA
 3396254 595511 BT9727_r02 BT9727_0257     FALSE 0.008 266.000 0.000 NA   NA
 3396255 5459475 BT9727_r01 rRNA-23SrRNA_10     FALSE 0.025 159.000 0.000 NA   NA
 5459475 5459476 rRNA-23SrRNA_10 rRNA-5SrRNA_10     FALSE 0.108 49.000 0.000 NA   NA
 5459476 595515 rRNA-5SrRNA_10 BT9727_0260   purE FALSE 0.002 724.000 0.000 NA   NA
 595515 595516 BT9727_0260 BT9727_0261 purE purK TRUE 0.993 -3.000 0.108 0.001 Y NA
 595516 595517 BT9727_0261 BT9727_0262 purK purB TRUE 0.967 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 595517 595518 BT9727_0262 BT9727_0263 purB purC TRUE 0.879 89.000 0.065 1.000 Y NA
 595518 595519 BT9727_0263 BT9727_0264 purC purS TRUE 0.985 -7.000 0.453 1.000 Y NA
 595519 595520 BT9727_0264 BT9727_0265 purS purQ TRUE 0.996 -3.000 0.668 0.001 Y NA
 595520 595521 BT9727_0265 BT9727_0266 purQ purL TRUE 0.996 -16.000 0.322 0.001 Y NA
 595521 595522 BT9727_0266 BT9727_0267 purL purF TRUE 0.981 -15.000 0.201 1.000 Y NA
 595522 595523 BT9727_0267 BT9727_0268 purF purM TRUE 0.892 107.000 0.189 1.000 Y NA
 595523 595524 BT9727_0268 BT9727_0269 purM purN TRUE 0.993 -3.000 0.186 0.002 Y NA
 595524 595525 BT9727_0269 BT9727_0270 purN purH TRUE 0.937 25.000 0.204 1.000 Y NA
 595525 595526 BT9727_0270 BT9727_0271 purH purD TRUE 0.857 121.000 0.229 1.000 Y NA
 595527 595528 BT9727_0272 BT9727_0273     FALSE 0.014 210.000 0.000 NA   NA
 595529 595530 BT9727_0274 BT9727_0275   pcrA TRUE 0.743 1.000 0.042 NA   NA
 595530 595531 BT9727_0275 BT9727_0276 pcrA ligA TRUE 0.966 16.000 0.087 0.010 Y NA
 595531 595532 BT9727_0276 BT9727_0277 ligA   FALSE 0.124 17.000 0.000 NA   NA
 595532 595533 BT9727_0277 BT9727_0278     FALSE 0.088 96.000 0.000 NA   NA
 595533 595534 BT9727_0278 BT9727_0279   rocA FALSE 0.212 154.000 0.005 1.000   NA
 595536 595537 BT9727_0281 BT9727_0282     TRUE 0.977 -10.000 0.130 1.000 Y NA
 595537 595538 BT9727_0282 BT9727_0283     TRUE 0.905 22.000 0.118 NA Y NA
 595539 595540 BT9727_0284 BT9727_0285   arsA FALSE 0.322 -22.000 0.000 NA   NA
 595540 595541 BT9727_0285 BT9727_0286 arsA   TRUE 0.542 77.000 0.000 1.000 N NA
 595542 595543 BT9727_0287 BT9727_0288   gatC FALSE 0.149 142.000 0.004 NA   NA
 595543 595544 BT9727_0288 BT9727_0289 gatC gatA TRUE 0.989 16.000 0.686 0.001 Y NA
 595544 595545 BT9727_0289 BT9727_0290 gatA gatB TRUE 0.989 15.000 0.502 0.001 Y NA
 595545 595546 BT9727_0290 BT9727_0291 gatB   FALSE 0.051 471.000 0.034 1.000 N NA
 595546 595547 BT9727_0291 BT9727_0292     FALSE 0.140 140.000 0.000 1.000   NA
 595547 595548 BT9727_0292 BT9727_0293   gabT FALSE 0.226 155.000 0.016 1.000   NA
 595548 595549 BT9727_0293 BT9727_0294 gabT   TRUE 0.701 113.000 0.118 1.000 N NA
 595549 595550 BT9727_0294 BT9727_0295   gadD TRUE 0.844 -7.000 0.000 1.000 N NA
 595550 595551 BT9727_0295 BT9727_0296 gadD   TRUE 0.851 48.000 0.250 1.000 N NA
 595552 595553 BT9727_0297 BT9727_0298 ampS   TRUE 0.594 117.000 0.154 1.000   NA
 595556 595557 BT9727_0301 BT9727_0302     TRUE 0.849 97.000 0.016 1.000 Y NA
 595557 595558 BT9727_0302 BT9727_0303     FALSE 0.066 301.000 0.000 1.000 N NA
 595558 595559 BT9727_0303 BT9727_0304     FALSE 0.091 78.000 0.000 NA   NA
 595559 595560 BT9727_0304 BT9727_0305     FALSE 0.003 402.000 0.000 NA   NA
 595560 595561 BT9727_0305 BT9727_0306     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 595562 595563 BT9727_0307 BT9727_0308     TRUE 0.583 15.000 0.057 NA   NA
 595566 595567 BT9727_0311 BT9727_0312 amhX   FALSE 0.028 152.000 0.000 NA   NA
 595568 595569 BT9727_0313 BT9727_0314 ahpF ahpC TRUE 0.958 15.000 0.567 1.000 Y NA
 595570 595571 BT9727_0315 BT9727_0316 mtrK   TRUE 0.840 10.000 0.157 1.000   NA
 595571 595572 BT9727_0316 BT9727_0317   fucA TRUE 0.572 55.000 0.000 1.000 N NA
 595573 595574 BT9727_0318 BT9727_0319 fhuG fhuB TRUE 0.985 -3.000 0.517 1.000 Y NA
 595574 595575 BT9727_0319 BT9727_0320 fhuB fhuD TRUE 0.933 73.000 0.345 1.000 Y NA
 595578 595579 BT9727_0323 BT9727_0324   cotB FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 595579 595580 BT9727_0324 BT9727_0325 cotB cotB FALSE 0.120 21.000 0.000 NA   NA
 595580 595581 BT9727_0325 BT9727_0326 cotB   FALSE 0.023 163.000 0.000 NA   NA
 595581 595582 BT9727_0326 BT9727_0327     FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 595582 595583 BT9727_0327 BT9727_0328     FALSE 0.001 816.000 0.000 NA   NA
 595585 595586 BT9727_0330 BT9727_0331     FALSE 0.289 122.000 0.035 NA   NA
 595587 595588 BT9727_0332 BT9727_0333     FALSE 0.108 49.000 0.000 NA   NA
 595590 595591 BT9727_0335 BT9727_0336     TRUE 0.886 146.000 0.625 0.052 Y NA
 595591 595592 BT9727_0336 BT9727_0337   glnQ TRUE 0.826 122.000 0.125 1.000 Y NA
 595592 595593 BT9727_0337 BT9727_0338 glnQ mcp FALSE 0.198 171.000 0.000 1.000 N NA
 595594 595595 BT9727_0339 BT9727_0340 mcpA argR FALSE 0.246 154.000 0.000 1.000 N NA
 595595 595596 BT9727_0340 BT9727_0341 argR arcA FALSE 0.077 281.000 0.000 1.000 N NA
 595596 595597 BT9727_0341 BT9727_0342 arcA arcB TRUE 0.916 31.000 0.086 1.000 Y NA
 595597 595598 BT9727_0342 BT9727_0343 arcB arcD TRUE 0.904 100.000 0.171 1.000 Y NA
