For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.
Also see:
| Column | Description |
| Gene1 | VIMSS id of 1st gene in pair |
| SysName1 | Systematic name of 1st gene in pair |
| Name1 | Ordinary name of 1st gene in pair |
| Gene2 | VIMSS id of 2nd gene in pair |
| SysName2 | Systematic name of 2nd gene in pair |
| Name2 | Ordinary name of 2nd gene in pair |
| bOp | Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not |
| pOp | Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions. |
| Sep | Distance between the two genes, in base pairs |
| MOGScore | Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved) |
| GOScore | Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized |
| COGSim | Whether the genes share a COG category or not |
| ExprSim | Correlation of expression patterns (not available for most genomes) |
| Gene1 | Gene2 | SysName1 | SysName2 | Name1 | Name2 | bOp | pOp | Sep | MOGScore | GOScore | COGSim | ExprSim |
| 2123336 | 2123337 | APL_0001 | APL_0002 | dnaA | dnaN | TRUE | 0.996 | 17.000 | 0.273 | 1.000 | Y | NA |
| 2123337 | 2123338 | APL_0002 | APL_0003 | dnaN | recF | TRUE | 0.821 | 334.000 | 0.344 | 1.000 | Y | NA |
| 2123342 | 2123343 | APL_0007 | APL_0008 | lpxB | sohB | TRUE | 0.663 | 30.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 2123343 | 2123344 | APL_0008 | APL_0009 | sohB | FALSE | 0.046 | 235.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123344 | 2123345 | APL_0009 | APL_0010 | mraW | TRUE | 0.996 | 26.000 | 0.586 | NA | NA | ||
| 2123345 | 2123346 | APL_0010 | APL_0011 | mraW | ftsL | TRUE | 0.992 | 13.000 | 0.229 | 1.000 | N | NA |
| 2123346 | 2123347 | APL_0011 | APL_0012 | ftsL | ftsI | TRUE | 0.974 | 4.000 | 0.057 | 1.000 | N | NA |
| 2123347 | 2123348 | APL_0012 | APL_0013 | ftsI | murE | TRUE | 0.950 | 24.000 | 0.013 | 1.000 | Y | NA |
| 2123348 | 2123349 | APL_0013 | APL_0014 | murE | murF | TRUE | 0.843 | 215.000 | 0.163 | 0.005 | Y | NA |
| 2123349 | 2123350 | APL_0014 | APL_0015 | murF | mraY | TRUE | 0.967 | 97.000 | 0.163 | 0.008 | Y | NA |
| 2123350 | 2123351 | APL_0015 | APL_0016 | mraY | murD | TRUE | 0.998 | 84.000 | 0.726 | 0.008 | Y | NA |
| 2123351 | 2123352 | APL_0016 | APL_0017 | murD | ftsW | TRUE | 0.999 | 2.000 | 0.386 | 0.007 | N | NA |
| 2123352 | 2123353 | APL_0017 | APL_0018 | ftsW | murG | TRUE | 0.876 | 155.000 | 0.458 | 1.000 | N | NA |
| 2123353 | 2123354 | APL_0018 | APL_0019 | murG | murC | TRUE | 0.990 | 52.000 | 0.460 | 1.000 | Y | NA |
| 2123354 | 2123355 | APL_0019 | APL_0020 | murC | ddlB | TRUE | 0.921 | 108.000 | 0.067 | 0.008 | Y | NA |
| 2123355 | 2123356 | APL_0020 | APL_0021 | ddlB | ftsQ | TRUE | 0.950 | 141.000 | 0.410 | NA | Y | NA |
| 2123356 | 2123357 | APL_0021 | APL_0022 | ftsQ | ftsA | TRUE | 0.991 | 26.000 | 0.423 | NA | N | NA |
| 2123357 | 2123358 | APL_0022 | APL_0023 | ftsA | ftsZ | TRUE | 0.995 | 39.000 | 0.495 | 1.000 | Y | NA |
| 2123358 | 2123359 | APL_0023 | APL_0024 | ftsZ | lpxC | TRUE | 0.936 | 34.000 | 0.149 | 1.000 | N | NA |
| 2123359 | 2123360 | APL_0024 | APL_0025 | lpxC | recN | FALSE | 0.095 | 162.000 | 0.004 | 1.000 | N | NA |
| 2123361 | 2123362 | APL_0026 | APL_0027 | TRUE | 0.997 | 0.000 | 0.350 | 1.000 | NA | |||
| 2123362 | 2123363 | APL_0027 | APL_0028 | TRUE | 0.999 | 3.000 | 0.472 | 0.048 | Y | NA | ||
| 2123363 | 2123364 | APL_0028 | APL_0029 | TRUE | 0.983 | 94.000 | 0.429 | 0.048 | Y | NA | ||
| 2123364 | 2123365 | APL_0029 | APL_0030 | prfC | FALSE | 0.032 | 194.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123366 | 2123367 | APL_0031 | APL_0032 | yhaH | FALSE | 0.294 | 47.000 | 0.000 | 0.087 | NA | ||
| 2123367 | 2123368 | APL_0032 | APL_0033 | yhaH | pth | FALSE | 0.134 | 127.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 2123368 | 2123369 | APL_0033 | APL_0034 | pth | engD | TRUE | 0.942 | 109.000 | 0.237 | 1.000 | Y | NA |
| 2123369 | 2123370 | APL_0034 | APL_0035 | engD | FALSE | 0.293 | 72.000 | 0.003 | NA | N | NA | |
| 2123371 | 2123372 | APL_0036 | APL_0037 | slyB | TRUE | 0.550 | 31.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123372 | 2123373 | APL_0037 | APL_0038 | slyB | TRUE | 0.911 | 27.000 | 0.047 | NA | NA | ||
| 2123374 | 2123375 | APL_0039 | APL_0040 | argS | yhbZ | FALSE | 0.146 | 144.000 | 0.003 | 1.000 | NA | |
| 2123375 | 2123376 | APL_0040 | APL_0041 | yhbZ | FALSE | 0.270 | 75.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123377 | 2123378 | APL_0042 | APL_0043 | rlmB | pssA | FALSE | 0.283 | 79.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 2123378 | 2123379 | APL_0043 | APL_0044 | pssA | ileS | FALSE | 0.177 | 152.000 | 0.011 | 1.000 | N | NA |
| 2123379 | 2123380 | APL_0044 | APL_0045 | ileS | ribF | TRUE | 0.886 | 61.000 | 0.194 | 1.000 | N | NA |
| 2123381 | 2123382 | APL_0046 | APL_0047 | nadR | TRUE | 0.988 | -3.000 | 0.113 | 1.000 | NA | ||
| 2123382 | 2123383 | APL_0047 | APL_0048 | arcA | FALSE | 0.264 | 173.000 | 0.032 | 1.000 | NA | ||
| 2123383 | 2123384 | APL_0048 | APL_0049 | arcA | FALSE | 0.223 | 52.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123385 | 2123386 | APL_0050 | APL_0051 | FALSE | 0.045 | 238.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123387 | 2123388 | APL_0052 | APL_0053 | typA | FALSE | 0.066 | 333.000 | 0.003 | NA | NA | ||
| 2123388 | 2123389 | APL_0053 | APL_0054 | typA | grxA | FALSE | 0.115 | 159.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 2123391 | 2123392 | APL_0056 | APL_0057 | yicC | TRUE | 0.956 | 9.000 | 0.014 | NA | NA | ||
| 2123393 | 2123394 | APL_0058 | APL_0059 | yfhL | narP | FALSE | 0.248 | 146.000 | 0.013 | 1.000 | NA | |
| 2123395 | 2123396 | APL_0060 | APL_0061 | yibK | TRUE | 0.489 | 58.000 | 0.010 | 1.000 | N | NA | |
| 2123398 | 2123399 | APL_2109 | APL_2047 | FALSE | 0.257 | 87.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123399 | 2123400 | APL_2047 | APL_2048 | FALSE | 0.353 | 52.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123400 | 2123401 | APL_2048 | APL_2115 | FALSE | 0.042 | 267.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123401 | 2123402 | APL_2115 | APL_2121 | FALSE | 0.076 | 166.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123402 | 2123403 | APL_2121 | APL_0063 | dppA | FALSE | 0.038 | 381.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123403 | 2123404 | APL_0063 | APL_0064 | dppA | dppA | FALSE | 0.286 | 168.000 | 0.000 | 0.048 | Y | NA |
| 2123404 | 2123405 | APL_0064 | APL_0065 | dppA | dppB | TRUE | 0.700 | 128.000 | 0.028 | 0.048 | Y | NA |
| 2123405 | 2123406 | APL_0065 | APL_0066 | dppB | dppC | TRUE | 0.994 | 78.000 | 0.620 | 0.048 | Y | NA |
| 2123406 | 2123407 | APL_0066 | APL_0067 | dppC | dppD | TRUE | 1.000 | 11.000 | 0.717 | 1.000 | Y | NA |
| 2123407 | 2123408 | APL_0067 | APL_0068 | dppD | dppF | TRUE | 0.999 | 13.000 | 0.326 | 0.003 | Y | NA |
| 2123409 | 2123410 | APL_0069 | APL_0070 | psiE | FALSE | 0.271 | 78.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123410 | 2123411 | APL_0070 | APL_0071 | FALSE | 0.334 | 55.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123411 | 2123412 | APL_0071 | APL_0072 | ilvE | TRUE | 0.632 | 87.000 | 0.043 | NA | N | NA | |
| 2123412 | 2123413 | APL_0072 | APL_0073 | ilvE | ydhD | FALSE | 0.059 | 143.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123413 | 2123414 | APL_0073 | APL_0074 | ydhD | recR | FALSE | 0.282 | 72.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 2123414 | 2123415 | APL_0074 | APL_0075 | recR | ybaB | TRUE | 0.999 | 11.000 | 0.615 | NA | NA | |
| 2123415 | 2123416 | APL_0075 | APL_0076 | ybaB | tonB2 | FALSE | 0.120 | 169.000 | 0.003 | NA | NA | |
| 2123416 | 2123417 | APL_0076 | APL_0077 | tonB2 | exbD2 | TRUE | 0.998 | 10.000 | 0.444 | 1.000 | N | NA |
| 2123417 | 2123418 | APL_0077 | APL_0078 | exbD2 | exbB2 | TRUE | 0.995 | 45.000 | 0.556 | 0.065 | Y | NA |
| 2123419 | 2123420 | APL_0079 | APL_0080 | glpE | TRUE | 0.713 | 44.000 | 0.021 | NA | N | NA | |
| 2123421 | 2123422 | APL_0081 | APL_0082 | dhaM | dhaL | TRUE | 1.000 | 9.000 | 1.000 | 1.000 | NA | |
| 2123422 | 2123423 | APL_0082 | APL_0083 | dhaL | dhaK | TRUE | 0.998 | 2.000 | 0.075 | 0.001 | Y | NA |
| 2123424 | 2123425 | APL_0084 | APL_0085 | trxB | kdsB | FALSE | 0.244 | 108.000 | 0.004 | 0.070 | N | NA |
| 2123425 | 2123426 | APL_0085 | APL_0086 | kdsB | FALSE | 0.375 | 124.000 | 0.013 | NA | NA | ||
| 2123427 | 2123428 | APL_0087 | APL_0088 | nudC | rluE | TRUE | 0.649 | 18.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123428 | 2123429 | APL_0088 | APL_0089 | rluE | rhaT | TRUE | 0.862 | 4.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 2123429 | 2123430 | APL_0089 | APL_0090 | rhaT | FALSE | 0.352 | 30.000 | 0.000 | 0.100 | NA | ||
| 2123430 | 2123431 | APL_0090 | APL_0091 | pepQ | TRUE | 0.687 | 23.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123433 | 2123434 | APL_0093 | APL_0094 | engB | TRUE | 0.941 | 2.000 | 0.006 | NA | NA | ||
| 2123434 | 2123435 | APL_0094 | APL_0095 | engB | FALSE | 0.067 | 295.000 | 0.004 | 1.000 | NA | ||
| 2123435 | 2123436 | APL_0095 | APL_0096 | TRUE | 0.466 | 38.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |||
| 2123436 | 2123437 | APL_0096 | APL_0097 | ilvD | FALSE | 0.132 | 151.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA | |
| 2123437 | 2123438 | APL_0097 | APL_0098 | ilvD | ilvM | TRUE | 0.484 | 118.000 | 0.024 | 1.000 | NA | |
| 2123438 | 2123439 | APL_0098 | APL_0099 | ilvM | ilvG | TRUE | 1.000 | 21.000 | 0.905 | 0.003 | NA | |
| 2123440 | 2123441 | APL_0100 | APL_0101 | nrfA | nrfB | TRUE | 0.997 | 21.000 | 0.267 | 0.003 | NA | |
| 2123441 | 2123442 | APL_0101 | APL_0102 | nrfB | nrfC | TRUE | 1.000 | 0.000 | 0.700 | 0.003 | NA | |
| 2123442 | 2123443 | APL_0102 | APL_0103 | nrfC | nrfD | TRUE | 1.000 | 0.000 | 0.700 | 0.003 | N | NA |
| 2123443 | 2123444 | APL_0103 | APL_0104 | nrfD | FALSE | 0.022 | 288.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123445 | 2123446 | APL_0105 | APL_0106 | uraA | putA | FALSE | 0.045 | 160.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123446 | 2123447 | APL_0106 | APL_0107 | putA | putP | TRUE | 0.608 | 103.000 | 0.052 | 1.000 | N | NA |
