MicrobesOnline Operon Predictions for Azotobacter vinelandii

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 682251 682252         FALSE 0.396 177.000 0.000 0.056 Y NA
 682252 682253         FALSE 0.616 99.000 0.000 1.000 Y NA
 682254 682255         FALSE 0.001 836.000 0.000 NA N NA
 682255 682256         FALSE 0.052 255.000 0.012 NA N NA
 1023127 682258         FALSE 0.018 88.000 0.000 NA   NA
 682261 682262         FALSE 0.001 314.000 0.000 NA   NA
 682262 682263         FALSE 0.000 496.000 0.000 NA   NA
 682265 682266         FALSE 0.004 392.000 0.000 NA N NA
 682269 682270         FALSE 0.140 167.000 0.000 1.000 N NA
 682270 682271         FALSE 0.160 163.000 0.008 NA N NA
 682271 682272         TRUE 0.934 2.000 0.031 NA Y NA
 682273 682274         FALSE 0.014 114.000 0.000 NA   NA
 682274 682275         FALSE 0.005 171.000 0.000 NA   NA
 682277 682278         FALSE 0.005 171.000 0.000 NA   NA
 682279 682280         TRUE 0.803 -7.000 0.036 1.000   NA
 682280 682281         TRUE 0.816 -3.000 0.055 NA   NA
 682282 682283         FALSE 0.516 226.000 0.022 0.009 Y NA
 682283 682284         TRUE 0.955 33.000 0.075 0.009 Y NA
 682285 1023237         FALSE 0.050 -16.000 0.000 NA   NA
 682286 682287         TRUE 0.825 60.000 0.035 1.000 Y NA
 682287 682288         FALSE 0.027 310.000 0.000 1.000 N NA
 682294 682295         FALSE 0.285 201.000 0.051 1.000 N NA
 682296 682297         TRUE 0.902 -43.000 0.022 1.000 Y NA
 682297 682298         TRUE 0.924 43.000 0.429 NA N NA
 682299 682300         TRUE 0.879 3.000 0.088 NA   NA
 682300 682301         TRUE 0.922 -27.000 0.071 NA Y NA
 682301 682302         TRUE 0.786 5.000 0.048 NA   NA
 682302 682303         TRUE 0.980 -3.000 0.667 NA   NA
 682303 682304         FALSE 0.672 -7.000 0.036 NA   NA
 682304 682305         FALSE 0.693 10.000 0.036 NA   NA
 682305 682306         TRUE 0.877 -3.000 0.048 1.000   NA
 682306 682307         TRUE 0.799 -3.000 0.048 NA   NA
 682307 682308         FALSE 0.008 142.000 0.000 NA   NA
 682308 682309         TRUE 0.959 -15.000 0.500 NA   NA
 682311 682312         TRUE 0.749 31.000 0.039 1.000 N NA
 682312 682313         TRUE 0.925 22.000 0.078 1.000 Y NA
 682313 682314         FALSE 0.177 233.000 0.036 1.000 N NA
 682314 682315         FALSE 0.009 608.000 0.000 1.000 N NA
 1023301 682319         FALSE 0.081 -3.000 0.000 NA   NA
 682319 682320         TRUE 0.976 -3.000 0.360 NA N NA
 682321 682322         TRUE 0.918 98.000 0.194 1.000 Y NA
 682323 682324         TRUE 0.936 29.000 0.429 NA N NA
 682326 682327         FALSE 0.038 268.000 0.000 1.000 N NA
 682327 682328         TRUE 0.989 11.000 0.889 1.000 N NA
 682328 682329         FALSE 0.389 174.000 0.047 1.000 N NA
 682330 682331         TRUE 0.912 -3.000 0.041 1.000 N NA
 682331 682332         TRUE 0.991 10.000 0.507 0.079 Y NA
 682332 682333         TRUE 0.883 -3.000 0.022 1.000 N NA
 682335 1029397       pseudo FALSE 0.016 97.000 0.000 NA   NA
 1029397 1023337     pseudo   FALSE 0.000 1156.000 0.000 NA   NA
 682336 682337         TRUE 0.976 41.000 0.128 0.002 Y NA
 1023343 682339         FALSE 0.001 408.000 0.000 NA   NA
 682339 682340         FALSE 0.703 160.000 0.083 1.000 Y NA
 682340 1023347         FALSE 0.001 366.000 0.000 NA   NA
 682341 682342         FALSE 0.020 53.000 0.000 NA   NA
 682342 682343         FALSE 0.019 75.000 0.000 NA   NA
 682343 682344         FALSE 0.017 95.000 0.000 NA   NA
 682344 682345         FALSE 0.018 89.000 0.000 NA   NA
 682345 1023353         FALSE 0.000 573.000 0.000 NA   NA
 682347 1029398       pseudo FALSE 0.001 257.000 0.000 NA   NA
 1029398 682348     pseudo   FALSE 0.023 38.000 0.000 NA   NA
 682348 682349         TRUE 0.948 -3.000 0.231 NA   NA
 682354 682355         TRUE 0.852 -46.000 0.047 1.000 N NA
 682355 682356         TRUE 0.932 8.000 0.079 1.000 N NA
 682359 682360         FALSE 0.081 -3.000 0.000 NA   NA
 682360 682361         TRUE 0.969 3.000 0.400 NA   NA
 682362 682363         FALSE 0.055 12.000 0.000 NA   NA
 682363 682364         FALSE 0.002 217.000 0.000 NA   NA
 682364 682365         TRUE 0.946 -16.000 0.381 NA   NA
 682366 682367         FALSE 0.024 37.000 0.000 NA   NA
 1023384 682369         FALSE 0.001 369.000 0.000 NA   NA
 682372 1029290       rrf FALSE 0.001 264.000 0.000 NA   NA
 682374 682375         FALSE 0.000 909.000 0.000 NA   NA
 682375 682376         FALSE 0.081 -3.000 0.000 NA   NA
 682377 682378         TRUE 0.975 -3.000 0.500 NA   NA
 682378 682379         TRUE 0.980 7.000 0.750 NA   NA
 682379 682380         TRUE 0.965 23.000 1.000 NA   NA
 682381 682382         FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   NA
 682384 682385         TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 682385 682386         TRUE 0.949 44.000 1.000 NA   NA
 682386 682387         FALSE 0.088 0.000 0.000 NA   NA
 682388 682389         TRUE 0.977 -19.000 1.000 NA   NA
 682389 682390         TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 682390 682391         TRUE 0.983 -3.000 0.750 NA   NA
 682392 682393         TRUE 0.952 19.000 0.600 NA   NA
 682393 682394         TRUE 0.984 -3.000 0.833 NA   NA
 682397 682398         FALSE 0.001 368.000 0.000 NA   NA
 682398 682399         FALSE 0.286 130.000 0.041 NA   NA
 682399 1023187         FALSE 0.018 83.000 0.000 NA   NA
 1023187 1023192         FALSE 0.000 1207.000 0.000 NA   NA
 1023192 1023196         FALSE 0.020 52.000 0.000 NA   NA
 1023196 1027368         FALSE 0.000 1251.000 0.000 NA   NA
 1027368 1027369         FALSE 0.001 270.000 0.000 NA   NA
 1027369 1023217         FALSE 0.027 29.000 0.000 NA   NA
 1023217 1023220         FALSE 0.063 -6.000 0.000 NA   NA
 1023220 682400         FALSE 0.032 562.000 0.000 1.000 Y NA
 682400 1023239         FALSE 0.000 923.000 0.000 NA   NA
 1023239 1023246         FALSE 0.000 900.000 0.000 NA   NA
 1023246 1023252         FALSE 0.008 633.000 0.000 1.000 N NA
 1023252 682401         FALSE 0.000 475.000 0.000 NA   NA