 595598 595599 BT9727_0343 BT9727_0344 arcD arcC TRUE 0.957 38.000 0.667 1.000 Y NA
 595599 595600 BT9727_0344 BT9727_0345 arcC   FALSE 0.326 200.000 0.095 1.000 N NA
 595600 595601 BT9727_0345 BT9727_0346     FALSE 0.273 152.000 0.095 NA   NA
 595601 595602 BT9727_0346 BT9727_0347     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 595602 595603 BT9727_0347 BT9727_0348   ptsG TRUE 0.590 206.000 0.167 1.000 Y NA
 595603 595604 BT9727_0348 BT9727_0349 ptsG   TRUE 0.914 5.000 0.750 NA   NA
 595604 595605 BT9727_0349 BT9727_0350     FALSE 0.006 307.000 0.000 NA   NA
 595607 595608 BT9727_0352 BT9727_0353 thiM thiE TRUE 0.977 17.000 0.113 0.002 Y NA
 595610 595611 BT9727_0355 BT9727_0356 cheW   FALSE 0.008 264.000 0.000 NA   NA
 595611 595612 BT9727_0356 BT9727_0357     TRUE 0.929 -52.000 0.365 NA   NA
 595612 595613 BT9727_0357 BT9727_0358     TRUE 0.979 -3.000 0.379 NA Y NA
 595613 595614 BT9727_0358 BT9727_0359     TRUE 0.962 -3.000 0.076 NA Y NA
 595614 595615 BT9727_0359 BT9727_0360     FALSE 0.097 68.000 0.000 NA   NA
 595615 595616 BT9727_0360 BT9727_0361     FALSE 0.006 303.000 0.000 NA   NA
 595618 595619 BT9727_0363 BT9727_0364     FALSE 0.170 11.000 0.000 NA   NA
 595619 595620 BT9727_0364 BT9727_0365     FALSE 0.133 14.000 0.000 NA   NA
 595620 595621 BT9727_0365 BT9727_0366     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 595621 595622 BT9727_0366 BT9727_0367     TRUE 0.809 67.000 0.750 NA   NA
 595622 595623 BT9727_0367 BT9727_0368     FALSE 0.102 57.000 0.000 NA   NA
 595623 595624 BT9727_0368 BT9727_0369     FALSE 0.105 52.000 0.000 NA   NA
 595625 595626 BT9727_0370 BT9727_0371     FALSE 0.376 109.000 0.040 NA   NA
 595627 595628 BT9727_0372 BT9727_0373   proS FALSE 0.004 348.000 0.000 NA   NA
 595630 595631 BT9727_0375 BT9727_0376   terD TRUE 0.532 129.000 0.050 1.000 N NA
 595631 595632 BT9727_0376 BT9727_0377 terD terD TRUE 0.986 18.000 0.625 0.003 Y NA
 595632 595633 BT9727_0377 BT9727_0378 terD   TRUE 0.980 81.000 0.583 0.003 Y NA
 595633 595634 BT9727_0378 BT9727_0379     TRUE 0.840 74.000 0.292 1.000 N NA
 595634 595635 BT9727_0379 BT9727_0380     TRUE 0.563 110.000 0.167 NA   NA
 595635 595636 BT9727_0380 BT9727_0381     TRUE 0.833 19.000 0.615 NA   NA
 595637 595638 BT9727_0382 BT9727_0383 pacL   FALSE 0.016 192.000 0.000 NA   NA
 595639 595640 BT9727_0384 BT9727_0385 ptp   FALSE 0.387 54.000 0.008 NA   NA
 595640 595641 BT9727_0385 BT9727_0386   rbn TRUE 0.792 7.000 0.130 NA   NA
 595642 595643 BT9727_0387 BT9727_0388     FALSE 0.120 34.000 0.000 NA   NA
 595644 595645 BT9727_0389 BT9727_0390     FALSE 0.049 123.000 0.000 NA   NA
 595650 595651 BT9727_0395 BT9727_0396     FALSE 0.003 409.000 0.000 NA   NA
 595652 595653 BT9727_0397 BT9727_0398     TRUE 0.617 82.000 0.141 NA   NA
 595655 595656 BT9727_0400 BT9727_0401   fumA FALSE 0.134 207.000 0.071 NA   NA
 595656 595657 BT9727_0401 BT9727_0402 fumA   TRUE 0.638 127.000 0.136 1.000 N NA
 595657 595658 BT9727_0402 BT9727_0403   alkA TRUE 0.794 60.000 0.119 1.000 N NA
 595658 595659 BT9727_0403 BT9727_0404 alkA   TRUE 0.900 11.000 0.213 1.000 N NA
 595659 595660 BT9727_0404 BT9727_0405   truA TRUE 0.914 57.000 0.000 0.018 Y NA
 595661 595662 BT9727_0406 BT9727_0407   rocR FALSE 0.090 84.000 0.000 NA   NA
 595663 595664 BT9727_0408 BT9727_0409   rocE FALSE 0.073 107.000 0.000 NA   NA
 595664 595665 BT9727_0409 BT9727_0410 rocE argE TRUE 0.797 96.000 0.000 1.000 Y NA
 595668 595669 BT9727_0413 BT9727_0414   glsA FALSE 0.238 176.000 0.133 NA   NA
 595670 595671 BT9727_0415 BT9727_0416 nagE pbpX FALSE 0.119 228.000 0.000 1.000 N NA
 595671 595672 BT9727_0416 BT9727_0417 pbpX   FALSE 0.090 84.000 0.000 NA   NA
 595672 595673 BT9727_0417 BT9727_0418     FALSE 0.022 167.000 0.000 NA   NA
 595673 595674 BT9727_0418 BT9727_0419     FALSE 0.322 -31.000 0.000 NA   NA
 595674 595675 BT9727_0419 BT9727_0420     FALSE 0.133 14.000 0.000 NA   NA
 595675 595676 BT9727_0420 BT9727_0421     TRUE 0.936 -10.000 0.000 NA Y NA
 595676 595677 BT9727_0421 BT9727_0422   galE TRUE 0.964 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 595677 595678 BT9727_0422 BT9727_0423 galE   FALSE 0.323 -19.000 0.000 NA   NA
 595678 595679 BT9727_0423 BT9727_0424   pflB FALSE 0.005 340.000 0.000 NA   NA
 595679 595680 BT9727_0424 BT9727_0425 pflB pflA TRUE 0.759 70.000 0.083 1.000 N NA
 595680 595681 BT9727_0425 BT9727_0426 pflA ugtP FALSE 0.033 413.000 0.000 1.000 N NA
 595682 595683 BT9727_0427 BT9727_0428   hutI FALSE 0.066 242.000 0.000 NA N NA
 595683 595684 BT9727_0428 BT9727_0429 hutI   FALSE 0.389 141.000 0.087 1.000   NA
 595685 595686 BT9727_0430 BT9727_0431 recX   TRUE 0.657 10.000 0.049 NA   NA
 595686 595687 BT9727_0431 BT9727_0432     FALSE 0.034 541.000 0.161 NA   NA
 595691 595692 BT9727_0436 BT9727_0437 sspE   FALSE 0.316 189.000 0.353 NA   NA
 595692 595693 BT9727_0437 BT9727_0438     FALSE 0.104 233.000 0.069 NA   NA
 595693 595694 BT9727_0438 BT9727_0439     TRUE 0.799 55.000 0.230 NA N NA
 595695 595696 BT9727_0440 BT9727_0441   gltB FALSE 0.120 261.000 0.130 NA   NA
 595696 595697 BT9727_0441 BT9727_0442 gltB gsaB FALSE 0.243 199.000 0.020 1.000 N NA
