MicrobesOnline Operon Predictions for Prochlorococcus marinus str. MIT 9303

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1218468 1218467     dnaN   TRUE 0.710 4.000 0.022 NA   NA
 1218467 1218466         FALSE 0.600 58.000 0.039 NA   NA
 1218466 1218465       purF TRUE 0.861 60.000 0.019 1.000 Y NA
 1218464 1218463         TRUE 0.833 78.000 0.314 1.000   NA
 1218463 1218462         TRUE 0.818 10.000 0.102 1.000   NA
 1218461 1218460         FALSE 0.596 72.000 0.043 NA   NA
 1218460 1218459       nusB FALSE 0.361 30.000 0.016 NA   NA
 1218459 1218458     nusB ftsY TRUE 0.876 0.000 0.013 1.000   NA
 1218458 1218457     ftsY rsbU TRUE 0.726 64.000 0.013 1.000 N NA
 1218457 1218456     rsbU argH TRUE 0.688 30.000 0.021 1.000 N NA
 1218456 1218455     argH   FALSE 0.261 124.000 0.019 1.000   NA
 1218453 1218452         FALSE 0.105 -73.000 0.024 1.000   NA
 1218451 1218450       pilT TRUE 0.911 17.000 0.218 1.000 Y NA
 1218450 1218449     pilT   TRUE 0.931 11.000 0.028 0.004 Y NA
 1218448 1218447     grpE dnaJ TRUE 0.935 45.000 0.168 0.013 Y NA
 1218447 1218446     dnaJ   TRUE 0.910 -3.000 0.067 1.000   NA
 1218446 1218445         FALSE 0.638 -13.000 0.058 1.000   NA
 1218444 1218443       murB FALSE 0.494 25.000 0.030 NA   NA
 1218443 1218442     murB murC TRUE 0.834 -24.000 0.136 0.006 Y NA
 1218440 1218439     thiL   TRUE 0.736 11.000 0.003 1.000 N NA
 1218438 1218437     efp accB TRUE 0.956 0.000 0.120 1.000 N NA
 1218431 1218430         TRUE 0.687 63.000 0.091 NA   NA
 1218429 1218428         TRUE 0.806 -10.000 0.471 NA   NA
 1218428 1218427         FALSE 0.220 201.000 0.588 NA   NA
 1309271 1218426     tRNA-Gly dhsS FALSE 0.290 49.000 0.000 NA   NA
 1218425 1218424     cbiD   TRUE 0.721 41.000 0.023 1.000 N NA
 1218424 1219685         FALSE 0.060 195.000 0.000 1.000   NA
 1219685 1218423         FALSE 0.005 338.000 0.000 NA   NA
 1218423 1218422         TRUE 0.857 16.000 0.650 NA   NA
 1218422 1218421         TRUE 0.718 6.000 0.047 NA   NA
 1218420 1218419       sqdB TRUE 0.893 30.000 0.194 1.000 Y NA
 1218419 1218418     sqdB   TRUE 0.675 59.000 0.079 NA   NA
 1218418 1218417       thiG FALSE 0.456 68.000 0.018 NA   NA
 1218416 1219683         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219682 1294984         FALSE 0.068 129.000 0.000 NA   NA
 1218415 1218414     rplT rpmI TRUE 0.969 71.000 0.928 0.028 Y NA
 1295434 1218413         FALSE 0.247 25.000 0.000 NA   NA
 1218413 1218412         TRUE 0.816 25.000 0.164 1.000 N NA
 1218411 1218410     dnaX   FALSE 0.250 24.000 0.000 NA   NA
 1218410 1218409         FALSE 0.159 98.000 0.000 NA   NA
 1218409 1295283         FALSE 0.006 317.000 0.000 NA   NA
 1295283 1218408       clpX FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 1218408 1218407     clpX   TRUE 0.876 89.000 0.037 0.005 Y NA
 1218407 1218406       tig TRUE 0.858 47.000 0.025 1.000 Y NA
 1218405 1218404     asd dapA TRUE 0.961 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 1218402 1218401       mesJ FALSE 0.072 -39.000 0.007 NA   NA
 1218400 1218399         FALSE 0.645 45.000 0.086 NA   NA
 1218399 1218398       uvrB FALSE 0.160 105.000 0.003 NA   NA
 1218398 1219678     uvrB   FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 1219678 1219677         FALSE 0.307 54.000 0.000 NA   NA
 1218397 1218396     lysC holA TRUE 0.717 49.000 0.015 1.000 N NA
 1218394 1218393         TRUE 0.992 2.000 0.917 0.005 Y NA
 1218393 1218392         TRUE 0.962 -3.000 0.167 0.003   NA
 1218392 1218391         FALSE 0.507 36.000 0.000 1.000   NA
 1218390 1218389       ribH TRUE 0.723 53.000 0.037 1.000   NA
 1218389 1309288     ribH tRNA-Gly FALSE 0.256 79.000 0.000 NA   NA
 1218387 1218386       rfbA TRUE 0.753 16.000 0.000 0.005   NA
 1218386 1295324     rfbA rfbC TRUE 0.794 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 1295324 1218385     rfbC   FALSE 0.062 194.000 0.000 1.000   NA
 1218385 1218384       rfbD FALSE 0.521 21.000 0.000 1.000   NA
 1218384 1218383     rfbD   FALSE 0.060 227.000 0.000 1.000 N NA
 1218383 1218382         FALSE 0.392 154.000 0.250 1.000 N NA
 1218382 1218381       gmhA FALSE 0.342 -46.000 0.154 1.000 N NA
 1218381 1218380     gmhA rfaE TRUE 0.947 -3.000 0.154 1.000 N NA
 1218380 1218379     rfaE   TRUE 0.829 73.000 0.000 1.000 Y NA
 1218379 1218378         FALSE 0.498 30.000 0.000 1.000   NA
 1218378 1218377         TRUE 0.741 57.000 0.000 0.063   NA
 1218377 1219928         TRUE 0.925 -7.000 0.026 0.003 Y NA
 1219928 1295142         FALSE 0.302 14.000 0.000 NA   NA
 1295142 1218376         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1218375 1218374         FALSE 0.083 -30.000 0.000 NA   NA
 1218374 1218373         FALSE 0.246 36.000 0.000 NA   NA
 1218373 1218372       spsE TRUE 0.951 -7.000 0.549 1.000 Y NA
 1218372 1295384     spsE   FALSE 0.410 -15.000 0.000 1.000   NA
 1295384 1218371         TRUE 0.812 -3.000 0.000 1.000   NA
 1218371 1218370         TRUE 0.980 -3.000 0.418 1.000 Y NA
 1218370 1219676         TRUE 0.964 0.000 0.031 0.011 N NA
 1219676 1218369         TRUE 0.851 -7.000 0.131 1.000 N NA
 1218369 1218368         TRUE 0.938 2.000 0.144 1.000   NA
 1218368 1218367         TRUE 0.819 9.000 0.088 1.000   NA
 1219675 1219674         FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 1219674 1219673         FALSE 0.013 218.000 0.000 NA   NA
 1219673 1219672         FALSE 0.012 232.000 0.000 NA   NA
 1219672 1219671         FALSE 0.066 -36.000 0.000 NA   NA
 1219671 1219670         FALSE 0.378 8.000 0.000 NA   NA
 1219670 1218365         FALSE 0.307 58.000 0.000 NA   NA
 1218365 1218364         FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 1218363 1218362         FALSE 0.090 214.000 0.000 0.030   NA
 1218361 1219669         FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1219669 1218360         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1218360 1219668         FALSE 0.013 -100.000 0.000 NA   NA
 1218359 1218358         TRUE 0.812 -3.000 0.000 1.000   NA
 1218358 1218357         FALSE 0.033 164.000 0.000 NA   NA
 1218357 1218356         FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 1218356 1218355         FALSE 0.105 110.000 0.000 NA   NA
 1218355 1218354       tagG TRUE 0.979 -3.000 0.625 NA Y NA
 1218354 1218353     tagG   TRUE 0.893 4.000 0.000 NA Y NA
 1218353 1218352       rfbG TRUE 0.906 -15.000 0.624 1.000 Y NA
 1218352 1218351     rfbG   TRUE 0.928 57.000 0.247 1.000 Y NA
 1218351 1218350         TRUE 0.875 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1218350 1218349         TRUE 0.808 9.000 0.024 1.000 N NA
 1218349 1218348         TRUE 0.794 81.000 0.000 1.000 Y NA
 1218348 1218347         FALSE 0.583 58.000 0.000 1.000   NA
 1218347 1218346         TRUE 0.753 27.000 0.027 0.051   NA
 1218346 1218345         FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1218345 1219927         FALSE 0.076 -31.000 0.000 NA   NA
 1219665 1218344       secA FALSE 0.003 589.000 0.000 NA   NA
 1218343 1218342     cysE   TRUE 0.881 23.000 0.452 1.000 N NA
 1218341 1218340     infC miaA TRUE 0.862 63.000 0.020 1.000 Y NA
 1218339 1218338     gyrB   TRUE 0.791 0.000 0.020 NA   NA
 1218338 1218337         TRUE 0.754 -19.000 0.900 NA   NA
 1218337 1218336         TRUE 0.967 -7.000 0.722 0.079 Y NA
 1218336 1218335         FALSE 0.013 423.000 0.000 1.000   NA
 1218333 1218332     mgtE   TRUE 0.671 48.000 0.000 1.000 N NA
 1218331 1218330         TRUE 0.677 42.000 0.136 NA   NA
 1218330 1218329         TRUE 0.937 8.000 1.000 NA N NA
 1218328 1218327       sdhA TRUE 0.953 0.000 0.023 0.002   NA
 1218327 1218326     sdhA sdhB TRUE 0.971 -3.000 0.019 0.002 Y NA
 1218324 1218323     mutY   TRUE 0.667 25.000 0.014 1.000 N NA
 1218318 1218317     mreB mreC TRUE 0.881 5.000 0.043 1.000 N NA
 1218317 1218316     mreC   TRUE 0.821 0.000 0.024 NA   NA
 1218316 1218315         TRUE 0.746 14.000 0.169 NA   NA
 1218315 1218314         FALSE 0.394 147.000 0.185 1.000 N NA
 1218314 1218313       lysS TRUE 0.754 47.000 0.027 1.000 N NA
 1218313 1218312     lysS   FALSE 0.546 60.000 0.026 NA   NA
 1218311 1218310         TRUE 0.931 -3.000 0.333 NA   NA
 1218310 1218309         TRUE 0.829 26.000 0.611 NA   NA
 1218309 1218308         TRUE 0.874 -3.000 0.097 NA   NA
 1295362 1218307         FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 1218305 1218304     ruvB   TRUE 0.901 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1218304 1218303         TRUE 0.955 -3.000 0.365 1.000   NA
 1218303 1295162         TRUE 0.936 -3.000 0.365 NA   NA
 1295162 1218302       thiC FALSE 0.010 277.000 0.006 NA   NA
 1218302 1219661     thiC   FALSE 0.002 2218.000 0.000 NA   NA
 1219661 1219660         FALSE 0.004 397.000 0.000 NA   NA
 1218301 1219658         FALSE 0.002 1428.000 0.000 NA   NA
 1219658 1218300         FALSE 0.378 8.000 0.000 NA   NA
 1219657 1218299       aroK FALSE 0.003 663.000 0.000 NA   NA
 1218298 1218297         TRUE 0.951 9.000 0.370 1.000 Y NA
 1218297 1218296         FALSE 0.582 60.000 0.000 1.000   NA
 1218296 1219656         FALSE 0.138 103.000 0.000 NA   NA
 1219656 1218295         FALSE 0.027 175.000 0.000 NA   NA
 1218295 1219655         FALSE 0.094 115.000 0.000 NA   NA
 1219655 1218294         FALSE 0.005 373.000 0.000 NA   NA
 1218292 1218291         TRUE 0.863 -3.000 0.020 1.000   NA
 1218289 1218288     nadB psbU TRUE 0.713 72.000 0.036 1.000   NA
 1218288 1218287     psbU   FALSE 0.495 112.000 0.268 NA   NA
 1218286 1218285     bacA   TRUE 0.763 22.000 0.055 1.000 N NA
 1218285 1218284         FALSE 0.628 25.000 0.000 1.000 N NA
 1218284 1218283         TRUE 0.903 0.000 0.000 1.000 N NA
 1218283 1219652         FALSE 0.103 -27.000 0.000 NA   NA
 1309419 1309289     rrs tRNA-Ile FALSE 0.010 242.000 0.000 NA   NA
 1309289 1309290     tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.348 10.000 0.000 NA   NA
 1362595 1295379     pseudo   FALSE 0.378 8.000 0.000 NA   NA
 1365778 1309421     rrl rrf FALSE 0.105 110.000 0.000 NA   NA
 1218282 1219648     rbn   FALSE 0.609 40.000 0.069 NA   NA
 1219648 1218281         TRUE 0.909 2.000 0.154 NA   NA
 1218280 1219647         FALSE 0.306 64.000 0.000 NA   NA
 1218279 1218278       xseA TRUE 0.976 -3.000 0.412 0.001   NA
 1218278 1218277     xseA   FALSE 0.347 -10.000 0.013 NA   NA
 1218277 1218276         FALSE 0.449 126.000 0.357 NA   NA
 1218276 1218275       hrpB FALSE 0.354 106.000 0.012 1.000   NA
 1218275 1218274     hrpB   FALSE 0.280 16.000 0.000 NA   NA
 1218274 1218273         FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 1218273 1218272         TRUE 0.897 58.000 1.000 NA   NA
 1219925 1218271         FALSE 0.293 15.000 0.000 NA   NA
 1218270 1218269         FALSE 0.271 117.000 0.051 NA   NA
 1218267 1218266         FALSE 0.306 62.000 0.000 NA   NA
 1218264 1218263         TRUE 0.715 6.000 0.017 NA N NA
 1218263 1218262       trkG TRUE 0.950 25.000 0.438 0.003 Y NA
 1218262 1218261     trkG citT TRUE 0.900 106.000 0.500 0.003 Y NA
 1218261 1218260     citT   TRUE 0.830 3.000 0.009 1.000   NA
 1218260 1218259         TRUE 0.835 -3.000 0.010 1.000   NA
 1218258 1218257     cysH   FALSE 0.297 -42.000 0.026 1.000 N NA
 1218255 1218254         TRUE 0.722 99.000 0.556 NA   NA
 1218254 1218253         FALSE 0.290 177.000 0.636 NA   NA
 1218251 1218250         TRUE 0.946 10.000 1.000 1.000 N NA
 1218250 1218249         TRUE 0.942 5.000 1.000 NA   NA
 1218246 1218245         FALSE 0.164 97.000 0.000 NA   NA
 1218245 1295295         FALSE 0.003 532.000 0.000 NA   NA
 1295295 1218244         FALSE 0.069 128.000 0.000 NA   NA
 1219639 1218243         FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 1218243 1218242         FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 1218242 1219637         FALSE 0.006 309.000 0.000 NA   NA
 1219637 1219636         FALSE 0.011 233.000 0.000 NA   NA
 1219636 1218241         TRUE 0.953 -3.000 0.143 0.059   NA
 1218241 1294996         FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 1294996 1218240         FALSE 0.202 -13.000 0.000 NA   NA
 1218240 1219635         FALSE 0.239 145.000 0.000 0.037   NA
 1218239 1219632         TRUE 0.696 79.000 0.000 0.037   NA
 1219632 1295225         FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 1295225 1218238         FALSE 0.297 71.000 0.000 NA   NA
 1218237 1295276         FALSE 0.365 -6.000 0.000 NA   NA
 1295276 1219631         FALSE 0.006 326.000 0.000 NA   NA
 1219631 1295133         FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 1218236 1218235         FALSE 0.576 95.000 0.000 0.059   NA
 1218235 1218234         FALSE 0.037 227.000 0.000 1.000   NA
 1218234 1218233         FALSE 0.502 28.000 0.000 1.000   NA
 1218233 1218232         FALSE 0.309 56.000 0.000 NA   NA
 1218232 1218231         TRUE 0.877 17.000 0.947 NA   NA
 1218231 1362596       pseudo FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 1362596 1218230     pseudo   FALSE 0.269 44.000 0.000 NA   NA
 1219628 1218229         FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 1218229 1218228       sufC TRUE 0.941 50.000 0.466 1.000 Y NA
 1218228 1218227     sufC   TRUE 0.990 0.000 0.482 0.022 Y NA
 1218227 1218226         TRUE 0.867 8.000 0.081 1.000 N NA
 1218225 1219627     dap2   FALSE 0.012 -105.000 0.000 NA   NA
 1219626 1218224       def FALSE 0.019 -79.000 0.000 NA   NA
 1218223 1219625         FALSE 0.025 180.000 0.000 NA   NA
 1218221 1218220     hit   FALSE 0.572 26.000 0.016 1.000   NA
 1218220 1218219         FALSE 0.363 -57.000 0.576 1.000   NA
 1218218 1218217         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1218217 1218216         FALSE 0.046 144.000 0.000 NA   NA
 1218216 1219624         TRUE 0.682 105.000 0.556 NA   NA
 1309291 1218213     tRNA-Leu   FALSE 0.056 -38.000 0.000 NA   NA
 1218213 1218212         FALSE 0.602 49.000 0.018 NA N NA
 1218211 1218209         TRUE 0.755 62.000 0.177 NA   NA
 1218209 1218208         FALSE 0.473 106.000 0.150 NA   NA
 1219622 1219621         FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
 1219621 1295343         FALSE 0.306 63.000 0.000 NA   NA
 1219620 1218206         FALSE 0.241 29.000 0.000 NA   NA
 1218206 1218205         TRUE 0.962 0.000 0.522 NA   NA
 1218203 1218202         FALSE 0.283 75.000 0.000 NA   NA
 1218202 1218201         FALSE 0.657 8.000 0.000 1.000   NA
 1218201 1218200         TRUE 0.812 -3.000 0.000 1.000   NA
 1218198 1218197         FALSE 0.017 204.000 0.000 NA   NA
 1219619 1219618         FALSE 0.250 24.000 0.000 NA   NA
 1218196 1218195         FALSE 0.007 289.000 0.000 NA   NA
 1218195 1295023         FALSE 0.003 620.000 0.000 NA   NA
 1295023 1219615         FALSE 0.003 561.000 0.000 NA   NA
 1219615 1219614         FALSE 0.003 659.000 0.000 NA   NA
 1219614 1218194         FALSE 0.101 111.000 0.000 NA   NA
 1218194 1218193         FALSE 0.278 76.000 0.000 NA   NA
 1219613 1218191       cypX FALSE 0.003 706.000 0.000 NA   NA
