MicrobesOnline Operon Predictions for Acinetobacter sp. ADP1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 587519 587520 ACIAD0001 ACIAD0002 dnaA dnaN FALSE 0.329 236.000 0.273 1.000 Y NA
 587520 587521 ACIAD0002 ACIAD0003 dnaN recF TRUE 0.993 16.000 0.344 1.000 Y NA
 587521 587522 ACIAD0003 ACIAD0004 recF gyrB TRUE 0.984 53.000 0.257 0.005 Y NA
 587526 587527 ACIAD0008 ACIAD0009   adeT FALSE 0.015 249.000 0.000 NA   NA
 587527 587528 ACIAD0009 ACIAD0010 adeT   FALSE 0.129 119.000 0.007 NA   NA
 587530 587531 ACIAD0013 ACIAD0014 tyrS   FALSE 0.006 571.000 0.000 NA   NA
 587531 587532 ACIAD0014 ACIAD0015     FALSE 0.016 242.000 0.000 NA   NA
 587532 587533 ACIAD0015 ACIADrRNA16S_1     FALSE 0.006 534.000 0.000 NA   NA
 587533 587534 ACIADrRNA16S_1 ACIADtRNAIle_1     FALSE 0.238 62.000 0.000 NA   NA
 587534 587535 ACIADtRNAIle_1 ACIADtRNAAla_2     TRUE 0.439 37.000 0.000 NA   NA
 587535 587536 ACIADtRNAAla_2 ACIADrRNA23S_2     FALSE 0.009 344.000 0.000 NA   NA
 587536 587537 ACIADrRNA23S_2 ACIADrRNA5S_3     FALSE 0.024 186.000 0.000 NA   NA
 587537 587538 ACIADrRNA5S_3 ACIAD0017     FALSE 0.027 178.000 0.000 NA   NA
 587538 587539 ACIAD0017 ACIAD0018     FALSE 0.284 54.000 0.000 NA   NA
 587540 587541 ACIAD0019 ACIAD0020   fkpB FALSE 0.204 99.000 0.017 NA   NA
 587541 587542 ACIAD0020 ACIAD0021 fkpB lspA TRUE 0.992 -7.000 0.560 1.000 N NA
 587542 587543 ACIAD0021 ACIAD0022 lspA ileS TRUE 0.991 -7.000 0.500 1.000 N NA
 587543 587544 ACIAD0022 ACIAD0023 ileS ribF TRUE 0.644 65.000 0.194 1.000 N NA
 587545 587546 ACIAD0024 ACIAD0025     FALSE 0.348 45.000 0.000 NA   NA
 587548 587549 ACIAD0027 ACIAD0028     TRUE 0.994 -3.000 0.696 NA N NA
 587549 587550 ACIAD0028 ACIAD0029     TRUE 0.986 13.000 0.487 NA N NA
 587550 587551 ACIAD0029 ACIAD0030     FALSE 0.154 79.000 0.000 NA   NA
 587551 587552 ACIAD0030 ACIAD0031     TRUE 0.910 30.000 0.241 1.000   NA
 587552 587553 ACIAD0031 ACIAD0032     TRUE 0.784 16.000 0.000 1.000 N NA
 587554 587555 ACIAD0034 ACIAD0035 ssuB ssuC TRUE 0.998 4.000 0.657 1.000 Y NA
 587555 587556 ACIAD0035 ACIAD0036 ssuC ssuD TRUE 0.991 -3.000 0.423 1.000 N NA
 587556 587557 ACIAD0036 ACIAD0037 ssuD ssuA TRUE 0.957 23.000 0.375 1.000 N NA
 587557 587558 ACIAD0037 ACIAD0038 ssuA ssuA TRUE 0.996 27.000 0.188 0.002 Y NA
 587558 587559 ACIAD0038 ACIAD0039 ssuA argA FALSE 0.007 373.000 0.000 1.000 N NA
 587559 587560 ACIAD0039 ACIAD0040 argA   FALSE 0.159 112.000 0.014 NA   NA
 587560 587561 ACIAD0040 ACIAD0041     FALSE 0.028 176.000 0.000 NA   NA
 587561 587562 ACIAD0041 ACIAD0042     FALSE 0.013 270.000 0.000 NA   NA
 587562 587563 ACIAD0042 ACIAD0043     TRUE 0.813 31.000 0.120 0.088   NA
 587563 587564 ACIAD0043 ACIAD0044   ubiG TRUE 0.991 -3.000 0.328 1.000   NA
 587566 587567 ACIAD0046 ACIAD0047     TRUE 0.613 94.000 0.038 0.068 Y NA
 587568 587569 ACIAD0048 ACIAD0049     TRUE 0.940 35.000 0.750 1.000 N NA
 587569 587570 ACIAD0049 ACIAD0050   rph FALSE 0.310 68.000 0.005 1.000 N NA
 587570 587571 ACIAD0050 ACIAD0051 rph   FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 587571 587572 ACIAD0051 ACIAD0052     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 587572 587573 ACIAD0052 ACIAD0053     TRUE 0.918 2.000 0.000 NA   NA
 587573 587574 ACIAD0053 ACIAD0054     TRUE 0.918 1.000 0.000 NA   NA
 587574 587575 ACIAD0054 ACIAD0055     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 587575 587576 ACIAD0055 ACIAD0056     FALSE 0.268 57.000 0.000 NA   NA
 587576 587577 ACIAD0056 ACIAD0057     FALSE 0.117 90.000 0.000 NA   NA
 587577 587578 ACIAD0057 ACIAD0058     FALSE 0.177 74.000 0.000 NA   NA
 587578 587579 ACIAD0058 ACIAD0059     TRUE 0.886 -18.000 0.000 NA   NA
 587579 587580 ACIAD0059 ACIAD0060     FALSE 0.011 308.000 0.000 NA   NA
 587580 587581 ACIAD0060 ACIAD0061     TRUE 0.891 10.000 0.000 NA   NA
 587583 587584 ACIAD0063 ACIAD0064 ampD   TRUE 0.491 53.000 0.009 1.000   NA
 587585 587586 ACIAD0065 ACIAD0066 fklB fkpA TRUE 0.991 46.000 0.500 0.005 Y NA
 587586 587587 ACIAD0066 ACIAD0068 fkpA ptk FALSE 0.246 170.000 0.400 1.000 N NA
 587587 587588 ACIAD0068 ACIAD0069 ptk ptp TRUE 0.986 15.000 0.600 1.000 N NA
 587588 587589 ACIAD0069 ACIAD0070 ptp wza TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000 N NA
 587590 587591 ACIAD0072 ACIAD0073 ugd   TRUE 0.755 19.000 0.000 NA   NA
 587591 587592 ACIAD0073 ACIAD0074     TRUE 0.894 -10.000 0.000 NA   NA
 587592 587593 ACIAD0074 ACIAD0075     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 587593 587594 ACIAD0075 ACIAD0076   rmlB TRUE 0.581 30.000 0.000 1.000   NA
 587594 587595 ACIAD0076 ACIAD0078 rmlB rmlD TRUE 0.988 19.000 0.250 1.000 Y NA
 587595 587596 ACIAD0078 ACIAD0079 rmlD rmlA TRUE 1.000 1.000 0.250 0.001 Y NA
 587596 587597 ACIAD0079 ACIAD0080 rmlA rmlC TRUE 0.796 71.000 0.077 1.000 Y NA
 587597 587598 ACIAD0080 ACIAD0081 rmlC   TRUE 0.975 14.000 0.000 1.000 Y NA
 587598 587599 ACIAD0081 ACIAD0082     TRUE 0.971 -10.000 0.071 NA   NA
 587599 587600 ACIAD0082 ACIAD0083     TRUE 0.732 20.000 0.000 NA   NA
 587600 587601 ACIAD0083 ACIAD0084     TRUE 0.732 20.000 0.000 NA   NA
 587601 587602 ACIAD0084 ACIAD0085     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 587604 587605 ACIAD0087 ACIAD0088     TRUE 0.970 30.000 0.226 1.000 Y NA
 587605 587606 ACIAD0088 ACIAD0089     TRUE 0.976 0.000 0.050 1.000   NA
 587606 587607 ACIAD0089 ACIAD0090     TRUE 0.923 -3.000 0.000 1.000   NA
 587607 587608 ACIAD0090 ACIAD0091     TRUE 0.992 13.000 0.000 0.018 Y NA
 587608 587609 ACIAD0091 ACIAD0092     TRUE 0.998 9.000 0.107 0.018 Y NA
 587609 587610 ACIAD0092 ACIAD0093     TRUE 0.996 -6.000 0.208 NA Y NA
 587610 587611 ACIAD0093 ACIAD0094     TRUE 0.977 -19.000 0.132 NA   NA
 587611 587612 ACIAD0094 ACIAD0095   per TRUE 0.979 4.000 0.078 1.000   NA
 587612 587613 ACIAD0095 ACIAD0096 per   TRUE 0.995 2.000 0.117 1.000 Y NA
 587613 587614 ACIAD0096 ACIAD0098     FALSE 0.050 414.000 0.000 NA Y NA
 587614 587615 ACIAD0098 ACIAD0099   galU TRUE 0.548 80.000 0.000 NA Y NA
 587615 587616 ACIAD0099 ACIAD0100 galU   TRUE 0.963 27.000 0.083 1.000 Y NA
 587616 587617 ACIAD0100 ACIAD0101   pgi TRUE 0.981 -3.000 0.125 1.000 N NA
 587617 587618 ACIAD0101 ACIAD0102 pgi galE TRUE 0.981 -7.000 0.167 1.000 N NA
 587618 587619 ACIAD0102 ACIAD0103 galE   TRUE 0.843 37.000 0.000 NA Y NA
 587620 587621 ACIAD0104 ACIAD0105 manB   FALSE 0.037 143.000 0.000 1.000 N NA
 587622 587623 ACIAD0106 ACIAD0107 lldP lldR TRUE 0.968 24.000 0.600 1.000 N NA
 587623 587624 ACIAD0107 ACIAD0108 lldR lldD TRUE 0.987 -3.000 0.222 1.000 N NA
 587624 587625 ACIAD0108 ACIAD0109 lldD dld TRUE 0.994 4.000 0.062 1.000 Y NA
 587625 587626 ACIAD0109 ACIAD0110 dld   FALSE 0.056 128.000 0.000 NA   NA
 587627 587628 ACIAD0111 ACIAD0112   tyrB FALSE 0.038 154.000 0.000 NA   NA
 587628 587629 ACIAD0112 ACIAD0114 tyrB lrp FALSE 0.005 706.000 0.000 1.000 N NA
 587630 587631 ACIAD0115 ACIAD0116 dadA dadX TRUE 0.706 32.000 0.022 1.000 N NA
 587631 587632 ACIAD0116 ACIAD0117 dadX   TRUE 0.971 12.000 0.133 NA N NA
 587632 587633 ACIAD0117 ACIAD0118   cycA FALSE 0.010 254.000 0.000 NA N NA
 587633 587634 ACIAD0118 ACIAD0119 cycA   FALSE 0.005 527.000 0.000 1.000 N NA
 587634 587635 ACIAD0119 ACIAD0120     FALSE 0.355 115.000 0.000 1.000 Y NA
 587635 587636 ACIAD0120 ACIAD0121     TRUE 0.997 13.000 0.750 1.000 Y NA
 587636 587637 ACIAD0121 ACIAD0122     TRUE 0.997 1.000 1.000 NA   NA