 595698 595699 BT9727_0443 BT9727_0444     TRUE 0.951 -7.000 0.909 NA   NA
 595699 595700 BT9727_0444 BT9727_0445     TRUE 0.920 5.000 0.909 NA   NA
 595700 595701 BT9727_0445 BT9727_0446   lctB TRUE 0.667 73.000 0.188 NA   NA
 595701 595702 BT9727_0446 BT9727_0447 lctB bcp FALSE 0.482 45.000 0.031 NA   NA
 595702 595703 BT9727_0447 BT9727_0448 bcp perR FALSE 0.115 293.000 0.013 1.000 N NA
 5459477 5459478 rRNA-16SrRNA_11 rRNA-23SrRNA_11     FALSE 0.020 175.000 0.000 NA   NA
 5459478 5459479 rRNA-23SrRNA_11 rRNA-5SrRNA_11     FALSE 0.084 101.000 0.000 NA   NA
 5459479 5459480 rRNA-5SrRNA_11 tRNA-Asn-4     FALSE 0.181 9.000 0.000 NA   NA
 5459480 5459481 tRNA-Asn-4 tRNA-Ser-3     FALSE 0.270 0.000 0.000 NA   NA
 5459481 5459482 tRNA-Ser-3 tRNA-Glu-3     FALSE 0.128 15.000 0.000 NA   NA
 5459482 5459483 tRNA-Glu-3 tRNA-Val-4     FALSE 0.236 3.000 0.000 NA   NA
 5459483 5459484 tRNA-Val-4 tRNA-Met-3     FALSE 0.120 22.000 0.000 NA   NA
 5459484 5459485 tRNA-Met-3 tRNA-Asp-5     FALSE 0.258 1.000 0.000 NA   NA
 5459485 5459486 tRNA-Asp-5 tRNA-Phe-2     FALSE 0.198 7.000 0.000 NA   NA
 5459486 5459487 tRNA-Phe-2 tRNA-Thr-5     FALSE 0.125 16.000 0.000 NA   NA
 5459487 5459488 tRNA-Thr-5 tRNA-Tyr-1     FALSE 0.188 8.000 0.000 NA   NA
 5459488 5459489 tRNA-Tyr-1 tRNA-Trp-2     FALSE 0.215 5.000 0.000 NA   NA
 5459489 5459490 tRNA-Trp-2 tRNA-His-1     FALSE 0.124 17.000 0.000 NA   NA
 5459490 5459491 tRNA-His-1 tRNA-Gln-2     FALSE 0.100 61.000 0.000 NA   NA
 5459491 595720 tRNA-Gln-2 tRNA-Gly-9     FALSE 0.236 3.000 0.000 NA   NA
 595720 5459492 tRNA-Gly-9 tRNA-Cys-1     FALSE 0.159 12.000 0.000 NA   NA
 5459492 5459493 tRNA-Cys-1 tRNA-Leu-2     FALSE 0.188 8.000 0.000 NA   NA
 595724 595725 BT9727_0453 BT9727_0454   mutT FALSE 0.029 151.000 0.000 NA   NA
 595725 595726 BT9727_0454 BT9727_0455 mutT   FALSE 0.010 487.000 0.000 1.000   NA
 595726 595727 BT9727_0455 BT9727_0456   bdbD FALSE 0.231 182.000 0.071 1.000   NA
 595727 5459494 BT9727_0456 tRNA-Gly-8 bdbD   FALSE 0.059 116.000 0.000 NA   NA
 5459494 595729 tRNA-Gly-8 BT9727_0457     FALSE 0.016 196.000 0.000 NA   NA
 595729 595730 BT9727_0457 BT9727_0458     FALSE 0.465 45.000 0.026 NA   NA
 595730 595731 BT9727_0458 BT9727_0459   cspR TRUE 0.582 59.000 0.091 NA   NA
 595731 595732 BT9727_0459 BT9727_0460 cspR   FALSE 0.353 128.000 0.000 1.000 N NA
 595732 595733 BT9727_0460 BT9727_0461   prkA FALSE 0.118 392.000 0.000 1.000 Y NA
 595733 595734 BT9727_0461 BT9727_0462 prkA   FALSE 0.030 446.000 0.089 NA   NA
 595734 595735 BT9727_0462 BT9727_0463     FALSE 0.090 87.000 0.000 NA   NA
 595735 595736 BT9727_0463 BT9727_0464     FALSE 0.098 162.000 0.000 1.000   NA
 595738 595739 BT9727_0466 BT9727_0467 colA   FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 595739 595740 BT9727_0467 BT9727_0468     TRUE 0.806 13.000 0.306 NA   NA
 595740 595741 BT9727_0468 BT9727_0469   cheW FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
 595741 595742 BT9727_0469 BT9727_0470 cheW citS TRUE 0.730 152.000 0.000 0.019 Y NA
 595742 595743 BT9727_0470 BT9727_0471 citS   TRUE 0.982 0.000 0.333 0.085 Y NA
 595745 595746 BT9727_0473 BT9727_0474     FALSE 0.041 132.000 0.000 NA   NA
 595746 595747 BT9727_0474 BT9727_0475     FALSE 0.003 410.000 0.000 NA   NA
 595747 595748 BT9727_0475 BT9727_0476   glpP FALSE 0.002 559.000 0.000 NA   NA
 595748 595749 BT9727_0476 BT9727_0477 glpP   TRUE 0.846 -36.000 0.000 1.000 N NA
 595749 595750 BT9727_0477 BT9727_0478     TRUE 0.960 0.000 0.000 0.051 Y NA
 595750 595751 BT9727_0478 BT9727_0479     TRUE 0.992 -3.000 0.852 0.040 Y NA
 595751 595752 BT9727_0479 BT9727_0480     TRUE 0.972 22.000 0.615 0.040 Y NA
 595752 595753 BT9727_0480 BT9727_0481   pphA FALSE 0.013 420.000 0.000 1.000   NA
 595753 595754 BT9727_0481 BT9727_0482 pphA llrF FALSE 0.118 150.000 0.000 1.000   NA
 595754 595755 BT9727_0482 BT9727_0483 llrF   TRUE 0.973 -3.000 0.103 1.000 Y NA
 595755 595756 BT9727_0483 BT9727_0484     FALSE 0.014 207.000 0.000 NA   NA
 595756 595757 BT9727_0484 BT9727_0485     FALSE 0.188 8.000 0.000 NA   NA
 595757 595758 BT9727_0485 BT9727_0486   mcpA FALSE 0.009 254.000 0.000 NA   NA
 595758 595759 BT9727_0486 BT9727_0487 mcpA   TRUE 0.951 79.000 0.074 0.008 Y NA
 595759 595760 BT9727_0487 BT9727_0488     TRUE 0.984 -3.000 0.333 0.085 Y NA
 595760 595761 BT9727_0488 BT9727_0489   maeN TRUE 0.725 123.000 0.308 1.000 N NA
 595761 595762 BT9727_0489 BT9727_0490 maeN sfcA TRUE 0.914 60.000 0.143 1.000 Y NA
 595763 595764 BT9727_0491 BT9727_0492     FALSE 0.059 116.000 0.000 NA   NA
 595766 595767 BT9727_0494 BT9727_0495     FALSE 0.124 147.000 0.000 1.000   NA
 595767 595768 BT9727_0495 BT9727_0496   llrF TRUE 0.954 66.000 1.000 1.000 Y NA
 595768 595769 BT9727_0496 BT9727_0497 llrF   FALSE 0.017 834.000 0.000 1.000 N NA
 595769 595770 BT9727_0497 BT9727_0498   fdhD FALSE 0.117 229.000 0.000 1.000 N NA
 595771 595772 BT9727_0499 BT9727_0500 fdhF   TRUE 0.881 13.000 1.000 NA   NA
 595772 595773 BT9727_0500 BT9727_0502   glpQ FALSE 0.236 157.000 0.083 NA   NA
 595773 595774 BT9727_0502 BT9727_0503 glpQ ald FALSE 0.042 369.000 0.000 1.000 N NA