 1218191 1218190     cypX   FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 1219608 1219607         FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 1219607 1218188         FALSE 0.012 232.000 0.000 NA   NA
 1219605 1219603         FALSE 0.002 1154.000 0.000 NA   NA
 1362599 1219602     pseudo   FALSE 0.010 245.000 0.000 NA   NA
 1295278 1219601         FALSE 0.307 54.000 0.000 NA   NA
 1219601 1295238         FALSE 0.284 48.000 0.000 NA   NA
 1219597 1362601       pseudo FALSE 0.360 9.000 0.000 NA   NA
 1218186 1219596         FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 1219596 1219595         FALSE 0.004 465.000 0.000 NA   NA
 1219595 1295021         FALSE 0.252 23.000 0.000 NA   NA
 1295021 1218185       icc FALSE 0.013 225.000 0.000 NA   NA
 1219594 1218184         FALSE 0.004 392.000 0.000 NA   NA
 1218184 1218183         FALSE 0.003 668.000 0.000 NA   NA
 1219590 1218182         FALSE 0.291 73.000 0.000 NA   NA
 1218181 1218180     thy1   FALSE 0.003 690.000 0.000 NA   NA
 1218179 1218178     dnaJ hemB FALSE 0.662 39.000 0.007 1.000 N NA
 1218178 1218177     hemB   FALSE 0.346 -28.000 0.000 1.000 N NA
 1218176 1362602     malK pseudo FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 1362602 1218175     pseudo   FALSE 0.024 184.000 0.000 NA   NA
 1218175 1218174         FALSE 0.310 174.000 0.667 NA   NA
 1218174 1218173         TRUE 0.871 52.000 0.667 NA   NA
 1218172 1218171     obg   FALSE 0.215 87.000 0.000 NA   NA
 1218170 1295330         FALSE 0.241 34.000 0.000 NA   NA
 1218169 1218168         TRUE 0.796 -3.000 0.028 NA   NA
 1218168 1218167       ecm4 TRUE 0.923 -3.000 0.265 NA   NA
 1218164 1218163         TRUE 0.828 82.000 0.636 NA   NA
 1294896 1219923         FALSE 0.017 -90.000 0.000 NA   NA
 1219923 1218162       psbA FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1309270 1218160     tRNA-Thr   FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 1218160 1218159       infB FALSE 0.300 26.000 0.007 NA   NA
 1218159 1218158     infB   TRUE 0.807 64.000 0.171 NA N NA
 1218158 1218157       nusA TRUE 0.970 -3.000 0.323 NA Y NA
 1218157 1218156     nusA   TRUE 0.882 54.000 0.759 NA   NA
 1218154 1218153         FALSE 0.004 445.000 0.000 NA   NA
 1218153 1218152         TRUE 0.838 39.000 0.600 NA   NA
 1218151 1219583     aslB   TRUE 0.802 20.000 0.400 NA   NA
 1219583 1218150         FALSE 0.076 123.000 0.000 NA   NA
 1218150 1218149         FALSE 0.300 52.000 0.000 NA   NA
 1218149 1218148         FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 1218148 1218147         FALSE 0.368 107.000 0.065 NA   NA
 1218146 1218145         FALSE 0.261 40.000 0.000 NA   NA
 1218145 1295174         FALSE 0.013 224.000 0.000 NA   NA
 1295174 1218144         FALSE 0.021 193.000 0.000 NA   NA
 1218144 1218143       rpiA TRUE 0.744 43.000 0.030 1.000 N NA
 1218141 1218140     rpsT tatD TRUE 0.671 48.000 0.034 NA N NA
 1218140 1218139     tatD rpoB FALSE 0.024 284.000 0.012 NA N NA
 1218139 1218138     rpoB rpoC1 TRUE 0.971 50.000 0.851 0.002 Y NA
 1218137 1218136     rpoC2 hli3 TRUE 0.889 60.000 0.476 1.000   NA
 1218136 1218135     hli3   TRUE 0.869 -3.000 0.022 1.000   NA
 1218135 1218134       putP FALSE 0.576 43.000 0.011 1.000   NA
 1218134 1218133     putP   TRUE 0.768 52.000 0.213 NA   NA
 1218133 1218132         FALSE 0.640 35.000 0.118 NA   NA
 1218132 1218131         FALSE 0.619 92.000 0.175 NA   NA
 1218131 1218130         TRUE 0.973 0.000 1.000 NA   NA
 1218129 1218128     fer   TRUE 0.671 7.000 0.000 1.000   NA
 1218126 1294986         FALSE 0.034 -49.000 0.000 NA   NA
 1218125 1218124     bioA   FALSE 0.099 163.000 0.000 1.000   NA
 1218124 1218123         FALSE 0.005 379.000 0.000 NA   NA
 1218123 1218122       bioD TRUE 0.850 -3.000 0.061 NA   NA
 1218122 1218121     bioD   FALSE 0.551 -33.000 0.030 1.000 Y NA
 1218121 1218120         TRUE 0.900 -3.000 0.163 NA   NA
 1218120 1218119       bioF FALSE 0.614 15.000 0.053 NA   NA
 1218117 1218116       fumC TRUE 0.757 8.000 0.000 1.000 N NA
 1218116 1218115     fumC purB FALSE 0.176 159.000 0.011 1.000 N NA
 1218113 1218112     glnB   TRUE 0.851 41.000 0.682 NA   NA
 1219577 1218111         FALSE 0.066 130.000 0.000 NA   NA
 1218110 1218109     resB ccdA TRUE 0.966 5.000 0.371 1.000 Y NA
 1218109 1218108     ccdA   TRUE 0.797 88.000 0.202 1.000 N NA
 1218108 1295060         FALSE 0.041 149.000 0.000 NA   NA
 1218107 1218106         FALSE 0.114 -105.000 0.184 1.000   NA
 1218106 1219576         FALSE 0.246 -10.000 0.000 NA   NA
 1219576 1218105       atpB FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1218105 1218104     atpB   TRUE 0.965 48.000 0.679 0.005 Y NA
 1218104 1218103         TRUE 0.713 145.000 0.368 0.005 Y NA
 1218103 1218102         TRUE 0.989 -3.000 0.569 0.005 Y NA
 1218102 1218101       atpH TRUE 0.985 0.000 0.132 0.005 Y NA
 1218101 1218100     atpH atpA TRUE 0.971 52.000 0.864 0.005 Y NA
 1218100 1218099     atpA   TRUE 0.960 31.000 0.846 0.005 Y NA
 1295044 1218098         TRUE 0.719 13.000 0.125 NA   NA
 1218097 1218096     ald nadE TRUE 0.724 63.000 0.036 1.000   NA
 1218096 1218095     nadE nadD TRUE 0.900 0.000 0.023 1.000   NA
 1218094 1218093         TRUE 0.896 0.000 0.083 NA   NA
 1218093 1295385         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1218092 1218091     pepP   FALSE 0.305 65.000 0.000 NA   NA
 1295207 1218089         FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 1218088 1218087     mipB atpC FALSE 0.636 34.000 0.002 1.000 N NA
 1218087 1218086     atpC atpD TRUE 0.957 85.000 0.837 0.005 Y NA
 1218085 1218084       groEL TRUE 0.961 82.000 0.905 0.011 Y NA
 1218083 1219573         FALSE 0.089 117.000 0.000 NA   NA
 1219573 1218082       secG FALSE 0.003 739.000 0.000 NA   NA
 1218082 1218081     secG gpmI TRUE 0.734 58.000 0.041 1.000   NA
 1218078 1218077       rpoZ FALSE 0.414 64.000 0.013 NA   NA
 1218073 1218072         FALSE 0.654 65.000 0.065 NA   NA
 1218072 1218071         FALSE 0.063 131.000 0.000 NA   NA
 1218071 1218070         FALSE 0.025 182.000 0.000 NA   NA
 1218069 1309269     murD tRNA-Val FALSE 0.242 28.000 0.000 NA   NA
 1309269 1218068     tRNA-Val   FALSE 0.256 79.000 0.000 NA   NA
 1218068 1218067         FALSE 0.143 -99.000 0.442 NA   NA
 1218066 1218065     serA prmA TRUE 0.796 15.000 0.053 1.000 N NA
 1218065 1218064     prmA   FALSE 0.205 165.000 0.027 1.000 N NA
 1218064 1218063         TRUE 0.829 78.000 0.500 NA   NA
 1218063 1219571         FALSE 0.280 16.000 0.000 NA   NA
 1219571 1295388         FALSE 0.027 176.000 0.000 NA   NA
 1295388 1362604       pseudo FALSE 0.066 130.000 0.000 NA   NA
 1219570 1218062       psbV FALSE 0.033 164.000 0.000 NA   NA
 1295372 1218060         FALSE 0.066 -36.000 0.000 NA   NA
 1218060 1218059         TRUE 0.977 1.000 0.550 1.000 N NA
 1218059 1218058         FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 1218057 1218056       truB FALSE 0.614 72.000 0.012 1.000   NA
 1218056 1218055     truB rpmA TRUE 0.835 70.000 0.000 1.000 Y NA
 1218055 1218054     rpmA rplU TRUE 0.959 43.000 0.667 0.024 Y NA
 1218054 1295168     rplU   FALSE 0.006 323.000 0.000 NA   NA
 1218053 1218052     kaiB kaiC TRUE 0.821 100.000 0.927 1.000   NA
 1218051 1218050     nblS purD TRUE 0.714 25.000 0.025 1.000 N NA
 1218049 1218048       purC TRUE 0.752 -3.000 0.021 NA   NA
 1218048 1218047     purC   TRUE 0.806 70.000 0.058 1.000 N NA
 1218047 1218046       lpxC TRUE 0.971 0.000 0.052 1.000 Y NA
 1218046 1218045     lpxC fabZ TRUE 0.802 45.000 0.083 1.000 N NA
 1218045 1218044     fabZ lpxA TRUE 0.878 6.000 0.071 1.000 N NA
 1218044 1218043     lpxA lpxB TRUE 0.972 0.000 0.062 1.000 Y NA
 1218043 1218042     lpxB   TRUE 0.919 -3.000 0.034 1.000 N NA
 1218042 1218041         FALSE 0.367 113.000 0.114 NA   NA
 1218041 1219917         FALSE 0.241 34.000 0.000 NA   NA
 1218040 1218039     pepB   TRUE 0.726 -9.000 0.176 NA   NA
 1218039 1218038         FALSE 0.083 120.000 0.000 NA   NA
 1218037 1218036       tyrS FALSE 0.657 81.000 0.034 1.000   NA
 1218036 1218035     tyrS pyrF TRUE 0.730 21.000 0.027 1.000 N NA
 1218034 1218033         TRUE 0.952 0.000 0.369 NA   NA
 1218033 1219567         FALSE 0.317 -7.000 0.000 NA   NA
 1218032 1218031       melB TRUE 0.969 -3.000 0.833 NA N NA
 1218029 1218028       himA FALSE 0.293 160.000 0.400 NA   NA
 1218028 1218027     himA   FALSE 0.597 89.000 0.033 1.000   NA
 1218027 1218026         FALSE 0.463 91.000 0.006 1.000   NA
 1218026 1219566         FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 1219566 1295241         FALSE 0.018 -85.000 0.000 NA   NA
 1295241 1218025         FALSE 0.253 22.000 0.000 NA   NA
 1219564 1218023         FALSE 0.317 -7.000 0.000 NA   NA
 1218023 1362605       pseudo FALSE 0.039 153.000 0.000 NA   NA
 1362605 1219562     pseudo   FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1219562 1218022         FALSE 0.004 429.000 0.000 NA   NA
 1295201 1218021         FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 1218021 1295222         FALSE 0.071 127.000 0.000 NA   NA
 1295222 1219561         FALSE 0.005 376.000 0.000 NA   NA
 1218020 1362606       pseudo FALSE 0.392 7.000 0.000 NA   NA
 1219557 1218018         FALSE 0.128 -22.000 0.000 NA   NA
 1218018 1295299         FALSE 0.013 224.000 0.000 NA   NA
 1295299 1218017         FALSE 0.006 312.000 0.000 NA   NA
 1219555 1309268       tRNA-Arg FALSE 0.012 226.000 0.000 NA   NA
 1219554 1218014         FALSE 0.373 44.000 0.013 NA   NA
 1218012 1218011       rpsN FALSE 0.253 187.000 0.019 1.000 Y NA
 1218011 1219553     rpsN   FALSE 0.151 -18.000 0.000 NA   NA
 1219553 1218010         FALSE 0.334 11.000 0.000 NA   NA
 1218010 1218009       serS TRUE 0.722 20.000 0.024 1.000 N NA
 1218009 1218008     serS   TRUE 0.699 75.000 0.011 1.000 N NA
 1218008 1218007         TRUE 0.690 -3.000 0.014 NA   NA
 1218007 1218006       yidC TRUE 0.690 -3.000 0.014 NA   NA
 1218006 1218005     yidC   FALSE 0.524 82.000 0.043 NA   NA
 1218005 1218004       rnpA TRUE 0.825 -3.000 0.041 NA   NA
 1218004 1218003     rnpA rpl34, rpmH TRUE 0.912 61.000 0.787 1.000   NA
 1218003 1218002     rpl34, rpmH   FALSE 0.533 49.000 0.027 NA   NA
 1218002 1218001       aroH FALSE 0.288 128.000 0.114 NA   NA
 1218001 1218000     aroH sppA TRUE 0.954 -3.000 0.207 1.000 N NA
 1217999 1217998         FALSE 0.455 119.000 0.000 0.068 N NA
 1217995 1217994     pspA   FALSE 0.306 126.000 0.045 NA N NA
 1217994 1217993       birA TRUE 0.667 -13.000 0.027 1.000 N NA
 1217991 1217990         TRUE 0.922 85.000 0.182 0.004 Y NA
 1217990 1217989       salX TRUE 0.941 -3.000 0.111 1.000 N NA
 1217989 1217988     salX ndhB TRUE 0.851 -7.000 0.134 1.000 N NA
 1217987 1217986     topA   TRUE 0.792 0.000 0.020 NA   NA
 1217986 1217985         TRUE 0.877 -3.000 0.105 NA   NA
 1217985 1217984       cobT FALSE 0.090 -94.000 0.155 NA   NA
 1217984 1217983     cobT   FALSE 0.645 30.000 0.130 NA   NA
 1217982 1217981         TRUE 0.842 -3.000 0.054 NA   NA
 1217980 1217979     ribE   FALSE 0.235 93.000 0.009 NA   NA
 1217978 1217977       ctaE TRUE 0.797 96.000 1.000 NA   NA
 1217977 1217976     ctaE cyoB TRUE 0.989 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 1217976 1217975     cyoB ctaC TRUE 0.989 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 1295039 1217974       ctaA FALSE 0.348 10.000 0.000 NA   NA
 1217974 1217973     ctaA ctaB TRUE 0.906 -7.000 0.090 1.000 Y NA
 1217973 1217972     ctaB ccmA FALSE 0.642 87.000 0.019 1.000 N NA
 1217972 1217971     ccmA   TRUE 0.777 77.000 0.138 1.000   NA
 1217967 1217966         TRUE 0.863 12.000 0.156 1.000 N NA
 1217966 1217965         TRUE 0.921 -3.000 0.143 NA N NA
 1219548 1295233     ispD   FALSE 0.513 4.000 0.000 NA   NA
 1217964 1217963       ubiA TRUE 0.903 4.000 0.043 1.000 N NA
 1309267 1217960     tRNA-Val cobM FALSE 0.242 28.000 0.000 NA   NA
 1217960 1217959     cobM lgt TRUE 0.947 0.000 0.061 1.000 N NA
 1217959 1217958     lgt petA TRUE 0.863 21.000 0.476 1.000   NA
 1217958 1217957     petA petC TRUE 0.941 54.000 0.881 0.050   NA
 1217956 1217955     tatC   FALSE 0.288 125.000 0.033 NA N NA
 1217953 1217952     psaJ psaF TRUE 0.913 46.000 0.455 0.016   NA
 1217951 1217950     qri7   FALSE 0.364 38.000 0.015 NA   NA
 1219547 1217949       pilT FALSE 0.202 -13.000 0.000 NA   NA
 1217948 1217947     wecB   FALSE 0.089 -76.000 0.073 NA   NA
 1217947 1217946         TRUE 0.892 0.000 0.073 NA   NA
 1217946 1217945       nhaP FALSE 0.560 -10.000 0.054 NA   NA
 1217944 1309266     gltX tRNA-Asp FALSE 0.242 28.000 0.000 NA   NA
 1217943 1309265       tRNA-Trp FALSE 0.087 -29.000 0.000 NA   NA
 1309265 1217942     tRNA-Trp rplS FALSE 0.306 64.000 0.000 NA   NA
 1295272 1217941       map FALSE 0.094 115.000 0.000 NA   NA
 1217939 1217938       pta FALSE 0.641 40.000 0.097 NA   NA
 1217938 1217937     pta   FALSE 0.513 38.000 0.032 NA   NA
 1219545 1219544         FALSE 0.007 295.000 0.000 NA   NA
 1219544 1217934         FALSE 0.307 54.000 0.000 NA   NA
 1217934 1217933         FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 1217927 1219543         FALSE 0.629 1.000 0.000 NA   NA
 1219543 1217926         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217926 1217925         TRUE 0.677 -6.000 0.047 NA   NA
 1217925 1362609       pseudo FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 1362609 1217924     pseudo   FALSE 0.005 357.000 0.000 NA   NA
 1219542 1219541         FALSE 0.283 75.000 0.000 NA   NA
 1219541 1217923       thiP FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 1217922 1219539         FALSE 0.229 84.000 0.000 NA   NA
 1219539 1217921         FALSE 0.295 72.000 0.000 NA   NA
 1217921 1217920         FALSE 0.439 91.000 0.035 NA   NA
 1217920 1217919         FALSE 0.025 272.000 0.000 1.000   NA
 1217919 1217918         FALSE 0.317 -7.000 0.000 NA   NA
 1217918 1295245         FALSE 0.243 27.000 0.000 NA   NA
 1217917 1217916         FALSE 0.178 94.000 0.000 NA   NA
 1217916 1295210         FALSE 0.020 195.000 0.000 NA   NA
 1217915 1219536         FALSE 0.303 68.000 0.000 NA   NA
 1217914 1295075         FALSE 0.304 67.000 0.000 NA   NA
 1295075 1219534         FALSE 0.031 -51.000 0.000 NA   NA
 1219534 1217913         FALSE 0.023 -73.000 0.000 NA   NA
 1217913 1217912         FALSE 0.167 96.000 0.000 NA   NA
 1219531 1217909       priA FALSE 0.006 323.000 0.000 NA   NA
 1219530 1217908         FALSE 0.114 -25.000 0.000 NA   NA
 1217908 1217907       argB FALSE 0.513 4.000 0.000 NA   NA
 1217907 1217906     argB   FALSE 0.418 -13.000 0.027 NA   NA
 1217901 1217900       purA FALSE 0.600 44.000 0.021 NA N NA
 1217900 1217899     purA psb27 FALSE 0.390 87.000 0.022 NA   NA
 1217899 1217898     psb27 proS FALSE 0.438 29.000 0.023 NA   NA
 1217896 1217895       arsC TRUE 0.800 57.000 0.045 1.000 N NA
 1217894 1219528         FALSE 0.304 53.000 0.000 NA   NA
 1217892 1217891       gpmB TRUE 0.842 5.000 0.017 1.000 N NA