| 2123447 | 2123448 | APL_0107 | APL_0108 | putP | iclR | FALSE | 0.019 | 575.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123448 | 2123449 | APL_0108 | APL_0109 | iclR | TRUE | 0.789 | -3.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123449 | 2123450 | APL_0109 | APL_0110 | FALSE | 0.208 | 271.000 | 0.042 | NA | NA | |||
| 2123451 | 2123452 | APL_0111 | APL_0112 | hemE | FALSE | 0.217 | 106.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123452 | 2123453 | APL_0112 | APL_0113 | hemE | TRUE | 0.409 | 124.000 | 0.017 | NA | NA | ||
| 2123453 | 2123454 | APL_0113 | APL_0114 | hupA | TRUE | 0.887 | 136.000 | 0.361 | NA | NA | ||
| 2123456 | 2123457 | APL_0116 | APL_0117 | bioB | FALSE | 0.244 | 96.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123459 | 2123460 | APL_0119 | APL_0120 | proQ | prc | TRUE | 0.939 | 92.000 | 0.338 | NA | N | NA |
| 2123460 | 2123461 | APL_0120 | APL_0121 | prc | TRUE | 0.658 | 97.000 | 0.047 | 1.000 | NA | ||
| 2123461 | 2123462 | APL_0121 | APL_0122 | TRUE | 0.599 | 172.000 | 0.171 | NA | NA | |||
| 2123462 | 2123463 | APL_0122 | APL_0123 | TRUE | 0.964 | 18.000 | 0.065 | NA | NA | |||
| 2123464 | 2123465 | APL_0124 | APL_0125 | TRUE | 0.983 | -3.000 | 0.068 | NA | NA | |||
| 2123465 | 2123466 | APL_0125 | APL_0126 | TRUE | 0.979 | 2.000 | 0.053 | NA | NA | |||
| 2123466 | 2123467 | APL_0126 | APL_0127 | yfeD | FALSE | 0.344 | 72.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA | |
| 2123467 | 2123468 | APL_0127 | APL_0128 | yfeD | yfeC | TRUE | 0.995 | -7.000 | 0.025 | 0.007 | Y | NA |
| 2123468 | 2123469 | APL_0128 | APL_0129 | yfeC | rnhB | TRUE | 0.889 | 1.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 2123469 | 2123470 | APL_0129 | APL_0130 | rnhB | engC | TRUE | 0.793 | 23.000 | 0.003 | 1.000 | NA | |
| 2123471 | 2123472 | APL_0131 | APL_0132 | gcvA | TRUE | 0.966 | 0.000 | 0.021 | 1.000 | NA | ||
| 2123472 | 2123473 | APL_0132 | APL_0133 | cysB | TRUE | 0.966 | 0.000 | 0.021 | 1.000 | NA | ||
| 2123473 | 2123474 | APL_0133 | APL_0134 | cysB | TRUE | 0.973 | 1.000 | 0.033 | NA | NA | ||
| 2123476 | 2123477 | APL_0136 | APL_0137 | pyrG | FALSE | 0.318 | 103.000 | 0.003 | NA | NA | ||
| 2123478 | 2123479 | APL_0138 | APL_0139 | leuD | leuC | TRUE | 1.000 | 11.000 | 0.465 | 0.001 | Y | NA |
| 2123480 | 2123481 | APL_0140 | APL_0141 | TRUE | 0.830 | 128.000 | 0.265 | NA | N | NA | ||
| 2123481 | 2123482 | APL_0141 | APL_0142 | glxK | TRUE | 0.998 | 11.000 | 0.317 | 1.000 | Y | NA | |
| 2123482 | 2123483 | APL_0142 | APL_0143 | glxK | TRUE | 0.628 | 19.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123484 | 2123485 | APL_0144 | APL_0145 | TRUE | 0.873 | 4.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123485 | 2123486 | APL_0145 | APL_0146 | dusA | FALSE | 0.303 | 60.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123487 | 2123488 | APL_0147 | APL_0148 | rnr1 | TRUE | 0.997 | -13.000 | 0.051 | 0.003 | Y | NA | |
| 2123490 | 2123491 | APL_0150 | APL_0151 | nqrA | nqrB | TRUE | 1.000 | 5.000 | 0.536 | 0.004 | Y | NA |
| 2123491 | 2123492 | APL_0151 | APL_0152 | nqrB | nqrC | TRUE | 1.000 | 3.000 | 0.333 | 0.004 | Y | NA |
| 2123492 | 2123493 | APL_0152 | APL_0153 | nqrC | nqrD | TRUE | 1.000 | 0.000 | 0.952 | 0.004 | Y | NA |
| 2123493 | 2123494 | APL_0153 | APL_0154 | nqrD | nqrE | TRUE | 0.999 | 2.000 | 0.305 | 0.004 | Y | NA |
| 2123494 | 2123495 | APL_0154 | APL_0155 | nqrE | nqrF | TRUE | 1.000 | 11.000 | 0.532 | 0.004 | Y | NA |
| 2123495 | 2123496 | APL_0155 | APL_0156 | nqrF | apbE | TRUE | 0.861 | 207.000 | 0.556 | 1.000 | N | NA |
| 2123496 | 2123497 | APL_0156 | APL_0157 | apbE | TRUE | 0.986 | 13.000 | 0.125 | NA | NA | ||
| 2123497 | 2123498 | APL_0157 | APL_0158 | trmU | FALSE | 0.106 | 229.000 | 0.006 | NA | NA | ||
| 2123499 | 2123500 | APL_0159 | APL_0160 | hcaT | proC | TRUE | 0.965 | -3.000 | 0.019 | NA | NA | |
| 2123501 | 2123502 | APL_0161 | APL_0162 | rdgC | TRUE | 0.848 | 10.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123503 | 2123504 | APL_0163 | APL_0164 | TRUE | 1.000 | 5.000 | 0.842 | 1.000 | NA | |||
| 2123505 | 2123506 | APL_0165 | APL_0166 | rnfA | rnfB | TRUE | 0.999 | 21.000 | 0.584 | 0.051 | Y | NA |
| 2123506 | 2123507 | APL_0166 | APL_0167 | rnfB | rnfC | TRUE | 1.000 | -7.000 | 0.455 | 0.017 | Y | NA |
| 2123507 | 2123508 | APL_0167 | APL_0168 | rnfC | TRUE | 0.969 | -7.000 | 0.025 | NA | NA | ||
| 2123508 | 2123509 | APL_0168 | APL_0169 | rnfD | TRUE | 0.926 | 20.000 | 0.022 | NA | NA | ||
| 2123509 | 2123510 | APL_0169 | APL_0170 | rnfD | rnfG | TRUE | 1.000 | 0.000 | 0.825 | 0.051 | Y | NA |
| 2123510 | 2123511 | APL_0170 | APL_0171 | rnfG | rnfE | TRUE | 0.999 | 12.000 | 0.529 | 0.051 | Y | NA |
| 2123511 | 2123512 | APL_0171 | APL_0172 | rnfE | msbB | TRUE | 0.946 | 9.000 | 0.016 | 1.000 | N | NA |
| 2123514 | 2123515 | APL_0174 | APL_0175 | tbpA | dksA | FALSE | 0.028 | 207.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123515 | 2123516 | APL_0175 | APL_0176 | dksA | pcnB | FALSE | 0.306 | 143.000 | 0.027 | 1.000 | N | NA |
| 2123516 | 2123517 | APL_0176 | APL_0177 | pcnB | folK | TRUE | 0.910 | 70.000 | 0.263 | 1.000 | N | NA |
| 2123518 | 2123519 | APL_0178 | APL_0179 | TRUE | 0.999 | -3.000 | 0.537 | NA | NA | |||
| 2123519 | 2123520 | APL_0179 | APL_0180 | TRUE | 0.876 | 33.000 | 0.043 | NA | NA | |||
| 2123521 | 2123522 | APL_0181 | APL_0182 | gloA | dnaQ | TRUE | 0.438 | 140.000 | 0.066 | 1.000 | N | NA |
| 2123523 | 2123524 | APL_0183 | APL_0184 | tyrA | FALSE | 0.022 | 576.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 2123524 | 2123525 | APL_0184 | APL_0185 | tyrA | aroF | TRUE | 0.932 | 113.000 | 0.218 | 1.000 | Y | NA |
| 2123525 | 2123526 | APL_0185 | APL_0186 | aroF | TRUE | 0.769 | 42.000 | 0.033 | 1.000 | N | NA | |
| 2123526 | 2123527 | APL_0186 | APL_0187 | pykA | TRUE | 0.485 | 88.000 | 0.017 | 1.000 | N | NA | |
| 2123528 | 2123529 | APL_0188 | APL_0189 | sixA | dus | FALSE | 0.026 | 223.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123529 | 2123530 | APL_0189 | APL_0190 | dus | fis | TRUE | 0.959 | 28.000 | 0.168 | 1.000 | N | NA |
| 2123531 | 2123532 | APL_0191 | APL_0192 | dam | TRUE | 0.696 | 65.000 | 0.045 | 1.000 | NA | ||
| 2123532 | 2123533 | APL_0192 | APL_0193 | dam | aroB | TRUE | 0.942 | -7.000 | 0.013 | 1.000 | N | NA |
| 2123533 | 2123534 | APL_0193 | APL_0194 | aroB | aroK | TRUE | 0.948 | 74.000 | 0.200 | 1.000 | Y | NA |
| 2123534 | 2123535 | APL_0194 | APL_0195 | aroK | mrcA | FALSE | 0.023 | 262.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123536 | 2123537 | APL_0196 | APL_0197 | TRUE | 0.987 | 72.000 | 0.667 | NA | NA | |||
| 2123537 | 2123538 | APL_0197 | APL_0198 | TRUE | 0.999 | 3.000 | 0.667 | NA | NA | |||
| 2123538 | 2123539 | APL_0198 | APL_0199 | TRUE | 1.000 | -7.000 | 1.000 | NA | NA | |||
| 2123539 | 2123540 | APL_0199 | APL_0200 | hofQ | TRUE | 0.961 | 12.000 | 0.024 | NA | NA | ||
| 2123540 | 2123541 | APL_0200 | APL_0201 | hofQ | nusB | FALSE | 0.196 | 126.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 2123541 | 2123542 | APL_0201 | APL_0202 | nusB | thiL | TRUE | 0.870 | 68.000 | 0.191 | 1.000 | N | NA |
| 2123542 | 2123543 | APL_0202 | APL_0203 | thiL | pgpA | TRUE | 0.992 | 13.000 | 0.235 | 1.000 | N | NA |
| 2123543 | 2123544 | APL_0203 | APL_0204 | pgpA | TRUE | 0.959 | 9.000 | 0.027 | 1.000 | N | NA | |
| 2123546 | 2123547 | APL_0206 | APL_0207 | suhB | dxs | FALSE | 0.273 | 121.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA |
| 2123548 | 2123549 | APL_0208 | APL_0209 | TRUE | 0.537 | 33.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123549 | 2123550 | APL_0209 | APL_0210 | TRUE | 0.996 | 12.000 | 0.286 | NA | NA | |||
| 2123550 | 2123551 | APL_0210 | APL_0211 | glyA | FALSE | 0.152 | 89.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123551 | 2123552 | APL_0211 | APL_0212 | glyA | pnnK | FALSE | 0.025 | 231.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123552 | 2123553 | APL_0212 | APL_0213 | pnnK | FALSE | 0.252 | 91.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123553 | 2123554 | APL_0213 | APL_0214 | TRUE | 0.999 | -3.000 | 0.513 | NA | NA | |||
| 2123554 | 6507143 | APL_0214 | FALSE | NA | 37.000 | 0.000 | NA | NA | ||||
| 6507143 | 6730100 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730100 | 6507144 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507144 | 6730101 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730101 | 6507145 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507145 | 6730102 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730102 | 6507146 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507146 | 6730103 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730103 | 6507147 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507147 | 6730104 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730104 | 6507148 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507148 | 6730105 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730105 | 6507149 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507149 | 6730106 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730106 | 6507150 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507150 | 6730107 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730107 | 6507151 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507151 | 6730108 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730108 | 6507152 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507152 | 6730109 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730109 | 6507153 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507153 | 6730110 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730110 | 6507154 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507154 | 6730111 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730111 | 6507155 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507155 | 6730112 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730112 | 6507156 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507156 | 6730113 | TRUE | NA | -32.