 595774 595775 BT9727_0503 BT9727_0504 ald   TRUE 0.943 104.000 1.000 1.000 Y NA
 595775 595776 BT9727_0504 BT9727_0505   arsR FALSE 0.087 267.000 0.000 1.000 N NA
 595776 595777 BT9727_0505 BT9727_0506 arsR   TRUE 0.827 25.000 0.120 1.000 N NA
 595779 595780 BT9727_0508 BT9727_0509 nprR npr FALSE 0.028 295.000 0.000 1.000   NA
 595782 595783 BT9727_0511 BT9727_0512     TRUE 0.806 16.000 0.400 NA   NA
 595785 595786 BT9727_0514 BT9727_0515     TRUE 0.865 135.000 0.200 0.047 Y NA
 595787 595788 BT9727_0516 BT9727_0517 lytR nupC FALSE 0.056 264.000 0.000 NA N NA
 595789 595790 BT9727_0518 BT9727_0519 gloA   FALSE 0.071 108.000 0.000 NA   NA
 595790 595791 BT9727_0519 BT9727_0520   aspA FALSE 0.023 163.000 0.000 NA   NA
 595793 595794 BT9727_0522 BT9727_0523 arsR sspH TRUE 0.644 123.000 0.333 1.000   NA
 595795 595796 BT9727_0524 BT9727_0525 ptr2 fecB FALSE 0.039 382.000 0.000 1.000 N NA
 595797 595798 BT9727_0526 BT9727_0527   fecD TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.040 Y NA
 595798 595799 BT9727_0527 BT9727_0528 fecD fecE TRUE 0.873 13.000 0.000 1.000 Y NA
 595801 595802 BT9727_0530 BT9727_0531 bioF   TRUE 0.815 45.000 0.125 1.000 N NA
 595802 595803 BT9727_0531 BT9727_0532   pyrE TRUE 0.534 89.000 0.000 1.000 N NA
 595803 595804 BT9727_0532 BT9727_0533 pyrE   TRUE 0.951 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 595805 595806 BT9727_0534 BT9727_0535   norQ TRUE 0.920 4.000 0.810 NA   NA
 595806 595807 BT9727_0535 BT9727_0536 norQ cls FALSE 0.173 128.000 0.000 1.000   NA
 595808 595809 BT9727_0537 BT9727_0538     FALSE 0.122 31.000 0.000 NA   NA
 595809 595810 BT9727_0538 BT9727_0539     FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 595812 595813 BT9727_0541 BT9727_0542 treR treB TRUE 0.527 142.000 0.097 1.000 N NA
 595813 595814 BT9727_0542 BT9727_0543 treB treC TRUE 0.962 14.000 0.645 1.000 Y NA
 595815 595816 BT9727_0544 BT9727_0545 gerKC gerKB TRUE 0.983 -19.000 0.500 0.008   NA
 595816 595817 BT9727_0545 BT9727_0546 gerKB gerKA TRUE 0.934 -19.000 0.000 0.008   NA
 595818 595819 BT9727_0547 BT9727_0548     FALSE 0.121 24.000 0.000 NA   NA
 595819 595820 BT9727_0548 BT9727_0549   alsT FALSE 0.025 158.000 0.000 NA   NA
 595820 595821 BT9727_0549 BT9727_0551 alsT glnQ TRUE 0.624 134.000 0.000 1.000 Y NA
 595821 595822 BT9727_0551 BT9727_0552 glnQ glnH TRUE 0.958 13.000 0.360 1.000 Y NA
 595822 595823 BT9727_0552 BT9727_0553 glnH glnP TRUE 0.944 63.000 0.180 0.050 Y NA
 595823 595824 BT9727_0553 BT9727_0554 glnP glnP TRUE 0.994 1.000 0.980 0.005 Y NA
 595824 595825 BT9727_0554 BT9727_0555 glnP rocE FALSE 0.445 205.000 0.000 0.066 Y NA
 595825 595826 BT9727_0555 BT9727_0556 rocE   TRUE 0.901 -25.000 0.009 1.000 N NA
 595826 595827 BT9727_0556 BT9727_0557     TRUE 0.562 63.000 0.000 1.000 N NA
 595827 595828 BT9727_0557 BT9727_0558   rpoD FALSE 0.182 178.000 0.000 1.000 N NA
 595828 595829 BT9727_0558 BT9727_0559 rpoD   FALSE 0.321 -34.000 0.000 NA   NA
 595832 595833 BT9727_0562 BT9727_0563 lcoS lcoR TRUE 0.969 12.000 0.667 1.000 Y NA
 595834 595835 BT9727_0564 BT9727_0565     FALSE 0.025 158.000 0.000 NA   NA
 595835 595836 BT9727_0565 BT9727_0566   uspA TRUE 0.824 66.000 0.200 1.000 N NA
 595837 595838 BT9727_0567 BT9727_0568 oppA oppC TRUE 0.947 15.000 0.064 0.039 Y NA
 595838 595839 BT9727_0568 BT9727_0569 oppC oppB TRUE 0.965 19.000 0.282 0.039 Y NA
 595839 595840 BT9727_0569 BT9727_0570 oppB oppF TRUE 0.856 15.000 0.444 1.000   NA
 595840 595841 BT9727_0570 BT9727_0571 oppF oppD TRUE 0.983 -13.000 0.371 0.004   NA
 595841 595842 BT9727_0571 BT9727_0572 oppD glpT FALSE 0.075 285.000 0.000 1.000 N NA
 595843 595844 BT9727_0573 BT9727_0574     TRUE 0.899 20.000 0.500 1.000 N NA
 595844 595845 BT9727_0574 BT9727_0575   rbsR TRUE 0.609 138.000 0.182 1.000 N NA
 595845 595846 BT9727_0575 BT9727_0576 rbsR rbsK TRUE 0.769 14.000 0.027 1.000 N NA
 595846 595847 BT9727_0576 BT9727_0577 rbsK rbsD TRUE 0.981 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 595847 595848 BT9727_0577 BT9727_0578 rbsD rbsA TRUE 0.958 19.000 0.611 1.000 Y NA
 595848 595849 BT9727_0578 BT9727_0579 rbsA rbsC TRUE 0.982 3.000 0.879 1.000 Y NA
 595849 595850 BT9727_0579 BT9727_0580 rbsC rbsB TRUE 0.953 15.000 0.712 NA Y NA
 595850 595851 BT9727_0580 BT9727_0581 rbsB tal TRUE 0.858 35.000 0.013 NA Y NA
 595851 595852 BT9727_0581 BT9727_0582 tal inA FALSE 0.023 318.000 0.000 1.000   NA
 595852 595853 BT9727_0582 BT9727_0583 inA   FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 595855 595856 BT9727_0585 BT9727_0586 adhB   FALSE 0.053 119.000 0.000 NA   NA
 595856 595857 BT9727_0586 BT9727_0587   plc FALSE 0.009 254.000 0.000 NA   NA
 595857 595858 BT9727_0587 BT9727_0588 plc spH TRUE 0.934 -61.000 0.250 1.000   NA
 595858 595859 BT9727_0588 BT9727_0589 spH   FALSE 0.399 108.000 0.045 NA   NA
 595859 595860 BT9727_0589 BT9727_0590     TRUE 0.937 -12.000 0.182 NA N NA
 595863 595864 BT9727_0593 BT9727_0594 bacA mcpC TRUE 0.617 133.000 0.154 1.000 N NA
 595865 595866 BT9727_0595 BT9727_0596     FALSE 0.279 104.000 0.000 1.000   NA