 1217890 1217889         FALSE 0.239 82.000 0.000 NA   NA
 1217889 1217888         FALSE 0.307 54.000 0.000 NA   NA
 1217888 1217887       tal TRUE 0.733 93.000 0.131 1.000 N NA
 1217887 1295287     tal   FALSE 0.013 218.000 0.000 NA   NA
 1295287 1217886         FALSE 0.250 24.000 0.000 NA   NA
 1217885 1217884     fixC frr TRUE 0.907 -3.000 0.022 1.000 N NA
 1217884 1217883     frr pyrH TRUE 0.904 78.000 0.626 1.000 N NA
 1217883 1217882     pyrH cobO FALSE 0.034 317.000 0.010 1.000 N NA
 1217882 1217881     cobO   TRUE 0.739 44.000 0.026 1.000 N NA
 1217881 1217880         TRUE 0.955 -3.000 0.367 1.000   NA
 1217878 1217877     ilvB   TRUE 0.918 0.000 0.149 NA   NA
 1217876 1217875         FALSE 0.287 74.000 0.000 NA   NA
 1217874 1217873         TRUE 0.748 -3.000 0.020 NA   NA
 1217873 1217872       rps1b, rpsA2, nbp1 TRUE 0.949 -3.000 0.513 NA   NA
 1217871 1217870         TRUE 0.868 77.000 0.465 1.000   NA
 1217870 1217869         FALSE 0.352 163.000 0.659 NA   NA
 1217869 1217868         FALSE 0.250 24.000 0.000 NA   NA
 1217868 1217867       accA FALSE 0.652 27.000 0.033 1.000   NA
 1217867 1217866     accA   TRUE 0.803 6.000 0.033 1.000   NA
 1217866 1217865       folE TRUE 0.882 11.000 0.348 1.000   NA
 1217865 1217864     folE   FALSE 0.048 142.000 0.000 NA   NA
 1217860 1362610       pseudo FALSE 0.291 73.000 0.000 NA   NA
 1362610 1219521     pseudo   FALSE 0.300 52.000 0.000 NA   NA
 1219521 1217859         TRUE 0.791 80.000 0.395 NA   NA
 1217859 1217858         TRUE 0.733 83.000 0.274 NA   NA
 1217857 1217856     chlL chlB FALSE 0.332 203.000 0.226 0.002 N NA
 1217856 1217855     chlB chlN TRUE 0.976 8.000 0.591 0.002 Y NA
 1217854 1217853         FALSE 0.066 201.000 0.048 NA   NA
 1217853 1217852         TRUE 0.840 5.000 0.152 NA   NA
 1217852 1217851         FALSE 0.006 328.000 0.000 NA   NA
 1219519 1219914         FALSE 0.128 -22.000 0.000 NA   NA
 1219914 1295212         FALSE 0.042 -45.000 0.000 NA   NA
 1295212 1217850         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219913 1217847       ccmK FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 1217847 1217846     ccmK rbcL TRUE 0.861 70.000 0.373 NA N NA
 1217846 1217845     rbcL rbcS TRUE 0.815 109.000 0.392 0.001 N NA
 1217845 1217844     rbcS csoS2 FALSE 0.586 112.000 0.474 NA   NA
 1217844 1219517     csoS2   FALSE 0.629 1.000 0.000 NA   NA
 1219517 1217843       csoS3 FALSE 0.013 -100.000 0.000 NA   NA
 1217843 1217842     csoS3   TRUE 0.968 2.000 0.925 NA   NA
 1217842 1217841         TRUE 0.986 0.000 0.868 NA Y NA
 1217841 1362611       pseudo FALSE 0.011 239.000 0.000 NA   NA
 1362611 1217840     pseudo   FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1217840 1217839         FALSE 0.062 144.000 0.008 NA   NA
 1217839 1217838         FALSE 0.211 -16.000 0.008 NA   NA
 1217834 1217833     hisG   TRUE 0.927 0.000 0.021 1.000 N NA
 1217833 1217832         TRUE 0.669 101.000 0.222 1.000   NA
 1217831 1217830         FALSE 0.003 526.000 0.000 NA   NA
 1217830 1217829         FALSE 0.014 214.000 0.000 NA   NA
 1217829 1217828         TRUE 0.720 7.000 0.057 NA   NA
 1217827 1217826     dnaA   TRUE 0.664 76.000 0.000 1.000 N NA
 1217825 1219515         FALSE 0.007 291.000 0.000 NA   NA
 1219515 1295068         FALSE 0.014 -99.000 0.000 NA   NA
 1295068 1217824         FALSE 0.165 -16.000 0.000 NA   NA
 1217824 1217823       cobQ TRUE 0.879 -3.000 0.026 1.000   NA
 1217823 1217822     cobQ   TRUE 0.815 -3.000 0.036 NA   NA
 1217820 1217819         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217818 1217817     psbC psbD TRUE 0.889 -16.000 0.878 0.003   NA
 1219513 1217816         FALSE 0.246 -10.000 0.000 NA   NA
 1217816 1217815         TRUE 0.936 4.000 0.317 1.000   NA
 1217814 1217813     ilvN   TRUE 0.909 -3.000 0.065 1.000   NA
 1217812 1217811         TRUE 0.678 29.000 0.050 1.000   NA
 1217811 1217810         TRUE 0.878 56.000 0.392 1.000   NA
 1217810 1217809         TRUE 0.813 76.000 0.392 NA   NA
 1217809 1217808         TRUE 0.709 83.000 0.229 NA   NA
 1217805 1217804         FALSE 0.500 95.000 0.083 NA   NA
 1217801 1217800     pntA pntA-2 TRUE 0.986 0.000 0.829 0.002   NA
 1217800 1217799     pntA-2 pntB TRUE 0.965 0.000 0.072 0.002   NA
 1217799 1217798     pntB   FALSE 0.628 -19.000 0.354 NA   NA
 1217797 1217796       dxr FALSE 0.071 -75.000 0.016 NA N NA
 1217794 1217793     cysS   FALSE 0.454 35.000 0.000 NA N NA
 1217793 1217792       polA FALSE 0.012 382.000 0.000 NA N NA
 1217792 1217791     polA acrA TRUE 0.676 25.000 0.017 1.000 N NA
 1217790 1219911         FALSE 0.038 226.000 0.000 1.000   NA
 1219508 1295006         FALSE 0.038 -46.000 0.000 NA   NA
 1217789 1217788         FALSE 0.322 12.000 0.000 NA   NA
 1217788 1217787         FALSE 0.036 157.000 0.000 NA   NA
 1217787 1295417         FALSE 0.003 749.000 0.000 NA   NA
 1295417 1217786         FALSE 0.181 -15.000 0.000 NA   NA
 1217785 1217784         FALSE 0.003 631.000 0.000 NA   NA
 1217784 1217783         FALSE 0.011 239.000 0.000 NA   NA
 1217783 1219910         FALSE 0.006 332.000 0.000 NA   NA
 1217781 1217780     dppB ddpA TRUE 0.987 0.000 0.267 0.027 Y NA
 1217780 1295007     ddpA   FALSE 0.285 142.000 0.225 NA   NA
 1295007 1217779       thrA FALSE 0.205 165.000 0.214 NA   NA
 1217779 1217778     thrA   TRUE 0.706 38.000 0.180 NA   NA
 1217778 1217777         FALSE 0.502 10.000 0.018 NA   NA
 1217777 1217776         FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 1217776 1217775         FALSE 0.121 148.000 0.000 1.000   NA
 1217775 1217774         TRUE 0.875 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1217774 1217773       ruvC TRUE 0.743 9.000 0.000 1.000 N NA
 1217773 1217772     ruvC chlI TRUE 0.864 5.000 0.026 1.000 N NA
 1217772 1217771     chlI   TRUE 0.880 -3.000 0.111 NA   NA
 1217771 1217770       penP TRUE 0.939 -3.000 0.393 NA   NA
 1217770 1217769     penP lasT TRUE 0.739 31.000 0.046 1.000 N NA
 1217768 1219503         FALSE 0.004 487.000 0.000 NA   NA
 1219503 1219501         FALSE 0.002 915.000 0.000 NA   NA
 1219501 1294936         FALSE 0.003 576.000 0.000 NA   NA
 1294936 1219500         FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 1219498 1217767         FALSE 0.150 100.000 0.000 NA   NA
 1217767 1217766         FALSE 0.299 197.000 0.333 0.040   NA
 1217766 1217765       cytM FALSE 0.008 860.000 0.000 1.000   NA
 1217765 1217764     cytM   FALSE 0.360 103.000 0.004 1.000   NA
 1217764 1217763         TRUE 0.905 -3.000 0.021 1.000 N NA
 1217763 1217762         FALSE 0.608 95.000 0.069 1.000   NA
 1217762 1217761       guaB FALSE 0.072 225.000 0.038 1.000   NA
 1217761 1217760     guaB   FALSE 0.654 73.000 0.076 NA   NA
 1217759 1217758         TRUE 0.894 3.000 0.017 1.000 N NA
 1217756 1217755     leuA   TRUE 0.872 4.000 0.018 1.000 N NA
 1362612 1294915     pseudo   FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 1294915 1217751         FALSE 0.062 132.000 0.000 NA   NA
 1217751 1219495         FALSE 0.239 30.000 0.000 NA   NA
 1219495 1219494         FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1219494 1217750         FALSE 0.273 45.000 0.000 NA   NA
 1217750 1217749       rluA TRUE 0.811 69.000 0.333 NA   NA
 1217747 1217746     folD ispA TRUE 0.905 25.000 0.250 1.000 Y NA
 1217746 1217745     ispA   TRUE 0.914 -3.000 0.214 NA   NA
 1217745 1217744         TRUE 0.858 -3.000 0.069 NA   NA
 1217743 1217742         TRUE 0.705 78.000 0.167 NA   NA
 1217742 1217741       cobB TRUE 0.688 70.000 0.000 1.000 N NA
 1217741 1217740     cobB   TRUE 0.767 40.000 0.167 NA N NA
 1217740 1217739       zwf TRUE 0.921 42.000 0.583 NA Y NA
 1217739 1217738     zwf petH FALSE 0.206 171.000 0.117 1.000   NA
 1309264 1217736     tRNA-Glu   FALSE 0.225 85.000 0.000 NA   NA
 1217736 1219492         FALSE 0.031 -51.000 0.000 NA   NA
 1219492 1295141         FALSE 0.011 -112.000 0.000 NA   NA
 1219490 1219489         FALSE 0.139 -19.000 0.000 NA   NA
 1219489 1217734         FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 1362613 1295197     pseudo   FALSE 0.307 59.000 0.000 NA   NA
 1295197 1217732         FALSE 0.255 38.000 0.000 NA   NA
 1217732 1217731         TRUE 0.785 22.000 0.220 NA N NA
 1217731 1217730         TRUE 0.690 57.000 0.092 NA   NA
 1217730 1217729         TRUE 0.850 27.000 0.459 1.000   NA
 1217727 1217726       recC TRUE 0.750 -6.000 0.025 1.000   NA
 1217726 1217725     recC STE14 FALSE 0.577 88.000 0.034 NA N NA
 1217725 1217724     STE14   FALSE 0.017 296.000 0.000 NA N NA
 1217724 1217723       recB FALSE 0.020 431.000 0.000 1.000 N NA
 1217723 1217722     recB recD TRUE 0.958 -3.000 0.120 0.003   NA
 1217722 1217721     recD   TRUE 0.718 14.000 0.034 1.000   NA
 1217721 1217720       srmB TRUE 0.748 52.000 0.021 1.000 N NA
 1217720 1219487     srmB   FALSE 0.580 11.000 0.026 NA   NA
 1219487 1217719         FALSE 0.004 447.000 0.000 NA   NA
 1217718 1219485         TRUE 0.796 -3.000 0.028 NA   NA
 1219485 1217717         FALSE 0.005 369.000 0.000 NA   NA
 1217715 1217714     recR   TRUE 0.853 5.000 0.021 1.000 N NA
 1217713 1217712       prsA FALSE 0.003 865.000 0.000 NA   NA
 1295019 1295187         FALSE 0.016 207.000 0.000 NA   NA
 1217704 1217703     cad cdsA TRUE 0.699 20.000 0.019 1.000 N NA
 1217702 1217701       todF TRUE 0.936 3.000 0.371 NA   NA
 1217701 1217700     todF gldA TRUE 0.839 15.000 0.250 1.000   NA
 1217700 1217699     gldA clpC FALSE 0.253 -76.000 0.237 1.000 N NA
 1217699 1217698     clpC   FALSE 0.137 176.000 0.032 1.000   NA
 1217697 1217696     lysA   FALSE 0.533 24.000 0.040 NA   NA
 1217696 1217695       uppS TRUE 0.828 -3.000 0.043 NA   NA
 1217695 1217694     uppS bioB TRUE 0.708 21.000 0.021 1.000 N NA
 1217694 1217693     bioB   TRUE 0.773 -3.000 0.024 NA   NA
 1217691 1217690     pepN crtH FALSE 0.134 170.000 0.000 1.000 N NA
 1217690 1217689     crtH gid FALSE 0.466 133.000 0.031 0.031 N NA
 1217689 1219483     gid   FALSE 0.554 75.000 0.000 1.000   NA
 1309293 1217688     tRNA-Lys   FALSE 0.020 194.000 0.000 NA   NA
 1217687 1219482         FALSE 0.008 270.000 0.000 NA   NA
 1219477 1219475         FALSE 0.012 229.000 0.000 NA   NA
 1219475 1219474         FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1217686 1219470         FALSE 0.015 209.000 0.000 NA   NA
 1219469 1219468         FALSE 0.075 124.000 0.000 NA   NA
 1219468 1362614       pseudo FALSE 0.045 145.000 0.000 NA   NA
 1219465 1219463         FALSE 0.003 586.000 0.000 NA   NA
 1217684 1217683         FALSE 0.027 176.000 0.000 NA   NA
 1219460 1219459         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219459 1217681         FALSE 0.007 286.000 0.000 NA   NA
 1217680 1362616       pseudo FALSE 0.348 10.000 0.000 NA   NA
 1362616 1219458     pseudo   FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1219455 1219454         FALSE 0.271 77.000 0.000 NA   NA
 1217678 1217677         FALSE 0.004 398.000 0.000 NA   NA
 1217675 1217674         FALSE 0.029 171.000 0.000 NA   NA
 1295339 1294927         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219447 1219446         FALSE 0.295 50.000 0.000 NA   NA
 1219446 1217672         FALSE 0.056 136.000 0.000 NA   NA
 1217672 1219445         FALSE 0.246 36.000 0.000 NA   NA
 1362617 1217669     pseudo   FALSE 0.007 295.000 0.000 NA   NA
 1217669 1217668         FALSE 0.016 207.000 0.000 NA   NA
 1217668 1219439         FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 1219439 1217667         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1295024 1217666         FALSE 0.263 19.000 0.000 NA   NA
 1219438 1295022         FALSE 0.006 322.000 0.000 NA   NA
 1295022 1362618       pseudo FALSE 0.003 771.000 0.000 NA   NA
 1362618 1219436     pseudo   FALSE 0.572 3.000 0.000 NA   NA
 1219436 1217665       rpsU FALSE 0.300 52.000 0.000 NA   NA
 1219909 1362619       pseudo FALSE 0.307 54.000 0.000 NA   NA
 1362619 1295083     pseudo   FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 1219434 1295266         FALSE 0.031 -51.000 0.000 NA   NA
 1219433 1217664         FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 1217664 1362620       pseudo FALSE 0.051 140.000 0.000 NA   NA
 1219432 1219431         FALSE 0.261 20.000 0.000 NA   NA
 1219431 1219430         FALSE 0.056 136.000 0.000 NA   NA
 1219430 1362621       pseudo FALSE 0.007 289.000 0.000 NA   NA
 1362621 1295248     pseudo   FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1362622 1295300     pseudo   FALSE 0.252 23.000 0.000 NA   NA
 1295082 1295253         FALSE 0.072 126.000 0.000 NA   NA
 1295253 1217663         FALSE 0.239 82.000 0.000 NA   NA
 1217663 1217662         FALSE 0.003 677.000 0.000 NA   NA
 1217662 1219427         FALSE 0.006 319.000 0.000 NA   NA
 1219427 1217661         FALSE 0.295 72.000 0.000 NA   NA
 1217660 1217659         FALSE 0.016 207.000 0.000 NA   NA
 1362623 1217658     pseudo   FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 1217658 1217657         FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 1217657 1219424         FALSE 0.016 355.000 0.000 1.000   NA
 1219424 1219423         FALSE 0.030 250.000 0.000 1.000   NA
 1219423 1217656         TRUE 0.812 -3.000 0.000 1.000   NA
 1217655 1294994         FALSE 0.266 18.000 0.000 NA   NA
 1295119 1295172         FALSE 0.036 -48.000 0.000 NA   NA
 1295172 1219420         FALSE 0.016 206.000 0.000 NA   NA
 1219420 1219419         FALSE 0.252 23.000 0.000 NA   NA
 1217653 1219417         FALSE 0.015 208.000 0.000 NA   NA
 1217652 1219416         FALSE 0.297 71.000 0.000 NA   NA
 1217651 1217650         FALSE 0.063 131.000 0.000 NA   NA
 1217650 1217649       arsR FALSE 0.025 180.000 0.000 NA   NA
 1217648 1217647     gap3   TRUE 0.965 1.000 0.689 NA   NA
 1294988 1217646     crp   FALSE 0.070 214.000 0.000 1.000 N NA
 1217644 1217643     phoR   FALSE 0.645 -6.000 0.000 1.000   NA
 1217643 1217642         FALSE 0.035 336.000 0.000 0.036   NA
 1217642 1217641         TRUE 0.907 38.000 0.080 0.092 Y NA
 1217641 1217640         TRUE 0.972 4.000 0.339 1.000 Y NA
 1295279 1217639         FALSE 0.271 77.000 0.000 NA   NA
 1217639 1217638         TRUE 0.749 -12.000 0.357 NA   NA
 1219906 1219413         FALSE 0.008 276.000 0.000 NA   NA
 1219905 1295400         FALSE 0.003 531.000 0.000 NA   NA
 1295400 1219410         FALSE 0.202 -13.000 0.000 NA   NA
 1217636 1217635         TRUE 0.820 -3.000 0.038 NA   NA
 1217635 1217634         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217634 1217633         TRUE 0.975 -3.000 0.759 1.000 N NA
 1217633 1217632         TRUE 0.972 63.000 0.828 0.001 Y NA
 1217632 1217631       phnC TRUE 0.965 44.000 0.750 0.002 Y NA
 1217629 1294941         FALSE 0.018 -85.000 0.000 NA   NA
 1294941 1219406         FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 1219406 1219904         FALSE 0.247 25.000 0.000 NA   NA
 1219405 1219404         FALSE 0.256 21.000 0.000 NA   NA