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730113 | 6507157 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507157 | 6730114 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730114 | 6507158 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507158 | 6730115 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730115 | 6507159 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507159 | 6730116 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730116 | 6507160 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507160 | 6730117 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730117 | 6507161 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507161 | 6730118 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730118 | 6507162 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507162 | 6730119 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730119 | 6507163 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507163 | 6730120 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730120 | 6507164 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507164 | 6730121 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730121 | 6507165 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507165 | 6730122 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730122 | 6507166 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507166 | 6730123 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730123 | 6507167 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507167 | 6730124 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730124 | 6507168 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507168 | 6730125 | TRUE | NA | -33.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730125 | 6507169 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507169 | 6730126 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730126 | 6507170 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507170 | 6730127 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730127 | 6507171 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507171 | 6730128 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730128 | 6507172 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507172 | 6730129 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730129 | 6507173 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507173 | 6730130 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730130 | 6507174 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507174 | 6730131 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730131 | 6507175 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507175 | 6730132 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730132 | 6507176 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507176 | 6730133 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730133 | 6507177 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507177 | 6730134 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730134 | 6507178 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507178 | 6730135 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730135 | 6507179 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507179 | 6730136 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730136 | 6507180 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507180 | 6730137 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730137 | 6507181 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507181 | 6730138 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730138 | 6507182 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507182 | 6730139 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730139 | 6507183 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507183 | 6730140 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730140 | 6507184 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507184 | 6730141 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730141 | 6507185 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507185 | 6730142 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730142 | 6507186 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507186 | 6730143 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730143 | 6507187 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507187 | 6730144 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730144 | 6507188 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507188 | 6730145 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730145 | 6507189 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507189 | 6730146 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730146 | 6507190 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507190 | 6730147 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730147 | 6507191 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507191 | 6730148 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730148 | 6507192 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507192 | 6730149 | TRUE | NA | -31.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730149 | 6507193 | TRUE | NA | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6507193 | 6730150 | TRUE | NA | -27.000 | 0.000 | NA | NA | |||||
| 6730150 | 2123555 | APL_0215 | FALSE | NA | 142.000 | 0.000 | NA | NA | ||||
| 2123555 | 2123556 | APL_0215 | APL_0216 | TRUE | 0.980 | 3.000 | 0.057 | NA | NA | |||
| 2123556 | 2123557 | APL_0216 | APL_0217 | TRUE | 1.000 | 2.000 | 0.800 | NA | NA | |||
| 2123557 | 2123558 | APL_0217 | APL_0218 | TRUE | 1.000 | -3.000 | 0.929 | NA | NA | |||
| 2123559 | 2123560 | APL_0219 | APL_0220 | thrS | FALSE | 0.070 | 142.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 2123560 | 2123561 | APL_0220 | APL_0221 | TRUE | 0.984 | 10.000 | 0.092 | NA | NA | |||
| 2123561 | 2123562 | APL_0221 | APL_0222 | TRUE | 0.991 | 12.000 | 0.175 | NA | NA | |||
| 2123562 | 2123563 | APL_0222 | APL_0223 | infC | FALSE | 0.041 | 278.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123563 | 2123564 | APL_0223 | APL_0224 | infC | rpmI | TRUE | 0.948 | 249.000 | 0.656 | 1.000 | Y | NA |
| 2123564 | 2123565 | APL_0224 | APL_0225 | rpmI | rplT | TRUE | 0.998 | 68.000 | 0.963 | 0.026 | Y | NA |
| 2123565 | 2123566 | APL_0225 | APL_0226 | rplT | FALSE | 0.385 | 49.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123566 | 2123567 | APL_0226 | APL_0227 | TRUE | 0.537 | 33.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123568 | 2123569 | APL_0228 | APL_0229 | rluA | TRUE | 0.437 | 44.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123571 | 2123572 | APL_0231 | APL_0232 | TRUE | 0.934 | 53.000 | 0.248 | NA | N | NA | ||
| 2123572 | 2123573 | APL_0232 | APL_0233 | TRUE | 0.958 | 0.000 | 0.013 | NA | NA | |||
| 2123573 | 2123574 | APL_0233 | APL_0234 | FALSE | 0.124 | 175.000 | 0.004 | NA | NA | |||
| 2123575 | 2123576 | APL_0235 | APL_2049 | bolA | FALSE | 0.202 | 112.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123577 | 2123578 | APL_0236 | APL_0237 | TRUE | 0.940 | 20.000 | 0.034 | NA | NA | |||
| 2123579 | 2123580 | APL_0238 | APL_0239 | secA | FALSE | 0.376 | 109.000 | 0.006 | NA | NA | ||
| 2123580 | 2123581 | APL_0239 | APL_0240 | secA | FALSE | 0.125 | 130.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123581 | 2123582 | APL_0240 | APL_0241 | mutT | TRUE | 0.865 | -3.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123582 | 2123583 | APL_0241 | APL_0242 | mutT | argC | FALSE | 0.025 | 235.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123583 | 2123584 | APL_0242 | APL_0243 | argC | argB | TRUE | 0.965 | 30.000 | 0.006 | 0.004 | Y | NA |
| 2123584 | 2123585 | APL_0243 | APL_0244 | argB | argD | TRUE | 0.981 | 14.000 | 0.022 | 1.000 | Y | NA |
| 2123585 | 2123586 | APL_0244 | APL_0245 | argD | FALSE | 0.046 | 214.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123586 | 2123587 | APL_0245 | APL_0246 | TRUE | 0.802 | 15.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |||
| 2123588 | 2123589 | APL_0247 | APL_0248 | rho | cysK | FALSE | 0.068 | 198.000 | 0.004 | 1.000 | N | NA |
| 2123589 | 2123590 | APL_0248 | APL_0249 | cysK | thrB | FALSE | 0.180 | 212.000 | 0.000 | 1.000 | Y | NA |
| 2123590 | 2123591 | APL_0249 | APL_0250 | thrB | thrA | TRUE | 0.999 | 0.000 | 0.400 | 1.000 | Y | NA |
| 2123594 | 2123596 | APL_0253 | APL_2050 | recD | FALSE | 0.034 | 2328.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123596 | 2123597 | APL_2050 | APL_2116 | FALSE | 0.050 | 217.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123597 | 2123598 | APL_2116 | APL_2122 | FALSE | 0.074 | 168.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123600 | 2123601 | APL_0255 | APL_0256 | gpt | gmk | TRUE | 0.666 | 84.000 | 0.003 | 1.000 | Y | NA |
| 2123601 | 2123602 | APL_0256 | APL_0257 | gmk | FALSE | 0.261 | 102.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA | |
| 2123603 | 2123604 | APL_0258 | APL_0259 | TRUE | 0.997 | -7.000 | 0.321 | NA | NA | |||
| 2123604 | 2123605 | APL_0259 | APL_0260 | modC | TRUE | 0.563 | 48.000 | 0.008 | NA | N | NA | |
| 2123605 | 2123606 | APL_0260 | APL_0261 | modC | modB | TRUE | 1.000 | 4.000 | 0.536 | 0.002 | Y | NA |
| 2123606 | 2123607 | APL_0261 | APL_0262 | modB | modA | TRUE | 0.998 | 60.000 | 0.634 | 0.002 | Y | NA |
| 2123607 | 2123608 | APL_0262 | APL_0263 | modA | TRUE | 0.411 | 96.000 | 0.010 | NA | N | NA | |
| 2123608 | 2123609 | APL_0263 | APL_0264 | TRUE | 1.000 | 4.000 | 0.933 | NA | N | NA | ||
| 2123609 | 2123610 | APL_0264 | APL_0265 | dnaX | TRUE | 0.937 | 0.000 | 0.010 | 1.000 | N | NA | |
| 2123610 | 2123611 | APL_0265 | APL_0266 | dnaX | apt | TRUE | 0.838 | 49.000 | 0.094 | 1.000 | N | NA |
| 2123612 | 2123613 | APL_0267 | APL_0268 | TRUE | 0.990 | 0.000 | 0.130 | NA | NA | |||
| 2123613 | 2123614 | APL_0268 | APL_0269 | thrCA | TRUE | 0.981 | 11.000 | 0.093 | NA | N | NA | |