 595866 595867 BT9727_0596 BT9727_0597     FALSE 0.317 -7.000 0.000 NA   NA
 595867 595868 BT9727_0597 BT9727_0598     FALSE 0.057 117.000 0.000 NA   NA
 595870 595871 BT9727_0600 BT9727_0601 brnQ   FALSE 0.037 136.000 0.000 NA   NA
 595872 595873 BT9727_0602 BT9727_0603   proY FALSE 0.076 182.000 0.000 1.000   NA
 595874 595875 BT9727_0604 BT9727_0605     FALSE 0.145 138.000 0.000 1.000   NA
 595875 595876 BT9727_0605 BT9727_0606     FALSE 0.215 5.000 0.000 NA   NA
 595877 595878 BT9727_0607 BT9727_0608     TRUE 0.599 15.000 0.065 NA   NA
 595878 595879 BT9727_0608 BT9727_0609   napA FALSE 0.096 72.000 0.000 NA   NA
 595879 595880 BT9727_0609 BT9727_0610 napA qoxD FALSE 0.182 223.000 0.000 0.066 N NA
 595880 595881 BT9727_0610 BT9727_0611 qoxD qoxC TRUE 0.977 1.000 0.308 1.000 Y NA
 595881 595882 BT9727_0611 BT9727_0612 qoxC qoxB TRUE 0.970 14.000 0.308 0.037 Y NA
 595882 595883 BT9727_0612 BT9727_0613 qoxB qoxA TRUE 0.978 25.000 0.308 0.006 Y NA
 595883 595884 BT9727_0613 BT9727_0614 qoxA   FALSE 0.007 282.000 0.000 NA   NA
 595885 595886 BT9727_0615 BT9727_0616   amaA TRUE 0.654 132.000 1.000 NA   NA
 595886 595887 BT9727_0616 BT9727_0617 amaA   TRUE 0.822 2.000 0.111 NA   NA
 595887 595888 BT9727_0617 BT9727_0618     TRUE 0.943 -3.000 0.778 NA   NA
 595888 595889 BT9727_0618 BT9727_0619   gerLA TRUE 0.661 102.000 0.125 1.000   NA
 595889 595890 BT9727_0619 BT9727_0620 gerLA gerLB TRUE 0.980 1.000 0.800 0.008   NA
 595890 595891 BT9727_0620 BT9727_0621 gerLB gerLC TRUE 0.934 -25.000 0.000 0.008   NA
 595892 595893 BT9727_0622 BT9727_0623 feoB feoB TRUE 0.988 -22.000 0.364 0.001   NA
 595893 595894 BT9727_0623 BT9727_0624 feoB feoA TRUE 0.922 -3.000 0.216 1.000   NA
 595895 595896 BT9727_0625 BT9727_0626 pstS pstC TRUE 0.916 68.000 0.172 1.000 Y NA
 595896 595897 BT9727_0626 BT9727_0627 pstC pstA TRUE 0.995 3.000 0.849 0.002 Y NA
 595897 595898 BT9727_0627 BT9727_0628 pstA   FALSE 0.017 186.000 0.000 NA   NA
 5459495 5459496 rRNA-16SrRNA_12 rRNA-23SrRNA_12     FALSE 0.020 175.000 0.000 NA   NA
 5459496 5459497 rRNA-23SrRNA_12 rRNA-5SrRNA_12     FALSE 0.084 101.000 0.000 NA   NA
 5459497 595903 rRNA-5SrRNA_12 tRNA-Val-7     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 595903 5459498 tRNA-Val-7 tRNA-Tyr-3     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 5459498 5459499 tRNA-Tyr-3 tRNA-Gln-1     FALSE 0.181 9.000 0.000 NA   NA
 5459499 595906 tRNA-Gln-1 tRNA-Lys-6     FALSE 0.248 2.000 0.000 NA   NA
 595906 5459500 tRNA-Lys-6 tRNA-Leu-1     FALSE 0.159 12.000 0.000 NA   NA
 5459500 5459501 tRNA-Leu-1 tRNA-Gly-4     FALSE 0.122 27.000 0.000 NA   NA
 5459501 5459502 tRNA-Gly-4 tRNA-Leu-7     FALSE 0.133 14.000 0.000 NA   NA
 5459502 5459503 tRNA-Leu-7 tRNA-Arg-1     FALSE 0.258 1.000 0.000 NA   NA
 5459503 5459504 tRNA-Arg-1 tRNA-Pro-3     FALSE 0.188 8.000 0.000 NA   NA
 5459504 5459505 tRNA-Pro-3 tRNA-Ala-6     FALSE 0.133 14.000 0.000 NA   NA
 5459505 5459506 tRNA-Ala-6 tRNA-Ser-6     FALSE 0.124 18.000 0.000 NA   NA
 5459506 5459507 tRNA-Ser-6 tRNA-Ser-1     FALSE 0.104 53.000 0.000 NA   NA
 5459507 5459508 tRNA-Ser-1 tRNA-Met-6     FALSE 0.124 18.000 0.000 NA   NA
 5459508 5459509 tRNA-Met-6 tRNA-Asp-3     FALSE 0.248 2.000 0.000 NA   NA
 5459509 5459510 tRNA-Asp-3 tRNA-Phe-1     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 5459510 595918 tRNA-Phe-1 tRNA-Thr-6     FALSE 0.198 7.000 0.000 NA   NA
 595918 5459511 tRNA-Thr-6 tRNA-Trp-1     FALSE 0.224 4.000 0.000 NA   NA
 5459511 5459512 tRNA-Trp-1 tRNA-Ile-3     FALSE 0.170 11.000 0.000 NA   NA
 5459512 5459513 tRNA-Ile-3 tRNA-Asn-5     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 5459513 5459514 tRNA-Asn-5 tRNA-Glu-5     FALSE 0.277 -1.000 0.000 NA   NA
 5459514 595923 tRNA-Glu-5 BT9727_0631     FALSE 0.046 127.000 0.000 NA   NA
 595923 595924 BT9727_0631 BT9727_0632     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 595925 595926 BT9727_0633 BT9727_0634     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 595927 595928 BT9727_0635 BT9727_0636 tenA   TRUE 0.847 -31.000 0.000 1.000 N NA
 595928 595929 BT9727_0636 BT9727_0637     TRUE 0.938 0.000 0.000 1.000 Y NA
 595929 595930 BT9727_0637 BT9727_0638     TRUE 0.967 -3.000 0.116 NA Y NA
 595930 595931 BT9727_0638 BT9727_0639   thiE TRUE 0.759 11.000 0.029 NA N NA
 595931 595932 BT9727_0639 BT9727_0640 thiE goxB TRUE 0.922 -7.000 0.053 1.000 N NA
 595932 595933 BT9727_0640 BT9727_0641 goxB thiS TRUE 0.790 16.000 0.061 1.000 N NA
 595933 595934 BT9727_0641 BT9727_0642 thiS thiG TRUE 0.969 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 595934 595935 BT9727_0642 BT9727_0643 thiG thiF TRUE 0.981 -7.000 0.004 0.028 Y NA
 595935 595936 BT9727_0643 BT9727_0644 thiF thiD TRUE 0.945 16.000 0.286 1.000 Y NA
 595936 595937 BT9727_0644 BT9727_0645 thiD   FALSE 0.007 293.000 0.000 NA   NA
 595939 595940 BT9727_0647 BT9727_0648 kdpA kdpB TRUE 0.992 11.000 0.531 0.001 Y NA
 595940 595941 BT9727_0648 BT9727_0649 kdpB kdpC TRUE 0.976 17.000 0.044 0.001 Y NA
 595941 595942 BT9727_0649 BT9727_0650 kdpC kdpD TRUE 0.836 57.000 0.571 1.000   NA