 587637 587638 ACIAD0122 ACIAD0123     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 587638 587639 ACIAD0123 ACIAD0124     FALSE 0.031 155.000 0.000 1.000 N NA
 587640 587641 ACIAD0125 ACIAD0126   garD TRUE 0.562 52.000 0.039 NA   NA
 587641 587642 ACIAD0126 ACIAD0127 garD gudP TRUE 0.769 69.000 0.039 1.000 Y NA
 587643 587644 ACIAD0128 ACIAD0130 gudD kdgD FALSE 0.078 711.000 0.107 0.087 Y NA
 587644 587645 ACIAD0130 ACIAD0131 kdgD   TRUE 0.616 33.000 0.036 0.087 N NA
 587645 587646 ACIAD0131 ACIAD0132     FALSE 0.016 216.000 0.000 1.000 N NA
 587648 587649 ACIAD0134 ACIAD0135     FALSE 0.039 152.000 0.000 NA   NA
 587649 587650 ACIAD0135 ACIAD0136     FALSE 0.014 239.000 0.000 1.000 N NA
 587650 587651 ACIAD0136 ACIAD0137     TRUE 0.997 11.000 0.667 1.000 Y NA
 587651 587652 ACIAD0137 ACIAD0138     TRUE 0.994 -3.000 0.545 1.000   NA
 587652 587653 ACIAD0138 ACIAD0139     FALSE 0.223 65.000 0.000 NA   NA
 587654 587655 ACIADtRNAGly_3 ACIADtRNAGly_4     FALSE 0.374 42.000 0.000 NA   NA
 587656 587657 ACIAD0141 ACIAD0142     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 587657 587658 ACIAD0142 ACIAD0143     TRUE 0.936 12.000 0.008 NA   NA
 587658 587659 ACIAD0143 ACIAD0144     FALSE 0.341 82.000 0.043 NA   NA
 587659 587660 ACIAD0144 ACIAD0145     TRUE 0.966 -7.000 0.043 NA   NA
 587660 587661 ACIAD0145 ACIAD0147     FALSE 0.020 210.000 0.000 NA   NA
 587663 587664 ACIAD0149 ACIAD0150     FALSE 0.073 113.000 0.000 NA   NA
 587664 587665 ACIAD0150 ACIAD0151   guaA FALSE 0.284 54.000 0.000 NA   NA
 587667 587668 ACIAD0154 ACIAD0155     TRUE 0.766 34.000 0.057 NA   NA
 587668 587669 ACIAD0155 ACIAD0156     TRUE 0.813 16.000 0.000 NA   NA
 587669 587670 ACIAD0156 ACIAD0157     FALSE 0.040 151.000 0.000 NA   NA
 587670 587671 ACIAD0157 ACIAD0158     TRUE 0.979 -3.000 0.086 NA   NA
 587671 587672 ACIAD0158 ACIAD0159     TRUE 0.822 66.000 0.080 1.000 Y NA
 587674 587675 ACIAD0161 ACIAD0162     FALSE 0.166 76.000 0.000 NA   NA
 587676 587677 ACIAD0163 ACIAD0164   argS FALSE 0.261 116.000 0.099 NA   NA
 587677 587678 ACIAD0164 ACIAD0165 argS   FALSE 0.038 153.000 0.000 NA   NA
 587679 587680 ACIAD0166 ACIAD0167 sfcA   FALSE 0.050 136.000 0.000 NA   NA
 587680 587681 ACIAD0167 ACIAD0168     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 587681 587682 ACIAD0168 ACIAD0169     TRUE 0.918 2.000 0.000 NA   NA
 587682 587683 ACIAD0169 ACIAD0171     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 587686 587687 ACIAD0174 ACIAD0175 znuB znuC TRUE 0.981 3.000 0.000 0.090 Y NA
 587687 587688 ACIAD0175 ACIAD0176 znuC zur TRUE 0.984 -9.000 0.000 NA Y NA
 587689 587690 ACIAD0177 ACIAD0178 znuA atpI FALSE 0.061 174.000 0.017 1.000 N NA
 587690 587691 ACIAD0178 ACIAD0180 atpI atpB TRUE 0.805 104.000 0.500 1.000 Y NA
 587691 587692 ACIAD0180 ACIAD0182 atpB atpE TRUE 0.971 85.000 0.464 0.004 Y NA
 587692 587693 ACIAD0182 ACIAD0183 atpE atpF TRUE 0.994 40.000 0.531 0.004 Y NA
 587693 587694 ACIAD0183 ACIAD0184 atpF atpH TRUE 0.999 12.000 0.250 0.004 Y NA
 587694 587695 ACIAD0184 ACIAD0185 atpH atpA TRUE 0.998 31.000 0.953 0.004 Y NA
 587695 587696 ACIAD0185 ACIAD0186 atpA atpG TRUE 0.986 78.000 0.920 0.004 Y NA
 587696 587697 ACIAD0186 ACIAD0187 atpG atpD TRUE 0.995 31.000 0.385 0.004 Y NA
 587697 587698 ACIAD0187 ACIAD0188 atpD atpC TRUE 0.993 28.000 0.096 0.004 Y NA
 587698 587699 ACIAD0188 ACIAD0189 atpC   FALSE 0.104 144.000 0.023 NA   NA
 587699 587700 ACIAD0189 ACIAD0190     FALSE 0.064 121.000 0.000 NA   NA
 587700 587701 ACIAD0190 ACIAD0191     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 587702 587703 ACIAD0192 ACIAD0193     FALSE 0.055 192.000 0.020 NA   NA
 587703 587704 ACIAD0193 ACIAD0194     FALSE 0.105 136.000 0.020 1.000 N NA
 587704 587705 ACIAD0194 ACIAD0195     TRUE 0.973 19.000 0.500 NA N NA
 587706 587707 ACIAD0196 ACIAD0197     TRUE 0.691 78.000 0.500 NA N NA
 587707 587708 ACIAD0197 ACIAD0198     FALSE 0.008 418.000 0.000 NA   NA
 587708 587709 ACIAD0198 ACIAD0199     TRUE 0.513 34.000 0.000 1.000   NA
 587709 587710 ACIAD0199 ACIAD0200     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 587710 587711 ACIAD0200 ACIAD0201     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 587711 587712 ACIAD0201 ACIAD0202     FALSE 0.038 162.000 0.000 1.000   NA
 587712 587713 ACIAD0202 ACIAD0203     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 587713 587714 ACIAD0203 ACIAD0204     FALSE 0.166 76.000 0.000 NA   NA
 587714 587715 ACIAD0204 ACIAD0205     TRUE 0.403 42.000 0.000 1.000   NA
 587715 587716 ACIAD0205 ACIAD0206     TRUE 0.854 25.000 0.035 1.000   NA
 587716 587717 ACIAD0206 ACIAD0207     TRUE 0.994 13.000 0.788 0.053   NA
 587718 587719 ACIAD0208 ACIAD0209     TRUE 0.684 34.000 0.032 NA N NA
 587719 587720 ACIAD0209 ACIAD0210     TRUE 0.955 18.000 0.164 NA   NA
 587721 587722 ACIAD0211 ACIAD0212 def   TRUE 0.482 34.000 0.000 NA   NA
 587722 587723 ACIAD0212 ACIAD0214     FALSE 0.091 103.000 0.000 NA   NA
 587723 587724 ACIAD0214 ACIAD0215     TRUE 0.587 48.000 0.037 NA   NA
 587726 587727 ACIAD0217 ACIADrRNA16S_4     FALSE 0.007 480.000 0.000 NA   NA
 587727 587728 ACIADrRNA16S_4 ACIADtRNAIle_5     FALSE 0.238 62.000 0.000 NA   NA
 587728 587729 ACIADtRNAIle_5 ACIADtRNAAla_6     TRUE 0.439 37.000 0.000 NA   NA
 587729 587730 ACIADtRNAAla_6 ACIADrRNA23S_5     FALSE 0.009 344.000 0.000 NA   NA
 587730 587731 ACIADrRNA23S_5 ACIADrRNA5S_6     FALSE 0.024 186.000 0.000 NA   NA
 587731 587732 ACIADrRNA5S_6 ACIAD0219     FALSE 0.033 164.000 0.000 NA   NA
 587732 587733 ACIAD0219 ACIAD0220     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 587733 587734 ACIAD0220 ACIAD0221     FALSE 0.008 392.000 0.000 NA   NA
 587735 587736 ACIAD0222 ACIAD0223   shiA TRUE 0.889 1.000 0.000 NA N NA
 587736 587737 ACIAD0223 ACIAD0224 shiA   TRUE 0.918 1.000 0.000 NA   NA
 587737 587738 ACIAD0224 ACIAD0225   dinP FALSE 0.128 86.000 0.000 NA   NA
 587738 587739 ACIAD0225 ACIAD0226 dinP   TRUE 0.954 -3.000 0.009 1.000 N NA
 587739 587740 ACIAD0226 ACIAD0228     TRUE 0.835 42.000 0.250 1.000   NA
 587740 587741 ACIAD0228 ACIAD0229     FALSE 0.127 130.000 0.022 NA   NA
 587742 587743 ACIAD0230 ACIAD0231     TRUE 0.594 56.000 0.069 NA   NA
 587743 587744 ACIAD0231 ACIAD0232     TRUE 0.546 49.000 0.024 NA   NA
 587744 587745 ACIAD0232 ACIAD0233     FALSE 0.017 232.000 0.000 NA   NA
 587745 587746 ACIAD0233 ACIAD0234   parC FALSE 0.077 158.000 0.008 1.000   NA
 587746 587747 ACIAD0234 ACIAD0235 parC fadD FALSE 0.035 147.000 0.000 1.000 N NA
 587749 587750 ACIAD0237 ACIAD0239   ppa FALSE 0.105 127.000 0.005 NA   NA
 587753 587754 ACIAD0242 ACIAD0243     TRUE 0.548 70.000 0.104 NA   NA
 587755 587756 ACIAD0244 ACIAD0245 glnK amtB TRUE 0.832 62.000 0.667 1.000 N NA
 587756 587757 ACIAD0245 ACIAD0246 amtB   FALSE 0.087 123.000 0.004 NA N NA
 587757 587758 ACIAD0246 ACIAD0247   ribD TRUE 0.987 -7.000 0.314 NA N NA
 587758 587759 ACIAD0247 ACIAD0248 ribD   TRUE 0.942 -3.000 0.003 1.000 N NA
 587759 587760 ACIAD0248 ACIAD0249   ribC TRUE 0.467 45.000 0.004 1.000 N NA
 587761 587762 ACIAD0250 ACIAD0251     TRUE 0.629 123.000 1.000 NA   NA
 587762 587763 ACIAD0251 ACIAD0252   holC TRUE 0.639 36.000 0.008 NA   NA
 587763 587764 ACIAD0252 ACIAD0253 holC pepA TRUE 0.991 -7.000 0.459 1.000 N NA
 587765 587766 ACIAD0254 ACIAD0255     TRUE 0.996 0.000 0.929 0.070   NA
 587766 587767 ACIAD0255 ACIAD0256   gpmI FALSE 0.122 122.000 0.005 1.000   NA
 587767 587768 ACIAD0256 ACIAD0257 gpmI   TRUE 0.927 11.000 0.005 1.000 N NA