| 2123614 | 2123615 | APL_0269 | APL_0270 | thrCA | TRUE | 0.966 | 15.000 | 0.047 | NA | NA | ||
| 2123616 | 2123617 | APL_0271 | APL_0272 | yfeA | TRUE | 1.000 | 2.000 | 0.682 | 1.000 | Y | NA | |
| 2123617 | 2123618 | APL_0272 | APL_0273 | yfeA | TRUE | 0.823 | 67.000 | 0.031 | NA | Y | NA | |
| 2123618 | 2123619 | APL_0273 | APL_0274 | TRUE | 0.864 | 53.000 | 0.111 | NA | NA | |||
| 2123620 | 2123621 | APL_0275 | APL_0276 | pgsA | frpB | FALSE | 0.103 | 120.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123621 | 2123622 | APL_0276 | APL_0277 | frpB | uvrC | FALSE | 0.050 | 153.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123622 | 2123623 | APL_0277 | APL_0278 | uvrC | TRUE | 0.607 | 69.000 | 0.000 | NA | Y | NA | |
| 2123625 | 2123626 | APL_0280 | APL_0281 | potA | potB | TRUE | 1.000 | -13.000 | 0.580 | 1.000 | Y | NA |
| 2123626 | 2123627 | APL_0281 | APL_0282 | potB | potC | TRUE | 0.999 | 27.000 | 0.606 | 0.043 | Y | NA |
| 2123627 | 2123628 | APL_0282 | APL_0283 | potC | ruvA | FALSE | 0.061 | 142.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123628 | 2123629 | APL_0283 | APL_0284 | ruvA | ruvB | TRUE | 0.922 | 139.000 | 0.116 | 0.001 | Y | NA |
| 2123631 | 2123632 | APL_0286 | APL_0287 | gyrA | hsdM | FALSE | 0.240 | 97.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 2123632 | 2123633 | APL_0287 | APL_0289 | hsdM | TRUE | 0.877 | 2.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123633 | 2123634 | APL_0289 | APL_0290 | FALSE | 0.075 | 167.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123634 | 2123635 | APL_0290 | APL_0291 | prrC | TRUE | 0.871 | 6.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123635 | 2123636 | APL_0291 | APL_0293 | prrC | TRUE | 0.871 | 6.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123636 | 2123637 | APL_0293 | APL_0294 | uupA | TRUE | 0.744 | 19.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123637 | 2123638 | APL_0294 | APL_0295 | uupA | TRUE | 0.944 | 0.000 | 0.007 | 1.000 | NA | ||
| 2123640 | 2123641 | APL_0297 | APL_0298 | cydA | cydB | TRUE | 1.000 | 14.000 | 0.875 | 0.046 | Y | NA |
| 2123641 | 2123642 | APL_0298 | APL_0299 | cydB | FALSE | 0.032 | 568.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123642 | 2123643 | APL_0299 | APL_0300 | tolQ | TRUE | 0.993 | 35.000 | 0.562 | 1.000 | NA | ||
| 2123643 | 2123644 | APL_0300 | APL_0301 | tolQ | tolR | TRUE | 0.988 | 79.000 | 0.507 | 0.059 | Y | NA |
| 2123644 | 2123645 | APL_0301 | APL_0302 | tolR | tolA | TRUE | 0.913 | 16.000 | 0.014 | NA | N | NA |
| 2123645 | 2123646 | APL_0302 | APL_0303 | tolA | tolB | TRUE | 0.873 | 18.000 | 0.008 | NA | N | NA |
| 2123646 | 2123647 | APL_0303 | APL_0304 | tolB | palA | TRUE | 0.965 | 26.000 | 0.165 | 1.000 | N | NA |
| 2123647 | 2123648 | APL_0304 | APL_0305 | palA | FALSE | 0.060 | 178.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123648 | 2123649 | APL_0305 | APL_0306 | djlA | FALSE | 0.250 | 80.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123649 | 2123650 | APL_0306 | APL_0307 | djlA | dusC | TRUE | 0.522 | 85.000 | 0.021 | 1.000 | N | NA |
| 2123650 | 2123651 | APL_0307 | APL_0308 | dusC | TRUE | 0.658 | 52.000 | 0.016 | NA | NA | ||
| 2123653 | 2123654 | APL_0310 | APL_0311 | moeA | moeB | TRUE | 0.998 | 10.000 | 0.126 | 0.005 | Y | NA |
| 2123654 | 2123655 | APL_0311 | APL_2051 | moeB | FALSE | 0.249 | 93.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123657 | 2123658 | APL_0313 | APL_0314 | hepA | FALSE | 0.036 | 176.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123658 | 2123659 | APL_0314 | APL_0315 | hepA | rluA | TRUE | 0.930 | 70.000 | 0.304 | 1.000 | N | NA |
| 2123661 | 2123662 | APL_0317 | APL_0318 | yhiR | pryE | TRUE | 0.467 | 87.000 | 0.009 | 1.000 | NA | |
| 2123662 | 2123663 | APL_0318 | APL_0319 | pryE | FALSE | 0.064 | 139.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123664 | 2123665 | APL_0320 | APL_0321 | metC | dsbB | FALSE | 0.163 | 77.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123665 | 2123666 | APL_0321 | APL_0322 | dsbB | nhaB | TRUE | 0.981 | 97.000 | 0.661 | 1.000 | N | NA |
| 2123667 | 2123668 | APL_0323 | APL_0324 | fadR | phoH | TRUE | 0.772 | 9.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123669 | 2123670 | APL_0325 | APL_0326 | prfB | FALSE | 0.247 | 72.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123671 | 2123672 | APL_0327 | APL_0328 | selD | mutT | TRUE | 0.782 | 5.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123672 | 2123673 | APL_0328 | APL_0329 | mutT | TRUE | 0.764 | 10.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123674 | 2123675 | APL_0330 | APL_0331 | hlp | FALSE | 0.320 | 57.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123675 | 2123676 | APL_0331 | APL_0332 | hlp | hlpB | TRUE | 0.961 | 81.000 | 0.400 | NA | NA | |
| 2123676 | 2123677 | APL_0332 | APL_0333 | hlpB | visC | FALSE | 0.382 | 136.000 | 0.026 | NA | NA | |
| 2123677 | 2123678 | APL_0333 | APL_0334 | visC | FALSE | 0.324 | 124.000 | 0.007 | NA | NA | ||
| 2123678 | 2123679 | APL_0334 | APL_0335 | ptsN | TRUE | 0.984 | 19.000 | 0.170 | NA | NA | ||
| 2123679 | 2123680 | APL_0335 | APL_0336 | ptsN | yhgB | TRUE | 0.681 | 50.000 | 0.018 | 1.000 | NA | |
| 2123680 | 2123681 | APL_0336 | APL_0337 | yhgB | TRUE | 0.999 | 10.000 | 0.532 | 1.000 | NA | ||
| 2123681 | 2123682 | APL_0337 | APL_0338 | TRUE | 0.996 | 25.000 | 0.538 | NA | NA | |||
| 2123682 | 2123683 | APL_0338 | APL_0339 | pepC | FALSE | 0.082 | 160.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123683 | 2123684 | APL_0339 | APL_0340 | pepC | FALSE | 0.050 | 215.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123684 | 2123685 | APL_0340 | APL_0341 | TRUE | 0.987 | -3.000 | 0.098 | NA | NA | |||
| 2123685 | 2123686 | APL_0341 | APL_0342 | TRUE | 0.835 | 67.000 | 0.128 | NA | NA | |||
| 2123686 | 2123687 | APL_0342 | APL_0343 | fruA | FALSE | 0.067 | 176.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123687 | 2123688 | APL_0343 | APL_0344 | fruA | fruK | TRUE | 0.995 | 82.000 | 0.717 | 1.000 | Y | NA |
| 2123688 | 2123689 | APL_0344 | APL_0345 | fruK | fruB | TRUE | 0.998 | 15.000 | 0.326 | 1.000 | Y | NA |
| 2123690 | 2123691 | APL_0346 | APL_0347 | glgB | glgX | TRUE | 0.999 | 7.000 | 0.226 | 0.002 | Y | NA |
| 2123691 | 2123692 | APL_0347 | APL_0348 | glgX | glgC | TRUE | 0.997 | 16.000 | 0.290 | 1.000 | Y | NA |
| 2123692 | 2123693 | APL_0348 | APL_0349 | glgC | glgA | TRUE | 0.969 | 103.000 | 0.333 | 1.000 | Y | NA |
| 2123693 | 2123694 | APL_0349 | APL_0350 | glgA | glgP | TRUE | 0.984 | 30.000 | 0.195 | 1.000 | Y | NA |
| 2123695 | 2123696 | APL_0351 | APL_0352 | ndk | metG | FALSE | 0.385 | 59.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 2123697 | 2123698 | APL_0353 | APL_0354 | menC | rsuA | FALSE | 0.021 | 314.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123698 | 2123699 | APL_0354 | APL_0355 | rsuA | proP | TRUE | 0.995 | 0.000 | 0.278 | 1.000 | N | NA |
| 2123700 | 2123701 | APL_0356 | APL_0357 | TRUE | 0.761 | 71.000 | 0.077 | NA | NA | |||
| 2123702 | 2123703 | APL_0358 | APL_0359 | nfo | nlpC | FALSE | 0.284 | 121.000 | 0.007 | NA | N | NA |
| 2123704 | 2123705 | APL_0360 | APL_0361 | impA | grcA | FALSE | 0.048 | 226.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 2123707 | 2123708 | APL_0363 | APL_0364 | ssa1 | FALSE | 0.246 | 95.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123708 | 2123709 | APL_0364 | APL_0365 | ssa1 | hrpA | FALSE | 0.044 | 221.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 2123709 | 2123710 | APL_0365 | APL_0366 | hrpA | FALSE | 0.236 | 170.000 | 0.020 | NA | NA | ||
| 2123710 | 2123711 | APL_0366 | APL_0367 | grpE | FALSE | 0.094 | 197.000 | 0.003 | NA | NA | ||
| 2123712 | 2123713 | APL_0368 | APL_0369 | potD2 | norM | TRUE | 0.578 | 144.000 | 0.133 | 1.000 | N | NA |
| 2123713 | 2123714 | APL_0369 | APL_0370 | norM | recB | TRUE | 0.899 | 16.000 | 0.012 | 1.000 | N | NA |
| 2123715 | 2123716 | APL_0371 | APL_0372 | lnt | corC | TRUE | 0.990 | 82.000 | 0.794 | NA | N | NA |
| 2123717 | 2123718 | APL_0373 | APL_0374 | glpF | FALSE | 0.046 | 236.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123718 | 2123719 | APL_0374 | APL_0375 | glpF | glpK | TRUE | 0.898 | 35.000 | 0.094 | 1.000 | N | NA |
| 2123720 | 2123721 | APL_0376 | APL_0377 | lon | glpT | FALSE | 0.317 | 146.000 | 0.036 | 1.000 | N | NA |
| 2123721 | 2123722 | APL_0377 | APL_0378 | glpT | glpQ | TRUE | 0.799 | 203.000 | 0.446 | 1.000 | N | NA |
| 2123723 | 2123724 | APL_0379 | APL_0380 | glpA | glpB | TRUE | 1.000 | -10.000 | 0.754 | 0.002 | N | NA |
| 2123724 | 2123725 | APL_0380 | APL_0381 | glpB | glpC | TRUE | 1.000 | -3.000 | 0.705 | 0.002 | N | NA |
| 2123725 | 2123726 | APL_0381 | APL_0382 | glpC | ribD | FALSE | 0.038 | 172.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123726 | 2123727 | APL_0382 | APL_0383 | ribD | ribE | TRUE | 0.971 | 123.000 | 0.450 | 1.000 | Y | NA |
| 2123727 | 2123728 | APL_0383 | APL_0384 | ribE | ribA | TRUE | 0.986 | 61.000 | 0.445 | 1.000 | Y | NA |
| 2123728 | 2123729 | APL_0384 | APL_0385 | ribA | ribH | TRUE | 0.991 | 111.000 | 0.409 | 0.002 | Y | NA |
| 2123730 | 2123731 | APL_0386 | APL_0387 | greB | kpsF | TRUE | 0.949 | 10.000 | 0.020 | 1.000 | N | NA |
| 2123731 | 2123732 | APL_0387 | APL_0388 | kpsF | pepB | TRUE | 0.399 | 128.000 | 0.033 | 1.000 | N | NA |
| 2123732 | 2123733 | APL_0388 | APL_0389 | pepB | ompP4 | TRUE | 0.526 | 115.000 | 0.029 | 1.000 | NA | |
| 2123735 | 2123736 | APL_0391 | APL_0392 | macA | FALSE | 0.222 | 97.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123737 | 2123738 | APL_0393 | APL_0394 | leuA | rpoE | FALSE | 0.021 | 343.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123738 | 2123739 | APL_0394 | APL_0395 | rpoE | rseA | TRUE | 0.999 | 20.000 | 0.766 | NA | N | NA |
| 2123739 | 2123740 | APL_0395 | APL_0396 | rseA | rseC | FALSE | 0.177 | 225.000 | 0.000 | NA | Y | NA |
| 2123740 | 2123741 | APL_0396 | APL_0397 | rseC | lcfA | TRUE | 0.940 | 12.000 | 0.015 | NA | N | NA |