 682403 682404         FALSE 0.520 148.000 0.059 1.000 N NA
 682405 682406         TRUE 0.998 3.000 0.461 0.001 Y NA
 682408 682409         FALSE 0.370 0.000 0.000 1.000   NA
 682409 682410         FALSE 0.010 242.000 0.000 1.000   NA
 682413 682414         FALSE 0.192 110.000 0.017 NA   NA
 682414 1023123         FALSE 0.048 -24.000 0.000 NA   NA
 682416 682417         TRUE 0.937 -3.000 0.129 1.000   NA
 682417 682418         TRUE 0.906 -76.000 0.181 1.000   NA
 682418 682419         FALSE 0.513 20.000 0.000 1.000 N NA
 682419 682420         FALSE 0.615 146.000 0.025 1.000 Y NA
 682421 682422         FALSE 0.082 109.000 0.000 1.000   NA
 1023138 1023140         FALSE 0.001 338.000 0.000 NA   NA
 682423 682424         FALSE 0.458 9.000 0.013 NA   NA
 682424 1028878       tRNA-Gly FALSE 0.002 246.000 0.000 NA   NA
 1028878 1028879     tRNA-Gly tRNA-Thr FALSE 0.031 24.000 0.000 NA   NA
 682425 1028880       tRNA-Trp FALSE 0.020 54.000 0.000 NA   NA
 1028880 682426     tRNA-Trp   FALSE 0.022 43.000 0.000 NA   NA
 682426 682427         TRUE 0.989 11.000 0.829 1.000 N NA
 682428 682429         TRUE 0.998 1.000 0.831 0.016 Y NA
 682429 682430         TRUE 0.875 198.000 0.377 0.016 Y NA
 682430 682431         TRUE 0.990 82.000 0.888 0.012 Y NA
 682431 682432         FALSE 0.409 215.000 0.219 1.000   NA
 682433 682434         FALSE 0.721 138.000 0.155 1.000 N NA
 682439 682440         TRUE 0.996 15.000 0.958 0.012 Y NA
 682440 682441         TRUE 0.996 -3.000 0.904 1.000 Y NA
 682442 682443         TRUE 0.995 17.000 0.894 0.016 Y NA
 682444 682445         TRUE 0.996 14.000 0.905 0.016 Y NA
 682445 682446         TRUE 0.995 15.000 0.894 0.016 Y NA
 682446 682447         TRUE 0.998 0.000 0.868 0.012 Y NA
 682449 682450         TRUE 0.996 13.000 0.958 0.016 Y NA
 682450 682451         TRUE 0.995 21.000 0.894 0.012 Y NA
 682452 682453         TRUE 0.915 184.000 0.425 0.012 Y NA
 682454 682455         TRUE 0.997 11.000 0.886 0.012 Y NA
 682455 682456         TRUE 0.998 4.000 0.973 0.016 Y NA
 682457 682458         TRUE 0.998 4.000 0.677 0.002 Y NA
 682458 682459         TRUE 0.992 1.000 0.873 1.000 N NA
 682459 682460         TRUE 0.736 29.000 0.033 1.000 N NA
 1029399 682467     pseudo   FALSE 0.003 192.000 0.000 NA   NA
 682469 1029400       pseudo FALSE 0.000 701.000 0.000 NA   NA
 1029400 682470     pseudo   FALSE 0.004 186.000 0.000 NA   NA
 682473 682474         TRUE 0.825 10.000 0.075 NA   NA
 682474 682475         TRUE 0.994 2.000 0.766 NA Y NA
 682475 682476         TRUE 0.859 101.000 0.430 NA   NA
 682478 682479         FALSE 0.098 91.000 0.000 1.000   NA
 682479 682480         TRUE 0.963 -3.000 0.333 NA   NA
 682482 682483         TRUE 0.984 16.000 0.445 1.000 Y NA
 682483 682484         TRUE 0.987 97.000 0.409 0.002 Y NA
 682484 682485         TRUE 0.986 -3.000 0.467 1.000 N NA
 682486 682487         TRUE 0.965 -7.000 0.235 1.000 N NA
 682487 682488         TRUE 0.816 -3.000 0.023 NA N NA
 682488 682489         FALSE 0.074 293.000 0.043 NA N NA
 682489 682490         FALSE 0.729 2.000 0.000 1.000 N NA
 682493 682494         FALSE 0.106 127.000 0.011 NA   NA
 682496 682497         FALSE 0.548 149.000 0.012 1.000 Y NA
 682497 682498         TRUE 0.819 61.000 0.109 1.000 N NA
 682499 682500         FALSE 0.057 176.000 0.014 NA   NA
 1023300 1023304         FALSE 0.029 25.000 0.000 NA   NA
 682502 682503         TRUE 0.992 18.000 0.287 0.002 Y NA
 682503 682504         TRUE 0.936 23.000 0.248 1.000 N NA
 682504 682505         FALSE 0.335 168.000 0.026 1.000 N NA
 682505 1023316         FALSE 0.009 138.000 0.000 NA   NA
 682507 682508         FALSE 0.000 502.000 0.000 NA   NA
 682508 682509         FALSE 0.661 39.000 0.020 1.000 N NA
 682509 1029401       pseudo FALSE 0.012 124.000 0.000 NA   NA
 682510 682511         FALSE 0.289 113.000 0.000 1.000 N NA
 682512 682513         FALSE 0.004 183.000 0.000 NA   NA
 682513 682514         FALSE 0.417 149.000 0.000 1.000 Y NA
 682516 682517         FALSE 0.010 131.000 0.000 NA   NA
 682518 682519         FALSE 0.021 49.000 0.000 NA   NA
 682519 682520         FALSE 0.000 1589.000 0.000 NA   NA
 682521 682522         FALSE 0.510 238.000 0.667 NA   NA
 682522 682523         FALSE 0.677 80.000 0.133 NA   NA
 682523 682524         FALSE 0.071 211.000 0.000 1.000 N NA
 682524 682525         TRUE 0.863 11.000 0.000 1.000 Y NA
 682525 682526         TRUE 0.993 -3.000 0.545 1.000 Y NA
 682526 682527         TRUE 0.998 0.000 0.700 0.011 Y NA
 682528 682529         FALSE 0.001 811.000 0.000 1.000   NA
 682532 682533         FALSE 0.000 699.000 0.000 NA   NA
 682534 1023352         FALSE 0.016 98.000 0.000 NA   NA
 682536 682537         TRUE 0.909 10.000 0.056 1.000 N NA
 682537 682538         FALSE 0.511 54.000 0.025 1.000   NA
 682540 1029403       pseudo FALSE 0.018 77.000 0.000 NA   NA
 1029403 682541     pseudo   FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   NA
 682542 682543         TRUE 0.925 -67.000 0.153 1.000 N NA
 682543 682544         TRUE 0.855 91.000 0.262 1.000   NA
 682544 682545         TRUE 0.960 14.000 0.407 1.000   NA
 682545 682546         TRUE 0.827 96.000 0.219 1.000   NA
 682548 682549         FALSE 0.715 35.000 0.115 NA   NA
 682549 682550         TRUE 0.872 56.000 0.185 1.000 N NA
 1028882 1028881     tRNA-Leu tRNA-Leu FALSE 0.015 108.000 0.000 NA   NA
 1028881 1023376     tRNA-Leu   FALSE 0.018 77.000 0.000 NA   NA
 682552 682553         FALSE 0.531 163.000 0.020 1.000 Y NA
 682553 682554         TRUE 0.985 29.000 0.358 0.012 Y NA
 682554 682555         FALSE 0.469 36.000 0.039 NA   NA
 682556 682557         TRUE 0.741 112.000 0.095 1.000 N NA
 682557 682558         FALSE 0.119 68.000 0.000 NA N NA
 682559 682560         FALSE 0.314 103.000 0.000 1.000 N NA
 682561 682562         FALSE 0.322 99.000 0.000 1.000 N NA
 682562 682563         TRUE 0.868 -3.000 0.044 1.000   NA
 682564 682565         FALSE 0.196 92.000 0.015 NA   NA
 682567 682568         TRUE 0.775 35.000 0.098 1.000   NA