 587769 587770 ACIAD0258 ACIAD0259 pilR pilS TRUE 0.992 18.000 0.575 0.088 Y NA
 587770 587771 ACIAD0259 ACIAD0260 pilS gacA TRUE 0.975 19.000 0.036 1.000 Y NA
 587773 587774 ACIAD0263 ACIAD0264 thrC hom TRUE 0.849 61.000 0.090 1.000 Y NA
 587774 587775 ACIAD0264 ACIAD0265 hom dsbC FALSE 0.028 164.000 0.000 1.000 N NA
 587775 587776 ACIAD0265 ACIAD0266 dsbC xerD FALSE 0.087 130.000 0.005 1.000 N NA
 587777 587778 ACIAD0267 ACIAD0268     TRUE 0.997 -3.000 0.421 1.000 Y NA
 587778 587779 ACIAD0268 ACIAD0269     TRUE 0.901 17.000 0.016 NA   NA
 587779 587780 ACIAD0269 ACIAD0270   murD FALSE 0.080 138.000 0.003 NA   NA
 587780 587781 ACIAD0270 ACIAD0271 murD ftsW TRUE 0.994 22.000 0.386 0.003 N NA
 587782 587783 ACIAD0272 ACIAD0273   dksA TRUE 0.954 5.000 0.004 1.000   NA
 587783 587784 ACIAD0273 ACIAD0274 dksA icc FALSE 0.054 203.000 0.018 1.000   NA
 587784 587785 ACIAD0274 ACIAD0275 icc aspP TRUE 0.975 3.000 0.050 1.000   NA
 587785 587786 ACIAD0275 ACIAD0276 aspP thiC FALSE 0.297 82.000 0.016 1.000   NA
 587787 587788 ACIAD0278 ACIAD0279 tolC phoU FALSE 0.193 91.000 0.012 NA N NA
 587789 587790 ACIAD0282 ACIAD0283   argH TRUE 0.927 10.000 0.005 NA N NA
 587791 587792 ACIAD0284 ACIAD0285 algZ algR TRUE 0.962 58.000 0.709 0.011   NA
 587792 587793 ACIAD0285 ACIAD0286 algR hemC FALSE 0.245 94.000 0.038 1.000 N NA
 587793 587794 ACIAD0286 ACIAD0287 hemC hemD TRUE 0.999 7.000 0.171 0.002 Y NA
 587794 587795 ACIAD0287 ACIAD0288 hemD   TRUE 0.955 9.000 0.017 NA   NA
 587795 587796 ACIAD0288 ACIAD0289     TRUE 0.991 16.000 1.000 NA   NA
 587796 587797 ACIAD0289 ACIAD0290     TRUE 0.959 9.000 0.028 NA   NA
 587797 587798 ACIAD0290 ACIAD0291     FALSE 0.021 207.000 0.000 NA   NA
 587798 587799 ACIAD0291 ACIAD0292     FALSE 0.033 163.000 0.000 NA   NA
 587799 587800 ACIAD0292 ACIAD0293     TRUE 0.978 0.000 0.072 NA   NA
 587800 587801 ACIAD0293 ACIAD0294     TRUE 0.916 41.000 0.093 1.000 Y NA
 587801 587802 ACIAD0294 ACIAD0295     TRUE 0.637 67.000 0.182 NA   NA
 587802 587803 ACIAD0295 ACIAD0296   gph TRUE 0.706 34.000 0.024 NA   NA
 587803 587804 ACIAD0296 ACIAD0297 gph trpE FALSE 0.237 104.000 0.038 1.000   NA
 587804 587805 ACIAD0297 ACIADtRNAThr_7 trpE   FALSE 0.097 99.000 0.000 NA   NA
 587805 587806 ACIADtRNAThr_7 ACIADtRNATyr_8     FALSE 0.255 59.000 0.000 NA   NA
 587806 587807 ACIADtRNATyr_8 ACIADtRNAGly_9     TRUE 0.420 38.000 0.000 NA   NA
 587807 587808 ACIADtRNAGly_9 ACIADtRNAThr_10     TRUE 0.844 14.000 0.000 NA   NA
 587808 587809 ACIADtRNAThr_10 ACIAD0299   tufB FALSE 0.030 171.000 0.000 NA   NA
 587809 587810 ACIAD0299 ACIADtRNATrp_11 tufB   FALSE 0.268 57.000 0.000 NA   NA
 587810 587811 ACIADtRNATrp_11 ACIAD0300   secE FALSE 0.166 76.000 0.000 NA   NA
 587811 587812 ACIAD0300 ACIAD0301 secE nusG TRUE 0.940 8.000 0.005 1.000 N NA
 587812 587813 ACIAD0301 ACIAD0302 nusG rplK TRUE 0.587 114.000 0.762 1.000 N NA
 587813 587814 ACIAD0302 ACIAD0304 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.831 0.024 Y NA
 587814 587815 ACIAD0304 ACIAD0305 rplA rplJ TRUE 0.582 240.000 0.377 0.024 Y NA
 587815 587816 ACIAD0305 ACIAD0306 rplJ rplL TRUE 0.990 43.000 0.888 0.018 Y NA
 587816 587817 ACIAD0306 ACIAD0307 rplL rpoB FALSE 0.079 309.000 0.219 1.000   NA
 587817 587818 ACIAD0307 ACIAD0308 rpoB rpoC TRUE 0.993 41.000 0.875 0.001   NA
 587818 587819 ACIAD0308 ACIAD0310 rpoC   FALSE 0.015 247.000 0.000 NA   NA
 587821 587822 ACIAD0312 ACIAD0313     FALSE 0.153 120.000 0.026 NA   NA
 587822 587823 ACIAD0313 ACIAD0314     FALSE 0.012 279.000 0.000 NA   NA
 587823 587824 ACIAD0314 ACIAD0315     FALSE 0.017 233.000 0.000 NA   NA
 587824 587825 ACIAD0315 ACIAD0316   htpG FALSE 0.162 105.000 0.007 NA   NA
 587827 587828 ACIAD0318 ACIAD0319     FALSE 0.057 118.000 0.000 1.000 N NA
 587828 587829 ACIAD0319 ACIAD0320     FALSE 0.051 124.000 0.000 1.000 N NA
 587829 587830 ACIAD0320 ACIAD0321     TRUE 0.993 9.000 0.000 0.039 Y NA
 587831 587832 ACIAD0323 ACIAD0324     FALSE 0.008 423.000 0.000 NA   NA
 587832 587833 ACIAD0324 ACIAD0328     FALSE 0.016 241.000 0.000 NA   NA
 587836 587837 ACIAD0332 ACIAD0333     FALSE 0.015 250.000 0.000 NA   NA
 587838 587839 ACIAD0334 ACIAD0335 fadA fadB TRUE 0.997 14.000 0.928 1.000 Y NA
 587840 587841 ACIAD0336 ACIAD0337   lpxO FALSE 0.133 166.000 0.095 NA   NA
 587841 587842 ACIAD0337 ACIAD0339 lpxO   FALSE 0.119 176.000 0.095 NA   NA
 587842 587843 ACIAD0339 ACIAD0340   uvrC FALSE 0.176 91.000 0.003 NA   NA
 587843 587844 ACIAD0340 ACIAD0341 uvrC   FALSE 0.156 88.000 0.003 NA N NA
 587844 587845 ACIAD0341 ACIAD0342   pgsA TRUE 0.414 102.000 0.000 NA Y NA
 587845 587846 ACIAD0342 ACIAD0344 pgsA ada FALSE 0.060 115.000 0.000 1.000 N NA
 587846 587847 ACIAD0344 ACIAD0345 ada alkB TRUE 0.991 -3.000 0.013 NA Y NA
 587849 587850 ACIAD0349 ACIAD0350     TRUE 0.974 -16.000 0.097 NA   NA
 587850 587851 ACIAD0350 ACIAD0351     TRUE 0.795 35.000 0.087 NA   NA
 587852 587853 ACIAD0352 ACIAD0353     TRUE 0.985 -7.000 0.248 NA N NA
 587853 587854 ACIAD0353 ACIAD0354   recN FALSE 0.106 116.000 0.005 NA N NA
 587855 587856 ACIAD0355 ACIAD0356     FALSE 0.301 79.000 0.017 NA   NA
 587856 587857 ACIAD0356 ACIAD0357     FALSE 0.153 100.000 0.003 NA   NA
 587857 587858 ACIAD0357 ACIAD0358     FALSE 0.311 41.000 0.000 NA N NA
 587859 587860 ACIAD0359 ACIAD0360 coaE pilD TRUE 0.992 6.000 0.513 1.000 N NA
 587860 587861 ACIAD0360 ACIAD0361 pilD pilC TRUE 0.997 0.000 0.354 1.000 Y NA
 587861 587862 ACIAD0361 ACIAD0362 pilC pilB TRUE 0.992 29.000 0.394 0.016 Y NA
 587863 587864 ACIAD0363 ACIAD0364 tpiA secG TRUE 0.936 10.000 0.006 1.000 N NA
 587864 587865 ACIAD0364 ACIADtRNALeu_12 secG   FALSE 0.268 57.000 0.000 NA   NA
 587865 587866 ACIADtRNALeu_12 ACIADtRNAMet_13     FALSE 0.007 496.000 0.000 NA   NA
 587866 587867 ACIADtRNAMet_13 ACIADtRNAMet_14     FALSE 0.123 88.000 0.000 NA   NA
 587867 587868 ACIADtRNAMet_14 ACIAD0367     FALSE 0.021 203.000 0.000 NA   NA
 587868 587869 ACIAD0367 ACIAD0368   nusA TRUE 0.942 36.000 0.760 NA   NA
 587869 587870 ACIAD0368 ACIAD0369 nusA infB TRUE 0.985 11.000 0.332 1.000 N NA
 587870 587871 ACIAD0369 ACIAD0370 infB rbfA TRUE 0.998 0.000 0.609 1.000 Y NA
 587872 587873 ACIAD0371 ACIAD0372 phaG phaF TRUE 0.998 10.000 0.971 1.000 Y NA
 587873 587874 ACIAD0372 ACIAD0373 phaF phaE TRUE 0.998 -3.000 0.756 0.069 Y NA
 587874 587875 ACIAD0373 ACIAD0374 phaE phaD TRUE 0.998 3.000 0.756 1.000 Y NA
 587875 587876 ACIAD0374 ACIAD0375 phaD phaC TRUE 1.000 0.000 0.990 0.007 Y NA
 587876 587877 ACIAD0375 ACIAD0376 phaC phaAB TRUE 1.000 -3.000 0.881 0.007 Y NA
 587877 587878 ACIAD0376 ACIAD0378 phaAB   FALSE 0.010 328.000 0.000 NA   NA
 587878 587879 ACIAD0378 ACIAD0379     TRUE 0.961 13.000 0.071 NA   NA
 587879 587880 ACIAD0379 ACIAD0380   hisIE TRUE 0.940 10.000 0.003 1.000   NA
 587880 587881 ACIAD0380 ACIAD0381 hisIE   FALSE 0.047 169.000 0.003 1.000 N NA
 587881 587882 ACIAD0381 ACIAD0382   ubiB TRUE 0.852 20.000 0.008 NA   NA
 587882 587883 ACIAD0382 ACIAD0383 ubiB   TRUE 0.986 14.000 0.494 NA   NA
 587883 587884 ACIAD0383 ACIAD0384   ubiE TRUE 0.974 13.000 0.160 NA   NA
 587884 587885 ACIAD0384 ACIAD0385 ubiE   FALSE 0.101 134.000 0.007 NA   NA
 587885 587886 ACIAD0385 ACIAD0386     FALSE 0.007 491.000 0.000 NA   NA
 587887 587888 ACIAD0387 ACIAD0388     TRUE 0.705 24.000 0.000 1.000   NA
 587888 587889 ACIAD0388 ACIAD0389     TRUE 0.981 28.000 0.400 1.000 Y NA
 587889 587890 ACIAD0389 ACIAD0390     TRUE 0.927 1.000 0.000 1.000   NA
 587890 587891 ACIAD0390 ACIAD0394   pap FALSE 0.006 944.000 0.000 NA   NA