 1219403 1219402         FALSE 0.114 -25.000 0.000 NA   NA
 1217626 1362625       pseudo FALSE 0.105 110.000 0.000 NA   NA
 1217625 1217624         TRUE 0.928 0.000 0.182 NA   NA
 1217624 1217623         TRUE 0.929 6.000 0.889 NA   NA
 1219398 1219397         FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 1217621 1219395         FALSE 0.089 117.000 0.000 NA   NA
 1219395 1217620         FALSE 0.023 188.000 0.000 NA   NA
 1217620 1219393         FALSE 0.020 195.000 0.000 NA   NA
 1217619 1295136         FALSE 0.069 128.000 0.000 NA   NA
 1219390 1219389         FALSE 0.306 63.000 0.000 NA   NA
 1295331 1219903         FALSE 0.011 -112.000 0.000 NA   NA
 1219903 1219388         FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1219388 1219387         FALSE 0.151 -18.000 0.000 NA   NA
 1219387 1219386         FALSE 0.220 86.000 0.000 NA   NA
 1219386 1219385         FALSE 0.007 294.000 0.000 NA   NA
 1295014 1294905         FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 1294905 1217618         FALSE 0.004 475.000 0.000 NA   NA
 1217618 1217617         FALSE 0.003 844.000 0.000 NA   NA
 1217617 1217616         FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 1217616 1219383         FALSE 0.261 20.000 0.000 NA   NA
 1219382 1362627       pseudo FALSE 0.307 54.000 0.000 NA   NA
 1295054 1217614         FALSE 0.264 78.000 0.000 NA   NA
 1217614 1217613         FALSE 0.023 188.000 0.000 NA   NA
 1217613 1217612         FALSE 0.005 337.000 0.000 NA   NA
 1217608 1217607         FALSE 0.011 233.000 0.000 NA   NA
 1217606 1217605         FALSE 0.297 71.000 0.000 NA   NA
 1217605 1217604         FALSE 0.023 188.000 0.000 NA   NA
 1295167 1295086         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1295161 1219380         FALSE 0.302 14.000 0.000 NA   NA
 1362628 1217603     pseudo   FALSE 0.572 3.000 0.000 NA   NA
 1217602 1217601         FALSE 0.014 214.000 0.000 NA   NA
 1217601 1217600         FALSE 0.241 29.000 0.000 NA   NA
 1217600 1295053         FALSE 0.114 -25.000 0.000 NA   NA
 1295053 1217599         FALSE 0.239 31.000 0.000 NA   NA
 1217599 1217598         FALSE 0.105 110.000 0.000 NA   NA
 1217595 1217594         FALSE 0.271 77.000 0.000 NA   NA
 1217594 1219378         FALSE 0.040 150.000 0.000 NA   NA
 1219378 1217593         FALSE 0.202 -13.000 0.000 NA   NA
 1219377 1217592         FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 1217591 1217590     glnQ   TRUE 0.942 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1217589 1217588         FALSE 0.620 30.000 0.102 NA   NA
 1217588 1217587         TRUE 0.971 7.000 0.424 0.024 Y NA
 1217586 1217585         FALSE 0.013 417.000 0.000 1.000   NA
 1217585 1217584         TRUE 0.903 33.000 0.800 1.000 N NA
 1219375 1217583         FALSE 0.247 25.000 0.000 NA   NA
 1217583 1295326         FALSE 0.043 147.000 0.000 NA   NA
 1295326 1295057         FALSE 0.258 39.000 0.000 NA   NA
 1295057 1217582         FALSE 0.020 -78.000 0.000 NA   NA
 1295443 1219374         FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 1219901 1217579         FALSE 0.209 88.000 0.000 NA   NA
 1217579 1217578         FALSE 0.092 116.000 0.000 NA   NA
 1217578 1217577       hflC FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 1217577 1217576     hflC   FALSE 0.025 654.000 0.000 0.056 N NA
 1217576 1219900         FALSE 0.042 148.000 0.000 NA   NA
 1219900 1295254         FALSE 0.143 102.000 0.000 NA   NA
 1295332 1295327         FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 1295327 1217575         FALSE 0.114 -25.000 0.000 NA   NA
 1217575 1295352         FALSE 0.334 11.000 0.000 NA   NA
 1295352 1219371         FALSE 0.034 -49.000 0.000 NA   NA
 1219371 1219899         FALSE 0.125 106.000 0.000 NA   NA
 1219899 1295190         FALSE 0.008 -199.000 0.000 NA   NA
 1219369 1217574         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217572 1219366         FALSE 0.013 -100.000 0.000 NA   NA
 1295198 1217571         FALSE 0.008 277.000 0.000 NA   NA
 1217571 1219365         FALSE 0.003 660.000 0.000 NA   NA
 1217569 1219363         FALSE 0.295 50.000 0.000 NA   NA
 1295173 1219362         FALSE 0.054 -40.000 0.000 NA   NA
 1219362 1309294       tRNA-Pro FALSE 0.010 -127.000 0.000 NA   NA
 1309294 1217568     tRNA-Pro   FALSE 0.003 513.000 0.000 NA   NA
 1217568 1217567         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217567 1219360         FALSE 0.263 41.000 0.000 NA   NA
 1219898 1217566         FALSE 0.015 213.000 0.000 NA   NA
 1217564 1217563         FALSE 0.004 397.000 0.000 NA   NA
 1217563 1219354         FALSE 0.360 9.000 0.000 NA   NA
 1219353 1217562         FALSE 0.003 735.000 0.000 NA   NA
 1217562 1295073         FALSE 0.003 821.000 0.000 NA   NA
 1219351 1217561         FALSE 0.054 137.000 0.000 NA   NA
 1217561 1219350         FALSE 0.016 207.000 0.000 NA   NA
 1219350 1217560         FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1217560 1219348         FALSE 0.015 208.000 0.000 NA   NA
 1217559 1217558         FALSE 0.015 364.000 0.000 1.000   NA
 1294947 1219344         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219344 1362630       pseudo FALSE 0.017 204.000 0.000 NA   NA
 1362630 1217557     pseudo   FALSE 0.241 29.000 0.000 NA   NA
 1217557 1219343         FALSE 0.003 587.000 0.000 NA   NA
 1295063 1219340         FALSE 0.455 5.000 0.000 NA   NA
 1219338 1295047         FALSE 0.004 396.000 0.000 NA   NA
 1295047 1219337         FALSE 0.097 113.000 0.000 NA   NA
 1219336 1217555         FALSE 0.263 41.000 0.000 NA   NA
 1217553 1219335         FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 1219335 1217552         FALSE 0.083 120.000 0.000 NA   NA
 1217552 1362632       pseudo FALSE 0.007 297.000 0.000 NA   NA
 1362632 1217551     pseudo   FALSE 0.246 36.000 0.000 NA   NA
 1217551 1217550         FALSE 0.003 620.000 0.000 NA   NA
 1217549 1217548         FALSE 0.052 139.000 0.000 NA   NA
 1217547 1219333         FALSE 0.297 71.000 0.000 NA   NA
 1219332 1219331         FALSE 0.024 184.000 0.000 NA   NA
 1219331 1217546         FALSE 0.190 92.000 0.000 NA   NA
 1217546 1219330         FALSE 0.271 17.000 0.000 NA   NA
 1219329 1217545       alkB FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 1217544 1217543         FALSE 0.004 448.000 0.000 NA   NA
 1219328 1217542       metA FALSE 0.009 659.000 0.000 1.000   NA
 1217542 1217541     metA MET17 TRUE 0.881 15.000 0.048 1.000 Y NA
 1217541 1217540     MET17   TRUE 0.694 44.000 0.149 NA   NA
 1219897 1217538         FALSE 0.095 165.000 0.000 1.000   NA
 1217538 1219327         FALSE 0.263 42.000 0.000 NA   NA
 1219327 1219326         FALSE 0.306 63.000 0.000 NA   NA
 1219326 1362633       pseudo FALSE 0.243 35.000 0.000 NA   NA
 1362633 1294925     pseudo   FALSE 0.280 16.000 0.000 NA   NA
 1294925 1217537         FALSE 0.093 -28.000 0.000 NA   NA
 1217537 1217536         TRUE 0.879 3.000 0.114 NA   NA
 1217536 1362634       pseudo FALSE 0.002 909.000 0.000 NA   NA
 1217535 1217534     sbcD sbcC TRUE 0.950 8.000 0.312 1.000 Y NA
 1217533 1217532         FALSE 0.461 102.000 0.100 NA   NA
 1217531 1217530     stpA   FALSE 0.019 691.000 0.059 1.000   NA
 1295143 1217528         FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1217528 1217527         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217526 1219323         FALSE 0.373 98.000 0.000 1.000   NA
 1219323 1217525         FALSE 0.312 13.000 0.000 NA   NA
 1217525 1219322         FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 1217524 1217523     mscL pncA FALSE 0.476 100.000 0.000 1.000 N NA
 1217523 1362635     pncA pseudo FALSE 0.005 337.000 0.000 NA   NA
 1362635 1217522     pseudo   FALSE 0.003 824.000 0.000 NA   NA
 1217519 1362636       pseudo FALSE 0.003 581.000 0.000 NA   NA
 1362636 1219320     pseudo   FALSE 0.003 653.000 0.000 NA   NA
 1219319 1217518         FALSE 0.008 278.000 0.000 NA   NA
 1219317 1295030         FALSE 0.003 582.000 0.000 NA   NA
 1295030 1217517         FALSE 0.006 323.000 0.000 NA   NA
 1217517 1217516         FALSE 0.004 477.000 0.000 NA   NA
 1217516 1219313         FALSE 0.002 1241.000 0.000 NA   NA
 1219313 1219312         FALSE 0.306 63.000 0.000 NA   NA
 1219312 1219311         FALSE 0.003 600.000 0.000 NA   NA
 1219310 1219309         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219309 1217515         FALSE 0.003 523.000 0.000 NA   NA
 1217514 1219307         FALSE 0.045 145.000 0.000 NA   NA
 1219307 1219306         FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 1219306 1217513         FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 1219305 1217512         FALSE 0.004 461.000 0.000 NA   NA
 1217512 1217511         FALSE 0.239 30.000 0.000 NA   NA
 1217511 1217510         FALSE 0.392 7.000 0.000 NA   NA
 1294957 1219304         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219304 1219303         FALSE 0.003 645.000 0.000 NA   NA
 1219303 1219300         FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 1219300 1294959         FALSE 0.070 -33.000 0.000 NA   NA
 1294959 1217508         FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 1309263 1217507     tRNA-Met ansA FALSE 0.290 49.000 0.000 NA   NA
 1217506 1217505         FALSE 0.508 -7.000 0.021 NA   NA
 1217504 1217503     carB   FALSE 0.246 36.000 0.000 NA   NA
 1217503 1219298         FALSE 0.412 6.000 0.000 NA   NA
 1219298 1295394         FALSE 0.306 62.000 0.000 NA   NA
 1217502 1217501         FALSE 0.595 57.000 0.037 NA   NA
 1217500 1217499       tpi FALSE 0.529 34.000 0.005 1.000   NA
 1217499 1362638     tpi pseudo FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1362638 1217498     pseudo   FALSE 0.006 309.000 0.000 NA   NA
 1217496 1217495     dapB   FALSE 0.501 18.000 0.027 NA   NA
 1217494 1217493     ubiH   TRUE 0.817 22.000 0.485 NA   NA
 1217491 1362639       pseudo FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1362639 1294968     pseudo   FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 1294968 1217489         FALSE 0.061 133.000 0.000 NA   NA
 1217487 1217486         TRUE 0.990 0.000 0.900 1.000 Y NA
 1217486 1217485         FALSE 0.274 121.000 0.066 NA   NA
 1217485 1217484         FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 1217483 1295094     isiB   FALSE 0.003 665.000 0.000 NA   NA
 1217482 1217481         FALSE 0.003 774.000 0.000 NA   NA
 1217481 1217480         FALSE 0.013 829.000 0.000 1.000 N NA
 1219294 1309262       tRNA-Ser FALSE 0.023 -72.000 0.000 NA   NA
 1217478 1217477         FALSE 0.005 356.000 0.000 NA   NA
 1217477 1217476       nrdJ FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 1217475 1217474       prfC FALSE 0.022 380.000 0.021 1.000   NA
 1217473 1217472         TRUE 0.748 39.000 0.250 NA   NA
 1217470 1217469         TRUE 0.864 9.000 0.388 NA   NA
 1217467 1217466       tesA TRUE 0.820 74.000 0.100 1.000 N NA
 1217466 1217465     tesA   TRUE 0.849 23.000 0.264 1.000 N NA
 1217465 1217464         TRUE 0.985 -3.000 0.696 1.000 Y NA
 1217464 1217463       phnD TRUE 0.984 -3.000 0.690 1.000 Y NA
 1217463 1217462     phnD aspC TRUE 0.841 24.000 0.238 1.000 N NA
 1217461 1217460       gcpE TRUE 0.729 45.000 0.022 1.000 N NA
 1217460 1217459     gcpE   TRUE 0.724 38.000 0.026 1.000 N NA
 1219291 1217458       mfd FALSE 0.286 82.000 0.003 NA   NA
 1217458 1217457     mfd hcaE FALSE 0.183 148.000 0.000 1.000 N NA
 1217457 1217456     hcaE   FALSE 0.003 872.000 0.000 NA   NA
 1217456 1217455       fmt FALSE 0.016 206.000 0.000 NA   NA
 1217455 1217454     fmt pmbA TRUE 0.718 3.000 0.018 NA   NA
 1217454 1217453     pmbA tldD TRUE 0.891 3.000 0.146 NA   NA
 1217453 1295364     tldD   FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 1295364 1217452         FALSE 0.151 -18.000 0.000 NA   NA
 1217452 1294983         TRUE 0.774 79.000 0.333 NA   NA
 1294983 1217451       ubiX TRUE 0.888 -3.000 0.135 NA   NA
 1217451 1217450     ubiX vacB TRUE 0.938 4.000 0.188 1.000 N NA
 1217450 1217449     vacB   FALSE 0.613 119.000 0.439 1.000   NA
 1217449 1217448         FALSE 0.298 -48.000 0.055 0.052   NA
 1217448 1217447         FALSE 0.630 68.000 0.055 NA   NA
 1217447 1217446         FALSE 0.076 195.000 0.058 NA   NA
 1217446 1217445       recJ TRUE 0.886 -3.000 0.009 1.000 N NA
 1295291 1217444         FALSE 0.572 3.000 0.000 NA   NA
 1217444 1217443         TRUE 0.848 -3.000 0.059 NA   NA
 1217443 1217442         FALSE 0.349 -37.000 0.243 NA   NA
 1219289 1217441         FALSE 0.018 -85.000 0.000 NA   NA
 1309261 1217437     tRNA-Met   FALSE 0.258 39.000 0.000 NA   NA
 1217437 1217436       cspR FALSE 0.317 120.000 0.000 1.000 N NA
 1217436 1217435     cspR cobU TRUE 0.922 -3.000 0.039 1.000 N NA
 1217435 1217434     cobU   FALSE 0.600 -13.000 0.035 1.000   NA
 1217434 1217433         FALSE 0.241 29.000 0.000 NA   NA
 1217433 1217432         FALSE 0.241 34.000 0.000 NA   NA
 1217430 1217429       metG TRUE 0.772 0.000 0.018 NA   NA
 1217429 1219284     metG   FALSE 0.004 391.000 0.000 NA   NA
 1217427 1217426       rpsR TRUE 0.787 12.000 0.027 1.000 N NA
 1217426 1217425     rpsR rpmG TRUE 0.795 39.000 0.037 0.018   NA
 1217423 1217422     trmA   FALSE 0.008 1234.000 0.000 1.000   NA
 1217422 1217421         FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 1217421 1217420         FALSE 0.013 224.000 0.000 NA   NA
 1217420 1217419       apa2 TRUE 0.769 89.000 0.154 1.000 N NA
 1217419 1217418     apa2   TRUE 0.791 -10.000 0.212 1.000   NA
 1217418 1219282         FALSE 0.002 1144.000 0.000 NA   NA
 1217416 1217415     metH ilvE TRUE 0.882 58.000 0.036 1.000 Y NA
 1217413 1217412         FALSE 0.622 -7.000 0.044 NA   NA
 1217412 1217411       uvrC FALSE 0.372 66.000 0.008 NA   NA
 1217411 1217410     uvrC   FALSE 0.167 -43.000 0.015 1.000   NA
 1217409 1217408     coaD   FALSE 0.576 21.000 0.055 NA   NA
 1217407 1217406     dacB   TRUE 0.867 -3.000 0.083 NA   NA
 1217406 1217405         FALSE 0.424 123.000 0.268 NA   NA
 1217405 1217404         TRUE 0.713 89.000 0.324 NA   NA
 1217404 1217403         TRUE 0.774 51.000 0.000 0.003   NA
 1217403 1219281         FALSE 0.202 -13.000 0.000 NA   NA
 1219281 1217402       dapF FALSE 0.241 34.000 0.000 NA   NA
 1217401 1217400       leuS FALSE 0.382 58.000 0.009 NA   NA
 1217397 1217396         FALSE 0.411 -18.000 0.013 1.000   NA
 1362641 1217395     pseudo purN FALSE 0.261 20.000 0.000 NA   NA
 1217392 1217391         FALSE 0.041 267.000 0.022 1.000   NA
 1217391 1217390         TRUE 0.953 3.000 0.634 NA   NA
 1217390 1217389         TRUE 0.851 52.000 0.488 NA   NA
 1217389 1217388         TRUE 0.923 -16.000 0.488 0.005 Y NA
 1217387 1217386     pstC pstA TRUE 0.990 2.000 0.541 0.002 Y NA
 1217386 1217385     pstA pstB TRUE 0.973 69.000 0.952 0.002 Y NA
 1217384 1217383       hisZ TRUE 0.734 23.000 0.032 1.000 N NA
 1217383 1217382     hisZ   TRUE 0.709 36.000 0.024 1.000 N NA