 682569 682570         FALSE 0.001 318.000 0.000 NA   NA
 682571 682572         FALSE 0.259 124.000 0.000 1.000 N NA
 682572 682573         TRUE 0.820 28.000 0.009 1.000 Y NA
 682575 1023114         FALSE 0.035 -438.000 0.000 NA   NA
 1023114 1023118         FALSE 0.023 38.000 0.000 NA   NA
 1023118 1023121         FALSE 0.025 33.000 0.000 NA   NA
 1023121 682576         FALSE 0.036 -315.000 0.000 NA   NA
 682577 682578         TRUE 0.995 -58.000 0.863 0.001   NA
 682578 682579         TRUE 0.988 3.000 0.150 0.001   NA
 682579 682580         FALSE 0.009 138.000 0.000 NA   NA
 682580 682581         FALSE 0.002 216.000 0.000 NA   NA
 682581 682582         TRUE 0.980 -3.000 0.667 NA   NA
 682582 682583         FALSE 0.026 31.000 0.000 NA   NA
 682583 682584         FALSE 0.028 177.000 0.000 1.000   NA
 682584 682585         FALSE 0.032 169.000 0.000 1.000   NA
 682585 682586         FALSE 0.016 100.000 0.000 NA   NA
 682586 682587         FALSE 0.007 148.000 0.000 NA   NA
 682587 682588         FALSE 0.018 81.000 0.000 NA   NA
 1027370 682590         FALSE 0.018 87.000 0.000 NA   NA
 682590 1023159         FALSE 0.003 206.000 0.000 NA   NA
 682591 682592         FALSE 0.046 245.000 0.000 1.000 N NA
 682592 682593         FALSE 0.635 -7.000 0.003 1.000   NA
 682593 682594         TRUE 0.914 -10.000 0.143 1.000   NA
 682594 682595         TRUE 0.939 20.000 0.121 0.008   NA
 682595 1027371         TRUE 0.809 -3.000 0.052 NA   NA
 1027371 682596         TRUE 0.827 29.000 0.200 NA   NA
 682596 682597         TRUE 0.975 -3.000 0.102 1.000 Y NA
 682597 682598         TRUE 0.929 73.000 0.193 1.000 Y NA
 682598 682599         TRUE 0.990 2.000 0.643 1.000 N NA
 682600 682601         FALSE 0.002 223.000 0.000 NA   NA
 682602 682603         FALSE 0.037 180.000 0.008 NA   NA
 682604 682605         TRUE 0.901 -3.000 0.118 NA   NA
 682605 682606         TRUE 0.819 -60.000 0.118 NA   NA
 682606 682607         FALSE 0.081 -3.000 0.000 NA   NA
 682607 682608         FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 682608 682609         FALSE 0.050 13.000 0.000 NA   NA
 682609 682610         FALSE 0.001 284.000 0.000 NA   NA
 682610 682611         TRUE 0.742 20.000 0.087 NA   NA
 682611 682612         TRUE 0.885 31.000 0.333 NA   NA
 682612 682613         TRUE 0.973 5.000 0.500 NA   NA
 682613 682614         TRUE 0.976 12.000 0.026 0.003 Y NA
 682615 682616         FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 682616 682617         TRUE 0.771 24.000 0.125 NA   NA
 682617 682618         FALSE 0.722 5.000 0.035 NA   NA
 682618 682619         TRUE 0.830 132.000 0.082 0.008 N NA
 1023221 1023226         FALSE 0.045 14.000 0.000 NA   NA
 682620 682621         TRUE 0.872 127.000 0.090 0.004 N NA
 682622 682623         FALSE 0.680 34.000 0.094 NA   NA
 682625 682626         FALSE 0.581 -3.000 0.017 NA   NA
 682626 682627         FALSE 0.081 -3.000 0.000 NA   NA
 682629 682630         TRUE 0.885 61.000 0.000 0.003 Y NA
 682630 682631         TRUE 0.983 44.000 0.248 0.003 Y NA
 682631 682632         FALSE 0.002 526.000 0.000 1.000   NA
 682633 1023262         FALSE 0.019 66.000 0.000 NA   NA
 682635 682636         FALSE 0.471 89.000 0.023 1.000   NA
 682636 682637         TRUE 0.994 20.000 0.341 0.001 Y NA
 682639 682640         TRUE 0.882 33.000 0.333 NA   NA
 682641 682642         TRUE 0.805 -3.000 0.050 NA   NA
 682643 682644         FALSE 0.070 123.000 0.000 1.000   NA
 682644 682645         FALSE 0.421 122.000 0.000 NA Y NA
 682645 682646         TRUE 0.961 -16.000 0.375 NA N NA
 682647 682648         TRUE 0.871 10.000 0.106 NA   NA
 682650 682651         TRUE 0.976 31.000 0.500 1.000 Y NA
 682652 1029404       pseudo FALSE 0.000 594.000 0.000 NA   NA
 1029404 1023287     pseudo   FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 682653 682654         TRUE 0.996 16.000 0.786 0.003 Y NA
 682654 682655         TRUE 0.938 28.000 0.311 1.000 N NA
 682655 682656         TRUE 0.978 15.000 0.605 1.000 N NA
 682658 682659         TRUE 0.971 -25.000 0.783 NA   NA
 682659 682660         TRUE 0.790 41.000 0.190 NA   NA
 682660 682661         TRUE 0.937 87.000 0.234 1.000 Y NA
 682663 1029405       pseudo FALSE 0.036 19.000 0.000 NA   NA
 1029405 682664     pseudo   FALSE 0.014 109.000 0.000 NA   NA
 682664 682665         TRUE 0.996 3.000 0.533 0.001   NA
 682667 682668         FALSE 0.020 58.000 0.000 NA   NA
 682668 682669         TRUE 0.979 -7.000 0.206 0.099 Y NA
 682670 682671         FALSE 0.153 31.000 0.000 NA N NA
 682671 682672         FALSE 0.155 64.000 0.009 NA   NA
 682672 682673         FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 682673 682674         FALSE 0.000 1594.000 0.000 NA   NA
 682674 682675         FALSE 0.005 171.000 0.000 NA   NA
 682675 682676         FALSE 0.001 278.000 0.000 NA   NA
 682676 682677         FALSE 0.005 342.000 0.000 NA N NA
 682677 1027372         FALSE 0.002 256.000 0.000 NA   NA
 1027372 1027373         FALSE 0.021 48.000 0.000 NA   NA
 1027373 682678         FALSE 0.002 610.000 0.000 NA N NA
 682678 1029406       pseudo FALSE 0.088 0.000 0.000 NA   NA
 1029406 682679     pseudo   FALSE 0.084 2.000 0.000 NA   NA
 682680 682681         FALSE 0.017 93.000 0.000 NA   NA
 682682 682683         FALSE 0.389 157.000 0.000 1.000 Y NA
 682686 682687         TRUE 0.954 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 682687 682688         TRUE 0.985 0.000 0.400 1.000 N NA
 682688 682689         FALSE 0.000 506.000 0.000 NA   NA
 682689 682690         FALSE 0.050 145.000 0.005 NA   NA
 682692 1023350         FALSE 0.038 -133.000 0.000 NA   NA
 682693 682694         FALSE 0.172 190.000 0.064 NA   NA
 682694 682695         FALSE 0.059 297.000 0.033 1.000   NA
 682697 682698         FALSE 0.123 42.000 0.000 1.000   NA
 682698 682699         TRUE 0.970 -19.000 0.750 NA   NA
 682699 682700         TRUE 0.983 2.000 0.750 NA   NA
 682700 682701         TRUE 0.960 -13.000 0.500 NA   NA
 682701 682702         FALSE 0.088 0.000 0.000 NA   NA