 587892 587893 ACIAD0395 ACIAD0396 citA   FALSE 0.023 190.000 0.000 NA   NA
 587894 587895 ACIAD0397 ACIAD0398 recC recB TRUE 0.999 7.000 0.078 0.001 Y NA
 587895 587896 ACIAD0398 ACIAD0399 recB recD TRUE 0.845 96.000 0.034 0.001   NA
 587898 587899 ACIAD0401 ACIAD0402 rpsO pnp FALSE 0.312 253.000 0.306 1.000 Y NA
 587899 587900 ACIAD0402 ACIAD0403 pnp   FALSE 0.010 278.000 0.000 1.000 N NA
 587900 587901 ACIAD0403 ACIAD0404   crcB FALSE 0.017 188.000 0.000 NA N NA
 587902 587903 ACIAD0405 ACIAD0406   cbpA TRUE 0.972 12.000 0.111 NA   NA
 587903 587904 ACIAD0406 ACIAD0407 cbpA hslO TRUE 0.508 203.000 0.000 0.004 Y NA
 587904 587905 ACIAD0407 ACIAD0408 hslO kef TRUE 0.548 39.000 0.005 0.068 N NA
 587905 587906 ACIAD0408 ACIAD0409 kef priA FALSE 0.279 74.000 0.006 1.000 N NA
 587907 587908 ACIAD0411 ACIAD0412 xcpS xcpT TRUE 0.999 6.000 0.209 0.005 Y NA
 587908 587909 ACIAD0412 ACIAD0413 xcpT   FALSE 0.013 264.000 0.000 NA   NA
 587909 587910 ACIAD0413 ACIAD0414     FALSE 0.050 136.000 0.000 NA   NA
 587911 587912 ACIAD0415 ACIAD0416 lnt corC TRUE 0.971 -3.000 0.064 NA N NA
 587914 587915 ACIAD0418 ACIAD0419 aroE   FALSE 0.180 77.000 0.000 1.000   NA
 587916 587917 ACIAD0420 ACIAD0421     TRUE 0.894 -10.000 0.000 NA   NA
 587917 587918 ACIAD0421 ACIAD0422     FALSE 0.221 98.000 0.018 1.000   NA
 587919 587920 ACIAD0424 ACIAD0425   rpmE2 FALSE 0.013 267.000 0.000 NA   NA
 587920 587921 ACIAD0425 ACIAD0426 rpmE2   FALSE 0.213 92.000 0.009 NA   NA
 587922 587923 ACIAD0427 ACIAD0428     TRUE 0.985 40.000 0.235 0.011 Y NA
 587924 587925 ACIAD0429 ACIAD0431 norM   TRUE 0.788 29.000 0.033 NA   NA
 587929 587930 ACIAD0436 ACIADtRNALys_15 ahpC   FALSE 0.020 211.000 0.000 NA   NA
 587930 587931 ACIADtRNALys_15 ACIADtRNALys_16     FALSE 0.082 109.000 0.000 NA   NA
 587931 587932 ACIADtRNALys_16 ACIAD0437     FALSE 0.064 121.000 0.000 NA   NA
 587932 587933 ACIAD0437 ACIAD0438   rne FALSE 0.070 184.000 0.045 1.000 N NA
 587934 587935 ACIAD0441 ACIAD0442   rluC FALSE 0.056 178.000 0.007 NA   NA
 587935 587936 ACIAD0442 ACIAD0443 rluC   TRUE 0.993 -3.000 0.459 1.000   NA
 587936 587937 ACIAD0443 ACIAD0444     TRUE 0.549 47.000 0.011 1.000   NA
 587937 587938 ACIAD0444 ACIAD0445     TRUE 0.619 52.000 0.075 1.000 N NA
 587939 587940 ACIAD0446 ACIAD0448   hcaR FALSE 0.064 121.000 0.000 NA   NA
 587941 587942 ACIAD0449 ACIAD0450     FALSE 0.274 56.000 0.000 NA   NA
 587945 587946 ACIAD0454 ACIAD0455 ptsP nudH TRUE 0.513 71.000 0.100 1.000 N NA
 587950 587951 ACIAD0460 ACIAD0461     FALSE 0.016 238.000 0.000 NA   NA
 587951 587952 ACIAD0461 ACIAD0462     FALSE 0.234 95.000 0.026 NA   NA
 587953 587954 ACIAD0463 ACIAD0465 leuC   TRUE 0.904 0.000 0.000 1.000 N NA
 587954 587955 ACIAD0465 ACIAD0466   leuD TRUE 0.721 19.000 0.000 1.000 N NA
 587955 587956 ACIAD0466 ACIAD0468 leuD   FALSE 0.158 111.000 0.011 NA   NA
 587956 587957 ACIAD0468 ACIAD0469   leuB TRUE 0.664 49.000 0.079 NA   NA
 587957 587958 ACIAD0469 ACIAD0471 leuB   FALSE 0.021 203.000 0.000 NA   NA
 587961 587962 ACIAD0474 ACIAD0476 truA   TRUE 0.971 19.000 0.011 1.000 Y NA
 587962 587963 ACIAD0476 ACIAD0477     TRUE 0.891 48.000 0.667 NA   NA
 587963 587964 ACIAD0477 ACIAD0479   asd FALSE 0.018 226.000 0.000 NA   NA
 587965 587966 ACIAD0480 ACIAD0481   gltP FALSE 0.006 836.000 0.000 NA   NA
 587967 587968 ACIAD0482 ACIAD0484   htrB FALSE 0.088 267.000 0.000 1.000 Y NA
 587968 587969 ACIAD0484 ACIAD0485 htrB   FALSE 0.015 223.000 0.000 1.000 N NA
 587969 587970 ACIAD0485 ACIAD0486     FALSE 0.080 286.000 0.000 1.000 Y NA
 587970 587971 ACIAD0486 ACIAD0487   uup FALSE 0.020 224.000 0.000 1.000   NA
 587972 587973 ACIAD0488 ACIAD0489     FALSE 0.284 54.000 0.000 NA   NA
 587973 587974 ACIAD0489 ACIAD0492     FALSE 0.030 171.000 0.000 NA   NA
 587974 587975 ACIAD0492 ACIAD0493   topA TRUE 0.579 37.000 0.003 NA   NA
 587975 587976 ACIAD0493 ACIAD0494 topA   FALSE 0.018 221.000 0.000 NA   NA
 587976 587977 ACIAD0494 ACIAD0495     TRUE 0.508 52.000 0.018 NA   NA
 587977 587978 ACIAD0495 ACIAD0496     TRUE 0.470 59.000 0.018 1.000   NA
 587978 587979 ACIAD0496 ACIAD0497     TRUE 0.961 -7.000 0.031 NA   NA
 587979 587980 ACIAD0497 ACIAD0498     FALSE 0.294 119.000 0.154 NA   NA
 587980 587981 ACIAD0498 ACIAD0499     FALSE 0.378 113.000 0.231 NA   NA
 587982 587983 ACIAD0500 ACIAD0501   rpmG FALSE 0.079 141.000 0.006 1.000 N NA
 587983 587984 ACIAD0501 ACIAD0502 rpmG rpmB TRUE 0.998 13.000 0.279 0.018 Y NA
 587984 587985 ACIAD0502 ACIAD0503 rpmB calB FALSE 0.046 167.000 0.003 1.000 N NA
 587986 587987 ACIAD0504 ACIAD0505   purU1 TRUE 0.415 61.000 0.018 1.000 N NA
 587987 587988 ACIAD0505 ACIAD0507 purU1   FALSE 0.009 310.000 0.000 1.000 N NA
 587988 587989 ACIAD0507 ACIAD0508     TRUE 0.990 20.000 0.500 0.015 N NA
 587989 587990 ACIAD0508 ACIAD0509     TRUE 0.999 0.000 0.750 0.065 Y NA
 587991 587992 ACIAD0510 ACIAD0511 msrA   TRUE 0.496 87.000 0.000 NA Y NA
 587994 587995 ACIAD0513 ACIAD0514   folA TRUE 0.770 27.000 0.009 NA   NA
 587995 587996 ACIAD0514 ACIAD0515 folA thyA TRUE 0.926 13.000 0.013 1.000 N NA
 587996 587997 ACIAD0515 ACIAD0516 thyA   TRUE 0.585 111.000 0.667 NA   NA
 587997 587998 ACIAD0516 ACIAD0517     TRUE 0.882 65.000 1.000 NA   NA
 587998 587999 ACIAD0517 ACIAD0518   lgt FALSE 0.123 116.000 0.005 NA   NA
 588001 588002 ACIAD0520 ACIAD0521   tatC FALSE 0.049 178.000 0.004 NA   NA
 588002 588003 ACIAD0521 ACIAD0522 tatC tatB TRUE 0.997 -3.000 0.272 NA Y NA
 588003 588004 ACIAD0522 ACIAD0523 tatB tatA TRUE 0.985 13.000 0.013 1.000 Y NA
 588005 588006 ACIAD0524 ACIAD0525     FALSE 0.082 109.000 0.000 NA   NA
 588007 588008 ACIAD0526 ACIAD0527     TRUE 0.688 35.000 0.015 1.000   NA
 588008 588009 ACIAD0527 ACIAD0528   metW TRUE 0.960 -3.000 0.013 NA   NA
 588009 588010 ACIAD0528 ACIAD0529 metW metX TRUE 0.992 -3.000 0.455 NA   NA
 588010 588011 ACIAD0529 ACIAD0530 metX leuA TRUE 0.603 86.000 0.007 1.000 Y NA
 588011 588012 ACIAD0530 ACIAD0531 leuA piuC FALSE 0.008 451.000 0.000 1.000   NA
 588012 588013 ACIAD0531 ACIAD0532 piuC   FALSE 0.234 112.000 0.056 1.000   NA
 588014 588015 ACIAD0533 ACIAD0534 tig clpP FALSE 0.359 193.000 0.196 1.000 Y NA
 588015 588016 ACIAD0534 ACIAD0535 clpP clpX TRUE 0.970 29.000 0.201 1.000 Y NA
 588016 588017 ACIAD0535 ACIAD0536 clpX   FALSE 0.070 147.000 0.003 NA   NA
 588018 588019 ACIAD0537 ACIAD0538   fumA FALSE 0.085 148.000 0.009 NA   NA
 588021 588022 ACIAD0540 ACIAD0541 pta ack TRUE 0.849 44.000 0.007 1.000 Y NA
 588023 588024 ACIAD0542 ACIAD0543 edd eda TRUE 0.976 34.000 0.520 1.000 Y NA
 588024 588025 ACIAD0543 ACIAD0544 eda gntT FALSE 0.225 185.000 0.018 1.000 Y NA
 588025 588026 ACIAD0544 ACIAD0545 gntT gntK TRUE 0.991 17.000 0.250 1.000 Y NA
 588026 588027 ACIAD0545 ACIAD0546 gntK   FALSE 0.105 138.000 0.023 1.000 N NA
 588030 588031 ACIAD0550 ACIAD0551   nagZ FALSE 0.047 120.000 0.000 NA N NA
 588032 588033 ACIAD0552 ACIAD0553 prc   FALSE 0.223 183.000 0.014 1.000 Y NA
 588033 588034 ACIAD0553 ACIAD0554     TRUE 0.733 32.000 0.018 1.000   NA
 588034 588035 ACIAD0554 ACIAD0555     TRUE 0.507 54.000 0.018 1.000   NA
 588035 588036 ACIAD0555 ACIAD0556   ndk FALSE 0.178 111.000 0.017 1.000   NA
 588036 588037 ACIAD0556 ACIAD0557 ndk   FALSE 0.306 123.000 0.178 1.000   NA
 588037 588038 ACIAD0557 ACIAD0558   pilF TRUE 0.970 19.000 0.339 1.000   NA
 588038 588039 ACIAD0558 ACIAD0560 pilF   TRUE 0.992 -9.000 0.526 1.000   NA
 588039 588040 ACIAD0560 ACIAD0561   ispG TRUE 0.940 24.000 0.204 1.000   NA