 595944 595945 BT9727_0652 BT9727_0653     TRUE 0.504 129.000 0.133 1.000   NA
 595945 595946 BT9727_0653 BT9727_0654     FALSE 0.016 193.000 0.000 NA   NA
 595946 595947 BT9727_0654 BT9727_0655     FALSE 0.053 119.000 0.000 NA   NA
 595947 595948 BT9727_0655 BT9727_0656     FALSE 0.258 1.000 0.000 NA   NA
 595948 595949 BT9727_0656 BT9727_0657     FALSE 0.258 1.000 0.000 NA   NA
 595949 595950 BT9727_0657 BT9727_0658     FALSE 0.323 -19.000 0.000 NA   NA
 595951 595952 BT9727_0659 BT9727_0660 rbsC rbsA TRUE 0.989 -16.000 0.957 1.000 Y NA
 595952 595953 BT9727_0660 BT9727_0661 rbsA rbsB TRUE 0.976 0.000 0.383 NA Y NA
 595953 595954 BT9727_0661 BT9727_0662 rbsB   FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 595955 595956 BT9727_0663 BT9727_0664     TRUE 0.681 67.000 0.200 NA   NA
 595956 595957 BT9727_0664 BT9727_0665     TRUE 0.834 56.000 1.000 NA   NA
 595958 595959 BT9727_0666 BT9727_0667 scrK scrB TRUE 0.945 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 595959 595960 BT9727_0667 BT9727_0668 scrB scrA TRUE 0.930 18.000 0.139 1.000 Y NA
 595960 595961 BT9727_0668 BT9727_0669 scrA scrR TRUE 0.657 129.000 0.190 1.000 N NA
 595961 595962 BT9727_0669 BT9727_0670 scrR   FALSE 0.055 118.000 0.000 NA   NA
 595962 595963 BT9727_0670 BT9727_0671   trxA TRUE 0.734 73.000 0.333 NA   NA
 595963 595964 BT9727_0671 BT9727_0672 trxA dsbB TRUE 0.844 13.000 0.286 1.000   NA
 595964 595965 BT9727_0672 BT9727_0673 dsbB   FALSE 0.023 166.000 0.000 NA   NA
 595965 595966 BT9727_0673 BT9727_0674     FALSE 0.489 118.000 0.143 NA   NA
 595966 595967 BT9727_0674 BT9727_0675     TRUE 0.698 46.000 0.182 NA   NA
 595967 595968 BT9727_0675 BT9727_0676   gerAC TRUE 0.945 13.000 0.333 0.008   NA
 595968 595969 BT9727_0676 BT9727_0677 gerAC gerA TRUE 0.985 -3.000 1.000 0.008   NA
 595969 595970 BT9727_0677 BT9727_0678 gerA   FALSE 0.046 127.000 0.000 NA   NA
 595971 595972 BT9727_0679 BT9727_0680   spoVR FALSE 0.059 116.000 0.000 NA   NA
 595972 595973 BT9727_0680 BT9727_0681 spoVR   FALSE 0.071 108.000 0.000 NA   NA
 595973 595974 BT9727_0681 BT9727_0682     FALSE 0.020 174.000 0.000 NA   NA
 595974 595975 BT9727_0682 BT9727_0683     TRUE 0.934 -9.000 0.429 NA   NA
 595975 595976 BT9727_0683 BT9727_0684   ndh FALSE 0.002 477.000 0.000 NA   NA
 595976 595977 BT9727_0684 BT9727_0685 ndh   FALSE 0.017 186.000 0.000 NA   NA
 595977 595978 BT9727_0685 BT9727_0686     FALSE 0.090 89.000 0.000 NA   NA
 595978 595979 BT9727_0686 BT9727_0687     TRUE 0.785 39.000 0.207 1.000   NA
 595979 595980 BT9727_0687 BT9727_0688     FALSE 0.382 32.000 0.000 1.000   NA
 595980 595981 BT9727_0688 BT9727_0689     FALSE 0.489 31.000 0.000 NA N NA
 595981 595982 BT9727_0689 BT9727_0690     TRUE 0.934 15.000 0.292 NA Y NA
 595982 595983 BT9727_0690 BT9727_0691     TRUE 0.744 61.000 0.333 NA   NA
 595983 595984 BT9727_0691 BT9727_0692     FALSE 0.120 34.000 0.000 NA   NA
 595985 595986 BT9727_0693 BT9727_0694     FALSE 0.496 149.000 0.500 NA   NA
 595986 595987 BT9727_0694 BT9727_0695   trk FALSE 0.023 388.000 0.000 NA N NA
 595987 595988 BT9727_0695 BT9727_0696 trk   FALSE 0.251 267.000 0.000 1.000 Y NA
 595988 595989 BT9727_0696 BT9727_0697   norA FALSE 0.054 331.000 0.000 1.000 N NA
 595990 595991 BT9727_0698 BT9727_0699   licT FALSE 0.095 73.000 0.000 NA   NA
 595991 595992 BT9727_0699 BT9727_0700 licT celC TRUE 0.764 112.000 0.000 0.008 N NA
 595992 595993 BT9727_0700 BT9727_0701 celC celA TRUE 0.976 2.000 0.000 0.006 Y NA
 595993 595994 BT9727_0701 BT9727_0702 celA celB TRUE 0.923 83.000 0.000 0.006 Y NA
 595994 595995 BT9727_0702 BT9727_0703 celB   FALSE 0.322 -24.000 0.000 NA   NA
 595995 595996 BT9727_0703 BT9727_0704     FALSE 0.321 -10.000 0.000 NA   NA
 595997 595998 BT9727_0706 BT9727_0707     FALSE 0.002 571.000 0.000 NA   NA
 595998 595999 BT9727_0707 BT9727_0708     TRUE 0.980 3.000 1.000 NA Y NA
 595999 596000 BT9727_0708 BT9727_0709     TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000 N NA
 596001 596002 BT9727_0710 BT9727_0711   oppB FALSE 0.090 88.000 0.000 NA   NA
 596002 596003 BT9727_0711 BT9727_0712 oppB oppC TRUE 0.959 2.000 0.000 0.039 Y NA
 596004 596005 BT9727_0713 BT9727_0714 brnQ cotJC FALSE 0.126 219.000 0.000 1.000 N NA
 596005 596006 BT9727_0714 BT9727_0715 cotJC cotJB TRUE 0.863 13.000 0.375 1.000   NA
 596006 596007 BT9727_0715 BT9727_0716 cotJB cotJA TRUE 0.943 -3.000 0.778 NA   NA
 596008 596009 BT9727_0717 BT9727_0718     TRUE 0.826 15.000 0.500 NA   NA
 596011 596012 BT9727_0720 BT9727_0721   dedA FALSE 0.170 11.000 0.000 NA   NA
 596012 596013 BT9727_0721 BT9727_0722 dedA   FALSE 0.066 111.000 0.000 NA   NA
 596013 596014 BT9727_0722 BT9727_0723     FALSE 0.120 21.000 0.000 NA   NA
 596014 596015 BT9727_0723 BT9727_0724     FALSE 0.112 44.000 0.000 NA   NA
 596017 596018 BT9727_0726 BT9727_0727     TRUE 0.650 80.000 0.182 NA   NA
 596020 596021 BT9727_0729 BT9727_0730 napA   FALSE 0.047 126.000 0.000 NA   NA
 596021 596022 BT9727_0730 BT9727_0731     FALSE 0.122 30.000 0.000 NA   NA
 596022 596023 BT9727_0731 BT9727_0732     TRUE 0.743 155.000 0.089 0.001   NA