 682702 682703         FALSE 0.081 -3.000 0.000 NA   NA
 682703 682704         TRUE 0.987 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 682705 682706         TRUE 0.938 -13.000 0.312 NA   NA
 682707 682708         TRUE 0.990 12.000 0.579 1.000 Y NA
 682709 682710         FALSE 0.479 24.000 0.000 1.000 N NA
 682710 682711         FALSE 0.031 572.000 0.000 1.000 Y NA
 682711 682712         TRUE 0.805 -79.000 0.000 0.098 Y NA
 682713 682714         FALSE 0.006 159.000 0.000 NA   NA
 682714 682715         FALSE 0.002 681.000 0.000 1.000   NA
 682715 1023375         FALSE 0.020 57.000 0.000 NA   NA
 682718 682719         FALSE 0.166 23.000 0.000 1.000   NA
 682719 682720         FALSE 0.157 25.000 0.000 1.000   NA
 1029407 682721     pseudo   FALSE 0.003 206.000 0.000 NA   NA
 682723 682724         FALSE 0.498 75.000 0.057 NA   NA
 682724 682725         TRUE 0.974 -3.000 0.496 NA   NA
 682725 682726         FALSE 0.005 174.000 0.000 NA   NA
 682727 1023391         FALSE 0.002 214.000 0.000 NA   NA
 682729 682730         TRUE 0.954 89.000 0.500 NA Y NA
 682730 682731         TRUE 0.979 -3.000 0.417 NA N NA
 682731 682732         FALSE 0.108 64.000 0.000 1.000   NA
 682732 682733         FALSE 0.723 109.000 0.044 0.018   NA
 682735 1023400         FALSE 0.022 43.000 0.000 NA   NA
 682736 682737         FALSE 0.000 1670.000 0.000 NA   NA
 682738 682739         FALSE 0.000 668.000 0.000 NA   NA
 682740 682741         TRUE 0.992 13.000 0.238 0.003 Y NA
 682741 1023402         FALSE 0.009 139.000 0.000 NA   NA
 682744 682745         TRUE 0.977 0.000 0.352 1.000   NA
 682745 682746         TRUE 0.993 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 682747 682748         TRUE 0.998 9.000 0.778 0.002 Y NA
 682749 682750         TRUE 0.998 -3.000 0.641 0.006 Y NA
 682750 682751         TRUE 0.998 5.000 0.808 0.003 Y NA
 682751 682752         TRUE 0.994 14.000 0.492 0.006 Y NA
 682752 682753         TRUE 0.993 15.000 0.442 0.006 Y NA
 682753 682754         TRUE 0.993 -3.000 0.198 0.006 Y NA
 682754 682755         TRUE 0.919 153.000 0.198 0.006 Y NA
 682755 682756         TRUE 0.998 -3.000 0.900 0.006 Y NA
 682756 682757         TRUE 0.996 2.000 0.358 0.006 Y NA
 682757 682758         TRUE 0.983 77.000 0.321 0.003 Y NA
 682758 682759         TRUE 0.997 11.000 0.717 0.003 Y NA
 682759 682760         FALSE 0.000 431.000 0.000 NA   NA
 682761 682762         FALSE 0.001 278.000 0.000 NA   NA
 682762 1029408       pseudo FALSE 0.003 191.000 0.000 NA   NA
 1029408 682763     pseudo   FALSE 0.038 18.000 0.000 NA   NA
 682763 682764         FALSE 0.360 79.000 0.033 NA   NA
 682764 682765         FALSE 0.616 99.000 0.109 NA   NA
 682765 682766         TRUE 0.906 -3.000 0.126 NA   NA
 682767 1023413         FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 1023413 1023414         FALSE 0.022 44.000 0.000 NA   NA
 1023414 682768         FALSE 0.010 132.000 0.000 NA   NA
 682768 682769         FALSE 0.052 569.000 0.070 1.000 N NA
 682770 682771         TRUE 0.940 30.000 0.689 NA   NA
 682772 682773         TRUE 0.753 103.000 0.088 1.000 N NA
 682774 682775         TRUE 0.860 52.000 0.055 1.000 Y NA
 682776 682777         TRUE 0.902 26.000 0.173 1.000 N NA
 682777 682778         TRUE 0.945 -55.000 0.210 1.000 N NA
 682778 682779         TRUE 0.863 -151.000 0.068 0.097 N NA
 682779 682780         FALSE 0.643 75.000 0.028 1.000 N NA
 682781 682782         TRUE 0.908 -3.000 0.074 NA N NA
 682782 682783         TRUE 0.984 -3.000 0.274 NA Y NA
 682783 682784         TRUE 0.994 0.000 0.802 NA Y NA
 682785 682786         FALSE 0.000 495.000 0.000 NA   NA
 682786 1029409       pseudo FALSE 0.088 0.000 0.000 NA   NA
 1023417 1023419         FALSE 0.019 66.000 0.000 NA   NA
 682788 1023420         FALSE 0.003 203.000 0.000 NA   NA
 682789 1027374         FALSE 0.019 67.000 0.000 NA   NA
 1027374 682790         FALSE 0.033 22.000 0.000 NA   NA
 1023421 682791         FALSE 0.055 -10.000 0.000 NA   NA
 682791 682792         FALSE 0.001 771.000 0.000 1.000   NA
 682792 682793         TRUE 0.978 28.000 0.426 0.003   NA
 682793 682794         TRUE 0.989 -3.000 0.061 0.003 Y NA
 682794 682795         FALSE 0.051 238.000 0.000 1.000 N NA
 682795 682796         FALSE 0.203 330.000 0.000 0.006 Y NA
 682796 682797         FALSE 0.719 142.000 0.000 0.006 Y NA
 682797 1023422         FALSE 0.020 56.000 0.000 NA   NA
 1023422 682798         FALSE 0.039 -103.000 0.000 NA   NA
 682798 682799         TRUE 0.927 23.000 0.316 1.000   NA
 682799 682800         FALSE 0.148 392.000 0.056 1.000 Y NA
 682800 682801         TRUE 0.997 -3.000 0.640 0.008 Y NA
 682801 682802         TRUE 0.941 4.000 0.018 1.000 Y NA
 682802 682803         FALSE 0.088 0.000 0.000 NA   NA
 682803 682804         FALSE 0.028 27.000 0.000 NA   NA
 682804 682805         FALSE 0.152 166.000 0.008 1.000   NA
 682805 682806         FALSE 0.004 360.000 0.000 1.000   NA
 682808 682809         FALSE 0.003 202.000 0.000 NA   NA
 682809 682810         TRUE 0.963 11.000 0.478 NA   NA
 682812 682813         FALSE 0.147 241.000 0.000 1.000 Y NA
 682813 682814         TRUE 0.991 -15.000 0.688 1.000 Y NA
 682814 682815         TRUE 0.979 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 682815 682816         TRUE 0.976 -3.000 0.521 NA   NA
 682816 682817         FALSE 0.549 -51.000 0.029 NA   NA
 682817 682818         FALSE 0.000 817.000 0.000 NA   NA
 682818 1027375         FALSE 0.000 832.000 0.000 NA   NA
 682819 682820         FALSE 0.670 144.000 0.133 1.000 N NA
 682820 682821         FALSE 0.005 323.000 0.000 1.000   NA
 682821 682822         TRUE 0.873 13.000 0.154 NA   NA
 682823 682824         FALSE 0.019 72.000 0.000 NA   NA
 682824 682825         TRUE 0.992 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 682825 1029289       rrs FALSE 0.001 402.000 0.000 NA   NA
 1029289 1029410     rrs pseudo FALSE 0.036 -389.000 0.000 NA   NA
 1029410 1028883     pseudo tRNA-Ile FALSE 0.003 197.000 0.000 NA   NA