 588040 588041 ACIAD0561 ACIAD0562 ispG hisS TRUE 0.987 -3.000 0.223 1.000 N NA
 588041 588042 ACIAD0562 ACIAD0563 hisS   TRUE 0.905 32.000 0.274 1.000   NA
 588042 588043 ACIAD0563 ACIAD0564     TRUE 0.993 0.000 0.443 1.000   NA
 588043 588044 ACIAD0564 ACIAD0565     FALSE 0.222 189.000 0.403 1.000   NA
 588044 588045 ACIAD0565 ACIAD0566     FALSE 0.054 180.000 0.008 NA   NA
 588045 588046 ACIAD0566 ACIAD0567     TRUE 0.992 -12.000 0.632 NA   NA
 588046 588047 ACIAD0567 ACIAD0568     TRUE 0.994 -3.000 0.647 NA   NA
 588047 588048 ACIAD0568 ACIAD0569     TRUE 0.991 10.000 0.516 NA   NA
 588048 588049 ACIAD0569 ACIAD0570     TRUE 0.993 0.000 0.495 NA   NA
 588049 588050 ACIAD0570 ACIAD0571     TRUE 0.995 -7.000 0.842 NA   NA
 588050 588051 ACIAD0571 ACIAD0572     TRUE 0.987 -3.000 0.211 NA   NA
 588051 588052 ACIAD0572 ACIAD0573     TRUE 0.982 3.000 0.116 NA   NA
 588052 588053 ACIAD0573 ACIAD0574   hutH TRUE 0.991 2.000 0.287 1.000   NA
 588053 588054 ACIAD0574 ACIAD0575 hutH   TRUE 0.989 -10.000 0.356 NA   NA
 588054 588055 ACIAD0575 ACIAD0576     TRUE 0.666 66.000 0.208 NA   NA
 588055 588056 ACIAD0576 ACIAD0577     TRUE 0.992 2.000 0.396 NA   NA
 588056 588057 ACIAD0577 ACIAD0578     TRUE 0.974 16.000 0.283 NA   NA
 588057 588058 ACIAD0578 ACIAD0579     TRUE 0.969 2.000 0.033 NA   NA
 588058 588059 ACIAD0579 ACIAD0580     TRUE 0.967 7.000 0.040 NA   NA
 588059 588060 ACIAD0580 ACIAD0581     TRUE 0.998 -3.000 0.608 NA Y NA
 588060 588061 ACIAD0581 ACIAD0582   fabG TRUE 0.998 -3.000 0.646 NA Y NA
 588061 588062 ACIAD0582 ACIAD0583 fabG fabF TRUE 0.998 0.000 0.649 1.000 Y NA
 588062 588063 ACIAD0583 ACIAD0584 fabF   TRUE 0.939 14.000 0.035 NA   NA
 588063 588064 ACIAD0584 ACIAD0585     TRUE 0.886 22.000 0.047 NA   NA
 588064 588065 ACIAD0585 ACIAD0586     TRUE 0.455 36.000 0.000 NA   NA
 588066 588067 ACIAD0587 ACIAD0588 secF secD TRUE 1.000 9.000 0.235 0.001 Y NA
 588067 588068 ACIAD0588 ACIAD0589 secD   TRUE 0.880 55.000 0.125 NA Y NA
 588068 588069 ACIAD0589 ACIAD0590   tgt TRUE 0.475 103.000 0.348 NA N NA
 588069 588070 ACIAD0590 ACIAD0591 tgt queA TRUE 0.782 319.000 0.371 0.001 Y NA
 588072 588073 ACIADtRNALeu_17 ACIAD0593     FALSE 0.006 593.000 0.000 NA   NA
 588073 588074 ACIAD0593 ACIAD0595     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 588074 588075 ACIAD0595 ACIAD0596   glnE TRUE 0.881 38.000 0.007 1.000 Y NA
 588075 588076 ACIAD0596 ACIAD0597 glnE ilvE TRUE 0.931 18.000 0.077 1.000 N NA
 588076 588077 ACIAD0597 ACIAD0598 ilvE   TRUE 0.455 47.000 0.006 NA N NA
 588077 588078 ACIAD0598 ACIAD0599     TRUE 0.982 5.000 0.118 NA   NA
 588078 588079 ACIAD0599 ACIAD0600     TRUE 0.975 -3.000 0.064 NA   NA
 588079 588080 ACIAD0600 ACIAD0601     TRUE 0.957 -3.000 0.022 NA N NA
 588080 588081 ACIAD0601 ACIAD0602     TRUE 0.992 6.000 0.032 NA Y NA
 588083 588084 ACIAD0604 ACIAD0605     FALSE 0.117 90.000 0.000 NA   NA
 588084 588085 ACIAD0605 ACIAD0606     TRUE 0.904 -6.000 0.000 NA   NA
 588086 588087 ACIAD0607 ACIAD0608     TRUE 0.420 38.000 0.000 NA   NA
 588087 588088 ACIAD0608 ACIAD0609   aspS FALSE 0.067 149.000 0.003 NA   NA
 588088 588089 ACIAD0609 ACIAD0610 aspS   FALSE 0.184 90.000 0.003 NA   NA
 588090 588091 ACIAD0611 ACIAD0612     FALSE 0.358 210.000 0.000 0.012 Y NA
 588091 588092 ACIAD0612 ACIAD0613     FALSE 0.041 128.000 0.000 NA N NA
 588093 588094 ACIAD0614 ACIAD0615     TRUE 0.902 8.000 0.000 NA   NA
 588095 588096 ACIAD0616 ACIAD0618     FALSE 0.059 125.000 0.000 NA   NA
 588096 588097 ACIAD0618 ACIAD0620     FALSE 0.017 232.000 0.000 NA   NA
 588100 588101 ACIAD0623 ACIAD0624 acdA acdB TRUE 0.741 163.000 0.167 0.011 Y NA
 588101 588102 ACIAD0624 ACIAD0625 acdB   FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 588103 588104 ACIAD0626 ACIAD0627 baeS baeR TRUE 0.998 4.000 0.764 1.000 Y NA
 588105 588106 ACIAD0628 ACIAD0629     FALSE 0.079 110.000 0.000 NA   NA
 588106 588107 ACIAD0629 ACIAD0630     TRUE 0.522 57.000 0.038 NA   NA
 588109 588110 ACIAD0632 ACIAD0633     TRUE 0.627 40.000 0.016 1.000   NA
 588110 588111 ACIAD0633 ACIAD0634   btuB FALSE 0.180 110.000 0.016 1.000   NA
 588112 588113 ACIAD0635 ACIAD0636 trpF trpB TRUE 1.000 2.000 0.415 0.002 Y NA
 588113 588114 ACIAD0636 ACIAD0638 trpB   FALSE 0.312 70.000 0.004 NA   NA
 588114 588115 ACIAD0638 ACIAD0639     TRUE 0.673 44.000 0.065 NA   NA
 588117 588118 ACIAD0641 ACIAD0642   trpA FALSE 0.006 427.000 0.000 1.000 N NA
 588118 588119 ACIAD0642 ACIAD0643 trpA accD TRUE 0.986 -3.000 0.204 1.000 N NA
 588119 588120 ACIAD0643 ACIAD0644 accD folC TRUE 0.984 -3.000 0.167 1.000 N NA
 588120 588121 ACIAD0644 ACIAD0645 folC   TRUE 0.959 -3.000 0.010 NA   NA
 588122 588123 ACIAD0646 ACIAD0647     FALSE 0.057 135.000 0.000 1.000   NA
 588124 588125 ACIAD0648 ACIAD0649 secA   FALSE 0.065 155.000 0.004 NA   NA
 588125 588126 ACIAD0649 ACIAD0650   argJ FALSE 0.043 146.000 0.000 NA   NA
 588126 588127 ACIAD0650 ACIAD0651 argJ nadA FALSE 0.075 138.000 0.004 1.000 N NA
 588127 588128 ACIAD0651 ACIADtRNAPro_18 nadA   FALSE 0.054 131.000 0.000 NA   NA
 588128 588129 ACIADtRNAPro_18 ACIADtRNAArg_19     FALSE 0.246 61.000 0.000 NA   NA
 588129 588130 ACIADtRNAArg_19 ACIADtRNAHis_20     TRUE 0.406 39.000 0.000 NA   NA
 588130 588131 ACIADtRNAHis_20 ACIADtRNAPro_21     TRUE 0.911 5.000 0.000 NA   NA
 588132 588133 ACIAD0653 ACIAD0654     TRUE 0.747 18.000 0.000 1.000 N NA
 588133 588134 ACIAD0654 ACIAD0655     TRUE 0.906 7.000 0.000 NA   NA
 588135 588136 ACIADrRNA16S_7 ACIADtRNAIle_22     FALSE 0.238 62.000 0.000 NA   NA
 588136 588137 ACIADtRNAIle_22 ACIADtRNAAla_23     TRUE 0.439 37.000 0.000 NA   NA
 588137 588138 ACIADtRNAAla_23 ACIADrRNA23S_8     FALSE 0.007 434.000 0.000 NA   NA
 588138 588139 ACIADrRNA23S_8 ACIADrRNA5S_9     FALSE 0.024 187.000 0.000 NA   NA
 588139 588140 ACIADrRNA5S_9 ACIAD0657   rpoN FALSE 0.016 241.000 0.000 NA   NA
 588140 588141 ACIAD0657 ACIAD0658 rpoN   FALSE 0.201 154.000 0.212 NA N NA
 588141 588142 ACIAD0658 ACIAD0659     FALSE 0.232 78.000 0.006 NA N NA
 588142 588143 ACIAD0659 ACIAD0660   murA TRUE 0.979 7.000 0.132 NA N NA
 588143 588144 ACIAD0660 ACIAD0661 murA hisG TRUE 0.981 -3.000 0.117 1.000 N NA
 588144 588145 ACIAD0661 ACIAD0663 hisG hisD TRUE 0.670 284.000 0.286 0.004 Y NA
 588145 588146 ACIAD0663 ACIAD0664 hisD hisC TRUE 0.946 80.000 0.087 0.004 Y NA
 588148 588149 ACIAD0666 ACIAD0667     FALSE 0.011 313.000 0.000 NA   NA
 588149 588150 ACIAD0667 ACIAD0668     TRUE 0.944 22.000 0.200 NA   NA
 588150 588151 ACIAD0668 ACIAD0669     TRUE 0.971 15.000 0.200 NA   NA
 588151 588153 ACIAD0669 ACIAD0671     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 588153 588154 ACIAD0671 ACIAD0672     TRUE 0.981 19.000 0.667 NA   NA
 588156 588157 ACIAD0674 ACIAD0675     TRUE 0.850 26.000 0.043 1.000   NA
 588157 588158 ACIAD0675 ACIAD0677     FALSE 0.146 107.000 0.003 1.000   NA
 588158 588159 ACIAD0677 ACIAD0678     TRUE 0.903 13.000 0.003 1.000 N NA
 588159 588160 ACIAD0678 ACIAD0679     TRUE 0.957 -6.000 0.015 NA   NA
 588160 588161 ACIAD0679 ACIAD0681     FALSE 0.120 129.000 0.015 NA   NA
 588161 588162 ACIAD0681 ACIAD0682     TRUE 0.971 -22.000 0.077 1.000   NA
 588164 588165 ACIAD0684 ACIAD0685   rpe TRUE 0.886 -18.000 0.000 NA   NA
 588165 588166 ACIAD0685 ACIAD0686 rpe   FALSE 0.008 374.000 0.000 NA   NA
 588166 588167 ACIAD0686 ACIAD0687   pcoA TRUE 0.640 59.000 0.118 NA   NA
 588167 588168 ACIAD0687 ACIAD0688 pcoA pcoB TRUE 0.997 -13.000 0.118 0.002 N NA