 1217382 1217381       htpG FALSE 0.589 91.000 0.011 1.000 N NA
 1217381 1217380     htpG rpmB TRUE 0.744 67.000 0.019 1.000 N NA
 1217380 1219279     rpmB   FALSE 0.277 46.000 0.000 NA   NA
 1219279 1217379         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217379 1217378         TRUE 0.989 -3.000 0.692 0.022 Y NA
 1217378 1217377         TRUE 0.975 -3.000 0.064 0.022 Y NA
 1217377 1217376         TRUE 0.960 -3.000 0.092 0.022 N NA
 1217374 1217373         TRUE 0.954 -3.000 0.625 NA   NA
 1217373 1217372       psaK TRUE 0.819 69.000 0.357 NA   NA
 1217371 1217370       dxs TRUE 0.901 5.000 0.090 1.000 N NA
 1217369 1217368     ilvA   FALSE 0.620 38.000 0.028 NA N NA
 1217368 1217367         FALSE 0.484 27.000 0.029 NA   NA
 1217366 1217365         TRUE 0.917 -3.000 0.231 NA   NA
 1217364 1217363     pykF salY TRUE 0.937 7.000 0.476 1.000 N NA
 1217363 1217362     salY   FALSE 0.096 315.000 0.282 1.000 N NA
 1217359 1219276         FALSE 0.009 -145.000 0.000 NA   NA
 1219276 1219275         FALSE 0.242 28.000 0.000 NA   NA
 1219275 1217358       petN FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1217357 1219273         FALSE 0.003 653.000 0.000 NA   NA
 1219273 1217356         FALSE 0.181 -15.000 0.000 NA   NA
 1217356 1362642       pseudo FALSE 0.513 4.000 0.000 NA   NA
 1217355 1217354     purK lacF TRUE 0.736 28.000 0.040 1.000 N NA
 1217350 1217349         FALSE 0.008 278.000 0.000 NA   NA
 1217349 1217348         TRUE 0.763 -6.000 0.123 NA   NA
 1217346 1219271         FALSE 0.060 134.000 0.000 NA   NA
 1217342 1295041         FALSE 0.229 84.000 0.000 NA   NA
 1295041 1217341         TRUE 0.961 2.000 0.667 NA   NA
 1217341 1219269         TRUE 0.966 0.000 0.667 NA   NA
 1219269 1219268         FALSE 0.062 363.000 0.500 NA   NA
 1219268 1295078         FALSE 0.024 -67.000 0.000 NA   NA
 1295078 1217340         FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 1217340 1362643       pseudo FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 1217339 1217338       carA TRUE 0.822 31.000 0.021 1.000 Y NA
 1217338 1217337     carA   TRUE 0.734 74.000 0.020 1.000 N NA
 1217337 1217336         TRUE 0.922 -3.000 0.113 1.000   NA
 1217336 1217335         TRUE 0.876 15.000 0.150 0.006   NA
 1217335 1217334         FALSE 0.529 45.000 0.031 NA   NA
 1217334 1217333       gatA FALSE 0.437 37.000 0.022 NA   NA
 1217333 1217332     gatA dnaE TRUE 0.711 77.000 0.019 1.000 N NA
 1217331 1217330       rpsO FALSE 0.583 52.000 0.037 NA   NA
 1217330 1217329     rpsO ruvA TRUE 0.758 59.000 0.021 1.000 N NA
 1217328 1219261         FALSE 0.412 6.000 0.000 NA   NA
 1217327 1217326       dnaG FALSE 0.059 186.000 0.000 NA N NA
 1219259 1219258         FALSE 0.182 130.000 0.000 1.000   NA
 1217325 1217324         TRUE 0.826 40.000 0.500 NA   NA
 1295184 1217322         FALSE 0.220 86.000 0.000 NA   NA
 1217322 1294930         FALSE 0.334 11.000 0.000 NA   NA
 1217321 1217320     umuD   FALSE 0.025 181.000 0.000 NA   NA
 1217320 1295072         FALSE 0.012 226.000 0.000 NA   NA
 1295072 1217319         FALSE 0.004 416.000 0.000 NA   NA
 1219256 1217318         FALSE 0.004 458.000 0.000 NA   NA
 1217317 1217316         FALSE 0.006 310.000 0.000 NA   NA
 1217315 1219255     pspE   FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 1219255 1219254         FALSE 0.365 -6.000 0.000 NA   NA
 1217314 1217313         FALSE 0.012 -103.000 0.000 NA   NA
 1217313 1217312         FALSE 0.012 232.000 0.000 NA   NA
 1217311 1217310       gdhA FALSE 0.049 247.000 0.000 1.000 N NA
 1217309 1217308     ksgA ispE TRUE 0.896 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1217308 1217307     ispE   TRUE 0.948 -3.000 0.488 NA   NA
 1217307 1217306         FALSE 0.277 46.000 0.000 NA   NA
 1217306 1217305       pdhB FALSE 0.306 63.000 0.000 NA   NA
 1217305 1217304     pdhB secD TRUE 0.921 4.000 0.091 1.000 N NA
 1217304 1217303     secD secF TRUE 0.986 4.000 0.516 0.001 Y NA
 1217303 1219249     secF   TRUE 0.672 -7.000 0.069 NA   NA
 1219249 1219248         FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 1219246 1219245         FALSE 0.114 -25.000 0.000 NA   NA
 1217301 1217300         FALSE 0.599 96.000 0.196 NA   NA
 1295157 1217299         FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 1217298 1217297     rsbW   TRUE 0.764 65.000 0.194 NA   NA
 1217296 1217295       psb28 FALSE 0.600 26.000 0.077 NA   NA
 1217295 1217294     psb28   TRUE 0.809 34.000 0.488 NA   NA
 1217294 1217293         TRUE 0.951 -3.000 0.550 NA   NA
 1217292 1217291       glnA FALSE 0.003 563.000 0.000 NA   NA
 1217287 1219239         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219239 1295102         FALSE 0.008 -172.000 0.000 NA   NA
 1295102 1217286       lspA FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 1217286 1217285     lspA   TRUE 0.951 -3.000 0.554 NA   NA
 1217283 1217282         FALSE 0.263 -96.000 0.352 0.005   NA
 1217281 1217280     pcyA   TRUE 0.811 21.000 0.455 NA   NA
 1217280 1217279         TRUE 0.985 0.000 0.769 NA Y NA
 1217279 1217278         TRUE 0.946 43.000 0.769 1.000 Y NA
 1217278 1217277         TRUE 0.856 38.000 0.800 NA   NA
 1217277 1217276         FALSE 0.655 92.000 0.234 NA   NA
 1217276 1217275       rpsB FALSE 0.086 141.000 0.017 NA   NA
 1217275 1217274     rpsB tsf TRUE 0.874 83.000 0.748 1.000   NA
 1217274 1217273     tsf   FALSE 0.354 24.000 0.014 NA   NA
 1217273 1217272       recG FALSE 0.087 -51.000 0.029 NA   NA
 1217272 1219238     recG   FALSE 0.243 35.000 0.000 NA   NA
 1219238 1295265         FALSE 0.297 51.000 0.000 NA   NA
 1295265 1217271       ddpX FALSE 0.048 -43.000 0.000 NA   NA
 1217268 1295378     chlP   FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1217267 1217266     vanY typA FALSE 0.211 147.000 0.011 1.000 N NA
 1217266 1217265     typA   FALSE 0.528 9.000 0.019 NA   NA
 1217265 1217264         FALSE 0.410 103.000 0.066 NA   NA
 1217264 1217263         TRUE 0.795 -3.000 0.027 NA   NA
 1217263 1217262         TRUE 0.879 -3.000 0.026 1.000   NA
 1217262 1217261       ccmC TRUE 0.750 40.000 0.105 1.000   NA
 1217259 1217258     glpX hemA TRUE 0.729 32.000 0.038 1.000 N NA
 1217258 1217257     hemA glgC FALSE 0.374 127.000 0.027 1.000 N NA
 1217257 1219237     glgC   FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219237 1217256       gnd FALSE 0.291 73.000 0.000 NA   NA
 1217256 1217255     gnd   TRUE 0.938 11.000 0.046 0.002 Y NA
 1217254 1217253         FALSE 0.128 217.000 0.358 NA   NA
 1217252 1217251     ilvD   TRUE 0.702 41.000 0.165 NA   NA
 1217251 1217250       upp FALSE 0.443 25.000 0.023 NA   NA
 1217249 1217248       cobW FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217247 1217246     proX proW TRUE 0.941 51.000 0.188 0.022 Y NA
 1217246 1217245     proW proV TRUE 0.988 -3.000 0.600 0.050 Y NA
 1217245 1295203     proV   FALSE 0.022 190.000 0.000 NA   NA
 1217244 1217243         TRUE 0.870 40.000 0.191 0.009   NA
 1217243 1219232         FALSE 0.008 280.000 0.000 NA   NA
 1219232 1219231         FALSE 0.181 -15.000 0.000 NA   NA
 1219231 1217242         FALSE 0.004 457.000 0.000 NA   NA
 1217242 1219229         FALSE 0.005 356.000 0.000 NA   NA
 1219229 1217241         FALSE 0.304 53.000 0.000 NA   NA
 1217241 1295034         FALSE 0.007 296.000 0.000 NA   NA
 1217240 1362644       pseudo FALSE 0.220 86.000 0.000 NA   NA
 1362644 1217239     pseudo   FALSE 0.007 295.000 0.000 NA   NA
 1217239 1295229         FALSE 0.003 869.000 0.000 NA   NA
 1217238 1217237         FALSE 0.025 182.000 0.000 NA   NA
 1217237 1219226         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219226 1294912         FALSE 0.074 125.000 0.000 NA   NA
 1295037 1362645       pseudo FALSE 0.009 258.000 0.000 NA   NA
 1219225 1217236         FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1219223 1217234         FALSE 0.003 545.000 0.000 NA   NA
 1217233 1295439         FALSE 0.011 233.000 0.000 NA   NA
 1217232 1217231     purS   TRUE 0.978 8.000 0.656 0.001 Y NA
 1217231 1217230         FALSE 0.498 85.000 0.015 NA N NA
 1217229 1217228       cbbA FALSE 0.598 100.000 0.000 0.002   NA
 1217228 1217227     cbbA   FALSE 0.474 121.000 0.169 1.000   NA
 1217227 1217226         TRUE 0.783 10.000 0.169 NA   NA
 1217226 1217225       accD FALSE 0.398 45.000 0.016 NA   NA
 1217225 1217224     accD   FALSE 0.124 188.000 0.013 1.000 N NA
 1217224 1217223       prkB FALSE 0.021 422.000 0.000 1.000 N NA
 1217223 1217222     prkB leuB TRUE 0.790 98.000 0.074 1.000 Y NA
 1217222 1217221     leuB lpxD TRUE 0.762 38.000 0.052 1.000 N NA
 1217221 1217220     lpxD proB TRUE 0.781 57.000 0.029 1.000 N NA
 1217220 1217219     proB   TRUE 0.780 -3.000 0.025 NA   NA
 1217219 1217218         TRUE 0.860 6.000 0.264 NA   NA
 1217218 1217217         FALSE 0.532 21.000 0.038 NA   NA
 1217217 1217216         FALSE 0.028 -159.000 0.042 NA   NA
 1217215 1217214         TRUE 0.669 82.000 0.156 NA   NA
 1217214 1217213         TRUE 0.728 33.000 0.250 NA   NA
 1217213 1217212         TRUE 0.836 72.000 0.444 NA   NA
 1217212 1217211       hisA FALSE 0.356 120.000 0.014 1.000 N NA
 1295129 1217208         FALSE 0.280 16.000 0.000 NA   NA
 1217205 1217204         FALSE 0.005 381.000 0.000 NA   NA
 1217203 1217202         TRUE 0.888 -3.000 0.132 NA   NA
 1217202 1217201         FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 1217200 1362646     petJ pseudo FALSE 0.302 69.000 0.000 NA   NA
 1217198 1217197         TRUE 0.735 27.000 0.256 NA   NA
 1219219 1217196         FALSE 0.215 87.000 0.000 NA   NA
 1217195 1217194     nth   FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 1217193 1217192       potA TRUE 0.851 0.000 0.000 1.000   NA
 1362647 1217190     pseudo   FALSE 0.322 12.000 0.000 NA   NA
 1217188 1217187         FALSE 0.003 529.000 0.000 NA   NA
 1217186 1217185         FALSE 0.008 1092.000 0.038 NA   NA
 1295148 1219210         FALSE 0.042 -45.000 0.000 NA   NA
 1219210 1217183         FALSE 0.027 -61.000 0.000 NA   NA
 1217183 1309295       tRNA-Pro FALSE 0.293 15.000 0.000 NA   NA
 1217182 1219209         FALSE 0.026 -63.000 0.000 NA   NA
 1219209 1362648       pseudo FALSE 0.004 414.000 0.000 NA   NA
 1362648 1217181     pseudo   FALSE 0.019 197.000 0.000 NA   NA
 1217181 1219207         FALSE 0.005 340.000 0.000 NA   NA
 1219206 1295285         FALSE 0.173 95.000 0.000 NA   NA
 1295285 1219205         FALSE 0.010 -117.000 0.000 NA   NA
 1219205 1219204         FALSE 0.290 49.000 0.000 NA   NA
 1219204 1295033         FALSE 0.513 4.000 0.000 NA   NA
 1295033 1219202         FALSE 0.003 743.000 0.000 NA   NA
 1219202 1362649       pseudo FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1295264 1217180         FALSE 0.005 384.000 0.000 NA   NA
 1217180 1219199         FALSE 0.005 351.000 0.000 NA   NA
 1219199 1217179         FALSE 0.002 994.000 0.000 NA   NA
 1217179 1219197         FALSE 0.178 94.000 0.000 NA   NA
 1217177 1217176         FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
 1217176 1217175         FALSE 0.629 1.000 0.000 NA   NA
 1217175 1217174         FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 1217173 1217172         FALSE 0.202 -13.000 0.000 NA   NA
 1217171 1217170         TRUE 0.876 0.000 0.054 NA   NA
 1217170 1219195         FALSE 0.042 -45.000 0.000 NA   NA
 1217169 1295191     gor   FALSE 0.309 56.000 0.000 NA   NA
 1217168 1219194     ECM27   FALSE 0.066 130.000 0.000 NA   NA
 1217166 1217165         TRUE 0.941 5.000 0.925 NA   NA
 1217165 1217164       trpA TRUE 0.786 37.000 0.375 NA   NA
 1217161 1295322         FALSE 0.006 322.000 0.000 NA   NA
 1295322 1217160         FALSE 0.125 106.000 0.000 NA   NA
 1217160 1217159         FALSE 0.462 105.000 0.126 NA   NA
 1217159 1217158         TRUE 0.918 6.000 0.688 NA   NA
 1217158 1217157         TRUE 0.968 0.000 0.714 NA   NA
 1217157 1217156         TRUE 0.680 111.000 0.905 NA   NA
 1217156 1295262         FALSE 0.037 155.000 0.000 NA   NA
 1217155 1217154         FALSE 0.023 417.000 0.123 NA   NA
 1217153 1219894     hisI   FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 1362650 1217152     pseudo   FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 1217151 1219190     clpB   FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 1219190 1217150       petE FALSE 0.480 88.000 0.043 NA   NA
 1217150 1217149     petE   TRUE 0.870 35.000 0.404 1.000 N NA
 1217149 1217148       hemE TRUE 0.918 -3.000 0.032 1.000 N NA
 1217148 1217147     hemE glgB FALSE 0.467 110.000 0.024 1.000 N NA
 1217147 1217146     glgB   FALSE 0.510 101.000 0.146 NA   NA
 1217146 1217145         FALSE 0.265 -45.000 0.240 NA   NA
 1217145 1219189         TRUE 0.847 -10.000 0.760 NA   NA
 1219189 1217144         TRUE 0.876 58.000 0.684 NA   NA
 1217144 1217143         TRUE 0.759 -10.000 0.317 NA   NA
 1217142 1217141         TRUE 0.673 5.000 0.023 NA   NA
 1217141 1217140       proA FALSE 0.658 35.000 0.012 1.000 N NA
 1217140 1217139     proA folB TRUE 0.909 -3.000 0.023 1.000 N NA
 1217139 1217138     folB   FALSE 0.650 22.000 0.027 1.000   NA
 1217138 1219188         TRUE 0.668 59.000 0.073 NA   NA
 1219188 1217137         TRUE 0.752 -7.000 0.162 NA   NA
 1217137 1217136         TRUE 0.861 21.000 0.833 NA   NA
 1219187 1362651       pseudo FALSE 0.173 95.000 0.000 NA   NA
 1217134 1217133       prlC TRUE 0.817 5.000 0.111 NA   NA
 1217133 1217132     prlC   TRUE 0.958 4.000 0.444 1.000 N NA
 1217132 1217131       thrB TRUE 0.783 58.000 0.031 1.000 N NA
 1217131 1217130     thrB glk TRUE 0.806 15.000 0.013 0.075 N NA
 1219185 1217129       thrS FALSE 0.291 73.000 0.000 NA   NA
 1217128 1217127       trpS FALSE 0.026 342.000 0.000 1.000 N NA
 1217127 1217126     trpS   TRUE 0.770 4.000 0.034 NA   NA
 1217125 1217124         FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 1217124 1217123         FALSE 0.023 285.000 0.000 1.000   NA
 1217123 1217122         TRUE 0.990 0.000 0.894 1.000 Y NA
 1217122 1217121         TRUE 0.989 -3.000 0.857 0.075 Y NA
 1217121 1362652       pseudo FALSE 0.011 235.000 0.000 NA   NA
 1362652 1217120     pseudo   FALSE 0.250 24.000 0.000 NA   NA
 1217120 1217119         TRUE 0.968 2.000 0.350 1.000 N NA
 1217119 1217118       bcsA TRUE 0.809 -9.000 0.093 1.000 N NA
 1217118 1219182     bcsA   FALSE 0.004 409.000 0.000 NA   NA
 1362653 1217117     pseudo   FALSE 0.309 56.000 0.000 NA   NA
 1217116 1217115         TRUE 0.821 16.000 0.423 NA   NA
 1217114 1217113     menD menB TRUE 0.965 6.000 0.147 0.001 Y NA
 1217113 1217112     menB   FALSE 0.554 58.000 0.027 NA   NA
 1217112 1217111       glgA FALSE 0.613 60.000 0.045 NA   NA
 1217111 1294963     glgA   FALSE 0.317 -7.000 0.000 NA   NA
 1294963 1217110         FALSE 0.412 6.000 0.000 NA   NA
 1217110 1217109       murF TRUE 0.937 0.000 0.238 NA   NA
 1217108 1217107     glmU   FALSE 0.087 -45.000 0.021 NA   NA
 1217107 1217106       aroA FALSE 0.230 -19.000 0.017 NA   NA