 1028883 1028884     tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.022 45.000 0.000 NA   NA
 1028884 1029288     tRNA-Ala rrl FALSE 0.002 246.000 0.000 NA   NA
 1029291 1028885     rrf tRNA-Pro FALSE 0.000 528.000 0.000 NA   NA
 682827 682828         TRUE 0.974 5.000 0.000 0.002 Y NA
 682828 682829         FALSE 0.356 75.000 0.000 1.000 N NA
 682834 682835         FALSE 0.103 77.000 0.000 1.000   NA
 682835 682836         FALSE 0.104 75.000 0.000 1.000   NA
 682836 682837         TRUE 0.814 80.000 0.100 0.069 N NA
 682837 682838         FALSE 0.682 137.000 0.100 0.069 N NA
 682838 682839         TRUE 0.984 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 682839 682840         TRUE 0.964 16.000 0.182 1.000 Y NA
 682840 1029412       pseudo FALSE 0.024 36.000 0.000 NA   NA
 1029412 682841     pseudo   FALSE 0.082 3.000 0.000 NA   NA
 682841 682842         TRUE 0.904 59.000 0.263 1.000 N NA
 682842 682843         TRUE 0.962 12.000 0.500 NA   NA
 682843 682844         TRUE 0.977 0.000 0.500 NA   NA
 682844 682845         FALSE 0.004 415.000 0.000 NA N NA
 682846 682847         FALSE 0.002 218.000 0.000 NA   NA
 682847 682848         FALSE 0.000 638.000 0.000 NA   NA
 682848 682849         FALSE 0.595 82.000 0.087 NA   NA
 682850 682851         FALSE 0.669 146.000 0.141 1.000 N NA
 682851 682852         TRUE 0.879 82.000 0.070 0.064 Y NA
 682857 682858         FALSE 0.072 120.000 0.000 1.000   NA
 682859 682860         FALSE 0.167 97.000 0.013 NA   NA
 682860 682861         FALSE 0.079 267.000 0.007 1.000 N NA
 682862 682863         TRUE 0.844 75.000 0.050 1.000 Y NA
 682865 1028886       tRNA-Glu FALSE 0.007 151.000 0.000 NA   NA
 1028886 1028887     tRNA-Glu tRNA-Gly FALSE 0.082 3.000 0.000 NA   NA
 1028887 1028888     tRNA-Gly tRNA-Gly FALSE 0.013 119.000 0.000 NA   NA
 682866 682867         FALSE 0.499 99.000 0.066 NA   NA
 682868 682869         TRUE 0.990 -3.000 0.933 NA N NA
 682870 682871         TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 682875 682876         FALSE 0.157 196.000 0.063 NA   NA
 682876 682877         FALSE 0.698 108.000 0.182 NA   NA
 682877 682878         FALSE 0.387 13.000 0.013 NA   NA
 682878 1027376         TRUE 0.944 2.000 0.209 NA   NA
 682879 682880         FALSE 0.485 52.000 0.048 NA   NA
 682880 682881         TRUE 0.981 -3.000 0.675 NA   NA
 682881 682882         FALSE 0.430 32.000 0.004 NA N NA
 682882 682883         TRUE 0.795 -144.000 0.000 1.000 Y NA
 682885 682886         FALSE 0.347 87.000 0.000 1.000 N NA
 682887 682888         TRUE 0.744 101.000 0.120 0.068   NA
 682888 682889         TRUE 0.968 8.000 0.328 1.000   NA
 682889 682890         TRUE 0.798 103.000 0.132 1.000 N NA
 682890 1023434         FALSE 0.011 127.000 0.000 NA   NA
 682891 1029413       pseudo FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 1023106 682892         FALSE 0.074 119.000 0.000 1.000   NA
 682892 1029414       pseudo FALSE 0.000 502.000 0.000 NA   NA
 1029414 682893     pseudo   FALSE 0.018 85.000 0.000 NA   NA
 682894 682895         FALSE 0.044 480.000 0.000 0.004   NA
 682895 682896         FALSE 0.224 213.000 0.000 0.068 Y NA
 682897 682898         FALSE 0.621 83.000 0.025 0.096 N NA
 682899 682900         FALSE 0.081 285.000 0.083 NA   NA
 682900 1023157         FALSE 0.020 59.000 0.000 NA   NA
 682901 682902         TRUE 0.995 2.000 0.750 0.072 Y NA
 682902 682903         TRUE 0.981 34.000 0.625 0.012 N NA
 682903 682904         FALSE 0.367 61.000 0.000 1.000 N NA
 682904 682905         TRUE 0.996 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 682908 682909         FALSE 0.410 38.000 0.000 1.000 N NA
 682910 682911         FALSE 0.043 155.000 0.000 NA N NA
 682913 682914         FALSE 0.005 1432.000 0.000 1.000 N NA
 682914 682915         FALSE 0.007 710.000 0.000 1.000 N NA
 682917 682918         FALSE 0.279 181.000 0.057 1.000   NA
 682918 1023218         FALSE 0.001 320.000 0.000 NA   NA
 682919 682920         TRUE 0.798 70.000 0.156 NA N NA
 682920 682921         TRUE 0.971 -7.000 0.207 NA Y NA
 682921 682922         TRUE 0.898 63.000 0.172 NA Y NA
 682922 682923         TRUE 0.976 14.000 0.714 NA N NA
 682923 682924         FALSE 0.088 102.000 0.000 1.000   NA
 682924 682925         FALSE 0.002 754.000 0.000 0.072   NA
 682926 682927         FALSE 0.002 722.000 0.000 NA N NA
 682927 682928         FALSE 0.018 76.000 0.000 NA   NA
 682928 682929         FALSE 0.613 127.000 0.167 NA   NA
 682930 682931         FALSE 0.065 127.000 0.000 1.000   NA
 682934 682935         FALSE 0.012 236.000 0.000 1.000   NA
 682936 1029415       pseudo FALSE 0.000 446.000 0.000 NA   NA
 1029415 682937     pseudo   FALSE 0.001 271.000 0.000 NA   NA
 682941 682942         FALSE 0.378 51.000 0.000 1.000 N NA
 682942 682943         FALSE 0.010 556.000 0.000 1.000 N NA
 682943 682944         FALSE 0.353 77.000 0.000 1.000 N NA
 682944 682945         TRUE 0.926 -58.000 0.000 0.008 Y NA
 682947 682948         FALSE 0.552 51.000 0.033 1.000   NA
 1023303 1023305         FALSE 0.072 7.000 0.000 NA   NA
 682949 682950         FALSE 0.521 79.000 0.000 NA Y NA
 682951 682952         FALSE 0.695 39.000 0.061 NA N NA
 682952 682953         FALSE 0.389 143.000 0.046 NA N NA
 682953 682954         TRUE 0.803 74.000 0.169 1.000   NA
 682954 682955         FALSE 0.410 77.000 0.040 NA   NA
 682957 682958         FALSE 0.007 151.000 0.000 NA   NA
 682960 682961         TRUE 0.749 25.000 0.000 1.000 Y NA
 682961 682962         FALSE 0.723 125.000 0.104 1.000 N NA
 682962 682963         TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.001 N NA
 682965 682966         FALSE 0.056 134.000 0.000 1.000   NA
 682966 682967         TRUE 0.876 -3.000 0.087 NA   NA
 682967 682968         FALSE 0.001 396.000 0.000 NA   NA
 682970 682971         FALSE 0.002 671.000 0.000 1.000   NA
 682971 682972         FALSE 0.625 51.000 0.048 1.000   NA
 682972 682973         TRUE 0.868 76.000 0.073 1.000 Y NA
 682973 682974         FALSE 0.541 56.000 0.000 NA Y NA