| 2123741 | 2123742 | APL_0397 | APL_0398 | lcfA | upp | FALSE | 0.163 | 67.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123743 | 2123744 | APL_0399 | APL_0400 | ksgA | surA | TRUE | 0.635 | 66.000 | 0.041 | 1.000 | N | NA |
| 2123744 | 2123745 | APL_0400 | APL_0401 | surA | pyrR | TRUE | 0.533 | 81.000 | 0.021 | 1.000 | N | NA |
| 2123745 | 2123746 | APL_0401 | APL_0402 | pyrR | hldE | TRUE | 0.870 | 16.000 | 0.006 | 1.000 | N | NA |
| 2123746 | 2123747 | APL_0402 | APL_0403 | hldE | engA | TRUE | 0.413 | 114.000 | 0.012 | 1.000 | NA | |
| 2123747 | 2123748 | APL_0403 | APL_0404 | engA | hemA | FALSE | 0.165 | 158.000 | 0.006 | 1.000 | NA | |
| 2123749 | 2123750 | APL_0405 | APL_0406 | relA | dxr | FALSE | 0.360 | 74.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 2123751 | 2123752 | APL_0407 | APL_0408 | lpxA | fabZ | TRUE | 0.983 | 28.000 | 0.319 | 1.000 | N | NA |
| 2123752 | 2123753 | APL_0408 | APL_0409 | fabZ | lpxD | TRUE | 0.908 | 69.000 | 0.257 | 1.000 | N | NA |
| 2123753 | 2123754 | APL_0409 | APL_0410 | lpxD | TRUE | 0.999 | 0.000 | 0.640 | 1.000 | NA | ||
| 2123754 | 2123755 | APL_0410 | APL_0411 | D15 | TRUE | 0.912 | 116.000 | 0.312 | 1.000 | NA | ||
| 2123755 | 2123756 | APL_0411 | APL_0412 | D15 | ecfE | TRUE | 0.959 | 62.000 | 0.224 | 1.000 | Y | NA |
| 2123756 | 2123757 | APL_0412 | APL_0413 | ecfE | cdsA | TRUE | 0.979 | 7.000 | 0.076 | 1.000 | N | NA |
| 2123757 | 2123758 | APL_0413 | APL_0414 | cdsA | uppS | TRUE | 0.996 | 25.000 | 0.344 | 1.000 | Y | NA |
| 2123758 | 2123759 | APL_0414 | APL_0415 | uppS | gloB | FALSE | 0.124 | 172.000 | 0.005 | 1.000 | NA | |
| 2123759 | 2123760 | APL_0415 | APL_0416 | gloB | TRUE | 0.495 | 59.000 | 0.006 | 1.000 | NA | ||
| 2123760 | 2123761 | APL_0416 | APL_0417 | pgpB | TRUE | 0.988 | 3.000 | 0.111 | 1.000 | NA | ||
| 2123761 | 2123762 | APL_0417 | APL_0418 | pgpB | TRUE | 0.437 | 92.000 | 0.006 | NA | NA | ||
| 2123764 | 2123765 | APL_0420 | APL_0421 | pbpG | waaQ | FALSE | 0.242 | 84.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 2123766 | 2123767 | APL_0422 | APL_0423 | argG | rnhA | FALSE | 0.098 | 122.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123767 | 2123768 | APL_0423 | APL_0424 | rnhA | cvpA | FALSE | 0.078 | 157.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 2123768 | 2123769 | APL_0424 | APL_0425 | cvpA | purF | TRUE | 0.986 | 14.000 | 0.137 | 1.000 | NA | |
| 2123770 | 2123771 | APL_0426 | APL_0427 | gdhA | FALSE | 0.244 | 96.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123771 | 2123772 | APL_0427 | APL_0428 | gdhA | smpA | FALSE | 0.021 | 304.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123772 | 2123773 | APL_0428 | APL_0429 | smpA | TRUE | 0.830 | 71.000 | 0.127 | NA | NA | ||
| 2123774 | 2123775 | APL_0430 | APL_0431 | TRUE | 0.765 | 28.000 | 0.006 | NA | NA | |||
| 2123775 | 2123776 | APL_0431 | APL_2052 | FALSE | 0.238 | 98.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123776 | 2123777 | APL_2052 | APL_0432 | leuB | FALSE | 0.037 | 391.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123779 | 2123780 | APL_0434 | APL_0435 | gapA | mreB | FALSE | 0.031 | 196.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123780 | 2123781 | APL_0435 | APL_0436 | mreB | mreC | TRUE | 0.927 | 117.000 | 0.392 | 1.000 | N | NA |
| 2123781 | 2123782 | APL_0436 | APL_0437 | mreC | mreD | TRUE | 1.000 | 0.000 | 0.503 | 0.004 | Y | NA |
| 2123782 | 2123783 | APL_0437 | APL_0438 | mreD | TRUE | 0.903 | 13.000 | 0.007 | 1.000 | N | NA | |
| 2123783 | 2123784 | APL_0438 | APL_0439 | znuB | FALSE | 0.329 | 81.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA | |
| 2123784 | 2123785 | APL_0439 | APL_0440 | znuB | FALSE | 0.184 | 179.000 | 0.014 | 1.000 | NA | ||
| 2123787 | 2123788 | APL_0442 | APL_0443 | sanA | FALSE | 0.043 | 260.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123789 | 2123790 | APL_0444 | APL_0445 | ykgF | TRUE | 0.778 | 129.000 | 0.186 | NA | NA | ||
| 2123790 | 2123791 | APL_0445 | APL_0446 | ykgF | ykgE | TRUE | 0.995 | 10.000 | 0.140 | NA | Y | NA |
| 2123791 | 2123792 | APL_0446 | APL_0447 | ykgE | lctP | TRUE | 0.844 | 170.000 | 0.250 | NA | Y | NA |
| 2123792 | 2123793 | APL_0447 | APL_0448 | lctP | hns | FALSE | 0.033 | 466.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 2123794 | 2123795 | APL_0449 | APL_0450 | mglB | FALSE | 0.033 | 206.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 2123796 | 2123797 | APL_0451 | APL_0452 | sucD | sucC | TRUE | 0.999 | 3.000 | 0.275 | 0.001 | Y | NA |
| 2123797 | 2123798 | APL_0452 | APL_0453 | sucC | FALSE | 0.105 | 144.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123798 | 2123799 | APL_0453 | APL_0454 | sucB | FALSE | 0.212 | 143.000 | 0.006 | NA | NA | ||
| 2123799 | 2123800 | APL_0454 | APL_0455 | sucB | sucA | TRUE | 0.993 | 120.000 | 0.758 | 1.000 | Y | NA |
| 2123800 | 2123801 | APL_0455 | APL_0456 | sucA | znuC | FALSE | 0.024 | 243.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123802 | 2123803 | APL_0457 | APL_0458 | dsbC | TRUE | 0.945 | 19.000 | 0.054 | 1.000 | N | NA | |
| 2123803 | 2123804 | APL_0458 | APL_0459 | dsbC | recJ | TRUE | 0.873 | 50.000 | 0.132 | 1.000 | N | NA |
| 2123804 | 2123805 | APL_0459 | APL_0460 | recJ | plpD | FALSE | 0.186 | 134.000 | 0.006 | 1.000 | N | NA |
| 2123805 | 2123806 | APL_0460 | APL_0461 | plpD | TRUE | 0.947 | 82.000 | 0.333 | 1.000 | NA | ||
| 2123806 | 2123807 | APL_0461 | APL_0462 | narQ | TRUE | 0.868 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123807 | 2123808 | APL_0462 | APL_0463 | narQ | TRUE | 0.932 | 23.000 | 0.058 | 1.000 | N | NA | |
| 2123808 | 2123809 | APL_0463 | APL_0464 | FALSE | 0.321 | 41.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | ||
| 2123809 | 2123810 | APL_0464 | APL_0465 | TRUE | 0.865 | 28.000 | 0.024 | NA | NA | |||
| 2123812 | 2123813 | APL_0467 | APL_0468 | FALSE | 0.253 | 90.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123813 | 2123814 | APL_0468 | APL_0469 | trpB | FALSE | 0.105 | 183.000 | 0.004 | 1.000 | NA | ||
| 2123814 | 2123815 | APL_0469 | APL_0470 | trpB | trpA | TRUE | 1.000 | 2.000 | 0.578 | 0.001 | Y | NA |
| 2123816 | 2123817 | APL_0471 | APL_0472 | TRUE | 0.998 | 9.000 | 0.400 | NA | NA | |||
| 2123818 | 2123819 | APL_0473 | APL_0474 | polA | lolA | FALSE | 0.019 | 674.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123819 | 2123820 | APL_0474 | APL_0475 | lolA | trpR | TRUE | 0.482 | 75.000 | 0.014 | 1.000 | N | NA |
| 2123820 | 2123821 | APL_0475 | APL_0476 | trpR | mtgA | TRUE | 0.903 | 29.000 | 0.061 | 1.000 | NA | |
| 2123822 | 2123823 | APL_0477 | APL_0478 | TRUE | 0.619 | 27.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123823 | 2123824 | APL_0478 | APL_0479 | TRUE | 0.817 | 15.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123824 | 2123825 | APL_0479 | APL_0480 | TRUE | 0.999 | 11.000 | 0.688 | NA | NA | |||
| 2123825 | 2123826 | APL_0480 | APL_0481 | TRUE | 0.424 | 45.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123827 | 2123828 | APL_0482 | APL_0483 | FALSE | 0.163 | 75.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | ||
| 2123828 | 2123829 | APL_0483 | APL_0484 | rimK | TRUE | 0.992 | -3.000 | 0.182 | 1.000 | N | NA | |
| 2123831 | 2123832 | APL_0486 | APL_0487 | maeB | rplY | FALSE | 0.033 | 186.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123833 | 2123834 | APL_0488 | APL_0489 | FALSE | 0.039 | 262.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |||
| 2123834 | 2123835 | APL_0489 | APL_0490 | FALSE | 0.048 | 207.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |||
| 2123835 | 2123836 | APL_0490 | APL_0491 | TRUE | 0.878 | 1.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123836 | 2123837 | APL_0491 | APL_0492 | FALSE | 0.043 | 260.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123837 | 2123838 | APL_0492 | APL_0493 | TRUE | 0.515 | 35.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123838 | 2123839 | APL_0493 | APL_0494 | rdgC | FALSE | 0.056 | 199.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123839 | 2123840 | APL_0494 | APL_0495 | rdgC | FALSE | 0.125 | 3154.000 | 0.000 | 1.000 | Y | NA | |
| 2123840 | 2123841 | APL_0495 | APL_0496 | TRUE | 0.931 | 45.000 | 0.162 | NA | NA | |||
| 2123841 | 2123842 | APL_0496 | APL_0497 | FALSE | 0.326 | 56.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123843 | 2123844 | APL_0498 | APL_0499 | FALSE | 0.320 | 59.000 | 0.000 | 0.053 | NA | |||
| 2123844 | 2123845 | APL_0499 | APL_0500 | FALSE | 0.087 | 156.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123845 | 2123846 | APL_0500 | APL_0501 | TRUE | 0.875 | 3.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123846 | 2123847 | APL_0501 | APL_0502 | FALSE | 0.059 | 195.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123847 | 2123848 | APL_0502 | APL_0503 | rusA | FALSE | 0.266 | 72.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123848 | 2123849 | APL_0503 | APL_0504 | rusA | TRUE | 0.863 | -7.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123849 | 2123850 | APL_0504 | APL_0505 | FALSE | 0.034 | 372.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |||
| 2123850 | 2123851 | APL_0505 | APL_0506 | TRUE | 0.995 | 92.000 | 1.000 | NA | NA | |||
| 2123851 | 2123852 | APL_0506 | APL_0507 | FALSE | 0.035 | 529.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123852 | 2123853 | APL_0507 | APL_0508 | TRUE | 0.999 | 3.000 | 0.667 | NA | NA | |||
| 2123853 | 2123854 | APL_0508 | APL_0509 | FALSE | 0.049 | 221.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123854 | 2123855 | APL_0509 | APL_0510 | TRUE | 1.000 | -64.000 | 1.000 | 1.000 | NA | |||
| 2123855 | 2123856 | APL_0510 | APL_0511 | TRUE | 0.940 | 74.000 | 0.300 | NA | NA | |||
| 2123856 | 2123857 | APL_0511 | APL_0512 | TRUE | 0.997 | -7.000 | 0.300 | NA | NA | |||
| 2123857 | 2123858 | APL_0512 | APL_0513 | TRUE | 1.000 | 3.000 | 0.750 | NA | NA | |||
| 2123858 | 2123859 | APL_0513 | APL_0514 | TRUE | 0.999 | -3.000 | 0.500 | NA | NA | |||
| 2123859 | 2123860 | APL_0514 | APL_0515 | TRUE | 0.996 | 0.000 | 0.286 | NA | NA | |||