 1217106 1217105     aroA ubiD FALSE 0.117 148.000 0.009 NA N NA
 1217104 1217103         TRUE 0.706 43.000 0.051 1.000   NA
 1217103 1217102       amiC FALSE 0.101 -91.000 0.051 1.000   NA
 1217102 1217101     amiC murI TRUE 0.953 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 1217101 1217100     murI sds TRUE 0.712 23.000 0.024 1.000 N NA
 1217099 1219180         FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 1219180 1295370         FALSE 0.290 49.000 0.000 NA   NA
 1217097 1217096         TRUE 0.909 -3.000 0.190 NA   NA
 1217095 1217094     dnaQ   FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 1217094 1217093       def FALSE 0.068 129.000 0.000 NA   NA
 1219179 1219178         FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 1217092 1219177         FALSE 0.003 572.000 0.000 NA   NA
 1219177 1219176         FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1219176 1219175         FALSE 0.263 19.000 0.000 NA   NA
 1219175 1219172         FALSE 0.003 613.000 0.000 NA   NA
 1219172 1217091         FALSE 0.003 522.000 0.000 NA   NA
 1217091 1217090         FALSE 0.039 151.000 0.000 NA   NA
 1309258 1217089     tRNA-Ala lexA FALSE 0.306 62.000 0.000 NA   NA
 1217089 1217088     lexA argF FALSE 0.191 163.000 0.020 1.000 N NA
 1217088 1217087     argF   TRUE 0.763 55.000 0.022 1.000 N NA
 1217087 1295304         FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 1295304 1295369         FALSE 0.004 472.000 0.000 NA   NA
 1219891 1217086         FALSE 0.138 103.000 0.000 NA   NA
 1217083 1217082         TRUE 0.704 4.000 0.021 NA   NA
 1217082 1217081         TRUE 0.895 1.000 0.095 NA   NA
 1217080 1217079         FALSE 0.021 192.000 0.000 NA   NA
 1217079 1217078         FALSE 0.190 92.000 0.000 NA   NA
 1217078 1217077         FALSE 0.021 193.000 0.000 NA   NA
 1217075 1217074         FALSE 0.266 18.000 0.000 NA   NA
 1217074 1217073       pheS FALSE 0.486 103.000 0.011 1.000 N NA
 1217068 1217067     thiE thiS TRUE 0.981 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 1217067 1217066     thiS   FALSE 0.408 -34.000 0.310 NA   NA
 1217066 1217065         FALSE 0.182 162.000 0.150 NA   NA
 1217065 1295176         TRUE 0.745 66.000 0.167 NA   NA
 1217064 1217063         TRUE 0.911 -3.000 0.070 1.000   NA
 1217063 1217062       trmD TRUE 0.836 -3.000 0.011 1.000   NA
 1217062 1217061     trmD era FALSE 0.174 178.000 0.010 0.018   NA
 1217059 1219166         FALSE 0.307 54.000 0.000 NA   NA
 1219166 1217058         FALSE 0.629 1.000 0.000 NA   NA
 1217058 1217057         TRUE 0.846 63.000 0.025 0.039 N NA
 1217057 1217056         FALSE 0.276 110.000 0.037 NA   NA
 1217056 1217055       phoH FALSE 0.489 77.000 0.024 NA   NA
 1217055 1217054     phoH rpsP TRUE 0.790 9.000 0.019 1.000 N NA
 1217054 1217053     rpsP ffh TRUE 0.859 82.000 0.361 1.000 N NA
 1217053 1217052     ffh   FALSE 0.636 70.000 0.016 1.000   NA
 1217052 1219165         FALSE 0.060 -37.000 0.000 NA   NA
 1217050 1217049         FALSE 0.299 113.000 0.021 NA N NA
 1295026 1219164         FALSE 0.008 284.000 0.000 NA   NA
 1219164 1219890         FALSE 0.239 31.000 0.000 NA   NA
 1219163 1219162         FALSE 0.004 444.000 0.000 NA   NA
 1219162 1219161         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1217046 1217045     fkpA   TRUE 0.781 69.000 0.096 1.000   NA
 1217045 1217044         TRUE 0.697 92.000 0.154 1.000   NA
 1217043 1219160         FALSE 0.030 -52.000 0.000 NA   NA
 1219160 1217042       trpC FALSE 0.006 321.000 0.000 NA   NA
 1217042 1217041     trpC lpd TRUE 0.808 64.000 0.057 1.000 N NA
 1217041 1217040     lpd   TRUE 0.892 6.000 0.115 1.000 N NA
 1217040 1217039         TRUE 0.674 32.000 0.049 1.000   NA
 1295029 1219157         FALSE 0.261 40.000 0.000 NA   NA
 1217038 1309296       tRNA-Leu FALSE 0.004 412.000 0.000 NA   NA
 1309296 1217037     tRNA-Leu argD FALSE 0.025 -66.000 0.000 NA   NA
 1217037 1217036     argD folC TRUE 0.960 1.000 0.181 1.000 N NA
 1217036 1217035     folC   FALSE 0.523 21.000 0.034 NA   NA
 1217033 1217032     codA   TRUE 0.768 33.000 0.357 NA   NA
 1309297 1295347     tRNA-His   FALSE 0.053 -41.000 0.000 NA   NA
 1295347 1217031         FALSE 0.264 78.000 0.000 NA   NA
 1217031 1217030       ddlA TRUE 0.709 41.000 0.020 1.000 N NA
 1217030 1217029     ddlA   FALSE 0.584 16.000 0.046 NA   NA
 1217029 1217028       ftsQ FALSE 0.529 60.000 0.024 NA   NA
 1219154 1217024         FALSE 0.048 -43.000 0.000 NA   NA
 1217024 1217023         FALSE 0.600 31.000 0.084 NA   NA
 1217023 1217022         TRUE 0.945 92.000 0.745 0.003 Y NA
 1217022 1217021         FALSE 0.599 49.000 0.048 NA   NA
 1217021 1217020       ilvC FALSE 0.186 99.000 0.002 NA   NA
 1217020 1217019     ilvC cbiB TRUE 0.790 87.000 0.017 1.000 Y NA
 1217019 1294933     cbiB   FALSE 0.293 15.000 0.000 NA   NA
 1217018 1217017     wcaJ   TRUE 0.911 31.000 0.344 1.000 Y NA
 1217016 1217015         FALSE 0.256 79.000 0.000 NA   NA
 1219153 1217014         FALSE 0.128 -22.000 0.000 NA   NA
 1217013 1217012         FALSE 0.630 -27.000 0.600 NA   NA
 1217012 1219151         TRUE 0.986 4.000 0.600 0.005 Y NA
 1219151 1217011         FALSE 0.016 1781.000 0.000 0.030   NA
 1217010 1219150         FALSE 0.012 232.000 0.000 NA   NA
 1295040 1219149         FALSE 0.221 -12.000 0.000 NA   NA
 1294934 1219147         FALSE 0.221 -12.000 0.000 NA   NA
 1217008 1219146         FALSE 0.019 202.000 0.000 NA   NA
 1219146 1217007         FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1219887 1362654       pseudo FALSE 0.080 121.000 0.000 NA   NA
 1362654 1217006     pseudo   FALSE 0.003 589.000 0.000 NA   NA
 1217005 1219143         FALSE 0.392 7.000 0.000 NA   NA
 1219143 1219142         FALSE 0.241 34.000 0.000 NA   NA
 1217004 1217003         TRUE 0.705 79.000 0.000 0.022   NA
 1217002 1294953         FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1294953 1309256       tRNA-Ser FALSE 0.024 185.000 0.000 NA   NA
 1309256 1217001     tRNA-Ser   FALSE 0.242 28.000 0.000 NA   NA
 1219137 1219136         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219136 1219135         FALSE 0.271 17.000 0.000 NA   NA
 1219135 1362655       pseudo FALSE 0.572 3.000 0.000 NA   NA
 1362655 1216999     pseudo piuC FALSE 0.003 752.000 0.000 NA   NA
 1216999 1216998     piuC   FALSE 0.658 97.000 0.326 NA   NA
 1219134 1216997         FALSE 0.412 6.000 0.000 NA   NA
 1216997 1216996         TRUE 0.905 3.000 0.000 0.020   NA
 1216996 1216995       glyQ FALSE 0.113 153.000 0.000 1.000   NA
 1294894 1216993         FALSE 0.087 118.000 0.000 NA   NA
 1219133 1216992         FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 1295307 1216991         FALSE 0.241 29.000 0.000 NA   NA
 1216991 1216990       ubiE FALSE 0.340 43.000 0.010 NA   NA
 1216990 1219130     ubiE   FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1219130 1216989       hisF FALSE 0.312 13.000 0.000 NA   NA
 1295038 1216988       chlG FALSE 0.257 -46.000 0.262 NA   NA
 1216988 1216987     chlG mrcB TRUE 0.968 -3.000 0.452 1.000 N NA
 1216986 1216985     sun   TRUE 0.917 0.000 0.014 1.000 N NA
 1216983 1216982       dppC FALSE 0.602 52.000 0.043 NA   NA
 1216982 1216981     dppC   FALSE 0.621 38.000 0.022 1.000   NA
 1216980 1219127         FALSE 0.209 109.000 0.020 NA   NA
 1219127 1219886         FALSE 0.003 563.000 0.000 NA   NA
 1216978 1216977         FALSE 0.003 493.000 0.000 NA   NA
 1216977 1216976         FALSE 0.140 -82.000 0.250 NA   NA
 1216976 1216975         FALSE 0.559 -33.000 0.750 NA   NA
 1216975 1216974         TRUE 0.962 -3.000 0.857 NA   NA
 1216974 1219885         FALSE 0.302 14.000 0.000 NA   NA
 1219885 1294892         FALSE 0.009 -141.000 0.000 NA   NA
 1216973 1216972         FALSE 0.020 754.000 0.000 NA Y NA
 1216972 1216971         TRUE 0.932 6.000 1.000 NA   NA
 1216971 1216970         FALSE 0.097 336.000 1.000 NA   NA
 1216970 1216969         FALSE 0.246 -10.000 0.000 NA   NA
 1216969 1216968         FALSE 0.572 3.000 0.000 NA   NA
 1216967 1219121     lepA   FALSE 0.005 383.000 0.000 NA   NA
 1216961 1216960         FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1295230 1295027         FALSE 0.021 192.000 0.000 NA   NA
 1295027 1219117         FALSE 0.092 116.000 0.000 NA   NA
 1219117 1219116         FALSE 0.317 -7.000 0.000 NA   NA
 1219116 1216959         FALSE 0.003 633.000 0.000 NA   NA
 1216959 1216958         FALSE 0.010 450.000 0.000 NA N NA
 1216958 1219115         FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 1219115 1216957         FALSE 0.007 290.000 0.000 NA   NA
 1216957 1216956       hupE FALSE 0.003 543.000 0.000 NA   NA
 1216956 1219114     hupE   FALSE 0.063 131.000 0.000 NA   NA
 1216955 1219113     murE   FALSE 0.148 -64.000 0.049 1.000   NA
 1219113 1216954         TRUE 0.827 0.000 0.025 NA   NA
 1216952 1216951     metB   TRUE 0.989 0.000 0.250 0.001 Y NA
 1216951 1216950         TRUE 0.865 97.000 0.095 0.013 Y NA
 1216949 1362656     queA pseudo FALSE 0.048 142.000 0.000 NA   NA
 1362656 1216948     pseudo   FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1295367 1216946         FALSE 0.278 76.000 0.000 NA   NA
 1216946 1216944         FALSE 0.003 611.000 0.000 NA   NA
 1216944 1216943         FALSE 0.203 165.000 0.000 0.009   NA
 1216942 1219109     pdhC   FALSE 0.048 -43.000 0.000 NA   NA
 1216940 1219107         FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 1219107 1216939         FALSE 0.004 484.000 0.000 NA   NA
 1216938 1216937       fadD TRUE 0.828 70.000 0.388 NA   NA
 1216937 1216936     fadD lipB FALSE 0.232 156.000 0.029 1.000 N NA
 1216935 1216934     lrtA deoC TRUE 0.676 16.000 0.039 NA N NA
 1216934 1216933     deoC recO TRUE 0.895 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1216933 1216932     recO   FALSE 0.606 -13.000 0.013 1.000 N NA
 1216932 1216931         TRUE 0.827 31.000 0.216 1.000 N NA
 1216930 1216929     proC   TRUE 0.795 -10.000 0.224 1.000   NA
 1216929 1216928         FALSE 0.354 128.000 0.194 NA   NA
 1216928 1294955         TRUE 0.722 8.000 0.065 NA   NA
 1294955 1216927       cbiQ TRUE 0.853 12.000 0.447 NA   NA
 1216927 1216926     cbiQ   TRUE 0.855 4.000 0.029 1.000   NA
 1216926 1216925         FALSE 0.395 63.000 0.011 NA   NA
 1216925 1216924         FALSE 0.167 96.000 0.000 NA   NA
 1216924 1219104         FALSE 0.255 38.000 0.000 NA   NA
 1216920 1216919       cobI/cbiL FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1216917 1216916     miaE aroQ TRUE 0.922 -3.000 0.039 1.000 N NA
 1309298 1309299     tRNA-Tyr tRNA-Thr FALSE 0.378 8.000 0.000 NA   NA
 1216915 1219102         FALSE 0.290 49.000 0.000 NA   NA
 1219102 1216914         FALSE 0.014 215.000 0.000 NA   NA
 1219101 1219100         FALSE 0.133 -21.000 0.000 NA   NA
 1219100 1216913       alsT FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 1219099 1216911         FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 1216911 1216910         TRUE 0.898 59.000 0.571 1.000   NA
 1216909 1216908     recQ   TRUE 0.799 63.000 0.273 NA   NA
 1216907 1216906     psaE mutM TRUE 0.812 6.000 0.040 1.000   NA
 1216906 1216905     mutM   TRUE 0.724 13.000 0.010 1.000 N NA
 1216905 1294958         TRUE 0.869 12.000 0.174 1.000 N NA
 1294958 1295250         FALSE 0.302 14.000 0.000 NA   NA
 1309422 1365779     rrf rrl FALSE 0.105 110.000 0.000 NA   NA
 1295085 1362657       pseudo FALSE 0.412 6.000 0.000 NA   NA
 1309282 1309281     tRNA-Ala tRNA-Ile FALSE 0.348 10.000 0.000 NA   NA
 1309281 1309420     tRNA-Ile rrs FALSE 0.010 242.000 0.000 NA   NA
 1219097 1219096     petD petB TRUE 0.864 91.000 0.471 0.044   NA
 1219095 1219094         TRUE 0.911 -3.000 0.071 1.000   NA
 1219094 1219093       minC TRUE 0.708 48.000 0.038 1.000   NA
 1219093 1219092     minC minD FALSE 0.574 154.000 0.368 1.000 Y NA
 1219092 1219091     minD minE TRUE 0.954 5.000 0.347 NA Y NA
 1219091 1295145     minE   FALSE 0.239 31.000 0.000 NA   NA
 1295145 1219880         FALSE 0.003 530.000 0.000 NA   NA
 1219880 1295095         FALSE 0.002 1059.000 0.000 NA   NA
 1219090 1219878         FALSE 0.012 231.000 0.000 NA   NA
 1219878 1219089         FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 1219877 1309283       tRNA-Thr FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 1309283 1219947     tRNA-Thr   FALSE 0.293 15.000 0.000 NA   NA
 1219876 1362658       pseudo FALSE 0.334 11.000 0.000 NA   NA
 1362658 1219875     pseudo   FALSE 0.280 16.000 0.000 NA   NA
 1219875 1219874         FALSE 0.239 30.000 0.000 NA   NA
 1219874 1219873         FALSE 0.006 313.000 0.000 NA   NA
 1219088 1219087     sua5 hemK TRUE 0.743 -28.000 0.444 NA Y NA
 1219087 1219086     hemK smf TRUE 0.757 10.000 0.011 1.000 N NA
 1219086 1219085     smf   FALSE 0.412 13.000 0.012 NA   NA
 1295320 1219084         FALSE 0.060 -37.000 0.000 NA   NA
 1219084 1219083       fdx FALSE 0.405 156.000 0.472 1.000   NA
 1219082 1219870     psbB psbT TRUE 0.929 52.000 0.651 0.044   NA
 1219870 1219869     psbT   FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 1219869 1219081         FALSE 0.239 33.000 0.000 NA   NA
 1219081 1219080       rps1a, rpsA1 FALSE 0.307 102.000 0.025 NA   NA
 1219080 1219079     rps1a, rpsA1   TRUE 0.763 17.000 0.112 1.000   NA
 1219079 1219078       metK TRUE 0.885 -3.000 0.030 1.000   NA
 1219078 1219077     metK xylB TRUE 0.828 8.000 0.028 1.000 N NA
 1219077 1219076     xylB   FALSE 0.070 190.000 0.041 NA   NA
 1219076 1219075         FALSE 0.172 106.000 0.011 NA   NA
 1219946 1219867         FALSE 0.004 437.000 0.000 NA   NA
 1309284 1219865     tRNA-Phe   FALSE 0.378 8.000 0.000 NA   NA
 1295296 1219864         FALSE 0.178 94.000 0.000 NA   NA
 1219864 1219863         FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 1219862 1219074       cpeS TRUE 0.747 38.000 0.259 NA   NA
 1219074 1219073     cpeS cpeT TRUE 0.815 18.000 0.444 NA   NA
 1362660 1219072     pseudo cpeY FALSE 0.247 25.000 0.000 NA   NA
 1219069 1219068     cpeA cpeB TRUE 0.897 57.000 0.167 0.001   NA
 1219856 1219855         FALSE 0.022 189.000 0.000 NA   NA
 1219855 1219067       ho1 FALSE 0.097 113.000 0.000 NA   NA
 1219067 1219854     ho1   FALSE 0.280 16.000 0.000 NA   NA
 1219854 1219066       pebA FALSE 0.317 -7.000 0.000 NA   NA
 1219066 1219065     pebA pebB TRUE 0.982 -3.000 0.808 0.001   NA
 1219063 1219062     panC rlpA FALSE 0.514 81.000 0.012 NA N NA
 1219061 1219060     purM   FALSE 0.053 171.000 0.018 NA   NA
 1219060 1219059         FALSE 0.330 141.000 0.308 NA   NA
 1219059 1219058         TRUE 0.895 5.000 0.346 NA   NA
 1219057 1362662       pseudo FALSE 0.256 21.000 0.000 NA   NA
 1295152 1219056         TRUE 0.934 1.000 0.000 0.002   NA
 1219056 1295043         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1295043 1219848         FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1219848 1219055         FALSE 0.012 228.000 0.000 NA   NA