 682974 1023340         FALSE 0.012 123.000 0.000 NA   NA
 682975 682976         TRUE 0.904 0.000 0.000 1.000 Y NA
 682976 682977         TRUE 0.960 -3.000 0.047 1.000 Y NA
 1023346 682979         FALSE 0.001 383.000 0.000 NA   NA
 682979 682980         FALSE 0.009 138.000 0.000 NA   NA
 682980 682981         FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 682981 682982         FALSE 0.001 277.000 0.000 NA   NA
 682982 1023351         FALSE 0.001 426.000 0.000 NA   NA
 682983 682984         TRUE 0.939 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 682984 682985         TRUE 0.982 -3.000 0.250 NA Y NA
 682985 682986         TRUE 0.942 0.000 0.038 NA Y NA
 682986 1023357         TRUE 0.929 -909.000 0.076 1.000 Y NA
 1023357 682987         TRUE 0.982 -255.000 0.396 0.003   NA
 682987 682988         TRUE 0.975 -7.000 0.720 NA   NA
 682988 682989         FALSE 0.531 65.000 0.062 NA   NA
 682989 682990         TRUE 0.985 -3.000 0.844 NA   NA
 682990 682991         FALSE 0.541 36.000 0.053 NA   NA
 682991 682992         TRUE 0.941 62.000 0.228 1.000 Y NA
 682992 682993         TRUE 0.968 17.000 0.200 0.069 Y NA
 682993 682994         TRUE 0.996 -3.000 0.180 0.001 Y NA
 1023103 682996         FALSE 0.009 139.000 0.000 NA   NA
 682996 682997         TRUE 0.749 136.000 0.000 0.005 Y NA
 682997 682998         TRUE 0.733 1.000 0.000 1.000 N NA
 682998 682999         FALSE 0.651 11.000 0.000 1.000 N NA
 682999 683000         FALSE 0.627 12.000 0.000 1.000 N NA
 683000 683001         FALSE 0.539 17.000 0.000 1.000 N NA
 683001 683002         TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 683002 683003         TRUE 0.953 13.000 0.000 0.003 Y NA
 683004 1023143         FALSE 0.015 103.000 0.000 NA   NA
 683005 683006         TRUE 0.954 11.000 0.250 1.000   NA
 683007 683008         FALSE 0.003 402.000 0.000 1.000   NA
 683009 683010         TRUE 0.998 8.000 1.000 0.015 Y NA
 683010 683011         TRUE 0.982 0.000 0.333 1.000 N NA
 683011 683012         TRUE 0.915 43.000 0.381 NA N NA
 683012 683013         TRUE 0.988 -3.000 0.400 NA Y NA
 683013 683014         TRUE 0.980 -16.000 0.286 1.000 Y NA
 6549095 6757427         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757427 6549096         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549096 6757428         TRUE NA -35.000 0.000 NA   NA
 6757428 6549097         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549097 6757429         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757429 6549098         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549098 6757430         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757430 6549099         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549099 6757431         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757431 6549100         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549100 6757432         TRUE NA -35.000 0.000 NA   NA
 6757432 6549101         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549101 6757433         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6549102 6757434         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757434 6549103         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549103 6757435         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757435 6549104         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549104 6757436         TRUE NA -35.000 0.000 NA   NA
 6757436 6549105         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549105 6757437         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757437 6549106         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549106 6757438         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757438 6549107         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549107 6757439         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757439 6549108         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549108 6757440         TRUE NA -34.000 0.000 NA   NA
 6757440 6549109         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549109 6757441         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757441 6549110         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549110 6757442         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757442 6549111         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549111 6757443         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757443 6549112         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549112 6757444         TRUE NA -34.000 0.000 NA   NA
 6757444 6549113         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549113 6757445         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757445 6549114         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549114 6757446         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757446 6549115         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549115 6757447         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6549116 6757448         TRUE NA -35.000 0.000 NA   NA
 6757448 6549117         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549117 6757449         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757449 6549118         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549118 6757450         TRUE NA -34.000 0.000 NA   NA
 6757450 6549119         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549119 6757451         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757451 6549120         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549120 6757452         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757452 6549121         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549121 6757453         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757453 6549122         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549122 6757454         TRUE NA -36.000 0.000 NA   NA