 588168 588169 ACIAD0688 ACIAD0689 pcoB   TRUE 0.929 25.000 0.000 NA Y NA
 588169 588170 ACIAD0689 ACIAD0691   sugE FALSE 0.263 137.000 0.000 NA Y NA
 588170 588171 ACIAD0691 ACIAD0692 sugE ogt TRUE 0.959 4.000 0.018 1.000 N NA
 588172 588173 ACIAD0693 ACIAD0694     TRUE 0.592 132.000 1.000 NA   NA
 588173 588174 ACIAD0694 ACIAD0695     TRUE 0.637 116.000 1.000 NA N NA
 588176 588177 ACIAD0700 ACIAD0701 lysP rsmC TRUE 0.957 19.000 0.231 1.000 N NA
 588177 588178 ACIAD0701 ACIAD0702 rsmC   TRUE 0.476 64.000 0.049 1.000 N NA
 588179 588180 ACIAD0703 ACIAD0704 typA mscL FALSE 0.010 277.000 0.000 1.000 N NA
 588180 588181 ACIAD0704 ACIAD0705 mscL   FALSE 0.067 156.000 0.005 NA   NA
 588182 588183 ACIAD0706 ACIAD0707 ppiC mutM TRUE 0.625 36.000 0.004 1.000   NA
 588184 588185 ACIAD0708 ACIAD0709     TRUE 0.874 20.000 0.033 1.000 N NA
 588185 588186 ACIAD0709 ACIAD0710     TRUE 0.465 66.000 0.037 1.000   NA
 588187 588188 ACIAD0711 ACIAD0713     FALSE 0.011 328.000 0.000 1.000   NA
 588188 588189 ACIAD0713 ACIAD0714     FALSE 0.019 236.000 0.000 1.000   NA
 588190 588191 ACIAD0715 ACIAD0716 rluA   FALSE 0.057 127.000 0.000 NA   NA
 588191 588192 ACIAD0716 ACIAD0717     FALSE 0.051 135.000 0.000 NA   NA
 588192 588193 ACIAD0717 ACIAD0718     FALSE 0.162 77.000 0.000 NA   NA
 588193 588194 ACIAD0718 ACIAD0719     FALSE 0.218 66.000 0.000 NA   NA
 588194 588195 ACIAD0719 ACIAD0720     FALSE 0.258 48.000 0.000 NA N NA
 588195 588196 ACIAD0720 ACIAD0721     FALSE 0.050 136.000 0.000 NA   NA
 588197 588198 ACIAD0722 ACIAD0724 nrdB nrdA TRUE 0.811 329.000 0.512 0.001 Y NA
 588199 588200 ACIAD0726 ACIAD0727 rstA rstB TRUE 0.972 47.000 0.895 1.000 Y NA
 588202 588203 ACIAD0730 ACIAD0731 nuoA nuoB TRUE 1.000 7.000 0.717 0.003 Y NA
 588203 588204 ACIAD0731 ACIAD0733 nuoB nuoCD TRUE 0.971 82.000 0.321 0.003 Y NA
 588204 588205 ACIAD0733 ACIAD0734 nuoCD nuoE TRUE 0.999 10.000 0.358 0.007 Y NA
 588205 588206 ACIAD0734 ACIAD0735 nuoE nuoF TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.007 Y NA
 588206 588207 ACIAD0735 ACIAD0736 nuoF nuoG TRUE 0.999 12.000 0.198 0.007 Y NA
 588207 588208 ACIAD0736 ACIAD0737 nuoG nuoH TRUE 0.997 19.000 0.198 0.007 Y NA
 588208 588209 ACIAD0737 ACIAD0738 nuoH nuoI TRUE 0.998 19.000 0.442 0.007 Y NA
 588209 588210 ACIAD0738 ACIAD0739 nuoI nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.492 0.007 Y NA
 588210 588211 ACIAD0739 ACIAD0740 nuoJ nuoK TRUE 1.000 0.000 0.808 0.003 Y NA
 588211 588212 ACIAD0740 ACIAD0741 nuoK nuoL TRUE 1.000 -3.000 0.641 0.007 Y NA
 588212 588213 ACIAD0741 ACIAD0742 nuoL nuoM TRUE 1.000 2.000 0.629 0.003 Y NA
 588213 588214 ACIAD0742 ACIAD0743 nuoM nuoN TRUE 0.999 16.000 0.778 0.003 Y NA
 588214 588215 ACIAD0743 ACIAD0744 nuoN upp FALSE 0.150 98.000 0.004 1.000 N NA
 588215 588216 ACIAD0744 ACIAD0745 upp   FALSE 0.021 185.000 0.000 1.000 N NA
 588220 588221 ACIAD0749 ACIAD0750     FALSE 0.017 229.000 0.000 NA   NA
 588222 588223 ACIAD0752 ACIAD0753     FALSE 0.375 71.000 0.021 NA   NA
 588223 588224 ACIAD0753 ACIAD0754     TRUE 0.978 10.000 0.000 0.079 Y NA
 588224 588225 ACIAD0754 ACIAD0755     FALSE 0.122 82.000 0.000 1.000 N NA
 588225 588226 ACIAD0755 ACIAD0756     TRUE 0.975 16.000 0.286 NA   NA
 588226 588227 ACIAD0756 ACIAD0757     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 588228 588229 ACIAD0758 ACIAD0759     FALSE 0.315 44.000 0.000 1.000 N NA
 588229 588230 ACIAD0759 ACIAD0760     FALSE 0.073 113.000 0.000 NA   NA
 588231 588232 ACIAD0761 ACIAD0762     FALSE 0.161 182.000 0.000 1.000 Y NA
 588233 588234 ACIAD0764 ACIAD0765     TRUE 0.973 -7.000 0.073 NA   NA
 588235 588236 ACIAD0766 ACIAD0767     FALSE 0.057 127.000 0.000 NA   NA
 588236 588237 ACIAD0767 ACIAD0768   metG FALSE 0.205 69.000 0.000 NA   NA
 588237 588238 ACIAD0768 ACIAD0769 metG tsx FALSE 0.022 182.000 0.000 1.000 N NA
 588239 588240 ACIAD0770 ACIAD0772     FALSE 0.124 121.000 0.007 NA   NA
 588240 588241 ACIAD0772 ACIAD0773     FALSE 0.052 175.000 0.007 1.000 N NA
 588243 588244 ACIAD0775 ACIAD0776   dcd FALSE 0.172 98.000 0.008 1.000 N NA
 588244 588245 ACIAD0776 ACIAD0777 dcd   FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 588245 588246 ACIAD0777 ACIAD0778     TRUE 0.994 12.000 1.000 NA   NA
 588246 588247 ACIAD0778 ACIAD0779     TRUE 0.989 14.000 0.667 NA   NA
 588247 588248 ACIAD0779 ACIAD0780     TRUE 0.813 16.000 0.000 NA   NA
 588248 588249 ACIAD0780 ACIAD0781     FALSE 0.041 148.000 0.000 NA   NA
 588250 588251 ACIAD0782 ACIAD0783 proS nolG FALSE 0.128 103.000 0.004 NA N NA
 588251 588252 ACIAD0783 ACIAD0784 nolG nolF TRUE 0.968 24.000 0.643 NA N NA
 588252 588253 ACIAD0784 ACIAD0785 nolF   TRUE 0.649 57.000 0.111 NA   NA
 588254 588255 ACIAD0786 ACIAD0787 pilG pilH TRUE 0.991 24.000 0.409 0.010   NA
 588255 588256 ACIAD0787 ACIAD0788 pilH pilI TRUE 0.990 4.000 0.281 1.000   NA
 588256 588257 ACIAD0788 ACIAD0789 pilI pilJ TRUE 0.921 43.000 0.817 NA   NA
 588257 588258 ACIAD0789 ACIAD0790 pilJ chpA TRUE 0.689 85.000 0.542 NA   NA
 588259 588260 ACIAD0791 ACIAD0792 dapE ecnB FALSE 0.137 119.000 0.007 1.000   NA
 588260 588261 ACIAD0792 ACIAD0793 ecnB   FALSE 0.115 144.000 0.034 NA   NA
 588262 588263 ACIAD0794 ACIAD0795     TRUE 0.968 -7.000 0.048 NA   NA
 588263 588264 ACIAD0795 ACIADtRNAVal_24     FALSE 0.014 257.000 0.000 NA   NA
 588264 588265 ACIADtRNAVal_24 ACIADtRNAAsp_25     TRUE 0.679 24.000 0.000 NA   NA
 588265 588266 ACIADtRNAAsp_25 ACIADtRNAAsp_26     FALSE 0.327 48.000 0.000 NA   NA
 588266 588267 ACIADtRNAAsp_26 ACIADtRNAVal_27     TRUE 0.692 23.000 0.000 NA   NA
 588267 588268 ACIADtRNAVal_27 ACIADtRNAAsp_28     TRUE 0.455 36.000 0.000 NA   NA
 588268 588269 ACIADtRNAAsp_28 ACIADtRNAVal_29     FALSE 0.099 98.000 0.000 NA   NA
 588269 588270 ACIADtRNAVal_29 ACIAD0797     FALSE 0.133 85.000 0.000 NA   NA
 588271 588272 ACIAD0798 ACIAD0799     FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 588272 588273 ACIAD0799 ACIAD0800     FALSE 0.132 157.000 0.074 NA   NA
 588273 588274 ACIAD0800 ACIAD0801     FALSE 0.264 93.000 0.037 NA   NA
 588277 588278 ACIAD0804 ACIAD0805 gltS   FALSE 0.355 115.000 0.000 1.000 Y NA
 588278 588279 ACIAD0805 ACIAD0806     FALSE 0.220 140.000 0.133 1.000   NA
 588280 588281 ACIAD0807 ACIAD0808     FALSE 0.045 143.000 0.000 NA   NA
 588283 588284 ACIAD0810 ACIAD0811     FALSE 0.044 144.000 0.000 NA   NA
 588284 588285 ACIAD0811 ACIAD0812     TRUE 1.000 -3.000 0.878 0.001 Y NA
 588288 588289 ACIAD0815 ACIAD0816     TRUE 0.420 38.000 0.000 NA   NA
 588289 588290 ACIAD0816 ACIAD0817     FALSE 0.387 41.000 0.000 NA   NA
 588290 588291 ACIAD0817 ACIAD0818     TRUE 0.467 35.000 0.000 NA   NA
 588291 588292 ACIAD0818 ACIAD0819     FALSE 0.066 119.000 0.000 NA   NA
 588292 588293 ACIAD0819 ACIAD0820     FALSE 0.011 306.000 0.000 NA   NA
 588293 588294 ACIAD0820 ACIAD0821     FALSE 0.154 79.000 0.000 NA   NA
 588295 588296 ACIAD0822 ACIAD0823 gatB gatA TRUE 1.000 0.000 0.502 0.001 Y NA
 588296 588297 ACIAD0823 ACIAD0824 gatA gatC TRUE 0.996 53.000 0.686 0.001 Y NA
 588298 588299 ACIAD0825 ACIAD0826 mreB mreC TRUE 0.969 19.000 0.392 1.000 N NA
 588299 588300 ACIAD0826 ACIAD0828 mreC mreD TRUE 0.996 35.000 0.503 0.003 Y NA
 588300 588301 ACIAD0828 ACIAD0829 mreD   TRUE 0.987 3.000 0.241 NA N NA
 588301 588302 ACIAD0829 ACIAD0830   cafA TRUE 0.927 28.000 0.339 NA N NA
 588302 588303 ACIAD0830 ACIAD0831 cafA   FALSE 0.087 137.000 0.004 NA   NA
 588304 588305 ACIAD0832 ACIAD0833 wax-dgaT cysH FALSE 0.061 172.000 0.005 1.000   NA