 1219055 1219054         FALSE 0.304 67.000 0.000 NA   NA
 1219052 1219846     rnd   FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1219846 1362663       pseudo FALSE 0.048 142.000 0.000 NA   NA
 1219051 1219050         TRUE 0.732 37.000 0.238 NA   NA
 1219048 1219047     mrp   TRUE 0.959 3.000 0.041 1.000 Y NA
 1219047 1219046         TRUE 0.910 -3.000 0.024 1.000 N NA
 1219046 1219045       psaD FALSE 0.597 119.000 0.381 1.000   NA
 1219045 1219044     psaD   TRUE 0.781 65.000 0.091 1.000   NA
 1219044 1219043         TRUE 0.905 -3.000 0.059 1.000   NA
 1219043 1219042       ppc TRUE 0.959 3.000 0.457 1.000   NA
 1219042 1219041     ppc   FALSE 0.581 -28.000 0.500 NA   NA
 1219844 1309279       tRNA-Arg FALSE 0.365 -6.000 0.000 NA   NA
 1309279 1295306     tRNA-Arg   FALSE 0.290 49.000 0.000 NA   NA
 1219040 1219039     recF speD TRUE 0.703 28.000 0.024 1.000 N NA
 1219038 1295268         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219037 1219841         FALSE 0.093 -28.000 0.000 NA   NA
 1294989 1295244         FALSE 0.004 452.000 0.000 NA   NA
 1219034 1219033     thiF   FALSE 0.467 -28.000 0.108 1.000   NA
 1219028 1219027     dinG   FALSE 0.618 42.000 0.072 NA   NA
 1219026 1219025     recA   FALSE 0.149 154.000 0.019 1.000   NA
 1219025 1309278       tRNA-Gln FALSE 0.280 16.000 0.000 NA   NA
 1309278 1219024     tRNA-Gln   FALSE 0.131 105.000 0.000 NA   NA
 1219024 1219023       hycB TRUE 0.831 55.000 0.189 1.000   NA
 1219023 1219022     hycB   TRUE 0.895 72.000 0.595 1.000   NA
 1219021 1219020     rplC rplD TRUE 0.989 0.000 0.361 0.015 Y NA
 1219020 1219019     rplD rplW TRUE 0.966 -7.000 0.513 0.015 Y NA
 1219019 1219018     rplW rplB TRUE 0.965 17.000 0.849 0.016 Y NA
 1219018 1219017     rplB rpsS TRUE 0.959 36.000 0.820 0.020 Y NA
 1219017 1219016     rpsS rplV TRUE 0.983 5.000 0.769 0.020 Y NA
 1219016 1219015     rplV rpsC TRUE 0.960 20.000 0.719 0.020 Y NA
 1219015 1219014     rpsC rplP TRUE 0.964 17.000 0.828 0.020 Y NA
 1219014 1219013     rplP rpmC TRUE 0.987 4.000 0.802 0.015 Y NA
 1219013 1219012     rpmC rpsQ TRUE 0.963 20.000 0.828 0.015 Y NA
 1219012 1219011     rpsQ rplN TRUE 0.990 -3.000 0.791 0.020 Y NA
 1219011 1219010     rplN rplX TRUE 0.979 2.000 0.071 0.020 Y NA
 1219009 1219008     rplE rpsH TRUE 0.907 25.000 0.059 0.015 Y NA
 1219008 1219007     rpsH rplF TRUE 0.966 16.000 0.808 0.015 Y NA
 1219007 1219006     rplF rplR TRUE 0.959 34.000 0.815 0.015 Y NA
 1219006 1219005     rplR rpsE TRUE 0.963 18.000 0.814 0.020 Y NA
 1219005 1219004     rpsE rplO FALSE 0.353 -94.000 0.148 0.020 Y NA
 1219004 1219003     rplO secY TRUE 0.789 108.000 0.730 1.000 N NA
 1219003 1219002     secY adk TRUE 0.704 41.000 0.019 1.000 N NA
 1219002 1219001     adk rpmJ TRUE 0.721 47.000 0.050 1.000   NA
 1219001 1219000     rpmJ rpsM TRUE 0.701 109.000 0.194 0.015   NA
 1219000 1218999     rpsM rpsK TRUE 0.970 64.000 0.810 0.015 Y NA
 1218999 1218998     rpsK rpoA TRUE 0.876 48.000 0.308 1.000 N NA
 1218998 1218997     rpoA rplQ TRUE 0.917 40.000 0.873 1.000 N NA
 1218997 1218996     rplQ truA TRUE 0.881 39.000 0.102 1.000 Y NA
 1218996 1218995     truA rplM FALSE 0.262 202.000 0.058 1.000 Y NA
 1218995 1218994     rplM rpsI TRUE 0.989 -3.000 0.601 0.015 Y NA
 1218994 1218993     rpsI rpmE TRUE 0.924 49.000 0.062 0.015 Y NA
 1218993 1218992     rpmE prfA TRUE 0.898 49.000 0.110 1.000 Y NA
 1218990 1309285     alr tRNA-Ser FALSE 0.305 65.000 0.000 NA   NA
 1309285 1218989     tRNA-Ser   FALSE 0.022 189.000 0.000 NA   NA
 1218989 1219836         FALSE 0.005 370.000 0.000 NA   NA
 1219836 1219835       rfbD FALSE 0.083 -30.000 0.000 NA   NA
 1219835 1295087     rfbD   FALSE 0.009 267.000 0.000 NA   NA
 1218988 1218987         TRUE 0.772 40.000 0.010 0.001   NA
 1218987 1218986         FALSE 0.006 315.000 0.000 NA   NA
 1218985 1218984     spr   TRUE 0.667 -22.000 0.061 NA Y NA
 1218982 1218981     psaI psaL TRUE 0.923 45.000 0.583 0.011   NA
 1218980 1218979     psaB psaA TRUE 0.916 22.000 0.513 0.002   NA
 1218978 1218977       cobJ FALSE 0.163 176.000 0.184 NA   NA
 1218976 1219831         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219831 1219830         FALSE 0.080 121.000 0.000 NA   NA
 1218974 1218972       gltB TRUE 0.837 4.000 0.086 NA   NA
 1218970 1218969     rpsL rpsG TRUE 0.967 66.000 0.620 0.003 Y NA
 1218969 1218968     rpsG fusA TRUE 0.905 93.000 0.579 1.000 Y NA
 1218968 1218967     fusA tufA TRUE 0.955 43.000 0.400 0.001 Y NA
 1218967 1294949     tufA   FALSE 0.076 -31.000 0.000 NA   NA
 1294949 1218966       rpsJ FALSE 0.239 33.000 0.000 NA   NA
 1218966 1218965     rpsJ   TRUE 0.697 59.000 0.025 1.000   NA
 1218965 1218964         TRUE 0.690 21.000 0.047 1.000   NA
 1218961 1218960     rnhB rne TRUE 0.958 2.000 0.033 0.016 N NA
 1218960 1218959     rne   FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 1218958 1218957         TRUE 0.703 55.000 0.110 NA   NA
 1218957 1218956         FALSE 0.549 108.000 0.289 NA   NA
 1295237 1218954       aroC FALSE 0.120 107.000 0.000 NA   NA
 1218954 1295310     aroC   FALSE 0.089 117.000 0.000 NA   NA
 1218953 1219829         TRUE 0.804 62.000 0.294 NA   NA
 1219829 1218952         FALSE 0.056 490.000 0.415 1.000   NA
 1218952 1218951       met3 TRUE 0.791 46.000 0.061 1.000 N NA
 1218951 1218950     met3 psbO FALSE 0.216 156.000 0.064 1.000   NA
 1218948 1218947     dfp   FALSE 0.491 -10.000 0.030 NA   NA
 1309286 1219828     tRNA-Ala   FALSE 0.283 75.000 0.000 NA   NA
 1219828 1218946         FALSE 0.394 -30.000 0.188 NA   NA
 1218946 1218945         FALSE 0.216 169.000 0.278 NA   NA
 1218945 1218944         TRUE 0.826 80.000 0.556 NA   NA
 1218943 1218942     pyrB   TRUE 0.900 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1295240 1218940         FALSE 0.060 -37.000 0.000 NA   NA
 1218940 1218939         FALSE 0.048 -43.000 0.000 NA   NA
 1218939 1219827         FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 1219827 1218938         FALSE 0.334 11.000 0.000 NA   NA
 1295226 1219826         FALSE 0.365 -6.000 0.000 NA   NA
 1295246 1219825         FALSE 0.263 42.000 0.000 NA   NA
 1219825 1219942         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219942 1218937         FALSE 0.102 206.000 0.000 0.027   NA
 1218937 1218936         FALSE 0.504 27.000 0.000 1.000   NA
 1218936 1218935         FALSE 0.024 490.000 0.000 0.021   NA
 1218935 1218934         FALSE 0.053 204.000 0.000 1.000   NA
 1218934 1218933         FALSE 0.336 103.000 0.000 1.000   NA
 1218933 1219824         FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 1219824 1218932         FALSE 0.334 11.000 0.000 NA   NA
 1295282 1219823         FALSE 0.365 -6.000 0.000 NA   NA
 1219941 1218931         FALSE 0.015 209.000 0.000 NA   NA
 1218929 1218928     mpg   FALSE 0.532 43.000 0.000 1.000   NA
 1218928 1219821         FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 1219821 1218927         FALSE 0.056 136.000 0.000 NA   NA
 1218927 1218926         TRUE 0.688 32.000 0.000 0.021   NA
 1218926 1219819         FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 1294954 1219818         FALSE 0.011 -108.000 0.000 NA   NA
 1294931 1218925         FALSE 0.150 100.000 0.000 NA   NA
 1218924 1218923       gatC TRUE 0.700 -3.000 0.015 NA   NA
 1218922 1309276     crtR tRNA-Leu FALSE 0.269 44.000 0.000 NA   NA
 1295387 1219815         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1219815 1218920         FALSE 0.239 31.000 0.000 NA   NA
 1218920 1294951         FALSE 0.629 1.000 0.000 NA   NA
 1218919 1218918         TRUE 0.876 3.000 0.106 NA   NA
 1218918 1218917         TRUE 0.936 0.000 0.226 NA   NA
 1218917 1218916         TRUE 0.901 6.000 0.324 NA N NA
 1219814 1218914         FALSE 0.203 89.000 0.000 NA   NA
 1218912 1218911         FALSE 0.004 426.000 0.000 NA   NA
 1219811 1219810         FALSE 0.261 40.000 0.000 NA   NA
 1219810 1219809         FALSE 0.312 13.000 0.000 NA   NA
 1219809 1218910       dcd FALSE 0.159 98.000 0.000 NA   NA
 1218910 1218909     dcd   TRUE 0.952 0.000 0.091 1.000 N NA
 1218908 1218907     rph ntcA FALSE 0.242 141.000 0.015 1.000 N NA
 1218907 1218906     ntcA   FALSE 0.305 66.000 0.000 NA   NA
 1218906 1218905         FALSE 0.083 -30.000 0.000 NA   NA
 1218904 1218903       pth TRUE 0.808 0.000 0.022 NA   NA
 1218903 1218902     pth   TRUE 0.779 8.000 0.011 1.000 N NA
 1218902 1218901       psbH TRUE 0.805 35.000 0.262 1.000   NA
 1218898 1218897     psbI   FALSE 0.583 106.000 0.324 NA   NA
 1218896 1218895       leuD FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 1218895 1218894     leuD leuC TRUE 0.985 -3.000 0.268 0.001 Y NA
 1218894 1218893     leuC cinA FALSE 0.650 26.000 0.032 1.000   NA
 1218893 1218892     cinA rfe FALSE 0.425 -25.000 0.032 1.000   NA
 1218892 1218891     rfe glyA FALSE 0.659 104.000 0.137 1.000 N NA
 1218890 1218889         TRUE 0.850 43.000 0.667 NA   NA
 1218889 1218888         TRUE 0.774 26.000 0.359 NA   NA
 1218884 1218883     lytB   TRUE 0.754 62.000 0.175 NA   NA
 1218883 1218882         FALSE 0.015 209.000 0.000 NA   NA
 1362664 1218878     pseudo   FALSE 0.271 77.000 0.000 NA   NA
 1218876 1218875     tgt psbK FALSE 0.648 31.000 0.034 1.000   NA
 1218874 1218873     rffM   FALSE 0.079 176.000 0.000 1.000   NA
 1218873 1218872         FALSE 0.626 19.000 0.078 NA   NA
 1218872 1218871         FALSE 0.442 101.000 0.077 NA   NA
 1218870 1218869     pyrE   TRUE 0.889 -3.000 0.034 1.000   NA
 1218867 1218866         TRUE 0.903 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1218865 1218864         FALSE 0.304 53.000 0.000 NA   NA
 1218864 1219804         FALSE 0.280 16.000 0.000 NA   NA
 1218862 1218861         FALSE 0.360 -31.000 0.171 NA   NA
 1218859 1218858         FALSE 0.360 -31.000 0.171 NA   NA
 1218856 1218855         TRUE 0.748 67.000 0.020 1.000 N NA
 1218855 1218854       fabI TRUE 0.693 28.000 0.021 1.000 N NA
 1218854 1218853     fabI   FALSE 0.278 76.000 0.000 NA   NA
 1218852 1218851       degT TRUE 0.754 55.000 0.057 1.000   NA
 1218851 1219802     degT   FALSE 0.009 267.000 0.000 NA   NA
 1218850 1218849       folK TRUE 0.720 61.000 0.033 1.000   NA
 1218847 1218846         TRUE 0.985 0.000 0.690 NA Y NA
 1218844 1218843     ndhJ ndhK TRUE 0.987 -3.000 0.406 0.002 Y NA
 1218843 1218842     ndhK ndhC TRUE 0.980 5.000 0.428 0.002 Y NA
 1218841 1218840     rub   TRUE 0.862 13.000 0.521 NA   NA
 1218840 1218839       psbE TRUE 0.673 107.000 0.625 NA   NA
 1218839 1218838     psbE psbF TRUE 0.977 4.000 0.837 0.002   NA
 1218838 1218837     psbF psbL TRUE 0.940 16.000 0.872 0.003   NA
 1218837 1218836     psbL psbJ TRUE 0.948 13.000 0.878 0.003   NA
 1362665 1218834     pseudo   FALSE 0.612 2.000 0.000 NA   NA
 1219799 1295192         FALSE 0.181 -15.000 0.000 NA   NA
 1218832 1218831       ugd TRUE 0.971 -3.000 0.157 1.000 Y NA
 1218831 1218830     ugd hisS FALSE 0.468 104.000 0.008 1.000 N NA
 1218830 1295289     hisS   FALSE 0.263 41.000 0.000 NA   NA
 1295289 1295397         FALSE 0.051 140.000 0.000 NA   NA
 1295397 1219798         FALSE 0.006 332.000 0.000 NA   NA
 1218829 1218828     galE   TRUE 0.777 63.000 0.000 NA Y NA
 1218826 1218825         TRUE 0.915 0.000 0.036 1.000   NA
 1218824 1218823         TRUE 0.886 -3.000 0.031 1.000   NA
 1218823 1218822         FALSE 0.536 -7.000 0.023 NA   NA
 1218821 1218820     kdsB   TRUE 0.763 6.000 0.020 1.000   NA
 1219795 1218819       kdsA FALSE 0.029 -54.000 0.000 NA   NA
 1218819 1218818     kdsA   FALSE 0.303 68.000 0.000 NA   NA
 1218817 1218816       uvrD FALSE 0.010 -202.000 0.007 NA   NA
 1218816 1219794     uvrD   FALSE 0.307 58.000 0.000 NA   NA
 1295323 1218815         FALSE 0.250 80.000 0.000 NA   NA
 1218814 1218813         TRUE 0.981 -3.000 0.182 0.016 Y NA
 1218813 1218812         TRUE 0.927 -16.000 0.615 0.016 Y NA
 1218812 1218811         TRUE 0.989 -3.000 0.692 0.016 Y NA
 1218811 1218810         TRUE 0.937 8.000 0.533 1.000 N NA
 1218810 1218809         FALSE 0.324 175.000 0.435 1.000   NA
 1218809 1218808         TRUE 0.699 -18.000 0.478 NA   NA
 1295009 1219790         FALSE 0.015 -94.000 0.000 NA   NA
 1219790 1294937         FALSE 0.010 -127.000 0.000 NA   NA
 1294937 1218807         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1218806 1219789         FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 1218805 1219786     icd   FALSE 0.003 503.000 0.000 NA   NA
 1219786 1218804         FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 1295328 1218803         FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1218801 1219784         FALSE 0.049 141.000 0.000 NA   NA
 1219784 1218800         FALSE 0.011 234.000 0.000 NA   NA
 1218800 1218799         FALSE 0.582 60.000 0.000 1.000   NA
 1218799 1295236         FALSE 0.052 139.000 0.000 NA   NA
 1218798 1295349         FALSE 0.242 28.000 0.000 NA   NA
 1295349 1219783         FALSE 0.009 -136.000 0.000 NA   NA
 1219783 1218797       galM FALSE 0.003 634.000 0.000 NA   NA
 1218797 1218796     galM   TRUE 0.898 8.000 0.339 1.000   NA
 1218796 1218795       kefB TRUE 0.808 75.000 0.179 1.000   NA
 1218795 1219780     kefB   FALSE 0.028 -55.000 0.000 NA   NA
 1218793 1218792         TRUE 0.868 38.000 0.950 NA   NA
 1218792 1309273       tRNA-Arg FALSE 0.173 95.000 0.000 NA   NA
 1309273 1295235     tRNA-Arg   FALSE 0.322 12.000 0.000 NA   NA
 1309424 1219779     rnpB   FALSE 0.060 -37.000 0.000 NA   NA
 1219779 1218791       rnc FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1218789 1218788     rimM manC TRUE 0.722 57.000 0.011 1.000 N NA
 1218787 1218786     glmS psaC TRUE 0.696 86.000 0.031 1.000 N NA
 1218785 1218784     acpP fabF TRUE 0.949 9.000 0.346 1.000 Y NA
 1218784 1218783     fabF tktA TRUE 0.813 53.000 0.062 1.000 N NA
 1218783 1218782     tktA   FALSE 0.534 135.000 0.055 1.000 Y NA
 1218782 1218781         FALSE 0.163 206.000 0.000 1.000 Y NA
 1218780 1218779         FALSE 0.603 37.000 0.073 NA   NA
 1295017 1218778         FALSE 0.009 254.000 0.000 NA   NA
 1218778 1218777       rbfA TRUE 0.797 3.000 0.030 NA   NA
 1218777 1218776     rbfA   TRUE 0.912 -3.000 0.025 1.000 N NA
 1218776 1218775         FALSE 0.496 -37.000 0.216 1.000 N NA
 1218775 1218774       hemD TRUE 0.929 -3.000 0.058 1.000 N NA
 1219939 1218773         FALSE 0.346 -31.000 0.156 NA   NA
 1218773 1218772       crtQ TRUE 0.959 3.000 0.800 NA   NA
 1218770 1218769         TRUE 0.913 2.000 0.167 NA   NA
 1218769 1362666       pseudo FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1218768 1218767         TRUE 0.750 29.000 0.143 1.000   NA
 1218766 1218765         TRUE 0.964 -3.000 0.364 1.000 N NA
 1218765 1218764         TRUE 0.904 24.000 0.714 1.000 N NA
 1218764 1218763         FALSE 0.168 134.000 0.000 1.000   NA
 1218763 1219776         FALSE 0.024 -67.000 0.000 NA   NA
 1219776 1295165         FALSE 0.309 56.000 0.000 NA   NA
 1219938 1218762         FALSE 0.009 -130.000 0.000 NA   NA