| 2123860 | 2123861 | APL_0515 | APL_0516 | TRUE | 0.991 | 59.000 | 0.714 | NA | NA | |||
| 2123861 | 2123862 | APL_0516 | APL_0517 | TRUE | 0.999 | 24.000 | 1.000 | NA | NA | |||
| 2123862 | 2123863 | APL_0517 | APL_0518 | FALSE | 0.038 | 366.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123863 | 2123864 | APL_0518 | APL_0519 | TRUE | 0.879 | 252.000 | 0.600 | NA | NA | |||
| 2123864 | 2123865 | APL_0519 | APL_0520 | FALSE | 0.034 | 853.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123865 | 2123866 | APL_0520 | APL_0521 | FALSE | 0.176 | 121.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123866 | 2123867 | APL_0521 | APL_0522 | TRUE | 0.962 | 161.000 | 0.750 | NA | NA | |||
| 2123867 | 2123868 | APL_0522 | APL_0523 | TRUE | 0.999 | 24.000 | 0.800 | NA | NA | |||
| 2123868 | 2123869 | APL_0523 | APL_0524 | TRUE | 0.867 | 318.000 | 0.600 | NA | NA | |||
| 2123869 | 2123870 | APL_0524 | APL_0525 | FALSE | 0.311 | 59.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123870 | 2123871 | APL_0525 | APL_0526 | FALSE | 0.034 | 961.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123871 | 2123872 | APL_0526 | APL_0527 | TRUE | 0.492 | 123.000 | 0.030 | NA | NA | |||
| 2123872 | 2123873 | APL_0527 | APL_0528 | TRUE | 0.531 | 100.000 | 0.020 | 1.000 | NA | |||
| 2123873 | 2123874 | APL_0528 | APL_0529 | FALSE | 0.037 | 391.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123874 | 2123875 | APL_0529 | APL_0531 | TRUE | 0.874 | -7.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123875 | 2123876 | APL_0531 | APL_0532 | TRUE | 0.412 | 44.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |||
| 2123876 | 2123877 | APL_0532 | APL_0533 | thiF | TRUE | 0.838 | 88.000 | 0.053 | 0.016 | NA | ||
| 2123877 | 2123878 | APL_0533 | APL_0534 | thiF | thiS | TRUE | 0.984 | 31.000 | 0.337 | 1.000 | NA | |
| 2123878 | 2123879 | APL_0534 | APL_0535 | thiS | thiG | TRUE | 0.443 | 436.000 | 0.188 | 1.000 | NA | |
| 2123879 | 2123880 | APL_0535 | APL_0536 | thiG | thiH | TRUE | 0.998 | 10.000 | 0.228 | 0.003 | NA | |
| 2123880 | 2123881 | APL_0536 | APL_0537 | thiH | FALSE | 0.209 | 55.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2123881 | 2123882 | APL_0537 | APL_0538 | TRUE | 0.989 | 23.000 | 0.301 | NA | N | NA | ||
| 2123882 | 2123883 | APL_0538 | APL_0539 | thiD | FALSE | 0.222 | 166.000 | 0.015 | NA | NA | ||
| 2123883 | 2123884 | APL_0539 | APL_0540 | thiD | thiE | TRUE | 0.961 | 14.000 | 0.036 | 1.000 | NA | |
| 2123884 | 2123885 | APL_0540 | APL_0541 | thiE | lepA | FALSE | 0.038 | 172.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123885 | 2123886 | APL_0541 | APL_0542 | lepA | lepB | TRUE | 0.882 | 105.000 | 0.224 | 1.000 | NA | |
| 2123886 | 2123887 | APL_0542 | APL_0543 | lepB | rnc | TRUE | 0.785 | 97.000 | 0.111 | 1.000 | NA | |
| 2123887 | 2123888 | APL_0543 | APL_0544 | rnc | era | TRUE | 0.875 | 70.000 | 0.119 | 0.030 | NA | |
| 2123888 | 2123889 | APL_0544 | APL_0545 | era | recO | TRUE | 0.986 | 10.000 | 0.109 | 1.000 | NA | |
| 2123890 | 2123891 | APL_0546 | APL_0547 | tadG | tadF | TRUE | 0.991 | 24.000 | 0.333 | NA | NA | |
| 2123891 | 2123892 | APL_0547 | APL_0548 | tadF | tadE | TRUE | 0.871 | -28.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 2123892 | 2123893 | APL_0548 | APL_0549 | tadE | tadD | TRUE | 0.875 | 3.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 2123893 | 2123894 | APL_0549 | APL_0550 | tadD | tadC | TRUE | 1.000 | -10.000 | 0.714 | NA | Y | NA |
| 2123894 | 2123895 | APL_0550 | APL_0551 | tadC | tadB | TRUE | 1.000 | 0.000 | 1.000 | NA | Y | NA |
| 2123895 | 2123896 | APL_0551 | APL_0552 | tadB | tadA | TRUE | 1.000 | 0.000 | 1.000 | NA | Y | NA |
| 2123896 | 2123897 | APL_0552 | APL_0553 | tadA | tadZ | TRUE | 1.000 | 9.000 | 0.833 | NA | Y | NA |
| 2123897 | 2123898 | APL_0553 | APL_0554 | tadZ | rcpB | TRUE | 0.899 | 163.000 | 0.500 | NA | NA | |
| 2123898 | 2123899 | APL_0554 | APL_0555 | rcpB | rcpA | TRUE | 0.999 | -3.000 | 0.600 | NA | NA | |
| 2123899 | 2123900 | APL_0555 | APL_0556 | rcpA | rcpC | TRUE | 1.000 | -10.000 | 0.833 | NA | NA | |
| 2123900 | 2123901 | APL_0556 | APL_0557 | rcpC | tadV | TRUE | 0.997 | 29.000 | 0.714 | NA | NA | |
| 2123901 | 2123902 | APL_0557 | APL_0558 | tadV | flp2 | TRUE | 0.424 | 45.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 2123902 | 2123903 | APL_0558 | APL_0559 | flp2 | flp1 | FALSE | 0.303 | 60.000 | 0.000 | NA | NA | |
| 2123904 | 2123905 | APL_0560 | APL_0561 | rhlB | FALSE | 0.184 | 118.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123905 | 2123906 | APL_0561 | APL_0562 | FALSE | 0.364 | 51.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123906 | 2123907 | APL_0562 | APL_0563 | afuA_2 | FALSE | 0.051 | 200.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2123907 | 2123908 | APL_0563 | APL_0564 | afuA_2 | afuB_2 | TRUE | 0.476 | 132.000 | 0.000 | 0.041 | Y | NA |
| 2123908 | 2123909 | APL_0564 | APL_0565 | afuB_2 | cirA | FALSE | 0.071 | 289.000 | 0.000 | 0.041 | NA | |
| 2123909 | 2123910 | APL_0565 | APL_0566 | cirA | rpsB | FALSE | 0.038 | 265.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |
| 2123910 | 2123911 | APL_0566 | APL_0567 | rpsB | tsf | TRUE | 0.996 | 96.000 | 0.815 | 1.000 | Y | NA |
| 2123913 | 2123914 | APL_0569 | APL_0570 | pyrH | frr | TRUE | 0.939 | 184.000 | 0.736 | 1.000 | N | NA |
| 2123916 | 2123917 | APL_0572 | APL_0573 | pdxS | pdxT | TRUE | 1.000 | 0.000 | 0.640 | NA | Y | NA |
| 2123918 | 2123919 | APL_0574 | APL_0575 | deaD | TRUE | 0.859 | 38.000 | 0.005 | 1.000 | Y | NA | |
| 2123919 | 2123920 | APL_0575 | APL_0576 | deaD | nlpI | FALSE | 0.313 | 222.000 | 0.085 | 1.000 | NA | |
| 2123920 | 2123921 | APL_0576 | APL_0577 | nlpI | pnp | TRUE | 0.760 | 61.000 | 0.067 | 1.000 | NA | |
| 2123922 | 2123923 | APL_0578 | APL_0579 | parC | mukF | FALSE | 0.072 | 140.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 2123923 | 2123924 | APL_0579 | APL_0580 | mukF | mukE | TRUE | 0.959 | 80.000 | 0.235 | NA | Y | NA |
| 2123924 | 2123925 | APL_0580 | APL_0581 | mukE | mukB | TRUE | 1.000 | 21.000 | 0.875 | 0.001 | Y | NA |
| 2123925 | 2123926 | APL_0581 | APL_0582 | mukB | sotB | FALSE | 0.185 | 77.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 2123927 | 2123928 | APL_0583 | APL_0584 | TRUE | 0.999 | 3.000 | 0.612 | NA | NA | |||
| 2123929 | 2123930 | APL_0585 | APL_0586 | TRUE | 0.978 | 33.000 | 0.308 | 1.000 | N | NA | ||
| 2123930 | 2123931 | APL_0586 | APL_0587 | acrB | TRUE | 0.998 | 13.000 | 0.500 | NA | N | NA | |
| 2123931 | 2123932 | APL_0587 | APL_0588 | acrB | glmU | FALSE | 0.031 | 219.000 | 0.000 | NA | N | NA |
| 2123933 | 2123934 | APL_0589 | APL_0590 | TRUE | 0.873 | 4.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123936 | 2123937 | APL_0592 | APL_0593 | guaA | guaB | TRUE | 0.889 | 419.000 | 0.244 | 0.001 | Y | NA |
| 2123938 | 2123939 | APL_0594 | APL_0595 | ftsJ | ftsH | TRUE | 0.797 | 104.000 | 0.150 | 1.000 | N | NA |
| 2123939 | 2123940 | APL_0595 | APL_0596 | ftsH | tyrP-A | FALSE | 0.024 | 238.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123940 | 2123941 | APL_0596 | APL_0597 | tyrP-A | tyrP-B | TRUE | 0.989 | 96.000 | 0.333 | 0.005 | Y | NA |
| 2123941 | 2123942 | APL_0597 | APL_0598 | tyrP-B | glnD | FALSE | 0.125 | 107.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123944 | 2123945 | APL_0600 | APL_0601 | rplM | rpsI | TRUE | 1.000 | 17.000 | 0.979 | 0.024 | Y | NA |
| 2123945 | 2123946 | APL_0601 | APL_0602 | rpsI | FALSE | 0.171 | 122.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123946 | 2123947 | APL_0602 | APL_0603 | TRUE | 0.966 | 0.000 | 0.019 | NA | NA | |||
| 2123947 | 2123948 | APL_0603 | APL_0604 | fieF | TRUE | 0.892 | 26.000 | 0.026 | NA | NA | ||
| 2123948 | 2123949 | APL_0604 | APL_0605 | fieF | TRUE | 0.947 | -19.000 | 0.009 | NA | NA | ||
| 2123949 | 2123950 | APL_0605 | APL_0606 | FALSE | 0.236 | 99.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123952 | 2123953 | APL_0608 | APL_0609 | pheS | pheT | TRUE | 0.997 | 99.000 | 0.661 | 0.001 | Y | NA |
| 2123953 | 2123954 | APL_0609 | APL_0610 | pheT | ihfA | TRUE | 0.985 | 18.000 | 0.196 | 1.000 | N | NA |
| 2123954 | 2123955 | APL_0610 | APL_0611 | ihfA | TRUE | 0.597 | 61.000 | 0.024 | NA | N | NA | |
| 2123956 | 2123957 | APL_0612 | APL_0613 | TRUE | 0.993 | 42.000 | 0.429 | NA | Y | NA | ||
| 2123957 | 2123958 | APL_0613 | APL_0614 | bioD1 | FALSE | 0.182 | 73.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 2123958 | 2123959 | APL_0614 | APL_0615 | bioD1 | mlc | TRUE | 0.804 | 54.000 | 0.088 | NA | N | NA |
| 2123960 | 2123961 | APL_0616 | APL_0617 | rnd | lrp | TRUE | 0.418 | 85.000 | 0.010 | 1.000 | N | NA |
| 2123961 | 2123962 | APL_0617 | APL_0618 | lrp | ftsK | TRUE | 0.953 | 12.000 | 0.026 | 1.000 | N | NA |
| 2123962 | 2123963 | APL_0618 | APL_0619 | ftsK | FALSE | 0.062 | 185.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123963 | 2123964 | APL_0619 | APL_0620 | aroG | FALSE | 0.166 | 123.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123964 | 2123965 | APL_0620 | APL_0621 | aroG | FALSE | 0.288 | 104.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA | |
| 2123966 | 2123967 | APL_0622 | APL_0623 | tdk | TRUE | 0.539 | 60.000 | 0.009 | NA | NA | ||
| 2123969 | 2123970 | APL_0625 | APL_0626 | macB | FALSE | 0.251 | 92.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123970 | 2123971 | APL_0626 | APL_0627 | macB | FALSE | 0.032 | 145.000 | 0.000 | 0.085 | N | NA | |
| 2123971 | 2123972 | APL_0627 | APL_0628 | FALSE | 0.047 | 229.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123972 | 2123973 | APL_0628 | APL_0629 | cpxR | FALSE | 0.277 | 65.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123973 | 2123974 | APL_0629 | APL_0630 | cpxR | mazG | FALSE | 0.290 | 125.000 | 0.006 | 1.000 | NA | |
| 2123975 | 2123976 | APL_0631 | APL_0632 | accD | folC | TRUE | 0.682 | 57.000 | 0.041 | 1.000 | N | NA |