 596023 596024 BT9727_0732 BT9727_0733   scrA TRUE 0.817 24.000 0.289 1.000   NA
 596024 596025 BT9727_0733 BT9727_0734 scrA   TRUE 0.735 49.000 0.269 NA   NA
 596025 596026 BT9727_0734 BT9727_0735   yfiD FALSE 0.024 161.000 0.000 NA   NA
 596026 596027 BT9727_0735 BT9727_0736 yfiD   FALSE 0.026 156.000 0.000 NA   NA
 596027 596028 BT9727_0736 BT9727_0737     FALSE 0.270 0.000 0.000 NA   NA
 596030 596031 BT9727_0739 BT9727_0740     FALSE 0.345 129.000 0.000 1.000 N NA
 596031 596032 BT9727_0740 BT9727_0741     FALSE 0.016 1016.000 0.000 1.000 N NA
 596032 596033 BT9727_0741 BT9727_0742     TRUE 0.984 3.000 0.556 0.064 Y NA
 596033 596034 BT9727_0742 BT9727_0743     FALSE 0.339 130.000 0.000 1.000 N NA
 596034 596035 BT9727_0743 BT9727_0744   blT FALSE 0.136 211.000 0.000 1.000 N NA
 596037 596038 BT9727_0746 BT9727_0747     FALSE 0.121 20.000 0.000 NA   NA
 596041 596042 BT9727_0750 BT9727_0751     FALSE 0.010 240.000 0.000 NA   NA
 596042 596043 BT9727_0751 BT9727_0752   katB FALSE 0.380 24.000 0.000 1.000   NA
 596043 596044 BT9727_0752 BT9727_0753 katB   FALSE 0.092 204.000 0.000 NA N NA
 596044 596045 BT9727_0753 BT9727_0754   arcD TRUE 0.880 61.000 1.000 NA N NA
 596046 596047 BT9727_0755 BT9727_0756 racE   FALSE 0.064 113.000 0.000 NA   NA
 596049 596050 BT9727_0758 BT9727_0759     TRUE 0.995 -3.000 0.679 0.004 Y NA
 596050 596051 BT9727_0759 BT9727_0760     FALSE 0.154 272.000 0.000 0.049 N NA
 596051 596052 BT9727_0760 BT9727_0761     TRUE 0.986 5.000 0.680 0.049 Y NA
 596052 596053 BT9727_0761 BT9727_0762     TRUE 0.938 29.000 0.210 1.000 Y NA
 596056 596057 BT9727_0765 BT9727_0766 yheD yheC TRUE 0.849 21.000 0.867 NA   NA
 596058 596059 BT9727_0767 BT9727_0768 yheB yheA FALSE 0.192 143.000 0.026 NA   NA
 596060 596061 BT9727_0769 BT9727_0770     FALSE 0.120 22.000 0.000 NA   NA
 596062 596063 BT9727_0771 BT9727_0772 alsS alsD TRUE 0.880 17.000 0.311 1.000 N NA
 596066 596067 BT9727_0775 BT9727_0776     TRUE 0.597 75.000 0.113 NA   NA
 596068 596069 BT9727_0777 BT9727_0778 hemN fadD FALSE 0.074 315.000 0.000 0.081 N NA
 596071 596072 BT9727_0780 BT9727_0781     FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 596072 596073 BT9727_0781 BT9727_0782     FALSE 0.004 356.000 0.000 NA   NA
 596074 596075 BT9727_0783 BT9727_0784   secA TRUE 0.604 5.000 0.010 NA   NA
 596076 596077 BT9727_0785 BT9727_0786 csaA csaB TRUE 0.525 89.000 0.022 1.000   NA
 596079 596080 BT9727_0788 BT9727_0789 lytB/lytA   FALSE 0.002 542.000 0.000 NA   NA
 596082 596083 BT9727_0791 BT9727_0792 crt   FALSE 0.083 102.000 0.000 NA   NA
 596083 596084 BT9727_0792 BT9727_0793     FALSE 0.124 18.000 0.000 NA   NA
 596084 596085 BT9727_0793 BT9727_0795   yhfE FALSE 0.005 328.000 0.000 NA   NA
 596085 596086 BT9727_0795 BT9727_0796 yhfE   FALSE 0.070 235.000 0.000 NA N NA
 596086 596087 BT9727_0796 BT9727_0797     FALSE 0.224 133.000 0.000 NA N NA
 596089 596090 BT9727_0799 BT9727_0800 prdF arcB TRUE 0.900 20.000 0.037 1.000 Y NA
 596090 596091 BT9727_0800 BT9727_0801 arcB   FALSE 0.017 185.000 0.000 NA   NA
 596091 596092 BT9727_0801 BT9727_0802     FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 596092 596093 BT9727_0802 BT9727_0803     TRUE 0.854 38.000 1.000 NA   NA
 596093 596094 BT9727_0803 BT9727_0804     FALSE 0.296 -3.000 0.000 NA   NA
 596094 596095 BT9727_0804 BT9727_0805     FALSE 0.128 15.000 0.000 NA   NA
 596095 596096 BT9727_0805 BT9727_0806     FALSE 0.248 2.000 0.000 NA   NA
 596096 596097 BT9727_0806 BT9727_0807     FALSE 0.113 43.000 0.000 NA   NA
 596097 596098 BT9727_0807 BT9727_0808     FALSE 0.321 -46.000 0.000 NA   NA
 596100 596101 BT9727_0810 BT9727_0811     FALSE 0.090 84.000 0.000 NA   NA
 596101 596102 BT9727_0811 BT9727_0812     FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 596102 596103 BT9727_0812 BT9727_0813     FALSE 0.119 35.000 0.000 NA   NA
 596103 596104 BT9727_0813 BT9727_0814     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 596104 596105 BT9727_0814 BT9727_0815     FALSE 0.115 40.000 0.000 NA   NA
 596105 596106 BT9727_0815 BT9727_0816   syd FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 596106 596107 BT9727_0816 BT9727_0817 syd   FALSE 0.004 355.000 0.000 NA   NA
 596107 596108 BT9727_0817 BT9727_0818     FALSE 0.003 437.000 0.000 NA   NA
 596108 596109 BT9727_0818 BT9727_0819     FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 596109 596110 BT9727_0819 BT9727_0820     FALSE 0.004 375.000 0.000 NA   NA
 596112 596113 BT9727_0822 BT9727_0823 oppA oppB TRUE 0.893 56.000 0.000 0.038 Y NA
 596113 596114 BT9727_0823 BT9727_0824 oppB oppC TRUE 0.976 7.000 0.154 0.038 Y NA
 596114 596115 BT9727_0824 BT9727_0825 oppC oppD TRUE 0.850 27.000 0.000 1.000 Y NA
 596115 596116 BT9727_0825 BT9727_0826 oppD oppF TRUE 0.986 -16.000 0.000 0.003 Y NA
 596116 596117 BT9727_0826 BT9727_0827 oppF   FALSE 0.017 447.000 0.000 NA N NA
 596117 596118 BT9727_0827 BT9727_0828     FALSE 0.096 70.000 0.000 NA   NA
 596118 596119 BT9727_0828 BT9727_0829     FALSE 0.112 44.000 0.000 NA   NA
 596119 596120 BT9727_0829 BT9727_0830     FALSE 0.296 -3.000 0.000 NA   NA