 1218762 1219774         FALSE 0.007 286.000 0.000 NA   NA
 1219774 1218761         FALSE 0.269 44.000 0.000 NA   NA
 1218761 1218760         FALSE 0.622 80.000 0.091 NA   NA
 1219773 1218759         FALSE 0.266 18.000 0.000 NA   NA
 1218759 1218758         FALSE 0.012 232.000 0.000 NA   NA
 1218758 1219771         FALSE 0.023 188.000 0.000 NA   NA
 1219771 1219770         FALSE 0.056 136.000 0.000 NA   NA
 1218757 1218756         TRUE 0.663 42.000 0.117 NA   NA
 1218756 1309287       tRNA-Asn FALSE 0.250 24.000 0.000 NA   NA
 1309287 1218755     tRNA-Asn rpaA FALSE 0.008 281.000 0.000 NA   NA
 1218754 1218753     holB tmk TRUE 0.957 -3.000 0.254 1.000 N NA
 1218753 1218752     tmk zntA TRUE 0.939 -3.000 0.020 0.065 N NA
 1218749 1218748     rpaB plsX FALSE 0.556 -19.000 0.026 1.000 N NA
 1218748 1218747     plsX fabH TRUE 0.919 95.000 0.380 0.003 Y NA
 1218747 1218746     fabH fabD TRUE 0.903 29.000 0.043 0.003 Y NA
 1218746 1218745     fabD   TRUE 0.967 4.000 0.218 1.000 Y NA
 1218744 1218743         TRUE 0.691 -3.000 0.014 NA   NA
 1218743 1218742       ycf34 TRUE 0.769 -3.000 0.023 NA   NA
 1218741 1219769         FALSE 0.103 -27.000 0.000 NA   NA
 1219769 1218740         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1218739 1218738     crtB,pys pds TRUE 0.959 4.000 0.691 1.000   NA
 1218737 1218736         TRUE 0.912 -3.000 0.205 NA   NA
 1218734 1218733       ndhF FALSE 0.526 35.000 0.041 NA   NA
 1218733 1218732     ndhF   TRUE 0.887 89.000 0.050 0.002 Y NA
 1218732 1218731         FALSE 0.005 443.000 0.009 NA   NA
 1218731 1218730         FALSE 0.548 46.000 0.034 NA   NA
 1218730 1219766         FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 1219766 1218729         FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 1218729 1218728         FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1218728 1218727         FALSE 0.002 981.000 0.000 NA   NA
 1218727 1218726         FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 1218726 1219765         FALSE 0.003 548.000 0.000 NA   NA
 1294919 1219764         FALSE 0.007 288.000 0.000 NA   NA
 1219764 1218725       metF FALSE 0.552 47.000 0.000 1.000   NA
 1294966 1218723         FALSE 0.536 92.000 0.090 NA   NA
 1218723 1218722         TRUE 0.854 6.000 0.101 1.000   NA
 1218722 1218721       ndhE TRUE 0.824 13.000 0.071 1.000 N NA
 1218721 1218720     ndhE ndhG TRUE 0.958 40.000 0.506 0.002 Y NA
 1218720 1218719     ndhG ndhI TRUE 0.983 -3.000 0.192 0.005 Y NA
 1218719 1219763     ndhI   FALSE 0.277 46.000 0.000 NA   NA
 1219763 1218718       ndhA FALSE 0.165 -16.000 0.000 NA   NA
 1218718 1218717     ndhA gltA TRUE 0.883 25.000 0.137 1.000 Y NA
 1218717 1218716     gltA sixA TRUE 0.817 26.000 0.171 1.000 N NA
 1218716 1218715     sixA   FALSE 0.141 -49.000 0.078 NA   NA
 1218715 1219762         FALSE 0.239 31.000 0.000 NA   NA
 1218714 1218713     hrcA   FALSE 0.091 199.000 0.000 1.000 N NA
 1218711 1218710         FALSE 0.420 -7.000 0.012 NA   NA
 1218710 1219761         FALSE 0.317 -7.000 0.000 NA   NA
 1218708 1218707       trpB FALSE 0.052 139.000 0.000 NA   NA
 1218707 1295127     trpB   FALSE 0.291 73.000 0.000 NA   NA
 1295204 1218704         FALSE 0.026 179.000 0.000 NA   NA
 1218704 1218703         FALSE 0.662 31.000 0.150 NA   NA
 1218703 1218702       purE FALSE 0.322 77.000 0.003 NA   NA
 1218701 1218700     nagA chlM TRUE 0.797 27.000 0.128 1.000 N NA
 1219758 1218699         FALSE 0.435 25.000 0.022 NA   NA
 1218699 1218698         TRUE 0.917 4.000 0.074 1.000 N NA
 1218698 1218697         FALSE 0.636 95.000 0.244 NA   NA
 1218696 1218695         FALSE 0.106 185.000 0.086 NA   NA
 1218694 1218693         FALSE 0.294 -10.000 0.003 NA   NA
 1218692 1218691     ndhH   FALSE 0.239 33.000 0.000 NA   NA
 1294940 1218690         FALSE 0.017 204.000 0.000 NA   NA
 1218688 1218687       menE TRUE 0.702 3.000 0.016 NA   NA
 1218687 1218686     menE menC TRUE 0.967 -3.000 0.104 0.001 N NA
 1218686 1218685     menC menA TRUE 0.894 5.000 0.066 1.000 N NA
 1218683 1218682     gshB grxC FALSE 0.505 -25.000 0.028 1.000 N NA
 1218681 1218680     prfB   FALSE 0.618 8.000 0.025 NA   NA
 1218680 1218679         TRUE 0.671 8.000 0.039 NA   NA
 1218679 1218678       dgkA FALSE 0.648 25.000 0.123 NA   NA
 1218678 1218677     dgkA pabA TRUE 0.867 15.000 0.231 1.000 N NA
 1218676 1218675         FALSE 0.063 131.000 0.000 NA   NA
 1218674 1218673       argS TRUE 0.918 0.000 0.015 1.000 N NA
 1218670 1218669         FALSE 0.007 298.000 0.000 NA   NA
 1218669 1218668       nadC FALSE 0.007 299.000 0.000 NA   NA
 1218668 1218667     nadC thdF FALSE 0.427 98.000 0.014 1.000   NA
 1218666 1219754         FALSE 0.291 73.000 0.000 NA   NA
 1219754 1218665         FALSE 0.266 18.000 0.000 NA   NA
 1219750 1218663         FALSE 0.012 228.000 0.000 NA   NA
 1218663 1219749         FALSE 0.009 265.000 0.000 NA   NA
 1219749 1218662       mscS FALSE 0.022 189.000 0.000 NA   NA
 1218660 1219744         FALSE 0.003 631.000 0.000 NA   NA
 1219744 1362667       pseudo FALSE 0.003 667.000 0.000 NA   NA
 1218659 1218658         FALSE 0.505 130.000 0.579 NA   NA
 1218658 1218657         TRUE 0.963 0.000 0.576 NA   NA
 1218655 1218654     gloA clpB2 TRUE 0.873 6.000 0.061 1.000 N NA
 1218654 1218653     clpB2 secE TRUE 0.744 74.000 0.023 1.000 N NA
 1218653 1218652     secE nusG TRUE 0.922 16.000 0.843 1.000 N NA
 1218652 1218651     nusG rplK TRUE 0.907 41.000 0.681 1.000 N NA
 1218651 1218650     rplK rplA TRUE 0.970 59.000 0.838 0.018 Y NA
 1218650 1218649     rplA rplJ FALSE 0.252 237.000 0.302 1.000 Y NA
 1218649 1218648     rplJ rplL FALSE 0.447 -94.000 0.884 1.000 Y NA
 1218648 1295430     rplL   FALSE 0.629 1.000 0.000 NA   NA
 1218646 1218645     rnhA pyrD TRUE 0.794 12.000 0.031 1.000 N NA
 1218645 1218644     pyrD   FALSE 0.314 40.000 0.005 NA   NA
 1218644 1218643         TRUE 0.891 0.000 0.071 NA   NA
 1218643 1218642         TRUE 0.840 -3.000 0.053 NA   NA
 1218642 1218641         FALSE 0.560 77.000 0.040 NA   NA
 1218636 1218635         FALSE 0.577 -3.000 0.000 NA   NA
 1218635 1218634       mmsB FALSE 0.031 315.000 0.000 1.000 N NA
 1218632 1218631         TRUE 0.872 -3.000 0.023 1.000   NA
 1218631 1218630       rluD TRUE 0.854 -3.000 0.018 1.000   NA
 1218630 1218629     rluD   FALSE 0.047 253.000 0.000 1.000 N NA
 1218629 1219937         FALSE 0.334 11.000 0.000 NA   NA
 1218628 1219736         FALSE 0.005 338.000 0.000 NA   NA
 1219736 1218627         FALSE 0.019 199.000 0.000 NA   NA
 1218626 1219735     spoT   FALSE 0.273 45.000 0.000 NA   NA
 1219735 1362668       pseudo FALSE 0.003 500.000 0.000 NA   NA
 1362668 1218625     pseudo   FALSE 0.306 60.000 0.000 NA   NA
 1218625 1219936         FALSE 0.103 -27.000 0.000 NA   NA
 1219734 1218623         FALSE 0.040 150.000 0.000 NA   NA
 1218623 1219733         FALSE 0.302 69.000 0.000 NA   NA
 1362669 1219732     pseudo   FALSE 0.378 8.000 0.000 NA   NA
 1219732 1219731         FALSE 0.243 35.000 0.000 NA   NA
 1219731 1219730         FALSE 0.093 -28.000 0.000 NA   NA
 1219730 1219729         FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1219729 1218622         FALSE 0.004 413.000 0.000 NA   NA
 1218621 1218620       argJ FALSE 0.007 293.000 0.000 NA   NA
 1295252 1219935         FALSE 0.004 488.000 0.000 NA   NA
 1218612 1218611         TRUE 0.824 36.000 0.571 NA   NA
 1218611 1218610         FALSE 0.005 336.000 0.000 NA   NA
 1218610 1218609         FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 1218607 1218606     hepA   TRUE 0.843 16.000 0.311 1.000   NA
 1218606 1295211         TRUE 0.727 -7.000 0.128 NA   NA
 1295407 1219725         FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 1218605 1218604         TRUE 0.961 0.000 0.061 NA Y NA
 1218604 1218603         TRUE 0.902 -7.000 0.202 NA Y NA
 1218603 1218602         TRUE 0.827 60.000 0.086 1.000 N NA
 1218602 1219724         FALSE 0.440 90.000 0.000 1.000   NA
 1219724 1218601         FALSE 0.215 121.000 0.000 1.000   NA
 1218601 1218600         FALSE 0.009 676.000 0.000 1.000   NA
 1294901 1219723         FALSE 0.241 29.000 0.000 NA   NA
 1295074 1218598         FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 1218597 1219934         FALSE 0.225 85.000 0.000 NA   NA
 1218596 1218595         FALSE 0.334 11.000 0.000 NA   NA
 1218595 1295105         FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 1294967 1218594         FALSE 0.243 27.000 0.000 NA   NA
 1218593 1218592         TRUE 0.690 26.000 0.000 0.025   NA
 1218592 1218591         TRUE 0.889 -3.000 0.136 NA   NA
 1218591 1218590         TRUE 0.741 66.000 0.161 NA   NA
 1218590 1218589         FALSE 0.066 189.000 0.000 1.000   NA
 1218589 1218588         FALSE 0.576 98.000 0.000 0.019   NA
 1218588 1218587         TRUE 0.740 75.000 0.000 0.019   NA
 1218587 1218586         TRUE 0.735 76.000 0.000 0.019   NA
 1218586 1218585         TRUE 0.713 79.000 0.000 0.019   NA
 1218584 1219719         FALSE 0.019 202.000 0.000 NA   NA
 1219719 1218583         FALSE 0.644 0.000 0.000 NA   NA
 1218583 1219718         FALSE 0.629 1.000 0.000 NA   NA
 1219718 1219717         FALSE 0.269 44.000 0.000 NA   NA
 1219717 1295429         FALSE 0.015 -94.000 0.000 NA   NA
 1295429 1218582         FALSE 0.263 19.000 0.000 NA   NA
 1218581 1219715         FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 1219715 1218580         FALSE 0.241 34.000 0.000 NA   NA
 1218580 1218579         TRUE 0.783 97.000 0.000 0.029 Y NA
 1218579 1295113         FALSE 0.572 3.000 0.000 NA   NA
 1295113 1218578         FALSE 0.048 -43.000 0.000 NA   NA
 1218576 1218575       gcvP FALSE 0.197 117.000 0.024 NA   NA
 1218575 1218574     gcvP gcvH TRUE 0.940 81.000 0.249 0.001 Y NA
 1218574 1218573     gcvH   TRUE 0.771 21.000 0.060 1.000 N NA
 1218570 1218569     ole1 rplI TRUE 0.675 44.000 0.007 1.000 N NA
 1218569 1218568     rplI dnaB TRUE 0.801 63.000 0.048 1.000 N NA
 1218568 1218567     dnaB gidA TRUE 0.719 52.000 0.012 1.000 N NA
 1218567 1218566     gidA   FALSE 0.333 26.000 0.012 NA   NA
 1218566 1218565       ubiC FALSE 0.575 60.000 0.032 NA   NA
 1218565 1218564     ubiC   FALSE 0.458 88.000 0.035 NA   NA
 1218563 1218562         FALSE 0.616 106.000 0.387 NA   NA
 1218562 1219714         FALSE 0.048 -43.000 0.000 NA   NA
 1218561 1218560       lig FALSE 0.369 25.000 0.016 NA   NA
 1218560 1218559     lig   FALSE 0.318 40.000 0.006 NA   NA
 1218557 1218556         TRUE 0.929 2.000 0.239 NA   NA
 1218556 1218555         TRUE 0.955 -3.000 0.648 NA   NA
 1218553 1218552     valS   FALSE 0.298 25.000 0.004 NA   NA
 1218551 1362670       pseudo FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 1362670 1219711     pseudo   FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 1219711 1218550         FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 1218550 1218549         FALSE 0.232 136.000 0.098 NA   NA
 1218547 1219932         FALSE 0.308 55.000 0.000 NA   NA
 1219932 1219930         FALSE 0.250 37.000 0.000 NA   NA
 1219930 1218546       pdxH FALSE 0.013 225.000 0.000 NA   NA
 1218546 1218545     pdxH   FALSE 0.617 82.000 0.000 1.000 N NA
 1218544 1218543         TRUE 0.951 -7.000 0.286 0.062 Y NA
 1218542 1218541         TRUE 0.784 54.000 0.238 NA   NA
 1218540 1218539         TRUE 0.904 -3.000 0.172 NA   NA
 1218539 1218538         TRUE 0.749 14.000 0.172 NA   NA
 1218538 1295077         FALSE 0.021 191.000 0.000 NA   NA
 1218536 1219708         FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 1219708 1309272       tRNA-Val FALSE 0.005 381.000 0.000 NA   NA
 1219707 1218535         FALSE 0.027 -130.000 0.029 NA   NA
 1218535 1219706         FALSE 0.215 87.000 0.000 NA   NA
 1219706 1218534         FALSE 0.005 352.000 0.000 NA   NA
 1219704 1218533         FALSE 0.135 289.000 0.679 1.000   NA
 1218533 1218532         TRUE 0.975 0.000 0.667 1.000   NA
 1218532 1218531         FALSE 0.119 241.000 0.261 1.000   NA
 1218531 1295382         FALSE 0.508 -10.000 0.000 1.000   NA
 1219702 1218530         FALSE 0.114 -25.000 0.000 NA   NA
 1218529 1218528     speE speB TRUE 0.972 0.000 0.064 1.000 Y NA
 1218526 1218525     aspS   TRUE 0.713 69.000 0.009 1.000 N NA
 1218525 1218524         TRUE 0.750 30.000 0.056 1.000 N NA
 1218524 1218523       pyrG FALSE 0.657 38.000 0.006 1.000 N NA
 1218523 1218522     pyrG nrdG TRUE 0.895 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1218521 1295132         FALSE 0.284 48.000 0.000 NA   NA
 1295132 1219699         FALSE 0.225 85.000 0.000 NA   NA
 1219697 1218520         FALSE 0.239 30.000 0.000 NA   NA
 1218520 1295436         FALSE 0.006 300.000 0.000 NA   NA
 1218519 1218518         FALSE 0.109 -78.000 0.037 1.000   NA
 1218518 1218517       pabC TRUE 0.972 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 1218516 1218515     livF urtD TRUE 0.759 -16.000 0.126 0.011   NA
 1218515 1218514     urtD urtC TRUE 0.927 -3.000 0.137 1.000   NA
 1218514 1218513     urtC livH TRUE 0.984 5.000 0.888 0.017 Y NA
 1218513 1218512     livH   TRUE 0.835 99.000 0.429 NA Y NA
 1218512 1218511       ureG FALSE 0.418 115.000 0.079 NA N NA
 1218511 1218510     ureG ureF TRUE 0.992 0.000 0.550 0.003 Y NA
 1218510 1218509     ureF ureE TRUE 0.992 0.000 0.560 0.003 Y NA
 1218508 1218507     ureD ureA TRUE 0.936 79.000 0.664 0.003 N NA
 1218507 1218506     ureA ureB TRUE 0.974 10.000 0.595 0.001 Y NA
 1218506 1218505     ureB ureC TRUE 0.955 37.000 0.486 0.001 Y NA
 1218504 1218503     cysG   TRUE 0.950 -3.000 0.318 1.000   NA
 1362672 1219695     pseudo   FALSE 0.241 29.000 0.000 NA   NA
 1218502 1219694     nirA   TRUE 0.722 53.000 0.139 NA   NA
 1219694 1218501       focA FALSE 0.552 37.000 0.049 NA   NA
 1218501 1218500     focA   TRUE 0.736 13.000 0.039 1.000   NA
 1218497 1218496       ppk TRUE 0.860 43.000 0.037 1.000 Y NA
 1218496 1218495     ppk   FALSE 0.091 209.000 0.019 1.000 N NA
 1218495 1218494       SEC59 TRUE 0.886 57.000 0.292 1.000 N NA
 1218492 1218491     acnB eriC TRUE 0.764 -10.000 0.062 1.000 N NA
 1218491 1218490     eriC   FALSE 0.036 506.000 0.089 1.000 N NA
 1218489 1218488       purU TRUE 0.732 15.000 0.050 1.000   NA
 1218485 1218484     aroE   FALSE 0.651 25.000 0.126 NA   NA
 1218484 1218483       rpsF FALSE 0.346 79.000 0.012 NA   NA
 1218483 1218482     rpsF   FALSE 0.346 45.000 0.010 NA   NA
 1218481 1219690     argG   TRUE 0.721 0.000 0.010 NA   NA
 1218480 1218479       mraY FALSE 0.551 62.000 0.027 NA   NA
 1218479 1218478     mraY   FALSE 0.227 148.000 0.000 0.033   NA
 1218477 1218476       purT FALSE 0.264 78.000 0.000 NA   NA
 1218475 1218474     sps   FALSE 0.050 258.000 0.031 1.000   NA
 1218474 1218473       uvrA TRUE 0.871 0.000 0.011 1.000   NA
 1218473 1218472     uvrA recN TRUE 0.894 47.000 0.021 0.061 Y NA
 1218471 1218470         TRUE 0.801 25.000 0.452 NA   NA
 1218470 1218469       thrC FALSE 0.533 83.000 0.050 NA   NA
 1218469 1218468     thrC dnaN FALSE 0.017 542.000 0.000 1.000 N NA