| 2123976 | 2123977 | APL_0632 | APL_0633 | folC | hsdM3 | FALSE | 0.028 | 209.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2123977 | 2123978 | APL_0633 | APL_0634 | hsdM3 | hsdS3 | FALSE | 0.340 | 144.000 | 0.000 | 0.052 | Y | NA |
| 2123978 | 2123979 | APL_0634 | APL_0635 | hsdS3 | FALSE | 0.067 | 176.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123979 | 2123980 | APL_0635 | APL_0636 | hsdR3 | FALSE | 0.122 | 135.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123980 | 2123981 | APL_0636 | APL_2053 | hsdR3 | FALSE | 0.255 | 88.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123981 | 2123982 | APL_2053 | APL_0637 | FALSE | 0.049 | 221.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2123982 | 2123983 | APL_0637 | APL_0638 | nusA | TRUE | 0.999 | 17.000 | 0.760 | NA | NA | ||
| 2123983 | 2123984 | APL_0638 | APL_0639 | nusA | infB | TRUE | 0.991 | 22.000 | 0.332 | 1.000 | N | NA |
| 2123984 | 2123985 | APL_0639 | APL_0640 | infB | rbfA | TRUE | 0.963 | 172.000 | 0.609 | 1.000 | Y | NA |
| 2123985 | 2123986 | APL_0640 | APL_0641 | rbfA | truB | TRUE | 0.999 | 1.000 | 0.432 | 1.000 | Y | NA |
| 2123986 | 2123987 | APL_0641 | APL_0642 | truB | mltB | TRUE | 0.442 | 46.000 | 0.003 | NA | N | NA |
| 2123987 | 2123988 | APL_0642 | APL_0643 | mltB | FALSE | 0.139 | 129.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123989 | 2123990 | APL_0644 | APL_0645 | pta | ackA | TRUE | 0.938 | 56.000 | 0.133 | 1.000 | Y | NA |
| 2123992 | 2123993 | APL_0648 | APL_0649 | ompP2 | FALSE | 0.042 | 272.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2123995 | 2123996 | APL_0651 | APL_0652 | galU | manB | TRUE | 0.890 | 113.000 | 0.286 | 1.000 | N | NA |
| 2123996 | 2123997 | APL_0652 | APL_0653 | manB | csrA | TRUE | 0.989 | 35.000 | 0.500 | 1.000 | N | NA |
| 2123997 | 2123998 | APL_0653 | APL_0654 | csrA | alaS | TRUE | 0.441 | 78.000 | 0.011 | 1.000 | N | NA |
| 2123998 | 2123999 | APL_0654 | APL_0655 | alaS | uspA | FALSE | 0.085 | 226.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 2124001 | 2124002 | APL_0657 | APL_0658 | sspB | sspA | TRUE | 1.000 | 0.000 | 0.918 | NA | NA | |
| 2124003 | 2124004 | APL_0659 | APL_0660 | purE | ansB | TRUE | 0.869 | 10.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 2124004 | 2124005 | APL_0660 | APL_0661 | ansB | purK | FALSE | 0.324 | 110.000 | 0.008 | 1.000 | N | NA |
| 2124005 | 2124006 | APL_0661 | APL_0662 | purK | aspC | FALSE | 0.313 | 132.000 | 0.019 | 1.000 | N | NA |
| 2124007 | 2124008 | APL_0663 | APL_0664 | pepP | FALSE | 0.037 | 409.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124008 | 2124009 | APL_0664 | APL_0665 | FALSE | 0.119 | 136.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124009 | 2124010 | APL_0665 | APL_0666 | TRUE | 1.000 | 1.000 | 0.810 | NA | NA | |||
| 2124010 | 2124011 | APL_0666 | APL_0667 | uvrB | FALSE | 0.125 | 134.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124012 | 2124013 | APL_0668 | APL_0669 | TRUE | 0.999 | 15.000 | 0.468 | NA | Y | NA | ||
| 2124013 | 2124014 | APL_0669 | APL_0670 | TRUE | 0.857 | 11.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124015 | 2124016 | APL_0671 | APL_0672 | trpH | TRUE | 0.953 | 4.000 | 0.012 | NA | NA | ||
| 2124016 | 2124017 | APL_0672 | APL_0673 | sbcB | TRUE | 0.968 | 17.000 | 0.010 | NA | Y | NA | |
| 2124017 | 2124018 | APL_0673 | APL_0674 | sbcB | FALSE | 0.024 | 242.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2124020 | 2124021 | APL_0676 | APL_0677 | TRUE | 0.648 | 87.000 | 0.036 | NA | NA | |||
| 2124022 | 2124023 | APL_0678 | APL_0679 | efp | glnS | FALSE | 0.349 | 155.000 | 0.003 | 0.059 | Y | NA |
| 2124024 | 2124025 | APL_0680 | APL_0681 | FALSE | 0.035 | 182.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | ||
| 2124025 | 2124026 | APL_0681 | APL_0682 | hpt | TRUE | 0.447 | 109.000 | 0.021 | 1.000 | N | NA | |
| 2124026 | 2124027 | APL_0682 | APL_0683 | hpt | metB | FALSE | 0.133 | 104.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2124027 | 2124028 | APL_0683 | APL_0684 | metB | dapB | TRUE | 0.571 | 114.000 | 0.003 | 1.000 | Y | NA |
| 2124028 | 2124029 | APL_0684 | APL_0685 | dapB | mtfA | FALSE | 0.309 | 109.000 | 0.003 | NA | NA | |
| 2124029 | 2124030 | APL_0685 | APL_0686 | mtfA | FALSE | 0.295 | 372.000 | 0.098 | NA | NA | ||
| 2124032 | 2124033 | APL_0688 | APL_0689 | torZ | torY | TRUE | 0.883 | 196.000 | 0.312 | 0.043 | Y | NA |
| 2124034 | 2124035 | APL_0690 | APL_0691 | moaA | moaC | TRUE | 0.630 | 248.000 | 0.039 | 0.005 | Y | NA |
| 2124035 | 2124036 | APL_0691 | APL_0692 | moaC | moaD | TRUE | 0.996 | 22.000 | 0.151 | 0.005 | Y | NA |
| 2124036 | 2124037 | APL_0692 | APL_0693 | moaD | moaE | TRUE | 1.000 | 1.000 | 0.542 | 0.005 | Y | NA |
| 2124037 | 2124038 | APL_0693 | APL_0694 | moaE | TRUE | 0.417 | 81.000 | 0.004 | NA | NA | ||
| 2124038 | 2124039 | APL_0694 | APL_0695 | TRUE | 0.902 | 12.000 | 0.003 | NA | NA | |||
| 2124042 | 2124043 | APL_0698 | APL_0699 | argA | aroA | FALSE | 0.377 | 148.000 | 0.004 | 1.000 | Y | NA |
| 2124043 | 2124044 | APL_0699 | APL_0700 | aroA | hisC | TRUE | 0.986 | 14.000 | 0.042 | 1.000 | Y | NA |
| 2124044 | 2124045 | APL_0700 | APL_0701 | hisC | FALSE | 0.380 | 200.000 | 0.000 | 0.016 | Y | NA | |
| 2124045 | 2124046 | APL_0701 | APL_0702 | serC | FALSE | 0.369 | 206.000 | 0.000 | 0.016 | Y | NA | |
| 2124046 | 2124047 | APL_0702 | APL_0703 | serC | FALSE | 0.032 | 194.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2124047 | 2124048 | APL_0703 | APL_0704 | TRUE | 0.879 | 0.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124048 | 2124049 | APL_0704 | APL_0705 | TRUE | 0.422 | 402.000 | 0.167 | NA | NA | |||
| 2124049 | 2124050 | APL_0705 | APL_0706 | FALSE | 0.022 | 280.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | ||
| 2124050 | 2124051 | APL_0706 | APL_0707 | TRUE | 0.994 | 10.000 | 0.243 | NA | N | NA | ||
| 2124051 | 2124052 | APL_0707 | APL_0708 | ppx | FALSE | 0.035 | 201.000 | 0.000 | NA | N | NA | |
| 2124053 | 2124054 | APL_0709 | APL_0710 | lysC | FALSE | 0.036 | 495.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124055 | 2124056 | APL_0711 | APL_0712 | TRUE | 0.943 | 0.000 | 0.006 | NA | NA | |||
| 2124056 | 2124057 | APL_0712 | APL_0713 | dnaB | TRUE | 0.804 | 38.000 | 0.022 | NA | NA | ||
| 2124058 | 2124059 | APL_0714 | APL_0715 | TRUE | 0.957 | 87.000 | 0.243 | 1.000 | Y | NA | ||
| 2124059 | 2124060 | APL_0715 | APL_0716 | TRUE | 0.998 | 63.000 | 0.918 | 0.040 | Y | NA | ||
| 2124060 | 2124061 | APL_0716 | APL_0717 | TRUE | 0.994 | 2.000 | 0.091 | 1.000 | Y | NA | ||
| 2124061 | 2124062 | APL_0717 | APL_0718 | FALSE | 0.216 | 189.000 | 0.000 | NA | Y | NA | ||
| 2124062 | 2124063 | APL_0718 | APL_0719 | TRUE | 0.998 | 10.000 | 0.497 | NA | NA | |||
| 2124063 | 2124064 | APL_0719 | APL_0720 | TRUE | 0.844 | 64.000 | 0.130 | NA | NA | |||
| 2124065 | 2124066 | APL_0721 | APL_0722 | TRUE | 0.972 | 7.000 | 0.035 | NA | NA | |||
| 2124066 | 2124067 | APL_0722 | APL_0723 | tgt | TRUE | 0.467 | 73.000 | 0.006 | NA | NA | ||
| 2124068 | 2124069 | APL_0724 | APL_0725 | cspD | TRUE | 0.485 | 123.000 | 0.027 | NA | NA | ||
| 2124069 | 2124070 | APL_0725 | APL_0726 | cspD | FALSE | 0.358 | 118.000 | 0.014 | 1.000 | N | NA | |
| 2124070 | 2124071 | APL_0726 | APL_0727 | ilvI | FALSE | 0.021 | 317.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2124071 | 2124072 | APL_0727 | APL_0728 | ilvI | ilvH | TRUE | 1.000 | -7.000 | 0.461 | 0.002 | Y | NA |
| 2124074 | 2124075 | APL_0730 | APL_0731 | TRUE | 0.753 | 45.000 | 0.021 | NA | NA | |||
| 2124075 | 2124076 | APL_0731 | APL_0732 | ubiX | TRUE | 0.667 | 60.000 | 0.026 | NA | NA | ||
| 2124076 | 2124077 | APL_0732 | APL_0733 | ubiX | TRUE | 0.875 | 3.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124077 | 2124078 | APL_0733 | APL_0734 | TRUE | 0.408 | 47.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124079 | 2124080 | APL_0735 | APL_0736 | pyrF | TRUE | 0.617 | 80.000 | 0.039 | 1.000 | N | NA | |
| 2124080 | 2124081 | APL_0736 | APL_0737 | pyrF | TRUE | 0.962 | 25.000 | 0.142 | 1.000 | N | NA | |
| 2124081 | 2124082 | APL_0737 | APL_0738 | TRUE | 0.995 | 0.000 | 0.239 | NA | NA | |||
| 2124082 | 2124083 | APL_0738 | APL_0739 | ihfB | TRUE | 0.862 | 69.000 | 0.156 | NA | NA | ||
| 2124083 | 2124084 | APL_0739 | APL_0740 | ihfB | rpsA | TRUE | 0.911 | 74.000 | 0.263 | 1.000 | N | NA |
| 2124084 | 2124085 | APL_0740 | APL_0741 | rpsA | cmkA | TRUE | 0.841 | 97.000 | 0.176 | 1.000 | N | NA |
| 2124085 | 2124086 | APL_0741 | APL_0742 | cmkA | degS | TRUE | 0.653 | 30.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 2124086 | 2124087 | APL_0742 | APL_2108 | degS | FALSE | 0.102 | 145.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124087 | 2124088 | APL_2108 | APL_0743 | secG | TRUE | 0.763 | 19.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124088 | 2124089 | APL_0743 | APL_0744 | secG | topB2 | FALSE | 0.244 | 132.000 | 0.011 | 1.000 | N | NA |
| 2124091 | 2124092 | APL_0747 | APL_0748 | mepA | aroC | TRUE | 0.526 | 95.000 | 0.024 | 1.000 | N | NA |
| 2124092 | 2124093 | APL_0748 | APL_0749 | aroC | TRUE | 0.736 | 22.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA | |
| 2124093 | 2124094 | APL_0749 | APL_0750 | TRUE | 0.926 | 18.000 | 0.000 | 0.083 | Y | NA | ||
| 2124094 | 2124095 | APL_0750 | APL_0751 | menE | TRUE | 0.941 | -19.000 | 0.013 | 1.000 | N | NA | |
| 2124095 | 2124096 | APL_0751 | APL_0752 | menE | seqA | TRUE | 0.938 | 18.000 | 0.035 | NA | N | NA |
| 2124097 | 2124098 | APL_0753 | APL_0754 | yecO | TRUE | 0.955 | 8.000 | 0.013 | NA | NA | ||
| 2124098 | 2124099 | APL_0754 | APL_0755 | yecO | fabI | FALSE | 0.156 | 199.000 | 0.013 | NA | NA | |
| 2124099 | 2124100 | APL_0755 | APL_0756 | fabI | FALSE | 0.036 | 448.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124100 | 2124101 | APL_0756 | APL_0757 | rnb | FALSE | 0.133 | 132.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124101 | 2124102 | APL_0757 | APL_0758 | rnb | FALSE | 0.250 | 75.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2124102 | 2124103 | APL_0758 | APL_0759 | TRUE | 0.998 | -3.000 | 0.392 | 1.000 | NA | |||