 588307 588308 ACIAD0835 ACIAD0836     FALSE 0.255 59.000 0.000 NA   NA
 588308 588309 ACIAD0836 ACIAD0837     FALSE 0.026 183.000 0.000 NA   NA
 588309 588310 ACIAD0837 ACIAD0838     FALSE 0.085 154.000 0.010 1.000   NA
 588312 588313 ACIAD0840 ACIAD0841     TRUE 0.986 7.000 0.239 1.000 N NA
 588314 588315 ACIAD0842 ACIAD0843     FALSE 0.200 70.000 0.000 NA   NA
 588315 588316 ACIAD0843 ACIAD0844     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 588316 588317 ACIAD0844 ACIAD0846     FALSE 0.162 98.000 0.005 1.000 N NA
 588317 588318 ACIAD0846 ACIAD0847     TRUE 0.998 2.000 0.027 0.013 Y NA
 588318 588319 ACIAD0847 ACIAD0848   ligA FALSE 0.291 78.000 0.018 1.000 N NA
 588321 588322 ACIAD0850 ACIAD0851     TRUE 0.914 4.000 0.000 NA   NA
 588322 588323 ACIAD0851 ACIAD0852   bfrA FALSE 0.016 256.000 0.000 1.000   NA
 588323 588324 ACIAD0852 ACIAD0853 bfrA   FALSE 0.018 228.000 0.000 NA   NA
 588326 588327 ACIAD0855 ACIAD0856   bioA TRUE 0.411 58.000 0.006 NA   NA
 588327 588328 ACIAD0856 ACIAD0857 bioA bioF TRUE 0.998 -13.000 0.185 0.015 Y NA
 588328 588329 ACIAD0857 ACIAD0858 bioF   TRUE 0.978 -9.000 0.106 1.000   NA
 588329 588330 ACIAD0858 ACIAD0859   bioD TRUE 0.998 -3.000 0.156 0.002   NA
 588331 588332 ACIAD0860 ACIAD0861     FALSE 0.050 136.000 0.000 NA   NA
 588332 588333 ACIAD0861 ACIAD0862     TRUE 0.754 42.000 0.150 NA N NA
 588333 588334 ACIAD0862 ACIAD0863     TRUE 0.995 -3.000 0.675 NA   NA
 588336 588337 ACIAD0865 ACIAD0866     FALSE 0.262 84.000 0.012 NA   NA
 588338 588339 ACIAD0868 ACIAD0869   rpmF TRUE 0.778 72.000 0.590 NA   NA
 588339 588340 ACIAD0869 ACIAD0870 rpmF fabD FALSE 0.076 154.000 0.014 1.000 N NA
 588340 588341 ACIAD0870 ACIAD0871 fabD fabG TRUE 1.000 -3.000 0.571 0.003 Y NA
 588341 588342 ACIAD0871 ACIAD0872 fabG acpP TRUE 0.998 -22.000 0.006 0.003 Y NA
 588342 588343 ACIAD0872 ACIAD0873 acpP   FALSE 0.065 189.000 0.030 1.000   NA
 588344 588345 ACIAD0874 ACIAD0875   thiD FALSE 0.171 75.000 0.000 NA   NA
 588346 588347 ACIAD0876 ACIAD0877     FALSE 0.039 161.000 0.000 1.000   NA
 588348 588349 ACIAD0878 ACIAD0879   fabB FALSE 0.010 319.000 0.000 NA   NA
 588350 588351 ACIAD0880 ACIAD0881   rpsL FALSE 0.042 185.000 0.003 NA   NA
 588351 588352 ACIAD0881 ACIAD0883 rpsL rpsG TRUE 0.940 161.000 0.935 0.003 Y NA
 588352 588353 ACIAD0883 ACIAD0884 rpsG fusA FALSE 0.205 178.000 0.003 1.000 Y NA
 588353 588354 ACIAD0884 ACIAD0885 fusA tufA TRUE 0.930 92.000 0.003 0.001 Y NA
 588354 588355 ACIAD0885 ACIAD0886 tufA   FALSE 0.016 257.000 0.000 1.000   NA
 588355 588356 ACIAD0886 ACIAD0887   rimI FALSE 0.043 153.000 0.000 1.000   NA
 588357 588358 ACIAD0888 ACIAD0889   aat TRUE 0.983 25.000 0.286 1.000 Y NA
 588358 588359 ACIAD0889 ACIAD0890 aat trxB TRUE 0.764 73.000 0.055 1.000 Y NA
 588361 588362 ACIAD0892 ACIAD0893   minE FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 588362 588363 ACIAD0893 ACIAD0894 minE minD TRUE 0.998 3.000 0.801 NA Y NA
 588363 588364 ACIAD0894 ACIAD0895 minD minC TRUE 0.973 43.000 0.821 1.000 Y NA
 588364 588365 ACIAD0895 ACIAD0896 minC   FALSE 0.122 124.000 0.009 NA   NA
 588365 588366 ACIAD0896 ACIAD0897     FALSE 0.062 212.000 0.048 NA   NA
 588367 588368 ACIAD0898 ACIAD0900   rep FALSE 0.108 126.000 0.009 1.000 N NA
 588368 588369 ACIAD0900 ACIAD0901 rep dut TRUE 0.789 25.000 0.010 1.000 N NA
 588369 588370 ACIAD0901 ACIAD0902 dut algC FALSE 0.103 192.000 0.119 1.000 N NA
 588370 588371 ACIAD0902 ACIAD0903 algC argB TRUE 0.959 11.000 0.053 1.000 N NA
 588371 588372 ACIAD0903 ACIAD0904 argB   FALSE 0.267 76.000 0.004 NA   NA
 588372 588373 ACIAD0904 ACIAD0905     FALSE 0.200 99.000 0.014 NA   NA
 588373 588374 ACIAD0905 ACIAD0907     FALSE 0.103 96.000 0.000 NA   NA
 588374 588375 ACIAD0907 ACIAD0908     TRUE 0.970 -3.000 0.043 NA   NA
 588378 588379 ACIAD0911 ACIAD0912 pilU pilT TRUE 0.994 37.000 0.713 0.010 Y NA
 588380 588381 ACIAD0913 ACIAD0914     FALSE 0.049 137.000 0.000 NA   NA
 588382 588383 ACIAD0915 ACIAD0916   sbcC FALSE 0.014 211.000 0.000 NA N NA
 588383 588384 ACIAD0916 ACIAD0917 sbcC sbcD TRUE 0.999 10.000 0.179 0.002 Y NA
 588387 588388 ACIAD0920 ACIAD0921     TRUE 0.460 67.000 0.044 NA   NA
 588389 588390 ACIAD0922 ACIAD0923   hemB TRUE 0.756 25.000 0.004 1.000 N NA
 588393 588394 ACIAD0926 ACIAD0927 emrA emrB TRUE 0.991 7.000 0.444 1.000 N NA
 588394 588395 ACIAD0927 ACIAD0929 emrB ggt FALSE 0.018 204.000 0.000 1.000 N NA
 588399 588400 ACIAD0932 ACIAD0933     FALSE 0.184 73.000 0.000 NA   NA
 588400 588401 ACIAD0933 ACIAD0934     TRUE 0.994 -49.000 0.960 NA   NA
 588401 588402 ACIAD0934 ACIAD0935     TRUE 0.971 -3.000 0.047 NA   NA
 588402 588403 ACIAD0935 ACIAD0936     TRUE 0.975 -6.000 0.078 NA   NA
 588405 588406 ACIAD0938 ACIAD0939     FALSE 0.006 923.000 0.000 NA   NA
 588406 588407 ACIAD0939 ACIAD0940     FALSE 0.128 86.000 0.000 NA   NA
 588407 588408 ACIAD0940 ACIAD0941     TRUE 0.918 2.000 0.000 NA   NA
 588408 588409 ACIAD0941 ACIAD0942     FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 588409 588410 ACIAD0942 ACIAD0943     FALSE 0.171 75.000 0.000 NA   NA
 588410 588411 ACIAD0943 ACIAD0944     TRUE 0.899 9.000 0.000 NA   NA
 588411 588412 ACIAD0944 ACIAD0945     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 588412 588413 ACIAD0945 ACIAD0946     FALSE 0.246 61.000 0.000 NA   NA
 588413 588414 ACIAD0946 ACIAD0947     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 588414 588415 ACIAD0947 ACIAD0948     FALSE 0.128 86.000 0.000 NA   NA
 588415 588416 ACIAD0948 ACIAD0949     TRUE 0.909 6.000 0.000 NA   NA
 588416 588417 ACIAD0949 ACIAD0951     FALSE 0.048 138.000 0.000 NA   NA
 588418 588419 ACIAD0952 ACIAD0953     TRUE 0.994 9.000 0.000 0.035 Y NA
 588421 588422 ACIAD0956 ACIAD0957     TRUE 0.883 -22.000 0.000 NA   NA
 588422 588423 ACIAD0957 ACIAD0958     TRUE 0.994 9.000 0.000 0.035 Y NA
 588423 588424 ACIAD0958 ACIAD0959     FALSE 0.200 70.000 0.000 NA   NA
 588426 588427 ACIAD0961 ACIAD0962     FALSE 0.052 133.000 0.000 NA   NA
 588427 588428 ACIAD0962 ACIAD0963     FALSE 0.219 111.000 0.069 NA N NA
 588428 588429 ACIAD0963 ACIAD0964     TRUE 0.956 17.000 0.176 NA N NA
 588432 588433 ACIAD0967 ACIAD0968 iciA   TRUE 0.548 88.000 0.000 0.059 Y NA
 588434 588435 ACIAD0969 ACIAD0970     TRUE 0.996 4.000 0.231 1.000 Y NA
 588435 588436 ACIAD0970 ACIAD0971     TRUE 0.996 4.000 0.154 1.000 Y NA
 588439 588440 ACIAD0975 ACIAD0976     FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 588440 588441 ACIAD0976 ACIAD0977     FALSE 0.150 80.000 0.000 NA   NA
 588441 588442 ACIAD0977 ACIAD0978   vanR FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 588443 588444 ACIAD0979 ACIAD0980 vanB vanA TRUE 0.986 3.000 0.136 0.059 N NA
 588444 588445 ACIAD0980 ACIAD0981 vanA   FALSE 0.006 577.000 0.000 NA   NA
 588446 588447 ACIAD0982 ACIAD0983 vanK   TRUE 0.955 32.000 0.667 0.061   NA
 588448 588449 ACIAD0984 ACIAD0985     FALSE 0.011 260.000 0.000 1.000 N NA
 588450 588451 ACIAD0986 ACIAD0987     TRUE 0.979 19.000 0.600 NA   NA
 588451 588452 ACIAD0987 ACIAD0988     TRUE 0.992 9.000 0.541 NA   NA
 588452 588453 ACIAD0988 ACIAD0989     TRUE 0.995 6.000 0.326 0.041 N NA
 588453 588454 ACIAD0989 ACIAD0990     TRUE 0.959 11.000 0.043 NA   NA
 588454 588455 ACIAD0990 ACIAD0991     TRUE 0.947 26.000 0.371 NA   NA
 588455 588456 ACIAD0991 ACIAD0992     TRUE 0.796 67.000 0.538 NA   NA
 588456 588457 ACIAD0992 ACIAD0993     TRUE 0.958 31.000 0.150 NA Y NA