 6757454 6549123         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549123 6757455         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757455 6549124         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549124 6757456         TRUE NA -35.000 0.000 NA   NA
 6757456 6549125         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549125 6757457         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757457 6549126         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549126 6757458         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757458 6549127         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549127 6757459         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757459 6549128         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549128 6757460         TRUE NA -34.000 0.000 NA   NA
 6757460 6549129         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549129 6757461         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757461 6549130         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549130 6757462         TRUE NA -34.000 0.000 NA   NA
 6757462 6549131         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549131 6757463         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6549132 6757464         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757464 6549133         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549133 6757465         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757465 6549134         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549134 6757466         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757466 6549135         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549135 6757467         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757467 6549136         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549136 6757468         TRUE NA -35.000 0.000 NA   NA
 6757468 6549137         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549137 6757469         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757469 6549138         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549138 6757470         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757470 6549139         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549139 6757471         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757471 6549140         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549140 6757472         TRUE NA -35.000 0.000 NA   NA
 6757472 6549141         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549141 6757473         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757473 6549142         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549142 6757474         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757474 6549143         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549143 6757475         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757475 6549144         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549144 6757476         TRUE NA -34.000 0.000 NA   NA
 6757476 6549145         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549145 6757477         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757477 6549146         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549146 6757478         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757478 6549147         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549147 6757479         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757479 6549148         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549148 6757480         TRUE NA -35.000 0.000 NA   NA
 6757480 6549149         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549149 6757481         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757481 6549150         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549150 6757482         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757482 6549151         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549151 6757483         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757483 6549152         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549152 6757484         TRUE NA -32.000 0.000 NA   NA
 6757484 6549153         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549153 6757485         TRUE NA -31.000 0.000 NA   NA
 6757485 6549154         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549154 6757486         TRUE NA -33.000 0.000 NA   NA
 6757486 6549155         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 6549155 6757487         TRUE NA -25.000 0.000 NA   NA
 6757487 683015         FALSE NA 67.000 0.000 NA   NA
 683016 683017         FALSE 0.666 10.000 0.031 NA   NA
 683017 683018         TRUE 0.991 0.000 0.375 1.000 Y NA
 683018 683019         FALSE 0.009 135.000 0.000 NA   NA
 683019 683020         FALSE 0.667 -10.000 0.037 NA   NA
 683021 683022         TRUE 0.794 95.000 0.106 1.000 N NA
 683022 683023         FALSE 0.401 94.000 0.042 NA   NA
 683023 683024         TRUE 0.950 -10.000 0.375 NA   NA
 683024 683025         TRUE 0.973 -229.000 0.550 0.081 N NA
 683025 683026         FALSE 0.008 665.000 0.000 1.000 N NA
 683026 683027         TRUE 0.979 0.000 0.263 1.000 N NA
 683027 1029416       pseudo FALSE 0.015 105.000 0.000 NA   NA
 1029416 683028     pseudo   FALSE 0.004 182.000 0.000 NA   NA
 683028 1029417       pseudo FALSE 0.013 120.000 0.000 NA   NA
 1029417 683029     pseudo   FALSE 0.084 2.000 0.000 NA   NA
 683029 683030         TRUE 0.749 130.000 0.152 1.000 N NA
 683030 683031         FALSE 0.200 140.000 0.000 1.000 N NA
 683032 683033         TRUE 0.851 165.000 0.306 1.000 Y NA
 683033 683034         TRUE 0.888 133.000 0.223 1.000 Y NA
 683034 683035         TRUE 0.992 4.000 0.432 1.000 Y NA