| 2124103 | 2124104 | APL_0759 | APL_0760 | apaH | TRUE | 0.513 | 25.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2124104 | 2124105 | APL_0760 | APL_2054 | apaH | FALSE | 0.282 | 64.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124107 | 2124108 | APL_0762 | APL_0763 | perM | FALSE | 0.311 | 59.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124108 | 2124109 | APL_0763 | APL_0764 | perM | TRUE | 0.561 | 30.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124109 | 2124110 | APL_0764 | APL_0765 | queA | TRUE | 0.397 | 48.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124111 | 2124112 | APL_0766 | APL_0767 | rec2 | FALSE | 0.321 | 100.000 | 0.003 | 1.000 | NA | ||
| 2124113 | 2124114 | APL_0768 | APL_0769 | dgkA | ushA | TRUE | 0.877 | 81.000 | 0.200 | 1.000 | N | NA |
| 2124114 | 2124115 | APL_0769 | APL_0770 | ushA | FALSE | 0.036 | 455.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124116 | 2124117 | APL_2107 | APL_2106 | TRUE | 0.778 | 18.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124117 | 2124118 | APL_2106 | APL_0771 | lpdA | FALSE | 0.043 | 258.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124118 | 2124119 | APL_0771 | APL_0772 | lpdA | aceF | TRUE | 0.982 | 96.000 | 0.440 | 1.000 | Y | NA |
| 2124119 | 2124120 | APL_0772 | APL_0773 | aceF | aceE | TRUE | 0.985 | 60.000 | 0.412 | 1.000 | Y | NA |
| 2124120 | 2124121 | APL_0773 | APL_0774 | aceE | pyrD | FALSE | 0.021 | 355.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2124121 | 2124122 | APL_0774 | APL_0775 | pyrD | prsA | TRUE | 0.689 | 74.000 | 0.005 | 1.000 | Y | NA |
| 2124122 | 2124123 | APL_0775 | APL_0776 | prsA | ispE | TRUE | 0.980 | 12.000 | 0.099 | 1.000 | N | NA |
| 2124123 | 2124124 | APL_0776 | APL_0777 | ispE | lolB | TRUE | 0.993 | 10.000 | 0.224 | 1.000 | N | NA |
| 2124124 | 2124125 | APL_0777 | APL_0778 | lolB | msbA | FALSE | 0.202 | 129.000 | 0.006 | 1.000 | N | NA |
| 2124125 | 2124126 | APL_0778 | APL_0779 | msbA | FALSE | 0.130 | 105.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA | |
| 2124126 | 2124127 | APL_0779 | APL_0780 | TRUE | 0.998 | 10.000 | 0.392 | 1.000 | NA | |||
| 2124127 | 2124128 | APL_0780 | APL_0781 | TRUE | 0.553 | 67.000 | 0.015 | 1.000 | NA | |||
| 2124128 | 2124129 | APL_0781 | APL_0782 | uvrA | FALSE | 0.131 | 480.000 | 0.000 | 1.000 | Y | NA | |
| 2124131 | 2124132 | APL_0784 | APL_0785 | FALSE | 0.039 | 324.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124132 | 2124133 | APL_0785 | APL_0786 | FALSE | 0.037 | 422.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124133 | 2124134 | APL_0786 | APL_0787 | FALSE | 0.270 | 67.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124134 | 2124135 | APL_0787 | APL_0788 | FALSE | 0.036 | 313.000 | 0.000 | 1.000 | NA | |||
| 2124136 | 2124137 | APL_0789 | APL_0790 | FALSE | 0.035 | 539.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124138 | 2124139 | APL_0792 | APL_0793 | sapD | FALSE | 0.262 | 83.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124139 | 2124140 | APL_0793 | APL_0794 | sapD | sapC | TRUE | 1.000 | 14.000 | 0.757 | 1.000 | Y | NA |
| 2124140 | 2124141 | APL_0794 | APL_0795 | sapC | sapB | TRUE | 1.000 | -10.000 | 0.785 | 0.039 | Y | NA |
| 2124141 | 2124142 | APL_0795 | APL_0796 | sapB | sapA | TRUE | 0.999 | 0.000 | 0.615 | 0.039 | N | NA |
| 2124142 | 2124143 | APL_0796 | APL_0797 | sapA | tyrR | TRUE | 0.990 | 10.000 | 0.059 | 1.000 | Y | NA |
| 2124144 | 2124145 | APL_0798 | APL_0799 | lpcA | FALSE | 0.036 | 492.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124147 | 2124148 | APL_0801 | APL_0802 | ftsB | ispD | TRUE | 0.987 | 16.000 | 0.198 | 1.000 | N | NA |
| 2124148 | 2124149 | APL_0802 | APL_0803 | ispD | ispF | TRUE | 0.999 | -3.000 | 0.451 | 1.000 | Y | NA |
| 2124150 | 2124151 | APL_0804 | APL_0805 | TRUE | 0.815 | 38.000 | 0.027 | 1.000 | NA | |||
| 2124152 | 2124153 | APL_0806 | APL_0807 | xseB | ispA | TRUE | 0.903 | 9.000 | 0.005 | 1.000 | N | NA |
| 2124154 | 2124155 | APL_0808 | APL_0809 | lysS | FALSE | 0.232 | 101.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124155 | 2124156 | APL_0809 | APL_0810 | lysS | cafA | FALSE | 0.372 | 135.000 | 0.000 | 0.057 | Y | NA |
| 2124158 | 2124159 | APL_0812 | APL_0813 | res | mod | TRUE | 0.756 | 140.000 | 0.222 | 0.050 | N | NA |
| 2124160 | 2124161 | APL_0814 | APL_0815 | FALSE | 0.292 | 146.000 | 0.018 | NA | NA | |||
| 2124163 | 2124164 | APL_2055 | APL_0817 | xseA | FALSE | 0.143 | 128.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124164 | 2124165 | APL_0817 | APL_2056 | xseA | FALSE | 0.044 | 250.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124167 | 2124168 | APL_0819 | APL_0820 | purR | TRUE | 0.967 | 23.000 | 0.111 | NA | NA | ||
| 2124169 | 2124170 | APL_0821 | APL_0822 | gyrB | ubiA | FALSE | 0.027 | 213.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2124170 | 2124171 | APL_0822 | APL_0823 | ubiA | glpR | TRUE | 0.934 | 0.000 | 0.009 | 1.000 | N | NA |
| 2124171 | 2124172 | APL_0823 | APL_0824 | glpR | purB | FALSE | 0.275 | 68.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA |
| 2124172 | 2124173 | APL_0824 | APL_0825 | purB | TRUE | 0.846 | 57.000 | 0.109 | NA | NA | ||
| 2124173 | 2124174 | APL_0825 | APL_0826 | cydC | FALSE | 0.229 | 165.000 | 0.016 | NA | NA | ||
| 2124174 | 2124175 | APL_0826 | APL_0827 | cydC | cydD | TRUE | 1.000 | 11.000 | 0.559 | 0.006 | Y | NA |
| 2124175 | 2124176 | APL_0827 | APL_0828 | cydD | FALSE | 0.204 | 160.000 | 0.011 | NA | NA | ||
| 2124176 | 2124177 | APL_0828 | APL_0829 | TRUE | 0.976 | 61.000 | 0.496 | NA | NA | |||
| 2124177 | 2124178 | APL_0829 | APL_0830 | TRUE | 0.925 | 16.000 | 0.012 | NA | NA | |||
| 2124178 | 2124179 | APL_0830 | APL_0831 | TRUE | 0.991 | 0.000 | 0.148 | NA | NA | |||
| 2124182 | 2124183 | APL_0834 | APL_0835 | udk | dcd | TRUE | 0.995 | 9.000 | 0.131 | 1.000 | Y | NA |
| 2124185 | 2124186 | APL_0837 | APL_0838 | TRUE | 0.999 | 4.000 | 0.667 | 1.000 | NA | |||
| 2124186 | 2124187 | APL_0838 | APL_0839 | TRUE | 0.996 | 2.000 | 0.286 | NA | NA | |||
| 2124187 | 2124188 | APL_0839 | APL_0840 | TRUE | 0.984 | 17.000 | 0.167 | NA | N | NA | ||
| 2124189 | 2124190 | APL_0841 | APL_0842 | pntB | pntA | TRUE | 1.000 | 11.000 | 0.691 | 0.001 | Y | NA |
| 2124192 | 2124193 | APL_0844 | APL_0845 | queF | gmhB | TRUE | 0.939 | 13.000 | 0.012 | 1.000 | NA | |
| 2124193 | 2124194 | APL_0845 | APL_0846 | gmhB | bcp | TRUE | 0.953 | 3.000 | 0.018 | 1.000 | N | NA |
| 2124194 | 2124195 | APL_0846 | APL_0847 | bcp | FALSE | 0.292 | 75.000 | 0.003 | 1.000 | N | NA | |
| 2124196 | 2124197 | APL_0848 | APL_0849 | TRUE | 0.981 | 99.000 | 0.364 | 0.039 | Y | NA | ||
| 2124197 | 2124198 | APL_0849 | APL_0850 | TRUE | 0.999 | 0.000 | 0.455 | 0.082 | Y | NA | ||
| 2124198 | 2124199 | APL_0850 | APL_0851 | TRUE | 0.999 | 4.000 | 0.467 | 0.003 | NA | |||
| 2124199 | 2124200 | APL_0851 | APL_0852 | TRUE | 0.883 | 52.000 | 0.133 | 1.000 | NA | |||
| 2124204 | 2124205 | APL_0856 | APL_0857 | sdaC | sdaA | TRUE | 0.990 | 96.000 | 0.571 | NA | Y | NA |
| 2124206 | 2124207 | APL_0858 | APL_0859 | trpCF | FALSE | 0.049 | 205.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2124208 | 2124209 | APL_0860 | APL_0861 | fic | TRUE | 0.869 | 8.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124209 | 2124210 | APL_0861 | APL_0862 | truC | TRUE | 0.999 | 1.000 | 0.544 | NA | NA | ||
| 2124210 | 2124211 | APL_0862 | APL_0863 | truC | TRUE | 0.982 | 2.000 | 0.067 | NA | NA | ||
| 2124211 | 2124212 | APL_0863 | APL_0864 | TRUE | 0.982 | -3.000 | 0.067 | NA | NA | |||
| 2124214 | 2124215 | APL_0866 | APL_0867 | smpB | FALSE | 0.208 | 134.000 | 0.004 | 1.000 | NA | ||
| 2124215 | 2124216 | APL_0867 | APL_0868 | smpB | serS | FALSE | 0.224 | 118.000 | 0.004 | 1.000 | N | NA |
| 2124217 | 2124218 | APL_0869 | APL_0870 | abgB | TRUE | 0.938 | 94.000 | 0.320 | 1.000 | NA | ||
| 2124218 | 2124219 | APL_0870 | APL_0871 | pepE | TRUE | 0.985 | 11.000 | 0.122 | 1.000 | N | NA | |
| 2124220 | 2124221 | APL_0872 | APL_0873 | leuS | rlpB | TRUE | 0.840 | 108.000 | 0.195 | NA | N | NA |
| 2124221 | 2124222 | APL_0873 | APL_0874 | rlpB | holA | TRUE | 0.841 | 109.000 | 0.200 | NA | N | NA |
| 2124223 | 2124224 | APL_0875 | APL_0876 | yacG | coaE | TRUE | 0.961 | -18.000 | 0.018 | 1.000 | NA | |
| 2124224 | 2124225 | APL_0876 | APL_0877 | coaE | apfD | TRUE | 0.965 | 22.000 | 0.100 | 1.000 | NA | |
| 2124225 | 2124226 | APL_0877 | APL_0878 | apfD | apfC | TRUE | 0.962 | 27.000 | 0.150 | 1.000 | NA | |
| 2124226 | 2124227 | APL_0878 | APL_0879 | apfC | apfB | TRUE | 0.997 | -16.000 | 0.182 | 1.000 | Y | NA |
| 2124227 | 2124228 | APL_0879 | APL_0880 | apfB | apfA | TRUE | 0.999 | 18.000 | 0.515 | NA | Y | NA |
| 2124230 | 2124231 | APL_0882 | APL_0883 | folA | FALSE | 0.146 | 127.000 | 0.000 | NA | NA | ||
| 2124232 | 2124233 | APL_0884 | APL_0885 | proB | TRUE | 0.922 | 13.000 | 0.006 | 1.000 | NA | ||
| 2124233 | 2124234 | APL_0885 | APL_0886 | nth | TRUE | 0.956 | 1.000 | 0.013 | 1.000 | NA | ||
| 2124234 | 2124235 | APL_0886 | APL_0887 | nth | fadI | FALSE | 0.028 | 210.000 | 0.000 | 1.000 | N | NA |
| 2124235 | 2124236 | APL_0887 | APL_0888 | fadI | fadJ | TRUE | 0.984 | 10.000 | 0.018 | 1.000 | Y | NA |
| 2124236 | 2124237 | APL_0888 | APL_0889 | fadJ | TRUE | 0.915 | 91.000 | 0.250 | NA | NA | ||
| 2124238 | 2124239 | APL_0890 | APL_0891 | fdhD | TRUE | 0.866 | 2.000 | 0.000 | 1.000 | NA | ||
| 2124240 | 2124241 | APL_0892 | APL_0893 | fdxG | fdxG | TRUE | 0.995 | 49.000 | 0.500 | 0.003 | NA | |
| 2124241 | 2124242 | APL_0893 | APL_0894 | fdxG | fdxH | TRUE | 1.000 | 0.000 | 0.714 | 0.002 | NA | |
| 2124242 | 2124243 | APL_0894 | APL_0895 | fdxH | fdnI | TRUE | 1.000 | -7.000 | 0.368 | 0.002 | Y | NA |
| 2124243 | 2124244 | APL_0895 | APL_0896 | fdnI | fdhE | TRUE | 0.787 | 110.000 | 0.152 | NA | N | NA |
| 2124245 | 2124246 | APL_2105 | APL_2104 | TRUE | 0.437 | 44.000 | 0.000 | NA | NA | |||
| 2124247 | 2124248 | APL_0897 | APL_0898 | folD | FALSE | 0.127 | 145.000 | 0.003 | NA | N | NA | |
| 2124249 |