 596120 596121 BT9727_0830 BT9727_0831     FALSE 0.270 0.000 0.000 NA   NA
 596121 596122 BT9727_0831 BT9727_0832     FALSE 0.128 15.000 0.000 NA   NA
 596122 596123 BT9727_0832 BT9727_0833     TRUE 0.821 0.000 0.091 NA   NA
 596123 596124 BT9727_0833 BT9727_0834     FALSE 0.236 3.000 0.000 NA   NA
 596124 596125 BT9727_0834 BT9727_0835     FALSE 0.002 520.000 0.000 NA   NA
 596127 596128 BT9727_0837 BT9727_0838 citS citT TRUE 0.964 20.000 0.727 0.081 Y NA
 596128 596129 BT9727_0838 BT9727_0839 citT   TRUE 0.946 -72.000 0.364 1.000   NA
 596135 596136 BT9727_0845 BT9727_0846     FALSE 0.039 134.000 0.000 NA   NA
 596136 596137 BT9727_0846 BT9727_0847     FALSE 0.104 53.000 0.000 NA   NA
 596137 596138 BT9727_0847 BT9727_0848     FALSE 0.016 193.000 0.000 NA   NA
 596138 596139 BT9727_0848 BT9727_0849   dnaB FALSE 0.322 -12.000 0.000 NA   NA
 596141 596142 BT9727_0851 BT9727_0852     FALSE 0.097 69.000 0.000 NA   NA
 596145 596146 BT9727_0855 BT9727_0856     TRUE 0.812 -18.000 0.050 NA   NA
 596146 596147 BT9727_0856 BT9727_0857     TRUE 0.911 -7.000 0.250 NA   NA
 596147 596148 BT9727_0857 BT9727_0858     FALSE 0.002 710.000 0.000 NA   NA
 596148 596149 BT9727_0858 BT9727_0859     FALSE 0.207 6.000 0.000 NA   NA
 596150 596151 BT9727_0860 BT9727_0861     FALSE 0.314 76.000 0.000 1.000   NA
 596152 596153 BT9727_0862 BT9727_0864     FALSE 0.101 58.000 0.000 NA   NA
 596154 596155 BT9727_0865 BT9727_0866     FALSE 0.128 15.000 0.000 NA   NA
 596155 596156 BT9727_0866 BT9727_0867     FALSE 0.122 31.000 0.000 NA   NA
 596156 5459515 BT9727_0867 tRNA-Cys-2     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 5459515 596158 tRNA-Cys-2 BT9727_0868     FALSE 0.003 418.000 0.000 NA   NA
 596160 596161 BT9727_0870 BT9727_0871     FALSE 0.057 117.000 0.000 NA   NA
 596161 596162 BT9727_0871 BT9727_0872     FALSE 0.004 371.000 0.000 NA   NA
 596163 596164 BT9727_0874 BT9727_0875     FALSE 0.007 291.000 0.000 NA   NA
 596165 596166 BT9727_0876 BT9727_0877 licT bglP FALSE 0.498 147.000 0.267 1.000   NA
 596166 596167 BT9727_0877 BT9727_0878 bglP bglH TRUE 0.888 96.000 0.095 1.000 Y NA
 596167 596168 BT9727_0878 BT9727_0879 bglH marR FALSE 0.229 159.000 0.000 1.000 N NA
 596168 596169 BT9727_0879 BT9727_0880 marR pssA TRUE 0.617 20.000 0.000 1.000 N NA
 596169 596170 BT9727_0880 BT9727_0881 pssA atpI FALSE 0.379 23.000 0.000 1.000   NA
 596171 596172 BT9727_0882 BT9727_0883   lytB FALSE 0.320 -118.000 0.000 NA   NA
 596172 596173 BT9727_0883 BT9727_0885 lytB   FALSE 0.081 103.000 0.000 NA   NA
 596175 596176 BT9727_0887 BT9727_0888 dhaL   TRUE 0.881 20.000 0.600 NA N NA
 596177 596178 BT9727_0889 BT9727_0890 dhaL   FALSE 0.012 223.000 0.000 NA   NA
 596181 596182 BT9727_0893 BT9727_0894     FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 596182 596183 BT9727_0894 BT9727_0896   tnpA FALSE 0.338 56.000 0.000 1.000   NA
 596184 596185 BT9727_0895 BT9727_0897     FALSE 0.006 311.000 0.000 NA   NA
 596185 596186 BT9727_0897 BT9727_0898     FALSE 0.001 815.000 0.000 NA   NA
 596188 596189 BT9727_0900 BT9727_0901     FALSE 0.042 130.000 0.000 NA   NA
 596189 596190 BT9727_0901 BT9727_0902     FALSE 0.133 14.000 0.000 NA   NA
 596190 596191 BT9727_0902 BT9727_0903     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 596192 596193 BT9727_0905 BT9727_0906     FALSE 0.011 232.000 0.000 NA   NA
 596194 596195 BT9727_0907 BT9727_0908 yflT   FALSE 0.106 51.000 0.000 NA   NA
 596195 596196 BT9727_0908 BT9727_0909   ydaS FALSE 0.093 76.000 0.000 NA   NA
 596198 596199 BT9727_0911 BT9727_0912 rsbV rsbW TRUE 0.978 7.000 0.805 1.000 Y NA
 596199 596200 BT9727_0912 BT9727_0913 rsbW sigB TRUE 0.971 -37.000 0.618 1.000 N NA
 596200 596201 BT9727_0913 BT9727_0914 sigB   TRUE 0.554 70.000 0.000 1.000 N NA
 596201 596202 BT9727_0914 BT9727_0915   rsbU FALSE 0.188 176.000 0.000 1.000 N NA
 596203 596204 BT9727_0916 BT9727_0917 cheR   TRUE 0.917 17.000 0.083 1.000 Y NA
 596204 596205 BT9727_0917 BT9727_0918     FALSE 0.014 206.000 0.000 NA   NA
 596206 596207 BT9727_0919 BT9727_0920     FALSE 0.100 61.000 0.000 NA   NA
 596207 596208 BT9727_0920 BT9727_0921     FALSE 0.033 143.000 0.000 NA   NA
 596210 596211 BT9727_0923 BT9727_0924 mrsR2 mrsK2 TRUE 0.945 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 596211 596212 BT9727_0924 BT9727_0925 mrsK2 mrsF TRUE 0.544 76.000 0.000 1.000 N NA
 596212 596213 BT9727_0925 BT9727_0926 mrsF mrsG FALSE 0.270 0.000 0.000 NA   NA
 596213 596214 BT9727_0926 BT9727_0927 mrsG mrsE TRUE 0.868 13.000 0.750 NA   NA
 596218 596219 BT9727_0931 BT9727_0932   yhaN TRUE 0.905 -3.000 0.259 NA   NA
 596219 596220 BT9727_0932 BT9727_0933 yhaN   TRUE 0.764 42.000 0.321 NA   NA
 596220 596221 BT9727_0933 BT9727_0934     FALSE 0.028 295.000 0.000 1.000   NA
 596221 596222 BT9727_0934 BT9727_0935     FALSE 0.002 504.000 0.000 NA   NA
 596222 596223 BT9727_0935 BT9727_0936     FALSE 0.105 52.000 0.000 NA   NA
 596223 596224 BT9727_0936 BT9727_0937     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 596224 596225 BT9727_0937 BT9727_0938     FALSE 0.270 0.000 0.000 NA   NA
 596225 596226