 588457 588458 ACIAD0993 ACIAD0994     TRUE 0.730 62.000 0.275 NA   NA
 588458 588459 ACIAD0994 ACIAD0995     TRUE 0.983 4.000 0.130 NA   NA
 588459 588460 ACIAD0995 ACIAD0997     TRUE 0.971 12.000 0.091 1.000   NA
 588460 588461 ACIAD0997 ACIAD0998     TRUE 0.978 14.000 0.234 1.000   NA
 588461 588462 ACIAD0998 ACIAD0999     TRUE 0.758 63.000 0.400 1.000 N NA
 588462 588463 ACIAD0999 ACIAD1000     FALSE 0.015 250.000 0.000 NA   NA
 588463 588464 ACIAD1000 ACIAD1001     FALSE 0.044 144.000 0.000 NA   NA
 588465 588466 ACIAD1002 ACIAD1003     FALSE 0.030 179.000 0.000 1.000   NA
 588468 588469 ACIAD1005 ACIAD1006     FALSE 0.227 64.000 0.000 NA   NA
 588469 588470 ACIAD1006 ACIAD1007   mqo FALSE 0.251 60.000 0.000 NA   NA
 588470 588471 ACIAD1007 ACIAD1008 mqo betA FALSE 0.008 500.000 0.000 1.000   NA
 588471 588472 ACIAD1008 ACIAD1009 betA betB TRUE 0.709 89.000 0.745 1.000 N NA
 588472 588473 ACIAD1009 ACIAD1010 betB betI TRUE 0.992 -7.000 0.577 1.000 N NA
 588474 588475 ACIAD1011 ACIAD1012   betT TRUE 0.517 166.000 0.143 0.047 Y NA
 588475 588476 ACIAD1012 ACIAD1013 betT   TRUE 0.955 13.000 0.071 NA N NA
 588477 588478 ACIAD1014 ACIAD1015   lipA FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 588479 588480 ACIAD1017 ACIAD1018 acoA acoB TRUE 1.000 16.000 0.843 0.001 Y NA
 588480 588481 ACIAD1018 ACIAD1019 acoB acoC TRUE 0.991 2.000 0.034 0.076 Y NA
 588481 588482 ACIAD1019 ACIAD1020 acoC acoD TRUE 0.995 5.000 0.106 1.000 Y NA
 588482 588483 ACIAD1020 ACIAD1021 acoD   TRUE 0.747 18.000 0.000 1.000 N NA
 588483 588484 ACIAD1021 ACIAD1022   budC TRUE 0.989 10.000 0.111 0.040 N NA
 588484 588485 ACIAD1022 ACIAD1023 budC   FALSE 0.075 289.000 0.000 NA Y NA
 588489 588490 ACIAD1027 ACIAD1028   fbp TRUE 0.516 50.000 0.015 NA   NA
 588490 588491 ACIAD1028 ACIAD1029 fbp   FALSE 0.009 378.000 0.000 1.000   NA
 588491 588492 ACIAD1029 ACIAD1030     TRUE 0.994 7.000 0.744 NA N NA
 588492 588493 ACIAD1030 ACIAD1031     TRUE 0.936 18.000 0.077 NA   NA
 588493 588494 ACIAD1031 ACIAD1032     FALSE 0.029 173.000 0.000 NA   NA
 588494 588495 ACIAD1032 ACIAD1033     FALSE 0.116 84.000 0.000 1.000 N NA
 588495 588496 ACIAD1033 ACIAD1034     TRUE 0.979 -3.000 0.083 NA   NA
 588496 588497 ACIAD1034 ACIAD1035     FALSE 0.255 59.000 0.000 NA   NA
 588498 588499 ACIAD1036 ACIAD1037     FALSE 0.085 106.000 0.000 NA   NA
 588500 588501 ACIAD1038 ACIAD1039   def2 TRUE 0.927 0.000 0.000 1.000   NA
 588501 588502 ACIAD1039 ACIAD1040 def2   FALSE 0.071 161.000 0.018 1.000 N NA
 588504 588505 ACIAD1042 ACIAD1044 fsr   FALSE 0.006 390.000 0.000 NA N NA
 588507 588508 ACIAD1046 ACIAD1047   pit FALSE 0.066 119.000 0.000 NA   NA
 588508 588509 ACIAD1047 ACIAD1048 pit dsdA FALSE 0.139 133.000 0.047 1.000 N NA
 588510 588511 ACIAD1049 ACIAD1051     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 588512 588513 ACIAD1052 ACIAD1053   pfeA FALSE 0.293 158.000 0.018 0.014   NA
 588513 588514 ACIAD1053 ACIAD1054 pfeA   FALSE 0.309 255.000 0.000 0.011 Y NA
 588518 588519 ACIAD1058 ACIAD1059     TRUE 0.955 -3.000 0.018 NA N NA
 588521 588522 ACIAD1061 ACIAD1062 mtgA ppk FALSE 0.134 122.000 0.009 1.000   NA
 588523 588524 ACIAD1063 ACIAD1064 estR   TRUE 0.937 14.000 0.031 NA   NA
 588524 588525 ACIAD1064 ACIAD1065   rubB TRUE 0.585 56.000 0.065 NA   NA
 588525 588526 ACIAD1065 ACIAD1066 rubB rubA FALSE 0.364 85.000 0.065 NA   NA
 588526 588527 ACIAD1066 ACIAD1068 rubA   FALSE 0.008 381.000 0.000 NA   NA
 588529 588530 ACIAD1070 ACIAD1071 sodM cobQ FALSE 0.023 179.000 0.000 1.000 N NA
 588531 588532 ACIAD1072 ACIAD1073 cysD cysN TRUE 0.972 53.000 0.214 0.001 N NA
 588534 588535 ACIAD1075 ACIAD1076     FALSE 0.008 406.000 0.000 NA   NA
 588535 588536 ACIAD1076 ACIAD1077     TRUE 0.920 16.000 0.027 NA   NA
 588536 588537 ACIAD1077 ACIAD1078     FALSE 0.047 139.000 0.000 NA   NA
 588537 588538 ACIAD1078 ACIAD1080     TRUE 0.909 6.000 0.000 NA   NA
 588539 588540 ACIAD1081 ACIAD1082     FALSE 0.172 123.000 0.038 1.000   NA
 588541 588542 ACIAD1083 ACIAD1084   aceA FALSE 0.008 405.000 0.000 NA   NA
 588543 588544 ACIAD1085 ACIAD1087     FALSE 0.048 138.000 0.000 NA   NA
 588545 588546 ACIAD1088 ACIAD1089 ureD ureA TRUE 0.847 109.000 0.293 0.003 N NA
 588546 588547 ACIAD1089 ACIAD1090 ureA ureB TRUE 0.998 23.000 0.256 0.001 Y NA
 588547 588548 ACIAD1090 ACIAD1091 ureB ureC TRUE 0.996 31.000 0.134 0.001 Y NA
 588548 588549 ACIAD1091 ACIAD1092 ureC   TRUE 0.778 15.000 0.000 NA N NA
 588549 588550 ACIAD1092 ACIAD1093   ureE TRUE 0.853 10.000 0.000 NA N NA
 588550 588551 ACIAD1093 ACIAD1094 ureE ureF TRUE 1.000 -10.000 0.877 0.003 Y NA
 588551 588552 ACIAD1094 ACIAD1095 ureF ureG TRUE 0.989 64.000 0.595 0.003 Y NA
 588552 588553 ACIAD1095 ACIAD1096 ureG ureJ TRUE 0.988 10.000 0.009 NA Y NA
 588553 588554 ACIAD1096 ACIAD1097 ureJ   FALSE 0.026 180.000 0.000 NA   NA
 588554 588555 ACIAD1097 ACIAD1099     FALSE 0.048 138.000 0.000 NA   NA
 588556 588557 ACIAD1100 ACIAD1101   pbpA TRUE 0.950 0.000 0.005 1.000 N NA
 588558 588559 ACIAD1102 ACIAD1103     TRUE 0.766 64.000 0.400 NA   NA
 588559 588560 ACIAD1103 ACIAD1105   adk FALSE 0.280 81.000 0.013 NA   NA
 588560 588561 ACIAD1105 ACIAD1106 adk   FALSE 0.171 75.000 0.000 NA   NA
 588562 588563 ACIAD1108 ACIAD1109 nth   TRUE 0.899 16.000 0.013 1.000 N NA
 588565 588566 ACIAD1111 ACIAD1112     FALSE 0.012 277.000 0.000 NA   NA
 588566 588567 ACIAD1112 ACIAD1113     FALSE 0.139 112.000 0.006 NA   NA
 588567 588568 ACIAD1113 ACIAD1114     FALSE 0.073 113.000 0.000 NA   NA
 588568 588569 ACIAD1114 ACIAD1115   lon FALSE 0.107 94.000 0.000 NA   NA
 588569 588570 ACIAD1115 ACIAD1116 lon   FALSE 0.012 146.000 0.000 0.078 N NA
 588570 588571 ACIAD1116 ACIAD1117     FALSE 0.028 164.000 0.000 1.000 N NA
 588571 588572 ACIAD1117 ACIAD1118     TRUE 0.989 7.000 0.273 1.000   NA
 588572 588573 ACIAD1118 ACIAD1119     TRUE 0.888 -16.000 0.000 NA   NA
 588573 588574 ACIAD1119 ACIAD1120     TRUE 0.971 -9.000 0.068 NA   NA
 588574 588575 ACIAD1120 ACIAD1121   lip1 FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 588577 588578 ACIAD1123 ACIAD1124     TRUE 0.953 -3.000 0.005 NA   NA
 588579 588580 ACIAD1125 ACIAD1126   pepP TRUE 0.751 62.000 0.332 NA   NA
 588580 588581 ACIAD1126 ACIAD1127 pepP ubiH TRUE 0.945 26.000 0.387 1.000 N NA
 588581 588582 ACIAD1127 ACIAD1128 ubiH   TRUE 0.999 -3.000 0.025 0.001 Y NA
 588582 588583 ACIAD1128 ACIAD1129     FALSE 0.230 173.000 0.333 NA   NA
 588585 588586 ACIAD1131 ACIAD1132     TRUE 0.987 0.000 0.183 NA   NA
 588586 588587 ACIAD1132 ACIAD1133     FALSE 0.243 86.000 0.010 NA   NA
 588587 588588 ACIAD1133 ACIAD1134   aesT TRUE 0.952 -10.000 0.016 NA   NA
 588589 588590 ACIAD1135 ACIAD1136     TRUE 0.987 0.000 0.188 NA   NA
 588590 588591 ACIAD1136 ACIAD1137   rnhA-dnaQ FALSE 0.150 116.000 0.017 NA   NA
 588592 588593 ACIAD1138 ACIAD1139     TRUE 0.927 16.000 0.030 1.000   NA
 588593 588594 ACIAD1139 ACIAD1140     TRUE 0.894 28.000 0.030 0.046   NA
 588594 588595 ACIAD1140 ACIAD1141     TRUE 0.998 0.000 1.000 0.046   NA
 588595 588596 ACIAD1141 ACIAD1142     TRUE 0.893 -25.000 0.000 1.000   NA
 588596 588597 ACIAD1142 ACIAD1143     FALSE 0.104 102.000 0.000 1.000   NA
 588598 588599 ACIADtRNAGlu_30 ACIADtRNAGlu_31     TRUE 0.630 26.000 0.000 NA   NA
 588599 588600 ACIADtRNAGlu_31 ACIAD1144     FALSE 0.060 124.000 0.000 NA   NA
 588600 588601 ACIAD1144 ACIAD1145     FALSE 0.072 114.000 0.000 NA   NA
 588601 588602 ACIAD1145 ACIAD1147     FALSE 0.056 128.000 0.000 NA   NA
 588602