 683035 683036         TRUE 0.970 93.000 0.609 1.000 Y NA
 683036 683037         TRUE 0.941 28.000 0.332 1.000 N NA
 683037 683038         TRUE 0.934 48.000 0.760 NA   NA
 683038 1028890       tRNA-Met FALSE 0.021 49.000 0.000 NA   NA
 1028890 1028889     tRNA-Met tRNA-Leu FALSE 0.016 97.000 0.000 NA   NA
 1028889 683039     tRNA-Leu   FALSE 0.068 9.000 0.000 NA   NA
 683039 683040         FALSE 0.215 190.000 0.017 1.000 N NA
 683040 683041         TRUE 0.959 15.000 0.306 1.000 N NA
 683041 683042         TRUE 0.914 7.000 0.053 1.000 N NA
 683042 683043         FALSE 0.358 152.000 0.048 NA N NA
 683045 683046         TRUE 0.983 -3.000 0.385 1.000 N NA
 683046 683047         TRUE 0.988 37.000 0.227 0.001 Y NA
 683047 683048         FALSE 0.486 187.000 0.039 1.000 Y NA
 683048 683049         FALSE 0.703 79.000 0.047 1.000 N NA
 683049 683050         TRUE 0.915 117.000 0.025 0.002 Y NA
 683050 683051         TRUE 0.842 142.000 0.032 0.005 Y NA
 683055 683056         TRUE 0.869 -37.000 0.168 NA   NA
 683059 683060         FALSE 0.653 148.000 0.077 NA Y NA
 683060 683061         TRUE 0.969 -3.000 0.130 NA Y NA
 683061 683062         TRUE 0.970 -3.000 0.407 NA   NA
 683062 683063         TRUE 0.944 -3.000 0.213 NA   NA
 1029296 683065     ssrA   FALSE 0.014 114.000 0.000 NA   NA
 683065 683066         FALSE 0.015 955.000 0.000 0.008   NA
 683066 1023279         FALSE 0.006 156.000 0.000 NA   NA
 1023279 1023280         FALSE 0.045 14.000 0.000 NA   NA
 683067 683068         TRUE 0.997 12.000 0.667 0.002 Y NA
 683068 683069         FALSE 0.008 269.000 0.000 1.000   NA
 683071 683072         TRUE 0.773 65.000 0.013 1.000 Y NA
 683072 683073         FALSE 0.041 480.000 0.000 1.000 Y NA
 683073 683074         FALSE 0.571 116.000 0.000 1.000 Y NA
 683074 683075         TRUE 0.970 10.000 0.115 1.000 Y NA
 683075 683076         TRUE 0.997 0.000 0.542 0.015 Y NA
 683079 683080         FALSE 0.081 -3.000 0.000 NA   NA
 683084 683085         FALSE 0.062 222.000 0.000 1.000 N NA
 683087 683088         TRUE 0.993 -3.000 0.511 0.081 Y NA
 1023133 1023134         FALSE 0.020 55.000 0.000 NA   NA
 683089 683090         TRUE 0.956 9.000 0.333 NA   NA
 683090 683091         FALSE 0.021 48.000 0.000 NA   NA
 683091 1023148         FALSE 0.002 220.000 0.000 NA   NA
 683093 683094         FALSE 0.000 463.000 0.000 NA   NA
 683097 683098         TRUE 0.941 -3.000 0.078 1.000 N NA
 683098 683099         FALSE 0.007 722.000 0.000 1.000 N NA
 683101 683102         TRUE 0.903 -81.000 0.029 1.000 Y NA
 683105 683106         FALSE 0.110 125.000 0.011 NA   NA
 683107 683108         FALSE 0.122 55.000 0.000 NA N NA
 683109 683110         FALSE 0.362 70.000 0.000 1.000 N NA
 683111 683112         FALSE 0.068 214.000 0.000 1.000 N NA
 683112 683113         TRUE 0.785 24.000 0.040 1.000 N NA
 683113 683114         FALSE 0.686 45.000 0.000 1.000 Y NA
 683116 683117         FALSE 0.404 32.000 0.028 NA   NA
 683117 683118         TRUE 0.965 -3.000 0.357 NA   NA
 683118 683119         FALSE 0.025 34.000 0.000 NA   NA
 683120 683121         TRUE 0.951 -7.000 0.168 1.000 N NA
 683121 683122         FALSE 0.015 213.000 0.000 1.000   NA
 683122 683123         FALSE 0.001 1179.000 0.000 1.000   NA
 683123 683124         TRUE 0.909 -13.000 0.058 0.037   NA
 683124 683125         FALSE 0.690 -3.000 0.027 NA   NA
 683125 1023233         FALSE 0.034 21.000 0.000 NA   NA
 1023233 683126         TRUE 0.798 14.000 0.092 NA   NA
 683126 683127         TRUE 0.972 5.000 0.224 1.000 N NA
 683127 683128         FALSE 0.391 149.000 0.024 1.000 N NA
 683128 1027379         TRUE 0.878 12.000 0.147 NA   NA
 1027379 683129         TRUE 0.750 159.000 0.544 NA   NA
 683129 683130         TRUE 0.993 9.000 0.897 NA Y NA
 683130 683131         TRUE 0.959 33.000 0.766 NA N NA
 683131 683132         FALSE 0.040 -102.000 0.000 NA   NA
 683132 683133         FALSE 0.001 280.000 0.000 NA   NA
 683135 683136         FALSE 0.606 -16.000 0.033 NA   NA
 683139 1029418       pseudo FALSE 0.088 0.000 0.000 NA   NA
 1029418 683140     pseudo   FALSE 0.011 127.000 0.000 NA   NA
 683141 683142         FALSE 0.010 259.000 0.000 NA N NA
 683142 1029419       pseudo FALSE 0.001 316.000 0.000 NA   NA
 1029419 683143     pseudo   FALSE 0.019 72.000 0.000 NA   NA
 683143 1023267         FALSE 0.037 -208.000 0.000 NA   NA
 1029420 683144     pseudo   FALSE 0.084 2.000 0.000 NA   NA
 683144 683145         FALSE 0.006 156.000 0.000 NA   NA
 683145 683146         TRUE 0.910 12.000 0.200 NA   NA
 683146 1023270         FALSE 0.000 483.000 0.000 NA   NA
 683147 683148         FALSE 0.259 124.000 0.000 1.000 N NA
 683150 683151         FALSE 0.019 570.000 0.000 NA Y NA
 683151 683152         FALSE 0.002 233.000 0.000 NA   NA
 683152 683153         FALSE 0.005 172.000 0.000 NA   NA
 683153 683154         FALSE 0.038 -135.000 0.000 NA   NA
 683154 683155         FALSE 0.286 325.000 0.117 1.000 Y NA
 683156 683157         TRUE 0.986 0.000 0.208 1.000 Y NA
 683157 683158         FALSE 0.506 -3.000 0.013 NA   NA
 683158 683159         FALSE 0.693 14.000 0.051 NA   NA
 683159 683160         TRUE 0.969 -3.000 0.128 NA Y NA
 683160 683161         TRUE 0.967 -3.000 0.118 NA Y NA
 683161 683162         FALSE 0.013 781.000 0.000 NA Y NA
 683162 683163         FALSE 0.267 159.000 0.000 NA Y NA
 683163 683164         FALSE 0.607 31.000 0.000 NA Y NA
 683164 683165         FALSE 0.081 -3.000 0.000 NA   NA
 683165 683166         FALSE 0.050 13.000 0.000 NA   NA
 683166 683167         FALSE 0.352 -3.000 0.000 1.000   NA
 683168 683169         FALSE 0.011 129.000 0.000 NA   NA
 683169 683170         FALSE 0.004 189.000 0.000 NA   NA
 683172 683173         FALSE 0.700 29.000 0.095 NA   NA
 683173 683174         FALSE 0.006 165.000 0.000 NA   NA
 683174 683175         FALSE 0.005 169.000 0.000 NA   NA
 683175 683176         TRUE 0.846 2.000 0.065 NA   NA
 683176 683177         FALSE 0.009 138.000 0.000 NA   NA
 683177 683178         FALSE 0.018 83.000 0.000 NA